Pdx1

Pdx1
Ідентифікатори
Символи	PDX1, GSF, IDX-1, IPF1, IUF1, MODY4, PAGEN1, PDX-1, STF-1, pancreatic and duodenal homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600733 MGI: 102851 HomoloGene: 175 GeneCards: PDX1
Пов'язані генетичні захворювання
partial pancreatic agenesis, maturity-onset diabetes of the young type 9
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • protein heterodimerization activity • promoter-specific chromatin binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • exocrine pancreas development • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • glucose homeostasis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • insulin secretion • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • generation of precursor metabolites and energy • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell population proliferation • positive regulation of cell population proliferation • nitric oxide mediated signal transduction • glucose metabolic process • animal organ morphogenesis • pancreas development • liver development • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • morphogenesis of embryonic epithelium • digestive tract development • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • negative regulation of cell population proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • endocrine pancreas development • type B pancreatic cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • detection of glucose • smoothened signaling pathway • central nervous system development • response to wounding • response to glucose • response to iron(II) ion • response to chlorate • регуляція експресії генів • positive regulation of cell death • GO:1904578 response to organic cyclic compound • animal organ regeneration • response to nutrient levels • positive regulation of insulin secretion • response to vitamin • response to lipid • response to cytokine • response to nicotine • response to leucine • response to alkaloid • positive regulation of DNA binding • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • response to glucocorticoid • transdifferentiation • response to fatty acid Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3651	18609
Ensembl	ENSG00000139515	ENSMUSG00000029644
UniProt	P52945	P52946
RefSeq (мРНК)	NM_000209	NM_008814
RefSeq (білок)	NP_000200	NP_032840
Локус (UCSC)	Хр. 13: 27.92 – 27.93 Mb	Хр. 5: 147.21 – 147.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Pdx1 (англ. Pancreatic and duodenal homeobox 1) – білок, який кодується геном PDX1, розташованим у людей на довгому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 283 амінокислот, а молекулярна маса — 30 771.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNGEEQYYAA		TQLYKDPCAF		QRGPAPEFSA		SPPACLYMGR		QPPPPPPHPF
PGALGALEQG		SPPDISPYEV		PPLADDPAVA		HLHHHLPAQL		ALPHPPAGPF
PEGAEPGVLE		EPNRVQLPFP		WMKSTKAHAW		KGQWAGGAYA		AEPEENKRTR
TAYTRAQLLE		LEKEFLFNKY		ISRPRRVELA		VMLNLTERHI		KIWFQNRRMK
WKKEEDKKRG		GGTAVGGGGV		AEPEQDCAVT		SGEELLALPP		PPPPGGAVPP
AAPVAAREGR		LPPGLSASPQ		PSSVAPRRPQ		EPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Транскрипційний фактор залучений до розвитку підшлункової залози та дозрівання β-клітин. Відповідний ген, що його кодує, носить назву Pdx1 (у гризунів) або Ipf1 (в людини).

Література

• Stoffers D.A., Zinkin N.T., Stanojevic V., Clarke W.L., Habener J.F. (1997). Pancreatic agenesis attributable to a single nucleotide deletion in the human IPF1 gene coding sequence. Nat. Genet. 15: 106—110. PMID 8988180 DOI:10.1038/ng0197-106
• Francis J., Chakrabarti S.K., Garmey J.C., Mirmira R.G. (2005). Pdx-1 links histone H3-Lys-4 methylation to RNA polymerase II elongation during activation of insulin transcription. J. Biol. Chem. 280: 36244—36253. PMID 16141209 DOI:10.1074/jbc.M505741200

Див. також

• Хромосома 13