KR20080082109A - Protein marker flavin reductase for breast cancer diagnosis and diagnosis kit for breast cancer using antibody against the same - Google Patents

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Abstract

A breast cancer diagnostic kit comprising an antibody specific to a flavin reductase protein marker is provided to show high specificity and accuracy of diagnosis and diagnose the breast cancer very conveniently using blood of a patient, thereby being usefully used for an early diagnosis of the breast cancer. A kit for diagnosing breast cancer comprises an antibody specific to a flavin reductase protein marker having an amino acid sequence of SEQ ID : NO. 1. The kit further comprises a secondary antibody conjugate where a marker colored by a reaction with a substrate is conjugated, a coloring substrate solution which is subject to the color reaction with the marker, a washing solution and an enzyme reaction stopping solution. Further, the antibody is multi-clone antibody or single-clone antibody.

Description

유방암 진단용 단백질 마커 플라빈 환원효소 및 이에 대한 항체를 포함하는 유방암 진단키트{PROTEIN MARKER FLAVIN REDUCTASE FOR BREAST CANCER DIAGNOSIS AND DIAGNOSIS KIT FOR BREAST CANCER USING ANTIBODY AGAINST THE SAME}PROTEIN MARKER FLAVIN REDUCTASE FOR BREAST CANCER DIAGNOSIS AND DIAGNOSIS KIT FOR BREAST CANCER USING ANTIBODY AGAINST THE SAME}

도 1은 비환자 대조군과 유방암 환자군의 혈장을 각각 가벼운 동위원소와 무거운 동위원소로 치환된 cICAT(cleavable Isotope-Coded Affinity Tag) 시약으로 표지하고 트립신으로 절단한 후, 질량분석기로 동정 및 정량하여 유방암 환자군에서 특이적으로 발현양이 증가한 펩티드의 두 동위원소 쌍에 대한 크로마토그램을 나타낸 것이고, 1 is labeled with a cleavable isotope-coded affinity tag (cICAT) reagent substituted with a light isotope and a heavy isotope, and digested with trypsin, and then identified and quantified by mass spectrometry. Shows chromatograms of two isotopic pairs of peptides with increased expression in the patient group,

도 2a2b는 상기 1에서 유방암 환자군에서 특이적으로 발현양이 증가한 것으로 확인된 서열번호: 2의 아미노산 서열을 갖는 펩티드를 각각 가벼운 동위원소(2a)와 무거운 동위원소(2b)의 cICAT으로 표지한 후 탠덤질량분석기(tandem mass spectrometry)로 분석한 결과이고, Figures 2a and 2b are the Fig. 1 specifically in breast cancer patients typically express both the sequence number found to be increased: the cICAT of a peptide having an amino acid sequence of the second light isotopes (2a) respectively with heavier isotopes (2b) After labeling, the result is analyzed by tandem mass spectrometry,

도 3은 비환자 대조군의 혈장과 유방암 환자군의 혈장을 전기영동으로 분석한 후 항-플라빈 환원효소 항체로 면역블럿팅을 수행한 결과이고, 3 is a result of immunoblotting with anti-flavin reductase antibody after analyzing the plasma of the non-patient control group and the plasma of the breast cancer patient group by electrophoresis.

도 4는 상기 3의 면역블럿팅에 의해 측정된 플라빈 환원효소의 항원 농도를 그래프로 나타낸 것이다. Figure 4 is a graph showing the antigen concentration of the flavin reductase measured by the immunoblotting of Figure 3 above.

본 발명은 혈액에서 유방암 발병 유무를 선택적으로 진단할 수 있는 단백질 마커로서의 플라빈 환원효소 및 이를 특이적으로 인식하는 항체를 포함하는 유방암 진단키트에 관한 것이다.The present invention relates to a breast cancer diagnostic kit comprising a flavin reductase as a protein marker capable of selectively diagnosing the development of breast cancer in the blood and an antibody that specifically recognizes it.

현재 유방암의 발병 원인으로 여성 호르몬, 가족력, 과거력, 출산력, 식생활 습관 등의 다양한 인자들이 거론되고 있지만 아직까지 명확하게 규명된 것은 없다. 2005년 통계청의 조사에 의하면, 한국 여성의 유방암 발생은 최근 급격히 증가하여 1998년 자궁경부암을 추월한 이래 2001년 발생한 한국 여성암 환자의 16.1%를 차지하면서 위암을 제치고 여성암 1위가 되었다. 특히, 2002년에는 2001년에 비해 유방암(11.1%)이 가장 급증한 암으로 나타나 저 출산, 짧은 수유기간, 이른 초경, 늦은 폐경 등의 요인과 함께 생리적으로 왕성한 신체적 변화를 겪는 시기에 여성호르몬의 자극을 받는 횟수의 급격한 증가로 인한 유선조직의 민감도 증가, 식생활의 서구화, 생활환경의 오염 등의 이유로 유방암 발생이 급격하게 증가하고 있다.Currently, various factors such as female hormones, family history, past history, fertility, and dietary habits have been discussed as the causes of breast cancer, but there is no clear explanation yet. According to a survey by the National Statistical Office in 2005, breast cancer in Korean women has recently increased rapidly, exceeding cervical cancer in 1998, accounting for 16.1% of Korean cancer patients in 2001, surpassing stomach cancer, becoming the number one female cancer. In 2002, breast cancer (11.1%) was the most rapid cancer compared to 2001, and female hormones were stimulated during physiologically active physical changes with factors such as low birth, short lactation, early menarche and late menopause. The incidence of breast cancer is increasing rapidly due to the increased sensitivity of the mammary gland tissues due to the rapid increase in the number of times of receiving cancer, the westernization of the diet, and the pollution of the living environment.

이러한 유방암의 발생빈도 및 유방암으로 인한 사망률의 증가는 현재의 서구화 실태로 보아 앞으로도 상당기간 지속될 것으로 예상된다. 유방암은 암세포의 성장으로 인한 주변 조직의 침범 또는 림프절 전이 등의 증상을 초래하는 것이 보통이지만, 대부분이 아무런 증상 없이도 자가검진으로 진단될 수 있다. 따라서, 유방암으로 인한 사망률을 줄이기 위해서는 유방암을 효과적으로 조기에 진단하는 것이 매우 중요하다(Tuli R. et al., Breast J., 12: 343-348, 2006).The increase in the incidence of breast cancer and mortality due to breast cancer is expected to continue for some time in view of the current westernization. Breast cancer usually causes symptoms such as invasion of surrounding tissues or lymph node metastasis due to the growth of cancer cells, but most of them can be diagnosed by self-examination without any symptoms. Therefore, it is very important to effectively and early diagnose breast cancer in order to reduce mortality from breast cancer (Tuli R. et al., Breast J. , 12: 343-348, 2006).

유방암을 진단하기 위해서 여러 가지 방법이 복합적으로 사용되고 있는데, 현재까지는 유방암 환자의 70%가 자가진단에 의해서 내원하고 있다. 그러나, 이러한 자가진단 방법은 악성종양과 양성 혹을 구분하는 것이 매우 어렵다는 단점이 있다. 그 밖에, 유방암의 진단방법으로 X-선 유방촬영법, 초음파검사법, 세침흡입세포검사법, 자기공명촬영법 등이 있는데, 최종적으로는 조직검사를 통해 확인하는 것이 중요하다. X-선 유방촬영법은 X-선으로 유방을 찍어 검사하는 방법으로 혹이 양성인지 악성인지를 감별하는데 우수할 뿐만 아니라, 숨어 있는 혹을 발견하는 방법으로서 자가진단으로 혹이 만져지기 이전에 초기의 유방암을 진단하는데 가장 효과적인 방법이다. 그러나, 유방촬영법은 젊은 여성같이 유선이 많이 발달되어 있다거나 유방이 작고 섬유질이 많은 우리나라 여성에게서는 진단율이 떨어지는 단점이 있으며, 자주 찍으면 오히려 유방암이 유발될 수도 있다는 논란이 있다. 이러한 유방촬영법의 대안으로 초음파검사법이 사용되고 있는데, 초음파검사법은 물혹과 단단한 혹을 구별하는데 효과적이긴 하지만, 악성종양과 양성 혹을 감별하는 능력은 떨어진다.Various methods are used to diagnose breast cancer. To date, 70% of breast cancer patients come by self-diagnosis. However, this self-diagnosis method has a disadvantage in that it is very difficult to distinguish between malignant tumors and benign nodules. In addition, X-ray mammography, ultrasonography, fine needle aspiration cytology, magnetic resonance imaging, etc. are diagnosed as breast cancer, and finally, it is important to confirm through histological examination. X-ray mammography is an excellent method for screening breasts with X-rays to distinguish whether the bumps are benign or malignant, and to detect hidden nodules before they are touched by self-diagnosis. It is the most effective way to diagnose breast cancer. However, mammography has a disadvantage in that a lot of mammary glands are developed like young women, or in Korean women with small breasts and a lot of fiber, the diagnosis rate is lowered, and frequent taking may cause breast cancer. Ultrasonography is used as an alternative to mammography, which is effective in distinguishing between water nodules and hard nodules, but lacks the ability to differentiate between benign tumors and benign nodules.

이러한 기존 진단방법의 단점을 보완하기 위한 방법으로 환자의 혈액에서 종양 표지자(marker)의 농도를 측정하여 유방암을 진단하려는 시도가 있었다(Clinton SR. et al., Biomed . Sci . Instrum., 39: 408-414, 2003; Rui Z. et al., Proteomics, 3: 433-439, 2003; Soletormos G. et al., Dan . Med . Bull ., 48: 229-255, 2001). 그러나, 이러한 종양 표지자들의 진단적 또는 예후 인자로서의 가치가 연구되고는 있지만, 아직까지 제한적으로 사용되고 있을 뿐으로 공식적으로 권 장되고 있는 유방암 표지자는 없는 실정이다.In order to make up for the shortcomings of these conventional diagnostic methods, there have been attempts to diagnose breast cancer by measuring the concentration of tumor markers in the blood of patients (Clinton SR. Et al., Biomed . Sci . Instrum. , 39: 408-414, 2003; Rui Z. et al., Proteomics , 3: 433-439, 2003; Soletormos G. et al., Dan . Med . Bull . , 48: 229-255, 2001). However, although the value of such tumor markers as a diagnostic or prognostic factor has been studied, there are no breast cancer markers that are officially recommended due to their limited use.

한편, 플라빈 환원효소(flavin reductase)는 수용성 단백질로 주로 간이나 적혈구에서 생성되고, 심장, 폐, 부신이나 대뇌에 소량 존재하며, 빌리베르딘(biliverdin) 환원효소라는 이름으로도 알려져 있다. 이 효소는 NADPH를 환원제로 사용하여 플라빈 모노뉴클레오티드(flavin mononucleotide), 메틸렌블루(methylene blue), 메트헤모글로빈(methemoglobin) 등의 환원을 촉매한다(Sass MD. et al., J. Lab . Clin . Med .. 70: 760-767, 1967; Quandt KS. et al., Proc . Natl . Acad. Sci . USA, 91: 9322-9326, 1994). 또한, 플라빈 환원효소는 세포가 산화에 의해 손상을 입는 것을 방지하며 철 대사 조절에도 관여하고, 간에서는 빌리베르딘을 빌리루빈(bilirubin)으로 전환시키는 역할을 담당한다. 최근 보고에 의하면, 빌리베르딘 환원효소가 결핍될 경우 세포 손상이 증가하면서 암세포 발달과 뇌세포 손상이 증가하고 소량의 과산화수소를 처리하더라도 세포가 사멸한다는 사실이 확인되었고, 빌리루빈을 암 세포주에 처리하면 암세포의 증식이 억제된다는 사실이 보고되었다(Baranano DE. et al. Proc . Natl . Acad . Sci . USA, 99: 16093-16098, 2002; Rao P. et al., Biochem . Biophys . Res . Commun ., 342: 1279-1283, 2006). 또한, 간암, 구강 편평세포암, 신장암 환자로부터 적출한 암조직에서 플라빈 환원효소의 발현양이 주변 정상조직보다 증가되었고(Maines MD. et al., J. Urol ., 162: 1467-1472, 1999; Melle C. et al., J. Proteome Res., 6: 306-315, 2007; Lo WY. et al., Clin . Chim . Acta ., 376: 101-107, 2007), 특히 신장암에서는 플리빈 환원효소의 양이 효소로서의 활성도와 직접 연관되어 있음이 보고되었 다(Maines MD. et al., J. Urol ., 162: 1467-1472, 1999). 그러나, 혈액 내에서 암과 관련하여 플라빈 환원효소 단백질의 발현양에 대한 연구는 아직까지 보고된 바 없다.Flavin reductase is a water-soluble protein, produced mainly in the liver or red blood cells, present in small amounts in the heart, lung, adrenal gland, or cerebrum, and is also known as biliverdin reductase. This enzyme catalyzes the reduction of flavin mononucleotides, methylene blue, and methemoglobin using NADPH as a reducing agent (Sass MD. Et al., J. Lab . Clin . .. Med 70: 760-767, 1967 ; Quandt KS et al, Proc Natl Acad Sci USA, 91:...... 9322-9326, 1994). Flavin reductase also prevents cells from being damaged by oxidation and is involved in the regulation of iron metabolism, and in the liver plays a role in converting biliverdine to bilirubin. Recent reports have shown that deficiency of biliberdine reductase increases cell damage, increases cancer cell development and brain cell damage, and kills cells even when treated with small amounts of hydrogen peroxide. The proliferation of cancer cells has been reported (Baranano DE. Et al. Proc . Natl . Acad . Sci . USA , 99: 16093-16098, 2002; Rao P. et al., Biochem . Biophys . Res . Commun . , 342: 1279-1283, 2006). In addition, the expression level of flavin reductase was increased in the cancer tissues extracted from liver, oral squamous cell, and renal cancer patients (Maines MD. Et al., J. Urol . , 162: 1467-1472). , 1999; Melle C. et al, J. Proteome Res, 6: 306-315, 2007; Lo WY et al, Clin Chim Acta, 376:....... 101-107, 2007), particularly kidney cancer It has been reported that the amount of plybin reductase is directly related to enzyme activity (Maines MD. Et al., J. Urol . , 162: 1467-1472, 1999). However, studies on the amount of expression of the flavin reductase protein in the blood with respect to cancer have not been reported yet.

이에, 본 발명자들은 유방암 환자로부터 얻어진 생물학적 검체 시료 내에서 특이하게 변화하는 단백질을 발굴하고 이를 유방암의 조기 진단에 이용하는 방법을 개발하기 위하여 예의 연구 노력한 결과, 플라빈 환원효소 단백질이 정상인에 비하여 유방암 환자의 혈액에서 특이적으로 그 양이 증가하여 존재한다는 사실을 발견하고, 이의 항체를 이용한 면역화학적 방법으로 유방암을 간편하게 진단할 수 있음을 확인함으로써 본 발명을 완성하였다.Accordingly, the present inventors have made intensive studies to find a method for detecting a specific protein in a biological sample obtained from a breast cancer patient and using the same for early diagnosis of breast cancer. The present invention was completed by discovering that the amount of blood in the blood cells was specifically increased and confirming that breast cancer could be easily diagnosed by an immunochemical method using the antibody thereof.

따라서, 본 발명의 목적은 혈액내 존재하는 플라빈 환원효소를 이용하여 간편하게 유방암을 진단할 수 있는 방법을 제공하는 것이다.Accordingly, it is an object of the present invention to provide a method for easily diagnosing breast cancer using flavin reductase present in blood.

상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호: 1의 아미노산 서열을 갖는 플라빈 환원효소의 유방암 진단용 단백질 마커를 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention provides a protein marker for breast cancer diagnosis of flavin reductase having an amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 .

또한, 본 발명은 상기 플라빈 환원효소 단백질 마커를 선택적으로 인지하는 항체를 포함하는 유방암 진단키트를 제공한다.The present invention also provides a breast cancer diagnostic kit comprising an antibody that selectively recognizes the flavin reductase protein marker.

아울러, 본 발명은 검체에서 항원-항체 결합반응을 통해 플라빈 환원효소 단백질 마커를 검출하는 방법을 제공한다.In addition, the present invention provides a method for detecting a flavin reductase protein marker through an antigen-antibody binding reaction in a sample.

이하, 본 발명을 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.

본 발명의 일 측면에 의하면, 본 발명은 유방암 진단을 위한 단백질 마커로서 서열번호: 1의 아미노산 서열을 갖는 플라빈 환원효소 단백질 마커를 제공한다.According to one aspect of the invention, the present invention provides a flavin reductase protein marker having an amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 as a protein marker for breast cancer diagnosis.

본 발명은 유방암 환자의 혈액에서 특이적으로 그 양이 증가하여 유방암의 진단에 유용하게 사용될 수 있는 진단 마커를 선발하기 위하여, cICAT(cleavable isotope-coded affinity tag) 시약을 단백질에 표지하고 질량분석기로 정량분석하는 방법을 사용한다. cICAT는 티올기(thiol)에 특이적으로 반응할 수 있도록 개발된 시약으로, 9개의 탄소원소가 모두 가벼운 동위원소(12C) 또는 무거운 동위원소(13C)로 치환된 링커(linker)를 사용하여 만들어진 두 종류의 다른 동위원소 태그(tag)를 포함한다. 따라서, 화학적 성질은 동일하지만 9 Da의 질량차이가 나는 두 종류의 cICAT 시약으로 비교하고자 하는 두 시료 내에 있는 단백질의 시스테인(cysteine) 잔기를 표지하고 트립신(trypsin)으로 절단하여 표지된 펩티드만을 모아 질량분석기로 동정하고 정량하면 두 시료에서 양적 차이가 나는 단백질을 알아낼 수 있다(Gygi SP. et al., Nat. Biotechnol ., 17: 994-999, 1999).In order to select a diagnostic marker which can be usefully used for the diagnosis of breast cancer due to its specific increase in the blood of breast cancer patients, the present invention uses a mass spectrometer to label a protein with a cICAT (cleavable isotope-coded affinity tag) reagent. Use quantitative methods. cICAT is a reagent developed specifically to react with thiols and uses a linker in which all nine carbons are substituted with light isotopes ( 12 C) or heavy isotopes ( 13 C). It contains two different types of isotope tags. Thus, two types of cICAT reagents with the same chemical properties but with a 9 Da mass difference are labeled with cysteine residues of the proteins in the two samples to be compared and cut with trypsin to collect only labeled peptides. Identification and quantitation with an analyzer can identify proteins with quantitative differences in the two samples (Gygi SP. Et al., Nat. Biotechnol . , 17: 994-999, 1999).

본 발명에서는 cIACT 분석을 위해 먼저 유방암 환자의 혈장과 비환자의 혈장을 각각 따로 모아 유방암 환자군과 비환자 대조군 혈장 시료를 준비한다. 사람의 혈장에는 소수의 단백질이 혈장 내 단백질 농도의 대부분을 차지하기 때문에, 소량의 대다수 단백질을 동정하기 위해서는 먼저 상대적으로 양이 많은 단백질을 제거해야 한다(Anderson NL. et al., Mol . Cell . Proteomics, 1: 845-867, 2002; Somiari RI. et al., J. Chromatogr . B Analyt . Technol . Biomed . Life Sci ., 815: 215-225, 2005). 준비된 유방암 환자군과 비환자 대조군의 혈장 시료로부터 상대적으로 양이 많은 단백질, 예컨대 알부민, 면역글로불린 A, 면역글로불린 G, 헵토글로빈(heptoglobin), 트랜스페린(trasnferrin), 트립신 저해제(trypsin inhibitor) 등을 제거하기 위해 다중 친화 컬럼(multiple affinity column)을 이용하여 액체 크로마토그래피를 수행한다. 상기 컬럼에 결합하지 않은 단백질 구획을 자외선 흡광도 280 ㎚로 추적하여 모으고 컬럼에 결합한 단백질들을 제거하였다. 이와 같이 상대적으로 양이 많은 6종의 단백질들이 대부분 제거된 혈장단백질 구획을 모아 3 kDa 이상의 크기를 갖는 단백질들만을 농축한 후, 비환자 대조군과 유방암 환자군의 단백질 시료를 각각 가벼운 cICAT 시약과 무거운 cICAT 시약으로 표지하고 동량으로 혼합한 뒤 트립신을 처리하여 다수의 펩티드 절편으로 절단한다. 이렇게 얻은 펩티드 절편을 강한 양이온 교환수지 컬럼 크로마토그래피를 이용하여 다수의 분획으로 나누고, 각 분획으로부터 아비딘(avidin) 친화성 컬럼 크로마토그래피를 통해 cICAT 시약이 결합되어 있는 펩티드만을 분리하여 농축한다. 농축된 펩티드 절편을 역상 수지 크로마토그래피 시스템을 통해 분리하고 탠덤질량분석기(tanderm mass spectrometry)를 사용해 각 펩티드 절편의 탠덤질량분석 스펙트럼을 얻는다. 컴퓨터 분석 프로그램으로 펩티드 절편의 탠덤질량분석 정보를 공지된 단백질 데이터베이스와 비교 검색하여 단백질을 동정하고, 유방암 환자군과 비환자 대조군 시료 사이의 양적 차이를 분석한다(도 12 참조)(Keller A. et al., Anal . Chem., 15: 5395-5392, 2002; Nesvizhskii AI. et al., Anal . Chem., 75: 4646-4658, 2003; Li XJ. et al., Anal . Chem., 75: 6648-6657, 2003). 이로부터 비환자 대조군에 비해 유방암 환자군에서 특이적으로 발현양이 증가한 단백질로서 서열번호: 1로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 플라빈 환원효소 단백질이 동정된다.In the present invention, the plasma and non-patient plasma samples of the breast cancer patients and the non-patient control plasma samples are first prepared separately for the cIACT analysis. Since few proteins make up the majority of plasma protein concentrations in human plasma, relatively large amounts of proteins must first be removed to identify small amounts of proteins (Anderson NL. Et al., Mol . Cell . Proteomics, 1:.... .. 845-867, 2002; Somiari RI et al, J. Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci . , 815: 215-225, 2005). Relatively high amounts of proteins such as albumin, immunoglobulin A, immunoglobulin G, heptoglobin, trasnferrin, trypsin inhibitor, and the like are removed from the plasma samples of the prepared breast cancer patients and non-patient controls. To perform the liquid chromatography using a multiple affinity column. Protein compartments not bound to the column were tracked with ultraviolet absorbance at 280 nm and collected to remove proteins bound to the column. The plasma protein compartment from which the six relatively large amounts of proteins were mostly removed was concentrated to concentrate only proteins having a size of 3 kDa or more, and then the protein samples of the non-patient control group and the breast cancer patient group were light cICAT reagent and heavy cICAT, respectively. Labeled with reagents, mixed in equal amounts, trypsin treated to cleave into multiple peptide fragments. The peptide fragments thus obtained are divided into a plurality of fractions using strong cation exchange resin column chromatography, and only the peptides to which cICAT reagent is bound are separated and concentrated from each fraction by avidin affinity column chromatography. Concentrated peptide fragments are separated via reverse phase resin chromatography system and tandem mass spectrometry is used to obtain tandem mass spectra of each peptide fragment. A computer analysis program compares the tandem mass spectrometry information of peptide fragments with a known protein database to identify proteins and analyze quantitative differences between breast cancer patient groups and non-patient control samples (see FIGS. 1 and 2 ). et al, Anal Chem, 15: 5395-5392, 2002; Nesvizhskii AI et al, Anal Chem, 75:........... 4646-4658, 2003; Li XJ et al, Anal Chem, 75 : 6648-6657, 2003). From this, a flavin reductase protein having an amino acid sequence as set forth in SEQ ID NO: 1 was identified as a protein with an increased expression level in breast cancer patient groups as compared to a non-patient control group.

본 발명에서 유방암 환자의 혈액에서 특이적으로 발현양이 증가한 것으로 확인된 플라빈 환원효소 단백질을 유방암의 진단 마커로 이용하는 것은 본 발명이 최초이다. 또한, 상기 단백질은 혈장에서 검출이 가능하기 때문에 생검(biopsy)을 통해서만 진단이 가능하던 기존의 단백질과는 달리 환자에게 불편을 초래하지 않으면서 간편한 방법으로 유방암을 진단하는데 활용될 수 있다.In the present invention, the present invention is the first use of a flavin reductase protein, which has been shown to specifically increase in the blood of breast cancer patients, as a diagnostic marker for breast cancer. In addition, since the protein can be detected in plasma, unlike the conventional protein, which can be diagnosed only through biopsy, the protein can be used to diagnose breast cancer in a convenient manner without causing inconvenience to the patient.

본 발명에서는 상기 플라빈 환원효소가 유방암 환자의 혈액에서만 특이적으로 그 양이 증가함을 발견하고, 이를 선택적으로 인지하는 항체를 이용하여 비환자 대조군과 유방암 환자군의 혈장 시료를 대상으로 한 면역화학 분석에서 유의한 결과를 얻어(도 34 참조), 상기 플라빈 환원효소가 유방암의 진단 마커로 유용하게 사용될 수 있음을 확인한다.In the present invention, it was found that the amount of the flavin reductase specifically increased only in the blood of breast cancer patients, and the immunochemistry of non-patient controls and breast cancer patient plasma samples using antibodies that selectively recognize the flavin reductase. Significant results were obtained from the analysis (see FIGS. 3 and 4 ), confirming that the flavin reductase could be usefully used as a diagnostic marker for breast cancer.

본 발명의 일 실시예에 의하면, 피검자의 혈액 시료를 채취하고, 피검자의 혈액 시료에 함유된 상기 유방암 진단 마커인 플라빈 환원효소를 이에 대한 항체를 이용하여 검출함으로써 유방암의 발병 여부를 확인할 수 있다.According to an embodiment of the present invention, whether or not the onset of breast cancer can be confirmed by collecting a blood sample of a subject and detecting flavin reductase, which is the breast cancer diagnostic marker contained in the blood sample of the subject, using an antibody thereto. .

따라서, 본 발명의 플라빈 환원효소 및 이를 선택적으로 인지하는 항체를 이용한 유방암의 발병 확인방법은 환자의 혈액을 이용하는 새로운 면역학적 진단도구로서 민감도가 우수할 뿐만 아니라 생검을 이용하지 않고 혈액을 대상으로 간편하게 분석할 수 있어, 유방암의 조기 진단에 유용하게 사용될 수 있다.Therefore, the method for confirming the onset of breast cancer using the flavin reductase of the present invention and the antibody selectively recognizing the same is not only excellent in sensitivity as a new immunological diagnostic tool using the blood of the patient, but also the blood without the biopsy. It can be easily analyzed and can be useful for the early diagnosis of breast cancer.

이에, 본 발명의 다른 측면에 의하면, 본 발명은 유방암 진단 마커인 플라빈 환원효소에 선택적으로 결합하는 항체를 포함하는 유방암 진단키트를 제공한다.Accordingly, according to another aspect of the present invention, the present invention provides a breast cancer diagnostic kit comprising an antibody that selectively binds to flavin reductase which is a breast cancer diagnostic marker.

플라빈 환원효소 마커 단백질에 선택적으로 결합하는 항체를 제조하기 위해서는 플라빈 환원효소의 입수가 선행되어야 하며, 이는 서열번호: 1의 아미노산 서열을 이용하여 합성하거나 유전자 재조합을 이용하여 미생물에서 생산할 수 있고, 또는 혈액으로부터 직접 분리하여 준비할 수도 있다.In order to prepare antibodies that selectively bind to flavin reductase marker proteins, the acquisition of flavin reductase must be preceded, which can be synthesized using the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or produced in microorganisms using genetic recombination. Alternatively, they may be prepared separately from the blood.

본 발명의 목적상, 상기 항체는 플라빈 환원효소의 다클론 항체 및 단클론 항체를 모두 포함할 수 있으나, 항원과 보다 특이적으로 결합할 수 있는 단클론 항체가 바람직하다.For the purposes of the present invention, the antibody may include both polyclonal and monoclonal antibodies of flavin reductase, but monoclonal antibodies capable of more specifically binding to antigens are preferred.

다클론 항체는 당업자에 알려진 종래 방법에 따라 면역원(antigen)으로 플라빈 환원효소 마커 단백질 또는 그의 단편을 외부 숙주에 주사함으로써 제조될 수 있다. 이러한 외부 숙주로는 마우스, 랫트, 양, 토끼와 같은 포유동물을 예로 들 수 있으며, 면역원은 일반적으로 항원성을 증가시키기 위한 보조제(adjuvant)와 함께 근육내, 복강내 또는 피하주사 등의 방법으로 투여되어 외부 숙주를 면역화시킨다. 면역화된 외부 숙주로부터 정기적으로 혈청을 채취하여 향상된 역가 및 항원에 대한 특이성을 보이는 혈청을 수거하거나 이로부터 항체를 분리, 정제하여 플라빈 환원효소에 특이적인 다클론 항체를 제조할 수 있다.Polyclonal antibodies can be prepared by injecting flavin reductase marker proteins or fragments thereof into an external host with an immunogen according to conventional methods known to those skilled in the art. Examples of such external hosts include mammals such as mice, rats, sheep and rabbits, and immunogens are generally administered by intramuscular, intraperitoneal or subcutaneous injection, together with an adjuvant to increase antigenicity. Is administered to immunize an external host. Serum may be collected periodically from an immunized external host to harvest serum showing enhanced titers and specificity for antigen or antibodies may be isolated and purified from them to prepare polyclonal antibodies specific for flavin reductase.

단클론 항체는 당업자에 알려진 융합(fusion)에 의한 불멸화된 세포주 생성방법(Kohler G. et al., Nature, 256: 495-497, 1975)을 이용하여 제조될 수 있다. 상기 방법을 간략히 설명하면, 먼저 순수한 플라빈 환원효소 단백질 또는 그의 단 편으로 마우스를 면역시키거나, 이의 펩티드를 합성하여 소혈청 알부민과 결합시켜 마우스에 면역시킨다. 면역이 된 마우스로부터 분리한 항체-생산 B 임파구를 인간 또는 마우스의 골수종세포와 융합하여 불멸화된 하이브리도마 세포를 생성한다. 이어, 효소면역분석법(ELISA; Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay)으로 하이브리도마 세포의 단클론 항체의 생성 여부를 조사하여 양성 클론을 선발하고 이를 배양한 후 항체를 분리, 정제하거나 쥐의 복강에 주입한 후 복수를 채취하여 플라빈 환원효소에 특이적인 단클론 항체를 제조할 수 있다.Monoclonal antibodies can be prepared using methods of generating immortalized cell lines by fusion known to those skilled in the art (Kohler G. et al., Nature , 256: 495-497, 1975). Briefly, the method is first immunized with pure flavin reductase protein or a fragment thereof, or a peptide thereof is synthesized and combined with bovine serum albumin to immunize the mouse. Antibody-producing B lymphocytes isolated from immunized mice are fused with myeloma cells of human or mouse to produce immortalized hybridoma cells. Subsequently, the enzyme immunoassay (ELISA; Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay) was used to investigate the production of monoclonal antibodies in the hybridoma cells. Ascites may be harvested to prepare monoclonal antibodies specific for flavin reductase.

본 발명의 플라빈 환원효소 단백질의 검출에 사용되는 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체 분자의 기능적인 단편이란 적어도 항원 결합능을 보유하고 있는 단편을 의미하며, Fab, F(ab'), F(ab')2 및 Fv 등이 있다.Antibodies used in the detection of the flavin reductase proteins of the invention include functional fragments of antibody molecules as well as complete forms having two full length light chains and two full length heavy chains. A functional fragment of an antibody molecule means a fragment having at least antigen-binding ability, and includes Fab, F (ab '), F (ab') 2 and Fv.

본 발명의 유방암 진단키트에는 플라빈 환원효소를 선택적으로 인지하는 항체뿐만 아니라 당분야에서 면역학적 분석에 일반적으로 사용되는 도구, 시약 등이 포함된다.Breast cancer diagnostic kits of the present invention include not only antibodies that selectively recognize flavin reductase, but also tools, reagents, and the like that are generally used for immunological analysis in the art.

본 발명의 일 실시예에 따르면, 상기 유방암 진단키트는 플라빈 환원효소 단백질에 특이적인 항체; 기질과의 반응에 의해서 발색하는 표지체가 접합된 이차항체 접합체(conjugate); 상기 표지체와 발색 반응할 발색기질 용액; 세척액; 및 효소반응 정지용액을 포함할 수 있다.According to one embodiment of the invention, the breast cancer diagnostic kit is an antibody specific for the flavin reductase protein; Secondary antibody conjugates to which a label that is developed by reaction with a substrate is conjugated; A color substrate solution to be colored and reacted with the label; Washing liquid; And it may include a solution for stopping the enzyme reaction.

또한, 본 발명의 유방암 진단키트는 플라빈 환원효소 표준 항원을 포함하는 양성 대조군과 상기 항원이 주입되지 않은 동물의 항혈청을 포함하는 음성 대조군을 추가적으로 포함할 수 있다.In addition, the breast cancer diagnostic kit of the present invention may further include a positive control comprising a flavin reductase standard antigen and a negative control comprising an antiserum of an animal not injected with the antigen.

본 발명의 유방암 진단키트는 항원-항체 결합반응을 통하여 항체 단백질에 대한 항원을 정량 또는 정성적으로 분석함으로써 유방암을 진단할 수 있으며, 상기 항원-항체 결합반응은 통상의 효소면역분석법(ELISA), 방사능면역분석법(radioimmnoassay, RIA), 샌드위치 측정법(sandwich assay), 웨스턴 블롯팅, 면역침강법, 면역조직화학염색법(immnohistochemical staining), 형광면역법, 효소기질발색법, 항원-항체 응집법 등의 방법을 이용하여 측정할 수 있다. 예를 들어, 검체 및 대조군을 표면에 코팅시킨 96-웰 마이크로타이터 플레이트 등을 이용하여 재조합 단클론 항체 단백질과 반응하는 ELISA를 수행하도록 상기 진단키트를 제공할 수 있다.Breast cancer diagnostic kit of the present invention can diagnose breast cancer by quantitatively or qualitatively analyzing the antigen to the antibody protein through an antigen-antibody binding reaction, the antigen-antibody binding reaction is a conventional enzyme immunoassay (ELISA), Radioimmunoassay (RIA), sandwich assay, western blotting, immunoprecipitation, immunohistochemical staining, fluorescence immunoassay, enzyme substrate coloration, antigen-antibody aggregation Can be measured. For example, the diagnostic kit may be provided to perform an ELISA that reacts with a recombinant monoclonal antibody protein using a 96-well microtiter plate or the like coated on a surface of a sample and a control.

항원-항체 결합반응을 위한 고정체로는 나이트로셀룰로오즈 막, PVDF 막, 폴리비닐(polyvinyl) 수지 또는 폴리스티렌(polystyrene) 수지로 합성된 웰 플레이트(well plate), 유리로 된 슬라이드 글래스 등이 사용될 수 있다.As a fixture for antigen-antibody coupling reaction, a nitrocellulose membrane, a PVDF membrane, a well plate synthesized with a polyvinyl resin or a polystyrene resin, a slide glass made of glass, or the like may be used. .

이차항체의 표지체는 발색반응을 하는 통상의 발색제가 바람직하며, HRP(horseradish peroxidase), 염기성 탈인산화효소(alkaline phosphatase), 콜로이드 골드(coloid gold), FITC(poly L-lysine-fluorescein isothiocyanate), RITC(rhodamine-B-isothiocyanate) 등의 형광물질(fluorescein) 및 색소(dye) 등의 표지체가 사용될 수 있다.As for the label of the secondary antibody, a conventional color developing agent having a color reaction is preferable, and horseradish peroxidase (HRP), basic alkaline phosphatase, colloid gold, poly L-lysine-fluorescein isothiocyanate (FITC), Labels such as fluorescents such as rhodamine-B-isothiocyanate (RITC) and dyes may be used.

발색을 유도하기 위한 발색기질은 발색반응을 하는 표지체에 따라 사용하는 것이 바람직하며, TMB(3,3',5,5'-tetramethyl bezidine), ABTS[2,2'-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid)], OPD(o-phenylenediamine) 등을 사용할 수 있다. 이때, 발색기질은 완충용액(0.1 M NaAc, pH 5.5)에 용해된 상태로 제공되는 것이 더욱 바람직하다. TMB와 같은 발색기질은 이차항체 접합체의 표지체로 사용된 HRP에 의해 분해되어 발색 침적체를 생성하고, 이 발색 침적체의 침적 정도를 육안으로 확인함으로써 플라빈 환원효소 단백질 항원의 존재 유무를 검출한다.Color substrate to induce color development is preferably used according to the labeling reaction, TMB (3,3 ', 5,5'-tetramethyl bezidine), ABTS [2,2'-azino-bis (3) -ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid), and OPD (o-phenylenediamine) can be used. At this time, the color substrate is more preferably provided in a dissolved state in a buffer solution (0.1 M NaAc, pH 5.5). A chromogenic substrate such as TMB is decomposed by HRP used as a marker of the secondary antibody conjugate to generate a chromosome deposit, and the presence of flavin reductase protein antigen is detected by visually confirming the degree of deposition of the chromosome deposit. .

세척액은 인산염 완충용액, NaCl 및 트윈 20(Tween 20)을 포함하는 것이 바람직하며, 0.02 M 인산염 완충용액, 0.13 M NaCl, 및 0.05% 트윈 20으로 구성된 완충용액(PBST)이 더욱 바람직하다. 세척액은 항원-항체 결합반응 후 항원-항체 결합체에 이차항체를 반응시킨 다음 적당량을 고정체에 첨가하여 3 내지 6회 세척한다. 반응 정지용액은 황산용액(H2SO4)이 바람직하게 사용될 수 있다.The wash preferably comprises phosphate buffer, NaCl and Tween 20, more preferably a buffer consisting of 0.02 M phosphate buffer, 0.13 M NaCl, and 0.05% Tween 20 (PBST). The wash solution is washed 3 to 6 times by reacting the secondary antibody to the antigen-antibody conjugate after the antigen-antibody binding reaction, and then adding an appropriate amount to the fixture. As the reaction terminating solution, sulfuric acid solution (H 2 SO 4 ) may be preferably used.

아울러, 본 발명의 또 다른 측면은 검체에서 유방암 진단용 마커 단백질인 플라빈 환원효소를 항원-항체 결합반응을 이용하여 검출하는 방법을 제공한다.In addition, another aspect of the present invention provides a method for detecting flavin reductase, a marker protein for diagnosing breast cancer in a sample using an antigen-antibody binding reaction.

상기 검출방법은 혈액내 단백질을 고정화시키거나 전기영동(SDS-PAGE)으로 분리시킨 후 나이트로셀룰로즈 막으로 전이시키고 플라빈 환원효소를 선택적으로 인지하는 항체와 접촉시켜 항원-항체 결합반응을 통해 플라빈 환원효소 단백질의 존재를 간접적으로 확인하는 것을 포함한다. 상기 항원-항체 결합반응으로는 효소면역분석법(ELISA), 방사능면역분석법(RIA), 샌드위치 측정, 웨스턴 블롯팅, 면역침강법, 면역조직화학염색법, 형광면역법, 효소기질발색법, 항원-항체 응집법 등을 예로 들 수 있다. 검체로서는 혈청 또는 혈장을 사용할 수 있고, 혈장이 더 바람직하다.The detection method is immobilized by electrophoresis (SDS-PAGE) of the proteins in the blood and then transferred to the nitrocellulose membrane and contacted with an antibody that selectively recognizes the flavin reductase, and then through the antigen-antibody binding reaction. Indirectly identifying the presence of an empty reductase protein. The antigen-antibody binding reaction includes enzyme immunoassay (ELISA), radioimmunoassay (RIA), sandwich measurement, western blotting, immunoprecipitation, immunohistochemical staining, fluorescence immunoassay, enzyme substrate coloration, and antigen-antibody aggregation. Etc. can be mentioned. Serum or plasma may be used as a sample, and plasma is more preferable.

본 발명의 바람직한 실시예에 의하면, 상기 검출방법은,According to a preferred embodiment of the present invention, the detection method,

1) 검체 및 대조군의 단백질을 고정체에 코팅시키는 단계;1) coating the sample and the protein of the control to the fixture;

2) 상기 고정체에 플라빈 환원효소에 특이적인 항체를 첨가하여 항원-항체 결합반응을 수행하는 단계;2) performing an antigen-antibody binding reaction by adding an antibody specific for flavin reductase to the fixture;

3) 상기 항원-항체 결합반응을 통해 생성된 항원-항체 결합반응물을 이차항체 접합체(conjugate) 및 발색기질 용액을 이용하여 검출하는 단계; 및3) detecting the antigen-antibody binding reactant produced through the antigen-antibody binding reaction using a secondary antibody conjugate and a color substrate solution; And

4) 검체와 대조군에 대한 검출 결과를 비교하는 단계를 포함할 수 있다.4) comparing the detection results for the sample and the control.

상기 검출방법을 구체적으로 설명하면, 먼저 검체로부터 혈장단백질을 분자량에 따라 분리한다. 플라빈 환원효소는 분자량이 대략 22 kDa이므로 15% 폴리아크릴아마이드 겔을 이용하여 전기영동을 수행하고, 이로부터 분리된 단백질들을 나이트로셀룰로즈 막과 같은 고정체로 전이시켜 고정한다. 이어, 고정된 단백질 항원에 특이적인 항체를 가하여 항원-항체 결합반응을 수행한다. 검체에 플라빈 환원효소 단백질이 존재한다면, 상기 단백질이 고정된 막에 플라빈 환원효소 특이적인 항체가 가해졌을 때 항원-항체 결합반응이 일어나게 된다. 플라빈 환원효소와 이에 대한 항체의 결합 정도를 측정하기 위해서, 플라빈 환원효소 항체에 친화성을 갖는 이차항체와 결합시키는 단계를 수행하는데, 이차항체에 접합된 HRP(horseradish peroxidase)가 기질인 ECL(enhanced chemiluminescence)과 반응하여 발색반응을 일으키는지의 여부와 그 정도를 대조군과 비교함으로써 검체 시료내 유방암 진단 마커인 플라빈 환원효소 단백질의 존재 여부를 검출하게 된다.Specifically, the plasma protein is separated from the sample according to the molecular weight. Since the flavin reductase has a molecular weight of approximately 22 kDa, electrophoresis is performed using a 15% polyacrylamide gel, and the proteins separated therefrom are fixed by transferring to a fixture such as a nitrocellulose membrane. Subsequently, an antibody specific for the immobilized protein antigen is added to perform an antigen-antibody binding reaction. If a flavin reductase protein is present in the sample, an antigen-antibody binding reaction occurs when a flavin reductase specific antibody is added to the membrane to which the protein is immobilized. In order to measure the degree of binding of the flavin reductase to the antibody to the antibody, a step of binding to a secondary antibody having an affinity for the flavin reductase antibody is carried out, wherein the horseradish peroxidase (HRP) conjugated to the secondary antibody is a substrate ECL. The presence of flavin reductase protein, which is a diagnostic marker for breast cancer, in the specimens is detected by comparing the extent of the color reaction with enhanced chemiluminescence and the extent of the color reaction.

한편, 플라빈 환원효소에 특이적인 항체를 생물학적 마이크로칩(biological microchip) 상에 고정시킨 후 대상자로부터 분리된 검체 시료와 반응시켜 상기 항체 단백질에 대한 항원을 검출할 수 있는 생물학적 마이크로칩 및 자동화된 미세배열 시스템(microarray system)을 이용하면, 한 번의 분석으로 대량의 시료를 분석할 수 있는 장점이 있다.Meanwhile, biological microchips and automated microorganisms capable of detecting antigens for the antibody proteins by immobilizing an antibody specific for flavin reductase on a biological microchip and then reacting with a sample sample isolated from the subject. Using an microarray system has the advantage of analyzing a large number of samples in one analysis.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것은 아니다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. These examples are only for illustrating the present invention more specifically, but the scope of the present invention is not limited by these examples.

실시예Example 1: 유방암 특이적 진단  1: Breast Cancer Specific Diagnosis 마커로서As a marker 플라빈Flavin 환원효소의 동정 Identification of Reductase

본 발명자들은 유방암 환자의 혈액에서 특이적으로 그 양이 증가하여 유방암의 진단에 유용하게 사용될 수 있는 진단 마커를 선발하기 위하여, cICAT(cleavable isotope-coded affinity tag) 시약을 단백질에 표지하고 질량분석기로 정량분석하는 방법을 사용하였다(Gygi SP. et al., Nat . Biotechnol., 17: 994-999, 1999). cICAT 정량분석을 위하여 9개의 탄소원소가 모두 가벼운 동위원소(12C) 또는 무거운 동위원소(13C)로 치환된 두 종류의 시약으로 구성된 cICAT 시약(Cat. No. 4339039, Applied Biosystems사)을 사용하였다. 상기 cICAT 시약은 티올기(thiol)에 특이적으로 반응하도록 개발된 것이다.In order to select a diagnostic marker that can be usefully used for the diagnosis of breast cancer due to its specific increase in the blood of breast cancer patients, the present inventors label a protein with a cICAT (cleavable isotope-coded affinity tag) reagent and use a mass spectrometer. Quantitative analysis was used (Gygi SP. Et al., Nat . Biotechnol. , 17: 994-999, 1999). For cICAT quantitative analysis, cICAT reagents (Cat. No. 4339039, Applied Biosystems) consisting of two reagents in which all nine carbon elements were replaced with light isotopes ( 12 C) or heavy isotopes ( 13 C) were used. It was. The cICAT reagent was developed to specifically react with a thiol group.

한편, 유방암 환자 6명의 혈장과 비환자 7명의 혈장을 따로 섞어 유방암 환 자군과 비환자 대조군의 혈장 시료를 준비하였다. 준비된 유방암 환자군과 비환자 대조군의 혈장 시료로부터 상대적으로 양이 많은 단백질인 알부민, 면역글로불린 A, 면역글로불린 G, 헵토글로빈, 트랜스페린 및 트립신 저해제를 제거하기 위해 MARS(multiple affinity removal system, Aglient사) 컬럼을 이용하여 액체 크로마토그래피를 수행하였다. 상기 컬럼에 결합하지 않은 단백질 구획을 자외선 흡광도 280 ㎚로 추적하여 모으고 컬럼에 결합한 혈장 단백질들을 분리하여 제거하였다. 이렇게 준비된 혈장 시료는 아세톤 침전을 통해 염류를 제거하고 유방암 환자군과 비환자 대조군의 혈장으로부터 각각 100 ㎍의 단백질 시료를 준비하였다. 유방암 환자군의 단백질 시료에는 무거운 cICAT 시약 3.5 mM을 첨가하고 비환자 대조군의 단백질 시료에는 가벼운 cICAT 시약 3.5 mM을 첨가하여 37℃에서 120분간 반응시켜 표지하였다. cICAT 시약으로 표지된 각각의 단백질 시료를 동일한 비율로 혼합한 후 전체 단백질 200 ㎍의 1/40에 해당하는 양인 5 ㎍의 트립신을 25 ㎕를 첨가하고 37℃에서 16시간 동안 처리하여 다수의 펩티드 절편으로 분리하였다. 이렇게 얻은 펩티드 절편을 강한 양이온 교환수지 컬럼에 적재하고 염화칼륨 농도 구배(0%→60%)를 통해 용리하여 여러 개의 분획으로 나누었다. 양이온 교환수지 컬럼 크로마토그래피를 통해 얻은 16개의 분획을 아비딘 친화성 컬럼에 충진하여 cICAT 시약이 결합되어 있는 펩티드만을 농축하였다. 이로부터 얻은 농축 시료에 인산을 처리하여 cICAT 시약에 접합되어 있는 바이오틴(biotin)을 제거함으로써 질량 분석을 위한 최종 시료를 준비하였다.On the other hand, plasma of six breast cancer patients and plasma of seven non-patients were separately mixed to prepare plasma samples of the breast cancer patient group and the non-patient control group. Multiple affinity removal system (Aglient) to remove relatively high protein albumin, immunoglobulin A, immunoglobulin G, heptoglobin, transferrin and trypsin inhibitors from plasma samples of prepared breast cancer patients and non-patient controls. Liquid chromatography was performed using the column. Protein compartments not bound to the column were collected by tracking with an ultraviolet absorbance of 280 nm and plasma proteins bound to the column were separated and removed. Thus prepared plasma samples were removed through acetone precipitation, and 100 μg of protein samples were prepared from the plasma of breast cancer patients and non-patient controls, respectively. The protein samples of the breast cancer patient group were added with 3.5 mM heavy cICAT reagent, and the protein samples of the non-patient control group were added with 3.5 mM light cICAT reagent and reacted for 120 minutes at 37 ° C for labeling. Each protein sample labeled with cICAT reagent was mixed in equal proportions, followed by adding 25 μl of 5 μg trypsin, equivalent to 1/40 of 200 μg total protein, and treating it for 16 hours at 37 ° C. Separated. The peptide fragment thus obtained was loaded on a strong cation exchange resin column, eluted through a potassium chloride concentration gradient (0% → 60%), and divided into several fractions. Sixteen fractions obtained through cation exchange resin column chromatography were packed in an avidin affinity column to concentrate only the peptide to which the cICAT reagent was bound. The resulting sample was treated with phosphoric acid to remove biotin conjugated to cICAT reagents, thereby preparing a final sample for mass spectrometry.

상기에서 준비된 최종 시료를 역상 수지 크로마토그래피에 걸어 혈장 펩티드 절편을 분리하고 탠덤질량분석기를 사용해 각 절편의 탠덤질량분석 스펙트럼을 얻었다. 이때, 역상 수지 크로마토그래피는 내경 75 ㎛의 무수규산이 입혀진 모세관(silica coated capillary)에 매직 아쿠아 수지(magic C18 aqua resin, Microchom사)를 충진한 컬럼으로 70분간 5%~40%의 아세토니트릴 농도 구배를 이용하여 실시하였다. SEQUEST 컴퓨터 분석 프로그램(Thermofinnigan사)으로 펩티드 절편의 탠덤질량분석 정보를 SWISS-PROT 단백질 데이터베이스와 비교 검색하여 단백질을 동정하고, ISB 파이프라인(Institute for Systems Biology사)을 사용하여 동정된 단백질을 재확인하였으며, 이로부터 유방암 환자군과 비환자 대조군 시료 사이의 양적 차이를 분석하였다(Keller A. et al , Anal . Chem., 15: 5395-5392, 2002; Nesvizhskii AI. et al., Anal . Chem., 75: 4646-4658, 2003; Li XJ. et al., Anal. Chem., 75: 6648-6657, 2003).The final sample prepared above was subjected to reverse phase resin chromatography to separate plasma peptide fragments, and a tandem mass spectrometry of each fragment was obtained using a tandem mass spectrometer. At this time, reverse phase chromatography is a column filled with a magic aqua resin (magic C18 aqua resin, Microchom) in a silica coated capillary with an inner diameter of 75 μm and acetonitrile concentration of 5% to 40% for 70 minutes. It was carried out using a gradient. Proteins were identified by comparing the tandem mass spectrometry information of peptide fragments with the SWISS-PROT protein database using the SEQUEST computer analysis program (Thermofinnigan) and reconfirmed proteins identified using the ISB pipeline (Institute for Systems Biology). From this, the quantitative differences between breast cancer patients and non-patient control samples were analyzed (Keller A. et al, Anal . Chem ., 15: 5395-5392, 2002; Nesvizhskii AI. Et al., Anal . Chem ., 75 : 4646-4658, 2003; Li X J. et al., Anal. Chem ., 75: 6648-6657, 2003).

비환자 대조군으로부터 얻은 혈장 시료내의 단백질들은 가벼운 cICAT 시약으로 표지되고 유방암 환자군으로부터 얻은 혈장 시료내의 단백질들은 무거운 cICAT 시약으로 표지되기 때문에, 동일한 단백질로부터 얻은 동일한 아미노산 서열을 갖는 펩티드들도 질량 차이를 나타낸다. 따라서, 하나의 단백질을 동정하는데 사용된 펩티드는 가벼운 cICAT 시약으로 표지된 펩티드일 수도 있고 무거운 cICAT 시약으로 표지된 펩티드일 수도 있다. 이와 같이 특정 단백질의 동정에 사용된 가벼운 cICAT 시약과 무거운 cICAT 시약으로 표지된 펩티드 각각의 크로마토그램을 추적하여 이들의 질량 피크(mass peak) 면적을 계산하고 각 펩티드의 크로마토그램 면적비를 구하면 비환자 대조군과 유방암 환자군 사이에 단백질 발현양의 차이를 정량 할 수 있다. 이러한 정량분석으로부터 비환자 대조군에 비해 유방암 환자군에서 특이적으로 발현양이 증가한 트립틱 펩티드를 선별하였고 이 펩티드가 서열번호: 2의 아미노산 서열을 가짐을 확인하였다.Since proteins in plasma samples from non-patient controls are labeled with light cICAT reagents and proteins in plasma samples from breast cancer patient groups are labeled with heavy cICAT reagents, peptides with the same amino acid sequence from the same protein also show mass differences. Thus, the peptide used to identify one protein may be a peptide labeled with a light cICAT reagent or may be a peptide labeled with a heavy cICAT reagent. The chromatograms of each of the peptides labeled with the light and heavy cICAT reagents used for identification of specific proteins were traced to calculate their mass peak area and the chromatogram area ratio of each peptide was calculated. The difference in protein expression can be quantified between the cancer and breast cancer patients. From these quantitative analyzes, tryptic peptides with an increased expression level were specifically selected in the breast cancer patient group compared to the non-patient control group and confirmed that the peptide has an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 .

도 1은 상기에서 선별된 서열번호: 2의 펩티드의 아미노산 서열 중에서 시스테인 잔기가 가벼운 cICAT 시약으로 표지(C+)된 비환자 대조군 유래 펩티드와 시스테인 잔기가 무거운 cICAT 시약으로 표지(C*)된 유방암 환자군 유래 펩티드를 추적하여 도식화한 것으로, 가벼운 cICAT 시약과 무거운 cICAT 시약으로 표지된 각 펩티드의 크로마토그램의 면적을 계산한 결과, 비환자 대조군에 비하여 상기 펩티드의 발현양이 유방암 환자군에서 3.48배 증가하였음을 확인하였다. 도 2a2b는 상기에서 유방암 환자군의 혈액에서 특이적으로 발현양이 증가한 것으로 확인된 서열번호: 2의 펩티드에 대한 탠덤질량분석 스펙트럼 결과를 나타낸 것으로, 이로부터 질량분석기에 의해 동정된 단백질이 서열번호: 1의 아미노산 서열을 갖는 플라빈 환원효소 단백질임을 확인하였다. 1 is a breast cancer in which a cysteine residue is labeled with a light cICAT reagent (C + ) and a cysteine residue is labeled with a heavy cICAT reagent (C * ) in the amino acid sequence of the peptide of SEQ ID NO: 2 selected above. Based on traces of patient-derived peptides, the area of the chromatogram of each peptide labeled with a light cICAT reagent and a heavy cICAT reagent increased by 3.48-fold in the breast cancer patient group compared to the non-patient control group. It was confirmed. 2A and 2B show tandem mass spectrometry results of the peptide of SEQ ID NO: 2 , in which the amount of expression in the blood of the breast cancer patient group specifically increased, wherein the protein identified by the mass spectrometer was sequenced It was confirmed that it is a flavin reductase protein having an amino acid sequence of No. 1 .

실시예Example 2:  2: 면역블롯팅을Immunoblotting 이용한  Used 혈액내In the blood 플라빈Flavin 환원효소의 검출 Reductase Detection

상기 실시예 1에서 동정된 서열번호: 1의 플라빈 환원효소 단백질이 혈액에서 유방암의 선택적 진단을 위한 마커로서 사용될 수 있는지를 확인하기 위하여 다음과 같이 면역블롯팅을 수행하였다.In order to confirm whether the flavin reductase protein of SEQ ID NO: 1 identified in Example 1 can be used as a marker for the selective diagnosis of breast cancer in the blood, immunoblotting was performed as follows.

먼저, 유방암 환자군 6명 및 비환자 대조군 7명으로부터 각각 혈장을 30 ㎕씩 취하고 혈장 단백질의 대부분을 차지하는 단백질들인 알부민, 면역글로불린 A, 면역글로불린 G, 헵토글로빈, 트랜스페린, 트립신 저해제 등을 제거하기 위해서 MARS(Aligent사) 컬럼을 장착한 크로마토그래피를 수행하였다. 상기 컬럼에 결합하지 않은 단백질 구획을 자외선 흡광도 280 ㎚로 추적하여 모으고 컬럼에 결합한 혈액 단백질들을 분리하여 제거하였다. 이와 같이 혈액 단백질이 제거된 구획으로부터 3 kDa 이상의 크기를 갖는 단백질들만을 모아 농축하여 유방암 환자군 및 비환자 대조군의 혈장 단백질 시료를 준비하였다. 이와 같이 준비된 혈장 단백질 시료 각 5 ㎍과 1% SDS가 포함된 완충용액을 혼합한 후 15% SDS 폴리아크릴아마이드 겔을 이용하여 전기영동을 수행하였다. 분리된 혈청 단백질을 25 mM 트리스(Tris-HCl), 190 mM 글라이신(glycine) 및 10% 메탄올(methanol)이 포함된 용액 내에서 나이트로셀룰로즈 막으로 전이시키고 전이된 막을 5% 탈지분유가 함유된 TBST(Tris-buffered saline Tween 20)에서 1시간 동안 반응시켰다.First, take 30 μl of plasma from 6 breast cancer patients and 7 non-patient controls, and remove albumin, immunoglobulin A, immunoglobulin G, heptoglobin, transferrin, trypsin inhibitors, etc. In order to perform the chromatography equipped with MARS (Aligent) column. Protein compartments not bound to the column were collected by tracking with an ultraviolet absorbance of 280 nm, and blood proteins bound to the column were separated and removed. Thus, only proteins having a size of 3 kDa or more were collected and concentrated from the blood protein-removed compartment to prepare plasma protein samples of the breast cancer patient group and the non-patient control group. 5 μg of each of the prepared plasma protein samples and a buffer solution containing 1% SDS were mixed, followed by electrophoresis using 15% SDS polyacrylamide gel. The separated serum proteins were transferred to nitrocellulose membranes in a solution containing 25 mM Tris-HCl, 190 mM glycine and 10% methanol and the transferred membranes contained 5% skim milk powder. The reaction was carried out in TBST (Tris-buffered saline Tween 20) for 1 hour.

이어, 상기 나이트로셀룰로즈 막을 항-플라빈 환원효소 항체(1:1000, Abnova사)와 4℃에서 16시간 동안 반응시키고 TBST로 3회 세척한 후 마우스 면역글로불린과 결합하는 마우스 IgG-HRP(1:2000, Amersham Bioscience사)와 25℃에서 1시간 동안 반응시켰다. 그 뒤, 상기 나이트로셀룰로즈 막을 ECL(enhanced chemiluminescence, Amersham Bioscience사)과 반응시킨 후 X-ray 필름에 감광시켜 플라빈 환원효소 항원의 농도를 측정하였다.Subsequently, the nitrocellulose membrane was reacted with an anti-flavin reductase antibody (1: 1000, Abnova) for 16 hours at 4 ° C., washed three times with TBST, and then mouse IgG-HRP (1). : 2000, Amersham Bioscience) and the reaction at 25 ℃ for 1 hour. Thereafter, the nitrocellulose membrane was reacted with ECL (enhanced chemiluminescence, Amersham Bioscience, Inc.) and then subjected to X-ray film to measure the concentration of flavin reductase antigen.

도 3은 상기와 같이 비환자 대조군의 혈장과 유방암 환자군의 혈장을 전기영동으로 분석한 후 항-플라빈 환원효소 항체로 면역블럿팅을 수행한 결과이고, 도 4도 3의 면역블롯팅에 의해 측정된 항원의 농도를 그래프로 도시한 것이다. 도 34에 나타난 바와 같이, 유방암 환자의 경우 혈액 내 플라빈 환원효소 단백질의 농도가 정상인에 비하여 평균 3.1배 높은 경향을 나타내었는데, 이러한 결과로부터 혈액 내 플라빈 환원효소를 선택적으로 인지하는 항체를 사용하여 항원의 농도를 측정하고 이를 비환자 대조군과 비교함으로써 상대적으로 증가된 플라빈 환원효소 단백질의 농도를 나타내는 피시험자를 유방암 환자로 진단할 수 있음을 확인하였다. FIG. 3 shows the results of immunoblotting with an anti-flavin reductase antibody after analyzing the plasma of the non-patient control group and the plasma of the breast cancer patient group by electrophoresis, and FIG. 4 shows the immunoblotting of FIG . The concentration of antigen measured by the graph is shown. As shown in Figures 3 and 4, in the case of breast cancer patients, the concentration of flavin reductase protein in blood tended to be 3.1 times higher than that of normal people. From these results, antibodies that selectively recognize flavin reductase in blood By measuring the concentration of the antigen using and comparing it with the non-patient control, it was confirmed that a test subject showing a relatively increased concentration of flavin reductase protein can be diagnosed as a breast cancer patient.

상기에서 살펴본 바와 같이, 본 발명의 유방암 진단용 마커 단백질 및 이의 항체를 이용한 유방암 진단키트는 비교적 채취가 용이한 혈액을 검체로 하기 때문에 생검을 대상으로 하는 기존의 유방암 진단방법과는 달리 환자에게 부담을 주지않고 매우 간편하게 유방암을 진단할 수 있을 뿐만 아니라 진단의 정확도 및 민감도가 높아 유방암의 조기 진단에 유용하게 사용될 수 있다.As described above, the breast cancer diagnostic kit using the marker protein for diagnosing breast cancer of the present invention and an antibody thereof has a burden on a patient unlike a conventional breast cancer diagnosis method for biopsy because blood samples are relatively easy to collect. Not only can breast cancer be diagnosed very easily, but also the accuracy and sensitivity of the diagnosis can be useful for early diagnosis of breast cancer.

<110> Korea Institute of Science and Technology <120> PROTEIN MARKER FLAVIN REDUCTASE FOR BREAST CANCER DIAGNOSIS AND DIAGNOSIS KIT FOR BREAST CANCER USING ANTIBODY AGAINST THE SAME <130> KC071050 <160> 2 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 205 <212> PRT <213> human flavin reductase protein <400> 1 Ala Val Lys Lys Ile Ala Ile Phe Gly Ala Thr Gly Gln Thr Gly Leu 1 5 10 15 Thr Thr Leu Ala Gln Ala Val Gln Ala Gly Tyr Glu Val Thr Val Leu 20 25 30 Val Arg Asp Ser Ser Arg Leu Pro Ser Glu Gly Pro Arg Pro Ala His 35 40 45 Val Val Val Gly Asp Val Leu Gln Ala Ala Asp Val Asp Lys Thr Val 50 55 60 Ala Gly Gln Asp Ala Val Ile Val Leu Leu Gly Thr Arg Asn Asp Leu 65 70 75 80 Ser Pro Thr Thr Val Met Ser Glu Gly Ala Arg Asn Ile Val Ala Ala 85 90 95 Met Lys Ala His Gly Val Asp Lys Val Val Ala Cys Thr Ser Ala Phe 100 105 110 Leu Leu Trp Asp Pro Thr Lys Val Pro Pro Arg Leu Gln Ala Val Thr 115 120 125 Asp Asp His Ile Arg Met His Lys Val Leu Arg Glu Ser Gly Leu Lys 130 135 140 Tyr Val Ala Val Met Pro Pro His Ile Gly Asp Gln Pro Leu Thr Gly 145 150 155 160 Ala Tyr Thr Val Thr Leu Asp Gly Arg Gly Pro Ser Arg Val Ile Ser 165 170 175 Lys His Asp Leu Gly His Phe Met Leu Arg Cys Leu Thr Thr Asp Glu 180 185 190 Tyr Asp Gly His Ser Thr Tyr Pro Ser His Gln Tyr Gln 195 200 205 <210> 2 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> tryptic peptide <400> 2 Cys Leu Thr Thr Asp Glu Tyr Asp Gly His Ser Thr Tyr Pro Ser His 1 5 10 15 Gln Tyr Gln <110> Korea Institute of Science and Technology <120> PROTEIN MARKER FLAVIN REDUCTASE FOR BREAST CANCER DIAGNOSIS AND          DIAGNOSIS KIT FOR BREAST CANCER USING ANTIBODY AGAINST THE SAME <130> KC071050 <160> 2 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 205 <212> PRT <213> human flavin reductase protein <400> 1 Ala Val Lys Lys Ile Ala Ile Phe Gly Ala Thr Gly Gln Thr Gly Leu   1 5 10 15 Thr Thr Leu Ala Gln Ala Val Gln Ala Gly Tyr Glu Val Thr Val Leu              20 25 30 Val Arg Asp Ser Ser Arg Leu Pro Ser Glu Gly Pro Arg Pro Ala His          35 40 45 Val Val Val Gly Asp Val Leu Gln Ala Ala Asp Val Asp Lys Thr Val      50 55 60 Ala Gly Gln Asp Ala Val Ile Val Leu Leu Gly Thr Arg Asn Asp Leu  65 70 75 80 Ser Pro Thr Thr Val Met Ser Glu Gly Ala Arg Asn Ile Val Ala Ala                  85 90 95 Met Lys Ala His Gly Val Asp Lys Val Val Ala Cys Thr Ser Ala Phe             100 105 110 Leu Leu Trp Asp Pro Thr Lys Val Pro Pro Arg Leu Gln Ala Val Thr         115 120 125 Asp Asp His Ile Arg Met His Lys Val Leu Arg Glu Ser Gly Leu Lys     130 135 140 Tyr Val Ala Val Met Pro Pro His Ile Gly Asp Gln Pro Leu Thr Gly 145 150 155 160 Ala Tyr Thr Val Thr Leu Asp Gly Arg Gly Pro Ser Arg Val Ile Ser                 165 170 175 Lys His Asp Leu Gly His Phe Met Leu Arg Cys Leu Thr Thr Asp Glu             180 185 190 Tyr Asp Gly His Ser Thr Tyr Pro Ser His Gln Tyr Gln         195 200 205 <210> 2 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> tryptic peptide <400> 2 Cys Leu Thr Thr Asp Glu Tyr Asp Gly His Ser Thr Tyr Pro Ser His   1 5 10 15 Gln Tyr Gln              

Claims (12)

서열번호: 1의 아미노산 서열을 갖는 플라빈 환원효소 단백질 마커에 특이적인 항체를 포함하는 유방암 진단키트.A breast cancer diagnostic kit comprising an antibody specific for a flavin reductase protein marker having an amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 . 제1항에 있어서,The method of claim 1, 상기 항체가 다클론 항체 또는 단클론 항체인 것을 특징으로 하는 유방암 진단키트.Breast cancer diagnostic kit, characterized in that the antibody is a polyclonal antibody or a monoclonal antibody. 제1항에 있어서,The method of claim 1, 기질과의 반응에 의하여 발색하는 표지체가 접합된 이차항체 접합체; 상기 표지체와 발색 반응할 발색기질 용액; 세척액; 및 효소반응 정지액을 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 유방암 진단키트.Secondary antibody conjugates to which a label that is developed by reaction with a substrate is conjugated; A color substrate solution to be colored and reacted with the label; Washing liquid; And a breast cancer diagnostic kit further comprises an enzyme reaction stopper. 제3항에 있어서,The method of claim 3, 이차항체 접합체의 표지체가 HRP(horseradish peroxidase), 염기성 탈인산화효소(alkaline phosphatase), 콜로이드 골드(coloid gold), 형광물질(fluorescein) 및 색소(dye)로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 진단키트.Diagnostic kit characterized in that the label of the secondary antibody conjugate is selected from the group consisting of horseradish peroxidase (HRP), basic alkaline phosphatase, colloid gold, fluorescent (fluorescein) and dye (dye) . 제3항에 있어서,The method of claim 3, 발색기질이 TMB(3,3',5,5'-tetramethyl bezidine), ABTS[2,2'-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid)] 및 OPD(o-phenylenediamine)로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 진단키트.Group consisting of TMB (3,3 ', 5,5'-tetramethyl bezidine), ABTS [2,2'-azino-bis (3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid)] and OPD (o-phenylenediamine) The diagnostic kit, characterized in that selected from. 검체로부터 항원-항체 결합반응을 이용하여 플라빈 환원효소 단백질 마커를 검출하는 방법.A method for detecting flavin reductase protein markers from an object using an antigen-antibody binding reaction. 제6항에 있어서,The method of claim 6, 1) 검체 및 대조군의 단백질을 고정체에 코팅시키는 단계;1) coating the sample and the protein of the control to the fixture; 2) 상기 고정체에 플라빈 환원효소에 특이적인 항체를 첨가하여 항원-항체 결합반응을 수행하는 단계;2) performing an antigen-antibody binding reaction by adding an antibody specific for flavin reductase to the fixture; 3) 상기 항원-항체 결합반응을 통해 생성된 항원-항체 결합반응물을 이차항체 접합체(conjugate) 및 발색기질 용액을 이용하여 검출하는 단계; 및3) detecting the antigen-antibody binding reactant produced through the antigen-antibody binding reaction using a secondary antibody conjugate and a color substrate solution; And 4) 검체와 대조군에 대한 검출 결과를 비교하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.4) comparing the detection results for the sample and the control. 제7항에 있어서,The method of claim 7, wherein 단계 1)의 검체가 혈청 또는 혈장인 것을 특징으로 하는 방법.The sample of step 1) is characterized in that the serum or plasma. 제7항에 있어서,The method of claim 7, wherein 단계 1)의 고정체가 나이트로셀룰로오즈 막, PVDF 막, 폴리비닐(polyvinyl) 또는 폴리스티렌(polystyrene) 수지로 합성된 웰 플레이트 및 유리로 된 슬라이드 글래스로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.The fixture of step 1) is selected from the group consisting of nitrocellulose membranes, PVDF membranes, well plates synthesized from polyvinyl or polystyrene resins and slide glass of glass. 제7항에 있어서,The method of claim 7, wherein 단계 2)의 상기 항원-항체 결합반응이 효소면역분석법(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA), 방사능면역분석법(radioimmnoassay, RIA), 샌드위치 측정법(sandwich assay), 웨스턴 블롯팅, 면역침강법, 면역조직화학염색법(immnohistochemical staining), 형광면역법, 효소기질발색법, 항원-항체 응집법으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.The antigen-antibody binding reaction of step 2) is performed by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), radioimmuno assay (RIA), sandwich assay, western blotting, immunoprecipitation method, immune tissue Immunohistochemical staining (Immnohistochemical staining), fluorescence immunoassay, enzyme substrate coloration, antigen-antibody aggregation method characterized in that it is selected from the group consisting of. 제7항에 있어서,The method of claim 7, wherein 단계 3)의 이차항체 접합체의 표지체가 HRP, 염기성 탈인산화효소, 콜로이드 골드, 형광물질 및 색소로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.The label of the secondary antibody conjugate of step 3) is selected from the group consisting of HRP, basic dephosphatase, colloidal gold, fluorescent substance and pigment. 제7항에 있어서,The method of claim 7, wherein 단계 3)의 발색기질이 TMB, ABTS 및 OPD로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.The chromogenic substrate of step 3) is selected from the group consisting of TMB, ABTS and OPD.
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KR100475449B1 (en) * 2002-06-10 2005-03-10 (주)프로테옴텍 Marker for Diagnosis of Breast Cancer

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