PTPRC

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
PTPRC
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PTPRC, B220, CD45, CD45R, GP180, L-CA, LCA, LY5, T200, protein tyrosine phosphatase, receptor type C, protein tyrosine phosphatase receptor type C
Зовнішні ІД OMIM: 151460 MGI: 97810 HomoloGene: 2126 GeneCards: PTPRC
Пов'язані генетичні захворювання
неспецифічний виразковий коліт[1]
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001267798
NM_002838
NM_080921
NM_080922
NM_001111316
NM_001268286
NM_011210
RefSeq (білок)
NP_001254727
NP_002829
NP_563578
NP_563578.2
NP_002829.3
NP_001104786
NP_001255215
NP_035340
Локус (UCSC) Хр. 1: 198.64 – 198.76 Mb Хр. 1: 137.99 – 138.1 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PTPRC (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 304 амінокислот, а молекулярна маса — 147 254[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MYLWLKLLAFGFAFLDTEVFVTGQSPTPSPTGLTTAKMPSVPLSSDPLPT
HTTAFSPASTFERENDFSETTTSLSPDNTSTQVSPDSLDNASAFNTTGVS
SVQTPHLPTHADSQTPSAGTDTQTFSGSAANAKLNPTPGSNAISDVPGER
STASTFPTDPVSPLTTTLSLAHHSSAALPARTSNTTITANTSDAYLNASE
TTTLSPSGSAVISTTTIATTPSKPTCDEKYANITVDYLYNKETKLFTAKL
NVNENVECGNNTCTNNEVHNLTECKNASVSISHNSCTAPDKTLILDVPPG
VEKFQLHDCTQVEKADTTICLKWKNIETFTCDTQNITYRFQCGNMIFDNK
EIKLENLEPEHEYKCDSEILYNNHKFTNASKIIKTDFGSPGEPQIIFCRS
EAAHQGVITWNPPQRSFHNFTLCYIKETEKDCLNLDKNLIKYDLQNLKPY
TKYVLSLHAYIIAKVQRNGSAAMCHFTTKSAPPSQVWNMTVSMTSDNSMH
VKCRPPRDRNGPHERYHLEVEAGNTLVRNESHKNCDFRVKDLQYSTDYTF
KAYFHNGDYPGEPFILHHSTSYNSKALIAFLAFLIIVTSIALLVVLYKIY
DLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRL
FLAEFQSIPRVFSKFPIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGD
AGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVDDFWRMIWEQKATVIVMVT
RCEEGNRNKCAEYWPSMEEGTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNK
KEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVH
CSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENKVDVYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQY
ILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLP
SYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSD
ESSDDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQ
RKVKVIVMLTELKHGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLR
VFELRHSKRKDSRTVYQYQYTNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLPQKN
SSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTGIFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVK
ALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVKKNNHQEDKIEFDNEV
DKVKQDANCVNPLGAPEKLPEAKEQAEGSEPTSGTEGPEHSVNGPASPAL
NQGS

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз. Локалізований у мембрані.

Література

[ред. | ред. код]
  • Streuli M., Hall L.R., Saga Y., Schlossman S.F., Saito H. (1987). Differential usage of three exons generates at least five different mRNAs encoding human leukocyte common antigens. J. Exp. Med. 166: 1548—1566. PMID 2824653 DOI:10.1084/jem.166.5.1548
  • Tsai A.Y.M., Streuli M., Saito H. (1989). Integrity of the exon 6 sequence is essential for tissue-specific alternative splicing of human leukocyte common antigen pre-mRNA. Mol. Cell. Biol. 9: 4550—4555. PMID 2531281 DOI:10.1128/MCB.9.10.4550
  • Charbonneau H., Tonks N.K., Walsh K.A., Fischer E.H. (1988). The leukocyte common antigen (CD45): a putative receptor-linked protein tyrosine phosphatase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 7182—7186. PMID 2845400 DOI:10.1073/pnas.85.19.7182
  • Wu L., Fu J., Shen S.-H. (2002). SKAP55 coupled with CD45 positively regulates T-cell receptor-mediated gene transcription. Mol. Cell. Biol. 22: 2673—2686. PMID 11909961 DOI:10.1128/MCB.22.8.2673-2686.2002
  • Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
  • Nam H.J., Poy F., Saito H., Frederick C.A. (2005). Structural basis for the function and regulation of the receptor protein tyrosine phosphatase CD45. J. Exp. Med. 201: 441—452. PMID 15684325 DOI:10.1084/jem.20041890

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з PTPRC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9666 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, P08575 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]