KR101104830B1 - 스트레스 조건에 대한 식물의 내성을 증가시키기 위한 방법및 수단 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 식물에서 내생성 PARG 단백질의 활성을 감소시킴으로써 가뭄, 강한 광 강도, 고온, 영양결핍 등을 비롯한 비생물적 스트레스 또는 나쁜 생장 조건에 대한 식물의 내성을 증가시키는 방법과 수단을 제공한다.
Description
본 발명은 가뭄, 강한 광 세기, 고온, 영양결핍 등과 같은 나쁜 생장 조건에 대한 식물의 내성을 증가시키기 위해 식물에서 폴리(ADP-리보스) 글라이코하이드롤라아제를 사용하는 것에 관한 것이다. 비생물적 스트레스 조건에 대한 내성을 나타내는 식물을 제조하는 방법 및 수단도 제공된다.
흔히, 비생물적 스트레스는 나쁜 조건에 노출된 식물 세포의 DNA에 직접적으로 또는 간접적으로 손상을 줄 수 있다. 게놈 손상은, 수선하지 않고 방치하면, 세포 치사를 초래할 수 있다. 식물이 나타내는 스트레스 조건에 대한 내성은 나쁜 조건에 노출된 식물 세포가 그 손상을 감소 및/또는 수선하여서 생존하는 능력의 결과이다.
다른 진핵생물처럼, 식물 세포는 정교한 DNA 수선 계를 발달시켜 왔다. DNA 가닥 중단에 의한 폴리(ADP-리보스) 중합효소(PARP)의 활성화는 DNA 손상에 대한 첫 세포 반응이다. PARP는 니코틴아마이드 다이뉴클레오타이드(NAD)의 전환에 의해 얻은 ADP-리보스 분자를 연속적으로 부가함으로써 단백질의 번역후 수식을 촉진하여 200개 이하의 ADP-리보스 잔기(식물에서 약 40 잔기)를 함유하는 다중분지 중합체를 형성한다. 폴리(ADP-리보스) 합성이 DNA 사슬 중단에 의존하는 의존성 및 DNA 수선, 복제 및 전사반응의 주요 이팩터(effector)를 함유하는 다중단백질 복합체에 PARP가 존재하는 것은 상기 번역후 수식이 핵산의 대사 및 DNA 수선에 관여함을 강하게 암시한다. 폴리(ADP-리보스) 합성이 세포 주기 및 세포 치사의 조절에 관여함도 보여주는 증거도 있다.
단백질의 폴리(ADP-리보실)화는 살아있는 세포에서는 일시적인 것이다. 폴리(ADP-리보스) 중합체는 신속하게 전환되며, 폴리(ADP-리보스)글라이코하이드롤라아제(PARG; E.C.3.21.143)의 엑소글라이코시다아제 및 엔도글라이코시다아제 활성에 의해 자유 ADP-리보스로 전환된다. 단백질 수용체 상의 ADP 리보스의 가장 기본 단위체는 다른 효소(ADP-리보실 단백질 리아제)의 작용으로 가수분해된다.
세포 생존에 대한 PARP의 상술한 긍정적인(DNA-손상 관련된) 효과 이외에, PARP의 부정적인 효과도 있다. DNA 손상에 대해 PARP를 활성화시키는 과정은 NAD+ 수준의 급속 저하와 관련이 있으며, 이것은 PARP에 의해 전달된 각 ADP-리보스 단위체가 1분자의 NAD+를 소비하기 때문이다. 또한, NAD+ 고갈은 ATP 고갈을 초래하며, 이는 NAD+ 재합성이 NAD+ 1분자당 적어도(생합성 경로에 따라 좌우) 3분자의 ATP를 필요로 하기 때문이다. 또한 NAD+ 고갈은 당분해 과정 동안 ATP를 재합성하는데 필요한 글리세르알데하이드-3-포스페이트 탈수소효소 활성을 차단한다. 결국, NAD+는 전자 수송 및 산화 인산화반응을 통하여 ATP를 생성하는데 필요한 전자의 주요 전달자이다.
NAD+ 및 ATP 고갈의 생리적 결과는 DNA-손상 유도된 세포 치사의 측면에서 확립되어 왔다. 세포 자살의 완료는 ATP의 존재에 절대적으로 의존하며, 이 뉴클레오타이드가 없으면 이 유형의 세포 사멸은 세포자살에서 괴사로 바뀐다. 이러한 세포성 용해는 인접 세포에 추가의 손상을 미치는 괴사와 관련되어 있기 때문에, 다세포 생물의 경우 괴사보다 세포자살에 의한 세포치사가 바람직하다.
따라서 세포가 DNA 손상을 이겨 살아남을 가능성에 대한 폴리(ADP 리보실)화의 긍정적인 효과와 부정적인 효과의 균형을 신중히 숙고하는 것이 아주 중요하다.
WO 00/04173호는 내생성 폴리-(ADP-리보스)중합효소 (PARP) 유전자의 발현 및/또는 겉보기 활성에 영향을 주는 "PCD 조절 키메라 유전자"를 도입함으로써, 진핵 세포 및 생물, 특히 식물 세포 및 식물에서 프로그래밍된 세포치사(PCD)를 조절하는 방법을 개시한다. 프로그래밍된 세포치사는 억제되거나 유발될 수 있다. 상기 국제특허출원 공보에 기재된 발명은 특히 PCD를 조절하거나, 생장속도를 향상시키거나, 또는 스트레스 내성 세포 및 생물을 생성하기 위한, PARP 활성을 갖는 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열의 용도에 관한 것이다.
PARG를 암호화하는 유전자는 다수의 동물, 예컨대 라투스 노르베기쿠스(Rattus norvegicus)(수탁번호: NM-031339, NW-043030, AB019366), 무스 무스쿨루스(Mus musculus)(수탁번호: NT-039598, NM-003631, AF079557), 호모 사피엔스(Homo sapiens)(수탁번호: NT-017696, NM-003631, AF005043), 보스 타우루스(Bos taurus)(수탁번호: NM-174138, U78975), 드로소필라 멜라노가스터(Drosophila melanogaster)(수탁번호: AF079556)에서 확인되어 있다.
식물에서, 폴리(ADP-리보스)글라이코하이드롤라아제는, 아라비돕시스 (Arabidopsis)에서 유전자의 시간-조절된 전사 및 영양성장기로부터 개화기(tej)로 가는 광기간 의존적 전환기가 영향을 받은 돌연변이에서 불활성화된 야생형 유전자의 유전자 지도-기초 클로닝에 의해 확인되었다. 이 유전자의 뉴클레오타이드 서열은 수탁번호 AF 3964690(Panda et al., 2002 Dev. Cell. 3, 51-61)하의 뉴클레오타이드 데이터 베이스로부터 입수할 수 있다.
발명의 개요
본 발명은 기능적으로 연결된 식물-발현성 프로모터; 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하는 DNA 영역; 및 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관련된 3' 말단 영역을 포함하는 키메라 유전자를 식물 세포에 제공하여 트랜스제닉 식물 세포를 생성하는 단계를 포함하는, 스트레스 조건에 대한 내성을 나타내는 식물을 제조하는 방법을 제공한다. 상기 트랜스제닉 식물 세포로부터 트랜스제닉 식물주 집단이 재생될 수 있고; 또 스트레스 내성 식물주는 트랜스제닉 식물주 집단내에서 확인된다. ParG 억제성 RNA 분자는 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자(내생성 ParG 유전자)의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 20개의 연속적 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 포함할 수 있다. ParG 억제성 RNA 분자는 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자(내생성 ParG 유전자)의 뉴클레오타이드 서열의 상보서열의 적어도 20개의 연속적 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 포함할 수 있다. 다른 구체예로서, ParG 억제성 RNA는 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 20개의 연속적인 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 센스 영역 및 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 상보서열의 적어도 20개의 연속적 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 안티센스 영역을 포함할 수 있고, 상기 센스 및 안티센스 영역은 상기 적어도 20개의 연속적인 뉴클레오타이드를 포함하는 이중 가닥 RNA 영역을 형성할 수 있다. 상기 키메라 유전자는 상기 ParG 억제성 RNA 분자를 암호화하는 DNA 영역 및 3' 말단 영역 사이에 자가-스플라이싱 리보자임을 암호화하는 DNA 영역을 더 포함할 수 있다. 스트레스 조건은 열, 가뭄, 영양결핍, 산화적 스트레스 또는 강한 광 조건으로부터 선택될 수 있다.
본 발명의 다른 구체예로서, 관심을 갖고 있는 식물의 ParG 암호화 유전자의 일부를 포함하는 적어도 100bp의 DNA 단편을 분리하는 단계; 식물-발현성 프로모터 영역을 식물의 ParG 암호화 유전자의 일부를 포함하는 상기 분리된 DNA 단편에 프로모터 영역과 비교하여 정방향으로 연결하고; 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여된 3' 말단 영역을 식물의 ParG 암호화 유전자의 일부를 포함하는 상기 분리된 DNA 단편에 프로모터 영역과 비교하여 역방향으로 기능적으로 연결시켜 키메라 유전자를 생성하는 단계를 포함하는, 스트레스 조건에 대한 내성을 나타내는 식물을 제조하는 방법을 제공한다. 이들 키메라 유전자는 식물 세포에 제공되어 트랜스제닉 식물 세포를 생성한다. 이 트랜스제닉 식물 세포로부터 트랜스제닉 식물주 집단이 재생되며; 또 상기 트랜스제닉 식물주 집단내에서 스트레스 내성 식물주를 확인한다. 본 발명은 또한 상기 과정에 의해 얻은 스트레스 내성 식물 세포 및 식물에도 관한 것이다.
본 발명의 다른 구체예로서, 식물 세포에 키메라 유전자를 제공함으로써 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하는 DNA 영역을 포함하는 트랜스제닉 식물 세포를 생성하는 단계; 상기 트랜스제닉 식물 세포로부터 트랜스제닉 식물주 집단을 재생하는 단계; 및 상기 트랜스제닉 식물주 집단내에서 스트레스 내성 식물주를 확인하는 단계를 포함하는, 스트레스 조건에 대한 내성을 나타내는 식물을 제조하는 방법이 제공되며, 이 때 상기 DNA 영역은 식물-발현성 프로모터, 및 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여하는 3' 말단 영역에 기능적으로 연결된 서열번호 1, 2 또는 16의 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열의 적어도 21 내지 100개 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열, 또는 서열번호 3, 4, 15 또는 23의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 21 내지 100개 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 포함한다.
본 발명은 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하는 DNA 영역과 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여하는 3' 말단 영역에 기능적으로 연결된 식물-발현성 프로모터를 포함하는 DNA 분자도 제공한다. ParG 억제성 RNA 분자는 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자(내생성 ParG 유전자)의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 20개의 연속적인 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 포함할 수 있다. 상기 ParG 억제성 RNA 분자는 또한 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자(내생성 ParG 유전자)의 뉴클레오타이드 서열의 상보서열의 적어도 20개의 연속적인 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 포함할 수 있다. 다른 구체예로서, 상기 ParG 억제성 RNA는 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 20개의 연속적인 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 센스 영역 및 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 상보서열의 적어도 20개의 연속적인 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 안티센스 영역을 포함할 수 있으며, 상기 센스 및 안티센스 영역은 적어도 20개의 연속적인 뉴클레오타이드를 포함하는 이중 가닥 RNA 영역을 형성할 수 있다. 키메라 유전자는 또한 ParG 억제성 RNA 분자를 암호화하는 DNA 영역과 3' 말단 영역 사이에 자가-스플라이싱 리보자임을 암호화하는 DNA 영역을 더 포함할 수 있다. 키메라 유전자는 또한 서열번호 1, 2 또는 16의 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열의 적어도 21 내지 100개 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열, 또는 서열번호 3, 4, 15 또는 23의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 21 내지 100개 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 포함할 수 있다.
다른 구체예로서, 본 발명은 본 발명의 DNA 분자를 포함하는 식물 세포 및 이러한 식물 세포로 실질적으로 구성된 식물뿐만 아니라 이러한 식물을 다른 식물과 교배시키는 단계를 포함하는 스트레스 내성 식물의 제조 방법에도 관한 것이다. 본 발명의 키메라 유전자를 포함하는 식물의 종자 및 증식물질도 또한 제공된다.
본 발명은 식물 세포주 또는 식물 또는 식물주를 돌연변이 처리시키는 단계; 내생성 ParG 유전자에서 돌연변이를 갖는 식물 세포 또는 식물을 확인하는 단계; 확인된 식물 세포 또는 식물을 스트레스 조건으로 처리시키고, 대조용 식물보다 상기 스트레스 조건을 더 잘 견디는 식물 세포 또는 식물을 확인하는 단계를 포함하는, 스트레스 내성 식물을 얻는 방법에 관한 것이다. 다르게는, ParG 억제제 내성에 대해 식물 세포 또는 식물을 선별할 수 있고, 상기 단락에 기재된 바와 같이 더 처리될 수 있다.
본 발명은 또한 내생성 ParG 유전자 내에 돌연변이를 갖는 스트레스 내성 식물 세포 또는 식물에도 관한 것이다.
도 1은 진핵생물 세포에서 PARP/PARG의 작용에 의한 폴리-ADP 리보스 중합반응/해중합 반응 주기의 개략도이다.
도 2는 강한 광 스트레스 하에서 아라비돕시스(Arabidopsis)주의 NAD+ 및 ATP 함량의 다이아그램이다. 짙은 색 막대표시는, 낮은 광 조건하에서 측정된 NAD 함량에 대한 %값으로 표시된, 강한 광 조건하에서 측정된 NAD 함량을 도시한다. 옅은 색 막대표시는, 낮은 광 조건하에서 측정된 ATP 함량에 대한 %값으로 표시된, 강한 광 조건하에서 측정된 ATP 함량을 도시한다.
도 3은 질소 결핍 스트레스 하의 옥수수 주의 NAD+ 및 ATP 함량의 다이아그램이다. 짙은 색 막대표시는 NAD 함량을 나타내는 반면에, 옅은 색 막대표시는 ATP 함량을 나타낸다.
본 발명은 PARP 유전자 발현을 감소시키는 키메라 유전자를 포함하는 스트레스 내성 식물주로부터 얻은 세포가 형질전환되지 않은 식물주로부터 얻은 세포에 비하여 나쁜 조건하에서 더 높은 NAD/ATP 함량을 나타낸다는 것을 기초로 한다. 한편, 위성 바이러스에 기초한 일시적 침묵 RNA 벡터를 사용하여 담배에서 PARP를 암호화하는 유전자 발현을 침묵시키는 것은 동일 침묵 계를 사용한 PARP를 암호화하는 유전자의 침묵에서 관찰된 것과 유사한 표현형을 초래함이 밝혀졌다. 또한, 아라비돕시스 및 담배와 같은 식물에서 PARG 암호화 유전자 발현의 침묵은 높은 광 조건에 의해 부여된 스트레스 조전과 같은 스트레스 조건에 대해 보다 증가된 내성을 나타내는 식물을 제조하였다.
본 발명을 특정 작용 모드에 한정시키는 것은 아니지만, PARG 유전자 발현의 침묵은 이하의 이유로 인하여 PARP 유전자 발현의 침묵과 유사한 표현형을 초래할 것으로 기대된다. 도 1로부터 알 수 있듯이, PARP에 의해 촉진되고 NAD를 소비하는 ADP 리보스의 중합 후에 PARG에 의해 촉진되는 폴리 ADP 리보스에 의한 해중합이 일어난다. PARP 단백질 자체의 폴리 ADP 리보실화는 PARP 단백질의 불활성화를 초래한다. ADP 리보스 중합반응/해중합반응 주기가 식물 세포에서 생겨서 NAD 결핍 및 그에 따른 ATP 결핍을 초래하는 속도는 PARP 유전자 발현의 감소 또는 PARP의 효소 작용에 의해 느려지거나 또는 중지될 수 있다. 그 결과, 식물 세포, 및 그러한 세포를 포함하는 식물은 나쁜 조건에 대해 더욱 내성이 된다. 여기서 제공된 데이터는 PARG 유전자 발현 또는 PARG 활성의 감소에 의한 상기 주기의 둔화 또는 중지를 통하여 유사한 효과를 얻을 수 있음을 보여준다.
본 발명은 나쁜 환경 조건에 대응한 식물 세포 치사의 감소, 및 ParG 유전자 발현양을 변경하는 것에 의해, 또는 식물 세포에서 PARG 단백질의 활성 또는 겉보기 활성을 변경하는 것에 의해 향상된 스트레스 내성에 관한 것이다. 따라서, ParG 유전자의 발현량은 키메라 유전자를 도입하여 ParG 유전자의 발현을 변경하는 것에 의해, 또는 발현 신호를 포함한 내생성 PARG 암호화 서열을 변경하는 것에 의해 유전적으로 제어될 수 있다.
본 발명의 일개 구체예로서,
- 기능적으로 연결된 하기 DNA 단편들을 포함하는 키메라 유전자를 식물 세포에 제공하여 트랜스제닉 식물 세포를 생성하는 단계:
식물-발현성 프로모터; 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하는 DNA 영역; 및 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여하는 3' 말단 영역;
식물-발현성 프로모터; 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하는 DNA 영역; 및 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여하는 3' 말단 영역;
- 상기 트랜스제닉 식물 세포로부터 트랜스제닉 식물주 집단을 재생하는 단계; 및
- 상기 트랜스제닉 식물주 집단내에서 스트레스 내성 식물주를 확인하는 단계
를 포함하는, 스트레스 조건 또는 나쁜 생장조건에 대한 내성을 나타내는 식물의 제조 방법을 제공한다.
를 포함하는, 스트레스 조건 또는 나쁜 생장조건에 대한 내성을 나타내는 식물의 제조 방법을 제공한다.
본 명세서에서 말하는 "스트레스 내성 식물" 또는 "스트레스 조건 또는 나쁜 생장 조건에 대한 내성을 나타내는 식물"은 비제한적으로 가뭄, 고온, 제한된 영양(특히 질소) 공급, 강한 광 세기와 같은 나쁜 생장 조건에 일정 시간 처리되면 본 발명의 방법에 따라 처리되지 않은 대조 식물에 비하여 더 잘 생장하는 식물(특히, 본 발명에 따라 얻은 식물)이다. 이것은 일반적인 식물의 외관으로부터 분명하며 예컨대 증가된 바이오매스 생산, 나쁜 조건하에서 지속적인 영양 생장 또는 더 많은 종자 생산에 의해 측정될 수 있다. 스트레스 내성 식물은 더 넓은 생장 스펙트럼을 가지며, 즉 이들은 수율 손실없이 더 넓은 범위의 기후적 및 기타 비생물적 변화를 견딜 수 있다. 생화학적으로, 스트레스 내성은 스트레스 조건하의 대조 식물과 비교하여 스트레스 내성 식물의 더 높은 NAD+ - NADH/ATP 함량 및 더 낮은 반응성 산소종의 생산량으로 드러난다. 스트레스 내성은 또한 동일 조건하에서 대조 식물과 비교하여 스트레스 내성 식물에서 더 높은 엽록소 함량, 더 높은 광합성 및 더 낮은 엽록소 형광으로 분명해진다.
스트레스 내성이 분명해지기 위해서 식물이 나쁜 조건하에서 연속적으로 생장할 필요는 없다는 것이 분명하다. 통상, 본 발명에 따른 식물 또는 식물 세포와 대조 식물 또는 식물 세포 사이의 스트레스 내성 차이는 생장하는 동안 비교적 단시간 동안 나쁜 조건에 직면하더라도 분명해질 것이다.
본 명세서에 사용된 바와 같이, "ParG 억제성 RNA 분자"는 식물 세포의 내생성 PARG 암호화 유전자를 바람직하게는 전사후 유전자침묵을 통하여 감소시킬 수 있는 RNA 분자이다. ParG 억제성 RNA 분자가 ParG 암호화 유전자의 발현을 전사후 유전자침묵을 통하여 감소시킬 때에도, 이러한 RNA 분자는 예컨대 내생성 ParG 유전자의 DNA 메틸화를 안내하는 등의 세포내에서 다른 작용을 발휘하여, 궁극적으로 PARG 암호화 유전자의 발현 감소를 초래한다. 또한, 식물 세포의 내생성 PARG 암호화 유전자의 발현은 전사상 침묵에 의해, 예컨대 내생성 ParG 유전자의 프로모터 영역을 표적으로 한 RNAi 또는 dsRNA를 사용하는 것에 의해 감소될 수 있다.
본 명세서에 사용된 바와 같이, "PARG 암호화 유전자" 또는 "ParG 유전자"는 PARG(폴리 ADP 리보스 글라이코하이드롤라아제) 단백질을 암호화할 수 있는 유전자로서, PARG 단백질은 내생성 해당작용(endoglycolytic) 또는 외생성 해당작용(exoglycolytic)에 의해 자유 ADP 리보스 단위체를 방출함으로써 폴리 ADP-리보스의 해중합을 촉진한다.
PARG 암호화 유전자는 서열번호 1(아기장대: 아라비돕시스 탈리아나(Arabidopsis thaliana)) 또는 서열번호 2(솔라눔 튜버로숨(Solanum tuberosum)) 또는 서열번호 16(벼: 오리자 사티바(Oryza sativa))의 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 그의 일부를 암호화하는 뉴클레오타이드 서열, 예컨대 서열번호 3, 서열번호 4, 서열번호 15 또는 서열번호 23(옥수수: 제아 메이즈(Zea mays))의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 DNA 단편을 포함할 수 있다.
그러나, 당해 분야의 숙련자들은 식물 종으로부터 얻은 상술한 PARG 암호화 유전자로부터 유도된 프로브를 사용한 혼성화(hybridization), 또는 심지어는 동물 종으로부터 얻은 상술한 PARG 암호화 유전자로부터 유도된 프로브를 사용한 혼성화에 의해서 다른 식물 종으로부터도 변이 DNA 서열을 분리할 수 있음은 잘 알 수 있을 것이다. 이를 위하여, 상기 프로브들은 상기 PARG 암호화 유전자 서열의 코딩 영역으로부터, 바람직하게는 서열번호 3 또는 서열번호 4의 코딩 영역으로부터 얻은 적어도 40개의 연속된 뉴클레오타이드를 포함하는 뉴클레오타이드 서열을 가져야 한다. 그러나 상기 프로브는 상술한 ParG 유전자의 약 50, 60, 75, 100, 200 또는 500개의 연속된 뉴클레오타이드와 같은 ParG 유전자로부터 유도된 뉴클레오타이드 서열의 더 긴 영역을 포함할 수 있다. 바람직하게는, 상기 프로브는 동물로부터 얻은 상이한 PARG 단백질을 정렬하는 것에 의해 확인된 촉매 도메인의 고도로 보존되는 영역중의 하나를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함해야 한다. 이들 영역은 또한 아기장대로부터 확인된 PARG 단백질에도 존재하며 아미노산 서열 LXVDFANXXXGGG(위치 252의 아미노산에서부터 위치 264의 아미노산에 이르는 서열번호 1에 상응함; X는 임의의 아미노산일 수 있음), LXVDFANXXXGGGXXXXGXVQEEIRF(위치 252의 아미노산에서부터 위치 277의 아미노산에 이르는 서열번호 1에 상응) 또는 LXVDFANXXXGGGXXXXGXVQEEIRFXXXPE(위치 252의 아미노산에서부터 위치 282의 아미노산에 이르는 서열번호 1에 상응), TGXWGCCTXFXGD(위치 449의 아미노산에서부터 위치 460의 아미노산에 이르는 서열번호 1에 상응) 또는 TGXWGCGAFXGDXXLKXXXQ(위치 449의 아미노산에서부터 위치 468의 아미노산에 이르는 서열번호 1에 상응)를 포함한다. 다른 보존된 영역은 아미노산 서열 DXXXRXXXXAIDA(위치 335의 아미노산에서부터 위치 344의 아미노산에 이르는 서열번호 1에 상응) 또는 REXXKAXXGF(위치 360의 아미노산에서부터 위치 369의 아미노산에 이르는 서열번호 1에 상응) 또는 GXXXXSXYTGY(위치 303의 아미노산에서부터 위치 313의 아미노산에 이르는 서열번호 1에 상응)를 갖는다. 혼성화는 바람직하게는 엄격한(stringent) 조건하에서 이루어져야 한다.
본 명세서에 사용된 바와 같은 "엄격한 혼성화 조건"은 프로브와 표적 서열 사이에 95% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 97% 이상의 서열 동일성이 존재하면 혼성화가 일반적으로 생긴다는 것을 의미한다. 엄격한 조건의 예는 50% 폼아마이드, 5 x SSC(150mM NaCl, 15mM 시트르산삼나트륨), 50mM 인산나트륨 (pH 7.6), 5 x 덴하트 용액, 10% 황산 덱스트란, 및 연어 정자 DNA와 같은 변성되고 전단처리된 캐리어 DNA 20㎍/ml를 포함하는 용액에서 철야로 교반한 다음 혼성화 지지체를 0.1 x SSC로 약 65℃에서 약 10분간 (2회) 세척하는 것이다. 다른 혼성화 및 세척 조건은 공지되어 있으며, 문헌[Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor, NY(1989), 특히 11장]에 예시되어 있다.
다르게는, ParG 암호화 유전자 또는 그의 일부는 상술한 PARG 암호화 유전자의 뉴클레오타이드 서열 또는 그의 상보적인 서열로부터 적어도 20개의 연속된 뉴클레오타이드를 포함하는 올리고뉴클레오타이드를 프라이머로 사용한 PCR-기제 수법에 의해 분리할 수 있다. 이러한 프라이머는 상술한 바와 같은 보존된 영역을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하거나 또는 이러한 뉴클레오타이드 서열에 상보적일 수 있다. 상기 목적을 위해 사용될 수 있는 올리고뉴클레오타이드는 서열번호 5, 6, 7 또는 8의 뉴클레오타이드 서열을 포함할 수 있다. 사용될 수 있는 올리고뉴클레오타이드는 예컨대 서열번호 17, 18, 19, 20, 21 또는 22의 올리고뉴클레오타이드 프라이머와 같이 축퇴될 수 있다.
ParG 유전자로부터의 특정 PCR 단편은 예컨대 아라비돕시스(Arabidopsis) 게놈 DNA 또는 cDNA를 주형 DNA로 사용하여 서열번호 5 및 6의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 올리고뉴클레오타이드의 조합을 사용함으로써 얻을 수 있거나, 또는 엄격한 어닐링 조건하에서 감자 게놈 DNA 또는 cDNA를 주형 DNA로서 사용하여 서열번호 7 및 8의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 올리고뉴클레오타이드의 조합을 사용함으로써 얻을 수 있다.
분리한 서열은 기능성 PARG 단백질 또는 그의 일부를 암호화할 수 있다. 바람직하게는 분리된 서열은 예시된 바와 같은 PARG 단백질의 촉매적 도메인으로부터 고도로 보존되는 영역 1 또는 그 이상을 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함해야 한다.
그러나, 본 발명의 목적을 위해서는 분리된 서열이 기능적 ParG 단백질을 암호화하거나 또는 완전한 코딩 영역을 분리할 필요는 없다. 실제로, 본 발명에 필요한 것은 ParG 억제성 RNA를 생성할 수 있는, 식물로부터 확인되거나 분리된 내생성 ParG 유전자를 기본으로 하여 키메라 유전자가 고안되거나 제조될 수 있어야 하는 것이다. 몇몇 대체 방법을 이용하여 이러한 ParG 억제성 RNA 분자를 생성할 수 있다.
일 구체예로서, ParG 억제성 RNA 분자를 암호화하는 키메라 유전자는 소위 안티센스 기술을 기초로 한다. 즉, 키메라 유전자의 코딩 영역은 그 발현을 감소시키려 하는 식물 세포 또는 식물의 내생 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 상보서열의 적어도 20개의 연속된 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함한다. 이러한 키메라 유전자는 분리되거나 확인된 ParG 유전자, 또는 이러한 유전자의 일부로부터 얻은 적어도 20개의 뉴클레오타이드를 포함하는 DNA 단편을 식물-발현성 프로모터, 및 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여된 3' 말단 형성 영역에 역방향으로 기능적으로 연결시키는 것에 의해 편리하게 작성할 수 있다. 분리된 ParG 유전자로부터 얻은 이러한 DNA 단편의 정확한 뉴클레오타이드 서열 또는 완전한 뉴클레오타이드 서열을 알 필요가 없음은 분명할 것이다.
다른 구체예로서, ParG 억제성 RNA 분자를 암호화하는 키메라 유전자는 소위 공동-억제 기술을 기초로 하고 있다. 다시 말해, 키메라 유전자의 코딩 영역은 식물 세포 또는 식물의 내생성 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 20개의 연속된 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하며, 그의 발현을 감소시키는 것을 목적으로 한다. 이러한 키메라 유전자는 분리되거나 확인된 ParG 유전자 또는 이러한 유전자의 일부로부터 얻은 적어도 20개의 뉴클레오타이드를 포함하는 DNA 단편을 식물-발현성 프로모터, 및 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여된 3' 말단 영역에 직접적인 방향으로 기능적으로 연결하는 것에 의해 편리하게 작성할 수 있다. 마찬가지로, 분리된 ParG 유전자로부터 얻은 사용된 DNA 단편의 정확한 뉴클레오타이드 서열을 알 필요가 없다.
내생 ParG 유전자의 발현을 감소시키려 하는 상술한 키메라 유전자의 효율은 비정상의, 폴리아데닐화되지 않은 ParG 억제성 RNA 분자의 발현을 초래하는 DNA 요소의 삽입에 의해 더욱 향상될 수 있다. 이러한 목적에 적합한 1개 DNA 요소는 WO 00/01133 호에 기재된 바와 같은 자가-스플라이싱 리보자임(self-splicing ribozyme)을 암호화하는 DNA 영역이다.
식물 세포의 내생 ParG 유전자의 발현을 감소시킴에 있어서 상술한 키메라 유전자의 효율은 1개의 식물 세포에, 안티센스 ParG 억제성 RNA 분자를 암호화하는 상기 기재된 바와 같은 키메라 유전자 및 센스 ParG 억제성 RNA 분자를 암호화하는 상기 기재한 바와 같은 키메라 유전자를 동시에 삽입시키는 것에 의해 더욱 향상될 수 있으며, 상기 안티센스 및 센스 ParG 억제성 RNA 분자는 WO 95/53050 호에 기재된 바와 같이, 적어도 20개의 연속적인 뉴클레오타이드 사이의 염기쌍에 의해 이중 가닥 RNA 영역을 형성할 수 있다.
WO 95/53050 호에 기재된 바와 같이, 이중 가닥 RNA 영역을 형성할 수 있는 센스 및 안티센스 ParG 억제성 RNA 영역은 바람직하게는 1개의 스페이서 영역에 의해 분리된 1개의 RNA 분자에 존재할 수 있다.
스페이서 영역은 인트론 서열을 포함할 수 있다. 이러한 키메라 유전자는 그 발현을 감소시키려고 하는 분리되거나 확인된 내생성 ParG 유전자에서 얻은 적어도 20개의 뉴클레오타이드를 포함하는 DNA 단편을, 식물-발현성 프로모터, 및 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여된 3' 말단 형성 영역에 역방향으로 기능적으로 연결시키는 것에 의해 편리하게 작성할 수 있다. 이러한 키메라 유전자를 작성하기 위하여, WO 02/059294 호에 기재된 벡터를 사용할 수 있다.
따라서 본 발명의 일 구체예는,
- 식물-발현성 프로모터; 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하며, 상기 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 20개의 연속된 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 DNA 영역; 또는 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하며, 상기 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 상보서열의 적어도 20개의 연속된 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 DNA 영역; 또는 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하고, 상기 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 20개의 연속된 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 센스 영역, 및 상기 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 상보서열의 적어도 20개의 연속된 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 안티센스 영역(이때, 상기 센스 영역 및 안티센스 영역은 상기 적어도 20개의 연속적인 뉴클레오타이드를 포함하는 이중 가닥 RNA 영역을 형성할 수 있다)을 포함하는 DNA 영역의 기능적으로 연결된 DNA 단편을 포함하는 키메라 유전자를 식물 세포에 제공하여 트랜스제닉 식물 세포를 생성하는 단계;
- 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여된 3' 말단 영역을 포함하는 키메라 유전자를 식물 세포에 제공하여 트랜스제닉 식물 세포를 생성하는 단계;
- 상기 트랜스제닉 식물 세포로부터 트랜스제닉 식물주 집단을 재생하는 단계; 및
- 상기 트랜스제닉 식물주 집단내에서 스트레스 내성 식물주를 확인하는 단계를 포함하는 스트레스 내성 식물주를 얻는 방법에 관한 것이다.
본 명세서에 기재된 바와 같이 "포함하는"은 상술한 특징, 정수, 단계 또는 성분의 존재를 특정하는 것으로 이해되지만, 1 이상의 특징, 정수, 단계 또는 성분 또는 그의 그룹의 존재 또는 부가를 제외하는 것은 아니다. 따라서, 예컨대 핵산 또는 뉴클레오타이드 또는 아미노산 서열을 포함하는 단백질은 실제적으로 인용된 것 이상의 뉴클레오타이드 또는 아미노산을 포함할 수 있으며, 즉 더 큰 핵산 또는 단백질에 협지될 수 있다. 기능적으로 또는 구조적으로 정의된 DNA 영역을 포함하는 키메라 유전자는 부가적인 DNA 영역을 포함할 수 있다.
따라서 약 20nt의 ParG 코딩 영역의 안티센스 또는 센스 RNA 영역의 최소 뉴클레오타이드 서열은 대형 RNA 분자내에 포함될 수 있어 20nt 내지 표적 유전자의 크기와 동일한 길이만큼 다양할 수 있음이 분명하다.
상술한 안티센스 또는 센스 뉴클레오타이드 영역은 약 21nt 내지 약 5000nt 길이, 예컨대 21nt, 40nt, 50nt, 100nt, 200nt, 300nt, 500nt, 1000nt, 2000nt 또는 약 5000nt 또는 그 이상의 길이일 수 있다.
또한, 본 발명의 목적을 위해서는, 사용된 억제성 ParG RNA 분자의 뉴클레오타이드 서열 또는 키메라 유전자의 암호화 영역이 식물 세포에서 그 발현을 감소시키려는 내생성 ParG 유전자와 완전히 동일하거나 또는 이에 상보적일 필요는 없다. 서열이 더 길수록, 전체 서열 확인에 필요한 요건은 엄격함이 덜하다. 따라서, 센스 또는 안티센스 영역은 내생성 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열 또는 그의 상보적인 서열에 대하여 약 40% 또는 50% 또는 60% 또는 70% 또는 80% 또는 90% 또는 100%의 전체적인 서열 상동성을 가질 수 있다. 그러나, 상술한 바와 같이 안티센스 또는 센스 영역은 내생성 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열과 약 100% 서열 동일성을 갖는 20개의 연속된 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함해야 한다. 바람직하게는 약 100% 서열 동일성을 갖는 스트레치는 약 50, 75 또는 100nt이어야 한다.
본 발명의 목적을 위하여, %로 나타낸, 2개의 관련 뉴클레오타이드 서열의 "서열 동일성"은 비교한 위치 수로 나눈 동일 잔기를 갖는 2개의 적합하게 정렬된 서열에서 위치의 수(x100)를 지칭한다. 갭, 즉 어떤 잔기가 1개의 서열에 존재하지만 다른 서열에는 존재하지 않는 정렬에서의 위치가 비-동일 잔기 위치로 간주된다. 2개 서열의 정렬은 니들맨 및 분슈 알고리즘(Needleman and Wunsch 1970) 컴퓨터-보조된 서열 정렬에 의해 실시되며, 갭 생성 페널티가 50이고 갭 연장 페널티가 3인 디폴트 스코링 매트릭스를 이용한 위스콘신 패키지(Wisconsin Package) 버전 10.1(Genetics Computer Group, Madison, Wisconsin, USA)의 일부인 GAP와 같은 표준 소프트웨어프로그램을 이용하여 편리하게 실시될 수 있다.
RNA 분자의 뉴클레오타이드 서열이 상응하는 DNA 분자의 뉴클레오타이드 서열을 참조하여 정의될 때마다, 뉴클레오타이드 서열 중의 티민(T)은 우라실(U)로 교체되어야 한다. 언급되는 것이 RNA 분자인지 DNA 분자인지는 본원의 내용으로부터 명확할 것이다.
특정 식물 변종 또는 식물 종에서 특정 ParG 유전자에 대한 억제성 ParG 유전자를 생성할 수 있는 키메라 유전자는 다른 식물 변종 또는 식물 종에서 ParG 유전자 발현을 억제하기 위해 사용될 수 있다. 실제로, ParG 억제성 RNA 영역 및 ParG 유전자 사이에 충분한 상동성이 존재하거나, 또는 ParG 유전자가 19개 뉴클레오타이드의 동일 스트레치를 공유한다면, 다른 유전자의 발현은 하향 조절될 것이다.
핵산 대사에서 ParG의 잠재적 역할의 측면에서, ParG 억제성 RNA에 의한 내생성 ParG 유전자의 발현이 완전하게 억제되지 않는 것이 유리할 수 있다. ParG 억제성 RNA를 암호화하는 키메라 유전자의 도입을 통한 유전자 침묵에 의하여 특정 유전자의 발현을 하향조절하는 것은 상이한 정도의 ParG 유전자의 침묵의 분포를 나타내는 상이한 트랜스제닉 주의 집단을 초래할 것이다. 이러한 집단은 원하는 침묵 정도에 따라 내생성 ParG 유전자가 침묵되어 있는 개별 트랜스제닉 식물주를 함유할 것이다. 당해 분야의 숙련자들은 이러한 식물주를 강한 광 세기, 산화성 스트레스, 가뭄, 열 등과 같은 특정의 나쁜 조건으로 처리시키고 그 처리를 충분히 이겨서 가장 잘 생존하는 식물주를 선별하는 것에 의해 식물주를 용이하게 확인할 수 있다.
본 명세서에 사용된 바와 같이, 용어 "프로모터"는 전사를 개시하는 동안 DNA-의존적 RNA 중합효소에 의해 인식되어 결합되는(직접적으로 또는 간접적으로) DNA를 의미한다. 프로모터는 전사 개시 부위, 및 전사 개시 인자 및 RNA 중합효소에 대한 결합 부위를 포함하며, 유전자 발현 조절 단백질이 결합될 수 있는 다양한 다른 부위(예컨대 인헨서)를 포함할 수 있다.
본 명세서에 사용된 바와 같은 "조절 영역"은 단백질 또는 폴리펩타이드를 코딩하는 DNA와 같은 주어진 DNA 서열의 전사를 주도하고 전사 타이밍과 수준을 제어(즉, 조절)하는데 관여하는 DNA를 의미한다. 예컨대, 5' 조절 영역(또는 "프로모터 영역")은 코딩 서열의 상류(즉, 5')에 위치하는 DNA 서열로서 프로모터와 5'-비번역 리더 서열을 포함한다. 3' 조절 영역은 코딩 서열의 하류(즉, 3')에 존재하는 DNA 서열로서 1 이상의 폴리아데닐화 시그널을 비롯한 적합한 전사 종결(및/또는 조절) 시그널을 포함한다.
본 발명의 일 구체예로서, 프로모터는 구성적 프로모터이다. 본 발명의 다른 구체예로서, 프로모터 활성은 비제한적인 호르몬, 화학 화합물, 기계적 충격, 비생물적 또는 생물적 스트레스 조건 등과 같은 외부 또는 내부 자극에 의해 향상될 수 있다(유도성 프로모터). 프로모터의 활성은 일시적으로 또는 공간적 방식으로 조절될 수 있다(조직 특이적 프로모터; 발달학적으로 조절되는 프로모터).
본 발명의 목적을 위하여, 프로모터는 식물-발현성 프로모터이다. 본 명세서에 사용된 바와 같이, 용어 "식물-발현성 프로모터"는 식물 세포에서 전사를 제어(개시)할 수 있는 DNA 서열을 의미한다. 이것은 어떤 식물 기원의 프로모터라도 포함하지만, 식물 세포에서 전사를 지시할 수 있는 비-식물 기원의 프로모터도 포함하며, 즉 CaMV35S(Hasper et al., 1988)와 같은 바이러스성 또는 세균 기원의 특정 프로모터, 지하의 클로버 바이러스 프로모터 4호 또는 7호(WO 9606932 호), 또는 비제한적인 종자 특이적 프로모터를 비롯한 조직 특이적 또는 기관 특이적 프로모터를 포함하는 T-DNA 유전자 프로모터(예컨대 WO89/03887 호), 기관-프리모르디아 특이적프로모터(An et al., 1996), 줄기 특이적 프로모터(Keller et al., 1988), 잎 특이적 프로모터(Hudspeth et al., 1989), 메소필 특이적 프로모터(광 유도성 루비스코 프로모터와 같은), 뿌리 특이적 프로모터(Keller et al., 1989), 덩이줄기 특이적 프로모터(Keil et al., 1989), 도관 조직 특이적 프로모터(Peleman et al., 1989), 스타멘-선별적 프로모터(WO 89/10396 호, WO 92/13956 호), 열개 영역(dehiscence zone) 특이적 프로모터(WO 97/13865 호) 등의 특정 프로모터이다.
키메라 유전자를 식물에 도입하는 방법은 당해 분야의 숙련자에게 공지되어 있고 또 아그로박테륨-매개 형질전환, 입자 건 전달, 미량주입, 손상되지 않은 세포의 엘렉트로포레이션, 폴리에틸렌글리콜 매개 원형질 형질전환, 원형질의 엘렉트로포레이션, 리포좀 매개 형질전환, 실리콘-휘스커 매개 형질전환 등을 포함한다. 이렇게 하여 얻은 형질전환된 세포는 성숙한 수정가능한 식물로 재생될 수 있다.
본 발명에 따른 트랜스제닉 식물 세포 및 식물주는 WO 00/04173 호에 기재된 바와 같이 PARP 유전자의 발현을 감소시키는 키메라 유전자를 더 포함할 수 있다. 이들 추가의 키메라 유전자는 본 발명의 트랜스제닉 식물주를 PARP 유전자 발현 감소성 키메라 유전자를 함유하는 트랜스제닉 식물과 교배하는 것에 의해 도입될 수 있다. 트랜스제닉 식물 세포 또는 식물주는 본 발명의 키메라 유전자를 PARP 유전자 발현 감소성 키메라 유전자를 포함하는 트랜스제닉 식물 세포에 도입하거나 형질전환시키는 것에 의해 또는 그 역으로 실시하는 것에 의해 얻을 수 있다. 다르게는, PARP 및 PARG 억제성 RNA 영역은 1개 키메라 유전자에 의해 암호화될 수 있고 1개의 RNA 분자로서 전사될 수 있다.
본 발명의 키메라 유전자(또는 그에 상응하는 억제성 RNA 분자)는 WO 00/63397 호 또는 WO 02/13964 호에 기재된 바와 같이 바이러스성 RNA 벡터와 같은 바이러스성 벡터를 사용하여 일시적 방식으로 식물 세포에 도입될 수 있다.
본 발명의 명세서를 읽어보면, PARG 활성이 감소된 돌연변이 식물 세포 및 식물주는 본 명세서에 기재된 트랜스제닉 식물 세포 및 식물주와 동일한 효과를 위해 사용될 수 있음을 당해 분야의 숙련자라면 잘 알 수 있을 것이다. 식물 세포 또는 식물의 ParG 유전자에서 돌연변이는 EMS 돌연변이법과 같은 화학적 돌연변이법이 민감성 검출 방법(예컨대 변성 HPLC)과 조합된 당해 분야의 숙련자에게 공지된 스크리닝 방법을 이용하여 용이하게 확인될 수 있다. 이러한 수법의 일례는 문헌[McCallum et al., Plant Physiology 123 439-442] 또는 WO 01/75167 호에 기재된 바와 같은 소위 "게놈에서 표적 유도된 국소 병반" 방법이다. 그러나, 특정의 게놈 영역 또는 대립유전자에서 돌연변이를 검출하기 위한 다른 방법도 또한 가능하며, 기존의 또는 새로이 생성된 삽입 돌연변이 식물주의 라이브러리를 스크리닝하는 것을 포함하며, 이들 돌연변이 식물주의 게놈 DNA의 푸울은 삽입된 DNA 단편에 특이적인 프라이머 및 삽입하려고 하는 게놈 영역 또는 대립유전자에 특이적인 프라이머를 사용하여 PCR 증폭 처리된다(예컨대 Maes et al., 1999, Trends in Plant Science, 4, pp 90-96).
식물 세포주 및 식물주는 갈로탄닌과 같은 ParG 억제제에 대한 내성을 나타내는 식물 세포주 또는 식물주를 선별함으로써 돌연변이처리될 수 있다. [Ying, et al. (2001), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98(21), 12227-12232; Ying, W., Swanson, R.A. (2000). NeuroReport 11(7), 1385-1388].
따라서, ParG 유전자에서 돌연변이를 포함하는 식물 세포 및 식물주를 확인하기 위한 방법도 유용하다. 돌연변이 세포 또는 식물주 집단은 상이한 비생물적 스트레스 처리될 수 있으며, 이들의 표현형 또는 생존은 쉽게 측정될 수 있다. 부가적으로, 스트레스받은 세포의 NAD 및/또는 ATP 함량을 측정해서 스트레스를 받지 않은 세포의 측정치와 비교한다. 스트레스 내성 세포에서, 스트레스 조건하의 NAD 함량의 감소는, 스트레스를 받지 않은 세포와 비교할 때, 상응하는 대조 세포에 대하여 더 낮아야 한다.
본 발명의 목적은 본 발명에 따른 키메라 유전자 또는 RNA 분자를 함유하는 식물 세포 및 식물을 제공하는 것이다. 전통적인 육종 방법에 의해 제조된, 본 발명의 키메라 유전자 유전자를 포함하는 식물의 배우자, 종자, 배, 접합체 또는 체세포, 자손 또는 잡종(하이브리드) 또한 본 발명의 범위에 포함된다.
본 명세서에 기재된 방법으로 얻은 식물은, 전통적인 육종 수법에 의해 다른 식물과 교배되어 본 발명의 키메라 유전자를 포함하는 스트레스 내성 자손 식물을 제조할 수 있다.
본 명세서에 기재된 방법과 수단은 모든 식물 세포 및 식물, 단자엽 식물 및 쌍자엽 식물 세포 및 식물에 적합한 것으로 믿어지며, 비제한적인 예로서 목면, 브라시카(Brassica) 채소, 평지, 밀, 옥수수, 보리, 알팔파, 땅콩, 해바라기, 벼, 귀리, 사탕수수, 콩, 잔디, 보리, 호밀, 소굼, 사탕수수, 채소(치커리, 상추, 토마토, 주키니호박, 피망, 가지, 오이, 메론, 양파, 부추), 담배, 감자, 사탕무우, 파파야, 파인애플, 망고, 아기장대(Arabidopsis thaliana) 뿐만 아니라 원예, 화초원예 또는 임업(포플라, 전나무, 유칼립투스 등)에 이용되는 식물도 포함한다.
이하의 비제한적인 실시예는 본 발명에 따른 식물에서 스트레스 내성을 증가시키는 방법 및 수단을 개시한다.
실시예에서 특별히 언급하지 않는 한, 모든 재조합 DNA 수법은 문헌[Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY 및 Volumes 1 and 2 of Ausubel et al. (1994) Current Protocols in Molecular Biology, Current Protocols, USA]에 기재된 표준 수준에 따라 실시한다. 식물 분자실험용 표준 물질 및 방법은 BIOS Scientific Publications Ltd(UK) 및 Blackwell Scientific Publications, UK에 의해 공동 발행된 문헌[R.D.D. Croy, Plant Molecular Biology Labfax (1993)]에 기재되어 있다. 표준 분자 생물학 수법에 대한 다른 참고문헌은 문헌[Sambrook and Russell (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Third Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY 및 Volumes I and II of Brown (1998) Molecular Biology LabFax, Second Edition, Academic Press (UK)]를 포함한다. 중합효소 연쇄반응에 대한 표준 물질 및 방법은 문헌[Dieffenbach 및 Dveksler (1995) PCR Primer: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 및 McPherson et al. (2000) PCR - Basics: From Background to Bench, First Edition, Springer Verlag, Germany]에서 찾아 볼 수 있다.
발명의 상세한 설명 및 실시예 전체에서, 서열에 대한 설명은 다음과 같다:
서열번호 1: 아기장대(Arabidopsis thaliana)로부터 얻은 ParG 단백질의 아미노산 서열.
서열번호 2: 솔라눔 튜베로숨(Solanum tuberosum)으로부터 얻은 ParG 단백질의 아미노산 서열.
서열번호 3: 아기장대(Arabidopsis thaliana)로부터 얻은 ParG 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 4: 솔라눔 튜베로숨(Solanum tuberosum)으로부터 얻은 ParG 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 5: ParG 단백질을 암호화하는 DNA 단편의 일부의 PCR 증폭에 적합한 올리고뉴클레오타이드 프라이머의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 6: ParG 단백질을 암호화하는 DNA 단편의 일부의 PCR 증폭에 적합한 올리고뉴클레오타이드 프라이머의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 7: ParG 단백질을 암호화하는 DNA 단편의 일부의 PCR 증폭에 적합한 올리고뉴클레오타이드 프라이머의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 8: ParG 단백질을 암호화하는 DNA 단편의 일부의 PCR 증폭에 적합한 올리고뉴클레오타이드 프라이머의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 9: 아라비돕시스(Arabidopsis) ParG 유전자 서열을 기본으로 하는, ParG 발현을 감소시키는 키메라 유전자를 함유하는 T-DNA 벡터의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 10: PARG 단백질의 보존된 서열 1의 아미노산 서열.
서열번호 11: PARG 단백질의 보존된 서열 2의 아미노산 서열.
서열번호 12: PARG 단백질의 보존된 서열 3의 아미노산 서열.
서열번호 13: PARG 단백질의 보존된 서열 4의 아미노산 서열.
서열번호 14: PARG 단백질의 보존된 서열 5의 아미노산 서열.
서열번호 15: 벼(Oryza sativa)로부터 얻은 ParG 단백질의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 16: 벼(Oryza sativa)로부터 얻은 ParG 단백질의 아미노산 서열.
서열번호 17: ParG 단백질을 암호화하는 DNA 단편의 일부를 PCR 증폭시키기에 적합한 올리고뉴클레오타이드 프라이머 PG1의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 18: ParG 단백질을 암호화하는 DNA 단편의 일부를 PCR 증폭시키기에 적합한 올리고뉴클레오타이드 프라이머 PG2의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 19: ParG 단백질을 암호화하는 DNA 단편의 일부를 PCR 증폭시키기에 적합한 올리고뉴클레오타이드 프라이머 PG3의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 20: ParG 단백질을 암호화하는 DNA 단편의 일부를 PCR 증폭시키기에 적합한 올리고뉴클레오타이드 프라이머 PG4의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 21: ParG 단백질을 암호화하는 DNA 단편의 일부를 PCR 증폭시키기에 적합한 올리고뉴클레오타이드 프라이머 PG5의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 22: ParG 단백질을 암호화하는 DNA 단편의 일부를 PCR 증폭시키기에 적합한 올리고뉴클레오타이드 프라이머 PG6의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 23: 옥수수(Zea mays)로부터 얻은 ParG 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 24: PARG 발현을 감소시킬 수 있는 키메라 유전자를 포함하는 T-DNA 벡터의 뉴클레오타이드 서열.
서열번호 25: PARG 발현을 감소시킬 수 있는 키메라 유전자를 포함하는 T-DNA 벡터의 뉴클레오타이드 서열.
실시예
1.
PARP
유전자 발현을 감소시키는
키메라
유전자를 함유하는
트랜스
제닉 스트레스 내성 식물주의 에너지 생산 효율에 대한 스트레스 영향의 분석
WO 00/04173 호에 기재된 바와 같은 PARP 유전자 발현을 감소시키는 키메라 유전자를 포함하는 트랜스제닉 브라씨카 나푸스(Brassica napus) 식물의 배축을 생장 배지상에서 5일간 배양하였다. 외식편(explant)을 30mg/L 아스피린 또는 아세틸살리실산(산화성 스트레스 조건을 초래)을 포함하는 액체 배지에 전달하여 1일 동안 두었다. 대조 실험에서는 비-트랜스제닉 브라씨카 나푸스(Brassica napus) 식물의 배축 N90-740을 동일 생장 배지상에서 배양한 다음 30mg/L 아스피린을 포함하는 액체 배지에서 하루 배양하였다. 또한, 트랜스제닉 주 및 대조용 주의 배축을 아스 피린을 갖지 않는 동일 생장 배지 상에서 배양하였다.
배양 기간 후, 125개 외식편의 ATP 함량을 각 실험당 측정하였다. 부가적으로, 125개 외식편당 3시간 동안 소비된 산소량을 측정하였다. 결과를 하기 표 A에 요약하였다. 표준오차는 6% 미만이다. 대조 식물에서 소비된 산소 mg당 ATP의 몰비는 산화성 스트레스가 가해진 대조 식물에서는 감소하는 반면, 스트레스 조건하에서 스트레스 내성 트랜스제닉 식물주에서의 동일비율은 실질적으로 증가하였고 대조 식물에 비하여 현저히 더 높았다(약 24%). 따라서 이 스트레스 내성 트랜스제닉 식물은 일정한 에너지 생산 효율을 유지한 반면, 대조 식물주는 감소된 에너지 생산효율을 나타내었다. 또한, 산화적 스트레스 처리받지 않은 대조 식물에서 슈퍼옥시드 생산율로 표시된 슈퍼옥시드 생산은 스트레스 조건하의 스트레스 내성 식물에서는 증가하지 않았다.
다른 실험으로서, WO 00/04173 호에 기재된 바와 같은 PARP 유전자 발현을 감소시키는 키메라 유전자를 포함하는 4개의 상이한 트랜스제닉 아라비돕시스(Arabidopsis) 주의 NAD+ 및 ATP 함량을 높은 광 조건 및 낮은 광 조건하에서 측정하고, 동일 조건하의 형질전환되지 않은 대조용 식물주에 대해 얻은 값과 비교하였다. 4개의 상이한 식물주는 열 및/또는 가뭄 조건을 견디는 이들의 능력에 의해 드러나듯이 상이한 정도의 스트레스 내성을 나타내었다. 높은 광 스트레스 하의 NAD 및 ATP 함량에 대해 얻은 값을 낮은 광 조건하의 NAD 및 ATP 함량에 대한 값의 %로서 표시하고 도 2에 플럿팅하였다.
이 결과는 높은 광 스트레스는 대조용 식물 세포 및 최소한 스트레스 내성 트랜스제닉 식물주에서 현저한 NAD 감소를 초래한다. 트랜스제닉 식물주의 스트레스 내성이 높을수록, 높은 광 스트레스 조건하에서 NAD 감소는 덜 현저하다.
다른 실험으로서, WO 00/04173 호에 기재된 바와 같은 PARP 유전자 발현을 감소시키는 키메라 유전자를 포함하는 트랜스제닉 옥수수 주와 형질전환되지 않은 옥수수 주 사이의 교배로부터 생긴 분리된 집단의 NAD+ 및 ATP 함량을 영양(질소) 결핍 조건하에서 측정하였고, 동일 조건하에서 형질전환되지 않은 대조 식물주에 대해 얻은 값과 비교하였다. 도 3은 수득한 결과를 그래프로 표시한 것이다. 반접합체 및 쌍을 이루지 않는 식물주는 선별 마커 유전자의 존재를 확인하는 것에 의해 구별되었다. NAD 및 ATP 함량은 형질전환되지 않은 대조용 식물 또는 비접합체 식물에서보다 반접합체성, 스트레스 내성 식물에서 훨씬 더 높았다.
실시예 2. ParG 유전자 발현을 감소시키는 키메라 유전자의 제조
아라비돕시스(Arabidopsis) 및 관련 식물에서 PARG 유전자의 발현을 감소시키기 위하여, 이중 가닥 RNA를 형성할 수 있는 센스 및 안티센스 영역을 모두 포함하는 dsRNA를 발현할 수 있는 키메라 유전자를 제조하였다. 이러한 dsRNA는 전사후 유전자침묵에 의해 서열 상동성을 공유하는 유전자의 발현을 감소시키는데 아주 효과적이다. 키메라 유전자는 다음 DNA 단편을 포함한다:
● 꽃양배추 모자이크 바이러스로부터 얻은 프로모터 영역(CaMV 35S);
● 아기장대(Arabidopsis thaliana)로부터 얻은 ParG 유전자로부터의 163bp를 정방향으로 포함하는 DNA 단편(Genbank Accession number AF394690, 뉴클레오타이드 위치 973-1135);
● 플라베리아(Flaveria)로부터 얻은 pdk 유전자로부터의 인트론 2를 암호화하는 DNA 단편;
● 아기장대(Arabidopsis thaliana)로부터 얻은 ParG 유전자로부터의 163bp를 역방향으로 포함하는 DNA 단편(Genbank Accession number AF394690, 뉴클레오타이드 위치 973-1135);
● 아그로박테륨 튜메파시엔스(Agrobacterium tumefaciense)로부터 얻은 옥토핀 합성효소로부터의 3' 미번역 말단의 단편.
키메라 유전자를, 제초제 포스피노트리신에 대한 내성을 제공하는 선별가능한 마커 유전자와 함께 T-DNA로부터 좌우 경계 서열 사이의 T-DNA 벡터에 도입하였다.
감자 및 관련 식물에서 PARG 유전자의 발현을 감소시키기 위하여, 아라비돕시스(Arabidopsis) PARG 단백질의 N-말단 부분과 높은 서열 동일성을 갖는 단백질을 암호화할 수 있는 감자로부터 cDNA 서열의 센스 및 안티센스 영역 모두를 포함하는 dsRNA를 발현할 수 있는 키메라 유전자를 제조하였다. 키메라 유전자는 하기 DNA 단편을 포함한다:
● 꽃양배추 모자이크 바이러스로부터 얻은 프로모터 영역(CaMV 35S);
● 솔라눔 튜베로숨(Solanum tuberosum)으로부터 얻은 ParG 상동체로부터의 적어도 100bp의 서열을 정방향으로 포함하는 DNA 단편(Genbank Accession number BE340510);
● 플라베리아(Flaveria)로부터 얻은 pdk 유전자로부터의 인트론 2를 암호화하는 DNA 단편;
● 솔라눔 튜베로숨(Solanum tuberosum)으로부터 얻은 ParG 상동체로부터의 적어도 100bp의 서열을 역방향으로 포함하는 DNA 단편(Genbank Accession number BE340510);
● 아그로박테륨 튜메파시엔스(Agrobacterium tumefaciense)로부터 얻은 옥토핀 합성효소로부터의 3' 미번역 말단의 단편.
키메라 유전자를, 제초제 포스피노트리신에 대한 내성을 제공하는 선별가능한 마커 유전자와 함께 T-DNA로부터 좌우 경계 서열 사이의 T-DNA 벡터에 도입하였다.
실시예
3.
ParG
유전자 발현을 감소시키는
키메라
유전자를 포함하는
트랜스
제닉 식물주의 분석.
실시예 2의 키메라 유전자를 아그로박테륨 매개 형질전환에 의해 각각 아라비돕시스(Arabidopsis) 또는 감자에 도입하였다.
수득한 트랜스제닉 식물주 집단을 대조 식물과 함께 이하의 스트레스 조건으로 처리하였다:
● 일정 일수 동안(온실) 또는 일정 시간(시험관내) 동안 증가된 열
● 일정 일수 동안 가뭄
● 일정 일수 동안 높은 광 조건
● 영양 결핍.
상술한 스트레스 조건을 잘 견디어 생존한 개별 식물주를 선별하였다.
상술한 식물의 NAD 함량 및 ATP 함량을 대조 및 스트레스 조건하에서 측정하였다.
실시예
4. 식물 세포에서
NAD
,
ATP
및
슈퍼옥시드
라디칼의
정량 측정.
식물 조직에서 ATP의 정량은, 기본적으로 문헌[Rawyler et al.(1999), Plant Physiol. 120, 293-300]에 기재된 바와 같이 실시되었다. A2S3 배지 상에서 4-5일간 배양되거나 또는 시험관내 배양된 아라비돕시스(Arabidopsis) 식물에서 2주간 배양된 배축 외식편의 ATP 함량의 측정에 어세이를 이용하였다. 모든 조작은 특별히 언급하지 않는 한 파쇄된 얼음상에서 실시하였다.
ATP 추출
- 액체 질소를 사용하여 식물 물질을 동결시킨다.
● 100 배축 외식편
● ±700mg 아라비돕시스 식물(뿌리+싹)(18일 된 C24 식물 약 32-37)
- 냉동된 배축을 모르타르에 넣고 6% 과염소산을 부가한다.
- 실온에서 막자를 사용하여 추출을 실시할 수 있다. 추출 후, 샘플을 가능한한 빨리 얼음에 둔다.
- 4℃에서 24,000g(Sorvall, SS34 로터, 14,000rpm에서)으로 10분간 원심분리한다.
- 5M K2CO3를 사용하여 상청액을 중화시킨다(350㎕의 5M K2CO3를 3ml의 상청액에 부가).
- 상기 기재된 바와 같이 방사에 의해 KClO4를 제거한다.
ATP의 정량적 생물발광 측정:
- 시그마사가 제조한 ATP 생물발광 어세이 키트를 사용한다(FL-AA).
- 추출물을 6000x로 희석(약 6mL 추출물로부터 100㎕를 취하고, 이것을 1000배 희석함). ATP 생물발광 어세이 키트의 'ATP 어세이 혼합 희석 완충액'(FL-AAB)을 이용하여 희석을 실시하였다.
- 터너 디자인(미국 서니베일 소재)의 TD-20/20 루미노미터를 이용하여 생성된 광량을 측정한다.
- 표준 곡선: 키트(FL-AAS)의 ATP 표준을 10ml의 물(2 x 10- 6몰)에 용해시킨다.
식물 조직중의 NAD+ 및 NADH의 정량은 하기 식물 물질을 사용하여 카프(Karp) 등(1983) 또는 필리포빅(Filipovic) 등(1999)에 의해 기재된 바와 같이 실시하였다:
브라씨카 나푸스(Brassica napus): 5일 배양된 배축 외식편/샘플 150개
아라비돕시스(Arabidopsis): 시험관내에서 생장한 18일된 식물 1000mg(싹 + 뿌리)/샘플(±60 C24 식물에 상응).
어세이 용액
(A) NADH의 측정용: 25 mM 인산칼륨 완충액 pH 7
0.1mM DTT
3μM FMN(플루카 제조, 83810)
30μM n-도데칸알(시그마 제조, D-7384)
(B) NAD+ + NADH 측정용:
NADH 만을 측정하기 위함
+ 2㎍/mL 알코올 탈수소효소(로슈 제조, 102 717)
추출
- 액체 질소를 사용하여 냉동한다.
- 냉동된 식물 물질을 냉각된 모르타르(-20℃에서 냉각)에 넣고 5mL 추출 완충액을 부가한다.
- 막자를 사용하여 물질을 분쇄한다.
- 4℃에서 24000g(소르발, SS34 로터, 14000rpm)으로 15분간 원심분리한다.
- 분석을 위해 1mL의 상청액을 취한다.
어세이
NADH
-390μL의 어세이 용액 A
- + 10μL 추출물
- +2μL NAD(P)H:FMN 산화환원효소
- +100μL 루시페라제 용액
NAD+ + NADH
- 390μL의 어세이 용액 B
- + 10μL 추출물
- 실온에서 2분간
- +2μL NAD(P)H:FMN 산화환원효소
- +100μL 루시페라제 용액
생성된 광량은 터너 디자인(미국 썬베일 소재)의 TD-20/20 루미노미터를 이용하여 측정한다.
NADH-표준
NADH 저장용액: 1 mM (7.1 mg/10mL H2O)
NADH: 이나트륨 염, 로슈 제조, 107 735
10mM 인산칼륨 완충액 pH7을 사용한 일련의 희석: (10-2); 5 x 10-3; 2 x 10-3; 10-3; 5 x 10-4.
390μL의 어세이 용액 A에 10μL의 희석물을 부가하여 반응을 실시한다.
표준 곡선 만듬.
문헌[De Block 및 De Brouwer (2002) Plant Physiol. Biochem. 40, 845-852]에 기재된 바와 같이 XTT의 환원량을 검출하는 것에 의해 슈퍼옥시드 라디칼 생산을 측정하였다.
브라씨카 나푸스(Brassica napus)
배지 및 반응 완충액
파종 배지(배지 201):
1/2 농축된 무라시게 및 스쿠그 염
2% 수크로오스
pH 5.8
0.6% 한천 완충액 (Difco Bacto Agar)
250mg/l 트리아실린
캘러스 유도 배지 A2S3:
MS 배지, 0.5g/l Mes(pH 5.8), 3% 수크로오스, 40mg/l 아데닌-SO4,
0.5% 아가로오스, 1mg/l 2,4-D, 0.25mg/l NAA, 1mg/l BAP,250 mg/l
트리아실린
배양 배지:
25mM K-포스페이트 완충액 pH 5.8
2% 수크로오스
25ml 배지에 대해 1방울의 Tween20
반응 완충액:
50mM K-포스페이트 완충액 pH 7.4
1mM 나트륨, 3'-{1-[페닐아미노-카본일]-3,4-테트라아졸륨}-비스(4-메톡시-6-나이트로) = XTT(bts, 독일, cat n°2525)
25 ml 완충액에 대해 1방울의 Tween20
종자의 멸균 - 종자의 발아전 처리 - 묘목의 성장. 종자를 70% 에탄올에 2분간 침지시킨 다음 0.1% Tween20을 함유하는 차아염소산나트륨 용액(약 6% 활성 염소 함유)에서 15분간 표면멸균시킨다. 마지막으로, 종자를 1리터의 멸균 수돗물로 헹군다. 멸균 수돗물에서 종자를 1시간 이상동안 배양한다(발아를 억제할 수 있는 성분이 종자로부터 확산되도록). 종자를 50ml의 멸균 수돗물(+250mg/l 트리아실린)을 함유하는 250ml 엘렌마이어 플라스크에 둔다. 약 20시간 동안 진탕시킨다. 어린 뿌리가 돌출한 종자를 약 125ml의 파종 배지를 함유하는, Duchefa로부터 구입한 시험관 벤트 용기에 두었다(10개 종자/용기, 오염에 의한 종자의 손실을 감소시키기 위해 너무 많지 않도록). 이들 종자를 ±24℃ 및 10-30:아인슈타인/s-1m-2에서 16시간의 일조시간으로 발아시킨다.
배축 외식편의 예비배양 및 스트레스 유도
- 파종한지 12-14일 후 배축을 약 7-10 mm 절편으로 절단한다.
- 배축 외식편(25개 배축/옵틸룩스 페트리디시, Falcon S1005, 덴마크)을 배지 A2S3상 25℃에서 5일간 배양한다(10-30/아인슈타인/s-1m-2).
XTT-어세이
- 150개의 배축 외식편을 50ml Falcon관으로 옮긴다.
- 반응 완충액으로 세척한다(XTT 갖지 않음).
- 20mL 반응 완충액 + XTT 부가.
(외식편은 가라앉지만 진공 침윤되지 않는다)
- 26℃의 암소에서 약 3시간 동안 배양한다.
- 470 nm에서 반응 배지의 흡수를 측정.
아기장대(Arabidopsis thaliana)
배지 및 반응완충액
식물 배지:
1/2 농축된 무라시게 및 스쿠그 염
B5 비타민
1.5% 수크로오스
pH 5.8
0.7% Difco 한천
배양 배지:
10mM K-포스페이트 완충액 pH 5.8
2% 수크로오스
25ml 배지에 대해 1방울의 Tween20
반응 완충액:
50mM K-포스페이트 완충액 pH 7.4
1mM 나트륨, 3'-{1-[페닐아미노-카본일]-3,4-테트라아졸륨}-비스(4-메톡시-6-나이트로) = XTT(bts, 독일, cat n°2525)
25ml 완충액에 대해 1방울의 Tween20
아라비돕시스(Arabidopsis) 식물
- 아라비돕시스 식물주: 시험하기 위한 대조용 식물주
- 아라비돕시스 종자의 멸균:
2분. 70% 에탄올
10분. 탈색(6% 활성 염소) + 20ml 용액에 대해 1방울의 Tween20
멸균 수돗물로 5회 세척
- 종자의 발아전 처리:
12 ml 멸균 수돗물을 함유하는 9cm 옵틸룩스 페트리디시(Falcon 제조)에서 실시.
밤새 내지 24시간 동안 낮은 광
- 아라비돕시스 식물의 생장
±125ml의 식물 배지를 함유하는 팔콘이 제조한 인테그리드 조직 배양 디스크(nr. 3025)에 종자를 파종한다: 1 종자/그리드.
식물을 24℃, 30μ 아인슈타인s-1m-2, 16 시간 주간 - 8시간 야간의 조건에서 약 3주간 생장시킨다(추대 형성 전).
XTT-어세이
대조 조건(스트레스 없음)
- 한천 플레이트로부터 싹(뿌리 포함)을 수거하고, 이것을 반응 완충액(XTT 포함하지 않음)을 함유하는 50ml Falcon 관에 직접 넣었다.
스트레스받은 싹
- 싹을, 반응 완충액(XTT포함하지 않음)을 함유하는 50ml Falcon 관으로 전달한다.
- 반응 완충액을 XTT를 함유하는 완충액(40 mL/관)으로 교체한다.
- 싹은 가라앉아야 하지만, 진공 침투되지 않는다.
- 26℃ 암소에서 약 3시간 동안 배양한다.
- 470 nm에서 반응 배지의 흡수를 측정한다.
클라크 폴라로그래프 전극을 이용하여 산소 소비를 측정하는 것에 의한 호흡량 측정은 다음과 같은 방식으로 실시하였다:
식물 물질
브라씨카 나푸스(Brassica napus)
150-200* 배축 외식편
25℃에서 5일간 배양 (참조 프로토콜 활력 어세이)
* 150개 외식편 에러 < 10%; 200개 외식편 에러 < 6%
아라비돕시스
시험관내 식물(싹 + 뿌리)에서 C24±1000mg* (18일된 식물 약 50개에 상응)
파종하기 전에 발아전 처리된 종자
24℃에서 18일간 생장
(시험관내 생장 아라비돕시스에서 프로토콜 참조).
* 에러 < 8%
배양 배지
브라씨카 나푸스(Brassica napus)
25mM K-포스페이트 완충액 pH 5.8
2% 수크로오스
Tween20(1방울/25ml)
아라비돕시스
10mM K-포스페이트 완충액 pH 5.8
2% 수크로오스
Tween20(1방울/25ml)
사용하기 전에, 적어도 수시간 동안 잘 교반함으로써 배지에 공기를 쐬어 준다(산소로 포화).
어세이
- 배양 배지로 충전된 100ml 유리 병(Schott, 독일)에 외식편을 넣는다. 각 병에는 동일 중량의 싹을 넣는다(±700mg).
- 병에 가득 채워 넘치게 하고 긴밀하게 폐쇄한다(대량의 공기 기포 피함).
- 외식편을 함유하지 않는 배양 배지(blanco)를 병에 채운다.
- 24℃에서 낮은 광으로 3-4시간(브라씨카 나푸스), 3시간(아라비돕시스)동안 배양한다.
- 배양하는 동안 서서히 진탕시킨다(외식편 주변의 배지의 산소 결핍을 피하기 위해).
- 손으로 쥐는 용존산소 미터(Cyberscan DO 310; Eutech Instruments, 싱가포르)를 이용하여 배양 배지의 산소 함량(mg/l)을 측정한다.
- mg/l 소모 산소 = [산소] blanco - [산소]샘플
실시예
5.
ParG
유전자 발현을 감소시키는
키메라
유전자를 포함하는 트랜스제닉 식물주의 분석
실시예 2의 키메라 유전자를 아그로박테륨 매개 형질전환에 의해 아라비돕시스(Arabidopsis)와 담배(Nicotiana tabacum) 품종 Petit Havana SR1에 도입하였다.
트랜스제닉 종자를 MS염/2; B5 비타민; 1.5% 수크로오스; pH 5.8 및 0.7% Difco 한천을 함유하는 배지상에서 발아시켰다. 발아된 종자를 14 내지 18일간 약 30 μmol m-1s-1의 낮은 광(광합성 양자 플럭스) 처리시킨 후, 광세기를 약 6배 증가시켰다(광합성 양자 플럭스 약 190μmolm-1s-1). 1일 후, 효소적 사이클링 방법[Karp et al. (1983) Anal. Biochem. 128, pp175-180]을 이용하여 NAD 및 NADH 함량을 측정하였다. 묘목의 일부를 높은 광 조건하에서 약 3일 내지 며칠 배양시킨 후 손상을 평가하였다. 손상은 어린 잎과 싹의 선단이 어두워지고, 오래된 잎이 탈색되며 성장이 둔화되는 것으로부터 눈으로 확인할 수 있다. 아라비돕시스에 대한 결과를 표 1에 요약하고 담배에 대한 결과는 표 2에 요약한다.
트랜스제닉 식물에서 높은 광 스트레스에 대한 내성과 세포의 NAD+NADH 함량 사이에는 긍정적인 상관관계가 있다. TTC 감소능과 높은 광 내성 사이에는 반대되는 상관관계가 관찰될 수 있다.
실시예 6. 곡류 식물에 사용하기에 적합한 ParG 유전자 발현 감소성 키메라 유전자의 제조.
곡류, 예를 들면 벼 또는 옥수수 및 관련 식물에서 PARG 유전자의 발현을 감소시키기 위하여, PARG 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열과 높은 서열 동일성을 갖는 단백질을 암호화할 수 있는, 벼로부터 얻은 뉴클레오타이드 서열의 센스 및 안티센스 영역을 둘 모두 포함하는 dsRNA를 발현할 수 있는 키메라 유전자를 제조한다. 이러한 키메라 유전자는 다음 DNA 단편을 포함한다:
● 꽃양배추 모자이크 바이러스로부터 얻은 프로모터 영역(CaMV 35S);
● 벼(Oryza sativa)로부터 얻은 ParG 상동체로부터의 적어도 100bp의 서열을 정방향으로 포함하는 DNA 단편(서열번호 15);
● 플라베리아(Flaveria)로부터 얻은 pdk 유전자로부터의 인트론 2를 암호화하는 DNA 단편;
● 벼(Oryza sativa)로부터 얻은 ParG 상동체로부터의 적어도 100bp의 서열을 역방향으로 포함하는 DNA 단편(서열번호 15);
● 아그로박테륨 튜메파시엔스(Agrobacterium tumefaciense)로부터 얻은 옥토핀 합성효소로부터의 3' 미번역 말단의 단편.
키메라 유전자를, 예컨대 제초제 포스피노트리신에 대한 내성을 제공하는 선별가능한 마커 유전자와 함께 T-DNA로부터 좌우 경계 서열 사이의 T-DNA 벡터에 도입하였다.
벼 또는 옥수수 및 관련 식물과 같은 곡류에서 PARG 유전자의 발현을 감소시키기 위하여, PARG 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열과 높은 서열 동일성을 갖는 단백질을 암호화할 수 있는, 벼로부터 얻은 뉴클레오타이드 서열의 센스 및 안티센스 영역을 둘 모두 포함하는 dsRNA를 발현할 수 있는 키메라 유전자를 작성한다. 이러한 키메라 유전자는 다음 DNA 단편을 포함한다:
● 꽃양배추 모자이크 바이러스로부터 얻은 프로모터 영역(CaMV 35S);
● 옥수수(Zae mays)로부터 얻은 ParG 상동체로부터의 적어도 100bp의 서열을 정방향으로 포함하는 DNA 단편(서열번호 23);
● 플라베리아(Flaveria)로부터 얻은 pdk 유전자로부터의 인트론 2를 암호화하는 DNA 단편;
● 옥수수(Zae mays)로부터 얻은 ParG 상동체로부터의 적어도 100bp의 서열을 역방향으로 포함하는 DNA 단편(서열번호 23);
● 아그로박테륨 튜메파시엔스(Agrobacterium tumefaciense)로부터 얻은 옥토핀 합성효소로부터의 3' 미번역 말단의 단편.
키메라 유전자를, 예컨대 제초제 포스피노트리신에 대한 내성을 제공하는 선별가능한 마커 유전자와 함께 T-DNA로부터 좌우 경계 서열 사이의 T-DNA 벡터에 도입하였다. 앞 단락에서 기재한 바와 같은 2개의 상이한 키메라 유전자를 포함하는 2개 예의 T-DNA 벡터의 뉴클레오타이드 서열은 서열번호 24 및 25에 예시되어 있다.
실시예
7.
ParG
유전자 발현을 감소시키는
키메라
유전자를 포함하는
트랜스
제닉 식물주의 분석.
실시예 6의 키메라 유전자를 아그로박테륨 매개 형질전환에 의해 벼 또는 옥수수에 각각 도입한다.
얻은 트랜스제닉 주 집단은 대조용 식물과 함께 하기 스트레스 조건으로 처리시켰다:
● 일정 일수 동안(온실) 또는 일정 시간(시험관내) 동안 증가된 열
● 일정 일수 동안 가뭄
● 일정 일수 동안 강한 광 조건
● 영양 결핍.
상술한 스트레스 조건 또는 적어도 그 하나를 잘 견디어 생존한 개별 식물주 를 선별하였다.
상술한 식물에 대한 NAD 함량 및 ATP 함량은 대조 및 스트레스 조건하에서 측정하였다.
SEQUENCE LISTING
<110> Bayer BioScience N.V.
De Block, Marc
<120> Methods and means for increasing the tolerance of plants to stress conditions.
<130> BCS 03 2002 WO1
<150> EP03076044.1
<151> 2003-04-09
<150> US 60/496,688
<151> 2003-08-21
<160> 25
<170> PatentIn version 3.1
<210> 1
<211> 548
<212> PRT
<213> Arabidopsis thaliana
<400> 1
Met Glu Asn Arg Glu Asp Leu Asn Ser Ile Leu Pro Tyr Leu Pro Leu
1 5 10 15
Val Ile Arg Ser Ser Ser Leu Tyr Trp Pro Pro Arg Val Val Glu Ala
20 25 30
Leu Lys Ala Met Ser Glu Gly Pro Ser His Ser Gln Val Asp Ser Gly
35 40 45
Glu Val Leu Arg Gln Ala Ile Phe Asp Met Arg Arg Ser Leu Ser Phe
50 55 60
Ser Thr Leu Glu Pro Ser Ala Ser Asn Gly Tyr Ala Phe Leu Phe Asp
65 70 75 80
Glu Leu Ile Asp Glu Lys Glu Ser Lys Arg Trp Phe Asp Glu Ile Ile
85 90 95
Pro Ala Leu Ala Ser Leu Leu Leu Gln Phe Pro Ser Leu Leu Glu Val
100 105 110
His Phe Gln Asn Ala Asp Asn Ile Val Ser Gly Ile Lys Thr Gly Leu
115 120 125
Arg Leu Leu Asn Ser Gln Gln Ala Gly Ile Val Phe Leu Ser Gln Glu
130 135 140
Leu Ile Gly Ala Leu Leu Ala Cys Ser Phe Phe Cys Leu Phe Pro Asp
145 150 155 160
Asp Asn Arg Gly Ala Lys His Leu Pro Val Ile Asn Phe Asp His Leu
165 170 175
Phe Ala Ser Leu Tyr Ile Ser Tyr Ser Gln Ser Gln Glu Ser Lys Ile
180 185 190
Arg Cys Ile Met His Tyr Phe Glu Arg Phe Cys Ser Cys Val Pro Ile
195 200 205
Gly Ile Val Ser Phe Glu Arg Lys Ile Thr Ala Ala Pro Asp Ala Asp
210 215 220
Phe Trp Ser Lys Ser Asp Val Ser Leu Cys Ala Phe Lys Val His Ser
225 230 235 240
Phe Gly Leu Ile Glu Asp Gln Pro Asp Asn Ala Leu Glu Val Asp Phe
245 250 255
Ala Asn Lys Tyr Leu Gly Gly Gly Ser Leu Ser Arg Gly Cys Val Gln
260 265 270
Glu Glu Ile Arg Phe Met Ile Asn Pro Glu Leu Ile Ala Gly Met Leu
275 280 285
Phe Leu Pro Arg Met Asp Asp Asn Glu Ala Ile Glu Ile Val Gly Ala
290 295 300
Glu Arg Phe Ser Cys Tyr Thr Gly Tyr Ala Ser Ser Phe Arg Phe Ala
305 310 315 320
Gly Glu Tyr Ile Asp Lys Lys Ala Met Asp Pro Phe Lys Arg Arg Arg
325 330 335
Thr Arg Ile Val Ala Ile Asp Ala Leu Cys Thr Pro Lys Met Arg His
340 345 350
Phe Lys Asp Ile Cys Leu Leu Arg Glu Ile Asn Lys Ala Leu Cys Gly
355 360 365
Phe Leu Asn Cys Ser Lys Ala Trp Glu His Gln Asn Ile Phe Met Asp
370 375 380
Glu Gly Asp Asn Glu Ile Gln Leu Val Arg Asn Gly Arg Asp Ser Gly
385 390 395 400
Leu Leu Arg Thr Glu Thr Thr Ala Ser His Arg Thr Pro Leu Asn Asp
405 410 415
Val Glu Met Asn Arg Glu Lys Pro Ala Asn Asn Leu Ile Arg Asp Phe
420 425 430
Tyr Val Glu Gly Val Asp Asn Glu Asp His Glu Asp Asp Gly Val Ala
435 440 445
Thr Gly Asn Trp Gly Cys Gly Val Phe Gly Gly Asp Pro Glu Leu Lys
450 455 460
Ala Thr Ile Gln Trp Leu Ala Ala Ser Gln Thr Arg Arg Pro Phe Ile
465 470 475 480
Ser Tyr Tyr Thr Phe Gly Val Glu Ala Leu Arg Asn Leu Asp Gln Val
485 490 495
Thr Lys Trp Ile Leu Ser His Lys Trp Thr Val Gly Asp Leu Trp Asn
500 505 510
Met Met Leu Glu Tyr Ser Ala Gln Arg Leu Tyr Lys Gln Thr Ser Val
515 520 525
Gly Phe Phe Ser Trp Leu Leu Pro Ser Leu Ala Thr Thr Asn Lys Ala
530 535 540
Ile Gln Pro Pro
545
<210> 2
<211> 169
<212> PRT
<213> Solanum tuberosum
<400> 2
Met Glu Asn Arg Glu Asp Val Lys Ser Ile Leu Pro Phe Leu Pro Val
1 5 10 15
Cys Leu Arg Ser Ser Ser Leu Phe Trp Pro Pro Leu Val Val Glu Ala
20 25 30
Leu Lys Ala Leu Ser Glu Gly Pro His Tyr Ser Asn Val Asn Ser Gly
35 40 45
Gln Val Leu Phe Leu Ala Ile Ser Asp Ile Arg Asn Ser Leu Ser Leu
50 55 60
Pro Asp Ser Ser Ile Ser Ser Ser Ala Ser Asp Gly Phe Ser Leu Leu
65 70 75 80
Phe Asp Asp Leu Ile Pro Arg Asp Glu Ala Val Lys Trp Phe Lys Glu
85 90 95
Val Val Pro Lys Met Ala Asp Leu Leu Leu Arg Leu Pro Ser Leu Leu
100 105 110
Glu Ala His Tyr Glu Lys Ala Asp Gly Gly Ile Val Lys Gly Val Asn
115 120 125
Thr Gly Leu Arg Leu Leu Glu Ser Gln Gln Pro Gly Ile Val Phe Leu
130 135 140
Ser Gln Glu Leu Val Gly Ala Leu Leu Ala Cys Ser Phe Phe Cys Tyr
145 150 155 160
Ser Leu Pro Met Ile Glu Val Ser Val
165
<210> 3
<211> 1647
<212> DNA
<213> Arabidopsis thaliana
<400> 3
atggagaatc gcgaagatct taactcaatt cttccgtacc ttccacttgt aattcgttcg 60
tcgtcgctgt attggccgcc gcgtgtggtg gaggcgttaa aggcaatgtc tgaaggacca 120
tctcacagcc aagttgactc aggagaggtt ctacggcaag ctattttcga tatgagacga 180
tccttatctt tctctactct cgagccatct gcttctaatg gctacgcatt tctctttgac 240
gaattgattg atgagaaaga atcaaagaga tggttcgatg agattatccc agcattggcg 300
agcttacttc tacagtttcc atctctgtta gaagtgcatt tccaaaatgc tgataatatt 360
gttagtggaa tcaaaaccgg tcttcgtttg ttaaattccc aacaagctgg cattgttttc 420
ctcagccagg agttgattgg agctcttctt gcatgctctt tcttttgttt gtttccggat 480
gataatagag gtgcaaaaca ccttccagtc atcaactttg atcatttgtt tgcaagcctt 540
tatataagtt atagtcaaag tcaagaaagc aagataagat gtattatgca ttactttgaa 600
aggttttgct cctgcgtgcc tattggtatt gtttcatttg aacgcaagat taccgctgct 660
cctgatgctg atttctggag caagtctgac gtttctcttt gtgcatttaa ggttcactct 720
tttgggttaa ttgaagatca acctgacaat gctctcgaag tggactttgc aaacaagtat 780
ctcggaggtg gttccctaag tagagggtgc gtgcaggaag agatacgctt catgattaac 840
cctgaattaa tcgctggcat gcttttcttg cctcggatgg atgacaatga agctatagaa 900
atagttggtg cggaaagatt ttcatgttac acagggtatg catcttcgtt tcggtttgct 960
ggtgagtaca ttgacaaaaa ggcaatggat cctttcaaaa ggcgaagaac cagaattgtt 1020
gcaattgatg cattatgtac accgaagatg agacacttta aagatatatg tcttttaagg 1080
gaaattaata aggcactatg tggcttttta aattgtagca aggcttggga gcaccagaat 1140
atattcatgg atgaaggaga taatgaaatt cagcttgtcc gaaacggcag agattctggt 1200
cttctgcgta cagaaactac tgcgtcacac cgaactccac taaatgatgt tgagatgaat 1260
agagaaaagc ctgctaacaa tcttatcaga gatttttatg tggaaggagt tgataacgag 1320
gatcatgaag atgatggtgt cgcgacaggg aattggggat gtggtgtttt tggaggagac 1380
ccagagctaa aggctacgat acaatggctt gctgcttccc agactcgaag accatttata 1440
tcatattaca cctttggagt agaggcactc cgaaacctag atcaggtgac gaagtggatt 1500
ctttcccata aatggactgt tggagatctg tggaacatga tgttagaata ttctgctcaa 1560
aggctctaca agcaaaccag tgttggcttc ttttcttggc tacttccatc tctagctacc 1620
accaacaaag ctatccagcc gccttga 1647
<210> 4
<211> 598
<212> DNA
<213> Solanum tuberosum
<400> 4
gcaatggaga atagagaaga cgtgaagtca atccttccct ttttgccggt gtgtctccga 60
tcatcttctc ttttctggcc gccgctagtt gttgaagcac tgaaagccct ctctgaaggc 120
cctcattaca gcaatgttaa ctccggccaa gtcctcttcc tcgcaatctc cgacattcgg 180
aattcccttt cactacctga ttcttcaatt tcctcttctg cttcagacgg attttctctc 240
ttatttgatg atttaattcc tagggatgaa gctgttaaat ggttcaaaga agtggtgccg 300
aaaatggcgg atttgctatt gcggttgcct tccttattgg aggctcacta tgagaaggct 360
gatggtggaa ttgttaaagg agtcaacact ggtcttcgct tattggaatc acaacagcct 420
ggcattgttt tcctcagtca ggaattagtc ggtgctcttc ttgcatgttc cttcttttgc 480
tattccctac caatgataga ggtatctgta tgatcagtat gacgagaaat ttgaaaataa 540
attgaagtgc attcttcact attttgagag gattggctca ttgatacctg cgggctac 598
<210> 5
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> oligonucleotide primer ParGAt1
<400> 5
ggatcccctg caggacaaaa aggcaatgga tcctttc 37
<210> 6
<211> 39
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> oligonucleotide primer ParGAt2
<400> 6
gcacgaattc gcggccgcgg tgctcccaag ccttgctac 39
<210> 7
<211> 39
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> oligonucleotide primer ParGSt1
<400> 7
ggatcccctg caggctcact atgagaaggc tgatggtgg 39
<210> 8
<211> 43
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> oligonucleotide primer ParGSt2
<400> 8
gcacgaattc gcggccgcgt catactgatc atacagatac ctc 43
<210> 9
<211> 13466
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleotide sequence of pTVE428
<220>
<221> misc_feature
<222> (198)..(222)
<223> Right T-DNA border
<220>
<221> misc_feature
<222> (983)..(273)
<223> 3' ocs (3' untranslated end of octopine synthase gene)
<220>
<221> misc_feature
<222> (995)..(1155)
<223> part of poly (ADP-ribose) glycohydrolase
<220>
<221> misc_feature
<222> (1929)..(1188)
<223> intron 2 from the Pdk gene of Flaveria
<220>
<221> misc_feature
<222> (2122)..(1962)
<223> part of poly (ADP-ribose) glycohydrolase
<220>
<221> misc_feature
<222> (3476)..(2131)
<223> 35S promoter region from Cauliflower Mosaic Virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (3948)..(3737)
<223> 3' untranslated end of gene 7 from Agrobacterium tumefaciens
<220>
<221> misc_feature
<222> (4521)..(3970)
<223> bar coding region
<220>
<221> misc_feature
<222> (6247)..(4522)
<223> PSSuAra promoter region
<220>
<221> misc_feature
<222> (6415)..(6439)
<223> left border region of T-DNA of Agrobacterium tumefaciens
<400> 9
agattcgaag ctcggtcccg tgggtgttct gtcgtctcgt tgtacaacga aatccattcc 60
cattccgcgc tcaagatggc ttcccctcgg cagttcatca gggctaaatc aatctagccg 120
acttgtccgg tgaaatgggc tgcactccaa cagaaacaat caaacaaaca tacacagcga 180
cttattcaca cgcgacaaat tacaacggta tatatcctgc cagtactcgg ccgtcgaccg 240
cggtaccccg gaattaagct tgcatgcctg caggtcctgc tgagcctcga catgttgtcg 300
caaaattcgc cctggacccg cccaacgatt tgtcgtcact gtcaaggttt gacctgcact 360
tcatttgggg cccacataca ccaaaaaaat gctgcataat tctcggggca gcaagtcggt 420
tacccggccg ccgtgctgga ccgggttgaa tggtgcccgt aactttcggt agagcggacg 480
gccaatactc aacttcaagg aatctcaccc atgcgcgccg gcggggaacc ggagttccct 540
tcagtgaacg ttattagttc gccgctcggt gtgtcgtaga tactagcccc tggggccttt 600
tgaaatttga ataagattta tgtaatcagt cttttaggtt tgaccggttc tgccgctttt 660
tttaaaattg gatttgtaat aataaaacgc aattgtttgt tattgtggcg ctctatcata 720
gatgtcgcta taaacctatt cagcacaata tattgttttc attttaatat tgtacatata 780
agtagtaggg tacaatcagt aaattgaacg gagaatatta ttcataaaaa tacgatagta 840
acgggtgata tattcattag aatgaaccga aaccggcggt aaggatctga gctacacatg 900
ctcaggtttt ttacaacgtg cacaacagaa ttgaaagcaa atatcatgcg atcataggcg 960
tctcgcatat ctcattaaag caggactcta gagacaaaaa ggcaatggat cctttcaaaa 1020
ggcgaagaac cagaattgtt gcaattgatg cattatgtac accgaagatg agacacttta 1080
aagatatatg tcttttaagg gaaattaata aggcactatg tggcttttta aattgtagca 1140
aggcttggga gcaccatcga tttcgaaccc agcttcccaa ctgtaatcaa tccaaatgta 1200
agatcaatga taacacaatg acatgatcta tcatgttacc ttgtttattc atgttcgact 1260
aattcattta attaatagtc aatccattta gaagttaata aaactacaag tattatttag 1320
aaattaataa gaatgttgat tgaaaataat actatataaa atgatagatc ttgcgctttg 1380
ttatattagc attagattat gttttgttac attagattac tgtttctatt agtttgatat 1440
tatttgttac tttagcttgt tatttaatat tttgtttatt gataaattac aagcagattg 1500
gaatttctaa caaaatattt attaactttt aaactaaaat atttagtaat ggtatagata 1560
tttaattata taataaacta ttaatcataa aaaaatatta ttttaattta tttattctta 1620
tttttactat agtattttat cattgatatt taattcatca aaccagctag aattactatt 1680
atgattaaaa caaatattaa tgctagtata tcatcttaca tgttcgatca aattcattaa 1740
aaataatata cttactctca acttttatct tcttcgtctt acacatcact tgtcatattt 1800
ttttacatta ctatgttgtt tatgtaaaca atatatttat aaattatttt ttcacaatta 1860
taacaactat attattataa tcatactaat taacatcact taactatttt atactaaaag 1920
gaaaaaagaa aataattatt tccttaccaa gctggggtac cggtgctccc aagccttgct 1980
acaatttaaa aagccacata gtgccttatt aatttccctt aaaagacata tatctttaaa 2040
gtgtctcatc ttcggtgtac ataatgcatc aattgcaaca attctggttc ttcgcctttt 2100
gaaaggatcc attgcctttt tgtcctcgag cgtgtcctct ccaaatgaaa tgaacttcct 2160
tatatagagg aagggtcttg cgaaggatag tgggattgtg cgtcatccct tacgtcagtg 2220
gagatgtcac atcaatccac ttgctttgaa gacgtggttg gaacgtcttc tttttccacg 2280
atgctcctcg tgggtggggg tccatctttg ggaccactgt cggcagagag atcttgaatg 2340
atagcctttc ctttatcgca atgatggcat ttgtaggagc caccttcctt ttctactgtc 2400
ctttcgatga agtgacagat agctgggcaa tggaatccga ggaggtttcc cgaaattatc 2460
ctttgttgaa aagtctcaat agccctttgg tcttctgaga ctgtatcttt gacatttttg 2520
gagtagacca gagtgtcgtg ctccaccatg ttgacgaaga ttttcttctt gtcattgagt 2580
cgtaaaagac tctgtatgaa ctgttcgcca gtcttcacgg cgagttctgt tagatcctcg 2640
atttgaatct tagactccat gcatggcctt agattcagta ggaactacct ttttagagac 2700
tccaatctct attacttgcc ttggtttatg aagcaagcct tgaatcgtcc atactggaat 2760
agtacttctg atcttgagaa atatgtcttt ctctgtgttc ttgatgcaat tagtcctgaa 2820
tcttttgact gcatctttaa ccttcttggg aaggtatttg atctcctgga gattgttact 2880
cgggtagatc gtcttgatga gacctgctgc gtaggcctct ctaaccatct gtgggtcagc 2940
attctttctg aaattgaaga ggctaacctt ctcattatca gtggtgaaca tagtgtcgtc 3000
accttcacct tcgaacttcc ttcctagatc gtaaagatag aggaaatcgt ccattgtaat 3060
ctccggggca aaggagatct cttttggggc tggatcactg ctgggccttt tggttcctag 3120
cgtgagccag tgggcttttt gctttggtgg gcttgttagg gccttagcaa agctcttggg 3180
cttgagttga gcttctcctt tggggatgaa gttcaacctg tctgtttgct gacttgttgt 3240
gtacgcgtca gctgctgctc ttgcctctgt aatagtggca aatttcttgt gtgcaactcc 3300
gggaacgccg tttgttgccg cctttgtaca accccagtca tcgtatatac cggcatgtgg 3360
accgttatac acaacgtagt agttgatatg agggtgttga atacccgatt ctgctctgag 3420
aggagcaact gtgctgttaa gctcagattt ttgtgggatt ggaattaatt cgtcgagcgg 3480
ccgctcgacg agcgcgccga tatcgcgatc gcccgggccg gccatttaaa tgaattcgag 3540
ctcggtaccc aaacgcggcc gcaagctata acttcgtata gcatacatta tacgaagtta 3600
ttcgactcta gaggatccca attcccatgc atggagtcaa agattcaaat agaggacact 3660
tctcgaactc ggccgtcgaa ctcggccgtc gagtacatgg tcgataagaa aaggcaattt 3720
gtagatgtta attcccatct tgaaagaaat atagtttaaa tatttattga taaaataaca 3780
agtcaggtat tatagtccaa gcaaaaacat aaatttattg atgcaagttt aaattcagaa 3840
atatttcaat aactgattat atcagctggt acattgccgt agatgaaaga ctgagtgcga 3900
tattatgtgt aatacataaa ttgatgatat agctagctta gctcatcggg ggatcctaga 3960
cgcgtgagat cagatctcgg tgacgggcag gaccggacgg ggcggtaccg gcaggctgaa 4020
gtccagctgc cagaaaccca cgtcatgcca gttcccgtgc ttgaagccgg ccgcccgcag 4080
catgccgcgg ggggcatatc cgagcgcctc gtgcatgcgc acgctcgggt cgttgggcag 4140
cccgatgaca gcgaccacgc tcttgaagcc ctgtgcctcc agggacttca gcaggtgggt 4200
gtagagcgtg gagcccagtc ccgtccgctg gtggcggggg gagacgtaca cggtcgactc 4260
ggccgtccag tcgtaggcgt tgcgtgcctt ccaggggccc gcgtaggcga tgccggcgac 4320
ctcgccgtcc acctcggcga cgagccaggg atagcgctcc cgcagacgga cgaggtcgtc 4380
cgtccactcc tgcggttcct gcggctcggt acggaagttg accgtgcttg tctcgatgta 4440
gtggttgacg atggtgcaga ccgccggcat gtccgcctcg gtggcacggc ggatgtcggc 4500
cgggcgtcgt tctgggtcca ttgttcttct ttactctttg tgtgactgag gtttggtcta 4560
gtgctttggt catctatata taatgataac aacaatgaga acaagctttg gagtgatcgg 4620
agggtctagg atacatgaga ttcaagtgga ctaggatcta caccgttgga ttttgagtgt 4680
ggatatgtgt gaggttaatt ttacttggta acggccacaa aggcctaagg agaggtgttg 4740
agacccttat cggcttgaac cgctggaata atgccacgtg gaagataatt ccatgaatct 4800
tatcgttatc tatgagtgaa attgtgtgat ggtggagtgg tgcttgctca ttttacttgc 4860
ctggtggact tggccctttc cttatgggga atttatattt tacttactat agagctttca 4920
tacctttttt ttaccttgga tttagttaat atataatggt atgattcatg aataaaaatg 4980
ggaaattttt gaatttgtac tgctaaatgc ataagattag gtgaaactgt ggaatatata 5040
tttttttcat ttaaaagcaa aatttgcctt ttactagaat tataaatata gaaaaatata 5100
taacattcaa ataaaaatga aaataagaac tttcaaaaaa cagaactatg tttaatgtgt 5160
aaagattagt cgcacatcaa gtcatctgtt acaatatgtt acaacaagtc ataagcccaa 5220
caaagttagc acgtctaaat aaactaaaga gtccacgaaa atattacaaa tcataagccc 5280
aacaaagtta ttgatcaaaa aaaaaaaacg cccaacaaag ctaaacaaag tccaaaaaaa 5340
acttctcaag tctccatctt cctttatgaa cattgaaaac tatacacaaa acaagtcaga 5400
taaatctctt tctgggcctg tcttcccaac ctcctacatc acttccctat cggattgaat 5460
gttttacttg taccttttcc gttgcaatga tattgatagt atgtttgtga aaactaatag 5520
ggttaacaat cgaagtcatg gaatatggat ttggtccaag attttccgag agctttctag 5580
tagaaagccc atcaccagaa atttactagt aaaataaatc accaattagg tttcttatta 5640
tgtgccaaat tcaatataat tatagaggat atttcaaatg aaaacgtatg aatgttatta 5700
gtaaatggtc aggtaagaca ttaaaaaaat cctacgtcag atattcaact ttaaaaattc 5760
gatcagtgtg gaattgtaca aaaatttggg atctactata tatatataat gctttacaac 5820
acttggattt ttttttggag gctggaattt ttaatctaca tatttgtttt ggccatgcac 5880
caactcattg tttagtgtaa tactttgatt ttgtcaaata tatgtgttcg tgtatatttg 5940
tataagaatt tctttgacca tatacacaca cacatatata tatatatata tatattatat 6000
atcatgcact tttaattgaa aaaataatat atatatatat agtgcatttt ttctaacaac 6060
catatatgtt gcgattgatc tgcaaaaata ctgctagagt aatgaaaaat ataatctatt 6120
gctgaaatta tctcagatgt taagattttc ttaaagtaaa ttctttcaaa ttttagctaa 6180
aagtcttgta ataactaaag aataatacac aatctcgacc acggaaaaaa aacacataat 6240
aaatttgaat ttcgaccgcg gtacccggaa ttgggttata attacctcag gtcgaggaat 6300
taattcggta cgtacctaat aacttcgtat agcatacatt atacgaagtt atatggatct 6360
cgaggcatta cggcattacg gcactcgcga gggtcccaat tcgagcatgg agccatttac 6420
aattgaatat atcctgccgc cgctgccgct ttgcacccgg tggagcttgc atgttggttt 6480
ctacgcagaa ctgagccggt taggcagata atttccattg agaactgagc catgtgcacc 6540
ttccccccaa cacggtgagc gacggggcaa cggagtgatc cacatgggac ttttaaacat 6600
catccgtcgg atggcgttgc gagagaagca gtcgatccgt gagatcagcc gacgcaccgg 6660
gcaggcgcgc aacacgatcg caaagtattt gaacgcaggt acaatcgagc cgacgttcac 6720
ggtaccggaa cgaccaagca agctagctta gtaaagccct cgctagattt taatgcggat 6780
gttgcgatta cttcgccaac tattgcgata acaagaaaaa gccagccttt catgatatat 6840
ctcccaattt gtgtagggct tattatgcac gcttaaaaat aataaaagca gacttgacct 6900
gatagtttgg ctgtgagcaa ttatgtgctt agtgcatcta acgcttgagt taagccgcgc 6960
cgcgaagcgg cgtcggcttg aacgaattgt tagacattat ttgccgacta ccttggtgat 7020
ctcgcctttc acgtagtgga caaattcttc caactgatct gcgcgcgagg ccaagcgatc 7080
ttcttcttgt ccaagataag cctgtctagc ttcaagtatg acgggctgat actgggccgg 7140
caggcgctcc attgcccagt cggcagcgac atccttcggc gcgattttgc cggttactgc 7200
gctgtaccaa atgcgggaca acgtaagcac tacatttcgc tcatcgccag cccagtcggg 7260
cggcgagttc catagcgtta aggtttcatt tagcgcctca aatagatcct gttcaggaac 7320
cggatcaaag agttcctccg ccgctggacc taccaaggca acgctatgtt ctcttgcttt 7380
tgtcagcaag atagccagat caatgtcgat cgtggctggc tcgaagatac ctgcaagaat 7440
gtcattgcgc tgccattctc caaattgcag ttcgcgctta gctggataac gccacggaat 7500
gatgtcgtcg tgcacaacaa tggtgacttc tacagcgcgg agaatctcgc tctctccagg 7560
ggaagccgaa gtttccaaaa ggtcgttgat caaagctcgc cgcgttgttt catcaagcct 7620
tacggtcacc gtaaccagca aatcaatatc actgtgtggc ttcaggccgc catccactgc 7680
ggagccgtac aaatgtacgg ccagcaacgt cggttcgaga tggcgctcga tgacgccaac 7740
tacctctgat agttgagtcg atacttcggc gatcaccgct tccctcatga tgtttaactt 7800
tgttttaggg cgactgccct gctgcgtaac atcgttgctg ctccataaca tcaaacatcg 7860
acccacggcg taacgcgctt gctgcttgga tgcccgaggc atagactgta ccccaaaaaa 7920
acagtcataa caagccatga aaaccgccac tgcgccgtta ccaccgctgc gttcggtcaa 7980
ggttctggac cagttgcgtg agcgcatacg ctacttgcat tacagcttac gaaccgaaca 8040
ggcttatgtc cactgggttc gtgccttcat ccgtttccac ggtgtgcgtc acccggcaac 8100
cttgggcagc agcgaagtcg aggcatttct gtcctggctg gcgaacgagc gcaaggtttc 8160
ggtctccacg catcgtcagg cattggcggc cttgctgttc ttctacggca agtgctgtgc 8220
acggatctgc cctggcttca ggagatcgga agacctcggc cgtccgggcg cttgccggtg 8280
gtgctgaccc cggatgaagt ctctagagct ctagagggtt cgcatcctcg gttttctgga 8340
aggcgagcat cgtttgttcg cccagcttct gtatggaacg ggcatgcgga tcagtgaggg 8400
tttgcaactg cgggtcaagg atctggattt cgatcacggc acgatcatcg tgcgggaggg 8460
caagggctcc aaggatcggg ccttgatgtt acccgagagc ttggcaccca gcctgcgcga 8520
gcagggatcg atccaacccc tccgctgcta tagtgcagtc ggcttctgac gttcagtgca 8580
gccgtcttct gaaaacgaca tgtcgcacaa gtcctaagtt acgcgacagg ctgccgccct 8640
gcccttttcc tggcgttttc ttgtcgcgtg ttttagtcgc ataaagtaga atacttgcga 8700
ctagaaccgg agacattacg ccatgaacaa gagcgccgcc gctggcctgc tgggctatgc 8760
ccgcgtcagc accgacgacc aggacttgac caaccaacgg gccgaactgc acgcggccgg 8820
ctgcaccaag ctgttttccg agaagatcac cggcaccagg cgcgaccgcc cggagctggc 8880
caggatgctt gaccacctac gccctggcga cgttgtgaca gtgaccaggc tagaccgcct 8940
ggcccgcagc acccgcgacc tactggacat tgccgagcgc atccaggagg ccggcgcggg 9000
cctgcgtagc ctggcagagc cgtgggccga caccaccacg ccggccggcc gcatggtgtt 9060
gaccgtgttc gccggcattg ccgagttcga gcgttcccta atcatcgacc gcacccggag 9120
cgggcgcgag gccgccaagg cccgaggcgt gaagtttggc ccccgcccta ccctcacccc 9180
ggcacagatc gcgcacgccc gcgagctgat cgaccaggaa ggccgcaccg tgaaagaggc 9240
ggctgcactg cttggcgtgc atcgctcgac cctgtaccgc gcacttgagc gcagcgagga 9300
agtgacgccc accgaggcca ggcggcgcgg tgccttccgt gaggacgcat tgaccgaggc 9360
cgacgccctg gcggccgccg agaatgaacg ccaagaggaa caagcatgaa accgcaccag 9420
gacggccagg acgaaccgtt tttcattacc gaagagatcg aggcggagat gatcgcggcc 9480
gggtacgtgt tcgagccgcc cgcgcacgtc tcaaccgtgc ggctgcatga aatcctggcc 9540
ggtttgtctg atgccaagct ggcggcctgg ccggccagct tggccgctga agaaaccgag 9600
cgccgccgtc taaaaaggtg atgtgtattt gagtaaaaca gcttgcgtca tgcggtcgct 9660
gcgtatatga tgcgatgagt aaataaacaa atacgcaagg ggaacgcatg aaggttatcg 9720
ctgtacttaa ccagaaaggc gggtcaggca agacgaccat cgcaacccat ctagcccgcg 9780
ccctgcaact cgccggggcc gatgttctgt tagtcgattc cgatccccag ggcagtgccc 9840
gcgattgggc ggccgtgcgg gaagatcaac cgctaaccgt tgtcggcatc gaccgcccga 9900
cgattgaccg cgacgtgaag gccatcggcc ggcgcgactt cgtagtgatc gacggagcgc 9960
cccaggcggc ggacttggct gtgtccgcga tcaaggcagc cgacttcgtg ctgattccgg 10020
tgcagccaag cccttacgac atatgggcca ccgccgacct ggtggagctg gttaagcagc 10080
gcattgaggt cacggatgga aggctacaag cggcctttgt cgtgtcgcgg gcgatcaaag 10140
gcacgcgcat cggcggtgag gttgccgagg cgctggccgg gtacgagctg cccattcttg 10200
agtcccgtat cacgcagcgc gtgagctacc caggcactgc cgccgccggc acaaccgttc 10260
ttgaatcaga acccgagggc gacgctgccc gcgaggtcca ggcgctggcc gctgaaatta 10320
aatcaaaact catttgagtt aatgaggtaa agagaaaatg agcaaaagca caaacacgct 10380
aagtgccggc cgtccgagcg cacgcagcag caaggctgca acgttggcca gcctggcaga 10440
cacgccagcc atgaagcggg tcaactttca gttgccggcg gaggatcaca ccaagctgaa 10500
gatgtacgcg gtacgccaag gcaagaccat taccgagctg ctatctgaat acatcgcgca 10560
gctaccagag taaatgagca aatgaataaa tgagtagatg aattttagcg gctaaaggag 10620
gcggcatgga aaatcaagaa caaccaggca ccgacgccgt ggaatgcccc atgtgtggag 10680
gaacgggcgg ttggccaggc gtaagcggct gggttgtctg ccggccctgc aatggcactg 10740
gaacccccaa gcccgaggaa tcggcgtgac ggtcgcaaac catccggccc ggtacaaatc 10800
ggcgcggcgc tgggtgatga cctggtggag aagttgaagg ccgcgcaggc cgcccagcgg 10860
caacgcatcg aggcagaagc acgccccggt gaatcgtggc aagcggccgc tgatcgaatc 10920
cgcaaagaat cccggcaacc gccggcagcc ggtgcgccgt cgattaggaa gccgcccaag 10980
ggcgacgagc aaccagattt tttcgttccg atgctctatg acgtgggcac ccgcgatagt 11040
cgcagcatca tggacgtggc cgttttccgt ctgtcgaagc gtgaccgacg agctggcgag 11100
gtgatccgct acgagcttcc agacgggcac gtagaggttt ccgcagggcc ggccggcatg 11160
gccagtgtgt gggattacga cctggtactg atggcggttt cccatctaac cgaatccatg 11220
aaccgatacc gggaagggaa gggagacaag cccggccgcg tgttccgtcc acacgttgcg 11280
gacgtactca agttctgccg gcgagccgat ggcggaaagc agaaagacga cctggtagaa 11340
acctgcattc ggttaaacac cacgcacgtt gccatgcagc gtacgaagaa ggccaagaac 11400
ggccgcctgg tgacggtatc cgagggtgaa gccttgatta gccgctacaa gatcgtaaag 11460
agcgaaaccg ggcggccgga gtacatcgag atcgagctag ctgattggat gtaccgcgag 11520
atcacagaag gcaagaaccc ggacgtgctg acggttcacc ccgattactt tttgatcgat 11580
cccggcatcg gccgttttct ctaccgcctg gcacgccgcg ccgcaggcaa ggcagaagcc 11640
agatggttgt tcaagacgat ctacgaacgc agtggcagcg ccggagagtt caagaagttc 11700
tgtttcaccg tgcgcaagct gatcgggtca aatgacctgc cggagtacga tttgaaggag 11760
gaggcggggc aggctggccc gatcctagtc atgcgctacc gcaacctgat cgagggcgaa 11820
gcatccgccg gttcctaatg tacggagcag atgctagggc aaattgccct agcaggggaa 11880
aaaggtcgaa aaggtctctt tcctgtggat agcacgtaca ttgggaaccc aaagccgtac 11940
attgggaacc ggaacccgta cattgggaac ccaaagccgt acattgggaa ccggtcacac 12000
atgtaagtga ctgatataaa agagaaaaaa ggcgattttt ccgcctaaaa ctctttaaaa 12060
cttattaaaa ctcttaaaac ccgcctggcc tgtgcataac tgtctggcca gcgcacagcc 12120
gaagagctgc aaaaagcgcc tacccttcgg tcgctgcgct ccctacgccc cgccgcttcg 12180
cgtcggccta tcgcggccgc tggccgctca aaaatggctg gcctacggcc aggcaatcta 12240
ccagggcgcg gacaagccgc gccgtcgcca ctcgaccgcc ggcgcccaca tcaaggcacc 12300
ctgcctcgcg cgtttcggtg atgacggtga aaacctctga cacatgcagc tcccggagac 12360
ggtcacagct tgtctgtaag cggatgccgg gagcagacaa gcccgtcagg gcgcgtcagc 12420
gggtgttggc gggtgtcggg gcgcagccat gacccagtca cgtagcgata gcggagtgta 12480
tactggctta actatgcggc atcagagcag attgtactga gagtgcacca tatgcggtgt 12540
gaaataccgc acagatgcgt aaggagaaaa taccgcatca ggcgctcttc cgcttcctcg 12600
ctcactgact cgctgcgctc ggtcgttcgg ctgcggcgag cggtatcagc tcactcaaag 12660
gcggtaatac ggttatccac agaatcaggg gataacgcag gaaagaacat gtgagcaaaa 12720
ggccagcaaa aggccaggaa ccgtaaaaag gccgcgttgc tggcgttttt ccataggctc 12780
cgcccccctg acgagcatca caaaaatcga cgctcaagtc agaggtggcg aaacccgaca 12840
ggactataaa gataccaggc gtttccccct ggaagctccc tcgtgcgctc tcctgttccg 12900
accctgccgc ttaccggata cctgtccgcc tttctccctt cgggaagcgt ggcgctttct 12960
catagctcac gctgtaggta tctcagttcg gtgtaggtcg ttcgctccaa gctgggctgt 13020
gtgcacgaac cccccgttca gcccgaccgc tgcgccttat ccggtaacta tcgtcttgag 13080
tccaacccgg taagacacga cttatcgcca ctggcagcag ccactggtaa caggattagc 13140
agagcgaggt atgtaggcgg tgctacagag ttcttgaagt ggtggcctaa ctacggctac 13200
actagaagga cagtatttgg tatctgcgct ctgctgaagc cagttacctt cggaaaaaga 13260
gttggtagct cttgatccgg caaacaaacc accgctggta gcggtggttt ttttgtttgc 13320
aagcagcaga ttacgcgcag aaaaaaagga tctcaagaag atccggaaaa cgcaagcgca 13380
aagagaaagc aggtagcttg cagtgggctt acatggcgat agctagactg ggcggtttta 13440
tggacagcaa gcgaaccgga attgcc 13466
<210> 10
<211> 31
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Consensus sequence 1 of PARG protein
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (2)..(2)
<223> X represents any amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (8)..(10)
<223> X represents any amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (14)..(17)
<223> X represents any amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (19)..(19)
<223> X represents any amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (27)..(29)
<223> X represents any amino acid
<400> 10
Leu Xaa Val Asp Phe Ala Asn Xaa Xaa Xaa Gly Gly Gly Xaa Xaa Xaa
1 5 10 15
Xaa Gly Xaa Val Gln Glu Glu Ile Arg Phe Xaa Xaa Xaa Pro Glu
20 25 30
<210> 11
<211> 20
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Consensus sequence 2 for PARG protein
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> X represents any amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (10)..(10)
<223> X represents any amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (13)..(14)
<223> X represents any amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (17)..(19)
<223> X represents any amino acid
<400> 11
Thr Gly Xaa Trp Gly Cys Gly Ala Phe Xaa Gly Asp Xaa Xaa Leu Lys
1 5 10 15
Xaa Xaa Xaa Gln
20
<210> 12
<211> 13
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Consensus sequence 3 for PARG protein
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (2)..(4)
<223> X represents any amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (6)..(9)
<223> X represents any amino acid
<400> 12
Asp Xaa Xaa Xaa Arg Xaa Xaa Xaa Xaa Ala Ile Asp Ala
1 5 10
<210> 13
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Consensus sequence 4 for PARG protein
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(4)
<223> X represents any amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (7)..(8)
<223> X represents any amino acid
<400> 13
Arg Glu Xaa Xaa Lys Ala Xaa Xaa Gly Phe
1 5 10
<210> 14
<211> 11
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> conserved PARG region
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (2)..(5)
<223> X represents any amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (7)..(7)
<223> X represents any amino acid
<400> 14
Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Ser Xaa Tyr Thr Gly Tyr
1 5 10
<210> 15
<211> 1530
<212> DNA
<213> Oryza sativa
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(1530)
<223>
<400> 15
atg gag gcg cgc ggc gac ctg cgc tcg atc ctg ccc tac ctc ccc gtc 48
Met Glu Ala Arg Gly Asp Leu Arg Ser Ile Leu Pro Tyr Leu Pro Val
1 5 10 15
gtg ctc cgc ggc ggc gcg ctc ttc tgg ccg ccg gcg gcg cag gag gcg 96
Val Leu Arg Gly Gly Ala Leu Phe Trp Pro Pro Ala Ala Gln Glu Ala
20 25 30
ctc aag gcg ctg gcg ctg ggc ccc gac gtg agc cgc gtc tcc tcc ggc 144
Leu Lys Ala Leu Ala Leu Gly Pro Asp Val Ser Arg Val Ser Ser Gly
35 40 45
gac gtc ctc gcc gac gcc ctc acc gac ctc cgc ctc gcg ctc aac ctc 192
Asp Val Leu Ala Asp Ala Leu Thr Asp Leu Arg Leu Ala Leu Asn Leu
50 55 60
gac cca ctc ccg cgc cgc gcc gcc gag ggc ttc gcg ctc ttc ttc gac 240
Asp Pro Leu Pro Arg Arg Ala Ala Glu Gly Phe Ala Leu Phe Phe Asp
65 70 75 80
gac ctc ctg tcg cgg gcg cag gcg cgg gac tgg ttc gac cac gtc gcc 288
Asp Leu Leu Ser Arg Ala Gln Ala Arg Asp Trp Phe Asp His Val Ala
85 90 95
ccc tcc ctc gcc cgc ctc ctc ctc cgc ctc ccc acg ctg ctc gag ggc 336
Pro Ser Leu Ala Arg Leu Leu Leu Arg Leu Pro Thr Leu Leu Glu Gly
100 105 110
cac tac cgc gcc gcc ggc gac gag gct cgc ggg ctc cgc atc ctg agc 384
His Tyr Arg Ala Ala Gly Asp Glu Ala Arg Gly Leu Arg Ile Leu Ser
115 120 125
tcg cag gat gcc ggg ctc gtg ctc ctc agc cag gag ctc gcc gcc gcg 432
Ser Gln Asp Ala Gly Leu Val Leu Leu Ser Gln Glu Leu Ala Ala Ala
130 135 140
ctg ctc gcc tgc gcg ctc ttc tgc ctg ttc ccc acc gcc gat agg gcc 480
Leu Leu Ala Cys Ala Leu Phe Cys Leu Phe Pro Thr Ala Asp Arg Ala
145 150 155 160
gag gcg tgc ctc ccg gcg atc aat ttc gat agc cta ttt gcg gca ctg 528
Glu Ala Cys Leu Pro Ala Ile Asn Phe Asp Ser Leu Phe Ala Ala Leu
165 170 175
tgt tat aat tcg agg caa agc cag gag cag aag gtg agg tgc ctt gtt 576
Cys Tyr Asn Ser Arg Gln Ser Gln Glu Gln Lys Val Arg Cys Leu Val
180 185 190
cac tat ttt gac agg gtg acc gct tct aca cct act ggt tcc gtt tcg 624
His Tyr Phe Asp Arg Val Thr Ala Ser Thr Pro Thr Gly Ser Val Ser
195 200 205
ttt gag cgt aag gtt ctt cct cgc cgt cct gaa tct gat ggc att acg 672
Phe Glu Arg Lys Val Leu Pro Arg Arg Pro Glu Ser Asp Gly Ile Thr
210 215 220
tac cct gac atg gat act tgg atg aaa tct ggt gtt ccc ctt tgc aca 720
Tyr Pro Asp Met Asp Thr Trp Met Lys Ser Gly Val Pro Leu Cys Thr
225 230 235 240
ttc cgg gta ttt tcc tca ggc ttg ata gaa gat gag gaa caa gaa gcc 768
Phe Arg Val Phe Ser Ser Gly Leu Ile Glu Asp Glu Glu Gln Glu Ala
245 250 255
ctt gaa gtt gac ttt gca aat aga tat ttg gga ggt ggc gca ctt tcc 816
Leu Glu Val Asp Phe Ala Asn Arg Tyr Leu Gly Gly Gly Ala Leu Ser
260 265 270
aga ggc tgc gtg cag gaa gaa atc cgg ttc atg ata aac cca gaa ttg 864
Arg Gly Cys Val Gln Glu Glu Ile Arg Phe Met Ile Asn Pro Glu Leu
275 280 285
atc gtg ggc atg ctc ttc atg gtt tca atg gaa gat aat gaa gct ata 912
Ile Val Gly Met Leu Phe Met Val Ser Met Glu Asp Asn Glu Ala Ile
290 295 300
gaa att gtt ggt gca gaa agg ttc tca cag tac atg ggg tat ggt tcc 960
Glu Ile Val Gly Ala Glu Arg Phe Ser Gln Tyr Met Gly Tyr Gly Ser
305 310 315 320
tca ttc cgt ttt act ggt gac tac tta gat agc aaa ccc ttt gat gcg 1008
Ser Phe Arg Phe Thr Gly Asp Tyr Leu Asp Ser Lys Pro Phe Asp Ala
325 330 335
atg ggt aga cgg aaa act agg ata gtg gca att gat gct ttg gac tgt 1056
Met Gly Arg Arg Lys Thr Arg Ile Val Ala Ile Asp Ala Leu Asp Cys
340 345 350
cca act agg tta cag ttt gaa tct agt ggt ctt cta agg gaa gtg aac 1104
Pro Thr Arg Leu Gln Phe Glu Ser Ser Gly Leu Leu Arg Glu Val Asn
355 360 365
aag gct ttt tgt gga ttt ttg gat caa tca aat cat cag ctc tgt gca 1152
Lys Ala Phe Cys Gly Phe Leu Asp Gln Ser Asn His Gln Leu Cys Ala
370 375 380
aag ctt gtc cag gat tta aat aca aag gat aac tgt cca agt gtc att 1200
Lys Leu Val Gln Asp Leu Asn Thr Lys Asp Asn Cys Pro Ser Val Ile
385 390 395 400
cct gat gaa tgc ata gga gtt tca act gga aac tgg ggt tgc ggg gct 1248
Pro Asp Glu Cys Ile Gly Val Ser Thr Gly Asn Trp Gly Cys Gly Ala
405 410 415
ttt ggt gga aac cct gaa atc aag agc atg att caa tgg att gct gca 1296
Phe Gly Gly Asn Pro Glu Ile Lys Ser Met Ile Gln Trp Ile Ala Ala
420 425 430
tca cag gca ctc cga tct ttt att aac tac tac act ttt gag tcc gaa 1344
Ser Gln Ala Leu Arg Ser Phe Ile Asn Tyr Tyr Thr Phe Glu Ser Glu
435 440 445
tca ctg aaa aga tta gaa gag gtg acc cag tgg ata ttg cgc cat agg 1392
Ser Leu Lys Arg Leu Glu Glu Val Thr Gln Trp Ile Leu Arg His Arg
450 455 460
tgg acg gtt ggc gag ttg tgg gac atg ctt gtg gag tat tca tcc cag 1440
Trp Thr Val Gly Glu Leu Trp Asp Met Leu Val Glu Tyr Ser Ser Gln
465 470 475 480
agg cta aga gga gac acc aat gag ggc ttt tta aca tgg cta ctt ccc 1488
Arg Leu Arg Gly Asp Thr Asn Glu Gly Phe Leu Thr Trp Leu Leu Pro
485 490 495
aag gac atc ccc aat ggt gat gta gat tac atg tgt gaa tag 1530
Lys Asp Ile Pro Asn Gly Asp Val Asp Tyr Met Cys Glu
500 505
<210> 16
<211> 509
<212> PRT
<213> Oryza sativa
<400> 16
Met Glu Ala Arg Gly Asp Leu Arg Ser Ile Leu Pro Tyr Leu Pro Val
1 5 10 15
Val Leu Arg Gly Gly Ala Leu Phe Trp Pro Pro Ala Ala Gln Glu Ala
20 25 30
Leu Lys Ala Leu Ala Leu Gly Pro Asp Val Ser Arg Val Ser Ser Gly
35 40 45
Asp Val Leu Ala Asp Ala Leu Thr Asp Leu Arg Leu Ala Leu Asn Leu
50 55 60
Asp Pro Leu Pro Arg Arg Ala Ala Glu Gly Phe Ala Leu Phe Phe Asp
65 70 75 80
Asp Leu Leu Ser Arg Ala Gln Ala Arg Asp Trp Phe Asp His Val Ala
85 90 95
Pro Ser Leu Ala Arg Leu Leu Leu Arg Leu Pro Thr Leu Leu Glu Gly
100 105 110
His Tyr Arg Ala Ala Gly Asp Glu Ala Arg Gly Leu Arg Ile Leu Ser
115 120 125
Ser Gln Asp Ala Gly Leu Val Leu Leu Ser Gln Glu Leu Ala Ala Ala
130 135 140
Leu Leu Ala Cys Ala Leu Phe Cys Leu Phe Pro Thr Ala Asp Arg Ala
145 150 155 160
Glu Ala Cys Leu Pro Ala Ile Asn Phe Asp Ser Leu Phe Ala Ala Leu
165 170 175
Cys Tyr Asn Ser Arg Gln Ser Gln Glu Gln Lys Val Arg Cys Leu Val
180 185 190
His Tyr Phe Asp Arg Val Thr Ala Ser Thr Pro Thr Gly Ser Val Ser
195 200 205
Phe Glu Arg Lys Val Leu Pro Arg Arg Pro Glu Ser Asp Gly Ile Thr
210 215 220
Tyr Pro Asp Met Asp Thr Trp Met Lys Ser Gly Val Pro Leu Cys Thr
225 230 235 240
Phe Arg Val Phe Ser Ser Gly Leu Ile Glu Asp Glu Glu Gln Glu Ala
245 250 255
Leu Glu Val Asp Phe Ala Asn Arg Tyr Leu Gly Gly Gly Ala Leu Ser
260 265 270
Arg Gly Cys Val Gln Glu Glu Ile Arg Phe Met Ile Asn Pro Glu Leu
275 280 285
Ile Val Gly Met Leu Phe Met Val Ser Met Glu Asp Asn Glu Ala Ile
290 295 300
Glu Ile Val Gly Ala Glu Arg Phe Ser Gln Tyr Met Gly Tyr Gly Ser
305 310 315 320
Ser Phe Arg Phe Thr Gly Asp Tyr Leu Asp Ser Lys Pro Phe Asp Ala
325 330 335
Met Gly Arg Arg Lys Thr Arg Ile Val Ala Ile Asp Ala Leu Asp Cys
340 345 350
Pro Thr Arg Leu Gln Phe Glu Ser Ser Gly Leu Leu Arg Glu Val Asn
355 360 365
Lys Ala Phe Cys Gly Phe Leu Asp Gln Ser Asn His Gln Leu Cys Ala
370 375 380
Lys Leu Val Gln Asp Leu Asn Thr Lys Asp Asn Cys Pro Ser Val Ile
385 390 395 400
Pro Asp Glu Cys Ile Gly Val Ser Thr Gly Asn Trp Gly Cys Gly Ala
405 410 415
Phe Gly Gly Asn Pro Glu Ile Lys Ser Met Ile Gln Trp Ile Ala Ala
420 425 430
Ser Gln Ala Leu Arg Ser Phe Ile Asn Tyr Tyr Thr Phe Glu Ser Glu
435 440 445
Ser Leu Lys Arg Leu Glu Glu Val Thr Gln Trp Ile Leu Arg His Arg
450 455 460
Trp Thr Val Gly Glu Leu Trp Asp Met Leu Val Glu Tyr Ser Ser Gln
465 470 475 480
Arg Leu Arg Gly Asp Thr Asn Glu Gly Phe Leu Thr Trp Leu Leu Pro
485 490 495
Lys Asp Ile Pro Asn Gly Asp Val Asp Tyr Met Cys Glu
500 505
<210> 17
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> degenerate oligonucleotide primer PG1
<400> 17
atgtbccaca rmtckccrac mgtcc 25
<210> 18
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> degenerate oligonucleotide primer PG2
<400> 18
gggtytccwc caaaarcmcc rcawcccc 28
<210> 19
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> degenerate oligonucleotide primer PG3
<400> 19
gctatagaaa twgtyggtgy rgaaag 26
<210> 20
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> degenerate oligonucleotide primer PG4
<400> 20
agrggstgyg trcaggarga ratmcg 26
<210> 21
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> degenerate oligonucleotide primer PG5
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)..(18)
<223> n=any nucleotide
<400> 21
atggargaya aygargcnat hga 23
<210> 22
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> degenerate oligonucleotide primer PG6
<400> 22
ccaytgdagc atrctyttda gytc 24
<210> 23
<211> 603
<212> DNA
<213> zea mays
<400> 23
tagggctgtg tgcaggagga aatccgcttc atgataaacc ccgaattgat tgtgggtatg 60
ctattcttgt cttgtatgga agataacgag gctatagaaa tctttggtgc agaacggttc 120
tcacagtata tgggttatgg ttcctccttt cgctttgttg gtgactattt agataccaaa 180
ccctttgatt cgatgggcag acggagaact aggattgtgg ctatcgatgc tttggactgt 240
ccagctaggt tacactatga atctggctgt ctcctaaggg aagtgaacaa ggcattttgt 300
ggatttttcg atcaatcgaa acaccatctc tatgcgaagc ttttccagga tttgcacaac 360
aaggatgact tttcaagcat caattccagt gagtacgtag gagtttcaac aggaaactgg 420
ggttgtggtg cttttggtgg aaaccctgaa atcaagagca tgattcagtg gattgctgca 480
tcacaggctc ttcgcccttt tgttaattac tacacttttg agaacgtgtc tctgcaaaga 540
ttagaggagg tgatccagtg gatacggctt catggctgga ctgtcggcga gctgtggaac 600
ata 603
<210> 24
<211> 12987
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<223> T-DNA vector comprising a chimeric ParG expression reducing gene
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(25)
<223> complement of Left T-DNA border
<220>
<221> misc_feature
<222> (58)..(318)
<223> complement of 3' nos
<220>
<221> misc_feature
<222> (337)..(888)
<223> bar coding region
<220>
<221> misc_feature
<222> (889)..(1721)
<223> 35S promoter
<220>
<221> misc_feature
<222> (1728)..(3123)
<223> 35S promoter
<220>
<221> misc_feature
<222> (3133)..(3311)
<223> part of ParG homologue of Zea mays
<220>
<221> misc_feature
<222> (3344)..(4085)
<223> Pdk intron
<220>
<221> misc_feature
<222> (4119)..(4297)
<223> part of ParG homologue of Zea mays (inverted)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4310)..(5020)
<223> 3' OCS
<220>
<221> misc_feature
<222> (5066)..(5042)
<223> Right T-DNA border
<400> 24
cggcaggata tattcaattg taaatggctc catggcgatc gctctagagg atcttcccga 60
tctagtaaca tagatgacac cgcgcgcgat aatttatcct agtttgcgcg ctatattttg 120
ttttctatcg cgtattaaat gtataattgc gggactctaa tcataaaaac ccatctcata 180
aataacgtca tgcattacat gttaattatt acatgcttaa cgtaattcaa cagaaattat 240
atgataatca tcgcaagacc ggcaacagga ttcaatctta agaaacttta ttgccaaatg 300
tttgaacgat ctgcttcgga tcctagacgc gtgagatcag atctcggtga cgggcaggac 360
cggacggggc ggtaccggca ggctgaagtc cagctgccag aaacccacgt catgccagtt 420
cccgtgcttg aagccggccg cccgcagcat gccgcggggg gcatatccga gcgcctcgtg 480
catgcgcacg ctcgggtcgt tgggcagccc gatgacagcg accacgctct tgaagccctg 540
tgcctccagg gacttcagca ggtgggtgta gagcgtggag cccagtcccg tccgctggtg 600
gcggggggag acgtacacgg tcgactcggc cgtccagtcg taggcgttgc gtgccttcca 660
ggggcccgcg taggcgatgc cggcgacctc gccgtccacc tcggcgacga gccagggata 720
gcgctcccgc agacggacga ggtcgtccgt ccactcctgc ggttcctgcg gctcggtacg 780
gaagttgacc gtgcttgtct cgatgtagtg gttgacgatg gtgcagaccg ccggcatgtc 840
cgcctcggtg gcacggcgga tgtcggccgg gcgtcgttct gggtccatgg ttatagagag 900
agagatagat ttatagagag agactggtga tttcagcgtg tcctctccaa atgaaatgaa 960
cttccttata tagaggaagg gtcttgcgaa ggatagtggg attgtgcgtc atcccttacg 1020
tcagtggaga tgtcacatca atccacttgc tttgaagacg tggttggaac gtcttctttt 1080
tccacgatgc tcctcgtggg tgggggtcca tctttgggac cactgtcggc agaggcatct 1140
tgaatgatag cctttccttt atcgcaatga tggcatttgt aggagccacc ttccttttct 1200
actgtccttt cgatgaagtg acagatagct gggcaatgga atccgaggag gtttcccgaa 1260
attatccttt gttgaaaagt ctcaatagcc ctttggtctt ctgagactgt atctttgaca 1320
tttttggagt agaccagagt gtcgtgctcc accatgttga cgaagatttt cttcttgtca 1380
ttgagtcgta aaagactctg tatgaactgt tcgccagtct tcacggcgag ttctgttaga 1440
tcctcgattt gaatcttaga ctccatgcat ggccttagat tcagtaggaa ctaccttttt 1500
agagactcca atctctatta cttgccttgg tttatgaagc aagccttgaa tcgtccatac 1560
tggaatagta cttctgatct tgagaaatat gtctttctct gtgttcttga tgcaattagt 1620
cctgaatctt ttgactgcat ctttaacctt cttgggaagg tatttgatct cctggagatt 1680
gttactcggg tagatcgtct tgatgagacc tgctgcgtag gaacgcggcc gcgtatacgt 1740
atcgatatct tcgaattcga gctcgtcgag cggccgctcg acgaattaat tccaatccca 1800
caaaaatctg agcttaacag cacagttgct cctctcagag cagaatcggg tattcaacac 1860
cctcatatca actactacgt tgtgtataac ggtccacatg ccggtatata cgatgactgg 1920
ggttgtacaa aggcggcaac aaacggcgtt cccggagttg cacacaagaa atttgccact 1980
attacagagg caagagcagc agctgacgcg tacacaacaa gtcagcaaac agacaggttg 2040
aacttcatcc ccaaaggaga agctcaactc aagcccaaga gctttgctaa ggccctaaca 2100
agcccaccaa agcaaaaagc ccactggctc acgctaggaa ccaaaaggcc cagcagtgat 2160
ccagccccaa aagagatctc ctttgccccg gagattacaa tggacgattt cctctatctt 2220
tacgatctag gaaggaagtt cgaaggtgaa ggtgacgaca ctatgttcac cactgataat 2280
gagaaggtta gcctcttcaa tttcagaaag aatgctgacc cacagatggt tagagaggcc 2340
tacgcagcag gtctcatcaa gacgatctac ccgagtaaca atctccagga gatcaaatac 2400
cttcccaaga aggttaaaga tgcagtcaaa agattcagga ctaattgcat caagaacaca 2460
gagaaagaca tatttctcaa gatcagaagt actattccag tatggacgat tcaaggcttg 2520
cttcataaac caaggcaagt aatagagatt ggagtctcta aaaaggtagt tcctactgaa 2580
tctaaggcca tgcatggagt ctaagattca aatcgaggat ctaacagaac tcgccgtgaa 2640
gactggcgaa cagttcatac agagtctttt acgactcaat gacaagaaga aaatcttcgt 2700
caacatggtg gagcacgaca ctctggtcta ctccaaaaat gtcaaagata cagtctcaga 2760
agaccaaagg gctattgaga cttttcaaca aaggataatt tcgggaaacc tcctcggatt 2820
ccattgccca gctatctgtc acttcatcga aaggacagta gaaaaggaag gtggctccta 2880
caaatgccat cattgcgata aaggaaaggc tatcattcaa gatctctctg ccgacagtgg 2940
tcccaaagat ggacccccac ccacgaggag catcgtggaa aaagaagacg ttccaaccac 3000
gtcttcaaag caagtggatt gatgtgacat ctccactgac gtaagggatg acgcacaatc 3060
ccactatcct tcgcaagacc cttcctctat ataaggaagt tcatttcatt tggagaggac 3120
acgctcgagc ccgaattgat tgtgggtatg ctattcttgt cttgtatgga agataacgag 3180
gctatagaaa tctttggtgc agaacggttc tcacagtata tgggttatgg ttcctccttt 3240
cgctttgttg gtgactattt agataccaaa ccctttgatt cgatgggcag acggagaact 3300
aggattgtgg cggtacccca gcttggtaag gaaataatta ttttcttttt tccttttagt 3360
ataaaatagt taagtgatgt taattagtat gattataata atatagttgt tataattgtg 3420
aaaaaataat ttataaatat attgtttaca taaacaacat agtaatgtaa aaaaatatga 3480
caagtgatgt gtaagacgaa gaagataaaa gttgagagta agtatattat ttttaatgaa 3540
tttgatcgaa catgtaagat gatatactag cattaatatt tgttttaatc ataatagtaa 3600
ttctagctgg tttgatgaat taaatatcaa tgataaaata ctatagtaaa aataagaata 3660
aataaattaa aataatattt ttttatgatt aatagtttat tatataatta aatatctata 3720
ccattactaa atattttagt ttaaaagtta ataaatattt tgttagaaat tccaatctgc 3780
ttgtaattta tcaataaaca aaatattaaa taacaagcta aagtaacaaa taatatcaaa 3840
ctaatagaaa cagtaatcta atgtaacaaa acataatcta atgctaatat aacaaagcgc 3900
aagatctatc attttatata gtattatttt caatcaacat tcttattaat ttctaaataa 3960
tacttgtagt tttattaact tctaaatgga ttgactatta attaaatgaa ttagtcgaac 4020
atgaataaac aaggtaacat gatagatcat gtcattgtgt tatcattgat cttacatttg 4080
gattgattac agttgggaag ctgggttcga aatcgatagc cacaatccta gttctccgtc 4140
tgcccatcga atcaaagggt ttggtatcta aatagtcacc aacaaagcga aaggaggaac 4200
cataacccat atactgtgag aaccgttctg caccaaagat ttctatagcc tcgttatctt 4260
ccatacaaga caagaatagc atacccacaa tcaattcggg tctagagtcc tgctttaatg 4320
agatatgcga gacgcctatg atcgcatgat atttgctttc aattctgttg tgcacgttgt 4380
aaaaaacctg agcatgtgta gctcagatcc ttaccgccgg tttcggttca ttctaatgaa 4440
tatatcaccc gttactatcg tatttttatg aataatattc tccgttcaat ttactgattg 4500
taccctacta cttatatgta caatattaaa atgaaaacaa tatattgtgc tgaataggtt 4560
tatagcgaca tctatgatag agcgccacaa taacaaacaa ttgcgtttta ttattacaaa 4620
tccaatttta aaaaaagcgg cagaaccggt caaacctaaa agactgatta cataaatctt 4680
attcaaattt caaaaggccc caggggctag tatctacgac acaccgagcg gcgaactaat 4740
aacgttcact gaagggaact ccggttcccc gccggcgcgc atgggtgaga ttccttgaag 4800
ttgagtattg gccgtccgct ctaccgaaag ttacgggcac cattcaaccc ggtccagcac 4860
ggcggccggg taaccgactt gctgccccga gaattatgca gcattttttt ggtgtatgtg 4920
ggccccaaat gaagtgcagg tcaaaccttg acagtgacga caaatcgttg ggcgggtcca 4980
gggcgaattt tgcgacaaca tgtcgaggct cagcaggacc tgcaggtcga cggccgagta 5040
ctggcaggat atataccgtt gtaatttgtc gcgtgtgaat aagtcgctgt gtatgtttgt 5100
ttgattgttt ctgttggagt gcagcccatt tcaccggaca agtcggctag attgatttag 5160
ccctgatgaa ctgccgaggg gaagccatct tgagcgcgga atgggaatgg atttcgttgt 5220
acaacgagac gacagaacac ccacgggacc gagcttcgat cgagcatcaa atgaaactgc 5280
aatttattca tatcaggatt atcaatacca tatttttgaa aaagccgttt ctgtaatgaa 5340
ggagaaaact caccgaggca gttccatagg atggcaagat cctggtatcg gtctgcgatt 5400
ccgactcgtc caacatcaat acaacctatt aatttcccct cgtcaaaaat aaggttatca 5460
agtgagaaat caccatgagt gacgactgaa tccggtgaga atggcaaaag tttatgcatt 5520
tctttccaga cttgttcaac aggccagcca ttacgctcgt catcaaaatc actcgcatca 5580
accaaaccgt tattcattcg tgattgcgcc tgagcgagac gaaatacgcc gctgttaaaa 5640
ggacaattac aaacaggaat cgaatgcaac cggcgcagga acactgccag cgcatcaaca 5700
atattttcac ctgaatcagg atattcttct aatacctgga atgctgtttt tccggggatc 5760
gcagtggtga gtaaccatgc atcatcagga gtacggataa aatgcttgat ggtcggaaga 5820
ggcataaatt ccgtcagcca gtttagtctg accatctcat ctgtaacatc attggcaacg 5880
ctacctttgc catgtttcag aaacaactct ggcgcatcgg gcttcccata caatcgatag 5940
attgtcgcac ctgattgccc gacattatcc gaatctggca attccggttc gcttgctgtc 6000
cataaaaccg cccagtctag ctatcgccat gtaagcccac tgcaagctac ctgctttctc 6060
tttgcgcttg cgttttccgg atcttcttga gatccttttt ttctgcgcgt aatctgctgc 6120
ttgcaaacaa aaaaaccacc gctaccagcg gtggtttgtt tgccggatca agagctacca 6180
actctttttc cgaaggtaac tggcttcagc agagcgcaga taccaaatac tgtccttcta 6240
gtgtagccgt agttaggcca ccacttcaag aactctgtag caccgcctac atacctcgct 6300
ctgctaatcc tgttaccagt ggctgctgcc agtggcgata agtcgtgtct taccgggttg 6360
gactcaagac gatagttacc ggataaggcg cagcggtcgg gctgaacggg gggttcgtgc 6420
acacagccca gcttggagcg aacgacctac accgaactga gatacctaca gcgtgagcta 6480
tgagaaagcg ccacgcttcc cgaagggaga aaggcggaca ggtatccggt aagcggcagg 6540
gtcggaacag gagagcgcac gagggagctt ccagggggaa acgcctggta tctttatagt 6600
cctgtcgggt ttcgccacct ctgacttgag cgtcgatttt tgtgatgctc gtcagggggg 6660
cggagcctat ggaaaaacgc cagcaacgcg gcctttttac ggttcctggc cttttgctgg 6720
ccttttgctc acatgttctt tcctgcgtta tcccctgatt ctgtggataa ccgtattacc 6780
gcctttgagt gagctgatac cgctcgccgc agccgaacga ccgagcgcag cgagtcagtg 6840
agcgaggaag cggaagagcg cctgatgcgg tattttctcc ttacgcatct gtgcggtatt 6900
tcacaccgca tatggtgcac tctcagtaca atctgctctg atgccgcata gttaagccag 6960
tatacactcc gctatcgcta cgtgactggg tcatggctgc gccccgacac ccgccaacac 7020
ccgctgacgc gccctgacgg gcttgtctgc tcccggcatc cgcttacaga caagctgtga 7080
ccgtctccgg gagctgcatg tgtcagaggt tttcaccgtc atcaccgaaa cgcgcgaggc 7140
agggtgcctt gatgtgggcg ccggcggtcg agtggcgacg gcgcggcttg tccgcgccct 7200
ggtagattgc ctggccgtag gccagccatt tttgagcggc cagcggccgc gataggccga 7260
cgcgaagcgg cggggcgtag ggagcgcagc gaccgaaggg taggcgcttt ttgcagctct 7320
tcggctgtgc gctggccaga cagttatgca caggccaggc gggttttaag agttttaata 7380
agttttaaag agttttaggc ggaaaaatcg ccttttttct cttttatatc agtcacttac 7440
atgtgtgacc ggttcccaat gtacggcttt gggttcccaa tgtacgggtt ccggttccca 7500
atgtacggct ttgggttccc aatgtacgtg ctatccacag gaaagagacc ttttcgacct 7560
ttttcccctg ctagggcaat ttgccctagc atctgctccg tacattagga accggcggat 7620
gcttcgccct cgatcaggtt gcggtagcgc atgactagga tcgggccagc ctgccccgcc 7680
tcctccttca aatcgtactc cggcaggtca tttgacccga tcagcttgcg cacggtgaaa 7740
cagaacttct tgaactctcc ggcgctgcca ctgcgttcgt agatcgtctt gaacaaccat 7800
ctggcttctg ccttgcctgc ggcgcggcgt gccaggcggt agagaaaacg gccgatgccg 7860
ggatcgatca aaaagtaatc ggggtgaacc gtcagcacgt ccgggttctt gccttctgtg 7920
atctcgcggt acatccaatc agctagctcg atctcgatgt actccggccg cccggtttcg 7980
ctctttacga tcttgtagcg gctaatcaag gcttcaccct cggataccgt caccaggcgg 8040
ccgttcttgg ccttcttcgt acgctgcatg gcaacgtgcg tggtgtttaa ccgaatgcag 8100
gtttctacca ggtcgtcttt ctgctttccg ccatcggctc gccggcagaa cttgagtacg 8160
tccgcaacgt gtggacggaa cacgcggccg ggcttgtctc ccttcccttc ccggtatcgg 8220
ttcatggatt cggttagatg ggaaaccgcc atcagtacca ggtcgtaatc ccacacactg 8280
gccatgccgg ccggccctgc ggaaacctct acgtgcccgt ctggaagctc gtagcggatc 8340
acctcgccag ctcgtcggtc acgcttcgac agacggaaaa cggccacgtc catgatgctg 8400
cgactatcgc gggtgcccac gtcatagagc atcggaacga aaaaatctgg ttgctcgtcg 8460
cccttgggcg gcttcctaat cgacggcgca ccggctgccg gcggttgccg ggattctttg 8520
cggattcgat cagcggccgc ttgccacgat tcaccggggc gtgcttctgc ctcgatgcgt 8580
tgccgctggg cggcctgcgc ggccttcaac ttctccacca ggtcatcacc cagcgccgcg 8640
ccgatttgta ccgggccgga tggtttgcga ccgtcacgcc gattcctcgg gcttgggggt 8700
tccagtgcca ttgcagggcc ggcagacaac ccagccgctt acgcctggcc aaccgcccgt 8760
tcctccacac atggggcatt ccacggcgtc ggtgcctggt tgttcttgat tttccatgcc 8820
gcctccttta gccgctaaaa ttcatctact catttattca tttgctcatt tactctggta 8880
gctgcgcgat gtattcagat agcagctcgg taatggtctt gccttggcgt accgcgtaca 8940
tcttcagctt ggtgtgatcc tccgccggca actgaaagtt gacccgcttc atggctggcg 9000
tgtctgccag gctggccaac gttgcagcct tgctgctgcg tgcgctcgga cggccggcac 9060
ttagcgtgtt tgtgcttttg ctcattttct ctttacctca ttaactcaaa tgagttttga 9120
tttaatttca gcggccagcg cctggacctc gcgggcagcg tcgccctcgg gttctgattc 9180
aagaacggtt gtgccggcgg cggcagtgcc tgggtagctc acgcgctgcg tgatacggga 9240
ctcaagaatg ggcagctcgt acccggccag cgcctcggca acctcaccgc cgatgcgcgt 9300
gcctttgatc gcccgcgaca cgacaaaggc cgcttgtagc cttccatccg tgacctcaat 9360
gcgctgctta accagctcca ccaggtcggc ggtggcccat atgtcgtaag ggcttggctg 9420
caccggaatc agcacgaagt cggctgcctt gatcgcggac acagccaagt ccgccgcctg 9480
gggcgctccg tcgatcacta cgaagtcgcg ccggccgatg gccttcacgt cgcggtcaat 9540
cgtcgggcgg tcgatgccga caacggttag cggttgatct tcccgcacgg ccgcccaatc 9600
gcgggcactg ccctggggat cggaatcgac taacagaaca tcggccccgg cgagttgcag 9660
ggcgcgggct agatgggttg cgatggtcgt cttgcctgac ccgcctttct ggttaagtac 9720
agcgataacc ttcatgcgtt ccccttgcgt atttgtttat ttactcatcg catcatatac 9780
gcagcgaccg catgacgcaa gctgttttac tcaaatacac atcacctttt tagacggcgg 9840
cgctcggttt cttcagcggc caagctggcc ggccaggccg ccagcttggc atcagacaaa 9900
ccggccagga tttcatgcag ccgcacggtt gagacgtgcg cgggcggctc gaacacgtac 9960
ccggccgcga tcatctccgc ctcgatctct tcggtaatga aaaacggttc gtcctggccg 10020
tcctggtgcg gtttcatgct tgttcctctt ggcgttcatt ctcggcggcc gccagggcgt 10080
cggcctcggt caatgcgtcc tcacggaagg caccgcgccg cctggcctcg gtgggcgtca 10140
cttcctcgct gcgctcaagt gcgcggtaca gggtcgagcg atgcacgcca agcagtgcag 10200
ccgcctcttt cacggtgcgg ccttcctggt cgatcagctc gcgggcgtgc gcgatctgtg 10260
ccggggtgag ggtagggcgg gggccaaact tcacgcctcg ggccttggcg gcctcgcgcc 10320
cgctccgggt gcggtcgatg attagggaac gctcgaactc ggcaatgccg gcgaacacgg 10380
tcaacaccat gcggccggcc ggcgtggtgg tgtcggccca cggctctgcc aggctacgca 10440
ggcccgcgcc ggcctcctgg atgcgctcgg caatgtccag taggtcgcgg gtgctgcggg 10500
ccaggcggtc tagcctggtc actgtcacaa cgtcgccagg gcgtaggtgg tcaagcatcc 10560
tggccagctc cgggcggtcg cgcctggtgc cggtgatctt ctcggaaaac agcttggtgc 10620
agccggccgc gtgcagttcg gcccgttggt tggtcaagtc ctggtcgtcg gtgctgacgc 10680
gggcatagcc cagcaggcca gcggcggcgc tcttgttcat ggcgtaatgt ctccggttct 10740
agtcgcaagt attctacttt atgcgactaa aacacgcgac aagaaaacgc caggaaaagg 10800
gcagggcggc agcctgtcgc gtaacttagg acttgtgcga catgtcgttt tcagaagacg 10860
gctgcactga acgtcagaag ccgactgcac tatagcagcg gaggggttgg atcgatccct 10920
gctcgcgcag gctgggtgcc aagctctcgg gtaacatcaa ggcccgatcc ttggagccct 10980
tgccctcccg cacgatgatc gtgccgtgat cgaaatccag atccttgacc cgcagttgca 11040
aaccctcact gatccgcatg cccgttccat acagaagctg ggcgaacaaa cgatgctcgc 11100
cttccagaaa accgaggatg cgaaccactt catccggggt cagcaccacc ggcaagcgcc 11160
cggacggccg aggtcttccg atctcctgaa gccagggcag atccgtgcac agcacttgcc 11220
gtagaagaac agcaaggccg ccaatgcctg acgatgcgtg gagaccgaaa ccttgcgctc 11280
gttcgccagc caggacagaa atgcctcgac ttcgctgctg cccaaggttg ccgggtgacg 11340
cacaccgtgg aaacggatga aggcacgaac ccagtggaca taagcctgtt cggttcgtaa 11400
gctgtaatgc aagtagcgta tgcgctcacg caactggtcc agaaccttga ccgaacgcag 11460
cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat gactgttttt ttggggtaca 11520
gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc gtgggtcgat gtttgatgtt 11580
atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct aaaacaaagt taaacatcat 11640
gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca gaggtagttg gcgtcatcga 11700
gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac ggctccgcag tggatggcgg 11760
cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg accgtaaggc ttgatgaaac 11820
aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg gcttcccctg gagagagcga 11880
gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac gacatcattc cgtggcgtta 11940
tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc aatgacattc ttgcaggtat 12000
cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg ctgacaaaag caagagaaca 12060
tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt gatccggttc ctgaacagga 12120
tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac tcgccgcccg actgggctgg 12180
cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg tacagcgcag taaccggcaa 12240
aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag cgcctgccgg cccagtatca 12300
gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa gaagaagatc gcttggcctc 12360
gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa ggcgagatca ccaaggtagt 12420
cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc ttcgcggcgc ggcttaactc 12480
aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa actatcaggt caagtctgct 12540
tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat tgggagatat atcatgaaag 12600
gctggctttt tcttgttatc gcaatagttg gcgaagtaat cgcaacatcc gcattaaaat 12660
ctagcgaggg ctttactaag ctagcttgct tggtcgttcc ggtaccgtga acgtcggctc 12720
gattgtacct gcgttcaaat actttgcgat cgtgttgcgc gcctgcccgg tgcgtcggct 12780
gatctcacgg atcgactgct tctctcgcaa cgccatccga cggatgatgt ttaaaagtcc 12840
catgtggatc actccgttgc cccgtcgctc accgtgttgg ggggaaggtg cacatggctc 12900
agttctcaat ggaaattatc tgcctaaccg gctcagttct gcgtagaaac caacatgcaa 12960
gctccaccgg gtgcaaagcg gcagcgg 12987
<210> 25
<211> 13226
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<223> T-DNA vector comprising a chimeric ParG expression reducing gene
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(25)
<223> Left T-DNA border (C)
<220>
<221> misc_feature
<222> (58)..(318)
<223> 3' nos (C)
<220>
<221> misc_feature
<222> (337)..(888)
<223> bar coding region (C)
<220>
<221> misc_feature
<222> (889)..(1721)
<223> 35S3 promoter region (C)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1778)..(3123)
<223> 35S promoter region
<220>
<221> misc_feature
<222> (3130)..(3431)
<223> part of ParG homologue of Zea mays
<220>
<221> misc_feature
<222> (3464)..(4205)
<223> Pdk-intron
<220>
<221> misc_feature
<222> (4238)..(4536)
<223> part of ParG homologue of Zea mays (C)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4549)..(5259)
<223> 3' ocs
<220>
<221> misc_feature
<222> (5281)..(5305)
<223> Right T-dNA border (C)
<400> 25
cggcaggata tattcaattg taaatggctc catggcgatc gctctagagg atcttcccga 60
tctagtaaca tagatgacac cgcgcgcgat aatttatcct agtttgcgcg ctatattttg 120
ttttctatcg cgtattaaat gtataattgc gggactctaa tcataaaaac ccatctcata 180
aataacgtca tgcattacat gttaattatt acatgcttaa cgtaattcaa cagaaattat 240
atgataatca tcgcaagacc ggcaacagga ttcaatctta agaaacttta ttgccaaatg 300
tttgaacgat ctgcttcgga tcctagacgc gtgagatcag atctcggtga cgggcaggac 360
cggacggggc ggtaccggca ggctgaagtc cagctgccag aaacccacgt catgccagtt 420
cccgtgcttg aagccggccg cccgcagcat gccgcggggg gcatatccga gcgcctcgtg 480
catgcgcacg ctcgggtcgt tgggcagccc gatgacagcg accacgctct tgaagccctg 540
tgcctccagg gacttcagca ggtgggtgta gagcgtggag cccagtcccg tccgctggtg 600
gcggggggag acgtacacgg tcgactcggc cgtccagtcg taggcgttgc gtgccttcca 660
ggggcccgcg taggcgatgc cggcgacctc gccgtccacc tcggcgacga gccagggata 720
gcgctcccgc agacggacga ggtcgtccgt ccactcctgc ggttcctgcg gctcggtacg 780
gaagttgacc gtgcttgtct cgatgtagtg gttgacgatg gtgcagaccg ccggcatgtc 840
cgcctcggtg gcacggcgga tgtcggccgg gcgtcgttct gggtccatgg ttatagagag 900
agagatagat ttatagagag agactggtga tttcagcgtg tcctctccaa atgaaatgaa 960
cttccttata tagaggaagg gtcttgcgaa ggatagtggg attgtgcgtc atcccttacg 1020
tcagtggaga tgtcacatca atccacttgc tttgaagacg tggttggaac gtcttctttt 1080
tccacgatgc tcctcgtggg tgggggtcca tctttgggac cactgtcggc agaggcatct 1140
tgaatgatag cctttccttt atcgcaatga tggcatttgt aggagccacc ttccttttct 1200
actgtccttt cgatgaagtg acagatagct gggcaatgga atccgaggag gtttcccgaa 1260
attatccttt gttgaaaagt ctcaatagcc ctttggtctt ctgagactgt atctttgaca 1320
tttttggagt agaccagagt gtcgtgctcc accatgttga cgaagatttt cttcttgtca 1380
ttgagtcgta aaagactctg tatgaactgt tcgccagtct tcacggcgag ttctgttaga 1440
tcctcgattt gaatcttaga ctccatgcat ggccttagat tcagtaggaa ctaccttttt 1500
agagactcca atctctatta cttgccttgg tttatgaagc aagccttgaa tcgtccatac 1560
tggaatagta cttctgatct tgagaaatat gtctttctct gtgttcttga tgcaattagt 1620
cctgaatctt ttgactgcat ctttaacctt cttgggaagg tatttgatct cctggagatt 1680
gttactcggg tagatcgtct tgatgagacc tgctgcgtag gaacgcggcc gcgtatacgt 1740
atcgatatct tcgaattcga gctcgtcgag cggccgctcg acgaattaat tccaatccca 1800
caaaaatctg agcttaacag cacagttgct cctctcagag cagaatcggg tattcaacac 1860
cctcatatca actactacgt tgtgtataac ggtccacatg ccggtatata cgatgactgg 1920
ggttgtacaa aggcggcaac aaacggcgtt cccggagttg cacacaagaa atttgccact 1980
attacagagg caagagcagc agctgacgcg tacacaacaa gtcagcaaac agacaggttg 2040
aacttcatcc ccaaaggaga agctcaactc aagcccaaga gctttgctaa ggccctaaca 2100
agcccaccaa agcaaaaagc ccactggctc acgctaggaa ccaaaaggcc cagcagtgat 2160
ccagccccaa aagagatctc ctttgccccg gagattacaa tggacgattt cctctatctt 2220
tacgatctag gaaggaagtt cgaaggtgaa ggtgacgaca ctatgttcac cactgataat 2280
gagaaggtta gcctcttcaa tttcagaaag aatgctgacc cacagatggt tagagaggcc 2340
tacgcagcag gtctcatcaa gacgatctac ccgagtaaca atctccagga gatcaaatac 2400
cttcccaaga aggttaaaga tgcagtcaaa agattcagga ctaattgcat caagaacaca 2460
gagaaagaca tatttctcaa gatcagaagt actattccag tatggacgat tcaaggcttg 2520
cttcataaac caaggcaagt aatagagatt ggagtctcta aaaaggtagt tcctactgaa 2580
tctaaggcca tgcatggagt ctaagattca aatcgaggat ctaacagaac tcgccgtgaa 2640
gactggcgaa cagttcatac agagtctttt acgactcaat gacaagaaga aaatcttcgt 2700
caacatggtg gagcacgaca ctctggtcta ctccaaaaat gtcaaagata cagtctcaga 2760
agaccaaagg gctattgaga cttttcaaca aaggataatt tcgggaaacc tcctcggatt 2820
ccattgccca gctatctgtc acttcatcga aaggacagta gaaaaggaag gtggctccta 2880
caaatgccat cattgcgata aaggaaaggc tatcattcaa gatctctctg ccgacagtgg 2940
tcccaaagat ggacccccac ccacgaggag catcgtggaa aaagaagacg ttccaaccac 3000
gtcttcaaag caagtggatt gatgtgacat ctccactgac gtaagggatg acgcacaatc 3060
ccactatcct tcgcaagacc cttcctctat ataaggaagt tcatttcatt tggagaggac 3120
acgctcgagg aatctggctg tctcctaagg gaagtgaaca aggcattttg tggatttttc 3180
gatcaatcga aacaccatct ctatgcgaag cttttccagg atttgcacaa caaggatgac 3240
ttttcaagca tcaattccag tgagtacgta ggagtttcaa caggaaactg gggttgtggt 3300
gcttttggtg gaaaccctga aatcaagagc atgattcagt ggattgctgc atcacaggct 3360
cttcgccctt ttgttaatta ctacactttt gagaacgtgt ctctgcaaag attagaggag 3420
gtgatccagt gggtacccca gcttggtaag gaaataatta ttttcttttt tccttttagt 3480
ataaaatagt taagtgatgt taattagtat gattataata atatagttgt tataattgtg 3540
aaaaaataat ttataaatat attgtttaca taaacaacat agtaatgtaa aaaaatatga 3600
caagtgatgt gtaagacgaa gaagataaaa gttgagagta agtatattat ttttaatgaa 3660
tttgatcgaa catgtaagat gatatactag cattaatatt tgttttaatc ataatagtaa 3720
ttctagctgg tttgatgaat taaatatcaa tgataaaata ctatagtaaa aataagaata 3780
aataaattaa aataatattt ttttatgatt aatagtttat tatataatta aatatctata 3840
ccattactaa atattttagt ttaaaagtta ataaatattt tgttagaaat tccaatctgc 3900
ttgtaattta tcaataaaca aaatattaaa taacaagcta aagtaacaaa taatatcaaa 3960
ctaatagaaa cagtaatcta atgtaacaaa acataatcta atgctaatat aacaaagcgc 4020
aagatctatc attttatata gtattatttt caatcaacat tcttattaat ttctaaataa 4080
tacttgtagt tttattaact tctaaatgga ttgactatta attaaatgaa ttagtcgaac 4140
atgaataaac aaggtaacat gatagatcat gtcattgtgt tatcattgat cttacatttg 4200
gattgattac agttgggaag ctgggttcga aatcgatcac tggatcacct cctctaatct 4260
ttgcagagac acgttctcaa aagtgtagta attaacaaaa gggcgaagag cctgtgatgc 4320
agcaatccac tgaatcatgc tcttgatttc agggtttcca ccaaaagcac cacaacccca 4380
gtttcctgtt gaaactccta cgtactcact ggaattgatg cttgaaaagt catccttgtt 4440
gtgcaaatcc tggaaaagct tcgcatagag atggtgtttc gattgatcga aaaatccaca 4500
aaatgccttg ttcacttccc ttaggagaca gccagattct ctagagtcct gctttaatga 4560
gatatgcgag acgcctatga tcgcatgata tttgctttca attctgttgt gcacgttgta 4620
aaaaacctga gcatgtgtag ctcagatcct taccgccggt ttcggttcat tctaatgaat 4680
atatcacccg ttactatcgt atttttatga ataatattct ccgttcaatt tactgattgt 4740
accctactac ttatatgtac aatattaaaa tgaaaacaat atattgtgct gaataggttt 4800
atagcgacat ctatgataga gcgccacaat aacaaacaat tgcgttttat tattacaaat 4860
ccaattttaa aaaaagcggc agaaccggtc aaacctaaaa gactgattac ataaatctta 4920
ttcaaatttc aaaaggcccc aggggctagt atctacgaca caccgagcgg cgaactaata 4980
acgttcactg aagggaactc cggttccccg ccggcgcgca tgggtgagat tccttgaagt 5040
tgagtattgg ccgtccgctc taccgaaagt tacgggcacc attcaacccg gtccagcacg 5100
gcggccgggt aaccgacttg ctgccccgag aattatgcag catttttttg gtgtatgtgg 5160
gccccaaatg aagtgcaggt caaaccttga cagtgacgac aaatcgttgg gcgggtccag 5220
ggcgaatttt gcgacaacat gtcgaggctc agcaggacct gcaggtcgac ggccgagtac 5280
tggcaggata tataccgttg taatttgtcg cgtgtgaata agtcgctgtg tatgtttgtt 5340
tgattgtttc tgttggagtg cagcccattt caccggacaa gtcggctaga ttgatttagc 5400
cctgatgaac tgccgagggg aagccatctt gagcgcggaa tgggaatgga tttcgttgta 5460
caacgagacg acagaacacc cacgggaccg agcttcgatc gagcatcaaa tgaaactgca 5520
atttattcat atcaggatta tcaataccat atttttgaaa aagccgtttc tgtaatgaag 5580
gagaaaactc accgaggcag ttccatagga tggcaagatc ctggtatcgg tctgcgattc 5640
cgactcgtcc aacatcaata caacctatta atttcccctc gtcaaaaata aggttatcaa 5700
gtgagaaatc accatgagtg acgactgaat ccggtgagaa tggcaaaagt ttatgcattt 5760
ctttccagac ttgttcaaca ggccagccat tacgctcgtc atcaaaatca ctcgcatcaa 5820
ccaaaccgtt attcattcgt gattgcgcct gagcgagacg aaatacgccg ctgttaaaag 5880
gacaattaca aacaggaatc gaatgcaacc ggcgcaggaa cactgccagc gcatcaacaa 5940
tattttcacc tgaatcagga tattcttcta atacctggaa tgctgttttt ccggggatcg 6000
cagtggtgag taaccatgca tcatcaggag tacggataaa atgcttgatg gtcggaagag 6060
gcataaattc cgtcagccag tttagtctga ccatctcatc tgtaacatca ttggcaacgc 6120
tacctttgcc atgtttcaga aacaactctg gcgcatcggg cttcccatac aatcgataga 6180
ttgtcgcacc tgattgcccg acattatccg aatctggcaa ttccggttcg cttgctgtcc 6240
ataaaaccgc ccagtctagc tatcgccatg taagcccact gcaagctacc tgctttctct 6300
ttgcgcttgc gttttccgga tcttcttgag atcctttttt tctgcgcgta atctgctgct 6360
tgcaaacaaa aaaaccaccg ctaccagcgg tggtttgttt gccggatcaa gagctaccaa 6420
ctctttttcc gaaggtaact ggcttcagca gagcgcagat accaaatact gtccttctag 6480
tgtagccgta gttaggccac cacttcaaga actctgtagc accgcctaca tacctcgctc 6540
tgctaatcct gttaccagtg gctgctgcca gtggcgataa gtcgtgtctt accgggttgg 6600
actcaagacg atagttaccg gataaggcgc agcggtcggg ctgaacgggg ggttcgtgca 6660
cacagcccag cttggagcga acgacctaca ccgaactgag atacctacag cgtgagctat 6720
gagaaagcgc cacgcttccc gaagggagaa aggcggacag gtatccggta agcggcaggg 6780
tcggaacagg agagcgcacg agggagcttc cagggggaaa cgcctggtat ctttatagtc 6840
ctgtcgggtt tcgccacctc tgacttgagc gtcgattttt gtgatgctcg tcaggggggc 6900
ggagcctatg gaaaaacgcc agcaacgcgg cctttttacg gttcctggcc ttttgctggc 6960
cttttgctca catgttcttt cctgcgttat cccctgattc tgtggataac cgtattaccg 7020
cctttgagtg agctgatacc gctcgccgca gccgaacgac cgagcgcagc gagtcagtga 7080
gcgaggaagc ggaagagcgc ctgatgcggt attttctcct tacgcatctg tgcggtattt 7140
cacaccgcat atggtgcact ctcagtacaa tctgctctga tgccgcatag ttaagccagt 7200
atacactccg ctatcgctac gtgactgggt catggctgcg ccccgacacc cgccaacacc 7260
cgctgacgcg ccctgacggg cttgtctgct cccggcatcc gcttacagac aagctgtgac 7320
cgtctccggg agctgcatgt gtcagaggtt ttcaccgtca tcaccgaaac gcgcgaggca 7380
gggtgccttg atgtgggcgc cggcggtcga gtggcgacgg cgcggcttgt ccgcgccctg 7440
gtagattgcc tggccgtagg ccagccattt ttgagcggcc agcggccgcg ataggccgac 7500
gcgaagcggc ggggcgtagg gagcgcagcg accgaagggt aggcgctttt tgcagctctt 7560
cggctgtgcg ctggccagac agttatgcac aggccaggcg ggttttaaga gttttaataa 7620
gttttaaaga gttttaggcg gaaaaatcgc cttttttctc ttttatatca gtcacttaca 7680
tgtgtgaccg gttcccaatg tacggctttg ggttcccaat gtacgggttc cggttcccaa 7740
tgtacggctt tgggttccca atgtacgtgc tatccacagg aaagagacct tttcgacctt 7800
tttcccctgc tagggcaatt tgccctagca tctgctccgt acattaggaa ccggcggatg 7860
cttcgccctc gatcaggttg cggtagcgca tgactaggat cgggccagcc tgccccgcct 7920
cctccttcaa atcgtactcc ggcaggtcat ttgacccgat cagcttgcgc acggtgaaac 7980
agaacttctt gaactctccg gcgctgccac tgcgttcgta gatcgtcttg aacaaccatc 8040
tggcttctgc cttgcctgcg gcgcggcgtg ccaggcggta gagaaaacgg ccgatgccgg 8100
gatcgatcaa aaagtaatcg gggtgaaccg tcagcacgtc cgggttcttg ccttctgtga 8160
tctcgcggta catccaatca gctagctcga tctcgatgta ctccggccgc ccggtttcgc 8220
tctttacgat cttgtagcgg ctaatcaagg cttcaccctc ggataccgtc accaggcggc 8280
cgttcttggc cttcttcgta cgctgcatgg caacgtgcgt ggtgtttaac cgaatgcagg 8340
tttctaccag gtcgtctttc tgctttccgc catcggctcg ccggcagaac ttgagtacgt 8400
ccgcaacgtg tggacggaac acgcggccgg gcttgtctcc cttcccttcc cggtatcggt 8460
tcatggattc ggttagatgg gaaaccgcca tcagtaccag gtcgtaatcc cacacactgg 8520
ccatgccggc cggccctgcg gaaacctcta cgtgcccgtc tggaagctcg tagcggatca 8580
cctcgccagc tcgtcggtca cgcttcgaca gacggaaaac ggccacgtcc atgatgctgc 8640
gactatcgcg ggtgcccacg tcatagagca tcggaacgaa aaaatctggt tgctcgtcgc 8700
ccttgggcgg cttcctaatc gacggcgcac cggctgccgg cggttgccgg gattctttgc 8760
ggattcgatc agcggccgct tgccacgatt caccggggcg tgcttctgcc tcgatgcgtt 8820
gccgctgggc ggcctgcgcg gccttcaact tctccaccag gtcatcaccc agcgccgcgc 8880
cgatttgtac cgggccggat ggtttgcgac cgtcacgccg attcctcggg cttgggggtt 8940
ccagtgccat tgcagggccg gcagacaacc cagccgctta cgcctggcca accgcccgtt 9000
cctccacaca tggggcattc cacggcgtcg gtgcctggtt gttcttgatt ttccatgccg 9060
cctcctttag ccgctaaaat tcatctactc atttattcat ttgctcattt actctggtag 9120
ctgcgcgatg tattcagata gcagctcggt aatggtcttg ccttggcgta ccgcgtacat 9180
cttcagcttg gtgtgatcct ccgccggcaa ctgaaagttg acccgcttca tggctggcgt 9240
gtctgccagg ctggccaacg ttgcagcctt gctgctgcgt gcgctcggac ggccggcact 9300
tagcgtgttt gtgcttttgc tcattttctc tttacctcat taactcaaat gagttttgat 9360
ttaatttcag cggccagcgc ctggacctcg cgggcagcgt cgccctcggg ttctgattca 9420
agaacggttg tgccggcggc ggcagtgcct gggtagctca cgcgctgcgt gatacgggac 9480
tcaagaatgg gcagctcgta cccggccagc gcctcggcaa cctcaccgcc gatgcgcgtg 9540
cctttgatcg cccgcgacac gacaaaggcc gcttgtagcc ttccatccgt gacctcaatg 9600
cgctgcttaa ccagctccac caggtcggcg gtggcccata tgtcgtaagg gcttggctgc 9660
accggaatca gcacgaagtc ggctgccttg atcgcggaca cagccaagtc cgccgcctgg 9720
ggcgctccgt cgatcactac gaagtcgcgc cggccgatgg ccttcacgtc gcggtcaatc 9780
gtcgggcggt cgatgccgac aacggttagc ggttgatctt cccgcacggc cgcccaatcg 9840
cgggcactgc cctggggatc ggaatcgact aacagaacat cggccccggc gagttgcagg 9900
gcgcgggcta gatgggttgc gatggtcgtc ttgcctgacc cgcctttctg gttaagtaca 9960
gcgataacct tcatgcgttc cccttgcgta tttgtttatt tactcatcgc atcatatacg 10020
cagcgaccgc atgacgcaag ctgttttact caaatacaca tcaccttttt agacggcggc 10080
gctcggtttc ttcagcggcc aagctggccg gccaggccgc cagcttggca tcagacaaac 10140
cggccaggat ttcatgcagc cgcacggttg agacgtgcgc gggcggctcg aacacgtacc 10200
cggccgcgat catctccgcc tcgatctctt cggtaatgaa aaacggttcg tcctggccgt 10260
cctggtgcgg tttcatgctt gttcctcttg gcgttcattc tcggcggccg ccagggcgtc 10320
ggcctcggtc aatgcgtcct cacggaaggc accgcgccgc ctggcctcgg tgggcgtcac 10380
ttcctcgctg cgctcaagtg cgcggtacag ggtcgagcga tgcacgccaa gcagtgcagc 10440
cgcctctttc acggtgcggc cttcctggtc gatcagctcg cgggcgtgcg cgatctgtgc 10500
cggggtgagg gtagggcggg ggccaaactt cacgcctcgg gccttggcgg cctcgcgccc 10560
gctccgggtg cggtcgatga ttagggaacg ctcgaactcg gcaatgccgg cgaacacggt 10620
caacaccatg cggccggccg gcgtggtggt gtcggcccac ggctctgcca ggctacgcag 10680
gcccgcgccg gcctcctgga tgcgctcggc aatgtccagt aggtcgcggg tgctgcgggc 10740
caggcggtct agcctggtca ctgtcacaac gtcgccaggg cgtaggtggt caagcatcct 10800
ggccagctcc gggcggtcgc gcctggtgcc ggtgatcttc tcggaaaaca gcttggtgca 10860
gccggccgcg tgcagttcgg cccgttggtt ggtcaagtcc tggtcgtcgg tgctgacgcg 10920
ggcatagccc agcaggccag cggcggcgct cttgttcatg gcgtaatgtc tccggttcta 10980
gtcgcaagta ttctacttta tgcgactaaa acacgcgaca agaaaacgcc aggaaaaggg 11040
cagggcggca gcctgtcgcg taacttagga cttgtgcgac atgtcgtttt cagaagacgg 11100
ctgcactgaa cgtcagaagc cgactgcact atagcagcgg aggggttgga tcgatccctg 11160
ctcgcgcagg ctgggtgcca agctctcggg taacatcaag gcccgatcct tggagccctt 11220
gccctcccgc acgatgatcg tgccgtgatc gaaatccaga tccttgaccc gcagttgcaa 11280
accctcactg atccgcatgc ccgttccata cagaagctgg gcgaacaaac gatgctcgcc 11340
ttccagaaaa ccgaggatgc gaaccacttc atccggggtc agcaccaccg gcaagcgccc 11400
ggacggccga ggtcttccga tctcctgaag ccagggcaga tccgtgcaca gcacttgccg 11460
tagaagaaca gcaaggccgc caatgcctga cgatgcgtgg agaccgaaac cttgcgctcg 11520
ttcgccagcc aggacagaaa tgcctcgact tcgctgctgc ccaaggttgc cgggtgacgc 11580
acaccgtgga aacggatgaa ggcacgaacc cagtggacat aagcctgttc ggttcgtaag 11640
ctgtaatgca agtagcgtat gcgctcacgc aactggtcca gaaccttgac cgaacgcagc 11700
ggtggtaacg gcgcagtggc ggttttcatg gcttgttatg actgtttttt tggggtacag 11760
tctatgcctc gggcatccaa gcagcaagcg cgttacgccg tgggtcgatg tttgatgtta 11820
tggagcagca acgatgttac gcagcagggc agtcgcccta aaacaaagtt aaacatcatg 11880
agggaagcgg tgatcgccga agtatcgact caactatcag aggtagttgg cgtcatcgag 11940
cgccatctcg aaccgacgtt gctggccgta catttgtacg gctccgcagt ggatggcggc 12000
ctgaagccac acagtgatat tgatttgctg gttacggtga ccgtaaggct tgatgaaaca 12060
acgcggcgag ctttgatcaa cgaccttttg gaaacttcgg cttcccctgg agagagcgag 12120
attctccgcg ctgtagaagt caccattgtt gtgcacgacg acatcattcc gtggcgttat 12180
ccagctaagc gcgaactgca atttggagaa tggcagcgca atgacattct tgcaggtatc 12240
ttcgagccag ccacgatcga cattgatctg gctatcttgc tgacaaaagc aagagaacat 12300
agcgttgcct tggtaggtcc agcggcggag gaactctttg atccggttcc tgaacaggat 12360
ctatttgagg cgctaaatga aaccttaacg ctatggaact cgccgcccga ctgggctggc 12420
gatgagcgaa atgtagtgct tacgttgtcc cgcatttggt acagcgcagt aaccggcaaa 12480
atcgcgccga aggatgtcgc tgccgactgg gcaatggagc gcctgccggc ccagtatcag 12540
cccgtcatac ttgaagctag acaggcttat cttggacaag aagaagatcg cttggcctcg 12600
cgcgcagatc agttggaaga atttgtccac tacgtgaaag gcgagatcac caaggtagtc 12660
ggcaaataat gtctaacaat tcgttcaagc cgacgccgct tcgcggcgcg gcttaactca 12720
agcgttagat gcactaagca cataattgct cacagccaaa ctatcaggtc aagtctgctt 12780
ttattatttt taagcgtgca taataagccc tacacaaatt gggagatata tcatgaaagg 12840
ctggcttttt cttgttatcg caatagttgg cgaagtaatc gcaacatccg cattaaaatc 12900
tagcgagggc tttactaagc tagcttgctt ggtcgttccg gtaccgtgaa cgtcggctcg 12960
attgtacctg cgttcaaata ctttgcgatc gtgttgcgcg cctgcccggt gcgtcggctg 13020
atctcacgga tcgactgctt ctctcgcaac gccatccgac ggatgatgtt taaaagtccc 13080
atgtggatca ctccgttgcc ccgtcgctca ccgtgttggg gggaaggtgc acatggctca 13140
gttctcaatg gaaattatct gcctaaccgg ctcagttctg cgtagaaacc aacatgcaag 13200
ctccaccggg tgcaaagcgg cagcgg 13226
Claims (19)
- (a) 기능적으로 연결된 하기 (i) 내지 (iii)의 DNA 단편을 포함하는 키메라 유전자를 식물 세포에 제공하여 트랜스제닉 식물 세포를 생성하는 단계:(i) 식물-발현성 프로모터, (ii) 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하는DNA 영역, 및 (iii) 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여하는 3' 말단 영역;(b) 상기 트랜스제닉 식물 세포로부터 트랜스제닉 식물주 집단을 재생하는 단계; 및(c) 상기 트랜스제닉 식물주 집단내에서 스트레스 내성 식물주를 확인하는 단계를 포함하는, 스트레스 조건에 대한 내성을 나타내는 식물을 제조하는 방법.
- 제 1 항에 있어서,ParG 억제성 RNA 분자가 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 20개의 연속적 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하는, 방법.
- 제 1 항에 있어서,ParG 억제성 RNA 분자가 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 상보서열의 적어도 20개의 연속적 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하는, 방법.
- 청구항 4은(는) 설정등록료 납부시 포기되었습니다.제 2 항 또는 제 3 항에 있어서,키메라 유전자가 ParG 억제성 RNA 분자를 암호화하는 DNA 영역과 3' 말단 영역 사이에 자가-스플라이싱 리보자임(self-splicing ribozyme)을 암호화하는 DNA 영역을 더 포함하는, 방법.
- 제 1 항에 있어서,ParG 억제성 RNA가 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 20개의 연속적 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 센스 영역, 및 식물 세포에 존재하는 ParG 유전자의 뉴클레오타이드 서열의 상보서열의 적어도 20개의 연속적 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 안티센스 영역을 포함하고, 이때 상기 센스 영역 및 안티센스 영역이 상기 적어도 20개의 연속적 뉴클레오타이드를 포함하는 이중 가닥 RNA 영역을 형성할 수 있는, 방법.
- 제 1 항 내지 제 3 항 및 제 5 항중 어느 한 항에 있어서,스트레스 조건이 열, 가뭄, 영양 결핍, 산화적 스트레스 및 강한 광 조건으로부터 선택되는, 방법.
- 청구항 7은(는) 설정등록료 납부시 포기되었습니다.제 1 항 내지 제 3 항 및 제 5 항중 어느 한 항에 있어서,트랜스제닉 식물주를 다른 식물주와 더 교배시켜 스트레스 내성 자손 식물을 수득하는 단계를 포함하는 방법.
- (a) 식물의 ParG 암호화 유전자의 일부를 포함하는 적어도 100bp의 DNA 단편을 분리하는 단계;(b) 하기 (i) 내지 (iv)의 DNA 단편을 기능적으로 연결하여 키메라 유전자를 생성하는 단계:(i) 식물-발현성 프로모터 영역, (ii) 상기 식물의 ParG 암호화 유전자의 일부를 상기 프로모터 영역과 비교하여 정방향으로 포함하는 상기 분리된 DNA 단편, (iii) 상기 식물의 ParG 암호화 유전자의 일부를 상기 프로모터 영역과 비교하여 역방향으로 포함하는 상기 분리된 DNA 단편, 및 (iv) 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여하는 3' 말단 영역;(c) 상기 키메라 유전자를 식물 세포에 제공하여 트랜스제닉 식물 세포를 생성하는 단계;(d) 상기 트랜스제닉 식물 세포로부터 트랜스제닉 식물주 집단을 재생하는 단계; 및(e) 상기 트랜스제닉 식물주 집단내에서 스트레스 내성 식물주를 확인하는 단계를 포함하는, 스트레스 조건에 대한 내성을 나타내는 식물을 제조하는 방법.
- (i) 식물-발현성 프로모터;(ii) 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하는 DNA 영역; 및(iii) 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여하는 3' 말단 영역을 포함하는 DNA 분자.
- 제 9 항에 있어서,DNA 영역이 서열번호 1, 2 또는 16의 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열의 적어도 21 내지 100개 뉴클레오타이드, 또는 서열번호 3, 4, 15 또는 23의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 21 내지 100개 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하는, DNA 분자.
- 제 9 항 또는 제 10 항에 따른 DNA 분자를 포함하는 식물 세포.
- 제 11 항에 따른 식물 세포로 본질적으로 구성된 식물.
- 청구항 13은(는) 설정등록료 납부시 포기되었습니다.제 12 항에 따른 식물을 다른 식물과 더 교배시키는 단계를 포함하는, 스트레스 내성 식물을 제조하는 방법.
- 제 9 항 또는 제 10 항에 따른 키메라 유전자를 포함하는, 제 12 항에 따른 식물의 종자 또는 증식물질.
- 청구항 15은(는) 설정등록료 납부시 포기되었습니다.제 8 항에 따른 방법에 의해 수득되는 식물.
- (a) 기능적으로 연결된 하기 (i) 내지 (iii)의 DNA 단편을 포함하는 키메라 유전자를 식물 세포에 제공하여 트랜스제닉 식물 세포를 생성하는 단계:(i) 식물-발현성 프로모터, (ii) 전사되었을 때 ParG 억제성 RNA 분자를 생성하고, 서열번호 1, 2 또는 16의 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열의 적어도 21 내지 100개 뉴클레오타이드, 또는 서열번호 3, 4, 15 또는 23의 뉴클레오타이드 서열의 적어도 21 내지 100개 뉴클레오타이드로 구성된 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 DNA 영역, 및 (iii) 전사 종결 및 폴리아데닐화에 관여하는 3' 말단 영역;(b) 상기 트랜스제닉 식물 세포로부터 트랜스제닉 식물주 집단을 재생하는 단계; 및(c) 상기 트랜스제닉 식물주 집단내에서 스트레스 내성 식물주를 확인하는 단계를 포함하는, 스트레스 조건에 대한 내성을 나타내는 식물을 제조하는 방법.
- (a) 식물 세포주, 식물 또는 식물주를 돌연변이 처리시키는 단계;(b) 내생성 ParG 유전자에 돌연변이를 갖는 식물 세포 또는 식물을 확인하는 단계;(c) 확인된 식물 세포 또는 식물을 스트레스 조건으로 처리시키는 단계; 및(d) 대조용 식물에 비하여 스트레스 조건을 더 잘 견디는 식물 세포 또는 식물을 확인하는 단계를 포함하는, 스트레스 조건에 대한 내성을 나타내는 식물을 제조하는 방법.
- (a) ParG 억제제에 대한 내성을 나타내는 식물 세포주, 식물 또는 식물주를 선별하는 단계;(b) 내생성 ParG 유전자에 돌연변이를 갖는 식물 세포 또는 식물을 확인하는 단계;(c) 확인된 식물 세포 또는 식물을 스트레스 조건으로 처리시키는 단계; 및(d) 대조용 식물에 비하여 스트레스 조건을 더 잘 견디는 식물 세포 또는 식물을 확인하는 단계를 포함하는, 스트레스 조건에 대한 내성을 나타내는 식물을 제조하는 방법.
- 삭제
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