Y-STR 마커 목록
List of Y-STR markers다음의 Y-STR 표시자 목록은 법의학[1] 및 계보학 DNA 테스트에서 일반적으로 사용된다.
다이즈454는 가장 다양성이 낮고, 다중 카피 마커 다이즈464는 가장 다양한 Y-STR 마커다.
번호가 매겨진 Y-STR 마커의 Y-크롬의 위치는 대략 세포유전적 국산화(cytogenetic localization)로 지정할 수 있다. 예를 들어, DISS449는 Yp11.2에 위치하며, Y-크롬, 쁘띠 암, 밴드 1, 서브밴드 1, 서브 서브밴드 2, - DISS449를 의미한다.[2]
포렌식 랩은 보통 12개 또는 17개의 Y-STR을 검사하는 PowerPlex Y(Promega Corporation)와 Yfiler(응용 바이오 시스템) 키트를 사용한다. 족보 DNA 검사실은 최대 700개의 Y-STR을 검사한다.
돌연변이율
돌연변이 발생률은 챈들러(2006)에서 추정된 세대당 변화율이다.[3] 인용된 추정 오차는 일반적으로 +/- 15-20%이다. 관찰된 혈통의 대체 추정치(포렌식 사용을 위해 모든 마커가 포함되지는 않음)도 Y염색체 해플로타입 참조 데이터베이스에서 이용할 수 있다.
일부 트리뉴클레오티드 표지는 다른 표식보다 어떤 반복적인 길이에서 훨씬 더 높은 돌연변이율을 가질 수 있는 것으로 보인다. 예를 들어, 트리뉴클레오티드 DIS388의 변동은 일반적으로 11-13 값을 취할 때 대부분의 하플로그룹에서 매우 느리다. 그러나 Happlogroup J에는 훨씬 더 큰 변동과 더 빠른 돌연변이가 있는 것으로 보이며, 여기서 일반적으로 값은 14-18이다. 마찬가지로 트리뉴클레오티드 다이제392는 Happlogroup N과 Q에서 "빠른" 것으로 보고되며, 다른 그룹에서는 드물게 14-16 값을 취한다.[4]
Y-STR 마커
| STR | 메모들 | DNA 서열 모티브를 반복하다 | 고집을 부리다 | 돌연변이율 | 링크스 |
|---|---|---|---|---|---|
| DIS19=14 | DIS394 참조 | — | — | — | — |
| 다이즈385 | DIS385는 다중 카피 마커로, DIS385a와 DIS385b를 포함한다. DIS385a와 DIS385b의 순서는 뒤바꿀 수 있으며, 그 순서를 키틀러 순서라고 한다. | GAAA | 13-18 | 0.00226 | NIST 팩트 시트 |
| 다이즈388 | ATT | 17 | 0.00022 [5] | ||
| 다이즈389 | DIS389는 다중 카피 마커로, DIS389i와 DIS389ii를 포함한다. DIS389ii는 DIS389의 총 길이를 가리킨다. 따라서 DIS389i에 1단계 돌연변이가 생기면 DIS389i에도 나타나게 된다. | (TCTG)(TCTA)(TCTG)(TCTA) | i:13 2시 30분 | 0.00186, 0.00242 | NIST 팩트 시트 |
| DIS390 | (TCTA)(TCTG) | 23 | 0.00311 | NIST 팩트 시트 | |
| DIS391 | TCTA | 11 | 0.00265 | NIST 팩트 시트 | |
| DIS392 | TAT | 11 | 0.00052 [5] | NIST 팩트 시트 | |
| DIS393 | DIS393은 DIS395로도 알려져 있다. | AGAT | 12 | 0.00076 | NIST 팩트 시트 |
| DIS394 | DIS394는 DIS19로도 알려져 있다. | 타가 | 14 | 0.00151 | NIST 팩트 시트 |
| 다이스413 | Y DNA의 Palindromic 부위에서 발견됨 | 21-22 | |||
| 다이스425 | DIS425는 측정할 수 있을 때 매우 안정적이다. 그러나 실제로는 다중 부품 표식기 DYF371(아래)의 한 복사본이며, 이와 같이 recLOH 돌연변이는 종종 다른 복사본이 덮어쓸 때 측정할 수 없게 만들 수 있다. 예를 들어, SNP M284가 이 마커에서 null 값을 렌더링할 수 있기 때문에 I-M38(I2a2a1a1a1; 이전의 I1b2a1)에 대한 SNP 정의와 관련이 있다. E-M96과 서브클레이드의 대부분의 멤버도 null 값을 렌더링한다. 그럼에도 불구하고, 그것은 원래 옥스포드 조상이 제공한 적은 수의 표식 중 하나였고, 패밀리 트리 DNA는 나중에 그것을 족보학자들에게도 제공하는 것을 선택했다. | TGT | 12 | [5] | |
| 다이스426 | GTT | 11 | 0.00009 [5] | NIST 팩트 시트 | |
| 다이스434 | TAAT(CTAT) | 9 | NIST 팩트 시트 | ||
| DIS435 | TGGA 11 | ||||
| 다이스436 | GTT | 12 | [5] | ||
| 다이스437 | TCTA | 14 | 0.00099 | NIST 팩트 시트 | |
| 다이스438 | TTTTC | 10 | 0.00055 | NIST 팩트 시트 | |
| 다이즈439 | DYS439는 Y-GATA-A4로도 알려져 있다. DIS439는 Haplogroup R1b1c9a에 대한 SNP 정의와 관련이 있는데, SNP는 이 마커에서 null 값을 렌더링할 수 있기 때문이다. | AGAT | 12 | 0.00477 | NIST 팩트 시트 |
| 다이즈441 | CCTT | 15 | 새로운 멀티플렉스 PCR 시스템 | ||
| 다이즈442 | TATC | 11 | 0.00324 | 새로운 멀티플렉스 PCR 시스템 | |
| 다이즈443 | TTCC 0 | ||||
| 다이즈444 | 타가 | 11 | 새로운 멀티플렉스 PCR 시스템 | ||
| 다이스445 | TTA | 11 | 새로운 멀티플렉스 PCR 시스템 | ||
| 다이즈446 | TCTCT | 14 | 소렌슨 마커 디테일 | ||
| 다이즈447 | 타아와 | 26 | 0.00264 | NIST 팩트 시트 | |
| 다이즈448 | 아가갓 | 20 | 0.00135 | NIST 팩트 시트 | |
| 다이즈449 | TTC | 25 | 0.00838 | 소렌슨 마커 디테일 | |
| 다이즈450 | TTTTA | 8 | |||
| 다이즈452 | 야택 | 29 | |||
| 다이즈453 | AAAT | 0 | |||
다이즈454 | DIS454는 계보학적 DNA 테스트에서 일반적으로 사용되는 Y-STR 마커 중 가장 변화가 적은 것이다. Ybase의 DIS454 출품작 중 96%는 11회, 3%는 10회, 2%는 12회(출처)를 가지고 있다. | AAAT | 11 | 0.00016 | |
| 다이즈455 | AAAT | 11 | 0.00016 | 소렌슨 마커 디테일 | |
| 다이즈456 | AGAT | 14 | 0.00735 | 소렌슨 마커 디테일 | |
| 다이즈458 | GAAA | 18 | 0.00814 | 소렌슨 마커 디테일 | |
| 다이즈459 | 이것은 다중 카피 마커로, DIS459a와 DIS459b를 포함한다. | TAAA | 8-9 | 0.00132 | |
| 다이스460 | DYS460은 원래 Y-GATA-A7.1로 알려져 있었다. | 아타그 | 10 | 0.00402 | NIST 팩트 시트 |
| 다이스461 | DYS461은 원래 Y-GATA-A7.2로 알려져 있었다. | (TAGA) 카가 | 11 | NIST 팩트 시트 | |
| 다이스462 | TATG | 11 | |||
| 다이스463 | 아아그 | 22 | |||
다이스464 | DIS464는 다중 카피 팔린드로믹 마커다. 남성은 일반적으로 DYS464a, DYS464b, DYS464c, DYS464d와 같은 경우에 알려진 4개의 복사본을 가지고 있다. 사본은 4부 미만이거나 그 이상이 될 수 있는데, 이 경우 DIS464e, DIS464f 등으로 알려져 있다. DYS464는 Y-STR 마커(소스) 중에서 가장 다양한 범위의 값이다. 이 마커는 분해능을 높이기 위해 별도의 g형식과 c형식으로 입력되기도 한다. 유형 분산은 대부분의 R1b happlogroup 남성에게서 찾을 수 있는 SNP에 기초한다. Y DNA의 팔린드로믹 부위의 일부분이다. | CCTT | 12-14-16-17 | 0.00566 | 멀티코피 Y-STR 마커 DYS464의 법의학적 값 |
| 다이스481 | CTT | 26 | [5] | ||
| 다이즈485 | TTA | 15 | [5] | ||
| 다이즈487 | ATT | 13 | [5] | ||
| 다이스490 | TTA | 12 | [5] | ||
| 다이스494 | TAT | 9 | [5] | ||
| 다이스495 | AAT | 15 | [5] | ||
| 다이스497 | TAT | 15 | [5] | ||
| 다이즈504 | 14 | ||||
| 다이즈505 | TCCT | 13 | |||
| 다이즈508 | TATC | 0 | |||
| 다이스518 | AAG | 0 | NIST 통신. 키트 | ||
| 다이스520 | 아타스 | 21 | |||
| 다이즈522 | 가타 | 13 | |||
| 다이스525 | 타가 | 10 | |||
| DIS531 | AAAT | 11 | |||
| 다이제532 | CTT | 10 | |||
| 다이스533 | ATCT | 11 | |||
| 다이스534 | CTT | 15 | |||
| 다이스540 | TTAT | 11 | |||
| 다이스549 | AGAT | 13 | |||
| 다이즈556 | AATA | 12 | |||
| 다이즈557 | TTC | 18 | |||
| 다이스565 | TAAA | 11 | |||
| 다이스570 | TTC | 12-23 | 0.00790 | ||
| DIS572 | AAAT | 12 | |||
| DIS573 | TTA | 0 | |||
| 다이즈575 | AAAT | 8-12 | |||
| 다이즈576 | AAG | 17 | 0.01022 | ||
| DIS578 | AAAT | 8 | |||
| 다이스589 | TATT | 11 | |||
| 다이스590 | TTTG | 8 | |||
| 다이제스594 | 타아 | 10 | |||
| 다이즈607 | AAG | 14 | 0.00411 | ||
| DIS612 | |||||
| DIS614 | |||||
| DIS626 | AAG | ||||
| DIS627 | AAG | 0 | NIST 통신. 키트 | ||
| DIS632 | CATT | 8 | |||
| DIS635 | Y-GATA-C4라고도 한다. | TSTA 화합물 | 21 | 0.0046 | NIST 팩트 시트 |
| DIS636 | 11 | ||||
| DIS638 | TTA | 11 | |||
| DIS641 | TAAA | 10 | |||
| 다이즈643 | CTTT | 9 | |||
| DIS710 | GAAA | 36 | |||
| DIS714 | TTTTC | 25 | |||
| DIS716 | CCATT | 27 | |||
| DIS717 | TGTAT | 20 | |||
| DIS724 | 팔린드로믹(CDY)이라고도 함 | 33-35 | 0.03531 | ||
| DIS725 | 팔린드로믹 | ||||
| DIS726 | 심막색 부위의 YSTR 표식기 | 12 | |||
| DYF371 | DYF371은 다코피, 팔린드로믹 지역 표식이다. DIS425 마커를 포함하며, 해당 마커에서 null 값이 발생할 경우 정보를 제공할 수 있다. | 12 | |||
| DYF385S1 | DIS459에 근접하여 YSTR 마커가 중복됨 | 8-9 | |||
| DYF387S1 a/b | RAG | 0 | NIST 통신. 키트 | ||
| DYF397 | DYF397은 팔린드로믹 지역 표식이다. | ||||
DYF399 | 비대칭 3개 alle STR locus는 Y염색체의 팔린드로믹 영역에서 삭제 및 재조합 재배열을 관찰하는 데 사용할 수 있다. | 17-29 (불완전한 많은 대립) | 명명법 | ||
| DYF401 | DYF401은 팔린드로믹 지역 표식이다. | ||||
| DYF406S1 | 11 | ||||
| DYF408 | DYF408은 팔린드로믹 지역 표식이다. | ||||
| DYF411 | DYF411은 팔린드로믹 지역 표식이다. | ||||
| DXYS156 | |||||
| YCAII | YCAII는 YCA를 포함하는 다중 카피 마커다.IIA & YCAIIB | 22-22 | 0.00123 | ||
| Y-가타-H4 | 타가 | 10 | 0.00208 | NIST 팩트 시트 | |
| Y-가타-C4 | DIS635 참조 | ||||
| Y-가타-A10 | 타가 | 14 | NIST 팩트 시트 | ||
| Y-GAAT-1B07 | 11 |
Y-STR alle 명명법
DNA 테스트 회사나 실험실은 동일한 Y-STR 얼레를 지정하기 위해 서로 다른 명칭을 사용한다. 따라서 이러한 경우에 전환이 적용되어 서로 다른 기업에서 얻은 Y-STR 결과를 정확하게 비교해야 한다. 가장 일반적인 명칭은 역사적으로 여러 회사가 다르게 보고한 Y-STR 마커에 대해 NIST가 제공한 지침에 기초한다. NIST 표준은 유전자 계보 회사를 위한 국제유전계보학회(ISOGG)의 제안이다.[6][7]
참고 및 참조
- ^ "Interview with John Butler and Members of the NIST Human Identity Project Team". JoGG. Retrieved 11 August 2012.
- ^ GDB 인간 게놈 데이터베이스의 DIS449
- ^ Chandler(2006) (그러나 이 메일링 목록 설명 참조)
- ^ "GENEALOGY-DNA-L Archives — DYS 388 Mutation Rate?". Archived from the original on 2007-10-03. Retrieved 2007-02-27.
- ^ a b c d e f g h i j k l 트리뉴클레오티드 - #Mutation rate 참조
- ^ "Marker Standards". Sorenson Molecular Genealogy Foundation. Archived from the original on 21 July 2012. Retrieved 11 August 2012.
- ^ Matthiesen, Diana Gale (19 July 2011). "Converting Y-DNA STR Test Results between SMGF, AncestryDNA, and FamilyTreeDNA". Retrieved 11 August 2012.
- 케이서 외 (2004), 인간 Y-크로모소말 마이크로위성 종합조사 Am. J. hum. 지네, 74 1183-1197. NB 온라인 전용 데이터 파일
- Krahn, Thomas. "Y-STR fingerprint - Panels" (PDF). Price List DNA-Fingerprint - Genealogy Testing Services. Retrieved 11 August 2012.
- Butler, John M. (9 January 2012). "Y-Chromosome STRs". Short Tandem Repeat DNA. NIST Standard Reference Database SRD 130. Retrieved 11 August 2012.
- Butler, John; Kline, Decker (2009-06-29). "Summary List of Y Chromosome STR Loci and Available Fact Sheets". NIST Standard Reference Database SRD 130. Retrieved 11 August 2012.
