TAF7

TAF7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4RGW, 5FUR
Ідентифікатори
Символи	TAF7, TAF2F, TAFII55, TATA-box binding protein associated factor 7
Зовнішні ІД	OMIM: 600573 MGI: 1346348 HomoloGene: 133942 GeneCards: TAF7
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • thyroid hormone receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • vitamin D receptor binding • protein heterodimerization activity • H3K27me3 modified histone binding • TFIIH-class transcription factor complex binding • P-TEFb complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • комплекс Ґольджі • transcription factor TFTC complex • MLL1 complex • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription regulator complex • transcription factor TFIID complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of protein kinase activity • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • spermine transport • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • DNA-templated transcription, initiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of histone acetylation • intracellular estrogen receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6879	24074
Ensembl	ENSG00000178913	ENSMUSG00000051316
UniProt	Q15545	Q9R1C0
RefSeq (мРНК)	NM_005642	NM_175770
RefSeq (білок)	NP_005633	NP_786964
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.26 – 141.32 Mb	Хр. 18: 37.77 – 37.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF7 (англ. TATA-box binding protein associated factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 349 амінокислот, а молекулярна маса — 40 259.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKSKDDAPH		ELESQFILRL		PPEYASTVRR		AVQSGHVNLK		DRLTIELHPD
GRHGIVRVDR		VPLASKLVDL		PCVMESLKTI		DKKTFYKTAD		ICQMLVSTVD
GDLYPPVEEP		VASTDPKASK		KKDKDKEKKF		IWNHGITLPL		KNVRKRRFRK
TAKKKYIESP		DVEKEVKRLL		STDAEAVSTR		WEIIAEDETK		EAENQGLDIS
SPGMSGHRQG		HDSLEHDELR		EIFNDLSSSS		EDEDETQHQD		EEDINIIDTE
EDLERQLQDK		LNESDEQHQE		NEGTNQLVMG		IQKQIDNMKG		KLQETQDRAK
RQEDLIMKVE		NLALKNRFQA		VLDELKQKED		REKEQLSSLQ		EELESLLEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

• Chiang C.-M., Roeder R.G. (1995). Cloning of an intrinsic human TFIID subunit that interacts with multiple transcriptional activators. Science. 267: 531—536. PMID 7824954 DOI:10.1126/science.7824954
• Zhou T., Chiang C.-M. (2001). The intronless and TATA-less human TAFII55 gene contains a functional initiator and a downstream promoter element. J. Biol. Chem. 276: 25503—25511. PMID 11340078 DOI:10.1074/jbc.M102875200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wu S.Y., Thomas M.C., Hou S.Y., Likhite V., Chiang C.M. (1999). Isolation of mouse TFIID and functional characterization of TBP and TFIID in mediating estrogen receptor and chromatin transcription. J. Biol. Chem. 274: 23480—23490. PMID 10438527 DOI:10.1074/jbc.274.33.23480
• Couture J.-F., Collazo E., Hauk G., Trievel R.C. (2006). Structural basis for the methylation site specificity of SET7/9. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 140—146. PMID 16415881 DOI:10.1038/nsmb1045
• Kloet S.L., Whiting J.L., Gafken P., Ranish J., Wang E.H. (2012). Phosphorylation-dependent regulation of cyclin D1 and cyclin A gene transcription by TFIID subunits TAF1 and TAF7. Mol. Cell. Biol. 32: 3358—3369. PMID 22711989 DOI:10.1128/MCB.00416-12

Див. також

• Хромосома 5