Le Palace de Combat est accessible après avoir battu le Conseil 4 de Hoenn. Il fait partie de la Zone de Combat. Pour s'y rendre la première fois, il faut prendre le ferry le Marina à Nénucrique ou Poivressel. Le défi du Palace de Combat est de gagner 7 combats d'affilée. Cependant, ce sont les Pokémon qui choisissent eux-mêmes leurs attaques.
Le joueur doit inscrire trois Pokémon pour le tournoi.
Le joueur doit vaincre sept Dresseurs consécutivement pour gagner.
Les Pokémon ne gagnent pas de points d'expérience pendant les combats.
Le joueur a le choix entre deux styles de combat :
le style « Niveau 50 » est ouvert aux Pokémon dont le niveau est de 50 ou moins. Tous les Dresseurs auront des Pokémon de niveau 50.
le style « Niveau libre » est ouvert à tous les Pokémon, il n'y a pas de limite de niveau. Le niveau des Pokémon des adversaires sera celui du plus puissant Pokémon du joueur. Cependant, aucun des Dresseurs affrontés n'aura de Pokémon d'un niveau inférieur à 60.
Le joueur a le choix entre deux modes :
Le mode « Solo » où un Pokémon se bat contre un Pokémon.
Le mode « Duo » où deux Pokémon se battent ensemble contre deux Pokémon dans un Combat Duo.
L'usage d'objet est interdit pour le Dresseur.
Les objets tenus sont autorisés, mais deux Pokémon inscrits ne peuvent pas porter un même objet.
Si le jeu est éteint sans sauvegarder pendant un challenge, le joueur est disqualifié.
Le joueur enchaîne sept combats de suite. Le principe est simple : le Dresseur n'a qu'à choisir si le Pokémon attaque, laisse sa place à un autre ou abandonne. Le Pokémon choisit ses attaques par lui-même. Il agira différemment selon sa nature et le nombre de PV qui lui reste. Voici quelques possibilités :
Mewtwo
Mew
Lugia
Ho-Oh
Celebi
Kyogre
Groudon
Rayquaza
Jirachi
Deoxys
Tengalice
Jungko
Florizarre
Scarhino
Hélédelle
Kaorine