EGR1

EGR1
EGR1
Zinc finger DNA complex.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스EGR1, AT225, G0S30, KROX-24, NGFI-A, TIS8, ZIF-268, ZNF225, 조기 성장 응답 1
외부 IDOMIM : 128990 MGI : 95295 HomoloGene : 56394 GenCard : EGR 1
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001964

NM_007913

RefSeq(단백질)

NP_001955

NP_031939

장소(UCSC)Chr 5: 138.47 ~138.47 MbChr 18: 34.99 – 35 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

EGR-1(조기성장응답단백질1)은 ZNF268(아연지단백질 268) 또는 NGFI-A(신경성장인자유도단백질A)라고도 불리며 EGR1 유전자에 의해 인체 내에서 부호화되는 단백질이다.

EGR-1은 포유류의 전사인자이다.그것은 또한 Krox-24, TIS8, ZENK로 명명되었다.그것은 원래 쥐에게서 발견되었다.

기능.

이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 CysHis형22 아연 핑거 단백질의 EGR 계열에 속합니다.그것은 핵단백질이고 전사조절제 역할을 한다.그것이 활성화하는 표적 유전자의 산물은 분화와 유사분열을 위해 필요하다.연구 결과 종양 억제 유전자인 [5]것으로 나타났습니다.

그것은 뇌에서 뚜렷한 발현 패턴을 가지고 있고, 그것의 유도는 신경 활동과 관련이 있는 것으로 나타났다.몇몇 연구들은 그것이 신경[6]가소성에 영향을 미친다는 것을 암시한다.

EGR-1은 메모리 형성에 있어 중요한 전사 인자입니다.뉴런 후생유전 재프로그래밍에 필수적인 역할을 합니다.EGR-1은 DNA 탈메틸화 [7]경로를 시작하는 TET1 단백질을 모집한다.DNA 메틸화 마크를 제거하면 다운스트림 유전자가 활성화된다.EGR-1은 TET1과 함께 뇌 발달, 학습 장기 신경 가소성 중 뇌 DNA의 메틸화 부위의 분포를 프로그래밍하는 데 사용된다.EGR-1은 또한 VAMP2발현[8]조절하는 것으로 밝혀졌다.

신경계에서의 기능 외에도 섬유소성 질환에서 EGR-1과 함께 EGR-2가 유도된다는 중요한 증거가 있으며,[9] 생쥐에서 실험적으로 유도되는 섬유화에 필요하다.

난소 기능에도 관여할 수 있습니다

구조.

EGR-1의 DNA 결합 도메인은 CysHis22 유형의 세의 아연 핑거 도메인으로 구성됩니다.EGR-1 아연 핑거 도메인의 아미노산 구조는 단일 문자 아미노산 코드를 사용하여 이 표에 나와 있습니다.손가락 1 ~ 3은 f1 - f3으로 표시됩니다.수치는 알파 나선의 잔류물(아미노산)에 대한 것이다(0은 없음).'x'로 표시된 잔류물은 아연 핑거의 일부가 아니라 모든 것을 연결하는 역할을 합니다.

-1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 x x x x x
f1 M A E E R P Y A C P V E S C D R R F S R S D E L T R H I R I H T G Q K P
f2 F Q C R I - - C M R N F S R S D H L T T H I R T H T G E K P
f3 F A C D I - - C G R K F A R S D E R K R H T K I H L R Q K D

아미노산 키 : 알라닌(Ala, A), 아르기닌(Arg, R), 아스파라긴(Asn, N), 아스파르트산(Asp, D), 시스테인(Cys, C), 글루탐산(Glu, E), 글루타민(Gln, Q), 글리신(Glycine)T), 트립토판(Trp, W), 티로신(Tyr, Y), 발린(Val, V)

1991년 EGR-1의 아연 핑거 도메인으로 결합된 DNA의 결정 구조가 해결되어 아연 핑거 DNA 결합 [11]도메인의 초기 연구에 큰 도움이 되었다.

인간 EGR-1 단백질은 분자량이 57.5kDa인 543개의 아미노산을 함유하고 있으며, 이 유전자는 염색체 5에 위치한다.

DNA결합특이성

EGR-1은 DNA 배열 5'-GGG GCG-3'(5'-GGGG GCG-3'[12][13] 등 유사)과 결합한다.f1 위치 6은 5'G(왼쪽에서 첫 번째 베이스 카운트), f1 위치 3은 두 번째 베이스(C), f1 위치 -1은 세 번째 위치(G), f2 위치 6은 네 번째 베이스(T) 등을 결합한다.

상호 작용

EGR-1은 다음 부품과 상호 작용하는 것으로 나타났습니다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000120738 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000038418 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: EGR1 early growth response 1".
  6. ^ Knapska E, Kaczmarek L (November 2004). "A gene for neuronal plasticity in the mammalian brain: Zif268/Egr-1/NGFI-A/Krox-24/TIS8/ZENK?". Progress in Neurobiology. 74 (4): 183–211. doi:10.1016/j.pneurobio.2004.05.007. PMID 15556287. S2CID 39251786.
  7. ^ Sun Z, Xu X, He J, Murray A, Sun MA, Wei X, Wang X, McCoig E, Xi E, Jiang X, Li L, Zhu J, Morozov A, Pick AMRELL, Hie, Hie 1을 모집합니다.NAT Communic.2019년 8월 29일;10 (1):3892.doi:10.1038/s41467-019-11905-3.PMID 31467272
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추가 정보

외부 링크