JP6790490B2 - 情報処理装置、情報処理方法及び情報処理システム - Google Patents
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Description
前記ピーク位置に関連する情報に基づいて前記生物由来対象の推定される特性候補を決定する、特性候補決定部と、
を備える情報処理装置が提供される。
前記ピーク位置に関連する情報に基づいて前記生物由来対象の推定される特性候補を決定することと、
を含む、情報処理方法が提供される。
前記パルス波形のデータに基づき前記パルス波形のピーク位置に関連する情報を特定するパルス波形解析部および前記ピーク位置に関連する情報に基づいて前記生物由来対象の推定される特性候補を決定する特性候補決定部を備える情報処理装置と、
を備える、情報処理システムが提供される。
なお、上記の効果は必ずしも限定的なものではなく、上記の効果とともに、または上記の効果に代えて、本明細書に示されたいずれかの効果、または本明細書から把握され得る他の効果が奏されてもよい。
1.第1の実施の形態(セルアナライザ)
1.1.情報処理システムの概要
1.2.測定サンプル
1.3.測定ユニットの構成
1.4.情報処理装置の構成
1.5.情報処理方法の流れ
2.第2の実施の形態(セルソータ)
2.1.情報処理システムの構成
2.2.情報処理方法の流れ
3.情報処理装置のハードウェア構成
以下では、図1〜図18を参照しながら、本開示の第1の実施形態について詳細に説明する。
まず、図1を参照しながら、本実施形態に係る情報処理システムについて説明する。図1は、第1の実施形態に係る情報処理システムを示した説明図である。図2および図3は、図1に示す情報処理システムが備える測定ユニットを説明する概要図である。
測定サンプルである生物由来対象は、蛍光スペクトルの測定に先立って、1以上の蛍光色素により標識(染色)されることができる。生物由来対象の蛍光色素標識は、公知の任意の手法によって行うことができる。例えば測定対象を細胞とする場合には、細胞表面分子に対する蛍光標識抗体と細胞とを混合し、細胞表面分子に抗体を結合させる。蛍光標識抗体は、抗体に直接蛍光色素を結合させたものであってもよく、ビオチン標識した抗体にアビジンを結合した蛍光色素をアビジン・ビオチン反応によって結合させたものであってもよい。また、抗体は、モノクローナル抗体又はポリクローナル抗体であってもよい。
測定ユニット20の一例であるフローサイトメーターは、本実施形態においては、各生物由来試料Sを分析することのできるセルアナライザである。図2に示したように、サンプルSの染色に利用された蛍光色素を励起可能な波長を有するレーザ光を、レーザ光源21からフローセル231を流れる染色された生物由来試料Sに対して射出する。また、フローサイトメーターに設けられた光検出器25は、レーザ光の照射された生物由来試料Sから放射される蛍光を、光電子増倍管251等の光検出器により検出する。なお、図2の例では1台のレーザ光源21しか描画されていないが、複数のレーザ光源が設けられていてもよい。
続いて、図4を参照しながら、本実施形態に係る情報処理装置10について、詳細に説明する。図4は、本実施形態に係る情報処理装置10の構成を示すブロック図である。
例えば、パルス波形解析部104は、第1のパルス波形の検出に用いられた波長帯とは異なる波長帯で検出された第2のパルス波形中のピークに関する情報に基づき、第1のパルス波形中のピークを特定することができる。そして、パルス波形解析部104は、第1のパルス波形において特定されたピークについて解析を行い、当該ピークのピーク位置に関連する情報を含む、第1のパルス波形の形状情報を得ることができる。第2のパルス波形中のピークに関する情報としては、例えば、ピークの位置、高さ、面積、幅等が挙げられる。
続いて、図18を参照しながら、本実施形態に係る情報処理方法の流れについて、その一例を簡単に説明する。図18は、第1の実施形態に係る情報処理方法の流れの一例を示したフローチャートである。
以上、図18を参照しながら、本実施形態に係る情報処理の流れの一例を簡単に説明した。
以下では、図19〜図21を参照しながら、本開示の第2の実施形態について詳細に説明する。
まず、図19を参照しながら、本実施形態に係る情報処理システムについて説明する。図19は、第2の実施形態に係る情報処理システムを示したブロック図である。図19に示すように、本実施形態に係る情報処理システム1Aは、主に測定ユニット20Aが分取部29を備えている点で、すなわち測定ユニット20が分取可能なセルソータである点で、第1の実施形態に係る情報処理システム1と相違する。以下、本実施形態の第1の実施形態との相違点を主として説明し、同様の事項については説明を省略する。
測定部28は、第1の実施形態における測定ユニット20に相当する。そして、測定部28は、測定サンプルSについての測定を行うとともに、測定後の測定サンプルSを分取部29に輸送する。
なお分取部29への指示は、決定された生物由来対象の生物学特性候補に基づいて行われてもよいし、形状情報の解析結果に基づいて行われてもよい。
続いて、図20、図21を参照しながら、本実施形態に係る情報処理方法の流れについて、その例を簡単に説明する。図20、図21は、第2の実施形態に係る情報処理方法の流れの一例を示したフローチャートである。なお、本実施形態に係る情報処理システム1Aは、分取部29を備えているため、本実施形態に係る情報処理方法は、分取方法の一部を構成する。
以上、図20および図21に基づいて、本開示の第2の実施形態に係る情報処理方法の流れについて説明した。
次に、図22を参照しながら、本開示の第1の実施形態に係る情報処理装置10のハードウェア構成について、詳細に説明する。図22は、本開示の第1の実施形態に係る情報処理装置10のハードウェア構成を説明するためのブロック図である。なお、本開示の第2の実施形態に係る情報処理装置10Aの構成は、情報処理装置10の構成と同様とすることができるため、以下、情報処理装置10について代表的に説明する。
(1) 移動する生物由来対象に対して光線を照射することにより検出されるパルス波形のデータに基づき前記パルス波形のピーク位置に関連する情報を特定する、パルス波形解析部と、
前記ピーク位置に関連する情報に基づいて前記生物由来対象の推定される特性候補を決定する、特性候補決定部と、
を備える情報処理装置。
(2) 前記ピーク位置に関連する情報は、前記パルス波形におけるピークの数を含む、(1)に記載の情報処理装置。
(3) 前記パルス波形が複数のピークを有する場合、前記ピーク位置に関連する情報は、複数の前記ピーク間の強度の比較を含む、(1)または(2)に記載の情報処理装置。
(4) 前記パルス波形が複数のピークを有する場合、前記ピーク位置に関連する情報は、複数の前記ピーク位置の比較を含む、(1)〜(3)のいずれか一項に記載の情報処理装置。
(5) 前記パルス波形解析部は、互いに異なる波長帯の複数の前記パルス波形について解析し、それぞれについての前記ピーク位置に関連する情報を特定する、(1)〜(4)のいずれか一項に記載の情報処理装置。
(6) 前記ピーク位置に関連する情報は、前記互いに異なる波長帯の複数の前記パルス波形の位置の比較を含む、(5)に記載の情報処理装置。
(7) 前記パルス波形解析部は、複数の所定の形状モデルから、前記パルス波形と関連する前記形状モデルを選択し、選択された前記形状モデルと前記パルス波形とを比較することにより、解析を行う、(1)〜(6)のいずれか一項に記載の情報処理装置。
(8) 前記パルス波形解析部は、第1のパルス波形の検出に用いられた波長帯とは異なる波長帯で検出された第2のパルス波形中のピークに基づき、第1のパルス波形中のピークを特定する、(1)〜(7)のいずれか一項に記載の情報処理装置。
(9) 前記パルス波形解析部は、前記パルス波形中の少なくとも1以上のピークを減衰させたベースラインを得、当該パルス波形と当該ベースラインとの比較に基づき当該パルス波形中の前記少なくとも1以上のピークを特定する、(1)〜(7)のいずれか一項に記載の情報処理装置。
(10) さらに、前記ピーク位置に関連する情報と前記特性候補とを関連付ける関連情報を記憶する記憶部を備える、(1)〜(9)のいずれか一項に記載の情報処理装置。
(11) さらに、前記特性候補と前記ピーク位置に関連する情報との関連を学習する、学習部を備える、(1)〜(10)のいずれか一項に記載の情報処理装置。
(12) 前記生物由来対象は、異方性を有する形状をなす、(1)〜(11)のいずれか一項に記載の情報処理装置。
(13) 推定された前記特性候補は、前記生物由来対象の分取のための情報として用いられる、(1)〜(12)のいずれか一項に記載の情報処理装置。
(14) 移動する生物由来対象に対して光線を照射することにより検出されるパルス波形のデータに基づき前記パルス波形のピーク位置に関連する情報を特定することと、
前記ピーク位置に関連する情報に基づいて前記生物由来対象の推定される特性候補を決定することと、
を含む、情報処理方法。
(15) 移動する生物由来対象に対して光線を照射し、パルス波形を検出するフローサイトメーターと、
前記パルス波形のデータに基づき前記パルス波形のピーク位置に関連する情報を特定するパルス波形解析部および前記ピーク位置に関連する情報に基づいて前記生物由来対象の推定される特性候補を決定する特性候補決定部を備える情報処理装置と、
を備える、情報処理システム。
(16) 前記フローサイトメーターは、前記生物由来対象を分取可能な分取部を備え、
前記分取部は、前記ピーク位置に関連する情報に応じて前記生物由来対象を分取するように構成されている、(15)に記載の情報処理システム。
10、10A 情報処理装置
20、20A 測定ユニット
21 レーザ光源
23 フロー系
231 フローセル
25 光検出器
251 光電子増倍管
253 ディテクタ
27 光学系
271 波長選択フィルタ
28 測定部
29 分取部
102 データ取得部
104 パルス波形解析部
106、106A 特性候補決定部
108 記憶部
110 学習部
112、112A 出力部
114 表示制御部
116 入力部
300、300A 細胞
301A、301B、302、303 抗原
304 蛍光色素
310 細胞核
400、401、402 パルス波形
403 ベースライン
404 スパイクデータ
405 スパイク
410 ピーク
901 CPU
902 ROM
903 RAM
907 ホストバス
909 ブリッジ
911 外部バス
913 インターフェース
915 入力装置
917 出力装置
919 ストレージ装置
921 ドライブ
923 接続ポート
925 通信装置
927 リムーバブル記録媒体
929 外部接続機器
931 通信網
Claims (16)
- 移動する生物由来対象に対して光線を照射することにより検出されるパルス波形のデータに基づき、前記パルス波形の1パルスに含まれる時間軸上の位置が異なる複数のピークの情報を特定する、パルス波形解析部と、
前記特定された複数のピークのそれぞれの情報毎に前記生物由来対象の推定される特性候補を決定する、特性候補決定部と、
前記決定された特性候補を出力する出力部と、
を備える情報処理装置。 - 前記ピークの情報は、前記複数のピークの数を含む、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記ピークの情報は、前記複数のピーク間の強度を比較した情報を含む、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記ピークの情報は、前記複数のピークの時間軸上の位置を比較した情報を含む、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記パルス波形解析部は、互いに異なる波長帯の複数の前記パルス波形について解析し、複数の前記パルス波形に含まれる時間軸上の位置が異なる複数のピークの情報を特定する、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記ピークの情報は、前記互いに異なる波長帯の複数の前記パルス波形の時間軸上の位置を比較した情報を含む、請求項5に記載の情報処理装置。
- 前記パルス波形解析部は、複数の所定の形状モデルから、前記パルス波形と関連する前記形状モデルを選択し、選択された前記形状モデルと前記パルス波形とを比較することにより、解析を行う、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記パルス波形解析部は、第1のパルス波形の検出に用いられた波長帯とは異なる波長帯で検出された第2のパルス波形中のピークの情報に基づき、第1のパルス波形中のピークを特定する、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記パルス波形解析部は、前記パルス波形中の少なくとも1以上のピークを減衰させたベースラインを得、当該パルス波形と当該ベースラインとの比較に基づき当該パルス波形中の前記複数のピークを特定する、請求項1に記載の情報処理装置。
- さらに、前記ピークの情報と前記特性候補とを関連付ける関連データを記憶する記憶部を備える、請求項1に記載の情報処理装置。
- さらに、前記特性候補と前記ピークの情報との関連を学習する、学習部を備える、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記生物由来対象は、異方性を有する形状をなす、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記出力された前記特性候補は、前記生物由来対象の分取のための情報として用いられる、請求項1に記載の情報処理装置。
- 移動する生物由来対象に対して光線を照射することにより検出されるパルス波形のデータに基づき前記パルス波形の1パルスに含まれる時間軸上の位置が異なる複数のピークの情報を特定することと、
前記特定された複数のピークのそれぞれの情報毎に前記生物由来対象の推定される特性候補を決定することと、
前記決定された特性候補を出力することと、
を含む、情報処理方法。 - 移動する生物由来対象に対して光線を照射し、パルス波形を検出するフローサイトメーターと、
前記パルス波形のデータに基づき前記パルス波形の1パルスに含まれる時間軸上の位置が異なる複数のピークの情報を特定するパルス波形解析部、前記特定された複数のピークのそれぞれの情報毎に前記生物由来対象の推定される特性候補を決定する特性候補決定部および前記決定された特性候補を出力する出力部を備える情報処理装置と、
を備える、情報処理システム。 - 前記フローサイトメーターは、前記生物由来対象を分取可能な分取部を備え、
前記分取部は、前記複数のピークのそれぞれの情報に応じて前記生物由来対象を分取するように構成されている、請求項15に記載の情報処理システム。
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