Prijeđi na sadržaj

RecBCD

Izvor: Wikipedija
Eksodezoksiribonukleaza V
Identifikatori
EC broj 3.1.11.5
CAS broj 37350-26-8
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA entry
ExPASy NiceZyme view
KEGG KEGG entry
MetaCyc metabolic pathway
PRIAM profile
PDB RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Kristalografiska struktura RecBCD enzima (1W36).[1] RecB, RecC, i RecD podjedinice enzima su obojene ljubičasto, zeleno, i margenta, dok je delimično odvijen DNK heliks za koji je enzim vezan obojen smeđe.

RecBCD (EC 3.1.11.5, Escherichia coli eksonukleaza V, E. coli eksonukleaza V, gen recBC endoenzim, RecBC dezoksiribonukleaza, gen recBC DNaza, eksonukleaza V, gen recBCD enzimi) je enzim E. coli bakterije koji inicira rekombinantnu popravku potencijalno letalnog prekida dvolančane DNK koji može da bude posledica izlaganju jonizirajućoj radijaciji, replikacionih grešaka, endonukleaza, oksidativnog oštećenja, i niza drugih faktora.[2] RecBCD enzim je helikaza koja odvija, ili razdvaja DNK lance, kao i nukleaza koja preseca jednolančanu DNK.[1] Ovaj enzim katalizuje sledeću hemijsku reakciju

Eksonukleolitičko razlaganje (u prisustvu ATP) u bilo 5'- ka 3'- ili 3'- ka 5'- smeru čime se formiraju 5'-fosfooligonukleotidi

Struktura

[uredi | uredi kod]

Enzimski kompleks se sastoji od tri različite podjedinice: RecB, RecC, i RecD i stoga se kompleks naziva RecBCD. Pre otkrića recD gena,[3] ovaj enzim je bio poznat kao RecBC. Svaka podjedinica je kodirana zasebnim genom:

gen lanac protein funkcija
RecB beta P08394 3'-5' helikaza, nukleaza
RecC gama P07648 prepoznaje Chi (engl. Crossover Hotspot Instigator)
RecD alfa P04993 5'-3' helikaza

Reference

[uredi | uredi kod]
  1. 1,0 1,1 Singleton MR, Dillingham MS, Gaudier M, Kowalczykowski SC, Wigley DB (November 2004). „Crystal structure of RecBCD enzyme reveals a machine for processing DNA breaks”. Nature 432 (7014): 187–93. DOI:10.1038/nature02988. PMID 15538360. 
  2. Spies M, Kowalczykowski SC (2003). „Homologous recombination by RecBCD and RecF pathways”. u: Higgins P. Bacterial Chromosomes. Washington, D.C: ASM Press. str. 389–403. ISBN 1-55581-232-5. 
  3. Amundsen SK, Taylor AF, Chaudhury AM, Smith GR (August 1986). recD: the gene for an essential third subunit of exonuclease V.”. Proc Natl Acad Sci U S A. 83 (15): 5558–62. DOI:10.1073/pnas.83.15.5558. PMC 386327. PMID 3526335. 

Literatura

[uredi | uredi kod]

Spoljašnje veze

[uredi | uredi kod]