HMGN1

HMGN1
Ідентифікатори
Символи	HMGN1, HMG14, high mobility group nucleosome binding domain 1
Зовнішні ІД	OMIM: 163920 HomoloGene: 3643 GeneCards: HMGN1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleosomal DNA binding • DNA binding • chromatin binding Клітинна компонента • цитоплазма • Хроматин • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation • pyrimidine dimer repair by nucleotide-excision repair • transcription-coupled nucleotide-excision repair • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • response to UV-B • response to UV-C • regulation of development, heterochronic • post-embryonic camera-type eye morphogenesis • regulation of epithelial cell proliferation • positive regulation of NAD+ ADP-ribosyltransferase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3150	100911295
Ensembl	ENSG00000205581	н/д
UniProt	P05114	Q5U1W8
RefSeq (мРНК)	NM_004965	XM_003751029
RefSeq (білок)	NP_004956	NP_001013202
Локус (UCSC)	Хр. 21: 39.34 – 39.35 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HMGN1 (англ. High mobility group nucleosome binding domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 100 амінокислот, а молекулярна маса — 10 659.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPKRKVSSAE		GAAKEEPKRR		SARLSAKPPA		KVEAKPKKAA		AKDKSSDKKV
QTKGKRGAKG		KQAEVANQET		KEDLPAENGE		TKTEESPASD		EAGEKEAKSD

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін

V: Валін

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Louie D.F., Gloor K.K., Galasinski S.C., Resing K.A., Ahn N.G. (2000). Phosphorylation and subcellular redistribution of high mobility group proteins 14 and 17, analyzed by mass spectrometry. Protein Sci. 9: 170—179. PMID 10739259 DOI:10.1110/ps.9.1.170
• Zougman A., Ziolkowski P., Mann M., Wisniewski J.R. (2008). Evidence for insertional RNA editing in humans. Curr. Biol. 18: 1760—1765. PMID 18993075 DOI:10.1016/j.cub.2008.09.059
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
• Landsman D., Srikantha T., Westermann R., Bustin M. (1986). Chromosomal protein HMG-14. Complete human cDNA sequence and evidence for a multigene family. J. Biol. Chem. 261: 16082—16086. PMID 3782107

Див. також

• Хромосома 21