POU2F1

POU2F1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1CQT, 1E3O, 1GT0, 1HF0, 1O4X, 1OCT, 1POG
Ідентифікатори
Символи	POU2F1, OCT1, OTF1, oct-1B, POU class 2 homeobox 1, Oct1Z
Зовнішні ІД	OMIM: 164175 MGI: 101898 HomoloGene: 37658 GeneCards: POU2F1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity; • DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• ендоплазматичний ретикулум; • клітинне ядро; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • нуклеоплазма; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5451
	18986
	ENSG00000143190
	ENSMUSG00000026565
	P14859
	P25425
	NM_001198783; NM_001198786; NM_002697; NM_001365848; NM_001365849
	NM_011137; NM_198932; NM_198933; NM_198934; NM_001368808
	NP_001185712; NP_001185715; NP_002688; NP_001352777; NP_001352778
	NP_035267; NP_945150; NP_945151; NP_945152; NP_001355737
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POU2F1 (англ. POU class 2 homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 743 амінокислот, а молекулярна маса — 76 472^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNNPSETSKP	SMESGDGNTG	TQTNGLDFQK	QPVPVGGAIS	TAQAQAFLGH
LHQVQLAGTS	LQAAAQSLNV	QSKSNEESGD	SQQPSQPSQQ	PSVQAAIPQT
QLMLAGGQIT	GLTLTPAQQQ	LLLQQAQAQA	QLLAAAVQQH	SASQQHSAAG
ATISASAATP	MTQIPLSQPI	QIAQDLQQLQ	QLQQQNLNLQ	QFVLVHPTTN
LQPAQFIISQ	TPQGQQGLLQ	AQNLLTQLPQ	QSQANLLQSQ	PSITLTSQPA
TPTRTIAATP	IQTLPQSQST	PKRIDTPSLE	EPSDLEELEQ	FAKTFKQRRI
KLGFTQGDVG	LAMGKLYGND	FSQTTISRFE	ALNLSFKNMC	KLKPLLEKWL
NDAENLSSDS	SLSSPSALNS	PGIEGLSRRR	KKRTSIETNI	RVALEKSFLE
NQKPTSEEIT	MIADQLNMEK	EVIRVWFCNR	RQKEKRINPP	SSGGTSSSPI
KAIFPSPTSL	VATTPSLVTS	SAATTLTVSP	VLPLTSAAVT	NLSVTGTSDT
TSNNTATVIS	TAPPASSAVT	SPSLSPSPSA	SASTSEASSA	SETSTTQTTS
TPLSSPLGTS	QVMVTASGLQ	TAAAAALQGA	AQLPANASLA	AMAAAAGLNP
SLMAPSQFAA	GGALLSLNPG	TLSGALSPAL	MSNSTLATIQ	ALASGGSLPI
TSLDATGNLV	FANAGGAPNI	VTAPLFLNPQ	NLSLLTSNPV	SLVSAAAASA
GNSAPVASLH	ATSTSAESIQ	NSLFTVASAS	GAASTTTTAS	KAQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Sturm R.A., Das G., Herr W. (1988). The ubiquitous octamer-binding protein Oct-1 contains a POU domain with a homeo box subdomain. Genes Dev. 2: 1582—1599. PMID 2905684 DOI:10.1101/gad.2.12a.1582
Luchina N.N., Krivega I.V., Pankratova E.V. (2003). Human Oct-1L isoform has tissue-specific expression pattern similar to Oct-2. Immunol. Lett. 85: 237—241. PMID 12663137 DOI:10.1016/S0165-2478(02)00179-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Segil N., Roberts S.B., Heintz N. (1991). Mitotic phosphorylation of the Oct-1 homeodomain and regulation of Oct-1 DNA binding activity. Science. 254: 1814—1816. PMID 1684878 DOI:10.1126/science.1684878
Mahajan S.S., Wilson A.C. (2000). Mutations in host cell factor 1 separate its role in cell proliferation from recruitment of VP16 and LZIP. Mol. Cell. Biol. 20: 919—928. PMID 10629049 DOI:10.1128/MCB.20.3.919-928.2000
Wysocka J., Herr W. (2003). The herpes simplex virus VP16-induced complex: the makings of a regulatory switch. Trends Biochem. Sci. 28: 294—304. PMID 12826401 DOI:10.1016/S0968-0004(03)00088-4

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9212 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-16 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P14859 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9212 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-16 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P14859 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

POU2F1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук