TPCN2

TPCN2
Ідентифікатори
Символи	TPCN2, SHEP10, TPC2, two pore segment channel 2
Зовнішні ІД	OMIM: 612163 MGI: 2385297 HomoloGene: 16375 GeneCards: TPCN2
Реагує на сполуку
phosphatidyl (3,5) inositol biphosphate, верапаміл
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein kinase binding • NAADP-sensitive calcium-release channel activity • voltage-gated calcium channel activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • endosome membrane • лізосома • lysosomal membrane Біологічний процес • release of sequestered calcium ion into cytosol • membrane depolarization during action potential • response to vitamin D • regulation of ion transmembrane transport • cellular calcium ion homeostasis • ion transport • ion transmembrane transport • regulation of autophagy • calcium ion transmembrane transport • lysosome organization • calcium-mediated signaling • calcium ion transport • трансмембранний транспорт • smooth muscle contraction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	219931	233979
Ensembl	ENSG00000162341	ENSMUSG00000048677
UniProt	Q8NHX9	Q8BWC0
RefSeq (мРНК)	NM_139075	NM_146206
RefSeq (білок)	NP_620714	NP_666318
Локус (UCSC)	Хр. 11: 69.05 – 69.14 Mb	Хр. 7: 144.74 – 144.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TPCN2 (англ. Two pore segment channel 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 752 амінокислот, а молекулярна маса — 85 243.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEPQAESEP		LLGGARGGGG		DWPAGLTTYR		SIQVGPGAAA		RWDLCIDQAV
VFIEDAIQYR		SINHRVDASS		MWLYRRYYSN		VCQRTLSFTI		FLILFLAFIE
TPSSLTSTAD		VRYRAAPWEP		PCGLTESVEV		LCLLVFAADL		SVKGYLFGWA
HFQKNLWLLG		YLVVLVVSLV		DWTVSLSLVC		HEPLRIRRLL		RPFFLLQNSS
MMKKTLKCIR		WSLPEMASVG		LLLAIHLCLF		TMFGMLLFAG		GKQDDGQDRE
RLTYFQNLPE		SLTSLLVLLT		TANNPDVMIP		AYSKNRAYAI		FFIVFTVIGS
LFLMNLLTAI		IYSQFRGYLM		KSLQTSLFRR		RLGTRAAFEV		LSSMVGEGGA
FPQAVGVKPQ		NLLQVLQKVQ		LDSSHKQAMM		EKVRSYGSVL		LSAEEFQKLF
NELDRSVVKE		HPPRPEYQSP		FLQSAQFLFG		HYYFDYLGNL		IALANLVSIC
VFLVLDADVL		PAERDDFILG		ILNCVFIVYY		LLEMLLKVFA		LGLRGYLSYP
SNVFDGLLTV		VLLVLEISTL		AVYRLPHPGW		RPEMVGLLSL		WDMTRMLNML
IVFRFLRIIP		SMKLMAVVAS		TVLGLVQNMR		AFGGILVVVY		YVFAIIGINL
FRGVIVALPG		NSSLAPANGS		APCGSFEQLE		YWANNFDDFA		AALVTLWNLM
VVNNWQVFLD		AYRRYSGPWS		KIYFVLWWLV		SSVIWVNLFL		ALILENFLHK
WDPRSHLQPL		AGTPEATYQM		TVELLFRDIL		EEPGEDELTE		RLSQHPHLWL
CR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, лізосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lam A.K., Galione A., Lai F.A., Zissimopoulos S. (2013). Hax-1 identified as a two-pore channel (TPC)-binding protein. FEBS Lett. 587: 3782—3786. PMID 24188827 DOI:10.1016/j.febslet.2013.10.031

Див. також

• Хромосома 11