NRL
NRL (англ. Neural retina leucine zipper) – транскрипційний фактор основного домену лейцинової застібки (bZIP). Це білок, який специфічно експресується у хребетних, а саме в епіфізі і фоторецепторах паличок, але не в колбочках або інших типах клітин. NRL необхідний для диференціювання паличкових фоторецепторів під час розвитку сітківки Належить підсімейству MAF.[4]
За допомогою Саузерн-блот аналізу геномної ДНК з гібридної панелі соматичних клітин людини/гризуна Ян-Фенг і Сваруп (1992)[5] виявили ген NRL на 14 хромосомі людини. Гібридизація in situ з метафазними хромосомами віднесла ген до області 14q11.1-q11.2. Ділянка D14S46E тепер належить гену NRL. Вважається, що через специфічну модель експресії NRL може спричиняти захворювання сітківки.[5][6]
Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 237 амінокислот, а молекулярна маса — 25 940[7]. Посттрансляційна модифікації включають фосфорилювання та диSUMO-лювання на Ліз-20
Кодований геномом білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
NRL регулює експресію кількох специфічних для паличок генів, а міссенс-мутації в ньому спричиняють аутосомно-домінантний пігментний ретиніт у людини. Міттон та ін. (2003)[8] використовували дріжджовий двогібридний скринінг, щоб ідентифікувати FIZ1, NRL-взаємодіючий білок у сітківці. FIZ1 пригнічував NRL-, але не CRX-опосередковану трансактивацію промоторної активності родопсину у тимчасово трансфікованій лінії клітин нирки мавпи.[9]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MALPPSPLAM | EYVNDFDLMK | FEVKREPSEG | RPGPPTASLG | STPYSSVPPS | ||||
| PTFSEPGMVG | ATEGTRPGLE | ELYWLATLQQ | QLGAGEALGL | SPEEAMELLQ | ||||
| GQGPVPVDGP | HGYYPGSPEE | TGAQHVQLAE | RFSDAALVSM | SVRELNRQLR | ||||
| GCGRDEALRL | KQRRRTLKNR | GYAQACRSKR | LQQRRGLEAE | RARLAAQLDA | ||||
| LRAEVARLAR | ERDLYKARCD | RLTSSGPGSG | DPSHLFL |
NRL регулює експресію кількох специфічних для паличок генів, наприклад RHO та PDE6B. Функціонує також як коактиватор транскрипції, стимулюючи транскрипцію, опосередковану транскрипційним фактором CRX і NR2E3. Зв’язується специфічним для послідовності способом з промотором родопсину.
Білки Crx (cone-rod homeobox), FIZ1 (Flt-3 interacting zinc finger) і TBP (TATA box binding protein) взаємодіють з NRL, щоб регулювати його транскрипційну активність в експресії цільового гена, родопсину.[10][11] У свою чергу, під час регуляції експресії певного гена сітківки NRL може посилювати або пригнічувати транскрипцію наступними посттрансляційними модифікаціями, таких як фосфорилювання, SUMO-лювання, ацетилювання та убіквітинування, та шляхом фізичної взаємодії з геномними цис-регуляторними послідовностями або іншими регуляторними білками[12][13].
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з NRL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ Kanda, Atsuhiro; Friedman, James S.; Nishiguchi, Koji M.; Swaroop, Anand (2007-06). Retinopathy mutations in the bZIP protein NRL alter phosphorylation and transcriptional activity. Human Mutation. Т. 28, № 6. с. 589—598. doi:10.1002/humu.20488. ISSN 1098-1004. PMID 17335001. Архів оригіналу за 20 січня 2022. Процитовано 20 січня 2022.
- ↑ а б Yang-Feng, T. L.; Swaroop, A. (1992-10). Neural retina-specific leucine zipper gene NRL (D14S46E) maps to human chromosome 14q11.1-q11.2. Genomics. Т. 14, № 2. с. 491—492. doi:10.1016/s0888-7543(05)80248-4. ISSN 0888-7543. PMID 1427865. Архів оригіналу за 20 січня 2022. Процитовано 20 січня 2022.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8002 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P54845 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ Mitton, Kenneth P.; Swain, Prabodh K.; Khanna, Hemant; Dowd, Mary; Apel, Ingrid J.; Swaroop, Anand (15 лютого 2003). Interaction of retinal bZIP transcription factor NRL with Flt3-interacting zinc-finger protein Fiz1: possible role of Fiz1 as a transcriptional repressor. Human Molecular Genetics. Т. 12, № 4. с. 365—373. doi:10.1093/hmg/ddg035. ISSN 0964-6906. PMID 12566383. Архів оригіналу за 20 січня 2022. Процитовано 20 січня 2022.
- ↑ Similar articles for PMID 12566383 - Search Results - PubMed. PubMed (англ.). Архів оригіналу за 20 січня 2022. Процитовано 20 січня 2022.
- ↑ Mitton, K. P.; Swain, P. K.; Chen, S.; Xu, S.; Zack, D. J.; Swaroop, A. (22 вересня 2000). The leucine zipper of NRL interacts with the CRX homeodomain. A possible mechanism of transcriptional synergy in rhodopsin regulation. The Journal of Biological Chemistry. Т. 275, № 38. с. 29794—29799. doi:10.1074/jbc.M003658200. ISSN 0021-9258. PMID 10887186. Архів оригіналу за 20 січня 2022. Процитовано 20 січня 2022.
{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання) - ↑ Friedman, James S.; Khanna, Hemant; Swain, Prabodh K.; Denicola, Raphael; Cheng, Hong; Mitton, Kenneth P.; Weber, Christian H.; Hicks, David; Swaroop, Anand (5 листопада 2004). The minimal transactivation domain of the basic motif-leucine zipper transcription factor NRL interacts with TATA-binding protein. The Journal of Biological Chemistry. Т. 279, № 45. с. 47233—47241. doi:10.1074/jbc.M408298200. ISSN 0021-9258. PMID 15328344. Архів оригіналу за 20 січня 2022. Процитовано 20 січня 2022.
{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання) - ↑ Roger, Jerome E.; Nellissery, Jacob; Kim, Douglas S.; Swaroop, Anand (13 серпня 2010). Sumoylation of bZIP transcription factor NRL modulates target gene expression during photoreceptor differentiation. The Journal of Biological Chemistry. Т. 285, № 33. с. 25637—25644. doi:10.1074/jbc.M110.142810. ISSN 1083-351X. PMC 2919127. PMID 20551322. Архів оригіналу за 20 січня 2022. Процитовано 20 січня 2022.
{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання) - ↑ NRL - Neural retina-specific leucine zipper protein - Homo sapiens (Human) - NRL gene & protein. www.uniprot.org (англ.). Архів оригіналу за 20 січня 2022. Процитовано 20 січня 2022.
|
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |