클로로플렉소타
Chloroflexota| 클로로플렉소타 | |
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과학적 분류  | |
| 도메인: | 박테리아 |
| (순위 미지정): | 테라박테리아 |
| 문: | 클로로플렉소타 게리티 홀트 2021[1] |
| 반 | |
| 동의어 | |
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클로로플렉소타는 산소를 사용하고 고온에서 잘 자라는 호기성 열친화성 물질, 광합성을 위해 빛을 사용하는 무산소 광영양 생물, 할로겐화 기관을 사용하는 혐기성 할로레스피러를 포함한 다양한 표현형을 가진 박테리아의 문이다.h 독성 염소화 에텐 및 폴리염화 비페닐)을 전자 수용체로 사용한다.
클로로플렉소타문의 구성원은 단엽류이지만 대부분 그램 음성으로 [2]염색된다.잘 연구된 박테리아의 많은 잎은 디딤과 염색 그램 음성인 반면, 그램 양성으로 염색되는 잘 알려진 단엽은 Firmicutes (또는 Bacillota) (낮은 G+C 그램 양성자), Actinomycetota (높은 G+C 그램 양성자), 그리고 Deinoccoccota (두꺼운 펩타)를 포함한다.
역사
분류군의 이름은 2001년 베르제이의 계통세균학 설명서 제1권에 작성되었으며, Cloroflexus라는 이름의 라틴어 복수형으로, 문(文)의 표준속 명칭이 일반적인 [3]관행이다.
1987년, 칼 워즈는 분자 계통 발생학 혁명의 전조로 간주되고, 11구역으로 16S리보솜 RNA(SSU)순서를 토대로 일시적으로"Chloroflexi"으로 표기된"녹색non-sulfur 박테리아와 친척들"[4][5]에 속 클로로프렉 수스, Herpetosiphon과 Thermomicrobium 그룹 Eubacteria 나뉘어 진 권에매미 Bergey의 체계적 세균학 [6]매뉴얼 중 하나.
클로로플렉소타는 깊은 분지문(세균 계통 세균학 설명서 1권 참조)에서 같은 이름의 [6]단일 클래스를 포함하는 것으로 간주되었습니다.그러나 2001년 이후 새롭게 발견된 종 덕분에 새로운 분류가 만들어졌고 클로로플렉시 문(Phyloroflexi)은 현재 여러 분류로 나뉘어 있다.
'[8]데할로코이데스'는 1997년 부분적으로 기술된 '데할로코이데스 에테노게네스'의 이름을 따 2004년 [7]Hugenholts & Stackebrandt가 붙인 자리 표시자 이름입니다.완전히 기술된 첫 번째 종은 모에 외 연구진이 쓴 Dehalogenimonas lykanthroporepellens였다.2009년,[9] 그러나 그 종에 대한 기술에서는 두 종이 단지 90%의 16S 리보솜 RNA 정체성을 공유하기 때문에, 그 분류는 공식화되지 않았고, 가족이나 목도 제시되지 않았다. 즉, 서로 다른 과 또는 목으로 [9]분류될 수 있다는 것을 의미한다.
클로로플렉소타의 최근 계통발생학적 분석 결과 현재 문([10]門)의 일부인 다른 분류들의 그룹화에 대한 지지력이 매우 약한 것으로 밝혀졌다.문군을 구성하는 6개 클래스는 대규모 단백질 데이터셋에 대한 연결된 염기서열을 기반으로 계통수에서 일관되게 잘 지지된 분지군을 형성하지 않았으며, 전체 [10]문군이 유일하게 공유하는 보존된 시그니처 인델은 확인되지 않았다.그러나 Cloroflexi와 Thermomicrobia 클래스는 일반적인 계통발생학적 수단과 50S 리보솜 단백질 L19 및 UDP-글루코스 4-에피머라아제에서 [10]공유 보존 시그니처 인델의 식별에 의해 일관되게 함께 그룹화되는 것으로 확인되었다.Cloroflexi sensu stricto 문(문)은 Cloroflexi와 Thermomicrobia만으로 구성되어야 하며, 다른 4개 클래스(Dehalococococoidetes, Anaerolineae, Caldilineae 및 Kettonobacteria)는 Cloroflexi [10]근방의 하나 이상의 독립적인 지엽을 나타낼 수 있다.
계통발생학
현재 인정된 분류법은 LPSN([11]Standing in Nomenclature)과 [12]NCBI(National Center for Biotechnology Information)를 사용한 원핵생물명목록에 기초하고 있다.계통 발생은 모든 종류의 살아있는 나무 프로젝트의[13] 16S rRNA 기반 LTP 릴리스 132를 기반으로 합니다.
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주의:
♠ 국립생명공학정보센터(NCBI)에서 발견되었지만 LSPN(Standing in Nomenclature)과 함께 원핵생물명목록에는 기재되지 않은 균주.
♪ 순수(축적) 문화가 격리되거나 이용 가능하지 않은 원핵생물. 즉, 배양되지 않았거나 몇 개의 연속된 경로 이상 지속할 수 없는 원핵생물
분류법
"Candidatus Chlorotrix" 클라펜바흐 & 피어슨 2004[17]
- "Candidatus Chlorotrix halophila" Clappenbach & Pierson 2004 종
클래스 Thermoflexia Dodsworth 외 2014
- Thermoflexales Dodsworth 외 2014년 주문
- Thermoflexaceae Dodsworth 등 2014년
- Thermoflexus Dodsworth 등 2014년
- Thermoflexus hugenholtzi Dodsworth 등 2014년
- Thermoflexus Dodsworth 등 2014년
- Thermoflexaceae Dodsworth 등 2014년
Class Dehalocococoidia Löffler et al. 2013 ["Dehalocococoidetes" Hugenholts & Stackebrandt 2004]
- DehalococoidalesLöffler 등 2013년식
- 데할로코코이드과 뢰플러 등 2013년
- 데할로코이데스속Löffler 등 2013년 ["Dehalocococoides" Maymo-Gatel 등 1997년]
- 종 데할로코이데스 맥카티 뢰플러 외 2013 ["데할로코이데스 에테노게네스" Maymo-Gatel 외 1997]
- DehalogenimonasMoe 등 2009년
- 종 D. alkenigignens Bowmann 외 2013
- 종 D. 포미섹시덴스 키 외 2017
- D. Lykanthroporepellens Moe 등 2009년 (타입 sp.)
- 데할로코이데스속Löffler 등 2013년 ["Dehalocococoides" Maymo-Gatel 등 1997년]
- 데할로코코이드과 뢰플러 등 2013년
클래스 아나롤리나에 야마다 외 2006
- Anaerolineales Yamada 등 2006년 주문
- 아네롤린과 야마다 외 2006년
- "Thermanaerothrix"속 ♠ Gregoire et al. 2011[18]
- 종 "Thermanaerothrix daxensis" ♠ Gregoire et al. 2011
- "Brevefilum"속 ♠ 매킬로이 외 2017년
- 종 "Brevefilum fermentans" ♠ McIlroy 등 2017년
- "Candidatus Roseilinea"속 ♠ Thiel et al. 2016
- 종 "Candidatus Rosilinea gracile" ♠ Thiel et al. 2016
- Thermomarinilinea Nunoura 등 2013년
- Thermomarinilinea lacunifontana Nunoura 등 2013년
- 아네롤리나속세키구치 외 2003년 개정. 야마다 외 2006년
- BellilineaYamada 등 2007년[16]
- 야마다 등 2007년[16] 종
- FlexilineaSun 등 2015년
- 종 Flexilinea flocculi Sun et al.
- LevilineaYamada 등 2006년[14]
- 종 Levilinea sacarolytica 야마다 외 2006
- 렙톨리나야마다 등 2006년[14]
- 렙톨리나 타디비탈리스 야마다 외 2006년
- LongilineaYamada 등 2007년[16]
- 종 Longilinea arvoryzae Yamada et al.
- OrnatilineaPodosokorskaya 등 2013년
- 오나틸리나 aprima Podosokorskaya 등 2013년
- PelolineaImachi 등 2014년
- 종 Pelolinea subsumbricina 이마치 등 2014년
- "Thermanaerothrix"속 ♠ Gregoire et al. 2011[18]
- 아네롤린과 야마다 외 2006년
Class Forticatenia Kawaichi et al.
- 주문 Forticatenales Kawaichi 등 2013년
- 패밀리카텐과 가와이치 등 2013년
- "Candidatus Promineofilum"속 ♠ McIlroy 등 2016년
- 종 "Candidatus Promineofilum breve" ♠ McIlroy et al. 2016
- 솔티카테나카와이치속 등 2013년
- 종족보르티카테나 마리티마 카와이치 외 2013년
- "Candidatus Promineofilum"속 ♠ McIlroy 등 2016년
- 패밀리카텐과 가와이치 등 2013년
야마다 외 2006년 제1종
- Caldilineales Yamada 등 2006년 주문
Class Kettonobacteria Cavaletti et al. 2007 emend. 야베 외 2010년 [케도박테리아(식) 카발레티 외 2006년]
- Thermogematisporales Yabe et al. 2011년
- KettonobacteralesCavaletti 등 2007년 주문 [Kettobacterales (sic) Cavaletti 등 2006년]
- Kettonobacteriaceae Cavaletti et al. 2007 [Kettobacteraceae (sic) Cavaletti et al. 2006]
- DictyobacterYabe 등 2017년
- Dictyobacter aurantiacus Yabe et al. 2017
- 케도노박터리그속. 카발레티 외 2007년 [Kettobacter (sic) Cavaletti 외 2006년]
- DictyobacterYabe 등 2017년
- 타르모스포로트리치과 야베 외 2010
- ThermosporothrixYabe 등 2010년[22]
- 종 T. hazakensis 야베 외 2010
- 종 T. 나루코넨시스 야베, 사카이, 요코타 2016
- ThermosporothrixYabe 등 2010년[22]
- Kettonobacteriaceae Cavaletti et al. 2007 [Kettobacteraceae (sic) Cavaletti et al. 2006]
Class Chloroflexia Gupta et al. 2013
- KallotenualesCole 외 2013 주문
- Kallotenuaceae Cole 등 2013년
- KallotenueCole 등 2013년
- Kallotenue 파피롤리튬 콜 외 2013
- KallotenueCole 등 2013년
- Kallotenuaceae Cole 등 2013년
- Herpetosiphonales Gupta et al. 2013 주문 ["Herpetosiphonales" Castenholz 2001]
- Chloroflexales Gupta 등 2013년 주문
- "Dehalobium"속 ♠ Wu et[26] al.
- 종 "Dehalobium chlorocoercia" ♠ Wu et al. 2002
- RoseiflexineaeGupta 등 2013년식 서브오더
- 장미과 Gupta 등 2013년
- "Kouleothrix"속 ♠ Kohno 등
- 종 "Kouleothrix aurantiaca" ♠ Kohno 외
- 헬리오트릭스속 ♦ 피어슨 외 1986년
- Heliotrix orgenensis ♦ Pierson 등 1986년[27]
- 로지플렉서스하나다속 등 2002년
- "Kouleothrix"속 ♠ Kohno 등
- 장미과 Gupta 등 2013년
- 아목 ChloroflexineaeGupta 등. 2013
- 클로로플렉스과 Gupta 등 2013년
- 칸디다투스클로로필룸속티엘 외 연구진 2016
- 종 칸디다투스 클로라네로필룸 코퍼로섬 티엘 외 2016년
- Chloroflexus Pierson & Castenholz 1974속
- 종 C. 골재 하나다 외 1995년[29]
- 종 C. aurantiacus Pierson & Castenholz 1974[30] (타입 sp)
- 종 C. islandicus 가이신 외 2017
- 칸디다투스클로로필룸속티엘 외 연구진 2016
- 물오징어과 Gupta et al.
- 칸디다투스클로로플로카고렌코 등 2014년
- 칸디다투스 클로로플로카 아시아티카 고렌코 외 2014년
- 클로로네마속♪두비니나&고렌코
- 클로로네마 기간테움 ♪ 두비니나 & 고렌코 1975
- OxibrochlorisGorlenko & Pivovarova 1989 emend. 케펜 외 2000년
- 종 O. 크라이시♪고렌코&피보바로바 1989(type sp)
- O. trichoides ♦ (예: Szafer) Gorlenko & Korotkov 1989 emend. 케펜 외 2000년 [오실라토리아 트리코이데스 (스자퍼) 라우터 1915년생]
- 칸디다투스클로로플로카고렌코 등 2014년
- 클로로플렉스과 Gupta 등 2013년
- "Dehalobium"속 ♠ Wu et[26] al.
어원학
클로로플렉시라는 이름은 클로로플렉서스의 남성 복수인 네오라틴 주격이다.이것은 기술된 첫 번째 속 이름이다.The noun is a combination of the Greek adjective chloros, -a, on (χλωρός, -ά, -όν),[31] meaning "greenish-yellow," and the Latin masculine passive perfect participle flexus (of flecto),[32] meaning "bent."[6]이 어원은 1810년 험프리 데이비 경이 발견해 연두색에서 따온 원소인 염소와 무관하다.같은 뿌리를 가진 또 다른 문종은 클로로비오타인데 반해, "시아노박테리아"는 "푸른 녹색"[33]을 의미하는 시아노스 뿌리를 가지고 있다.
다른 식물과 달리 클로로플렉소타속 이름에는 테마 뿌리가 없으며, 사실 클로로-로 시작되거나 클로로비로 끝나는 많은 속들이 시아노박테리아 또는 클로로비이다.
레퍼런스
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