LRRIQ3

LRRIQ3
LRRIQ3
식별자
에일리어스LRRIQ3, LRRC44, 류신이 풍부한 리피트 및 IQ 모티브는 3, 류신이 풍부한 리피트 및 IQ 모티브는 3
외부 IDOMIM: 617957 MGI: 1921685 HomoloGene: 23668 GenCard: LRRIQ3
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

127255

74435

앙상블

ENSG00000162620

ENSMUSG000028182

유니프로트

A6PVS8
H0Y5F9

Q14DL3

RefSeq(mRNA)

NM_001105659
NM_145258
NM_001322315

NM_028938

RefSeq(단백질)

NP_001099129
NP_001309244

NP_083214

장소(UCSC)Chr 1: 74.03 ~74.2 MbChr 3: 154.8 ~154.9 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

LRRC44로도 알려진 LRRIQ3(류신이 풍부한 반복 및 IQ 모티브 3 포함)는 LRRIQ3 [5]유전자에 의해 인체에서 암호화되는 단백질이다.그것은 주로 고환에서 발현되며 많은 [6]질병과 관련이 있다.

진

궤적

LRRIQ3는 1p31.[7]1에서 인간 염색체 1의 짧은 팔 끝의 마이너스 가닥에서 발견된다.

전체적인 구조

LRRIQ3의 [7]추정 시퀀스에는 총 7개의 엑손이 있습니다.

mRNA

표현

LRRIQ3는 2개의 1차 이소형식으로 표현되며,[7] 각각 624개의 아미노산 길이와 464개의 아미노산 길이의 단백질을 생성한다.인간 및 갈색 쥐 [8][9]조직에서 낮은 수준으로 발현되며 고환 조직에서 가장 높은 발현 수준으로 발현됩니다.T 세포, 부고환, 신장, 그리고 많은 [10]분비샘에서 비교적 높은 발현 수준이 존재한다.

단백질

일반적인 특징과 구성 특징

인간단백질 LRRIQ3 Isoform 1은 아미노산 624개로 구성되며 분자량은 73.7kDa이다.LRRIQ3의 등전점은 9.73으로, 이는 LRRIQ3가 정상 생리학적 pH(~7.4)[11]에서 염기성임을 의미한다.또한 인간 LRRIQ3가 항체염색으로부터 [12]혈장막에 국재한다는 강력한 증거가 있다.LRRIQ3에는 리신 잔기가 풍부하여 총 82개의 리신이 있습니다.그것은 또한 글리신 [13]함량이 약간 낮습니다.

도메인과 모티브

LRRIQ3에는 총 4개의 보존 도메인이 있으며, 3개의 류신이 풍부한 반복 도메인과 1개의 IQ 칼모듈린 결합 [13]모티브가 있다.류신이 풍부한 반복은 전형적으로 단백질-단백질 상호작용에 관여하며 특징적인 [14][15]α/β 편자주름을 형성한다.IQ 모티브는 칼모듈린([16]CaM) 또는 CaM 유사 단백질의 결합 부위를 제공한다.

세컨더리 및 세컨더리 구조

LRRIQ3는 긴 알파 나선형 C 말단 도메인을 포함한 구조에서 대부분 알파 나선형일 것으로 예측된다.그것은 또한 [17][18][19][20]단량체 역할을 할 것으로 예상된다.

LRRIQ3용 I-TASSER가[21] 생성한 최고의 모델입니다.류신이 풍부한 3회 반복은 각각 빨간색, 연어, 마젠타로 표시됩니다.IQ 칼모듈린 결합 도메인은 녹색으로 표시됩니다.

번역 후 수정

LRRIQ3는 많은 번역 후 수정을 겪을 것으로 예상된다.여기에는 O-GlcNAcylation, SMOylation, 유비퀴티네이션 및 인산화 [22][23]등이 포함됩니다.LRRIQ3는 잘 보존된 4개의 스모 사이트와 잘 보존된 1개의 유비쿼티네이션 [22]사이트를 가질 것으로 예상된다.다음 그림에 이러한 번역 후 수정 내용을 나타냅니다.

DOG 2.0을 [24]사용하여 생성된 LRRIQ3의 도메인, 모티브 및 번역 후 수정 사이트의 표현.

단백질 상호작용

LRRIQ3가 2-하이브리드 분석 및 친화성 크로마토그래피에서 다수의 단백질과 상호작용한다는 증거가 있다.LRRIQ3가 상호작용하는 단백질로는 LIN, NCK2, GNB4, ABL1이 [25][26]있다.이 단백질들은 세포 신호 전달, 세포 골격 재구성, 세포 분화와 다른 [27][28][29][30]것들과 연관되어 있다.

호몰로지와 진화

패러로그와 오솔로그

인간에게는 LRRIQ3에 대한 패럴로그가 존재하지 않는다.[6]그러나 [31]BLAST에서 보고한 바와 같이 다음과 같은 여러 가지 정형외과가 있습니다.아래의 "백만 년 전(MYA)"에 나열된 인간 단백질로부터의 발산 후 몇 년은 [32]TimeTree를 사용하여 계산되었습니다.

인간 LRRIQ3 단백질에 대한 직교(NP_001099129.1)
속과 종 공통명 인간 혈통과의 차이(MYA) 등록 번호 시퀀스 길이(aa) 인간 단백질에 대한 배열 동일성 인간 단백질과의 배열 유사성
고릴라고릴라 고릴라 9.06 XP_004026030.1 624 97% 98%
마카카물라타 붉은원숭이 29.44 XP_001097148.2 623 93% 95%
마리티무스 북극곰 96 XP_008689049.1 625 76% 87%
펠리스카투스 길들여진 고양이 96 XP_003990274.1 625 74% 86%
카멜루스페루스 쌍봉낙타 96 XP_006178380.1 618 73% 84%
오릭톨라구스쿠니쿨루스 유럽토끼 90 XP_002715603.1 622 71% 83%
들소 들소 아메리카 들소 96 XP_010847739.1 625 70% 82%
마나투스라티로스트리스 매너티 105 XP_004369192.1 623 70% 82%
록소돈타아프리카나 아프리카코끼리 105 XP_003411181.1 625 68% 80%
콘딜루라크리스타 별코두더지 96 XP_004679575.1 627 67% 80%
엡테시쿠스후스쿠스 큰갈색박쥐 96 XP_008137759.1 621 66% 80%
미오티스다비디 베스퍼박쥐 96 XP_006775977.1 618 65% 79%
노베기쿠스 노르웨이쥐 90 NP_001019478.1 633 62% 77%
무스쿨루스 하우스마우스 90 NP_083214.2 633 63% 76%
소렉스아라네우스 큰쥐 96 XP_004603704.1 612 55% 73%
히가시바리 칠거북 312 XP_005285573.1 624 40% 56%
포고나비두근 수염이 있는 용 312 XP_020650341.1 651 35% 54%
만텔리오스트레일리아오스트레일리스 갈색키위 312 XP_013800580.1 664 35% 54%
오스트랄리스카멜루스스트루시오카멜리스 남타조 312 XP_009685099.1 628 34% 51%

임상적 의의

LRRIQ3는 많은 암과 관련이 있다.RNA-seq 실험은 LRRIQ3가 췌장암, 대장암,[33][34][35] 유방암을 포함한 여러 질병 상태에서 심각하게 하향 조절된다는 것을 보여주었다2(-3.4와 -4.2 사이의 로그 폴드 변화).

레퍼런스

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