HOXC6

HOXC6
Ідентифікатори
Символи	HOXC6, CP25, HHO.C8, HOX3, HOX3C, homeobox C6
Зовнішні ІД	OMIM: 142972 MGI: 96197 HomoloGene: 19533 GeneCards: HOXC6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • anterior/posterior pattern specification; • embryonic skeletal system development; • negative regulation of nucleic acid-templated transcription; • multicellular organism development; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3223
	15425
	ENSG00000197757
	ENSMUSG00000001661
	P09630
	P10629
	NM_153693; NM_004503
	NM_010465
	NP_004494; NP_710160
	NP_034595
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXC6 (англ. Homeobox C6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 235 амінокислот, а молекулярна маса — 26 915^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNSYFTNPSL	SCHLAGGQDV	LPNVALNSTA	YDPVRHFSTY	GAAVAQNRIY
STPFYSPQEN	VVFSSSRGPY	DYGSNSFYQE	KDMLSNCRQN	TLGHNTQTSI
AQDFSSEQGR	TAPQDQKASI	QIYPWMQRMN	SHSGVGYGAD	RRRGRQIYSR
YQTLELEKEF	HFNRYLTRRR	RIEIANALCL	TERQIKIWFQ	NRRMKWKKES
NLTSTLSGGG	GGATADSLGG	KEEKREETEE	EKQKE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Simeone A., Pannese M., Acampora D., D'Esposito M., Boncinelli E. (1988). At least three human homeoboxes on chromosome 12 belong to the same transcription unit. Nucleic Acids Res. 16: 5379—5390. PMID 2898768 DOI:10.1093/nar/16.12.5379
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5128 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P09630 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.