Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
DLX1
Ідентифікатори
Символи
DLX1 , Dlx, Dlx-1, distal-less homeobox 1
Зовнішні ІД
OMIM : 600029 MGI: 94901 HomoloGene: 22558 GeneCards: DLX1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • cerebral cortex GABAergic interneuron differentiation • proximal/distal pattern formation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic skeletal system development • multicellular organism development • odontogenesis of dentin-containing tooth • cerebral cortex GABAergic interneuron fate commitment • negative regulation of oligodendrocyte differentiation • forebrain neuron differentiation • hippocampus development • subpallium development • negative regulation of Notch signaling pathway • positive regulation of cell differentiation • negative regulation of photoreceptor cell differentiation • positive regulation of amacrine cell differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of BMP signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to transforming growth factor beta stimulus • cellular response to BMP stimulus • negative regulation of cellular response to transforming growth factor beta stimulus • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 172.08 – 172.09 Mb
Хр. 2: 71.36 – 71.36 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
DLX1 (англ. Distal-less homeobox 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот , а молекулярна маса — 27 320[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MTMTTMPESL NSPVSGKAVF MEFGPPNQQM SPSPMSHGHY SMHCLHSAGH
SQPDGAYSSA SSFSRPLGYP YVNSVSSHAS SPYISSVQSY PGSASLAQSR
LEDPGADSEK STVVEGGEVR FNGKGKKIRK PRTIYSSLQL QALNRRFQQT
QYLALPERAE LAASLGLTQT QVKIWFQNKR SKFKKLMKQG GAALEGSALA
NGRALSAGSP PVPPGWNPNS SSGKGSGGNA GSYIPSYTSW YPSAHQEAMQ
QPQLM
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші