JP2014512812A5 - - Google Patents

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その他の実施態様においては、抗体又は抗原結合性タンパク質は、抗WT1−scFvであるか、又はHLA−A0201と連結してアミノ酸配列RMFPNAPYL(配列番号1)を有するペプチドに特異的に結合する、配列番号36のアミノ酸配列を含む抗原結合性領域を有するその抗原結合性断片である。他の実施態様においては、抗WT1抗体は、scFv−Fc融合タンパク質、又はVH及びVL領域若しくは表2から選択されるCDRを有する完全長ヒトIgGである。
Figure 2014512812
その他の実施態様においては、抗体又は抗原結合性タンパク質は、抗WT1−scFvであるか、又はHLA−A0201と連結してアミノ酸配列RMFPNAPYL(配列番号1)を有するペプチドに特異的に結合する、配列番号54のアミノ酸配列を含む抗原結合性領域を有するその抗原結合性断片である。他の実施態様においては、抗WT1抗体は、scFv−Fc融合タンパク質、又はVH及びVL領域若しくは表3から選択されるCDRを有する完全長ヒトIgGである。
Figure 2014512812
その他の実施態様においては、抗体又は抗原結合性タンパク質は、抗WT1−scFvであるか、又はHLA−A0201と連結してアミノ酸配列RMFPNAPYL(配列番号1)を有するペプチドに特異的に結合する、配列番号72のアミノ酸配列を含む抗原結合性領域を有するその抗原結合性断片である。他の実施態様においては、抗WT1抗体は、scFv−Fc融合タンパク質、又はVH及びVL領域若しくは表4から選択されるCDRを有する完全長ヒトIgGである。
Figure 2014512812
その他の実施態様においては、抗体又は抗原結合性タンパク質は、抗WT1−scFvであるか、又はHLA−A0201と連結してアミノ酸配列RMFPNAPYL(配列番号1)を有するペプチドに特異的に結合する、配列番号90のアミノ酸配列を含む抗原結合性領域を有するその抗原結合性断片である。他の実施態様においては、抗WT1抗体は、scFv−Fc融合タンパク質、又はVH及びVL領域若しくは表5から選択されるCDRを有する完全長ヒトIgGである。
Figure 2014512812
その他の実施態様においては、抗体又は抗原結合性タンパク質は、抗WT1−scFvであるか、又はHLA−A0201と連結してアミノ酸配列RMFPNAPYL(配列番号1)を有するペプチドに特異的に結合する、配列番号108のアミノ酸配列を含む抗原結合性領域を有するその抗原結合性断片である。他の実施態様においては、抗WT1抗体は、scFv−Fc融合タンパク質、又はVH及びVL領域若しくは表6から選択されるCDRを有する完全長ヒトIgGである。
Figure 2014512812
ある実施態様では、定常領域/フレームワーク領域は、例えば、アミノ酸の置換により抗体の特性を修正するために改変される(例えば、1又はそれ以上の、抗原結合親和性、Fc受容体結合、例えば、グリコシル化、フコシル化などの抗体の炭水化物、システイン残基の数、エフェクター細胞の機能、補完機能、又は結合部位の導入を増加又は減少させるため)。さらに、薬物、毒素、放射性同位体、サイトカイン、炎症性ペプチド、又は細胞傷害性剤に対する抗体の結合も考えられる。
一旦選択すると、陽性のscFvクローンを、間接的なフローサイトメトリーによって、T2生細胞表面上のHLA−A2/ペプチド複合体へのそれらの結合について試験する。簡潔には、ファージクローンを、W1−Aペプチド又は無関係なペプチド(コントロール)でパルスしたT2細胞とともにインキュベートする。細胞を、次いで、マウス抗M13コートタンパク質モノクローナル抗体とともに洗浄する。細胞を再び洗浄し、フローサイトメトリーに先立って、FITC−ヤギ(Fab)抗マウスIgで標識する。
《材料》
細胞サンプル、細胞株、及び抗体
メモリアルスローンケタリングがんセンター治験審査委員会のインフォームドコンセントにプロトコルが承認された後、HLA型の健康ドナー及び患者からの末梢血単核細胞(PBMC)を、フィコール密度遠心分離によって得た。ヒト中皮腫細胞株を得るためのソースは、前述されている(29)。細胞株は、H−Meso1A、JMN、VAMT、H2452、H2373、H28、MSTO、Meso11、Meso34、Meso37、Meso47、及びMeso56を含む。すべての細胞は、メモリアルスローンケタリングがんセンターの細胞免疫学教室によってHLA型とされた。白血病細胞株LAMA81、BV173、及び697、(WT1+、A0201+)は、HJ Stauss博士(ロンドン大学、ロンドン、イギリス)によって,親切にも提供された。メラノーマ細胞株MeWo(WT1−、A201+)、SKLY16(B細胞リンパ腫、WT1‐、A0201+)、K562、RwLeu4、及びHL60、全てのWT1+白血病、及びTAP欠損T2細胞株を、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクションから得た。細胞株を、5%FCS、ペニシリン、ストレプトマイシン、グルタミン2mmol/L、及び2−メルカプトエタノールを補充したRPMI1640中で、37、5%のCO で培養した。
造血細胞株、付着細胞株[非酵素的細胞ストリッパー(name)を用いて回収]、正常なドナー及びAML患者由来の末梢血単核細胞を、前述のように得た。細胞をPBSで一度洗浄し、PBS中の2%ヒト血清中において、0で10細胞/mLで再懸濁した。細胞(10チューブで2回実施)を、氷上で45分間、125−I標識WT1AB1(1μg/mL)とともにインキュベートし、次に、PBS内の1%ウシ血清アルブミンを用いて、0で広範囲に洗浄した。特異的結合を決定するために、50過剰量非標識WT1AB1存在下で、氷上で20分間プレインキュベーションした後に、細胞の2つのセットを評価した。結合放射線を、ガンマカウンターによって測定し、特異的結合を決定し、細胞辺りの結合した抗体の数を、比放射能から計算した。
次の重要な問題は、WT1ab1が細胞表面上のHLA−A0201分子によって提示され、自然に処理されたWT1エピトープRMFを認識できたかどうかであった。細胞株のパネルは、WT1mRNA及びHLA遺伝子型(表13)の発現に基づいて選択された。
Figure 2014512812
予想されたように、WT1AB1の結合の強さも、中皮腫細胞H2373、白血病細胞株697とLAMA、及び骨髄腫細胞株U266に示すように、直接HLA−A0201分子の発現レベルと関連付けられているように思われた。これらの細胞株は、WT1転写物及びHLA−A2の両方に陽性であり、HLA−A2の発現レベルは低く(表13)、モノクローナル抗体は結合を示さなかった。一方、T2細胞を用いて得られた結果は、HLA−A2分子を高レベルで発現させたT2細胞として単独でHLA−A0201へ結合する、WT1ab1の可能性に反論する。特に、WT1ab1は単独では、又はR3及びEwing肉腫由来のような他のHLA−A0201結合ペプチド、又はRMFペプチドのヘテロクリティックペプチドであるWT1−A1でパルスしても、T2細胞に結合しない。これら2種のペプチドは、T2安定化アッセイ(28)において、HLA−A0201分子に対する高い親和性が示されている。これらの結果は、WT1ab1認識が、複合体においてRMFペプチドとA0201分子の共同で構成されるエピトープに特異的であったという強い証拠を提供した。WT1ab3及びWT1ab5の2つの他のモノクローナル抗体の、BV173及びJMN細胞に対する結合もまた、WT1ab1より弱かった。
《実施例5》
細胞上のWT1ab1結合部位の定量化
125I標識WT1ab1を用いた放射免疫測定を、抗体のWT1HLA−A0201細胞株に対する特異性を確認するため、親和定数を決定するため、かつ細胞株のパネル上の細胞当たりの抗体結合部位の数を評価するために、用いた。JMN細胞への結合に基づくスキャッチャード分析は、約0.2nMの親和定数を示した(図23)。この数値は、Forte Bio装置を用いて、干渉分光法により確認した。125I標識WT1ab1を、抗体のWT1 HLA−A0201細胞株に対する特異性を確認するため、及び細胞株のパネル上の抗体結合部位の数を評価するために用いた(図24)。二価のモノクローナル抗体が表面上の1又は2の複合体に結合しているかどうかを、我々は判断できないため、細胞当たりのエピトープの合計は、モノクローナル抗体結合部位の数の二倍になることがある。再度、WT1ab1は、HLA−A0201及びWT1mRNAの両方に陽性である、JMN、ALL−3、BA25、BV173に結合したが、HLA−A0201陰性(HL60)又はWT1mRNA陰性(SKLY−16)には結合しなかった。WT1ab1は、HLA−A0201及びWT1の両方に陽性の697細胞には結合しなったが、低レベルのHLA−A0201(表13)を含んでおり、あるレベルのMHC複合体の総数が、WT1ab1結合のための十分なWT1ペプチドが存在するために必要であると確認した。RMFでパルスしたT2は最も多い数のモノクローナル抗体と結合し(50000/細胞)、次いで、細胞辺り〜6×10WT1ab1分子と結合したJMN細胞であり、これは、それぞれが一価又は二価抗体結合だと想定して、1細胞辺り、6×10及び1.2×10RMFペプチド/A2複合体を翻訳したこととなる。3個の白血病陽性細胞株は、1×10及び2×10WT1ab1分子、又は2×10及び4×10の結合部位と結合した(図24)。これらの結果を、定量的フローサイトメトリーによって確認した。

Claims (41)

  1. (A)(i)配列番号2、3、及び4のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域、並びに配列番号8、9、及び10のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;
    (ii)配列番号20、21、及び22のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域、並びに配列番号26、27、及び28のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;
    (iii)配列番号38、39、及び40のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域、並びに配列番号44、45、及び46から選択されるアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;
    (iv)配列番号56、57、及び58のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域、並びに配列番号62、63、及び64のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;
    (v)配列番号74、75、及び76のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域、並びに配列番号80、81、及び82のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;若しくは
    (vi)配列番号92、93、及び94のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域、並びに配列番号98、99、及び100のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;又は
    (B)配列番号14及び16、32及び34、50及び52、68及び70、86及び88、並びに104及び106から選択される第一及び第二アミノ酸配列を含むV及びV;又は
    (C)配列番号18、36、54、72、90、及び108から選択されるアミノ酸配列
    のうちの1を含む単離された抗体、若しくはその抗原結合性断片。
  2. (A)(i)配列番号2、3、及び4;(ii)20、21、及び22;(iii)38、39、及び40;(iv)56、57、及び58;(v)74、75、及び76;並びに(vi)92、93、及び94から選択されるアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域;及び
    (B)(i)配列番号8、9、及び10;(ii)26、27、及び28;(iii)44、45、及び46;(iv)62、63、及び64;(v)80、81、及び82;並びに(vi)98、99、及び100から選択されるアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域
    を含む単離された抗体、若しくはその抗原結合性断片。
  3. (i)配列番号14及び16;(ii)32及び34;(iii)50及び52;(iv)68及び70;(v)86及び88;並びに(vi)104及び106から選択される第一及び第二アミノ酸配列をそれぞれ含むV及びV
    を含む単離された抗体、若しくはその抗原結合性断片。
  4. 配列番号18、36、54、72、90、及び108から選択されるアミノ酸配列
    を含む単離された抗体、若しくはその抗原結合性断片。
  5. 抗体が、ヒト可変領域フレームワーク領域を含む、請求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体。
  6. 抗体が、完全ヒト抗体である、請求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体。
  7. 抗体が、HLA−A2に結合したWT1ペプチドに特異的に結合する、請求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体。
  8. WT1が、アミノ酸配列RMFPNAPYLを有する、請求項7に記載の抗体。
  9. HLA−A2が、HLA−A0201である、請求項7に記載の抗体。
  10. 抗体の抗原結合性領域が、Fab、Fab’、F(ab’)、Fv、又は単鎖Fv(scFv)である、請求項1〜9のいずれか1項に記載の抗体。
  11. 治療薬に結合した、請求項1〜9のいずれか1項に記載の抗体。
  12. 治療薬が、薬剤、毒素、放射性同位体、タンパク質、又はペプチドである、請求項11に記載の抗体。
  13. 請求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体をコードしている単離された核酸。
  14. (A)(i)配列番号5、6、及び7;23、24、及び25;41、42、及び43;58、59、及び60;77、78、及び79;並びに95、96、及び97からなる群から選択される第一、第二、及び第三ヌクレオチド配列;及び
    (ii)配列番号11、12、及び13;29、30、及び31;47、48、及び49;65、66、及び67;83、84、及び85;並びに101、102、及び103からなる群から選択される第四、第五、及び第六ヌクレオチド配列;又は
    (B)配列番号15及び17、33及び35、51及び53、69及び71、87及び89、並びに105及び107からなる群から選択される第一及び第二ヌクレオチド配列;又は
    (C)配列番号19、37、55、73、91、及び109からなる群から選択されるヌクレオチド配列
    を含む単離された核酸。
  15. (A)配列番号(i)5、6、及び7;(ii)23、24、及び25;(iii)41、42、及び43;(iv)58、59、及び60;(v)77、78、及び79;並びに(vi)95、96、及び97からなる群から選択される第一、第二、及び第三ヌクレオチド配列;及び
    (B)配列番号(vii)11、12、及び13;(viii)29、30、及び31;(ix)47、48、及び49;(x)65、66、及び67;(xi)83、84、及び85;並びに(xii)101、102、及び103からなる群から選択される第四、第五、及び第六ヌクレオチド配列
    を含む単離された核酸。
  16. 第一、第二、及び第三ヌクレオチド配列が、抗体のHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3をそれぞれコードし、第四、第五、及び第六ヌクレオチド配列が、抗体のLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3をそれぞれコードする、請求項15に記載の核酸。
  17. 配列番号(i)15及び17;(ii)33及び35;(iii)51及び53;(iv)69及び71;(v)87及び89;並びに(vi)105及び107からなる群から選択される第一及び第二ヌクレオチド配列をそれぞれ含む単離された核酸。
  18. 第一ヌクレオチド配列が、抗体のVをコードし、第二ヌクレオチド配列が抗体のVをコードする、請求項17に記載の核酸。
  19. 配列番号19、37、55、73、91、及び109からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む核酸。
  20. 核酸が、scFvをコードする、請求項19に記載の核酸。
  21. 請求項13〜20のいずれか1項に記載の核酸を含むベクター。
  22. 請求項13〜20のいずれか1項に記載の核酸を含む細胞。
  23. その表面に請求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体を発現させる、請求項22に記載の細胞。
  24. 全細胞又は組織中のWT1を探知する方法であって、
    (A)細胞又は組織に、HLA−A2に結合するWT1ペプチドに特異的に結合する、探知可能な標識を含む抗体又はその抗原結合性断片と接触させ;
    (B)抗体に結合した量が、細胞又は組織中のWT1の量を示し、細胞又は組織に関連した探知可能な標識の量を測定することにより、細胞又は組織に結合した抗体の量を決定すること
    を含む方法。
  25. 抗体が、アミノ酸配列RMFPNAPYL(配列番号1)を有するHLA−A2に結合したWT1ペプチドに特異的に結合する、請求項24に記載の方法。
  26. WT1ペプチドが、HLA−A0201に結合する、請求項25に記載の方法。
  27. 請求項24に記載の方法であって、抗体が、
    (A)(i)配列番号2、3、及び4のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域;並びに配列番号8、9、及び10のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;
    (ii)配列番号20、21、及び22のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域;並びに配列番号26、27、及び28のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;
    (iii)配列番号38、39、及び40のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域;並びに配列番号44、45、及び46から選択されるアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;
    (iv)配列番号56、57、及び58のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域;並びに配列番号62、63、及び64のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;
    (v)配列番号74、75、及び76のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域;並びに配列番号80、81、及び82のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;若しくは
    (vi)配列番号92、93、及び94のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC−CDR1、HC−CDR2、及びHC−CDR3を含む重鎖可変領域;並びに配列番号98、99、及び100のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC−CDR1、LC−CDR2、及びLC−CDR3を含む軽鎖可変領域;又は
    (B)配列番号14及び16;32及び34;50及び52;68及び70;86及び88;並びに104及び106から選択される第一及び第二アミノ酸配列を含むV及びV、又は
    (C)配列番号18、36、54、72、90及び108から選択されるアミノ酸配列
    のうちの1を含む単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  28. 請求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体を含むキット。
  29. 求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体を含む、WT1陽性疾患治療用の医薬組成物
  30. 請求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体及び薬学的に許容可能な担体を含む医薬組成物。
  31. 治療的に効果のある量の請求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体又はその抗原結合性断片を含むWT1陽性疾患患者治療用の医薬組成物
  32. WT1陽性疾患が、慢性白血病、急性白血病、又はWT1腫瘍である、請求項31に記載の医薬組成物
  33. WT1陽性疾患が、慢性骨髄性白血病、多発性骨髄腫(MM)、急性リンパ性白血病(ALL)、急性骨髄/骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、中皮腫、卵巣癌、消化管癌、乳癌、前立腺癌、及びグリア芽腫からなる群から選択される、請求項31に記載の医薬組成物
  34. 抗体が、抗体に結合する細胞傷害性部分を有する結合体である、請求項31に記載の医薬組成物
  35. 治療的に効果のある量の請求項13〜20のいずれか1項に記載の核酸を含む、WT1陽性疾患患者治療用の医薬組成物
  36. WT1陽性疾患が、慢性白血病、急性白血病、又はWT1腫瘍である、請求項35に記載の医薬組成物
  37. WT1陽性疾患が、慢性骨髄性白血病、多発性骨髄腫(MM)、急性リンパ性白血病(ALL)、急性骨髄/骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、中皮腫、卵巣癌、消化管癌、乳癌、前立腺癌、及びグリア芽腫からなる群から選択される、請求項36に記載の医薬組成物
  38. 求項13〜20のいずれか1項に記載の核酸を含む、WT1陽性疾患治療用の医薬組成物
  39. 請求項13〜20のいずれか1項に記載の核酸を含む、医薬組成物。
  40. LA−A2に結合したWT1ペプチドに特異的に結合する抗体又はその抗原結合性断片を含、WT1 細胞を死滅させるための医薬組成物
  41. 抗体又はその抗原結合性断片が、それらに結合する細胞傷害性部分を有する、請求項40に記載の医薬組成物
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