ATF6

ATF6
Ідентифікатори
Символи	ATF6, ATF6A, ACHM7, activating transcription factor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 605537 MGI: 1926157 HomoloGene: 32015 GeneCards: ATF6
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Паркінсона, achromatopsia 7, achromatopsia
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein heterodimerization activity • ubiquitin protein ligase binding • cAMP response element binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • nuclear envelope • мембрана • endoplasmic reticulum membrane • Golgi membrane • нуклеоплазма • integral component of endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • розвиток ока • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • Відповідь на незгорнуті білки • ATF6-mediated unfolded protein response • response to unfolded protein • згортання білків • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зір • positive regulation of apoptotic process • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of ATF6-mediated unfolded protein response Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22926	226641
Ensembl	ENSG00000118217	ENSMUSG00000026663
UniProt	P18850	F6VAN0
RefSeq (мРНК)	NM_007348	NM_001081304
RefSeq (білок)	NP_031374	NP_001074773
Локус (UCSC)	Хр. 1: 161.77 – 161.98 Mb	Хр. 1: 170.53 – 170.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATF6 (англ. Activating transcription factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 670 амінокислот, а молекулярна маса — 74 585.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGEPAGVAGT		MESPFSPGLF		HRLDEDWDSA		LFAELGYFTD		TDELQLEAAN
ETYENNFDNL		DFDLDLMPWE		SDIWDINNQI		CTVKDIKAEP		QPLSPASSSY
SVSSPRSVDS		YSSTQHVPEE		LDLSSSSQMS		PLSLYGENSN		SLSSAEPLKE
DKPVTGPRNK		TENGLTPKKK		IQVNSKPSIQ		PKPLLLPAAP		KTQTNSSVPA
KTIIIQTVPT		LMPLAKQQPI		ISLQPAPTKG		QTVLLSQPTV		VQLQAPGVLP
SAQPVLAVAG		GVTQLPNHVV		NVVPAPSANS		PVNGKLSVTK		PVLQSTMRNV
GSDIAVLRRQ		QRMIKNRESA		CQSRKKKKEY		MLGLEARLKA		ALSENEQLKK
ENGTLKRQLD		EVVSENQRLK		VPSPKRRVVC		VMIVLAFIIL		NYGPMSMLEQ
DSRRMNPSVS		PANQRRHLLG		FSAKEAQDTS		DGIIQKNSYR		YDHSVSNDKA
LMVLTEEPLL		YIPPPPCQPL		INTTESLRLN		HELRGWVHRH		EVERTKSRRM
TNNQQKTRIL		QGALEQGSNS		QLMAVQYTET		TSSISRNSGS		ELQVYYASPR
SYQDFFEAIR		RRGDTFYVVS		FRRDHLLLPA		TTHNKTTRPK		MSIVLPAINI
NENVINGQDY		EVMMQIDCQV		MDTRILHIKS		SSVPPYLRDQ		QRNQTNTFFG
SPPAATEATH		VVSTIPESLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, відповідь на порушення конформації білку, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Zhu C., Johansen F.E., Prywes R. (1997). Interaction of ATF6 and serum response factor. Mol. Cell. Biol. 17: 4957—4966. PMID 9271374 DOI:10.1128/MCB.17.9.4957
• Yoshida H., Haze K., Yanagi H., Yura T., Mori K. (1998). Identification of the cis-acting endoplasmic reticulum stress response element responsible for transcriptional induction of mammalian glucose-regulated proteins; involvement of basic-leucine zipper transcription factors. J. Biol. Chem. 273: 33741—33749. PMID 9837962 DOI:10.1074/jbc.273.50.33741
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers. Genes Dev. 3: 2083—2090. PMID 2516827 DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
• Haze K., Yoshida H., Yanagi H., Yura T., Mori K. (1999). Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress. Mol. Biol. Cell. 10: 3787—3799. PMID 10564271 DOI:10.1091/mbc.10.11.3787
• Yoshida H., Matsui T., Yamamoto A., Okada T., Mori K. (2001). XBP1 mRNA is induced by ATF6 and spliced by IRE1 in response to ER stress to produce a highly active transcription factor. Cell. 107: 881—891. PMID 11779464 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00611-0

Див. також

• Хромосома 1