JP5707396B2 - 被験体におけるsmn2スプライシングのモジュレーションのための組成物および方法 - Google Patents
被験体におけるsmn2スプライシングのモジュレーションのための組成物および方法 Download PDFInfo
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Description
本出願は、電子フォーマットのSequence Listingとともに出願されるものである。このSequence Listingは、2010年6月17日に作成され、サイズが5 Kbの「20100617_CORE0086WOSEQ.txt」というタイトルのファイルとして提供される。配列表の電子フォーマットでのこの情報は、その全体を参照として本願明細書中に援用される。
上述の一般的な記載および以下の詳細な記載は両方共、例示的かつ説明的なものでしかなく、請求項に記載されるような発明の限定を目的とはしていないことを理解すべきである。本明細書中において、単数形を使用する場合には、特に言及していない限り、複数も含まれる。本明細書中で使用される場合、“または”の使用は、 そうではないと記載されていない限り、“および/または”を意味する。さらに、“含む” の用語および“含まれる”などのその他の形態を使用することは、限定的なことではない。同様に、“要素”または“構成成分”などの用語は、特に言及しない限り、1単位を含む要素および構成成分、および1より多いサブユニットを含む要素および構成成分の両方を包含する。
具体的な定義を提示していない場合、本明細書中で記載される分析化学、合成有機化学、および医学および医薬化学と関連して使用される用語用法、および分析化学、合成有機化学、および医学および医薬化学の手順および技術は、当該技術分野においてよく知られており、そして一般的に使用され。標準的な技術は、化学合成および化学的解析のために使用することができる。特定のそのような技術および手順を、以下の文献中に見出すことができ(例えば、“Carbohydrate Modifications in Antisense Research” Edited by Sangvi and Cook, American Chemical Society , Washington D.C., 1994;“Remington's Pharmaceutical Sciences,” Mack Publishing Co., Easton, Pa., 18th edition, 1990;および“Antisense Drug Technology, Principles, Strategies, and Applications” Edited by Stanley T. Crooke, CRC Press, Boca Raton, Florida;およびSambrook et al., “Molecular Cloning, A laboratory Manual, ” 2ndEdition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989)、これらをいずれかの目的のために参照により援用される。認められる場合、すべての特許、出願、公開された出願およびその他の刊行物および本明細書中の開示全体で言及されているその他のデータは、それぞれの全体を参照により援用する。
“ヌクレオシド”は、ヘテロ環式塩基成分および糖成分を含む化合物を意味する。ヌクレオシド には、天然に生じるヌクレオシド,修飾ヌクレオシド、および模倣塩基を有するヌクレオシドおよび/または糖基が含まれるが、しかしこれらに限定されるわけではない。ヌクレオシド は、様々な置換基のいずれかにより修飾されていてもよい。
特定の態様において、本発明は、天然に生じるオリゴマー、例えばDNAまたはRNA、のオリゴヌクレオチドと比較して、1またはそれ以上の修飾を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドに関連する方法および組成物を提供する。そのような修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドは、1またはそれ以上の所望の特性を有することができる。特定のそのような修飾は、例えば、その標的核酸へのアンチセンスオリゴヌクレオチドの親和性を上昇させることにより、1またはそれ以上のヌクレアーゼに対するその耐性を上昇させることにより、および/またはオリゴヌクレオチドの薬物動態性または組織分布を変化させることにより、アンチセンスオリゴヌクレオチドのアンチセンス活性を変化させる。特定の態様において、そのような修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドは、1またはそれ以上の修飾ヌクレオシドおよび/または1またはそれ以上の修飾ヌクレオシド結合および/または1またはそれ以上の複合体基を含む。
特定の態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、1またはそれ以上の修飾ヌクレオシドを含む。そのような修飾ヌクレオシドには、修飾糖および/または修飾核酸塩基が含まれていもよい。特定の態様において、オリゴヌクレオチド中へのそのような修飾ヌクレオシドの取り込みは、結果として標的核酸に対する親和性の増加および/またはヌクレアーゼ分解への耐性の増加、および/または修飾オリゴヌクレオチドの毒性の改善および/または取り込み特性の改善を含む(しかしこれらには限定されない)安定性の増加を生じる。
天然に生じるヌクレオシドの塩基部分は、ヘテロ環式塩基であり、典型的にはプリンおよびピリミジンである。プリン核酸塩基であるアデニン(A)およびグアニン(G)、そしてピリミジン核酸塩基であるチミに(T)、シトシン(C)およびウラシル(U)、などの“非修飾”または“天然”核酸塩基に加えて、当業者に知られている多数の修飾核酸塩基または核酸塩基模倣体は、本明細書中で好ましい化合物中への取り込みのために かなうものである。特定の態様において、修飾核酸塩基は、例えば7-デアザプリン、5-メチルシトシン、またはG-クランプなどの親核酸塩基と構造的にかなり類似している核酸塩基である。特定の態様において、核酸塩基 模倣体 には、例えば、三環系フェノキサジン核酸塩基 模倣体などの、より複雑な構造物が含まれる。上述した修飾核酸塩基の調製方法もまた、当業者に知られている。
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、場合により、1またはそれ以上の ヌクレオシドを含有していてもよく、ここで糖成分は、天然の糖と比較して修飾されている。そのような糖修飾ヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドは、ヌクレアーゼ安定性を亢進させ、結合親和性を増加させ、またはいくつかのその他の有益な生物学的特性を増加させた可能性がある。そのような修飾には、置換基の付加、二環系核酸(BNA)を形成するためのジェミナル(一つの原子に同種原子が二つ結合したもの)ではない環原子の架橋、S、N(R)、またはC(R1)(R)2(R = H、C1-C12アルキルまたは保護基)によるリボシル環酸素原子の置換、および例えば、2'-F-5'-メチル置換ヌクレオシドなどのこれらの組み合わせ(PCT国際出願2008/101157を参照、その他の開示された5',2'-bis置換ヌクレオシドについては2008年8月21日に公開)、またはさらに2'-位の置換基によるSを有するリボシル環酸素原子の置換(公開U.S.特許出願US2005-0130923、2005年6月16日に公開、を参照)、またはBNAの選択的な5'-置換(PCT国際出願WO 2007/134181を参照、2007年11月22日に公開、LNAが、例えば5'-メチルまたは5'-ビニル基により置換されている)が含まれるが、これらには限定されない。
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、場合により、1またはそれ以上の修飾ヌクレオシド間結合を含有してもよい。結合基のこれらの2つの主要なクラスは、リン原子の有無により規定される。代表的なリン含有結合には、ホスホジエステル(P=O)、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ホスホールアミデート、およびホスホロチオエート(P=S)が含まれるが、しかしこれらに限定されるわけではない。代表的な非-リン含有結合基には、メチレンメチルアミノ(-CH2-N(CH3)-O-CH2-)、チオジエステル(-O-C(O)-S-)、チオノカルバメート(-O-C(O)(NH)-S-);シロキサン(-O-Si(H)2-O-);およびN,N'-ジメチルヒドラジン(-CH2-N(CH3)-N(CH3)-)が含まれるが、しかしこれらに限定されるわけではない。非-リン結合基を有するオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオシドと呼ばれる。天然のホスホジエステル結合と比較して、修飾結合を使用して、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を変化させる、典型的には増加させることができる。特定の態様において、キラル原子を有する結合を、ラセミ混合物として、別個のエナントマーとして、調製することができる。代表的なキラル結合には、アルキルホスホネートおよびホスホロチオエートが含まれるが、しかしこれらに限定されるわけではない。リン-含有結合および非-リン-含有結合の調製方法は、当業者に周知である。
特定の態様において、本発明は、様々な範囲の長さのいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。特定の態様において、本発明は、X-Y結合ヌクレオシドを含むかまたはX-Y結合ヌクレオシドからなるアンチセンス化合物またはアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供し、ここで、XおよびYはそれぞれ独立して8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、および50から選択され;ただしX<Yである。例えば、特定の態様において、本発明は: 8〜9、8〜10、8〜11、8〜12、8〜13、8〜14、8〜15、8〜16、8〜17、8〜18、8〜19、8〜20、8〜21、8〜22、8〜23、8〜24、8〜25、8〜26、8〜27、8〜28、8〜29、8〜30、9〜10、9〜11、9〜12、9〜13、9〜14、9〜15、9〜16、9〜17、9〜18、9〜19、9〜20、9〜21、9〜22、9〜23、9〜24、9〜25、9〜26、9〜27、9〜28、9〜29、9〜30、10〜11、10〜12、10〜13、10〜14、10〜15、10〜16、10〜17、10〜18、10〜19、10〜20、10〜21、10〜22、10〜23、10〜24、10〜25、10〜26、10〜27、10〜28、10〜29、10〜30、11〜12、11〜13、11〜14、11〜15、11〜16、11〜17、11〜18、11〜19、11〜20、11〜21、11〜22、11〜23、11〜24、11〜25、11〜26、11〜27、11〜28、11〜29、11〜30、12〜13、12〜14、12〜15、12〜16、12〜17、12〜18、12〜19、12〜20、12〜21、12〜22、12〜23、12〜24、12〜25、12〜26、12〜27、12〜28、12〜29、12〜30、13〜14、13〜15、13〜16、13〜17、13〜18、13〜19、13〜20、13〜21、13〜22、13〜23、13〜24、13〜25、13〜26、13〜27、13〜28、13〜29、13〜30、14〜15、14〜16、14〜17、14〜18、14〜19、14〜20、14〜21、14〜22、14〜23、14〜24、14〜25、14〜26、14〜27、14〜28、14〜29、14〜30、15〜16、15〜17、15〜18、15〜19、15〜20、15〜21、15〜22、15〜23、15〜24、15〜25、15〜26、15〜27、15〜28、15〜29、15〜30、16〜17、16〜18、16〜19、16〜20、16〜21、16〜22、16〜23、16〜24、16〜25、16〜26、16〜27、16〜28、16〜29、16〜30、17〜18、17〜19、17〜20、17〜21、17〜22、17〜23、17〜24、17〜25、17〜26、17〜27、17〜28、17〜29、17〜30、18〜19、18〜20、18〜21、18〜22、18〜23、18〜24、18〜25、18〜26、18〜27、18〜28、18〜29、18〜30、19〜20、19〜21、19〜22、19〜23、19〜24、19〜25、19〜26、19〜29、19〜28、19〜29、19〜30、20〜21、20〜22、20〜23、20〜24、20〜25、20〜26、20〜27、20〜28、20〜29、20〜30、21〜22、21〜23、21〜24、21〜25、21〜26、21〜27、21〜28、21〜29、21〜30、22〜23、22〜24、22〜25、22〜26、22〜27、22〜28、22〜29、22〜30、23〜24、23〜25、23〜26、23〜27、23〜28、23〜29、23〜30、24〜25、24〜26、24〜27、24〜28、24〜29、24〜30、25〜26、25〜27、25〜28、25〜29、25〜30、26〜27、26〜28、26〜29、26〜30、27〜28、27〜29、27〜30、28〜29、28〜30、または29〜30の結合したヌクレオシドを含むかまたはそのようなヌクレオシドからなるアンチセンス化合物またはアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。
特定の態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、その長さ方向に沿って特異的方向に配置される化学的に修飾されたサブユニットを有する。特定の態様において、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、完全に修飾される。特定の態様において、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、均質に修飾される。特定の態様において、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、均質に修飾され、そしてそれぞれのヌクレオシドは2'-MOE 糖成分を含む。特定の態様において、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、均質に修飾され、そしてそれぞれのヌクレオシドは2'-OMe 糖成分を含む。特定の態様において、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、均質に修飾され、そしてそれぞれのヌクレオシドはモルホリノ糖成分を含む。
Nu1 Nu1 Nu2 Nu2 Nu1 Nu1;
Nu1 Nu2 Nu2 Nu1 Nu2 Nu2;
Nu1Nu1 Nu2 Nu1 Nu1 Nu2;
Nu1 Nu2 Nu2 Nu1 Nu2 Nu1 Nu1 Nu2 Nu2;
Nu1 Nu2 Nu1 Nu2 Nu1 Nu1;
Nu1Nu1 Nu2 Nu1 Nu2 Nu1 Nu2;
Nu1 Nu2 Nu1 Nu2 Nu1 Nu1;
Nu1 Nu2 Nu2 Nu1 Nu1 Nu2 Nu2 Nu1 Nu2 Nu1 Nu2 Nu1 Nu1;
Nu2Nu1 Nu2 Nu2 Nu1 Nu1 Nu2Nu2 Nu1 Nu2 Nu1Nu2 Nu1Nu1;または
Nu1 Nu2Nu1 Nu2Nu2 Nu1 Nu1 Nu2 Nu2 Nu1Nu2 Nu1 Nu2 Nu1 Nu1;
ここで、Nu1は、第1のタイプのヌクレオシドであり、そしてNu2は、第2のタイプのヌクレオシドである。特定の態様において、Nu1およびNu2の一方は、2'-MOEヌクレオシドであり、Nu1およひNu2の他方は:2'-OMe修飾ヌクレオシド、BNA、および非修飾DNAまたはRNAヌクレオシドから選択される。
特定の態様において、本発明は、オリゴマー化合物を提供する。特定の態様において、オリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドのみからなる。特定の態様において、オリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドおよび1またはそれ以上の複合体および/または末端基を含む。そのような複合体および/または末端基を、上述の化学モチーフのいずれかを有するオリゴヌクレオチドに対して添加することができる。このように、例えば、交互のヌクレオシドの領域を有するオリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物は、末端基を含んでもよい。
特定の態様において、本発明のオリゴヌクレオチドは、1またはそれ以上の複合体基の結合により修飾される。一般的には、複合体基は、薬力学、薬物動態、安定性、結合、吸着、細胞分布、細胞取り込み、荷電、およびクリアランスを含む(しかし、これらには限定されない)、結合するオリゴマー化合物の1またはそれ以上の特性を修飾する。複合体基は、一般的には、化学分野において使用され、そして直接的または選択的な複合体結合成分または複合体結合基を介して、オリゴヌクレオチドなどのオリゴマー化合物などの親化合物に対して結合する。複合体基には、インターカレーター、リポーター分子、ポリアミン、ポリアミド、ポリエチレングリコール、チオエーテル、ポリエーテル、コレステロール、チオコレステロール、コール酸成分、葉酸、脂質、リン脂質、ビオチン、フェナジン、フェナントリジン、アントラキノン、アダマンタン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、および色素が含まれるが、これらには限定されない。特定の複合体基は、以前に記載されたものであり、例えば:コレステロール成分(Letsinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1989, 86, 6553-6556)、コール酸(Manoharan et al., Bioorg. Med. Chem. Let., 1994, 4, 1053-1060)、チオエーテル、例えば、ヘキシル-S-トリチルチオール(Manoharan et al., Ann. N.Y. Acad. Sci., 1992, 660, 306-309;Manoharan et al., Bioorg. Med. Chem. Let., 1993, 3, 2765-2770)、チオコレステロール(Oberhauser et al., Nucl. Acids Res., 1992, 20, 533-538)、脂肪族鎖、例えば、ドデカンジオールまたはウンデシル残基(Saison-Behmoaras et al., EMBO J., 1991, 10, 1111-1118;Kabanov et al., FEBS Lett., 1990, 259, 327-330;Svinarchuk et al., Biochimie, 1993, 75, 49-54)、リン脂質、例えば、ジ-ヘキサデシル-rac-グリセロールまたはトリエチル-アンモニウム1,2-ジ-O-ヘキサデシル-rac-グリセロ-3-H-ホスホネート(Manoharan et al., Tetrahedron Lett., 1995, 36, 3651-3654;Shea et al., Nucl. Acids Res., 1990, 18, 3777-3783)、ポリアミンまたはポリエチレングリコール鎖(Manoharan et al., Nucleosides & Nucleotides, 1995, 14, 969-973)、またはアダマンタン酢酸(Manoharan et al., Tetrahedron Lett., 1995, 36, 3651-3654)、パルミチル成分(Mishra et al., Biochim. Biophys. Acta, 1995, 1264, 229-237)、またはオクタデシルアミンまたはヘキシルアミノ-カルボニル-オキシコレステロール成分(Crooke et al., J. Pharmacol. Exp. Ther., 1996, 277, 923-937)である。
特定の態様において、オリゴマー化合物は、一方または両方の末端に末端基を含む。特定の態様において、末端基は、以下に記載する複合体基のいずれかを含んでもよい。特定の態様において、末端基は、追加のヌクレオシドおよび/または逆向き脱塩基ヌクレオシドを含んでもよい。特定の態様において、末端基は、安定化基である。
特定の態様において、本発明のオリゴマー化合物は、モチーフ:
T1-(Nu1)n1-(Nu2)n2-(Nu1)n3-(Nu2)n4-(Nu1)n5-T2、
を含み、ここで:
Nu1 は、第1のタイプのヌクレオシドであり;
Nu2は、第1のタイプのヌクレオシドであり;
n1およびn5のそれぞれは、独立して0〜3であり;
n2+n4の合計は、10〜25の範囲であり;
n3は、0〜5であり;そして
T1およびT2のそれぞれは、独立して、H、ヒドロキシル保護基、選択的な結合複合体基またはキャップ基である。
特定の態様において、本発明のオリゴマー化合物は、アンチセンス化合物である。したがって、そのような態様において、オリゴマー化合物は、標的核酸とハイブリダイズし、結果としてアンチセンス活性を生じる。
特定の態様において、本発明は、特異的な結合が所望される条件下、すなわち、in vivoアッセイまたは治療的処置の場合の生理学的条件下、およびアッセイがin vitroアッセイの場合に行われる条件下、アンチセンス化合物の非-標的核酸配列への非-特異的結合を回避するために十分な程度の相補性が存在する場合に、標的核酸へ特異的にハイブリダイズするアンチセンス化合物を提供する。
特定の態様において、本明細書中で提供されるアンチセンス化合物は、pre-mRNAに対して相補的なものである。特定の態様において、そのようなアンチセンス化合物は、pre-mRNA のスプライシングを変更される。そのような特定の態様において、標的pre-mRNAに対応する成熟mRNA の一つの変異体の成熟mRNAの別の変異体に対する比率を、変える。そのような特定の態様において、標的pre-mRNAから発現されるタンパク質の一つの変異体の、タンパク質のその他の変異体に対する比率を変える。pre-mRNAのスプライシングを変化させるために使用することができる特定のオリゴマー化合物 および核酸塩基 配列は、例えば、以下の文献(US 6,210,892;US 5,627,274;US 5,665,593;5,916,808;US 5,976,879;US2006/0172962;US2007/002390;US2005/0074801;US2007/0105807;US2005/0054836;WO 2007/090073;WO2007/047913;Hua et al., PLoS Biol 5(4):e73;Vickers et al., J. Immunol. 2006 Mar 15, 176(6):3652-61;およびHua et al., American J. of Human Genetics (April 2008) 82, 1-15)において見出すことができ、そのそれぞれをあらゆる目的でその全体を参照として援用する。特定の態様において、スプライシングを変えるアンチセンス配列を、本発明のモチーフに従って修飾した。
特定の態様において、本発明は、1またはそれ以上の アンチセンス化合物を含む医薬組成物を提供する。特定の態様において、そのような医薬組成物は、滅菌生理食塩水溶液および1またはそれ以上の アンチセンス化合物を含む。特定の態様において、そのような医薬組成物は、滅菌生理食塩水溶液および1またはそれ以上の アンチセンス化合物からなる。
特定の態様において、1またはそれ以上の アンチセンス化合物を含む医薬組成物が、被験体に対して投与される。特定の態様において、そのような医薬組成物は、注射により投与される。特定の態様において、そのような医薬組成物は、点滴により投与される。
SMAは、脊髄性運動ニューロンの破壊により特徴づけられる遺伝子障害である。SMAは、SMN1遺伝子の両方の機能的コピーのホモ接合体性喪失により生じる。しかしながら、SMN2遺伝子は、SMN1と同一のタンパク質をコードする可能性を有し、そしてしたがって、SMA患者の遺伝子欠失を克服する。SMN2は、エクソン7の位置+6に、翻訳的にはサイレントな変異(C→T)を含有し、これがSMN2転写物中にエクソン7の不十分な含有物を生じる。したがって、SMN2の支配的な形態、これはエクソン7を欠失したものであり、不安定で不活性である。このように、治療用化合物は、エクソン7を含有するSMN2転写物の割合を増加させるようにSMN2スプライシングを修飾することができ、そしてSMAの処置のために有用である。
特定の態様において、被験体は、1またはそれ以上のSMAの指標を有する。特定の態様において、被験体は、1またはそれ以上の筋肉の電気的活性を低下させた。特定の態様において、被験体は、変異SMN1遺伝子を有する。特定の態様において、 被験体のSMN1遺伝子は存在しないか、または機能的SMNタンパク質を生成することができない。特定の態様において、被験体は、遺伝子試験により診断される。特定の態様において、被験体は、筋肉バイオプシーにより同定される。特定の態様において、被験体は、 まっすぐに座ることができない。特定の態様において、被験体は、座るかおよび/または歩くことができない。特定の態様において、被験体は、呼吸および/または食事に補助を必要とする。 特定の態様において、 被験体は、筋肉および/または筋肉バイオプシーの電気生理学的測定により同定される。
特定の態様において、本発明は、投与量および投与頻度を提供する。特定の態様において、医薬組成物は、ボーラス注入として投与される。そのような特定の態様において、ボーラス注入の用量は、被験体の体重キログラム当たり0.01〜25ミリグラムのアンチセンス化合物である。そのような特定の態様において、ボーラス注入の用量は、被験体の体重キログラム当たり0.01〜10ミリグラムのアンチセンス化合物である。特定の態様において、用量は、被験体の体重キログラム当たり0.05〜5ミリグラムのアンチセンス化合物である。特定の態様において、用量は、被験体の体重キログラム当たり0.1〜2ミリグラムのアンチセンス化合物である。特定の態様において、用量は、被験体の体重キログラム当たり0.5〜1ミリグラムのアンチセンス化合物である。特定の態様において、そのような用量が、月に2回投与される。特定の態様において、そのような用量が毎月投与される。特定の態様において、そのような用量が、2ヶ月ごとに投与される。特定の態様において、そのような用量が、6ヶ月ごとに投与される。特定の態様において、そのような用量が、CSF中へのボーラス注入により投与される。特定の態様において、そのような用量が、くも膜下腔ボーラス注入により投与される。特定の態様において、そのような用量が、ボーラス全身性注射(例えば、皮下注射、筋肉内注射、または静脈内注射)により投与される。特定の態様において、被験体は、CSF中へのボーラス注入およびボーラス全身性注射を受ける。そのような態様において、CSFボーラスおよび全身性ボーラスの用量は、互いに同一であっても異なっていてもよい。特定の態様において、CSFおよび全身性用量は、異なる頻度で投与される。特定の態様において、本発明は、少なくとも1つのボーラスくも膜下注入および少なくとも1つのボーラス皮下注入を含む投薬処方を提供する。
特定の態様において、被験体はヒトである。特定の態様において、ヒト用量は、本明細書中に記載されるもののような動物実験からのデータから算出されまたは推定される。特定の態様において、ヒト用量は、本明細書中で記載されるののようなサルおよび/またはマウスの実験からからのデータから算出されまたは推定される。特定の態様において、ヒト用量は、本明細書中で記載されるののようなマウスの実験からからのデータから算出されまたは推定される。特定の態様において、適切なヒト用量は、脳重量および/または脳脊髄液(CSF)ターンオーバー速度の知見と併せて、マウスからの薬物動態データを使用して算出することができる。例えば、マウスの脳重量はおよそ0.4 gであり、これはその体重のおよそ2%である。ヒトにおいては、平均脳重量は1.5 kgであり、これはその体重のおよそ2.5%である。特定の態様において、CSF中への投与は、脳組織への取り込みおよびそれに引き続く代謝を通じて、化合物の一部の排除を生じる。マウス脳重量に対するヒト脳重量の比率を縮尺因子として使用することにより、脳組織を通じた除去およびクリアランスの推定を算出することができる。さらに、CSFのターンオーバー速度を使用して、CSFから血液への化合物の除去を推定することができる。マウスCSFのターンオーバー速度は、1日あたりおよそ10〜12倍である(0.04 mLが0.325μl/分で生成される)。ヒトのCSFターンオーバー速度は、1日あたりおよそ4倍である(100〜160 mLが350〜400μl/分で生成される)。クリアランス、そしてしたがって投与要求性、は、脳重量除去scalingおよび/またはCSFターンオーバーscalingに基づくことができる。外挿されたヒトCSFクリアランスを使用して、マウスにおける用量に近似させたヒトでの等用量を推定することができる。このように、脳重量およびCSFターンオーバー速度に基づいて、組織代謝における差異の原因となるヒト用量を、推定することができる。算出および推定のこのような方法は、当業者に知られている。
特定の態様において、上述の投与量、投与頻度、投与経路、誘導相および維持相、および第1の投与のタイミングを組み合わせて、SMAを有する被験体についての投与処方を提供する。そのような投与処方を選択しそして調整し、1またはそれ以上の SMAの症候の改善を提供しおよび/または医薬組成物の投与に寄与しうる毒性または副作用を減少しまたは回避する。特定の態様において、被験体は、子宮内のものであるかまたは新生児である。そのような態様において、医薬組成物の投与、特に連続的点滴による投与、は、特定のチャレンジを提示する。したがって、特定の態様において、本発明は、被験体が子宮内にいるかまたは非常に若いあいだ、ボーラス投与による医薬組成物の投与を提供し、その後、被験体がより年齢が高く、そしてそのようなポンプの設置がより実際的である場合、埋めこまれた点滴ポンプを介した連続的点滴を行う。さらに、特定の態様において、被験体が成長するにつれて、絶対的な用量が増加され、同一のまたは類似の用量:体重比を達成する。以下の表は、治療処方を例示することを意図しているが、当業者が容易に達成しうる可能性のある組み合わせを限定することを意図していない。
特定の態様において、本発明の医薬組成物を、SMAを治療するためおよび/または1またはそれ以上のSMAと関連する 症候を治療するため、少なくとも1つのその他の医薬組成物と共投与する。特定の態様において、そのようなその他の医薬組成物は、トリコスタチン-A、バルプロ酸、リルゾール、ヒドロキシウレア、およびブチレートまたはブチレート誘導体から選択される。特定の態様において、本発明の医薬組成物は、トリコスタチン-Aと共投与する。特定の態様において、本発明の医薬組成物は、例えば、Thurmond, et al., J. Med Chem. 2008, 51, 449-469に記載されるように、キナゾリンの誘導体と共投与する。特定の態様において、本発明の医薬組成物および少なくとも1つのその他の医薬組成物を、同時に共投与する。特定の態様において、本発明の医薬組成物および少なくとも1つのその他の医薬組成物を、異なる時点で共投与する。
特定の態様において、少なくとも1つの本発明の医薬組成物の投与の結果、被験体において表現型変化が生じる。特定の態様において、そのような表現型変化には:エクソン7が含まれるSMN mRNAの絶対量の増加;エクソン7が含まれるSMN mRNAのエクソン7を欠失するSMN mRNAに対する比の増加; エクソン7が含まれるSMNタンパク質の絶対量の増加;エクソン7が含まれるSMNタンパク質のエクソン7を欠失するSMNタンパク質に対する比の増加;筋力の改善、少なくとも1つの筋肉の電気的活性の改善;呼吸の改善;体重増加;および生存、が含まれるが、しかしこれらに限定されるわけではない。特定の態様において、少なくとも1つの表現型変化は、被験体の運動ニューロン中で検出される。特定の態様において、少なくとも1つの本発明の医薬組成物の投与 の結果、被験体が腹筋運動をすること、立ち上がることおよび/または歩くことができるようになる。特定の態様において、少なくとも1つの本発明の医薬組成物の投与の結果、被験体が介助なしに食べ、飲みおよび/または呼吸することができる様になる。特定の態様において、治療効果は、筋肉の電気生理学的評価により評価される。特定の態様において、本発明の医薬組成物の投与は、SMAの少なくとも1つの症候を改善し、そして炎症性作用をほとんどまたは何も有さない。そのような特定の態様において、炎症性作用がないことを処置に際してAif1レベルの顕著な増加が存在しないことにより決定する。
特定の態様において、本発明の医薬組成物は、投与のための投与単位として調製される。特定のそのような投与単位は、0.01 mg〜100mgから選択される濃度でのものである。そのような特定の態様において、本発明の医薬組成物は、0.01 mg、0.1 mg、0.5 mg、1 mg、5 mg、10 mg、20 mg、25 mg、50 mg、75 mg、100 mg、150 mg、および200 mg から選択されるアンチセンス化合物の用量を含む。特定の態様において、医薬組成物は、0.1 mg、0.5 mg、1 mg、5 mg、10 mg、25 mg、および50 mgから選択されるオリゴヌクレオチドの用量を含む。
特定の態様において、本発明は、少なくとも1つの医薬組成物を含むキットを提供する。特定の態様において、そのようなキットは、送達手段、例えば、シリンジまたは点滴ポンプ、をさらに含む。
本明細書中で記載される特定の化合物、組成物および方法が、特定の態様に従って具体的に記載される一方、以下の実施例は、本明細書中で記載される化合物を説明するためにのみ機能し、そして限定することを目的とはしていない。参照文献のそれぞれ、GenBankアクセッション番号、および本明細書中で記載される同様のものは、その全体を参照として本明細書により援用される。
以下のオリゴヌクレオチドを、以前に報告された標準的な技術を使用して合成した。
上述したアンチセンス化合物の治療上の有効性および安全性を、適切な動物モデルにおいて試験することができる。 例えば、ヒト疾患に最も類似していると思われる動物モデルには、特定の疾患を高い頻度で自然発生的に発生する動物種かまたは発生するように誘導される動物種が含まれる。
台湾マウスは、生理食塩水、または35 mg/kgの396443またはミスマッチアンチセンスオリゴヌクレオチド対照を1日1回5日間腹腔内注射することにより処置し、そして2日後のday 7に犠死させた。肝臓および腎臓を回収し、そしてRNAを標準的技術を使用して単離した。エクソン7を有するSMN2およびエクソン7を有さないSMN2を、RT-PCRにより可視化した。ISIS396443の投与の結果、生理食塩水処置動物およびミスマッチ対照処置動物と比較して、腎臓および肝臓からのSMN2におけるエクソン7の含有物が実質的に増加した。
台湾マウスに対して、生理食塩水または150μgのISIS396443のいずれかをを毎日7日間ICV注射した。マウスをday 8に犠死させ、RNAを脳および脊髄 から抽出した。RT-PCR解析は、ISIS396443により処置した動物から得られた脳および脊髄サンプル中のSMN2において、エクソン7含有物の実質的な増加を示した。これらの結果から、エクソン7の除去がSMA表現型と関連していることから、SMNを標的化するアンチセンスオリゴヌクレオチドによるICV処置は、SMA症状を救済することができることが示される。
台湾マウスに対して、生理食塩水または10、50、100、または150μgのISIS396443のいずれかを毎日7日間ICV注射し(各処置群について5匹のマウス)そしてday 8に犠死させた。RNAを単離し、RT-PCRにより解析した。10μg処置群は、中程度のエクソン7含有物を示した。50μg、100μg、および150μg群はすべて、実質的なエクソン7含有物を示した。
作用の期間を決定するため、24匹のマウスに対して、50μgのISIS396443を毎日7日間ICV注射した。4匹のマウスを最終投与(時間0)の時点で犠死させ、そして4匹のマウスを:最終投与の1週間後、2週間後、4週間後および8週間後にそれぞれ犠死させた。すべての処置マウスは、week 8の時点で効果と共に、RT-PCRにより実質的なエクソン7含有物を示し、図1に示されるように、他の群と差異を示さなかった:
これらの結果から、ISIS396443を1日あたり50μgで7日間ICV投与すると、処置後少なくとも8週間のあいだ有効であることが示される。
マイクロ-浸透性ポンプ(Azlet Osmotic Pumps, Cupertino, CA, USA)を使用して、ISIS396443を、ヒトSMN2トランスジーンを有する成体type-III Smn+/-マウスまたはSmn-/- SMAマウス(台湾系統)に、右側脳室を介して脳脊髄液(CSF)中に送達した。用量-反応性の研究により、生理食塩水-処置マウスでは約10%であったのと比較して、ISIS396443の脳室内(ICV)点滴により、脊髄でのSMN2エクソン7の含有物が約90%にまで増加した。ウェスタンブロッティング解析および免疫組織化学的解析により、脊髄運動ニューロンにおけるヒトトランスジェニックSMNタンパク質レベルの強固な増加が示された。これらの結果から、エクソン7の除去がSMA表現型と関連していることから、アンチセンスオリゴヌクレオチドISIS396443のCNS点滴により、SMA症状を救済することができることが示される。
20μgまたは10μgのいずれかのISIS396443の単回ICV注射を、妊娠day 15(E15)に胚性台湾マウスに投与した。動物を、生後day 7(P7)に犠死させた。RNAを、腰部脊髄から単離し、そしてRT-PCRにより解析した。ISIS 396443の単回胚投与は結果として実質的なエクソン7の含有物を生じる。これらの結果から、エクソン7の除去がSMA表現型と関連していることから、アンチセンスオリゴヌクレオチドISIS396443での子宮内処置により、SMA症状を救済することができることが示される。
ヘテロ接合体(SMN+/-、hSMN2+/+、SMNΔ7+/+)交配ペアを交配させ、そして出産のその日(P0)に、新生仔を、ISIS396443(18-mer、SEQ ID NO. 1)、ISIS396449(15-mer、SEQ ID NO. 2)、ISIS387954(20-mer、SEQ ID NO. 7)またはスクランブル化対照ASO(ISIS439273;18-mer)により処置した。マウスに、側脳室中に全用量8μg(各側脳室に対して4μg)を両側性で注射した。すべての注射を、記載されたように(Passini et al, J. Virol. (2001) 75:12382-12392)、細く引いたガラスピペット針を用いて行った。注射の後、新生仔のつま先を切断し、そして遺伝子型決定を行い(Le et al., Hum. Mol. Genet. (2005) 14:845-857)、SMA(SMN-/-、hSMN2+/+、SMNΔ7+/+)マウス、ヘテロ接合体マウス、および野生型(SMN+/+、hSMN2+/+、SMNΔ7+/+)マウスを特定した。すべての一胎仔を取り出し、7匹の新生仔を生存についての胎仔サイズのための対照とした。非処置対照群を生成するために、胎仔の数匹には注射をしなかった。
2種のアンチセンス化合物および1種の対照化合物を、SMAのマウスモデルにおいて試験した。化合物 は、以下の表に記載する。
カニクイザル(Cynomolgus)を使用して、異なる投与量および異なる投与経路の場合の、ISIS395443の分布を評価した。ISIS396443は、2匹のサルに投与した。一頭のサルには、3 mgをICV点滴により投与し、もう一頭のサルには3 mgをIT点滴により投与した。両方の点滴とも、24時間の期間にわたり送達した。これらのサルは、点滴期間の終了後96時間後に犠死させ、そして組織を回収した。ISIS396443の濃度は、脊髄の頸部、胸部、および腰部由来のサンプル中で測定した。結果を以下の表にまとめた。
重症のSMA表現型を有するマウス(sSMAマウス)を作出した。ホモ接合体sSMAマウスは、2コピーのヒトSMN2を有し、マウスSMNを有さない。平均寿命は、約10日である。さらに、SMAマウスはより小さくより短い尾を持つ。ヘテロ接合体は、マウスSMNを持ち、そして正常に発生する。
sSMAマウスおよび健康なヘテロ接合体対照マウスをグループ分けし、以下のように、ボーラスICV注射および/またはボーラス皮下注入(SC)により、ISIS396443の作用を研究した:
グループ1 - ICV+SC
1回のICV注射では、P1またはP2に20μg(生後day 1または2);そして2回の皮下注入では50μg/gをP0とP3とのあいだに送達。
2回のSC注射では50μg/gをP0とP3とのあいだに送達;そして1回の皮下注入では、50μg/gをP5とP6とのあいだに送達;そして、皮下注入では50μg/gをP9とP10とのあいだに送達。
2回のSC注射では、50μg/gをP0とP3とのあいだに送達。
1回のICV注射では、生理食塩水をP1またはP2に送達;そして2回の皮下注入では、生理食塩水をP0とP3とのあいだに送達。
1回のICV注射では、20μgをP1またはP2に送達;そして2回の皮下注入では、50μg/gをヘテロ接合体マウスのP0とP3とのあいだに送達。
異なる用量の皮下ISIS396443投与を受けたsSMAマウスの生存を、以下の投与群により評価した。
2回のSC注射、全量でマウス当たり400μgを、P0〜P3に送達し、1回目の用量はP0またはP1に150μg(3μlの体積)および2回目の用量はP2またはP3に送達される250μgであった(5μlの体積)。
2回のSC注射、全量でマウス当たり200μgを、P0とP3との間に送達し、1回目の用量はP0〜P1に75μg(1.5μlの体積)および2回目の用量はP2またはP3にに送達される125μgであった(2.5μlの体積)。
2回のSC注射、全量でマウス当たり100μgを、P0とP3との間に送達し、1回目の用量はP0またはP1に40μg(2μlの体積)および2回目の用量はP2またはP3にに送達される60μgであった(3μlの体積)。
P0とP3とのあいだに生理食塩水の2回のSC注射、1回目の注射はP0またはP1に行い(5μlの体積)、そして2回目の注射はP2またはP3に送達した(5μlの体積)。
処置なしのマウス。
脳室内ボーラス注入(ICVボーラス)による投与を、連続脳室内点滴(ICV点滴)による投与と比較した。SMA type IIIトランスジェニックマウスに、ISIS387954を投与した。ICV点滴マウスに対して、全量で0(PBS対照)、87.5μg、175μg、350μg、または700μgを、7日間かけて注入し、そしてその後2日後に犠死させた。ICVボーラスマウスに対して、同一の全量、0(PBS対照)、87.5μg、175μg、350μg、または700μgを、単回ICV注射にて注入し、そしてその後9日後に犠死させた。各群5匹のマウスが存在した。RNAを腰部脊髄から回収し、そしてリアルタイムPCRにより解析した。イントロン7含有物を、生理食塩水-処置対照に対して正規化した。結果を、以下の表にまとめた。
脳室内ボーラスによる投与を、追加の用量にて試験した。トランスジェニックマウスに対して、0、10.9μg、21.9μg、43.4μg、87.5μg、または175μgのISIS387954を、単回ボーラスICV注射により投与し、そして実施例13に示されるように、9日後に犠死させた。サンプルを脳および腰部脊髄から採取した。RNAを調製し、そしてイントロン7含有物の変化について、そしてAIF1の変化について、RT-PCRにより解析した。サンプルのいずれも、対照と比較して、AIF1の変化を示さなかった。イントロン7含有物からの結果を、以下の表にまとめる。ED50は、およそ22μgである。
Claims (17)
- ヒトSMN2をコードするpre-mRNAのイントロン7に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物であって、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが配列番号1の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有し、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシドが修飾糖成分を含み、それぞれの修飾糖成分が2'-メトキシエチル糖成分であり、それぞれのヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であるもの、を含む、
SMAに関連する少なくとも1つの症状を有する被験体に対して投与するための、被検体の脳脊髄液中に投与される医薬組成物。 - 投与 が、くも膜下腔中に行われる、請求項1に記載される医薬組成物。
- 投与が、脳内の脳脊髄液中に行われる、請求項1に記載される医薬組成物。
- 投与が、(i)ボーラス注入すること、または(ii)送達用ポンプを用いて注入すること、を含む、請求項1〜3のいずれかに記載される医薬組成物。
- アンチセンス化合物が、被験体の体重kg当たり0.01〜10ミリグラムの用量で投与される、請求項1〜4のいずれかに記載される医薬組成物。
- 被験体の運動ニューロン中の、SMN2 mRNAのエクソン7の含有量を、増加する、請求項1〜5のいずれかに記載される医薬組成物。
- 被験体の運動ニューロン中の、SMN2ポリペプチドのエクソン7アミノ酸の含有量を、増加させる、請求項1〜6のいずれかに記載される医薬組成物。
- 被検体がサバイバル運動ニューロン1(SMN1)と関連する疾患または症状を有する、請求項1〜7のいずれかに記載される医薬組成物。
- 被験体が、(i)SMA;(ii)I型SMA;(iii)II型SMA;または(iv)III型SMAを有する、請求項1〜8のいずれかに記載される医薬組成物。
- アンチセンス化合物を投与することにより、少なくとも10%のエクソン7を有するSMN2 mRNAの量の増加を結果として生じる、請求項9に記載される医薬組成物。
- 投与することにより、被験体のSMAの少なくとも1つの兆候を改善する、請求項1〜10のいずれかに記載される医薬組成物。
- アンチセンスオリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾された核酸塩基を含む、請求項1〜11のいずれかに記載される医薬組成物。
- 修飾された核酸塩基が、5-メチルシトシンである、請求項12に記載される医薬組成物。
- アンチセンス化合物を、全身的にも投与する、請求項1〜13のいずれかに記載される医薬組成物。
- 全身性投与が、静脈内注射または腹腔内注射によるものである、請求項14に記載の医薬組成物。
- 全身性投与および中枢神経系への投与が、同時に行われる、請求項14または15に記載される医薬組成物。
- 全身性投与および中枢神経系への投与が、異なる時点で行われる、請求項14または15に記載される医薬組成物。
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