Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
SP7
Ідентифікатори
Символи
SP7 , OI11, OI12, OSX, osterix, Sp7 transcription factor
Зовнішні ІД
OMIM : 606633 MGI: 2153568 HomoloGene: 15607 GeneCards: SP7
Пов'язані генетичні захворювання
osteogenesis imperfecta type 12 [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес
• osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • hematopoietic stem cell differentiation • positive regulation of stem cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 53.33 – 53.35 Mb
Хр. 15: 102.27 – 102.28 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
SP7 (англ. Sp7 transcription factor 7 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот , а молекулярна маса — 44 718[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MASSLLEEEA HYGSSPLAML TAACSKFGGS SPLRDSTTLG KGGTKKPYAD
LSAPKTMGDA YPAPFSSTNG LLSPAGSPPA PASGYANDYP PFPHSFPGPT
GAQDPGLLVP KGHSSSDCLP SVYTSLDMTH PYGSWYKAGI HAGISPGPGN
TPTPWWDMHP GGNWLGGGQG QGDGLQGTLS TGPAQPPLNP QLPTYPSDFA
PLNPAPYPAP HLLQPGPQHV LPQDVYKPKA VGNSGQLEGS GAAKPPRGAG
TGGSGGYAGS GAGRSTCDCP NCQELERLGA AAAGLRKKPI HSCHIPGCGK
VYGKASHLKA HLRWHTGERP FVCNWLFCGK RFTRSDELER HVRTHTREKK
FTCLLCSKRF TRSDHLSKHQ RTHGEPGPGP PPSGPKELGE GRSVGEEEAN
QPPRSSTSPA PPEKAHGGSP EQSNLLEI
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Sinha K.M., Yasuda H., Coombes M.M., Dent S.Y., de Crombrugghe B. (2010). Regulation of the osteoblast-specific transcription factor Osterix by NO66, a Jumonji family histone demethylase. EMBO J . 29 : 68—79. PMID 19927124 DOI :10.1038/emboj.2009.332
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші