HOPX

HOPX
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UHS, 2HI3
Ідентифікатори
Символи	HOPX, CAMEO, HOD, HOP, LAGY, NECC1, OB1, SMAP31, TOTO, HOP homeobox
Зовнішні ІД	OMIM: 607275 MGI: 1916782 HomoloGene: 15859 GeneCards: HOPX
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell differentiation • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • trophectodermal cell differentiation • chaperone-mediated protein complex assembly • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84525	74318
Ensembl	ENSG00000171476	ENSMUSG00000059325
UniProt	Q9BPY8	Q8R1H0
RefSeq (мРНК)	NM_001145459 NM_001145460 NM_032495 NM_139211 NM_139212	NM_001159900 NM_001159901 NM_175606
RefSeq (білок)	NP_001138931 NP_001138932 NP_115884 NP_631957 NP_631958	NP_001153372 NP_001153373 NP_783199
Локус (UCSC)	Хр. 4: 56.65 – 56.68 Mb	Хр. 5: 77.23 – 77.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOPX (англ. HOP homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 73 амінокислот, а молекулярна маса — 8 260.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAETASGPT		EDQVEILEYN		FNKVDKHPDS		TTLCLIAAEA		GLSEEETQKW
FKQRLAKWRR		SEGLPSECRS		VTD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Chen Y., Petersen S., Pacyna-Gengelbach M., Pietas A., Petersen I. (2003). Identification of a novel homeobox-containing gene, LAGY, which is downregulated in lung cancer. Oncology. 64: 450—458. PMID 12759545 DOI:10.1159/000070306
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4