JP2019500848A - 抗体/t細胞受容体キメラ構築物およびその使用 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、2015年10月23日に出願された米国仮出願第62/245,944号、2016年3月7日に出願された米国仮出願第62/304,918号、2016年6月3日に出願された米国仮出願第62/345,649号、および2016年8月1日に出願された米国仮出願第62/369,694号の優先権を主張し、これらすべてが、全体において参照によって組み込まれる。
ASCIIテキストファイルでの以下の提出の内容は、その全体が参照によって本明細書に組み込まれる:コンピューター可読形式(CRF)の配列表(ファイル名:750042000340SEQLIST.txt、データ記録:2016年10月20日、サイズ:104KB)。
T細胞受容体エフェクター機能を有する、抗体特異性を有するキメラ受容体分子を操作するためのいくつかの試みが行われてきた。例えば、Kuwana, Yら、Biochem. Biophys. Res. Commun. 149巻(3号):960〜968頁、1987年;Gross, Gら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86巻:10024〜10028頁、1989年;Gross, GおよびEshhar, Z、FASEB J. 6巻(15号):3370〜3378頁、1992年;米国特許第7,741,465号を参照のこと。今日まで、これらのキメラ受容体の中には、臨床的使用に採用されたものは存在せず、ヒトT細胞において改善された発現および機能性を有する抗体−TCRキメラ受容体の新規設計が必要とされている。
本明細書で言及される全ての刊行物、特許、特許出願および公開された特許出願の開示は、それらの全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用する場合、「処置」または「処置する」は、臨床結果を含む有益なまたは所望の結果を得るためのアプローチである。本発明の目的のために、有益なまたは所望の臨床結果には、以下のうち1または複数が含まれるがこれらに限定されない:疾患から生じる1もしくは複数の症状を軽減すること、疾患の程度を弱めること、疾患を安定化すること(例えば、疾患の悪化を防止もしくは遅延させること)、疾患の拡散(例えば、転移)を防止もしくは遅延させること、疾患の再発を防止もしくは遅延させること、疾患の進行を遅延もしくは減速させること、疾患状態を緩和すること、疾患の寛解(部分的もしくは全体的)を提供すること、疾患を処置するために必要とされる1もしくは複数の他の薬物療法の用量を減少させること、疾患の進行を遅延させること、生活の質を増加もしくは改善すること、体重増加を増加させること、および/または生存期間を延長させること。疾患の病理学的結果(例えば、がんにおける腫瘍体積など)の低減もまた、「処置」によって包含される。本発明の方法は、処置のこれらの態様のうちいずれか1または複数を企図する。
一態様では、本発明は、標的抗原(例えば、細胞表面抗原またはペプチド/MHC複合体)に特異的に結合し、少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュール(例えば、CD3δε、CD3γεまたはζζ)をリクルートすることが可能な、標的抗原特異的キメラ抗体/T細胞受容体(abTCR)を提供する。一部の実施形態では、abTCRは、第1のポリペプチド鎖と第2のポリペプチド鎖とを含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチド鎖と第2のポリペプチド鎖とは、例えば、共有結合(例えば、ペプチド結合または他の化学結合)または非共有結合によって連結される。一部の実施形態では、abTCRは、第1のポリペプチド鎖と第2のポリペプチド鎖とを含むヘテロ二量体である。一部の実施形態では、第1のポリペプチド鎖と第2のポリペプチド鎖とは、少なくとも1つのジスルフィド結合によって連結される。abTCRの特異性は、標的抗原に対する結合特異性を付与する抗体部分に由来する。一部の実施形態では、抗体部分は、VH、CH1、VLおよびCL抗体ドメインを含むFab様抗原結合モジュールである。一部の実施形態では、抗体部分は、VHおよびVL抗体ドメインを含むFv様抗原結合モジュールである。abTCRがTCR関連シグナル伝達モジュールをリクルートする能力は、T細胞受容体モジュール(TCRM)に由来する。一部の実施形態では、TCRMは、TCR(例えば、αβTCRまたはγδTCR)の膜貫通モジュールを含む。一部の実施形態では、TCRMは、TCRの接続ペプチドまたはその断片の一方または両方をさらに含む。一部の実施形態では、膜貫通モジュールおよび接続ペプチドまたはその断片は、同じTCR型(αβまたはγδ)に由来する。一部の実施形態では、膜貫通モジュールはαβTCRに由来し、接続ペプチドもしくはその断片はγδTCRに由来し、または膜貫通モジュールはγδTCRに由来し、接続ペプチドもしくはその断片はαβTCRに由来する。一部の実施形態では、abTCRは、少なくとも1つの細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、abTCRの少なくとも1つの細胞内ドメインのうち1つまたは複数は、TCRの細胞内ドメイン由来の配列を含む。一部の実施形態では、abTCRの少なくとも1つの細胞内ドメインのうち1つまたは複数は、T細胞共刺激シグナル伝達配列を含む。共刺激シグナル伝達配列は、例えば、CD27、CD28、4−1BB(CD137)、OX40、CD30、CD40、ICOS、リンパ球機能関連抗原−1(LFA−1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83と特異的に結合するリガンドなどを含む共刺激分子の細胞内ドメインの一部分であり得る。一部の実施形態では、抗体部分は、abTCRの細胞外ドメイン中に含まれる。一部の実施形態では、abTCRは、細胞外ドメインの長さを最適化するために、抗体部分とTCRMとの間に1つまたは複数のペプチドリンカーをさらに含む。一部の実施形態では、標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュール(例えば、Fab様またはFv様抗原結合モジュール)に対する言及は、抗原結合モジュールが、a)他の分子に対するその結合親和性の少なくとも約10(例えば、少なくとも約10、20、30、40、50、75、100、200、300、400、500、750、1000またはそれよりも大きい数のいずれかを含む)倍である親和性で、またはb)他の分子への結合に対するそのKdの約1/10倍以下(例えば、約1/10、1/20、1/30、1/40、1/50、1/75、1/100、1/200、1/300、1/400、1/500、1/750、1/1000またはそれ未満のいずれか以下)のKdで、標的抗原に結合することを意味する。結合親和性は、ELISA、蛍光活性化細胞分取(FACS)分析または放射性免疫沈降アッセイ(RIA)などの、当該分野で公知の方法によって決定され得る。Kdは、例えば、Biacore機器を利用する表面プラズモン共鳴(SPR)アッセイ、または例えば、Sapidyne機器を利用する速度論的排除アッセイ(KinExA)などの、当該分野で公知の方法によって決定され得る。
abTCRをコードする核酸分子もまた企図される。一部の実施形態では、本明細書に記載されるabTCRのいずれかによれば、abTCRをコードする核酸(または核酸のセット)が提供される。
一部の実施形態では、本明細書に記載されるabTCRのいずれかにしたがうabTCRをその表面上に提示するエフェクター細胞(例えば、T細胞)が提供される。一部の実施形態では、エフェクター細胞は、abTCRをコードする核酸を含み、abTCRは核酸から発現され、エフェクター細胞表面に局在化される。一部の実施形態では、abTCRは、外因的に発現され、エフェクター細胞と組み合わされる。一部の実施形態では、エフェクター細胞は、T細胞である。一部の実施形態では、エフェクター細胞は、細胞傷害性T細胞、ヘルパーT細胞、ナチュラルキラーT細胞およびサプレッサーT細胞からなる群から選択される。一部の実施形態では、エフェクター細胞は、abTCRのTCRDが由来するTCRサブユニットを発現しない。例えば、一部の実施形態では、エフェクター細胞はαβT細胞であり、導入されたabTCRのTCRDは、TCRδおよびγ鎖に由来する配列を含み、またはT細胞はγδT細胞であり、導入されたabTCRのTCRDは、TCRαおよびβ鎖に由来する配列を含む。一部の実施形態では、エフェクター細胞は、abTCRのTCRDが由来する内因性TCRサブユニットの一方または両方の発現を遮断するまたは減少させるように改変されている。例えば、一部の実施形態では、エフェクター細胞は、TCRαおよび/またはβ鎖の発現を遮断するまたは減少させるように改変されているαβT細胞であり、導入されたabTCRのTCRDは、TCRαおよびβ鎖に由来する配列を含み、あるいはエフェクター細胞は、TCRγおよび/またはδ鎖の発現を遮断するまたは減少させるように改変されているγδT細胞であり、導入されたabTCRのTCRDは、TCRγおよびδ鎖に由来する配列を含む。遺伝子発現を破壊するための細胞の改変には、例えば、RNA干渉(例えば、siRNA、shRNA、miRNA)、遺伝子編集(例えば、CRISPRベースまたはTALENベースの遺伝子ノックアウト)などを含む当該分野で公知の任意のかかる技術が含まれる。例えば、一部の実施形態では、本明細書に記載されるabTCRのいずれかにしたがうabTCRをコードする核酸を含むエフェクター細胞(例えば、T細胞)であって、abTCRが核酸から発現され、エフェクター細胞表面に局在化される、エフェクター細胞が提供される。一部の実施形態では、abTCRをコードする核酸は、abTCRの第1のポリペプチド鎖をコードする第1の核酸配列およびabTCRの第2のポリペプチド鎖をコードする第2の核酸配列を含む。一部の実施形態では、第1の核酸配列は、第1のベクター上に位置し、第2の核酸配列は、第2のベクター上に位置する。一部の実施形態では、第1および第2の核酸配列は、同じベクター上に位置する。ベクターは、例えば、哺乳動物発現ベクターおよびウイルスベクター(例えば、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルスおよびレンチウイルスに由来するもの)からなる群から選択され得る。一部の実施形態では、ベクターのうち1つまたは複数は、エフェクター細胞の宿主ゲノム中に組み込まれる。一部の実施形態では、第1の核酸配列は、第1のプロモーターの制御下にあり、第2の核酸配列は、第2のプロモーターの制御下にある。一部の実施形態では、第1および第2のプロモーターは、同じ配列を有する。一部の実施形態では、第1および第2のプロモーターは、異なる配列を有する。一部の実施形態では、第1および第2の核酸は、単一のプロモーターの制御下にある。一部の実施形態では、第1、第2および/または単一のプロモーターは、誘導性である。一部の実施形態では、第1のポリペプチド鎖の発現は、第2のポリペプチド鎖の発現とほぼ同じである。一部の実施形態では、第1のポリペプチド鎖の発現は、第2のポリペプチド鎖の発現の少なくとも約2(例えば、少なくとも約2、3、4、5またはそれよりも多くのいずれか)倍である。一部の実施形態では、第1のポリペプチド鎖の発現は、第2のポリペプチド鎖の発現の約1/2倍以下(例えば、約1/2、1/3、1/4、1/5またはそれ未満のいずれか以下)である。発現は、mRNAレベルまたはタンパク質レベルで決定され得る。mRNA発現のレベルは、ノーザンブロッティング、定量的RT−PCR、マイクロアレイ分析などを含む、種々の周知の方法を使用して、核酸から転写されたmRNAの量を測定することによって決定され得る。タンパク質発現のレベルは、免疫細胞化学的染色、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、ウエスタンブロット分析、発光アッセイ、質量分析、高速液体クロマトグラフィー、高圧液体クロマトグラフィー−タンデム質量分析などを含む公知の方法によって測定され得る。一部の実施形態では、エフェクター細胞は、細胞傷害性T細胞、ヘルパーT細胞、ナチュラルキラーT細胞およびサプレッサーT細胞からなる群から選択される。
一部の実施形態では、本明細書に記載されるabTCRのいずれかによれば、抗体部分は、モノクローナル抗体由来の配列を含むFab様抗原結合モジュールである。一部の実施形態では、Fab様抗原結合モジュールは、モノクローナル抗体由来のVH、CH1、VLおよびCLドメインを含む。モノクローナル抗体は、例えば、KohlerおよびMilstein、Nature、256巻:495頁(1975年)ならびにSergeevaら、Blood、117巻(16号):4262〜4272頁によって記載されるものなどのハイブリドーマ法を使用して調製され得る。
abTCR抗体部分は、ヒトまたはヒト化であり得る。非ヒト(例えば、マウス)抗体部分のヒト化形態は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小の配列を典型的には含む、キメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖、またはそれらの断片(例えば、Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2、scFv、または抗体の他の抗原結合サブ配列)である。ヒト化抗体部分には、レシピエントのCDR由来の残基が、所望の特異性、親和性および能力を有するマウス、ラットまたはウサギなどの非ヒト種(ドナー抗体)のCDR由来の残基によって置き換えられた、ヒト免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖、またはそれらの断片(レシピエント抗体)が含まれる。一部の場合には、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク残基が、対応する非ヒト残基によって置き換えられる。ヒト化抗体部分は、レシピエント抗体部分中にも、インポートされたCDRまたはフレームワーク配列中にも見出されない残基もまた含み得る。一般に、ヒト化抗体部分は、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含み得、ここで、CDR領域の全てまたは実質的に全ては、非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、FR領域の全てまたは実質的に全ては、ヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものである。例えば、Jonesら、Nature、321巻:522〜525頁(1986年);Riechmannら、Nature、332巻:323〜329頁(1988年);Presta、Curr. Op. Struct. Biol.、2巻:593〜596頁(1992年)を参照のこと。
一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体のアミノ酸配列バリアントが企図される。例えば、抗体の結合親和性および/または他の生物学的特性を改善することが望まれ得る。抗体のアミノ酸配列バリアントは、抗体をコードするヌクレオチド配列中に適切な改変を導入することによって、またはペプチド合成によって調製され得る。かかる改変には、例えば、抗体のアミノ酸配列からの欠失、および/またはかかるアミノ酸配列中への挿入、および/またはかかるアミノ酸配列内の残基の置換が含まれる。最終構築物が所望の特徴、例えば、抗原結合を有することを条件として、欠失、挿入および置換の任意の組合せが、最終構築物に到達するために作製され得る。
a.疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
b.中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
c.酸性:Asp、Glu;
d.塩基性:His、Lys、Arg;
e.鎖配向に影響を与える残基:Gly、Pro;
f.芳香族:Trp、Tyr、Phe。
一部の実施形態では、本明細書に記載のabTCRのいずれかにしたがうabTCRは、当該分野で公知であり容易に入手可能なさらなる非タンパク質性部分を含むように、さらに改変され得る。abTCRの誘導体化に適切な部分には、水溶性ポリマーが含まれるがこれらに限定されない。水溶性ポリマーの非限定的な例には、ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ−1,3−ジオキソラン、ポリ−1,3,6−トリオキサン、エチレン/無水マレイン酸コポリマー、ポリアミノ酸(ホモポリマーまたはランダムコポリマーのいずれか)、およびデキストランまたはポリ(n−ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、プロプロピレングリコール(propropylene glycol)ホモポリマー、ポリプロピレンオキシド(prolypropylene oxide)/エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール(例えば、グリセロール)、ポリビニルアルコール、ならびにそれらの混合物が含まれるがこれらに限定されない。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、水中でのその安定性に起因して、製造における利点を有し得る。ポリマーは、任意の分子量のものであり得、分岐鎖または非分岐鎖であり得る。abTCRに結合したポリマーの数は変動し得、1よりも多いポリマーが結合される場合、それらは同じまたは異なる分子であり得る。一般に、誘導体化に使用されるポリマーの数および/または型は、改善すべきabTCRの特定の特性または機能、abTCR誘導体が規定された条件下で治療に使用されるかどうかなどが含まれるがこれらに限定されない考慮事項に基づいて決定され得る。
本発明は、一態様では、abTCRを発現するエフェクター細胞(例えば、リンパ球、例えば、T細胞)を提供する。abTCRを発現するエフェクター細胞(例えば、T細胞)(abTCRエフェクター細胞、例えば、abTCR T細胞)を調製する例示的な方法は、本明細書で提供される。
一部の実施形態では、本発明のabTCRエフェクター細胞(例えば、abTCR T細胞)は、本明細書に記載されるabTCRをコードするウイルスベクターで、エフェクター細胞(例えば、本明細書に記載される方法によって調製されるT細胞)を形質導入することによって生成される。ウイルスベクター送達系には、エフェクター細胞への送達後にエピソームまたは組み込まれたゲノムのいずれかを有する、DNAおよびRNAウイルスが含まれる。遺伝子療法手順の概説については、Anderson、Science 256巻:808〜813頁(1992年);NabelおよびFeigner、TIBTECH 11巻:211〜217頁(1993年);MitaniおよびCaskey、TIBTECH 11巻:162〜166頁(1993年);Dillon、TIBTECH 11巻:167〜175頁(1993年);Miller、Nature 357巻:455〜460頁(1992年);Van Brunt、Biotechnology 6巻(10号):1149〜1154頁(1988年);Vigne、Restorative Neurology and Neuroscience 8巻:35〜36頁(1995年);KremerおよびPerricaudet、British Medical Bulletin 51巻(l号):31〜44頁(1995年);ならびにYuら、Gene Therapy 1巻:13〜26頁(1994年)を参照のこと。一部の実施形態では、ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターであり、abTCRエフェクター細胞は、abTCRエフェクター細胞ゲノム中に組み込まれたレンチウイルスベクターを含む。一部の実施形態では、abTCRエフェクター細胞は、そのゲノム中に組み込まれたレンチウイルスベクターを含むabTCR T細胞である。
一部の実施形態では、本明細書に記載されるabTCRエフェクター細胞のいずれかにしたがうabTCRエフェクター細胞について不均一な細胞集団を富化する方法が提供される。
標的抗原に対して特異的な候補abTCR構築物を単離するために、abTCRライブラリー、例えば、複数のabTCRをコードする核酸のライブラリーを発現する細胞が、標的抗原またはその中に含まれる1つもしくは複数のエピトープを含むリガンドに曝露され、その後、リガンドに特異的に結合するライブラリーの親和性メンバーが単離され得る。一部の実施形態では、リガンドは、固体支持体上に固定化される。一部の実施形態では、支持体は、ビーズ、マイクロタイタープレート、イムノチューブ、またはかかる目的に有用な、当該分野で公知の任意の材料の表面であり得る。一部の実施形態では、タグ化されたリガンド標的(例えば、ビオチン化リガンド)に対する相互作用は、溶液中で起こる。一部の実施形態では、手順には、非特異的で非反応性のライブラリーメンバーを除去するための、1回または複数の洗浄するステップ(パニング)が含まれる。一部の実施形態では、溶液中の複合体を精製するために、それらは、固定化によってまたは遠心分離によって捕捉される。一部の実施形態では、親和性メンバーは、可溶性ビオチン化リガンド上で捕捉され、その後、ストレプトアビジンビーズ上に親和性複合体(親和性メンバーおよびリガンド)が固定化される。一部の実施形態では、固体支持体は、ビーズである。一部の実施形態では、ビーズには、例えば、磁性ビーズ(例えば、Bangs Laboratories、Polysciences inc.、Dynal Biotech、Miltenyi BiotechまたはQuantum Magneticから)、非磁性ビーズ(例えば、PierceおよびUpstate technology)、単分散ビーズ(例えば、Dynal BiotechおよびMicroparticle Gmbh)および多分散ビーズ(例えば、Chemagen)が含まれる。磁性ビーズの使用は、文献(Uhlen, Mら(1994年)、Advances in Biomagnetic Separation、BioTechniques press、Westborough、MA)中に徹底的に記載されている。一部の実施形態では、親和性メンバーは、陽性選択によって精製される。一部の実施形態では、親和性メンバーは、望ましくないライブラリーメンバーを除去するために、陰性選択によって精製される。一部の実施形態では、親和性メンバーは、陽性選択ステップおよび陰性選択ステップの両方によって精製される。
MHCクラスIタンパク質は、主要組織適合複合体(MHC)分子の2つの主要なクラスのうちの一方であり(他方はMHCクラスIIである)、身体のほぼ全ての有核細胞上で見出される。それらの機能は、細胞内由来のタンパク質の断片をT細胞にディスプレイすることである;健康な細胞は無視されるが、外来タンパク質または変異したタンパク質を含む細胞は、免疫系によって攻撃される。MHCクラスIタンパク質は、細胞質ゾルタンパク質に由来するペプチドを提示するので、MHCクラスI提示の経路は、細胞質ゾル経路または内因性経路と呼ばれる場合が多い。クラスI MHC分子は、プロテアソームによる細胞質ゾルタンパク質の分解から主に生成されるペプチドを結合する。次いで、MHC I:ペプチド複合体は、細胞の原形質膜中に挿入される。ペプチドは、クラスI MHC分子の細胞外部分に結合される。したがって、クラスI MHCの機能は、細胞内タンパク質を細胞傷害性T細胞(CTL)にディスプレイすることである。しかし、クラスI MHCは、交差提示として公知のプロセスにおいて、外因性タンパク質から生成されたペプチドもまた提示できる。
本明細書に記載される実施形態のいずれかにしたがうabTCR、本明細書に記載される実施形態のいずれかにしたがうabTCRをコードする核酸、または本明細書に記載される実施形態のいずれかにしたがうabTCRエフェクター細胞を含む組成物(例えば、医薬組成物、本明細書で製剤とも呼ぶ)もまた本明細書で提供される。一部の実施形態では、組成物は、本明細書に記載されるabTCRのいずれかにしたがうabTCRをその表面上に提示するエフェクター細胞(例えば、T細胞)を含むabTCRエフェクター細胞組成物(例えば、医薬組成物)である。一部の実施形態では、abTCRエフェクター細胞組成物は、医薬組成物である。
本発明のabTCRおよび/または組成物は、例えば、がんおよび感染性疾患(例えば、ウイルス感染症)を含む、標的抗原(TA)発現と関連する疾患および/または障害(本明細書で「標的抗原陽性」または「TA陽性」疾患または障害とも呼ぶ)を処置するために、個体(例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)に投与され得る。したがって、本出願は、一部の実施形態では、個体において標的抗原陽性疾患(例えば、がんまたはウイルス感染症)を処置するための方法であって、個体に、有効量の、抗体部分を含むabTCR、例えば、本明細書に記載されるabTCRのいずれか1つを含む組成物(例えば、医薬組成物)を投与するステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、組成物は、abTCRと関連する細胞(例えば、エフェクター細胞)をさらに含む。一部の実施形態では、がんは、例えば、副腎皮質癌、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、結腸直腸がん、食道がん、グリア芽細胞腫、グリオーマ、肝細胞癌、頭頸部がん、腎臓がん、肺がん、メラノーマ、中皮腫、多発性骨髄腫、膵臓がん、褐色細胞腫、形質細胞腫、神経芽細胞腫、卵巣がん、前立腺がん、肉腫、胃がん、子宮がんおよび甲状腺がんからなる群から選択される。一部の実施形態では、ウイルス感染症は、例えば、サイトメガロウイルス(CMV)、エプスタイン−バーウイルス(EBV)、B型肝炎ウイルス(HBV)、カポジ肉腫関連ヘルペスウイルス(KSHV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)、伝染性軟属腫ウイルス(MCV)、ヒトT細胞白血病ウイルス1(HTLV−1)、HIV(ヒト免疫不全ウイルス)およびC型肝炎ウイルス(HCV)からなる群から選択されるウイルスによって引き起こされる。
abTCRエフェクター細胞は、一部の実施形態では、標的抗原と関連するがんを処置するために有用であり得る。本明細書に記載される方法のいずれかを使用して処置され得るがんには、血管新生されていない腫瘍、またはまだ実質的に血管新生されていない腫瘍、ならびに血管新生された腫瘍が含まれる。がんは、非固形腫瘍(例えば、血液学的腫瘍、例えば、白血病およびリンパ腫)を含み得、または固形腫瘍を含み得る。本発明のabTCRエフェクター細胞で処置されるがんの型には、癌腫、芽細胞腫および肉腫、ならびにある特定の白血病またはリンパ様悪性腫瘍、良性および悪性の腫瘍、ならびに悪性腫瘍、例えば、肉腫、癌腫およびメラノーマが含まれるがこれらに限定されない。成体腫瘍/がんおよび小児腫瘍/がんもまた含まれる。
本発明の一部の実施形態では、標的抗原陽性疾患、例えば、がん(例えば、副腎皮質癌、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、結腸直腸がん、食道がん、グリア芽細胞腫、グリオーマ、肝細胞癌、頭頸部がん、腎臓がん、肺がん、メラノーマ、中皮腫、多発性骨髄腫、膵臓がん、褐色細胞腫、形質細胞腫、神経芽細胞腫、卵巣がん、前立腺がん、肉腫、胃がん、子宮がんまたは甲状腺がん)またはウイルス感染症(例えば、CMV、EBV、HBV、KSHV、HPV、MCV、HTLV−1、HIV−1またはHCVによる感染症)の処置に有用な材料を含む製造物品が提供される。製造物品は、容器、および、容器上のまたは容器に付随する標識または添付文書を含み得る。適切な容器としては、例えば、ビン、バイアル、シリンジなどが挙げられる。容器は、ガラスまたはプラスチックなどの種々の材料から形成されたものであってよい。一般に、容器は、本明細書に記載の疾患または障害の処置に有効である組成物を保持し、滅菌アクセスポートを有し得る(例えば、容器は、静脈内溶液バッグまたは皮下注射針で穴をあけることができる止め栓を有するバイアルであってよい)。組成物中の少なくとも1つの活性剤は、本発明のabTCRをその表面上に提示するエフェクター細胞である。標識または添付文書は、組成物が特定の状態を処置するために使用されるものであることを示す。標識または添付文書は、abTCRエフェクター細胞組成物の患者への投与に関する指示をさらに含む。本明細書に記載のコンビナトリアル治療を含む製造物品およびキットも企図される。
例示的な実施形態
標的抗原に特異的に結合する抗体−T細胞受容体(TCR)キメラ分子(abTCR)であって、
a)VHおよびCH1抗体ドメインを含む第1の抗原結合ドメインと第1のTCRサブユニットの第1の膜貫通ドメインを含む第1のT細胞受容体ドメイン(TCRD)とを含む第1のポリペプチド鎖;ならびに
b)VLおよびCL抗体ドメインを含む第2の抗原結合ドメインと第2のTCRサブユニットの第2の膜貫通ドメインを含む第2のTCRDとを含む第2のポリペプチド鎖
を含み、
前記第1の抗原結合ドメインの前記VHおよびCH1ドメインと前記第2の抗原結合ドメインの前記VLおよびCLドメインとが、前記標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュールを形成し、
前記第1のTCRDと前記第2のTCRDとが、少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュールをリクルートすることが可能なT細胞受容体モジュール(TCRM)を形成する、
abTCR。
前記抗原結合モジュールが、前記CH1ドメイン中の残基と前記CLドメイン中の残基との間のジスルフィド結合を含む、実施形態1に記載のabTCR。
前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインと前記第1のTCRDとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含む、実施形態1または2に記載のabTCR。
前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のTCRDとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、実施形態1から3のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第1のペプチドリンカーおよび/または前記第2のペプチドリンカーが個々に、約5〜約50アミノ酸長である、実施形態3または4に記載のabTCR。
前記標的抗原が細胞表面抗原である、実施形態1から5のいずれか一項に記載のabTCR。
前記細胞表面抗原が、タンパク質、炭水化物および脂質からなる群から選択される、実施形態6に記載のabTCR。
前記細胞表面抗原が、CD19、ROR1、ROR2、BCMA、GPRC5DまたはFCRL5である、実施形態7に記載のabTCR。
前記標的抗原が、ペプチドと主要組織適合複合体(MHC)タンパク質とを含む複合体である、実施形態1から5のいずれか一項に記載のabTCR。
標的抗原に特異的に結合するabTCRであって、
a)VH抗体ドメインを含む第1の抗原結合ドメインと第1のTCRサブユニットの第1の膜貫通ドメインを含む第1のTCRDとを含む第1のポリペプチド鎖;および
b)VL抗体ドメインを含む第2の抗原結合ドメインと第2のTCRサブユニットの第2の膜貫通ドメインを含む第2のTCRDとを含む第2のポリペプチド鎖
を含み、
前記第1の抗原結合ドメインの前記VHドメインと前記第2の抗原結合ドメインの前記VLドメインとが、前記標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュールを形成し、
前記第1のTCRDと前記第2のTCRDとが、少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュールをリクルートすることが可能なT細胞受容体モジュール(TCRM)を形成し、
前記標的抗原が、ペプチドとMHCタンパク質とを含む複合体である、
abTCR。
前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインと前記第1のTCRDとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含み、前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のTCRDとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、実施形態10に記載のabTCR。
前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニット由来の定常ドメインまたはその断片を個々に含む、実施形態11に記載のabTCR。
前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、実施形態12に記載のabTCR。
前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、Cα、Cβ、CγもしくはCδTCRドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、実施形態12に記載のabTCR。
前記第1のTCRDが、前記第1の膜貫通ドメインのN末端側に、TCRサブユニットの第1の接続ペプチドまたはその断片をさらに含む、実施形態1から14のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第2のTCRDが、前記第2の膜貫通ドメインのN末端側に、TCRサブユニットの第2の接続ペプチドまたはその断片をさらに含む、実施形態1から15のいずれか一項に記載のabTCR。
前記TCRMが、前記第1の接続ペプチド中の残基と前記第2の接続ペプチド中の残基との間のジスルフィド結合を含む、実施形態15または16に記載のabTCR。
前記第1のTCRDが、前記第1の膜貫通ドメインのC末端側に、TCR細胞内配列を含む第1のTCR細胞内ドメインをさらに含む、実施形態1から17のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第2のTCRDが、前記第2の膜貫通ドメインのC末端側に、TCR細胞内配列を含む第2のTCR細胞内ドメインをさらに含む、実施形態1から18のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の膜貫通ドメインのC末端側に、共刺激細胞内シグナル伝達配列を含む第1のアクセサリ細胞内ドメインをさらに含む、実施形態1から19のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の膜貫通ドメインのC末端側に、共刺激細胞内シグナル伝達配列を含む第2のアクセサリ細胞内ドメインをさらに含む、実施形態1から20のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインのN末端側に、第1のシグナル伝達ペプチドをさらに含む、実施形態1から21のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインのN末端側に、第2のシグナル伝達ペプチドをさらに含む、実施形態1から22のいずれか一項に記載のabTCR。
前記標的抗原複合体中の前記ペプチドが、WT−1、AFP、HPV16−E7、NY−ESO−1、PRAME、EBV−LMP2A、HIV−1およびPSAからなる群から選択されるタンパク質に由来する、実施形態9から23のいずれか一項に記載のabTCR。
前記分子が、約0.1pM〜約500nMの平衡解離定数(Kd)で前記標的抗原に結合する、実施形態1から24のいずれか一項に記載のabTCR。
前記TCR関連シグナル伝達モジュールが、CD3δε、CD3γεおよびζζからなる群から選択される、実施形態1から25のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第1のTCRサブユニットがTCRα鎖であり、前記第2のTCRサブユニットがTCRβ鎖である、実施形態1から26のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第1のTCRサブユニットがTCRβ鎖であり、前記第2のTCRサブユニットがTCRα鎖である、実施形態1から26のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第1のTCRサブユニットがTCRγ鎖であり、前記第2のTCRサブユニットがTCRδ鎖である、実施形態1から26のいずれか一項に記載のabTCR。
前記第1のTCRサブユニットがTCRδ鎖であり、前記第2のTCRサブユニットがTCRγ鎖である、実施形態1から26のいずれか一項に記載のabTCR。
実施形態1から30のいずれか一項に記載のabTCRの前記第1および第2のポリペプチド鎖をコードする核酸(複数可)。
実施形態1から30のいずれか一項に記載のabTCRと、CD3δε、CD3γεおよびζζからなる群から選択される少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュールとを含む複合体。
前記abTCRとCD3δε、CD3γεおよびζζとを含む八量体である、実施形態32に記載の複合体。
実施形態1から30のいずれか一項に記載のabTCRまたは実施形態32もしくは33に記載の複合体をその表面上に提示するエフェクター細胞。
実施形態31に記載の核酸(複数可)を含むエフェクター細胞。
前記第1のTCRサブユニットおよび/または前記第2のTCRサブユニットを発現しない、実施形態34または35に記載のエフェクター細胞。
a)前記第1のTCRサブユニットがTCRαであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRβであり;または
b)前記第1のTCRサブユニットがTCRβであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRαであり;
前記エフェクター細胞がγδT細胞である、実施形態36に記載のエフェクター細胞。
a)前記第1のTCRサブユニットがTCRγであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRδであり;または
b)前記第1のTCRサブユニットがTCRδであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRγであり;
前記エフェクター細胞がαβT細胞である、実施形態36に記載のエフェクター細胞。
第1の内因性TCRサブユニットおよび/または第2の内因性TCRサブユニットの発現を遮断するまたは減少させるように改変されている、実施形態34から36のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
a)前記第1のTCRサブユニットがTCRαであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRβであり;または
b)前記第1のTCRサブユニットがTCRβであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRαであり;
前記エフェクター細胞が、TCRαおよび/またはTCRβの発現を遮断するまたは減少させるように改変されたαβT細胞である、実施形態39に記載のエフェクター細胞。
a)前記第1のTCRサブユニットがTCRγであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRδであり;または
b)前記第1のTCRサブユニットがTCRδであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRγであり;
前記エフェクター細胞が、TCRγおよび/またはTCRδの発現を遮断するまたは減少させるように改変されたγδT細胞である、実施形態39に記載のエフェクター細胞。
CD3+細胞である、実施形態34から41のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
前記CD3+細胞が、細胞傷害性T細胞、ヘルパーT細胞、ナチュラルキラーT細胞およびサプレッサーT細胞からなる群から選択される、実施形態42に記載のエフェクター細胞。
a)第1のプロモーターの制御下の前記abTCRの前記第1のポリペプチド鎖をコードする第1の核酸配列を含む第1のベクターと、b)第2のプロモーターの制御下の前記abTCRの前記第2のポリペプチド鎖をコードする第2の核酸配列を含む第2のベクターとを含む、実施形態34から43のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
a)第1のプロモーターの制御下の前記abTCRの前記第1のポリペプチド鎖をコードする第1の核酸配列と;b)第2のプロモーターの制御下の前記abTCRの前記第2のポリペプチド鎖をコードする第2の核酸配列とを含むベクターを含む、実施形態34から43のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
a)前記abTCRの前記第1のポリペプチド鎖をコードする第1の核酸配列と;b)前記abTCRの前記第2のポリペプチド鎖をコードする第2の核酸配列とを含むベクターを含み、前記第1および第2の核酸配列が、単一のプロモーターの制御下にある、実施形態34から43のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
前記abTCRの前記第1のポリペプチド鎖の発現が、前記abTCRの前記第2のポリペプチド鎖の発現とは、2倍よりも大きく異なる、実施形態34から45のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
標的抗原を提示する標的細胞を死滅させる方法であって、前記標的細胞を、実施形態34から47のいずれか一項に記載のエフェクター細胞と接触させるステップを含み、前記abTCRが、前記標的抗原に特異的に結合する、方法。
標的抗原を提示する標的細胞を死滅させる方法であって、前記標的細胞を、前記標的抗原に特異的に結合するabTCRを含むエフェクターαβT細胞と接触させるステップを含み、前記abTCRが、
a)VH抗体ドメインを含む第1の抗原結合ドメインと第1のTCRサブユニットの第1の膜貫通ドメインを含む第1のTCRDとを含む第1のポリペプチド鎖;および
b)VL抗体ドメインを含む第2の抗原結合ドメインと第2のTCRサブユニットの第2の膜貫通ドメインを含む第2のTCRDとを含む第2のポリペプチド鎖
を含み、
前記第1の抗原結合ドメインの前記VHドメインと前記第2の抗原結合ドメインの前記VLドメインとが、前記標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュールを形成し、
前記第1のTCRDと前記第2のTCRDとが、少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュールをリクルートすることが可能なT細胞受容体モジュール(TCRM)を形成し、
前記第1のTCRサブユニットがTCRγであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRδである、または前記第1のTCRサブユニットがTCRδであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRγである、
方法。
前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインと前記第1のTCRDとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含み、前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のTCRDとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、実施形態49に記載の方法。
前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニット由来の定常ドメインまたはその断片を個々に含む、実施形態50に記載の方法。
前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、実施形態51に記載の方法。
前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、Cα、Cβ、CγもしくはCδTCRドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、実施形態51に記載の方法。
前記接触させるステップがin vivoである、実施形態48から53のいずれか一項に記載の方法。
前記接触させるステップがin vitroである、実施形態48から53のいずれか一項に記載の方法。
実施形態1から30のいずれか一項に記載のabTCR、実施形態31に記載の核酸(複数可)、または実施形態34から47のいずれか一項に記載のエフェクター細胞と、薬学的に許容されるキャリアとを含む医薬組成物。
それを必要とする個体において標的抗原関連疾患を処置する方法であって、前記個体に、有効量の、実施形態51に記載の医薬組成物を投与するステップを含む方法。
それを必要とする個体において標的抗原関連疾患を処置する方法であって、前記個体に、有効量の、前記標的抗原に特異的に結合するabTCRを含むエフェクターαβT細胞を含む組成物を投与するステップを含み、前記abTCRが、
a)VH抗体ドメインを含む第1の抗原結合ドメインと第1のTCRサブユニットの第1の膜貫通ドメインを含む第1のTCRDとを含む第1のポリペプチド鎖;および
b)VL抗体ドメインを含む第2の抗原結合ドメインと第2のTCRサブユニットの第2の膜貫通ドメインを含む第2のTCRDとを含む第2のポリペプチド鎖
を含み、
前記第1の抗原結合ドメインの前記VHドメインと前記第2の抗原結合ドメインの前記VLドメインとが、前記標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュールを形成し、
前記第1のTCRDと前記第2のTCRDとが、少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュールをリクルートすることが可能なT細胞受容体モジュール(TCRM)を形成し、
前記第1のTCRサブユニットがTCRγであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRδである、または前記第1のTCRサブユニットがTCRδであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRγである、
方法。
前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインと前記第1のTCRDとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含み、前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のTCRDとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、実施形態58に記載の方法。
前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニット由来の定常ドメインまたはその断片を個々に含む、実施形態59に記載の方法。
前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、実施形態60に記載の方法。
前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、Cα、Cβ、CγもしくはCδTCRドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、実施形態60に記載の方法。
前記標的抗原関連疾患ががんである、実施形態57から62のいずれか一項に記載の方法。
前記がんが、副腎皮質癌、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、結腸直腸がん、食道がん、グリア芽細胞腫、グリオーマ、肝細胞癌、頭頸部がん、腎臓がん、白血病、リンパ腫、肺がん、メラノーマ、中皮腫、多発性骨髄腫、膵臓がん、褐色細胞腫、形質細胞腫、神経芽細胞腫、卵巣がん、前立腺がん、肉腫、胃がん、子宮がんおよび甲状腺がんからなる群から選択される、実施形態63に記載の方法。
前記標的抗原関連疾患がウイルス感染症である、実施形態57から62のいずれか一項に記載の方法。
前記ウイルス感染症が、サイトメガロウイルス(CMV)、エプスタイン−バーウイルス(EBV)、B型肝炎ウイルス(HBV)、カポジ肉腫関連ヘルペスウイルス(KSHV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)、伝染性軟属腫ウイルス(MCV)、ヒトT細胞白血病ウイルス1(HTLV−1)、HIV(ヒト免疫不全ウイルス)およびC型肝炎ウイルス(HCV)からなる群から選択されるウイルスによって引き起こされる、実施形態65に記載の方法。
実施形態34〜47のいずれか1つに記載のエフェクター細胞について不均一な細胞集団を富化する方法であって、
a)不均一な細胞集団を、固体支持体に固定化された標的抗原と接触させて、固体支持体上の標的抗原に結合したエフェクター細胞の複合体を形成するステップ;および
b)不均一な細胞集団から複合体を分離し、それによって、エフェクター細胞について富化された細胞集団を生成するステップ
を含む方法。
実施形態1から30のいずれか一項に記載の複数のabTCRをコードする配列を含む核酸ライブラリー。
標的抗原に対して特異的なabTCRをコードする配列について、実施形態68に記載の核酸ライブラリーをスクリーニングする方法であって、
a)abTCRが複数のCD3+細胞の表面上で発現されるように、核酸ライブラリーを複数のCD3+細胞中に導入するステップ;
b)複数のCD3+細胞を、標識された標的抗原と共にインキュベートするステップ;
c)標識された標的抗原と結合したCD3+細胞を収集するステップ;および
d)ステップc)において収集した細胞から、abTCRをコードする配列を単離し、それによって、標的抗原に対して特異的なabTCRを同定するステップ
を含む方法。
細胞試料、細胞株および抗体
細胞株HepG2(ATCC HB−8065;HLA−A2+、AFP+)、SK−HEP−1(ATCC HTB−52;HLA−A2+、AFP−)、Raji(ATCC CCL−86;CD19+)、CA46(ATCC CRL−1648;CD19+)、Jurkat(ATCC CRL−2899、CD19−)、J.RT3−T3.5(ATCC TIB−153)、Jeko−1(ATCC CRL−3006;CD19+)、THP−1(ATCC TIB−202、CD19−)、Daudi(ATCC CCL−213;CD19+)、HeLa(ATCC CCL−2)、MDA−MB−231(ATCC HTB−26)およびMCF−7(ATCC HTB−22)は、American Type Culture Collectionから取得した。Jurkatは、T細胞白血病由来のヒトTリンパ球細胞株である。J.RT3−T3.5は、T細胞受容体β鎖を欠いているJurkat細胞由来変異株である。Rajiは、CD19を発現するBurkittリンパ腫細胞株である。Raji−CD19ノックアウト(Raji−CD19KO)株は、CRISPR技術によって生成された。3つの異なるガイド配列は、Raji細胞中のCD19を標的化するように設計された。CRISPR−Cas9ベクターはOrigeneから購入し、各ガイドは、pCas−Guideベクターに別々にクローニングした。電気穿孔法の3日後、各ガイドによるノックアウト効率をフローサイトメトリーによって評価し、最良のCD19ノックアウトプールを限界希釈によってクローン選択のために選択した。選択されたクローンを配列決定によって完全なCD19ノックアウトとして確認した。別の対照細胞株、SK−HEP−1−AFP−MGは、AFPペプチドAFP158(配列番号53)を発現するミニ遺伝子カセットを用いてSK−HEP−1細胞株を形質導入することによって生成し、AFP158/HLA−A*02:01複合体の高レベルの細胞表面発現を生じた。すべての細胞株を10%FBSおよび2mMグルタミンを補充したRPMI1640またはDMEMにおいて37℃/5%CO2で培養した。
抗体−T細胞受容体(abTCR)キメラ設計
4つの異なる抗体−T細胞受容体キメラ構築物(abTCR)設計(abTCR−3、abTCR−4、abTCR−5およびabTCR−6)を、企図されるバリエーションも含んで、図1Aおよび1Bに示す。これらの設計では、抗体Fab断片の重鎖(IgVH−IgCH1)および軽鎖(IgVL−IgCL)ドメインは、可変および定常ドメインを欠いており、T細胞表面上に発現され得るキメラ抗体−TCRヘテロ二量体を形成するようにそれらの接続ペプチド(定常ドメイン後の領域)のすべてまたは一部を含むT細胞受容体α/β鎖またはγ/δ鎖断片のアミノ末端に融合される。abTCR設計それぞれのIgVHおよびIgVLドメインは、抗原結合特異性を決定し、IgCH1およびIgCLと合わせてFab断片に似た構造を形成する。天然TCRでは、Vα/VβまたはVδ/VγドメインはTCRの抗原結合ドメインを形成する。これらの設計は、Vα−Cα/Vβ−CβまたはVδ−Cδ/Vγ−Cγ領域をIgVH−IgCH1またはIgVL−IgCLで置き換え、それによりCD3δε、CD3γεおよびCD3ζζなどの天然TCR複合体中のアクセサリ分子と会合する構築物の能力を維持しながら、構築物への抗体の結合特異性を付与している。これらの設計は、抗体の可変ドメインがTCR定常領域に連結され、Vα/Vβ領域だけをIgVH/IgVLで置き換えている、GrossおよびEshhar(Endowing T cells with antibody specificity using chimeric T cell receptors、FASEB J. 1992年(15巻):3370頁)によって記載されたcTCR設計とは異なっている。
T細胞株におけるabTCRの発現
成熟T細胞ではTCR−CD3複合体は、図2に示すとおり、無処置複合体を形成するように膜内および膜外接触を通じて会合すると考えられている4つの二量体モジュール:TCRαβ(またはTCRγδ)、CD3δε、CD3γεおよびCD3ζζからなる(Wucherpfennig KWら、Structural biology of the T-cell receptor: insights into receptor assembly, ligand recognition, and initiation of signaling. Cold Spring Harb Perspect Biol. 2010年4月;2巻(4号):a005140から)。複合体アセンブリは小胞体(ER)で生じる。完全なTCR−CD3複合体だけが、ゴルジ装置に移入され、グリコシル化工程を通り、T細胞の細胞膜に輸送される。不完全なTCRは、ゴルジから、それらが分解されるリソソームに方向付けられる。
5セットのabTCR構築物(abTCR−3、−4、−5、−6、−6MD)を、抗AFP158/HLA−A*02:01抗体のIgVHおよびIgVL領域を用いて生成した。J.RT3−T3.5およびJurkat細胞は、abTCR−3(配列番号23および24)、abTCR−4(配列番号25および26)、abTCR−5(配列番号29および30)、abTCR−6(配列番号33および34)またはabTCR−6MD(配列番号35および36)構築物を用いて形質導入し、abTCRの個々のサブユニットの発現を抗Flagまたは抗HA抗体を使用するウエスタンブロットにおいて検出した(図3)。各構築物について2つのサブユニットを2つの別々のレンチウイルスベクターにサブクローニングした。完全なabTCRヘテロ二量体を発現するために、T細胞を両方のベクターを用いて形質導入した。TCRβおよびTCRδキメラをHAを用いてタグ付けした一方で、TCRαおよびTCRγキメラはabTCRサブユニットのC末端に結合された3xFlagを用いてタグ付けした。HAまたは3xFlagタグを有するTCR鎖は、図3で各abTCR設計についての表示の下に括弧で示されている。
上に記載の5対のキメラabTCR鎖(abTCR−3、−4、−5、−6、−6MD)をJ.RT3−T3.5(図4A〜4C)およびJurkat(図5A〜5C)細胞に個々に形質導入した。abTCR構築物を用いて形質導入された細胞を、次の:(i)J.RT3−T3.5細胞でのCD3ε発現のレスキューを評価するための抗CD3ε抗体(図4A)、(ii)Jurkat細胞でのTCRαβの内因性発現へのabTCR構築物の影響を評価するための抗TCRαβ抗体(図5A)、(iii)形質導入abTCR構築物による抗原結合を評価するためのPE標識されたAFP158/HLA−A*02:01四量体(図4Bおよび5B)、ならびに(iv)キメラ構築物の表面発現を評価するためにabTCRキメラ(図4Cおよび5C)において使用された抗AFP158/HLA−A*02:01抗体に対する抗イディオタイプ抗体、によって評価した。
初代T細胞でのabTCRの発現
abTCR構築物をT細胞株に良好に形質導入でき、CD3複合体と共に機能性抗原結合受容体として細胞表面に発現できたことを実証し、次いで本発明者らは初代T細胞でのabTCRの発現を検査した。
末梢血リンパ球を健常ドナーから単離し、抗AFP158/HLA−A*02:01結合部分(配列番号35および36)をコードするabTCR−6MD構築物を用いて形質導入した。abTCRγおよびδサブユニットを初代ヒトT細胞を形質導入するために同じレンチウイルスベクターにサブクローニングした。形質導入の5日後、abTCR−T細胞および偽形質導入細胞をAFP158四量体ならびにCD4およびCD8抗体を用いて共染色し、フローサイトメトリーによって分析した。図7Aは、CD8対抗原(AFP158四量体)の結合の散布図を示しており、一方図7Bは、CD8対CD4の散布図を示している。偽形質導入T細胞ではCD4:CD8の比は、約2:1である(図7B上パネル)。同じCD4:CD8の比がabTCR−6MD構築物を用いて形質導入された細胞において観察された(図7B中央パネル)。本発明者らは、CD4:CD8の比がabTCR−6MD形質導入細胞中のAFP158四量体+集団においてもまた約2:1であることを見出した(図7B下パネルおよび図7Aでのゲーティングを参照のこと)。これは、abTCRキメラがCD4+およびCD8+初代T細胞の両方で発現され得ることを示している。
T細胞株におけるabTCR発現がJ.RT3−T3.5細胞でのCD3εの表面発現をレスキューできたと仮定して、本発明者らは初代T細胞において発現されたabTCR構築物がCD3複合体中の個々の鎖と物理的に会合するかどうかを共免疫沈降(co−ip)によって検査した。初代T細胞を抗CD3および抗CD28を使用して刺激し、次いで偽形質導入または、抗AFP158/HLA−A*02:01結合部分(配列番号35および36)をコードするabTCR−6MD構築物を用いて形質導入した。形質導入の12日後、abTCR−T細胞をAFP158四量体+細胞を富化させるためにSK−HEP−1−AFP−MGとさらに12日間共培養した。次いで細胞をジギトニン(0.1%)溶解緩衝液を用いて溶解し、抗Flag抗体を3xFlagタグを介してTCRγ鎖をi.p.するために使用した。図8に示すとおりCD3δ、CD3ε、CD3γおよびCD3ζ鎖をabTCRγキメラを用いて同時免疫沈降し、形質導入abTCRキメラが内因性CD3複合体と物理的に会合したことを実証した。抗Flag免疫沈降で偽形質導入試料において観察されたCD3εより大きなMWを有するバンドは、非特異的バンドである。
同じ抗AFP158/HLA−A*02:01可変ドメインを含有するabTCR−6MDおよびCAR構築物を用いて形質導入されたT細胞の生物学的活性の特徴付け
abTCR形質導入T細胞は抗原陽性がん細胞を特異的に殺滅し得る
初代T細胞を偽形質導入または、抗AFP158/HLA−A*02:01 scFv(配列番号37)を含有するCARもしくは同じ抗AFP158/HLA−A*02:01可変ドメイン(配列番号35および36)を含有するabTCR−6MDをコードするレンチウイルスベクターを用いて形質導入した。形質導入効率をPE標識されたAFP158/HLA−A*02:01四量体を用いる染色によって決定した(図9A)。同様の形質導入率(CARTについて32%およびabTCRについて34%)を有するT細胞集団をがん細胞株を殺滅するそれらの能力を検査するために使用した。2.5:1のエフェクターおよび標的の比で3つの細胞株を使用した:HepG2(AFP+/HLA−A2+)、SK−HEP−1(AFP−/HLA−A2+)およびSK−HEP−1−AFP−MG(AFPミニ遺伝子を用いて形質導入されたSK−HEP−1)。特異的溶解を16時間インキュベーション後に、Cytox 96 Non−radioactive Cytotoxicity Assay(Promega)を使用して測定した。図9Bに示すとおり、CARおよび、抗AFP158/HLA−A*02:01結合部分を有するabTCR−6MDの両方を用いて形質導入されたT細胞は、抗原陽性細胞株HepG2およびSK−HEP−1−AFP−MGの殺滅を方向付けたが、抗原陰性細胞株SK−HEP−1の殺滅はもたらさなかった。abTCR形質導入細胞において観察された特異的溶解のレベルは、CAR−T細胞についてのもとの同等である。
abTCR対CAR形質導入T細胞での生物学的活性をさらに特徴付けるために、本発明者らは、脱顆粒活性の測定としてCD107a表面発現を検出するためのフローサイトメトリーアッセイを使用した。抗AFP158/HLA*02:01結合部分を有するabTCRおよびCAR形質導入T細胞は、上のとおり生成され、HepG2、SK−HEP−1およびSK−HEP−1−AFP−MG細胞と4時間、抗CD107a抗体とprotein transport inhibitor cocktail(eBioscience)の1:200希釈物の存在下で同時インキュベートした。標的細胞との同時インキュベーション後、形質導入T細胞をAFP158/HLA四量体および抗CD8を用いて染色した。四量体陽性、CD8陽性T細胞での脱顆粒を図10右パネルに示す。CD107a発現によって測定された最も高いレベルの脱顆粒は、SK−HEP−1−AFP−MG(実線、灰色)に続くHepG2(点線、灰色)との同時インキュベーションで観察された一方で、脱顆粒はabTCRおよびCARの両方の形質導入T細胞を用いた親抗原陰性SK−HEP−1(実線、白色)では観察されなかった。同じ標的細胞が使用される場合に脱顆粒のレベルは、abTCRおよびCAR形質導入細胞の間で同様であった。これは、上記のT細胞媒介細胞溶解データと一致する。合わせて考えて本発明者らは、abTCR形質導入T細胞が脱顆粒において抗原陽性がん細胞に対してCAR形質導入細胞と同等に応答性であり(図10)、細胞殺滅を媒介する(図9)ことを実証した。
abTCRまたはCARのいずれかを用いて形質導入され、同様の形質導入率を有するT細胞を生成し、上記のとおり標的細胞と同時インキュベートした。図9Bに示すin vitro殺滅アッセイ後のIL−2、IL−4、IL−6、IL−8、IL−10、GM−CSF、IFN−γおよびTNF−αの培地への放出をMagpix multiplex system(Luminex)をBio−plex Pro Human Cytokine 8−plex Assay(BioRad)と共に使用して測定した。アッセイの検出限界に達するようにSK−HEP−1−AFP−MG標的反応由来の上清は25倍希釈したが、他のすべての試料は希釈しなかった。サイトカイン濃度を、培地、標的単独およびエフェクター単独由来のサイトカイン放出を減算した後に公知の標準曲線を用いて決定した。
抗原刺激の際にabTCRおよびCAR形質導入細胞上に発現される消耗マーカーのレベルを検討するために、CD3+T細胞をEasySep Human T Cell Isolation Kit(StemCell Technologies)を使用してPBMC富化全血から調製し、上記のとおりCD3/CD28 Dynabeadsを用いて活性化させた。活性化および拡大増殖させた細胞集団は、フローサイトメトリーによって>99%CD3+であった。次いでこれらの細胞を抗AFP158/HLA−A*02:01 scFv(配列番号37)を含有するCARまたは同じ抗AFP158/HLA−A*02:01可変ドメイン(配列番号35および36)を含有するabTCR−6MDをコードするレンチウイルスベクターを用いて7〜9日間形質導入した。形質導入細胞をエフェクターおよび標的の比2.5:1で標的細胞と16時間共培養し、AFP158四量体および抗CD8抗体を消耗マーカーPD−1、TIM−3またはLAG−3に対する抗体と共に用いて共染色した。形質導入T細胞上の消耗マーカーのレベルを四量体+(即ち、形質導入された)T細胞でのゲーティングによってフローサイトメトリーによって分析した。独立したフローサイトメトリー実験では、本発明者らはCD8−であった四量体+T細胞がCD4+であった(データ示さず)ことを決定した。
抗AFP158 abTCRがin vitro拡大増殖の際にT細胞の分化を遅延させ得るかどうかを決定するために、本発明者らは、3つのT細胞分化マーカー、メモリーT細胞マーカーCCR7およびCD28、ならびに最終分化マーカー、グランザイムBの細胞表面発現を測定した。抗AFP158/HLA−A*02:01 scFv(配列番号37)を含有するCARまたは同じ抗AFP158/HLA−A*02:01可変ドメイン(配列番号35および36)を含有するabTCR−6MDをコードするレンチウイルスベクターを用いてT細胞を形質導入し、これらのマーカーに対する抗体を用いて染色し、フローサイトメトリーによってウイルス形質導入後10〜12日目に分析した(図15)。結果は、CD4+およびCD8+T細胞の両方についてabTCR T細胞がCAR T細胞よりも多くのCCR7およびCD28を発現したが、グランザイムBは少なかったことを示し、抗AFP158 abTCR T細胞がin vitroでのT細胞拡大増殖後に抗AFP158 CAR T細胞よりも分化していないことを示唆している。
抗AFP158/HLA−A*02:01 abTCR−6MDを発現するように形質導入された初代T細胞の細胞増殖を同じ抗体可変ドメインを有する抗AFP158/HLA−A*02:01 abTCR−7を用いて形質導入されたT細胞のものと比較した。6.7×105T細胞を0日目に100U/ml IL−2の存在下でαCD3/αCD28ビーズ(1:1の割合)によって活性化させた。活性化T細胞を抗AFP158/HLA−A*02:01 abTCR−6MD(配列番号35のアミノ酸配列を有するTCRδキメラサブユニットおよび配列番号36のアミノ酸配列を有するTCRγキメラサブユニット)をコードするレンチウイルスベクターまたは、抗AFP158/HLA−A*02:01 abTCR−7(配列番号81のアミノ酸配列を有するTCRδキメラサブユニットおよび配列番号82のアミノ酸配列を有するTCRγキメラサブユニット)をコードするレンチウイルスベクターのいずれかでMOI4で1日目に形質導入した。次いで形質導入T細胞を培養し、IL−2の存在下で9〜10日間拡大増殖させた。細胞数を1日目、5日目、7日目および9日目に計数した。図16Aに示すとおりabTCR−6−MD形質導入T細胞は、9日目までにおよそ2倍の生細胞を有して、abTCR−7形質導入T細胞よりも早く増殖した。形質導入T細胞でのabTCR−6MDおよびabTCR−7構築物の発現を9日目にFLAGタグ付き構築物についてのウエスタンブロット分析によって評価した。簡潔に述べると、500万形質導入T細胞を100μl溶解緩衝液に溶解し、可溶化物13μlをNuPage systemを使用して4〜12%ポリアクリルアミドゲル上で分離した。マウス抗FLAG抗体(1μg/ml)をabTCRガンマ鎖を検出するために使用し、マウス抗CD3ゼータ(1μg/ml)を内因性CD3を検出するために使用した。図16Bに示すとおりabTCR−7構築物は、abTCR−6MD構築物よりも高いレベルで発現された。対応する抗CD3ζバンドで標準化した可溶化物についての抗FLAGバンドの強度をImageJソフトウェアを使用して定量し、abTCR−6MDと比較したabTCR−7の発現の20%の相対的増加を示した。
abTCR−6MDおよび、同じ抗ヒトCD19可変ドメインを有するCAR構築物を用いて形質導入されたT細胞の生物学的活性の特徴付け
実施例4では、使用された抗体部分は抗原としてペプチド/MHC複合体に結合するTCR模倣物であった。abTCR設計が伝統的抗体標的(細胞表面抗原)とも作用することを実証するために、同様の実験設定をヒトCD19に対する抗体に基づいた構築物を使用して実行した。
初代T細胞を偽形質導入または、抗CD19結合ドメインを含有するCAR(配列番号44、IgVHドメインを有するscFv、配列番号45、およびIgVLドメイン、配列番号46を含む、例示的抗CD19抗体由来)または同じ抗CD19可変ドメインを含有するabTCR−6MD(配列番号42および43)をコードするレンチウイルスベクターを用いて形質導入した。CARまたはabTCR(両方とも形質導入率25%)を用いて形質導入されたT細胞をB細胞株JeKo−1(CD19+)、IM9(CD19+)、Jurkat(CD19−)およびTHP−1(CD19−)を、エフェクターおよび標的の比5:1で殺滅するそれらの能力を検査するために使用した。特異的殺滅のレベルを図9Bについての記載と同じ方法を使用して16時間で測定した。図17に示すとおり、抗CD19結合部分を有するCARおよびabTCR−6MDの両方はCD19陽性JeKo−1およびIM9細胞の殺滅を同様のレベルで方向付けたが、CD19陰性であるJurkatおよびTHP−1は殺滅しなかった。
上記がん殺滅実験において使用されたものと同じ形質導入されたT細胞集団を標的細胞としてのJeKo−1、IM9、THP−1およびJurkatとそれらとを共インキュベートすることによるサイトカイン放出アッセイにおいて使用した。8つのヒトサイトカインのパネル(IL−2、IL−4、IL−6、IL−8、IL−10、GM−CSF、IFN−γ、TNF−α)を16時間後に測定した。検査したすべてのサイトカインは、CD19+標的細胞との共インキュベーションの際にCAR形質導入T細胞の培地中で検出されたが、CD19−細胞ではされなかった(図18Aおよび18B)。abTCR形質導入T細胞を用いた共インキュベーション試料では、IL−10を除く検査したすべてのサイトカインの放出は、CD19+細胞を含むabTCR試料において低かった。抗CD19抗体構築物でのこれらの発見は、抗AFP158/HLA−A*02:01抗体構築物のものと同様であり:同様のがん細胞殺滅がCAR−TおよびabTCR形質導入細胞において観察された一方で、サイトカイン放出のレベルはabTCR形質導入T細胞が使用された場合に低かった。これは、高レベルのサイトカイン放出が望ましくない生理学的作用を生じる設定においてabTCRを使用することに有利である可能性がある。
抗原刺激の際に抗CD19 abTCRおよびCAR形質導入細胞で発現される消耗マーカーのレベルを抗AFP158キメラ受容体について上に記載のとおり決定した。細胞をクローン5−13 abTCR−6MDまたは同じ抗CD19可変ドメインを含有するCARを用いて形質導入した。標的細胞株は、Raji(CD19+)、Raji−CD19KO(CD19−)およびJeko−1(CD19+)を含んだ。検査条件下で各消耗マーカーについて陽性の細胞のパーセントを決定し、表3に示す。
抗CD19 abTCRがin vitro拡大増殖の際にT細胞の分化を遅延させ得るかどうかを決定するために、本発明者らは、3つのT細胞分化マーカー、メモリーT細胞マーカーCCR7およびCD28、ならびに最終分化マーカー、グランザイムBの細胞表面発現を測定した。T細胞をクローン 5−13abTCR−6MDまたは同じ抗CD19可変ドメインを有するCARを用いて形質導入し、これらのマーカーに対する抗体を用いて染色し、フローサイトメトリーによってウイルス形質導入後10〜12日目に分析した(図20)。結果は、CD4+およびCD8+T細胞の両方についてabTCR T細胞がCAR T細胞よりも多くのCCR7およびCD28を発現したが、グランザイムBは少なかったことを示し、クローン5−13 abTCR T細胞がin vitroでのT細胞拡大増殖後に対応する CAR T細胞よりも分化していないことを示唆しており、抗AFP158キメラ受容体について観察されたものと一致していた。
abTCR T細胞があまり分化しておらず、CAR T細胞よりも高い増殖能力を有するかどうかをさらに決定するために、本発明者らは抗原陽性がん細胞とのエンゲージメント後のabTCRおよびCAR T細胞のCFSE蛍光、細胞分割の指標における変化をモニターした。T細胞をクローン5−13 abTCR−6MDまたは同じ抗CD19可変ドメインを有するCARを用いたウイルス形質導入10日後にCFSE色素を用いて標識し、ベースライン蛍光をフローサイトメトリーによって記録した。標識T細胞をRaji細胞(CD19+がん細胞株)とサイトカイン不含有培地中でインキュベートした。CFSE蛍光を2日目および3日目にCD4+およびCD8+T細胞についてフローサイトメトリーによって測定した(図21)。2日目と3日目の間のCFSE蛍光強度の減少は、細胞増殖の量を示し、CAR T細胞よりもabTCR T細胞において顕著に高く、クローン5−13 abTCR T細胞が対応するCAR T細胞よりも多くの細胞分割を受けていることを示している。
T細胞表面abTCRとCARとの内部移行率を比較するために、T細胞をクローン5−13 abTCR−6MDまたは、同じ抗CD19可変ドメインを含有するCARを用いて形質導入し、CypHer5E、酸性pH6.5で蛍光を発するPH感受性色素を用いて標識した抗CD19結合部分を認識する抗イディオタイプ抗体を用いて氷上、30分間染色した。次いで細胞を37℃で表示の時間インキュベートし、固定し、粒度およびキメラ受容体発現についてフローサイトメトリーによって分析した(図22、Y軸は側方散乱、X軸はCypHer5E染色)。結果は、ほとんどすべてのCARが染色後90分までに内部移行されたことを示している。対照的にabTCRは、ずっと低い率で内部移行され、大部分のabTCRは90分間でさえ細胞表面上に残っていた。
抗CD19 abTCR−6MDを発現するように形質導入された初代T細胞の細胞増殖を同じ抗体可変ドメインおよび膜貫通ドメインを有するがTCRδおよびTCRγポリペプチド由来の定常領域を含む抗CD19キメラ構築物(cTCR)を用いて形質導入されたT細胞のものと比較した。6.7×105個のT細胞を0日目に100U/ml IL−2の存在下でαCD3/αCD28ビーズ(1:1の割合)によって活性化させた。活性化T細胞を抗CD19 abTCR−6MD(配列番号56のアミノ酸配列を有するTCRδキメラサブユニットおよび配列番号54のアミノ酸配列を有するTCRγキメラサブユニット)をコードするレンチウイルスベクターまたは、抗CD19 cTCR(配列番号75のアミノ酸配列を有するTCRδキメラサブユニットおよび配列番号76のアミノ酸配列を有するTCRγキメラサブユニット)をコードするレンチウイルスベクターのいずれかでMOI4で1日目に形質導入した。次いで形質導入T細胞を培養し、IL−2の存在下で9〜10日間拡大増殖させた。細胞数を1日目、5日目、7日目および9日目に計数した。図23Aに示すとおりabTCR形質導入T細胞は、9日目に1.7倍超の生細胞数を有して、cTCR形質導入T細胞よりも早く増殖した。
abTCR−6MDおよび、同じ抗NY−ESO−1/HLA−A*02:01可変ドメインを有するCAR構築物を用いて形質導入されたT細胞の生物学的活性の特徴付け
抗NY−ESO−1/HLA−A*02:01 abTCR形質導入T細胞はNY−ESO−1陽性がん細胞を殺滅し得る
初代T細胞を偽形質導入または、CARもしくは、配列番号73のアミノ酸配列を有するIgVLドメインおよび配列番号72のアミノ酸配列を有するIgVHドメインを含む抗NY−ESO−1/HLA−A*02:01結合部分を含有するabTCR−6MDのいずれかを発現するように形質導入した。CARは、N−末端からC末端までを有するscFv、IgVLドメイン、リンカー(配列番号74)およびIgVHドメインを含んだ。CARまたはabTCRを用いて形質導入されたT細胞は、フローサイトメトリーによってアッセイされたとおりそれらのそれぞれのキメラ受容体を同様のレベルで発現し、エフェクターおよび標的の比5:1で細胞株IM9(HLA−A2+、NY−ESO−1+)、Colo205(HLA−A2+、NY−ESO−1−)、MDA−231(HLA−A2+、NY−ESO−1−)、MCF7(HLA−A2+、NY−ESO−1−)、JeKo−1(HLA−A2+、NY−ESO−1+)、Raji(HLA−A2+、NY−ESO−1−)、Hep1(HLA−A2+、NY−ESO−1−)およびJurkat(HLA−A2+、NY−ESO−1−)を殺滅するそれらの能力を検査するために使用した。特異的殺滅のレベルを上の記載と同じ方法を使用して16時間で測定した。図24に示すとおり、CARおよび、抗NY−ESO−1/HLA−A*02:01結合部分を有するabTCR−6MDの両方がNY−ESO−1陽性JeKo−1およびIM9細胞の殺滅を同様のレベルで方向付けたが、NY−ESO−1陰性である他の細胞は殺滅させなかった。
上記がん殺滅実験において使用したものと同じ形質導入T細胞集団を、それらをIM9、Colo205、MDA−231、MCF7、JeKo−1、Hep1およびJurkat細胞と共インキュベーションすることによってサイトカイン放出アッセイにおいて使用した。4つのヒトサイトカイン(IL−2、GM−CSF、IFN−γ、TNF−α)のパネルを16時間後に測定した。検査したすべてのサイトカインは、NY−ESO−1+標的細胞との共インキュベーションの際にCARおよびabTCR形質導入T細胞の培地で検出されたが、大部分のNY−ESO−1−細胞ではされなかった(データ示さず)。重要なことにabTCR形質導入T細胞共インキュベーションによって検査したNY−ESO−1+標的細胞の大部分から放出されたサイトカインのレベルは、CAR形質導入T細胞共インキュベーションによるものより顕著に低かった(データ示さず)。
abTCR−6MD構築物を用いて形質導入されたナチュラルキラーT(NKT)細胞および制御性T(Treg)細胞の生物学的活性の特徴付け
抗CD19 abTCR形質導入NKT細胞
ビオチン抗体カクテルおよび抗ビオチンマイクロビーズを用いる非CD3+/CD56+細胞(非NKT細胞)の間接磁気標識化によってNKT細胞をヒトPBMCから単離し、CD3+/CD56+NKT細胞について富化するために非NKT細胞を枯渇させた。富化NKT細胞集団についてCD3およびCD56の表面発現をフローサイトメトリーによって評価し、図25Aに示す。NKT細胞を抗CD3/抗CD28ビーズによって活性化し、抗CD19 abTCRをコードするレンチウイルスを用いて形質導入し、10%FBSおよびIL−2(100U/ml)を含有するRPMI−1640中で拡大増殖させた。形質導入効率は、抗CD19結合部分に特異的な抗イディオタイプ抗体を用いるフローサイトメトリーによって測定して80%超であった。NKT細胞をCD19発現RajiまたはRaji CD19−ノックアウト(CD19ko)がん細胞株とエフェクターおよび標的の比5:1で16時間共インキュベートし、培地中のサイトカイン放出(IL−2、GM−CSF、IFNγ、TNFα)の測定が続いた(図25B)。抗CD19 abTCR形質導入NKT細胞は、CD19−陽性Raji細胞とインキュベートされた場合に、検査したそれぞれのサイトカインを放出するが、CD19陰性Raji CD19ko細胞とインキュベートされた場合には放出しないように活性化されたが、偽形質導入NKT細胞はされず、CD19抗原を含む形質導入されたabTCRのがん細胞への結合を通じてNKT細胞が特異的に活性化され得ることを示している。
Treg細胞をCD4+/CD25+Treg細胞の直接磁気標識化によってヒトPBMCから単離した。単離されたTreg細胞集団についてCD4およびCD25の表面発現をフローサイトメトリーによって評価し、図26Aに示す。Treg細胞を抗CD3/抗CD28ビーズによって活性化し、抗CD19 abTCRをコードするレンチウイルスを用いて形質導入し、10%FBSおよびIL−2(100U/ml)を含有するRPMI−1640中で拡大増殖させた。形質導入効率は、抗CD19結合部分に特異的な抗イディオタイプ抗体を用いるフローサイトメトリーによって測定して80%であった。Treg細胞をCD19発現RajiまたはRaji CD19−ノックアウト(CD19ko)がん細胞株とエフェクターおよび標的の比5:1で16時間共インキュベートし、培地中のIL−10サイトカイン放出の測定が続いた(図26B)。抗CD19 abTCR形質導入Treg細胞は、CD19陽性Raji細胞とインキュベートされた場合にIL−10を放出するが、CD19陰性Raji CD19ko細胞とインキュベートされた場合には放出しないように活性化されたが、偽形質導入Treg細胞はされず、CD19抗原を含む形質導入abTCRのがん細胞への結合を通じてTreg細胞が特異的に活性化され得ることを示している。
異なる抗体重鎖定常ドメインを有するabTCRを用いて形質導入されたT細胞の生物学的活性の特徴付け
先の実施例ではabTCR構築物において使用された抗体部分は、配列番号39のアミノ酸配列を有するIgG1 CH1ドメインを含有した。abTCR設計が他の免疫グロブリン重鎖由来のCH1ドメインとも作用することを実証するために、標的細胞殺滅アッセイをIgG1(配列番号39)、IgG2(配列番号60、61もしくは62)、IgG3(配列番号63)またはIgG4(配列番号64)のいずれか由来のCH1ドメインを有する抗AFP158/HLA−A*02:01抗体に基づく構築物を使用して上に記載のとおり実行した。abTCRを用いて形質導入されたT細胞を表面発現の指標としてAFP158四量体結合についてアッセイし(表4)、HepG2(AFP+/HLA−A2+)、SK−HEP−1(AFP−/HLA−A2+)およびSK−HEP−1−AFP−MG(AFPミニ遺伝子を用いて形質導入されたSK−HEP−1)細胞を殺滅するそれらの能力について検査した。特異的溶解を16時間インキュベーション後にCytox 96 Non−radioactive Cytotoxicity Assay(Promega)を使用して測定した。図27に示すとおり、抗AFP158/HLA−A*02:01結合部分を有するabTCRのいずれかを用いて形質導入されたT細胞は、抗原陽性細胞株HepG2およびSK−HEP−1−AFP−MGの殺滅を方向付けたが、抗原陰性細胞株SK−HEP−1の殺滅はもたらさなかった。重要なことに、非IgG1 CH1ドメイン含有abTCRの表面発現はIgG1 CH1含有abTCRと比較して低かったが(表4を参照のこと)、それらは同様のレベルの標的細胞殺滅を生じ、それらの機能特性が増強されていることを示唆している。
共刺激ドメイン含有abTCRを用いて形質導入されたT細胞の生物学的活性の特徴付け
C末端共刺激ドメインを含むabTCR設計の実現可能性を実証するために、種々の抗AFP158/HLA−A*02:01 abTCR構築物をCD28および/または4−1BB由来の共刺激断片を使用して設計した(図28)。abTCRは、配列番号36のアミノ酸配列を含有するTCRγキメラサブユニットおよび配列番号35のアミノ酸配列を含有するTCRδキメラサブユニットからなった。CD28共刺激ドメインを有するabTCRサブユニットは、それらのC末端に融合した配列番号70のアミノ酸配列を有し、4−1BB共刺激ドメインを有するサブユニットはそれらのC末端に融合した配列番号71のアミノ酸配列を有した。abTCR構築物をJ.RT3−R3.5細胞に形質導入し、abTCR発現およびCD3表面発現レスキューをフローサイトメトリーを使用して上に記載のとおりアッセイした。結果を表5に要約する。abTCRの発現およびCD3発現をレスキューするそれらの能力は、共刺激ドメインを含むまたは含まない種々のabTCR構築物の間で同様であった。別の実験では初代T細胞を、abTCR構築物を用いて形質導入し、フローサイトメトリーによってCD8発現およびAFP158四量体結合についてアッセイした(表6)。abTCRを用いて形質導入された初代T細胞をAFP158四量体結合およびCD4またはCD8発現のいずれかについてゲーティングし、フローサイトメトリーによってCCR7、CD45RA、CD28およびグランザイムBの発現についてアッセイした(表7)。これらの結果は、ウイルス形質導入および形質導入されたT細胞の分化が共刺激ドメインを含むまたは含まない種々のabTCR構築物間で同様であることを示している。標的細胞殺滅アッセイをabTCR構築物を使用して上に記載のとおり実行した。abTCRを用いて形質導入されたT細胞をHepG2(AFP+/HLA−A2+)、SK−HEP−1(AFP−/HLA−A2+)およびSK−HEP−1−AFP−MG(AFPミニ遺伝子を用いて形質導入されたSK−HEP−1)細胞を殺滅するそれらの能力についてアッセイした。図29に示すとおり、abTCRのいずれかを用いて形質導入されたT細胞は、抗原陽性細胞株HepG2およびSK−HEP−1−AFP−MGの殺滅を方向付けたが、抗原陰性細胞株SK−HEP−1の殺滅はもたらさなかった。
abTCR形質導入T細胞のin vivo有効性研究
ヒト肝細胞癌異種移植モデルでの抗AFP158/HLA−A*02:01抗体についてのin vivo抗腫瘍性活性
抗AFP158/HLA−A*02:01結合部分(配列番号35および36)を含有するabTCR−6MD構築物を用いて形質導入されたT細胞のin vivo抗腫瘍性活性をSCID−beigeマウスにおいてSK−HEP−1−AFP−MGの皮下(s.c.)モデルを使用して検査した。SK−HEP−1−AFP−MG細胞をSCID−beigeマウスの右側腹部にマウス1匹あたり5×106細胞s.c.移植した。平均腫瘍体積が100mm3に達したら、動物を腫瘍体積に基づいて:(i)偽形質導入T細胞および(ii)abTCR形質導入T細胞、を受ける2つの群にランダム化した(1群あたりマウス8匹)。動物をランダム化の直後にマウス1匹あたり107の偽またはabTCR形質導入を2週間ごとに1回、3回用量で静脈注射(i.v.)によって処置した。マウスを全身健康状態、有害応答の可能性およびある場合は腫瘍体積の変化について注意深くモニターした。偽およびabTCR形質導入T細胞の両方が現在の用量およびスケジュールを十分に許容した。投薬に関連する体重変化は、研究全体を通じて観察されなかった(図33)。SK−HEP−1−AFP−MG腫瘍は偽またはabTCR形質導入T細胞のi.v.投与後に継続して増殖したが、abTCR形質導入T細胞で処置した腫瘍の増殖速度は偽T処置腫瘍と比較して減速した。図34Aに示すとおり、腫瘍増殖曲線の分離は、投薬開始後20日目に始まった。31日目に、abTCR形質導入T細処置腫瘍において23%増殖阻害が観察された(t検定、p=0.018)。
CARおよび、例示的抗hCD19抗体結合部分を含むabTCRを用いて形質導入されたT細胞のin vivo抗腫瘍性活性をNOD SCIDガンマ(NSG)マウスにおけるCD19陽性ヒトリンパ腫異種移植モデルにおいて検査する。Raji−luc−GFP細胞をComparative Biosciences,Inc.(Sunnyville、California 94085)から購入し、RPMI培地+10%FBSおよび1%L−グルタミンにおいて37℃、5%CO2を用いた加湿雰囲気中で培養する。Raji−luc−GFP細胞は、CD19陽性バーキットリンパ腫細胞株、Raji由来であり、ホタルルシフェラーゼ(luc)および緑色蛍光タンパク質の両方をコードする二重レポーター遺伝子を用いる安定トランスフェクション後に、生物発光画像法を使用してin vivoで追跡可能な細胞を生じる。NSGマウスをJackson Laboratories(Bar Harbor、ME USA 04609)から購入し、実験の前に少なくとも7日間順化させる。Raji−luc−GFP細胞をPBSに再懸濁し、NSGマウスに尾静脈を通じて1×106細胞/100μl/マウスで静脈内(i.v.)移植する。腫瘍移植5日後、動物をXenogen IVIS imaging systemを使用して腫瘍負荷の評価のために画像化する。マウスを光子発光に基づいて6.7×105光子の平均光子発光で次の4つの群にランダム化する(n=1群あたりマウス6匹):(i)無処置、(ii)偽形質導入ヒトT細胞、(iii)抗CD19 CAR−T処置、および(iv)抗hCD19 abTCR T細胞処置。ランダム化の直後に動物を偽または抗CD19 CAR−T細胞を用いてマウス1匹あたり107細胞の用量で、2週間ごとに1回、3回用量で、i.v.で処置する。
Raji B細胞リンパ腫Raji−luc−GFP細胞をNSGマウスに上に記載のとおり移植した。次いでマウスにクローン5−13 abTCR−6MD(配列番号56および54のアミノ酸配列を含む抗CD19クローン5−13結合部分を有するabTCR−6MD)を用いて形質導入された5×106個のabTCR+T細胞、クローン5−13 CAR(抗CD19クローン5−13結合部分を有するCAR)を用いて形質導入された5×106個のCAR+T細胞、または5×106個の偽T細胞を、注射試料あたりマウス8匹の群に注射した。血清をT細胞移植24時間後に収集し、血清中のヒトサイトカインの濃度をLuminex Magpix machineを使用して上に記載のとおり測定した。サイトカイン測定結果を図36に示す。腫瘍負荷を既に記載のとおりルシフェラーゼ活性によって測定し、結果を図37(定量)および27(画像法)に示す。
例示的抗hCD19抗体結合部分を含有するCARまたはabTCRを用いて形質導入されたT細胞のin vivo抗腫瘍性活性をNSGマウスでのCD19陽性ヒト白血病異種移植モデルにおいて検査した。NALM−6−luc−GFP細胞は、Memorial Sloan Kettering Cancer CenterのEric Smithの研究室からの贈与であり、RPMI培地+10%FBS中、37℃、5%CO2を用いた加湿雰囲気中で培養した。NALM−6−luc−GFP細胞は、CD19陽性急性リンパ性白血病細胞株、NALM−6由来であり、ホタルルシフェラーゼ(luc)および緑色蛍光タンパク質の両方をコードする二重レポーター遺伝子を用いる安定トランスフェクション後に、生物発光画像法を使用してin vivoで追跡可能な細胞を生じる。NSGマウスをJackson Laboratories(Bar Harbor、ME USA 04609)から購入し、実験の前に少なくとも3日間順化させる。NALM−6−luc−GFP細胞をPBSに再懸濁し、6〜8週齢メスNSGマウス30匹に尾静脈を通じて5×105細胞/100μl/マウスで静脈内(i.v.)移植する。腫瘍移植4日後、動物をXenogen IVIS imaging systemを使用して腫瘍負荷の評価のために画像化した。マウスを光子発光に基づいて次の4群にランダム化した:(i)ビヒクル、PBSのみ(n=マウス6匹);(ii)10×106個の偽形質導入ヒトT細胞(n=マウス6匹);(iii)5×106個のクローン5−13 CAR T細胞(抗CD19クローン5−13結合部分を有するCARを用いて形質導入されたT細胞)(n=マウス8匹);ならびに(iv)5×106個のクローン5−13 abTCR−6MD T細胞(配列番号56および54のアミノ酸配列を含む抗CD19クローン5−13結合部分を有するabTCR−6MDを用いて形質導入されたT細胞)(n=マウス8匹)。
Claims (69)
- 標的抗原に特異的に結合する抗体−T細胞受容体(TCR)キメラ分子(abTCR)であって、
a)VHおよびCH1抗体ドメインを含む第1の抗原結合ドメインと第1のTCRサブユニットの第1の膜貫通ドメインを含む第1のT細胞受容体ドメイン(TCRD)とを含む第1のポリペプチド鎖;ならびに
b)VLおよびCL抗体ドメインを含む第2の抗原結合ドメインと第2のTCRサブユニットの第2の膜貫通ドメインを含む第2のTCRDとを含む第2のポリペプチド鎖
を含み、
前記第1の抗原結合ドメインの前記VHおよびCH1ドメインと前記第2の抗原結合ドメインの前記VLおよびCLドメインとが、前記標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュールを形成し、
前記第1のTCRDと前記第2のTCRDとが、少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュールをリクルートすることが可能なT細胞受容体モジュール(TCRM)を形成する、
abTCR。 - 前記抗原結合モジュールが、前記CH1ドメイン中の残基と前記CLドメイン中の残基との間のジスルフィド結合を含む、請求項1に記載のabTCR。
- 前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインと前記第1のTCRDとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含む、請求項1または2に記載のabTCR。
- 前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のTCRDとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、請求項1から3のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第1のペプチドリンカーおよび/または前記第2のペプチドリンカーが個々に、約5〜約50アミノ酸長である、請求項3または4に記載のabTCR。
- 前記標的抗原が細胞表面抗原である、請求項1から5のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記細胞表面抗原が、タンパク質、炭水化物および脂質からなる群から選択される、請求項6に記載のabTCR。
- 前記細胞表面抗原が、CD19、ROR1、ROR2、BCMA、GPRC5DまたはFCRL5である、請求項7に記載のabTCR。
- 前記標的抗原が、ペプチドと主要組織適合複合体(MHC)タンパク質とを含む複合体である、請求項1から5のいずれか一項に記載のabTCR。
- 標的抗原に特異的に結合するabTCRであって、
a)VH抗体ドメインを含む第1の抗原結合ドメインと第1のTCRサブユニットの第1の膜貫通ドメインを含む第1のTCRDとを含む第1のポリペプチド鎖;および
b)VL抗体ドメインを含む第2の抗原結合ドメインと第2のTCRサブユニットの第2の膜貫通ドメインを含む第2のTCRDとを含む第2のポリペプチド鎖
を含み、
前記第1の抗原結合ドメインの前記VHドメインと前記第2の抗原結合ドメインの前記VLドメインとが、前記標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュールを形成し、
前記第1のTCRDと前記第2のTCRDとが、少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュールをリクルートすることが可能なT細胞受容体モジュール(TCRM)を形成し、
前記標的抗原が、ペプチドとMHCタンパク質とを含む複合体である、
abTCR。 - 前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインと前記第1のTCRDとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含み、前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のTCRDとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、請求項10に記載のabTCR。
- 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニット由来の定常ドメインまたはその断片を個々に含む、請求項11に記載のabTCR。
- 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、請求項12に記載のabTCR。
- 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、Cα、Cβ、CγもしくはCδTCRドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、請求項12に記載のabTCR。
- 前記第1のTCRDが、前記第1の膜貫通ドメインのN末端側に、TCRサブユニットの第1の接続ペプチドまたはその断片をさらに含む、請求項1から14のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第2のTCRDが、前記第2の膜貫通ドメインのN末端側に、TCRサブユニットの第2の接続ペプチドまたはその断片をさらに含む、請求項1から15のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記TCRMが、前記第1の接続ペプチド中の残基と前記第2の接続ペプチド中の残基との間のジスルフィド結合を含む、請求項15または16に記載のabTCR。
- 前記第1のTCRDが、前記第1の膜貫通ドメインのC末端側に、TCR細胞内配列を含む第1のTCR細胞内ドメインをさらに含む、請求項1から17のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第2のTCRDが、前記第2の膜貫通ドメインのC末端側に、TCR細胞内配列を含む第2のTCR細胞内ドメインをさらに含む、請求項1から18のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の膜貫通ドメインのC末端側に、共刺激細胞内シグナル伝達配列を含む第1のアクセサリ細胞内ドメインをさらに含む、請求項1から19のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の膜貫通ドメインのC末端側に、共刺激細胞内シグナル伝達配列を含む第2のアクセサリ細胞内ドメインをさらに含む、請求項1から20のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインのN末端側に、第1のシグナル伝達ペプチドをさらに含む、請求項1から21のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインのN末端側に、第2のシグナル伝達ペプチドをさらに含む、請求項1から22のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記標的抗原複合体中の前記ペプチドが、WT−1、AFP、HPV16−E7、NY−ESO−1、PRAME、EBV−LMP2A、HIV−1およびPSAからなる群から選択されるタンパク質に由来する、請求項9から23のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記分子が、約0.1pM〜約500nMの平衡解離定数(Kd)で前記標的抗原に結合する、請求項1から24のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記TCR関連シグナル伝達モジュールが、CD3δε、CD3γεおよびζζからなる群から選択される、請求項1から25のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第1のTCRサブユニットがTCRα鎖であり、前記第2のTCRサブユニットがTCRβ鎖である、請求項1から26のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第1のTCRサブユニットがTCRβ鎖であり、前記第2のTCRサブユニットがTCRα鎖である、請求項1から26のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第1のTCRサブユニットがTCRγ鎖であり、前記第2のTCRサブユニットがTCRδ鎖である、請求項1から26のいずれか一項に記載のabTCR。
- 前記第1のTCRサブユニットがTCRδ鎖であり、前記第2のTCRサブユニットがTCRγ鎖である、請求項1から26のいずれか一項に記載のabTCR。
- 請求項1から30のいずれか一項に記載のabTCRの前記第1および第2のポリペプチド鎖をコードする核酸(複数可)。
- 請求項1から30のいずれか一項に記載のabTCRと、CD3δε、CD3γεおよびζζからなる群から選択される少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュールとを含む複合体。
- 前記abTCRとCD3δε、CD3γεおよびζζとを含む八量体である、請求項32に記載の複合体。
- 請求項1から30のいずれか一項に記載のabTCRまたは請求項32もしくは33に記載の複合体をその表面上に提示するエフェクター細胞。
- 請求項31に記載の核酸(複数可)を含むエフェクター細胞。
- 前記第1のTCRサブユニットおよび/または前記第2のTCRサブユニットを発現しない、請求項34または35に記載のエフェクター細胞。
- a)前記第1のTCRサブユニットがTCRαであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRβであり;または
b)前記第1のTCRサブユニットがTCRβであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRαであり;
前記エフェクター細胞がγδT細胞である、請求項36に記載のエフェクター細胞。 - a)前記第1のTCRサブユニットがTCRγであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRδであり;または
b)前記第1のTCRサブユニットがTCRδであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRγであり;
前記エフェクター細胞がαβT細胞である、請求項36に記載のエフェクター細胞。 - 第1の内因性TCRサブユニットおよび/または第2の内因性TCRサブユニットの発現を遮断するまたは減少させるように改変されている、請求項34から36のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
- a)前記第1のTCRサブユニットがTCRαであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRβであり;または
b)前記第1のTCRサブユニットがTCRβであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRαであり;
前記エフェクター細胞が、TCRαおよび/またはTCRβの発現を遮断するまたは減少させるように改変されたαβT細胞である、請求項39に記載のエフェクター細胞。 - a)前記第1のTCRサブユニットがTCRγであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRδであり;または
b)前記第1のTCRサブユニットがTCRδであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRγであり;
前記エフェクター細胞が、TCRγおよび/またはTCRδの発現を遮断するまたは減少させるように改変されたγδT細胞である、請求項39に記載のエフェクター細胞。 - CD3+細胞である、請求項34から41のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
- 前記CD3+細胞が、細胞傷害性T細胞、ヘルパーT細胞、ナチュラルキラーT細胞およびサプレッサーT細胞からなる群から選択される、請求項42に記載のエフェクター細胞。
- a)第1のプロモーターの制御下の前記abTCRの前記第1のポリペプチド鎖をコードする第1の核酸配列を含む第1のベクターと、b)第2のプロモーターの制御下の前記abTCRの前記第2のポリペプチド鎖をコードする第2の核酸配列を含む第2のベクターとを含む、請求項34から43のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
- a)第1のプロモーターの制御下の前記abTCRの前記第1のポリペプチド鎖をコードする第1の核酸配列と;b)第2のプロモーターの制御下の前記abTCRの前記第2のポリペプチド鎖をコードする第2の核酸配列とを含むベクターを含む、請求項34から43のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
- a)前記abTCRの前記第1のポリペプチド鎖をコードする第1の核酸配列と;b)前記abTCRの前記第2のポリペプチド鎖をコードする第2の核酸配列とを含むベクターを含み、前記第1および第2の核酸配列が、単一のプロモーターの制御下にある、請求項34から43のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
- 前記abTCRの前記第1のポリペプチド鎖の発現が、前記abTCRの前記第2のポリペプチド鎖の発現とは、2倍よりも大きく異なる、請求項34から45のいずれか一項に記載のエフェクター細胞。
- 標的抗原を提示する標的細胞を死滅させる方法であって、前記標的細胞を、請求項34から47のいずれか一項に記載のエフェクター細胞と接触させるステップを含み、前記abTCRが、前記標的抗原に特異的に結合する、方法。
- 標的抗原を提示する標的細胞を死滅させる方法であって、前記標的細胞を、前記標的抗原に特異的に結合するabTCRを含むエフェクターαβT細胞と接触させるステップを含み、前記abTCRが、
a)VH抗体ドメインを含む第1の抗原結合ドメインと第1のTCRサブユニットの第1の膜貫通ドメインを含む第1のTCRDとを含む第1のポリペプチド鎖;および
b)VL抗体ドメインを含む第2の抗原結合ドメインと第2のTCRサブユニットの第2の膜貫通ドメインを含む第2のTCRDとを含む第2のポリペプチド鎖
を含み、
前記第1の抗原結合ドメインの前記VHドメインと前記第2の抗原結合ドメインの前記VLドメインとが、前記標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュールを形成し、
前記第1のTCRDと前記第2のTCRDとが、少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュールをリクルートすることが可能なT細胞受容体モジュール(TCRM)を形成し、
前記第1のTCRサブユニットがTCRγであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRδである、または前記第1のTCRサブユニットがTCRδであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRγである、
方法。 - 前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインと前記第1のTCRDとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含み、前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のTCRDとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、請求項49に記載の方法。
- 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニット由来の定常ドメインまたはその断片を個々に含む、請求項50に記載の方法。
- 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、請求項51に記載の方法。
- 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、Cα、Cβ、CγもしくはCδTCRドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、請求項51に記載の方法。
- 前記接触させるステップがin vivoである、請求項48から53のいずれか一項に記載の方法。
- 前記接触させるステップがin vitroである、請求項48から53のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項1から30のいずれか一項に記載のabTCR、請求項31に記載の核酸(複数可)、または請求項34から47のいずれか一項に記載のエフェクター細胞と、薬学的に許容されるキャリアとを含む医薬組成物。
- それを必要とする個体において標的抗原関連疾患を処置する方法であって、前記個体に、有効量の、請求項51に記載の医薬組成物を投与するステップを含む方法。
- それを必要とする個体において標的抗原関連疾患を処置する方法であって、前記個体に、有効量の、前記標的抗原に特異的に結合するabTCRを含むエフェクターαβT細胞を含む組成物を投与するステップを含み、前記abTCRが、
a)VH抗体ドメインを含む第1の抗原結合ドメインと第1のTCRサブユニットの第1の膜貫通ドメインを含む第1のTCRDとを含む第1のポリペプチド鎖;および
b)VL抗体ドメインを含む第2の抗原結合ドメインと第2のTCRサブユニットの第2の膜貫通ドメインを含む第2のTCRDとを含む第2のポリペプチド鎖
を含み、
前記第1の抗原結合ドメインの前記VHドメインと前記第2の抗原結合ドメインの前記VLドメインとが、前記標的抗原に特異的に結合する抗原結合モジュールを形成し、
前記第1のTCRDと前記第2のTCRDとが、少なくとも1つのTCR関連シグナル伝達モジュールをリクルートすることが可能なT細胞受容体モジュール(TCRM)を形成し、
前記第1のTCRサブユニットがTCRγであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRδである、または前記第1のTCRサブユニットがTCRδであり、前記第2のTCRサブユニットがTCRγである、
方法。 - 前記第1のポリペプチド鎖が、前記第1の抗原結合ドメインと前記第1のTCRDとの間に第1のペプチドリンカーをさらに含み、前記第2のポリペプチド鎖が、前記第2の抗原結合ドメインと前記第2のTCRDとの間に第2のペプチドリンカーをさらに含む、請求項58に記載の方法。
- 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、免疫グロブリンまたはT細胞受容体サブユニット由来の定常ドメインまたはその断片を個々に含む、請求項59に記載の方法。
- 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、CH1、CH2、CH3、CH4もしくはCL抗体ドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、請求項60に記載の方法。
- 前記第1および/または第2のペプチドリンカーが、Cα、Cβ、CγもしくはCδTCRドメイン、またはそれらの断片を個々に含む、請求項60に記載の方法。
- 前記標的抗原関連疾患ががんである、請求項57から62のいずれか一項に記載の方法。
- 前記がんが、副腎皮質癌、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、結腸直腸がん、食道がん、グリア芽細胞腫、グリオーマ、肝細胞癌、頭頸部がん、腎臓がん、白血病、リンパ腫、肺がん、メラノーマ、中皮腫、多発性骨髄腫、膵臓がん、褐色細胞腫、形質細胞腫、神経芽細胞腫、卵巣がん、前立腺がん、肉腫、胃がん、子宮がんおよび甲状腺がんからなる群から選択される、請求項63に記載の方法。
- 前記標的抗原関連疾患がウイルス感染症である、請求項57から62のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ウイルス感染症が、サイトメガロウイルス(CMV)、エプスタイン−バーウイルス(EBV)、B型肝炎ウイルス(HBV)、カポジ肉腫関連ヘルペスウイルス(KSHV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)、伝染性軟属腫ウイルス(MCV)、ヒトT細胞白血病ウイルス1(HTLV−1)、HIV(ヒト免疫不全ウイルス)およびC型肝炎ウイルス(HCV)からなる群から選択されるウイルスによって引き起こされる、請求項65に記載の方法。
- 請求項34から47のいずれか一項に記載のエフェクター細胞について不均一な細胞集団を富化する方法であって、
a)前記不均一な細胞集団を、前記標的抗原またはその中に含まれる1つもしくは複数のエピトープを含むリガンドと接触させて、前記リガンドに結合した前記エフェクター細胞の複合体を形成するステップ;および
b)前記不均一な細胞集団から前記複合体を分離し、それによって、前記エフェクター細胞について富化された細胞集団を生成するステップ
を含む方法。 - 請求項1から30のいずれか一項に記載の複数のabTCRをコードする配列を含む核酸ライブラリー。
- 標的抗原に対して特異的なabTCRをコードする配列について、請求項68に記載の核酸ライブラリーをスクリーニングする方法であって、
a)前記abTCRが複数の細胞の表面上で発現されるように、前記核酸ライブラリーを前記複数の細胞中に導入するステップ;
b)前記複数の細胞を、前記標的抗原またはその中に含まれる1つもしくは複数のエピトープを含むリガンドと共にインキュベートするステップ;
c)前記リガンドに結合した細胞を収集するステップ;および
d)ステップc)において収集した細胞から、前記abTCRをコードする配列を単離し、それによって、前記標的抗原に対して特異的なabTCRを同定するステップ
を含む方法。
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