팬클

팬클
사용 가능한 구조
PDB	Ortholog 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	3ZQS, 4CCG
식별자
에일리어스	FANCL, FAAP43, PHF9, POG, 판코니빈혈보완군 L, FA보완군 L
외부 ID	OMIM: 608111 MGI: 1914280 HomoloGene: 9987 GeneCard: FANCL
유전자 위치(인간)
크르.	2번 염색체(인간)
끝.	58,241,194 bp
유전자 위치(마우스)
크르.	11번 염색체(쥐)
끝.	26,421,876 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	뇌하수체; ; 뇌하수체 전엽; ; 아킬레스건; ; 뇌량; ; 경골; ; 이차 난모세포; ; 우측 자궁관; ; 핀; ; 태아; ; 췌장체;
	상단 표시 위치:
	파네스 세포; ; 원시적 특징; ; 복벽; ; 심내막 쿠션; ; 상악 융기; ; 심실중격; ; 밧세루; ; 내측 신경절 융기; ; 방실 밸브; ; 후상피;
	추가 참조 표현식 데이터
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	유비퀴틴산전달효소활성; 단백질 결합; 금속 이온 결합; 유비퀴틴단백질리가수분해효소결합; 유비퀴틴단백질리가수분해효소활성; 트랜스페라아제 활성;
셀룰러 컴포넌트	세포질; 핵; 핵외피; 판코니 빈혈 핵복합체; 핵소체; 핵체; 세포막내소기관;
생물학적 과정	단백질유비퀴티네이션; 배우자 발생; 세포군 증식 조절; 스트랜드간 가교 복구; 단백질단백질단백질화; DNA 손상 자극에 대한 세포 반응; DNA복구;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	55120
	67030
	ENSG00000115392
	ENSMUSG00000004018
	Q9NW38
	Q9CR14
	NM_001114636; NM_018062; NM_001374615
	NM_001277273; NM_025923
	NP_001108108; NP_060532; NP_001361544
	NP_001264202; NP_080199
	위키데이터
인간 보기/편집	마우스 표시/편집

E3 유비퀴틴-단백질 연결효소 FANCL은 FANCL ^[5]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 효소이다.

기능.

DNA 이중 가닥 손상 재조합 복구 - 몇 가지 중요한 단계입니다.ATM(ATM)은 DNA 이중 가닥 절단에 의해 모집되고 활성화되는 단백질 키나제이다.DNA 이중 가닥 손상은 판코니 빈혈 코어 복합체(FANCA/B/C/E/F/G/L/M)^[6]도 활성화한다.FA 코어 콤플렉스는 다운스트림타깃 FANCD2 및 FANCI를 ^[7]중단합니다.ATM은 CHEK2를 활성화(인산염)하고 FANCD2^[8] CHEK2는 BRCA1을 ^[9]인산화한다.BRCA1 및 RAD51을 ^[10]갖춘 유비쿼티드 FANCD2 복합체.PALB2 단백질은 ^[11]허브로 작용하여 DNA 이중 가닥 절단 부위에 BRCA1, BRCA2, RAD51을 결합시키고, 또한 RAD51-RAD51C-RAD51D-XRC2 (DBC2)의 구성원인 RAD51C와 결합한다.BCDX2 단지는 피해 현장의 RAD51 모집 또는 ^[12]안정을 담당합니다.RAD51은 이중 가닥 절단 수복 중 DNA의 상동 재조합 수복에 중요한 역할을 한다.이 과정에서 단일 가닥이 염기쌍의 상동성 DNA 분자의 가닥에 침입하는 ATP 의존성 DNA 가닥 교환이 일어난다.RAD51은 프로세스의 호몰로지 및 가닥 페어링 단계 검색에 관여합니다.

모든 판코니 빈혈(FA) 보완 그룹에서 돌연변이 결함에 대한 임상 표현형은 유사하다.이러한 표현형은 진행성 골수 기능 상실, 암 발병성 및 전형적인 선천성 ^[13]기형으로 특징지어진다.주요 세포 표현형은 DNA 손상에 대한 과민성, 특히 가닥간 DNA 가교이다.^[14]FA 단백질은 다단백질 경로를 통해 상호작용한다.DNA 간 교배는 FA 단백질과 유방암 감수성 유전자 1(BRCA1)의 배열을 포함한 상동 재조합에 의해 복구되는 매우 해로운 손상이다.

판코니 빈혈(FA) DNA 복구 경로는 DNA 가닥간 교차 링크(ICL)의 인식 및 복구에 필수적이다.이 경로의 중요한 단계는 RING E3 연결효소 FANCL에 의한 FANCD2의 모노비퀴트화이다.FANCL은 3개의 도메인, E2 결합효소와 상호작용하는 RING 도메인, 기판 상호작용에 필요한 중심 도메인 및 ^[15]FANCB와 상호작용하는 N말단 E2-like Fold(ELF) 도메인을 포함한다.FANCL의 ELF 도메인은 FANCL과 유비퀴틴 사이의 비공유 상호작용을 중개하기 위해서도 필요합니다.ELF 도메인은 척추동물 세포에서 효율적인 DNA 손상 유도 FANCD2 모노비퀴티션을 촉진하기 위해 필요하며,^[16] 이는 FANCL에 의한 FANCB 및 유비퀴틴 결합의 중요한 기능을 시사한다.

FANCL(FANCA, FANCB, FANCC, FANCE, FANCF, FANCG 및 FANCM)을 포함한 핵복합체는 FANCD2 단백질이 모노유화 ^[6]아이소폼으로 활성화되기 위해 필수적이다.정상, 돌연변이 없는 세포 FANCD2는 DNA 손상에 반응하여 모노유비화된다.활성화된 FANCD2 단백질은 BRCA1(유방암 감수성 단백질)과 이온화 방사 유도 포시 및 감수성 염색체의 시냅토네마 복합체에서 함께 국재한다(그림:이중 가닥 손상 재조합 수리)

레퍼런스

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000115392 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG00000004018 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: FANCL Fanconi anemia, complementation group L".
^ ^a ^b D'Andrea AD (2010). "Susceptibility pathways in Fanconi's anemia and breast cancer". N. Engl. J. Med. 362 (20): 1909–19. doi:10.1056/NEJMra0809889. PMC 3069698. PMID 20484397.
^ Sobeck A, Stone S, Landais I, de Graaf B, Hoatlin ME (2009). "The Fanconi anemia protein FANCM is controlled by FANCD2 and the ATR/ATM pathways". J. Biol. Chem. 284 (38): 25560–8. doi:10.1074/jbc.M109.007690. PMC 2757957. PMID 19633289.
^ Castillo P, Bogliolo M, Surralles J (2011). "Coordinated action of the Fanconi anemia and ataxia telangiectasia pathways in response to oxidative damage". DNA Repair (Amst.). 10 (5): 518–25. doi:10.1016/j.dnarep.2011.02.007. PMID 21466974.
^ Stolz A, Ertych N, Bastians H (2011). "Tumor suppressor CHK2: regulator of DNA damage response and mediator of chromosomal stability". Clin. Cancer Res. 17 (3): 401–5. doi:10.1158/1078-0432.CCR-10-1215. PMID 21088254.
^ Taniguchi T, Garcia-Higuera I, Andreassen PR, Gregory RC, Grompe M, D'Andrea AD (2002). "S-phase-specific interaction of the Fanconi anemia protein, FANCD2, with BRCA1 and RAD51". Blood. 100 (7): 2414–20. doi:10.1182/blood-2002-01-0278. PMID 12239151.
^ Park JY, Zhang F, Andreassen PR (2014). "PALB2: the hub of a network of tumor suppressors involved in DNA damage responses". Biochim. Biophys. Acta. 1846 (1): 263–75. doi:10.1016/j.bbcan.2014.06.003. PMC 4183126. PMID 24998779.
^ Chun J, Buechelmaier ES, Powell SN (2013). "Rad51 paralog complexes BCDX2 and CX3 act at different stages in the BRCA1-BRCA2-dependent homologous recombination pathway". Mol. Cell. Biol. 33 (2): 387–95. doi:10.1128/MCB.00465-12. PMC 3554112. PMID 23149936.
^ Walden, Helen; Deans, Andrew J. (2014). "The Fanconi anemia DNA repair pathway: structural and functional insights into a complex disorder". Annual Review of Biophysics. 43: 257–278. doi:10.1146/annurev-biophys-051013-022737. ISSN 1936-1238. PMID 24773018.
^ Deans, Andrew J.; West, Stephen C. (2011-06-24). "DNA interstrand crosslink repair and cancer". Nature Reviews. Cancer. 11 (7): 467–480. doi:10.1038/nrc3088. ISSN 1474-1768. PMC 3560328. PMID 21701511.
^ van Twest, Sylvie; Murphy, Vincent J.; Hodson, Charlotte; Tan, Winnie; Swuec, Paolo; O'Rourke, Julienne J.; Heierhorst, Jörg; Crismani, Wayne; Deans, Andrew J. (2017-01-19). "Mechanism of Ubiquitination and Deubiquitination in the Fanconi Anemia Pathway". Molecular Cell. 65 (2): 247–259. doi:10.1016/j.molcel.2016.11.005. ISSN 1097-4164. PMID 27986371.
^ Miles JA, Frost MG, Carroll E, Rowe ML, Howard MJ, Sidhu A, Chaugule VK, Alpi AF, Walden H (2015). "The Fanconi Anemia DNA Repair Pathway Is Regulated by an Interaction between Ubiquitin and the E2-like Fold Domain of FANCL". J. Biol. Chem. 290 (34): 20995–1006. doi:10.1074/jbc.M115.675835. PMC 4543658. PMID 26149689.

추가 정보

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Agoulnik AI, Lu B, Zhu Q, et al. (2003). "A novel gene, Pog, is necessary for primordial germ cell proliferation in the mouse and underlies the germ cell deficient mutation, gcd". Hum. Mol. Genet. 11 (24): 3047–53. doi:10.1093/hmg/11.24.3047. PMID 12417526.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Lu B, Bishop CE (2003). "Mouse GGN1 and GGN3, two germ cell-specific proteins from the single gene Ggn, interact with mouse POG and play a role in spermatogenesis". J. Biol. Chem. 278 (18): 16289–96. doi:10.1074/jbc.M211023200. PMID 12574169.
Lu B, Bishop CE (2004). "Late onset of spermatogenesis and gain of fertility in POG-deficient mice indicate that POG is not necessary for the proliferation of spermatogonia". Biol. Reprod. 69 (1): 161–8. doi:10.1095/biolreprod.102.014654. PMID 12606378.
Meetei AR, Sechi S, Wallisch M, et al. (2003). "A Multiprotein Nuclear Complex Connects Fanconi Anemia and Bloom Syndrome". Mol. Cell. Biol. 23 (10): 3417–26. doi:10.1128/MCB.23.10.3417-3426.2003. PMC 164758. PMID 12724401.
Meetei AR, de Winter JP, Medhurst AL, et al. (2003). "A novel ubiquitin ligase is deficient in Fanconi anemia". Nat. Genet. 35 (2): 165–70. doi:10.1038/ng1241. PMID 12973351. S2CID 10149290.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Meetei AR, Levitus M, Xue Y, et al. (2004). "X-linked inheritance of Fanconi anemia complementation group B". Nat. Genet. 36 (11): 1219–24. doi:10.1038/ng1458. PMID 15502827.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS, et al. (2005). "Generation and annotation of the DNA sequences of human chromosomes 2 and 4". Nature. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005Natur.434..724H. doi:10.1038/nature03466. PMID 15815621.
Meetei AR, Medhurst AL, Ling C, et al. (2005). "A Human Orthologue of Archaeal DNA Repair Protein Hef is Defective in Fanconi Anemia Complementation Group M". Nat. Genet. 37 (9): 958–63. doi:10.1038/ng1626. PMC 2704909. PMID 16116422.
Gurtan AM, Stuckert P, D'Andrea AD (2006). "The WD40 repeats of FANCL are required for Fanconi anemia core complex assembly". J. Biol. Chem. 281 (16): 10896–905. doi:10.1074/jbc.M511411200. PMID 16474167.
Zhang J, Wang X, Lin CJ, et al. (2007). "Altered expression of FANCL confers mitomycin C sensitivity in Calu-6 lung cancer cells". Cancer Biol. Ther. 5 (12): 1632–6. doi:10.4161/cbt.5.12.3351. PMID 17106252.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000115392 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG00000004018 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: FANCL Fanconi anemia, complementation group L".

[Andrea-6] D'Andrea AD (2010). "Susceptibility pathways in Fanconi's anemia and breast cancer". N. Engl. J. Med. 362 (20): 1909–19. doi:10.1056/NEJMra0809889. PMC 3069698. PMID 20484397.

[pmid19633289-7] Sobeck A, Stone S, Landais I, de Graaf B, Hoatlin ME (2009). "The Fanconi anemia protein FANCM is controlled by FANCD2 and the ATR/ATM pathways". J. Biol. Chem. 284 (38): 25560–8. doi:10.1074/jbc.M109.007690. PMC 2757957. PMID 19633289.

[Castillo-8] Castillo P, Bogliolo M, Surralles J (2011). "Coordinated action of the Fanconi anemia and ataxia telangiectasia pathways in response to oxidative damage". DNA Repair (Amst.). 10 (5): 518–25. doi:10.1016/j.dnarep.2011.02.007. PMID 21466974.

[pmid21088254-9] Stolz A, Ertych N, Bastians H (2011). "Tumor suppressor CHK2: regulator of DNA damage response and mediator of chromosomal stability". Clin. Cancer Res. 17 (3): 401–5. doi:10.1158/1078-0432.CCR-10-1215. PMID 21088254.

[pmid12239151-10] Taniguchi T, Garcia-Higuera I, Andreassen PR, Gregory RC, Grompe M, D'Andrea AD (2002). "S-phase-specific interaction of the Fanconi anemia protein, FANCD2, with BRCA1 and RAD51". Blood. 100 (7): 2414–20. doi:10.1182/blood-2002-01-0278. PMID 12239151.

[pmid24998779-11] Park JY, Zhang F, Andreassen PR (2014). "PALB2: the hub of a network of tumor suppressors involved in DNA damage responses". Biochim. Biophys. Acta. 1846 (1): 263–75. doi:10.1016/j.bbcan.2014.06.003. PMC 4183126. PMID 24998779.

[Chun-12] Chun J, Buechelmaier ES, Powell SN (2013). "Rad51 paralog complexes BCDX2 and CX3 act at different stages in the BRCA1-BRCA2-dependent homologous recombination pathway". Mol. Cell. Biol. 33 (2): 387–95. doi:10.1128/MCB.00465-12. PMC 3554112. PMID 23149936.

[13] Walden, Helen; Deans, Andrew J. (2014). "The Fanconi anemia DNA repair pathway: structural and functional insights into a complex disorder". Annual Review of Biophysics. 43: 257–278. doi:10.1146/annurev-biophys-051013-022737. ISSN 1936-1238. PMID 24773018.

[14] Deans, Andrew J.; West, Stephen C. (2011-06-24). "DNA interstrand crosslink repair and cancer". Nature Reviews. Cancer. 11 (7): 467–480. doi:10.1038/nrc3088. ISSN 1474-1768. PMC 3560328. PMID 21701511.

[15] van Twest, Sylvie; Murphy, Vincent J.; Hodson, Charlotte; Tan, Winnie; Swuec, Paolo; O'Rourke, Julienne J.; Heierhorst, Jörg; Crismani, Wayne; Deans, Andrew J. (2017-01-19). "Mechanism of Ubiquitination and Deubiquitination in the Fanconi Anemia Pathway". Molecular Cell. 65 (2): 247–259. doi:10.1016/j.molcel.2016.11.005. ISSN 1097-4164. PMID 27986371.

[pmid26149689-16] Miles JA, Frost MG, Carroll E, Rowe ML, Howard MJ, Sidhu A, Chaugule VK, Alpi AF, Walden H (2015). "The Fanconi Anemia DNA Repair Pathway Is Regulated by an Interaction between Ubiquitin and the E2-like Fold Domain of FANCL". J. Biol. Chem. 290 (34): 20995–1006. doi:10.1074/jbc.M115.675835. PMC 4543658. PMID 26149689.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

Search

팬클

네임스페이스

더

기능.

레퍼런스

추가 정보