TW202313972A - 新nrg1融合物、融合接合處及檢測彼等之方法 - Google Patents
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Abstract
本揭露係有關神經調節蛋白1 (NRG1)融合物的領域、檢測這類融合物的方法、鑑定或診斷具有這類融合物之患者的方法、以及治療包含有NRG1融合物之癌症、腫瘤或異常細胞的方法。此外,本揭露係有關用於治療患有包含有NRG1融合物之ErbB-2/ErbB-3陽性癌症之個體的治療性(人類)抗體領域。
Description
本揭露係有關神經調節蛋白1 (NRG1)融合物的領域、檢測這類融合物的方法、鑑定或診斷具有這類融合物之患者的方法、以及治療包含有NRG1融合物之癌症、腫瘤或異常細胞的方法。此外,本揭露係有關用於治療患有包含有NRG1融合物之ErbB-2/ErbB-3陽性癌症之個體的治療性(人類)抗體領域。
跨膜NRG1同功型之胞外結構域的蛋白分解處理會釋放可溶性因子。HRG1-β1係其中一種由NRG1基因編碼的蛋白質。NRG1含有Ig結構域及EGF樣結構域,該EGF樣域對於直接結合至受體酪胺酸激酶ErbB-3及ErbB-4而言是必要的。NRG1基因及同功型異形體已知有許多不同的別名,諸如:神經調節蛋白1 (Neuregulin 1);Pro-NRG1;HRGA;SMDF;HGL;GGF;NDF;NRG1內切轉錄2 (Intronic Transcript 2,不編碼蛋白質);Heregulin, α (45kD, ERBB2 P185-活化子);乙醯膽鹼受體誘導活性(Acetylcholine Receptor-Inducing Activity);原神經調節蛋白-1 (Pro-Neuregulin-1),為膜結合同功異形體;感覺及運動神經元衍生因子;新分化因子(Neu Differentiation Factor);神經膠質生長因子2;NRG1-IT2;MSTP131;MST131;ARIA;GGF2;HRG1;及HRG。NRG1基因的外部Id為HGNC: 7997;Entrez Gene: 3084;Ensembl: ENSG00000157168;OMIM: 142445及UniProtKB: Q02297。
NRG1之同功異形體係藉由選擇性剪接製造,且包括跨膜、外部膜結合、脫落(shed)、分泌、或胞內的形式(Falls之Exp Cell Res 284: 14–30, 2003; Hayes及Gullick之J. Mammary Gland Biol Neoplasia 13: 205-214, 2008)。彼等係結合至ErbB-3或ErbB-4,這可理解為促進與ErbB-2 (HER2)形成異二聚體。雖然通常將NRG1編碼蛋白視為有絲分裂原(mitogen),但其亦可強力促進細胞凋亡:尤其是在細胞中表現NRG1可造成該表現細胞的細胞凋亡(查閱Weinstein等人之oncogene 17: 2107–2113, 1998)。
鑒於各種不同具有NRG1融合的腫瘤類型,基於新的融合伴隨體以及NRG1與融合伴隨體之間的新的斷點,需要有更快且更穩健的診斷方法,且需要有鑑定前所未知的NRG融合物的方法。
本揭露一般而言係提供涉及NRG1與新穎融合配偶體之融合物,以及由其所編碼之多肽融合物。本揭露提供一種涉及以NRG1及VAPB、NRG1及PVALB、NRG1及DAAM1、NRG1及ASPH、NRG1及ZFAT或是NRG1及DSCAML1作為新穎融合配偶體之融合物,在此一般來說分別指的是VAPB-NRG1、PVALB-NRG1、DAAM1- NRG1、ASPH-NRG1、ZFAT-NRG1及DSCAML1-NRG1。更特別的是,本揭露之此態樣係有關:
包含有VAPB核酸序列或VAPB核酸序列的一部分且其與NRG1核酸序列的一部分或NRG1核酸序列的一部分融合之多核苷酸,或
包含有PVALB核酸序列或PVALB核酸序列的一部分且其與NRG1核酸序列的一部分或NRG1核酸序列的一部分融合之多核苷酸,或
包含有DAAM1核酸序列或DAAM1核酸序列的一部分且其與NRG1核酸序列的一部分或NRG1核酸序列的一部分融合之多核苷酸,或
包含有ASPH核酸序列或ASPH核酸序列的一部分且其與NRG1核酸序列的一部分或NRG1核酸序列的一部分融合之多核苷酸,或
包含有ZFAT核酸序列或ZFAT核酸序列的一部分且其與NRG1核酸序列的一部分或NRG1核酸序列的一部分融合之多核苷酸,或
包含有DSCAML1核酸序列或DSCAML1核酸序列的一部分且其與NRG1核酸序列的一部分或NRG1核酸序列的一部分融合之多核苷酸。
較佳地,該VAPB核酸序列包含序列SEQ ID NO: 17-23中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含SEQ ID NO: 17-23中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。較佳地,該NRG1核酸序列包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。
替代性地或除此之外,本揭露提供一種包含有VAPB之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,VAPB之外顯子1包含SEQ ID NO: 17或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 17的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
較佳地,該PVALB核酸序列包含序列SEQ ID NO: 439-444中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含SEQ ID NO: 439-444中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。較佳地,該NRG1核酸序列包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。
替代性地或除此之外,本揭露提供一種包含有PVALB之外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,PVALB之外顯子4包含SEQ ID NO: 422或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 422的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
較佳地,該DAAM1核酸序列包含序列SEQ ID NO: 606-631中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含SEQ ID NO: 606-631中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。較佳地,該NRG1核酸序列包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。
替代性地或除此之外,本揭露提供一種包含有DAAM1之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,DAAM1之外顯子1包含SEQ ID NO: 606或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 606的變異體。NRG1之外顯子1包含SEQ ID NO: 125或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 125的變異體。
較佳地,該ASPH核酸序列包含序列SEQ ID NO: 637-662中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含SEQ ID NO: 637-662中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。較佳地,該NRG1核酸序列包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。
替代性地或除此之外,本揭露提供一種包含有ASPH之外顯子22或外顯子22之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,ASPH之外顯子22包含SEQ ID NO: 658或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 658的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
較佳地,該ZFAT核酸序列包含序列SEQ ID NO: 830-846中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含SEQ ID NO: 830-846中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。較佳地,該NRG1核酸序列包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。
替代性地或除此之外,本揭露提供一種包含有ZFAT之外顯子12或外顯子12之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,ZFAT之外顯子12包含SEQ ID NO: 841或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 841的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
較佳地,該DSCAML1核酸序列包含序列SEQ ID NO: 870-903中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含SEQ ID NO: 870-903中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。較佳地,該NRG1核酸序列包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者(的一部分)或由其組成,或是包含序列SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體(的一部分)或由其組成。
替代性地或除此之外,本揭露提供一種包含有DSCAML1之外顯子3或外顯子3之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,DSCAML1之外顯子3包含SEQ ID NO: 872或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 872的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
另外地,本揭露提供涉及具先前未經揭露的融合接合處的NRG1之融合物,以及由其所編碼之多肽融合物。尤其,本揭露另外提供涉及NRG1與CADM1之融合物,在此一般來說指的是CADM1-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與CD44之融合物,在此一般來說指的是CD44-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與SLC3A2之融合物,在此一般來說指的是SLC3A2-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與VTCN1之融合物,在此一般來說指的是VTCN1-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與CDH1之融合物,在此一般來說指的是CDH1-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與CXADR之融合物,在此一般來說指的是CXADR-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與GTF2E2之融合物,在此一般來說指的是GTF2E2-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與CSMD1之融合物,在此一般來說指的是CSMD1-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與PTN之融合物,在此一般來說指的是PTN-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與ST14之融合物,在此一般來說指的是ST14-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與THBS1之融合物,在此一般來說指的是THBS1-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與AGRN之融合物,在此一般來說指的是AGRN-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與APP之融合物,在此一般來說指的是APP-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與WRN之融合物,在此一般來說指的是WRN-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與NRG1之融合物,在此一般來說指的是NRG1-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與NOTCH2之融合物,在此一般來說指的是NOTCH2-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與CD74之融合物,在此一般來說指的是CD74-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與SDC4之融合物,在此一般來說指的是SDC4-NRG1。本揭露也提供涉及NRG1與SLC4A4之融合物,在此一般來說指的是SLC4A4-NRG1。
本揭露提供以下新穎融合接合處。尤其,本揭露提供一種包含有CADM1之外顯子7或外顯子7之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,CADM1之外顯子7包含SEQ ID NO: 39或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 39的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有CD44之外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,CD44之外顯子5包含SEQ ID NO: 65或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 65的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有CD44之外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,CD44之外顯子5包含SEQ ID NO: 65或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 65的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有SLC3A2之轉錄本6之外顯子1或轉錄本6之外顯子1之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子5或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,所述SLC3A2之外顯子包含SEQ ID NO: 103或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 103的變異體。NRG1之外顯子5包含SEQ ID NO: 129或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 129的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有VTCN1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,VTCN1之外顯子2包含SEQ ID NO: 169或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 169的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有CDH1之外顯子11或外顯子11之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,CDH1之外顯子11包含SEQ ID NO: 198或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 198的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有CXADR之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,CXADR之外顯子1包含SEQ ID NO: 219或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 219的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有GTF2E2之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,GTF2E2之外顯子2包含SEQ ID NO: 236或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 236的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有CSMD1之外顯子23或外顯子23之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,CSMD1之外顯子23包含SEQ ID NO: 279或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 279的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有PTN之外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,PTN之外顯子4包含SEQ ID NO: 318或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 318的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有ST14之外顯子11或外顯子11之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,ST14之外顯子11包含SEQ ID NO: 342或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 342的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有THBS1之外顯子9或外顯子9之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,THBS1之外顯子9包含SEQ ID NO: 386或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 386的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有AGRN之外顯子12或外顯子12之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,AGRN之外顯子12包含SEQ ID NO: 416或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 416的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有PVALB之外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,PVALB之外顯子4包含SEQ ID NO: 442或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 442的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有SLC3A2之轉錄本3之外顯子2或轉錄本3之外顯子2之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,所述SLC3A2之外顯子包含SEQ ID NO: 457或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 457的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有APP之外顯子14或外顯子14之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,APP之外顯子14包含SEQ ID NO: 501或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 501的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有WRN之外顯子33或外顯子33之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,WRN之外顯子33包含SEQ ID NO: 562或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 562的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有NOTCH2之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,NOTCH2之外顯子6包含SEQ ID NO: 700或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 700的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有CD74之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,CD74之外顯子2包含SEQ ID NO: 720或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 720的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有SDC4之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,SDC4之外顯子2包含SEQ ID NO: 746或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 746的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有SDC4之外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,SDC4之外顯子4包含SEQ ID NO: 748或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 748的變異體。NRG1之外顯子2包含SEQ ID NO: 126或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 126的變異體。
尤其,本揭露提供一種包含有SLC4A4之外顯子14或外顯子14之對偶基因變異體的一部分且其與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,SLC4A4之外顯子14包含SEQ ID NO: 780或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 780的變異體。NRG1之外顯子6包含SEQ ID NO: 130或由其組成,且其對偶基因變異體較佳為SEQ ID NO: 130的變異體。
本文所提供之NRG1融合物皆已在源自患者的樣本中觀察到,尤其是經診斷患有癌症之患者。
所揭露之鑑定此等NRG1融合物及基因重排可提供用於判定NRG1多核苷酸融合物或多肽是否存在於或來自於生物樣本中的新方法,用於測定NRG1多肽融合物之活性的方法,用於診斷會表現NRG1多肽融合物之癌症、腫瘤或異常細胞的方法,用於測定NRG1多肽融合物之活性的方法,用於治療會表現NRG1多肽融合物之癌症、腫瘤或異常細胞的方法,及/或抑制特徵為表現NRG1多核苷酸融合物或多肽之腫瘤形成之病程的方法。本揭露因此亦提供此等或更多種態樣並詳細描述於下文中。
本揭露亦提供由選自以下之任一種多核苷酸融合物所編碼的多肽融合物:VAPB-NRG1、CADM1-NRG1 CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1及DSCAML1-NRG1。當本揭露之任一種多肽融合物被本文所提及之異常細胞表現時,其較佳地亦包含NRG1之EGF樣結構域。當本揭露之任一種多核苷酸融合物被含在本文所提及之異常細胞時,其較佳地包含編碼EGF樣結構域的NRG1外顯子,諸如NRG1之外顯子6、7或8,更佳地包含NRG1多核苷酸序列之外顯子6及7。
亦提供一種包含有本揭露之多核苷酸融合物的載體、一種包含有所述多核苷酸及/或所述載體之宿主細胞。亦提供一種製造本揭露之多肽的方法,包含將所述重組宿主細胞維持在適合該多核苷酸表現的條件下,藉以表現該多核苷酸融合物且產生一多肽融合物,隨後分離或純化該多肽。亦提供一種製造重組宿主細胞的方法,包含將所述載體導入宿主細胞內。
亦提供一種用於檢測本揭露之多核苷酸融合物的核酸探針、引子或引子對以及一種包含有用於檢測本揭露之多核苷酸融合物的存在之核酸探針、引子或引子對的檢測測定法。本揭露之這類核酸探針、引子或引子對較佳的長度為10-40個核苷酸。
亦提供一種用於檢測本揭露之多核苷酸融合物所編碼的多肽之第一抗體或第一與第二抗體對組,以及一種包含有該第一抗體或該第一與第二抗體對組以用於檢測本揭露之多核苷酸融合物所編碼之多肽的存在的檢測測定法。較佳地,該第一抗體與選自以下之多肽融合物結合:VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1及DSCAML1-NRG1,而該第一與第二抗體對組分別與VAPB及NRG1、或CADM1及NRG1、或CD44及NRG1、或SLC3A2及NRG1、或VTCN1及NRG1、或CDH1及NRG1、或CXADR及NRG1、或GTF2E2及NRG1、或CSMD1及NRG1、或PTN及NRG1、或ST14及NRG1、或THBS1及NRG1、或AGRN及NRG1、或PVALB及NRG1、APP及NRG1、或WRN及NRG1、或ASPH及NRG1、或NOTCH2及NRG1、或CD74及NRG1、或SDC4及NRG1、或SLC4A4及NRG1、或ZFAT及NRG1、或DSCAML1及NRG1結合。
本揭露包括了鑑定或檢測人類個體中之NRG1融合物之方法,且進一步涵蓋了診斷、治療選擇、及藥物治療之方法及其組合,以改善NRG1融合物相關的疾病,包括實體瘤。除此之外,本揭露提供直接了斷的手段或測定法來快速評估個體是否罹患或易於罹患癌症、腫瘤、或異常細胞。這類NRG1融合物資訊可有利作為診斷工具中之生物標誌物使用。
因此,亦提供一種於樣本中鑑定如本文所提及之任一多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
亦提供一種於樣本中檢測如本文所提及之任一多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽是否存在的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
亦提供一種確定來自個體之異常細胞(諸如癌細胞或腫瘤細胞)是否包含本文所提及之任一多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自該個體之細胞或所述細胞之多核苷酸或多肽內容物是否於樣本中存在該融合物。
亦提供一種鑑定一個體帶有本文所提及之多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。較佳地該檢驗之後為將該樣本中檢測到的融合物與帶有該融合物之個體聯繫在一起的步驟。
本文所提及之樣本的檢驗較佳地係為活體外分析或這類方法、或離體分析或這類方法的一部分。
較佳地,該個體為哺乳動物或人類個體,且該多核苷酸或多肽為哺乳動物或人類多核苷酸或多肽。
較佳地,本文所提及之任一多核苷酸融合物及/或本文所提及之由其所編碼之多肽係經分離及/或純化或是實質上分離或實質上純化。
本揭露係有關於罹患癌症或懷疑罹患癌症(尤其是實體癌或實體瘤)之個體。尤其,這類癌症為腺癌,更尤其是黏液腺癌、胰臟癌,更尤其是胰臟腺癌、或腎細胞癌、膽管癌、腦癌、神經膠質母細胞瘤、膽管癌、神經膠質瘤、胰管腺癌、肉瘤、膀胱癌、大腸癌、直腸癌、大腸直腸癌、膽囊癌、頭頸癌、前列腺癌、子宮癌、乳癌、卵巢癌、肝癌、子宮內膜癌、肺癌,尤其是非小細胞肺癌、或浸潤性黏液腺癌。該癌症可為原發性癌或轉移性癌。
本揭露亦提供一種治療患有ErbB-2及/或ErbB-3陽性異常細胞(諸如癌症或腫瘤)之個體的方法,所述異常細胞包含了本文所提及之多核苷酸融合物,且/或這類細胞表現了由其所編碼之多肽融合物,所述方法包含向該個體投與治療量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑。較佳地,投與所述標靶劑之前係檢測本文所提及之多核苷酸或多肽融合物。
本揭露亦提供一種抑制患有ErbB-2及ErbB-3陽性異常細胞之個體病程的方法,所述異常細胞包含了本文所提及之多核苷酸融合物,且/或表現了由其所編碼之多肽融合物,所述方法包含向該個體投與治療量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑。較佳地,投與所述標靶劑之前係檢測本文所提及之多核苷酸或多肽融合物。
本揭露亦提供一種供使用於患有ErbB-2及ErbB-3陽性癌症或腫瘤之個體的治療中的ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,所述癌症或腫瘤包含了本文所提及之多核苷酸融合物,且/或表現了由其所編碼之多肽融合物,所述治療包含向該個體投與治療量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑。較佳地,投與所述標靶劑之前係檢測本文所提及之多核苷酸或多肽融合物。
本揭露亦提供一種診斷帶有包含了本文所提及之多核苷酸融合物由其所編碼之多肽之異常細胞的個體的方法,該方法包含檢驗一獲自個體的樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
本揭露亦提供一種ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑之治療方法或用途,其中係篩選個體是否存有本文所提及之NGR1融合物,隨後投與ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑。
本揭露亦包括活體內模型,諸如表現在其基因體內或是包含有本文所提及之多核苷酸融合物的移植異常細胞之異種移植或基因轉殖動物模型,且/或表現由其所編碼之多肽融合物,以及使用ERB2及/或Erb3標靶劑或其他標靶劑之這類模型的治療。較佳地,該動物模型為非人類動物模型。
本揭露提供涉及NRG1與新穎融合配偶體之融合物,以及由其所編碼之多肽融合物。此外,本揭露提供涉及具先前未經揭露的融合接合處的NRG1之融合物,以及由其所編碼之多肽融合物。
一般而言,本揭露提供涉及NRG1與融合配偶體之融合物,該融合配偶體係選自VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1。所述融合物在此指的是VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、DAAM1-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1或DSCAML1-NRG1。存在本揭露之NRG1融合物中之任一者時,無論是多核苷酸或由其轉譯的多肽,都表示了異常細胞(諸如癌症或腫瘤)的存在。
NRG1
NRG1基因編碼各種NRG1的同功型異形體。各種同功型異形體及其預期功能在Adelaide等人之Genes Chromosomes Cancer, Aug;37(4):333-45 (2003)中進行了描述。GGF及GGF2同功型異形體含有kringle樣序列加上Ig及EGF樣結構域;並且SMDF同功型異形體與其他同功型異形體僅共用EGF樣結構域。NRG1同功型異形體的受體是酪胺酸激酶跨膜受體的ErbB家族。該家族也被稱作人類表皮生長因子(EGF)受體家族(HER)。該家族有四個成員:ErbB(紅血球母細胞瘤)-1、ErbB-2、ErbB-3及ErbB-4。受體(綜述於Yarden及Pines,Nat Rev Cancer. 2012 Jul 12;12(8):553-63)係廣泛表現於上皮細胞上。HER受體或其配位體,諸如神經調理因子(heregulin, HRG)或表皮生長因子(EGF)之表現量上調,是人類癌症中常見的事件(Wilson, Fridlyand等人,Nature. 2012 Jul 26; 487(7408): 505–509)。ErbB-1及ErbB-2的過度表現特別發生在上皮腫瘤中,並且與腫瘤侵襲、轉移、化療耐藥性及預後不良有關(Zhang, H., Berezov, A., Wang, Q., Zhang, G., Drebin, J., Murali, R.等人(2007) Erbb receptors: from oncogenes to targeted cancer therapies. J. Clin. Invest., 117, 2051- 2058)。在正常乳房中,ErbB-3已被證明在管腔上皮的生長及分化中很重要。例如,ErbB-3的丟失/抑制會導致在管腔上皮上的基底選擇性擴增(Balko, Miller等人,2012 PNAS January 3, 2012 109 (1) 221-226)。配體與酪胺酸激酶受體的細胞外結構域的結合誘導了受體二聚化,兩者介於相同(同二聚化(homodimerization))及不同(異二聚化(heterodimerization)受體亞型之間。二聚化可以活化細胞內的酪胺酸激酶結構域,使這些結構域進行自磷酸化且繼而活化許多下游的促增生信號傳導路徑,包括由促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)及促存活路徑Akt所介導的路徑(綜述於Yarden及Pines,2012)。ErbB-3可以藉由其配體的接合而被活化。這些配體包括但不限於神經調節蛋白(NRG)及神經調理因子(HRG),以及NRG1融合物。
各種NRG1融合基因係描述於Dhanasekaran等人Nature Communications 5:5893, 2014,以及Jonna等人,Clin Cancer Res August 15 2019, 25 (16) 4966-4972。
本文所使用之術語「NRG1」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。NRG1基因及同功型異形體已知有許多不同的別名,諸如:神經調節蛋白1 (Neuregulin 1);Pro-NRG1;HRGA;SMDF;HGL;GGF;NDF;NRG1內切轉錄2 (Intronic Transcript 2,不編碼蛋白質);Heregulin, α (45kD, ERBB2 P185-活化子);乙醯膽鹼受體誘導活性(Acetylcholine Receptor-Inducing Activity);原神經調節蛋白-1 (Pro-Neuregulin-1),為膜結合同功異形體;感覺及運動神經元衍生因子;新分化因子(Neu Differentiation Factor);神經膠質生長因子2;NRG1-IT2;MSTP131;MST131;ARIA;GGF2;HRG1;及HRG。NRG1基因的外部Id為HGNC: 7997;Entrez Gene: 3084;Ensembl: ENSG00000157168;OMIM: 142445及UniProtKB: Q02297。為了避免疑慮,帶有NRG1序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001159999.3或NM_001159999.3之對偶基因變異體的任何多核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。較佳地,本揭露之NRG1的全多核苷酸序列係根據SEQ ID NO: 138轉錄,而經轉錄的NRG1多肽序列係根據SEQ ID NO: 152。
較佳地,該編碼NRG1蛋白序列或NRG1外顯子的多核苷酸融合物部分進一步包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。於該融合物中之NRG1基因(例如NRG1基因的3’端)較佳地包含外顯子6、7或8的編碼序列。此結構域係由位於NRG1基因(例如外顯子6-8)3’處的部分編碼,且對於結合至ErbB-3而言是必要的。NRG1融合基因較佳地包含編碼NRG1的EGF樣結構域之核酸序列。本揭露之該等NRG1融合物較佳地在該融合物分子的3’端保有此EGF樣結構域的符合讀框編碼區。EGF樣結構域一般為約三十至四十個胺基酸殘基長之序列,其原型係發現於表皮生長因子(EGF)之序列[PMID: 2288911, PMID: 6334307, PMID: 1522591, PMID: 6607417, PMID: 3282918, PMID: 11498013]中。已知其係以大致保守的形式存在於其他眾多、主要為動物蛋白質之中。EGF樣結構域的共同特徵是,其等係發現於膜結合蛋白之細胞外結構域或已知會分泌的蛋白質中(例外:前列腺素G/H合成酶)。EGF樣結構域一般包括六個半胱胺酸殘基,已證明其等(在EGF中)涉及二硫化物鍵。主要結構為一個雙鏈β摺板,然後是一個環接到C端的短雙鏈摺板。保守半胱胺酸之間的次結構域長度不一。本揭露之例示性EGF樣結構域較佳地係由NCBI參考序列NM_001159999.3之外顯子6-8組成,更佳地由外顯子6及7組成,但本揭露是有關於NRG1的任何功能性EGF樣結構域。NRG1之EGF樣結構域因此較佳地包含例示性序列HLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYVMASF (SEQ ID: 163),或與其有至少85%一致性、或與其有至少90%、92%、94%、95%、96%或甚至至少98%一致性的對偶基因變異體。
本揭露之任一NRG1融合多核苷酸較佳地係至少包含VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1的5’部分來作為融合配偶體,以與NRG1核酸序列的3’部分融合。經轉譯的多肽融合物包含該NRG1融合多肽的游離C端以及該融合配偶體的游離N端。為了在分子融合物層級反應出此配向,係先提及NRG1的任一融合配偶體,接著是作為其融合配偶體的NRG1。
VAPB
VAPB或囊泡相關膜蛋白之相關蛋白B/C已知有許多不同名稱,諸如VAMP相關蛋白B及C;VAMP(囊泡相關膜蛋白)相關蛋白B及C;VAP-B;VAPB;ALS8;VAMP相關33 KDa蛋白;VAMP相關蛋白B/C;VAMP-B/VAMP-C;VAP-B/VAP-C;VAMP-B及VAP-C。VAPB基因的外部Id為HGNC: 12649;Entrez Gene: 9217;Ensembl: ENSG00000124164;OMIM: 605704;及UniProtKB: O95292。本文所使用之術語「VAPB」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有VAPB序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_004738.4或其任一對偶基因變異體的任何多核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
CADM1
CADM1或細胞黏附分子1已知有許多不同的名稱,諸如肺癌腫瘤抑制因子1;TSLC1;TSLC-1;生精免疫球蛋白超家族;SgIgSF;SgIGSF;免疫球蛋白超家族成員4;IGSF4;IgSF4;IGSF4A;突觸細胞黏附分子;SynCAM1;SYNCAM1;SynCAM;SYNCAM;Nectin樣蛋白2;NECL2;NECL-2;Nectin樣2;Necl-2;RA175;ST17;BL2;免疫球蛋白超家族之成員4D變異體1;免疫球蛋白超家族之成員4D變異體2;免疫球蛋白超家族之成員4;TSLC1/Nectin樣2/IGSF4;截斷的CADM1蛋白1及STSLC-1。CADM1的外部Id為HGNC: 5951;Entrez Gene: 23705;Ensembl: ENSG00000182985;OMIM: 605686;及UniProtKB: Q9BY67。本文所使用之術語「CADM1」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有CADM1序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001301045.1或其任一對偶基因變異體的任何多核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
CD44
CD44已知有許多不同的名稱,諸如CD44分子(印度血型);造血細胞E-及L-選滯蛋白配體;GP90淋巴細胞歸巢/黏附受體;硫酸軟骨素蛋白聚醣;細胞外基質受體III;硫酸軟骨素蛋白聚醣;吞噬細胞醣蛋白1;玻尿酸受體;赫爾墨斯抗原(Hermes Antigen);CD44抗原;ECMR-III;HUTCH-I;Epican;MDU2;MDU3;MIC4;LHR;CD44抗原(歸巢功能及印度血型系統);歸巢功能及印度血型系統;細胞表面醣蛋白CD44;印度血型抗原;吞噬細胞醣蛋白I;可溶性CD44;CDW44;CSPG8;HCELL;CDw44;PGP-1;MC56;Pgp1;及In。CD44基因的外部Id為HGNC: 1681;Entrez Gene: 960;Ensembl: ENSG00000026508;OMIM: 107269;及UniProtKB: P16070。本文所使用之術語「CD44」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有NRG1序列係指帶有來自諸如CD44參考序列NM_000610.4或其任一對偶基因變異體的任何多核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
SLC3A2
SLC3A2或溶質載體家族3成員2已知有許多不同的名稱,諸如淋巴細胞活化抗原4F2大次單元;溶質載體家族3(二元(Dibasic)及中性胺基酸轉運的活化子),成員2;由單株抗體4F2、TRA1.10、TROP4及T43所識別的抗原;溶質載體家族3(胺基酸轉運蛋白重鏈),成員2;4F2細胞表面抗原重鏈;CD98重鏈;4F2HC;MDU1;由單株抗體4F2定義的抗原,重鏈;由單株抗體4F2定義的抗原;4F2重鏈抗原;4F2重鏈;CD98抗原;CD98HC;4T2HC;NACAE;CD98及4F2。SLC3A2的外部Id為HGNC: 11026;Entrez Gene: 6520;Ensembl: ENSG00000168003;OMIM: 158070;及UniProtKB: P08195。本文所使用之術語「SLC3A2」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有SLC3A2轉錄本6序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001013251.3或其任一對偶基因變異體的任何多核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。而帶有SLC3A2轉錄本3序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001013251.3或其任一對偶基因變異體的任何多核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
VTCN1
VTCN1已知有許多不同的名稱,諸如含有T細胞活化抑制劑1的V-Set結構域;B7-H4;B7H4;免疫共刺激蛋白B7-H4;B7超級家族成員1;B7家族成員,H4;B7同源物4;B7h.5;B7S1;T細胞共刺激分子B7x;蛋白質B7S1;FLJ22418;PRO1291;VCTN1;VTCN1及B7X。VTCN1的外部Id為HGNC: 28873;NCBI Entrez Gene: 79679;Ensembl: ENSG00000134258;OMIM®: 608162及UniProtKB/Swiss-Prot: Q7Z7D3。本文所使用之術語「VTCN1」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有VTCN1序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_024626.4或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
CDH1
CDH1或鈣黏蛋白1已知有許多不同的名稱,諸如桑椹胚黏著蛋白(Uvomorulin);鈣黏蛋白1,第1型,E-鈣黏蛋白(上皮);上皮鈣黏蛋白;E-鈣黏蛋白;鈣黏蛋白-1;CAM 120/80;CD324;CDHE;UVO;鈣依賴性黏附蛋白,上皮;副睪分泌精子結合蛋白;鈣黏蛋白1,E-鈣黏蛋白(上皮);細胞-CAM 120/80;CD324抗原;E-鈣黏蛋白;Arc-1;BCDS1;ECAD;及LCAM。CDH1的外部Id為HGNC: 1748;NCBI Entrez Gene: 999;Ensembl: ENSG00000039068;OMIM®: 192090及UniProtKB/Swiss-Prot: P12830。本文所使用之術語「CDH1」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有CDH1序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001317185.2或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
CXADR
CXADR或柯薩奇病毒及腺病毒受體是B組柯薩奇病毒及C亞組腺病毒的第I型膜受體。已發現到此基因的若干編碼不同同功型異形體之轉錄變異體。與CXADR相關的疾病包括心肌炎及角膜結膜炎。其相關途徑包括黏附及同種異體移植排斥。它是上皮細胞頂部接合複合物的一個組成部分,可作用為嗜同性細胞黏附分子,對細胞緊密連接的完整性至關重要。其也涉及通過與白血球膜質膜的跨膜蛋白JAML黏附交互作用所進行的白血球跨上皮細胞遷移。這兩種受體之間的交互作用也介導了駐留在上皮細胞中的一種T細胞次族群γ-δ T細胞的活化,並涉及組織內環境穩定與修復。在上皮細胞CXADR一結合時,JAML會通過PI3激酶及MAP激酶來介導γ-δ T細胞中的下游細胞信號傳導事件。這藉由T細胞相應地刺激上皮細胞組織修復而造成細胞介素及生長因子的增生與生成。CXADR的外部Id包括HGNC: 2559 NCBI;Entrez Gene: 1525;Ensembl: ENSG00000154639;OMIM®: 602621;UniProtKB/Swiss-Prot: P78310。本文所使用之術語「CXADR」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有CXADR序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001207063.2或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
GTF2E2
GTF2E2或共用轉錄因子IIE (TFIIE)是RNA聚合酶II轉錄起始複合體的一部分,其吸收TFIIH且對RNA聚合酶II清除啟動子是絕對必要的。TFIIE是一種含α及β次單元的雜二聚體(且有時為雜四聚體)。此基因所編碼的蛋白質表現了TFIIE的β次單元。與GTF2E2相關的疾病包括髮硫發育障礙症6、非光敏性髮硫發育障礙症。其相關途徑有滑液膜纖維母細胞中之細胞凋亡路徑以及巨噬細胞中的CCR5路徑。GTF2E2的外部Id包括HGNC: 4651;NCBI Entrez Gene: 2961;Ensembl: ENSG00000197265;OMIM®: 189964;UniProtKB/Swiss-Prot: P29084。本文所使用之術語「GTF2E2」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有GTF2E2序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_002095.6或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
CSMD1
CSMD1(或CUB與Sushi多重功能域1)是一種與包括了自閉症及思覺失調症之疾病相關的蛋白質。CSMD1的外部Id包括HGNC: 14026;NCBI Entrez Gene: 64478;Ensembl: ENSG00000183117;OMIM®: 608397;UniProtKB/Swiss-Prot: Q96PZ7。本文所使用之術語「CSMD1」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有CSMD1序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_033225.6或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
PTN
多效生長因子(Pleiotrophin或PTN)蛋白質是一種分泌型肝素結合生長因子。該蛋白質在細胞生長與存活、細胞遷移、血管生成以及腫瘤生成中具有重要的作用。PTN (Pleiotrophin)是一種蛋白編碼基因。與PTN相關的疾病包括佩洛尼氏病(Peyronie's Disease)及鼻腔嗅神經母細胞瘤。其相關路徑有滑液膜纖維母細胞中的GPCR路徑及細胞凋亡路徑。PTN的外部Id包括HGNC: 9630;NCBI Entrez Gene: 5764;Ensembl: ENSG00000105894;OMIM®: 162095;UniProtKB/Swiss-Prot: P21246。本文所使用之術語「PTN」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有PTN序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001321386.2或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
ST14
ST14或ST14跨膜絲胺酸蛋白酶Matriptase是一種上皮細胞衍生的膜主體蛋白絲胺酸蛋白酶。此蛋白酶與Kunitz型絲胺酸蛋白酶抑制劑HAI-1形成複合物,且被發現到會被神經鞘胺醇1-磷酸鹽活化。此蛋白酶已被證明可裂解及活化肝細胞生長因子/分射因子,以及尿激酶纖溶酶原激活酶,這表明此蛋白酶作為其他蛋白酶與潛在生長因子之上皮細胞膜活化子的功能。與ST14相關的疾病包括不同類型的魚鱗病。其相關路徑包括發育生物學及黏附。ST14的外部Id包括HGNC: 11344;NCBI Entrez Gene: 6768;Ensembl: ENSG00000149418;OMIM®: 606797;UniProtKB/Swiss-Prot: Q9Y5Y6。本文所使用之術語「ST14」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有ST14序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_021978.4或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
THBS1
THBS1或血小板反應素1是一種雙硫鍵連接的同源三聚體蛋白次單元。此蛋白質是一種黏附性醣蛋白並介導細胞與細胞的交互作用以及細胞與基質的交互作用。此蛋白可結合至纖維蛋白原、纖維連接蛋白、層黏蛋白、V型膠原蛋白、及整聯蛋白α-V/β-1。此蛋白已被證明在血小板凝集、血管生成以及腫瘤生成中扮演重要角色。與THBS1相關的疾病包括血栓形成性血小板減少性紫瘢病及Peters-Plus症候群。其相關路徑有癌症中的蛋白多醣及胞外基質的降解。與此基因相關的基因本體(GO)標記包括鈣離子結合及肝素結合。THBS1的外部Id包括HGNC: 11785;NCBI Entrez Gene: 7057;Ensembl: ENSG00000137801;OMIM®: 188060;UniProtKB/Swiss-Prot: P07996。本文所使用之術語「THBS1」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有THBS1序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_003246.4或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
AGRN
AGRN或聚集蛋白(Agrin)是神經肌肉接合發育中重要的幾種蛋白質之一。所編碼的蛋白質包含數個層黏蛋白G、Kazal型絲胺酸蛋白抑制劑、及表皮生長因子結構域。其他的轉譯後修飾出現在添加葡萄糖胺聚醣及雙硫鍵。在與影響肢帶肌的先天性肌無力症候群有關的一個基因家族中發現到此基因的突變。與AGRN相關的疾病包括肌無力症候群、先天性、8及突觸前先天性肌無力症候群。其相關路徑有在神經肌肉接合、血腦障壁、及免疫細胞移位處的Agrin交互作用。AGRN的外部Id包括HGNC: 329;NCBI Entrez Gene: 375790;Ensembl: ENSG00000188157;OMIM®: 103320;UniProtKB/Swiss-Prot: O00468。本文所使用之術語「AGRN」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有AGRN序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001305275.2或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
PVALB
PVALB或微小白蛋白(Parvalbumin)是一種高親合性鈣離子結合蛋白,其在結構上與作用上與鈣調素及旋光素C相似。所編碼的蛋白被認為涉及到肌肉放鬆。與PVALB相關的疾病包括魚類過敏及胎兒酒精症候群。與此基因相關的基因本體標記包括鈣離子結合及蛋白雜二聚化活性。PVALB的外部Id包括HGNC: 9704;NCBI Entrez Gene: 5816;Ensembl: ENSG00000100362;OMIM®: 168890;UniProtKB/Swiss-Prot: P20472。本文所使用之術語「PVALB」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有PVALB序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_002854.3或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
APP
APP已知有許多不同的名稱,諸如類澱粉蛋白β前驅蛋白、α-SAPP、AD1、阿茲海默病類澱粉蛋白A4蛋白同源物、類澱粉蛋白β (A4)前驅蛋白、阿茲海默病類澱粉蛋白、腦血管類澱粉蛋白肽、類澱粉蛋白β前驅蛋白、類澱粉蛋白前驅蛋白、肽酶連接蛋白(Nexin)-II、蛋白酶連接蛋白-II、PN-II、PreA4、ABPP、APPI、CVAP、β-類澱粉蛋白前驅蛋白、睪丸組織蛋白Li 2、β-類澱粉蛋白肽(1-40)、β-類澱粉蛋白肽(1-42)、類澱粉蛋白β-A4蛋白、β-類澱粉蛋白肽、阿茲海默病、CTFγ、ABETA、AAA、PN2及A4。APP基因的外部ID是HGNC:620;Entrez Gene:351;Ensembl:ENSG00000142192;OMIM®:104760及UniProtKB/Swiss-Prot:P05067。APP基因的外部Id為HGNC: 620;Entrez Gene: 351;Ensembl: ENSG00000142192;OMIM®: 104760及UniProtKB/Swiss-Prot: P05067。本文所使用之術語「APP」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有APP序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001136130.3或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
WRN
WRN或維爾納氏症候群(Werner Syndrome) ATP依賴性解旋酶已知有許多不同的名稱,諸如WRN RecQ樣解旋酶;RECQL2;RECQ3;維爾納氏症候群RecQ樣解旋酶;DNA解旋酶、RecQ樣第3型;RecQ蛋白樣2;核酸外切酶WRN;維爾納氏症候群,RecQ解旋酶樣;維爾納氏症候群;EC 3.6.4.12;RECQL3;及RecQ3。WRN基因的外部ID為HGNC: 12791;NCBI Entrez Gene: 7486;Ensembl: ENSG00000165392;OMIM®: 604611;及UniProtKB/Swiss-Prot: Q14191。本文所使用之術語「WRN」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有WRN序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_000553.6或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
DAAM1
DAAM1或形態發生紊亂相關活化子1已知有許多不同的名稱,諸如KIAA0666;及形態發生紊亂相關活化子1。DAAM1基因的外部Id為HGNC: 18142;NCBI Entrez Gene: 23002;Ensembl: ENSG00000100592;OMIM®: 606626;及UniProtKB/Swiss-Prot: Q9Y4D1。本文所使用之術語「DAAM1」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有DAAM1序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001270520.2或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
ASPH
ASPH或天門冬胺酸β-羥化酶已知有許多不同的名稱,諸如BAH、CASQ2BP1、JCTN、HAAH、天門冬胺酸/天冬醯胺基β-羥化酶、肽-天門冬胺酸β-二氧酶、ASP β-羥化酶、Junctate、Junctin、Humbug、Cardiac Junctin、EC 1.14.11.16、A β H-J-J、FDLAB及AAH。ASPH基因的外部Id為HGNC: 757;Entrez Gene: 444;Ensembl: ENSG00000198363;OMIM®: 600582及UniProtKB/Swiss-Prot: Q12797。本文所使用之術語「ASPH」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有ASPH序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001164750.2或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
NOTCH2
NOTCH2或Notch 受體2已知有許多不同的名稱,諸如Notch 2;神經源性位點缺口同源蛋白2;HN2;Notch(果蠅)同源物2;Notch同源物2(果蠅);Notch同源物2;HJCYS;及AGS2。NOTCH2基因的外部Id為HGNC: 7882;NCBI Entrez Gene: 4853;Ensembl: ENSG00000134250;OMIM®: 600275;及UniProtKB/Swiss-Prot: Q04721。本文所使用之術語「NOTCH2」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有NOTCH2序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_024408.4或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
CD74
CD74已知有許多不同的名稱,諸如CD74分子;DHLAG;CD74分子,主要組織相容性複合物,II類不變鏈;HLA II類組織相容性抗原γ鏈;II類MHC相關不變鏈肽;HLA-DR抗原相關不變鏈;II類抗原的γ鏈;Ia相關不變鏈;MHC HLA-DR γ鏈;HLA-DR-γ;CLIP;Ia抗原相關不變鏈;CD74抗原;Ia-γ;HLADG;P33;II;及Ii;CD74基因的外部Id為HGNC: 1697;NCBI Entrez Gene: 972;Ensembl: ENSG00000019582;OMIM®: 142790;及UniProtKB/Swiss-Prot: P04233。本文所使用之術語「CD74」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有CD74序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001025159.3或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
SDC4
SDC4或多配體聚醣4 (Syndecan 4)已知有許多不同的名稱,諸如雙棲蛋白聚醣(Amphiglycan);SYND4;多配體聚醣4 (Amphiglycan, Ryudocan);多配體聚醣蛋白聚醣4;Ryudocan核心蛋白;多配體聚醣-4;Ryudocan;及Ryudocan雙棲蛋白聚醣。SDC4基因的外部Id為HGNC: 10661;NCBI Entrez Gene: 6385;Ensembl: ENSG00000124145;OMIM®: 600017;及UniProtKB/Swiss-Prot: P31431。本文所使用之術語「SDC4」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有SDC4序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_002999.4或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
SLC4A4
SLC4A4或溶質載體家族4成員4已知有許多不同的名稱,諸如NBC1;HNBC1;HhNMC;NBC2;PNBC;溶質載體家族4(碳酸氫鈉共轉運蛋白),成員4;產電位碳酸氫鈉共轉運蛋白1;Na(+)/HCO3(-)共轉運蛋白;SLC4A5;KNBC1;碳酸氫鈉共轉運蛋白1(碳酸氫鈉共轉運蛋白,腎臟;碳酸氫鈉共轉運蛋白,胰臟);溶質載體家族4,碳酸氫鈉共轉運蛋白,成員4,腦型;溶質載體家族4,碳酸氫鈉共轉運蛋白,成員4;溶質載體家族4,碳酸氫鈉共轉運蛋白,成員5;碳酸氫鈉共轉運蛋白;NBCe1-A;NBCE1;KNBC;及NBC。SLC4A4基因的外部Id為HGNC: 11030;NCBI Entrez Gene: 8671;Ensembl: ENSG00000080493;OMIM®: 603345;及UniProtKB/Swiss-Prot: Q9Y6R1。本文所使用之術語「SLC4A4」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有SLC4A4序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_001098484.3或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
ZFAT
ZFAT或含AT-鈎結構域的鋅指(Zing Finger And AT-Hook Domain Containing)已知有許多不同的名稱,諸如鋅指蛋白406;KIAA1485;ZNF406;ZFAT1;鋅指蛋白ZFAT;在自體免疫性甲狀腺疾病的鋅指基因;在AITD易感區的鋅指基因;及AITD3。ZFAT基因的外部Id為HGNC: 19899;NCBI Entrez Gene: 57623;Ensembl: ENSG00000066827;OMIM®: 610931;及UniProtKB/Swiss-Prot: Q9P243。本文所使用之術語「ZFAT」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有ZFAT序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_020863.4或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
DSCAML1
DSCAML1或類DS細胞黏附分子1已知有許多不同的名稱,諸如KIAA1132;類唐氏症細胞黏附分子蛋白1;唐氏症細胞黏附分子2;DSCAM2;類唐氏症細胞黏附分子1;類唐氏症細胞黏附分子1;及類DSCAM 1。DSCAML1基因的外部Id為HGNC: 14656;NCBI Entrez Gene: 57453;Ensembl: ENSG00000177103;OMIM®: 611782;及UniProtKB/Swiss-Prot: Q8TD84。本文所使用之術語「DSCAML1」並不意味著侷限於任何諸如蛋白質、RNA、mRNA、cDNA或DNA序列之形式,而是包括所有這類的形式,除非上下文清楚指出是哪種形式。為了避免疑慮,帶有DSCAML1序列係指帶有來自諸如NCBI參考序列NM_020693.4或其任一對偶基因變異體的任何核苷酸序列,包括編碼序列或是任何外顯子,但也包括任何多肽序列,或其任何部分。
NRG1 多核苷酸融合物
根據本揭露,現提供了會導致NRG1與融合配偶體融合之NRG1融合產物表現的前所未知的基因重排。尤其,提供了包含有NRG1之多核苷酸融合物,包括VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、DAAM1-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1或DSCAML1-NRG1。尤其,在被診斷患有癌症的人類患者中係存在或已鑑定出這類融合物,並在下節中更詳細地提及。
在某些實施例中,該NRG1融合物在編碼該EGF樣結構域之序列的3’處可包含另外的下游融合配偶體。
VAPB-NRG1 多核苷酸融合物
根據本揭露,亦提供一種包含有VAPB核酸序列(或VAPB核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸。所述融合物中也包括了VAPB及NRG1核酸序列的對偶基因變異體。
較佳地,該VAPB核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 17-23中之任一者或SEQ ID NO: 17-23中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成,而該NRG1核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或SEQ ID NO: 125-138中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成。更佳地,該VAPB核酸序列包含SEQ ID NO: 23或SEQ ID NO: 23的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成,而該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 138或SEQ ID NO: 138的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成。SEQ ID NO: 17-22分別對應根據NM_004738.4之VAPB的個別外顯子1-6。SEQ ID NO: 23對應根據NM_004738.4之VAPB的外顯子1-5。SEQ ID NO: 125-137分別對應根據NM_001159999之NRG1的個別外顯子1-13。SEQ ID NO: 138對應根據NM_001159999之NRG1的外顯子1-13。
在一較佳實施例中,該VAPB核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 17-23中之任一者(或SEQ ID NO: 17-23中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,而該NRG1核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 125-138中之任一者(或SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸。
較佳地,該VAPB核酸序列或其部分係位於NRG1核酸序列或其部分的5’處。
較佳地,該包含有VAPB之VAPB核酸序列(或所述序列的一部分)與NRG1核酸序列(或所述序列的一部分)融合之多核苷酸係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。包含有該VAPB-NRG1多核苷酸融合物或表現該多肽融合物之異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於VAPB與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在可使得所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該VAPB核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 17-23中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
在一較佳實施例中,該包含有VAPB核酸與NRG1核酸融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 3之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且較佳地包括位置43及44的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 3之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置53及54的核酸。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 3之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 3之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置43及44的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 3之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置43及44的核酸。
較佳地,該NRG1核酸序列之多核苷酸部分(或其對偶基因變異體)係編碼NRG1之EGF樣結構域,較佳為根據SEQ ID NO: 163之EGF樣結構域。
在一替代態樣中,提供了一種包含有VAPB之外顯子1或其對偶基因變異體的一部分與NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體的一部分融合之多核苷酸。較佳地,VAPB之外顯子1為SEQ ID NO: 17之外顯子。較佳地,NRG1之外顯子2為SEQ ID NO: 126之外顯子。所述VAPB外顯子1的部分較佳地包含SEQ ID NO: 1或其對偶基因變異體或是由其組成。所述NRG1外顯子2的部分較佳地包含SEQ ID NO: 2或其對偶基因變異體或是由其組成。當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 17及126可能就足夠了。來自NRG1外顯子2之3’處的任一序列係包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該VAPB之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 17有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
在一較佳實施例中,VAPB之外顯子1的部分係包含SEQ ID NO: 1或由其組成,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 1有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此融合物中之NRG1之外顯子2的部分係包含SEQ ID NO: 2或由其組成,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 2有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測VAPB與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。更佳地,VAPB之外顯子1的部分包含來自SEQ ID NO: 1之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置43的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 1之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置43的核酸。更佳地,VAPB之外顯子1的部分係包含或根據SEQ ID NO: 1或其對偶基因變異體。
替代性地,VAPB外顯子1的部分包含SEQ ID NO: 17(或SEQ ID NO: 17之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置399的核酸。較佳地,VAPB外顯子1的部分包含來自SEQ ID NO: 17或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置399的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 17之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置399的核酸。在此替代例中,VAPB外顯子1的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 17或其對偶基因變異體。較佳地,在與VAPB的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
在一替代性較佳實施例中,該包含有VAPB外顯子1的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 3之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置43及44的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 3之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置43及44的核酸。SEQ ID NO: 3包括介於VAPB與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於VAPB之位置43的核酸與源於NRG1之位置44的核酸之間。較佳地,該包含有VAPB外顯子1的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 3之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
較佳地,本文所提供之任一VAPB-NRG1多核苷酸融合物為VAPB與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有VAPB之外顯子1或外顯子1的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 3或其對偶基因變異體的融合物。
較佳地,VAPB外顯子1(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有VAPB的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之VAPB-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自VAPB的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該VAPB-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,包括肺癌或腺癌,尤其是肺腺癌或非小細胞肺癌。
CADM1-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有CADM1之外顯子7的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。CADM1之外顯子7較佳為SEQ ID NO: 39或SEQ ID NO: 39之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
較佳地,CADM1外顯子7之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 39有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,CADM1之外顯子7的部分係包含或根據SEQ ID NO: 5,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 5有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與CADM1的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 6之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 6有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測CADM1與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。更佳地,CADM1之外顯子7的部分包含來自SEQ ID NO: 5之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置43的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 5之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置53的核酸。更佳地,CADM1之外顯子7的部分係包含或根據SEQ ID NO: 5或其對偶基因變異體。
替代性地,CADM1外顯子7的部分包含SEQ ID NO: 39(或SEQ ID NO: 39之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置173的核酸。較佳地,CADM1外顯子7的部分包含來自SEQ ID NO: 39或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置173的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 39之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置173的核酸。在此替代例中,CADM1外顯子7的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 39或其對偶基因變異體。較佳地,在與CADM1的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
在一替代性較佳實施例中,該包含有CADM1外顯子7的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 7之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置53及54的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 7之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置53及54的核酸。SEQ ID NO: 7包括介於CADM1與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於CADM1之位置53的核酸與源於NRG1之位置54的核酸之間。較佳地,該包含有CADM1外顯子7的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 7之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 7之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 7之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置53及54的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 7之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置53及54的核酸。
較佳地,本文所提供之任一CADM1-NRG1多核苷酸融合物為CADM1與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有CADM1之外顯子7或外顯子7的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 7或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 7有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
較佳地,該包含有CADM1外顯子7(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及CADM1或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於CADM1與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該CADM1外顯子7(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有CADM1的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之CADM1-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自CADM1的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該CADM1-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,包括肺癌或腺癌,尤其是肺腺癌。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述CADM1-NRG1多核苷酸融合物較佳地進一步包括CADM1外顯子7之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 39及130可能就足夠了。來自CADM1外顯子7之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 33-38(或SEQ ID NO: 33-38之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之任一者或全部,或是由其組成。
CD44-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有CD44之外顯子5的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。CD44之外顯子5較佳為SEQ ID NO: 65或SEQ ID NO: 65之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
較佳地,該CD44外顯子5之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 65有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,CD44之外顯子5的部分係包含或根據SEQ ID NO: 9,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 9有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與CD44的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 10之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 10有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,CD44之外顯子5的部分包含來自SEQ ID NO: 9之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置52的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 9之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置52的核酸。更佳地,CD44之外顯子5的部分係包含或根據SEQ ID NO: 9或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測CD44與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,CD44外顯子5的部分包含SEQ ID NO: 65(或SEQ ID NO: 65之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置231的核酸。較佳地,CD44外顯子5的部分包含來自SEQ ID NO: 65或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置231的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 65之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置231的核酸。在此替代例中,CD44外顯子5的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 231或其對偶基因變異體。較佳地,在與CD44的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
在一替代性較佳實施例中,該包含有CD44外顯子5的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 11之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置52及53的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 11之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置52及53的核酸。SEQ ID NO: 11包括介於CD44與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於CD44之位置52的核酸與源於NRG1之位置53的核酸之間。較佳地,該包含有CD44外顯子5的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 15之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 11之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 11之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置52及53的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 11之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置52及53的核酸。
較佳地,本文所提供之任一CD44-NRG1多核苷酸融合物為CD44與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有CD44之外顯子5 (或外顯子5的一部分)以及NRG1之外顯子2 (或NRG1之外顯子2的一部分)之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 11或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 11有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
較佳地,該包含有CD44外顯子5(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及CD44或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於CD44與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該CD44外顯子5(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有CD44的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之CD44-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自CD44的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該CD44-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,包括胰臟癌或胰臟腺癌,尤其是胰臟導管腺癌(或PDAC)。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述CD44-NRG1多核苷酸融合物較佳地進一步包括CD44外顯子5之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 65及126可能就足夠了。來自CD44外顯子5之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 61-64(或SEQ ID NO: 61-64之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
再者,提供了一種包含有CD44之外顯子5的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。所述CD44之外顯子5較佳為SEQ ID NO: 65或SEQ ID NO: 65之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
較佳地,所述CD44外顯子5之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 65有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,所述CD44之外顯子5的部分係包含或根據SEQ ID NO: 759,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 9有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與CD44的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 760之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 760有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,CD44之外顯子5的部分包含來自SEQ ID NO: 759之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置75的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 759之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75的核酸。更佳地,所述CD44之外顯子5的部分係包含或根據SEQ ID NO: 759或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測CD44與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,所述CD44外顯子5的部分包含SEQ ID NO: 65(或SEQ ID NO: 65之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置231的核酸。較佳地,所述CD44外顯子5的部分包含來自SEQ ID NO: 65或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置231的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 65之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置231的核酸。在此替代例中,CD44外顯子5的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 65或其對偶基因變異體。較佳地,在與CD44的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一CD44-NRG1多核苷酸融合物為CD44與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有CD44之外顯子5或外顯子5的一部分以及NRG1之外顯子6或NRG1之外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 761或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 761有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有所述CD44外顯子5的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 761之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置75及76的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 761之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75及76的核酸。SEQ ID NO: 761包括介於CD44與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於CD44之位置75的核酸與源於NRG1之位置76的核酸之間。較佳地,該包含有CD44外顯子5的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 761之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 761之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 761之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置75及76的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 761之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置75及76的核酸。
較佳地,該包含有CD44外顯子5(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及所述CD44或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於CD44與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該CD44外顯子5(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有CD44的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之CD44-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自CD44的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該CD44-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是胰臟癌。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括CD44外顯子5之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 65及130可能就足夠了。來自CD44外顯子5之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 61-64(或SEQ ID NO: 61-64之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
SLC3A2-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有SLC3A2轉錄本6之外顯子1的一部分與NRG1之外顯子5的一部分融合之多核苷酸融合物。所述SLC3A2之外顯子1較佳為SEQ ID NO: 103或SEQ ID NO: 103之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子5較佳為SEQ ID NO: 129或SEQ ID NO: 129之對偶基因變異體的外顯子。
較佳地,所述SLC3A2外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 103有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子5之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 129有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,所述SLC3A2之外顯子1的部分係包含或根據SEQ ID NO: 13,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 13有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與SLC3A2的融合物中之NRG1之外顯子5的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 14之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 14有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,所述SLC3A2之外顯子1的部分包含來自SEQ ID NO: 13之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置53的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 13之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置53的核酸。更佳地,所述SLC3A2之外顯子1的部分係包含或根據SEQ ID NO: 13或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測SLC3A2與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,所述SLC3A2外顯子1的部分包含SEQ ID NO: 103(或SEQ ID NO: 103之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置552的核酸。較佳地,所述SLC3A2外顯子1的部分包含來自SEQ ID NO: 103或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置552的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 103之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置552的核酸。在此替代例中,SLC3A2外顯子1的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 103或其對偶基因變異體。較佳地,在與所述SLC3A2的融合物中之NRG1外顯子5的部分包含來自SEQ ID NO: 157或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 157之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一SLC3A2-NRG1多核苷酸融合物為SLC3A2與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有SLC3A2之轉錄本6之外顯子1或外顯子1的一部分以及NRG1之外顯子5或外顯子5的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 15或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 15有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有所述SLC3A2外顯子1的一部分與NRG1外顯子5的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 15之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置53及54的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 15之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置53及54的核酸。SEQ ID NO: 15包括介於SLC3A2與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於SLC3A2之位置53的核酸與源於NRG1之位置54的核酸之間。較佳地,該包含有SLC3A2外顯子1的一部分與NRG1外顯子5的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 15之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 15之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 15之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置53及54的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 15之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置53及54的核酸。
較佳地,該包含有SLC3A2轉錄本6之外顯子1(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子5(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及所述SLC3A2或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於所述SLC3A2與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該SLC3A2轉錄本6之外顯子1(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子5(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有SLC3A2的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之SLC3A2-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自SLC3A2的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該SLC3A2-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,包括肺癌或腺癌,尤其是肺腺癌。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述SCL3A2-NRG1多核苷酸融合物較佳地進一步包括NRG1外顯子5之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 103及129可能就足夠了。來自NRG1外顯子5之3’處的任一序列係包含SEQ ID NO: 130-137(或SEQ ID NO: 130-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
再者,提供了一種包含有SLC3A2轉錄本3之外顯子2的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。所述SLC3A2之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 457或SEQ ID NO: 457之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
較佳地,所述SLC3A2外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 457有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,所述SLC3A2之外顯子2的部分係包含或根據SEQ ID NO: 452,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 452有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與SLC3A2的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 453之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 453有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,SLC3A2之外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 452之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置93的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 452之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置93的核酸。更佳地,所述SLC3A2之外顯子2的部分係包含或根據SEQ ID NO: 452或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測SLC3A2與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,所述SLC3A2外顯子2的部分包含SEQ ID NO: 457(或SEQ ID NO: 457之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置93的核酸。較佳地,所述SLC3A2外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 457或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置93的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 39之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置457的核酸。在此替代例中,SLC3A2外顯子2的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 457或其對偶基因變異體。較佳地,在與SLC3A2轉錄本3的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一SLC3A2-NRG1多核苷酸融合物為SLC3A2與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有SLC3A2之轉錄本3之外顯子2或外顯子2的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 454或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 454有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有所述SLC3A2外顯子2的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 454之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置93及94的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 454之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置93及94的核酸。SEQ ID NO: 454包括介於所述SLC3A2與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於SLC3A2之位置93的核酸與源於NRG1之位置94的核酸之間。較佳地,該包含有SLC3A2外顯子2的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 454之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 454之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 454之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置93及94的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 454之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置93及94的核酸。
較佳地,該包含有SLC3A2轉錄本3之外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及所述SLC3A2或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於所述SLC3A2與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該SLC3A2轉錄本3之外顯子2(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有SLC3A2的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之SLC3A2-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自SLC3A2的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該CADM1-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,包括肺癌或腺癌,尤其是肺腺癌。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述SCL3A2-NRG1多核苷酸融合物較佳地進一步包括NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 457及130可能就足夠了。來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列係包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
VTCN1-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有VTCN1之外顯子2的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。VTCN1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 169或SEQ ID NO: 169之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
較佳地,該VTCN1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 169有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,VTCN1之外顯子2的部分係包含或根據SEQ ID NO: 164,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 164有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與VTCN1的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 165之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 165有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,VTCN1之外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 164之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置65的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 164之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置65的核酸。更佳地,VTCN1之外顯子2的部分係包含或根據SEQ ID NO: 164或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測VTCN1與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
較佳地,本文所提供之任一VTCN1-NRG1多核苷酸融合物為VTCN1與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有VTCN1之外顯子2或外顯子2的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 166或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 166有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有VTCN1外顯子2的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 166之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置65及66的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 166之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置65及66的核酸。SEQ ID NO: 166包括介於VTCN1與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於VTCN1之位置65的核酸與源於NRG1之位置66的核酸之間。較佳地,該包含有VTCN1外顯子2的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 166之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。較佳地,在與VTCN1的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 166之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 166之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置65及66的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 166之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置65及66的核酸。
較佳地,該包含有VTCN1外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及VTCN1或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於VTCN1與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該VTCN1外顯子2(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有VTCN1的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之VTCN1-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自VTCN1的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該VTCN1-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括VTCN1外顯子2之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 169及126可能就足夠了。來自VTCN1外顯子2之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 168(或SEQ ID NO: 168之任一對偶基因變異體)或是由其組成,而來自NRG1外顯子2之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
CDH1-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有CDH1之外顯子11的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。CDH1之外顯子11較佳為SEQ ID NO: 198或SEQ ID NO: 198之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括CDH1外顯子11之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 198及126可能就足夠了。來自CDH1外顯子11之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 188-197(或SEQ ID NO: 188-197之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子2之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該CDH1外顯子11之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 198有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,CDH1之外顯子11的部分係包含或根據SEQ ID NO: 184,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 184有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與CDH1的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 185之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 185有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,CDH1之外顯子11的部分包含來自SEQ ID NO: 184之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置119的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 184之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置119的核酸。更佳地,CDH1之外顯子11的部分係包含或根據SEQ ID NO: 184或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測CDH1與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,CDH1外顯子11的部分包含SEQ ID NO: 198(或SEQ ID NO: 198之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置146的核酸。較佳地,CDH1外顯子11的部分包含來自SEQ ID NO: 198或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置146的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 198之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置146的核酸。在此替代例中,CDH1外顯子11的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 198或其對偶基因變異體。
較佳地,本文所提供之任一CDH1-NRG1多核苷酸融合物為CDH1與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有CDH1之外顯子11或外顯子2的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 186或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 186有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有CDH1外顯子11的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 186之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置119及120的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 186之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置119及120的核酸。SEQ ID NO: 186包括介於CDH1與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於CDH1之位置119的核酸與源於NRG1之位置120的核酸之間。較佳地,該包含有CDH1外顯子11的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 186之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 186之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 186之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置119及120的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 186之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置119及120的核酸。
較佳地,該包含有CDH1外顯子11(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及CDH1或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於CDH1與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該CDH1外顯子11(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有CDH1的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之CDH1-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自CDH1的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該CDH1-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,包括肺癌或腺癌,尤其是肺腺癌。
CXADR-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有CXADR之外顯子1的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。CXADR之外顯子1較佳為SEQ ID NO: 2199或SEQ ID NO: 219之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括CXADR外顯子1之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 219及126可能就足夠了。NRG1外顯子2之3’處的任一序列係包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該CXADR外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 219有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,CXADR之外顯子1的部分係包含或根據SEQ ID NO: 215,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 215有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與CXADR的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 216之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 216有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,CXADR之外顯子1的部分包含來自SEQ ID NO: 215之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置43的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 215之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置43的核酸。更佳地,CXADR之外顯子1的部分係包含或根據SEQ ID NO: 215或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測CXADR與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,CXADR外顯子1的部分包含SEQ ID NO: 219(或SEQ ID NO: 219之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置130的核酸。較佳地,CXADR外顯子1的部分包含來自SEQ ID NO: 219或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置130的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 219之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置130的核酸。在此替代例中,CXADR外顯子1的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 219或其對偶基因變異體。
較佳地,本文所提供之任一CXADR-NRG1多核苷酸融合物為CXADR與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有CXADR之外顯子1或外顯子2的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 217或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 217有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有CXADR外顯子1的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 217之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置43及44的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 217之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置43及44的核酸。SEQ ID NO: 217包括介於CXADR與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於CXADR之位置43的核酸與源於NRG1之位置44的核酸之間。較佳地,該包含有CXADR外顯子1的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 217之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。較佳地,在與CXADR的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 217之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 217之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置43及44的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 217之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置43及44的核酸。
較佳地,該包含有CXADR外顯子1(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及CXADR或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於CXADR與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該CXADR外顯子1(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有CXADR的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之CXADR-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自CXADR的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該CXADR-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是大腸癌。
GTF2E2-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有GTF2E2之外顯子2的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。GTF2E2之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 236或SEQ ID NO: 236之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括GTF2E2外顯子2之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 236及126可能就足夠了。來自GTF2E2外顯子2之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 235(或SEQ ID NO: 235之任一對偶基因變異體)或是由其組成,而來自NRG1外顯子2之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該GTF2E2外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 236有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,GTF2E2之外顯子2的部分係包含或根據SEQ ID NO: 231,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 231有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與GTF2E2的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 232之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 232有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,GTF2E2之外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 231之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置141的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 231之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置141的核酸。更佳地,GTF2E2之外顯子2的部分係包含或根據SEQ ID NO: 231或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測GTF2E2與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,GTF2E2外顯子2的部分包含SEQ ID NO: 236(或SEQ ID NO: 236之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置170的核酸。較佳地,GTF2E2外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 236或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置170的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 236之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置170的核酸。在此替代例中,GTF2E2外顯子2的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 236或其對偶基因變異體。較佳地,在與GTF2E2的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一GTF2E2-NRG1多核苷酸融合物為GTF2E2與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有GTF2E2之外顯子2或外顯子2的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 233或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 233有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有GTF2E2外顯子2的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 233之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置141及142的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 233之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置141及142的核酸。SEQ ID NO: 233包括介於GTF2E2與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於GTF2E2之位置141的核酸與源於NRG1之位置142的核酸之間。較佳地,該包含有GTF2E2外顯子2的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 233之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 233之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 233之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置141及142的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 233之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置141及142的核酸。
較佳地,該包含有GTF2E2外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及GTF2E2或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於GTF2E2與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該GTF2E2外顯子2(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有GTF2E2的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之GTF2E2-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自GTF2E2的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該GTF2E2-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,更尤其是(轉移性)乳腺癌NOS。
CSMD1-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有CSMD1之外顯子23的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。CSMD1之外顯子23較佳為SEQ ID NO: 279或SEQ ID NO: 279之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括CSMD1外顯子23之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 279及130可能就足夠了。來自CSMD1外顯子23之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 257-278(或SEQ ID NO: 257-278之任一對偶基因變異體)中之任一者或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該CSMD1外顯子23之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 279有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,CSMD1之外顯子23的部分係包含或根據SEQ ID NO: 253,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 253有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與CSMD1的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 254之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 254有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,CSMD1之外顯子23的部分包含來自SEQ ID NO: 253之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置88的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 253之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置88的核酸。更佳地,CSMD1之外顯子23的部分係包含或根據SEQ ID NO: 253或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測CSMD1與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,CSMD1外顯子23的部分包含SEQ ID NO: 279(或SEQ ID NO: 279之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置157的核酸。較佳地,CSMD1外顯子23的部分包含來自SEQ ID NO: 279或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置157的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 279之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置157的核酸。在此替代例中,CSMD1外顯子23的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 279或其對偶基因變異體。較佳地,在與CSMD1的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一CSMD1-NRG1多核苷酸融合物為CSMD1與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有CSMD1之外顯子23或外顯子6的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 255或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 255有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有CSMD1外顯子23的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 255之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置88及89的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 255之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置88及89的核酸。SEQ ID NO: 255包括介於CSMD1與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於CSMD1之位置88的核酸與源於NRG1之位置89的核酸之間。較佳地,該包含有CSMD1外顯子23的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 255之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 255之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 255之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置88及89的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 255之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置88及89的核酸。
較佳地,該包含有CSMD1外顯子23(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及CSMD1或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於CSMD1與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該CSMD1外顯子23(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有CSMD1的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之CSMD1-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自CSMD1的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該CSMD1-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌。
PTN-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有PTN之外顯子4的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。PTN之外顯子4較佳為SEQ ID NO: 318或SEQ ID NO: 318之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括PTN外顯子4之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 318及126可能就足夠了。來自PTN外顯子4之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 315-317(或SEQ ID NO: 315-317之任一對偶基因變異體)中之任一者或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子2之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該PTN外顯子4之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 318有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,PTN之外顯子4的部分係包含或根據SEQ ID NO: 311,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 311有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與PTN的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 312之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 312有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,PTN之外顯子4的部分包含來自SEQ ID NO: 311之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置102的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 311之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置102的核酸。更佳地,PTN之外顯子4的部分係包含或根據SEQ ID NO: 311或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測PTN與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,PTN外顯子4的部分包含SEQ ID NO: 318(或SEQ ID NO: 318之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置162的核酸。較佳地,PTN外顯子4的部分包含來自SEQ ID NO: 318或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置162的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 318之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置162的核酸。在此替代例中,PTN外顯子4的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 318或其對偶基因變異體。較佳地,在與PTN的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一PTN-NRG1多核苷酸融合物為PTN與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有PTN之外顯子4或外顯子2的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 313或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 313有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有PTN外顯子4的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 313之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置102及103的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 313之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置102及103的核酸。SEQ ID NO: 313包括介於PTN與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於PTN之位置102的核酸與源於NRG1之位置103的核酸之間。較佳地,該包含有PTN外顯子4的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 313之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 313之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 313之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置102及103的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 313之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置102及103的核酸。
較佳地,該包含有PTN外顯子4(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及PTN或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於PTN與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該PTN外顯子4(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有PTN的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之PTN-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自PTN的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該PTN-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌。
ST14-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有ST14之外顯子11的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。ST14之外顯子11較佳為SEQ ID NO: 342或SEQ ID NO: 342之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括ST14外顯子11之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 324及130可能就足夠了。來自ST14外顯子11之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 332-341(或SEQ ID NO: 332-341之任一對偶基因變異體)中之任一者或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該ST14外顯子11之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 342有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,ST14之外顯子11的部分係包含或根據SEQ ID NO: 328,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 328有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與ST14的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 329之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 329有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,ST14之外顯子11的部分包含來自SEQ ID NO: 328之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置95的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 328之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置95的核酸。更佳地,ST14之外顯子11的部分係包含或根據SEQ ID NO: 328或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測ST14與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,ST14外顯子11的部分包含SEQ ID NO: 342(或SEQ ID NO: 342之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置131的核酸。較佳地,ST14外顯子11的部分包含來自SEQ ID NO: 342或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置131的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 342之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置131的核酸。在此替代例中,ST14外顯子11的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 342或其對偶基因變異體。較佳地,在與ST14 的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一ST14-NRG1多核苷酸融合物為ST14與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有ST14之外顯子11或外顯子6的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 330或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 330有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有ST14外顯子11的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 330之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置95及96的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 330之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置95及96的核酸。SEQ ID NO: 330包括介於ST14 與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於ST14之位置95的核酸與源於NRG1之位置96的核酸之間。較佳地,該包含有ST14外顯子11的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 330之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 330之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 330之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置95及96的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 330之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置95及96的核酸。
較佳地,該包含有ST14外顯子11(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及ST14或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於ST14與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該ST14外顯子11(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有ST14的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之ST14-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自ST14的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該ST14-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌。
THBS1-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有THBS1之外顯子9的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。THBS1之外顯子9較佳為SEQ ID NO: 386或SEQ ID NO: 386之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括THBS1外顯子9之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 386及130可能就足夠了。來自THBS1外顯子9之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 378-385(或SEQ ID NO: 378-385之任一對偶基因變異體)中之任一者或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該THBS1外顯子9之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 386有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,THBS1之外顯子9的部分係包含或根據SEQ ID NO: 374,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 374有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與THBS1的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 375之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 375有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,THBS1之外顯子9的部分包含來自SEQ ID NO: 374之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置56的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 374之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置56的核酸。更佳地,THBS1之外顯子9的部分係包含或根據SEQ ID NO: 374或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測THBS1與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,THBS1外顯子9的部分包含SEQ ID NO: 386(或SEQ ID NO: 386之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置177的核酸。較佳地,THBS1外顯子9的部分包含來自SEQ ID NO: 386或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置177的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 386之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置177的核酸。在此替代例中,THBS1外顯子9的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 386或其對偶基因變異體。較佳地,在與THBS1的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一THBS1-NRG1多核苷酸融合物為THBS1與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有THBS1之外顯子9或外顯子6的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 376或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 376有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有THBS1外顯子9的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 376之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置56及57的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 376之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置56及57的核酸。SEQ ID NO: 376包括介於THBS1與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於THBS1之位置56的核酸與源於NRG1之位置57的核酸之間。較佳地,該包含有THBS1外顯子9的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 376之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 376之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 376之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置56及57的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 376之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置56及57的核酸。
較佳地,該包含有THBS1外顯子9(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及THBS1或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於THBS1與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該THBS1外顯子9(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有THBS1的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之THBS1-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自THBS1的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該THBS1-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌。
AGRN-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有AGRN之外顯子12的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。AGRN之外顯子12較佳為SEQ ID NO: 416或SEQ ID NO: 416之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括AGRN外顯子12之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 416及130可能就足夠了。來自AGRN外顯子12之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 405-415(或SEQ ID NO: 405-415之任一對偶基因變異體)中之任一者或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該AGRN外顯子12之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 416有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,AGRN之外顯子12的部分係包含或根據SEQ ID NO: 401,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 401有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與AGRN的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 402之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 402有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,AGRN之外顯子12的部分包含來自SEQ ID NO: 401之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置106的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 401之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置106的核酸。更佳地,AGRN之外顯子12的部分係包含或根據SEQ ID NO: 401或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測AGRN與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,AGRN外顯子12的部分包含SEQ ID NO: 416(或SEQ ID NO: 416之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置106的核酸。較佳地,AGRN外顯子12的部分包含來自SEQ ID NO: 416或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置106的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 416之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置106的核酸。在此替代例中,AGRN外顯子12的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 416或其對偶基因變異體。較佳地,在與AGRN的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一AGRN-NRG1多核苷酸融合物為AGRN與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有AGRN之外顯子12或外顯子12的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 403或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 403有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有AGRN外顯子12的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 403之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置106及107的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 403之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置106及107的核酸。SEQ ID NO: 403包括介於AGRN與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於AGRN之位置106的核酸與源於NRG1之位置107的核酸之間。較佳地,該包含有AGRN外顯子12的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 403之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 403之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 403之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置106及107的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 403之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置106及107的核酸。
較佳地,該包含有AGRN外顯子12(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及AGRN或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於AGRN與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該AGRN外顯子12(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有AGRN的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之AGRN-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自AGRN的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該AGRN-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌。
PVALB-NRG1 多核苷酸融合物
根據本揭露,亦提供一種包含有PVALB核酸序列(或PVALB核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸。所述融合物中也包括了PVALB及NRG1核酸序列的對偶基因變異體。
較佳地,該PVALB核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 439-444中之任一者或SEQ ID NO: 439-444中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成,而該NRG1核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或SEQ ID NO: 125-138中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成。更佳地,該PVALB核酸序列包含SEQ ID NO: 444或SEQ ID NO: 444的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成,而該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 138或SEQ ID NO: 138的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成。SEQ ID NO: 439-443分別對應根據NM_002854.3之PVALB的個別外顯子1-5。SEQ ID NO: 444對應根據NM_002854.3之PVALB的外顯子1-5。SEQ ID NO: 125-137分別對應根據NM_001159999之NRG1的個別外顯子1-13。SEQ ID NO: 138對應根據NM_001159999之NRG1的外顯子1-13。
在一較佳實施例中,該PVALB核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 439-444中之任一者(或SEQ ID NO: 439-444中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,而該NRG1核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 125-138中之任一者(或SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸。
亦提供了一種包含有PVALB之外顯子4的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。PVALB之外顯子4較佳為SEQ ID NO: 442或SEQ ID NO: 442之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括PVALB外顯子4之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 422及130可能就足夠了。來自PVALB外顯子4之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 439-441(或SEQ ID NO: 439-441之任一對偶基因變異體)中之任一者或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該PVALB外顯子4之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 442有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,PVALB之外顯子4的部分係包含或根據SEQ ID NO: 435,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 435有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與PVALB的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 436之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 436有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,PVALB之外顯子4的部分包含來自SEQ ID NO: 435之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置102的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 435之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置102的核酸。更佳地,PVALB之外顯子4的部分係包含或根據SEQ ID NO: 435或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測PVALB與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,PVALB外顯子4的部分包含SEQ ID NO: 442(或SEQ ID NO: 442之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置110的核酸。較佳地,PVALB外顯子4的部分包含來自SEQ ID NO: 442或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置110的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 442之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置110的核酸。在此替代例中,PVALB外顯子4的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 442或其對偶基因變異體。較佳地,在與PVALB的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一PVALB-NRG1多核苷酸融合物為PVALB與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有PVALB之外顯子4或外顯子4的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 437或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 437有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有PVALB外顯子4的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 437之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置102及103的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 437之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置102及103的核酸。SEQ ID NO: 437包括介於PVALB與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於PVALB之位置102的核酸與源於NRG1之位置103的核酸之間。較佳地,該包含有PVALB外顯子4的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 437之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
較佳地,該包含有PVALB外顯子4(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及PVALB或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於PVALB與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該PVALB外顯子4(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有PVALB的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之PVALB-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自PVALB的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該PVALB-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌。
APP-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有APP之外顯子14的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。APP之外顯子14較佳為SEQ ID NO: 501或SEQ ID NO: 501之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括APP外顯子14之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 501及130可能就足夠了。來自APP外顯子14之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 488-500(或SEQ ID NO: 488-500之任一對偶基因變異體)中之任一者或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該APP外顯子14之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 501有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,APP之外顯子14的部分係包含或根據SEQ ID NO: 484,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 484有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與APP的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 485之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 485有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,APP之外顯子14的部分包含來自SEQ ID NO: 484之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置54的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 484之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置54的核酸。更佳地,APP之外顯子14的部分係包含或根據SEQ ID NO: 484或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測APP與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,APP外顯子14的部分包含SEQ ID NO: 501(或SEQ ID NO: 501之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置54的核酸。較佳地,APP外顯子14的部分包含來自SEQ ID NO: 501或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置54的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 501之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置54的核酸。在此替代例中,APP外顯子14的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 501或其對偶基因變異體。較佳地,在與APP的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一APP-NRG1多核苷酸融合物為APP與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有APP之外顯子14或外顯子14的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 486或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 486有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有APP外顯子14的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 486之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置54及55的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 486之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置54及55的核酸。SEQ ID NO: 486包括介於APP與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於APP之位置54的核酸與源於NRG1之位置54的核酸之間。較佳地,該包含有APP外顯子14的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 486之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 486之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 486之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置54及55的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 486之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置54及55的核酸。
較佳地,該包含有APP外顯子14(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及APP或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於APP與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該APP外顯子14(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有APP的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之APP-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自APP的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該APP-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌。
WRN-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有WRN之外顯子33的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。WRN之外顯子33較佳為SEQ ID NO: 562或SEQ ID NO: 562之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括WRN外顯子33之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 562及130可能就足夠了。來自WRN外顯子33之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 530-561(或SEQ ID NO: 530-561之任一對偶基因變異體)中之任一者或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該WRN外顯子33之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 562有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,WRN之外顯子33的部分係包含或根據SEQ ID NO: 526,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 526有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與WRN的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 527之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 527有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,WRN之外顯子33的部分包含來自SEQ ID NO: 526之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置96的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 526之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置96的核酸。更佳地,WRN之外顯子33的部分係包含或根據SEQ ID NO: 526或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測WRN與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,WRN外顯子33的部分包含SEQ ID NO: 562(或SEQ ID NO: 562之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置163的核酸。較佳地,WRN外顯子33的部分包含來自SEQ ID NO: 562或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置163的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 562之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置163的核酸。在此替代例中,WRN外顯子33的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 562或其對偶基因變異體。較佳地,在與WRN的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一WRN-NRG1多核苷酸融合物為WRN與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有WRN之外顯子33或外顯子33的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 528或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 528有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有WRN外顯子33的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 528之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置96及97的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 528之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置96及97的核酸。SEQ ID NO: 528包括介於WRN與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於WRN之位置96的核酸與源於NRG1之位置97的核酸之間。較佳地,該包含有WRN外顯子33的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 528之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 528之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 528之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置96及97的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 528之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置96及97的核酸。
較佳地,該包含有WRN外顯子33(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及WRN或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於WRN與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該WRN外顯子33(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有WRN的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之WRN-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自WRN的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該WRN-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是乳癌。
DAAM1-NRG1 多核苷酸融合物
根據本揭露,亦提供一種包含有DAAM1核酸序列(或DAAM1核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸。所述融合物中也包括了DAAM1及NRG1核酸序列的對偶基因變異體。
較佳地,該DAAM1核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 606-631中之任一者或SEQ ID NO: 606-631中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成,而該NRG1核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或SEQ ID NO: 125-138中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成。更佳地,該DAAM1核酸序列包含SEQ ID NO: 631或SEQ ID NO: 631的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成,而該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 138或SEQ ID NO: 138的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成。SEQ ID NO: 606-630分別對應根據NM_001270520.2之DAAM1的個別外顯子1-25。SEQ ID NO: 631對應根據NM_001270520.2之DAAM1的外顯子1-25。SEQ ID NO: 125-137分別對應根據NM_001159999.3之NRG1的個別外顯子1-13。SEQ ID NO: 138對應根據NM_001159999.3之NRG1的外顯子1-13。
在一較佳實施例中,該DAAM1核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 606-631中之任一者(或SEQ ID NO: 606-631中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,而該NRG1核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 125-138中之任一者(或SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸。
較佳地,該DAAM1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 606-631中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該DAAM1核酸序列或其部分係位於NRG1核酸序列或其部分的5’處。
較佳地,該包含有DAAM1之DAAM1核酸序列(或所述序列的一部分)與NRG1核酸序列(或所述序列的一部分)融合之多核苷酸係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。包含有該DAAM1-NRG1多核苷酸融合物之異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於DAAM1與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在可使得所得融合核酸編碼NRG1的EGF樣結構域的位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
亦提供了一種包含有DAAM1之外顯子1的一部分與NRG1之外顯子1的一部分融合之多核苷酸融合物。DAAM1之外顯子1較佳為SEQ ID NO: 606或SEQ ID NO: 606之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子1較佳為SEQ ID NO: 125或SEQ ID NO: 125之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括DAAM1外顯子1之5’處的任一序列以及NRG1外顯子1之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 606及125可能就足夠了。來自DAAM1外顯子1之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 606(或SEQ ID NO: 606之任一對偶基因變異體)或是由其組成,而來自NRG1外顯子1之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 126-137(或SEQ ID NO: 126-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該DAAM1外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 606有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,DAAM1之外顯子1的部分係包含或根據SEQ ID NO: 603,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 603有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與DAAM1的融合物中之NRG1之外顯子1的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 604之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 604有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,DAAM1之外顯子1的部分包含來自SEQ ID NO: 603之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置75的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 603之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75的核酸。更佳地,DAAM1之外顯子1的部分係包含或根據SEQ ID NO: 603或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測DAAM1與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,DAAM1外顯子1的部分包含SEQ ID NO: 606(或SEQ ID NO: 606之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置102的核酸。較佳地,DAAM1外顯子1的部分包含來自SEQ ID NO: 606或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置102的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 606之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置102的核酸。在此替代例中,DAAM1外顯子1的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 606或其對偶基因變異體。較佳地,在與DAAM1的融合物中之NRG1外顯子1的部分包含來自SEQ ID NO: 125或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 125之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
在一替代性較佳實施例中,該包含有DAAM1外顯子1的一部分與NRG1外顯子1的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 605之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置75及76的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 605之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75及76的核酸。SEQ ID NO: 605包括介於DAAM1與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於DAAM1之位置75的核酸與源於NRG1之位置76的核酸之間。較佳地,該包含有DAAM1外顯子1的一部分與NRG1外顯子1的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 605之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
較佳地,本文提供之任一DAAM1-NRG1多核苷酸融合物為DAAM1之未轉譯區域的一部分與NRG1之未轉譯區域的一部分之融合物。更佳地,所述融合物為一種包含有DAAM1之外顯子1(或外顯子1的一部分)與NRG1之外顯子1(或NRG1外顯子1的一部分)的融合物。所述融合物較佳為SEQ ID NO: 605或其對偶基因變異體之融合物,且與SEQ ID NO: 605有至少85%的一致性,較佳地與其至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
較佳地,DAAM1外顯子1(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子1(或其對偶基因變異體)的5’處。該NRG1蛋白因而變成了位在DAAM1啟動子的下游並且期望能在轉錄上受所述啟動子的控制。所得融合物因而導致了非蛋白質融合的NRG1蛋白質表現,且因此含有EGF樣結構域。隨之而來的是驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是乳癌。
ASPH-NRG1 多核苷酸融合物
根據本揭露,亦提供一種包含有ASPH核酸序列(或ASPH核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸。所述融合物中也包括了ASPH及NRG1核酸序列的對偶基因變異體。
較佳地,該ASPH核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 637-662中之任一者或SEQ ID NO: 637-662中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成,而該NRG1核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或SEQ ID NO: 125-138中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成。更佳地,該ASPH核酸序列包含SEQ ID NO: 662或SEQ ID NO: 662的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成,而該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 138或SEQ ID NO: 138的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成。SEQ ID NO: 637-661分別對應根據NM_001164750.2之ASPH的個別外顯子1-25。SEQ ID NO: 662對應根據NM_001164750.2之ASPH的外顯子1-25。SEQ ID NO: 125-137分別對應根據NM_001159999.3之NRG1的個別外顯子1-13。SEQ ID NO: 138對應根據NM_001159999.3之NRG1的外顯子1-13。
在一較佳實施例中,該ASPH核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 637-662中之任一者(或SEQ ID NO: 637-662中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,而該NRG1核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 125-138中之任一者(或SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸。
較佳地,該ASPH核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 637-662中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該ASPH核酸序列或其部分係位於NRG1核酸序列或其部分的5’處。
較佳地,該包含有ASPH之ASPH核酸序列(或所述序列的一部分)與NRG1核酸序列(或所述序列的一部分)融合之多核苷酸係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。包含有該ASPH-NRG1多核苷酸融合物或表現該多肽融合物之異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於ASPH與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在可使得所得融合產物、核酸或蛋白質包含NRG1的EGF樣結構域的位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
亦提供了一種包含有ASPH之外顯子22的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。ASPH之外顯子22較佳為SEQ ID NO: 658或SEQ ID NO: 658之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括ASPH外顯子22之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 658及126可能就足夠了。來自ASPH外顯子22之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 637-657(或SEQ ID NO: 637-657之任一對偶基因變異體)中之一或全部,而來自NRG1外顯子2之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該ASPH外顯子22之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 658有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,ASPH之外顯子22的部分係包含或根據SEQ ID NO: 633,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 633有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與ASPH的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 634之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 634有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,ASPH之外顯子22的部分包含來自SEQ ID NO: 633之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置75的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 633之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75的核酸。更佳地,ASPH之外顯子22的部分係包含或根據SEQ ID NO: 633或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測ASPH與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,ASPH外顯子22的部分包含SEQ ID NO: 658(或SEQ ID NO: 658之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置136的核酸。較佳地,ASPH外顯子22的部分包含來自SEQ ID NO: 658或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置136的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 658之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置136的核酸。在此替代例中,ASPH外顯子22的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 658或其對偶基因變異體。較佳地,在與ASPH的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
在一替代性較佳實施例中,該包含有ASPH外顯子22的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 635之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置75及76的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 635之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75及76的核酸。SEQ ID NO: 635包括介於ASPH與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於ASPH之位置75的核酸與源於NRG1之位置76的核酸之間。較佳地,該包含有ASPH外顯子22的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 635之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
較佳地,本文所提供之任一ASPH-NRG1多核苷酸融合物為ASPH與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有ASPH之外顯子22或外顯子22的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 635或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 635有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
較佳地,ASPH外顯子2(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有ASPH的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之ASPH-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自ASPH的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該ASPH-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌,更尤其是大腸直腸腺癌。
NOTCH2-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有NOTCH2之外顯子6的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。NOTCH2之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 700或SEQ ID NO: 700之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子1較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括NOTCH2外顯子6之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 700及130可能就足夠了。來自NOTCH2外顯子6之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 695-699(或SEQ ID NO: 695-699之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該NOTCH2外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 700有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,NOTCH2之外顯子6的部分係包含或根據SEQ ID NO: 691,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 691有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與NOTCH2的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 692之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 692有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,NOTCH2之外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 691之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置75的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 691之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75的核酸。更佳地,NOTCH2之外顯子6的部分係包含或根據SEQ ID NO: 691或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測NOTCH2與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,NOTCH2外顯子6的部分包含SEQ ID NO: 700(或SEQ ID NO: 700之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置234的核酸。較佳地,NOTCH2外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 700或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置234的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 700之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置234的核酸。在此替代例中,NOTCH2外顯子6的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 700或其對偶基因變異體。較佳地,在與NOTCH2的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一NOTCH2-NRG1多核苷酸融合物為NOTCH2與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有NOTCH2之外顯子6或外顯子6的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 693或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 693有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有NOTCH2外顯子6的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 693之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置75及76的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 693之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75及76的核酸。SEQ ID NO: 693包括介於NOTCH2與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於NOTCH2之位置75的核酸與源於NRG1之位置76的核酸之間。較佳地,該包含有NOTCH2外顯子6的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 693之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 693之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 693之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置75及76的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 693之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置75及76的核酸。
較佳地,該包含有NOTCH2外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及NOTCH2或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於NOTCH2與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該NOTCH2外顯子6(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有NOTCH2的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之NOTCH2-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自NOTCH2的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該NOTCH2-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌。
CD74-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有CD74之外顯子2的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。CD74之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 720或SEQ ID NO: 720之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括CD74外顯子2之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 720及126可能就足夠了。來自CD74外顯子2之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 719(或SEQ ID NO: 719之任一對偶基因變異體)或是由其組成,而來自NRG1外顯子2之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該CD74外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 720有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,CD74之外顯子2的部分係包含或根據SEQ ID NO: 715,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 715有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與CD74的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 716之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 716有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,CD74之外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 715之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置75的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 715之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75的核酸。更佳地,CD74之外顯子2的部分係包含或根據SEQ ID NO: 715或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測CD74與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,CD74外顯子2的部分包含SEQ ID NO: 720(或SEQ ID NO: 720之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置173的核酸。較佳地,CD74外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 720或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置173的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 720之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置173的核酸。在此替代例中,CD74外顯子2的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 720或其對偶基因變異體。較佳地,在與CD74的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一CD74-NRG1多核苷酸融合物為CD74與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有CD74之外顯子2或外顯子2的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 717或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 717有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有CD74外顯子2的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 717之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置53及54的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 7之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75及76的核酸。SEQ ID NO: 717包括介於CD74與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於CD74之位置75的核酸與源於NRG1之位置76的核酸之間。較佳地,該包含有CD74外顯子2的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 717之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 717之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 717之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置75及76的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 717之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置75及76的核酸。
較佳地,該包含有CD74外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及CD74或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於CD74與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該CD74外顯子2(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有CD74的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之CD74-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自CD74的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該CD74-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是肺癌。
SDC4-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有SDC4之外顯子2的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。所述SDC4之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 746或SEQ ID NO: 746之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
較佳地,所述SDC4外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 746有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,所述SDC4之外顯子2的部分係包含或根據SEQ ID NO: 741,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 741有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與SDC4的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 742之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 742有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,SDC4之外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 741之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置75的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 741之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75的核酸。更佳地,所述SDC4之外顯子2的部分係包含或根據SEQ ID NO: 741或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測SDC4與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,所述SDC4外顯子2的部分包含SEQ ID NO: 746(或SEQ ID NO: 746之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置139的核酸。較佳地,所述SDC4外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 746或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置139的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 746之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置139的核酸。在此替代例中,SDC4外顯子2的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 746或其對偶基因變異體。較佳地,在與SDC4的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一SDC4-NRG1多核苷酸融合物為SDC4與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有SDC4之外顯子2或外顯子2的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 743或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 743有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有所述SDC4外顯子2的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 743之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置75及76的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 743之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75及76的核酸。SEQ ID NO: 743包括介於SDC4與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於SDC4之位置75的核酸與源於NRG1之位置76的核酸之間。較佳地,該包含有SDC4外顯子2的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 743之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 743之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 743之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置75及76的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 743之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置75及76的核酸。
較佳地,該包含有SDC4外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及所述SDC4或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於SDC4與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該SDC4外顯子2(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有SDC4的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之SDC4-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自SDC4的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該SDC4-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是肺癌。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括SDC4外顯子2之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 746及126可能就足夠了。來自SDC4外顯子2之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 745(或SEQ ID NO: 745之任一對偶基因變異體)或是由其組成,而來自NRG1外顯子2之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
再者,提供了一種包含有SDC4之外顯子4的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。所述SDC4之外顯子4較佳為SEQ ID NO: 748或SEQ ID NO: 748之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
較佳地,所述SDC4外顯子4之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 748有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,所述SDC4之外顯子4的部分係包含或根據SEQ ID NO: 822,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 822有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與SDC4的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 823之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 823有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,SDC4之外顯子4的部分包含來自SEQ ID NO: 822之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置75的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 822之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75的核酸。更佳地,所述SDC4之外顯子4的部分係包含或根據SEQ ID NO: 822或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測SDC4與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,所述SDC4外顯子4的部分包含SEQ ID NO: 748(或SEQ ID NO: 748之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置199的核酸。較佳地,所述SDC4外顯子4的部分包含來自SEQ ID NO: 748或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置199的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 748之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置199的核酸。在此替代例中,SDC4外顯子4的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 748或其對偶基因變異體。較佳地,在與SDC4的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一SDC4-NRG1多核苷酸融合物為SDC4與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有SDC4之外顯子4或外顯子4的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 824或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 824有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有所述SDC4外顯子4的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 824之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置75及76的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 824之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75及76的核酸。SEQ ID NO: 824包括介於SDC4與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於SDC4之位置75的核酸與源於NRG1之位置76的核酸之間。較佳地,該包含有SDC4外顯子4的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 824之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 824之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 824之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置53及54的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 824之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置75及76的核酸。
較佳地,該包含有SDC4外顯子4(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及所述SDC4或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於SDC4與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該SDC4外顯子4(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有SDC4的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之SDC4-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自SDC4的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該SDC4-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,包括肺癌,尤其是非小細胞肺癌。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括SDC4外顯子4之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 748及126可能就足夠了。來自SDC4外顯子4之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 745-747(或SEQ ID NO: 745-747之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子2之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
SLC4A4-NRG1 多核苷酸融合物
亦提供了一種包含有SLC4A4之外顯子14的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。SLC4A4之外顯子14較佳為SEQ ID NO: 780或SEQ ID NO: 780之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括SLC4A4外顯子14之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 780及130可能就足夠了。來自SLC4A4外顯子14之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 767-779(或SEQ ID NO: 767-779之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該SLC4A4外顯子14之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 780有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,SLC4A4之外顯子14的部分係包含或根據SEQ ID NO: 763,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 763有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與SLC4A4的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 764之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 764有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,SLC4A4之外顯子14的部分包含來自SEQ ID NO: 763之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置75的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 763之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75的核酸。更佳地,SLC4A4之外顯子14的部分係包含或根據SEQ ID NO: 763或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測SLC4A4與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,SLC4A4外顯子14的部分包含SEQ ID NO: 780(或SEQ ID NO: 780之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置272的核酸。較佳地,SLC4A4外顯子14的部分包含來自SEQ ID NO: 780或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置272的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 780之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置272的核酸。在此替代例中,SLC4A4外顯子14的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 780或其對偶基因變異體。較佳地,在與SLC4A4的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
較佳地,本文所提供之任一SLC4A4-NRG1多核苷酸融合物為SLC4A4與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有SLC4A4之外顯子14或外顯子14的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 765或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 765有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
在一替代性較佳實施例中,該包含有SLC4A4外顯子14的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 765之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置75及76的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 765之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75及76的核酸。SEQ ID NO: 765包括介於SLC4A4與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於SLC4A4之位置75的核酸與源於NRG1之位置76的核酸之間。較佳地,該包含有SLC4A4外顯子14的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 765之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
在一較佳實施例中,提供了一種根據SEQ ID NO: 765之多核苷酸,或一種包含了來自SEQ ID NO: 765之約20、約30、約40個或全部的連續核酸且較佳地包括了位置75及76的核酸之多核苷酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 765之18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且較佳地至少包括位置75及76的核酸。
較佳地,該包含有SLC4A4外顯子14(或其對偶基因變異體)的一部分與NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的一部分融合之多核苷酸係為一種進一步包含了或編碼了NRG1的EGF樣結構域之較長多核苷酸的一部分。包含有涉及SLC4A4或表現該多肽融合物之多核苷酸融合物的異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了快速檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於SLC4A4與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在所得融合產物、核酸或蛋白質包含了NRG1之EGF樣結構域的這樣一個位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該SLC4A4外顯子14(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有SLC4A4的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之SLC4A4-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自SLC4A4的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該SLC4A4-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是胰臟癌。
ZFAT-NRG1 多核苷酸融合物
根據本揭露,亦提供一種包含有ZFAT核酸序列(或ZFAT核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸。所述融合物中也包括了ZFAT及NRG1核酸序列的對偶基因變異體。
較佳地,該ZFAT核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 830-846中之任一者或SEQ ID NO: 830-846中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成,而該NRG1核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或SEQ ID NO: 125-138中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成。更佳地,該ZFAT核酸序列包含SEQ ID NO: 846或SEQ ID NO: 846的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成,而該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 138或SEQ ID NO: 138的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成。SEQ ID NO: 830-845分別對應根據NM_020863.4之ZFAT的個別外顯子1-16。SEQ ID NO: 846對應根據NM_020863.4之ZFAT的外顯子1-16。SEQ ID NO: 125-137分別對應根據NM_001159999.3之NRG1的個別外顯子1-13。SEQ ID NO: 138對應根據NM_001159999.3之NRG1的外顯子1-13。
在一較佳實施例中,該ZFAT核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 830-846中之任一者(或SEQ ID NO: 830-846中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,而該NRG1核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 125-138中之任一者(或SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸。
較佳地,該ZFAT核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 830-846中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該ZFAT核酸序列或其部分係位於NRG1核酸序列或其部分的5’處。
較佳地,該包含有ZFAT之ZFAT核酸序列(或所述序列的一部分)與NRG1核酸序列(或所述序列的一部分)融合之多核苷酸係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。
包含有該ZFAT-NRG1多核苷酸融合物或表現該多肽融合物之異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於ZFAT與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在可使得所得融合產物、核酸或蛋白質包含NRG1的EGF樣結構域的位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
亦提供了一種包含有ZFAT之外顯子12的一部分與NRG1之外顯子6的一部分融合之多核苷酸融合物。ZFAT之外顯子12較佳為SEQ ID NO: 841或SEQ ID NO: 841之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子6較佳為SEQ ID NO: 130或SEQ ID NO: 130之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括ZFAT外顯子12之5’處的任一序列以及NRG1外顯子6之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 841及130可能就足夠了。來自ZFAT外顯子12之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 830-840(或SEQ ID NO: 830-840之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子6之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 131-137(或SEQ ID NO: 131-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該ZFAT外顯子12之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 841有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,ZFAT之外顯子12的部分係包含或根據SEQ ID NO: 826,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 826有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與ZFAT的融合物中之NRG1之外顯子6的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 827之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 827有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,ZFAT之外顯子12的部分包含來自SEQ ID NO: 826之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置75的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 826之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75的核酸。更佳地,ZFAT之外顯子12的部分係包含或根據SEQ ID NO: 826或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測ZFAT與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,ZFAT外顯子12的部分包含SEQ ID NO: 841(或SEQ ID NO: 841之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置139的核酸。較佳地,ZFAT外顯子12的部分包含來自SEQ ID NO: 841或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置139的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 841之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置139的核酸。在此替代例中,ZFAT外顯子12的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 841或其對偶基因變異體。較佳地,在與ZFAT的融合物中之NRG1外顯子6的部分包含來自SEQ ID NO: 130或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 130之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
在一替代性較佳實施例中,該包含有ZFAT外顯子12的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 828之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置75及76的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 828之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75及76的核酸。SEQ ID NO: 828包括介於ZFAT與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於ZFAT之位置75的核酸與源於NRG1之位置76的核酸之間。較佳地,該包含有ZFAT外顯子12的一部分與NRG1外顯子6的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 828之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
較佳地,本文所提供之任一ZFAT-NRG1多核苷酸融合物為ZFAT與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有ZFAT之外顯子12或外顯子12的一部分以及NRG1之外顯子6或外顯子6的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 828或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 828有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
較佳地,該ZFAT外顯子12(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子6(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有ZFAT的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之ZFAT-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自ZFAT的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該ZFAT-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是非小細胞肺癌。
DSCAML1-NRG1 多核苷酸融合物
根據本揭露,亦提供一種包含有DSCAML1核酸序列(或DSCAML1核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸。所述融合物中也包括了DSCAML1及NRG1核酸序列的對偶基因變異體。
較佳地,該DSCAML1核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 870-903中之任一者或SEQ ID NO: 870-903中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成,而該NRG1核酸序列(或其部分)包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或SEQ ID NO: 125-138中之任一者的對偶基因變異體,或是由其組成。更佳地,該DSCAML1核酸序列包含SEQ ID NO: 903或SEQ ID NO: 903的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成,而該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 138或SEQ ID NO: 138的對偶基因變異體之一部分,或是由其組成。SEQ ID NO: 870-902分別對應根據NM_020693.4之DSCAML1的個別外顯子1-33。SEQ ID NO: 903對應根據NM_020693.4之DSCAML1的外顯子1-33。SEQ ID NO: 125-137分別對應根據NM_001159999.3之NRG1的個別外顯子1-13。SEQ ID NO: 138對應根據NM_001159999.3之NRG1的外顯子1-13。
在一較佳實施例中,該DSCAML1核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 870-903中之任一者(或SEQ ID NO: 870-903中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,而該NRG1核酸序列部分包含來自SEQ ID NO: 125-138中之任一者(或SEQ ID NO: 125-138中之任一者之對偶基因變異體)之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸。
較佳地,該DSCAML1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 870-903中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,該DSCAML1核酸序列或其部分係位於NRG1核酸序列或其部分的5’處。
較佳地,該包含有DSCAML1之DSCAML1核酸序列(或所述序列的一部分)與NRG1核酸序列(或所述序列的一部分)融合之多核苷酸係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。
包含有該DSCAML1-NRG1多核苷酸融合物或表現該多肽融合物之異常細胞係包含或編碼NRG1的EGF樣結構域。為了檢測、診斷或鑑定之目的,只需證明介於DSCAML1與NRG1之間的融合接合處是符合讀框的並且發生在可使得所得融合產物、核酸或蛋白質包含NRG1的EGF樣結構域的位置即可。所述EGF樣結構域較佳為根據SEQ ID NO: 163或其對偶基因變異體的EGF樣結構域並與SEQ ID NO: 163有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
亦提供了一種包含有DSCAML1之外顯子3的一部分與NRG1之外顯子2的一部分融合之多核苷酸融合物。DSCAML1之外顯子3較佳為SEQ ID NO: 872或SEQ ID NO: 872之對偶基因變異體的外顯子,而NRG1之外顯子2較佳為SEQ ID NO: 126或SEQ ID NO: 126之對偶基因變異體的外顯子。
當存在於患者或個體的異常細胞中時,所述多核苷酸融合物較佳地進一步包括DSCAML1外顯子3之5’處的任一序列以及NRG1外顯子2之3’處的任一序列,但為了能使用以多核苷酸為基礎的檢測測定法來檢測融合接合處,至少存在SEQ ID NO: 872及126可能就足夠了。來自DSCAML1外顯子3之5’處的任一序列包含SEQ ID NO: 870-871(或SEQ ID NO: 870-871之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成,而來自NRG1外顯子2之3’處的任一序列包含SEQ ID NO: 127-137(或SEQ ID NO: 127-137之任一對偶基因變異體)中之一或全部,或是由其組成。
較佳地,該DSCAML1外顯子3之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 872有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性,而該NRG1外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,DSCAML1之外顯子3的部分係包含或根據SEQ ID NO: 866,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 866有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在與DSCAML1的融合物中之NRG1之外顯子2的部分較佳為或包含如SEQ ID NO: 867之序列,且其對偶基因變異體與SEQ ID NO: 867有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。更佳地,DSCAML1之外顯子3的部分包含來自SEQ ID NO: 866之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置75的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 826之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75的核酸。更佳地,DSCAML1之外顯子3的部分係包含或根據SEQ ID NO: 866或其對偶基因變異體。這類短的多核苷酸序列特別有利於檢測DSCAML1與NRG1之間是否存在有較大的多核苷酸融合物並確定這類融合物是否為包含有NRG1之EGF樣結構域之符合讀框的致癌性融合物。
替代性地,DSCAML1外顯子3的部分包含SEQ ID NO: 872(或SEQ ID NO: 872之對偶基因變異體)或由其組成,至少包括位置147的核酸。較佳地,DSCAML1外顯子3的部分包含來自SEQ ID NO: 872或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置147的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 872之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置147的核酸。在此替代例中,DSCAML1外顯子3的部分更佳地包含或根據SEQ ID NO: 872或其對偶基因變異體。較佳地,在與DSCAML1的融合物中之NRG1外顯子2的部分包含來自SEQ ID NO: 126或其對偶基因變異體之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸或是由其所組成,且至少包括位置1的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 126之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置1的核酸。
在一替代性較佳實施例中,該包含有DSCAML1外顯子3的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係包含來自SEQ ID NO: 868之2至約10、約20、約30、或高達約40個或甚至全部的連續核酸,且包括位置75及76的核酸。連續核酸的數目可為SEQ ID NO: 868之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40個或全部的核酸,且至少包括位置75及76的核酸。SEQ ID NO: 868包括介於DSCAML1與NRG1之間的接合處,尤其該接合處係介於源於DSCAML1之位置75的核酸與源於NRG1之位置76的核酸之間。較佳地,該包含有DSCAML1外顯子3的一部分與NRG1外顯子2的一部分融合之多核苷酸係具有SEQ ID NO: 868之多核苷酸序列或其對偶基因變異體。
較佳地,本文所提供之任一DSCAML1-NRG1多核苷酸融合物為DSCAML1與NRG1之符合讀框的融合。更佳地所述融合物為包含有DSCAML1之外顯子3或外顯子3的一部分以及NRG1之外顯子2或外顯子2的一部分之符合讀框的融合。所述符合讀框的融合較佳為SEQ ID NO: 868或其對偶基因變異體的融合物,且該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 868有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
較佳地,該DSCAML1外顯子3(或其對偶基因變異體)的部分係位於NRG1外顯子2(或其對偶基因變異體)的5’處。此核酸層級的配向造成融合多肽產物含有DSCAML1的N端和NRG1的C端。此外,本文所提供之DSCAML1-NRG1多核苷酸融合物產生了一種蛋白質融合物,其中從N端到該融合接合處的部分係為來自DSCAML1的多肽序列,而從該接合處到C端的部分為NRG1多肽序列,其中該NRG1部分也提供了其EGF樣結構域。該DSCAML1-NRG1融合蛋白因此保留了NRG1的EGF樣結構域以及驅動一小群人類癌症增生及存活的能力,尤其是腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌。
本文所提及之每個包含有NRG1之多核苷酸融合物,包括VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、DAAM1-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1或DSCAML1-NRG1,較佳地係被分離出來。本發明之任一方法較佳地包含從樣本分離出一或多種含有多核苷酸的組分。該一或多種含有多核苷酸的組分通常從樣本中的任一細胞或細胞材料中分離出來。
NRG1 多肽融合物
根據本揭露,現提供了包含有NRG1之多肽融合物,包括VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1及DSCAML1-NRG1。尤其,在被診斷患有癌症的人類患者中係存在或已鑑定出這類融合物,並在下節中更詳細地提及。
VAPB-NRG1 多肽融合物
根據本揭露,亦提供一種由包含有VAPB核酸序列(或VAPB核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸所編碼之多肽融合物。該VAPB核酸序列(或其部分)較佳地係編碼一包含有SEQ ID NO: 24-30中之任一者(或此等SEQ ID NO中之任一者之對偶基因變異體)或是由其組成的序列。該NRG1核酸序列(或其部分)較佳地係編碼一包含有SEQ ID NO: 139-152中之任一者(或此等SEQ ID NO中之任一者之對偶基因變異體)或是由其組成的序列。
SEQ ID NO: 24-30中之任一者之VAPB對偶基因變異體較佳地與該等序列有至少85%的序列一致性,更佳地與其有90%、92%、94%、96%或甚至更佳地至少98%的序列一致性。SEQ ID NO: 139-152中之任一者之NRG1對偶基因變異體較佳地與該等序列有至少85%的序列一致性,更佳地與其有90%、92%、94%、96%或甚至更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,所述融合物之VAPB核酸序列部分係編碼VAPB之多肽部分,此多肽部分包含來自SEQ ID NO: 24-30中之任一者(或SEQ ID NO: 24-30中之任一者之對偶基因變異體)之8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。較佳地,所述融合物之NRG1核酸序列部分係編碼NRG1之多肽部分,此多肽部分包含來自SEQ ID NO: 139-152中之任一者(或SEQ ID NO: 139-152中之任一者之對偶基因變異體)之8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。
較佳地,本揭露之任一VAPB-NRG1多肽融合物包括SEQ ID NO: 24-30中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 24-30之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括SEQ ID NO: 24-30中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有1、2、3、4或5個點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 24-30之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多核苷酸融合物包括SEQ ID NO: 24-30中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有1、2或3個點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 24-30之多肽的任一胺基酸。
在一較佳實施例中,亦提供一種由包含有VAPB之外顯子1 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該VAPB之外顯子1所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 24或SEQ ID NO: 24之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 141-151中之任一者或全部,或SEQ ID NO: 141-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可根據SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該VAPB之外顯子1部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 24或SEQ ID NO: 24之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 24有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一VAPB-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 4或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 4含有一個在VAPB與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置14之胺基酸(其係與VAPB的柄位置1-13處的胺基酸一起)與位置16之胺基酸(其係與NRG1的柄位置17-31處的胺基酸一起)之間。在位置15處,因為NRG1與VAPB出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該VAPB-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 4或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括位置14、15及16的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 4之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 4或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置14、15及16處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 4有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一VAPB-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 4的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 4之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 4的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 4之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 4的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 4之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於NRG1與VAPB之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自VAPB的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有VAPB-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
CADM1-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有CADM1之外顯子7 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該CADM1之外顯子7所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 51或SEQ ID NO: 51之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 45-50中之任一者或全部,或是SEQ ID NO: 45-50中之任一者之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 145-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 145-151中之任一者之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 45-50分別對應CADM1之外顯子1-7所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 145-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該CADM1之外顯子7部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 51或SEQ ID NO: 51之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 51有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CADM1-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 8或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 8含有一個在CADM1與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置17之胺基酸(其係與CADM1的柄位置1-16處的胺基酸一起)與位置19之胺基酸(其係與NRG1的柄位置20-28處的胺基酸一起)之間。在位置18處,因為NRG1與CADM1出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該CADM1-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 8或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置17、18及19的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 8之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 8或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置17、18及19處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 8有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CADM1-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 8的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 8之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 8的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 8之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 8的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 8之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於NRG1與CADM1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自CADM1的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有CADM1-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
CD44-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有CD44之外顯子5 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該CD44之外顯子5所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 84或SEQ ID NO: 84之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 80-83中之任一者或全部,或是SEQ ID NO: 80-83中之任一者之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 141-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 141-151中之任一者之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 80-83分別對應CD44之外顯子1-4所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可由SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該CD44之外顯子5部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 84或SEQ ID NO: 84之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 84有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CD44-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 12或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 12含有一個在CD44與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置17之胺基酸(其係與CD44的柄位置1-16處的胺基酸一起)與位置19之胺基酸(其係與NRG1的柄位置20-36處的胺基酸一起)之間。在位置18處,因為NRG1與CD44出乎意料產生符合讀框的融合而有蘇胺酸(T, Thr)殘基的存在。較佳地,該CD44-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 12或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置17、18及19的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 12之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 12或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置17、18及19處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 12有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CD44-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 12的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 12之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 12的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 12之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 12的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 12之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於NRG1與CD44之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自CD44的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有CD44-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
亦提供一種由包含有CD44之外顯子5 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該CD44之外顯子5所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 84或SEQ ID NO: 84之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 80-83中之任一者,或是SEQ ID NO: 80-83之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 145-151或SEQ ID NO: 145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 80-83分別對應CD44之外顯子1-4所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該CD44之外顯子5部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 84或SEQ ID NO: 84之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 84有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CD44--NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 762或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 762含有一個在CD44-與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置24之胺基酸(其係與CD44-的柄位置1-23處的胺基酸一起)與位置26之胺基酸(其係與NRG1的柄位置27-49處的胺基酸一起)之間。在位置25處,因為NRG1與CD44-出乎意料產生符合讀框的融合而有蘇胺酸(T, Thr)殘基的存在。較佳地,該CD44--NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 762或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置24、25及26的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 762之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 762或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置24、25及26處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 762有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CD44-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 762的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 762之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 762的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 762之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 762的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 762之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於CD44與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自CD44的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有CD44-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
SLC3A2-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有SLC3A2之轉錄本6之外顯子1 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子5 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。所述SLC3A2外顯子1所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 113或SEQ ID NO: 113之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子5所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 143或SEQ ID NO: 143之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 144-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 144-151中之任一者之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 144-151分別對應NRG1之外顯子6-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子5部分亦可由SEQ ID NO: 158或SEQ ID NO: 158之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列且包括一個由外顯子5之最3’符合讀框的三聯體所編碼之額外絲胺酸殘基。
較佳地,該SLC3A2之轉錄本6之外顯子1部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 113或SEQ ID NO: 113之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 113有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在一較佳實施例中,該SLC3A2-NRG1融合物中之NRG1之外顯子5部分至少包含SEQ ID NO: 143位置16的胺基酸,或SEQ ID NO: 143之對偶基因變異體的對應胺基酸。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 143有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之SLC3A2-NRG1多肽融合物之任一轉錄本6包括如SEQ ID NO: 16或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 16含有一個在SLC3A2與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置17之胺基酸(其係與SLC3A2的柄位置1-16處的胺基酸一起)與位置19之胺基酸(其係與NRG1的柄位置20-29處的胺基酸一起)之間。在位置18處,因為NRG1與該SLC3A2轉錄本出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該SLC3A2-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 16或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括位置17、18及19的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 16之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 16或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置17、18及19處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 16有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之SLC3A2-NRG1多肽融合物之任一轉錄本6包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 16的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 16之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 16的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 16之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 16的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 16之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於NRG1與SLC3A2之轉錄本6之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自SLC3A2的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有SLC3A2-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
亦提供一種由包含有SLC3A2之轉錄本3之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。所述SLC3A2外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 470或SEQ ID NO: 470之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 469或145-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 469或145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 145-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該SLC3A2之轉錄本3之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 470或SEQ ID NO: 470之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 470有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。在一較佳實施例中,該SLC3A2-NRG1融合物中之NRG1之外顯子6部分包含或者是根據SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的序列。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之SLC3A2-NRG1多肽融合物之任一轉錄本3包括如SEQ ID NO: 455或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 455含有一個在SLC3A2與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置30之胺基酸(其係與SLC3A2的柄位置1-29處的胺基酸一起)與位置32之胺基酸(其係與NRG1的柄位置33-39處的胺基酸一起)之間。在位置31處,因為NRG1與該SLC3A2轉錄本出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該SLC3A2-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 455或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括位置30、31及32的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 455之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 455或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置30、31及32處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 455有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之SLC3A2-NRG1多肽融合物之任一轉錄本3包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 455的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 455之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 455的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 455之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 455的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 455之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於NRG1與SLC3A2之轉錄本6之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自SLC3A2的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有SLC3A2-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
VTCN1-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有VTCN1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該VTCN1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 176或SEQ ID NO: 176之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 175或SEQ ID NO: 175之對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 141-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 141-151中之任一者之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 175對應VTCN1之外顯子1所編碼的多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可由SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該VTCN1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 176或SEQ ID NO: 176之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 176有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一VTCN1-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 167或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 167含有一個在VTCN1與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置21之胺基酸(其係與VTCN1的柄位置1-20處的胺基酸一起)與位置23之胺基酸(其係與NRG1的柄位置24-30處的胺基酸一起)之間。在位置22處,因為NRG1與VTCN1出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該VTCN1-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 167或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置21、22及23的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 167之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 167或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置21、22及23處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 167有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一VTCN1-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 167的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 167之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 167的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 167之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 167的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 167之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於VTCN1與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自VTCN1的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有VTCN1-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
CDH1-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有CDH1之外顯子11 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該CDH1之外顯子11所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 206或SEQ ID NO: 206之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 205或SEQ ID NO: 205之對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 141-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 141-151中之任一者之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 205對應CDH1之外顯子10所編碼的多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可由SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該CDH1之外顯子11部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 206或SEQ ID NO: 206之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 206有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CDH1-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 187或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 187含有一個在CDH1與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置39之胺基酸(其係與CDH1的柄位置1-38處的胺基酸一起)與位置41之胺基酸(其係與NRG1的柄位置42-49處的胺基酸一起)之間。在位置40處,因為NRG1與CDH1出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該CDH1-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 187或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置39、40及41的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 187之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 187或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置39、40及41處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 187有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CDH1-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 187的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 187之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 187的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 187之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 187的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 187之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於CDH1與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自CDH1的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有CDH1-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
CXADR-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有CXADR之外顯子1 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該CXADR之外顯子1所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 225或SEQ ID NO: 225之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 141-151,或SEQ ID NO: 141-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 225對應CXADR之外顯子1所編碼的多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可由SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該CXADR之外顯子1部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 225或SEQ ID NO: 225之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 225有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CXADR-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 218或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 218含有一個在CXADR與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置14之胺基酸(其係與CXADR的柄位置1-13處的胺基酸一起)與位置16之胺基酸(其係與NRG1的柄位置17-33處的胺基酸一起)之間。在位置15處,因為NRG1與CXADR出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該CXADR-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 218或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置14、15及16的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 218之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 218或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置14、15及16處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 218有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CXADR-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 218的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 218之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 218的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 218之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 218的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 218之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於CXADR與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自CXADR的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有CXADR-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
GTF2E2-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有GTF2E2之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該GTF2E2之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 244或SEQ ID NO: 244之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 141-151,或SEQ ID NO: 141-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可由SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該GTF2E2之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 244或SEQ ID NO: 244之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 244有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一GTF2E2-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 234或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 234含有一個在GTF2E2與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置46之胺基酸(其係與GTF2E2的柄位置1-45處的胺基酸一起)與位置48之胺基酸(其係與NRG1的柄位置49-88處的胺基酸一起)之間。在位置47處,因為NRG1與GTF2E2出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該GTF2E2-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 234或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置46、47及48的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 234之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 234或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置46、47及48處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 234有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一GTF2E2-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 234的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 234之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 234的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 234之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 234的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 234之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於GTF2E2與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自GTF2E2的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有GTF2E2-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
CSMD1-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有CSMD1之外顯子23 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該CSMD1之外顯子23所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 305或SEQ ID NO: 305之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 283-304中之任一者,或SEQ ID NO: 283-304之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 145-151,或SEQ ID NO: 145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 283-304分別對應CSMD1之外顯子1-22所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該CSMD1之外顯子23部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 305或SEQ ID NO: 305之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 305有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CSMD1-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 256或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 256含有一個在CSMD1與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置29之胺基酸(其係與CSMD1的柄位置1-28處的胺基酸一起)與位置31之胺基酸(其係與NRG1的柄位置32-50處的胺基酸一起)之間。在位置30處,因為NRG1與CSMD1出乎意料產生符合讀框的融合而有蘇胺酸(T, Thr)殘基的存在。較佳地,該CSMD1-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 256或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置29、30及31的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 256之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 256或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置29、30及31處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 256有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CSMD1-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 256的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 256之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 218的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 256之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 256的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 256之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於CSMD1與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自CSMD1的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有CSMD1-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
PTN-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有PTN之外顯子4 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該PTN之外顯子4所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 323或SEQ ID NO: 323之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 321及/或322或是SEQ ID NO: 321及/或322之對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 141-151,或是SEQ ID NO: 141-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 321、322及323分別對應PTN之外顯子2、3、4所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可由SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該PTN之外顯子4部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 323或SEQ ID NO: 323之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 323有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一PTN-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 314或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 314含有一個在PTN與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置33之胺基酸(其係與PTN的柄位置1-32處的胺基酸一起)與位置35之胺基酸(其係與NRG1的柄位置36-67處的胺基酸一起)之間。在位置34處,因為NRG1與PTN出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該PTN-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 314或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括位置33、34及35的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 314之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 314或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置33、34及35處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 314有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一PTN-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 314的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 314之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 314的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 314之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 314的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 314之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於PTN與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自PTN的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有PTN-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
ST14-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有ST14之外顯子11 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該ST14之外顯子11所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 362或SEQ ID NO: 362之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 352-361中之任一者,或是SEQ ID NO: 352-361之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 145-151或SEQ ID NO: 145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 352-361分別對應ST14之外顯子1-10所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該ST14之外顯子11部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 362或SEQ ID NO: 362之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 362有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一ST14-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 331或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 331含有一個在ST14與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置31之胺基酸(其係與ST14的柄位置1-30處的胺基酸一起)與位置33之胺基酸(其係與NRG1的柄位置34-60處的胺基酸一起)之間。在位置32處,因為NRG1與ST14出乎意料產生符合讀框的融合而有脯胺酸(P, pro)殘基的存在。較佳地,該ST14-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 331或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置31、32及33的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 331之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 331或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置31、32及33處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 455有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一ST14-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 331的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 331之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 331的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 331之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 331的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 331之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於ST14與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自ST14的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有ST14-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
THBS1-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有THBS1之外顯子9 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該THBS1之外顯子9所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 396或SEQ ID NO: 396之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 389-395中之任一者,或是SEQ ID NO: 389-395之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 145-151或SEQ ID NO: 145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 389-395分別對應THBS1之外顯子2-8所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該THBS1之外顯子9部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 396或SEQ ID NO: 396之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 396有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一THBS1-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 377或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 377含有一個在THBS1與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置18之胺基酸(其係與THBS1的柄位置1-16處的胺基酸一起)與位置20之胺基酸(其係與NRG1的柄位置20-48處的胺基酸一起)之間。在位置19處,因為NRG1與THBS1出乎意料產生符合讀框的融合而有蘇胺酸(T, Thr)殘基的存在。較佳地,該THBS1-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 377或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置18、19及20的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 377之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 377或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置18、19及20處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 377有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一THBS1-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 377的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 377之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 377的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 377之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 377的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 377之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於THBS1與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自THBS1的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有THBS1-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
AGRN-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有AGRN之外顯子12 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該AGRN之外顯子12所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 430或SEQ ID NO: 430之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 419-429中之任一者,或是SEQ ID NO: 419-429之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 145-151或SEQ ID NO: 145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 419-429分別對應AGRN之外顯子1-11所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該AGRN之外顯子12部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 430或SEQ ID NO: 430之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 430有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一AGRN-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 404或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 404含有一個在AGRN與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置35之胺基酸(其係與AGRN的柄位置1-34處的胺基酸一起)與位置37之胺基酸(其係與NRG1的柄位置38-69處的胺基酸一起)之間。在位置36處,因為NRG1與AGRN出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該AGRN-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 404或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置35、36及37的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 404之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 404或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置35、36及37處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 404有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一AGRN-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 404 的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 404 之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 404 的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 404 之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 404 的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 404 之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於AGRN與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自AGRN的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有AGRN-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
PVALB-NRG1 多肽融合物
根據本揭露,亦提供一種由包含有PVALB核酸序列(或PVALB核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸所編碼之多肽融合物。該PVALB核酸序列(或其部分)較佳地係編碼一包含有SEQ ID NO: 445-449中之任一者(或此等SEQ ID NO中之任一者之對偶基因變異體)或是由其組成的序列。該NRG1核酸序列(或其部分)較佳地係編碼一包含有SEQ ID NO: 139-152中之任一者(或此等SEQ ID NO中之任一者之對偶基因變異體)或是由其組成的序列。
SEQ ID NO: 445-449中之任一者之PVALB對偶基因變異體較佳地與該等序列有至少85%的序列一致性,更佳地與其有90%、92%、94%、96%或甚至更佳地至少98%的序列一致性。SEQ ID NO: 139-152中之任一者之NRG1對偶基因變異體較佳地與該等序列有至少85%的序列一致性,更佳地與其有90%、92%、94%、96%或甚至更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,所述融合物之PVALB核酸序列部分係編碼PVALB之多肽部分,此多肽部分包含來自SEQ ID NO: 445-449中之任一者(或SEQ ID NO: 445-449中之任一者之對偶基因變異體)之8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。較佳地,所述融合物之NRG1核酸序列部分係編碼NRG1之多肽部分,此多肽部分包含來自SEQ ID NO: 139-152中之任一者(或SEQ ID NO: 139-152中之任一者之對偶基因變異體)之8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。
較佳地,本揭露之任一PVALB-NRG1多肽融合物包括SEQ ID NO: 445-449中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 445-449之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括SEQ ID NO: 445-449中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有1、2、3、4或5個點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 445-449之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多核苷酸融合物包括SEQ ID NO: 445-449中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有1、2或3個點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 445-449之多肽的任一胺基酸。
在一較佳實施例中,亦提供一種由包含有PVALB之外顯子4 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該PVALB之外顯子4所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 447或SEQ ID NO: 447之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 445及446中之任一者,以及SEQ ID NO: 141-151中之任一者,或SEQ ID NO: 141-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 145-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可根據SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該PVALB之外顯子4部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 447或SEQ ID NO: 447之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 447有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一PVALB-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 438或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 438含有一個在PVALB與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置33之胺基酸(其係與PVALB的柄位置1-32處的胺基酸一起)與位置35之胺基酸(其係與NRG1的柄位置36-75處的胺基酸一起)之間。在位置34處,因為NRG1與PVALB出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該PVALB-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 438或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括位置33、34及35的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 438之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 438或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置33、34及35處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 438有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一PVALB-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 438的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 438之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 438的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 438之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 438的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 438之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於NRG1與PVALB之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自PVALB的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有PVALB-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
APP-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有APP之外顯子14 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該APP之外顯子14所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 519或SEQ ID NO: 519之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 506-518中之任一者,或是SEQ ID NO: 506-518之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 145-151或SEQ ID NO: 145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 506-518分別對應APP之外顯子1-3所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該APP之外顯子14部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 519或SEQ ID NO: 519之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 519有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一APP-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 487或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 487含有一個在APP與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置17之胺基酸(其係與APP的柄位置1-16處的胺基酸一起)與位置19之胺基酸(其係與NRG1的柄位置20-46處的胺基酸一起)之間。在位置18處,因為NRG1與APP出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該APP-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 487或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置17、18及19的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 487之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 487或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置17、18及19處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 487有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一APP-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 487的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 487之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 487的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 487之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 487的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 487之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於APP與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自APP的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有APP-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
WRN-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有WRN之外顯子33 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該WRN之外顯子33所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 597或SEQ ID NO: 597之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 566-596中之任一者,或是SEQ ID NO: 566-596之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 145-151或SEQ ID NO: 145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 566-596對應WRN之外顯子2-32所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該WRN之外顯子33部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 597或SEQ ID NO: 597之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 597有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一WRN-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 528或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 528含有一個在WRN與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置31之胺基酸(其係與WRN的柄位置1-30處的胺基酸一起)與位置33之胺基酸(其係與NRG1的柄位置34-60處的胺基酸一起)之間。在位置32處,因為NRG1與WRN出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該WRN-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 528或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置31、32及33的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 528之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 528或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置31、32及33處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 528有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一WRN-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 528的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 528之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 528的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 528之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 528的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 528之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於WRN與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自WRN的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有WRN-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
ASPH-NRG1 多肽融合物
根據本揭露,亦提供一種由包含有ASPH核酸序列(或ASPH核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸所編碼之多肽融合物。該ASPH核酸序列(或其部分)較佳地係編碼一包含有SEQ ID NO: 663-688中之任一者(或此等SEQ ID NO中之任一者之對偶基因變異體)或是由其組成的序列。該NRG1核酸序列(或其部分)較佳地係編碼一包含有SEQ ID NO: 139-152中之任一者(或此等SEQ ID NO中之任一者之對偶基因變異體)或是由其組成的序列。
SEQ ID NO: 663-688中之任一者之ASPH對偶基因變異體較佳地與該等序列有至少85%的序列一致性,更佳地與其有90%、92%、94%、96%或甚至更佳地至少98%的序列一致性。SEQ ID NO: 139-152中之任一者之NRG1對偶基因變異體較佳地與該等序列有至少85%的序列一致性,更佳地與其有90%、92%、94%、96%或甚至更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,所述融合物之ASPH核酸序列部分係編碼ASPH之多肽部分,此多肽部分包含來自SEQ ID NO: 663-688中之任一者(或SEQ ID NO: 663-688中之任一者之對偶基因變異體)之8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。較佳地,所述融合物之NRG1核酸序列部分係編碼NRG1之多肽部分,此多肽部分包含來自SEQ ID NO: 139-152中之任一者(或SEQ ID NO: 139-152中之任一者之對偶基因變異體)之8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。
較佳地,本揭露之任一ASPH-NRG1多肽融合物包括SEQ ID NO: 663-688中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 663-688之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括SEQ ID NO: 663-688中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有1、2、3、4或5個點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 663-688之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多核苷酸融合物包括SEQ ID NO: 663-688中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有1、2或3個點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 663-688之多肽的任一胺基酸。
在一較佳實施例中,亦提供一種由包含有ASPH之外顯子22 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該ASPH之外顯子22所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 684或SEQ ID NO: 684之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 663-683中之任一者以及SEQ ID NO: 141-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 663-683或SEQ ID NO: 141-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 663-683分別對應ASPH之外顯子1-21所編碼的個別多肽序列,而SEQ ID NO: 141-151 分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可根據SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體,其序列係對應外顯子3-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該ASPH之外顯子22部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 684或SEQ ID NO: 684之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 684有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一ASPH-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 636或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 636含有一個在ASPH與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置24之胺基酸(其係與ASPH的柄位置1-23處的胺基酸一起)與位置26之胺基酸(其係與NRG1的柄位置27-49處的胺基酸一起)之間。在位置25處,因為NRG1與ASPH出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該ASPH-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 636或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括位置24、25及26的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 636之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 636或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置24、25及26處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 636有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一ASPH-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 636的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 636之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 636的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 636之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 636的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 636之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於NRG1與ASPH之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自ASPH的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有ASPH-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
NOTCH2-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有NOTCH2之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該NOTCH2之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 709或SEQ ID NO: 709之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 704-708中之任一者,或是SEQ ID NO: 704-708之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 145-151或SEQ ID NO: 145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 566-596對應NOTCH2之外顯子1-5所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151 分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該NOTCH2之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 709或SEQ ID NO: 709之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 709有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一NOTCH2-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 694或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 694含有一個在NOTCH2與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置24之胺基酸(其係與NOTCH2的柄位置1-23處的胺基酸一起)與位置26之胺基酸(其係與NRG1的柄位置27-49處的胺基酸一起)之間。在位置25處,因為NRG1與NOTCH2出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該NOTCH2-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 694或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置24、25及26的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 694之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 694或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置24、25及26處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 694有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一NOTCH2-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 694的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 694之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 694的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 694之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 694的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 694之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於NOTCH2與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自NOTCH2的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有NOTCH2-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
CD74-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有CD74之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該CD74之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 730或SEQ ID NO: 730之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 729或SEQ ID NO: 141-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 729或SEQ ID NO: 141-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 729對應CD74之外顯子1所編碼的多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可由SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該CD74之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 730或SEQ ID NO: 730之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 730有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CD74-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 718或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 718含有一個在CD74與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置24之胺基酸(其係與CD74的柄位置1-23處的胺基酸一起)與位置26之胺基酸(其係與NRG1的柄位置27-49處的胺基酸一起)之間。在位置25處,因為NRG1與CD74出乎意料產生符合讀框的融合而有脯胺酸(P, pro)殘基的存在。較佳地,該CD74-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 718或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置24、25及26的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 718之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 718或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置24、25及26處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 718有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一CD74-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 718的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 718之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 718的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 718之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 718的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 718之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於CD74與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自CD74的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有CD74-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
SDC4-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有SDC4之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該SDC4之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 752或SEQ ID NO: 752之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 751或SEQ ID NO: 141-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 751或SEQ ID NO: 141-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 751對應SDC4之外顯子1所編碼的多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可由SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該SDC4之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 752或SEQ ID NO: 752之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 752有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一SDC4-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 744或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 744含有一個在SDC4與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置24之胺基酸(其係與SDC4的柄位置1-23處的胺基酸一起)與位置26之胺基酸(其係與NRG1的柄位置27-49處的胺基酸一起)之間。在位置25處,因為NRG1與SDC4出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該SDC4-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 744或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置24、25及26的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 744之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 744或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置24、25及26處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 744有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一SDC4-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 744的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 744之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 744的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 744之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 744的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 744之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於SDC4與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自SDC4的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有SDC4-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
亦提供一種由包含有SDC4之外顯子4 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該SDC4之外顯子4所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 754或SEQ ID NO: 754之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 751-753或SEQ ID NO: 141-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 751-753或SEQ ID NO: 141-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 751-753對應SDC4之外顯子1-3所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 141-151分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可由SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該SDC4之外顯子4部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 754或SEQ ID NO: 754之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 754有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一SDC4-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 825或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 825含有一個在SDC4與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置24之胺基酸(其係與SDC4的柄位置1-23處的胺基酸一起)與位置26之胺基酸(其係與NRG1的柄位置27-49處的胺基酸一起)之間。在位置25處,因為NRG1與SDC4出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該SDC4-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 825或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置24、25及26的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 825之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 825或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置24、25及26處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 825有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一SDC4-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 825的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 825之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 825的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 825之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 825的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 825之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於SDC4與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自SDC4的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有SDC4-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
SLC4A4-NRG1 多肽融合物
亦提供一種由包含有SLC4A4之外顯子14 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該SLC4A4之外顯子14所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 806或SEQ ID NO: 806之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 794-805中之任一者或SEQ ID NO: 794-805之任一對偶基因變異體,且較佳地進一步包括SEQ ID NO: 145-151或SEQ ID NO: 145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 794-805對應SLC4A4之外顯子2-13所編碼的個別多肽序列。SEQ ID NO: 145-151分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可由SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體所組成,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該SLC4A4之外顯子14部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 806或SEQ ID NO: 806之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 806有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一SLC4A4-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 766或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 766含有一個在SLC4A4與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置24之胺基酸(其係與SLC4A4的柄位置1-23處的胺基酸一起)與位置26之胺基酸(其係與NRG1的柄位置27-49處的胺基酸一起)之間。在位置25處,因為NRG1與SLC4A4出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該SLC4A4-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 766或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括其位置24、25及26的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 766之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 766或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置24、25及26處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 766有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一SLC4A4-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 766的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 766之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 766的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 766之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 766的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 766之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於SLC4A4與NRG1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自SLC4A4的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有SLC4A4-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
ZFAT-NRG1 多肽融合物
根據本揭露,亦提供一種由包含有ZFAT核酸序列(或ZFAT核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸所編碼之多肽融合物。該ZFAT核酸序列(或其部分)較佳地係編碼一包含有SEQ ID NO: 847-863中之任一者(或此等SEQ ID NO中之任一者之對偶基因變異體)或是由其組成的序列。該NRG1核酸序列(或其部分)較佳地係編碼一包含有SEQ ID NO: 139-152中之任一者(或此等SEQ ID NO中之任一者之對偶基因變異體)或是由其組成的序列。
SEQ ID NO: 847-863中之任一者之ZFAT對偶基因變異體較佳地與該等序列有至少85%的序列一致性,更佳地與其有90%、92%、94%、96%或甚至更佳地至少98%的序列一致性。SEQ ID NO: 139-152中之任一者之NRG1對偶基因變異體較佳地與該等序列有至少85%的序列一致性,更佳地與其有90%、92%、94%、96%或甚至更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,所述融合物之ZFAT核酸序列部分係編碼ZFAT之多肽部分,此多肽部分包含來自SEQ ID NO: 847-863中之任一者(或SEQ ID NO: 847-863中之任一者之對偶基因變異體)之8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。較佳地,所述融合物之NRG1核酸序列部分係編碼NRG1之多肽部分,此多肽部分包含來自SEQ ID NO: 139-152中之任一者(或SEQ ID NO: 139-152中之任一者之對偶基因變異體)之8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。
較佳地,本揭露之任一ZFAT-NRG1多肽融合物包括SEQ ID NO: 847-863中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 847-863之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括SEQ ID NO: 847-863中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有1、2、3、4或5個點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 847-863之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多核苷酸融合物包括SEQ ID NO: 847-863中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有1、2或3個點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 847-863之多肽的任一胺基酸。
在一較佳實施例中,亦提供一種由包含有ZFAT之外顯子12 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1之外顯子6 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該ZFAT之外顯子12所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 858或SEQ ID NO: 858之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子6所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 847-857中之任一者以及SEQ ID NO: 145-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 847-857或SEQ ID NO: 145-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 847-857分別對應ZFAT之外顯子1-11所編碼的個別多肽序列,而SEQ ID NO: 145-151 分別對應NRG1之外顯子7-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子6部分亦可根據SEQ ID NO: 156或SEQ ID NO: 156之對偶基因變異體,其序列係對應外顯子6-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該ZFAT之外顯子12部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 858或SEQ ID NO: 858之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 858有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子6部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 144或SEQ ID NO: 144之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 144有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一ZFAT-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 829或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 829含有一個在ZFAT與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置24之胺基酸(其係與ZFAT的柄位置1-23處的胺基酸一起)與位置26之胺基酸(其係與NRG1的柄位置27-49處的胺基酸一起)之間。在位置25處,因為NRG1與ZFAT出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該ZFAT-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 829或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括位置24、25及26的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 829之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 829或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置24、25及26處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 829有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一ZFAT-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 829的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 829之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 829的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 829之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 829的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 829之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於NRG1與ZFAT之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自ZFAT的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有ZFAT-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
DSCAML1-NRG1 多肽融合物
根據本揭露,亦提供一種由包含有DSCAML1核酸序列(或DSCAML1核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部分)融合的多核苷酸所編碼之多肽融合物。該DSCAML1核酸序列(或其部分)較佳地係編碼一包含有SEQ ID NO: 904-937中之任一者(或此等SEQ ID NO中之任一者之對偶基因變異體)或是由其組成的序列。該NRG1核酸序列(或其部分)較佳地係編碼一包含有SEQ ID NO: 139-152中之任一者(或此等SEQ ID NO中之任一者之對偶基因變異體)或是由其組成的序列。
SEQ ID NO: 904-937中之任一者之DSCAML1對偶基因變異體較佳地與該等序列有至少85%的序列一致性,更佳地與其有90%、92%、94%、96%或甚至更佳地至少98%的序列一致性。SEQ ID NO: 139-152中之任一者之NRG1對偶基因變異體較佳地與該等序列有至少85%的序列一致性,更佳地與其有90%、92%、94%、96%或甚至更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,所述融合物之DSCAML1核酸序列部分係編碼DSCAML1之多肽部分,此多肽部分包含來自SEQ ID NO: 904-937中之任一者(或SEQ ID NO: 904-937中之任一者之對偶基因變異體)之8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。較佳地,所述融合物之NRG1核酸序列部分係編碼NRG1之多肽部分,此多肽部分包含來自SEQ ID NO: 139-152中之任一者(或SEQ ID NO: 139-152中之任一者之對偶基因變異體)之8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。
較佳地,本揭露之任一DSCAML1-NRG1多肽融合物包括SEQ ID NO: 904-937中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 904-937之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括SEQ ID NO: 904-937中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有1、2、3、4或5個點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 904-937之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多核苷酸融合物包括SEQ ID NO: 904-937中之任一者的多肽序列,此多肽序列具有1、2或3個點突變添加、刪除或取代SEQ ID NO: 904-937之多肽的任一胺基酸。
在一較佳實施例中,亦提供一種由包含有DSCAML1之外顯子3 (或其對偶基因變異體)的一部分以及NRG1或其之外顯子2 (或其對偶基因變異體)的一部分之多核苷酸所編碼的多肽融合物。該DSCAML1之外顯子3所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 906或SEQ ID NO: 906之對偶基因變異體或是由其組成。該NRG1之外顯子2所編碼的多肽較佳地包含SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體或是由其組成。較佳地,所述多肽融合物進一步包括SEQ ID NO: 904-905中之任一者以及SEQ ID NO: 141-151中之任一者,或是SEQ ID NO: 904-905或SEQ ID NO: 141-151之任一對偶基因變異體。SEQ ID NO: 904-905分別對應DSCAML1之外顯子1-2所編碼的個別多肽序列,而SEQ ID NO: 141-151 分別對應NRG1之外顯子3-13所編碼的個別多肽序列。所述NRG1之外顯子2部分亦可根據SEQ ID NO: 154或SEQ ID NO: 154之對偶基因變異體,其序列係對應外顯子2-13全部所編碼的多肽序列。
較佳地,該DSCAML1之外顯子3部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 906或SEQ ID NO: 906之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 906有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。此外,該NRG1之外顯子2部分所編碼的多肽包含來自SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 140之對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,或是由其組成。該對偶基因變異體與SEQ ID NO: 140有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一DSCAML1-NRG1多肽融合物包括如SEQ ID NO: 869或其對偶基因變異體之多肽序列。SEQ ID NO: 869含有一個在DSCAML1與NRG1之間的融合接合處,該融合係位於位置24之胺基酸(其係與DSCAML1的柄位置1-23處的胺基酸一起)與位置26之胺基酸(其係與NRG1的柄位置27-49處的胺基酸一起)之間。在位置25處,因為NRG1與DSCAML1出乎意料產生符合讀框的融合而有丙胺酸(A, Ala)殘基的存在。較佳地,該DSCAML1-NRG1多肽融合物包括來自SEQ ID NO: 869或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個連續胺基酸,至少包括位置24、25及26的胺基酸。
在一較佳實施例中,其提供了一種根據SEQ ID NO: 869之多肽序列,或是一種包含來自SEQ ID NO: 869或其對偶基因變異體的8、9、10、11、12、13或14個或全部的連續胺基酸之多肽,至少包括位置24、25及26處的胺基酸。所述多肽序列與SEQ ID NO: 869有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,與其92%、94%、96%或更佳地至少98%的序列一致性。
較佳地,本揭露之任一DSCAML1-NRG1多肽融合物包括了具有一或多個(即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個)點突變之SEQ ID NO: 869的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 869之多肽的任一胺基酸。較佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2、3、4或5個點突變之SEQ ID NO: 869的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 869之多肽的任一胺基酸。更佳地,所述多肽融合物包括了具有1、2或3個點突變之SEQ ID NO: 869的多肽序列,且所述點突變添加、刪除或取代該包含有SEQ ID NO: 869之多肽的任一胺基酸。
較佳地,本文所提供之介於NRG1與DSCAML1之間的多肽融合物係經配向,使跨越N端至該融合接合處的部分為來自DSCAML1的多肽序列,而跨越該融合接合處至C端的部分為NRG1多肽序列。較佳地,該NRG1多肽序列包含或編碼EGF樣結構域。所述含有DSCAML1-NRG1多肽融合物之EGF樣結構域較佳地係由本文所提及之異常細胞所組成。
本文所提及之每個包含有NRG1之多核苷酸融合物,包括VAPB-NRG1, CADM1-NRG1, CD44-NRG1, SLC3A2-NRG1, VTCN1-NRG1, CDH1-NRG1, CXADR-NRG1, GTF2E2-NRG1, CSMD1-NRG1, PTN-NRG1, ST14-NRG1, THBS1-NRG1, AGRN-NRG1, PVALB-NRG1, APP-NRG1, WRN-NRG1, DAAM1-NRG1, ASPH-NRG1, NOTCH2-NRG1, CD74-NRG1, SDC4-NRG1, SLC4A4-NRG1, ZFAT-NRG1 and DSCAML1-NRG1,較佳地係被分離出來。本發明之任一方法較佳地包含從樣本分離出一或多種含有多肽的組分。該一或多種含有多肽的組分通常從樣本中的任一細胞或細胞材料中分離出來。
用於檢測或鑑定 NRG1 融合物之測定法
一般來說,待檢測之任一多核苷酸或多肽融合物係獲自或衍生自表現了包含有NRG1的EGF樣結構域之多核苷酸融合物的異常細胞。檢測測定法可以不是針對鑑定EGF樣結構域是否存在,因為其只需僅僅檢測實際的融合接合處以指示出進一步含有NRG1的EGF樣結構域的多核苷酸或多肽的存在即可。EGF樣結構域的存在可以從特異性地檢測或鑑定NRG1與任一融合配偶體之間為符合讀框的多核苷酸融合而推斷出,這樣的融合接合點會在NRG1的EGF樣結構域的5’處發現到。
熟習該項技術者可採用多種不同技術來檢測獲自人類個體樣本中的已知多核苷酸或多肽融合物,其每一者通常包括了會與所感興趣的目標特異性地結合的結合劑。這類結合劑係指一種可選擇性地與目標序列結合以達到特異性地檢測該目標之試劑,諸如引子、引子對、探針、或抗體。所述結合包括了與多核苷酸序列雜交或黏合,通常是為了擴增及/或檢測該目標,或藉由具高親合性及特異性之抗體結合表位以致使目標的檢測。
以特異性地與多核苷酸融合物結合之引子、引子對或探針的使用為基礎之技術在本領域中是眾所周知的。同樣地,以結合劑為基礎來檢測多肽的技術在本領域中是眾所周知的,特別是可以使用特異性地結合多肽的多肽。
其他使用本揭露之引子、引子對或探針的方式包括次世代定序(NGS),或是使用包含有多重免疫檢測技術之套組(panel)(例如利用Anchored Multiplex PCR (AMP™)技術靶向已知外顯子的Archer FusionPlex™ Custom Solid Panel)來檢測融合物,或例如使用QX200™ AutoDG™微滴式數位PCR系統(由BioRad提供)的微滴式數位PCR (ddPCR™)。其他手段包括分子信標的使用或是使用TaqMan™探針或嵌合型螢光染料(諸如SYBR™ Green)的定量PCR (Q-PCR)、螢光原位雜交(FISH)、次世代定序(NGS)、ddPCR™、Anchored Multiplex PCR、半定量PCR或定量PCR。
還有其他使用本揭露之探針來檢測本文所提及之NRG1與融合配偶體的多核苷酸融合物的方法,如IHC或FISH(諸如斷裂分離FISH),其中所感興趣的基因的兩端係以不同顏色標記。為檢測包含有本文所提及融合物之NRG1,使用正股hg38 chr8:31,639,222-32,764,405來設計適宜探針以標記NRG1基因的兩端以致使任何融合物的檢測。
本揭露提供一種用於檢測本文所提及之多核苷酸融合物的核酸探針、引子或引子對。亦提供一種包含有所述核酸探針、引子或引子對以用於檢測本文所提及之多核苷酸融合物的存在的檢測測定法。這類核酸探針、引子或引子對的長度使其可檢測所感興趣的多核苷酸,但較佳的長度為約10至約40個核苷酸。
較佳地,使用於檢測多核苷酸融合物之任一核酸探針、引子或引子對係包括本文所述之可檢測標籤物。
較佳地,於檢測選自VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、DAAM1-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1或DSCAML1-NRG1之多核苷酸融合物是否存在的測定法中使用任一核酸探針、引子或引子對,尤其是檢測本文所揭露之該等多核苷酸融合物中的融合接合處是否存在的測定法。
較佳地,藉由使用所述跨越NRG1與其融合配偶體之間的核酸接合處之探針、引子或引子對致使該融合接合物的擴增及檢測,以檢測本文所提及之任一多核苷酸融合物是否存在。
供使用於檢測 VAPB-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有VAPB核酸序列(或VAPB核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部份)融合的多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 23之多核苷酸(或SEQ ID NO: 23之對偶基因變異體)及根據SEQ ID NO: 138之多核苷酸(或SEQ ID NO: 138之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸。
此外,本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 3或由其組成的VAPB-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置43及44的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 3之多核苷酸(或SEQ ID NO: 3之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置43及44的核酸。
較佳地,該用於檢測VAPB與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由VAPB之外顯子1組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子1的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測VAPB與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 17組成的序列(或SEQ ID NO: 17之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自VAPB之外顯子1係包含SEQ ID NO: 17或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 CADM1-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 7或由其組成的CADM1-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置53及54的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 7之多核苷酸(或SEQ ID NO: 7之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置53及54的核酸。
較佳地,該用於檢測CADM1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由CADM1之外顯子7組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子7的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測CADM1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 57組成的序列(或SEQ ID NO: 57之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自CADM1之外顯子7係包含SEQ ID NO: 39或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 CD44-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 11或由其組成的CD44-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置52及53的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 11之多核苷酸(或SEQ ID NO: 11之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置52及53的核酸。
較佳地,該用於檢測CD44與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由CD44之外顯子5組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子5的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測CD44與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 99組成的序列(或SEQ ID NO: 99之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自CD44之外顯子5係包含SEQ ID NO: 65或其對偶基因變異體,或是由其組成。
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 761或由其組成的CD44-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置75及76的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 761之多核苷酸(或SEQ ID NO: 761之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置75及76的核酸。
較佳地,該用於檢測CD44與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由CD44之外顯子5組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子5的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測CD44與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 99組成的序列(或SEQ ID NO: 99之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自CD44之外顯子5係包含SEQ ID NO: 65或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 SLC3A2 -NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 15或由其組成的SLC3A2轉錄本6-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置53及54的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 15之多核苷酸(或SEQ ID NO: 15之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置53及54的核酸。
較佳地,該用於檢測SLC3A2轉錄本6與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由所述SLC3A2之外顯子1組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子1的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子5組成的序列、或一位於外顯子5的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測所述SLC3A2與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 103組成的序列(或SEQ ID NO: 103之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 157組成的序列(或SEQ ID NO: 157之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自SLC3A2轉錄本6之外顯子1係包含SEQ ID NO: 103或其對偶基因變異體,或是由其組成。
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 454或由其組成的SLC3A2轉錄本6-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置93及94的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 454之多核苷酸(或SEQ ID NO: 454之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置93及94的核酸。
較佳地,該用於檢測SLC3A2轉錄本3與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由所述SLC3A2之外顯子2組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子2的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測所述SLC3A2與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 482組成的序列(或SEQ ID NO: 482之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自SLC3A2轉錄本3之外顯子2係包含SEQ ID NO: 457或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 VTCN1-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 166或由其組成的VTCN1-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置65及66的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 166之多核苷酸(或SEQ ID NO: 166之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置65及66的核酸。
較佳地,該用於檢測VTCN1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由VTCN1之外顯子2組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子2的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測VTCN1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 181組成的序列(或SEQ ID NO: 181之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自VTCN1之外顯子2係包含SEQ ID NO: 169或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 CDH1-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 186或由其組成的CDH1-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置119及120的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 186之多核苷酸(或SEQ ID NO: 186之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置119及120的核酸。
較佳地,該用於檢測CDH1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由CDH1之外顯子11組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子11的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測CDH1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 213組成的序列(或SEQ ID NO: 213之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自CDH1之外顯子11係包含SEQ ID NO: 198或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 CXADR-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 217或由其組成的CXADR-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置43及44的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 217之多核苷酸(或SEQ ID NO: 217之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置43及44的核酸。
較佳地,該用於檢測CXADR與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由CXADR之外顯子1組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子1的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測CXADR與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 219組成的序列(或SEQ ID NO: 219之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自CXADR之外顯子1係包含SEQ ID NO: 219或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 GTF2E2-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 233或由其組成的GTF2E2-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置141及142的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 233之多核苷酸(或SEQ ID NO: 233之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置141及142的核酸。
較佳地,該用於檢測GTF2E2與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由GTF2E2之外顯子2組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子2的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測GTF2E2與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 252組成的序列(或SEQ ID NO: 252之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自GTF2E2之外顯子2係包含SEQ ID NO: 236或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 CSMD1-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 255或由其組成的CSMD1-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置88及89的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 255之多核苷酸(或SEQ ID NO: 255之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置88及89的核酸。
較佳地,該用於檢測CSMD1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由CSMD1之外顯子23組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子23的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測CSMD1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 309組成的序列(或SEQ ID NO: 309之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自CSMD1之外顯子23係包含SEQ ID NO: 279或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 PTN-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 313或由其組成的PTN-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置102及103的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 313之多核苷酸(或SEQ ID NO: 313之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置102及103的核酸。
較佳地,該用於檢測PTN與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由PTN之外顯子4組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子4的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測PTN與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 326組成的序列(或SEQ ID NO: 326之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自PTN之外顯子4係包含SEQ ID NO: 318或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 ST14-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 330或由其組成的ST14-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置95及96的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 330之多核苷酸(或SEQ ID NO: 330之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置95及96的核酸。
較佳地,該用於檢測ST14與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由ST14之外顯子11組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子11的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測ST14與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 372組成的序列(或SEQ ID NO: 372之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自ST14之外顯子11係包含SEQ ID NO: 362或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 THBS1-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 376或由其組成的THBS1-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置56及57的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 376之多核苷酸(或SEQ ID NO: 376之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置56及57的核酸。
較佳地,該用於檢測THBS1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由THBS1之外顯子9組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子9的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測THBS1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 399組成的序列(或SEQ ID NO: 399之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自THBS1之外顯子9係包含SEQ ID NO: 386或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 AGRN-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 403或由其組成的AGRN-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置106及107的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 403之多核苷酸(或SEQ ID NO: 403之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置106及107的核酸。
較佳地,該用於檢測AGRN與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由AGRN之外顯子12 組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子12 的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測AGRN與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 433組成的序列(或SEQ ID NO: 433之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自AGRN之外顯子12 係包含SEQ ID NO: 416或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 PVALB-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有PVALB核酸序列(或PVALB核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部份)融合的多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 444之多核苷酸(或SEQ ID NO: 444之對偶基因變異體)及根據SEQ ID NO: 138之多核苷酸(或SEQ ID NO: 138之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。
此外,本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 437或由其組成的PVALB-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置102及103的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 437之多核苷酸(或SEQ ID NO: 437之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置102及103的核酸。
較佳地,該用於檢測PVALB與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由PVALB之外顯子4組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子4的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測PVALB與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 450組成的序列(或SEQ ID NO: 450之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自PVALB之外顯子4係包含SEQ ID NO: 442或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 APP-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 486或由其組成的APP-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置54及55的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 486之多核苷酸(或SEQ ID NO: 486之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置54及55的核酸。
較佳地,該用於檢測APP與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由APP之外顯子14組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子14的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測APP與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 524組成的序列(或SEQ ID NO: 524之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自APP之外顯子14係包含SEQ ID NO: 501或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 WRN-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 528或由其組成的WRN-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置96及97的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 528之多核苷酸(或SEQ ID NO: 528之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置96及97的核酸。
較佳地,該用於檢測WRN與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由WRN之外顯子33組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子33的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測WRN與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 601組成的序列(或SEQ ID NO: 601之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自WRN之外顯子33係包含SEQ ID NO: 562或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 DAAM1-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 605或由其組成的DAAM1-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置75及76的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 605之多核苷酸(或SEQ ID NO: 605之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置75及76的核酸。
較佳地,該用於檢測DAAM1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由DAAM1之外顯子1組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子1的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子1組成的序列、或一位於外顯子1的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測DAAM1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 606組成的序列(或SEQ ID NO: 606之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自DAAM1之外顯子1係包含SEQ ID NO: 606或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 ASPH-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有ASPH核酸序列(或ASPH核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部份)融合的多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 662之多核苷酸(或SEQ ID NO: 662之對偶基因變異體)及根據SEQ ID NO: 138之多核苷酸(或SEQ ID NO: 138之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。
此外,本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 635或由其組成的ASPH-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置75及76的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 635之多核苷酸(或SEQ ID NO: 635之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置75及76的核酸。
較佳地,該用於檢測ASPH與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由ASPH之外顯子22組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子22的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測ASPH與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 689組成的序列(或SEQ ID NO: 689之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自ASPH之外顯子22係包含SEQ ID NO: 658或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 NOTCH2-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 693或由其組成的NOTCH2-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置75及76的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 693之多核苷酸(或SEQ ID NO: 693之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置75及76的核酸。
較佳地,該用於檢測NOTCH2與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由NOTCH2之外顯子6組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子6的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測NOTCH2與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 713組成的序列(或SEQ ID NO: 713之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自NOTCH2之外顯子6係包含SEQ ID NO: 700或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 CD74-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 717或由其組成的CD74-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置75及76的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 717之多核苷酸(或SEQ ID NO: 717之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置75及76的核酸。
較佳地,該用於檢測CD74與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由CD74之外顯子2組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子2的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測CD74與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 739組成的序列(或SEQ ID NO: 739之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自CD74之外顯子2係包含SEQ ID NO: 720或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 SDC4-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 743或由其組成的SDC4-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置75及76的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 743之多核苷酸(或SEQ ID NO: 743之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置75及76的核酸。
較佳地,該用於檢測SDC4與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由SDC4之外顯子2組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子2的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測SDC4與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 757組成的序列(或SEQ ID NO: 757之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自SDC4之外顯子2係包含SEQ ID NO: 746或其對偶基因變異體,或是由其組成。
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 824或由其組成的SDC4-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置75及76的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 824之多核苷酸(或SEQ ID NO: 824之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置75及76的核酸。
較佳地,該用於檢測SDC4與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由SDC4之外顯子4組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子4的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測SDC4與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 940組成的序列(或SEQ ID NO: 940之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自SDC4之外顯子2係包含SEQ ID NO: 748或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 SLC4A4 -NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 765或由其組成的SLC4A4-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置75及76的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 765之多核苷酸(或SEQ ID NO: 765之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置75及76的核酸。
較佳地,該用於檢測SLC4A4與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由SLC4A4之外顯子14組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子14的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測SLC4A4與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 820組成的序列(或SEQ ID NO: 820之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自SLC4A4之外顯子14係包含SEQ ID NO: 780或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 ZFAT-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有ZFAT核酸序列(或ZFAT核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部份)融合的多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 846之多核苷酸(或SEQ ID NO: 846之對偶基因變異體)及根據SEQ ID NO: 138之多核苷酸(或SEQ ID NO: 138之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。
此外,本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 828或由其組成的ZFAT-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置75及76的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 828之多核苷酸(或SEQ ID NO: 828之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置75及76的核酸。
較佳地,該用於檢測ZFAT與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由ZFAT之外顯子12組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子12的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子6組成的序列、或一位於外顯子6的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測ZFAT與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 864組成的序列(或SEQ ID NO: 864之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 155組成的序列(或SEQ ID NO: 155之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自ZFAT之外顯子12係包含SEQ ID NO: 841或其對偶基因變異體,或是由其組成。
供使用於檢測 DSCAML1-NRG1 融合物之測定法中的引子或探針
本揭露提供一種用於檢測包含有DSCAML1核酸序列(或DSCAML1核酸序列的一部分)與NRG1核酸序列(或NRG1核酸序列的一部份)融合的多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 903之多核苷酸(或SEQ ID NO: 903之對偶基因變異體)及根據SEQ ID NO: 138之多核苷酸(或SEQ ID NO: 138之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。
此外,本揭露提供一種用於檢測包含有SEQ ID NO: 868或由其組成的DSCAML1-NRG1多核苷酸融合物之核酸引子、引子對或探針,且該序列包括位置75及76的核酸。較佳地,該核酸探針、引子或引子對係特異性地與根據SEQ ID NO: 868之多核苷酸(或SEQ ID NO: 868之對偶基因變異體)雜合,或是與該序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至40個核苷酸,且該序列較佳地包括位置75及76的核酸。
較佳地,該用於檢測DSCAML1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與一由DSCAML1之外顯子3組成的序列(諸如使用於功能獲得對偶基因測定法中之序列)、一位於外顯子3的5’處之序列及/或一由NRG1之外顯子2組成的序列、或一位於外顯子2的3’處之序列(諸如NRG1之基因序列)雜合(或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸)。較佳地,該用於檢測DSCAML1與NRG1之融合物的核酸探針、引子或引子對係特異性地與SEQ ID NO: 938組成的序列(或SEQ ID NO: 938之對偶基因變異體)、及/或SEQ ID NO: 153組成的序列(或SEQ ID NO: 153之對偶基因變異體)雜合,或是與該等序列有95%、96%、97%、98%、99%或較佳地有100%的序列一致性且長度超過約12至約40個核苷酸。亦提供了用於檢測涉及所述外顯子任一者之對偶基因變異體的融合物之核酸探針、引子或引子對。
較佳地,來自DSCAML1之外顯子3係包含SEQ ID NO: 872或其對偶基因變異體,或是由其組成。
使用於原位雜交之探針
亦提供使用於原位雜交(ISH)測定法之探針以檢測涉及VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1之任何基因重排。尤其,該等探針係供使用於螢光原位雜交(FISH)或斷裂分離FISH。該基因重排較佳為VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1 CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1與NRG1之基因融合物,但因為這些ISH測定法係靶向本文所揭露之融合接合處的5’及3’側,可使用該ISH測定法來檢測涉及該等基因的任何基因重排。
因此,特別提供一第一核酸探針及一第二核酸探針供使用原位雜交測定法中,以檢測VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1之基因重排,其中:
- 用於檢測VAPB之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 1之位置42或43之核酸5’處的VAPB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 1之位置42或43之核酸3’處的VAPB序列雜交;
- 用於檢測CADM1之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 5之位置53之核酸5’處的CADM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 5之位置53之核酸3’處的CADM1序列雜交;
- 用於檢測CD44之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 9之位置52之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 9之位置52之核酸3’處的CD44序列雜交;
- 用於檢測CD44之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 759之位置75之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 759之位置75之核酸3’處的CD44序列雜交;
- 用於檢測SLC3A2之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 13之位置53之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 13之位置53之核酸3’處的SLC3A2序列雜交;
- 用於檢測VTCN1之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 164之位置65之核酸5’處的VTCN1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 164之位置65之核酸3’處的VTCN1序列雜交;
- 用於檢測CDH1之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 184之位置119之核酸5’處的CDH1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 184之位置119之核酸3’處的CDH1序列雜交;
- 用於檢測CXADR之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 215之位置43之核酸5’處的CXADR序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 215之位置43之核酸3’處的CXADR序列雜交;
- 用於檢測GTF2E2之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 231之位置141之核酸5’處的GTF2E2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 231之位置141之核酸3’處的GTF2E2序列雜交;
- 用於檢測CSMD1之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 253之位置88之核酸5’處的CSMD1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 253之位置88之核酸3’處的CSMD1序列雜交;
- 用於檢測PTN之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 311之位置102之核酸5’處的PTN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 311之位置102之核酸3’處的PTN序列雜交;
- 用於檢測ST14之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 328之位置95之核酸5’處的ST14序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 328之位置95之核酸3’處的ST14序列雜交;
- 用於檢測THBS1之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 374之位置56之核酸5’處的THBS1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 374之位置56之核酸3’處的THBS1序列雜交;
- 用於檢測AGRN之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 401之位置106之核酸5’處的AGRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 401之位置106之核酸3’處的AGRN序列雜交;
- 用於檢測PVALB之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 435之位置102之核酸5’處的PVALB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 435之位置102之核酸3’處的PVALB序列雜交;
- 用於檢測SLC3A2之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 452之位置93之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 452之位置93之核酸3’處的SLC3A2序列雜交;
- 用於檢測APP之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 484之位置54之核酸5’處的APP序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 484之位置54之核酸3’處的APP序列雜交;
- 用於檢測WRN之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 526之位置96之核酸5’處的WRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 526之位置96之核酸3’處的WRN序列雜交;
- 用於檢測DAAM1之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 603之位置75之核酸5’處的DAAM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 603之位置75之核酸3’處的DAAM1序列雜交;
- 用於檢測ASPH之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 633之位置75之核酸5’處的ASPH序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 633之位置75之核酸3’處的ASPH序列雜交;
- 用於檢測NOTCH2之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 691之位置75之核酸5’處的NOTCH2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 691之位置75之核酸3’處的NOTCH2序列雜交;
- 用於檢測CD74之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 715之位置75之核酸5’處的CD74序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 715之位置75之核酸3’處的CD74序列雜交;
- 用於檢測SDC4之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 741之位置75之核酸5’處的SDC4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 741之位置75之核酸3’處的SDC4序列雜交;
- 用於檢測SDC4之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 822之位置75之核酸5’處的SDC4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 822之位置75之核酸3’處的SDC4序列雜交;
- 用於檢測SLC4A4之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 763之位置75之核酸5’處的SLC4A4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 763之位置75之核酸3’處的SLC4A4序列雜交;
- 用於檢測ZFAT之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 826之位置75之核酸5’處的ZFAT序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 826之位置75之核酸3’處的ZFAT序列雜交;或
- 用於檢測DSCAML1之基因重排的第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 866之位置75之核酸5’處的DSCAML1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 866之位置75之核酸3’處的DSCAML1序列雜交。
替代性地,提供了一種較佳的ISH測定法,其中係檢測選自VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、DAAM1-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1或DSCAML1-NRG1之任一多核苷酸融合物。所述測定法制定了一第一探針及一第二探針的用途,其中若該第一探針與該融合接合處5’側的序列雜交,該第二探針則與另一側的序列雜交,或者是若該第一探針與該融合接合處3’側的序列雜交,該第二探針則與另一側的序列雜交,且其中該第一探針係與選自VAPB, CADM1, CD44, SLC3A2, VTCN1, CDH1, CXADR, GTF2E2, CSMD1, PTN, ST14, THBS1, AGRN, PVALB, APP, WRN, DAAM1, ASPH, NOTCH2, CD74, SDC4, SLC4A4, ZFAT or DSCAML1之序列雜交,而該第二探針係與NRG1序列雜交且較佳為諸如本文所提及之EGF樣結構域序列。包括了與EGF樣結構域雜交之探針時,會將所述結構域置於該NRG1 融合配偶體序列的附近。
特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測VAPB-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 3之位置42或43之核酸5’處的VAPB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 3之位置43或44之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測CADM1-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 7之位置53之核酸5’處的CADM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 7之位置54之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測CD44-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 11之位置52之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 11之位置53之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測CD44-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 761之位置75之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 761之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測SLC3A2-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 15之位置53之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 15之位置54之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測VTCN1-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 166之位置65之核酸5’處的VTCN1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 166之位置66之核酸3’處的VTCN1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測CDH1-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 186之位置119之核酸5’處的CDH1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 186之位置120之核酸3’處的CDH1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測CXADR-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 217之位置43之核酸5’處的CXADR序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 217之位置44之核酸3’處的CXADR序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測GTF2E2-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 233之位置141之核酸5’處的GTF2E2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 233之位置142之核酸3’處的GTF2E2序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測CSMD1-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 255之位置88之核酸5’處的CSMD1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 255之位置89之核酸3’處的CSMD1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測PTN-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 313之位置102之核酸5’處的PTN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 313之位置103之核酸3’處的PTN序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測ST14-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 330之位置95之核酸5’處的ST14序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 330之位置96之核酸3’處的ST14序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測THBS1-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 376之位置56之核酸5’處的THBS1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 376之位置57之核酸3’處的THBS1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測AGRN-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 403之位置106之核酸5’處的AGRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 403之位置107之核酸3’處的AGRN序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測PVALB-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 437之位置102之核酸5’處的PVALB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 437之位置103之核酸3’處的PVALB序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測SLC3A2-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 454之位置93之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 454之位置94之核酸3’處的SLC3A2序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測APP-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 486之位置54之核酸5’處的APP序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 486之位置55之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測WRN-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 528之位置96之核酸5’處的WRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 528之位置97之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測DAAM1-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 605之位置75之核酸5’處的DAAM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 605之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測ASPH-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 635之位置75之核酸5’處的ASPH序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 635之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測NOTCH2-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 693之位置75之核酸5’處的NOTCH2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 693之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測CD74-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 717之位置75之核酸5’處的CD74序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 717之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測SDC4-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 743之位置75之核酸5’處的SDC4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 743之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測SDC4-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 824之位置75之核酸5’處的SDC4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 824之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測SLC4A4-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 765之位置75之核酸5’處的SLC4A4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 765之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測ZFAT-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 828之位置75之核酸5’處的ZFAT序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 828之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
也特別提供了一種供使用於原位雜交測定法以檢測DSCAML1-NRG1融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 868之位置75之核酸5’處的DSCAML1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 868之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交,諸如本揭露之EGF樣結構域所包含之序列,特別是SEQ ID NO: 163之序列。
本文所提及之核酸探針、引子或引子對中之任一者係較佳地使用於以下鑑定或檢測方法中,以檢測選自VAPB-NRG1、CADM1-NRG1 CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、DAAM1-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1及DSCAML1-NRG1之多核苷酸、多肽融合物、其部分或對偶基因變異體中之任一者。
用於檢測 NRG 多核苷酸融合物之測定法
根據本揭露,其提供一種於樣本中鑑定如本文所提及之多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
亦提供一種於樣本中檢測多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽是否存在的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
亦提供一種確定來自個體之異常細胞是否包含多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自該個體之異常細胞之多核苷酸或多肽內容物是否於樣本中存在該融合物。
亦提供一種鑑定一個體帶有多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。較佳地該檢驗之後為將該樣本中檢測到的融合物與帶有該融合物之個體聯繫在一起的步驟。
較佳地,所述檢驗包含利用一結合劑特異性地結合所述多核苷酸,諸如本文所提及之任一核酸探針、引子或引子對,或特異性地與本文所提及之任一多核苷酸融合物所編碼之多肽結合,或是替代性地利用一結合劑與包含有該多核苷酸融合物之多核苷酸結合,來檢測本文所提及之任一多核苷酸或多肽融合物。該結合劑係利用來作為檢測步驟的一部分或是使檢測成為後續步驟。因此,於本揭露之任一方法中的檢驗較佳地包含利用一結合劑特異性地結合任一多核苷酸融合物或由其所編碼之任一多肽,以檢測這類融合物。所述結合劑較佳地包含引子、引子對、探針或抗體或是由其組成。此外,該結合劑較佳地包含一可檢測標籤物。
替代性地,所述檢驗包含利用一結合劑與包含有該多核苷酸融合物之多核苷酸結合以檢測該融合物。在此替代例中,該結合劑係與位於該多核苷酸接合處5’及/或3’處之多核苷酸結合且該多核苷酸接合處含有NRG1與其融合配偶體之間的實際接合處。該結合劑黏合或雜交的多核苷酸係作為轉接子來連接或以其他方式附接到該多核苷酸融合物,之後檢測該融合物。這類轉接子較佳地含有一個標籤或分子標記碼(barcode),諸如在定序方法學(包括次世代定序)中所用者。較佳地包含有標記碼或標籤之這類轉接子係附接至該多核苷酸融合物,以在擴增之後可檢測所述融合物。尤其,該結合劑可使用在Anchored Multiplex PCR (或AMP)中,其中在從mRNA產生cDNA之後獲得用於NGS之富含目標樣本庫。
較佳地,所述結合劑係特異性地與根據SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 6、SEQ ID NO: 7、SEQ ID NO: 9、SEQ ID NO: 10、SEQ ID NO: 11、SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14、SEQ ID NO: 15、SEQ ID NO: 164、SEQ ID NO: 165、SEQ ID NO: 166、SEQ ID NO: 184、SEQ ID NO: 185、SEQ ID NO: 186、SEQ ID NO: 215、SEQ ID NO: 216、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:435、SEQ ID NO:436、SEQ ID NO:437、SEQ ID NO:452、SEQ ID NO:453、SEQ ID NO:454、SEQ ID NO: 484、SEQ ID NO: 485、SEQ ID NO: 486、SEQ ID NO: 526、SEQ ID NO: 527、SEQ ID NO: 528、SEQ ID NO: 603、SEQ ID NO: 604、SEQ ID NO: 605、SEQ ID NO: 633、SEQ ID NO: 634、SEQ ID NO: 635、SEQ ID NO: 691、SEQ ID NO: 692、SEQ ID NO: 693、SEQ ID NO: 715、SEQ ID NO: 716、SEQ ID NO: 717、SEQ ID NO: 741、SEQ ID NO: 742、SEQ ID NO: 743、SEQ ID NO: 759、SEQ ID NO: 760、SEQ ID NO: 761、SEQ ID NO: 763、SEQ ID NO: 764、SEQ ID NO: 765、SEQ ID NO: 822、SEQ ID NO: 823、SEQ ID NO: 824、SEQ ID NO: 826、SEQ ID NO: 827、SEQ ID NO: 828、SEQ ID NO: 866、SEQ ID NO: 867或SEQ ID NO: 868中之任一者的多核苷酸序列結合。這些序列致使在所感興趣的融合接合處緊靠進行特異性雜交,或甚至含有該融合接合處,使其成為被所述結合劑結合的良好候選序列。
替代性地,該結合劑特異性地與包含有根據SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO: 6、SEQ ID NO: 7、SEQ ID NO: 9、SEQ ID NO: 10、SEQ ID NO: 11、SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14、SEQ ID NO: 15、SEQ ID NO: 164、SEQ ID NO: 165、SEQ ID NO: 166、SEQ ID NO: 184、SEQ ID NO: 185、SEQ ID NO: 186、SEQ ID NO: 215、SEQ ID NO: 216、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:435、SEQ ID NO:436、SEQ ID NO:437、SEQ ID NO:452、SEQ ID NO:453、SEQ ID NO:454、SEQ ID NO: 484、SEQ ID NO: 485、SEQ ID NO: 486、SEQ ID NO: 526、SEQ ID NO: 527、SEQ ID NO: 528、SEQ ID NO: 603、SEQ ID NO: 604、SEQ ID NO: 605、SEQ ID NO: 633、SEQ ID NO: 634、SEQ ID NO: 635、SEQ ID NO: 691、SEQ ID NO: 692、SEQ ID NO: 693、SEQ ID NO: 715、SEQ ID NO: 716、SEQ ID NO: 717、SEQ ID NO: 741、SEQ ID NO: 742、SEQ ID NO: 743、SEQ ID NO: 759、SEQ ID NO: 760、SEQ ID NO: 761、SEQ ID NO: 763、SEQ ID NO: 764、SEQ ID NO: 765、SEQ ID NO: 822、SEQ ID NO: 823、SEQ ID NO: 824、SEQ ID NO: 826、SEQ ID NO: 827、SEQ ID NO: 828、SEQ ID NO: 866、SEQ ID NO: 867或SEQ ID NO: 868中之任一者之序列的多核苷酸序列。在此替代例的一較佳態樣中,該結合劑較佳地黏合或雜交至一轉接子序列來附接(較佳地以連接方式)至該多核苷酸融合序列。較佳地包含有標記碼或標籤之這類轉接子係附接至該多核苷酸融合物,以在擴增之後可檢測所述融合物。另外地或替代性地,該結合劑包含一基因特異性引子、引子對、或探針,其任一者係結合至一位於融合斷點5’或3’處之核苷酸序列,而可擴增NRG1與VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1之接合處。
此外,檢驗任何本揭露之多核苷酸融合物是否存在係較佳地包含擴增帶有NRG1融合物或其一部分之多核苷酸,且較佳地使用DNA聚合酶,更佳地使用熱穩定DNA聚合酶或Taq聚合酶。
較佳地,該結合劑包含一第一引子及一第二引子以擴增包含有NRG1序列與VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1序列之核苷酸序列,進而檢測本文所提及之任一多核苷酸融合物。更佳地,提供了會與對於該融合物之NRG1序列部分具特異性的核苷酸序列雜交或黏合的第一引子,以及會與對於選自VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1之融合配偶體具特異性的核苷酸序列雜交或黏合的第二引子。較佳地,該第一及第二引子係緊靠融合接合處結合,以擴增包含有NRG1序列的一部分與VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1序列的一部分之序列。該第一或第二引子亦可結合至跨越了該融合接合處的位點。一般而言,經擴增的序列包含多達1000、900、800、700、600、500、400或300個鹼基對。一般而言,經擴增的序列會跨越該NRG1融合接合處。
因此亦提供一種結合劑,其為或包含長度為10-40個核苷酸之核酸探針或引子以用於檢測本揭露之VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1與NRG1之多核苷酸融合物,其中該融合物分別包含SEQ ID NO: 3位置43及44的核酸、SEQ ID NO: 7位置53及54的核酸、SEQ ID NO: 11位置52及53的核酸、SEQ ID NO: 15位置53及54的核酸、SEQ ID NO: 166位置65及66的核酸、SEQ ID NO: 186位置119及120的核酸、SEQ ID NO: 217位置43及44的核酸、SEQ ID NO: 233位置141及142的核酸、SEQ ID NO: 255位置88及89的核酸、SEQ ID NO: 313位置102及103的核酸、SEQ ID NO: 330位置95及96的核酸、SEQ ID NO: 376位置56及57的核酸、SEQ ID NO: 403位置106及107的核酸、SEQ ID NO: 437位置102及103的核酸、或SEQ ID NO: 454位置93及94的核酸、SEQ ID NO: 486位置54及55的核酸、SEQ ID NO: 528位置96及97的核酸、SEQ ID NO: 605位置75及76的核酸、SEQ ID NO: 635位置75及76的核酸、SEQ ID NO: 693位置75及76的核酸、SEQ ID NO: 717位置75及76的核酸、SEQ ID NO: 743位置75及76的核酸、SEQ ID NO: 761位置75及76的核酸、SEQ ID NO: 765位置75及76的核酸、SEQ ID NO: 824位置75及76的核酸、SEQ ID NO: 828位置75及76的核酸、SEQ ID NO: 868位置75及76的核酸。這些位置的核酸界定了NRG1與其融合配偶體之間的斷點或融合接合處。
較佳地,本文所提及之所述檢驗係包含擴增或檢測一用於區別該多核苷酸融合物或由其所編碼之多肽是否存在的序列。
在一較佳實施例中,該結合劑為多肽且較佳地藉由流式細胞儀(FC)、螢光原位雜交法(FISH)、免疫細胞化學染色法(ICC)、免疫螢光染色法(IF)來檢測其是否存在。熟習該項技術者可採用多種不同技術,使用FC、IHC、FISH、ICC或IF在樣本中檢測本揭露之NRG1融合物。例如,可使用靶向NRG1的第一抗體以及靶向選自VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1之NRG1融合配偶體的第二抗體來進行ICC。該第一與第二抗體的訊號共定位,或是使用蛋白大小為基礎的區別測定法來檢測具有期望大小之多肽產物是否存在,可顯示出各別NRG1融合產物是否存在。較佳地,該抗NRG1抗體係靶向NRG1之EGF樣結構域,而該第二抗體係靶向諸如VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1之融合配偶體的細胞外結構域。Frithiof等人於OncoTargets and therapy第9卷, 7095-7103, 2016年11月16日中提供了FISH實驗方案的一個例子。另外,可使用兩種不同的螢光檢測系統並結合在螢光顯微鏡中使用兩種不同通道來檢測抗體。基於兩個螢光訊號之重疊或未重疊外觀來說明結果。針對已知結構及序列的多肽來開發抗體,這完全屬於熟習該項技術者的工作範圍內。
較佳地,所要檢測之多核苷酸或多肽融合物係獲自於會表現包含有多核苷酸融合物之NRG1 EGF樣結構域的異常細胞。較佳地,本揭露之任何檢測方法係包含從個體獲得樣本的步驟,以及隨後從該樣本分離出該多核苷酸或其所編碼之多肽的步驟。此外,所述方法較佳地包含從該樣本純化或分離出該核苷酸或多肽的步驟。
較佳地,該樣本係獲自罹患癌症或腫瘤、或是懷疑罹患癌症或腫瘤並且帶有異常細胞的個體。該樣本可為液態檢體樣本,或是採自實體癌或實體瘤的樣本。該實體樣本較佳為經福馬林包埋及石蠟固定之含有異常細胞、一部分癌症或一部分腫瘤中之任一者的樣本。從實體癌或實體瘤採取樣本會嚴重破壞皮膚的物理完整性,可能還有內部器官,以觸及被調查的腫瘤。使用諸如選自血液、血清、血漿、胸腔積液、唾液、尿液、精液、痰、陰道液、羊水、腹膜液、腦脊液、骨髓、無細胞灌洗液或另一生物流體之液態檢體,可以有比這些方法更實惠、更快速、更可靠且侵入性更小的採樣。因此,較佳地,該樣本為液態檢體樣本。
檢測或鑑定 NRG1 融合物之基於抗體的測定法
亦提供一種以多肽為基礎的檢測測定法以及使用於其中的抗體。該檢測測定法的目標在於檢測本揭露之多肽NRG1融合物,尤其是本揭露之VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1及DSCAML1-NRG1融合物。
特別提供了一種適於檢測本文所提到之任何多肽融合物(較佳為本文所提到之任何多核苷酸融合物所編碼之任何多肽融合物)的第一抗體或第一與第二抗體組。熟習該項技術者完全有能力設計、研發及生產能夠且適於與本文所揭露之多肽融合物特異性地結合的抗體。
在使用第一抗體而不使用第二抗體的情況下,該第一抗體會特異性地檢測NRG1多肽融合物的獨特表位。這類表位包括跨越了介於NRG1與其融合配偶體之間之多肽融合物的表位。替代性地,在使用第一抗體而不使用第二抗體、並且於一檢測測定法中使用該第一抗體(諸如下文進一步討論)的情況下,所述測定法包括了一個辨別出非融合多肽的步驟(例如基於大小或電荷之分離步驟,諸如CIEX或HPLC)。在使用第一及第二抗體的情況下,該第一抗體會檢測該多肽融合物的一部分(即VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1),而該第二抗體會檢測該多肽融合物中包含有NRG1的部分。
更尤其是本揭露提供一種第一抗體或第一及第二抗體組供檢測由一多核苷酸融合物所編碼之多肽,且該多核苷酸融合物包含了一編碼VAPB(或VAPB之對偶基因變異體)蛋白序列之核酸與一編碼NRG1(或NRG1之對偶基因變異體)蛋白序列之核酸融合。
較佳地,該第一抗體、或第一與第二抗體組,係用於檢測包含有VAPB外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含有用於檢測涉及VAPB及NRG1之多核苷酸融合物所編碼之多肽的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合VAPB-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係結合VAPB及NRG1。
亦提供一種第一抗體、或第一與第二抗體組,用於檢測包含有CADM1外顯子7或外顯子7之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有CADM1外顯子7或外顯子7之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合CADM1-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合CADM1及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有CD44外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有CD44外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合CD44-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合CD44及NRG1。
亦提供一種第一抗體、或第一與第二抗體組,用於檢測包含有CD44外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有CD44外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合CD44-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合CD44及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有SLC3A2之轉錄本6之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有所述SLC3A2外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合SLC3A2轉錄本6之SLC3A2-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合所述SLC3A2及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有VTCN1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有VTCN1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合VTCN1-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合VTCN1及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有CDH1外顯子11或外顯子11之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有CDH1外顯子11或外顯子11之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合CDH1-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合CDH1及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有CXADR外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有CXADR外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合CXADR-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合CXADR及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有GFT2E2外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有GFT2E2外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合GFT2E2-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合GFT2E2及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有CSMD1外顯子23或外顯子23之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有CSMD1外顯子23或外顯子23之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合CSMD1-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合CSMD1及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有PTN外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有PTN外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合PTN-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合PTN及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有ST14外顯子11或外顯子11之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有ST14外顯子11或外顯子11之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合ST14-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合ST14及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有THBS1外顯子9或外顯子9之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有THBS1外顯子9或外顯子9之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合THBS1-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合THBS1及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有AGRN外顯子12或外顯子12之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有AGRN外顯子12或外顯子12之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合AGRN-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合AGRN及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有PVALB外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有PVALB外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合PVALB-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合PVALB及NRG1。
亦提供一種第一抗體、或第一與第二抗體組,用於檢測包含有SLC3A2之轉錄本3之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有所述SLC3A2外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合轉錄本3之SLC3A2-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合所述SLC3A2及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有APP外顯子14或外顯子14之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有APP外顯子14或外顯子14之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合APP-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合APP及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有WRN外顯子33或外顯子33之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有WRN外顯子33或外顯子33之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合WRN-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合WRN及NRG1。
本揭露亦提供一種第一抗體或第一及第二抗體組供檢測由一多核苷酸融合物所編碼之多肽,且該多核苷酸融合物包含了一編碼ASPH(或ASPH之對偶基因變異體)蛋白序列之核酸與一編碼NRG1(或NRG1之對偶基因變異體)蛋白序列之核酸融合。
更特別的是提供了一種用於檢測多肽融合物的第一抗體或第一與第二抗體組,且該多肽融合物包含一部分由ASPH之外顯子22或外顯子22之對偶基因變異體所編碼的多肽與一部分由NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽融合。也提供了一種包含有第一抗體或第一與第二抗體組之檢測測定法供檢測是否存在有包含了一部分由ASPH之外顯子22或外顯子22之對偶基因變異體所編碼的多肽與一部分由NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽融合之多肽融合物,其中該第一抗體較佳地結合該ASPH-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組分別較佳地結合ASPH與NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有NOTCH2外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有NOTCH2外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合NOTCH2-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合NOTCH2及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有CD74外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有CD74外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合CD74-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合CD74及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有SDC4外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有SDC4外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合SDC4-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合SDC4及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有SDC4外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有SDC4外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合SDC4-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合SDC4及NRG1。
亦提供一種第一抗體或第一與第二抗體組,用於檢測包含有SLC4A4外顯子14或外顯子14之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物。亦提供一種包含了用於檢測包含有SLC4A4外顯子14或外顯子14之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分與NRG1外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽的一部分所融合之多肽融合物的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體較佳地係結合SLC4A4-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組較佳地係分別結合SLC4A4及NRG1。
本揭露亦提供一種第一抗體或第一及第二抗體組供檢測由一多核苷酸融合物所編碼之多肽,且該多核苷酸融合物包含了一編碼ZFAT(或ZFAT之對偶基因變異體)蛋白序列之核酸與一編碼NRG1(或NRG1之對偶基因變異體)蛋白序列之核酸融合。
更特別的是提供了一種用於檢測多肽融合物的第一抗體或第一與第二抗體組,且該多肽融合物包含一部分由ZFAT之外顯子12或外顯子12之對偶基因變異體所編碼的多肽與一部分由NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽融合。也提供了一種包含有第一抗體或第一與第二抗體組之檢測測定法供檢測是否存在有包含了一部分由ZFAT之外顯子12或外顯子12之對偶基因變異體所編碼的多肽與一部分由NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體所編碼的多肽融合之多肽融合物,其中該第一抗體較佳地結合該ZFAT-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組分別較佳地結合ZFAT與NRG1。
本揭露亦提供一種第一抗體或第一及第二抗體組供檢測由一多核苷酸融合物所編碼之多肽,且該多核苷酸融合物包含了一編碼DSCAML1(或DSCAML1之對偶基因變異體)蛋白序列之核酸與一編碼NRG1(或NRG1之對偶基因變異體)蛋白序列之核酸融合。
更特別的是提供了一種用於檢測多肽融合物的第一抗體或第一與第二抗體組,且該多肽融合物包含一部分由DSCAML1之外顯子3或外顯子3之對偶基因變異體所編碼的多肽與一部分由NRG1之外顯子或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽融合。也提供了一種包含有第一抗體或第一與第二抗體組之檢測測定法供檢測是否存在有包含了一部分由DSCAML1之外顯子3或外顯子3之對偶基因變異體所編碼的多肽與一部分由NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體所編碼的多肽融合之多肽融合物,其中該第一抗體較佳地結合該DSCAML1-NRG1多肽融合物,而該第一與第二抗體組分別較佳地結合DSCAML1與NRG1。
較佳地,該抗NRG1抗體較佳地與NRG1之EGF樣結構域結合。在本揭露之多肽融合物中檢測EGF樣結構域的存在是有好處的,因為其顯示出EGF樣結構域被轉譯及因而與作為融合配偶體之VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1符合讀框的融合部分。
本文所提及之抗NRG1、VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1的抗體係可使用在流式細胞儀(FC)、螢光原位雜交法(FISH)、免疫細胞化學染色法(ICC)、免疫組織化學染色法(IHC)或免疫螢光染色法(IF)之中。
治療方法
本揭露之融合物存在於具有異常細胞之人類患者中或已於其中鑑定出,尤其是以診斷患有癌症之患者。本揭露之癌症尤其為胰臟癌,更尤其是胰臟導管腺癌、肉瘤、膀胱癌、大腸癌、直腸癌、大腸直腸癌、膽囊癌、頭頸癌、前列腺癌、子宮癌、乳癌、卵巢癌、肝癌、子宮內膜癌、肺癌,尤其是非小細胞肺癌、或浸潤性黏液腺癌。
一般而言,本揭露亦提供治療帶有像癌症、腫瘤之異常細胞之個體的方法,其中所述癌症、腫瘤或異常細胞,其細胞、癌症或腫瘤係包含本揭露之NRG1多核苷酸融合物或表現如本揭露之NRG1多肽融合物。
目前的NRG1融合物已確定為一個稱為eNRGy之臨床試驗及早期准入計畫(Early Access Program, 分別為NCT02912949及NCT04100694)(稱為)的一部分。截至2022年4月12日之截止日期,在整個融合配偶體及多種不同癌症類型中,根據RECIST 1.1標準觀察到總共約有70%之已登記且未被排除之經鑑定有NRG1融合物的患者表現出調查員評估反應。在表1的每個類別中都觀察到了調查員評估反應。觀察到反應的適應症包括胰腺導管腺癌、非小細胞肺癌、乳癌及膽管癌。
NRG1 融合配偶體的盛行率
表1:發現到的NRG1融合配偶體之百分比概述,於2022年4月12日截止前的臨床試驗NCT02912949的個體中,以已鑑定之所指融合配偶體佔融合物總數的百分比之方式表示。在截止日期前鑑定為其他包含NRG1融合物者佔總數為小於2%。
NRG1 融合配偶體類別 | 佔總數的百分比 |
CD74 | 31% |
SLC3A2 | 16% |
SDC4 | 9% |
RBPMS | 4% |
CDH1 | 2% |
VTCN1 | 2% |
Others | 23% |
較佳地,該異常細胞、癌(或癌細胞)或腫瘤(或腫瘤細胞)係包含本揭露之多核苷酸融合物,且該多核苷酸融合物進一步包含符合讀框的融合一編碼NRG1之EGF樣結構域的編碼序列。
本揭露亦提供一種治療患有包含了本文所提及之NRG1多核苷酸融合物或表現了本文所提及之NRG1多肽融合物的ErbB-2及/或ErbB-3陽性異常細胞、癌細胞或腫瘤細胞之個體的方法,所述方法包含檢測本文所提及之任一多核苷酸或多肽融合物是否存在,隨後向該個體投與有效量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,藉以治療該個體之癌症。存在本揭露之NRG1融合物中之任一者時,無論是多核苷酸或由其轉譯的多肽,都表示了癌症。
亦提供一種抑制患有包含了本文所提及之NRG1多核苷酸融合物或表現了本文所提及之NRG1多肽融合物的ErbB-2及ErbB-3陽性癌症之個體病程的方法,所述方法包含檢測本文所提及之任一多核苷酸或多肽融合物是否存在,隨後向該個體投與有效量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑。
亦提供一種供使用於患有包含了本文所提及之NRG1多核苷酸融合物或表現了本文所提及之NRG1多肽融合物的ErbB-2及ErbB-3陽性癌症之個體的治療中的ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,所述治療包含檢測本文所提及之任一多核苷酸或多肽融合物是否存在,隨後向該個體投與有效量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑。
亦提供一種供使用於帶有包含了本文所提及之NRG1多核苷酸融合物或表現了本文所提及之NRG1多肽融合物的ErbB-2及ErbB-3陽性癌症之個體的治療藥物的製造中之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,所述治療包含檢測本文所提及之任一多核苷酸或多肽融合物是否存在,隨後向該個體投與有效量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑。
再進一步提供了一種評估個體是否罹患癌症或是易於罹患癌症的方法,該方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在本文所提及之NRG1多核苷酸融合物或NRG1多肽融合物,且藉由鑑定所述融合物是否存在來評估所述個體罹患所述癌症或是易於罹患所述癌症。該檢驗較佳地包含利用一結合劑特異性地結合所述多核苷酸或是利用一結合劑與包含有所述多核苷酸融合物之多核苷酸結合來檢測該融合物。有關於與包含有所述多核苷酸融合物之多核苷酸結合的結合劑的更多細節詳見下述。
較佳地,本文所提及之診斷方法係包含將樣本中之NRG1融合物的檢測與表現本文所提及之NRG1多肽的癌症聯繫在一起的步驟,以診斷該個體患有表現了所述NRG1多肽融合物的癌症。NRG1融合分子的檢測使得可鑑定一個體患有表現了該NRG1融合多肽的癌症,且可診斷所述個體有這類癌症。對癌症的潛在致癌性驅動因素有所了解使得可選擇及指定改進或更好的特制治療。因此,檢測個體樣本中的融合分子,諸如融合多肽或多核苷酸,使得可改善患有NRG1相關癌症之個體的存活機會。
本揭露因此提供一種治療癌症的方法。該癌症較佳地係為復發性癌症或轉移性癌症。復發一般係指局部復發,且意指該癌症與原來的癌症在同一個地方或非常接近。當腫瘤已遷移到原來癌症附近的淋巴結或組織,或是擴散到遠離原來癌症更遠的器官或組織時,一般會說該腫瘤是轉移性腫瘤。在這類情況下,兩種表示皆可使用。
該癌症尤其為胰臟癌、胰臟腺癌、胰臟導管腺癌、肉瘤、膀胱癌、大腸直腸癌、膽囊癌、頭頸癌、前列腺癌、子宮癌、乳癌、卵巢癌、肝癌、子宮內膜癌、諸如非小細胞肺癌之肺癌,尤其是非小細胞肺癌,更尤其是浸潤性黏液腺癌。較佳地,該腫瘤基因體顯示出在選自由EGFR、KRAS、cKIT-BRCA1-2、MET、ROS、RET、ALK、較佳地KRAS所組成之群組的一或多個基因中是否存在突變。
本揭露制定了ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑用以治療會表現NRG1融合多肽的癌症之用途。所述,標靶劑係選自由以下所組成之群組:包含一結合ErbB-2之胞外部分的第一抗原結合位點及一結合ErbB-3之胞外部分的第二抗原結合位點之多特異性抗體、ErbB-2之酪胺酸激酶抑制劑、包含有一結合ErbB-2之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、包含有一結合ErbB-3之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、或其任何組合。
還包含投與一或多種選自以下組成之群的化合物以治療癌症:抑制PI3激酶路徑中之組分的抑制劑、抑制MAPK路徑中之組分的抑制劑、微管破壞藥物、及組蛋白去乙醯酶(HDAC)的抑制劑。所述抑制劑較佳地包含酪胺酸激酶抑制劑、PI3Ka抑制劑、Akt抑制劑、mTOR抑制劑或Src抑制劑。所述酪胺酸激酶抑制劑較佳為阿法替尼(afatinib)、拉帕替尼(lapatinib)及/或來那替尼(neratinib)。所述PI3Ka抑制劑較佳為BYL719。在一實施例中,所述Akt抑制劑為MK-2206。在一較佳實施例中,所述mTOR抑制劑為維莫司(everolimus)。在一較佳實施例中,所述Src抑制劑為塞卡替尼(saracatinib)。在揭示之一實施例中,所述微管破壞藥物為紫杉醇。在一較佳實施例中,所述HDAC抑制劑為伏立諾他(vorinostat)。在一實施例中,所述對ErbB 2及ErbB 3具有專一性的結合化合物為MM 111。
該ErbB-2標靶劑較佳為帶有單特異性雙價抗體且其包含有結合ErbB-2的細胞外部分的抗原結合位點。這類抗體較佳為曲妥珠單抗、帕妥珠單抗(pertuzumab)或曲妥珠單抗艾坦辛(trastuzumab-emtansine)。ErbB-2的靶向治療較佳為ErbB-2 TKI。該ErbB-2 TKI較佳為拉帕替尼、卡奈替尼(canertinib)、來那替尼、圖卡替尼(tucatinib)(或厄濱替尼(irbinitinib))、CP-724714、達洛西替尼(tarloxitinib)、穆布里替尼(mubritinib)、阿法替尼、伐利替尼(varlitinib)及達科米替尼(dacomitinib)中之一或多者,較佳為阿法替尼。ErbB-2 TKI也可能影響ErbB-1信號傳導,但與ErbB-1 TKI的不同之處在於它對ErbB-2具有顯著的活性。ErbB-3靶向治療較佳為帶有單特異性雙價抗體且其包含有結合ErbB-3的細胞外部分的抗原結合位點。這類抗體較佳為帕利珠單抗(patritumab)、絲立班單抗(seribantumab)、魯木魯珠單抗(lumretuzumab)、埃爾格木單抗(elgemtumab)、GSK2849330、KTN3379或AV-203。
較佳地,該包含有結合ErbB-3的細胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體係包含帕利珠單抗、絲立班單抗、魯木魯珠單抗、埃爾格木單抗、GSK2849330、KTN3379或AV-203。
該酪胺酸激酶抑制劑較佳為阿法替尼、拉帕替尼及/或來那替尼。
更佳地,該ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑為多特異性抗體,或更佳地為雙特異性抗體,且其包含了一與ErbB-2之細胞外部分結合的第一抗原結合位點以及一與ErbB-3之細胞外部分結合的第二抗原結合位點。尤其,所述雙特異性抗體為澤妥珠單抗(zenocutuzumab)。
該抗體較佳地可在ErbB-2及ErbB-3陽性細胞中降低配體誘導的ErbB-3受體功能。此外,該抗體較佳地可降低ErbB-2及ErbB-3陽性細胞中之配體誘導的生長。該抗體較佳地為包含有一與ErbB-2之細胞外部分結合的第一抗原結合位點以及一與ErbB-3之細胞外部分結合的第二抗原結合位點多特異性或雙特異性抗體。
該個體較佳為人類個體。該個體較佳為符合使用ErbB-2特異性抗體(諸如曲妥珠單抗)進行單株抗體療法的受試者。在一較佳實施例中,該個體包含有腫瘤/癌症,其較佳為ErbB-2/ErbB-3陽性癌症,較佳為具ErbB-2治療抗性基因型及/或heregulin抗性基因型之腫瘤/癌症,較佳為具單株抗體抗性基因型之腫瘤/癌症。涉及這類基因型之腫瘤可躲過當前抗HER2治療方案(諸如(但不限於)抗ErbB-2之單株抗體療法)的治療。
尤其,該癌症包含了屬於轉移性腫瘤的腫瘤,較佳地其中該腫瘤已遷移到原來癌症附近的淋巴結或組織,或是擴散到遠離原來癌症更遠的器官或組織。
本揭露亦包括活體內模型,諸如表現在其基因體內或是包含有本文所提及之多核苷酸融合物的移植異常細胞之異種移植或基因轉殖動物模型,且/或表現由其所編碼之多肽融合物,以及使用ERB2及/或Erb3標靶劑或其他標靶劑之這類模型的治療以評估這類試劑的治療活性。較佳地,該動物模型為非人類動物模型。
在所揭露的實施例中,所述活體內動物模型係包含如本揭露之多核苷酸融合物及/或表現由其所編碼之多肽融合物,其中由該動物模型所組成之多核苷酸融合物或多肽融合物較佳地係由存在於該動物模型中之移植異常細胞所組成,或是由該動物模型的基因體所組成。
在所揭露之實施例中,本揭露提供一種使用ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑之所述活體內動物模型的治療方法,該標靶劑係選自由以下所組成之群組:包含一結合ErbB-2之胞外部分的第一抗原結合位點及一結合ErbB-3之胞外部分的第二抗原結合位點之多特異性抗體、ErbB-2之酪胺酸激酶抑制劑、包含有一結合ErbB-2之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、包含有一結合ErbB-3之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、或其任何組合,所述方法包含向該動物投與所述Erb2及/或Erb3標靶劑。
在所揭露之實施例中,本揭露提供一種ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,其係選自由以下所組成之群組:包含一結合ErbB-2之胞外部分的第一抗原結合位點及一結合ErbB-3之胞外部分的第二抗原結合位點之多特異性抗體、ErbB-2之酪胺酸激酶抑制劑、包含有一結合ErbB-2之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、包含有一結合ErbB-3之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、或其任何組合,供使用於所述活體內動物模型的治療中。所述方法較佳地包含向該動物投與所述Erb2及/或Erb3標靶劑。
給藥及投與
本揭露之醫藥組合物中的活性成分或是任何治療方法中所投與之實際劑量含量可變化以獲得有效達成對特定患者、組合物及投藥模式之所需治療反應,而對患者不具有毒性的活性成分之量。所選劑量含量將視多種藥物動力學因素而定,包括所用之本揭露之特定組合物的活性、投藥途徑、投藥時間、所用特定化合物之排出速率、治療持續時間;與所用特定組合物組合使用的其他藥物、化合物及/或物質;所治療患者之年齡、性別、體重、病狀、一般健康狀況及先前醫療病史;及醫學領域中所熟知的類似因素。所述活性成分較佳為本揭露之任一Erb2及/或Erb3標靶劑。任何經批准的活性成分或正在進行臨床試驗的藥物,特別是一旦進入臨床試驗的第二期,可由醫生考慮按照批准的劑量方案或臨床試驗劑量治療方案投藥。
待向如本文中所提及之任一ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑的量通常在治療範圍內,其意指使用足夠量來獲得治療效果,同時該量不超過會導致副作用達不可接受程度的臨限值。用來獲得所要治療效果之治療物質所需量越低,治療範圍一般會越大。所選劑量水平將取決於各種因素,包括投予途徑、投予時間、所用特定化合物之排出速率、治療持續期間、組合使用的其他藥物、化合物及/或物質、所治療個體之年齡、性別、體重、病狀、一般健康狀況及先前醫療病史;及醫學領域中所熟知的類似因素。
關於澤妥珠單抗,其在相對高劑量下具有良好的安全性概況,因此比其他標靶或具細胞毒性的化學治療劑相比下提供了較大的治療範圍。本發明之雙特異性抗體的給藥係遵循每週、每兩週、或每三週一次750 mg的投與方案,較佳為每兩週一次750 mg的劑量。給藥較佳地係用於患有胰臟癌、NSCLC、或實體瘤的個體,且其包括患有具NRG1融合物之實體瘤的任何個體,其中此類個體已在投予化療照護標準、或ErbB-2或ErbB-3標靶劑、或TKI時有所進展。替代地,隨後的給藥方案包括每週一次400 mg的固定劑量投予,較佳為在單次投予800 mg之後開始。在此替代給藥方案之後,本揭露之雙特異性抗體較佳地係以每週一次400 mg的劑量投予3週,接著1週沒有給藥。接著,遵循一或多個由下列組成之四週期間循環:三次的每週一次400 mg之固定劑量,隨後一週不投予。較佳為遵循此方式直到觀察到治療效果。
給藥較佳地涉及以靜脈內注射進行本揭露之雙特異性抗體的兩次輸注以達到完整劑量,其較佳為在給藥> 360 mg抗體時。替代地,針對較低劑量可給予單次輸注的完整劑量,例如在給藥≤ 360 mg抗體時。給藥方案中可包括預備藥物以減緩輸注相關反應。
一般定義
冠詞「a」及「an」在本文中是指冠詞語法對象中的一個或多個(即,一個或至少一個)。
在整個本說明書及所附申請專利範圍中,詞語「包含」、「包括」及「具有」以及諸如「包含了」、「包含有」、「包括了」及「包括有」的變體將被解釋為具有包容性。也就是說,在上下文允許的情況下,這些詞語意欲表達可能包括未具體列舉的其他元素或整數。
當提及核酸或胺基酸序列時「一致性百分比(%)」的定義為在出於最佳比較目的而比對序列之後與經選擇序列中之殘基具有一致性之候選序列中之殘基百分比。為了使比對最佳化,可在二個序列之間在經比較之二個序列中之任一個中引入空隙。這類比對可在所比較之全長序列上進行。替代性地,比對可在較短長度上進行,例如在約20個、約50個、約100個或更多個核酸/鹼基或胺基酸上進行。序列一致性為經報導之經比對區上方之二個序列之間的一致匹配百分比。
序列比較及二個序列之間的序列一致性百分比測定可使用數學演算法來實現。熟習該項技術者將瞭解以下事實:數個不同電腦程式可用於比對二個序列且測定二個序列之間的一致性(Kruskal, J. B. (1983) An overview of sequence comparison In D. Sankoff and J. B. Kruskal, (編), Time warps, string edits and macromolecules: the theory and practice of sequence comparison, 第1 -44頁Addison Wesley)。兩個胺基酸序列或核酸序列之間的序列一致性百分比可使用用於二個序列比對之尼-翁氏(Needleman and Wunsch)演算法來測定(Needleman, S. B.及Wunsch, C. D. (1970) J. Mol. Biol. 48, 443-453)。 尼-翁氏演算法已實施於電腦程式NEEDLE中。出於本揭露之目的,使用來自EMBOSS軟體包之NEEDLE程式以測定胺基酸及核酸序列之一致性百分比(2.8.0版或更高版本,EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite (2000) Rice, P. LongdenJ.及Bleasby, A. Trends in Genetics 16, (6) 第276- 277頁, https://emboss.bioinformatics.nl/)。對於蛋白質序列,使用EBLOSUM62以用於取代矩陣。對於DNA序列,使用DNAFULL。所用參數為10之空隙開放罰分及0.5之空隙擴展罰分。
在比對之後,藉由如上文所描述之程式NEEDLE如下計算查詢序列與本揭露序列之間的序列一致性百分比:在二個序列中顯示相同胺基酸或相同核苷酸之比對中之對應位置數目除以減除比對中之空隙總數目之後的比對總長度。
「對偶基因變異體」係指在源自患者的樣本中所鑑定出之特定序列之天然發生的對偶基因,其所鑑定出之序列已被指派SEQ ID NO,且其變異體落入一個確定的變異範圍內。該變異性的定義為與表示其為對偶基因變異體之序列有至少85%序列一致性,較佳為90%一致性,或與其有92%、94%、95%、96%或更佳為至少98%序列一致性。這類變異體被認為是與之比較的序列的一個對偶基因,因此仍有資格作為它的變異體基因。如果在本文中沒有明確提及與一特定對偶基因變異體的關係,這些序列一致性百分比仍適用於所指的對偶基因變異體。
「雙特異性抗體」係指一抗體有一個抗體可變域結合至一第一抗原,而一個第二抗體可變域係結合至一第二抗原,其中所述第一及第二抗原是不相同的。術語「雙特異性抗體」亦涵蓋二元抗體,其中一個抗體可變域結合至一抗原的第一表位,而一個第二抗體可變域係結合至相同抗原的第二表位。該術語進一步包括其中至少一個VH能夠特異性地辨識出一第一抗原與一VL的抗體,與免疫球蛋白可變域中的至少一個VH配對,以能夠特異性地辨識出一第二抗原。所得VH/VL對將與抗原1或抗原2結合,且稱為「二合一抗體」,例如於WO 2008/027236、WO 2010/108127及Schaefer等人(Cancer Cell 20, 472-486, October 2011)中所描述。如本揭露之雙特異性抗體並不限於任何特定雙特異性型式或是產生其之方法。
「可檢測標籤」是指化學、生物或其他修飾,包括但不限於螢光、質量、殘基、染料、放射性同位素、標籤或標記修飾等,其致使檢測所感興趣的分子(在本文中較佳為多核苷酸或多肽)是否存在。較佳地,可檢測標籤為可見標籤、螢光染料、淬滅體、紫外光可檢測標籤、顯色標籤、放射性標籤、電化學標籤、標記、當與對酶或分子標記碼(barcode)具特異性之基質接觸時產生可檢測標籤的酶。例示性螢光染料包括水溶性羅丹明染料、螢光素、4,7-二氯螢光素、苯并呫噸染料及能量轉移染料,如以下參考文獻中所揭露者:Handbook of Molecular Probes and Research Reagents, 第8版(2002), Molecular Probes, Eugene, Oreg.; WO 2001/32783; 美國專利公開號US 2002-0081616, US 2002-0086985; 及Lee等人, 1997, Nucleic Acids Research 25:2816-2822。
「分離的」或「純化的」係指核酸或胺基酸序列被從其天然環境中移出而經分離或經純化。「分離的」核酸分子包括一種從存在於該核酸分子的天然來源中之其他核酸分子分離出者。此外,「分離的」核酸分子(諸如cDNA分子)在藉由重組技術產生時係包括不含其他細胞物質或培養基的狀態,或在化學合成時實質上不含化學前驅物或其他化學品。
本文中之「樣本」係指獲自個體或患者的樣本。這類樣本為生物樣本或患者樣本,這些術語在本文中可互換使用,因為本文所提及的樣本為獲自患者的生物樣本。術語「樣本」包括液態檢體樣本,採自實體癌或實體瘤的樣本,且在向其應用任何處理之前將含有多核苷酸融合物及/或多肽融合物。尤其,該樣本包含異常細胞,諸如腫瘤細胞或癌細胞。
措辭「不含其他細胞物質或培養基」係包括核酸分子製劑,其中將該核酸分子自分離或重組產生核酸分子之細胞的細胞成分分離出。
「引子」係指具有足夠長度以特異性地與所感興趣的核苷酸序列雜交的單股核苷酸分子,以致使與一界定了在聚合酶連鎖反應(PCR)中被擴增之所感興趣區域的第二引子一起特異性結合(在本文中也稱為雜交或黏合)至目標或選定核苷酸序列。在本文中,第一及第二引子,或引子對,係專門設計用於擴增跨越NRG1融合接合處的核苷酸區域。尤其,使用了一第一引子與一第二引子的組合,該第一引子係與對於在該融合接合處一側之NRG1序列部分具特異性的核苷酸序列雜交,而該第二引子係與對於在該融合接合處另一側之選自VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1之融合配偶體具特異性的核苷酸序列雜交。一般而言,引子本身並不包含可檢測標籤物。在NRG1融合多核苷酸之目標序列的全長上,引子通常與目標序列具有至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約97%、至少約98%或至少約99%的序列一致性。多核苷酸引子最佳為與其目標序列互補(在全長上具有100%序列一致性)。在本文中的所有實例中,序列一致性通常在非變異/目標序列的全長上測得。
「探針」或「核酸探針」係指具有足夠長度以特異性地與所感興趣的核苷酸序列雜交的單股核苷酸分子。尤其,在本揭露的上下文中,該探針可檢測發生在VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1之中的融合物,尤其是選自VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、 CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、DAAM1- NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1及DSCAML1-NRG1的融合物。探針通常包含一或兩種可檢測標籤物。在NRG1融合多核苷酸之目標序列的全長上,多核苷酸探針通常與目標序列具有至少約80%,至少約85%,至少約90%,至少約95%,至少約97%,至少約98%或至少約99%的序列一致性。該多核苷酸引子最佳為與其目標序列互補(在全長上具有100%序列一致性)。在本文中的所有實例中,序列一致性通常在非變異/目標序列的全長上測得。
該多核苷酸探針較佳為DNA探針、TaqMan探針、分子信標、蝎型探針(scorpion probe)或於FISH中使用的探針。DNA探針通常與互補的目標序列雜交,且接著可使用(例如)可檢測標籤物來檢測。TaqMan探針在本領域中是已知的,且為具有附接至5' 端的螢光染料及附接至3' 端的淬滅體之多核苷酸。PCR中使用的聚合酶可裂解經雜交的探針,使螢光染料不受淬滅作用而使得可被檢測到。分子信標探針在本領域是已知的,除了與目標序列雜交而將染料與淬滅體分開(而不是使用裂解將染料與淬滅體分離),其係與TaqMan探針相似。Scorpion探針在本領域中是已知的且與分子信標相似,除了其3'端還包含一個與引子的延伸產物之5'端互補的序列以打開雜交中的探針而使染料可被檢測到。該多核苷酸探針較佳為TaqMan探針。該多核苷酸探針較佳為TaqMan探針並使用於上述任何PCR方法之中。
使用於像FISH或斷裂分離FISH之技術中的探針係具有適宜長度且包含單一可檢測標籤物。FISH涉及已與間期染色體或中期染色體雜交之高特異性DNA探針的檢測且使之可見,以便使用螢光顯微鏡進行檢測。斷裂分離FISH係特別適合檢測融合斷點。在這種情況下,所感興趣的基因的兩端係以不同的顏色標記,當發生易位而產生融合物時,兩種單獨的顏色不會共定位,而會觀察到兩種原色。在具有正常複本數之經標記所感興趣基因的正常細胞中,這兩種顏色會共定位而產生融合信號。
用於鑑定由細胞構成的融合多核苷酸之探針或引子係可使用標準分子生物學技術來分離或純化,或基於本文所述資料庫紀錄中的序列資訊來合成。如本文所述之這類核酸分子係可使用標準雜交及選殖技術(例如,於Sambrook等人編,Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 第二版, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989中所述者)來分離。此外,可使用任何適宜標準分子生物技術來分離、純化或合成融合多核苷酸。在一些實施例中,該等引子或探針對於cDNA具特異性。例如,在一些實施例中,該等引子或探針對於cDNA中之外顯子-外顯子接合具特異性。
「多核苷酸融合物」係指兩個多核苷酸之間的共價鍵結連接,其中在融合接合處的一側係存有來自一個基因的核苷酸序列,而在另一側係存有來自另一個基因的核苷酸序列。在多核苷酸融合物之上下文中,該連接係以允許轉錄成蛋白質之方式而可操作地連接。在融合接合處的其中一側上,所述核苷酸序列較佳為來自VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1,且另一側上較佳為來自NRG1。
「多肽融合物」係指兩個胺基酸之間的共價鍵結連接,其中在融合接合處的一側係存有來自一個多肽的胺基酸序列,而在另一側係存有來自另一個多肽的胺基酸序列。在融合接合處的其中一側上,所述胺基酸序列較佳為來自VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1,且另一側上較佳為來自NRG1。
「融合配偶體」係指由於基因重排而已與NRG1基因或多肽發生融合之基因或多肽。在本揭露中,該融合配偶體為VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1 、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1中之一者。一般而言,該融合配偶體係位於該NRG1基因的上游處(在有義股的5’端),且符合讀框的融合而導致轉譯為一種包含有該融合配偶體之一部分與一NRG1部分的嵌合蛋白。由於接合兩個不同基因部分與融合多肽所導致的融合基因為來自這類融合基因的轉譯產物。
「融合點」係指在胺基酸或核苷酸序列中有一側出現NRG1序列且另一側出現NRG1融合配偶體序列的位置。此為發生基因重排而形成嵌合基因、mRNA及/或蛋白序列的接合處或位置。本文中之術語「融合點」係可與「接合處」或「融合接合處」互換。
「位於3’處的基因序列」係指位於所指基因的下游或3’處且被認為是所述基因的一部分之任何元件(無論是否具調節性質)。本文中之調節元件包括增強子、緘默子、反應元件、插入子、外顯子、內嵌啟動子,且該元件係對所涉基因具特異性,使得可因為靠近該融合接合處而以獨特方式擴增及鑑定該融合物。此上下文中之位於3’處的基因序列亦包括位於可用來獨特地鑑定所涉融合物之任何調節元件之間的任何基因序列。
「位於5’處的基因序列」係指位於所指基因的下游或5’處且被認為是所述基因的一部分之任何元件(無論是否具調節性質)。本文中之調節元件包括啟動子、增強子、緘默子、反應元件、插入子、外顯子、內嵌啟動子,且該元件係對所涉基因具特異性,使得可因為靠近該融合接合處而以獨特方式擴增及鑑定該融合物。此上下文中之位於5’處的基因序列亦包括位於可用來獨特地鑑定所涉融合物之任何調節元件之間的任何基因序列。
如本文中所使用,術語「ErbB-2」係指在人類中由ERBB-2基因編碼的蛋白質。該基因或蛋白質之替代名稱包括CD340;HER-2;HER-2/neu;MLN 19;NEU;NGL;TKR1。ERBB-2基因經常被稱為HER2 (出自人類表皮生長因子受體2)。當本文中指稱ErbB-2時,該指稱係指人類ErbB-2。包含有結合ErbB-2的抗原結合部位之抗體係與人類ErbB-2結合。ErbB-2抗原結合部位因在人類與其他哺乳動物異種同源物之間的序列及三級結構相似性而亦可結合此類異種同源物,但不一定如此。人類ErbB-2蛋白及其編碼基因之資料庫存取號為(NP_001005862.1、NP_004439.2、NC_000017.10、NT_010783.15、NC_018928.2)。給予存取號主要是為了提供將ErbB-2識別為目標之進一步方法,結合抗體的ErbB-2蛋白之實際序列可有所變化,例如因為編碼基因中之突變,諸如發生於一些癌症或類似者中的突變。ErbB-2抗原結合部位係與ErbB-2及其各種變異體結合,諸如由一些ErbB-2陽性腫瘤細胞所表現者。結合ErbB-2的抗原結合部位較佳地與ErbB-2之結構域I結合。
如本文中所使用,術語「ErbB-3」係指在人類中由ERBB3基因編碼的蛋白質。該基因或蛋白質之替代名稱為HER3;LCCS2;MDA-BF-1;c-ErbB-3;c-ErbB3;ErbB3-S;p180-ErbB3;p45-sErbB3;及p85-sErbB3。當本文中指稱ErbB-3時,該指稱係指人類ErbB-3。包含有結合ErbB-3的抗原結合部位之抗體係與人類ErbB-3結合。ErbB-3抗原結合部位因在人類與其他哺乳動物異種同源物之間的序列及三級結構相似性而亦可結合此類異種同源物,但不一定如此。人類ErbB-3蛋白及其編碼基因之資料庫存取號為(NP_001005915.1、NP_001973.2、NC_000012.11、NC_018923.2、NT_029419.12)。給予存取號主要是為了提供將ErbB-3識別為目標之進一步方法,抗體所結合的ErbB-3蛋白之實際序列可有所變化,例如因為編碼基因中之突變,諸如發生於一些癌症或類似者中的突變。ErbB-3抗原結合部位係與ErbB-3及其各種變異體結合,諸如由一些ErbB-3陽性腫瘤細胞所表現者。結合ErbB-3的抗原結合部位較佳地與ErbB-3之結構域III結合。
當指稱ErbB-2或ErbB-3或其替代名稱時,該指稱係指人類ErbB-2或ErbB-3。本文中所指稱之抗體係結合至ErbB-2或ErbB-3及許多突變的ErbB-2或ErbB-3蛋白(如癌症中可發現的)。
本文所提及之SEQ ID NO之任意範圍的數值係明確包括落入相關範圍內之全部的個別SEQ ID NO並包括其端值。因此,為避免疑慮,若(例如)指稱SEQ ID NO: 17-23,其係意欲在所提及之SEQ ID NO範圍的上下文中提及並揭露SEQ ID NO: 17、SEQ ID NO: 18、SEQ ID NO: 19、SEQ ID NO: 20、SEQ ID NO: 21、SEQ ID NO: 22及SEQ ID NO: 23。
條款
以下條項係說明例示性實施例。
1. 一種多核苷酸,包含:一VALB核酸序列或該VALB序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合。
2. 如第1項之多核苷酸,其中該VAPB核酸序列包含SEQ ID NO: 17-23中之任一者或由其組成,或包含SEQ ID NO: 17-23中之任一者之對偶基因變異體或由其組成,且該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或由其組成。
3. 如第1或2項之多核苷酸,其中該VALB核酸序列(或其對偶基因變異體)係位於NRG1核酸序列(或其對偶基因變異體)的5’端。
4. 如前述各項中之任一者之多核苷酸,其中該VAPB核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 17-23中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性。
5. 如前述各項中之任一者之多核苷酸,其中該VALB核酸與該NRG1核酸之融合物包含來自SEQ ID NO: 3的2至約40個連續核酸,較佳地包括位置102及103處的核酸
6. 如前述各項中之任一者之多核苷酸,其中該編碼NRG1蛋白序列(或其對偶基因變異體)之核酸係包含或編碼NRG1之EGF樣結構域,較佳為如SEQ ID NO: 163之EGF樣結構域。
7. 一種多核苷酸,包含:
- 一PVALB核酸序列或該PVALB序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合,或
- 一ASPH核酸序列或該ASPH序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合,或
- 一DAAM1核酸序列或該DAAM1序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合,或
- 一ZFAT核酸序列或該ZFAT序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合,或
- 一DACAML1核酸序列或該DSCAML1序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合。
8. 如第7項之多核苷酸,其中
- 該PVALB核酸序列包含SEQ ID NO: 439-444中之任一者或由其組成,或包含SEQ ID NO: 439-444中之任一者之對偶基因變異體或由其組成,且該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或由其組成;
- 該DAAM1核酸序列包含SEQ ID NO: 606-631中之任一者或由其組成,或包含SEQ ID NO: 606-631中之任一者之對偶基因變異體或由其組成,且該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或由其組成;
- 該ZFAT核酸序列包含SEQ ID NO: 830-846中之任一者或由其組成,或包含SEQ ID NO: 830-846中之任一者之對偶基因變異體或由其組成,且該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或由其組成;或
- 該DSCAML1核酸序列包含SEQ ID NO: 870-903中之任一者或由其組成,或包含SEQ ID NO: 870-903中之任一者之對偶基因變異體或由其組成,且該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或由其組成。
9. 如第7或8項之多核苷酸,其中該PVALB、DAAM1、ZFAT或DSCAML1核酸序列(或其對偶基因變異體)係位於NRG1核酸序列(或其對偶基因變異體)的5’端。
10. 如第7-9項中任一項之多核苷酸,其中
- 該PVALB核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 439-444中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;
- 該DAAM1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 606-631中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;
- 該ZFAT核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 830-846中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;或
- 該DSCAML1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 870-903中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性。
11. 如第7至10項中之任一項之多核苷酸,其中:
- 該PVALB核酸與該NRG1核酸之融合物包含來自SEQ ID NO: 437的2至約40個連續核酸,較佳地包括位置102及103處的核酸;
- 該DAAM1核酸與該NRG1核酸之融合物包含來自SEQ ID NO: 605的2至約40個連續核酸,較佳地包括位置75及76處的核酸;
- 該ZFAT核酸與該NRG1核酸之融合物包含來自SEQ ID NO: 828的2至約40個連續核酸,較佳地包括位置75及76處的核酸;或
- 該DSCAML1核酸與該NRG1核酸之融合物包含來自SEQ ID NO: 868的2至約40個連續核酸,較佳地包括位置75及76處的核酸。
12. 如第7至11項中之任一項之多核苷酸,其中該編碼NRG1蛋白序列(或其對偶基因變異體)之核酸係包含或編碼NRG1之EGF樣結構域,較佳為如SEQ ID NO: 163之EGF樣結構域。
13. 一種多核苷酸,包含:
- VAPB之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分,其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合;
- CADM1之外顯子7或外顯子7之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- CD44之外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分;
- SLC3A2之轉錄本6之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體的一部分;
- VTCN1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分;
- CDH1之外顯子11或外顯子11之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分;
- CXADR之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分;
- GTF2E2之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分;
- CSMD1之外顯子23或外顯子23之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- PTN之外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分;
- ST14之外顯子11或外顯子11之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- THBS1之外顯子9或外顯子9之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- AGRN之外顯子12或外顯子12之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- PVALB之外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- SLC3A2之轉錄本3之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- APP之外顯子14或外顯子14之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- WRN之外顯子33或外顯子33之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- DAAM1之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分;
- ASPH之外顯子22或外顯子22之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分;
- NOTCH2之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- CD74之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分;
- SDC4之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分;
- CD44之外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- SLC4A4之外顯子14或外顯子14之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;
- SDC4之外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分;
- ZFAT之外顯子12或外顯子12之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;或
- DSCAML1之外顯子3或外顯子3之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分。
14. 如第13項之多核苷酸,其中VAPB之外顯子1為SEQ ID NO: 17之外顯子;CADM1之外顯子7為SEQ ID NO: 39之外顯子;CD44之外顯子5為SEQ ID NO: 65之外顯子;SLC3A2之外顯子1為SEQ ID NO: 103之外顯子;VTCN1之外顯子2為SEQ ID NO: 169之外顯子;CDH1之外顯子11為SEQ ID NO: 198之外顯子;CXADR之外顯子1為SEQ ID NO: 219之外顯子;GTF2E2之外顯子2為SEQ ID NO: 236之外顯子;CSMD1之外顯子23為SEQ ID NO: 279之外顯子;PTN之外顯子4為SEQ ID NO: 318之外顯子;ST14之外顯子11為SEQ ID NO: 342之外顯子;THBS1之外顯子9為SEQ ID NO: 386之外顯子;AGRN之外顯子12為SEQ ID NO: 416之外顯子;PVALB之外顯子4為SEQ ID NO: 442之外顯子;SLC3A2之外顯子2為SEQ ID NO: 457之外顯子;APP之外顯子14為SEQ ID NO: 501之外顯子;WRN之外顯子33為SEQ ID NO: 562之外顯子;DAAM1之外顯子1為SEQ ID NO: 606之外顯子;ASPH之外顯子22為SEQ ID NO: 658之外顯子;NOTCH2之外顯子6為SEQ ID NO: 700之外顯子;CD74之外顯子2為SEQ ID NO: 720之外顯子;SDC4之外顯子2為SEQ ID NO: 746之外顯子;CD44之外顯子5為SEQ ID NO: 65之外顯子;SLC4A4之外顯子14為SEQ ID NO: 780之外顯子;SDC4之外顯子4為SEQ ID NO: 748之外顯子;ZFAT之外顯子12為SEQ ID NO: 841之外顯子;DSCAML1之外顯子3為SEQ ID NO: 872之外顯子,且NRG1之外顯子1、2、5及6分別為SEQ ID NO: 125、126、129及130之外顯子。
15. 如第13或14項中之任一項之多核苷酸,其中:
- 該VAPB之外顯子1或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該CADM1之外顯子7或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該CD44之外顯子5或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該SLC3A2之外顯子1或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子5或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該VTCN1之外顯子2或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該CDH1之外顯子11或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該CXADR之外顯子1或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該GTF2E2之外顯子2或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該CSMD1之外顯子23或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該PTN之外顯子4或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該ST14之外顯子11或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該THBS1之外顯子9或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該AGRN之外顯子12或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該PVALB之外顯子4或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該SCL3A2之外顯子2或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端;
- 該APP之外顯子14或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端;
- 該WRN之外顯子33或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端;
- 該DAAM1之外顯子1或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體部分的5’端;
- 該ASPH之外顯子22或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體部分的5’端;
- 該NOTCH2之外顯子6或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端;
- 該CD74之外顯子2或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體部分的5’端;
- 該SDC4之外顯子2或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體部分的5’端;
- 該CD44之外顯子5或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端;
- 該SLC4A4之外顯子14或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端;
- 該SDC4之外顯子4或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體部分的5’端;
- 該ZFAT之外顯子12或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端;及
- 該DSCAML1之外顯子3或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體部分的5’端。
16. 如第13至15項中之任一項之多核苷酸,其中:
- 該VAPB之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 17有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- CADM1該之外顯子7之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 39有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該CD44之外顯子5之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 65有至少85%的一致性,較佳地有至少90%的一致性,更佳地有至少95%的一致性,或較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該SLC3A2之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 103有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- VTCN1該之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 169有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該CDH1之外顯子11之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 198有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該NRG1之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該NRG1之外顯子5之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 129有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該NRG1之外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該CXADR之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 219有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該GTF2E2之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 236有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該CSMD1之外顯子23之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 279有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該PTN之外顯子4之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 318有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該ST14之外顯子11之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 342有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該THBS1之外顯子9之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 386有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該AGRN之外顯子12之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 416有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該PVALB之外顯子4之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 442有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該SCL3A2之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 457有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該APP之外顯子14之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 501有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該WRN之外顯子33之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 562有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該DAAM1之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 606有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該NRG1之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該ASPH之外顯子22之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 658有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該NOTCH2之外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 700有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該CD74之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 720有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該SDC4之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 746有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該CD44之外顯子5之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 65有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該SLC4A4之外顯子14之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 780有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該SDC4之外顯子4之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 748有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;
- 該ZFAT之外顯子12之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 841有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;及
- 該DSCAML1之外顯子3之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 872有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
17. 如第13至16項中之任一項之多核苷酸,其中:
- 該VAPB與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 3的2至約40個連續核酸,包括位置43及44處的核酸;
- 該CADM1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 7的2至約40個連續核酸,包括位置53及54處的核酸;
- 該CD44與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 11的2至約40個連續核酸,包括位置52及53處的核酸;
- 該SLC3A2與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 15的2至約40個連續核酸,包括位置53及54處的核酸;
- 該VTCN1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 166的2至約40個連續核酸,包括位置65及66處的核酸;
- 該CDH1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 186的2至約40個連續核酸,包括位置119及120處的核酸;
- 該CXADR與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 217的2至約40個連續核酸,包括位置43及44處的核酸;
- 該GTF2E2與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 233的2至約40個連續核酸,包括位置141及142處的核酸;
- 該CSMD1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 255的2至約40個連續核酸,包括位置88及89處的核酸;
- 該PTN與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 313的2至約40個連續核酸,包括位置102及103處的核酸;
- 該ST14與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 330的2至約40個連續核酸,包括位置95及96處的核酸;
- 該THBS1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 376的2至約40個連續核酸,包括位置56及57處的核酸;
- 該AGRN與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 403的2至約40個連續核酸,包括位置106及107處的核酸;
- 該PVALB與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 437的2至約40個連續核酸,包括位置102及103處的核酸;
- 該SLC3A2與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 454的2至約40個連續核酸,包括位置93及94處的核酸;
- 該APP與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 486的2至約40個連續核酸,包括位置54及55處的核酸;
- 該WRN與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 528的2至約40個連續核酸,包括位置96及97處的核酸;
- 該DAAM1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 605的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸;
- 該ASPH與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 635的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸;
- 該NOTCH2與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 693的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸;
- 該CD74與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 717的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸;
- 該SDC4與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 743的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸;
- 該CD44與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 761的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸;
- 該SLC4A4與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 765的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸;
- 該SDC4與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 824的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸;
- 該ZFAT與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 828的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸;以及
- 該DSCAML1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 868的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸。
18. 如第13至17項中之任一項之多核苷酸,其中:
- 該VAPB與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 3或其對偶基因變異體;
- 該CAD1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 7或其對偶基因變異體;
- 該CD44與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 11或其對偶基因變異體;
- 該SLC3A2與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 15或其對偶基因變異體;
- 該VTCN1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 166或其對偶基因變異體;
- 該CDH1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 186或其對偶基因變異體;
- 該CXADR與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 217或其對偶基因變異體;
- 該GTF2E2與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 233或其對偶基因變異體;
- 該CSMD1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 255或其對偶基因變異體;
- 該PTN與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 313或其對偶基因變異體;
- 該ST14與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 330或其對偶基因變異體;
- 該THBS1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 376或其對偶基因變異體;
- 該AGRN與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 403或其對偶基因變異體;
- 該PVALB與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 437或其對偶基因變異體;
- 該SLC3A2與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 454或其對偶基因變異體;
- 該APP與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 486或其對偶基因變異體;
- 該WRN與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 528或其對偶基因變異體;
- 該DAAM1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 605或其對偶基因變異體;
- 該ASPH與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 635或其對偶基因變異體;
- 該NOTCH2與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 693或其對偶基因變異體;
- 該CD74與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 717或其對偶基因變異體;
- 該SDC4與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 743或其對偶基因變異體;
- 該CD44與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 761或其對偶基因變異體;
- 該SLC4A4與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 765或其對偶基因變異體;
- 該SDC4與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 824或其對偶基因變異體;
- 該ZFAT與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 828或其對偶基因變異體;及
- 該DSCAML1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 868或其對偶基因變異體。
19. 如第13至18項中之任一項之多核苷酸,其中:
- 該VAPB之外顯子1部分為或包含SEQ ID NO: 1或SEQ ID NO: 1之對偶基因變異體;
- 該CADM1之外顯子7部分為或包含SEQ ID NO: 5或SEQ ID NO: 5之對偶基因變異體;
- 該CD44之外顯子5部分為或包含SEQ ID NO: 9或SEQ ID NO: 9之對偶基因變異體;
- 該SLC3A2之外顯子1部分為或包含SEQ ID NO: 13或SEQ ID NO: 13之對偶基因變異體;
- 該VTCN1之外顯子2部分為或包含SEQ ID NO: 164或SEQ ID NO: 164之對偶基因變異體;
- 該CDH1之外顯子11部分為或包含SEQ ID NO: 184或SEQ ID NO: 184之對偶基因變異體;
- 該CXADR之外顯子1部分為或包含SEQ ID NO: 219或SEQ ID NO: 219之對偶基因變異體;
- 該GTF2E2之外顯子2部分為或包含SEQ ID NO: 236或SEQ ID NO: 236之對偶基因變異體;
- 該CXADR之外顯子23部分為或包含SEQ ID NO: 279或SEQ ID NO: 279之對偶基因變異體;
- 該PTN之外顯子4部分為或包含SEQ ID NO: 318或SEQ ID NO: 318之對偶基因變異體;
- 該ST14之外顯子11部分為或包含SEQ ID NO: 342或SEQ ID NO: 342之對偶基因變異體;
- 該THBS1之外顯子9部分為或包含SEQ ID NO: 385或SEQ ID NO: 386之對偶基因變異體;
- 該AGRN之外顯子12部分為或包含SEQ ID NO: 416或SEQ ID NO: 416之對偶基因變異體;
- 該PVALB之外顯子4部分為或包含SEQ ID NO: 442或SEQ ID NO: 442之對偶基因變異體;
- 該SLC3A2之外顯子 2部分為或包含SEQ ID NO: 457或SEQ ID NO: 457之對偶基因變異體;
- 該NRG1之外顯子2部分為或包含SEQ ID NO: 165或SEQ ID NO: 165之對偶基因變異體;
- 該NRG1之外顯子5部分為或包含SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 14之對偶基因變異體;
- 該NRG1之外顯子6部分為或包含SEQ ID NO: 6或其對偶基因變異體;
- 該APP之外顯子14部分為或包含SEQ ID NO: 484或其對偶基因變異體;
- 該WRN之外顯子33部分為或包含SEQ ID NO: 526或其對偶基因變異體;
- 該DAAM1之外顯子1部分為或包含SEQ ID NO: 603或其對偶基因變異體;
- 該ASPH之外顯子22部分為或包含SEQ ID NO: 633或其對偶基因變異體;
- 該NOTCH2之外顯子6部分為或包含SEQ ID NO: 691或其對偶基因變異體;
- 該CD74之外顯子2部分為或包含SEQ ID NO: 715或其對偶基因變異體;
- 該SDC4之外顯子2部分為或包含SEQ ID NO: 741或其對偶基因變異體;
- 該CD44之外顯子5部分為或包含SEQ ID NO: 759或其對偶基因變異體;
- 該SLC4A4之外顯子14部分為或包含SEQ ID NO: 763或其對偶基因變異體;
- 該SDC4之外顯子4部分為或包含SEQ ID NO: 822或其對偶基因變異體;
- 該ZFAT之外顯子12部分為或包含SEQ ID NO: 826或其對偶基因變異體;
- 該DSCAML1之外顯子3部分為或包含SEQ ID NO: 866或其對偶基因變異體;及
- 該NRG1之外顯子1部分為或包含SEQ ID NO: 604或其對偶基因變異體。
20. 如第13至18項中之任一項之多核苷酸,其中:
- VAPB與NRG1之融合包含一個在VAPB之外顯子1與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 3的VAPB位置43之核酸與NRG1位置44之核酸之間的接合處;
- CADM1與NRG1之融合包含一個在CADM1之外顯子7與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 7的CADM1位置53之核酸與NRG1位置54之核酸之間的接合處;
- CD44與NRG1之融合包含一個在CD44之外顯子5與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 11的CD44位置52之核酸與NRG1位置53之核酸之間的接合處;
- SLC3A2與NRG1之融合包含一個在SLC3A2之外顯子1與NRG1之外顯子5之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 15的SLC3A2位置53之核酸與NRG1位置54之核酸之間的接合處;
- VTCN1與NRG1之融合包含一個在VTCN1之外顯子2與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 166的VTCN1位置65之核酸與NRG1位置66之核酸之間的接合處;
- CDH1與NRG1之融合包含一個在CDH1之外顯子11與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 186的CDH1位置119之核酸與NRG1位置120之核酸之間的接合處;
- CXADR與NRG1之融合包含一個在CXADR之外顯子1與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 217的CXADR位置43之核酸與NRG1位置44之核酸之間的接合處;
- GTF2E2與NRG1之融合包含一個在GTF2E2之外顯子2與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 233的GTF2E2位置141之核酸與NRG1位置142之核酸之間的接合處;
- CSMD1與NRG1之融合包含一個在CSMD1之外顯子23與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 255的CSMD1位置88之核酸與NRG1位置89之核酸之間的接合處;
- PTN與NRG1之融合包含一個在PTN之外顯子4與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 313的PTN位置102之核酸與NRG1位置103之核酸之間的接合處;
- ST14與NRG1之融合包含一個在ST14之外顯子11與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 330的ST14位置95之核酸與NRG1位置96之核酸之間的接合處;
- THBS1與NRG1之融合包含一個在THBS1之外顯子9與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 376的THBS1位置56之核酸與NRG1位置57之核酸之間的接合處;
- AGRN與NRG1之融合包含一個在AGRN之外顯子12與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 403的AGRN位置106之核酸與NRG1位置107之核酸之間的接合處;
- PVALB與NRG1之融合包含一個在PVALB之外顯子4與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 437的PVALB位置102之核酸與NRG1位置103之核酸之間的接合處;
- SLC3A2與NRG1之融合包含一個在SLC3A2之外顯子2與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 454的SLC3A2位置93之核酸與NRG1位置94之核酸之間的接合處;
- APP與NRG1之融合包含一個在APP之外顯子14與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 486的APP位置54之核酸與NRG1位置55之核酸之間的接合處;
- WRN與NRG1之融合包含一個在WRN之外顯子33與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 528的WRN位置96之核酸與NRG1位置97之核酸之間的接合處;
- DAAM1與NRG1之融合包含一個在DAAM1之外顯子1與NRG1之外顯子1之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 605的DAAM1位置之核酸75與NRG1位置之核酸76之間的接合處;
- ASPH與NRG1之融合包含一個在ASPH之外顯子22與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 635的ASPH位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處;
- NOTCH2與NRG1之融合包含一個在NOTCH2之外顯子6與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 693的NOTCH2位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處;
- CD74與NRG1之融合包含一個在CD74之外顯子2與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 717的CD74位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處;
- SDC4與NRG1之融合包含一個在SDC4之外顯子2與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 743的SDC4位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處;
- CD44與NRG1之融合包含一個在CD44之外顯子5與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 761的VAPB位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處;
- SLC4A4與NRG1之融合包含一個在SLC4A4之外顯子14與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 765的SLC4A4位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處;
- SDC4與NRG1之融合包含一個在SDC4之外顯子4與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 824的SDC4位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處;
- ZFAT與NRG1之融合包含一個在ZFAT之外顯子12與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 828的ZFAT位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處;及
- DSCAML1與NRG1之融合包含一個在DSCAML1之外顯子3與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 868的DSCAML1位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處。
21. 如前述各項中之任一者之多核苷酸,其中該多核苷酸係經分離的或純化的。
22. 如前述各項中之任一者之多核苷酸,其中該等融合中之任一者為符合讀框的融合。
23. 如前述各項中之任一者之多核苷酸,其中該多核苷酸為哺乳動物多核苷酸,較佳為人類多核苷酸。
24. 一種由如前述各項中之任一者之多核苷酸所編碼的多肽融合物。
25. 一種包含有如第1至23項中任一項之多核苷酸的載體。
26. 一種包含有如第1至23項中任一項之多核苷酸或如第25項之載體的重組宿主細胞。
27. 一種製造如第24項之多肽融合物的方法,包含將如第26項之宿主細胞維持在適合該宿主細胞所包含之多核苷酸表現的條件下,藉以表現該多核苷酸且產生一多肽融合物,隨後分離或純化該多肽融合物。
28. 一種製造重組宿主細胞的方法,包含將如第25項之載體導入一宿主細胞內。
29. 一種檢測測定法,其包含用於檢測如第1至23項中之任一項之多核苷酸融合物的存在之核酸探針、引子或引子對。
30. 一種用於檢測如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物的核酸探針、引子或引子對。
31. 如第30項之核酸探針、引子或引子對,其長度為10至40個核苷酸。
32. 如第30或31項之核酸探針、引子或引子對,其中所檢測到的融合物包含:
- VAPB與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 3或由其組成,且較佳地包括位置43或44的核酸;
- CADM1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 7或由其組成,且較佳地包括位置53或54的核酸;
- CD44與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 11或由其組成,且較佳地包括位置52或53的核酸;
- SLC3A2與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 15或由其組成,且較佳地包括位置53或54的核酸;
- VTCN1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 166或由其組成,且較佳地包括位置65或66的核酸;
- CDH1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 186或由其組成,且較佳地包括位置119或120的核酸;
- CXADR與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 217或由其組成,且較佳地包括位置43或44的核酸;
- GTF2E2與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 233或由其組成,且較佳地包括位置141或142的核酸;
- CSMD1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 255或由其組成,且較佳地包括位置88或89的核酸;
- PTN與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 313或由其組成,且較佳地包括位置102或103的核酸;
- ST14與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 330或由其組成,且較佳地包括位置95或96的核酸;
- THBS1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 376或由其組成,且較佳地包括位置56或57的核酸;
- AGRN與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 403或由其組成,且較佳地包括位置106或107的核酸;
- PVALB與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 437或由其組成,且較佳地包括位置102或103的核酸;
- SLC3A2與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 454或由其組成,且較佳地包括位置93或94的核酸;
- APP與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 486或由其組成,且較佳地包括位置54或55的核酸;
- WRN與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 528或由其組成,且較佳地包括位置96或97的核酸;
- DAAM1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 605或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸;
- ASPH與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 635或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸;
- NOTCH2與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 693或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸;
- CD74與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 717或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸;
- SDC4與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 743或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸;
- CD44與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 761或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸;
- SLC4A4與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 765或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸;
- SDC4與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 824或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸;
- ZFAT與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 828或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸;以及
- DSCAML1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 868或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸。
33. 如第30至32中任一項之核酸探針、引子或引子對,其中:
- 用以檢測VAPB與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由VAPB之外顯子1所組成之序列或位於外顯子1的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CADM1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CADM1之外顯子7所組成之序列或位於外顯子7的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CD44 與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CD44 之外顯子5所組成之序列或位於外顯子5的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測SLC3A2之轉錄本6與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SLC3A2之外顯子1所組成之序列或位於外顯子1的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子5所組成之序列或位於外顯子5的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測VTCN1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由VTCN1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CDH1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CDH1之外顯子11所組成之序列或位於外顯子11的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CXADR與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CXADR之外顯子1所組成之序列或位於外顯子1的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測GTF2E2與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由GTF2E2之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CSMD1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CSMD1之外顯子23所組成之序列或位於外顯子23的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測PTN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由PTN之外顯子4所組成之序列或位於外顯子4的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測ST14與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由ST14之外顯子11所組成之序列或位於外顯子11的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測THBS1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由THBS1之外顯子9所組成之序列或位於外顯子9的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測AGRN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由AGRN之外顯子12所組成之序列或位於外顯子12的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測PVALB與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由PVALB之外顯子4所組成之序列或位於外顯子4的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測SLC3A2之轉錄本3與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SLC3A2之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測APP與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由APP之外顯子14所組成之序列或位於外顯子14的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測WRN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由WRN之外顯子33所組成之序列或位於外顯子33的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測DAAM1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由DAAM1之外顯子1所組成之序列或位於外顯子1的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子1所組成之序列或位於外顯子1的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測ASPH與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由ASPH之外顯子22所組成之序列或位於外顯子22的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測NOTCH2與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由NOTCH2之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CD74與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CD74之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測SDC4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SDC4之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CD44與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CD44之外顯子5所組成之序列或位於外顯子5的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測SLC4A4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SLC4A4之外顯子14所組成之序列或位於外顯子14的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測SDC4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SDC4之外顯子4所組成之序列或位於外顯子4的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測ZFAT與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由ZFAT之外顯子12所組成之序列或位於外顯子12的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;或
- 用以檢測DSCAML1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由DSCAML1之外顯子3所組成之序列或位於外顯子3的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性。
34. 如第33項之核酸探針、引子或引子對,其中:
- 來自VAPB之外顯子1包含SEQ ID NO: 17或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自CADM1之外顯子7包含SEQ ID NO: 39或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自CD44之外顯子5包含SEQ ID NO: 65或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自SLC3A2之外顯子1包含SEQ ID NO: 103或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自VTCN1之外顯子2包含SEQ ID NO: 169或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自CDH1之外顯子11包含SEQ ID NO: 198或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自CXADR之外顯子1包含SEQ ID NO: 219或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自GTF2E2之外顯子2包含SEQ ID NO: 236或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自CSMD1之外顯子23包含SEQ ID NO: 279或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自PTN之外顯子4包含SEQ ID NO: 318或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自ST14之外顯子11包含SEQ ID NO: 342或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自THBS1之外顯子9包含SEQ ID NO: 386或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自AGRN之外顯子12包含SEQ ID NO: 416或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自PVALB之外顯子4包含SEQ ID NO: 442或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自SLC3A2之外顯子2包含SEQ ID NO: 457或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自APP之外顯子14包含SEQ ID NO: 501或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自WRN之外顯子33包含SEQ ID NO: 562或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自DAAM1之外顯子1包含SEQ ID NO: 606或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自ASPH之外顯子22包含SEQ ID NO: 658或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自NOTCH2之外顯子6包含SEQ ID NO: 700或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自CD74之外顯子2包含SEQ ID NO: 720或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自SDC4之外顯子2包含SEQ ID NO: 746或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自CD44之外顯子5包含SEQ ID NO: 65或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自SLC4A4之外顯子14包含SEQ ID NO: 780或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自SDC4之外顯子4包含SEQ ID NO: 748或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自ZFAT之外顯子12包含SEQ ID NO: 841或其對偶基因變異體,或是由其組成;
- 來自DSCAML1之外顯子3包含SEQ ID NO: 872或其對偶基因變異體,或是由其組成;以及
- 來自NRG1之外顯子1、2、5及6分別包含SEQ ID NO: 125、126、129及130或其對偶基因變異體,或是由其組成。
35. 如第33項之核酸探針、引子或引子對,其中:
- 用以檢測VAPB與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 17所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CADM1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 57所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CD44與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 99所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測SLC3A2 與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 103所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 157所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
-用以檢測VTCN1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 181所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CDH1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 213所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CXADR與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 219所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測GTF2E2與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 252所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CSMD1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 309所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測PTN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 326所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測ST14與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 372所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測THBS1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 399所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測AGRN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 433所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測PVALB與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 450所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測SLC3A2 與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 482所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測APP與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 524所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測WRN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 601所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測DAAM1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 606所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 138所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測ASPH與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 689所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測NOTCH2與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 713所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CD74與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 739所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測SDC4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 757所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測CD44與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 99所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測SLC4A4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 820所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測SDC4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 940所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;
- 用以檢測ZFAT與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 864所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;及
- 用以檢測DSCAML1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 938所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性。
36. 一種供使用於原位雜交測定法以檢測如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物的第一核酸探針及第二核酸探針,
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 3之位置43之核酸5’處的VAPB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 3之位置44之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 7之位置53之核酸5’處的CADM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 7之位置54之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 11之位置52之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 11之位置53之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 15之位置53之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 15之位置54之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 166之位置65之核酸5’處的VTCN1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 166之位置66之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 186之位置119之核酸5’處的CDH1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 186之位置120之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 217之位置43之核酸5’處的CXADR序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 217之位置44之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 233之位置141之核酸5’處的GTF2E2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 233之位置142之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 255之位置88之核酸5’處的CSMD1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 255之位置89之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 313之位置102之核酸5’處的PTN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 313之位置103之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 330之位置95之核酸5’處的ST14序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 330之位置96之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 376之位置56之核酸5’處的THBS1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 376之位置57之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 403之位置106之核酸5’處的AGRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 403之位置107之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 437之位置102之核酸5’處的PVALB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 437之位置103之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 454之位置93之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 454之位置94之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 486之位置54之核酸5’處的APP序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 486之位置55之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 528之位置96之核酸5’處的WRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 528之位置97之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 605之位置75之核酸5’處的DAAM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 605之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 635之位置75之核酸5’處的ASPH序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 635之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 693之位置75之核酸5’處的NOTCH2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 693之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 717之位置75之核酸5’處的CD74序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 717之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 743之位置75之核酸5’處的SDC4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 743之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 761之位置75之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 761之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 765之位置75之核酸5’處的SLC4A4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 765之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 824之位置75之核酸5’處的SDC4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 824之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交;
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 828之位置75之核酸5’處的ZFAT序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 828之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交;或
- 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 868之位置75之核酸5’處的DSCAML1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 868之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交。
37. 一種用於檢測如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物所編碼的多肽之第一抗體或第一與第二抗體對組。
38. 一種包含有用於檢測如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物所編碼之多肽的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體或第一與第二抗體組較佳為如第34項之第一抗體或第一與第二抗體組。
39. 如第38項之第一抗體或第一與第二抗體組,或如第32項之檢測測定法,其中該第一抗體係結合選自VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1或DSCAML1-NRG1之多肽融合物,而該第一與第二抗體組係分別結合VAPB與NRG1或CADM1與NRG1、或CD44與NRG1、SLC3A2與NRG1、CDH1與NRG1、CXADR與NRG1、GTF2E2與NRG1、CSMD1與NRG1、PTN與NRG1、ST14與NRG1、THBS1與NRG1、AGRN與NRG1、PVALB與NRG1、APP與NRG1、WRN與NRG1、ASPH與NRG1、NOTCH2與NRG1、CD74與NRG1、SDC4與NRG1、SLC4A4與NRG1、ZFAT與NRG1、或DSCAML1與NRG1。
40. 一種辨識一樣本中之如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
41. 一種於樣本中檢測如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽是否存在的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
42. 一種確定來自個體之異常細胞是否包含如第1至23項中任一項之融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自該個體之異常細胞之多核苷酸或多肽內容物是否於樣本中存在該融合物。
43. 一種辨識一個體帶有如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
44. 如第37至40項中任一項之方法,其中該檢驗包含利用諸如第31至36項中任一項之核酸探針、引子或引子對之結合劑特異性地結合該多核苷酸或由其所編碼之多肽以檢測該融合物,或利用結合一包含有該多核苷酸融合物之多核苷酸的結合劑以檢測該融合物。
45. 如第40至44項中任一項之方法,其中該檢驗包含擴增或檢測一用於區別該多核苷酸融合物或由其所編碼之多肽是否存在的序列。
46. 如第41至45項中任一項之方法,其中該多核苷酸融合物係獲自一會表現包含有NRG1之EGF樣結構域之多核苷酸融合物的異常細胞。
47. 如第40至46項中任一項之方法,其中該方法包含從一個體獲得樣本之步驟,隨後為從該樣本中分離該多核苷酸或由其所編碼之多肽的步驟。
48. 如第40至47項中任一項之方法,其中該方法包含從該樣本純化或分離該多核苷酸的步驟。
49. 如第40至48項中任一項之方法,其中該結合劑係為或包含引子、引子對、探針或抗體。
50. 如第40至49項中任一項之方法,其中該檢驗為一種體外方法,較佳為一種活體外方法。
51. 如第40至50項中任一項之方法,其中該結合劑包含或與一可檢測標籤物相關聯。
52. 如第40至51項中任一項之方法,其中該樣本為液態檢體樣本或固態樣本,諸如經福馬林固定之石蠟包埋組織(FFPE)樣本。
53. 如第40至52項中任一項之方法,其中該樣本包含血液、血清、血漿、胸水、尿液、精液、羊水或腹水。
54. 如第40至53項中任一項之方法,其中該樣本包含變異細胞,諸如腫瘤細胞或癌細胞,或其多核苷酸或多肽內容物。
55. 一種治療患有包含了多核苷酸融合物及/或表現了由其所編碼之融合多肽之ErbB-2及/或ErbB-3陽性癌症或腫瘤之個體的方法,所述方法包含向該個體投與有效量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,其中該融合物為如第1至23項中任一項之融合物。
56. 一種抑制患有包含了多核苷酸融合物及/或表現了由其所編碼之融合多肽之ErbB-2及ErbB-3陽性癌症或腫瘤之個體病程的方法,所述方法包含向該個體投與有效量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,其中所述融合物為如第1至23項中任一項之融合物。
57. 一種供使用於患有包含了多核苷酸融合物及/或表現了由其所編碼之融合多肽之ErbB-2及ErbB-3陽性癌症或腫瘤之個體的治療中的ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,所述治療包含向該個體投與有效量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,其中所述融合物為如第1至23項中任一項之融合物。
58. 一種診斷個體是否有包含如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物或由其所編碼之多肽的異常細胞之方法,該方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
59. 如第58項之方法,其中該檢驗包含利用諸如第30至35項中任一項之核酸探針、引子或引子對之結合劑特異性地結合該多核苷酸或由其所編碼之多肽以檢測該融合物,或利用結合一包含有該多核苷酸融合物之多核苷酸的結合劑以檢測該融合物。
60. 一種評估個體是否罹患癌症或腫瘤或是易於罹患癌症或腫瘤的方法,該方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物或由其所編碼之多肽,且藉由辨識所述多核苷酸或多肽融合物是否存在來評估所述個體罹患所述癌症或腫瘤或是易於罹患所述癌症或腫瘤。
61. 如第55至58項中任一項之方法或用途,其中該ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑係選自由以下所組成之群組:包含一結合ErbB-2之胞外部分之第一抗原結合位點及一結合ErbB-3之胞外部分之第二抗原結合位點的多特異性抗體、ErbB-2之酪胺酸激酶抑制劑、包含有一結合ErbB-2之胞外部分之抗原結合位點的單特異性雙價抗體、包含有一結合ErbB-3之胞外部分之抗原結合位點的單特異性雙價抗體、或其任何組合。
62. 如第55至58、或61項中任一項之方法或用途,其中該ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑為澤妥珠單抗(zenocutuzumab)。
63. 如第41至62項中任一項之方法或用途,其中該異常細胞、癌細胞或腫瘤細胞係包含如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物或由其編碼之多肽,且其中該細胞所包含之多核苷酸融合物進一步包含符合讀框的融合一編碼NRG1之EGF樣結構域的編碼序列。
64. 如第41至63項中任一項之方法或用途,其中該異常細胞係來自癌症,尤其所述癌症為腺癌,更尤其是黏液腺癌、胰臟癌,更尤其是胰臟腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌、腎細胞癌、肉瘤、膀胱癌、大腸癌、直腸癌、大腸直腸癌、膽囊癌、頭頸癌、前列腺癌、子宮癌、乳癌、卵巢癌、肝癌、子宮內膜癌、肺癌,較佳為非小細胞肺癌,較佳地、更佳地為浸潤性黏液腺癌、或是原發性癌或轉移性癌。
65. 一種包含如第1至23項中任一項之多核苷酸融合物及/或表現由其所編碼之多肽融合物的活體內動物模型,其中由該動物模型所組成之多核苷酸融合物或多肽融合物較佳地係由存在於該動物模型中之移植異常細胞所組成,或是由該動物模型的基因體所組成。
66. 一種以Erb2及/或Erb3標靶劑治療如第66項之活體內動物模型的方法,該標靶劑係選自由以下所組成之群組:包含一結合ErbB-2之胞外部分的第一抗原結合位點及一結合ErbB-3之胞外部分的第二抗原結合位點之多特異性抗體、ErbB-2之酪胺酸激酶抑制劑、包含有一結合ErbB-2之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、包含有一結合ErbB-3之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、或其任何組合,所述方法包含向該動物投與所述Erb2及/或Erb3標靶劑。
67. 一種供使用於原位雜交測定法以檢測VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1 CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1之基因重排的第一核酸探針及第二核酸探針,其中:
- 用於檢測VAPB之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 1之位置43之核酸5’處的VAPB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 1之位置43之核酸3’處的VAPB序列雜交;
- 用於檢測CADM1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 5之位置53之核酸5’處的CADM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 5之位置53之核酸3’處的CADM1序列雜交;
- 用於檢測CD44之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 9之位置52之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 9之位置52之核酸3’處的CD44序列雜交;
- 用於檢測SLC3A2之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 13之位置53之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 13之位置53之核酸3’處的SLC3A2序列雜交;
- 用於檢測VTCN1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 164之位置65之核酸5’處的VTCN1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 164之位置65之核酸3’處的VTCN1序列雜交;
- 用於檢測CDH1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 184之位置119之核酸5’處的CDH1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 184之位置119之核酸3’處的CDH1序列雜交;
- 用於檢測CXADR之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 215之位置43之核酸5’處的CXADR序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 215之位置43之核酸3’處的CXADR序列雜交;
- 用於檢測GTF2E2之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 231之位置141之核酸5’處的GTF2E2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 231之位置141之核酸3’處的GTF2E2序列雜交;
- 用於檢測CSMD1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 253之位置88之核酸5’處的CSMD1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 253之位置88之核酸3’處的CSMD1序列雜交;
- 用於檢測PTN之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 311之位置102之核酸5’處的PTN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 311之位置102之核酸3’處的PTN序列雜交;
- 用於檢測ST14之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 328之位置95之核酸5’處的ST14序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 328之位置95之核酸3’處的ST14序列雜交;
- 用於檢測AGRN之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 401之位置106之核酸5’處的AGRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 401之位置106之核酸3’處的AGRN序列雜交;
- 用於檢測THBS1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 374之位置56之核酸5’處的THBS1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 374之位置56之核酸3’處的THBS1序列雜交;
- 用於檢測PVALB之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 435之位置102之核酸5’處的PVALB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 435之位置102之核酸3’處的PVALB序列雜交;
- 用於檢測SLC3A2之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 452之位置93之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 452之位置93之核酸3’處的SLC3A2序列雜交;
- 用於檢測APP之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 484之位置54之核酸5’處的APP序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 484之位置54之核酸3’處的APP序列雜交;
- 用於檢測WRN之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 526之位置96之核酸5’處的WRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 526之位置96之核酸3’處的WRN序列雜交;
- 用於檢測DAAM1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 603之位置75之核酸5’處的DAAM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 603之位置75之核酸3’處的DAAM1序列雜交;
- 用於檢測ASPH之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 633之位置75之核酸5’處的ASPH序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 633之位置75之核酸3’處的ASPH序列雜交;
- 用於檢測NOTCH2之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 691之位置75之核酸5’處的NOTCH2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 691之位置75之核酸3’處的NOTCH2序列雜交;
- 用於檢測CD74之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 715之位置75之核酸5’處的CD74序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 715之位置75之核酸3’處的CD74序列雜交;
- 用於檢測SDC4之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 741之位置75之核酸5’處的SDC4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 741之位置75之核酸3’處的SDC4序列雜交;
- 用於檢測CD44之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 759之位置75之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 759之位置75之核酸3’處的CD44序列雜交;
- 用於檢測SLC4A4之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 763之位置75之核酸5’處的SLC4A4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 763之位置75之核酸3’處的SLC4A4序列雜交;
- 用於檢測SDC4 之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 822之位置75之核酸5’處的SDC4 序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 822之位置75之核酸3’處的SDC4 序列雜交;
- 用於檢測ZFAT之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 826之位置75之核酸5’處的ZFAT序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 826之位置75之核酸3’處的ZFAT序列雜交;或
- 用於檢測DSCAML1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 866之位置75之核酸5’處的DSCAML1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 866之位置75之核酸3’處的DSCAML1序列雜交。
實例 實例 1 :檢驗樣本製備
液態樣本或檢體包括血液、血清、血漿、胸腔積液、尿液、精液、陰道拭子、羊水、腹膜液、無細胞灌洗液或其他生物流體。
當使用血液作為起始材料時,可在以細胞穩定劑(諸如無細胞的DNA BCT管(Streck))處理過的管子中收集血液,該細胞穩定劑可防止血球細胞在收集後破裂,並將來自正常細胞的野生型DNA/RNA的汙染降至最低。
實例 2 :從血漿純化循環 DNA
雖然此實例的實驗方案描述了從1 ml的血漿樣本中分離cfDNA,但當期望有更高產量及其他樣本類型(如尿液及血清)時,該實驗方案也適合從其他體積中分離。該實驗方案係基於QIAamp®循環核酸套組(CNA) (Qiagen, 產品編號#55114)及日期為10/2019 的手冊(HB-0202-006)。
在開始之前,允許來自人類個體的血漿樣本平衡至室溫,無論是來自於適合冷藏溫度儲存的樣本或是從患者抽取後直接使用。所有的離心步驟都是在室溫下進行。必要時,用磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)將體積低於1 ml的樣本調整到總共1 ml。
緩衝液及試劑的製備
根據製造商的說明書來製備緩衝液ACB、ACW1及ACW2。簡言之,在使用前,將200 ml異丙醇(100 v/v%)添加到300 ml緩衝液ACB 濃縮物中以得到500 ml緩衝液ACB。在添加異丙醇之後,將所得緩衝液混合均勻。在使用前,將25 ml乙醇96–100 (v/v%)添加到19 ml緩衝液ACW1濃縮物以得到44 ml緩衝液ACW1。在添加乙醇之後將所得液體混合均勻。在使用前,將30 ml乙醇(96–100%)添加到13 ml緩衝液ACW2濃縮物中以得到43 ml緩衝液,隨後將其混合均勻。例如,要處理12個1 ml血漿樣本時,將10.6 ml緩衝液ACL與67.5 μl之含有載體的AVE緩衝液混合在一起。
從血漿分離cfDNA
流程:將100 µl QIAGEN蛋白酶K抽吸到50 ml離心管中,將1 ml的血漿添加到該50 ml離心管中。添加0.8 ml ACL緩衝液(含有1.0 µg載體RNA),之後關上蓋子並用脈衝渦動混合30秒且同時在管內形成渦流。將樣本及ACL緩衝液徹底混合以產生均質溶液。將樣本在60°C下培育30分鐘使其立即裂解。於離心管內向該溶胞產物添加1.8 ml ACB緩衝液,之後關上蓋子並用脈衝渦動徹底混合15至30秒。將該溶胞產物ACB緩衝混合液於離心管內在冰上培育5分鐘。將QIAamp小型管柱(Mini column)插入QIAvac 24 Plus上之真空接頭(VacConnector)中,並根據製造商的說明書設定。將20 ml延伸管插入敞開的QIAamp小型管柱中。將20 ml延伸管緊緊插入QIAamp小型管柱中。
在冰上培育之後,將該溶胞產物 – ACB緩衝混合液施加至QIAamp小型管柱的延伸管中。開啟真空幫浦,且當所有溶解物已完全被抽吸通過管柱時,關閉真空幫浦且使壓力釋放至0毫巴。小心地移出且丟棄延伸管。如果為QIAvac連接系統(Connecting System)的一部分,則可使用真空調節器(Vacuum Regulator)。為了避免交叉污染,不要將延伸管在鄰近的QIAamp小型管柱上方移動。將600 µl ACW1緩衝液施加至QIAamp小型管柱中。將管柱的蓋子打開且開啟真空幫浦。在所有ACW1緩衝液已被抽吸通過QIAamp小型管柱之後,關閉真空幫浦且使壓力釋放至0毫巴。將750 µl ACW2緩衝液施加至QIAamp小型管柱中。將管柱的蓋子打開且開啟真空幫浦。在所有ACW2緩衝液已被抽吸通過QIAamp小型管柱之後,關閉真空幫浦且使壓力釋放至0毫巴。將750 µl乙醇(96 v/v%)施加至QIAamp小型管柱中。將管柱的蓋子打開且開啟真空幫浦。在所有乙醇已被抽吸通過QIAamp離心層析管柱(spin column)之後,關閉真空幫浦且使壓力釋放至0毫巴。將QIAamp小型管柱的蓋子蓋緊,將該管柱自真空歧管中移出且拋棄真空接頭。將QIAamp小型管柱置放於乾淨的2 ml收集管中,且全速(20,000 x g; 14,000 rpm)離心3分鐘。將QIAamp小型管柱置放於新的2 ml收集管中。打開蓋子,且將總成在56°C下培育10分鐘以使膜完全乾燥。將QIAamp小型管柱置放於乾淨的1.5 ml溶離管中並丟棄最後使用的2 ml收集管。將20 µl AVE緩衝液小心地施加至QIAamp小型管柱膜(Mini membrane)之中心。蓋緊蓋子且在室溫下培育3分鐘。將溶離緩衝液AVE平衡至室溫。回收的溶離液體積為約5 µl,小於施加至QIAamp小型管柱的溶離體積。在微型離心機中以全速(20,000 x g; 14,000 rpm)將管柱離心1分鐘以溶離核酸,致使獲得細胞游離DNA。
用AVE緩衝液溶離游離的循環游離細胞DNA,即用於擴增反應或儲存在–30°C至–15°C下。經純化的核酸不含蛋白質、核酸酶及其他雜質。
接著,核酸濃度係於擴增NRG1融合物及檢測分析之前,根據製造商的建議來測定,諸如定量擴增測定法。
用於QIAvac 24 Plus系統之真空處理1–24 QIAGEN離心層析管柱的材料清單。QIAvac 24 Plus:處理1–24 離心層析管柱的真空歧管,包括QIAvac 24 Plus真空歧管、Luer Plugs及快速聯結管(Quick Couplings) (產品編號19413)。真空接頭(500):500型拋棄式接頭,供與魯爾槽(luer slot)或真空閥(VacValve)上的QIAamp小型管柱一起使用(產品編號19407)。真空閥(24):24個閥,供與QIAvac 24 Plus一起使用(產品編號19408)。真空調節器(Vacuum Regulator):供與QIAvac歧管一起使用(產品編號19530)。真空幫浦(230 V, 50 Hz):通用真空幫浦(容量為34 L/分鐘,8 mbar真空絕對值) (產品編號84020)。QIAvac連接系統(Connecting System):用以連接真空歧管與真空幫浦的系統:包括托盤、廢液瓶、管路、聯結管、閥門、壓力計、24個真空閥(產品編號19419)。
實例 3 :循環腫瘤 RNA (cfRNA)從血漿純化循環RNA
雖然此實例的實驗方案描述了從4 ml的血漿樣本中分離循環RNA,但當期望有更高產量及其他樣本類型(如尿液及血清)時,該實驗方案也適合從其他體積中分離。該實驗方案係基於QIAamp®循環核酸套組(CNA) (Qiagen, 產品編號#55114)及日期為10/2019 的手冊(HB-0202-006)。
在開始之前,允許來自人類個體的血漿樣本平衡至室溫,無論是來自於適合冷藏溫度儲存的樣本或是從患者抽取後直接使用。所有的離心步驟都是在室溫下進行。必要時,用磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)將體積低於4 ml的樣本調整到總共4 ml。
緩衝液及試劑的製備。
根據製造商的說明書來製備緩衝液ACB、ACW1及ACW2。簡言之,在使用前,將200 ml異丙醇(100 v/v%)添加到300 ml緩衝液ACB 濃縮物中以得到500 ml緩衝液ACB。在添加異丙醇之後,將所得緩衝液混合均勻。在使用前,將25 ml乙醇96–100 (v/v%)添加到19 ml緩衝液ACW1濃縮物以得到44 ml緩衝液ACW1。在添加乙醇之後將所得液體混合均勻。在使用前,將30 ml乙醇(96–100%)添加到13 ml緩衝液ACW2濃縮物中以得到43 ml緩衝液,隨後將其混合均勻。例如,要處理12個4 ml血漿樣本時,將43 ml緩衝液ACL與67.5 μl之含有載體的AVE緩衝液混合在一起。
從血漿分離cfRNA
流程:將400 µl QIAGEN蛋白酶K抽吸到50 ml離心管中,將4 ml的血漿添加到該50 ml離心管中。添加3.2 ml ACL緩衝液(含有1.0 µg載體RNA),之後關上蓋子並用脈衝渦動混合30秒且同時在管內形成渦流。將樣本及ACL緩衝液徹底混合以產生均質溶液。將樣本在60°C下培育30分鐘使其立即裂解。於離心管內向該溶胞產物添加7.2 ml ACB緩衝液,之後關上蓋子並用脈衝渦動徹底混合15至30秒。將該溶胞產物ACB緩衝混合液於離心管內在冰上培育5分鐘。將QIAamp小型管柱(Mini column)插入QIAvac 24 Plus上之真空接頭(VacConnector)中,並根據製造商的說明書設定。將20 ml延伸管插入敞開的QIAamp小型管柱中。將20 ml延伸管緊緊插入QIAamp小型管柱中。
在冰上培育之後,將該溶胞產物 – ACB緩衝混合液施加至QIAamp小型管柱的延伸管中。開啟真空幫浦,且當所有溶解物已完全被抽吸通過管柱時,關閉真空幫浦且使壓力釋放至0毫巴。小心地移出且丟棄延伸管。如果為QIAvac連接系統(Connecting System)的一部分,則可使用真空調節器(Vacuum Regulator)。為了避免交叉污染,不要將延伸管在鄰近的QIAamp小型管柱上方移動。將600 µl ACW1緩衝液施加至QIAamp小型管柱中。將管柱的蓋子打開且開啟真空幫浦。在所有ACW1緩衝液已被抽吸通過QIAamp小型管柱之後,關閉真空幫浦且使壓力釋放至0毫巴。將750 µl ACW2緩衝液施加至QIAamp小型管柱中。將管柱的蓋子打開且開啟真空幫浦。在所有ACW2緩衝液已被抽吸通過QIAamp小型管柱之後,關閉真空幫浦且使壓力釋放至0毫巴。將750 µl乙醇(96 v/v%)施加至QIAamp小型管柱中。將管柱的蓋子打開且開啟真空幫浦。在所有乙醇已被抽吸通過QIAamp離心層析管柱(spin column)之後,關閉真空幫浦且使壓力釋放至0毫巴。將QIAamp小型管柱的蓋子蓋緊,將該管柱自真空歧管中移出且拋棄真空接頭。將QIAamp小型管柱置放於乾淨的2 ml收集管中,且全速(20,000 x g; 14,000 rpm)離心3分鐘。將QIAamp小型管柱置放於新的2 ml收集管中。打開蓋子,且將總成在56°C下培育10分鐘以使膜完全乾燥。將QIAamp小型管柱置放於乾淨的1.5 ml溶離管中並丟棄最後使用的2 ml收集管。將20 µl AVE緩衝液小心地施加至QIAamp小型管柱膜(Mini membrane)之中心。蓋緊蓋子且在室溫下培育3分鐘。將溶離緩衝液AVE平衡至室溫。回收的溶離液體積為約5 µl,小於施加至QIAamp小型管柱的溶離體積。在微型離心機中以全速(20,000 x g; 14,000 rpm)將管柱離心1分鐘以溶離核酸,致使獲得細胞游離RNA。
用AVE緩衝液溶離游離的循環游離細胞RNA,即用於擴增反應或儲存在–30°C至–15°C下。經純化的核酸不含蛋白質、核酸酶及其他雜質。
接著,核酸濃度係於擴增NRG1融合物及檢測分析之前,根據製造商的建議來測定,諸如定量擴增測定法。
用於QIAvac 24 Plus系統之真空處理1–24 QIAGEN離心層析管柱的材料清單。QIAvac 24 Plus:處理1–24 離心層析管柱的真空歧管,包括QIAvac 24 Plus真空歧管、Luer Plugs及快速聯結管(Quick Couplings) (產品編號19413)。真空接頭(500):500型拋棄式接頭,供與魯爾槽(luer slot)或真空閥(VacValve)上的QIAamp小型管柱一起使用(產品編號19407)。真空閥(24):24個閥,供與QIAvac 24 Plus一起使用(產品編號19408)。真空調節器(Vacuum Regulator):供與QIAvac歧管一起使用(產品編號19530)。真空幫浦(230 V, 50 Hz):通用真空幫浦(容量為34 L/分鐘,8 mbar真空絕對值) (產品編號84020)。QIAvac連接系統(Connecting System):用以連接真空歧管與真空幫浦的系統:包括托盤、廢液瓶、管路、聯結管、閥門、壓力計、24個真空閥(產品編號19419)。
為了避免在純化期間及之後損失掉來自生物材料的RNA,首先徹底清潔任何塑料器皿或玻璃器皿,以消除可能的核糖核酸酶(RNase)污染。藉由建立及維護無RNase的環境,可以避免無意中將RNase引入分離流程中。
實例 4 :循環腫瘤細胞的分離
此實驗方案係描述從全血分離出循環腫瘤細胞,其使用AdnaTest BreastCancerSelect套組(ADNAGEN,產品編號T-1-508)使得可經由上皮及腫瘤相關抗原產生富集免疫磁性的腫瘤細胞。抗上皮及腫瘤相關抗原的抗體與磁珠(Dynabeads)共軛以標記周邊血中的腫瘤細胞。經標記的細胞係以磁粒收集器(AdnaMag-L及AdnaMag-S)萃取且隨後裂解。從所得溶胞產物分離出mRNA且使用於檢測NRG1融合物。
將全血(至少5 ml,但也可能是10 ml)收集在含有EDTA(例如,‘S Monovette® Kalium EDTA’, Sarstedt;‘BD Vacutainer® K3EDTA’, Becton Dickinson)的管子中且立即置於冰上,之後在4小時內抽吸並進行處理。
選擇磁珠(Select Bead)的製備:以抽吸方式使BreastSelect Beads(套組中所提供)徹底重新懸浮。計算全部樣本所需的BreastSelect Beads體積且將計算出的體積轉移到1.5 ml反應管。將反應管置於AdnaMag-S磁力收集器(AdnaGen GmbH, 產品編號T-1-800)中。在1分鐘後移除上清液。將磁珠用1 ml PBS (磷酸鹽緩衝鹽水; pH 7.0 – 7.3)洗滌三次。將反應管從AdnaMag-S移出並使其重新懸浮於100 μl PBS中。
腫瘤細胞的選擇:首先將5 ml的血液樣本抽吸到15 ml管子內。將100 μl之已重新懸浮的BreastSelect Beads添加至各血液樣本中。使管子在可傾斜和旋轉的設備上於室溫下慢速旋轉(大約5 rpm)30分鐘。接著將管子置於未置有磁性滑塊的AdnaMag-L (AdnaGen GmbH, 產品編號T-1-700)內,且向下擺動以釋放蓋子中獲得的血滴。接著將磁性滑塊插入且將管子在室溫下培育3分鐘。在不碰觸到磁珠的情況下用10 ml抽吸管將血液上清液完全移除。首先從AdnaMag-L將磁性滑塊移開,向管子添加5 ml的PBS,輕輕使磁珠/細胞複合物重新懸浮,以完成洗滌三次。將磁性滑塊放回到AdnaMag-L內且將管子在室溫下培育1分鐘,隨後用抽吸管移除上清液。洗滌之後,將磁性滑塊移開,將磁珠/細胞複合物重新懸浮1 ml PBS中並轉移到1.5 ml的反應管。將反應管置於已插入磁性滑塊的AdnaMag-S內。1分鐘之後,將上清液全部移除以進行後續的細胞裂解。
從AdnaMag-S將磁性滑塊移開,向每個反應管添加200 μl之經室溫平衡的裂解/結合緩衝液(套組中所提供),隨後藉由抽吸五次使重新懸浮。將磁性滑塊插入AdnaMag-S且培育1分鐘。將含有細胞溶胞產物的上清液轉移到新的1.5 ml反應管,且將含有磁珠的管子丟棄。該細胞溶胞產物係適於mRNA分離或儲存在-20°C下。該溶胞產物的mRNA係於反轉錄(RT-PCR)反應中使用寡聚胸腺嘧啶(Oligo (dT))引子來分離並轉錄成cDNA模板。隨後藉由PCR介導擴增來檢測NRG1融合物。
實例 5 :細胞外囊泡及胞泌體
使用ExoRNeasy Maxi套組(產品編號77023, QIAGEN GmbH, Hilden, 德國)而從血液獲得總囊泡RNA,該套組係基於以膜為基礎的親合性結合步驟而從無細胞的生物液體分離出胞泌體及其他EV。
步驟1包括血漿分離與儲存。將全血收集於含有EDTA的BD Vacutainer®靜脈採血管(Venous Blood Collection Tubes) (產品編號367525)(或是Streck公司之PAXgene®血液ccfDNA管[產品編號768115]及無細胞DNA BCT®管,但不是RNA BCT管)中。將管子儲存在室溫或4°C下且在1小時內處理。使用擺動式斗狀轉子將血液樣本在初次採血管中以1900 x g (3000 rpm)及4°C離心10分鐘。小心將上部(黃色)血漿相轉移到新的管子(具錐形底)中且不攪亂中間的血沉棕黃層(含有白細胞和血小板)。將血漿樣本在錐形管中以3000 x g及4°C離心15分鐘(或以16,000 x g離心10分鐘 – 見上文),或是通過0.8 µm過濾器(Sartorius® Minisart® NML [Sartorius產品編號16592])。小心將澄清上清液轉移到新的管子且不攪亂沉澱物。將血漿儲存在2–8°C達6小時並在同一天處理。
步驟2描述從4 ml的血漿獲得及裂解胞泌體及其他細胞外囊泡(EV)。將4 ml的結合緩衝液XBP添加至4 ml的血漿中並立即輕輕倒置管子5次以混合均勻。將血漿/XBP混合物添加至exoEasy離心層析管柱(spin column)(將EV結合至膜上的膜親合性管柱)且以500 x g離心1分鐘。將流出的液體丟棄,且將管柱放回同一個收集管中。將10 ml洗滌緩衝液XWP添加至exoEasy Maxi離心層析管柱,且以5000 x g離心5分鐘。將流出的液體與收集管一起丟棄。將離心層析管柱轉移至新的收集管。將700 µl QIAzol添加至膜以裂解囊泡,以5000 x g離心5分鐘以收集溶胞產物,將完全轉移至2 ml管子。
步驟3描述從溶胞產物分離出總RNA。根據製造商的說明書製備緩衝液RWT及RPE。將含有溶胞產物的管子短暫地渦動且在室溫下培育5分鐘。接著添加90 µl的氯仿至管子且劇烈搖動15秒。在室溫下培育2至3分鐘之後,在4°C下以12,000 x g將管子離心15分鐘。將上部水相轉移至新的收集管,添加2倍體積的100%乙醇且徹底混合。將700 µl樣本抽吸至在2 ml收集管中的RNeasy MinElute離心層析管柱中,且以≥8000 x g (≥10,000 rpm)離心15秒。丟棄流出的液體之後,使用剩餘的樣本重複此步驟。將700 µl緩衝液RWT添加至RNeasy MinElute離心層析管柱且以≥8000 x g (≥10,000 rpm)離心15秒,隨後添加500 µl緩衝液RPE且以≥8000 x g (≥10,000 rpm)離心15秒。將每個步驟中流出的液體丟棄。最後將500 µl緩衝液RPE添加至RNeasy MinElute離心層析管柱上且以≥8000 x g (≥10,000 rpm)離心2分鐘。將收集管與流出的液體一起丟棄。
將RNeasy MinElute離心層析管柱置入新的2 ml收集管且在蓋子打開下以全速離心5分鐘以使膜乾燥。將收集管與流出的液體一起丟棄。14 µl不含RNase的水來溶離RNA,讓管子靜置1分鐘,且以全速離心1分鐘。
實例 6 :經腫瘤教化的血小板 (TEP)
已知腫瘤細胞會將(突變的) RNA轉移到血小板中,隨後用於檢測腫瘤相關的RNA標誌物。此實驗方案將血小板mRNA的降解程度降至最低,且將其他細胞類型(如紅血球及白血球)的污染程度降至最低(Amisten S, Methods Mol Biol. 2012)。接著將獲自血小板RNA用來擴增及檢測NRG1融合物。
抗體共軛磁珠的製備:將1 ml Dynabead洗滌緩衝液(具0.1% (w/v) BSA的PBS,pH 7.4)與250 μl Dynabead漿料(Dynabeads® Pan Mouse IgG, Invitrogen)一起混合並置於Dynamag磁鐵(DynaMag™-2或DynaMag™-15, Invitrogen)中1分鐘,隨後將液體移除。在另一次洗滌之後,從磁鐵移出磁珠且使其重新懸浮於250 μL洗滌緩衝液中。將15 μl的抗CD235a抗體(小鼠,抗人類CD235a,紅血球表面標誌物,BD Inc, NJ, USA)及15 μl抗CD45抗體(小鼠抗人類CD45,白血球表面標誌物,BD Inc, NJ, USA)添加至磁珠,在溫和傾斜和旋轉下混合且培育至少30分鐘。將管子置於磁鐵中1分鐘以移除上清液,且將磁珠重新懸浮於250 μl洗滌緩衝液,之後儲存在4°C。
收集血球及純化血小板:以18 ml ACD (無菌抗凝劑:檸檬酸葡萄糖溶液, Sigma Aldrich)、12 μl的1 mM PGE1 (Prostaglandin E1, 1 mM於乙醇中的儲備液, Sigma Aldrich)、120 μl的30 mM乙醯柳酸(30 mM於乙醇中的儲備液, Sigma Aldrich)、及480 μl的0.5 M EDTA (Sigma Aldrich)來製備血小板抑制混合物。在進一步含有1.5 ml血小板抑制混合物之15 ml管子的管內收集8.5 ml的血。在室溫下以200g離心20分鐘之後,將上層上面85%之富含血小板(PRP)的血漿轉移到新的15 ml管子。在另一次離心(200g,10分鐘,室溫)移除白血球與紅血球之後,將85%的PRP轉移到50 ml管子。接著以AutoStop™ BC高效過濾器(Pall公司,產品編號ATSBC1E)將PRP過濾以移除白血球,將濾液與抗體共軛磁珠混合培育,同時在室溫下傾斜和旋轉45分鐘。將該PRP/磁珠混合物置於DynaMagTM-2內2分鐘,且將上清液轉移到新的管子以得到耗乏PRP。在重複PRP耗乏步驟之後,將上清液在室溫下以800g離心10分鐘以收取上清液。將血小板沉澱物秤重並以每100 mg沉澱物用1 ml TRIzol (Invitrogen)來溶解,樣本秤重小於100 mg時用最低量1 mL TRIzol。
分離血小板RNA:將溶解於TRIzol中的血小板樣本在室溫下培育5分鐘,且向每管添加200 μl氯仿(Sigma Aldrich)。在劇烈搖動15至30分鐘之後,將管子在室溫下培育2至3分鐘,並在4°C下以12,000g離心15分鐘。將10 μg極純肝醣(UltraPure™ Glycogen, Invitrogen, 產品編號10814–010)添加至新的無RNase管子。將TRIzol/氯仿混合物的水相小心添加至含有肝醣的管子,隨後添加500 μl的冷異丙醇(Sigma Aldrich)。將管子混合並在– 20°C下靜置過夜。在4°C下以12,000g離心15分鐘之後,移除上清液且將RNA沉澱物在1 ml的75 %乙醇中洗滌。將經乾燥的RNA沉澱物溶解於無RNase水中,且可進一步使用於反轉錄為cDNA。
實例 7 : ddPCR 核酸擴增及融合物檢測
使用微滴式數位聚合酶連鎖反應(ddPCR)來檢測來自液態檢體cfDNA及cfRNA樣本中的目標核酸融合物。
使用Bio-Rad’s QX100
TM或QX200
TM微滴式數位PCR系統來進行微滴式數位聚合酶連鎖反應(ddPCR),以致使檢測來自液態檢體DNA及/或RNA (cDNA)樣本中的目標核酸融合物。
引子及探針:引子是設計在融合接合處或斷點附近,以擴增60-200 bp大小的NRG1融合產物。使用Primer3 程式(Whitehead Institute for Biomedical Research, 麻省理工學院)來設計引子使其GC含量為50-60%且T
m介於50與65°C之間(在50 mM鹽濃度及300 nM寡核苷酸濃度下),以避免二級結構及引子二聚物。
使用具序列特異性且用FAM、HEX或VIC染料螢光標記的TaqMan
TM水解探針。探針序列係於擴增子(amplicon)的兩個引子之間選擇。水解探針的T
m係比GC含量為30-80%的引子高3-10°C。該等探針的長度小於30個核苷酸。
樣本製備:使用A260光譜儀來評估輸入DNA/RNA的濃度,以確認所要裝填之目標DNA/RNA濃度是在檢測動態範圍內。QX100或QX200系統建議的DNA動態範圍為每20 μl反應物120,000個複本數。也根據製造商的建議對基因體DNA使用4切酶或6切酶與每μg DNA 10單位酶來進行限制酶消化切割。經消化切割的DNA係儲存在-20°C下直至進一步使用。
當使用cfDNA做為起始材料進行實驗時,該融合序列係包括融合位點加上每一側有足夠長的毗鄰序列以涵蓋PCR擴增子。所得核苷酸序列係介於50-250 ntd。將T7啟動子序列(5'-CAGAGATGCATAATACGACTCACTATAGGGAGA-3')加到目標序列的5'端。雙股去氧核醣核酸(DNA)片段形式之合成序列係從IDT (www.idtdna.com)訂購,且於Tris-EDTA (TE)緩衝液中恢復水分至最終濃度為10 ng/μl。
當使用RNA做為起始材料時,首先使用RT-PCR來生成cDNA,例如使用針對寡聚胸腺嘧啶(oligo(dT))或基因特異性導引(priming)之Bio-Rad’s iScript
TMSelect cDNA合成套組。cDNA濃度係減至相等於約0.2 ng/μl RNA,且每個微滴式數位PCR反應(總體積20 μl)使用5 μl。
為了生成cfRNA之陽性對照組,使用活體外轉錄將60 ng的合成DNA轉成RNA且使用苯酚/胍基試劑將所得RNA轉錄物純化。添加DNase I以移除殘餘模板DNA。以凝膠電泳來評估RNA的品質。基於輸出到檢驗樣本的所要複本數,將所得RNA稀釋至範圍為0.25至2.5 fg的濃度。將供使用於陽性對照組之10 μl的分析RNA等分儲存在– 80°C下。使用無核酸酶的水作為cfDNA及cfRNA的陰性對照組。
ddPCR反應:製備20 μl PCR混合物,其含有樣本核酸(1 μg的DNA或cDNA,最終濃度為50 ng/μl)、探針用之2x ddPCR supermix ((Bio-Rad, 產品編號1863023;不含2’-去氧尿核苷 5’-三磷酸鹽) - 10 μl、20x融合特異性引子/探針組(450 nmol/L引子,250 nmol/L FAM探針) - 1 μl、20x對照目標引子/探針組(450 nmol/L引子,250 nmol/L HEX探針)- 1 μl及無核酸酶的水。建立稍微超過20 μl (22-25 μl)的初始反應物池,以確保能將20 μl的混合物轉移至DG8卡匣(Bio-Rad, 產品編號1864007)。將該等反應混合物合併並於一個單獨的管子中(而非在微滴產生卡匣中)混合均勻。接著將該等反應混合物轉移至已預載於DG8卡匣支架(Bio-Rad, 產品編號1863051)中之DG8卡匣。
裝填20 μl PCR反應物之後,將70 μl的微滴產生油(Bio-Rad, 產品編號1863005)裝填入DG8卡匣各孔底部。在DG8卡匣頂部安裝一個襯墊,將其置入QX200微滴產生儀。該微滴產生儀在約2.5分鐘內對8個樣本產生每樣本約20,000個微油滴。接著輕輕將微油滴抽吸轉移至96孔盤。使用Bio-Rad’s PX1TM PCR孔盤封膜儀(Plate Sealer)及可穿刺熱封箔將PCR孔盤熱封。接著將PCR孔盤置入具有96深孔反應模組之C1000 Touch
TM熱循環儀(Thermal Cycler)中進行PCR。熱循環條件如下:在95°C (10分鐘,1循環)活化酵素;變性(94°C, 30秒)及黏合/延長(55°C, 1分鐘) 40個循環;在98°C下酵素失活,10分鐘,1循環。使用每秒2°C的變溫速率。
在PCR擴增微油滴中的核酸目標之後,將含有微油滴的孔盤置入QX100或QX200微滴讀取儀,其中係使用軟體QuantaSoft,使用雙色檢測系統(設定成檢測FAM及HEX)個別分析每個微油滴。含有至少一個複本的目標DNA/RNA分子之陽性微油滴與陰性微油滴相比係展現出螢光增強。其濃度係以每μl最終1x ddPCR反應物中的複本數報告。使用閾值工具正確地指出微油滴群為雙陰性(FAM及HEX皆為陰性)、FAM陽性、HEC陽性、及雙陽性(FAM及HEX皆為陽性)。使用ABS分析,以每微升之複本數及每微滴之複本數得到目標物的絕對量化。
實例 8 :錨定多重 PCR
使用錨定多重PCR (AMP)來檢測基因融合物及檢測與所感興趣之基因的多重融合。以下實驗方案係基於Archer FusionPlex實體瘤(Solid Tumor)套組(ArcherDX, 產品編號AB0005),且使用獲自例如實例6之液態檢體的RNA來進行。
樣本庫製備:
包括一個含有至少數個已證實的基因融合之陽性對照組。包括一個非模板對照組作為每次運作時另外的樣本。
隨機導引、第一與第二股cDNA合成:該測定法所要輸入的是200 ng RNA,其係稀釋於pH8.0之10 mM Tris HCl中。將20 μl經稀釋的RNA添加至預冷的隨機導引(Random Priming)試劑連排反應管中(套組中所提供)。在混合及短暫快速旋轉之後,將混合物轉移到96孔PCR孔盤,以RT膜(USA Scientific, 產品編號2921-7800)密封並在熱循環儀鋁塊上以65°C培育5分鐘(蓋子加熱下)。
將隨機導引產物轉移到第一股試劑連排反應管(置於預冷鋁塊中)且混合、短暫快速旋轉,並轉移到96孔PCR孔盤。使用以下熱循環儀程式:25°C 10分鐘,42°C 30分鐘,80°C 20分鐘,保持4°C(蓋子加熱下)。
於一組新的PCR連排反應管中以無核酸酶的水製作1:10稀釋的第一股產物,以使用於Pre-Seq品質控制(QC)測定法之中。QC測定法主要是用於驗證非模板對照組中沒有cDNA合成。根據製造商的實驗方案進行QC測定法。
對於第二股cDNA合成,添加21 μl無核酸酶的水至其餘的第一股產物,且將40 μl的此產物添加至第二股試劑連排反應管(套組中所提供,置於預冷鋁塊中)。在混合及短暫快速旋轉之後,將混合物轉移到96孔PCR孔盤並密封。將孔盤插入熱循環儀鋁塊上,且使用以下熱循環儀程式:16°C 60分鐘,75°C 20分鐘,保持4°C(蓋子加熱下)。
末端修復(End Repair):將40 μl的第二股產物轉移到末端修復試劑連排反應管(套組中所提供,置於預冷鋁塊中)。在混合及短暫快速旋轉之後,將連排反應管在熱循環儀鋁塊中以25°C培育30分鐘,隨後保持4°C。在室溫下將該末端修復產物添加至純化珠粒(Agencourt AMPure XP Beads, Bechman Coulter, 產品編號A63881)。在混合之後,將該混合物在室溫下培育5分鐘,隨後在磁鐵(Alpaqua, 產品編號A32782)上培育5分鐘。丟棄上清液,將珠粒用200 μl 70%乙醇以培育30秒及風乾5分鐘進行洗滌兩次。使珠粒重新懸浮於22 μl之pH 8.0的10 mM Tris HCl中,離開磁鐵培育3分鐘,隨後在磁鐵上培育2分鐘。
接合步驟1:從末端修復珠粒純化孔盤取出20 μl轉移入接合步驟1連排反應管(套組中所提供,置於預冷鋁塊中)。在混合及短暫快速旋轉之後,將混合物於96孔PCR孔盤中在熱循環儀鋁塊內以37°C培育15分鐘,隨後保持4°C(蓋子加熱下)。將全部體積的接合步驟1產物添加至50 μl之經室溫平衡的珠粒。在混合之後,將該混合物在室溫下培育5分鐘,隨後在磁鐵上培育5分鐘。丟棄上清液,將珠粒用200 μl 70%乙醇以培育30秒進行洗滌兩次。在最終洗滌之後,移除全部的70%乙醇且將珠粒風乾5分鐘。將珠粒從磁鐵移開且重新懸浮在42 μl之pH 8.0的10 mM Tris HCl中,離開磁鐵培育3分鐘,隨後在磁鐵上培育2分鐘。
接合步驟2:從4°C儲藏庫中移出MBC適配連排反應管試劑(套組中所提供)並正確編號。為了定序目的,還記錄了樣本的特定索引。
從接合步驟1珠粒純化孔盤中取出40 μl轉移至MBC適配連排反應管(ArcherDX,產品編號AK0016-48,置於預冷鋁塊中)。在混合及短暫快速旋轉之後,將混合物轉移至接合步驟2試劑連排反應管(套組中所提供,也置於預冷鋁塊中)。在混合及短暫快速旋轉之後,將混合物在熱循環儀中以22°C培育5分鐘,隨後保持4°C。
將接合清理(Ligation Cleanup)珠粒(經室溫平衡)渦動且將50 μl添加至新的PCR連排反應管組。在磁鐵上培育1分鐘之後,丟棄上清液。將連排反應管從磁鐵移開且重新懸浮於50 μl的接合清理緩衝液中。
將接合步驟2產物添加至接合清理珠粒連排反應管,渦動混合且在室溫下培育5分鐘。重複進行混合及培育,之後將樣本在磁鐵上培育1分鐘並丟棄上清液。添加200 μl的接合清理緩衝液使其重新懸浮,且在快速旋轉之後將該混合物置於磁鐵上1分鐘。重複用接合清理緩衝液進行洗滌。使用超純水進行相同的洗滌動作,之後將珠粒重新懸浮於20 μl的5 mM NaOH中且於PCR孔盤中在熱循環儀鋁塊內用以下條件培育:75°C 10分鐘,隨後保持4°C(蓋子加熱下)。將PCR孔盤置於磁鐵上至少3分鐘。
第一次PCR:將2 μl的NRG1特異性引子(GSP1引子)添加至第一次PCR試劑連排反應管中的每個孔(套組中所提供)並與18 μl的接合步驟2清理產物混合。在短暫快速旋轉之後,將混合物在熱循環儀中用以下程式培育:95°C 3分鐘,15個循環;95°C 30秒 - 65°C 5分鐘(變溫速率100%);72°C 3分鐘,隨後保持4°C(蓋子加熱下)。
將20 μl的第一次PCR產物添加至24 μl之經室溫平衡的珠粒,混合並在室溫下培育5分鐘且在磁鐵上培育2分鐘。之後移除上清液,將珠粒用200 μl 70%乙醇以培育30秒及風乾進行洗滌兩次,並使其重新懸浮於24 μl之pH8.0的10 mM Tris HCl。
第二次PCR及樣本庫量化
將2 μl之另外的NRG1特異性引子(GSP2引子)添加至在冷鋁塊上之正確標記的第二次PCR試劑連排反應管中的每個孔(套組中所提供),且與18 μl的第一次PCR清理產物混合。在短暫快速旋轉之後,將混合物在熱循環儀中用以下條件培育:95°C 3分鐘,18個循環;95°C 30秒 - 65°C 5分鐘(變溫速率100%);72°C 3分鐘,隨後保持4°C(蓋子加熱下)。
將20 μl的第二次PCR產物添加至24 μl之經室溫平衡的珠粒,混合並在室溫下培育5分鐘且在磁鐵上培育2分鐘。之後移除上清液,將珠粒用200 μl 70%乙醇以培育30秒及風乾進行洗滌兩次。在磁鐵上培育2分鐘,將20 μl的第二次PCR產物轉移至新的PCR孔盤並進行定量。
每一樣本庫的濃度係以qPCR使用用於Illumina平台編碼KK4973之Kapa Biosystems樣本庫定量套組(Library Quantification Kit)根據製造商的說明書來測定。用pH8.0之10 mM Tris HCl與0.05% Tween將第二次PCR產物連續稀釋。以每孔6μl之樣本庫定量主混合液(library quantitation master mix) (Kapa Biosystems, 產品編號KK4973)添加至96孔光學反應盤,隨後添加4 μl之合適稀釋品或標準品(Kapa Biosystems, 產品編號KK4906、KK4903)。使用以下qPCR程式:95°C 5分鐘1個循環;95°C 30秒(變溫速率4.4°C/秒) - 60°C 45秒(變溫速率2.2°C/秒) 35個循環。完成樣本庫定量之後,將所有的樣本庫均一化,且將10 μl之每個經均一化的樣本庫合併到一個1.5 ml微量離心管彙集。
樣本庫之定序:
從冷藏庫中移出定序試劑卡匣並置入去離子水直到填充線至少一小時。使定序試劑套組(MiSeq試劑套組v3 – 600循環; Illumina; 產品編號MS-102-3003)與室溫平衡。將10 μl的樣本庫池與10 μl的0.2N NaOH合併以製作變性擴增子樣本庫(DAL)池且在室溫下培育5分鐘。將10 μl之pH 7.0的200 mM Tris HCl添加至DAL,隨後添加970 μl的HT1緩衝液(套組中所提供)。
合併300 μl的HT1、25 μl的20 pM PhiX及675 μl的DAL池以製作最終裝填管。在混合及短暫快速旋轉之後,將裝填管的全部體積添加至該定序試劑卡匣的樣本孔,且將該卡匣裝填到定序儀,以2×151 bp讀長與2×8索引測序數據(index reads)運行(MiSeqDx System – Illumina)。
RNA融合數據係使用適合的生物資訊數據分析軟體來分析。
實例 9 :次世代定序
次世代定序係以DNA樣本使用MI-Exome檢驗(Caris Molecular Intelligence®, Caris Life Sciences)來進行,該檢驗係使用DNA且使用定製人類外顯體套組提供腫瘤突變剖析,以檢測包括有單一核苷酸同質多形性、插入/缺失及DNA重排及融合事件等之變異體。
以下的定製外顯體套組(panel)為使用五種套組的混合套組。該套組係使用Illumina NovaSeq 6000儀器來進行驗證。該混合套組包括兩種獲自Agilent的現成套組以及三種由Caris開發且優化的套組:
Agilent Human All Exon V7 套組(48 MB)
Agilent SNP Backbone套組(具1 MB解析度之3 MB套組)
Caris 719-Gene Targeted Clinical套組(1 MB)
Caris Intronic Fusion套組(0.1 MB)
Caris Pathogenic套組(0.1 MB)
對於以RNA作為起始材料時,係使用全基因轉錄本測定法來進行次世代定序,例如MI TranscriptomeTM測定組(Caris Molecular Intelligence®, Caris Life Sciences)。當在Illumina NovaSeq儀器上定序時,該測定組係使用Agilent SureSelect Human All Exon套組來檢測基因融合物及剪接變異體。
實例 10 :螢光原位雜交 (FISH)
對獲自血漿或血液或其他液態檢體樣本上之循環腫瘤細胞(CTC)利用斷裂分離探針進行FISH。例如,循環腫瘤細胞係使用CellSearch® (Menarini silicon biosystems, 義大利)或ISET® (Rarecells Diagnostics, 巴黎,法國)系統而純化自血漿、血清等,並固定在載玻片上。
簡言之,將從全血中濃縮的CTC封固在獨立的載玻片上(Frithiof, Henrik等人,OncoTargets and therapy 第9卷, 7095-7103, 2016年11月16日)。將含有CTC的溶液(~900 μL)轉移至1.5 mL Eppendorf管且置於磁性托盤中。培育10分鐘之後,移除未附著的溶劑。使細胞重新懸浮於10 μL的1倍磷酸鹽緩衝鹽水且封固在超凍(superfrost)載玻片(ThermoScientific, 德國)且在37°C下培育30分鐘。將載玻片浸入100%甲醇中5分鐘完成固定。將樣本儲存在−20°C直至進一步評估。
使用ZytoLight® FISH-組織實施套組(Tissue Implementation Kit) (ZytoVision, 產品編號Z-2028-5)來完成細胞預處理。緩衝液PT1、ES1、WB1、WB2及MT7為套組中所提供。
將載玻片在70 °C下培育10分鐘,隨後在二甲苯中培育2 x 10分鐘。接著使用一連串乙醇的100%、100%、90%、70%乙醇使載玻片再水合各5分鐘,且最後在去離子水或蒸餾水中洗滌2 x 2分鐘。在98 °C下於預加溫之熱預處理檸檬酸液(Heat Pretreatment Solution Citric (PT1))中將載波片培育15分鐘,且立即轉移至去離子水或蒸餾水洗滌2 x 2分鐘。吸乾水分之後,向該樣本施用胃蛋白酶溶液(Pepsin Solution (ES1))且在37 °C之恆濕箱中培育15分鐘,並用洗滌緩衝液SSC (WB1)洗滌5分鐘。將載玻片於去離子水中洗滌1分鐘,在一連串乙醇的70%、90%、100%乙醇中脫水各1分鐘並風乾。
ZytoLight SPEC NRG1雙色斷裂分離探針(PL140)係由標記了綠色螢光染料(ZyGreen)及橙色螢光染料(ZyOrange)的多核苷酸所組成。這些探針係靶向所感興趣的基因(例如VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、AGRN、THBS1或PVALB)中所發生之映射至斷點的遠端與近端之序列。將10 μl的探針抽吸到各個預處理的樣本上,蓋上22 mm x 22 mm蓋玻片並密封。將載玻片置入75 °C之雜交儀中10分鐘以完成變性,隨後將載玻片轉移至恆濕箱中在37 °C下雜交過夜。
次日,將載玻片浸入37 °C之1 x Wash緩衝液A (WB2) 1至3分鐘以移除蓋玻片,且在37 °C下用洗滌緩衝液A再洗滌2 x 5分鐘。將載玻片在70%、90%及100%乙醇中各培育1分鐘且風乾。將25 μl的DAPI/DuraTect-溶液(MT7)抽吸到載玻片上,蓋上蓋玻片且在黑暗中培育15分鐘。接著以螢光顯微鏡使用合適的ZyGreen (激發波503 nm/發射波528 nm)及ZyOrange (激發波580 nm/發射波599 nm)濾鏡來評估樣本螢光。基於綠色及橙色訊號之重疊或未重疊外觀來說明結果。
實例 11 : 免疫細胞化學染色法 (ICC)
對獲自血漿或血液或其他液態檢體樣本上之循環腫瘤細胞進行免疫細胞化學染色法,以檢測NRG1融合蛋白的表現。例如,循環腫瘤細胞係使用CellSearch® (Menarini silicon biosystems, 義大利)或ISET® (Rarecells Diagnostics, 巴黎,法國)系統而純化自血漿、血清等,並固定在載玻片上。
簡言之,將從全血中濃縮的CTC封固在獨立的載玻片上(Frithiof, Henrik等人,OncoTargets and therapy 第9卷, 7095-7103, 2016年11月16日)。將含有CTC的溶液(~900 μL)轉移至1.5 mL Eppendorf管且置於磁性托盤中。培育10分鐘之後,移除未附著的溶劑。使細胞重新懸浮於10 μL的1倍磷酸鹽緩衝鹽水且封固在超凍載玻片(ThermoScientific, 德國)且在37°C下培育30分鐘。將載玻片浸入100%甲醇中5分鐘完成固定。將樣本儲存在−20°C直至進一步評估。
在固定之後,使用合適的免疫染色系統(例如Ventana Discovery自動免疫染色系統, Ventana Medical Systems, Tucson, AZ, USA)來進行載玻片上的蛋白質檢測。簡言之,將封固在超凍載玻片上的細胞在pH 8.0之EDTA基緩衝液中預處理。向本揭露之NRG1融合物施用兩種一級抗體。例如,抗NRG1抗體,其靶向位於融合接合處(諸如NRG1之EGFR結構域)C端側位置處的區域,以及另一種一級抗體,其靶向位於融合接合處N端位置處的CD44表位或結構域。用合適的稀釋劑進行抗體稀釋。使用合適的二級抗體及兩種不同螢光檢測系統來檢測該等抗體。在螢光顯微鏡中使用不同通道將免疫染色可視化。基於兩種螢光訊號之重疊或未重疊外觀來說明結果。
實例 12 :治療實驗方案
在經診斷帶有以下融合物中之各者的患者中用澤妥珠單抗進行治療:VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44 -NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、DAAM1-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SLC4A4-NRG1、SDC4-NRG1、ZFAT-NRG1及DSCAML1-NRG1,其治療如下。
按照雙週計劃,第一次輸注750毫克的澤妥珠單抗,用時4小時,隨後每隔一周輸注一次,用時2小時,以4周為一個週期。此外,還包括管理IRR(輸液相關反應)的預備藥物,其中包括所有輸液的解熱劑及抗組織胺。在第1天第1週期用藥之前還包括了皮質類固醇;此後,根據調查員的決定進行管理以管理IRR。
實例 13 :源自患者的 VAPB-NRG1 融合數據
將獲自經診斷患有肺腺癌之68歲男性病患之右體壁胸膜所得到之具60%腫瘤性細胞之經石蠟固定的腫瘤性材料樣本進行以下分子生物科技分析。
使用可檢測一組14 個基因(ALK、BRAF、EGFR、FGFR1、FGFR2、FGFR3、KRAS、MET、NRG1、NTRK1、NTRK2、NTRK3、RET、ROS1)的Archer FusionPlex
TM套組。根據製造商的說明書製備建庫,且在Illumina MiSeq定序儀上進行次世代定序(NGS),並使用Archer Analysis 6.0站點完成樣本分析。
在此套組中檢驗是否為VAPB-NRG1融合物陽性的樣本。對此樣本進行定序以致使如SEQ ID NO: 3之序列的鑑定。其顯示出在VAPB的外顯子1與NRG1的外顯子2之間出現一個融合接合處。帶下劃線的序列(核苷酸1-43)係與編碼VAPB (NM_004738.4)之基因的外顯子1的一部分對應。核苷酸44-94係與編碼NRG1的基因的一部分對應。
CAGGTCCTGAGCCTCGAGCCGCAGCACGAGCTCAAATTCCGAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTT (SEQ ID NO: 3)。
實例 14 :源自患者的 CADM1-NRG1 融合數據
將獲自經診斷罹患轉移性肺腺癌NOS之男性病患之具腫瘤性材料的經福馬林固定石蠟塊進行以下分子生物科技分析。
在以批准的顯微解剖技術收取轉移性腦組織之後進行分子檢驗。在顯微鏡下檢查候選載玻片,並圈選含有腫瘤細胞(及在需要檢驗時圈選出單獨的正常細胞)的區域。實驗室技師使用解剖顯微鏡從標記區域收取標的組織並取出。所標記及取出的區域係於顯微解剖後的載玻片上重新進行顯微鏡檢查,並複查顯微解剖的妥適性。
對獲自該樣本之cDNA進行RNA-Seq (RNA定序)以致使如SEQ ID NO: 7之序列的鑑定。其顯示出存在了符合讀框的融合且在CADM1基因之外顯子7與NRG1基因之外顯子6之間出現接合處。下劃線序列,即核苷酸1-53,係對應CADM1基因(NM_ 001301045.1)之外顯子7的一部分。核苷酸54-85係對應編碼NRG1之基因(NM_001159999.3)的一部分。
AGCTTCAAACATAGTGGGGAAAGCTCACTCGGATTATATGCTGTATGTATACGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCAT (SEQ ID NO: 7)。
使用Illumina NextSeq平台,基於次世代定序(NGS)分析將從經福馬林固定及石蠟包埋的腫瘤樣本分離出的基因體DNA進行腫瘤突變負荷分析。僅使用先前沒有關於生殖細胞改變的報告之誤義突變來計算腫瘤突變負荷。高突變負荷是免疫療法反應的一個潛在指標(Hellman等人,NEJM, 2018; Le等人,NEJM, 2015; Rizvi等人,Science, 2015; Rosenberg等人,Lancet 2016; Snyder等人,NEJM, 2014)。NSCLC中的截止點係基於一個大型第3期臨床試驗,其顯示出每兆鹼基中的TMB為10或有更多突變之患者在用免疫檢查點抑制劑組合療法治療時,其無進展生存期係比用化療治療時更長(Hellman等人,NEJM, 2018)。高:每兆鹼基大於或等於10個突變;低:每兆鹼基小於或等於9個突變。該患者樣本的TMB評分為9。
以NGS對樣本進行微衛星不穩定性(MSI)分析,其顯示出穩定的MSI特徵。NGS (MSI-NGS)之MSI狀態係藉由直接分析一組592個已知基因中所定序的已知微衛星區域來測得。為了確定臨床閾值,將MSI-NGS結果與來自於用傳統PCR為基礎的方法所分析之超過2,000個匹配臨床病例的結果進行比較。使用如用於突變檢測之相同深度與頻率標準來檢測微衛星基座中之基因體變異體。此測定法中只會考慮到會造成串聯重複序列數量改變的插入及缺失。計數每個樣本中的微衛星變異總數量並分成三個類別:高度、模稜兩可、及穩定。低MSI的結果係於穩定類別中報告。
在樣本上所進行的免疫組織化學染色顯示出ALK及PD-L1的結果為陰性,MLH1、MSH2、MSH6、PMS2及PTEN的結果為陽性。
使用NGS或RNA-Seq分析,在所獲得的樣本中未檢測到以下與癌症類型相關之生物標誌物的融合物或突變:NTRK1、NTRK2、NTRK3、KRAS、ALK、DOR2、ErbB2、ErbB3、ErbB4、PIK3CA、TP53、MET、PD-L1、RET、ROS1、STKI1、TP53。
實例 15 :源自患者的 CD44-NRG1 融合數據
將獲自46歲男性病患肝臟的腫瘤性材料生物樣本進行以下分子生物科技分析。
使用Archer FusionPlex
TMCustom Solid套組來檢測腫瘤樣本中的基因融合物,該套組利用了Anchored Multiplex PCR (AMP
TM)技術靶向先前報告過的染色體重排中的62個外顯子。對這62個標的外顯子設計出單向基因特異性引子(GSP)。將GPS與轉接子特異性引子組合來擴增已知的及新穎的融合轉錄物。在Illumina MiSeq定序儀上對富集的擴增子進行定序。
於此研究組中之樣本係經CD44-NRG1融合物檢驗為陽性。對該樣本進行定序以致使如SEQ ID NO: 11之序列的鑑定。其顯示出存在了符合讀框的融合且在CD44之外顯子5與NRG1之外顯子2之間出現融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-52,係對應CD44基因(NM_000610)之外顯子5的一部分。核苷酸53-110係對應編碼NRG1之基因之外顯子2的一部分。
GACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTACCACCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACT (SEQ ID NO: 11)。
該樣本在此含有總數62個外顯子標的之臨床驗證套組中係檢驗為陰性,該等標的為:ALK之外顯子20(NM_004304)、ERG之外顯子2,4,8 (NM_004449)、EWSR1之外顯子6,7,8,10,11 (NM_005243)、FGFR3之外顯子17,18 (NM_00142)、FGFR2之外顯子17 (NM_00141.4)、FOXO1之外顯子2 (NM_002015)、NTRK3之外顯子11,12,14,15 (NM_002530)、RET之外顯子12 (NM_020975)、ROS之外顯子34,35 (NM_002944)、SS18之外顯子10 (NM_001007559)、STAT6之外顯子16,17,19 (NM_001178078)、TAF15之外顯子6 (NM_139215)、TFE3之外顯子6 (NM_006521)、BRAF之外顯子7,9,11 (NM_004333)、NTRK1之外顯子12 (NM_002529)、FUS之外顯子5,8 (NM_004960)、CIC之外顯子20 (NM_015125)。
實例 16 :源自患者的 SLC3A2 -NRG1 融合數據
將獲自經診斷患有肺腺癌之女性病患之左下肺葉切除所得到之顯示出原發性腺癌組織的腫瘤性材料進行以下分子生物科技分析。
在藉由以下標的基因的定序收取腫瘤性細胞之後,使用Archer Lung Fusion Plex, Illumina MiniSEQ進行分子檢驗:ALK、BRAF、FGFR1、FGFR2、FGFR3、KRAS、MET、NRG1、NTRK1、NTRK2、NTRK3、RET、ROS1。參考基因體為GRCh37/hg19。
對獲自該樣本之cDNA進行RNA-Seq (RNA定序)以致使如SEQ ID NO: 15之序列的鑑定。其顯示出存在了出現在SLC3A2基因之外顯子1與NRG1基因之外顯子5之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-53,係對應編碼SLC3A2之基因((NM_001013251)之外顯子1的一部分。其餘35個核苷酸,即核苷酸54-88,係對應NRG1基因之外顯子5的一部分。
CCGCATCGGCGACCTTCAGGCCTTCCAGGGCCACGGCGCGGGCAACCTGGCGGCATCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCAT (SEQ ID NO: 15)。
實例 17 :源自患者的 VTCN1-NRG1 融合數據
將獲自經診斷罹患肺腺癌之病患右側胸骨旁部位之包含有腫瘤性細胞的選定組織塊之轉移性腫瘤性檢體材料進行以下分子生物科技分析。
在藉由定序收取腫瘤性細胞及TNA萃取之後,對所獲得的材料使用Archer Fusion Plex RNA CTL_V6 (Archerdx)套組進行分子檢驗,所述定序係經由Nextseq雙端(pair end)使用流通槽N°HFFJFAFX2以及Sophia DDM版本5.7.4—b127-31a209c、流程(Pipeline) ID ILL1AM1R2 / v5.5.24.1 / GEN1GN1FSQ2來實現。
所指的套組係可檢測以下目標區域(及括號內的外顯子)中的突變:AKT1 (3)、ALK (22, 23, 24, 25)、AXL (5, 11, 15, 17)、BRAF (11, 15)、CTNNB1 (3)、CYSLTR2 (6)、DDR2 (17)、EGFR (18, 19, 20, 21)、ERBB2 (20)、FGFR1 (2, 8, 9, 10, 17)、FGFR2 (2, 5, 7, 8, 9, 10)、FGFR3 (3, 5, 8, 9, 10)、GNA11 (4,5)、GNAS (8, 9)、GNAQ (4,5)、HRAS (2, 3, 4)、IDH1 (4)、IDH2 (4)、KEAP1 (全部)、KIT (11, 13, 17)、KRAS (2, 3, 4)、MAP2K1 (2, 3)、MET (13 à 19)、NRAS (2, 3, 4)、PIK3CA (9, 20)、POLE (9 à 14)、RAF1 (4, 5, 6, 7, 9, 10, 11, 12 )、RET (11, 13, 14, 15, 16)、ROS1 (38)、STK11 (全部)、TP53 (全部)。檢測以下轉錄融合物:ALK、AXL、BRAF、CCND1、EGFR、FGFR1、FGFR2、FGFR3、MAP2K1、MET、NRG1、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PPARG、RAF1、RET、ROS1。並檢測以下表現:ALK、CCND1、EGFR、ERBB2、FGFR1、FGFR2、FGFR3、MET、NTRK1、NTRK2、NTRK3、RET、ROS1。
在EGFR基因的外顯子18-21未觀察到突變;在KRAS基因的外顯子2及3未檢測到突變;在BRAF基因的外顯子11及15未檢測到突變;在ERBB2基因的外顯子20未檢測到突變;在PIK3CA基因的外顯子9及20未檢測到突變;在MET基因的外顯子14未檢測到突變;在IDH1基因的外顯子4檢測到突變395G>T,導致R132L胺基酸改變且在VTCN1的外顯子2與NRG1的外顯子2之間檢測到轉錄融合物。
未檢測到涉及ALK、ROS1、RET、NTRK1、NTRK2、NTRK3、FGFR1、FGFR2及FGFR3基因的轉錄融合物。
未檢測到ERBB2或MET過度表現。
對獲自該樣本之cDNA進行RNA-Seq (RNA定序)以致使如SEQ ID NO: 166之序列的鑑定。其顯示出存在了出現在VTCN1基因之外顯子2與NRG1基因之外顯子2之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-65,係對應編碼VTCN1之基因(存取碼NM_024626.4)之外顯子2的一部分。其餘28個核苷酸,即核苷酸66-93,係對應NRG1之外顯子2的一部分。
CATAATTAGCATCATCATTATTCTGGCTGGAGCAATTGCACTCATCATTGGCTTTGGTATTTCAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAA (SEQ ID NO: 166)。
實例 18 :源自患者的 CDH1-NRG1 融合數據
將獲自經診斷罹患胰臟腺癌之女性病患的腫瘤性材料進行以下分子生物科技分析。以Maxwell (Promega) FFPE LEV套組進行自動RNA萃取。
使用Archer Fusion Plex NGS進行分子檢驗。在含有161個基因之Oncomine Comprehensive Assay V3 (OCAV3)套組上進行NGS (S5XL – Life Technologies),其中81個被認為是具熱突變點基因(hotspot gene)且48個為全長基因,以及47個拷貝數基因。對獲自該樣本之cDNA進行RNA-Seq (RNA定序)以致使如SEQ ID NO: 186之序列的鑑定。
其顯示出存在了出現在CDH1基因之外顯子11與NRG1基因之外顯子2之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-119,係對應編碼CDH1之基因(NM_001317185.2)之外顯子11的一部分。其餘30個核苷酸,即核苷酸120-149,係對應NRG1基因之外顯子2的一部分。此外,NGS顯示出在FGFR3基因之外顯子10存在有突變1172C>T,引起了胺基酸改變Ala391Val。
CTGGCTGGAGATTAATCCGGACACTGGTGCCATTTCCACTCGGGCTGAGCTGGACAGGGAGGATTTTGAGCACGTGAAGAACAGCACGTACACAGCCCTAATCATAGCTACAGACAATGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAA (SEQ ID NO: 186)。
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAA 實例 19 :源自患者的 CXADR-NRG1 融合數據
將獲自經診斷罹患大腸癌之男性病患的腫瘤性材料進行以下分子生物科技分析。所提交組織樣本的腫瘤區域或從周圍組織顯微解剖的載玻片,使用標準方法分離總RNA。對分離出的RNA進行逆轉錄,且建構雙股DNA。對該樣本進行通用標籤及標記碼處理,並使用基因特異性引子及通用標記特異性引子(Archer FusionPlex化學公司)進行半巢式多重PCR。使用Illumina NextSeq v2化學品來製備產物及定序。使用Archer分析軟體v4.1來分析序列資料。分析靈敏性為大約5 RNA分子編碼該融合物並取決於所出現的特異性融合事件。融合物係與所報告的參考轉錄本比較。
分子分析顯示出存在了出現在CXADR基因之外顯子1與NRG1之外顯子2之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-43,係對應編碼CXADR之基因(NM_001207063.2)之外顯子1的一部分。其餘58個核苷酸,即核苷酸44-101,係對應NRG1基因之外顯子2的一部分。
ATGGCGCTCCTGCTGTGCTTCGTGCTCCTGTGCGGAGTAGTGGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACT (SEQ ID NO: 217)。
實例 20 :源自患者的 GTF2E2-NRG1 融合數據
將獲自經診斷罹患轉移性乳腺癌NOS之女性病患之具腫瘤性材料的經福馬林固定石蠟塊進行以下分子生物科技分析。
在以批准的顯微解剖技術收取組織之後進行分子檢驗。在顯微鏡下檢查候選載玻片,並圈選含有腫瘤細胞(及在需要檢驗時圈選出單獨的正常細胞)的區域。實驗室技師使用解剖顯微鏡從標記區域收取標的組織並取出。所標記及取出的區域係於顯微解剖後的載玻片上重新進行顯微鏡檢查,並複查顯微解剖的妥適性。
基因融合物及變異轉錄的偵測係於從經福馬林固定及石蠟包埋的腫瘤樣本分離出的mRNA上進行,其使用Agilent SureSelectXT的低起始量樣本庫製備化學品(Low Input Library prep chemistry),針對FFPE樣本優化,並結合SureSelect Human All Exon V7捕獲探針套組(bait panel) (48.2 Mb)與Illumina NovaSeq。此測定法係設計用來檢測出現在基因內已知的及新的斷點處之融合。此分析致使如SEQ ID NO: 233之序列的鑑定。其顯示出存在了符合讀框的融合且在GTF2E2基因之外顯子2與NRG1基因之外顯子2之間出現接合處。下劃線序列,即核苷酸1-141,係對應GTF2E2基因(NM_002095.6)之外顯子2的一部分。核苷酸142-268係對應編碼NRG1之基因(NM_001159999.3)的一部分。
GGGAGCTGTTCAAAAAACGAGCTCTTTCTACTCCTGTAGTAGAAAAACGTTCAGCATCTTCTGAGTCATCATCATCATCGTCAAAGAAGAAGAAAACAAAGGTAGAACATGGAGGATCGTCAGGCTCTAAACAAAATTCTGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAACCAGTTCTGAATACTCCTCTCTCAGATTCAAGTGGTTCAAGAATGGGAATGA (SEQ ID NO: 233)。
使用Illumina NextSeq平台,基於次世代定序(NGS)分析將從經福馬林固定及石蠟包埋的腫瘤樣本分離出的基因體DNA進行腫瘤突變負荷分析。僅使用先前沒有關於生殖細胞變異的報告之誤義突變來計算腫瘤突變負荷。使用以下所定義之腫瘤突變負荷閾值水平並建立截止點:
● 高:每兆鹼基大於或等於17個突變(≥17個突變/Mb)。
● 中:每兆鹼基大於或等於7個突變但小於17個突變(≥7個且<17個突變/Mb)。
● 低:每兆鹼基小於或等於6個突變(≤6個突變/Mb)。患者樣本指出TMB評分為9。
藉由NGS使用微衛星不穩定性(MSI)分析,未檢測到微衛星不穩定性。
使用NGS分析,在GATA3的外顯子6檢測到框移突變(c.1305_1327del23,蛋白變異P436fs)及失能變異體NTRK2 (蛋白變異p.Q172 c.514C>T, (NM_006180.4)。
實例 21 :源自患者的 CSMD1-NRG1 融合數據
將獲自經診斷罹患大腸直腸癌之男性病患的腫瘤性材料進行以下分子生物科技分析。
使用由596個帶有單核苷酸變異、插入與刪除(indel)、易位之基因所組成的定製腫瘤學檢驗套組進行雜交捕獲次世代定序。使用IDT xGen Exome研究套組v1.0雜交探針使得可從重排基因中無偏地檢測所表現的融合轉錄本而進行全基因體轉錄本RNA定序。
其顯示出存在了出現在CSMD1基因之外顯子23與NRG1之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-88,係對應編碼CSMD1之基因(NM_033225.6)之外顯子23的一部分。其餘的核苷酸,即核苷酸89-150,係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。相關的患者報告提及阿法替尼(Afatinib)及厄洛替尼(Erlotinib)為經FDA批准與此CSMD1-NRG1融合物相關的療法,同時提及GSK2849330作為調查性研究。此外,提到了與CSMD1-NRG1融合物相關的臨床試驗TAPUR (NCT02693535)。
在患者的材料中未鑑定出致病性生殖細胞突變,在KRAS或NRAS中也未鑑定出致病性單一核苷酸同質多形性。在患者的材料中鑑定出以下四種體細胞基因體變異體:在TP53中的Y220C誤義突變、在APC中的R564*終止突變( stop gain mutation)、在APC中的N1455fs框移突變、及在BRAF中的G469A誤義突變。確定MSI狀態為穩定的且腫瘤突變負荷為4.6m/MB。
鑑定出意義不明的變異體,包括:在APOB (NM_000384)中的c.3332+1G>A剪接區變異體、在GATA3 (NM_001002295)中的c.425C>T p.S142L誤義變異體、在LZTR1 (NM_006767)中的c.352C>T p.R118C誤義變異體、在CTC1 (NM_025099)中的c.227A>T p.H76L誤義變異體、在CYP1B1 (NM_000104)中的c.239G>A p.R80H誤義變異體、在RECQL4 (NM_004260)中的c.1099C>T p.R367W誤義變異體、在SOX2 (NM_003106)中的c.871A>G p.R291G誤義變異體、及在TCF7L2 (NM_001146274)中的c85_87del pE29del框內缺失。
該患者先前的治療包括氟脲嘧啶、菊白葉酸、伊立替康(Irinotecan)、貝伐單抗(Bevacizumab)及奧沙利鉑(Oxaliplatin)。
ATCCTAAACAGCACATCCAATCACCTGTGGCTAGAGTTCAACACCAATGGATCTGACACCGACCAAGGTTTTCAACTCACCTATACCACTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACT (SEQ ID NO: 255)。
實例 22 :源自患者的 PTN-NRG1 融合數據
將獲自經診斷罹患轉移性乳房惡性腫瘤NOS之女性病患之具腫瘤性材料的經福馬林固定石蠟塊進行以下分子生物科技分析。
在以批准的顯微解剖技術收取組織之後進行分子檢驗。在顯微鏡下檢查候選載玻片,並圈選含有腫瘤細胞(及在需要檢驗時圈選出單獨的正常細胞)的區域。實驗室技師使用解剖顯微鏡從標記區域收取標的組織並取出。所標記及取出的區域係於顯微解剖後的載玻片上重新進行顯微鏡檢查,並複查顯微解剖的妥適性。
基因融合物及變異轉錄的偵測係於從經福馬林固定及石蠟包埋的腫瘤樣本分離出的mRNA上進行,其使用Agilent SureSelectXT的低起始量樣本庫製備化學品(Low Input Library prep chemistry),針對FFPE樣本優化,並結合SureSelect Human All Exon V7捕獲探針套組(bait panel) (48.2 Mb)與Illumina NovaSeq。此測定法係設計用來檢測出現在基因內已知的及新的斷點處之融合。此分析致使如SEQ ID NO: 313之序列的鑑定。其顯示出存在了符合讀框的融合且在PTN基因之外顯子4與NRG1基因之外顯子2之間出現接合處。下劃線序列,即核苷酸1-102,係對應PTN基因(NM_001321386.2)之外顯子2的一部分。核苷酸103-205係對應編碼NRG1之基因(NM_001159999.3)的一部分。
CCAGAACTGGAAGTCTGAAGCGAGCCCTGCACAATGCCGAATGCCAGAAGACTGTCACCATCTCCAAGCCCTGTGGCAAACTGACCAAGCCCAAACCTCAAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAACCAGTTCTGAATACTCCTCTCTCAGATT (SEQ ID NO: 313)。
使用Illumina NextSeq平台,基於次世代定序(NGS)分析將從經福馬林固定及石蠟包埋的腫瘤樣本分離出的基因體DNA進行腫瘤突變負荷分析。僅使用先前沒有關於生殖細胞變異的報告之誤義突變來計算腫瘤突變負荷。使用以下所定義之腫瘤突變負荷閾值水平並建立截止點:
● 高:每兆鹼基大於或等於17個突變(≥17個突變/Mb)。
● 中:每兆鹼基大於或等於7個突變但小於17個突變(≥7個且<17個突變/Mb)。
● 低:每兆鹼基小於或等於6個突變(≤6個突變/Mb)。患者樣本顯示出低TMB評分。
藉由NGS使用微衛星不穩定性(MSI)分析,未檢測到微衛星不穩定性。
使用NGS分析,在TP53的外顯子10檢測到p.E336*, c.1006G>T突變(NM_000546.5)。在NTRK1/2/3、AKT1、BRCA1/2、ERBB2、ESR1、PIK3CA、PTEN中未檢測到變異,且對於PD-L1係得到陰性IHC結果(基於22c3及SP142)。
實例 23 :源自患者的 ST14-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患非小細胞肺癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行的分子分析顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 330序列所包含之ST14基因之外顯子11與NRG1之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-95,係對應編碼ST14之基因(NM_021978.4)之外顯子11的一部分。其餘87個核苷酸,即核苷酸96-182,係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。
CAACAGCAACAAGATCACAGTTCGCTTCCACTCAGATCAGTCCTACACCGACACCGGCTTCTTAGCTGAATACCTCTCCTACGACTCCAGTGACCCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCT (SEQ ID NO: 330)。
實例 24 :源自患者的 THBS1-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患胰臟腺癌的患者所獲得之具有腫瘤性材料之新鮮的、冷凍的、或經福馬林固定的石蠟塊中萃取腫瘤DNA,並進行以下分子生物技術分析。
調查萃取的DNA是否存有447個癌症基因的外顯子DNA序列且在60個基因中的191個區域進行重排檢測。從含有至少20%腫瘤細胞核的組織中分離出DNA,且使用溶液相Agilent SureSelect雜交捕獲套組及Illumina HiSeq 2500定序儀來進行大規模平行定序分析。
分子分析顯示出存在了出現在THBS1基因之外顯子9與NRG1之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-56,係對應編碼THBS1之基因(NM_003246.4)之外顯子9的一部分。核苷酸57-145係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。
ACCCTGTGAAGGCGAAGCGCGGGAGACCAAAGCCTGCAAGAAAGACGCCTGCCCCACTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCTTC (SEQ ID NO: 376)。
進一步的分子分析並未顯露出有ALK、NTRK1、NTRK2、NTRK3、ROS1的融合物,且未檢測到涉及BRCA1、BRCA2或PALB2的致病性突變、複本數改變或結構變異體。已對鑑定以下突變:TP53中的c.783-10_787delinsCCTG、TP53在17p13.1的單複本缺失、c.*178T>A,CDKN1B的外顯子3、在ERCC2外顯子12中的c.1205A>C (p.N402T)、在FANCD2外顯子21中的c.1858T>C (p.C620R)、在KIF1B外顯子5中的c.398A>C (p.N133T)、在NAB2中的c.1092-7T>C、在NOTCH1外顯子20中的c.3245G>A (p.R1082H)、在PTPN14外顯子13中的c.1798C>T (p.R600W)、及在RASA1外顯子9中的c.1273C>A (p.H425N)。
在KRAS或NRAS中也未鑑定出致病性單一核苷酸同質多形性。在患者的材料中鑑定出以下四種體細胞基因體變異體:在TP53中的Y220C誤義突變、在APC中的R564*終止突變( stop gain mutation)、在APC中的N1455fs框移突變、及在BRAF中的G469A誤義突變。確定MSI狀態為穩定的且腫瘤突變負荷為4.6m/MB。
實例 25 :源自患者的 AGRN-NRG1 融合數據
將獲自經診斷罹患胰臟癌(PDAC)之男性病患的腫瘤性材料進行以下分子生物科技分析。
使用由648個帶有單核苷酸變異、插入與刪除(indel)、易位之基因所組成的定製腫瘤學檢驗套組進行雜交捕獲次世代定序。可從重排基因中無偏地檢測所表現的融合轉錄本來進行全基因體轉錄本RNA定序。該測定法的限度為對於單核苷酸變異體的變異對偶基因分數(VAF)為5%且靈敏度為98.2%,對於插入與刪除的VAF為5%且靈敏度為91.8%,而對於易位的靈敏度為91.7%。
此分析致使如SEQ ID NO: 403之序列的鑑定。其顯示出存在了符合讀框的融合且在AGRN基因之外顯子12與NRG1基因之外顯子6之間出現接合處。下劃線序列,即核苷酸1-106,係對應AGRN基因(NM_001305275.2)之外顯子12的一部分。核苷酸107-207係對應編碼NRG1之基因(NM_001159999.3)的一部分。
GTGTGCGGCTCAGATGGGGTCACCTACAGCACCGAGTGTGAGCTGAAGAAGGCCAGGTGTGAGTCACAGCGAGGGCTCTACGTAGCGGCCCAGGGAGCCTGCCGAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCTTCATGGTGAAAGAC (SEQ ID NO: 403)。
此外,也檢測到FGFR1過度表現。
實例 26 :源自患者的 PVALB-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患非小細胞肺癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行的分子分析顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 437序列所包含之PVALB基因之外顯子4與NRG1之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-102,係對應編碼PVALB之基因(NM_002854.3)之外顯子4的一部分。核苷酸103-227係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。
TAAAAGGCTTCTCCCCAGATGCCAGAGACCTGTCTGCTAAAGAAACCAAGATGCTGATGGCTGCTGGAGACAAAGATGGGGACGGCAAAATTGGGGTTGACGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCTTCATGGTGAAAGACCTTTCAAACCCCTCGAGATACTTG (SEQ ID NO: 437)。
實例 27 :源自患者的 SLC3A2-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患肺癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行以下分子生物技術分析。先後使用Maxwell RSC及ReliaPrep™ FFPE Total RNA Promega套組以及Archer Dx CTL Fusionplex從經福馬林固定的石蠟塊萃取出總RNA。使用Archer Analysis第6.2.7版進行生物資訊分析。
此分析顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 454序列所包含之SLC3A2基因之外顯子2與NRG1之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-93,係對應編碼SLC3A2之基因(NM_002394.6)之外顯子2的一部分。核苷酸94-121係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。
AGTTGGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGACTGGTCTCGAACTCTTGGCCTCAGGTGATCCTCTTCCCTCAGCTTCCCAGAATGCCGAGATGATAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAG (SEQ ID NO: 454)。
實例 28 :源自患者的 APP-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患胰臟癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 486序列所包含之APP基因之外顯子14與NRG1基因之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-54,係對應編碼APP之基因(NM_001136130.3)之外顯子14的一部分。核苷酸55-141係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。
TTGAGCCTGTTGATGCCCGCCCTGCTGCCGACCGAGGACTGACCACTCGACCAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCT (SEQ ID NO: 486)。
實例 29 :源自患者的 WRN-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患乳癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 528序列所包含之WRN基因之外顯子33與NRG1基因之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-96,係對應編碼APP之基因(NM_000553.6)之外顯子33的一部分。核苷酸97-182係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。
AAGCTGGCTGCCCCCTTGATTTGGAGCGAGCAGGCCTGACTCCAGAGGTTCAGAAGATTATTGCTGATGTTATCCGAAACCCTCCCGTCAACTCAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGC (SEQ ID NO: 528)。
實例 30 :源自患者的 DAAM1-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患乳癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 605序列所包含之DAAM1基因之外顯子1與NRG1基因之外顯子1之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-75,係對應編碼DAAM1之基因(NM_001270520.2)之外顯子1的一部分。核苷酸76-150係對應NRG1基因之外顯子1的一部分。
GAAGGAAACTGTTTAACCGGATCCCATTGTACCCAGAGTGCAGAGCCGCCTTTCCAGCATGCAGGGGCTGCTCAGGACAGAGAGGGAGGAGGCGCGCGGGGACGGGGACGCCCAGGAGGACCCACTCGCGGGTCCCGCTCCGCTCCGGCA (SEQ ID NO: 605)。
實例 31 :源自患者的 ASPH-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患大腸直腸腺癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 635序列所包含之ASPH基因之外顯子22與NRG1基因之外顯子2之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-75,係對應編碼ASPH之基因(NM_001164750.2)之外顯子1的一部分。核苷酸76-150係對應NRG1基因之外顯子2的一部分。
AAGGTCTCTTCCTGCCTGAGGATGAAAACCTGAGGGAAAAAGGGGACTGGAGCCAGTTCACGCTGTGGCAGCAAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA (SEQ ID NO: 635)。
實例 32 :源自患者的 NOTCH2-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患胰臟癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 693序列所包含之NOTCH2基因之外顯子6與NRG1基因之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-75,係對應編碼NOTCH2之基因(NM_024408.4)之外顯子6的一部分。核苷酸76-150係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。
CCTCCTGTACTCCAGGCTCCACCTGCATCGACCGTGTGGCCTCCTTCTCTTGCATGTGCCCAGAGGGGAAGGCAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG (SEQ ID NO: 693)。
實例 33 :源自患者的 CD74-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患肺癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 717序列所包含之CD74基因之外顯子2與NRG1基因之外顯子2之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-75,係對應編碼CD74之基因(NM_001025159.3)之外顯子2的一部分。核苷酸76-150係對應NRG1基因之外顯子2的一部分。
AGGGCCGGCTGGACAAACTGACAGTCACCTCCCAGAACCTGCAGCTGGAGAACCTGCGCATGAAGCTTCCCAAGCCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA (SEQ ID NO: 717)。
實例 34 :源自患者的 SDC4-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患肺癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 743序列所包含之SDC4基因之外顯子2與NRG1基因之外顯子2之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-75,係對應編碼SDC4之基因(NM_002999.4)之外顯子2的一部分。核苷酸76-150係對應NRG1基因之外顯子2的一部分。
TACCAGACGATGAGGATGTAGTGGGGCCCGGGCAGGAATCTGATGACTTTGAGCTGTCTGGCTCTGGAGATCTGGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA (SEQ ID NO: 743)。
實例 35 :源自患者的 CD44-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患癌症的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 761序列所包含之CD44基因之外顯子5與NRG1基因之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-75,係對應編碼CD44之基因(NM_000610 .4)之外顯子2的一部分。核苷酸76-150係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。
TTTCTACTGTACACCCCATCCCAGACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTACCACTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG (SEQ ID NO: 761)。
實例 36 :源自患者的 SLC4A4-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患胰臟癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 765序列所包含之SLC4A4基因之外顯子14與NRG1基因之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-75,係對應編碼SLC4A4之基因(NM_001098484.3)之外顯子14的一部分。核苷酸76-150係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。
ACTACCCCATCAACTCCAACTTCAAAGTGGGCTACAACACTCTCTTTTCCTGTACCTGTGTGCCACCTGACCCAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG (SEQ ID NO: 765)。
實例 37 :源自患者的 SDC4-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患肺癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 824序列所包含之SDC4基因之外顯子4與NRG1基因之外顯子2之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-75,係對應編碼SDC4之基因(NM_002999.4)之外顯子4的一部分。核苷酸76-150係對應NRG1基因之外顯子2的一部分。
ATGTGTCCAACAAGGTGTCAATGTCCAGCACTGTGCAGGGCAGCAACATCTTTGAGAGAACGGAGGTCCTGGCAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA (SEQ ID NO: 824)。
實例 38 :源自患者的 ZFAT-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患肺癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 828序列所包含之ZFAT基因之外顯子12與NRG1基因之外顯子6之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-75,係對應編碼ZFAT之基因(NM_020863.4)之外顯子12的一部分。核苷酸76-150係對應NRG1基因之外顯子6的一部分。
ACAGGAAGCACCCTAATGAGGAGTATGCCAACGTGGGCACCGGGGAGCTGGCAGCGGAGGTGCTCATCCAGCAAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG (SEQ ID NO: 828)。
實例 39 :源自患者的 DSCAML1-NRG1 融合數據
從經診斷出罹患胰臟癌的患者所獲得之腫瘤性材料上進行分子生物技術分析,其顯示出存在了出現在如SEQ ID NO: 868序列所包含之DSCAML1基因之外顯子3與NRG1基因之外顯子2之間的符合讀框融合接合處。下劃線序列,即核苷酸1-75,係對應編碼DSCAML1之基因(NM_020693.4)之外顯子3的一部分。核苷酸76-150係對應NRG1基因之外顯子2的一部分。
GCCTCATCCCCTCTTCAGTGCAGGAATATGTTAGCGTTGTATCTTGGGAGAAAGACACAGTCTCCATCATCCCAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA (SEQ ID NO: 868)。
實例 40 : PDX 動物模型
製備源自患者的異種移植(PDX)動物模型使其含有包含了多核苷酸融合物且表現了由其所編碼之多肽融合物的異常細胞之植入異常細胞,以使用澤妥珠單抗作為ERB2及/或Erb3標靶劑進行治療來評估其治療活性。
可從含有癌症或樣本之樣本產生PDX模型,諸如在此實例中經診斷患有胰臟腺癌之女性患者,以及基本上如Puig等人, A Personalized Preclinical Model to Evaluate the Metastatic Potential of Patient-Derived Colon Cancer Initiating Cells, Clin Cancer Res; 19(24), 6787-6801 (2013)中所述之CDH1-NRG1多核苷酸融合物(見實例18),其全文係併入此申請案中。
對於全部的小鼠研究,使用介於6-8週齡之雌性NOD.CB17/AlhnRj-Prkdcscid/Rj小鼠(Janvier Labs)。
該等模型可以皮下注射,或在免疫缺陷小鼠的胰腺中原位注射。原位模型係於淋巴結、肝臟、肺或癌病中產生局部及遠處轉移,再現PDAC患者的前期疾病。
在第6週,將所有經載體或澤妥珠單抗治療的小鼠犧牲且分析治療功效。
可以對統計學上相關數量的NOD-SCID小鼠原位胰腺注射1*10^6個來自所述PDX模型的腫瘤細胞。從注射後15天開始,每週用CT成像來監測小鼠並檢測胰腺中的原發性腫瘤。在至少80%的動物的胰腺中有原發性腫瘤生長後開始進行治療。
基於不符合以下品質標準的小鼠將其排除在研究之外,包括手術後死亡、沒有原發性腫瘤、腫瘤過大的小鼠、體重不足、及一般疾病跡象。根據實例12進行給藥及治療方案,然而,使用標準程序及計算,注意從人類情況中適當地轉換與小鼠有關的條件。
本揭露之 序列資訊 VAPB 序列資訊SEQ ID NO:1 VAPB-NRG1融合物5’處之VAPB外顯子1序列
CAGGTCCTGAGCCTCGAGCCGCAGCACGAGCTCAAATTCCGAG
SEQ ID NO:2 VAPB-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTT
SEQ ID NO:3 VAPB-NRG1多核苷酸序列
CAGGTCCTGAGCCTCGAGCCGCAGCACGAGCTCAAATTCCGAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTT
SEQ ID NO:4 VAPB-NRG1多肽序列
QVLSLEPQHELKFRALPPRLKEMKSQESAAG
SEQ ID NO:17 VAPB之外顯子1
AGTCCCCGCCCCTGGAGCCGGCGGCGCAGGGCGCAGCTTCCCGCCGCCAGAGCGGGCCAGCCTGCTGCGTGCGTGCGTGTGTACGACTCTGCGTGCGTGCGTGCGTGCGTGCGTGCCGTCAGCTCGCCGGGCACCGCGGCCTCGCCCTCGCCCTCCGCCCCTGCGCCTGCACCGCGTAGACCGACCCCCCCCCAGCGCGCCCACCCGGTAGAGGACCCCCGCCCGTGCCCCGACCGGTCCCCGCCTTTTTGTAAAACTTAAAGCGGGCGCAGCATTAACGCTTCCCGCCCCGGTGACCTCTCAGGGGTCTCCCCGCCAAAGGTGCTCCGCCGCTAAGGAACATGGCGAAGGTGGAGCAGGTCCTGAGCCTCGAGCCGCAGCACGAGCTCAAATTCCGAG
SEQ ID NO:18 VAPB之外顯子2
GTCCCTTCACCGATGTTGTCACCACCAACCTAAAGCTTGGCAACCCGACAGACCGAAATGTGTGTTTTAAGGTGAAGACTACAGCACCACGTAGGTACTGTGTGAGGCCCAACAGCGGAATCATCGATGCAGGGGCCTCAATTAATGTATCTG
SEQ ID NO:19 VAPB之外顯子3
TGATGTTACAGCCTTTCGATTATGATCCCAATGAGAAAAGTAAACACAAGTTTATGGTTCAGTCTATGTTTGCTCCAACTGACACTTCAGATATGGAAGCAGTA
SEQ ID NO:20 VAPB之外顯子4
TGGAAGGAGGCAAAACCGGAAGACCTTATGGATTCAAAACTTAGATGTGTGTTTGAATTGCCAGCAGAGAATGATAAACCA
SEQ ID NO:21 VAPB之外顯子5
CATGATGTAGAAATAAATAAAATTATATCCACAACTGCATCAAAGACAGAAACACCAATAGTGTCTAAGTCTCTGAGTTCTTCTTTGGATGACACCGAAGTTAAGAAGGTTATGGAAGAATGTAAGAGGCTGCAAGGTGAAGTTCAGAGGCTACGGGAGGAGAACAAGCAGTTCAAG
SEQ ID NO:22 VAPB之外顯子6
GAAGAAGATGGACTGCGGATGAGGAAGACAGTGCAGAGCAACAGCCCCATTTCAGCATTAGCCCCAACTGGGAAGGAAGAAGGCCTTAGCACCCGGCTCTTGGCTCTGGTGGTTTTGTTCTTTATCGTTGGTGTAATTATTGGGAAGATTGCCTTGTAGAGGTAGCATGCACAGGATGGTAAATTGGATTGGTGGATCCACCATATCATGGGATTTAAATTTATCATAACCATGTGTAAAAAGAAATTAATGTATGATGACATCTCACAGGTCTTGCCTTTAAATTACCCCTCCCTGCACACACATACACAGATACACACACACAAATATAATGTAACGATCTTTTAGAAAGTTAAAAATGTATAGTAACTGATTGAGGGGGAAAAGAATGATCTTTATTAATGACAAGGGAAACCATGAGTAATGCCACAATGGCATATTGTAAATGTCATTTTAAACATTGGTAGGCCTTGGTACATGATGCTGGATTACCTCTCTTAAAATGACACCCTTCCTCGCCTGTTGGTGCTGGCCCTTGGGGAGCTGGAGCCCAGCATGCTGGGGAGTGCGGTCAGCTCCACACAGTAGTCCCCACGTGGCCCACTCCCGGCCCAGGCTGCTTTCCGTGTCTTCAGTTCTGTCCAAGCCATCAGCTCCTTGGGACTGATGAACAGAGTCAGAAGCCCAAAGGAATTGCACTGTGGCAGCATCAGACGTACTCGTCATAAGTGAGAGGCGTGTGTTGACTGATTGACCCAGCGCTTTGGAAATAAATGGCAGTGCTTTGTTCACTTAAAGGGACCAAGCTAAATTTGTATTGGTTCATGTAGTGAAGTCAAACTGTTATTCAGAGATGTTTAATGCATATTTAACTTATTTAATGTATTTCATCTCATGTTTTCTTATTGTCACAAGAGTACAGTTAATGCTGCGTGCTGCTGAACTCTGTTGGGTGAACTGGTATTGCTGCTGGAGGGCTGTGGGCTCCTCTGTCTCTGGAGAGTCTGGTCATGTGGAGGTGGGGTTTATTGGGATGCTGGAGAAGAGCTGCCAGGAAGTGTTTTTTCTGGGTCAGTAAATAACAACTGTCATAGGGAGGGAAATTCTCAGTAGTGACAGTCAACTCTAGGTTACCTTTTTTAATGAAGAGTAGTCAGTCTTCTAGATTGTTCTTATACCACCTCTCAACCATTACTCACACTTCCAGCGCCCAGGTCCAAGTCTGAGCCTGACCTCCCCTTGGGGACCTAGCCTGGAGTCAGGACAAATGGATCGGGCTGCAGAGGGTTAGAAGCGAGGGCACCAGCAGTTGTGGGTGGGGAGCAAGGGAAGAGAGAAACTCTTCAGCGAATCCTTCTAGTACTAGTTGAGAGTTTGACTGTGAATTAATTTTATGCCATAAAAGACCAACCCAGTTCTGTTTGACTATGTAGCATCTTGAAAAGAAAAATTATAATAAAGCCCCAAAATTAAGAATTCTTTTGTCATTTTGTCACATTTGCTCTATGGGGGGAATTATTATTTTATCATTTTTATTATTTTGCCATTGGAAGGTTAACTTTAAAATGAGCCCTATCACTGAGAAATACGTGTTTCATGATTTAACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTTTTTTTTGGTTGTCTTCAGCTGACAGTATGAAAAATGAAACTGCTGAAAAAGCTGAGCACCTGGTCACCCTTGGCCTTCCATTGCTTTGGCCTTCAGTAAAAAGCAGCCTCCCTTCTAGGTCAGGGAACCATGCCATTGAGACTAGTAACGGGCGTTCTGGGCACAGTCCCACTGTGCACAGGTTTGAGAGGACAAGTTCATCAGAAGGAAGGCAGTCCTTAGAAGTCACATACGTTGAGCCACGTTGCTCCTAAGCCTGGCTCTGTCAAGCTGGGTCAGGGGCCTTGAAACTGGAGAAGTGGAAGTCTATGGTTGGTCTGAGTAAGTAACTTCCTGTCTTCATGAAAAAAGTTGACTTTGAATCCCAGGTACTCACAGAAATGGTGAACAGACTTAGTTGTTACCCAGGCACCCATGGATTGTGTTGAGTGTGCAGACAGGGAGGCCACCCCAATAGGAATTCGTCTCCAGGATTTTTCCCATGTGTCCCCCAGTACTTATAAAAGGGAGTGAAAAGACCGAGCTGTAAGGCATGTGCCTTCTGCCACCTGACTTTCCGTGAGGGGACTAAAATTTACTAATTGTAGTTGCTGCAGCCAGTTAAGTCCTGTAGCTTCCAGGCCCTCATGTCTTTGATAGGAGAGTGCTTAGGTGGTCCCCAACAGTGCCTAGGGGTACAGTACAGTCCCATTACACTAGAGCAGGGCTCTATTTATTTTTAAAGGATATGGCCGTGTGTTTTGATAAAACTTTATTCACAAAAACAGCCGGGTCATGGGATTTGGCTTGTGAGTCTGTAACAGTTCTTAAAAAGAATATCTGAGAAACTACTCTGTTTTAGACCTTTGAAGGTGATTTAGAGTTTTGTGTACATCTAGGAGAAGGTGTTCAGCTTCTCAGAGGATGTGGACATTTTGGTTGCAGCTAAAAATCAGTCTCTGAAGTCTCTCTCCCTTCTAGAGGTTAGGACTTGGTGAACATGTTTGTGGGCCTTTTGACTGAGTGGCAGAAGGAAACTGCTCAGGAAGAGAAACAGGTGACTGATGGGAAGGTTGATTATTTTCTCAGTCATCCTGGCAGCCAAAAATGTGCCAGGAAAAGAAAGAATGTGGAGCACGCGTGGCTCCTGGAGGACTTGGAGATGCATGCACATTTAGGGTGTTTTCCCTAGAATTACATAATGAAAAAAAGAATAAGGCAAAGAGGAGGTGAATATGGGGCCTGTCACAACGGCCTGCCCTGCCCCAAGAGGGTTAAGAGTCAGATAATCGGGACGAAACTGGCATGGAAAGAGCGAGCCTAGGGAGGATGCCGCTGGGCAGTGTGCATGGGGGAGCTGCTGCCAGGCTGCCCTCCAGTCTGCTCCTGTGGTTACTGGCTCCACAGCACCTCAGAGAGGGCGGCCCTGGCTTCAGAAATGCCAGCCATAGTGCTCACAAATGCAGAAGAGATGGAAGCGGTGACAGAATCCTGAAAGTTTTTATTGATTGAAGTTTTAAATTGGTAACTTAAGCTTCCTTGGCACGATACAAAATACCTCTTAAAGACAGCAGGCTTTTTTATTTGTAGGTGTGAGGAACTGGCTTTAACTTTTTTCTCCTCCTAGTTTGCATGTTTTCCTTCTCTCGTCTTCTGAACTGCTGGCACCAGCAGTAATACATACTGATAAAATCAAAATTGATTTTTACCAGTGGCCAGTTTATGGCTAGAGAGACGACTTATACCTCCATAACACAGAAGGGGGAAAAATGAAGAACCTCCAGTGATCCGTGAAAACCTAAACGCTTTCAAACAAATCCCAGGAACAGAATTGCTATCGAAAGATATCATTGCCCAGTTTGCAGGCTATGTTGAGTCAGATAGAACTGAATGTAGTGAGAGCTCAGAGCTACAGAGCCTTTCAGATGAATTTGAAAACAGACTCTGTGTGTGTGTGCATGTGTGCATGTGTGCATGTGTGGCATATGTGCCGTATGTCAGTAGCTTGACAGTTTTCAAATCGTGCCTATATTTTTTTGCATACACAAATTTTTGTGTTTGCAAACTCAGAATCCATGCCAAAATACAATGTTATATGTCATTTTCAGCTCCTTCTCTAAAGGAATGGCCCATTTCTCATTGTAGTTTGAGAAATACATGTATGAAGAGATAGGGGTCTTGGGCTTCCCAGTGTCACTTTGAACACCTGAATAACATTTAACTCCTGAGACCTTCTCGGTGTAGAGGCCACTGCTTCCCCCTGCTGGAGATGGCATTTCATTGAAGGGCCTCTCGTGGCTTTCCCTGCCCCCGGCTGTCTGGCCTGAAGAAGGAGAAAGAACCAAACTGAACTATGAAAAGTTACCACTCTGAGGAGACCTCTCTTAATTAACACTTGGGGCCATGTTTGCTGTTGTTGAGAAGGAGTGTTCTCAAAGATGAGCTGGAATGGAATTGTATTTAGAAAGGCCCCTGCAAAGTATATAGATGGATGACTCTAGTTCATGACATACAAATCCCATAAGGCCAACGACCACTCTTCTGGAACACCAAGAGCAGCTCTGAGATCATGCTGGCCCTACGCGAATTGAGTTTCTGTGGCCTAATTGGATTTGGAGAACGCCTTCCCTGGCCCCTTTTCCTCAGACAGATCTGCTCTGATAGGAACCTTTTCAAGAAAGTTACTGTTGTTTCAATGCCACTCCTTACCTGTATAGAACATTTCCAATACATTCGCTCATTGAACTTAATCCTTGCAACTGTGACTGGGGGGTAGATGGCTCTGTTTGCATACGAAGAAATAAAGGCTCCAGGAGGTTAAATCGGGCAACTTTTTAGAACTAAATCAGTCTCTGTAAGGCCTACATTGCTAAGATACCATTTCAGCTCTGAAAATCTGCTTCAGGGAAGTGAGTGGATGAGGCCTTCCTGCCTCAGCTACTCTGCCCGTCTGTACATCTTTTGTGTCTGCCTCCGTACCTTATTCAGTTATTTTCACACTAAAGTAAGTAGAATTAAGACTGTAGTTCAGATGCTTTTTCTTTTTCTGTTGGAAACTGAACACACTACAGACAGTGAAAAAAGGTACATATTCCATTTTCTCATTGCCTGAAGATCTCTGCTGATGCTCCTGGAGAATGACTTTGGGGGCTTTAGAAAGAATATTGCCAGTCCGTCTCGGCAAGGAGATGATGGGAGCGCTTTATATGGAGGCTTTACATGACTTGTAAATTAAATGTGAATGAGGGCAGTTGATTAAAATTGGTATTACAGAAGGGCCCTGCTGAGGTTTGAAAACAGCTGAGCTGCTGATGTCTCAGGCCTTTCCCTGAATTAGCACTGCGGTTCTCCAGGATATCAGCAAAGAGGGCAAGTAATAGAAGCCCCTGATAAGGAGCGTCAGCCGACAGGCAAGCTTGGGAGGCTGTGGGAATGGGTCTGCCCCCAGCTTCACAGACCTCTTCCTCCAGCCTCTGAATCCCATTAGCCACAGCCTAGAACATTAGCTGAGCTGCACAAGCTCACCCACCCCTGTGCCAGGGGGCCCTGACCTCCCTCCATGCCATGTTTTTGGCTGTATCTACGGCACTTAACAATAGGGGCTTTTTATTTTCATTACAGAGATATTTTGAAAAATTTAAAAGACATGAACTCACATAAACAGTTATGGATGATAGTTAAAAGAGAAACGGGTGGAGGTGGATGAGAGGTTGTCTTCATGAATATAATTACTTGAGATTTTTTTTTCTTAATGGAATTAGTTTATTAGAAAATGTCTGTGTTAAATCCGTAGAAAAGGAAGAAAAGTGTAGCAACAAAAATGTAGCCATTATCTAACTTGCCATAAATATTTGCAGTTATGATACCTTGGAATGTTGCCACGATATGGATTGCTTTGATTAAAAGATGTCAGTTGAATAAAACAGTACTGTGGGAGAATCGCTTTCTGCTGCTAGATAAATGCTGATGTTTATTTTTAAACCAGGAAACATTGATCCTGTAACAATGCCCGATTACAATTGCTTTATTACACCCCAGGGCTGATGGAGATGTAATCACTTGGCTAATGGATGTGGGTGCAGGACAGATGCTCGCTTGCTGGCCTGCTTTCCTGCTTGCATTCTGATGAGCTGCAGGAGTGCGCCTGGCCTTCTGCAGGTGGAGCTGCTGTCAGAGCTTCGTTTCACTGATACCCAAAGCCATGTCTGACTGAAATAAAACAGGTTCCCTTTTTTTTTCCCTTTGGAAAATGCCAACTAAGGGAGACTAATCAGATATCTTAACACAATTTCATCCAGGCTTAGTGCTAACAAGATTGCGGGGCTTTTTAGGGTTTAAGAAGATGAGAAATGAGTGTGCACGTTTCACACGTTGACTTGCCGGTTTTTCCATGTCATACAAAAAAGTCCTGGCTGTTTCTCCGAACTGGCTGCCTGCATTCCCGTCTTTCTTTTGTTTTTAAGAAATAGACTGAATTCAGCTGTTAATCCTCTAGTACAGTATCCATGTTAAAATGTTTTTCCATTGCATCTTTTATGTGAATTCAAAGGTCAGAATTTATTGTCTGTGATATTGAGACCATGTGTACAAGAACTACTTTTTGCTTTTCATCATTCACTCCTTAGCAAACGTTTCGTAAGTACCCTCTGTCTGTTTGCTACTATATGAGGTGCTGCGAAATTAGTGGGCGTGGCTTTTTATATTTTTCATTCGTGTGTAGCCTAAGTAAGGTGACTCAAGATGATACACCGAGAGAAAAATGCAAAATATATTTGGTTCTCATTTCTGTTGCTGTCGTTTCCTTTTTAAAGACGATTTATCAACTGCTGCCATTTGGAACTTCCTATAAGAAACTAAAAATGATCTATTTCAGTGTTCCTTTCGCCTTTCCTCTGCTTTCTGAATAAATGGTTTCAGTAACCCATGCTGTTCTCTCCCTATTCTACGTCTTTCTCCCTATGTTGAAAAAAGATTCCCACAGTTTCTGATGTGTGTGTTTATAGTCTTCAATGTATGTTAACATGTTAGGAACTGAGTATCTTAAGAGATGTCTTAGAATGCTTTAGTTTTCATAATTTGTCCTTTATGTATTTTTCATTGTATTTGCTGTTTTGACATGGAAGTAATTTAAAAAGTTGGTGCAGGAAAGGACTCTTTACTGTTGCACATTTTGGTTTTCTGATATGTAATAAATTCATGGCTTGGCAGCTGACATGATGTTTCCCAGAGAGAAGGAGATGTATTTCTGCAGGGTCCAGACCAAAAGAGCCATTTACAGCATGTTCTCCCATGTTCCATTATCAGCCTGATGAAACCTGCCCTGCCAAGGCATAAACTTTTGTACTAGCTGTCTCCATATTATGTTCAATAAATTCTGTGCTCTGAATATATTTAAAAAAAAAAAAA
SEQ ID NO:23 VAPB之全部6個外顯子1-6按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:24 VAPB之外顯子1的轉譯多肽序列
MAKVEQVLSLEPQHELKFR
SEQ ID NO:25 VAPB之外顯子2的轉譯多肽序列
PFTDVVTTNLKLGNPTDRNVCFKVKTTAPRRYCVRPNSGIIDAGASINVS
SEQ ID NO:26 VAPB之外顯子3的轉譯多肽序列
MLQPFDYDPNEKSKHKFMVQSMFAPTDTSDMEAV
SEQ ID NO:27 VAPB之外顯子4的轉譯多肽序列
WKEAKPEDLMDSKLRCVFELPAENDKP
SEQ ID NO:28 VAPB之外顯子5的轉譯多肽序列
HDVEINKIISTTASKTETPIVSKSLSSSLDDTEVKKVMEECKRLQGEVQRLREENKQFK
SEQ ID NO:29 VAPB之外顯子6的轉譯多肽序列
EEDGLRMRKTVQSNSPISALAPTGKEEGLSTRLLALVVLFFIVGVIIGKIAL
SEQ ID NO:30 VAPB多肽序列
MAKVEQVLSLEPQHELKFRGPFTDVVTTNLKLGNPTDRNVCFKVKTTAPRRYCVRPNSGIIDAGASINVSVMLQPFDYDPNEKSKHKFMVQSMFAPTDTSDMEAVWKEAKPEDLMDSKLRCVFELPAENDKPHDVEINKIISTTASKTETPIVSKSLSSSLDDTEVKKVMEECKRLQGEVQRLREENKQFKEEDGLRMRKTVQSNSPISALAPTGKEEGLSTRLLALVVLFFIVGVIIGKIAL
CADM1 序列資訊SEQ ID NO:5 CADM1-NRG1融合物5’處之CADM1外顯子7序列
AGCTTCAAACATAGTGGGGAAAGCTCACTCGGATTATATGCTGTATGTATACG
SEQ ID NO:6 CADM1-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCAT
SEQ ID NO:7 CADM1-NRG1多核苷酸序列
AGCTTCAAACATAGTGGGGAAAGCTCACTCGGATTATATGCTGTATGTATACGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCAT
SEQ ID NO:8 CADM1-NRG1多肽序列
ASNIVGKAHSDYMLYVYATSTSTTGTSH
SEQ ID NO:33 CADM1之外顯子1
GGTTGGGCTCGCGGCGCTGTGATTGGTCTGCCCGGACTCCGCCTCCAGCGCATGTCATTAGCATCTCATTAGCTGTCCGCTCGGGCTCCGGAGGCAGCCAACGCCGCCAGTCTGAGGCAGGTGCCCGACATGGCGAGTGTAGTGCTGCCGAGCGGATCCCAGTGTGCGGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGCCTCCCGGGCTCCGGCTCCGGCTTCTGCTGTTGCTCTTCTCCGCCGCGGCACTGATCCCCACAG
SEQ ID NO:34 CADM1之外顯子2
GTGATGGGCAGAATCTGTTTACGAAAGACGTGACAGTGATCGAGGGAGAGGTTGCGACCATCAGTTGCCAAGTCAATAAGAGTGACGACTCTGTGATTCAGCTACTGAATCCCAACAGGCAGACCATTTATTTCAGGGACTTCAGGC
SEQ ID NO:35 CADM1之外顯子3
CTTTGAAGGACAGCAGGTTTCAGTTGCTGAATTTTTCTAGCAGTGAACTCAAAGTATCATTGACAAACGTCTCAATTTCTGATGAAGGAAGATACTTTTGCCAGCTCTATACCGATCCCCCACAGGAAAGTTACACCACCATCACAGTCCTGG
SEQ ID NO:36 CADM1之外顯子4
TCCCACCACGTAATCTGATGATCGATATCCAGAAAGACACTGCGGTGGAAGGTGAGGAGATTGAAGTCAACTGCACTGCTATGGCCAGCAAGCCAGCCACGACTATCAGGTGGTTCAAAGGGAACACAGAGCTAAAAG
SEQ ID NO:37 CADM1之外顯子5
GCAAATCGGAGGTGGAAGAGTGGTCAGACATGTACACTGTGACCAGTCAGCTGATGCTGAAGGTGCACAAGGAGGACGATGGGGTCCCAGTGATCTGCCAGGTGGAGCACCCTGCGGTCACTGGAAACCTGCAGACCCAGCGGTATCTAGAAGTACAGT
SEQ ID NO:38 CADM1之外顯子6
ATAAGCCTCAAGTGCACATTCAGATGACTTATCCTCTACAAGGCTTAACCCGGGAAGGGGACGCGCTTGAGTTAACATGTGAAGCCATCGGGAAGCCCCA
SEQ ID NO:39 CADM1之外顯子7
GCCTGTGATGGTAACTTGGGTGAGAGTCGATGATGAAATGCCTCAACACGCCGTACTGTCTGGGCCCAACCTGTTCATCAATAACCTAAACAAAACAGATAATGGTACATACCGCTGTGAAGCTTCAAACATAGTGGGGAAAGCTCACTCGGATTATATGCTGTATGTATACG
SEQ ID NO:40 CADM1之外顯子8
ACACAACGGCGACGACAGAACCAGCAGTTCACG
SEQ ID NO:41 CADM1之外顯子9
GCCTTACTCAGTTGCCCAATTCCGCAGAAGAACTGGACAGTGAGGACCTCTCAG
SEQ ID NO:42 CADM1之外顯子10
ATTCCCGAGCAGGTGAAGAAGGCTCGATCAGGGCAGTGGATCATGCCGTGATCGGTGGCGTCGTGGCGGTGGTGGTGTTCGCCATGCTGTGCTTGCTCATCATTCTGGGGCGCTATTTTGCCAGACATAAAG
SEQ ID NO:43 CADM1之外顯子11
GTACATACTTCACTCATGAAGCCAAAGGAGCCGATGACGCAGCAGACGCAGACACAGCTATAATCAATGCAGAAGGAGGACAGAACAACTCCGAAGAAAAGAAAGAGTACTTCATCTAGATCAGCCTTTTTGTTTCAATGAGGTGTCCAACTGGCCCTATTTAGATGATAAAGAGACAGTGATATTGGAACTTGCGAGAAATTCGTGTGTTTTTTTATGAATGGGTGGAAAGGTGTGAGACTGGGAAGGCTTGGGATTTGCTGTGTAAAAAAAAAAAAAATGTTCTTTGGAAAGTACACTCTGCTGTTTGACACCTCTTTTTTCGTTTGTTTGTTTGTTTAATTTTTATTTCTTCCTACCAAGTCAAACTTGGATACTTGGATTTAGTTTCAGTAGATTGCAGAAAATTCTGTGCCTTGTTTTTTGTTTGTTTGTTGCGTTCCTTTCTTTTCCCCCTTTGTGCACATTTATTTCCTCCCTCTACCCCAATTTCGGATTTTTTCCAAAATCTCCCATTTTGGAATTTGCCTGCTGGGATTCCTTAGACTCTTTTCCTTCCCTTTTCTGTTCTAGTTTTTTACTTTTGTTTATTTTTATGGTAACTGCTTTCTGTTCCAAATTCAGTTTCATAAAAGGAGAACCAGCACAGCTTAGATTTCATAGTTCAGAATTTAGTGTATCCATAATGCATTCTTCTCTGTTGTCGTAAAGATTTGGGTGAACAAACAATGAAAACTCTTTGCTGCTGCCCATGTTTCAAATACTTAGAGCAGTGAAGACTAGAAAATTAGACTGTGATTCAGAAAATGTTCTGTTTGCTGTGGAACTACATTACTGTACAGGGTTATCTGCAAGTGAGGTGTGTCACAATGAGATTGAATTTCACTGTCTTTAATTCTGTATCTGTAGACGGCTCAGTATAGATACCCTACGCTGTCCAGAAAGGTTTGGGGCAGAAAGGACTCCTCCTTTTTCCATGCCCTAAACAGACCTGACAGGTGAGGTCTGTTCCTTTTATATAAGTGGACAAATTTTGAGTTGCCACAGGAGGGGAAGTAGGGAGGGGGGAAATACAGTTCTGCTCTGGTTGTTTCTGTTCCAAATGATTCCATCCACCTTTCCCAATCGGCCTTACTTCTCACTAATTTGTAGGAAAAAGCAAGTTCGTCTGTTGTGCGAATGACTGAATGGGACAGAGTTGATTTTTTTTTTTTTTTCCTTTGTGCTTAGTTAGGAAGGCAGTAGGATGTGGCCTGCATGTACTGTATATTACAGATATTTGTCATGCTGGGATTTCCAACTCGAATCTGTGTGAAACTTTCATTCCTTCAGATTTGGCTTGACAAAGGCAGGAGGTACAAAAGAAGGGCTGGTATTGTTCTCACACTGGTCTGCTGTCGCTCTCAGTTCTCGATAGGTCAGAGCAGAGGTGGAAAAACAGCATGTACGGATTTTCAGTTACTTAATCAAAACTCAAATGTGAGTGTTTTTATCTTTTTACCTTTCATACACTAGCCTTGGCCTCTTTCCTCAGCCTTAAGAACCATCTGCCAAAAATTACTGATCCTCGCATGATGGCAGCCATAGTGCATAGCTACTAAAATCAGTGACCTTGAACATATCTTAGATGGGGAGCCTCGGGAAAAGGTAGAGGAGTCACGTTACCATTTACATGTTTTAAAGAAAGAAGTGTGGGGATTTTCACTGAAACGTCTAGGAAATCTAGAAGTAGTCCTGAAGGACAGAAACTAAACTCTTACCATATGTTTGGTAAGACTCCAGACTCCAGCTAACAGTCCCTATGGAAAGATGGCATCAAAAAAGATAGATCTATATATATATATAAATATATATTCTATTACATTTTCAGTGAGTAATTTTGGATTTTGCAAGGTGCATTTTTACTATTGTTACATTATGTGGAAAACTTATGCTGATTTATTTAAGGGGGAAAAAGTGTCAACTCTTTGTTATTTGAAAACATGTTTATTTTTCTTGTCTTTATTTTAACCTTTGATAGAACCATTGCAATATGGGGGCCTTTTGGGAACGGACTGGTATGTAAAAGAAAATCCATTATCGAGCAGCATTTTATTTACCCCTCCCCTATCCCTAGGCACTTAACCAAGACAAAAAGCCACAATGAACATCCCTTTTTCAATGAATTTTATAATCTGCAGCTCTATTCCGAGCCCTTAGCACCCATTCCGACCATAGTATAATCATATCAAAGGGTGAGAATCATTTAGCATGTTGTTGAAAGGTTTTTTTTCAGTTGTTCTTTTTAGAAAAAAAGAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAAATCACACCATTGCTCACAGAATTGGCATCTCATTTTTGGGACCTCCCATCTTTCTGTTTTGAAAAGTGTACAGTAGTGCAGTGTTCCTGATGTAACTTTATGGCTTACAATGTTGACATGTCTCAGGTTCATGTGTTGCGATTGGTGTTTTCCGTCTCAGGTAGATTGCAAAGTGTAGGCCCCACACATTGGAAAAAATAATAATAAAACAAAGCAAAAACAGGAAATTATGGATTTTAGTTGTATATTGGTTTATGTATTTTTTCTTAAGTATACAGTGCACTGTTTGAAATGTATTGTTGAGTATTACTTTGTACAGGTTGATCACTTTTTTTAGAGTGAAGAAAGAACAAACTTGTTTTTTGTGTTTTTTAAAGGAATATAAAATAATGAAGGATGTATAATTGATGCCAAATAAGCTTGTTCTTTAGTCACACCGACGTCTTATTTTTCCCTTTAGGCCAGTTCTGTTTTTAAGGTGTACATGGACAATGTTACAGTGTAAGAAACTCCATATCCATATGTTCCCATTCGCATTTTGTATTGGTTCATGTATACCATTTTTACAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAGTACTATAAAATATCTGTCTTCTTAATAAAAAAAAATTAATGTTACAAAGTGA
SEQ ID NO:44 CADM1之全部11個外顯子1-11按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:45 CADM1之外顯子1的轉譯多肽序列
MASVVLPSGSQCAAAAAAAAPPGLRLRLLLLLFSAAALIPT
SEQ ID NO:46 CADM1之外顯子2的轉譯多肽序列
DGQNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFR
SEQ ID NO:47 CADM1之外顯子3的轉譯多肽序列
LKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVL
SEQ ID NO:48 CADM1之外顯子4的轉譯多肽序列
PPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELK
SEQ ID NO:49 CADM1之外顯子5的轉譯多肽序列
KSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVHKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQ
SEQ ID NO:50 CADM1之外顯子6的轉譯多肽序列
KPQVHIQMTYPLQGLTREGDALELTCEAIGKP
SEQ ID NO:51 CADM1之外顯子7的轉譯多肽序列
PVMVTWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGKAHSDYMLYVY
SEQ ID NO:52 CADM1之外顯子8的轉譯多肽序列
TTATTEPAVH
SEQ ID NO:53 CADM1之外顯子9的轉譯多肽序列
LTQLPNSAEELDSEDLS
SEQ ID NO:54 CADM1之外顯子10的轉譯多肽序列
SRAGEEGSIRAVDHAVIGGVVAVVVFAMLCLLIILGRYFARHK
SEQ ID NO:55 CADM1之外顯子11的轉譯多肽序列
TYFTHEAKGADDAADADTAIINAEGGQNNSEEKKEYFI
SEQ ID NO:56 CADM1多肽序列
MASVVLPSGSQCAAAAAAAAPPGLRLRLLLLLFSAAALIPTGDGQNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFRPLKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELKGKSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVHKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQYKPQVHIQMTYPLQGLTREGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGKAHSDYMLYVYDTTATTEPAVHGLTQLPNSAEELDSEDLSDSRAGEEGSIRAVDHAVIGGVVAVVVFAMLCLLIILGRYFARHKGTYFTHEAKGADDAADADTAIINAEGGQNNSEEKKEYFI
SEQ ID NO:57 CADM1之全部7個外顯子1-7按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:58 CADM1之外顯子1-7按順序排列的轉譯多肽序列
MASVVLPSGSQCAAAAAAAAPPGLRLRLLLLLFSAAALIPTGDGQNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFRPLKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELKGKSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVHKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQYKPQVHIQMTYPLQGLTREGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGKAHSDYMLYVY
CD44 序列資訊SEQ ID NO:9 來自CD44-NRG1融合物5’處之CD44外顯子5的序列
GACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTACCA
SEQ ID NO:10 CD44-NRG1融合物3’處之NRG1外顯2子序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACT
SEQ ID NO:11 CD44-NRG1多核苷酸序列
GACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTACCACCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACT
SEQ ID NO:12 CD44-NRG1多肽序列
DEDSPWITDSTDRIPATTLPPRLKEMKSQESAAGSK
SEQ ID NO:61 CD44之外顯子1
CTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCG
SEQ ID NO:62 CD44之外顯子2
ATTTGAATATAACCTGCCGCTTTGCAGGTGTATTCCACGTGGAGAAAAATGGTCGCTACAGCATCTCTCGGACGGAGGCCGCTGACCTCTGCAAGGCTTTCAATAGCACCTTGCCCACAATGGCCCAGATGGAGAAAGCTCTGAGCATCGGATTTGAGACCTGCAG
SEQ ID NO:63 CD44之外顯子3
GTATGGGTTCATAGAAGGGCACGTGGTGATTCCCCGGATCCACCCCAACTCCATCTGTGCAGCAAACAACACAGGGGTGTACATCCTCACATCCAACACCTCCCAGTATGACACATATTGCTTCAATGCTTCAG
SEQ ID NO:64 CD44之外顯子4
CTCCACCTGAAGAAGATTGTACATCAGTCACAGACCTGCCCAATGCCTTTGATGGACCAATTACCATAA
SEQ ID NO:65 CD44之外顯子5
CTATTGTTAACCGTGATGGCACCCGCTATGTCCAGAAAGGAGAATACAGAACGAATCCTGAAGACATCTACCCCAGCAACCCTACTGATGATGACGTGAGCAGCGGCTCCTCCAGTGAAAGGAGCAGCACTTCAGGAGGTTACATCTTTTACACCTTTTCTACTGTACACCCCATCCCAGACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTACCA
SEQ ID NO:66 CD44之外顯子6
CTTTGATGAGCACTAGTGCTACAGCAACTGAGACAGCAACCAAGAGGCAAGAAACCTGGGATTGGTTTTCATGGTTGTTTCTACCATCAGAGTCAAAGAATCATCTTCACACAACAACACAAATGGCTG
SEQ ID NO:67 CD44之外顯子7
GTACGTCTTCAAATACCATCTCAGCAGGCTGGGAGCCAAATGAAGAAAATGAAGATGAAAGAGACAGACACCTCAGTTTTTCTGGATCAGGCATTGATGATGATGAAGATTTTATCTCCAGCACCA
SEQ ID NO:68 CD44之外顯子8
TTTCAACCACACCACGGGCTTTTGACCACACAAAACAGAACCAGGACTGGACCCAGTGGAACCCAAGCCATTCAAATCCGGAAGTGCTACTTCAGACAACCACAAGGATGACTG
SEQ ID NO:69 CD44之外顯子9
ATGTAGACAGAAATGGCACCACTGCTTATGAAGGAAACTGGAACCCAGAAGCACACCCTCCCCTCATTCACCATGAGCATCATGAGGAAGAAGAGACCCCACATTCTACAAGCACAA
SEQ ID NO:70 CD44之外顯子10
TCCAGGCAACTCCTAGTAGTACAACGGAAGAAACAGCTACCCAGAAGGAACAGTGGTTTGGCAACAGATGGCATGAGGGATATCGCCAAACACCCAAAGAAGACTCCCATTCGACAACAGGGACAGCTG
SEQ ID NO:71 CD44之外顯子11
CAGCCTCAGCTCATACCAGCCATCCAATGCAAGGAAGGACAACACCAAGCCCAGAGGACAGTTCCTGGACTGATTTCTTCAACCCAATCTCACACCCCATGGGACGAGGTCATCAAGCAGGAAGAAGGATGG
SEQ ID NO:72 CD44之外顯子12
ATATGGACTCCAGTCATAGTATAACGCTTCAGCCTACTGCAAATCCAAACACAGGTTTGGTGGAAGATTTGGACAGGACAGGACCTCTTTCAATGACAACGC
SEQ ID NO:73 CD44之外顯子13
AGCAGAGTAATTCTCAGAGCTTCTCTACATCACATGAAGGCTTGGAAGAAGATAAAGACCATCCAACAACTTCTACTCTGACATCAAGCA
SEQ ID NO:74 CD44之外顯子14
ATAGGAATGATGTCACAGGTGGAAGAAGAGACCCAAATCATTCTGAAGGCTCAACTACTTTACTGGAAGGTTATACCTCTCATTACCCACACACGAAGGAAAGCAGGACCTTCATCCCAGTGACCTCAGCTAAGACTGGGTCCTTTGGAGTTACTGCAGTTACTGTTGGAGATTCCAACTCTAATGTCAATCGTTCCTTATCAG
SEQ ID NO:75 CD44之外顯子15
GAGACCAAGACACATTCCACCCCAGTGGGGGGTCCCATACCACTCATGGATCTGAATCAGATG
SEQ ID NO:76 CD44之外顯子16
GACACTCACATGGGAGTCAAGAAGGTGGAGCAAACACAACCTCTGGTCCTATAAGGACACCCCAAATTCCAG
SEQ ID NO:77 CD44之外顯子17
AATGGCTGATCATCTTGGCATCCCTCTTGGCCTTGGCTTTGATTCTTGCAGTTTGCATTGCAGTCAACAGTCGAAGAAG
SEQ ID NO:78 CD44之外顯子18
GTGTGGGCAGAAGAAAAAGCTAGTGATCAACAGTGGCAATGGAGCTGTGGAGGACAGAAAGCCAAGTGGACTCAACGGAGAGGCCAGCAAGTCTCAGGAAATGGTGCATTTGGTGAACAAGGAGTCGTCAGAAACTCCAGACCAGTTTATGACAGCTGATGAGACAAGGAACCTGCAGAATGTGGACATGAAGATTGGGGTGTAACACCTACACCATTATCTTGGAAAGAAACAACCGTTGGAAACATAACCATTACAGGGAGCTGGGACACTTAACAGATGCAATGTGCTACTGATTGTTTCATTGCGAATCTTTTTTAGCATAAAATTTTCTACTCTTTTTGTTTTTTGTGTTTTGTTCTTTAAAGTCAGGTCCAATTTGTAAAAACAGCATTGCTTTCTGAAATTAGGGCCCAATTAATAATCAGCAAGAATTTGATCGTTCCAGTTCCCACTTGGAGGCCTTTCATCCCTCGGGTGTGCTATGGATGGCTTCTAACAAAAACTACACATATGTATTCCTGATCGCCAACCTTTCCCCCACCAGCTAAGGACATTTCCCAGGGTTAATAGGGCCTGGTCCCTGGGAGGAAATTTGAATGGGTCCATTTTGCCCTTCCATAGCCTAATCCCTGGGCATTGCTTTCCACTGAGGTTGGGGGTTGGGGTGTACTAGTTACACATCTTCAACAGACCCCCTCTAGAAATTTTTCAGATGCTTCTGGGAGACACCCAAAGGGTGAAGCTATTTATCTGTAGTAAACTATTTATCTGTGTTTTTGAAATATTAAACCCTGGATCAGTCCTTTGATCAGTATAATTTTTTAAAGTTACTTTGTCAGAGGCACAAAAGGGTTTAAACTGATTCATAATAAATATCTGTACTTCTTCGATCTTCACCTTTTGTGCTGTGATTCTTCAGTTTCTAAACCAGCACTGTCTGGGTCCCTACAATGTATCAGGAAGAGCTGAGAATGGTAAGGAGACTCTTCTAAGTCTTCATCTCAGAGACCCTGAGTTCCCACTCAGACCCACTCAGCCAAATCTCATGGAAGACCAAGGAGGGCAGCACTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTGACACTGTCCAAAGGTTTTCCATCCTGTCCTGGAATCAGAGTTGGAAGCTGAGGAGCTTCAGCCTCTTTTATGGTTTAATGGCCACCTGTTCTCTCCTGTGAAAGGCTTTGCAAAGTCACATTAAGTTTGCATGACCTGTTATCCCTGGGGCCCTATTTCATAGAGGCTGGCCCTATTAGTGATTTCCAAAAACAATATGGAAGTGCCTTTTGATGTCTTACAATAAGAGAAGAAGCCAATGGAAATGAAAGAGATTGGCAAAGGGGAAGGATGATGCCATGTAGATCCTGTTTGACATTTTTATGGCTGTATTTGTAAACTTAAACACACCAGTGTCTGTTCTTGATGCAGTTGCTATTTAGGATGAGTTAAGTGCCTGGGGAGTCCCTCAAAAGGTTAAAGGGATTCCCATCATTGGAATCTTATCACCAGATAGGCAAGTTTATGACCAAACAAGAGAGTACTGGCTTTATCCTCTAACCTCATATTTTCTCCCACTTGGCAAGTCCTTTGTGGCATTTATTCATCAGTCAGGGTGTCCGATTGGTCCTAGAACTTCCAAAGGCTGCTTGTCATAGAAGCCATTGCATCTATAAAGCAACGGCTCCTGTTAAATGGTATCTCCTTTCTGAGGCTCCTACTAAAAGTCATTTGTTACCTAAACTTATGTGCTTAACAGGCAATGCTTCTCAGACCACAAAGCAGAAAGAAGAAGAAAAGCTCCTGACTAAATCAGGGCTGGGCTTAGACAGAGTTGATCTGTAGAATATCTTTAAAGGAGAGATGTCAACTTTCTGCACTATTCCCAGCCTCTGCTCCTCCCTGTCTACCCTCTCCCCTCCCTCTCTCCCTCCACTTCACCCCACAATCTTGAAAAACTTCCTTTCTCTTCTGTGAACATCATTGGCCAGATCCATTTTCAGTGGTCTGGATTTCTTTTTATTTTCTTTTCAACTTGAAAGAAACTGGACATTAGGCCACTATGTGTTGTTACTGCCACTAGTGTTCAAGTGCCTCTTGTTTTCCCAGAGATTTCCTGGGTCTGCCAGAGGCCCAGACAGGCTCACTCAAGCTCTTTAACTGAAAAGCAACAAGCCACTCCAGGACAAGGTTCAAAATGGTTACAACAGCCTCTACCTGTCGCCCCAGGGAGAAAGGGGTAGTGATACAAGTCTCATAGCCAGAGATGGTTTTCCACTCCTTCTAGATATTCCCAAAAAGAGGCTGAGACAGGAGGTTATTTTCAATTTTATTTTGGAATTAAATACTTTTTTCCCTTTATTACTGTTGTAGTCCCTCACTTGGATATACCTCTGTTTTCACGATAGAAATAAGGGAGGTCTAGAGCTTCTATTCCTTGGCCATTGTCAACGGAGAGCTGGCCAAGTCTTCACAAACCCTTGCAACATTGCCTGAAGTTTATGGAATAAGATGTATTCTCACTCCCTTGATCTCAAGGGCGTAACTCTGGAAGCACAGCTTGACTACACGTCATTTTTACCAATGATTTTCAGGTGACCTGGGCTAAGTCATTTAAACTGGGTCTTTATAAAAGTAAAAGGCCAACATTTAATTATTTTGCAAAGCAACCTAAGAGCTAAAGATGTAATTTTTCTTGCAATTGTAAATCTTTTGTGTCTCCTGAAGACTTCCCTTAAAATTAGCTCTGAGTGAAAAATCAAAAGAGACAAAAGACATCTTCGAATCCATATTTCAAGCCTGGTAGAATTGGCTTTTCTAGCAGAACCTTTCCAAAAGTTTTATATTGAGATTCATAACAACACCAAGAATTGATTTTGTAGCCAACATTCATTCAATACTGTTATATCAGAGGAGTAGGAGAGAGGAAACATTTGACTTATCTGGAAAAGCAAAATGTACTTAAGAATAAGAATAACATGGTCCATTCACCTTTATGTTATAGATATGTCTTTGTGTAAATCATTTGTTTTGAGTTTTCAAAGAATAGCCCATTGTTCATTCTTGTGCTGTACAATGACCACTGTTATTGTTACTTTGACTTTTCAGAGCACACCCTTCCTCTGGTTTTTGTATATTTATTGATGGATCAATAATAATGAGGAAAGCATGATATGTATATTGCTGAGTTGAAAGCACTTATTGGAAAATATTAAAAGGCTAACATTAAAAGACTAAAGGAAACAGA
SEQ ID NO:79 CD44之全部18個外顯子1-18按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:80 CD44之外顯子1的轉譯多肽序列
MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQI
SEQ ID NO:81 CD44之外顯子2的轉譯多肽序列
LNITCRFAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTMAQMEKALSIGFETC
SEQ ID NO:82 CD44之外顯子3的轉譯多肽序列
YGFIEGHVVIPRIHPNSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNAS
SEQ ID NO:83 CD44之外顯子4的轉譯多肽序列
PPEEDCTSVTDLPNAFDGPITI
SEQ ID NO:84 CD44之外顯子5的轉譯多肽序列
IVNRDGTRYVQKGEYRTNPEDIYPSNPTDDDVSSGSSSERSSTSGGYIFYTFSTVHPIPDEDSPWITDSTDRIPAT
SEQ ID NO:85 CD44之外顯子6的轉譯多肽序列
LMSTSATATETATKRQETWDWFSWLFLPSESKNHLHTTTQMA
SEQ ID NO:86 CD44之外顯子7的轉譯多肽序列
TSSNTISAGWEPNEENEDERDRHLSFSGSGIDDDEDFISST
SEQ ID NO:87 CD44之外顯子8的轉譯多肽序列
STTPRAFDHTKQNQDWTQWNPSHSNPEVLLQTTTRMT
SEQ ID NO:88 CD44之外顯子9的轉譯多肽序列
VDRNGTTAYEGNWNPEAHPPLIHHEHHEEEETPHSTST
SEQ ID NO:89 CD44之外顯子10的轉譯多肽序列
QATPSSTTEETATQKEQWFGNRWHEGYRQTPKEDSHSTTGTA
SEQ ID NO:90 CD44之外顯子11的轉譯多肽序列
ASAHTSHPMQGRTTPSPEDSSWTDFFNPISHPMGRGHQAGRRM
SEQ ID NO:91 CD44之外顯子12的轉譯多肽序列
MDSSHSITLQPTANPNTGLVEDLDRTGPLSMTT
SEQ ID NO:92 CD44之外顯子13的轉譯多肽序列
QSNSQSFSTSHEGLEEDKDHPTTSTLTSS
SEQ ID NO:93 CD44之外顯子14的轉譯多肽序列
RNDVTGGRRDPNHSEGSTTLLEGYTSHYPHTKESRTFIPVTSAKTGSFGVTAVTVGDSNSNVNRSLS
SEQ ID NO:94 CD44之外顯子15的轉譯多肽序列
DQDTFHPSGGSHTTHGSESD
SEQ ID NO:95 CD44之外顯子16的轉譯多肽序列
HSHGSQEGGANTTSGPIRTPQIP
SEQ ID NO:96 CD44之外顯子17的轉譯多肽序列
WLIILASLLALALILAVCIAVNSRR
SEQ ID NO:97 CD44之外顯子18的轉譯多肽序列
CGQKKKLVINSGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKESSETPDQFMTADETRNLQNVDMKIGV
SEQ ID NO:98 CD44多肽序列
MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIDLNITCRFAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTMAQMEKALSIGFETCRYGFIEGHVVIPRIHPNSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPPEEDCTSVTDLPNAFDGPITITIVNRDGTRYVQKGEYRTNPEDIYPSNPTDDDVSSGSSSERSSTSGGYIFYTFSTVHPIPDEDSPWITDSTDRIPATTLMSTSATATETATKRQETWDWFSWLFLPSESKNHLHTTTQMAGTSSNTISAGWEPNEENEDERDRHLSFSGSGIDDDEDFISSTISTTPRAFDHTKQNQDWTQWNPSHSNPEVLLQTTTRMTDVDRNGTTAYEGNWNPEAHPPLIHHEHHEEEETPHSTSTIQATPSSTTEETATQKEQWFGNRWHEGYRQTPKEDSHSTTGTAAASAHTSHPMQGRTTPSPEDSSWTDFFNPISHPMGRGHQAGRRMDMDSSHSITLQPTANPNTGLVEDLDRTGPLSMTTQQSNSQSFSTSHEGLEEDKDHPTTSTLTSSNRNDVTGGRRDPNHSEGSTTLLEGYTSHYPHTKESRTFIPVTSAKTGSFGVTAVTVGDSNSNVNRSLSGDQDTFHPSGGSHTTHGSESDGHSHGSQEGGANTTSGPIRTPQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINSGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKESSETPDQFMTADETRNLQNVDMKIGV
SEQ ID NO:99 CD44之全部5個外顯子1-5按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:100 CD44之外顯子1-5的轉譯多肽序列
MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIDLNITCRFAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTMAQMEKALSIGFETCRYGFIEGHVVIPRIHPNSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPPEEDCTSVTDLPNAFDGPITITIVNRDGTRYVQKGEYRTNPEDIYPSNPTDDDVSSGSSSERSSTSGGYIFYTFSTVHPIPDEDSPWITDSTDRIPAT
SLC3A2 轉錄本 6 序列資訊SEQ ID NO:13 SLC3A2-NRG1融合物5’處之SLC3A2外顯子1序列
CCGCATCGGCGACCTTCAGGCCTTCCAGGGCCACGGCGCGGGCAACCTGGCGG
SEQ ID NO:14 SLC3A2-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子5序列
CATCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCAT
SEQ ID NO:15 SLC3A2-NRG1多核苷酸序列
CCGCATCGGCGACCTTCAGGCCTTCCAGGGCCACGGCGCGGGCAACCTGGCGGCATCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCAT
SEQ ID NO:16 SLC3A2-NRG1多肽序列
RIGDLQAFQGHGAGNLAASTSTSTTGTSH
SEQ ID NO:103 SLC3A2之外顯子1
AGATGCAGTAGCCGAAACTGCGCGGAGGCACAGAGGCCGGGGAGAGCGTTCTGGGTCCGAGGGTCCAGGTAGGGGTTGAGCCACCATCTGACCGCAAGCTGCGTCGTGTCGCCGGTTCTGCAGGCACCATGAGCCAGGACACCGAGGTGGATATGAAGGAGGTGGAGCTGAATGAGTTAGAGCCCGAGAAGCAGCCGATGAACGCGGCGTCTGGGGCGGCCATGTCCCTGGCGGGAGCCGAGAAGAATGGTCTGGTGAAGATCAAGGTGGCGGAAGACGAGGCGGAGGCGGCAGCCGCGGCTAAGTTCACGGGCCTGTCCAAGGAGGAGCTGCTGAAGGTGGCAGGCAGCCCCGGCTGGGTACGCACCCGCTGGGCACTGCTGCTGCTCTTCTGGCTCGGCTGGCTCGGCATGCTTGCTGGTGCCGTGGTCATAATCGTGCGAGCGCCGCGTTGTCGCGAGCTACCGGCGCAGAAGTGGTGGCACACGGGCGCCCTCTACCGCATCGGCGACCTTCAGGCCTTCCAGGGCCACGGCGCGGGCAACCTGGCGG
SEQ ID NO:104 SLC3A2之外顯子2
GTCTGAAGGGGCGTCTCGATTACCTGAGCTCTCTGAAGGTGAAGGGCCTTGTGCTGGGTCCAATTCACAAGAACCAGAAGGATGATGTCGCTCAGACTGACTTGCTGCAGATCGACCCCAATTTTGGCTCCAAGGAAGATTTTGACAGTCTCTTGCAATCGGCTAAAAAAAAGA
SEQ ID NO:105 SLC3A2之外顯子3
GCATCCGTGTCATTCTGGACCTTACTCCCAACTACCGGGGTGAGAACTCGTGGTTCTCCACTCAGGTTGACACTGTGGCCACCAAGGTGAA
SEQ ID NO:106 SLC3A2之外顯子4
GATGCTCTGGAGTTTTGGCTGCAAGCTGGCGTGGATGGGTTCCAGGTTCGGGACATAGAGAATCTGAAG
SEQ ID NO:107 SLC3A2之外顯子5
GATGCATCCTCATTCTTGGCTGAGTGGCAAAATATCACCAAGGGCTTCAGTGAAGACAG
SEQ ID NO:108 SLC3A2之外顯子6
GCTCTTGATTGCGGGGACTAACTCCTCCGACCTTCAGCAGATCCTGAGCCTACTCGAATCCAACAAAGACTTGCTGTTGACTAGCTCATACCTGTCTGATTCTGGTTCTACTGGGGAGCATACAAAATCCCTAGTCACACAGTATTTGAATGCCACTGGCAATCGCTGGTGCAGCTGGAGT
SEQ ID NO:109 SLC3A2之外顯子7
TTGTCTCAGGCAAGGCTCCTGACTTCCTTCTTGCCGGCTCAACTTCTCCGACTCTACCAGCTGATGCTCTTCACCCTGCCAGGGACCCCTGTTTTCAGCTACGGGGATGAGATTGGCCTGGATGCAGCTGCCCTTCCTGGACAG
SEQ ID NO:110 SLC3A2之外顯子8
CCTATGGAGGCTCCAGTCATGCTGTGGGATGAGTCCAGCTTCCCTGACATCCCAGGGGCTGTAAGTGCCAACATGACTGTGAAG
SEQ ID NO:111 SLC3A2之外顯子9
GGCCAGAGTGAAGACCCTGGCTCCCTCCTTTCCTTGTTCCGGCGGCTGAGTGACCAGCGGAGTAAGGAGCGCTCCCTACTGCATGGGGACTTCCACGCGTTCTCCGCTGGGCCTGGACTCTTCTCCTATATCCGCCACTGGGACCAGAATGAGCGTTTTCTGGTAGTGCTTAACTTTGGGGATGTGGGCCTCTCGGCTGGACTGCAGGCCTCCGACCTGCCTGCCAGCGCCAGCCTGCCAGCCAAGGCTGACCTCCTGCTCAGCACCCAGCCAGGCCGTGAGGAGGGCTCCCCTCTTGAGCTGGAACGCCTGAAACTGGAGCCTCACGAAGGGCTGCTGCTCCGCTTCCCCTACGCGGCCTGACTTCAGCCTGACATGGACCCACTACCCTTCTCCTTTCCTTCCCAGGCCCTTTGGCTTCTGATTTTTCTCTTTTTTAAAAACAAACAAACAAACTGTTGCAGATTATGAGTGAACCCCCAAATAGGGTGTTTTCTGCCTTCAAATAAAAGTCACCCCTGCATGGTGAA
SEQ ID NO:112 SLC3A2之全部9個外顯子1-9按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:113 SLC3A2之外顯子1的轉譯多肽序列
MSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGAAMSLAGAEKNGLVKIKVAEDEAEAAAAAKFTGLSKEELLKVAGSPGWVRTRWALLLLFWLGWLGMLAGAVVIIVRAPRCRELPAQKWWHTGALYRIGDLQAFQGHGAGNLA
SEQ ID NO:114 SLC3A2之外顯子2的轉譯多肽序列
LKGRLDYLSSLKVKGLVLGPIHKNQKDDVAQTDLLQIDPNFGSKEDFDSLLQSAKKK
SEQ ID NO:115 SLC3A2之外顯子3的轉譯多肽序列
IRVILDLTPNYRGENSWFSTQVDTVATKV
SEQ ID NO:116 SLC3A2之外顯子4的轉譯多肽序列
DALEFWLQAGVDGFQVRDIENLK
SEQ ID NO:117 SLC3A2之外顯子5的轉譯多肽序列
DASSFLAEWQNITKGFSED
SEQ ID NO:118 SLC3A2之外顯子6的轉譯多肽序列
LLIAGTNSSDLQQILSLLESNKDLLLTSSYLSDSGSTGEHTKSLVTQYLNATGNRWCSWS
SEQ ID NO:119 SLC3A2之外顯子7的轉譯多肽序列
LSQARLLTSFLPAQLLRLYQLMLFTLPGTPVFSYGDEIGLDAAALPGQ
SEQ ID NO:120 SLC3A2之外顯子8的轉譯多肽序列
PMEAPVMLWDESSFPDIPGAVSANMTVK
SEQ ID NO:121 SLC3A2之外顯子9的轉譯多肽序列
GQSEDPGSLLSLFRRLSDQRSKERSLLHGDFHAFSAGPGLFSYIRHWDQNERFLVVLNFGDVGLSAGLQASDLPASASLPAKADLLLSTQPGREEGSPLELERLKLEPHEGLLLRFPYAA
SEQ ID NO:122 SLC3A2多肽序列
MSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGAAMSLAGAEKNGLVKIKVAEDEAEAAAAAKFTGLSKEELLKVAGSPGWVRTRWALLLLFWLGWLGMLAGAVVIIVRAPRCRELPAQKWWHTGALYRIGDLQAFQGHGAGNLAGLKGRLDYLSSLKVKGLVLGPIHKNQKDDVAQTDLLQIDPNFGSKEDFDSLLQSAKKKSIRVILDLTPNYRGENSWFSTQVDTVATKVKDALEFWLQAGVDGFQVRDIENLKDASSFLAEWQNITKGFSEDRLLIAGTNSSDLQQILSLLESNKDLLLTSSYLSDSGSTGEHTKSLVTQYLNATGNRWCSWSLSQARLLTSFLPAQLLRLYQLMLFTLPGTPVFSYGDEIGLDAAALPGQPMEAPVMLWDESSFPDIPGAVSANMTVKGQSEDPGSLLSLFRRLSDQRSKERSLLHGDFHAFSAGPGLFSYIRHWDQNERFLVVLNFGDVGLSAGLQASDLPASASLPAKADLLLSTQPGREEGSPLELERLKLEPHEGLLLRFPYAA
NRG1 序列資訊SEQ ID NO:125 NRG1之外顯子1
AGTAAGCCTCCGCAGCCCACTCGGACTGCAGCCTGTTTGCCGCCCGTCCTCCCATTGCAGCACTCGGGGCGACAGAGAGGGAGGAGGCGCGCGGGGACGGGGACGCCCAGGAGGACCCACTCGCGGGTCCCGCTCCGCTCCGGCAGCAGCATGGGGAAAGGACGCGCGGGCCGAGTTGGCACCACAG
SEQ ID NO:126 NRG1之外顯子2
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAACCAGTTCTGAATACTCCTCTCTCAGATTCAAGTGGTTCAAGAATGGGAATGAATTGAATCGAAAAAACAAACCACAAAATATCAAGATACAAAAAAAGCCAGG
SEQ ID NO:127 NRG1之外顯子3
GAAGTCAGAACTTCGCATTAACAAAGCATCACTGGCTGATTCTGGAGAGTATATGTGCAAAGTGATCAGCAAATTAGGAAATGACAGTGCCTCTGCCAATATCACCATCGTGGAATCAAACG
SEQ ID NO:128 NRG1之外顯子4
AGATCATCACTGGTATGCCAGCCTCAACTGAAGGAGCATATGTGTCTTCAG
SEQ ID NO:129 NRG1之外顯子5
AGTCTCCCATTAGAATATCAGTATCCACAGAAGGAGCAAATACTTCTTCAT
SEQ ID NO:130 NRG1之外顯子6
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCTTCATGGTGAAAGACCTTTCAAACCCCTCGAGATACTTGTGCAA
SEQ ID NO:131 NRG1之外顯子7
GTGCCCAAATGAGTTTACTGGTGATCGCTGCCAAAACTACGTAATGGCCAGCTTCTACA
SEQ ID NO:132 NRG1之外顯子8
AGCATCTTGGGATTGAATTTATGG
SEQ ID NO:133 NRG1之外顯子9
AGGCGGAGGAGCTGTACCAGAAGAGAGTGCTGACCATAACCGGCATCTGCATCGCCCTCCTTGTGGTCGGCATCATGTGTGTGGTGGCCTACTGCAAAACCAA
SEQ ID NO:134 NRG1之外顯子10
GAAACAGCGGAAAAAGCTGCATGACCGTCTTCGGCAGAGCCTTCGGTCTGAACGAAACAATATGATGAACATTGCCAATGGGCCTCACCATCCTAACCCACCCCCCGAGAATGTCCAGCTGGTGAAT
SEQ ID NO:135 NRG1之外顯子11
CAATACGTATCTAAAAACGTCATCTCCAGTGAGCATATTGTTGAGAGAGAAGCAGAGACATCCTTTTCCACCAGTCACTATACTTCCACAGCCCATCACTCCACTACTGTCACCCAGACTCCTAGCCACAG
SEQ ID NO:136 NRG1之外顯子12
CTGGAGCAACGGACACACTGAAAGCATCCTTTCCGAAAGCCACTCTGTAATCGTGATGTCATCCGTAGAAAACAGTAGGCACAGCAGCCCAACTGGGGGCCCAAGAGGACGTCTTAATGGCACAGGAGGCCCTCGTGAATGTAACAGCTTCCTCAGGCATGCCAGAGAAACCCCTGATTCCTACCGAGACTCTCCTCATAGTGAAAG
SEQ ID NO:137 NRG1之外顯子13
GTATGTGTCAGCCATGACCACCCCGGCTCGTATGTCACCTGTAGATTTCCACACGCCAAGCTCCCCCAAATCGCCCCCTTCGGAAATGTCTCCACCCGTGTCCAGCATGACGGTGTCCATGCCTTCCATGGCGGTCAGCCCCTTCATGGAAGAAGAGAGACCTCTACTTCTCGTGACACCACCAAGGCTGCGGGAGAAGAAGTTTGACCATCACCCTCAGCAGTTCAGCTCCTTCCACCACAACCCCGCGCATGACAGTAACAGCCTCCCTGCTAGCCCCTTGAGGATAGTGGAGGATGAGGAGTATGAAACGACCCAAGAGTACGAGCCAGCCCAAGAGCCTGTTAAGAAACTCGCCAATAGCCGGCGGGCCAAAAGAACCAAGCCCAATGGCCACATTGCTAACAGATTGGAAGTGGACAGCAACACAAGCTCCCAGAGCAGTAACTCAGAGAGTGAAACAGAAGATGAAAGAGTAGGTGAAGATACGCCTTTCCTGGGCATACAGAACCCCCTGGCAGCCAGTCTTGAGGCAACACCTGCCTTCCGCCTGGCTGACAGCAGGACTAACCCAGCAGGCCGCTTCTCGACACAGGAAGAAATCCAGGCCAGGCTGTCTAGTGTAATTGCTAACCAAGACCCTATTGCTGTATAAAACCTAAATAAACACATAGATTCACCTGTAAAACTTTATTTTATATAATAAAGTATTCCACCTTAAATTAAACAATTTATTTTATTTTAGCAGTTCTGCAAATAGAAAACAGGAAAAAAACTTTTATAAATTAAATATATGTATGTAAAAATGTGTTATGTGCCATATGTAGCAATTTTTTACAGTATTTCAAAACGAGAAAGATATCAATGGTGCCTTTATGTTATGTTATGTCGAGAGCAAGTTTTGTACAGTTACAGTGATTGCTTTTCCACAGTATTTCTGCAAAACCTCTCATAGATTCAGTTTTTGCTGGCTTCTTGTGCATTGCATTATGATGTTGACTGGATGTATGATTTGCAAGACTTGCAACTGTCCCTCTGTTTGCTTGTAGTAGCACCCGATCAGTATGTCTTGTAATGGCACATCCATCCAGATATGCCTCTCTTGTGTATGAAGTTTTCTTTGCTTTCAGAATATGAAATGAGTTGTGTCTACTCTGCCAGCCAAAGGTTTGCCTCATTGGGCTCTGAGATAATAGTAGATCCAACAGCATGCTACTATTAAATACAGCAAGAAACTGCATTAAGTAATGTTAAATATTAGGAAGAAAGTAATACTGTGATTTAAAAAAAACTATATTATTAATCAGAAGACAGCTTGCTCTTACTAAAAGGAGCTCTCATTTACTTTATTTGATTTTATTTTTCTTGACAAAAAGCAACAGTTTTAGGGATAGCTTAGAAAATGGGTTCTGGCTTGCTATCAGGGTAAATCTAACACCTTACAAGAGGACTGAGTGTCACTTTCTCTCTGGGGGAATGATCCAGCAGCTTATCTAGTTGACAATCAAAACACGGCTGATAAAGGTGCAATCATTTCTGACATGTATTTTTCACTGATTTTGAAGCTAGTGATTGGTTGTGTCTTCTTGGCTCAAAAAGAAGCATATTACGGCACAAAAAGCCCAGCCCAGACAGCACATGCAGCATTTTGTCTGAAATACTTCTAGAGTCAAACGTGCCTGCTGTACATAGCGATGACTTGTCATCATAGGGAAGTATTTCCATCGTAGAGTGTTCAGAAGGAGTGACTGTATAGGTGGAGAGAAGCTTAGTGACTCCGTTGAAATTTTAAAATGTGGATGACCACCCCTTTCTCCCCCTTATTTTTCTTTTATCTTTCCATGTTGCCTTGATCAGGTCATAACTATGCATGAACATTTTTTATCAGGAATGGCCGATGTGTATGTGATTTGTAATCACAAGTAATGATTCATCAGGAAATGTCAATCCTGTTGGAAAGATTGCACCTTTACTTGCAGAAGTGACCCCCACCTGTGTCCTGACCTCTCCATTTACAGGCTCTCTCACCCATTTCCCCCACCTCCTTTAATTTTTGCTTTACTGTCATAAAGTAGGACTAAGATTGGTCTAAGCATTGCATGTTCTTTTGTGATGGTAAATCCAAAGGAAGGCCTATAAGTATTAACATTTGAAATAACTGCTAATTCAGGAAAATGGAAGAAAAAAAATTATTTGAAACACAGAACCCATTTCATGGCCTGCCTGATATCTGTGAAATCAGGGCTGGAGCTTTACTTAGGATTCACATGGCCTCCTAGGAACCATGGGACAAATGGGAAACAGGTTATCGGGGGATTCATGAAGTCAGTGAGAGTAATTGCTTCTTTTTTGCGGGTGAACTGAATGTATTTCTTCACCAAATCTTGATGTTAACAATTAAAAAGAAGAAATGACATGCAAGTAGGTCTTAGCAGAAAAATGCAGGCTGGGCATGAGTCATGTTGTTACCCTCCCACATGCTCCTACAATCCACAGAGATGCCTGTCTGCAGGTTCTTGAAGTTATTGTTAGTATTTGGTATCTCAAATTTTTCGTCACTGTTCACATGCCACTTTCTCTGTGCACAGTGGTATCCTCATTTGCTTTTTAACCTACACTGAGGAGTCTTTGTCAGGTTGCACTGATTTTCCAATTCTGCAGTAATGAGTAAGCTCACGGCATGGGGAAGAAGACAGTCAGTCCAATGAAGTTCTCTAAATTATTTTAACATTGCCTTTGAAGGCCTTGACTCATCCTTAGCTATTTCAATGAAGAAATTCCTACCATGAATTTAAAACCCTAAAAATTCTGTTTCAAATTCTTTGGGCATTGGGGTACTCAGATATCCCATTGTGGAAGAATTTTAAGAATAAATAGAAGTTTCTGTTGAGAACCATGAGCAACATGTTTCTTACAATGAGAATTGCTATGCATTTTAAAATTGCAAATATATATGAAAATTGAAGACAAGAGGAAATTGTATTTCTAACTTGATTCTGATCACTCACAGAGGTGGCATATTATTATAGTTGGGACATCCTTTGCACCCTTCATAAAAAAGGCCAGCTGACTGCTCAGCATCACCTGCCAAGGCCACTAGATTTGTGTTTACAGGGGTATCTCTGTGATGCTTGTCACATCACTCTTGACCACCTCTGTTAATAAATTCCGACAGTGCAGTGGCGATCGGAGTGTGAACTTATGTTCCCAGCATATGGAAAGCTATCTTAGGTTTTAAGGTAGTAGAAATTGCCCAGGAGTTTGACAGCAACTTTGTTTCCCGGGTCTAAAATCGTATCCCACTGAGGTGTATGCAGTGGAGCATAATACATGCAAATACATGCAAAACTCCTTTTGTTTCACCTAAGATTCACTTTCTATCTTACTTTCCCTTCCTGCCTAGTGTGACTTTTGCCCCCAAGAGTGCCTGGACAGCATTCTAGTTTCTACAAAATGGTCCTCTGTGTAGGTGAATGTGTCCCAAACCTGCTATCACTTTCTTGTTTCAGTGTGACTGTCTTGTTAGAGGTGAAGTTTATCCAGGGTAACTTGCTCACTAACTATTCCTTTTTATGGCCTGGGGTTAAAGGGCGCATGGCTCACACTGGTGAAAATAAGGAAGGCCTGGTCTTATCTTGTATTAATAATACTGGCTGCATTCCACCAGCCAGAGATTTCTATCTGCGAAGACCTATGAAACACTGAAGAGAAATGTAGGCAGAAGGAAATGGCCACATATCACAAGTTCTATTATATATTCTTTTGTAAATACATATTGTATATTACTTGGATGTTTTCTTATATCATTTACTGTCTTTTTGAGTTAATGTCAGTTTTTACTCTCTCAACTTACTATGTAACATTGTAAATAACATAATGTCCTTTATTATTTATATTTAAGCATCTAACATATAGAGTTGTTTTCATATAAGTTTAAGATAAATGTCAAAAATATATGTTCTTTTGTTTTTCTTTGCTTTAAAATTATGTATCTTTTCCTTTTCTTTTTTTTAAGAATAATTTATTGTTCAGGAGAAAGAATGTATATGTAACTGAAACTATCTGAAGAATGCACATTGAAGGCCGTGAGGTACTGATAAACTAAAGAATTTATTATTCAAAATACTAAGCAATAAGTAATTGTGATTTATTTAAAGTTTTGTCCATTTTCCATGAAAGACATACTGCAATAAAAATGCTACTCTGTGGAGACCTGGGAGTGTTGCTCAGCAGACTACAGCTTCAGTCTGTTAGACCAGCACCTTTCATCTCATTCCCATAGTTATGCTAATTTAGGATTGTGTTCCATGGACCCCATGATCACCTTGTCTATACGTTGCTTCTTGTCTGTCCATTGCTTTTGCCACACCACCTGTTCTCAAATCATCTCCTCCCTACCAATGCTGTTTATCACTTTCTTCCTTGTTGAAGAGGCCACACAACCAGACAGTACTATGCTTCCTTTTTCCTCCATACACAATAACAGAGAGAGAATATTCTAGGGCATGACTGCCTGGATCCTGGCTGTTGCTATCTTTTGTAGTGGCAGTAAGAAACTCCTTCAGACTAATGAAAATGTCAACGTGCCATTCAATCACGAAAGGTAACGAAAAATGCTCTCATGGTTCAAATAGTCCAATGGCCCATAGTGGCCTAAAAGGCAGCCAGTTGACACCTGGCCATGCTAAGCTTCCTTATACCATCCGCTAATGACTTTCCATTGGGCCCACAATTTACGGATTCATAATTTTAAAAGAGGAGAAGGCCAAGTTAGGTTCATTCCCCTTATTCTGTCAATAAAACAAATCAAACTCATGTCTATCTAACTGCTCAGGGAGGAGCCTTTGCATGAGAAAATTCTCATATTCTAAGACTGAGTCATAGAAATGAGGGTATTACTTTTCTTACTGCAATTAACCTAAACAAAAGCCATATTTTAACAAATAGATATTTGCATGGTACCCTTCATATATTCCAAGCATTTCACTCATTATTCCAGGTAGGTTAAGAGCTTCTGAAGTGTATGAAGTAAAGGTCAGCAATCCTTTGGGGTGAACAGTGGCCTCCTTTGGAGTTTGGGGGTAACCTGAGACTTCCCACCAATGTCCACCTCCATCTGTGTACCTAATTCCTATTACCTAGTTATGGCTCCTCTAGGATCATTTCCAAACACTCTGGATGTCCAGGAAATTTAAATTGTAGCTTTTGACTGAGCTAGTTTTTCCTATTTATATTAATAAATTTTCAAAAATGCTTGAAATCTTCACATTTGCAACAACTTTAGTTTTCATGCACATACAAACACAGAGAGACAAAAATTCCAAACAGACACTCTCCAAAAGCCACCACACTCTTTCACTTGCTCTATAGTCATTTAGCCAACCAGCCATGCAGAGAATATTTAAAACTTAAAGATTGAGACATTATTCTCAGTTTTTGCTGAGGCTTTGTAACGAAATTGAACACTATAAGCAGCTATTGTAGTAATTTTGGTTAAAATTGTTTGCCTGGGATATAGTATTTGAGGCAGAAGCACGTGTGTGAAGGAGGTGAGGTGGTTTGGAAAGAGTGAAGACTCGCAGCCAGATTGAATGTCTGGATAATTACTATAATTCTCCCTTCTTGGTTGAAACCATGTTCTCTCTTGATTTTTAAACCCAGGCTGCCTCTGGAAACAAGCAAACCTGAGTCTTTCTAACCTGAGTCTTCCCAATCATTAGATTTCTTTTCTGTCCTAACGATGAATGATAAAAGGACTTGATGTTCACAATTTGGGGTTATAAGGCAGGTCTGAAATCTGGAGACTCAAGATGCTGGAAGGAGTGGAAAGTTTCGATGACTTTATATGAATCACTTTGCACTCTATGTTTGGCTTGTCCTCTTTGAAACTGATTTACTAAAATAAATGTAAGGGAACTATTACTCCAAAAGATTAACTTGGCAGGAAATACCAATACTTTCAGTTTATGAAAGACAAAACTGTCTTGTTGCTACAGGAAGCTGCAATGTTCCTAACCTTTAAGGTTGGTGTTGAATAGGGTGGTCATGCCCTCCCCTGCAGGTATCTTTAGGCTCCTGTTGACCTCCTGGTACTATAACTGTTCGTCTTCTCTGGGTAGCTATTGATTTTGAACTTTAACATGCTTCAAAACTTTATTCATCAGGGAAATAGGAAAAGAGTTTTGTTACCTGGAGGAAATCTATTGTGATCTACCTGAGCTTTTTAAAAACAGACCAGGAGAAGGAAACCAGTAATTTTTAAAGAAGAGACAGAGAATGGGATAATAGTTTCACCCAGGATCTCTTTCTAACCCTTTCCCTTCAAATGAACTTATTGGAACAGAATTGGAAAGAAGAAAGGACATCTCTGCCCACCCCACAGGATGCCAAAAAGGCTAAAGAATTACCTCTGTAGATTTAAACATCTTTAATGGCTTATGTATAGATTTGCTAATACAGAGAGAAATGAACTATTAAATAAAAATCACATTTTATAATATTTTTATGGCTTAAAACATCCTTTATCTCCTTTTTGTTCTCTCTACATGATATGGTAAGTGATGAGGAAAATTTAGGCTCAGGAAGGTTAAAATCTTTCTTGGAGTTACACATCTAAGAGAGCTGCAGAGCTGACACTTGTACCCAGGTTTTCTGACTGCAAATCCAGTTTCTTTCTATTGCGTTCTTCCCCTTTCCCTGCCTCAAGCAGAAACAGGTTTTTTATTTTCAACCTTTATGTATACAGTATGTTATGTTACATCTACAGCTAAGTTTCTTTTTAGAAGAATGTGAGCCCTTCTAGCTTTGGTTTAGAGTGATTCTAGAAGCCAATTTCCTTGGCTTAGTGATTCTATGCACCTTTCCTAAACTTAGCTTTCTAAGGAAATGAAGTGTACGAGTGAGAATGAATTCACAATTTCGACATGTAGGTAGCATCCTAAAGTGAAAAGAGGAGGAAATTTGTGGTCAAAGCACTCTCCCCACCACTTAGAAACTTACTGACTGTGGGCAGCTTCCTCCTCCAAGTTTCCTTCCTGATTTACAAGACCGTGGTGTGGTCAGGATTAAACTTGAATACATGTAAGGAAGCCTGAAAGTGTCTAACACATAGCGAGTATTCAAATGCCACCTTCTATTTGATCCTTCCCCTCCAGTTCCTTAAGTTTTGGAATCTAGGTTTCTCAGTTCCAAATGGATTGACATTTGCATATCCCCATTGCACAATGGATCAAATAAACTTTATGTTATCATTTCTCCAACATAGTGCCAGTAAGCAAATCCTTTTTAATAACAACAGTATGTTGAGAAACATATCACCAAATAATATTTAACTTTGTAGCTTTGATAAGTTCTTTAGGTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTTGATCTGTCACCCAGACTGGAGTGCAATGGTTCAATTTTAGCTCACTGCAACCTGTAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCTCCACCATGCCCAGCGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGGGACAAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAATTCCTGGCCTTAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACCACCCATAACTTTATGTTTGTTTTTTTGATGCAGTATAAGTTCAGCTTGCTTCTTATGCAGCCATACCATTTCATGTTAACTCTGATTTTTAGCAGCTTATTACATTAGTGTTTTATTATTAATATAATTTTACAGAAATTTACTAAACCATGACTCTGTAGAGTTTTAATAATACTACCTCCAAACATCATTGCAAACATCTAGAAGAATGAACAAAAATGATCTTAGATCGACAGTATATCTGTTTGTCTTAGTTTCTACACAGGATGTTCAGACATATTCCATTTCTTTAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATAGGCCTGGCACGGTGGCTCATGACTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTTAGGCAGGCAAATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACTGGCCTGACCAACATGGTGAAACCTCGTCTCTATTAAAATTACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTTGAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTTGGTGACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAATCCCACCAAAAGTCTGCAGAGTGACCAAATTAGACGGCTCTGGTTTCAGATTAAATTCTAAATGTGAGAAACCACATAGCTCCCATGATCCATCCAATAATTCCTCACGTCCTCTTCACTCTTTACTCCATGCATAAAACAGAATTTTTTTTTCTCATCCTGGGTATGAAGCAATTAATAATTTACGGATTTAGCCTATTTGGATTCAATCCCTTCAAACTCCATACTACATCCAAGGTGGAAGTGACTTAAACTCTGATATCAATCATCAGGCTTGTAATATAGGCTTTGTTAATGGCAGGAGAGTCTAATAAAACTTTCTGTTCCTTATCCTTCATTTAAATGAAAAACTTTTTATTGAAAACAATCATAACTCTAGCTCATCATAAATATAATTCATGAGGACATTTTATTATTTTTATATTAAAGAAATAATATTATAGATGTAAACTTTGCACCTTTCTAATTATTATCATGAGTTAAGCTAATACTTGTCTTCTGGTCCCTAGATGATGATTCTTTTTTGCCTTACTGGAGGAGCCCTTGTCTTGAAGTGAGTTGCTTCAACAGCAGAGGACTTCTAGTTTCTCCCAGTTGAGCCTAAAGTGAACTTTTCATCTTCTTCAGAGGAAGGGGCTTCCTTGATTTGTACTTTTGTGGCTCCTCAGATAACACAGACAATTTTATCTTGGATCCCAGGTTCTCTTCACCATTAAGAATAAGAAAGAGAGAAAATGCTGTGCATGACAGCCACCTACTCCAAACTACCCAACCCCCTGTAACCAGGTACCTTCCAACAACGAGATGATTCTGCCCTCACTCAAGAGTCTCCCCCACAAAGATTCCATTCTCCCTTTACTTTTTATTTTTTATTTTTTTGCAAAACAAAGGCCTCCTTTAGTACCTCCTTAGTTTATAACCCTTATCTTCCCAGCTCTTCCCTTCACTGATACCTCTGATTTCAAAAGTTCTGAAGTCGGAAGACCACACAATTTCAGACTGTGAACAGAAATTCAGTCAGAAATTATTGGAGTTAGAAAGAATTTAGAGAAATTGTATTGAACTAGAAAGTCCTCTTTGATTAGTGGTGGCCCTTTAGAAAGTTCTAGGGCAGAGTCCCATGGTGTTTCATCTTTTCCATGATTTGCTTGACCAAAAACTTTTCTTTCACAACATGAAAATATGCTAATCCACCACACATTTTGGATTCTGCTCTGTTTGCCTGAGGTGTTAGATCTCTAGCCAGGACTGTGAAGGGAAGGAACTTGAATCCTTCCTATTGAGCTATTAATGCAGAGTCAGTGAGATGAAGGGTTCCACTCGGGGTCAAAATCATGTCAGTTACCAAGCAAAGGAGCAAGTAAGGGGAAACATCTCCTCATCTGGTTAGTGGAGCCACATTTCACCCACTGATCAAGCCAGACCTGAGCAATAGTCTAGATTTCTCCCTCCACATCTAATTGGTGACAATGGTGATTGTACCACTGACAGGTCACACAAGTCCACACCCTCCTTCACAGCCTCACTGCTTCGGCTCTTGTTTATGCTCTTATCAGCATCTGTCACTAGGATCCATTTGTCTCCTGACTCATCTACTTCCTTTCACTCCCCTGGGCCATCCTTCACATCATGCTAGAAGACTGTGTCTAACTTGCAGAACTTATTGTGTCAATCTCCTGGTTACGGCCCCTCCATGGCTCCCCACCTGACATAGGAGGCCCTTCACAATCTGGCTTCTGTCACTCATAACTTGTCTCCAGCCTTCATTCTTCAGTCTGATTTTATGGTTTTCTAGTTCCCCAATACACCACACCAGTGTTTATGAAACCCTAGTCATTGGCCTACGAACTTTATGATTATTGACATATTCATGTACCACCTGTATTATTTTTTGCATAGTGTTTATTTTTAATTGACTACATTTTTAACTACAATAAAGTAATTTCAACTAAAA
SEQ ID NO:138 NRG1之全部13個外顯子1-13按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:139 NRG1之外顯子1的轉譯多肽序列
MGKGRAGRVGTT
SEQ ID NO:140 NRG1之外顯子2的轉譯多肽序列
LPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETSSEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKP
SEQ ID NO:141 NRG1之外顯子3的轉譯多肽序列
KSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGNDSASANITIVESN
SEQ ID NO:142 NRG1之外顯子4的轉譯多肽序列
IITGMPASTEGAYVSS
SEQ ID NO:143 NRG1之外顯子5的轉譯多肽序列
SPIRISVSTEGANTSS
SEQ ID NO:144 NRG1之外顯子6的轉譯多肽序列
TSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLC
SEQ ID NO:145 NRG1之外顯子7的轉譯多肽序列
CPNEFTGDRCQNYVMASFY
SEQ ID NO:146 NRG1之外顯子8的轉譯多肽序列
HLGIEFM
SEQ ID NO:147 NRG1之外顯子9的轉譯多肽序列
AEELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKT
SEQ ID NO:148 NRG1之外顯子10的轉譯多肽序列
KQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPNPPPENVQLVN
SEQ ID NO:149 NRG1之外顯子11的轉譯多肽序列
QYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSH
SEQ ID NO:150 NRG1之外顯子12的轉譯多肽序列
WSNGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPHSE
SEQ ID NO:151 NRG1之外顯子13的轉譯多肽序列
YVSAMTTPARMSPVDFHTPSSPKSPPSEMSPPVSSMTVSMPSMAVSPFMEEERPLLLVTPPRLREKKFDHHPQQFSSFHHNPAHDSNSLPASPLRIVEDEEYETTQEYEPAQEPVKKLANSRRAKRTKPNGHIANRLEVDSNTSSQSSNSESETEDERVGEDTPFLGIQNPLAASLEATPAFRLADSRTNPAGRFSTQEEIQARLSSVIANQDPIAV
SEQ ID NO:152 NRG1多肽序列
MGKGRAGRVGTTALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETSSEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGNDSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYVMASFYKHLGIEFMEAEELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPHSERYVSAMTTPARMSPVDFHTPSSPKSPPSEMSPPVSSMTVSMPSMAVSPFMEEERPLLLVTPPRLREKKFDHHPQQFSSFHHNPAHDSNSLPASPLRIVEDEEYETTQEYEPAQEPVKKLANSRRAKRTKPNGHIANRLEVDSNTSSQSSNSESETEDERVGEDTPFLGIQNPLAASLEATPAFRLADSRTNPAGRFSTQEEIQARLSSVIANQDPIAV
SEQ ID NO:153 NRG1之全部12個外顯子2-13按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:154 NRG1之外顯子2-13的轉譯多肽序列
LPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETSSEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGNDSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTSSSTSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYVMASFYKHLGIEFMEAEELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPHSERYVSAMTTPARMSPVDFHTPSSPKSPPSEMSPPVSSMTVSMPSMAVSPFMEEERPLLLVTPPRLREKKFDHHPQQFSSFHHNPAHDSNSLPASPLRIVEDEEYETTQEYEPAQEPVKKLANSRRAKRTKPNGHIANRLEVDSNTSSQSSNSESETEDERVGEDTPFLGIQNPLAASLEATPAFRLADSRTNPAGRFSTQEEIQARLSSVIANQDPIAV
SEQ ID NO:155 NRG1之全部8個外顯子6-13按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:156 NRG1之外顯子6-13的轉譯多肽序列
TSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYVMASFYKHLGIEFMEAEELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPHSERYVSAMTTPARMSPVDFHTPSSPKSPPSEMSPPVSSMTVSMPSMAVSPFMEEERPLLLVTPPRLREKKFDHHPQQFSSFHHNPAHDSNSLPASPLRIVEDEEYETTQEYEPAQEPVKKLANSRRAKRTKPNGHIANRLEVDSNTSSQSSNSESETEDERVGEDTPFLGIQNPLAASLEATPAFRLADSRTNPAGRFSTQEEIQARLSSVIANQDPIAV
SEQ ID NO:157 NRG1之全部8個外顯子6-13按順序排列的多核苷酸序列(不包括外顯子5的核苷酸CAT)
SEQ ID NO:158 NRG1之外顯子5+CAT及外顯子6-13的轉譯多肽序列
STSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYVMASFYKHLGIEFMEAEELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMMNIANGPHHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHTESILSESHSVIVMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGTGGPRECNSFLRHARETPDSYRDSPHSERYVSAMTTPARMSPVDFHTPSSPKSPPSEMSPPVSSMTVSMPSMAVSPFMEEERPLLLVTPPRLREKKFDHHPQQFSSFHHNPAHDSNSLPASPLRIVEDEEYETTQEYEPAQEPVKKLANSRRAKRTKPNGHIANRLEVDSNTSSQSSNSESETEDERVGEDTPFLGIQNPLAASLEATPAFRLADSRTNPAGRFSTQEEIQARLSSVIANQDPIAV
SEQ ID NO:161 NRG1之全部5個外顯子1-5按順序排列的多核苷酸序列(不包括外顯子5的核苷酸CAT)
AGTAAGCCTCCGCAGCCCACTCGGACTGCAGCCTGTTTGCCGCCCGTCCTCCCATTGCAGCACTCGGGGCGACAGAGAGGGAGGAGGCGCGCGGGGACGGGGACGCCCAGGAGGACCCACTCGCGGGTCCCGCTCCGCTCCGGCAGCAGCATGGGGAAAGGACGCGCGGGCCGAGTTGGCACCACAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAACCAGTTCTGAATACTCCTCTCTCAGATTCAAGTGGTTCAAGAATGGGAATGAATTGAATCGAAAAAACAAACCACAAAATATCAAGATACAAAAAAAGCCAGGGAAGTCAGAACTTCGCATTAACAAAGCATCACTGGCTGATTCTGGAGAGTATATGTGCAAAGTGATCAGCAAATTAGGAAATGACAGTGCCTCTGCCAATATCACCATCGTGGAATCAAACGAGATCATCACTGGTATGCCAGCCTCAACTGAAGGAGCATATGTGTCTTCAGAGTCTCCCATTAGAATATCAGTATCCACAGAAGGAGCAAATACTTCTT
SEQ ID NO:162 NRG1外顯子1-5的轉譯多肽序列,不包括經轉譯外顯子5的最C端胺基酸(S)
MGKGRAGRVGTTALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETSSEYSSLRFKWFKNGNELNRKNKPQNIKIQKKPGKSELRINKASLADSGEYMCKVISKLGNDSASANITIVESNEIITGMPASTEGAYVSSESPIRISVSTEGANTS
SEQ ID NO:163 根據SEQ ID NO: 152之NRG1序列的EGF樣結構域
HLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCPNEFTGDRCQNYVMASF
VTCN1 序列資訊SEQ ID NO:164 VTCN1-NRG1融合物5’處之VTCN1外顯子2序列
CATAATTAGCATCATCATTATTCTGGCTGGAGCAATTGCACTCATCATTGGCTTTGGTATTTCAG
SEQ ID NO:165 VTCN1-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAA
SEQ ID NO:166 VTCN1-NRG1多核苷酸序列
CATAATTAGCATCATCATTATTCTGGCTGGAGCAATTGCACTCATCATTGGCTTTGGTATTTCAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAA
SEQ ID NO:167 VTCN1-NRG1多肽序列
IISIIIILAGAIALIIGFGISALPPRLKEM
SEQ ID NO:168 VTCN1之外顯子1
GTGAGTCACCAAGGAAGGCAGCGGCAGCTCCACTCAGCCAGTACCCAGATACGCTGGGAACCTTCCCCAGCCATGGCTTCCCTGGGGCAGATCCTCTTCTGGAG
SEQ ID NO:169 VTCN1之外顯子2
CATAATTAGCATCATCATTATTCTGGCTGGAGCAATTGCACTCATCATTGGCTTTGGTATTTCAG
SEQ ID NO:170 VTCN1之外顯子3
GGAGACACTCCATCACAGTCACTACTGTCGCCTCAGCTGGGAACATTGGGGAGGATGGAATCCTGAGCTGCACTTTTGAACCTGACATCAAACTTTCTGATATCGTGATACAATGGCTGAAGGAAGGTGTTTTAGGCTTGGTCCATGAGTTCAAAGAAGGCAAAGATGAGCTGTCGGAGCAGGATGAAATGTTCAGAGGCCGGACAGCAGTGTTTGCTGATCAAGTGATAGTTGGCAATGCCTCTTTGCGGCTGAAAAACGTGCAACTCACAGATGCTGGCACCTACAAATGTTATATCATCACTTCTAAAGGCAAGGGGAATGCTAACCTTGAGTATAAAACTGGAG
SEQ ID NO:171 VTCN1之外顯子4
CCTTCAGCATGCCGGAAGTGAATGTGGACTATAATGCCAGCTCAGAGACCTTGCGGTGTGAGGCTCCCCGATGGTTCCCCCAGCCCACAGTGGTCTGGGCATCCCAAGTTGACCAGGGAGCCAACTTCTCGGAAGTCTCCAATACCAGCTTTGAGCTGAACTCTGAGAATGTGACCATGAAGGTTGTGTCTGTGCTCTACAATGTTACGATCAACAACACATACTCCTGTATGATTGAAAATGACATTGCCAAAGCAACAGGGGATATCAAAGTGACAG
SEQ ID NO:172 VTCN1之外顯子5
AATCGGAGATCAAAAGGCGGAGTCACCTACAGCTGCTAAACTCAAAGGCTTCTCTGTGTGTCTCTTCTTTCTTTGCCATCAGCTGGGCACTTCTGCCTCTCAGCCCTTACCTGATGCTAAAATAATGTGCCTCGGCCACAAAAAAGCATGCAAAGTCATTGTTACAACAG
SEQ ID NO:173 VTCN1之外顯子6
GGATCTACAGAACTATTTCACCACCAGATATGACCTAGTTTTATATTTCTGGGAGGAAATGAATTCATATCTAGAAGTCTGGAGTGAGCAAACAAGAGCAAGAAACAAAAAGAAGCCAAAAGCAGAAGGCTCCAATATGAACAAGATAAATCTATCTTCAAAGACATATTAGAAGTTGGGAAAATAATTCATGTGAACTAGACAAGTGTGTTAAGAGTGATAAGTAAAATGCACGTGGAGACAAGTGCATCCCCAGATCTCAGGGACCTCCCCCTGCCTGTCACCTGGGGAGTGAGAGGACAGGATAGTGCATGTTCTTTGTCTCTGAATTTTTAGTTATATGTGCTGTAATGTTGCTCTGAGGAAGCCCCTGGAAAGTCTATCCCAACATATCCACATCTTATATTCCACAAATTAAGCTGTAGTATGTACCCTAAGACGCTGCTAATTGACTGCCACTTCGCAACTCAGGGGCGGCTGCATTTTAGTAATGGGTCAAATGATTCACTTTTTATGATGCTTCCAAAGGTGCCTTGGCTTCTCTTCCCAACTGACAAATGCCAAAGTTGAGAAAAATGATCATAATTTTAGCATAAACAGAGCAGTCGGCGACACCGATTTTATAAATAAACTGAGCACCTTCTTTTTAAACAAACAAATGCGGGTTTATTTCTCAGATGATGTTCATCCGTGAATGGTCCAGGGAAGGACCTTTCACCTTGTCTATATGGCATTATGTCATCACAAGCTCTGAGGCTTCTCCTTTCCATCCTGCGTGGACAGCTAAGACCTCAGTTTTCAATAGCATCTAGAGCAGTGGGACTCAGCTGGGGTGATTTCGCCCCCCATCTCCGGGGGAATGTCTGAAGACAATTTTGGTTACCTCAATGAGGGAGTGGAGGAGGATACAGTGCTACTACCAACTAGTGGATAGAGGCCAGGGATGCTGCTCAACCTCCTACCATGTACAGGACGTCTCCCCATTACAACTACCCAATCCGAAGTGTCAACTGTGTCAGGGCTAAGAAACCCTGGTTTTGAGTAGAAAAGGGCCTGGAAAGAGGGGAGCCAACAAATCTGTCTGCTTCCTCACATTAGTCATTGGCAAATAAGCATTCTGTCTCTTTGGCTGCTGCCTCAGCACAGAGAGCCAGAACTCTATCGGGCACCAGGATAACATCTCTCAGTGAACAGAGTTGACAAGGCCTATGGGAAATGCCTGATGGGATTATCTTCAGCTTGTTGAGCTTCTAAGTTTCTTTCCCTTCATTCTACCCTGCAAGCCAAGTTCTGTAAGAGAAATGCCTGAGTTCTAGCTCAGGTTTTCTTACTCTGAATTTAGATCTCCAGACCCTGCCTGGCCACAATTCAAATTAAGGCAACAAACATATACCTTCCATGAAGCACACACAGACTTTTGAAAGCAAGGACAATGACTGCTTGAATTGAGGCCTTGAGGAATGAAGCTTTGAAGGAAAAGAATACTTTGTTTCCAGCCCCCTTCCCACACTCTTCATGTGTTAACCACTGCCTTCCTGGACCTTGGAGCCACGGTGACTGTATTACATGTTGTTATAGAAAACTGATTTTAGAGTTCTGATCGTTCAAGAGAATGATTAAATATACATTTCCTACACCA
SEQ ID NO:174 VTCN1之全部6個外顯子1-6按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:175 VTCN1之外顯子1的轉譯多肽序列
MASLGQILFW
SEQ ID NO:176 VTCN1之外顯子2的轉譯多肽序列
IISIIIILAGAIALIIGFGIS
SEQ ID NO:177 VTCN1之外顯子3的轉譯多肽序列
RHSITVTTVASAGNIGEDGILSCTFEPDIKLSDIVIQWLKEGVLGLVHEFKEGKDELSEQDEMFRGRTAVFADQVIVGNASLRLKNVQLTDAGTYKCYIITSKGKGNANLEYKTG
SEQ ID NO:178 VTCN1之外顯子4的轉譯多肽序列
FSMPEVNVDYNASSETLRCEAPRWFPQPTVVWASQVDQGANFSEVSNTSFELNSENVTMKVVSVLYNVTINNTYSCMIENDIAKATGDIKVT
SEQ ID NO:179 VTCN1之外顯子5的轉譯多肽序列
SEIKRRSHLQLLNSKASLCVSSFFAISWALLPLSPYLMLK
SEQ ID NO:180 VTCN1多肽序列
MASLGQILFWSIISIIIILAGAIALIIGFGISGRHSITVTTVASAGNIGEDGILSCTFEPDIKLSDIVIQWLKEGVLGLVHEFKEGKDELSEQDEMFRGRTAVFADQVIVGNASLRLKNVQLTDAGTYKCYIITSKGKGNANLEYKTGAFSMPEVNVDYNASSETLRCEAPRWFPQPTVVWASQVDQGANFSEVSNTSFELNSENVTMKVVSVLYNVTINNTYSCMIENDIAKATGDIKVTESEIKRRSHLQLLNSKASLCVSSFFAISWALLPLSPYLMLK
SEQ ID NO:181 VTCN1之外顯子1及2
GTGAGTCACCAAGGAAGGCAGCGGCAGCTCCACTCAGCCAGTACCCAGATACGCTGGGAACCTTCCCCAGCCATGGCTTCCCTGGGGCAGATCCTCTTCTGGAGCATAATTAGCATCATCATTATTCTGGCTGGAGCAATTGCACTCATCATTGGCTTTGGTATTTCAG
SEQ ID NO:182 VTCN1之外顯子1及2的轉譯多肽序列
MASLGQILFWSIISIIIILAGAIALIIGFGIS
CDH1 序列資訊SEQ ID NO: 184 CDH1-NRG1融合物5’處之CDH1外顯子11序列
CTGGCTGGAGATTAATCCGGACACTGGTGCCATTTCCACTCGGGCTGAGCTGGACAGGGAGGATTTTGAGCACGTGAAGAACAGCACGTACACAGCCCTAATCATAGCTACAGACAATG
SEQ ID NO: 185 CDH1 -NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAA
SEQ ID NO: 186 CDH1-NRG1多核苷酸序列
CTGGCTGGAGATTAATCCGGACACTGGTGCCATTTCCACTCGGGCTGAGCTGGACAGGGAGGATTTTGAGCACGTGAAGAACAGCACGTACACAGCCCTAATCATAGCTACAGACAATGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAA
SEQ ID NO: 187 CDH1-NRG1多肽序列
WLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNALPPRLKEMK
SEQ ID NO: 188 CDH1之外顯子1
AGTGGCGTCGGAACTGCAAAGCACCTGTGAGCTTGCGGAAGTCAGTTCAGACTCCAGCCCGCTCCAGCCCGGCCCGACCCGACCGCACCCGGCGCCTGCCCTCGCTCGGCGTCCCCGGCCAGCCATGGGCCCTTGGAGCCGCAGCCTCTCGGCGCTGCTGCTGCTGCTGCAG
SEQ ID NO: 189 CDH1之外顯子2
GTCTCCTCTTGGCTCTGCCAGGAGCCGGAGCCCTGCCACCCTGGCTTTGACGCCGAGAGCTACACGTTCACGGTGCCCCGGCGCCACCTGGAGAGAGGCCGCGTCCTGGGCAGAG
SEQ ID NO: 190 CDH1之外顯子3
TGAATTTTGAAGATTGCACCGGTCGACAAAGGACAGCCTATTTTTCCCTCGACACCCGATTCAAAGTGGGCACAGATGGTGTGATTACAGTCAAAAGGCCTCTACGGTTTCATAACCCACAGATCCATTTCTTGGTCTACGCCTGGGACTCCACCTACAGAAAGTTTTCCACCAAAGTCACGCTGAATACAGTGGGGCACCACCACCGCCCCCCGCCCCATCAG
SEQ ID NO: 191 CDH1之外顯子4
GCCTCCGTTTCTGGAATCCAAGCAGAATTGCTCACATTTCCCAACTCCTCTCCTGGCCTCAGAAGACAGAAGAGAGACTGGGTTATTCCTCCCATCAGCTGCCCAGAAAATGAAAAAGGCCCATTTCCTAAAAACCTGGTTCAG
SEQ ID NO: 192 CDH1之外顯子5
ATCAAATCCAACAAAGACAAAGAAGGCAAGGTTTTCTACAGCATCACTGGCCAAGGAGCTGACACACCCCCTGTTGGTGTCTTTATTATTGAAAGAGAAACAGGATGGCTGAAGGTGACAGAGCCTCTGGATAGAGAACGCATTGCCACATACACT
SEQ ID NO: 193 CDH1之外顯子6
CTCTTCTCTCACGCTGTGTCATCCAACGGGAATGCAGTTGAGGATCCAATGGAGATTTTGATCACGGTAACCGATCAGAATGACAACAAGCCCGAATTCACCCAGGAGGTCTTTAAGGGGTCTGTCATGGAAGGTGCTCTTCCAG
SEQ ID NO: 194 CDH1之外顯子7
GAACCTCTGTGATGGAGGTCACAGCCACAGACGCGGACGATGATGTGAACACCTACAATGCCGCCATCGCTTACACCATCCTCAGCCAAGATCCTGAGCTCCCTGACAAAAATATGTTCACCATTAACAGGAACACAGGAGTCATCAGTGTGGTCACCACTGGGCTGGACCGAGAG
SEQ ID NO: 195 CDH1之外顯子8
AGTTTCCCTACGTATACCCTGGTGGTTCAAGCTGCTGACCTTCAAGGTGAGGGGTTAAGCACAACAGCAACAGCTGTGATCACAGTCACTGACACCAACGATAATCCTCCGATCTTCAATCCCACCACG
SEQ ID NO: 196 CDH1之外顯子9
TACAAGGGTCAGGTGCCTGAGAACGAGGCTAACGTCGTAATCACCACACTGAAAGTGACTGATGCTGATGCCCCCAATACCCCAGCGTGGGAGGCTGTATACACCATATTGAATGATGATGGTGGACAATTTGTCGTCACCACAAATCCAGTGAACAACGATGGCATTTTGAAAACAGCAAAGGTTTGTATGGTACCTGGCAAGATGCAGAAACTGGCATCCTCACAGCTGTTCATACCCTTGTCCCCTG
SEQ ID NO: 197 CDH1之外顯子10
GGCTTGGATTTTGAGGCCAAGCAGCAGTACATTCTACACGTAGCAGTGACGAATGTGGTACCTTTTGAGGTCTCTCTCACCACCTCCACAGCCACCGTCACCGTGGATGTGCTGGATGTGAATGAAGCCCCCATCTTTGTGCCTCCTGAAAAGAGAGTGGAAGTGTCCGAGGACTTTGGCGTGGGCCAGGAAATCACATCCTACACTGCCCAGGAGCCAGACACATTTATGGAACAGAAAATAAC
SEQ ID NO: 198 CDH1之外顯子11
ATATCGGATTTGGAGAGACACTGCCAACTGGCTGGAGATTAATCCGGACACTGGTGCCATTTCCACTCGGGCTGAGCTGGACAGGGAGGATTTTGAGCACGTGAAGAACAGCACGTACACAGCCCTAATCATAGCTACAGACAATG
SEQ ID NO: 199 CDH1之外顯子12
GTTCTCCAGTTGCTACTGGAACAGGGACACTTCTGCTGATCCTGTCTGATGTGAATGACAACGCCCCCATACCAGAACCTCGAACTATATTCTTCTGTGAGAGGAATCCAAAGCCTCAGGTCATAAACATCATTGATGCAGACCTTCCTCCCAATACATCTCCCTTCACAGCAGAACTAACACACGGGGCGAGTGCCAACTGGACCATTCAGTACAACGACCCAA
SEQ ID NO: 200 CDH1之外顯子13
CCCAAGAATCTATCATTTTGAAGCCAAAGATGGCCTTAGAGGTGGGTGACTACAAAATCAATCTCAAGCTCATGGATAACCAGAATAAAGACCAAGTGACCACCTTAGAGGTCAGCGTGTGTGACTGTGAAGGGGCCGCTGGCGTCTGTAGGAAGGCACAGCCTGTCGAAGCAGGATTGCAAATTCCTGCCATTCTGGGGATTCTTGGAGGAATTCTTGCTTTGCTAA
SEQ ID NO: 201 CDH1之外顯子14
TTCTGATTCTGCTGCTCTTGCTGTTTCTTCGGAGGAGAGCGGTGGTCAAAGAGCCCTTACTGCCCCCAGAGGATGACACCCGGGACAACGTTTATTACTATGATGAAGAAGGAGGCGGAGAAGAGGACCAG
SEQ ID NO: 202 CDH1之外顯子15
GACTTTGACTTGAGCCAGCTGCACAGGGGCCTGGACGCTCGGCCTGAAGTGACTCGTAACGACGTTGCACCAACCCTCATGAGTGTCCCCCGGTATCTTCCCCGCCCTGCCAATCCCGATGAAATTGGAAATTTTATTGATGAA
SEQ ID NO: 203 CDH1之外顯子16
AATCTGAAAGCGGCTGATACTGACCCCACAGCCCCGCCTTATGATTCTCTGCTCGTGTTTGACTATGAAGGAAGCGGTTCCGAAGCTGCTAGTCTGAGCTCCCTGAACTCCTCAGAGTCAGACAAAGACCAGGACTATGACTACTTGAACGAATGGGGCAATCGCTTCAAGAAGCTGGCTGACATGTACGGAGGCGGCGAGGACGACTAGGGGACTCGAGAGAGGCGGGCCCCAGACCCATGTGCTGGGAAATGCAGAAATCACGTTGCTGGTGGTTTTTCAGCTCCCTTCCCTTGAGATGAGTTTCTGGGGAAAAAAAAGAGACTGGTTAGTGATGCAGTTAGTATAGCTTTATACTCTCTCCACTTTATAGCTCTAATAAGTTTGTGTTAGAAAAGTTTCGACTTATTTCTTAAAGCTTTTTTTTTTTTCCCATCACTCTTTACATGGTGGTGATGTCCAAAAGATACCCAAATTTTAATATTCCAGAAGAACAACTTTAGCATCAGAAGGTTCACCCAGCACCTTGCAGATTTTCTTAAGGAATTTTGTCTCACTTTTAAAAAGAAGGGGAGAAGTCAGCTACTCTAGTTCTGTTGTTTTGTGTATATAATTTTTTAAAAAAAATTTGTGTGCTTCTGCTCATTACTACACTGGTGTGTCCCTCTGCCTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTCATTCTATCGGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCACAGCTCACTGCAGCCTTGTCCTCCCAGGCTCAAGCTATCCTTGCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGCACCACTACGCATGACTAATTTTTTAAATATTTGAGACGGGGTCTCCCTGTGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCATCTTGGCCTCCCAGAGTATTGGGATTACAGACATGAGCCACTGCACCTGCCCAGCTCCCCAACTCCCTGCCATTTTTTAAGAGACAGTTTCGCTCCATCGCCCAGGCCTGGGATGCAGTGATGTGATCATAGCTCACTGTAACCTCAAACTCTGGGGCTCAAGCAGTTCTCCCACCAGCCTCCTTTTTATTTTTTTGTACAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCTTCTGCCTTGGCCCCCCAAAGTGCTGGGATTGTGGGCATGAGCTGCTGTGCCCAGCCTCCATGTTTTAATATCAACTCTCACTCCTGAATTCAGTTGCTTTGCCCAAGATAGGAGTTCTCTGATGCAGAAATTATTGGGCTCTTTTAGGGTAAGAAGTTTGTGTCTTTGTCTGGCCACATCTTGACTAGGTATTGTCTACTCTGAAGACCTTTAATGGCTTCCCTCTTTCATCTCCTGAGTATGTAACTTGCAATGGGCAGCTATCCAGTGACTTGTTCTGAGTAAGTGTGTTCATTAATGTTTATTTAGCTCTGAAGCAAGAGTGATATACTCCAGGACTTAGAATAGTGCCTAAAGTGCTGCAGCCAAAGACAGAGCGGAACTATGAAAAGTGGGCTTGGAGATGGCAGGAGAGCTTGTCATTGAGCCTGGCAATTTAGCAAACTGATGCTGAGGATGATTGAGGTGGGTCTACCTCATCTCTGAAAATTCTGGAAGGAATGGAGGAGTCTCAACATGTGTTTCTGACACAAGATCCGTGGTTTGTACTCAAAGCCCAGAATCCCCAAGTGCCTGCTTTTGATGATGTCTACAGAAAATGCTGGCTGAGCTGAACACATTTGCCCAATTCCAGGTGTGCACAGAAAACCGAGAATATTCAAAATTCCAAATTTTTTTCTTAGGAGCAAGAAGAAAATGTGGCCCTAAAGGGGGTTAGTTGAGGGGTAGGGGGTAGTGAGGATCTTGATTTGGATCTCTTTTTATTTAAATGTGAATTTCAACTTTTGACAATCAAAGAAAAGACTTTTGTTGAAATAGCTTTACTGTTTCTCAAGTGTTTTGGAGAAAAAAATCAACCCTGCAATCACTTTTTGGAATTGTCTTGATTTTTCGGCAGTTCAAGCTATATCGAATATAGTTCTGTGTAGAGAATGTCACTGTAGTTTTGAGTGTATACATGTGTGGGTGCTGATAATTGTGTATTTTCTTTGGGGGTGGAAAAGGAAAACAATTCAAGCTGAGAAAAGTATTCTCAAAGATGCATTTTTATAAATTTTATTAAACAATTTTGTTAAA
SEQ ID NO: 204 CDH1之全部16個外顯子1-16按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO: 205 CDH1之外顯子10的轉譯多肽序列
MEQKI
SEQ ID NO: 206 CDH1之外顯子11的轉譯多肽序列
YRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDN
SEQ ID NO: 207 CDH1之外顯子12的轉譯多肽序列
SPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDP
SEQ ID NO: 208 CDH1之外顯子13的轉譯多肽序列
QESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALL
SEQ ID NO: 209 CDH1之外顯子14的轉譯多肽序列
LILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQ
SEQ ID NO: 210 CDH1之外顯子15的轉譯多肽序列
DFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDE
SEQ ID NO: 211 CDH1之外顯子16的轉譯多肽序列
NLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
SEQ ID NO: 212 CDH1多肽序列
MEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
SEQ ID NO: 213 CDH1之全部11個外顯子1-11按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO: 214 外顯子1-11的轉譯多肽序列
MEQKIYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDN
CXADR 序列資訊SEQ ID NO: 215 CXADR-NRG1融合物5’處之CXADR外顯子1序列
ATGGCGCTCCTGCTGTGCTTCGTGCTCCTGTGCGGAGTAGTGG
SEQ ID NO: 216 CXADR-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACT
SEQ ID NO: 217 CXADR-NRG1多核苷酸序列
ATGGCGCTCCTGCTGTGCTTCGTGCTCCTGTGCGGAGTAGTGGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACT
SEQ ID NO: 218 CXADR-NRG1多肽序列
MALLLCFVLLCGVVALPPRLKEMKSQESAAGSK
SEQ ID NO:219 CXADR之外顯子1
AGTCGGGAGCGCGCGAGGCGCGGGGAGCCTGGGACCAGGAGCGAGAGCCGCCTACCTGCAGCCGCCGCCCACGGCACGGCAGCCACCATGGCGCTCCTGCTGTGCTTCGTGCTCCTGTGCGGAGTAGTGG
SEQ ID NO:220 CXADR之外顯子2
ATTTCGCCAGAAGTTTGAGTATCACTACTCCTGAAGAGATGATTGAAAAAGCCAAAGGGGAAACTGCCTATCTGCCATGCAAATTTACGCTTAGTCCCGAAGACCAGGGACCGCTGGACATCGAGTGGCTGATATCACCAGCTGATAATCAGAAGGTGGATCAAGTG
SEQ ID NO:221 CXADR之外顯子3
ATTATTTTATATTCTGGAGACAAAATTTATGATGACTACTATCCAGATCTGAAAGGCCGAGTACATTTTACGAGTAATGATCTCAAATCTGGTGATGCATCAATAAATGTAACGAATTTACAACTGTCAGATATTGGCACATATCAGTGCAAAGTGAAAAAAGCTCCTGGTGTTGCAAATAAGAAGATTCATCTGGTAGTTCTTG
SEQ ID NO:222 CXADR之外顯子4
TTAAGCCTTCAGGTGCGAGATGTTACGTTGATGGATCTGAAGAAATTGGAAGTGACTTTAAGATAAAATGTGAACCAAAAGAAGGTTCACTTCCATTACAGTATGAGTGGCAAAAATTGTCTGACTCACAGAAAATGCCCACTTCATGGTTAGCAG
SEQ ID NO:223 CXADR之外顯子5
GGAAGATGTGCCACCTCCAAAGAGCCGTACGTCCACTGCCAGAAGCTACATCGGCAGTAATCATTCATCCCTGGGGTCCATGTCTCCTTCCAACATGGAAGGATATTCCAAGACTCAGTATAACCAAGTACCAAGTGAAGACTTTGAACGCACTCCTCAGAGTCCGACTCTCCCACCTGCTAAGGTAGCTGCCCCTAATCTAAGTCGAATGGGTGCGATTCCTGTGATGATTCCAGCACAGAGCAAGGATGGGTCTATAGTATAGAGCCTCCATATGTCTCATCTGTGCTCTCCGTGTTCCTTTCCTTTTTTTGATATATGAAAACCTATTCTGGTCTAAATTGTGTTACTAGCCTCAAAATACATCAAAAAATAAGTTAATCAGGAACTGTACGGAATATATTTTTAAAAATTTTTGTTTGGTTATATCGAAATAGTTACAGGCACTAAAGTTAGTAAAGAAAAGTTTACCATCTGAAAAAGCTGGATTTTCTTTAAGAGGTTGATTATAAAGTTTTCTAAATTTATCAGTACCTAAGTAAGATGTAGCGCTTTGAATATGAAATCATAGGTGAAGACATGGGTGAACTTACTTGCATACCAAGTTGATACTTGAATAACCATCTGAAAGTGGTACTTGATCATTTTTACCATTATTTTTAGGATGTGTATTTCATTTATTTATGGCCCACCAGTCTCCCCCAAATTAGTACAGAAATATCCATGACAAAATTACTTACGTATGTTTGTACTTGGTTTTACAGCTCCTTTGAAAACTCTGTGTTTGGAATATCTCTAAAAACATAGAAAACACTACAGTGGTTTAGAAATTACTAATTTTACTTCTAAGTCATTCATAAACCTTGTCTATGAAATGACTTCTTAAATATTTAGTTGATAGACTGCTACAGGTAATAGGGACTTAGCAAGCTCTTTTATATGCTAAAGGAGCATCTATCAGATTAAGTTAGAACATTTGCTGTCAGCCACATATTGAGATGACACTAGGTGCAATAGCAGGGATAGATTTTGTTGGTGAGTAGTCTCATGCCTTGAGATCTGTGGTGGTCTTCAAAATGGTGGCCAGCCAGATCAAGGATGTAGTATCTCATAGTTCCCAGGTGATATTTTTCTTATTAGAAAAATATTATAACTCATTTGTTGTTTGACACTTATAGATTGAAATTTCCTAATTTATTCTAAATTTTAAGTGGTTCTTTGGTTCCAGTGCTTTATGTTGTTGTTGTTTTTGGATGGTGTTACATATTATATGTTCTAGAAACATGTAATCCTAAATTTACCCTCTTGAATATAATCCCTGGATGATATTTTTTATCATAAATGCAGAATAATCAAATACATTTTAAGCAAGTTAAGTGTCCTCCATCAATTCTGTATTCCAGACTTGGGAGGATGTACAGTTGCTGTTGTGTGATCAAACATGTCTCTGTGTAGTTCCAGCAAATCAAGCTGAGCTTTGAAAAAGTTTGTCTTAGTTTTGTGAAGGTGATTTATTCTTAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAAAAGATAAGAAGGAGGAGTAAAGGGACTACTCCTCCTTGCCAAATGTGCTAAATATCATTTTAGGAGAAGAAAGTGGGTTTATTGTATTTCCCTTAAGATTGTGAGGGAGTGTGGATACAGTAGAATGAGCCAACAGTTTCTTTATAATAAATACGGTCTGCAATAAATTATTTCACTAGCTCTAAAACCTTTCCCTAGATTTTAGTAGGGAGTTGGTTTCTGTTAATATCTTTGGGTGCTGTGGTGGTAAATGCTATATTATGAACGGTGGCATGTATTTACAGTTAGAGTATTGTGTGTACACTTTTTAATGGTAAACTTAAGCTGAATGTGTAATGGATTTGTGTATAGTTTTACATATTTGGAAGCATTTTAAAAACAGGTTTTAACCTTATGTAAAATTACTTTTATACTCGTGTTAACATTTTCATCTGTGCCTTTTGGTAATTTAATTTCTATTATGAATTTCTGGTGCCTATGAGCTAGCTATCACCTACCTGAAAGGTGCTTAGAGGTGAAGGTACTGTTTCTAAAAACACATCACTGTGATACCTTTCTATCCTCACATTTTCAAGCTTGCCTCTTTTCTGTTCTTTGTGGATATAACTTAAGCAATTGTGTTATTCATAAAGGTTTAGAAATTTCAATATTCCCAACACTCTATGTTTCTGATTTTATAACAGTAGCCATTTTTGAAAGTCAGATGTTTGGCCTGTTTTATATGAATAAAGTTTATTTATAAAATATTATAAAAAATAAGTAAATAAACAGAACATTAATAATAAAGTTTTGGTTCTTCCTATTCCTGACTTTCATATAATGAAAATTATCCTATTGATCTAAGTAGAAGTTATCATAGAAAGTGGACACGTATAAGACTTTCCTTCCTTTTTTTTTTTAATAACATATGAGGAACAAGACTTCTCTTCCCATATACTTCATATTTTAGAGGACATTGTTTTAAAGGCTTATGTCTCACTGTAAAATTCTGTCAGCCAAATAGTACCAATACGTTTTCAAGTAGTTCTCACTGATAATTTAGTTGAACCAGAGATCAAATATTTGCTCCCGAATTACTACTGGTAATCAAGTAGTTGAACAAAAAATTACTAAAGCATTTCCGTTAGATCAGTCAAGGACAGTACTGCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACGGAGTCTCGGTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCTCCCATCACCACGCTCGGCTAAGTTTTTGTAATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACCACTGCACCCGGCCCAGTACTGCATCTTAACAGCAAAGCCATTTTATTCTACTTTATAACTGAGAGACTTGATACCATCCATCTCTTTAGGTTACAGAGGATAATTTGAAGAGAAATGTTACTGTAGAATATATAGTTCTGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGAGATAGGGTTTCACTATTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTGCTGGGCTCAGGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAATTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCGCAGCATCCAGCCAGTTCTGTACTTTGAATATGGAGTAGTTTACAGCTATTTTTTTTTCTTACTGGTAATCTTAACTAATATGATTCCCTTGTTAGAGAGCCTCTCACTCCCCCACCCCCAAAAATGTCTACTATTCATGACAGTAACCAATTATTCTGGACAAATTGCTTCTTTTTAATTTGAGCTATCTGCCATGGACTTTCTAAAATGGAAACACAGCCTGAGTGTATCTTAGGGAGAGTTTGATTGAAAAAATCCAAATCACTATCCATATAGATCATGGATATAAAGAGATACCTGATTTTTATTAAAAAGATACTTTTTCAAATTTAAGAGTTAATCTTGGAAATTTGGAACAAGTAAAGGGGCAAGTAAACCTTTTGATGAAATATAAAAGGAACTCATTGCATGAAGTTGACTATCAAATTCTGTGATGTGTGGCTTCTTAAAAATATTCTCAGTGTCTTTTGTGTGCGTGCAGCATGTACATTTGATGTTATGTGAATGTTGAGTTTTTTCTTCTAATTTTCACTTCAGCAGTGTTTAGGGCTTTCAGATGCCTTATTCCAGTGTGAACAGAAAAAGTTCATATTTTATGTGGTTAATGCTTTGATGTGTCACATAAAGAGTAGTTTGTAGAAAATGTTGGCACAATTTTAACTTCTTAGTGGCTTGTGACATTATATATTATATATATATATGTACATATATCTTTATAACATTCCTGTGTTTAGTAGTGTAAATGTTCTGGGCAAGTTTTAATATTTTGAATGCCTTTGGATATTCCAGCAATAAAGGCATCATGTTCTGCAATAGGATTTCTTACTCATTTACCTATTTTAACACTAAAATAGACCACAACTGAGCACAAATTCCTTTTATAAATGTTATAGAAGCAGGGAAGAATAATAAACACATTTGTGAATTGTGGTTCAGTTTATTTATCTTTAGGGAAGGCTGATCATTTATCTTATAGCAGATAACCCCAGCCTCTTATTCATTATGGTTAACTTTTATAATTTATCTTATTTTATAATTTAAGAATATAGTACATATCAGTTGGGTTTGGTTTTGGTCATCGAGACTAAAAGCTCCATCAAAACAGAACTTTGTGTTTTCTGCTAACTTATTTAATGACACAAGTTTTAAGAGAACCACAATTCATTGATTCACTTATTCTTTTCCCTAATTGTGAATTTTAGTGATAAATACACCTGTACTACTGAGGAAAATATTCTGACACTTCACGTGTGCAAAGTATAGAACTGACAGTGTCAGTTTCAGATTTTGTATGTACGATTTCTGGCTTATATATCCAATGGTGCAGATTTTGAAATTTGTAAGAACAAAATTTGTTAAGAAAAACAACTTGCTCTAGTTTTGTGACCTTGTGTACTTTTGAAATAAAATCAAGAAAGCAGTTCTCTGCCTC
SEQ ID NO:224 CXADR之全部5個外顯子1-5按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:225 CXADR之外顯子1的轉譯多肽序列
MALLLCFVLLCGVV
SEQ ID NO:226 CXADR之外顯子2的轉譯多肽序列
FARSLSITTPEEMIEKAKGETAYLPCKFTLSPEDQGPLDIEWLISPADNQKVDQV
SEQ ID NO:227 CXADR之外顯子3的轉譯多肽序列
IILYSGDKIYDDYYPDLKGRVHFTSNDLKSGDASINVTNLQLSDIGTYQCKVKKAPGVANKKIHLVVL
SEQ ID NO:228 CXADR之外顯子4的轉譯多肽序列
KPSGARCYVDGSEEIGSDFKIKCEPKEGSLPLQYEWQKLSDSQKMPTSWLA
SEQ ID NO:229 CXADR之外顯子5的轉譯多肽序列
KMCHLQRAVRPLPEATSAVIIHPWGPCLLPTWKDIPRLSITKYQVKTLNALLRVRLSHLLR
SEQ ID NO:230 CDAXR多肽序列
MALLLCFVLLCGVVDFARSLSITTPEEMIEKAKGETAYLPCKFTLSPEDQGPLDIEWLISPADNQKVDQVIILYSGDKIYDDYYPDLKGRVHFTSNDLKSGDASINVTNLQLSDIGTYQCKVKKAPGVANKKIHLVVLVKPSGARCYVDGSEEIGSDFKIKCEPKEGSLPLQYEWQKLSDSQKMPTSWLAGKMCHLQRAVRPLPEATSAVIIHPWGPCLLPTWKDIPRLSITKYQVKTLNALLRVRLSHLLR
GTF2E2 序列資訊SEQ ID NO: 231 GTF2E2-NRG1融合物5’處之GTF2E2外顯子2序列
GGGAGCTGTTCAAAAAACGAGCTCTTTCTACTCCTGTAGTAGAAAAACGTTCAGCATCTTCTGAGTCATCATCATCATCGTCAAAGAAGAAGAAAACAAAGGTAGAACATGGAGGATCGTCAGGCTCTAAACAAAATTCTG
SEQ ID NO: 232 GTF2E2-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAACCAGTTCTGAATACTCCTCTCTCAGATTCAAGTGGTTCAAGAATGGGAATGA
SEQ ID NO: 233 GTF2E2-NRG1多核苷酸序列
GGGAGCTGTTCAAAAAACGAGCTCTTTCTACTCCTGTAGTAGAAAAACGTTCAGCATCTTCTGAGTCATCATCATCATCGTCAAAGAAGAAGAAAACAAAGGTAGAACATGGAGGATCGTCAGGCTCTAAACAAAATTCTGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAACCAGTTCTGAATACTCCTCTCTCAGATTCAAGTGGTTCAAGAATGGGAATGA
SEQ ID NO: 234 GTF2E2-NRG1多肽序列
ELFKKRALSTPVVEKRSASSESSSSSSKKKKTKVEHGGSSGSKQNSALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETSSEYSSLRFKWFKNGN
SEQ ID NO:235 GTF2E2之外顯子1
ACTGAGCTCCTAGCACCCGATCGGGAAGTGGCGGGCGGAGTCCCGGGTCCAGTCGCCGCCTCAGCTACCGCCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCAGTGGTGAGACCCCGACCTGGCGGGTCAGCGCTGGGCGTGCGTGCGGGCAGGCGGGGGCGCTGACGAGAAGCAGGAAGAGGGTGCAGTGCCGGCGTGGGCGGCCGGCCGAGGCGGAGGCGCAGGAAGGGGGCGGCGAGTCGTGCGAGGCTGCCCTTCTCACTCAG
SEQ ID NO:236 GTF2E2之外顯子2
CATTATGGATCCAAGCCTGTTGAGAGAAAGGGAGCTGTTCAAAAAACGAGCTCTTTCTACTCCTGTAGTAGAAAAACGTTCAGCATCTTCTGAGTCATCATCATCATCGTCAAAGAAGAAGAAAACAAAGGTAGAACATGGAGGATCGTCAGGCTCTAAACAAAATTCTG
SEQ ID NO:237 GTF2E2之外顯子3
ATCATAGCAATGGATCATTTAACTTGAAAGCTTTGTCAGGAAGCTCTGGATATAAGTTTGGTGTTCTTGCTAAGATTGTGAATTACATGAAG
SEQ ID NO:238 GTF2E2之外顯子4
ACACGGCATCAGCGAGGAGATACGCATCCTCTAACCTTAGATGAAATTTTGGATGAAACACAACATTTAGATATTGGACTCAAGCAGAAACAATGGCTAATGACTGAG
SEQ ID NO:239 GTF2E2之外顯子5
GCTTTAGTCAACAATCCCAAAATTGAAGTAATAGATGGGAAGTATGCTTTCAAGCCCAAGTACAACGTGAGAGATAAGAAGGCCCTACTTAGGCTCTTAGATCAGCATGACCAGCGAGGATTAGGAGGAATTCTTTTAGAAGACATAGAAGAAGCACTGCCCAATTCCCAGAAAGCTGTCAAG
SEQ ID NO:240 GTF2E2之外顯子6
GCTTTGGGGGACCAGATACTATTTGTAAATCGTCCCGATAAGAAGAAAATACTTTTCTTCAATGATAAGAGCTGTCAGTTTTCTGTGGATGAAG
SEQ ID NO:241 GTF2E2之外顯子7
AATTTCAGAAACTGTGGAGGAGTGTCACTGTAGATTCCATGGACGAGGAGAAAATTGAAGAATATCTGAAGCGACAGGGTATTTCTTCCATGCAGGAATCTGGACCAAAGAAAGTG
SEQ ID NO:242 GTF2E2之外顯子8
GCCCCTATTCAGAGAAGGAAAAAGCCTGCTTCACAGAAAAAGCGACGCTTTAAGACTCATAACGAACACTTGGCTGGAGTGCTGAAGGATTACTCTGACATTACTTCCAGCAAATAGGGAACAGTTTTGCCCTGGAACAGAGTTACAGATACACAATCAAGAGTGTTCTTGCTGATGCTCGGGGTCTGAAGACTGTCTTCCTATCTGCTTCTTGCGGCTGAGGAGAGGAGCAGTTCAGTTTACAAAACAAGTGCAAATTACCAAACTCAAAGCTTATTTGAGTAGAATGGGCTCATGGGCAATGTGATGTTCCCTGTTAACCTTCTGTTACTCCCTGGGAGAAAGGCGCTGAGCGTGGCATGCAGGTGTCTTTGCTGTGTTTTTCTCCACTTCTAAATGGTTCCTGGTTCCTTTCTTCCTCGTTTGTTACTTTAGAGCAAGTTTGCCCATAGTCTTGAATGCAATATTTGTTTATTCCAAAAGAACATATTTATAATAAAATCACTGTAGAAGGATTTTTAAGATGTTAGTGAATTCTGTTTCTTTTCATTCTCGGAAATGGCAGGAAGCAGCTCCAGTCTCTGATTTCCATGGGTCACGTGCTGGGGATGTGATGAAGCCTGCAGTCTGCACTGTGTTGCTGAGCACATGGATTTCACCACTGGAACACAGGTGTGCTGCTTGTTAGCAAGCAGAGCAATAAAGATGTGCTGGATGTCA
SEQ ID NO:243 GTF2E2之全部8個外顯子1-8按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:244 GTF2E2之外顯子2的轉譯多肽序列
MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSASSESSSSSSKKKKTKVEHGGSSGSKQNS
SEQ ID NO:245 GTF2E2之外顯子3的轉譯多肽序列
HSNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAKIVNYMK
SEQ ID NO:246 GTF2E2之外顯子4的轉譯多肽序列
TRHQRGDTHPLTLDEILDETQHLDIGLKQKQWLMTE
SEQ ID NO:247 GTF2E2之外顯子5的轉譯多肽序列
ALVNNPKIEVIDGKYAFKPKYNVRDKKALLRLLDQHDQRGLGGILLEDIEEALPNSQKAVK
SEQ ID NO:248 GTF2E2之外顯子6的轉譯多肽序列
ALGDQILFVNRPDKKKILFFNDKSCQFSVDE
SEQ ID NO:249 GTF2E2之外顯子7的轉譯多肽序列
FQKLWRSVTVDSMDEEKIEEYLKRQGISSMQESGPKKV
SEQ ID NO:250 GTF2E2之外顯子8的轉譯多肽序列
APIQRRKKPASQKKRRFKTHNEHLAGVLKDYSDITSSK
SEQ ID NO:251 全蛋白質序列
MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSASSESSSSSSKKKKTKVEHGGSSGSKQNSDHSNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAKIVNYMKTRHQRGDTHPLTLDEILDETQHLDIGLKQKQWLMTEALVNNPKIEVIDGKYAFKPKYNVRDKKALLRLLDQHDQRGLGGILLEDIEEALPNSQKAVKALGDQILFVNRPDKKKILFFNDKSCQFSVDEEFQKLWRSVTVDSMDEEKIEEYLKRQGISSMQESGPKKVAPIQRRKKPASQKKRRFKTHNEHLAGVLKDYSDITSSK
SEQ ID NO:252 外顯子1-2
ACTGAGCTCCTAGCACCCGATCGGGAAGTGGCGGGCGGAGTCCCGGGTCCAGTCGCCGCCTCAGCTACCGCCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCAGTGGTGAGACCCCGACCTGGCGGGTCAGCGCTGGGCGTGCGTGCGGGCAGGCGGGGGCGCTGACGAGAAGCAGGAAGAGGGTGCAGTGCCGGCGTGGGCGGCCGGCCGAGGCGGAGGCGCAGGAAGGGGGCGGCGAGTCGTGCGAGGCTGCCCTTCTCACTCAGCATTATGGATCCAAGCCTGTTGAGAGAAAGGGAGCTGTTCAAAAAACGAGCTCTTTCTACTCCTGTAGTAGAAAAACGTTCAGCATCTTCTGAGTCATCATCATCATCGTCAAAGAAGAAGAAAACAAAGGTAGAACATGGAGGATCGTCAGGCTCTAAACAAAATTCTG
CSMD1 序列資訊SEQ ID NO: 253 CSMD1-NRG1融合物5’處之CSMD1外顯子23序列
ATCCTAAACAGCACATCCAATCACCTGTGGCTAGAGTTCAACACCAATGGATCTGACACCGACCAAGGTTTTCAACTCACCTATACCA
SEQ ID NO: 254 CSMD1-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACT
SEQ ID NO: 255 CSMD1-NRG1多核苷酸序列
ATCCTAAACAGCACATCCAATCACCTGTGGCTAGAGTTCAACACCAATGGATCTGACACCGACCAAGGTTTTCAACTCACCTATACCACTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACT
SEQ ID NO: 256 CSMD1-NRG1多肽序列
ILNSTSNHLWLEFNTNGSDTDQGFQLTYTTTSTSTTGTSHLVKCAEKEKT
SEQ ID NO:257 CSMD1之外顯子1
CTCCACGGCAGCGGCTCCTTGTGCCACTAGCAGCCCTTCTTCTGCGCTCTCCGCCTTTTCTCTCTAGACTGGATCTCTCCTCCCCCCCGCGCCCCCCTCCCCGCATCTCCCACTCGCTGGCTCTCTCTCCAGCTGCCTCCTCTCCAGGTCTCTCCTGGCTGCGCGCGCTCCTCTCCCCGCTTCTCCCCCTCCCGCAGCCTCGCCGCCTTGGTGCCTTCCTGCCCGGCTCGGCCGGCGCTCGTCCCCGGCCCCGGCCCCGCCAGCCCGGGTCTCCGCGCTCGGAGCAGCTCAGCCCTGCAGTGGCTCGGGACCCGATGCTATGAGAGGGAAGCGAGCCGGGCGCCCAGACCTTCAGGAGGCGTCGGATGCGCGGCGGGTCTTGGGACCGGGCTCTCTCTCCGGCTCGCCTTGCCCTCGGGTGATTATTTGGCTCCGCTCATAGCCCTGCCTTCCTCGGAGGAGCCATCGGTGTCGCGTGCGTGTGGAGTATCTGCAGACATGACTGCGTGGAGGAGATTCCAGTCGCTGCTCCTGCTTCTCGGGCTGCTGGTGCTGTGCGCGAGGCTCCTCACTGCAGCGAAGG
SEQ ID NO:258 CSMD1之外顯子2
GTCAGAACTGTGGAGGCTTAGTCCAGGGTCCCAATGGCACTATTGAGAGCCCAGGGTTTCCTCACGGGTATCCGAACTATGCCAACTGCACCTGGATCATCATCACGGGCGAGCGCAATAGGATACAGTTGTCCTTCCATACCTTTGCTCTTGAAGAAGATTTTGATATTTTATCAGTTTACGATGGACAGCCTCAACAAGGGAATTTAAAAGTGAG
SEQ ID NO:259 CSMD1之外顯子3
ATTATCGGGATTTCAGCTGCCCTCCTCTATAGTGAGTACAGGATCTATCCTCACTCTGTGGTTCACGACAGACTTCGCTGTGAGTGCCCAAGGTTTCAAAGCATTATATGAAG
SEQ ID NO:260 CSMD1之外顯子4
TTTTACCTAGCCACACTTGTGGAAATCCTGGAGAAATCCTGAAAGGAGTTCTGCATGGAACGAGATTCAACATAGGAGACAAAATCCGGTACAGCTGCCTCCCTGGCTACATCTTGGAAGGCCACGCCATCCTGACCTGCATCGTCAGCCCAGGAAATGGTGCATCGTGGGACTTCCCAGCTCCCTTTTGCAGAG
SEQ ID NO:261 CSMD1之外顯子5
CTGAGGGAGCCTGCGGAGGAACCTTACGCGGGACCAGCAGCTCCATCTCCAGCCCGCACTTCCCTTCAGAGTACGAGAACAACGCGGACTGCACCTGGACCATTCTGGCTGAGCCCGGGGACACCATTGCGCTGGTCTTCACTGACTTTCAGCTAGAAGAAGGATATGATTTCTTAGAGATCAGTGGCACGGAAGCTCCATCCATATG
SEQ ID NO:262 CSMD1之外顯子6
GCTAACTGGCATGAACCTCCCCTCTCCAGTTATCAGTAGCAAGAATTGGCTACGACTCCATTTCACCTCTGACAGCAACCACCGACGCAAAGGATTTAACGCTCAGTTCCAAG
SEQ ID NO:263 CSMD1之外顯子7
TGAAAAAGGCGATTGAGTTGAAGTCAAGAGGAGTCAAGATGCTGCCCAGCAAGGATGGAAGCCATAAAAACTCTGTCT
SEQ ID NO:264 CSMD1之外顯子8
TGAGCCAAGGAGGTGTTGCATTGGTCTCTGACATGTGTCCAGATCCTGGGATTCCAGAAAATGGTAGAAGAGCAGGTTCCGACTTCAG
SEQ ID NO:265 CSMD1之外顯子9
GGTTGGTGCAAATGTACAGTTTTCATGTGAGGACAATTACGTGCTCCAGGGATCTAAAAGCATCACCTGTCAGAGAGTTACAGAGACGCTCGCTGCTTGGAGTGACCACAGGCCCATCTGCCGAG
SEQ ID NO:266 CSMD1之外顯子10
CGAGAACATGTGGATCCAATCTGCGTGGGCCCAGCGGCGTCATTACCTCCCCTAATTATCCGGTTCAGTATGAAGATAATGCACACTGTGTGTGGGTCATCACCACCACCGACCCGGACAAG
SEQ ID NO:267 CSMD1之外顯子11
GTCATCAAGCTTGCCTTTGAAGAGTTTGAGCTGGAGCGAGGCTATGACACCCTGACGGTTGGTGATGCTGGGAAGGTGGGAGACACCAGATCGGTCTTGTACGT
SEQ ID NO:268 CSMD1之外顯子12
GCTCACGGGATCCAGTGTTCCTGACCTCATTGTGAGCATGAGCAACCAGATGTGGCTACATCTGCAGTCGGATGATAGCATTGGCTCACCTGGGTTTAAAGCTGTTTACCAAG
SEQ ID NO:269 CSMD1之外顯子13
AAATTGAAAAGGGAGGGTGTGGGGATCCTGGAATCCCCGCCTATGGGAAGCGGACGGGCAGCAGTTTCCTCCATGGAGATACACTCACCTTTGAATGCCCGGCGGCCTTTGAGCTGGTGGGGGAGAGAGTTATCACCTGTCAGCAGAACAATCAGTGGTCTGGCAACAAGCCCAGCTGTGTAT
SEQ ID NO:270 CSMD1之外顯子14
TTTCATGTTTCTTCAACTTTACGGCATCATCTGGGATTATTCTGTCACCAAATTATCCAGAGGAATATGGGAACAACATGAACTGTGTCTGGTTGATTATCTCGGAGCCAGGAAGTCGAATTCACCTAATCTTTAATGATTTTGATGTTGAGCCTCAGTTTGACTTTCTCGCGGTCAAGGATGATGGCATTTCTGACATAACTGTCCTGGGTACTTTTTCTGGCAATGAAGTGCCTTCCCAGCTGGCCAGCAGTGGGCATATAGTTCGCTTGGAATTTCAGTCTGACCATTCCACTACTGGCAGAGGGTTCAACATCACTTACACCA
SEQ ID NO:271 CSMD1之外顯子15
CATTTGGTCAGAATGAGTGCCATGATCCTGGCATTCCTATAAACGGACGACGTTTTGGTGACAGGTTTCTACTCGGGAGCTCGGTTTCTTTCCACTGTGATGATGGCTTTGTCAAGACCCAGGGATCCGAGTCCATTACCTGCATACTGCAAGACGGGAACGTGGTCTGGAGCTCCACCGTGCCCCGCTGTGAAG
SEQ ID NO:272 CSMD1之外顯子16
CTCCATGTGGTGGACATCTGACAGCGTCCAGCGGAGTCATTTTGCCTCCTGGATGGCCAGGATATTATAAGGATTCTTTACATTGTGAATGGATAATTGAAGCAAAACCAGGCCACTCTATCAAAATAACTTTTGACAG
SEQ ID NO:273 CSMD1之外顯子17
ATTTCAGACAGAGGTCAATTATGACACCTTGGAGGTCAGAGATGGGCCAGCCAGTTCGTCCCCACTGATCGGCGAGTACCACGGCACCCAGGCACCCCAGTTCCTCATCAGCACCGGGAACTTCATGTACCTGCTGTTCACCACTGACAACAGCCGCTCCAGCATCGGCTTCCTCATCCACTATGAGA
SEQ ID NO:274 CSMD1之外顯子18
GTGTGACGCTTGAGTCGGATTCCTGCCTGGACCCGGGCATCCCTGTGAACGGCCATCGCCACGGTGGAGACTTTGGCATCAGGTCCACAGTGACTTTCAGCTGTGACCCGGGGTACACACTAAGTGACGACGAGCCCCTCGTCTGTGAGAGGAACCACCAGTGGAACCACGCCTTGCCCAGCTGCGACG
SEQ ID NO:275 CSMD1之外顯子19
CTCTATGTGGAGGCTACATCCAAGGGAAGAGTGGAACAGTCCTTTCTCCTGGGTTTCCAGATTTTTATCCAAACTCTCTAAACTGCACGTGGACCATTGAAGTGTCTCATGGGAAAG
SEQ ID NO:276 CSMD1之外顯子20
GAGTTCAAATGATCTTTCACACCTTTCATCTTGAGAGTTCCCACGACTATTTACTGATCACAGAGGATGGAAGTTTTTCCGAGCCCGTTGCCAGGCTCACCGGGTCGGTGTTGCCTCATACGATCAAGGCAGGCCTGTTTGGAAACTTCACTGCCCAGCTTCGGTTTATATCAGACTTCTCAATTTCGTACGAGGGCTTCAATATCACATTTTCAG
SEQ ID NO:277 CSMD1之外顯子21
AATATGACCTGGAGCCATGTGATGATCCTGGAGTCCCTGCCTTCAGCCGAAGAATTGGTTTTCACTTTGGTGTGGGAGACTCTCTGACGTTTTCCTGCTTCCTGGGATATCGTTTAGAAGGTGCCACCAAGCTTACCTGCCTGGGTGGGGGCCGCCGTGTGTGGAGTGCACCTCTGCCAAGGTGTGTGG
SEQ ID NO:278 CSMD1之外顯子22
CCGAATGTGGAGCAAGTGTCAAAGGAAATGAAGGAACATTACTGTCTCCAAATTTTCCATCCAATTATGATAATAACCATGAGTGTATCTATAAAATAGAAACAGAAGCCGGCAAGGGCATCCACCTTAGAACACGAAGCTTCCAGCTGTTTGAAGGAGATACTCTAAAG
SEQ ID NO:279 CSMD1之外顯子23
GTATATGATGGAAAAGACAGTTCCTCACGTCCACTGGGCACGTTCACTAAAAATGAACTTCTGGGGCTGATCCTAAACAGCACATCCAATCACCTGTGGCTAGAGTTCAACACCAATGGATCTGACACCGACCAAGGTTTTCAACTCACCTATACCA
SEQ ID NO:280 CSMD1之外顯子24
GTTTTGATCTGGTAAAATGTGAGGATCCGGGCATCCCTAACTACGGCTATAGGATCCGTGATGAAGGCCACTTTACCGACACTGTAGTTCTGTACAGTTGCAACCCGGGGTACGCCATGCATGGCAGCAACACCCTGACCTGTTTGAGTGGAGACAGGAGAGTGTGGGACAAACCACTACCTTCGTGCATAG
SEQ ID NO:281 CSMD1之全部47個外顯子24-70按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:282 CSMD1之全部70個外顯子1-70按順序排列的多核苷酸序列
CTCCACGGCAGCGGCTCCTTGTGCCACTAGCAGCCCTTCTTCTGCGCTCTCCGCCTTTTCTCTCTAGACTGGATCTCTCCTCCCCCCCGCGCCCCCCTCCCCGCATCTCCCACTCGCTGGCTCTCTCTCCAGCTGCCTCCTCTCCAGGTCTCTCCTGGCTGCGCGCGCTCCTCTCCCCGCTTCTCCCCCTCCCGCAGCCTCGCCGCCTTGGTGCCTTCCTGCCCGGCTCGGCCGGCGCTCGTCCCCGGCCCCGGCCCCGCCAGCCCGGGTCTCCGCGCTCGGAGCAGCTCAGCCCTGCAGTGGCTCGGGACCCGATGCTATGAGAGGGAAGCGAGCCGGGCGCCCAGACCTTCAGGAGGCGTCGGATGCGCGGCGGGTCTTGGGACCGGGCTCTCTCTCCGGCTCGCCTTGCCCTCGGGTGATTATTTGGCTCCGCTCATAGCCCTGCCTTCCTCGGAGGAGCCATCGGTGTCGCGTGCGTGTGGAGTATCTGCAGACATGACTGCGTGGAGGAGATTCCAGTCGCTGCTCCTGCTTCTCGGGCTGCTGGTGCTGTGCGCGAGGCTCCTCACTGCAGCGAAGGGTCAGAACTGTGGAGGCTTAGTCCAGGGTCCCAATGGCACTATTGAGAGCCCAGGGTTTCCTCACGGGTATCCGAACTATGCCAACTGCACCTGGATCATCATCACGGGCGAGCGCAATAGGATACAGTTGTCCTTCCATACCTTTGCTCTTGAAGAAGATTTTGATATTTTATCAGTTTACGATGGACAGCCTCAACAAGGGAATTTAAAAGTGAGATTATCGGGATTTCAGCTGCCCTCCTCTATAGTGAGTACAGGATCTATCCTCACTCTGTGGTTCACGACAGACTTCGCTGTGAGTGCCCAAGGTTTCAAAGCATTATATGAAGTTTTACCTAGCCACACTTGTGGAAATCCTGGAGAAATCCTGAAAGGAGTTCTGCATGGAACGAGATTCAACATAGGAGACAAAATCCGGTACAGCTGCCTCCCTGGCTACATCTTGGAAGGCCACGCCATCCTGACCTGCATCGTCAGCCCAGGAAATGGTGCATCGTGGGACTTCCCAGCTCCCTTTTGCAGAGCTGAGGGAGCCTGCGGAGGAACCTTACGCGGGACCAGCAGCTCCATCTCCAGCCCGCACTTCCCTTCAGAGTACGAGAACAACGCGGACTGCACCTGGACCATTCTGGCTGAGCCCGGGGACACCATTGCGCTGGTCTTCACTGACTTTCAGCTAGAAGAAGGATATGATTTCTTAGAGATCAGTGGCACGGAAGCTCCATCCATATGGCTAACTGGCATGAACCTCCCCTCTCCAGTTATCAGTAGCAAGAATTGGCTACGACTCCATTTCACCTCTGACAGCAACCACCGACGCAAAGGATTTAACGCTCAGTTCCAAGTGAAAAAGGCGATTGAGTTGAAGTCAAGAGGAGTCAAGATGCTGCCCAGCAAGGATGGAAGCCATAAAAACTCTGTCTTGAGCCAAGGAGGTGTTGCATTGGTCTCTGACATGTGTCCAGATCCTGGGATTCCAGAAAATGGTAGAAGAGCAGGTTCCGACTTCAGGGTTGGTGCAAATGTACAGTTTTCATGTGAGGACAATTACGTGCTCCAGGGATCTAAAAGCATCACCTGTCAGAGAGTTACAGAGACGCTCGCTGCTTGGAGTGACCACAGGCCCATCTGCCGAGCGAGAACATGTGGATCCAATCTGCGTGGGCCCAGCGGCGTCATTACCTCCCCTAATTATCCGGTTCAGTATGAAGATAATGCACACTGTGTGTGGGTCATCACCACCACCGACCCGGACAAGGTCATCAAGCTTGCCTTTGAAGAGTTTGAGCTGGAGCGAGGCTATGACACCCTGACGGTTGGTGATGCTGGGAAGGTGGGAGACACCAGATCGGTCTTGTACGTGCTCACGGGATCCAGTGTTCCTGACCTCATTGTGAGCATGAGCAACCAGATGTGGCTACATCTGCAGTCGGATGATAGCATTGGCTCACCTGGGTTTAAAGCTGTTTACCAAGAAATTGAAAAGGGAGGGTGTGGGGATCCTGGAATCCCCGCCTATGGGAAGCGGACGGGCAGCAGTTTCCTCCATGGAGATACACTCACCTTTGAATGCCCGGCGGCCTTTGAGCTGGTGGGGGAGAGAGTTATCACCTGTCAGCAGAACAATCAGTGGTCTGGCAACAAGCCCAGCTGTGTATTTTCATGTTTCTTCAACTTTACGGCATCATCTGGGATTATTCTGTCACCAAATTATCCAGAGGAATATGGGAACAACATGAACTGTGTCTGGTTGATTATCTCGGAGCCAGGAAGTCGAATTCACCTAATCTTTAATGATTTTGATGTTGAGCCTCAGTTTGACTTTCTCGCGGTCAAGGATGATGGCATTTCTGACATAACTGTCCTGGGTACTTTTTCTGGCAATGAAGTGCCTTCCCAGCTGGCCAGCAGTGGGCATATAGTTCGCTTGGAATTTCAGTCTGACCATTCCACTACTGGCAGAGGGTTCAACATCACTTACACCACATTTGGTCAGAATGAGTGCCATGATCCTGGCATTCCTATAAACGGACGACGTTTTGGTGACAGGTTTCTACTCGGGAGCTCGGTTTCTTTCCACTGTGATGATGGCTTTGTCAAGACCCAGGGATCCGAGTCCATTACCTGCATACTGCAAGACGGGAACGTGGTCTGGAGCTCCACCGTGCCCCGCTGTGAAGCTCCATGTGGTGGACATCTGACAGCGTCCAGCGGAGTCATTTTGCCTCCTGGATGGCCAGGATATTATAAGGATTCTTTACATTGTGAATGGATAATTGAAGCAAAACCAGGCCACTCTATCAAAATAACTTTTGACAGATTTCAGACAGAGGTCAATTATGACACCTTGGAGGTCAGAGATGGGCCAGCCAGTTCGTCCCCACTGATCGGCGAGTACCACGGCACCCAGGCACCCCAGTTCCTCATCAGCACCGGGAACTTCATGTACCTGCTGTTCACCACTGACAACAGCCGCTCCAGCATCGGCTTCCTCATCCACTATGAGAGTGTGACGCTTGAGTCGGATTCCTGCCTGGACCCGGGCATCCCTGTGAACGGCCATCGCCACGGTGGAGACTTTGGCATCAGGTCCACAGTGACTTTCAGCTGTGACCCGGGGTACACACTAAGTGACGACGAGCCCCTCGTCTGTGAGAGGAACCACCAGTGGAACCACGCCTTGCCCAGCTGCGACGCTCTATGTGGAGGCTACATCCAAGGGAAGAGTGGAACAGTCCTTTCTCCTGGGTTTCCAGATTTTTATCCAAACTCTCTAAACTGCACGTGGACCATTGAAGTGTCTCATGGGAAAGGAGTTCAAATGATCTTTCACACCTTTCATCTTGAGAGTTCCCACGACTATTTACTGATCACAGAGGATGGAAGTTTTTCCGAGCCCGTTGCCAGGCTCACCGGGTCGGTGTTGCCTCATACGATCAAGGCAGGCCTGTTTGGAAACTTCACTGCCCAGCTTCGGTTTATATCAGACTTCTCAATTTCGTACGAGGGCTTCAATATCACATTTTCAGAATATGACCTGGAGCCATGTGATGATCCTGGAGTCCCTGCCTTCAGCCGAAGAATTGGTTTTCACTTTGGTGTGGGAGACTCTCTGACGTTTTCCTGCTTCCTGGGATATCGTTTAGAAGGTGCCACCAAGCTTACCTGCCTGGGTGGGGGCCGCCGTGTGTGGAGTGCACCTCTGCCAAGGTGTGTGGCCGAATGTGGAGCAAGTGTCAAAGGAAATGAAGGAACATTACTGTCTCCAAATTTTCCATCCAATTATGATAATAACCATGAGTGTATCTATAAAATAGAAACAGAAGCCGGCAAGGGCATCCACCTTAGAACACGAAGCTTCCAGCTGTTTGAAGGAGATACTCTAAAGGTATATGATGGAAAAGACAGTTCCTCACGTCCACTGGGCACGTTCACTAAAAATGAACTTCTGGGGCTGATCCTAAACAGCACATCCAATCACCTGTGGCTAGAGTTCAACACCAATGGATCTGACACCGACCAAGGTTTTCAACTCACCTATACCAGTTTTGATCTGGTAAAATGTGAGGATCCGGGCATCCCTAACTACGGCTATAGGATCCGTGATGAAGGCCACTTTACCGACACTGTAGTTCTGTACAGTTGCAACCCGGGGTACGCCATGCATGGCAGCAACACCCTGACCTGTTTGAGTGGAGACAGGAGAGTGTGGGACAAACCACTACCTTCGTGCATAGCGGAATGTGGTGGTCAGATCCATGCAGCCACATCAGGACGAATATTGTCCCCTGGCTATCCAGCTCCGTATGACAACAACCTCCACTGCACCTGGATTATAGAGGCAGACCCAGGAAAGACCATTAGCCTCCATTTCATTGTTTTCGACACGGAGATGGCTCACGACATCCTCAAGGTCTGGGACGGGCCGGTGGACAGTGACATCCTGCTGAAGGAGTGGAGTGGCTCCGCCCTTCCGGAGGACATCCACAGCACCTTCAACTCACTCACCCTGCAGTTCGACAGCGACTTCTTCATCAGCAAGTCTGGCTTCTCCATCCAGTTCTCCACCTCAATTGCAGCCACCTGTAACGATCCAGGTATGCCCCAAAATGGCACCCGCTATGGAGACAGCAGAGAGGCTGGAGACACCGTCACATTCCAGTGTGACCCTGGCTATCAGCTCCAAGGACAAGCCAAAATCACCTGTGTGCAGCTGAATAACCGGTTCTTTTGGCAACCAGACCCTCCTACATGCATAGCTGCTTGTGGAGGGAATCTGACGGGCCCAGCAGGTGTTATTTTGTCACCCAACTACCCACAGCCGTATCCTCCTGGGAAGGAATGTGACTGGAGAGTAAAAGTGAACCCGGACTTTGTCATCGCCTTGATATTCAAAAGTTTCAACATGGAGCCCAGCTATGACTTCCTACACATCTATGAAGGGGAAGATTCCAACAGCCCCCTCATTGGGAGTTACCAGGGCTCTCAGGCCCCAGAAAGAATAGAGAGTAGCGGAAACAGCCTGTTTCTGGCATTTCGGAGTGATGCCTCCGTGGGCCTTTCAGGGTTCGCCATTGAATTTAAAGAGAAACCACGGGAAGCTTGTTTTGACCCAGGAAATATAATGAATGGGACAAGAGTTGGAACAGACTTCAAGCTTGGCTCCACCATCACCTACCAGTGTGACTCTGGCTATAAGATTCTTGACCCCTCATCCATCACCTGTGTGATTGGGGCTGATGGGAAACCCTCCTGGGACCAAGTGCTGCCCTCCTGCAATGCTCCCTGTGGAGGCCAGTACACGGGATCAGAAGGGGTAGTTTTATCACCAAACTACCCCCATAATTACACAGCTGGTCAAATATGCCTCTATTCCATCACGGTACCAAAGGAATTCGTGGTCTTTGGACAGTTTGCCTATTTCCAGACAGCCCTGAATGATTTGGCAGAATTATTTGATGGAACCCATGCACAGGCCAGACTTCTCAGCTCACTCTCGGGGTCTCACTCAGGGGAAACATTGCCCTTGGCTACGTCAAATCAAATTCTGCTCCGATTCAGTGCAAAGAGCGGTGCCTCTGCCCGCGGCTTCCACTTCGTGTATCAAGCTGTTCCTCGTACCAGTGACACCCAATGCAGCTCTGTCCCCGAGCCCAGATACGGAAGGAGAATTGGTTCTGAGTTTTCTGCCGGCTCCATCGTCCGATTCGAGTGCAACCCGGGATACCTGCTTCAGGGTTCCACGGCGCTCCACTGCCAGTCCGTGCCCAACGCCTTGGCACAGTGGAACGACACGATCCCCAGCTGTGTGGTACCCTGCAGTGGCAATTTCACTCAACGAAGAGGTACAATCCTGTCCCCCGGCTACCCTGAGCCATACGGAAACAACTTGAACTGTATATGGAAGATCATAGTTACGGAGGGCTCGGGAATTCAGATCCAAGTGATCAGTTTTGCCACGGAGCAGAACTGGGACTCCCTTGAGATCCACGATGGTGGGGATGTGACCGCACCCAGACTGGGAAGCTTCTCAGGCACCACAGTACCGGCACTGCTGAACAGTACTTCCAACCAACTCTACCTGCATTTCCAGTCTGACATTAGTGTGGCAGCTGCTGGTTTCCACCTGGAATACAAAACTGTAGGTCTTGCTGCATGCCAAGAACCAGCCCTCCCCAGCAACAGCATCAAAATCGGAGATCGGTACATGGTGAACGACGTGCTCTCCTTCCAGTGCGAGCCCGGGTACACCCTGCAGGGCCGTTCCCACATTTCCTGTATGCCAGGGACCGTTCGCCGTTGGAACTATCCGTCTCCCCTGTGCATTGCAACCTGTGGAGGGACGCTGAGCACCTTGGGTGGTGTGATCCTGAGCCCCGGCTTCCCAGGTTCTTACCCCAACAACTTAGACTGCACCTGGAGGATCTCATTACCCATCGGCTATGGTGCACATATTCAGTTTCTGAATTTTTCTACCGAAGCTAATCATGACTTCCTTGAAATTCAAAATGGACCTTACCACACCAGCCCCATGATTGGACAATTTAGCGGCACGGATCTCCCCGCGGCCCTGCTGAGCACAACGCATGAAACCCTCATCCACTTTTATAGTGACCATTCGCAAAACCGGCAAGGATTTAAACTTGCTTACCAAGCCTATGAATTACAGAACTGTCCAGATCCACCCCCATTTCAGAATGGGTACATGATCAACTCGGATTACAGCGTGGGGCAATCAGTATCTTTCGAGTGTTATCCTGGGTACATTCTAATAGGCCATCCTGTCCTCACTTGTCAGCATGGGATCAACAGAAACTGGAACTACCCTTTTCCAAGATGTGATGCCCCTTGTGGGTACAACGTAACTTCTCAGAACGGCACCATCTACTCCCCTGGCTTTCCTGATGAGTATCCGATCCTGAAGGACTGCATTTGGCTCATCACGGTGCCTCCAGGGCACGGAGTTTACATCAACTTCACCCTGTTACAGACGGAAGCTGTCAACGATTACATTGCTGTTTGGGACGGTCCCGATCAGAACTCACCCCAGCTGGGAGTTTTCAGTGGCAACACAGCCCTCGAAACGGCGTATAGCTCCACCAACCAAGTCCTGCTCAAGTTCCACAGCGACTTTTCAAATGGAGGCTTCTTTGTCCTCAATTTCCACGCATTTCAGCTCAAGAAATGTCAACCTCCCCCAGCGGTTCCACAGGCAGAAATGCTTACTGAGGATGATGATTTCGAAATAGGAGATTTTGTGAAGTACCAGTGCCACCCCGGGTACACCTTGGTGGGGACCGACATTCTGACTTGCAAGCTCAGTTCCCAGTTGCAGTTTGAGGGTTCTCTCCCAACATGTGAAGCACAATGCCCAGCAAATGAAGTCCGGACTGGATCATCGGGAGTCATTCTCAGTCCAGGGTATCCGGGTAATTATTTTAACTCCCAGACTTGCTCTTGGAGTATTAAAGTGGAACCAAACTACAACATTACCATCTTTGTGGACACATTTCAAAGTGAAAAGCAGTTTGATGCACTGGAAGTGTTTGATGGTTCTTCTGGGCAAAGTCCTCTGCTAGTAGTCTTAAGTGGGAATCATACTGAACAATCAAATTTTACAAGCAGGAGTAATCAGTTATATCTCCGCTGGTCCACTGACCATGCCACCAGTAAGAAAGGATTCAAGATTCGCTATGCAGCACCTTACTGCAGTTTGACCCACCCCCTGAAGAATGGGGGTATTCTAAACAGGACTGCAGGAGCGGTTGGAAGCAAAGTGCATTATTTTTGCAAGCCTGGATACCGAATGGTCGGCCACAGCAATGCAACCTGTAGACGAAACCCACTTGGCATGTACCAGTGGGACTCCCTCACGCCACTCTGCCAGGCTGTGTCCTGTGGAATCCCAGAATCCCCAGGAAACGGTTCATTTACCGGGAACGAGTTCACTTTGGACAGTAAAGTGGTCTATGAATGTCATGAGGGCTTCAAGCTTGAATCCAGCCAGCAAGCAACAGCCGTGTGTCAAGAAGATGGGTTGTGGAGTAACAAGGGGAAGCCGCCCACGTGTAAGCCGGTCGCTTGCCCCAGCATTGAAGCTCAGCTCTCAGAACATGTCATCTGGAGGCTGGTTTCAGGATCCTTGAATGAGTACGGTGCTCAAGTATTGCTGAGCTGCAGTCCTGGTTACTACTTAGAAGGCTGGAGGCTCCTGCGGTGCCAGGCCAATGGGACGTGGAACATAGGAGATGAGAGGCCAAGCTGTCGAGTTATCTCGTGTGGAAGCCTTTCCTTTCCCCCAAATGGCAACAAGATTGGAACGTTGACAGTTTATGGGGCCACAGCTATATTTACGTGCAACACCGGCTACACGCTTGTGGGGTCTCATGTCAGAGAGTGCTTGGCAAATGGGCTCTGGAGCGGCAGCGAAACTCGATGTCTGGCTGGCCACTGCGGTTCCCCAGACCCGATTGTGAACGGTCACATTAGTGGAGATGGCTTCAGTTACAGAGACACGGTGGTTTACCAGTGCAATCCTGGTTTCCGGCTTGTGGGAACTTCCGTGAGGATATGCCTGCAAGACCACAAGTGGTCTGGACAAACGCCTGTCTGTGTCCCCATCACATGTGGTCACCCTGGAAACCCTGCCCACGGATTCACTAATGGCAGTGAGTTCAACCTGAATGATGTCGTGAATTTCACCTGCAACACGGGCTATTTGCTGCAGGGCGTGTCTCGAGCCCAGTGTCGGAGCAACGGCCAGTGGAGTAGCCCTCTGCCCACGTGTCGAGTGGTGAACTGTTCTGATCCAGGCTTTGTGGAAAATGCCATTCGTCACGGGCAACAGAACTTCCCTGAGAGTTTTGAGTATGGAATGAGTATCCTGTACCATTGCAAGAAGGGATTTTACTTGCTGGGATCTTCAGCCTTGACCTGTATGGCAAATGGCTTATGGGACCGATCCCTGCCCAAGTGTTTGGCTATATCGTGTGGACACCCAGGGGTCCCTGCCAACGCCGTCCTCACTGGAGAGCTGTTTACCTATGGCGCCGTCGTGCACTACTCCTGCAGAGGGAGCGAGAGCCTCATAGGCAACGACACGAGAGTGTGCCAGGAAGACAGTCACTGGAGCGGGGCACTGCCCCACTGCACAGGAAATAATCCTGGATTCTGTGGTGATCCGGGGACCCCAGCACATGGGTCTCGGCTTGGTGATGACTTTAAGACAAAGAGTCTTCTCCGCTTCTCCTGTGAAATGGGGCACCAGCTGAGGGGCTCCCCTGAACGCACGTGTTTGCTCAATGGGTCATGGTCAGGACTGCAGCCGGTGTGTGAGGCCGTGTCCTGTGGCAACCCTGGCACACCCACCAACGGAATGATTGTCAGTAGTGATGGCATTCTGTTCTCCAGCTCGGTCATCTATGCCTGCTGGGAAGGCTACAAGACCTCAGGGCTCATGACACGGCATTGCACAGCCAATGGGACCTGGACAGGCACTGCTCCCGACTGCACAATTATAAGTTGTGGGGATCCAGGCACACTAGCAAATGGCATCCAGTTTGGGACCGACTTCACCTTCAACAAGACTGTGAGCTATCAGTGTAACCCAGGCTATGTCATGGAAGCAGTCACATCCGCCACTATTCGCTGTACCAAAGACGGCAGGTGGAATCCGAGCAAACCTGTCTGCAAAGCCGTGCTGTGTCCTCAGCCGCCGCCGGTGCAGAATGGAACAGTGGAGGGAAGTGATTTCCGCTGGGGCTCCAGCATAAGTTACAGCTGCATGGACGGTTACCAGCTCTCTCACTCCGCCATCCTCTCCTGTGAAGGTCGCGGGGTGTGGAAAGGAGAGATCCCCCAGTGTCTCCCTGTGTTCTGCGGAGACCCTGGCATCCCCGCAGAAGGGCGACTTAGTGGGAAAAGTTTCACCTATAAGTCCGAAGTCTTCTTCCAGTGCAAATCTCCATTTATACTCGTGGGATCCTCCAGAAGAGTCTGCCAAGCTGACGGCACGTGGAGCGGCATACAACCCACCTGCATTGATCCTGCTCATAACACCTGCCCAGACCCTGGTACGCCACACTTTGGAATACAGAATAGCTCCAGAGGCTATGAGGTTGGAAGCACGGTTTTTTTCAGGTGCAGAAAAGGCTACCATATTCAAGGTTCCACGACTCGCACCTGCCTTGCCAATTTAACATGGAGTGGGATACAGACCGAATGTATACCTCATGCCTGCAGACAGCCAGAAACCCCGGCACACGCGGATGTGAGAGCCATCGATCTTCCTACTTTCGGCTACACCTTAGTGTACACCTGCCATCCAGGCTTTTTCCTCGCAGGGGGATCTGAGCACAGAACATGTAAAGCAGACATGAAATGGACAGGAAAGTCGCCTGTGTGTAAAAGTAAAGGAGTGAGAGAAGTTAATGAAACAGTTACTAAAACTCCAGTTCCTTCAGATGTCTTTTTCGTCAATTCACTGTGGAAGGGGTATTATGAATATTTAGGGAAAAGACAACCCGCCACTCTAACTGTTGACTGGTTCAATGCAACAAGCAGTAAGGTGAATGCCACCTTCAGCGAAGCCTCGCCAGTGGAGCTGAAGTTGACAGGCATTTACAAGAAGGAGGAGGCCCACTTACTCCTGAAAGCTTTTCAAATTAAAGGCCAGGCAGATATTTTTGTAAGCAAGTTCGAAAATGACAACTGGGGACTAGATGGTTATGTGTCATCTGGACTTGAAAGAGGAGGATTTACTTTTCAAGGTGACATTCATGGAAAAGACTTTGGAAAATTTAAGCTAGAAAGGCAAGATCCTTTAAACCCAGATCAAGACTCTTCCAGTCATTACCACGGCACCAGCAGTGGCTCTGTGGCGGCTGCCATTCTGGTTCCTTTCTTTGCTCTAATTTTATCAGGGTTTGCATTTTACCTCTACAAACACAGAACGAGACCAAAAGTTCAATACAATGGCTATGCTGGGCATGAAAACAGCAATGGACAAGCATCGTTTGAAAACCCCATGTATGATACAAACTTAAAACCCACAGAAGCCAAGGCTGTGAGGTTTGACACAACTCTGAACACAGTCTGTACAGTGGTATAGCCCTCAGTGCCCCAACAGGACTGATTCATAGCCATACCTCTGATGGACAAGCAGTGATTCCTTTGGTGCCATATACCACTCTCCCTTCCACTCTGGCTTTACTGCAGCGATCTTCAACCTTGTCTACTGGCATAAGTGCAGCGGGGATCTCTACTCAAATGTGTCAGGGTCTTCTACGGATCAAACTACACATGCGTTTTCATTCCAAAAGTGGGTTCTAAATGCCTGGCTGCATCTGTATGAAATCAAGGCACACTCCAGGAAGACTGCCACGTCGCGCCAACACGTCATACTCAATGCCTCAGACTTTCATATTTCTGTGTTGCTGAGATGCCTTTCAATGCAATCGTCTGGGCTCGTGGATATGTCCCTCAGGTGCGGTGACAGAATGGTGGCACCACGATATGTGTTCTCTTGTGTTGTTTTTCCTTTTTAAACCCCCATGAACACGAATACTCTGAAAAAAATAAAAAGCTTTCTGGAAGAAGACACCTTTCTGATAGAGGCTCACACCTACAAATGCTTCACTCTGTCCTTCCGAGACCTGACAAGCTTTGAGGACCTCACAGCTCCCCTGTGTGTTCATCTCTAGGGATGTTTGCAATTTCCCAGTCAGCTGTTCTGTCGCAGAATGTTTAATGCACAATTTTTTGCACTAGTGTGTTATGAATGACTAAGATTCTGATAAAAAAAATAAATTATTTACACAGGGTTTATACACACTATCCATTGTATATAAGCATTATTTCATATTATCAAGCTAAACATTCCCCCATCAGCTTAGTTGGAGTGTTAGGGAAAAGTATTCCTAGATATGGCACAGATTTTAAAAGGAAATACAGTATTGAAGAGATTTATTTTATTATTGCTTCAATTAGCTCCATTTACGTGTTGAATTCATTGAAGAGGTCCAATGAGAAAAAAACAGAAGCCTCCTTATTTCACACGTTTTCCTCCTTTAGTACCATCCTCATCCAATTACTGTCTCTCTGATACTACTTAATAGCAGGGGGTTTGCAGAAATTTCTGTTTGCCATGTAAAACTGTGAATAGTAATTTATTTTAGATAGTCGATGAACTTGTGGGTTTTAGCTCACAATGCAGCCTTCCCTTTTGCAGTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTACTGTGCCATCGATCTTTGATATTGCATTGAAAGACAATATACCACAGTAGCACCTTGAACTCAGTGAAAATTGTTCAGGATCAAAATACCAAGTGTTCTTTTAGAGGGAAGGAAAAAGTACACACACTCTCCTCTCACAATGATATATTTTATACATTCATTTGTTATTTGTTTCATGCTTTATGATTCCAGATGGAAAGGTAATTTCAGTGACTTTTCAAGTTTAAATTCCATTATAGGTAAATGATAAGTTATGATGCAAATAAAATCTATAAGATCCCCAGGGCAAATAAAAATCAAAACATGAAGTAGAAGATGTGGCCGTGAGGTAGTTTATGTAACAAATTCAAAGTGAAAATCATGTTTACTTTTACTTATACTTATTTGATAAAAATATTTTTGAAACGATAGTACTTATTTTATTATTTGATATTTCAGTTCCTATTCAATTGTGGCAGATTTTCTCTGTTTCACATTTTAGATTGGCGTTGGTAATAGAAATGTCAGAATGTTCAAATTGGCCTTCACGTTGTCGGAGTGAACACATTGACACCTAGCTTTAAGACTGATTTATCTGTTGGTGTACTGAAGGTTTCCATGTAGGACTTCAAATGTGGAAAAGGAAAAGCAGTCAGGAAAATGGGGCATTCTTTGGAGAGTCACGCGTTTTGATTCGGACATTTCCGTAGAGCTCGGCTCCCAGTGTTGTGTTCCTCGGTCGAAAGGGTCTCTGCTGTTTGGGGACTCACTGGCCTCTCCTAGGGACTCCTTTGTCTTGTGAACCCCACGCTGTTGGATTCTGTATCATTATGCTGAATTCTCTGCACAGTTTTCCCTGGCCAACCTGCCCACATCCTTGGAGATTTGCTTTGCCAGTGGGAATCCTTACATTGCTGTTTCACAGTAGACGGGACGAGGTCAGCGGGAGTCGTGCTCCTAACACACACATTGAACGAAACAGAAGATGATTGAAAGTGTGAGGAGGCTCGTGTGCAAGGGAGAACAGGGTTACTATACATATTAGTGTATATATATACATACATATATATATATATATATTGTACATATCTAAGTTTGAGTCATTCAAACTAGGTGCAAAATGCTGACTTCAGAGTCTGAATTAACATCTCTGTTCCCATATCCCTGACCTGCTCCCTGGTCAACGATGCTATGAAATCCTGAAATGACAGGACATACATACATACAAGAAACCACATATCAAATTAGATATGATTTTCCTTTGTGTGCAAAGTCAAACTGTCCTAGGGTTGCCAGTTTGAAGCATGTTATTTAAATGAAAAAAAAAATCAGTGAAATTCTCGTGTGAGAATTCTGCCTAGTTTCTTCCTAAGGTTGTGTGCAGTGTTGAACGGCGTCTCCGCAAGGTGTTGGAGGATCTCATTTTAGGGCAGTCAGGAGCTGTGCTTGCTGAGTTAGGTCTAGAAGACTCTTCCCTGAAGGCAACGGGAACACGCGTGAGGGACGCGACCACACACTAACAGAGGACACGTGCTTCAGAGCTGTTTAAAACTGCTGCTTGTTTTACACACACATCTTGCCTTTTTTCAGGCTAGCTGCAATAATTTTTTTCTTCTGTAAAATATTTTGTAAACAACAACAAAAAGCTATTATAAAAAGGGGGTAAAAAAAAGAACGCTGGCATTATGATCAGGAAAACCCATTGTCATCGCCGACCCTCCCTCCCGTCCCACCACACGCTGCTGTCACGACGTAGGTGCGAAAGACCTTTTTGTACAGAGATATATTTTTTATGAAGAATTTGTAAAATTATTAAATATGCTGTAATTTTTTGATTAATGTAGGTACATTGTTAAAAAATAAATGTTTTTACAATACAGAACTGTAATTTTCCCAATAATGTAAAATGTACCATCTCTAGCTGATTTTCAGTTCCAATCCTATTACACATGTATTAATATTAAAGTGGCCTGTTAAAATGAACAGTATCTTTTTTTTGTCAAAAAAATTATAAAGAGGGTGTAATATAGCCTGTGCAATGCCACCAATCTTTAAAGCAAATCAGAGTTCTAATTAAATATTTAATTTTA
SEQ ID NO:283 CSMD1之外顯子1的轉譯多肽序列
MTAWRRFQSLLLLLGLLVLCARLLTAAK
SEQ ID NO:284 CSMD1之外顯子2的轉譯多肽序列
QNCGGLVQGPNGTIESPGFPHGYPNYANCTWIIITGERNRIQLSFHTFALEEDFDILSVYDGQPQQGNLKV
SEQ ID NO:285 CSMD1之外顯子3的轉譯多肽序列
LSGFQLPSSIVSTGSILTLWFTTDFAVSAQGFKALYE
SEQ ID NO:286 CSMD1之外顯子4的轉譯多肽序列
LPSHTCGNPGEILKGVLHGTRFNIGDKIRYSCLPGYILEGHAILTCIVSPGNGASWDFPAPFCR
SEQ ID NO:287 CSMD1之外顯子5的轉譯多肽序列
EGACGGTLRGTSSSISSPHFPSEYENNADCTWTILAEPGDTIALVFTDFQLEEGYDFLEISGTEAPSI
SEQ ID NO:288 CSMD1之外顯子6的轉譯多肽序列
LTGMNLPSPVISSKNWLRLHFTSDSNHRRKGFNAQFQ
SEQ ID NO:289 CSMD1之外顯子7的轉譯多肽序列
KKAIELKSRGVKMLPSKDGSHKNSV
SEQ ID NO:290 CSMD1之外顯子8的轉譯多肽序列
SQGGVALVSDMCPDPGIPENGRRAGSDF
SEQ ID NO:291 CSMD1之外顯子9的轉譯多肽序列
VGANVQFSCEDNYVLQGSKSITCQRVTETLAAWSDHRPICR
SEQ ID NO:292 CSMD1之外顯子10的轉譯多肽序列
RTCGSNLRGPSGVITSPNYPVQYEDNAHCVWVITTTDPDK
SEQ ID NO:293 CSMD1之外顯子11的轉譯多肽序列
VIKLAFEEFELERGYDTLTVGDAGKVGDTRSVLY
SEQ ID NO:294 CSMD1之外顯子12的轉譯多肽序列
LTGSSVPDLIVSMSNQMWLHLQSDDSIGSPGFKAVYQ
SEQ ID NO:295 CSMD1之外顯子13的轉譯多肽序列
IEKGGCGDPGIPAYGKRTGSSFLHGDTLTFECPAAFELVGERVITCQQNNQWSGNKPSCV
SEQ ID NO:296 CSMD1之外顯子14的轉譯多肽序列
SCFFNFTASSGIILSPNYPEEYGNNMNCVWLIISEPGSRIHLIFNDFDVEPQFDFLAVKDDGISDITVLGTFSGNEVPSQLASSGHIVRLEFQSDHSTTGRGFNITYT
SEQ ID NO:297 CSMD1之外顯子15的轉譯多肽序列
FGQNECHDPGIPINGRRFGDRFLLGSSVSFHCDDGFVKTQGSESITCILQDGNVVWSSTVPRCE
SEQ ID NO:298 CSMD1之外顯子16的轉譯多肽序列
PCGGHLTASSGVILPPGWPGYYKDSLHCEWIIEAKPGHSIKITFD
SEQ ID NO:299 CSMD1之外顯子17的轉譯多肽序列
FQTEVNYDTLEVRDGPASSSPLIGEYHGTQAPQFLISTGNFMYLLFTTDNSRSSIGFLIHYE
SEQ ID NO:300 CSMD1之外顯子18的轉譯多肽序列
VTLESDSCLDPGIPVNGHRHGGDFGIRSTVTFSCDPGYTLSDDEPLVCERNHQWNHALPSCD
SEQ ID NO:301 CSMD1之外顯子19的轉譯多肽序列
LCGGYIQGKSGTVLSPGFPDFYPNSLNCTWTIEVSHGK
SEQ ID NO:302 CSMD1之外顯子20的轉譯多肽序列
VQMIFHTFHLESSHDYLLITEDGSFSEPVARLTGSVLPHTIKAGLFGNFTAQLRFISDFSISYEGFNITFS
SEQ ID NO:303 CSMD1之外顯子21的轉譯多肽序列
YDLEPCDDPGVPAFSRRIGFHFGVGDSLTFSCFLGYRLEGATKLTCLGGGRRVWSAPLPRCV
SEQ ID NO:304 CSMD1之外顯子22的轉譯多肽序列
ECGASVKGNEGTLLSPNFPSNYDNNHECIYKIETEAGKGIHLRTRSFQLFEGDTLK
SEQ ID NO:305 CSMD1之外顯子23的轉譯多肽序列
VYDGKDSSSRPLGTFTKNELLGLILNSTSNHLWLEFNTNGSDTDQGFQLTYT
SEQ ID NO:306 CSMD1之外顯子24的轉譯多肽序列
FDLVKCEDPGIPNYGYRIRDEGHFTDTVVLYSCNPGYAMHGSNTLTCLSGDRRVWDKPLPSCI
SEQ ID NO:307 來自外顯子24-70之全部47個外顯子按順序排列的轉譯多肽序列
SEQ ID NO:308 全蛋白質序列
MTAWRRFQSLLLLLGLLVLCARLLTAAKGQNCGGLVQGPNGTIESPGFPHGYPNYANCTWIIITGERNRIQLSFHTFALEEDFDILSVYDGQPQQGNLKVRLSGFQLPSSIVSTGSILTLWFTTDFAVSAQGFKALYEVLPSHTCGNPGEILKGVLHGTRFNIGDKIRYSCLPGYILEGHAILTCIVSPGNGASWDFPAPFCRAEGACGGTLRGTSSSISSPHFPSEYENNADCTWTILAEPGDTIALVFTDFQLEEGYDFLEISGTEAPSIWLTGMNLPSPVISSKNWLRLHFTSDSNHRRKGFNAQFQVKKAIELKSRGVKMLPSKDGSHKNSVLSQGGVALVSDMCPDPGIPENGRRAGSDFRVGANVQFSCEDNYVLQGSKSITCQRVTETLAAWSDHRPICRARTCGSNLRGPSGVITSPNYPVQYEDNAHCVWVITTTDPDKVIKLAFEEFELERGYDTLTVGDAGKVGDTRSVLYVLTGSSVPDLIVSMSNQMWLHLQSDDSIGSPGFKAVYQEIEKGGCGDPGIPAYGKRTGSSFLHGDTLTFECPAAFELVGERVITCQQNNQWSGNKPSCVFSCFFNFTASSGIILSPNYPEEYGNNMNCVWLIISEPGSRIHLIFNDFDVEPQFDFLAVKDDGISDITVLGTFSGNEVPSQLASSGHIVRLEFQSDHSTTGRGFNITYTTFGQNECHDPGIPINGRRFGDRFLLGSSVSFHCDDGFVKTQGSESITCILQDGNVVWSSTVPRCEAPCGGHLTASSGVILPPGWPGYYKDSLHCEWIIEAKPGHSIKITFDRFQTEVNYDTLEVRDGPASSSPLIGEYHGTQAPQFLISTGNFMYLLFTTDNSRSSIGFLIHYESVTLESDSCLDPGIPVNGHRHGGDFGIRSTVTFSCDPGYTLSDDEPLVCERNHQWNHALPSCDALCGGYIQGKSGTVLSPGFPDFYPNSLNCTWTIEVSHGKGVQMIFHTFHLESSHDYLLITEDGSFSEPVARLTGSVLPHTIKAGLFGNFTAQLRFISDFSISYEGFNITFSEYDLEPCDDPGVPAFSRRIGFHFGVGDSLTFSCFLGYRLEGATKLTCLGGGRRVWSAPLPRCVAECGASVKGNEGTLLSPNFPSNYDNNHECIYKIETEAGKGIHLRTRSFQLFEGDTLKVYDGKDSSSRPLGTFTKNELLGLILNSTSNHLWLEFNTNGSDTDQGFQLTYTSFDLVKCEDPGIPNYGYRIRDEGHFTDTVVLYSCNPGYAMHGSNTLTCLSGDRRVWDKPLPSCIAECGGQIHAATSGRILSPGYPAPYDNNLHCTWIIEADPGKTISLHFIVFDTEMAHDILKVWDGPVDSDILLKEWSGSALPEDIHSTFNSLTLQFDSDFFISKSGFSIQFSTSIAATCNDPGMPQNGTRYGDSREAGDTVTFQCDPGYQLQGQAKITCVQLNNRFFWQPDPPTCIAACGGNLTGPAGVILSPNYPQPYPPGKECDWRVKVNPDFVIALIFKSFNMEPSYDFLHIYEGEDSNSPLIGSYQGSQAPERIESSGNSLFLAFRSDASVGLSGFAIEFKEKPREACFDPGNIMNGTRVGTDFKLGSTITYQCDSGYKILDPSSITCVIGADGKPSWDQVLPSCNAPCGGQYTGSEGVVLSPNYPHNYTAGQICLYSITVPKEFVVFGQFAYFQTALNDLAELFDGTHAQARLLSSLSGSHSGETLPLATSNQILLRFSAKSGASARGFHFVYQAVPRTSDTQCSSVPEPRYGRRIGSEFSAGSIVRFECNPGYLLQGSTALHCQSVPNALAQWNDTIPSCVVPCSGNFTQRRGTILSPGYPEPYGNNLNCIWKIIVTEGSGIQIQVISFATEQNWDSLEIHDGGDVTAPRLGSFSGTTVPALLNSTSNQLYLHFQSDISVAAAGFHLEYKTVGLAACQEPALPSNSIKIGDRYMVNDVLSFQCEPGYTLQGRSHISCMPGTVRRWNYPSPLCIATCGGTLSTLGGVILSPGFPGSYPNNLDCTWRISLPIGYGAHIQFLNFSTEANHDFLEIQNGPYHTSPMIGQFSGTDLPAALLSTTHETLIHFYSDHSQNRQGFKLAYQAYELQNCPDPPPFQNGYMINSDYSVGQSVSFECYPGYILIGHPVLTCQHGINRNWNYPFPRCDAPCGYNVTSQNGTIYSPGFPDEYPILKDCIWLITVPPGHGVYINFTLLQTEAVNDYIAVWDGPDQNSPQLGVFSGNTALETAYSSTNQVLLKFHSDFSNGGFFVLNFHAFQLKKCQPPPAVPQAEMLTEDDDFEIGDFVKYQCHPGYTLVGTDILTCKLSSQLQFEGSLPTCEAQCPANEVRTGSSGVILSPGYPGNYFNSQTCSWSIKVEPNYNITIFVDTFQSEKQFDALEVFDGSSGQSPLLVVLSGNHTEQSNFTSRSNQLYLRWSTDHATSKKGFKIRYAAPYCSLTHPLKNGGILNRTAGAVGSKVHYFCKPGYRMVGHSNATCRRNPLGMYQWDSLTPLCQAVSCGIPESPGNGSFTGNEFTLDSKVVYECHEGFKLESSQQATAVCQEDGLWSNKGKPPTCKPVACPSIEAQLSEHVIWRLVSGSLNEYGAQVLLSCSPGYYLEGWRLLRCQANGTWNIGDERPSCRVISCGSLSFPPNGNKIGTLTVYGATAIFTCNTGYTLVGSHVRECLANGLWSGSETRCLAGHCGSPDPIVNGHISGDGFSYRDTVVYQCNPGFRLVGTSVRICLQDHKWSGQTPVCVPITCGHPGNPAHGFTNGSEFNLNDVVNFTCNTGYLLQGVSRAQCRSNGQWSSPLPTCRVVNCSDPGFVENAIRHGQQNFPESFEYGMSILYHCKKGFYLLGSSALTCMANGLWDRSLPKCLAISCGHPGVPANAVLTGELFTYGAVVHYSCRGSESLIGNDTRVCQEDSHWSGALPHCTGNNPGFCGDPGTPAHGSRLGDDFKTKSLLRFSCEMGHQLRGSPERTCLLNGSWSGLQPVCEAVSCGNPGTPTNGMIVSSDGILFSSSVIYACWEGYKTSGLMTRHCTANGTWTGTAPDCTIISCGDPGTLANGIQFGTDFTFNKTVSYQCNPGYVMEAVTSATIRCTKDGRWNPSKPVCKAVLCPQPPPVQNGTVEGSDFRWGSSISYSCMDGYQLSHSAILSCEGRGVWKGEIPQCLPVFCGDPGIPAEGRLSGKSFTYKSEVFFQCKSPFILVGSSRRVCQADGTWSGIQPTCIDPAHNTCPDPGTPHFGIQNSSRGYEVGSTVFFRCRKGYHIQGSTTRTCLANLTWSGIQTECIPHACRQPETPAHADVRAIDLPTFGYTLVYTCHPGFFLAGGSEHRTCKADMKWTGKSPVCKSKGVREVNETVTKTPVPSDVFFVNSLWKGYYEYLGKRQPATLTVDWFNATSSKVNATFSEASPVELKLTGIYKKEEAHLLLKAFQIKGQADIFVSKFENDNWGLDGYVSSGLERGGFTFQGDIHGKDFGKFKLERQDPLNPDQDSSSHYHGTSSGSVAAAILVPFFALILSGFAFYLYKHRTRPKVQYNGYAGHENSNGQASFENPMYDTNLKPTEAKAVRFDTTLNTVCTVV-
SEQ ID NO:309 CSMD1之全部23個外顯子1-23按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:310 來自CSMD1之全部23個外顯子1-23按順序排列的轉譯多肽序列
PTN 序列資訊SEQ ID NO: 311 PTN-NRG1融合物5’處之PTN外顯子4序列
CCAGAACTGGAAGTCTGAAGCGAGCCCTGCACAATGCCGAATGCCAGAAGACTGTCACCATCTCCAAGCCCTGTGGCAAACTGACCAAGCCCAAACCTCAAG
SEQ ID NO: 312 PTN-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAACCAGTTCTGAATACTCCTCTCTCAGATT
SEQ ID NO: 313 PTN-NRG1多核苷酸序列
CCAGAACTGGAAGTCTGAAGCGAGCCCTGCACAATGCCGAATGCCAGAAGACTGTCACCATCTCCAAGCCCTGTGGCAAACTGACCAAGCCCAAACCTCAAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAACCAGTTCTGAATACTCCTCTCTCAGATT
SEQ ID NO: 314 PTN-NRG1多肽序列
RTGSLKRALHNAECQKTVTISKPCGKLTKPKPQALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCETSSEYSSLR
SEQ ID NO:315 PTN之外顯子1
AAGGGGAAATAAGGGACAAGAGAGACCCTCTCATATTGTTTTATATTATTTCATACTCAGAAAAGGAAAGAGAAGCCAAACAAAAGGCAGGTAACCCAGCGCCTAGGAACCAGACCCGAAACCAAGGAACCAGATCTGAAACCAGGCCTGGGCCTGCCTGACCTAAGCCTGGTAGTAAAAATTCCACCCCTGACCTGACCTGGCAACTGTTGTTATCTACAGATTCCAGACATTGTATGGAAGGACACTGTGAAACCTCCCGTTCTGTTCTGTTTCACTCTGACCATCGGTGCTCACAGCCCCTATCACGTACCCCCTGGCTTGCTCAGTCGATCACGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAGAGTTGTTAGCCCTTAAAAGGGACAGAAGTTGAGCACCTGAGGAGCTCAGATTTTAAGACGCTAGGCTGCTGATGCTCCCAGCTGATTAAAGCCACTCCCTTCACTATCTCGGTGTCTCCTGTCCGCGGCTCGTCCTGCTACATTTCTTGGTTCCCTGACCGGCAAGCGAG
SEQ ID NO:316 PTN之外顯子2
AATGCAGGCTCAACAGTACCAGCAGCAGCGTCGAAAATTTGCAGCTGCCTTCTTGGCATTCATTTTCATACTGGCAGCTGTGGATACTGCTGAAGCAGGGAAGAAAGAGAAACCAG
SEQ ID NO:317 PTN之外顯子3
AAAAAAAAGTGAAGAAGTCTGACTGTGGAGAATGGCAGTGGAGTGTGTGTGTGCCCACCAGTGGAGACTGTGGGCTGGGCACACGGGAGGGCACTCGGACTGGAGCTGAGTGCAAGCAAACCATGAAGACCCAGAGATGTAAGATCCCCTGCAACTGGAAGAAGCAATTTGGCG
SEQ ID NO:318 PTN之外顯子4
CGGAGTGCAAATACCAGTTCCAGGCCTGGGGAGAATGTGACCTGAACACAGCCCTGAAGACCAGAACTGGAAGTCTGAAGCGAGCCCTGCACAATGCCGAATGCCAGAAGACTGTCACCATCTCCAAGCCCTGTGGCAAACTGACCAAGCCCAAACCTCAAG
SEQ ID NO:319 PTN之外顯子5
CAGAATCTAAGAAGAAGAAAAAGGAAGGCAAGAAACAGGAGAAGATGCTGGATTAAAAGATGTCACCTGTGGAACATAAAAAGGACATCAGCAAACAGGATCAGTTAACTATTGCATTTATATGTACCGTAGGCTTTGTATTCAAAAATTATCTATAGCTAAGTACACAATAAGCAAAAACAAAAAGAAAAGAAAATTTTTGTAGTAGCGTTTTTTAAATGTATACTATAGTACCAGTAGGGGCTTATAATAAAGGACTGTAATCTTATTTAGGAAGTTGACTTATAGTACATGATAAATGATAGACAATTGAGGTAAGTTTTTTGAAATTATGTGACATTTTACATTAAATTTTTTTTACATTTTTTGGGCAGCAATTTAAATGTTATGACTATGTAAACTACTTCTCTTGTTAGGTAATTTTTTTCACCTAGATTTTTTTCCCAATTGAGAAAAATATATACTAAACAAAATAGCAATAAAACATAATCACTCTATTTGAAGAAAATATCTTGTTTTCTGCCAATAGATTTTTTAAAATGTAGTCAGCAAAATGGGGGTGGGGAAGCAGAGCATGTCCTAGTTCAATGTTGACTTTTTTTTTTTTTAAAGAAAAGCATTAAGACATAAAATTCTTTCACTTTGGCAGAAGCATTTGTTTTCTTGATGAAATTATTTTTCCATCTGAGGAAAAAAATACTAGGAAAATAAATCAAGGTGATGCTGAAAAAAAAA
SEQ ID NO:320 PTN之全部5個外顯子1-5按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:321 PTN之外顯子2的轉譯多肽序列
MQAQQYQQQRRKFAAAFLAFIFILAAVDTAEAGKKEKP
SEQ ID NO:322 PTN之外顯子3的轉譯多肽序列
KKVKKSDCGEWQWSVCVPTSGDCGLGTREGTRTGAECKQTMKTQRCKIPCNWKKQFG
SEQ ID NO:323 PTN之外顯子4的轉譯多肽序列
ECKYQFQAWGECDLNTALKTRTGSLKRALHNAECQKTVTISKPCGKLTKPKPQ
SEQ ID NO:324 PTN之外顯子5
ESKKKKKEGKKQEKMLD
SEQ ID NO:325 全蛋白質序列
MQAQQYQQQRRKFAAAFLAFIFILAAVDTAEAGKKEKPEKKVKKSDCGEWQWSVCVPTSGDCGLGTREGTRTGAECKQTMKTQRCKIPCNWKKQFGAECKYQFQAWGECDLNTALKTRTGSLKRALHNAECQKTVTISKPCGKLTKPKPQAESKKKKKEGKKQEKMLD
SEQ ID NO:326 PTN之全部4個外顯子1-4按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:327 PTN之全部3個外顯子2-4按順序排列的轉譯多肽序列
ST14 序列資訊SEQ ID NO: 328 ST14-NRG1融合物5’處之ST14外顯子11序列
CAACAGCAACAAGATCACAGTTCGCTTCCACTCAGATCAGTCCTACACCGACACCGGCTTCTTAGCTGAATACCTCTCCTACGACTCCAGTGACC
SEQ ID NO: 329 ST14-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCT
SEQ ID NO: 330 ST14-NRG1多核苷酸序列
CAACAGCAACAAGATCACAGTTCGCTTCCACTCAGATCAGTCCTACACCGACACCGGCTTCTTAGCTGAATACCTCTCCTACGACTCCAGTGACCCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCT
SEQ ID NO: 331 ST14-NRG1多肽序列
NSNKITVRFHSDQSYTDTGFLAEYLSYDSSDPTSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGEC
SEQ ID NO:332 ST14之外顯子1
GTGAGAGCGGAGCTGCAGCCGGAGAAAGAGGAAGAGGGAGAGAGAGCGCGCCAGGGCGAGGGCACCGCCGCCGGTCGGGCGCGCTGGGCCTGCCCGGAATCCCGCCGCCTGCGCCCCGCGCCCCGCGCCCTGCGGGCCATGGGAGCCGGCCGCCGGCAGGGACGACGCCTGTGAGACCCGCGAGCGGCCTCGGGGACCATGGGGAGCGATCGGGCCCGCAAGGGCGGAGGGGGCCCGAAGGACTTCGGCGCGGGACTCAAGTACAACTCCCGGCACGAG
SEQ ID NO:333 ST14之外顯子2
AAAGTGAATGGCTTGGAGGAAGGCGTGGAGTTCCTGCCAGTCAACAACGTCAAGAAGGTGGAAAAGCATGGCCCGGGGCGCTGGGTGGTGCTGGCAGCCGTGCTGATCGGCCTCCTCTTGGTCTTGCTGGGGATCGGCTTCCTGGTGTGGCATTTGCAGT
SEQ ID NO:334 ST14之外顯子3
ACCGGGACGTGCGTGTCCAGAAGGTCTTCAATGGCTACATGAGGATCACAAATGAGAATTTTGTGGATGCCTACGAGAACTCCAACTCCACTGAGTTTGTAAGCCTGGCCAGCAAGGTGAAGGACGCG
SEQ ID NO:335 ST14之外顯子4
CTGAAGCTGCTGTACAGCGGAGTCCCATTCCTGGGCCCCTACCACAAGGAGTCGGCTGTGACGGCCTTCAG
SEQ ID NO:336 ST14之外顯子5
CGAGGGCAGCGTCATCGCCTACTACTGGTCTGAGTTCAGCATCCCGCAGCACCTGGTGGAGGAGGCCGAGCGCGTCATGGCCGAGGAGCGCGTAGTCATGCTGCCCCCGCGGGCGCGCTCCCTGAAGTCCTTTGTGGTCACCTCAGTGGTGGCTTTCC
SEQ ID NO:337 ST14之外顯子6
CCACGGACTCCAAAACAGTACAGAGGACCCAGGACA
SEQ ID NO:338 ST14之外顯子7
ACAGCTGCAGCTTTGGCCTGCACGCCCGCGGTGTGGAGCTGATGCGCTTCACCACGCCCGGCTTCCCTGACAGCCCCTACCCCGCTCATGCCCGCTGCCAGTGGGCCCTGCGGGGGGACGCCGACTCAGTGCTGAGCCTCACCTTCCGCAGCTTTGACCTTGCGTCCTGCGACGAGCGCGGCAGCGACCTGGTGACGGTGTACAACACCCTGAGCCCCATGGAGCCCCACGCCCTGGTGCA
SEQ ID NO:339 ST14之外顯子8
GTTGTGTGGCACCTACCCTCCCTCCTACAACCTGACCTTCCACTCCTCCCAGAACGTCCTGCTCATCACACTGATAACCAACACTGAGCGGCGGCATCCCGGCTTTGAGGCCACCTTCTTCCAGCTGCCTAGGATGAGCA
SEQ ID NO:340 ST14之外顯子9
GCTGTGGAGGCCGCTTACGTAAAGCCCAGGGGACATTCAACAGCCCCTACTACCCAGGCCACTACCCACCCAACATTGACTGCACATGGAACATTGAG
SEQ ID NO:341 ST14之外顯子10
GTGCCCAACAACCAGCATGTGAAGGTGCGCTTCAAATTCTTCTACCTGCTGGAGCCCGGCGTGCCTGCGGGCACCTGCCCCAAGGACTACGTGGAGATCAACGGGGAGAA
SEQ ID NO:342 ST14之外顯子11
ATACTGCGGAGAGAGGTCCCAGTTCGTCGTCACCAGCAACAGCAACAAGATCACAGTTCGCTTCCACTCAGATCAGTCCTACACCGACACCGGCTTCTTAGCTGAATACCTCTCCTACGACTCCAGTGACC
SEQ ID NO:343 ST14之外顯子12
CATGCCCGGGGCAGTTCACGTGCCGCACGGGGCGGTGTATCCGGAAGGAGCTGCGCTGTGATGGCTGGGCCGACTGCACCGACCACAGCGATGAGCTCAACTGCA
SEQ ID NO:344 ST14之外顯子13
GTTGCGACGCCGGCCACCAGTTCACGTGCAAGAACAAGTTCTGCAAGCCCCTCTTCTGGGTCTGCGACAGTGTGAACGACTGCGGAGACAACAGCGACGAGCAGGGGTGCA
SEQ ID NO:345 ST14之外顯子14
GTTGTCCGGCCCAGACCTTCAGGTGTTCCAATGGGAAGTGCCTCTCGAAAAGCCAGCAGTGCAATGGGAAGGACGACTGTGGGGACGGGTCCGACGAGGCCTCCTGCCCCAAGG
SEQ ID NO:346 ST14之外顯子15
TGAACGTCGTCACTTGTACCAAACACACCTACCGCTGCCTCAATGGGCTCTGCTTGAGCAAGGGCAACCCTGAGTGTGACGGGAAGGAGGACTGTAGCGACGGCTCAGATGAGAAGGACTGCG
SEQ ID NO:347 ST14之外顯子16
ACTGTGGGCTGCGGTCATTCACGAGACAGGCTCGTGTTGTTGGGGGCACGGATGCGGATGAGGGCGAGTGGCCCTGGCAGGTAAGCCTGCATGCTCTGGGCCAGGGCCACATCTGCGGTGCTTCCCTCATCTCTCCCAACTGGCTGGTCTCTGCCGCACACTGCTACATCGATGACAGAGGATTCAG
SEQ ID NO:348 ST14之外顯子17
GTACTCAGACCCCACGCAGTGGACGGCCTTCCTGGGCTTGCACGACCAGAGCCAGCGCAGCGCCCCTGGGGTGCAGGAGCGCAGGCTCAAGCGCATCATCTCCCACCCCTTCTTCAATGACTTCACCTTCGACTATGACATCGCGCTGCTGGAGCTGGAGAAACCGGCAGAGTACAGCTCCATGGTGCGGCCCATCTGCCTGCCGGACGCCTCCCATGTCTTCCCTGCCGGCAAGGCCATCTGGGTCACGGGCTGGGGACACACCCAGTATGGAG
SEQ ID NO:349 ST14之外顯子18
GCACTGGCGCGCTGATCCTGCAAAAGGGTGAGATCCGCGTCATCAACCAGACCACCTGCGAGAACCTCCTGCCGCAGCAGATCACGCCGCGCATGATGTGCGTGGGCTTCCTCAGCGGCGGCGTGGACTCCTGCCAG
SEQ ID NO:350 ST14之外顯子19
GGTGATTCCGGGGGACCCCTGTCCAGCGTGGAGGCGGATGGGCGGATCTTCCAGGCCGGTGTGGTGAGCTGGGGAGACGGCTGCGCTCAGAGGAACAAGCCAGGCGTGTACACAAGGCTCCCTCTGTTTCGGGACTGGATCAAAGAGAACACTGGGGTATAGGGGCCGGGGCCACCCAAATGTGTACACCTGCGGGGCCACCCATCGTCCACCCCAGTGTGCACGCCTGCAGGCTGGAGACTGGACCGCTGACTGCACCAGCGCCCCCAGAACATACACTGTGAACTCAATCTCCAGGGCTCCAAATCTGCCTAGAAAACCTCTCGCTTCCTCAGCCTCCAAAGTGGAGCTGGGAGGTAGAAGGGGAGGACACTGGTGGTTCTACTGACCCAACTGGGGGCAAAGGTTTGAAGACACAGCCTCCCCCGCCAGCCCCAAGCTGGGCCGAGGCGCGTTTGTGCATATCTGCCTCCCCTGTCTCTAAGGAGCAGCGGGAACGGAGCTTCGGGGCCTCCTCAGTGAAGGTGGTGGGGCTGCCGGATCTGGGCTGTGGGGCCCTTGGGCCACGCTCTTGAGGAAGCCCAGGCTCGGAGGACCCTGGAAAACAGACGGGTCTGAGACTGAAATTGTTTTACCAGCTCCCAGGGTGGACTTCAGTGTGTGTATTTGTGTAAATGAGTAAAACATTTTATTTCTTTTTA
SEQ ID NO:351 全mRNA多核苷酸序列
SEQ ID NO:352 ST14之外顯子1的轉譯多肽序列
MGSDRARKGGGGPKDFGAGLKYNSRHE
SEQ ID NO:353 ST14之外顯子2的轉譯多肽序列
KVNGLEEGVEFLPVNNVKKVEKHGPGRWVVLAAVLIGLLLVLLGIGFLVWHLQ
SEQ ID NO:354 ST14之外顯子3的轉譯多肽序列
RDVRVQKVFNGYMRITNENFVDAYENSNSTEFVSLASKVKDA
SEQ ID NO:355 ST14之外顯子4的轉譯多肽序列
LKLLYSGVPFLGPYHKESAVTAF
SEQ ID NO:356 ST14之外顯子5的轉譯多肽序列
EGSVIAYYWSEFSIPQHLVEEAERVMAEERVVMLPPRARSLKSFVVTSVVAF
SEQ ID NO:357 ST14之外顯子6的轉譯多肽序列
TDSKTVQRTQD
SEQ ID NO:358 ST14之外顯子7的轉譯多肽序列
SCSFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPAHARCQWALRGDADSVLSLTFRSFDLASCDERGSDLVTVYNTLSPMEPHALV
SEQ ID NO:359 ST14之外顯子8的轉譯多肽序列
LCGTYPPSYNLTFHSSQNVLLITLITNTERRHPGFEATFFQLPRMS
SEQ ID NO:360 ST14之外顯子9的轉譯多肽序列
CGGRLRKAQGTFNSPYYPGHYPPNIDCTWNIE
SEQ ID NO:361 ST14之外顯子10的轉譯多肽序列
VPNNQHVKVRFKFFYLLEPGVPAGTCPKDYVEINGE
SEQ ID NO:362 ST14之外顯子11的轉譯多肽序列
YCGERSQFVVTSNSNKITVRFHSDQSYTDTGFLAEYLSYDSSD
SEQ ID NO:363 ST14之外顯子12的轉譯多肽序列NM_021978.4
CPGQFTCRTGRCIRKELRCDGWADCTDHSDELNC
SEQ ID NO:364 ST14之外顯子13的轉譯多肽序列
CDAGHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGC
SEQ ID NO:365 ST14之外顯子14的轉譯多肽序列
CPAQTFRCSNGKCLSKSQQCNGKDDCGDGSDEASCPK
SEQ ID NO:366 ST14之外顯子15的轉譯多肽序列
NVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEKDC
SEQ ID NO:367 ST14之外顯子16的轉譯多肽序列
CGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSLHALGQGHICGASLISPNWLVSAAHCYIDDRGF
SEQ ID NO:368 ST14之外顯子17的轉譯多肽序列
YSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQERRLKRIISHPFFNDFTFDYDIALLELEKPAEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWGHTQYG
SEQ ID NO:369 ST14之外顯子18的轉譯多肽序列
TGALILQKGEIRVINQTTCENLLPQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQ
SEQ ID NO:370 ST14之外顯子19的轉譯多肽序列
GDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGDGCAQRNKPGVYTRLPLFRDWIKENTGV
SEQ ID NO:371 全蛋白質序列
MGSDRARKGGGGPKDFGAGLKYNSRHEKVNGLEEGVEFLPVNNVKKVEKHGPGRWVVLAAVLIGLLLVLLGIGFLVWHLQYRDVRVQKVFNGYMRITNENFVDAYENSNSTEFVSLASKVKDALKLLYSGVPFLGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSIPQHLVEEAERVMAEERVVMLPPRARSLKSFVVTSVVAFPTDSKTVQRTQDNSCSFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPAHARCQWALRGDADSVLSLTFRSFDLASCDERGSDLVTVYNTLSPMEPHALVQLCGTYPPSYNLTFHSSQNVLLITLITNTERRHPGFEATFFQLPRMSSCGGRLRKAQGTFNSPYYPGHYPPNIDCTWNIEVPNNQHVKVRFKFFYLLEPGVPAGTCPKDYVEINGEKYCGERSQFVVTSNSNKITVRFHSDQSYTDTGFLAEYLSYDSSDPCPGQFTCRTGRCIRKELRCDGWADCTDHSDELNCSCDAGHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGCSCPAQTFRCSNGKCLSKSQQCNGKDDCGDGSDEASCPKVNVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEKDCDCGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSLHALGQGHICGASLISPNWLVSAAHCYIDDRGFRYSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQERRLKRIISHPFFNDFTFDYDIALLELEKPAEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWGHTQYGGTGALILQKGEIRVINQTTCENLLPQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGDGCAQRNKPGVYTRLPLFRDWIKENTGV
SEQ ID NO:372 ST14之全部11個外顯子1-11按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:373 ST14之全部11個外顯子1-11按順序排列的轉譯多肽序列
THBS1 序列資訊SEQ ID NO: 374 THBS1-NRG1融合物5’處之THBS1外顯子9序列
ACCCTGTGAAGGCGAAGCGCGGGAGACCAAAGCCTGCAAGAAAGACGCCTGCCCCA
SEQ ID NO: 375 THBS1-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCTTC
SEQ ID NO: 376 THBS1-NRG1多核苷酸序列
ACCCTGTGAAGGCGAAGCGCGGGAGACCAAAGCCTGCAAGAAAGACGCCTGCCCCACTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCTTC
SEQ ID NO: 377 THBS1-NRG1多肽序列
PCEGEARETKACKKDACPTTSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECF
SEQ ID NO:378 THBS1之外顯子1
AGCCGCTGCGCCCGAGCTGGCCTGCGAGTTCAGGGCTCCTGTCGCTCTCCAGGAGCAACCTCTACTCCGGACGCACAGGCATTCCCCGCGCCCCTCCAGCCCTCGCCGCCCTCGCCACCGCTCCCGGCCGCCGCGCTCCGGTACACACAG
SEQ ID NO:379 THBS1之外顯子2
GATCCCTGCTGGGCACCAACAGCTCCACCATGGGGCTGGCCTGGGGACTAGGCGTCCTGTTCCTGATGCATGTGTGTGGCACCAACCGCATTCCAG
SEQ ID NO:380 THBS1之外顯子3
AGTCTGGCGGAGACAACAGCGTGTTTGACATCTTTGAACTCACCGGGGCCGCCCGCAAGGGGTCTGGGCGCCGACTGGTGAAGGGCCCCGACCCTTCCAGCCCAGCTTTCCGCATCGAGGATGCCAACCTGATCCCCCCTGTGCCTGATGACAAGTTCCAAGACCTGGTGGATGCTGTGCGGGCAGAAAAGGGTTTCCTCCTTCTGGCATCCCTGAGGCAGATGAAGAAGACCCGGGGCACGCTGCTGGCCCTGGAGCGGAAAGACCACTCTGGCCAGGTCTTCAGCGTGGTGTCCAATGGCAAGGCGGGCACCCTGGACCTCAGCCTGACCGTCCAAGGAAAGCAGCACGTGGTGTCTGTGGAAGAAGCTCTCCTGGCAACCGGCCAGTGGAAGAGCATCACCCTGTTTGTGCAGGAAGACAGGGCCCAGCTGTACATCGACTGTGAAAAGATGGAGAATGCTGAGTTGGACGTCCCCATCCAAAGCGTCTTCACCAGAGACCTGGCCAGCATCGCCAGACTCCGCATCGCAAAGGGGGGCGTCAATGACAATTTCCAG
SEQ ID NO:381 THBS1之外顯子4
GGGGTGCTGCAGAATGTGAGGTTTGTCTTTGGAACCACACCAGAAGACATCCTCAGGAACAAAGGCTGCTCCAGCT
SEQ ID NO:382 THBS1之外顯子5
CTACCAGTGTCCTCCTCACCCTTGACAACAACGTGGTGAATGGTTCCAGCCCTGCCATCCGCACTAACTACATTGGCCACAAGACAAAGGACTTGCAAGCCATCTGCGGCATCTCCTGTGATGAGCTGTCCAGCATGGTCCTGGAACTCAGGGGCCTGCGCACCATTGTGACCACGCTGCAGGACAGCATCCGCAAAGTG
SEQ ID NO:383 THBS1之外顯子6
ACTGAAGAGAACAAAGAGTTGGCCAATGAGCTGAGGCGGCCTCCCCTATGCTATCACAACGGAGTTCAGTACAGAAATAACGAGGAATGGACTGTTGATAGCTGCACTGAGTGTCACTGTCAG
SEQ ID NO:384 THBS1之外顯子7
AACTCAGTTACCATCTGCAAAAAGGTGTCCTGCCCCATCATGCCCTGCTCCAATGCCACAGTTCCTGATGGAGAATGCTGTCCTCGCTGTTGGC
SEQ ID NO:385 THBS1之外顯子8
CCAGCGACTCTGCGGACGATGGCTGGTCTCCATGGTCCGAGTGGACCTCCTGTTCTACGAGCTGTGGCAATGGAATTCAGCAGCGCGGCCGCTCCTGCGATAGCCTCAACAACCGATGTGAGGGCTCCTCGGTCCAGACACGGACCTGCCACATTCAGGAGTGTGACAAGAGAT
SEQ ID NO:386 THBS1之外顯子9
TTAAACAGGATGGTGGCTGGAGCCACTGGTCCCCGTGGTCATCTTGTTCTGTGACATGTGGTGATGGTGTGATCACAAGGATCCGGCTCTGCAACTCTCCCAGCCCCCAGATGAACGGGAAACCCTGTGAAGGCGAAGCGCGGGAGACCAAAGCCTGCAAGAAAGACGCCTGCCCCA
SEQ ID NO:387 THBS1之全部13個外顯子10-22按順序排列的多核苷酸序列
TTAAACAGGATGGTGGCTGGAGCCACTGGTCCCCGTGGTCATCTTGTTCTGTGACATGTGGTGATGGTGTGATCACAAGGATCCGGCTCTGCAACTCTCCCAGCCCCCAGATGAACGGGAAACCCTGTGAAGGCGAAGCGCGGGAGACCAAAGCCTGCAAGAAAGACGCCTGCCCCATCAATGGAGGCTGGGGTCCTTGGTCACCATGGGACATCTGTTCTGTCACCTGTGGAGGAGGGGTACAGAAACGTAGTCGTCTCTGCAACAACCCCACACCCCAGTTTGGAGGCAAGGACTGCGTTGGTGATGTAACAGAAAACCAGATCTGCAACAAGCAGGACTGTCCAATTGATGGATGCCTGTCCAATCCCTGCTTTGCCGGCGTGAAGTGTACTAGCTACCCTGATGGCAGCTGGAAATGTGGTGCTTGTCCCCCTGGTTACAGTGGAAATGGCATCCAGTGCACAGATGTTGATGAGTGCAAAGAAGTGCCTGATGCCTGCTTCAACCACAATGGAGAGCACCGGTGTGAGAACACGGACCCCGGCTACAACTGCCTGCCCTGCCCCCCACGCTTCACCGGCTCACAGCCCTTCGGCCAGGGTGTCGAACATGCCACGGCCAACAAACAGGTGTGCAAGCCCCGTAACCCCTGCACGGATGGGACCCACGACTGCAACAAGAACGCCAAGTGCAACTACCTGGGCCACTATAGCGACCCCATGTACCGCTGCGAGTGCAAGCCTGGCTACGCTGGCAATGGCATCATCTGCGGGGAGGACACAGACCTGGATGGCTGGCCCAATGAGAACCTGGTGTGCGTGGCCAATGCGACTTACCACTGCAAAAAGGATAATTGCCCCAACCTTCCCAACTCAGGGCAGGAAGACTATGACAAGGATGGAATTGGTGATGCCTGTGATGATGACGATGACAATGATAAAATTCCAGATGACAGGGACAACTGTCCATTCCATTACAACCCAGCTCAGTATGACTATGACAGAGATGATGTGGGAGACCGCTGTGACAACTGTCCCTACAACCACAACCCAGATCAGGCAGACACAGACAACAATGGGGAAGGAGACGCCTGTGCTGCAGACATTGATGGAGACGGTATCCTCAATGAACGGGACAACTGCCAGTACGTCTACAATGTGGACCAGAGAGACACTGATATGGATGGGGTTGGAGATCAGTGTGACAATTGCCCCTTGGAACACAATCCGGATCAGCTGGACTCTGACTCAGACCGCATTGGAGATACCTGTGACAACAATCAGGATATTGATGAAGATGGCCACCAGAACAATCTGGACAACTGTCCCTATGTGCCCAATGCCAACCAGGCTGACCATGACAAAGATGGCAAGGGAGATGCCTGTGACCACGATGATGACAACGATGGCATTCCTGATGACAAGGACAACTGCAGACTCGTGCCCAATCCCGACCAGAAGGACTCTGACGGCGATGGTCGAGGTGATGCCTGCAAAGATGATTTTGACCATGACAGTGTGCCAGACATCGATGACATCTGTCCTGAGAATGTTGACATCAGTGAGACCGATTTCCGCCGATTCCAGATGATTCCTCTGGACCCCAAAGGGACATCCCAAAATGACCCTAACTGGGTTGTACGCCATCAGGGTAAAGAACTCGTCCAGACTGTCAACTGTGATCCTGGACTCGCTGTAGGTTATGATGAGTTTAATGCTGTGGACTTCAGTGGCACCTTCTTCATCAACACCGAAAGGGACGATGACTATGCTGGATTTGTCTTTGGCTACCAGTCCAGCAGCCGCTTTTATGTTGTGATGTGGAAGCAAGTCACCCAGTCCTACTGGGACACCAACCCCACGAGGGCTCAGGGATACTCGGGCCTTTCTGTGAAAGTTGTAAACTCCACCACAGGGCCTGGCGAGCACCTGCGGAACGCCCTGTGGCACACAGGAAACACCCCTGGCCAGGTGCGCACCCTGTGGCATGACCCTCGTCACATAGGCTGGAAAGATTTCACCGCCTACAGATGGCGTCTCAGCCACAGGCCAAAGACGGGTTTCATTAGAGTGGTGATGTATGAAGGGAAGAAAATCATGGCTGACTCAGGACCCATCTATGATAAAACCTATGCTGGTGGTAGACTAGGGTTGTTTGTCTTCTCTCAAGAAATGGTGTTCTTCTCTGACCTGAAATACGAATGTAGAGATCCCTAATCATCAAATTGTTGATTGAAAGACTGATCATAAACCAATGCTGGTATTGCACCTTCTGGAACTATGGGCTTGAGAAAACCCCCAGGATCACTTCTCCTTGGCTTCCTTCTTTTCTGTGCTTGCATCAGTGTGGACTCCTAGAACGTGCGACCTGCCTCAAGAAAATGCAGTTTTCAAAAACAGACTCAGCATTCAGCCTCCAATGAATAAGACATCTTCCAAGCATATAAACAATTGCTTTGGTTTCCTTTTGAAAAAGCATCTACTTGCTTCAGTTGGGAAGGTGCCCATTCCACTCTGCCTTTGTCACAGAGCAGGGTGCTATTGTGAGGCCATCTCTGAGCAGTGGACTCAAAAGCATTTTCAGGCATGTCAGAGAAGGGAGGACTCACTAGAATTAGCAAACAAAACCACCCTGACATCCTCCTTCAGGAACACGGGGAGCAGAGGCCAAAGCACTAAGGGGAGGGCGCATACCCGAGACGATTGTATGAAGAAAATATGGAGGAACTGTTACATGTTCGGTACTAAGTCATTTTCAGGGGATTGAAAGACTATTGCTGGATTTCATGATGCTGACTGGCGTTAGCTGATTAACCCATGTAAATAGGCACTTAAATAGAAGCAGGAAAGGGAGACAAAGACTGGCTTCTGGACTTCCTCCCTGATCCCCACCCTTACTCATCACCTGCAGTGGCCAGAATTAGGGAATCAGAATCAAACCAGTGTAAGGCAGTGCTGGCTGCCATTGCCTGGTCACATTGAAATTGGTGGCTTCATTCTAGATGTAGCTTGTGCAGATGTAGCAGGAAAATAGGAAAACCTACCATCTCAGTGAGCACCAGCTGCCTCCCAAAGGAGGGGCAGCCGTGCTTATATTTTTATGGTTACAATGGCACAAAATTATTATCAACCTAACTAAAACATTCCTTTTCTCTTTTTTCCTGAATTATCATGGAGTTTTCTAATTCTCTCTTTTGGAATGTAGATTTTTTTTAAATGCTTTACGATGTAAAATATTTATTTTTTACTTATTCTGGAAGATCTGGCTGAAGGATTATTCATGGAACAGGAAGAAGCGTAAAGACTATCCATGTCATCTTTGTTGAGAGTCTTCGTGACTGTAAGATTGTAAATACAGATTATTTATTAACTCTGTTCTGCCTGGAAATTTAGGCTTCATACGGAAAGTGTTTGAGAGCAAGTAGTTGACATTTATCAGCAAATCTCTTGCAAGAACAGCACAAGGAAAATCAGTCTAATAAGCTGCTCTGCCCCTTGTGCTCAGAGTGGATGTTATGGGATTCTTTTTTTCTCTGTTTTATCTTTTCAAGTGGAATTAGTTGGTTATCCATTTGCAAATGTTTTAAATTGCAAAGAAAGCCATGAGGTCTTCAATACTGTTTTACCCCATCCCTTGTGCATATTTCCAGGGAGAAGGAAAGCATATACACTTTTTTCTTTCATTTTTCCAAAAGAGAAAAAAATGACAAAAGGTGAAACTTACATACAAATATTACCTCATTTGTTGTGTGACTGAGTAAAGAATTTTTGGATCAAGCGGAAAGAGTTTAAGTGTCTAACAAACTTAAAGCTACTGTAGTACCTAAAAAGTCAGTGTTGTACATAGCATAAAAACTCTGCAGAGAAGTATTCCCAATAAGGAAATAGCATTGAAATGTTAAATACAATTTCTGAAAGTTATGTTTTTTTTCTATCATCTGGTATACCATTGCTTTATTTTTATAAATTATTTTCTCATTGCCATTGGAATAGATATCTCAGATTGTGTAGATATGCTATTTAAATAATTTATCAGGAAATACTGCCTGTAGAGTTAGTATTTCTATTTTTATATAATGTTTGCACACTGAATTGAAGAATTGTTGGTTTTTTCTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTGACCTCCCATTTTTACTATTTGCCAATACCTTTTTCTAGGAATGTGCTTTTTTTTGTACACATTTTTATCCATTTTACATTCTAAAGCAGTGTAAGTTGTATATTACTGTTTCTTATGTACAAGGAACAACAATAAATCATATGGAAATTTATATTTATACTTACTGTATCCATGCTTATTTGTTCTCTACTGGCTTTATGTCATGAAGTATATGCGTAAATACCATTCATAAATCAATATAGCATATACAAAAATAAATTACAGTAAGTCATAGCAACATTCACAGTTTGTATGTGATTGAGAAAGACTGAGTTGCTCAGGCCTAGGCTTAGAATTTGCTGCGTTTGTGGAATAAAAGAACAAAATGATACATTAGCCTGCCATATCAA
SEQ ID NO:388 全mRNA多核苷酸序列
SEQ ID NO:389 THBS1之外顯子2的轉譯多肽序列
MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIP
SEQ ID NO:390 THBS1之外顯子3的轉譯多肽序列
SGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFRIEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVVSNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELDVPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDNFQ
SEQ ID NO:391 THBS1之外顯子4的轉譯多肽序列
GVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSS
SEQ ID NO:392 THBS1之外顯子5的轉譯多肽序列
TSVLLTLDNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDSIRKV
SEQ ID NO:393 THBS1之外顯子6的轉譯多肽序列
TEENKELANELRRPPLCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQ
SEQ ID NO:394 THBS1之外顯子7的轉譯多肽序列
NSVTICKKVSCPIMPCSNATVPDGECCPRCW
SEQ ID NO:395 THBS1之外顯子8的轉譯多肽序列
SDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNNRCEGSSVQTRTCHIQECDKR
SEQ ID NO:396 THBS1之外顯子9的轉譯多肽序列
KQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNGKPCEGEARETKACKKDACP
SEQ ID NO:397 THBS1之全部13個外顯子10-22按順序排列的轉譯多肽序列
KQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNGKPCEGEARETKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDCVGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACFNHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCTDGTHDCNKNAKCNYLGHYSDPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPNENLVCVANATYHCKKDNCPNLPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVGDRCDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGDQCDNCPLEHNPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDACDHDDDNDGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVDISETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGTFFINTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKIMADSGPIYDKTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
SEQ ID NO:398 全蛋白質序列
MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIPESGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFRIEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVVSNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELDVPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDNFQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVLLTLDNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDSIRKVTEENKELANELRRPPLCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQNSVTICKKVSCPIMPCSNATVPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNNRCEGSSVQTRTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNGKPCEGEARETKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDCVGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACFNHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCTDGTHDCNKNAKCNYLGHYSDPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPNENLVCVANATYHCKKDNCPNLPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVGDRCDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGDQCDNCPLEHNPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDACDHDDDNDGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVDISETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGTFFINTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKIMADSGPIYDKTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
SEQ ID NO:399 THBS1之全部9個外顯子1-9按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:400 THBS1之全部8個外顯子2-9按順序排列的轉譯多肽序列
AGRN 序列資訊SEQ ID NO: 401 AGRN-NRG1融合物5’處之AGRN外顯子12序列
GTGTGCGGCTCAGATGGGGTCACCTACAGCACCGAGTGTGAGCTGAAGAAGGCCAGGTGTGAGTCACAGCGAGGGCTCTACGTAGCGGCCCAGGGAGCCTGCCGAG
SEQ ID NO: 402 AGRN-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCTTCATGGTGAAAGAC
SEQ ID NO:403 AGRN-NRG1多核苷酸序列
GTGTGCGGCTCAGATGGGGTCACCTACAGCACCGAGTGTGAGCTGAAGAAGGCCAGGTGTGAGTCACAGCGAGGGCTCTACGTAGCGGCCCAGGGAGCCTGCCGAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCTTCATGGTGAAAGAC
SEQ ID NO:404 AGRN-NRG1多肽序列
VCGSDGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRATSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKD
SEQ ID NO:405 AGRN之外顯子1
AGTCCCGTCCCCGGCGCGGCCCGCGCGCTCCTCCGCCGCCTCTCGCCTGCGCCATGGCCGGCCGGTCCCACCCGGGCCCGCTGCGGCCGCTGCTGCCGCTCCTTGTGGTGGCCGCGTGCGTCCTGCCCGGAGCCGGCGGGACATGCCCGGAGCGCGCGCTGGAGCGGCGCGAGGAGGAGGCGAACGTGGTGCTCACCGGGACGGTGGAGGAGATCCTCAACGTGGACCCGGTGCAGCACACGTACTCCTGCAAG
SEQ ID NO:406 AGRN之外顯子2
GTTCGGGTCTGGCGGTACTTGAAGGGCAAAGACCTGGTGGCCCGGGAGAGCCTGCTGGACGGCGGCAACAAGGTGGTGATCAGCGGCTTTGGAGACCCCCTCATCTGTGACAACCAGGTGTCCACTGGGGACACCAGGATCTTCTTTGTGAACCCTGCACCCCCATACCTGTGGCCAGCCCACAAGAACGAGCTGATGCTCAACTCCAGCCTCATGCGGATCACCCTGCGGAACCTGGAGGAGGTGGAGTTCTGTGTGGAAG
SEQ ID NO:407 AGRN之外顯子3
ATAAACCCGGGACCCACTTCACTCCAGTGCCTCCGACGCCTCCTGATG
SEQ ID NO:408 AGRN之外顯子4
CGTGCCGGGGAATGCTGTGCGGCTTCGGCGCCGTGTGCGAGCCCAACGCGGAGGGGCCGGGCCGGGCGTCCTGCGTCTGCAAGAAGAGCCCGTGCCCCAGCGTGGTGGCGCCTGTGTGTGGGTCGGACGCCTCCACCTACAGCAACGAATGCGAGCTGCAGCGGGCGCAGTGCAGCCAGCAGCGCCGCATCCGCCTGCTCAGCCGCGGGCCGTGCG
SEQ ID NO:409 AGRN之外顯子5
GCTCGCGGGACCCCTGCTCCAACGTGACCTGCAGCTTCGGCAGCACCTGTGCGCGCTCGGCCGACGGGCTGACGGCCTCGTGCCTGTGCCCCGCGACCTGCCGTGGCGCCCCCGAGGGGACCGTCTGCGGCAGCGACGGCGCCGACTACCCCGGCGAGTGCCAGCTCCTGCGCCGCGCCTGCGCCCGCCAGGAGAATGTCTTCAAGAAGTTCGACGGCCCTTGTG
SEQ ID NO:410 AGRN之外顯子6
ACCCCTGTCAGGGCGCCCTCCCTGACCCGAGCCGCAGCTGCCGTGTGAACCCGCGCACGCGGCGCCCTGAGATGCTCCTACGGCCCGAGAGCTGCCCTGCCCGGCAGGCGCCAGTGTGTGGGGACGACGGAGTCACCTACGAAAACGACTGTGTCATGGGCCGATCGGGGGCCGCCCGGGGTCTCCTCCTGCAGAAAGTGCGCTCCGGCCAGTGCCAGGGTCGAG
SEQ ID NO:411 AGRN之外顯子7
ACCAGTGCCCGGAGCCCTGCCGGTTCAATGCCGTGTGCCTGTCCCGCCGTGGCCGTCCCCGCTGCTCCTGCGACCGCGTCACCTGTGACGGGGCCTACAGGCCCGTGTGTGCCCAGGACGGGCGCACGTATGACAGTGATTGCTGGCGGCAGCAGGCTGAGTGCCGGCAGCAGCGTGCCATCCCCAGCAAGCACCAGGGCCCGTGTG
SEQ ID NO:412 AGRN之外顯子8
ACCAGGCCCCGTCCCCATGCCTCGGGGTGCAGTGTGCATTTGGGGCGACGTGTGCTGTGAAGAACGGGCAGGCAGCGTGTGAATGCCTGCAGGCGTGCTCGAGCCTCTACGATCCTGTGTGCGGCAGCGACGGCGTCACATACGGCAGCGCGTGCGAGCTGGAGGCCACGGCCTGTACCCTCGGGCGGGAGATCCAGGTGGCGCGCAAAGGACCCTGTG
SEQ ID NO:413 AGRN之外顯子9
ACCGCTGCGGGCAGTGCCGCTTTGGAGCCCTGTGCGAGGCCGAGACCGGGCGCTGCGTGTGCCCCTCTGAATGCGTGGCTTTGGCCCAGCCCGTGTGTGGCTCCGACGGGCACACGTACCCCAGCGAGTGCATGCTGCACGTGCACGCCTGCACACACCAGATCAGCCTGCACGTGGCCTCAGCTGGACCCTGTG
SEQ ID NO:414 AGRN之外顯子10
AGACCTGTGGAGATGCCGTGTGTGCTTTTGGGGCTGTGTGCTCCGCAGGGCAGTGTGTGTGTCCCCGGTGTGAGCACCCCCCGCCCGGCCCCGTGTGTGGCAGCGACGGTGTCACCTACGGCAGTGCCTGCGAGCTACGGGAAGCCGCCTGCCTCCAGCAGACACAGATCGAGGAGGCCCGGGCAGGGCCGTGCGAGCAGG
SEQ ID NO:415 AGRN之外顯子11
CCGAGTGCGGTTCCGGAGGCTCTGGCTCTGGGGAGGACGGTGACTGTGAGCAGGAGCTGTGCCGGCAGCGCGGTGGCATCTGGGACGAGGACTCGGAGGACGGGCCGTGTGTCTGTGACTTCAGCTGCCAGAGTGTCCCAGGCAGCCCG
SEQ ID NO:416 AGRN之外顯子12
GTGTGCGGCTCAGATGGGGTCACCTACAGCACCGAGTGTGAGCTGAAGAAGGCCAGGTGTGAGTCACAGCGAGGGCTCTACGTAGCGGCCCAGGGAGCCTGCCGAG
SEQ ID NO:417 AGRN之全部27個外顯子13-39按順序排列的多核苷酸序列
GCCCCACCTTCGCCCCGCTGCCGCCTGTGGCCCCCTTACACTGTGCCCAGACGCCCTACGGCTGCTGCCAGGACAATATCACCGCAGCCCGGGGCGTGGGCCTGGCTGGCTGCCCCAGTGCCTGCCAGTGCAACCCCCATGGCTCTTACGGCGGCACCTGTGACCCAGCCACAGGCCAGTGCTCCTGCCGCCCAGGTGTGGGGGGCCTCAGGTGTGACCGCTGTGAGCCTGGCTTCTGGAACTTTCGAGGCATCGTCACCGATGGCCGGAGTGGCTGTACACCCTGCAGCTGTGATCCCCAAGGCGCCGTGCGGGATGACTGTGAGCAGATGACGGGGCTGTGCTCGTGTAAGCCCGGGGTGGCTGGACCCAAGTGTGGGCAGTGTCCAGACGGCCGTGCCCTGGGCCCCGCGGGCTGTGAAGCTGACGCTTCTGCGCCTGCGACCTGTGCGGAGATGCGCTGTGAGTTCGGTGCGCGGTGCGTGGAGGAGTCTGGCTCAGCCCACTGTGTCTGCCCGATGCTCACCTGTCCAGAGGCCAACGCTACCAAGGTCTGTGGGTCAGATGGAGTCACATACGGCAACGAGTGTCAGCTGAAGACCATCGCCTGCCGCCAGGGCCTGCAAATCTCTATCCAGAGCCTGGGCCCGTGCCAGGAGGCTGTTGCTCCCAGCACTCACCCGACATCTGCCTCCGTGACTGTGACCACCCCAGGGCTCCTCCTGAGCCAGGCACTGCCGGCCCCCCCCGGCGCCCTCCCCCTGGCTCCCAGCAGTACCGCACACAGCCAGACCACCCCTCCGCCCTCATCACGACCTCGGACCACTGCCAGCGTCCCCAGGACCACCGTGTGGCCCGTGCTGACGGTGCCCCCCACGGCACCCTCCCCTGCACCCAGCCTGGTGGCGTCCGCCTTTGGTGAATCTGGCAGCACTGATGGAAGCAGCGATGAGGAACTGAGCGGGGACCAGGAGGCCAGTGGGGGTGGCTCTGGGGGGCTCGAGCCCTTGGAGGGCAGCAGCGTGGCCACCCCTGGGCCACCTGTCGAGAGGGCTTCCTGCTACAACTCCGCGTTGGGCTGCTGCTCTGATGGGAAGACGCCCTCGCTGGACGCAGAGGGCTCCAACTGCCCCGCCACCAAGGTGTTCCAGGGCGTCCTGGAGCTGGAGGGCGTCGAGGGCCAGGAGCTGTTCTACACGCCCGAGATGGCTGACCCCAAGTCAGAACTGTTCGGGGAGACAGCCAGGAGCATTGAGAGCACCCTGGACGACCTCTTCCGGAATTCAGACGTCAAGAAGGATTTTCGGAGTGTCCGCTTGCGGGACCTGGGGCCCGGCAAATCCGTCCGCGCCATTGTGGATGTGCACTTTGACCCCACCACAGCCTTCAGGGCACCCGACGTGGCCCGGGCCCTGCTCCGGCAGATCCAGGTGTCCAGGCGCCGGTCCTTGGGGGTGAGGCGGCCGCTGCAGGAGCACGTGCGATTTATGGACTTTGACTGGTTTCCTGCGTTTATCACGGGGGCCACGTCAGGAGCCATTGCTGCGGGAGCCACGGCCAGAGCCACCACTGCATCGCGCCTGCCGTCCTCTGCTGTGACCCCTCGGGCCCCGCACCCCAGTCACACAAGCCAGCCCGTTGCCAAGACCACGGCAGCCCCCACCACACGTCGGCCCCCCACCACTGCCCCCAGCCGTGTGCCCGGACGTCGGCCCCCGGCCCCCCAGCAGCCTCCAAAGCCCTGTGACTCACAGCCCTGCTTCCACGGGGGGACCTGCCAGGACTGGGCATTGGGCGGGGGCTTCACCTGCAGCTGCCCGGCAGGCAGGGGAGGCGCCGTCTGTGAGAAGGTGCTTGGCGCCCCTGTGCCGGCCTTCGAGGGCCGCTCCTTCCTGGCCTTCCCCACTCTCCGCGCCTACCACACGCTGCGCCTGGCACTGGAATTCCGGGCGCTGGAGCCTCAGGGGCTGCTGCTGTACAATGGCAACGCCCGGGGCAAGGACTTCCTGGCATTGGCGCTGCTAGATGGCCGCGTGCAGCTCAGGTTTGACACAGGTTCGGGGCCGGCGGTGCTGACCAGTGCCGTGCCGGTAGAGCCGGGCCAGTGGCACCGCCTGGAGCTGTCCCGGCACTGGCGCCGGGGCACCCTCTCGGTGGATGGTGAGACCCCTGTTCTGGGCGAGAGTCCCAGTGGCACCGACGGCCTCAACCTGGACACAGACCTCTTTGTGGGCGGCGTACCCGAGGACCAGGCTGCCGTGGCGCTGGAGCGGACCTTCGTGGGCGCCGGCCTGAGGGGGTGCATCCGTTTGCTGGACGTCAACAACCAGCGCCTGGAGCTTGGCATTGGGCCGGGGGCTGCCACCCGAGGCTCTGGCGTGGGCGAGTGCGGGGACCACCCCTGCCTGCCCAACCCCTGCCATGGCGGGGCCCCATGCCAGAACCTGGAGGCTGGAAGGTTCCATTGCCAGTGCCCGCCCGGCCGCGTCGGACCAACCTGTGCCGATGAGAAGAGCCCCTGCCAGCCCAACCCCTGCCATGGGGCGGCGCCCTGCCGTGTGCTGCCCGAGGGTGGTGCTCAGTGCGAGTGCCCCCTGGGGCGTGAGGGCACCTTCTGCCAGACAGCCTCGGGGCAGGACGGCTCTGGGCCCTTCCTGGCTGACTTCAACGGCTTCTCCCACCTGGAGCTGAGAGGCCTGCACACCTTTGCACGGGACCTGGGGGAGAAGATGGCGCTGGAGGTCGTGTTCCTGGCACGAGGCCCCAGCGGCCTCCTGCTCTACAACGGGCAGAAGACGGACGGCAAGGGGGACTTCGTGTCGCTGGCACTGCGGGACCGCCGCCTGGAGTTCCGCTACGACCTGGGCAAGGGGGCAGCGGTCATCAGGAGCAGGGAGCCAGTCACCCTGGGAGCCTGGACCAGGGTCTCACTGGAGCGAAACGGCCGCAAGGGTGCCCTGCGTGTGGGCGACGGCCCCCGTGTGTTGGGGGAGTCCCCGAAATCCCGCAAGGTTCCGCACACCGTCCTCAACCTGAAGGAGCCGCTCTACGTAGGGGGCGCTCCCGACTTCAGCAAGCTGGCCCGTGCTGCTGCCGTGTCCTCTGGCTTCGACGGTGCCATCCAGCTGGTCTCCCTCGGAGGCCGCCAGCTGCTGACCCCGGAGCACGTGCTGCGGCAGGTGGACGTCACGTCCTTTGCAGGTCACCCCTGCACCCGGGCCTCAGGCCACCCCTGCCTCAATGGGGCCTCCTGCGTCCCGAGGGAGGCTGCCTATGTGTGCCTGTGTCCCGGGGGATTCTCAGGACCGCACTGCGAGAAGGGGCTGGTGGAGAAGTCAGCGGGGGACGTGGATACCTTGGCCTTTGACGGGCGGACCTTTGTCGAGTACCTCAACGCTGTGACCGAGAGCGAACTGGCCAATGAGATCCCCGTCCCCGAAACTCTGGATTCCGGGGCCCTTCACAGCGAGAAGGCACTGCAGAGCAACCACTTTGAACTGAGCCTGCGCACTGAGGCCACGCAGGGGCTGGTGCTCTGGAGTGGCAAGGCCACGGAGCGGGCAGACTATGTGGCACTGGCCATTGTGGACGGGCACCTGCAACTGAGCTACAACCTGGGCTCCCAGCCCGTGGTGCTGCGTTCCACCGTGCCCGTCAACACCAACCGCTGGTTGCGGGTCGTGGCACATAGGGAGCAGAGGGAAGGTTCCCTGCAGGTGGGCAATGAGGCCCCTGTGACCGGCTCCTCCCCGCTGGGCGCCACGCAGCTGGACACTGATGGAGCCCTGTGGCTTGGGGGCCTGCCGGAGCTGCCCGTGGGCCCAGCACTGCCCAAGGCCTACGGCACAGGCTTTGTGGGCTGCTTGCGGGACGTGGTGGTGGGCCGGCACCCGCTGCACCTGCTGGAGGACGCCGTCACCAAGCCAGAGCTGCGGCCCTGCCCCACCCCATGAGCTGGCACCAGAGCCCCGCGCCCGCTGTAATTATTTTCTATTTTTGTAAACTTGTTGCTTTTTGATATGATTTTCTTGCCTGAGTGTTGGCCGGAGGGACTGCTGGCCCGGCCTCCCTTCCGTCCAGGCAGCCGTGCTGCAGACAGACCTAGTGCCGAGGGATGGACAGGCGAGGTGGCAGCGTGGAGGGCTCGGCGTGGATGGCAGCCTCAGGACACACACCCCTGCCTCAAGGTGCTGAGCCCCCGCCTTGCACTGCGCCTGCCCCACGGTGTCCCCGCCGGGAAGCAGCCCCGGCTCCTGAATCACCCTCGCTCCGTCAGGCGGGACTCGTGTCCCAGAGAGGAAGGGGCTGCTGAGGTCTGATGGGGCCCTTCCTCCGGGTGACCCCACAGGGCCTTTCCAAGCCCCCATTTGAGCTGCTCCTTCCTGTGTGTGCTCTGGGCCCTGCCTCGGCCTCCTGCGCCAATACTGTGACTTCCAAACAATGTTACTGCTGGGCACAGCTCTGCGTTGCTCCCGTGCTGCCTGCGCCAGCCCCAGGCTGCTGAGGAGCAGAGGCCAGACCAGGGCCGATCTGGGTGTCCTGACCCTCAGCTGGCCCTGCCCAGCCACCCTGGACGTGACCGTATCCCTCTGCCACACCCCAGGCCCTGCGAGGGGCTATCGAGAGGAGCTCACTGTGGGATGGGGTTGACCTCTGCCGCCTGCCTGGGTATCTGGGCCTGGCCATGGCTGTGTTCTTCATGTGTTGATTTTATTTGACCCCTGGAGTGGTGGGTCTCATCTTTCCCATCTCGCCTGAGAGCGGCTGAGGGCTGCCTCACTGCAAATCCTCCCCACAGCGTCAGTGAAAGTCGTCCTTGTCTCAGAATGACCAGGGGCCAGCCAGTGTCTGACCAAGGTCAAGGGGCAGGTGCAGAGGTGGCAGGGATGGCTCCGAAGCCAGAAATGCCTTAAACTGCAACGTCCCGTCCCTTCCCCACCCCCATCCCATCCCCACCCCCAGCCCCAGCCCAGTCCTCCTAGGAGCAGGACCCGATGAAGCGGGCGGCGGTGGGGCTGGGTGCCGTGTTACTAACTCTAGTATGTTTCTGTGTCAATCGCTGTGAAATAAAGTCTGAAAACTTTAAAA
SEQ ID NO:418 全mRNA多核苷酸序列
SEQ ID NO:419 AGRN之外顯子1的轉譯多肽序列
MAGRSHPGPLRPLLPLLVVAACVLPGAGGTCPERALERREEEANVVLTGTVEEILNVDPVQHTYSCK
SEQ ID NO:420 AGRN之外顯子2的轉譯多肽序列
VRVWRYLKGKDLVARESLLDGGNKVVISGFGDPLICDNQVSTGDTRIFFVNPAPPYLWPAHKNELMLNSSLMRITLRNLEEVEFCVE
SEQ ID NO:421 AGRN之外顯子3的轉譯多肽序列
KPGTHFTPVPPTPPD
SEQ ID NO:422 AGRN之外顯子4的轉譯多肽序列
CRGMLCGFGAVCEPNAEGPGRASCVCKKSPCPSVVAPVCGSDASTYSNECELQRAQCSQQRRIRLLSRGPC
SEQ ID NO:423 AGRN之外顯子5的轉譯多肽序列
SRDPCSNVTCSFGSTCARSADGLTASCLCPATCRGAPEGTVCGSDGADYPGECQLLRRACARQENVFKKFDGPC
SEQ ID NO:424 AGRN之外顯子6的轉譯多肽序列
PCQGALPDPSRSCRVNPRTRRPEMLLRPESCPARQAPVCGDDGVTYENDCVMGRSGAARGLLLQKVRSGQCQGR
SEQ ID NO:425 AGRN之外顯子7的轉譯多肽序列
QCPEPCRFNAVCLSRRGRPRCSCDRVTCDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQRAIPSKHQGPC
SEQ ID NO:426 AGRN之外顯子8的轉譯多肽序列
QAPSPCLGVQCAFGATCAVKNGQAACECLQACSSLYDPVCGSDGVTYGSACELEATACTLGREIQVARKGPC
SEQ ID NO:427 AGRN之外顯子9的轉譯多肽序列
RCGQCRFGALCEAETGRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPC
SEQ ID NO:428 AGRN之外顯子10的轉譯多肽序列
TCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPGPVCGSDGVTYGSACELREAACLQQTQIEEARAGPCEQ
SEQ ID NO:429 AGRN之外顯子11的轉譯多肽序列
ECGSGGSGSGEDGDCEQELCRQRGGIWDEDSEDGPCVCDFSCQSVPGSP
SEQ ID NO:430 AGRN之外顯子12的轉譯多肽序列
VCGSDGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACR
SEQ ID NO:431 AGRN之全部27個外顯子12-39按順序排列的轉譯多肽序列
VCGSDGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITAARGVGLAGCPSACQCNPHGSYGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDGRSGCTPCSCDPQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPATCAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKTIACRQGLQISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSSTAHSQTTPPPSSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGGGSGGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLELEGVEGQELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSVRAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAFITGATSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAPTTRRPPTTAPSRVPGRRPPAPQQPPKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAPVPAFEGRSFLAFPTLRAYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNGNARGKDFLALALLDGRVQLRFDTGSGPAVLTSAVPVEPGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPVLGESPSGTDGLNLDTDLFVGGVPEDQAAVALERTFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGPGAATRGSGVGECGDHPCLPNPCHGGAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKSPCQPNPCHGAAPCRVLPEGGAQCECPLGREGTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYNGQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLERNGRKGALRVGDGPRVLGESPKSRKVPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKLARAAAVSSGFDGAIQLVSLGGRQLLTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGPHCEKGLVEKSAGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESELANEIPVPETLDSGALHSEKALQSNHFELSLRTEATQGLVLWSGKATERADYVALAIVDGHLQLSYNLGSQPVVLRSTVPVNTNRWLRVVAHREQREGSLQVGNEAPVTGSSPLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGTGFVGCLRDVVVGRHPLHLLEDAVTKPELRPCPTP
SEQ ID NO:432 全蛋白質序列
MAGRSHPGPLRPLLPLLVVAACVLPGAGGTCPERALERREEEANVVLTGTVEEILNVDPVQHTYSCKVRVWRYLKGKDLVARESLLDGGNKVVISGFGDPLICDNQVSTGDTRIFFVNPAPPYLWPAHKNELMLNSSLMRITLRNLEEVEFCVEDKPGTHFTPVPPTPPDACRGMLCGFGAVCEPNAEGPGRASCVCKKSPCPSVVAPVCGSDASTYSNECELQRAQCSQQRRIRLLSRGPCGSRDPCSNVTCSFGSTCARSADGLTASCLCPATCRGAPEGTVCGSDGADYPGECQLLRRACARQENVFKKFDGPCDPCQGALPDPSRSCRVNPRTRRPEMLLRPESCPARQAPVCGDDGVTYENDCVMGRSGAARGLLLQKVRSGQCQGRDQCPEPCRFNAVCLSRRGRPRCSCDRVTCDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQRAIPSKHQGPCDQAPSPCLGVQCAFGATCAVKNGQAACECLQACSSLYDPVCGSDGVTYGSACELEATACTLGREIQVARKGPCDRCGQCRFGALCEAETGRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPCETCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPGPVCGSDGVTYGSACELREAACLQQTQIEEARAGPCEQAECGSGGSGSGEDGDCEQELCRQRGGIWDEDSEDGPCVCDFSCQSVPGSPVCGSDGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITAARGVGLAGCPSACQCNPHGSYGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDGRSGCTPCSCDPQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPATCAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKTIACRQGLQISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSSTAHSQTTPPPSSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGGGSGGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLELEGVEGQELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSVRAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAFITGATSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAPTTRRPPTTAPSRVPGRRPPAPQQPPKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAPVPAFEGRSFLAFPTLRAYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNGNARGKDFLALALLDGRVQLRFDTGSGPAVLTSAVPVEPGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPVLGESPSGTDGLNLDTDLFVGGVPEDQAAVALERTFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGPGAATRGSGVGECGDHPCLPNPCHGGAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKSPCQPNPCHGAAPCRVLPEGGAQCECPLGREGTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYNGQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLERNGRKGALRVGDGPRVLGESPKSRKVPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKLARAAAVSSGFDGAIQLVSLGGRQLLTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGPHCEKGLVEKSAGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESELANEIPVPETLDSGALHSEKALQSNHFELSLRTEATQGLVLWSGKATERADYVALAIVDGHLQLSYNLGSQPVVLRSTVPVNTNRWLRVVAHREQREGSLQVGNEAPVTGSSPLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGTGFVGCLRDVVVGRHPLHLLEDAVTKPELRPCPTP
SEQ ID NO:433 AGRN之全部12個外顯子1-12按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:434 AGRN之全部12個外顯子1-12按順序排列的轉譯多肽序列
PVALB 序列資訊SEQ ID NO: 435 PVALB-NRG1融合物5’處之PVAPB外顯子4序列
TAAAAGGCTTCTCCCCAGATGCCAGAGACCTGTCTGCTAAAGAAACCAAGATGCTGATGGCTGCTGGAGACAAAGATGGGGACGGCAAAATTGGGGTTGACG
SEQ ID NO: 436 PVALB-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCTTCATGGTGAAAGACCTTTCAAACCCCTCGAGATACTTG
SEQ ID NO:437 PVALB-NRG1多核苷酸序列
TAAAAGGCTTCTCCCCAGATGCCAGAGACCTGTCTGCTAAAGAAACCAAGATGCTGATGGCTGCTGGAGACAAAGATGGGGACGGCAAAATTGGGGTTGACGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCTTCATGGTGAAAGACCTTTCAAACCCCTCGAGATACTTG
SEQ ID NO:438 PVALB-NRG1多肽序列
KGFSPDARDLSAKETKMLMAAGDKDGDGKIGVDATSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYL
SEQ ID NO:439 PVALB之外顯子1
ACTTCCCGACAGGACTTCCCACCAGCCCAGCCTTTCAGTGCAGGCTCCAGCCCTCCACCCCCACCCGAG
SEQ ID NO:440 PVALB之外顯子2
TTGCAGGATGTCGATGACAGACTTGCTGAACGCTGAGGACATCAAGAAGGCGGTGGGAGCCTTTAGCG
SEQ ID NO:441 PVALB之外顯子3
CTACCGACTCCTTCGACCACAAAAAGTTCTTCCAAATGGTCGGCCTGAAGAAAAAGAGTGCGGATGATGTGAAGAAGGTGTTTCACATGCTGGACAAGGACAAAAGTGGCTTCATCGAGGAGGATGAGCTGGG
SEQ ID NO:442 PVALB之外顯子4
ATTCATCCTAAAAGGCTTCTCCCCAGATGCCAGAGACCTGTCTGCTAAAGAAACCAAGATGCTGATGGCTGCTGGAGACAAAGATGGGGACGGCAAAATTGGGGTTGACG
SEQ ID NO:443 PVALB之外顯子5
AATTCTCCACTCTGGTGGCTGAAAGCTAAGAAGCACTGACTGCCCCTGGTCTTCCACCTCTCTGCCCTGAACACCCAATCTCGGCCCCTCTCGCCACCCTCCTGCATTTCTGTTCAGTTCGTTTATGTTATTTTTTACTCCCCCATCCCCTGTGGCCCTCTAATGACACCATTCTTCTGGAAAATGCTGGAGAAGCAATAAAGGTTGTACCAGTCA
SEQ ID NO:444 全mRNA多核苷酸序列
ACTTCCCGACAGGACTTCCCACCAGCCCAGCCTTTCAGTGCAGGCTCCAGCCCTCCACCCCCACCCGAGTTGCAGGATGTCGATGACAGACTTGCTGAACGCTGAGGACATCAAGAAGGCGGTGGGAGCCTTTAGCGCTACCGACTCCTTCGACCACAAAAAGTTCTTCCAAATGGTCGGCCTGAAGAAAAAGAGTGCGGATGATGTGAAGAAGGTGTTTCACATGCTGGACAAGGACAAAAGTGGCTTCATCGAGGAGGATGAGCTGGGATTCATCCTAAAAGGCTTCTCCCCAGATGCCAGAGACCTGTCTGCTAAAGAAACCAAGATGCTGATGGCTGCTGGAGACAAAGATGGGGACGGCAAAATTGGGGTTGACGAATTCTCCACTCTGGTGGCTGAAAGCTAAGAAGCACTGACTGCCCCTGGTCTTCCACCTCTCTGCCCTGAACACCCAATCTCGGCCCCTCTCGCCACCCTCCTGCATTTCTGTTCAGTTCGTTTATGTTATTTTTTACTCCCCCATCCCCTGTGGCCCTCTAATGACACCATTCTTCTGGAAAATGCTGGAGAAGCAATAAAGGTTGTACCAGTCA
SEQ ID NO:445 PVALB之外顯子2的轉譯多肽序列
MSMTDLLNAEDIKKAVGAFS
SEQ ID NO:446 PVALB之外顯子3的轉譯多肽序列
TDSFDHKKFFQMVGLKKKSADDVKKVFHMLDKDKSGFIEEDEL
SEQ ID NO:447 PVALB之外顯子4的轉譯多肽序列
FILKGFSPDARDLSAKETKMLMAAGDKDGDGKIGVD
SEQ ID NO:448 PVALB之外顯子5的轉譯多肽序列
FSTLVAES
SEQ ID NO:449 全蛋白質序列
MSMTDLLNAEDIKKAVGAFSATDSFDHKKFFQMVGLKKKSADDVKKVFHMLDKDKSGFIEEDELGFILKGFSPDARDLSAKETKMLMAAGDKDGDGKIGVDEFSTLVAES
SEQ ID NO:450 PVALB之全部4個外顯子1-4按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:451 PVALB之全部3個外顯子2-4按順序排列的轉譯多肽序列
SLC3A2 轉錄本 3 序列資訊SEQ ID NO:452 SLC3A2-NRG1融合物5’處之SLC3A2外顯子2序列
AGTTGGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGACTGGTCTCGAACTCTTGGCCTCAGGTGATCCTCTTCCCTCAGCTTCCCAGAATGCCGAGATGATAG
SEQ ID NO:453 SLC3A2-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAG
SEQ ID NO:454 SLC3A2-NRG1多核苷酸序列
AGTTGGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGACTGGTCTCGAACTCTTGGCCTCAGGTGATCCTCTTCCCTCAGCTTCCCAGAATGCCGAGATGATAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAG
SEQ ID NO:455 SLC3A2-NRG1多肽序列
LGSHCVAQTGLELLASGDPLPSASQNAEMIATSTSTTGT
SEQ ID NO:456 SLC3A2之外顯子1
GCATTGCGGCTTGGTTTTCTCACCCAGTGCATGTGGCAGGAGCGGTGAGATCACTGCCTCACGGCGATCCTGGACTGACGGTCACGACTGCCTACCCTCTAACCCTGTTCTGAGCTGCCCCTTGCCCACACACCCCAAACCTGTGTGCAGGATCCGCCTCCATGGAGCTACAGCCTCCTGAAGCCTCGATCGCCGTCGTGTCGATTCCGCGCCAGTTGCCTGGCTCACATTCGGAGGCTGGTGTCCAGGGTCTCAGCGCGGGGGACGACTCAG
SEQ ID NO:457 SLC3A2之外顯子2
AGTTGGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGACTGGTCTCGAACTCTTGGCCTCAGGTGATCCTCTTCCCTCAGCTTCCCAGAATGCCGAGATGATAG
SEQ ID NO:458 SLC3A2之外顯子3
AGACGGGGTCTGACTGTGTTACCCAGGCTGGTCTTCAACTCTTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTAGCTTCCAAGAATGCTGAGGTTACAG
SEQ ID NO:459 SLC3A2之外顯子4
GCACCATGAGCCAGGACACCGAGGTGGATATGAAGGAGGTGGAGCTGAATGAGTTAGAGCCCGAGAAGCAGCCGATGAACGCGGCGTCTGGGGCGGCCATGTCCCTGGCGGGAGCCGAGAAGAATGGTCTGGTGAAGATCAAGGTGGCGGAAGACGAGGCGGAGGCGGCAGCCGCGGCTAAGTTCACGGGCCTGTCCAAGGAGGAGCTGCTGAAGGTGGCAGGCAGCCCCGGCTGGGTACGCACCCGCTGGGCACTGCTGCTGCTCTTCTGGCTCGGCTGGCTCGGCATGCTTGCTGGTGCCGTGGTCATAATCGTGCGAGCGCCGCGTTGTCGCGAGCTACCGGCGCAGAAGTGGTGGCACACGGGCGCCCTCTACCGCATCGGCGACCTTCAGGCCTTCCAGGGCCACGGCGCGGGCAACCTGGCGG
SEQ ID NO:460 SLC3A2之外顯子5
GTCTGAAGGGGCGTCTCGATTACCTGAGCTCTCTGAAGGTGAAGGGCCTTGTGCTGGGTCCAATTCACAAGAACCAGAAGGATGATGTCGCTCAGACTGACTTGCTGCAGATCGACCCCAATTTTGGCTCCAAGGAAGATTTTGACAGTCTCTTGCAATCGGCTAAAAAAAAGA
SEQ ID NO:461 SLC3A2之外顯子6
GCATCCGTGTCATTCTGGACCTTACTCCCAACTACCGGGGTGAGAACTCGTGGTTCTCCACTCAGGTTGACACTGTGGCCACCAAGGTGAAG
SEQ ID NO:462 SLC3A2之外顯子7
GATGCTCTGGAGTTTTGGCTGCAAGCTGGCGTGGATGGGTTCCAGGTTCGGGACATAGAGAATCTGAAG
SEQ ID NO:463 SLC3A2之外顯子8
GATGCATCCTCATTCTTGGCTGAGTGGCAAAATATCACCAAGGGCTTCAGTGAAGACAG
SEQ ID NO:464 SLC3A2之外顯子9
GCTCTTGATTGCGGGGACTAACTCCTCCGACCTTCAGCAGATCCTGAGCCTACTCGAATCCAACAAAGACTTGCTGTTGACTAGCTCATACCTGTCTGATTCTGGTTCTACTGGGGAGCATACAAAATCCCTAGTCACACAGTATTTGAATGCCACTGGCAATCGCTGGTGCAGCTGGAGT
SEQ ID NO:465 SLC3A2之外顯子10
TTGTCTCAGGCAAGGCTCCTGACTTCCTTCTTGCCGGCTCAACTTCTCCGACTCTACCAGCTGATGCTCTTCACCCTGCCAGGGACCCCTGTTTTCAGCTACGGGGATGAGATTGGCCTGGATGCAGCTGCCCTTCCTGGACAG
SEQ ID NO:466 SLC3A2之外顯子11
CCTATGGAGGCTCCAGTCATGCTGTGGGATGAGTCCAGCTTCCCTGACATCCCAGGGGCTGTAAGTGCCAACATGACTGTGAAG
SEQ ID NO:467 SLC3A2之外顯子12
GGCCAGAGTGAAGACCCTGGCTCCCTCCTTTCCTTGTTCCGGCGGCTGAGTGACCAGCGGAGTAAGGAGCGCTCCCTACTGCATGGGGACTTCCACGCGTTCTCCGCTGGGCCTGGACTCTTCTCCTATATCCGCCACTGGGACCAGAATGAGCGTTTTCTGGTAGTGCTTAACTTTGGGGATGTGGGCCTCTCGGCTGGACTGCAGGCCTCCGACCTGCCTGCCAGCGCCAGCCTGCCAGCCAAGGCTGACCTCCTGCTCAGCACCCAGCCAGGCCGTGAGGAGGGCTCCCCTCTTGAGCTGGAACGCCTGAAACTGGAGCCTCACGAAGGGCTGCTGCTCCGCTTCCCCTACGCGGCCTGACTTCAGCCTGACATGGACCCACTACCCTTCTCCTTTCCTTCCCAGGCCCTTTGGCTTCTGATTTTTCTCTTTTTTAAAAACAAACAAACAAACTGTTGCAGATTATGAGTGAACCCCCAAATAGGGTGTTTTCTGCCTTCAAATAAAAGTCACCCCTGCATGGTGAA
SEQ ID NO:468 SLC3A2之全mRNA多核苷酸序列
SEQ ID NO:469 SLC3A2之外顯子1的轉譯多肽序列
MELQPPEASIAVVSIPRQLPGSHSEAGVQGLSAGDDS
SEQ ID NO:470 SLC3A2之外顯子2的轉譯多肽序列
LGSHCVAQTGLELLASGDPLPSASQNAEMI
SEQ ID NO:471 SLC3A2之外顯子3的轉譯多肽序列
TGSDCVTQAGLQLLASSDPPALASKNAEVT
SEQ ID NO:472 SLC3A2之外顯子4的轉譯多肽序列
TMSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGAAMSLAGAEKNGLVKIKVAEDEAEAAAAAKFTGLSKEELLKVAGSPGWVRTRWALLLLFWLGWLGMLAGAVVIIVRAPRCRELPAQKWWHTGALYRIGDLQAFQGHGAGNLA
SEQ ID NO:473 SLC3A2之外顯子5的轉譯多肽序列
LKGRLDYLSSLKVKGLVLGPIHKNQKDDVAQTDLLQIDPNFGSKEDFDSLLQSAKKK
SEQ ID NO:474 SLC3A2之外顯子6的轉譯多肽序列
IRVILDLTPNYRGENSWFSTQVDTVATKVK
SEQ ID NO:475 SLC3A2之外顯子7的轉譯多肽序列
DALEFWLQAGVDGFQVRDIENLK
SEQ ID NO:476 SLC3A2之外顯子8的轉譯多肽序列
DASSFLAEWQNITKGFSED
SEQ ID NO:477 SLC3A2之外顯子9的轉譯多肽序列
LLIAGTNSSDLQQILSLLESNKDLLLTSSYLSDSGSTGEHTKSLVTQYLNATGNRWCSWS
SEQ ID NO:478 SLC3A2之外顯子10的轉譯多肽序列
LSQARLLTSFLPAQLLRLYQLMLFTLPGTPVFSYGDEIGLDAAALPGQ
SEQ ID NO:479 SLC3A2之外顯子11的轉譯多肽序列
PMEAPVMLWDESSFPDIPGAVSANMTVK
SEQ ID NO:480 SLC3A2之外顯子12的轉譯多肽序列
GQSEDPGSLLSLFRRLSDQRSKERSLLHGDFHAFSAGPGLFSYIRHWDQNERFLVVLNFGDVGLSAGLQASDLPASASLPAKADLLLSTQPGREEGSPLELERLKLEPHEGLLLRFPYAA
SEQ ID NO:481 SLC3A2之全蛋白質序列
MELQPPEASIAVVSIPRQLPGSHSEAGVQGLSAGDDSELGSHCVAQTGLELLASGDPLPSASQNAEMIETGSDCVTQAGLQLLASSDPPALASKNAEVTGTMSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGAAMSLAGAEKNGLVKIKVAEDEAEAAAAAKFTGLSKEELLKVAGSPGWVRTRWALLLLFWLGWLGMLAGAVVIIVRAPRCRELPAQKWWHTGALYRIGDLQAFQGHGAGNLAGLKGRLDYLSSLKVKGLVLGPIHKNQKDDVAQTDLLQIDPNFGSKEDFDSLLQSAKKKSIRVILDLTPNYRGENSWFSTQVDTVATKVKDALEFWLQAGVDGFQVRDIENLKDASSFLAEWQNITKGFSEDRLLIAGTNSSDLQQILSLLESNKDLLLTSSYLSDSGSTGEHTKSLVTQYLNATGNRWCSWSLSQARLLTSFLPAQLLRLYQLMLFTLPGTPVFSYGDEIGLDAAALPGQPMEAPVMLWDESSFPDIPGAVSANMTVKGQSEDPGSLLSLFRRLSDQRSKERSLLHGDFHAFSAGPGLFSYIRHWDQNERFLVVLNFGDVGLSAGLQASDLPASASLPAKADLLLSTQPGREEGSPLELERLKLEPHEGLLLRFPYAA
SEQ ID NO:482 SLC3A2之外顯子1及2按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:483 SLC3A2之外顯子1-2按順序排列的轉譯多肽序列
APP 序列資訊SEQ ID NO:484 來自APP-NRG1融合物5’處之APP外顯子14的序列
TTGAGCCTGTTGATGCCCGCCCTGCTGCCGACCGAGGACTGACCACTCGACCAG
SEQ ID NO:485 APP-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCT
SEQ ID NO:486 APP-NRG1多核苷酸序列
TTGAGCCTGTTGATGCCCGCCCTGCTGCCGACCGAGGACTGACCACTCGACCAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCT
SEQ ID NO:487 APP-NRG1多肽序列
EPVDARPAADRGLTTRPATSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGEC
SEQ ID NO:488 APP之外顯子1
GTCAGTTTCCTCGGCAGCGGTAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGTGCGCGGGGGCCCCGGGAGACGGCGGCGGTGGCGGCGCGGGCAGAGCAAGGACGCGGCGGATCCCACTCGCACAGCAGCGCACTCGGTGCCCCGCGCAGGGTCGCGATGCTGCCCGGTTTGGCACTGCTCCTGCTGGCCGCCTGGACGGCTCGGGCGCTGGAG
SEQ ID NO:489 APP之外顯子2
GTCTACCCTGAACTGCAGATCACCAATGTGGTAGAAGCCAACCAACCAGTGACCATCCAGAACTGGTGCAAGCGGGGCCGCAAGCAGTGCAAGACCCATCCCCACTTTGTGATTCCCTACCGCTGCTTAG
SEQ ID NO:490 APP之外顯子3
TTGGTGAGTTTGTAAGTGATGCCCTTCTCGTTCCTGACAAGTGCAAATTCTTACACCAGGAGAGGATGGATGTTTGCGAAACTCATCTTCACTGGCACACCGTCGCCAAAGAG
SEQ ID NO:491 APP之外顯子4
ACATGCAGTGAGAAGAGTACCAACTTGCATGACTACGGCATGTTGCTGCCCTGCGGAATTGACAAGTTCCGAGGGGTAGAGTTTGTGTGTTGCCCACTGGCTGAAGAAAGTGACAATGTGGATTCTGCTGATGCGGAGGAGGATGACTCGGATGTCTGGTGGGGCGGAGCAGACACAGACTATGCAGATGGGAG
SEQ ID NO:492 APP之外顯子5
TGAAGACAAAGTAGTAGAAGTAGCAGAGGAGGAAGAAGTGGCTGAGGTGGAAGAAGAAGAAGCCGATGATGACGAGGACGATGAGGATGGTGATGAGGTAGAGGAAGAGGCTGAGGAACCCTACGAAGAAGCCACAGAGAGAACCACCAGCATTGCCACCACCACCACCACCACCACAGAGTCTGTGGAAGAGGTGGTTCGAG
SEQ ID NO:493 APP之外顯子6
AGGTGTGCTCTGAACAAGCCGAGACGGGGCCGTGCCGAGCAATGATCTCCCGCTGGTACTTTGATGTGACTGAAGGGAAGTGTGCCCCATTCTTTTACGGCGGATGTGGCGGCAACCGGAACAACTTTGACACAGAAGAGTACTGCATGGCCGTGTGTGGCAGCGCCA
SEQ ID NO:494 APP之外顯子7
TGTCCCAAAGTTTACTCAAGACTACCCAGGAACCTCTTGCCCGAGATCCTGTTAAAC
SEQ ID NO:495 APP之外顯子8
TTCCTACAACAGCAGCCAGTACCCCTGATGCCGTTGACAAGTATCTCGAGACACCTGGGGATGAGAATGAACATGCCCATTTCCAGAAAGCCAAAGAGAGGCTTGAGGCCAAGCACCGAGAGAGAATGTCCCAG
SEQ ID NO:496 APP之外顯子9
GTCATGAGAGAATGGGAAGAGGCAGAACGTCAAGCAAAGAACTTGCCTAAAGCTGATAAGAAGGCAGTTATCCAG
SEQ ID NO:497 APP之外顯子10
CATTTCCAGGAGAAAGTGGAATCTTTGGAACAGGAAGCAGCCAACGAGAGACAGCAGCTGGTGGAGACACACATGGCCAGAGTGGAAGCCATGCTCAATGACCGCCGCCGCCTGGCCCTGGAGAACTACATCACCGCTCTGCAGGCTGTTCCTCCTCGG
SEQ ID NO:498 APP之外顯子11
CCTCGTCACGTGTTCAATATGCTAAAGAAGTATGTCCGCGCAGAACAGAAGGACAGACAGCACACCCTAAAGCATTTCGAGCATGTGCGCATGGTGGATCCCAAGAAAGCCGCTCAGATCCGGTCCCAG
SEQ ID NO:499 APP之外顯子12
GTTATGACACACCTCCGTGTGATTTATGAGCGCATGAATCAGTCTCTCTCCCTGCTCTACAACGTGCCTGCAGTGGCCGAGGAGATTCAGGATGAAGTTG
SEQ ID NO:500 APP之外顯子13
ATGAGCTGCTTCAGAAAGAGCAAAACTATTCAGATGACGTCTTGGCCAACATGATTAGTGAACCAAGGATCAGTTACGGAAACGATGCTCTCATGCCATCTTTGACCGAAACGAAAACCACCGTGGAGCTCCTTCCCGTGAATGGAGAGTTCAGCCTGGACGATCTCCAGCCGTGGCATTCTTTTGGGGCTGACTCTGTGCCAGCCAACACAGAAAACGAAG
SEQ ID NO:501 APP之外顯子14
TTGAGCCTGTTGATGCCCGCCCTGCTGCCGACCGAGGACTGACCACTCGACCAG
SEQ ID NO:502 APP之外顯子15
GTTCTGGGTTGACAAATATCAAGACGGAGGAGATCTCTGAAGTGAAGATGGATGCAGAATTCCGACATGACTCAGGATATGAAGTTCATCATCAAAAATTG
SEQ ID NO:503 APP之外顯子16
GTGTTCTTTGCAGAAGATGTGGGTTCAAACAAAGGTGCAATCATTGGACTCATGGTGGGCGGTGTTGTCATAGCGACAGTGATCGTCATCACCTTGGTGATGCTGAAGAAGAAACAGTACACATCCATTCATCATGGTGTGGTGGAG
SEQ ID NO:504 APP之外顯子17
GTTGACGCCGCTGTCACCCCAGAGGAGCGCCACCTGTCCAAGATGCAGCAGAACGGCTACGAAAATCCAACCTACAAGTTCTTTGAGCAGATGCAGAACTAGACCCCCGCCACAGCAGCCTCTGAAGTTGGACAGCAAAACCATTGCTTCACTACCCATCGGTGTCCATTTATAGAATAATGTGGGAAGAAACAAACCCGTTTTATGATTTACTCATTATCGCCTTTTGACAGCTGTGCTGTAACACAAGTAGATGCCTGAACTTGAATTAATCCACACATCAGTAATGTATTCTATCTCTCTTTACATTTTGGTCTCTATACTACATTATTAATGGGTTTTGTGTACTGTAAAGAATTTAGCTGTATCAAACTAGTGCATGAATAGATTCTCTCCTGATTATTTATCACATAGCCCCTTAGCCAGTTGTATATTATTCTTGTGGTTTGTGACCCAATTAAGTCCTACTTTACATATGCTTTAAGAATCGATGGGGGATGCTTCATGTGAACGTGGGAGTTCAGCTGCTTCTCTTGCCTAAGTATTCCTTTCCTGATCACTATGCATTTTAAAGTTAAACATTTTTAAGTATTTCAGATGCTTTAGAGAGATTTTTTTTCCATGACTGCATTTTACTGTACAGATTGCTGCTTCTGCTATATTTGTGATATAGGAATTAAGAGGATACACACGTTTGTTTCTTCGTGCCTGTTTTATGTGCACACATTAGGCATTGAGACTTCAAGCTTTTCTTTTTTTGTCCACGTATCTTTGGGTCTTTGATAAAGAAAAGAATCCCTGTTCATTGTAAGCACTTTTACGGGGCGGGTGGGGAGGGGTGCTCTGCTGGTCTTCAATTACCAAGAATTCTCCAAAACAATTTTCTGCAGGATGATTGTACAGAATCATTGCTTATGACATGATCGCTTTCTACACTGTATTACATAAATAAATTAAATAAAATAACCCCGGGCAAGACTTTTCTTTGAAGGATGACTACAGACATTAAATAATCGAAGTAATTTTGGGTGGGGAGAAGAGGCAGATTCAATTTTCTTTAACCAGTCTGAAGTTTCATTTATGATACAAAAGAAGATGAAAATGGAAGTGGCAATATAAGGGGATGAGGAAGGCATGCCTGGACAAACCCTTCTTTTAAGATGTGTCTTCAATTTGTATAAAATGGTGTTTTCATGTAAATAAATACATTCTTGGAGGAGCA
SEQ ID NO:505 APP之全mRNA多核苷酸序列
GTCAGTTTCCTCGGCAGCGGTAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGTGCGCGGGGGCCCCGGGAGACGGCGGCGGTGGCGGCGCGGGCAGAGCAAGGACGCGGCGGATCCCACTCGCACAGCAGCGCACTCGGTGCCCCGCGCAGGGTCGCGATGCTGCCCGGTTTGGCACTGCTCCTGCTGGCCGCCTGGACGGCTCGGGCGCTGGAGGTCTACCCTGAACTGCAGATCACCAATGTGGTAGAAGCCAACCAACCAGTGACCATCCAGAACTGGTGCAAGCGGGGCCGCAAGCAGTGCAAGACCCATCCCCACTTTGTGATTCCCTACCGCTGCTTAGTTGGTGAGTTTGTAAGTGATGCCCTTCTCGTTCCTGACAAGTGCAAATTCTTACACCAGGAGAGGATGGATGTTTGCGAAACTCATCTTCACTGGCACACCGTCGCCAAAGAGACATGCAGTGAGAAGAGTACCAACTTGCATGACTACGGCATGTTGCTGCCCTGCGGAATTGACAAGTTCCGAGGGGTAGAGTTTGTGTGTTGCCCACTGGCTGAAGAAAGTGACAATGTGGATTCTGCTGATGCGGAGGAGGATGACTCGGATGTCTGGTGGGGCGGAGCAGACACAGACTATGCAGATGGGAGTGAAGACAAAGTAGTAGAAGTAGCAGAGGAGGAAGAAGTGGCTGAGGTGGAAGAAGAAGAAGCCGATGATGACGAGGACGATGAGGATGGTGATGAGGTAGAGGAAGAGGCTGAGGAACCCTACGAAGAAGCCACAGAGAGAACCACCAGCATTGCCACCACCACCACCACCACCACAGAGTCTGTGGAAGAGGTGGTTCGAGAGGTGTGCTCTGAACAAGCCGAGACGGGGCCGTGCCGAGCAATGATCTCCCGCTGGTACTTTGATGTGACTGAAGGGAAGTGTGCCCCATTCTTTTACGGCGGATGTGGCGGCAACCGGAACAACTTTGACACAGAAGAGTACTGCATGGCCGTGTGTGGCAGCGCCATGTCCCAAAGTTTACTCAAGACTACCCAGGAACCTCTTGCCCGAGATCCTGTTAAACTTCCTACAACAGCAGCCAGTACCCCTGATGCCGTTGACAAGTATCTCGAGACACCTGGGGATGAGAATGAACATGCCCATTTCCAGAAAGCCAAAGAGAGGCTTGAGGCCAAGCACCGAGAGAGAATGTCCCAGGTCATGAGAGAATGGGAAGAGGCAGAACGTCAAGCAAAGAACTTGCCTAAAGCTGATAAGAAGGCAGTTATCCAGCATTTCCAGGAGAAAGTGGAATCTTTGGAACAGGAAGCAGCCAACGAGAGACAGCAGCTGGTGGAGACACACATGGCCAGAGTGGAAGCCATGCTCAATGACCGCCGCCGCCTGGCCCTGGAGAACTACATCACCGCTCTGCAGGCTGTTCCTCCTCGGCCTCGTCACGTGTTCAATATGCTAAAGAAGTATGTCCGCGCAGAACAGAAGGACAGACAGCACACCCTAAAGCATTTCGAGCATGTGCGCATGGTGGATCCCAAGAAAGCCGCTCAGATCCGGTCCCAGGTTATGACACACCTCCGTGTGATTTATGAGCGCATGAATCAGTCTCTCTCCCTGCTCTACAACGTGCCTGCAGTGGCCGAGGAGATTCAGGATGAAGTTGATGAGCTGCTTCAGAAAGAGCAAAACTATTCAGATGACGTCTTGGCCAACATGATTAGTGAACCAAGGATCAGTTACGGAAACGATGCTCTCATGCCATCTTTGACCGAAACGAAAACCACCGTGGAGCTCCTTCCCGTGAATGGAGAGTTCAGCCTGGACGATCTCCAGCCGTGGCATTCTTTTGGGGCTGACTCTGTGCCAGCCAACACAGAAAACGAAGTTGAGCCTGTTGATGCCCGCCCTGCTGCCGACCGAGGACTGACCACTCGACCAGGTTCTGGGTTGACAAATATCAAGACGGAGGAGATCTCTGAAGTGAAGATGGATGCAGAATTCCGACATGACTCAGGATATGAAGTTCATCATCAAAAATTGGTGTTCTTTGCAGAAGATGTGGGTTCAAACAAAGGTGCAATCATTGGACTCATGGTGGGCGGTGTTGTCATAGCGACAGTGATCGTCATCACCTTGGTGATGCTGAAGAAGAAACAGTACACATCCATTCATCATGGTGTGGTGGAGGTTGACGCCGCTGTCACCCCAGAGGAGCGCCACCTGTCCAAGATGCAGCAGAACGGCTACGAAAATCCAACCTACAAGTTCTTTGAGCAGATGCAGAACTAGACCCCCGCCACAGCAGCCTCTGAAGTTGGACAGCAAAACCATTGCTTCACTACCCATCGGTGTCCATTTATAGAATAATGTGGGAAGAAACAAACCCGTTTTATGATTTACTCATTATCGCCTTTTGACAGCTGTGCTGTAACACAAGTAGATGCCTGAACTTGAATTAATCCACACATCAGTAATGTATTCTATCTCTCTTTACATTTTGGTCTCTATACTACATTATTAATGGGTTTTGTGTACTGTAAAGAATTTAGCTGTATCAAACTAGTGCATGAATAGATTCTCTCCTGATTATTTATCACATAGCCCCTTAGCCAGTTGTATATTATTCTTGTGGTTTGTGACCCAATTAAGTCCTACTTTACATATGCTTTAAGAATCGATGGGGGATGCTTCATGTGAACGTGGGAGTTCAGCTGCTTCTCTTGCCTAAGTATTCCTTTCCTGATCACTATGCATTTTAAAGTTAAACATTTTTAAGTATTTCAGATGCTTTAGAGAGATTTTTTTTCCATGACTGCATTTTACTGTACAGATTGCTGCTTCTGCTATATTTGTGATATAGGAATTAAGAGGATACACACGTTTGTTTCTTCGTGCCTGTTTTATGTGCACACATTAGGCATTGAGACTTCAAGCTTTTCTTTTTTTGTCCACGTATCTTTGGGTCTTTGATAAAGAAAAGAATCCCTGTTCATTGTAAGCACTTTTACGGGGCGGGTGGGGAGGGGTGCTCTGCTGGTCTTCAATTACCAAGAATTCTCCAAAACAATTTTCTGCAGGATGATTGTACAGAATCATTGCTTATGACATGATCGCTTTCTACACTGTATTACATAAATAAATTAAATAAAATAACCCCGGGCAAGACTTTTCTTTGAAGGATGACTACAGACATTAAATAATCGAAGTAATTTTGGGTGGGGAGAAGAGGCAGATTCAATTTTCTTTAACCAGTCTGAAGTTTCATTTATGATACAAAAGAAGATGAAAATGGAAGTGGCAATATAAGGGGATGAGGAAGGCATGCCTGGACAAACCCTTCTTTTAAGATGTGTCTTCAATTTGTATAAAATGGTGTTTTCATGTAAATAAATACATTCTTGGAGGAGCA
SEQ ID NO:506 APP之外顯子1的轉譯多肽序列
MLPGLALLLLAAWTARALE
SEQ ID NO:507 APP之外顯子2的轉譯多肽序列
VYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHPHFVIPYRCL
SEQ ID NO:508 APP之外顯子3的轉譯多肽序列
GEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKE
SEQ ID NO:509 APP之外顯子4的轉譯多肽序列
TCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADG
SEQ ID NO:510 APP之外顯子5的轉譯多肽序列
EDKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVR
SEQ ID NO:511 APP之外顯子6的轉譯多肽序列
VCSEQAETGPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSA
SEQ ID NO:512 APP之外顯子7的轉譯多肽序列
SQSLLKTTQEPLARDPVK
SEQ ID NO:513 APP之外顯子8的轉譯多肽序列
PTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQ
SEQ ID NO:514 APP之外顯子9的轉譯多肽序列
VMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQ
SEQ ID NO:515 APP之外顯子10的轉譯多肽序列
HFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPR
SEQ ID NO:516 APP之外顯子11的轉譯多肽序列
PRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQ
SEQ ID NO:517 APP之外顯子12的轉譯多肽序列
VMTHLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEV
SEQ ID NO:518 APP之外顯子13的轉譯多肽序列
ELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTETKTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENE
SEQ ID NO:519 APP之外顯子14的轉譯多肽序列
EPVDARPAADRGLTTRP
SEQ ID NO:520 APP之外顯子15的轉譯多肽序列
SGLTNIKTEEISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKL
SEQ ID NO:521 APP之外顯子16的轉譯多肽序列
VFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSIHHGVVE
SEQ ID NO:522 APP之外顯子17的轉譯多肽序列
VDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
SEQ ID NO:523 APP之全蛋白質序列
MLPGLALLLLAAWTARALEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVREVCSEQAETGPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSAMSQSLLKTTQEPLARDPVKLPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTETKTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARPAADRGLTTRPGSGLTNIKTEEISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
SEQ ID NO:524 APP之全部外顯子1-14按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:525 APP之全部外顯子1-14按順序排列的轉譯多肽序列
WRN 序列資訊SEQ ID NO:526 來自WRN-NRG1融合物5’處之WRN外顯子33的序列
AAGCTGGCTGCCCCCTTGATTTGGAGCGAGCAGGCCTGACTCCAGAGGTTCAGAAGATTATTGCTGATGTTATCCGAAACCCTCCCGTCAACTCAG
SEQ ID NO:527 WRN-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGCT
SEQ ID NO:528 WRN-NRG1多核苷酸序列
AAGCTGGCTGCCCCCTTGATTTGGAGCGAGCAGGCCTGACTCCAGAGGTTCAGAAGATTATTGCTGATGTTATCCGAAACCCTCCCGTCAACTCAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATGGAGGGGAGTGC
SEQ ID NO:529 WRN-NRG1多肽序列
AGCPLDLERAGLTPEVQKIIADVIRNPPVNSATSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGEC
SEQ ID NO:530 WRN之外顯子1
GTGTACTGTGTGCGCCGGGGAGGCGCCGGCTTGTACTCGGCAGCGCGGGAATAAAGTTTGCTGATTTGGTGTCTAGCCTGGATGCCTGGGTTGCAGGCCCTGCTTGTGGTGGCGCTCCACAGTCATCCGGCTGAAGAAGACCTGTTGGACTGGATCTTCTCGGG
SEQ ID NO:531 WRN之外顯子2
TTTTCTTTCAGATATTGTTTTGTATTTACCCATGAAGACATTGTTTTTTGGACTCTGCAAATAGGACATTTCAAAGATGAGTGAAAAAAAATTGGAAACAACTGCACAGCAGCGGAAATGTCCTGAATGGATGAATGTGCAGAATAAAAGATGTGCTGTAGAAGAAAGAAAG
SEQ ID NO:532 WRN之外顯子3
GCATGTGTTCGGAAGAGTGTTTTTGAAGATGACCTCCCCTTCTTAGAATTCACTGGATCCATTGTGTATAGTTACGATGCTAGTGATTGCTCTTTCCTGTCAGAAGATATTAG
SEQ ID NO:533 WRN之外顯子4
CATGAGTCTATCAGATGGGGATGTGGTGGGATTTGACATGGAGTGGCCACCATTATACAATAGAGGGAAACTTGGCAAAGTTGCACTAATTCAGTTGTGTGTTTCTGAGAGCAAATGTTACTTGTTCCACGTTTCTTCCATGTCAG
SEQ ID NO:534 WRN之外顯子5
TTTTTCCCCAGGGATTAAAAATGTTGCTTGAAAATAAAGCAGTTAAAAAGGCAGGTGTAGGAATTGAAGGAGATCAGTGGAAACTTCTACGTGACTTTGATATCAAATTGAAGAATTTTGTGGAGTTGACAGATGTTGCCAATAAAAAG
SEQ ID NO:535 WRN之外顯子6
CTGAAATGCACAGAGACCTGGAGCCTTAACAGTCTGGTTAAACACCTCTTAGGTAAACAGCTCCTGAAAGACAAGTCTATCCGCTGTAGCAATTGGAGTAAATTTCCTCTCACTGAGGACCAGAAACTGTATGCAGCCACTGATGCTTAT
SEQ ID NO:536 WRN之外顯子7
GCTGGTTTTATTATTTACCGAAATTTAGAGATTTTGGATGATACTGTGCAAAGGTTTGCTATAAATAAAG
SEQ ID NO:537 WRN之外顯子8
AGGAAGAAATCCTACTTAGCGACATGAACAAACAGTTGACTTCAATCTCTGAGGAAGTGATGGATCTGGCTAAGCATCTTCCTCATGCTTTCAGTAAATTGGAAAACCCACGGAG
SEQ ID NO:538 WRN之外顯子9
GGTTTCTATCTTACTAAAGGATATTTCAGAAAATCTATATTCACTGAGGAGGATGATAATTGGGTCTACTAACATTGAGACTGAACTGAGGCCCAGCAATAATTTAAACTTATTATCCTTTGAAGATTCAACTACTGGGGGAGTACAACAGAAACAAATTAGAGAACATGAAGTTTTAATTCACGTTGAAGATGAAACATGGGACCCAACACTTGATCATTTAGCTAAACATGATGGAGAAGATGTACTTGGAAATAAAGTGGAACGAAAAGAAGATGGATTTGAAGATGGAGTAGAAGACAACAAATTGAAAGAGAATATGGAAAGAGCTTGTTTGATGTCGTTAGATATTACAGAACATGAACTCCAAATTTTGGAACAGCAGTCTCAGGAAGAATATCTTAGTGATATTGCTTATAAATCTACTGAG
SEQ ID NO:539 WRN之外顯子10
CATTTATCTCCCAATGATAATGAAAACGATACGTCCTATGTAATTGAGAGTGATGAAGATTTAGAAATGGAGATGCTTAAG
SEQ ID NO:540 WRN之外顯子11
CATTTATCTCCCAATGATAATGAAAACGATACGTCCTATGTAATTGAGAGTGATGAAGATTTAGAAATGGAGATGCTTAAG
SEQ ID NO:541 WRN之外顯子12
TCTTTAGAAAACCTCAATAGTGGCACGGTAGAACCAACTCATTCTAAATGCTTAAAAATGGAAAGAAATCTGGGTCTTCCTACTAAAGAAGAAGAAGAAGATGATGAAAATGAAGCTAATGAAGGGGAAGAAGATGATGATAAGG
SEQ ID NO:542 WRN之外顯子13
ACTTTTTGTGGCCAGCACCCAATGAAGAGCAAGTTACTTGCCTCAAGATGTACTTTGGCCATTCCAGTTTTAAACC
SEQ ID NO:543 WRN之外顯子14
AGTTCAGTGGAAAGTGATTCATTCAGTATTAGAAGAAAGAAGAGATAATGTTGCTGTCATGGCAACTG
SEQ ID NO:544 WRN之外顯子15
GATATGGAAAGAGTTTGTGCTTCCAGTATCCACCTGTTTATGTAGGCAAGATTGGCCTTGTTATCTCTCCCCTTATTTCTCTGATGGAAGACCAAGTGCTACAGCTTAA
SEQ ID NO:545 WRN之外顯子16
AATGTCCAACATCCCAGCTTGCTTCCTTGGATCAGCACAGTCAGAAAATGTTCTAACAGATATTAAATT
SEQ ID NO:546 WRN之外顯子17
AGGTAAATACCGGATTGTATACGTAACTCCAGAATACTGTTCAGGTAACATGGGCCTGCTCCAGCAACTTGAGGCTGATATTG
SEQ ID NO:547 WRN之外顯子18
GTATCACGCTCATTGCTGTGGATGAGGCTCACTGTATTTCTGAGTGGGGGCATGATTTTAGGGATTCATTCAGGAAGTTGGGCTCCCTAAAGACAGCACTGCCAATG
SEQ ID NO:548 WRN之外顯子19
GTTCCAATCGTTGCACTTACTGCTACTGCAAGTTCTTCAATCCGGGAAGACATTGTACGTTGCTTAAATCTGAGAAATCCTCAGATCACCTGTACTGGTTTTGATCGACCAAACCTGTATTTAGAAGTTAGGCGAAAAACAGGGAATATCCTTCAGGATCTGCAGCCATTTCTTGTCAAAACAAG
SEQ ID NO:549 WRN之外顯子20
TTCCCACTGGGAATTTGAAGGTCCAACAATCATCTACTGTCCTTCTAGAAAAATGACACAACAAGTTACAGGTGAACTTAGGAAACTGAATCTATCCTGTGGAACATACCATGCGGGCATGAGTTTTAGCACAAGGAAAGACATTCATCATAGGTTTGTAAGAGATGAAATTCAG
SEQ ID NO:550 WRN之外顯子21
TGTGTCATAGCTACCATAGCTTTTGGAATGGGCATTAATAAAGCTGACATTCGCCAAGTCATTCATTACGGTGCTCCTAAGGACATGGAATCATATTATCAGGAGATTGGTAGAGCTGGTCGTGATGGACTTCAAAGTTCTTGTCACGTCCTCTGGGCTCCTGCAGACATTAACTTAAATAG
SEQ ID NO:551 WRN之外顯子22
GCACCTTCTTACTGAGATACGTAATGAGAAGTTTCGATTATACAAATTAAAGATGATGGCAAAGATGGAAAAATATCTTCATTCTAGCAGATGTAGGAGACA
SEQ ID NO:552 WRN之外顯子23
AATCATCTTGTCTCATTTTGAGGACAAACAAGTACAAAAAGCCTCCTTGGGAATTATGGGAACTGAAAAATGCTGTGATAATTGCAGGTCCAG
SEQ ID NO:553 WRN之外顯子24
ATTGGATCATTGCTATTCCATGGATGACTCAGAGGATACATCCTGGGACTTTGGTCCACAAGCATTTAAGCTTTTGTCTGCTGTGGACATCTTAGGCGAAAAATTTGGAATTGGGCTTCCAATTTTATTTCTCCGAGGATCT
SEQ ID NO:554 WRN之外顯子25
AATTCTCAGCGTCTTGCCGATCAATATCGCAGGCACAGTTTATTTGGCACTGGCAAGGATCAAACAGAGAGTTGGTGGAAGGCTTTTTCCCGTCAGCTGATCACTGAGGGATTCTTGGTAGAAGTTTCTCGGTATAACAAATTTATGAAGATTTGCGCCCTTACGAAAAAG
SEQ ID NO:555 WRN之外顯子26
GGTAGAAATTGGCTTCATAAAGCTAATACAGAATCTCAGAGCCTCATCCTTCAAGCTAATGAAGAATTGTGTCCAAAGAAGTTGCTTCTGCCTAG
SEQ ID NO:556 WRN之外顯子27
TTCGAAAACTGTATCTTCGGGCACCAAAGAGCATTGTTATAATCAAGTACCAGTTGAATTAAGTACAGAGAAGAAG
SEQ ID NO:557 WRN之外顯子28
TCTAACTTGGAGAAGTTATATTCTTATAAACCATGTGATAAGATTTCTTCTGGGAGTAACATTTCTAAAAAAAG
SEQ ID NO:558 WRN之外顯子29
TATCATGGTACAGTCACCAGAAAAAGCTTACAGTTCCTCACAGCCTGTTATTTCGGCACAAGAGCAGGAGACTCAG
SEQ ID NO:559 WRN之外顯子30
ATTGTGTTATATGGCAAATTGGTAGAAGCTAGGCAGAAACATGCCAATAAAATGGATGTTCCCCCAGCTATTCTGGCAACAAACAAGATACTGGTGGATATGGCCAAAATGAG
SEQ ID NO:560 WRN之外顯子31
ACCAACTACGGTTGAAAACGTAAAAAGGATTGATGGTGTTTCTGAAGGCAAAGCTGCCATGTTGGCCCCTCTGTTGGAAGTCATCAAACATTTCTGCCAAACAAATAGTGTTCAG
SEQ ID NO:561 WRN之外顯子32
ACAGACCTCTTTTCAAGTACAAAACCTCAAGAAGAACAGAAGACGAGTCTGGTAGCAAAAAATAAAATATGCACACTTTCACAGTCTATGGCCATCACATACTCTTTATTCCAAGAAAAGAAGATGCCTTTG
SEQ ID NO:562 WRN之外顯子33
AAGAGCATAGCTGAGAGCAGGATTCTGCCTCTCATGACAATTGGCATGCACTTATCCCAAGCGGTGAAAGCTGGCTGCCCCCTTGATTTGGAGCGAGCAGGCCTGACTCCAGAGGTTCAGAAGATTATTGCTGATGTTATCCGAAACCCTCCCGTCAACTCAG
SEQ ID NO:563 WRN之外顯子34
ATATGAGTAAAATTAGCCTAATCAGAATGTTAGTTCCTGAAAACATTGACACGTACCTTATCCACATGGCAATTGAGATCCTTAAACATGGTCCTGACAGCGGACTTCAACCTTCATGTGATGTCAACAAAAGGAGATGTTTTCCCGGTTCTGAAGAGATCTGTTCAAGTTCTAAGAGAAGCAAGGAAGAAGTAGGCATCAATACTGAG
SEQ ID NO:564 WRN之外顯子35
ACTTCATCTGCAGAGAGAAAGAGACGATTACCTGTGTGGTTTGCCAAAGGAAGTGATACCAGCAAGAAATTAATGGACAAAACGAAAAGGGGAGGTCTTTTTAGTTAAGCTGGCAATTACCAGAACAATTATGTTTCTTGCTGTATTATAAGAGGATAGCTATATTTTATTTCTGAAGAGTAAGGAGTAGTATTTTGGCTTAAAAATCATTCTAATTACAAAGTTCACTGTTTATTGAAGAACTGGCATCTTAAATCAGCCTTCCGCAATTCATGTAGTTTCTGGGTCTTCTGGGAGCCTACGTGAGTACATCACCTAACAGAATATTAAATTAGACTTCCTGTAAGATTGCTTTAAGAAACTGTTACTGTCCTGTTTTCTAATCTCTTTATTAAAACAGTGTATTTGGAAAATGTTATGTGCTCTGATTTGATATAGATAACAGATTAGTAGTTACATGGTAATTATGTGATATAAAATATTCATATATTATCAAAATTCTGTTTTGTAAATGTAAGAAAGCATAGTTATTTTACAAATTGTTTTTACTGTCTTTTGAAGAAGTTCTTAAATACGTTGTTAAATGGTATTAGTTGACCAGGGCAGTGAAAATGAAACCGCATTTTGGGTGCCATTAAATAGGGAAAAAACATGTAAAAAATGTAAAATGGAGACCAATTGCACTAGGCAAGTGTATATTTTGTATTTTATATACAATTTCTATTATTTTTCAAGTAATAAAACAATGTTTTTCATACTGAATATTATATATATATTTTTTAGCTTTCATTTACTTAATTATTTTAAGTACCTTTATTTTTCCAGGATGTCAGAATTTGATTCTAATCTCTCTTATGTAGCACATGTGACTTAATTTAAAACCTATACTGTGACACAGAGTTGGGTAAACGATGATTATTTAACTTTAAGCAGTTCACCATCCATTTCAAAGCCTTTGATTGGCTTTTTTGTAAATAAAAATAACTTGTTAAGAAACAAATATATCTGTCATAGAAGAACTAGAAAATCCAGGGAAGTGAGAAAAATGAAAATAAAAATCATTCATAGTTTTACTAGTAGCTAATCACAGTCAACCTCTTTTGTGTATCCCACCAGACTTTTTTATATTCATTTGTTTTTAGTTAAAATATAAAAGTCTCGTATATTCCCATTTTTCTGCATTGCATTACCAGAAGGTAGTGGCGCCTATTAAATATGTGATATGTTGTTGTCCAGCCATGGCTTCTGCATTTGCATGCTTTTGTGTGTGCATCTGCAATACCCTGTGAATATCCTGTGTGATGGAGTGGCAAGTACGCACAGACACGTCTGCTGCATGCCTAGGTACGAGGCTGTCTCCAGGAGAAGCACTTGTTTGATTATTTGAGTTGCCAATTGAATTTGCTGCTTTTTTTCATGGCTTGCCATTTTCACTGAAAAGAATGACTAATGAAAAACGATGATTGGTTATTAGATTTGGATGTTTGGCAGACATTTTCTCAAAATTGAACTAAGTTGGCCTCTTCACGGAAAACAACTGGTATTTGTTGTGCCAATGATAAAATTGGAGATTTCTAGCAAAATGTATAATTTTGGAAAAGTTGTGTTCCTCCACTGGAAGCTTGACAGCTTTCCTTAACATAAAGACTTCTCTTTCTCTTCGCTTTCACTACTACTACTACTAATTCTTCTTCTGATTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCCTTCTTCCTTCCTTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCTTCTTTCTCTCTTTCCTTCCTTCCCTTCCCTTCCCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTTCTTTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTCTTTCTCTTTTTCTTTCTTTCAAGCAGTCCTCCCGCCTCAGTCCCCCAAAATAGTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCACAGCCTTACATAAAGCCTTTTCTAATGAGATGGATAGTAATTAACAAATGTGAGTTTTTGATATTATATAAAGATTTTTTCTGTGTTTCGAAGATCCGTATAACTCAGTGAATCAGTATGTTCTGGATGACTAATATGTGATGTTAAGAAATCATGACTGAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGATCAGGAGATCGAGACCACCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGTTGGTGCGTGCCTATAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACCCCAGCCTGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAATAAAAAAAGAAATCATGACTGGGTAAAAGATCTGTTCAGAGTACAAGATGGACCAATGGATTTGATATATTTGAATATAACAGAGTATGAAAAAGTTTATTGATATAGTTTCAGATTACACACTGCAACTAATCTTTAAGAAACTATTACTTGTCCACTTTTTGGTAAAATTTCAGAGAACAATGTCCACCATTATCTGAACAGGCTATTAAAATACTCTTCTCTTTTCCAACTACGTGCCTGTGCAAAGTCAGATTTTTTTCATATACTTCAGCCAAAACAGCATATCAAAATGGATTGAATGCAGAAGTAGATCTGAGAATACAGCCACTTTTGTTAAGCCAGACAATGAGATTTGCAAAATGTAAACAATGCTGCTGTTCTCAGTTTTTAAAAATATGTTTTTTAAAAGTATTTATGTTAATGTGTACTTGGTTTACTACTGCTATTTTTAAATAAAACAAGAAACATTTTTAAATGTCTGTTTTAATTTCTAAAGTGGTAGTGATAGATATAACCCATATTAATAAAAGCTCTTTGGGGTCCTCAGTGATTTTTTTTTAAGAGTATGGAAGGGTTCTCAGACCTAAGAGATTGAGAAATGCTGATGTAATGTTTTATTATAAAGGTGTACCATGAATTATGTACCTTACTTCATATTGTTGGACATTAAAGTTGCTTTCAGTTTTTTTGTTTTAAA
SEQ ID NO:565 WRN之全mRNA多核苷酸序列
GTGTACTGTGTGCGCCGGGGAGGCGCCGGCTTGTACTCGGCAGCGCGGGAATAAAGTTTGCTGATTTGGTGTCTAGCCTGGATGCCTGGGTTGCAGGCCCTGCTTGTGGTGGCGCTCCACAGTCATCCGGCTGAAGAAGACCTGTTGGACTGGATCTTCTCGGGTTTTCTTTCAGATATTGTTTTGTATTTACCCATGAAGACATTGTTTTTTGGACTCTGCAAATAGGACATTTCAAAGATGAGTGAAAAAAAATTGGAAACAACTGCACAGCAGCGGAAATGTCCTGAATGGATGAATGTGCAGAATAAAAGATGTGCTGTAGAAGAAAGAAAGGCATGTGTTCGGAAGAGTGTTTTTGAAGATGACCTCCCCTTCTTAGAATTCACTGGATCCATTGTGTATAGTTACGATGCTAGTGATTGCTCTTTCCTGTCAGAAGATATTAGCATGAGTCTATCAGATGGGGATGTGGTGGGATTTGACATGGAGTGGCCACCATTATACAATAGAGGGAAACTTGGCAAAGTTGCACTAATTCAGTTGTGTGTTTCTGAGAGCAAATGTTACTTGTTCCACGTTTCTTCCATGTCAGTTTTTCCCCAGGGATTAAAAATGTTGCTTGAAAATAAAGCAGTTAAAAAGGCAGGTGTAGGAATTGAAGGAGATCAGTGGAAACTTCTACGTGACTTTGATATCAAATTGAAGAATTTTGTGGAGTTGACAGATGTTGCCAATAAAAAGCTGAAATGCACAGAGACCTGGAGCCTTAACAGTCTGGTTAAACACCTCTTAGGTAAACAGCTCCTGAAAGACAAGTCTATCCGCTGTAGCAATTGGAGTAAATTTCCTCTCACTGAGGACCAGAAACTGTATGCAGCCACTGATGCTTATGCTGGTTTTATTATTTACCGAAATTTAGAGATTTTGGATGATACTGTGCAAAGGTTTGCTATAAATAAAGAGGAAGAAATCCTACTTAGCGACATGAACAAACAGTTGACTTCAATCTCTGAGGAAGTGATGGATCTGGCTAAGCATCTTCCTCATGCTTTCAGTAAATTGGAAAACCCACGGAGGGTTTCTATCTTACTAAAGGATATTTCAGAAAATCTATATTCACTGAGGAGGATGATAATTGGGTCTACTAACATTGAGACTGAACTGAGGCCCAGCAATAATTTAAACTTATTATCCTTTGAAGATTCAACTACTGGGGGAGTACAACAGAAACAAATTAGAGAACATGAAGTTTTAATTCACGTTGAAGATGAAACATGGGACCCAACACTTGATCATTTAGCTAAACATGATGGAGAAGATGTACTTGGAAATAAAGTGGAACGAAAAGAAGATGGATTTGAAGATGGAGTAGAAGACAACAAATTGAAAGAGAATATGGAAAGAGCTTGTTTGATGTCGTTAGATATTACAGAACATGAACTCCAAATTTTGGAACAGCAGTCTCAGGAAGAATATCTTAGTGATATTGCTTATAAATCTACTGAGCATTTATCTCCCAATGATAATGAAAACGATACGTCCTATGTAATTGAGAGTGATGAAGATTTAGAAATGGAGATGCTTAAGCATTTATCTCCCAATGATAATGAAAACGATACGTCCTATGTAATTGAGAGTGATGAAGATTTAGAAATGGAGATGCTTAAGTCTTTAGAAAACCTCAATAGTGGCACGGTAGAACCAACTCATTCTAAATGCTTAAAAATGGAAAGAAATCTGGGTCTTCCTACTAAAGAAGAAGAAGAAGATGATGAAAATGAAGCTAATGAAGGGGAAGAAGATGATGATAAGGACTTTTTGTGGCCAGCACCCAATGAAGAGCAAGTTACTTGCCTCAAGATGTACTTTGGCCATTCCAGTTTTAAACCAGTTCAGTGGAAAGTGATTCATTCAGTATTAGAAGAAAGAAGAGATAATGTTGCTGTCATGGCAACTGGATATGGAAAGAGTTTGTGCTTCCAGTATCCACCTGTTTATGTAGGCAAGATTGGCCTTGTTATCTCTCCCCTTATTTCTCTGATGGAAGACCAAGTGCTACAGCTTAAAATGTCCAACATCCCAGCTTGCTTCCTTGGATCAGCACAGTCAGAAAATGTTCTAACAGATATTAAATTAGGTAAATACCGGATTGTATACGTAACTCCAGAATACTGTTCAGGTAACATGGGCCTGCTCCAGCAACTTGAGGCTGATATTGGTATCACGCTCATTGCTGTGGATGAGGCTCACTGTATTTCTGAGTGGGGGCATGATTTTAGGGATTCATTCAGGAAGTTGGGCTCCCTAAAGACAGCACTGCCAATGGTTCCAATCGTTGCACTTACTGCTACTGCAAGTTCTTCAATCCGGGAAGACATTGTACGTTGCTTAAATCTGAGAAATCCTCAGATCACCTGTACTGGTTTTGATCGACCAAACCTGTATTTAGAAGTTAGGCGAAAAACAGGGAATATCCTTCAGGATCTGCAGCCATTTCTTGTCAAAACAAGTTCCCACTGGGAATTTGAAGGTCCAACAATCATCTACTGTCCTTCTAGAAAAATGACACAACAAGTTACAGGTGAACTTAGGAAACTGAATCTATCCTGTGGAACATACCATGCGGGCATGAGTTTTAGCACAAGGAAAGACATTCATCATAGGTTTGTAAGAGATGAAATTCAGTGTGTCATAGCTACCATAGCTTTTGGAATGGGCATTAATAAAGCTGACATTCGCCAAGTCATTCATTACGGTGCTCCTAAGGACATGGAATCATATTATCAGGAGATTGGTAGAGCTGGTCGTGATGGACTTCAAAGTTCTTGTCACGTCCTCTGGGCTCCTGCAGACATTAACTTAAATAGGCACCTTCTTACTGAGATACGTAATGAGAAGTTTCGATTATACAAATTAAAGATGATGGCAAAGATGGAAAAATATCTTCATTCTAGCAGATGTAGGAGACAAATCATCTTGTCTCATTTTGAGGACAAACAAGTACAAAAAGCCTCCTTGGGAATTATGGGAACTGAAAAATGCTGTGATAATTGCAGGTCCAGATTGGATCATTGCTATTCCATGGATGACTCAGAGGATACATCCTGGGACTTTGGTCCACAAGCATTTAAGCTTTTGTCTGCTGTGGACATCTTAGGCGAAAAATTTGGAATTGGGCTTCCAATTTTATTTCTCCGAGGATCTAATTCTCAGCGTCTTGCCGATCAATATCGCAGGCACAGTTTATTTGGCACTGGCAAGGATCAAACAGAGAGTTGGTGGAAGGCTTTTTCCCGTCAGCTGATCACTGAGGGATTCTTGGTAGAAGTTTCTCGGTATAACAAATTTATGAAGATTTGCGCCCTTACGAAAAAGGGTAGAAATTGGCTTCATAAAGCTAATACAGAATCTCAGAGCCTCATCCTTCAAGCTAATGAAGAATTGTGTCCAAAGAAGTTGCTTCTGCCTAGTTCGAAAACTGTATCTTCGGGCACCAAAGAGCATTGTTATAATCAAGTACCAGTTGAATTAAGTACAGAGAAGAAGTCTAACTTGGAGAAGTTATATTCTTATAAACCATGTGATAAGATTTCTTCTGGGAGTAACATTTCTAAAAAAAGTATCATGGTACAGTCACCAGAAAAAGCTTACAGTTCCTCACAGCCTGTTATTTCGGCACAAGAGCAGGAGACTCAGATTGTGTTATATGGCAAATTGGTAGAAGCTAGGCAGAAACATGCCAATAAAATGGATGTTCCCCCAGCTATTCTGGCAACAAACAAGATACTGGTGGATATGGCCAAAATGAGACCAACTACGGTTGAAAACGTAAAAAGGATTGATGGTGTTTCTGAAGGCAAAGCTGCCATGTTGGCCCCTCTGTTGGAAGTCATCAAACATTTCTGCCAAACAAATAGTGTTCAGACAGACCTCTTTTCAAGTACAAAACCTCAAGAAGAACAGAAGACGAGTCTGGTAGCAAAAAATAAAATATGCACACTTTCACAGTCTATGGCCATCACATACTCTTTATTCCAAGAAAAGAAGATGCCTTTGAAGAGCATAGCTGAGAGCAGGATTCTGCCTCTCATGACAATTGGCATGCACTTATCCCAAGCGGTGAAAGCTGGCTGCCCCCTTGATTTGGAGCGAGCAGGCCTGACTCCAGAGGTTCAGAAGATTATTGCTGATGTTATCCGAAACCCTCCCGTCAACTCAGATATGAGTAAAATTAGCCTAATCAGAATGTTAGTTCCTGAAAACATTGACACGTACCTTATCCACATGGCAATTGAGATCCTTAAACATGGTCCTGACAGCGGACTTCAACCTTCATGTGATGTCAACAAAAGGAGATGTTTTCCCGGTTCTGAAGAGATCTGTTCAAGTTCTAAGAGAAGCAAGGAAGAAGTAGGCATCAATACTGAGACTTCATCTGCAGAGAGAAAGAGACGATTACCTGTGTGGTTTGCCAAAGGAAGTGATACCAGCAAGAAATTAATGGACAAAACGAAAAGGGGAGGTCTTTTTAGTTAAGCTGGCAATTACCAGAACAATTATGTTTCTTGCTGTATTATAAGAGGATAGCTATATTTTATTTCTGAAGAGTAAGGAGTAGTATTTTGGCTTAAAAATCATTCTAATTACAAAGTTCACTGTTTATTGAAGAACTGGCATCTTAAATCAGCCTTCCGCAATTCATGTAGTTTCTGGGTCTTCTGGGAGCCTACGTGAGTACATCACCTAACAGAATATTAAATTAGACTTCCTGTAAGATTGCTTTAAGAAACTGTTACTGTCCTGTTTTCTAATCTCTTTATTAAAACAGTGTATTTGGAAAATGTTATGTGCTCTGATTTGATATAGATAACAGATTAGTAGTTACATGGTAATTATGTGATATAAAATATTCATATATTATCAAAATTCTGTTTTGTAAATGTAAGAAAGCATAGTTATTTTACAAATTGTTTTTACTGTCTTTTGAAGAAGTTCTTAAATACGTTGTTAAATGGTATTAGTTGACCAGGGCAGTGAAAATGAAACCGCATTTTGGGTGCCATTAAATAGGGAAAAAACATGTAAAAAATGTAAAATGGAGACCAATTGCACTAGGCAAGTGTATATTTTGTATTTTATATACAATTTCTATTATTTTTCAAGTAATAAAACAATGTTTTTCATACTGAATATTATATATATATTTTTTAGCTTTCATTTACTTAATTATTTTAAGTACCTTTATTTTTCCAGGATGTCAGAATTTGATTCTAATCTCTCTTATGTAGCACATGTGACTTAATTTAAAACCTATACTGTGACACAGAGTTGGGTAAACGATGATTATTTAACTTTAAGCAGTTCACCATCCATTTCAAAGCCTTTGATTGGCTTTTTTGTAAATAAAAATAACTTGTTAAGAAACAAATATATCTGTCATAGAAGAACTAGAAAATCCAGGGAAGTGAGAAAAATGAAAATAAAAATCATTCATAGTTTTACTAGTAGCTAATCACAGTCAACCTCTTTTGTGTATCCCACCAGACTTTTTTATATTCATTTGTTTTTAGTTAAAATATAAAAGTCTCGTATATTCCCATTTTTCTGCATTGCATTACCAGAAGGTAGTGGCGCCTATTAAATATGTGATATGTTGTTGTCCAGCCATGGCTTCTGCATTTGCATGCTTTTGTGTGTGCATCTGCAATACCCTGTGAATATCCTGTGTGATGGAGTGGCAAGTACGCACAGACACGTCTGCTGCATGCCTAGGTACGAGGCTGTCTCCAGGAGAAGCACTTGTTTGATTATTTGAGTTGCCAATTGAATTTGCTGCTTTTTTTCATGGCTTGCCATTTTCACTGAAAAGAATGACTAATGAAAAACGATGATTGGTTATTAGATTTGGATGTTTGGCAGACATTTTCTCAAAATTGAACTAAGTTGGCCTCTTCACGGAAAACAACTGGTATTTGTTGTGCCAATGATAAAATTGGAGATTTCTAGCAAAATGTATAATTTTGGAAAAGTTGTGTTCCTCCACTGGAAGCTTGACAGCTTTCCTTAACATAAAGACTTCTCTTTCTCTTCGCTTTCACTACTACTACTACTAATTCTTCTTCTGATTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCCTTCTTCCTTCCTTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCTTCTTTCTCTCTTTCCTTCCTTCCCTTCCCTTCCCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTTCTTTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTCTTTCTCTTTTTCTTTCTTTCAAGCAGTCCTCCCGCCTCAGTCCCCCAAAATAGTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCACAGCCTTACATAAAGCCTTTTCTAATGAGATGGATAGTAATTAACAAATGTGAGTTTTTGATATTATATAAAGATTTTTTCTGTGTTTCGAAGATCCGTATAACTCAGTGAATCAGTATGTTCTGGATGACTAATATGTGATGTTAAGAAATCATGACTGAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGATCAGGAGATCGAGACCACCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGTTGGTGCGTGCCTATAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACCCCAGCCTGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAATAAAAAAAGAAATCATGACTGGGTAAAAGATCTGTTCAGAGTACAAGATGGACCAATGGATTTGATATATTTGAATATAACAGAGTATGAAAAAGTTTATTGATATAGTTTCAGATTACACACTGCAACTAATCTTTAAGAAACTATTACTTGTCCACTTTTTGGTAAAATTTCAGAGAACAATGTCCACCATTATCTGAACAGGCTATTAAAATACTCTTCTCTTTTCCAACTACGTGCCTGTGCAAAGTCAGATTTTTTTCATATACTTCAGCCAAAACAGCATATCAAAATGGATTGAATGCAGAAGTAGATCTGAGAATACAGCCACTTTTGTTAAGCCAGACAATGAGATTTGCAAAATGTAAACAATGCTGCTGTTCTCAGTTTTTAAAAATATGTTTTTTAAAAGTATTTATGTTAATGTGTACTTGGTTTACTACTGCTATTTTTAAATAAAACAAGAAACATTTTTAAATGTCTGTTTTAATTTCTAAAGTGGTAGTGATAGATATAACCCATATTAATAAAAGCTCTTTGGGGTCCTCAGTGATTTTTTTTTAAGAGTATGGAAGGGTTCTCAGACCTAAGAGATTGAGAAATGCTGATGTAATGTTTTATTATAAAGGTGTACCATGAATTATGTACCTTACTTCATATTGTTGGACATTAAAGTTGCTTTCAGTTTTTTTGTTTTAAA
SEQ ID NO:566 WRN之外顯子2的轉譯多肽序列
MSEKKLETTAQQRKCPEWMNVQNKRCAVEERK
SEQ ID NO:567 WRN之外顯子3的轉譯多肽序列
ACVRKSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDI
SEQ ID NO:568 WRN之外顯子4的轉譯多肽序列
MSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMS
SEQ ID NO:569 WRN之外顯子5的轉譯多肽序列
FPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKK
SEQ ID NO:570 WRN之外顯子6的轉譯多肽序列
LKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAY
SEQ ID NO:571 WRN之外顯子7的轉譯多肽序列
AGFIIYRNLEILDDTVQRFAINK
SEQ ID NO:572 WRN之外顯子8的轉譯多肽序列
EEILLSDMNKQLTSISEEVMDLAKHLPHAFSKLENPR
SEQ ID NO:573 WRN之外顯子9的轉譯多肽序列
VSILLKDISENLYSLRRMIIGSTNIETELRPSNNLNLLSFEDSTTGGVQQKQIREHEVLIHVEDETWDPTLDHLAKHDGEDVLGNKVERKEDGFEDGVEDNKLKENMERACLMSLDITEHELQILEQQSQEEYLSDIAYKSTE
SEQ ID NO:574 WRN之外顯子10的轉譯多肽序列
HLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLK
SEQ ID NO:575 WRN之外顯子11的轉譯多肽序列
HLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLK
SEQ ID NO:576 WRN之外顯子12的轉譯多肽序列
SLENLNSGTVEPTHSKCLKMERNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDK
SEQ ID NO:577 WRN之外顯子13的轉譯多肽序列
FLWPAPNEEQVTCLKMYFGHSSFK
SEQ ID NO:578 WRN之外顯子14的轉譯多肽序列
VQWKVIHSVLEERRDNVAVMAT
SEQ ID NO:579 WRN之外顯子15的轉譯多肽序列
YGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLISLMEDQVLQL
SEQ ID NO:580 WRN之外顯子16的轉譯多肽序列
MSNIPACFLGSAQSENVLTDIK
SEQ ID NO:581 WRN之外顯子17的轉譯多肽序列
GKYRIVYVTPEYCSGNMGLLQQLEADI
SEQ ID NO:582 WRN之外顯子18的轉譯多肽序列
ITLIAVDEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPM
SEQ ID NO:583 WRN之外顯子19的轉譯多肽序列
VPIVALTATASSSIREDIVRCLNLRNPQITCTGFDRPNLYLEVRRKTGNILQDLQPFLVKT
SEQ ID NO:584 WRN之外顯子20的轉譯多肽序列
SHWEFEGPTIIYCPSRKMTQQVTGELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFVRDEIQ
SEQ ID NO:585 WRN之外顯子21的轉譯多肽序列
CVIATIAFGMGINKADIRQVIHYGAPKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADINLN
SEQ ID NO:586 WRN之外顯子22的轉譯多肽序列
HLLTEIRNEKFRLYKLKMMAKMEKYLHSSRCRR
SEQ ID NO:587 WRN之外顯子23的轉譯多肽序列
IILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRS
SEQ ID NO:588 WRN之外顯子24的轉譯多肽序列
LDHCYSMDDSEDTSWDFGPQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRGS
SEQ ID NO:589 WRN之外顯子25的轉譯多肽序列
NSQRLADQYRRHSLFGTGKDQTESWWKAFSRQLITEGFLVEVSRYNKFMKICALTKK
SEQ ID NO:590 WRN之外顯子26的轉譯多肽序列
GRNWLHKANTESQSLILQANEELCPKKLLLP
SEQ ID NO:591 WRN之外顯子27的轉譯多肽序列
SKTVSSGTKEHCYNQVPVELSTEKK
SEQ ID NO:592 WRN之外顯子28的轉譯多肽序列
SNLEKLYSYKPCDKISSGSNISKK
SEQ ID NO:593 WRN之外顯子29的轉譯多肽序列
IMVQSPEKAYSSSQPVISAQEQETQ
SEQ ID NO:594 WRN之外顯子30的轉譯多肽序列
IVLYGKLVEARQKHANKMDVPPAILATNKILVDMAKM
SEQ ID NO:595 WRN之外顯子31的轉譯多肽序列
PTTVENVKRIDGVSEGKAAMLAPLLEVIKHFCQTNSVQ
SEQ ID NO:596 WRN之外顯子32的轉譯多肽序列
TDLFSSTKPQEEQKTSLVAKNKICTLSQSMAITYSLFQEKKMPL
SEQ ID NO:597 WRN之外顯子33的轉譯多肽序列
KSIAESRILPLMTIGMHLSQAVKAGCPLDLERAGLTPEVQKIIADVIRNPPVNS
SEQ ID NO:598 WRN之外顯子34的轉譯多肽序列
MSKISLIRMLVPENIDTYLIHMAIEILKHGPDSGLQPSCDVNKRRCFPGSEEICSSSKRSKEEVGINTE
SEQ ID NO:599 WRN之外顯子35的轉譯多肽序列
TSSAERKRRLPVWFAKGSDTSKKLMDKTKRGGLFS
SEQ ID NO:600 WRN之全蛋白質序列
MSEKKLETTAQQRKCPEWMNVQNKRCAVEERKACVRKSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILDDTVQRFAINKEEEILLSDMNKQLTSISEEVMDLAKHLPHAFSKLENPRRVSILLKDISENLYSLRRMIIGSTNIETELRPSNNLNLLSFEDSTTGGVQQKQIREHEVLIHVEDETWDPTLDHLAKHDGEDVLGNKVERKEDGFEDGVEDNKLKENMERACLMSLDITEHELQILEQQSQEEYLSDIAYKSTEHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKSLENLNSGTVEPTHSKCLKMERNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDKDFLWPAPNEEQVTCLKMYFGHSSFKPVQWKVIHSVLEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLISLMEDQVLQLKMSNIPACFLGSAQSENVLTDIKLGKYRIVYVTPEYCSGNMGLLQQLEADIGITLIAVDEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTATASSSIREDIVRCLNLRNPQITCTGFDRPNLYLEVRRKTGNILQDLQPFLVKTSSHWEFEGPTIIYCPSRKMTQQVTGELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFVRDEIQCVIATIAFGMGINKADIRQVIHYGAPKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADINLNRHLLTEIRNEKFRLYKLKMMAKMEKYLHSSRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLDHCYSMDDSEDTSWDFGPQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRGSNSQRLADQYRRHSLFGTGKDQTESWWKAFSRQLITEGFLVEVSRYNKFMKICALTKKGRNWLHKANTESQSLILQANEELCPKKLLLPSSKTVSSGTKEHCYNQVPVELSTEKKSNLEKLYSYKPCDKISSGSNISKKSIMVQSPEKAYSSSQPVISAQEQETQIVLYGKLVEARQKHANKMDVPPAILATNKILVDMAKMRPTTVENVKRIDGVSEGKAAMLAPLLEVIKHFCQTNSVQTDLFSSTKPQEEQKTSLVAKNKICTLSQSMAITYSLFQEKKMPLKSIAESRILPLMTIGMHLSQAVKAGCPLDLERAGLTPEVQKIIADVIRNPPVNSDMSKISLIRMLVPENIDTYLIHMAIEILKHGPDSGLQPSCDVNKRRCFPGSEEICSSSKRSKEEVGINTETSSAERKRRLPVWFAKGSDTSKKLMDKTKRGGLFS
SEQ ID NO:601 WRN之全部外顯子1-33按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:602 WRN之全部外顯子1-33按順序排列的轉譯多肽序列
DAAM1 序列資訊SEQ ID NO:603 來自DAAM1-NRG1融合物5’處之DAAM1之5'UTR/外顯子1的序列GAAGGAAACTGTTTAACCGGATCCCATTGTACCCAGAGTGCAGAGCCGCCTTTCCAGCATGCAGGGGCTGCTCAG
SEQ ID NO:604 DAAM1-NRG1融合物3’處之NRG1的5’UTR/外顯子1序列
GACAGAGAGGGAGGAGGCGCGCGGGGACGGGGACGCCCAGGAGGACCCACTCGCGGGTCCCGCTCCGCTCCGGCA
SEQ ID NO:605 DAAM1-NRG1多核苷酸序列
GAAGGAAACTGTTTAACCGGATCCCATTGTACCCAGAGTGCAGAGCCGCCTTTCCAGCATGCAGGGGCTGCTCAGGACAGAGAGGGAGGAGGCGCGCGGGGACGGGGACGCCCAGGAGGACCCACTCGCGGGTCCCGCTCCGCTCCGGCA
SEQ ID NO:606 DAAM1之外顯子1
GCGAGTTAGTAACCTACGAGCGGCTGTGAAGGAAACTGTTTAACCGGATCCCATTGTACCCAGAGTGCAGAGCCGCCTTTCCAGCATGCAGGGGCTGCTCAG
SEQ ID NO:607 DAAM1之外顯子2
CGTTTAGTCACATCAAGAAATAGAACAGAATTCAGCCATGGCCCCAAGAAAGAGAGGTGGACGAGGTATTTCATTCATCTTTTGCTGTTTCCGAAATAATGATCACCCAGAAATCACGTATCGGCTGCGAAATGATAGCAACTTTGCGCTTCAGACCATGGAACCAGCATTGCCCATGCCCCCTGTGGAGGAGCTGGATGTCATGTTCAGTGAACTGGTG
SEQ ID NO:608 DAAM1之外顯子3
GATGAACTGGACCTCACAGACAAACACAGAGAAGCCATGTTTGCACTTCCAGCTGAGAAAAAATGGCAAATATACTGTAGCAAGAAAAAG
SEQ ID NO:609 DAAM1之外顯子4
GACCAGGAAGAAAACAAGGGAGCTACAAGTTGGCCTGAATTCTACATTGATCAGCTCAATTCCATGGCTGCT
SEQ ID NO:610 DAAM1之外顯子5
AGAAAATCTCTGCTGGCTTTAGAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAAGAAGTAAAACTATAGAGAGTTTAAAGACAGCACTGAGGACAAAACCAATGAG
SEQ ID NO:611 DAAM1之外顯子6
GTTTGTAACCAGATTCATCGACTTGGATGGCCTATCATGTATCCTCAACTTTCTAAAGACCATGGACTACGAGACCTCAGAGTCTCGAATACATACTTCTCTCATTGGCTGTATAAAGGCGTTAATGAACAACTCTCAAGGCCGGGCTCACGTCCTGGCTCATTCTGAGAGTATTAATGTAATTGCTCAGAGTCTGAGCACAGAGAACATTAAAACGAAGGTGGCCGTGCTGGAAATCTTGGGCGCCGTGTGCCTGGTTCCCGGGGGCCACAAGAAGGTTCTGCAGGCCATGCTGCACTACCAGAAGTATGCCAGCGAAAGGACCCGCTTTCAG
SEQ ID NO:612 DAAM1之外顯子7
ACATTAATTAACGACTTGGATAAAAGCACTGGGCGGTATCGAGATGAAGTGAGTCTCAAGACTGCCATCATGTCCTTCATTAATGCAGTGCTCAGCCAAGGTGCAGGAGTG
SEQ ID NO:613 DAAM1之外顯子8
GAGAGTTTGGACTTTAGACTTCATCTTCGCTATGAATTTCTGATGTTAGGAATTCAACCTGTAATAGATAAATTAAGGGAACACGAAAATTCAACATTAGATAG
SEQ ID NO:614 DAAM1之外顯子9
GCATTTAGACTTTTTTGAAATGCTCCGAAATGAAGATGAACTAGAATTTGCCAAAAGATTTGAACTG
SEQ ID NO:615 DAAM1之外顯子10
GTTCACATAGACACAAAAAGTGCAACTCAGATGTTTGAGCTGACCAGGAAGAGGCTGACACATAGTGAAGCTTACCCGCATTTCATGTCCATCCTGCACCACTGCCTCCAAATGCCTT
SEQ ID NO:616 DAAM1之外顯子11
ACAAGAGGAGTGGCAACACTGTTCAGTACTGGCTACTACTAGATAGAATTATACAGCAGATAGTTATCCAGAATGACAAAGGACAGGACCCTGACTCCACACCTTTGGAAAACTTTAATATTAAGAATGTCGTACGAAT
SEQ ID NO:617 DAAM1之外顯子12
GTTGGTTAATGAAAATGAAGTTAAGCAGTGGAAAGAACAAGCGGAAAAAATGAGAAAAG
SEQ ID NO:618 DAAM1之外顯子13
AGCACAATGAGCTACAACAGAAACTGGAAAAGAAAGAACGAGAATGTGATGCTAAGACTCAAGAGAAGGAAGAGATGATGCAGACCTTAAATAAAATGAAAGAGAAACTTGAAAAGGAGACTACTGAGCATAAGCAAGTCAAGCAGCAGGTGGCGGACCTCACAGCACAGCTCCATGAGCTCAGCAGG
SEQ ID NO:619 DAAM1之外顯子14
AGGGCCGTCTGTGCTTCAATCCCAGGTGGACCCTCGCCTGGAGCACCAGGAGGGCCCTTTCCTTCCTCTGTGCCTGGATCTCTCCTTCCTCCCCCACCACCCCCACCTCTACCAGGTGGGATGCTTCCCCCTCCACCGCCTCCCCTCCCTCCAGGTGGCCCTCCTCCTCCCCCAGGGCCTCCTCCCTTAGGGGCAATCATGCCACCTCCTGGTGCTCCAATGGGCCTAGCACTGAAGAAGAAAAGCATTCCTCAGCCCACAAATGCCCTGAAATCCTTCAACTGGTCTAAACTGCCCGAG
SEQ ID NO:620 DAAM1之外顯子15
AACAAACTGGAAGGAACAGTATGGACCGAAATTGATGATACAAAAGTCTTCAAAATTCTAGATCTTGAAGACCTGGAAAGAACCTTCTCTGCCTATCAAAGACAGCAG
SEQ ID NO:621 DAAM1之外顯子16
AAAGAAGCAGATGCCATTGATGACACTCTGAGTTCCAAACTTAAAGTTAAAGAGCTTTCGGTGATTGATGGTCGGAGAGCTCAGAATTGCAACATCCTTCTATCGAG
SEQ ID NO:622 DAAM1之外顯子17
GTTGAAATTATCCAATGACGAAATCAAACGGGCAATTCTAACAATGGACGAACAGGAAGATCTGCCCAAGGACATGTTGGAACAG
SEQ ID NO:623 DAAM1之外顯子18
CTCTTGAAATTTGTTCCTGAAAAAAGTGACATTGACCTATTGGAGGAACATAAACACGAACTGGATCGGATGGCCAAGGCTGATAGGTTCCTTTTTGAGATGAGCCG
SEQ ID NO:624 DAAM1之外顯子19
AATTAATCACTATCAGCAAAGGTTGCAATCGCTGTACTTCAAAAAGAAGTTTGCAGAGCGTGTGGCAGAAGTGAAACCTAAAGTGGAAG
SEQ ID NO:625 DAAM1之外顯子20
CAATTCGTTCTGGCTCAGAAGAGGTGTTTAGGAGTGGTGCCCTCAAGCAGTTGCTGGAGGTGGTTTTGGCATTTGGAAATTATATGAATAAAGGTCAAAGAGGGAATGCATATGGATTCAAGATATCTAGCCTAAACAAAATTGCTGACACAAAATCCAGCATCGACAA
SEQ ID NO:626 DAAM1之外顯子21
AAACATTACCCTTTTGCACTATCTCATCACTATTGTGGAAAATAAGTACCCCAGTGTTCTCAATCTAAATGAAGAATTGCGAGATATTCCTCAAGCTGCGAAAGTAAA
SEQ ID NO:627 DAAM1之外顯子22
CATGACTGAGCTGGACAAAGAAATAAGTACCTTGAGAAGTGGCTTGAAAGCAGTAGAGACA
SEQ ID NO:628 DAAM1之外顯子23
GAGCTGGAATATCAGAAGTCTCAGCCCCCACAGCCCGGAGATAAGTTTGTGTCTGTTGTCAGCCAGTTCATCACAGTAGCCAGCTTCAGCTTCTCTGATGTTGAAGACCTTCTAGCAGAAGCTAAAGACCTG
SEQ ID NO:629 DAAM1之外顯子24
TTTACTAAAGCAGTGAAGCACTTTGGGGAAGAGGCTGGCAAAATACAACCAGATGAGTTCTTTGGCATTTTTGATCAATTTCTTCAAGCTGTGTCAGAAGCCAAACAAGAAAACGAAAATATGAGAAAGAAAAAGGAGGAAGAAGAACGTCGAGCTCGCATGGAAGCTCAG
SEQ ID NO:630 DAAM1之外顯子25
CTCAAAGAACAACGTGAAAGGGAACGTAAAATGAGAAAAGCTAAAGAGAATAGTGAAGAAAGCGGAGAGTTTGATGACCTTGTTTCAGCTTTACGCTCAGGAGAAGTGTTTGACAAAGACCTTTCTAAATTGAAACGGAATCGCAAACGTATTACCAACCAGATGACTGACAGCAGCAGAGAGAGACCAATCACAAAACTTAATTTCTAATTTTCCATGAATACTTTTTTTTAGAAAGCTCATTAGCAGCCCTCTAAAGTGACTAGAACGTTTCATTACACTGCCTTGCAATCCAAACAGTGGCAATTTTTTCCTTCATCTGTGAGTGAATGTGTGAACGTGTGTATGTAAATGTATGTGTGTATATATTAAAAAATGTATATAGATGTCTGAGTGTTGTCTGGAGACCTATACGTATGGTTAAAAAGATTTATGTTAATGTATGTGCTCCAAAACCTTTCGTGTATGCATTCACATTGAGTGTGGCTCATTTTCTTTCCCCGAACGCCATGACTGTTCAGAAGCACAATACTATCTCCTGAAAGAGATAAGAGACATTCCCTAGATTCAAAGGCAAAACAGAAGAAACAAACAAACAAACAAAAAAAGCTTGCAAAATATTTTATGGTTTCCAAGCTTGATATCCTTTAAAATTATTTTCATTGATGGAACTGGAGTTGTTGGAAAAACATAGATTTAAAATGATTTTTGATAGCTGACATTGTGATGTTGATGTATCACATCAGTAATAGGACCAGCTTTGAATTTCTGACATTGGTGTGGGGATACAGTCTGTAAATGTTTATTGAGAACATCTTGCACACAATTTGAATTATGTAGAATGTCAATCAAGTTTTTGTATATTTAAAAGTTGGACATCAATTTTTTCCCCTGATTTCATCAAGTTATCTCTGCCAAGTGCTCTTGATAATTTCTTCAGATTTTTGGAAAAAAACACTATATAAATGCAATCCATGCTTTTTTTAAAGAACAACATTGCCAGAGTATGCTTGTTCTAACAATATAGATATATAAACCTTAAAAATAATAAAATATCTCACCCAAGACTTAAAGGAAGAATTCTCTGAAGGGATAAAGATTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAATGGGGTGCCTTTTTGTTATAGTTTCTATTTTCTGTTTTGTAGGACAAGCTGCATTTTCTGTAAATATAGGTCTGGACTAAAGGATACATAAAGAATGCACAAAATGTCAACATCAGCAGAGATGCCCAGATCTATTTATCTCTAAGTATATTTGAAGTGATTGCTGTTTATATGTTGTCATTTTAAAATTGTGTGTCAGTAAAGCTACCTGTAAAATTTCAGTCCAAAAAAATAAAGCTCTCAGGGAGACATGAATAAAATCAATGAACATTAGAAAATAAAATATAGATGCTTACCATTAACCTACCAACTCTTAATATCCTTAAATTATGTGATATATAAAGAGGACTGTTACTTTTTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTTTGCTTTATTTATTTGTAGTTGGGGGCTAACGTTTTCTCTTTTCTTTCTATTGATCCTGTTGTGGTTGGGTTTCCTGTGGAGAGAGTAGTTTGTCCTGTTGCACTAGAACATTATTTACTCACTAAATTGAGTTTTTCAGTCAATTAACAAATATTTATTAAGTTCCTACTATGTACCAGGCATAGTAGGGCTACAATGGTAAGCAAGACAGAGTCCCTGCCCCCAAAGAGCTTATATTCTAATGGGGATATTAAGGGATGAATAGAATACCAATGTGTGCACTGTACAGGAATCATACTATTTAAAAATAATTTGTATAAACTATAATGCTTAGCACAGATGGCGAGTTATCTGTGCTATGTGAAAGCTGTGAAATAGTGCTCTAAGAGTTGTCAAGAGCTGTGGTTTTACATCTTTTCCTCATTGCAAATTTAGTGACTTTCTACACACTATATGGAAATAAATGACTAGCAAATAAAACAGTCATAAATACAAAGCAGAGGTTGCACTCCCCCAATCCCGAGTTAACCCAGGTCTGCAATAACACCATGTTAAAGGTGCAGATAGAGACTTGGCTCAAAAAGGCTTGGAGATGAGGAAGATTGGAATATAATGATGGTTTTGTCTGTTCCTTAACTAAAGTGCCTCTATGTATATTCTTTTCTATTTGTAGCAGGATAAATTTGGTCTGGCTCAGTTTTGGAACTGTATTTTGAAAATGGCTTTGTCTTACAGTTTAAGGAATAGACAGGTGGAGGGAAAGTCACATAAAGGAGCAAGTTTGTGTAGCTGTCCCTCTTGCCCCTTTTAATCATCCTCCTTTGATATGGCCATCCTGGTGGGCCTCCTTTGCCATTTCCATTTTTGGTTTCTTTCCCTGAAAACTGTGTGCAGGTAATTCCATGTGCCATTGTTGAAAAGAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACCTACTTTTTAGATTGGTGCTGGTGTAAGTAGCCACTTTTCTCTCTTGGGTGTGTATTTTAAACTTTTTTTGTTTTTTTAAATTAATGCCAAAAAGAAAATGCATAATTTGTAAACTTAATTATATGTCTTATATCTTATTAGCTTAGTAGTTGGAACCACTTAGTCTTTAGGTGCAAGACTGTTGTTAGATAGTACTGAGAAAAAAAAAGTATGTGTTATGAGACTGTACATGTTTTTTTAAAAATAGCAATATGCAATAAAGAGATGAATTCATTGGGTGTA
SEQ ID NO:631 DAAM1之全mRNA多核苷酸序列
GCGAGTTAGTAACCTACGAGCGGCTGTGAAGGAAACTGTTTAACCGGATCCCATTGTACCCAGAGTGCAGAGCCGCCTTTCCAGCATGCAGGGGCTGCTCAGCGTTTAGTCACATCAAGAAATAGAACAGAATTCAGCCATGGCCCCAAGAAAGAGAGGTGGACGAGGTATTTCATTCATCTTTTGCTGTTTCCGAAATAATGATCACCCAGAAATCACGTATCGGCTGCGAAATGATAGCAACTTTGCGCTTCAGACCATGGAACCAGCATTGCCCATGCCCCCTGTGGAGGAGCTGGATGTCATGTTCAGTGAACTGGTGGATGAACTGGACCTCACAGACAAACACAGAGAAGCCATGTTTGCACTTCCAGCTGAGAAAAAATGGCAAATATACTGTAGCAAGAAAAAGGACCAGGAAGAAAACAAGGGAGCTACAAGTTGGCCTGAATTCTACATTGATCAGCTCAATTCCATGGCTGCTAGAAAATCTCTGCTGGCTTTAGAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAAGAAGTAAAACTATAGAGAGTTTAAAGACAGCACTGAGGACAAAACCAATGAGGTTTGTAACCAGATTCATCGACTTGGATGGCCTATCATGTATCCTCAACTTTCTAAAGACCATGGACTACGAGACCTCAGAGTCTCGAATACATACTTCTCTCATTGGCTGTATAAAGGCGTTAATGAACAACTCTCAAGGCCGGGCTCACGTCCTGGCTCATTCTGAGAGTATTAATGTAATTGCTCAGAGTCTGAGCACAGAGAACATTAAAACGAAGGTGGCCGTGCTGGAAATCTTGGGCGCCGTGTGCCTGGTTCCCGGGGGCCACAAGAAGGTTCTGCAGGCCATGCTGCACTACCAGAAGTATGCCAGCGAAAGGACCCGCTTTCAGACATTAATTAACGACTTGGATAAAAGCACTGGGCGGTATCGAGATGAAGTGAGTCTCAAGACTGCCATCATGTCCTTCATTAATGCAGTGCTCAGCCAAGGTGCAGGAGTGGAGAGTTTGGACTTTAGACTTCATCTTCGCTATGAATTTCTGATGTTAGGAATTCAACCTGTAATAGATAAATTAAGGGAACACGAAAATTCAACATTAGATAGGCATTTAGACTTTTTTGAAATGCTCCGAAATGAAGATGAACTAGAATTTGCCAAAAGATTTGAACTGGTTCACATAGACACAAAAAGTGCAACTCAGATGTTTGAGCTGACCAGGAAGAGGCTGACACATAGTGAAGCTTACCCGCATTTCATGTCCATCCTGCACCACTGCCTCCAAATGCCTTACAAGAGGAGTGGCAACACTGTTCAGTACTGGCTACTACTAGATAGAATTATACAGCAGATAGTTATCCAGAATGACAAAGGACAGGACCCTGACTCCACACCTTTGGAAAACTTTAATATTAAGAATGTCGTACGAATGTTGGTTAATGAAAATGAAGTTAAGCAGTGGAAAGAACAAGCGGAAAAAATGAGAAAAGAGCACAATGAGCTACAACAGAAACTGGAAAAGAAAGAACGAGAATGTGATGCTAAGACTCAAGAGAAGGAAGAGATGATGCAGACCTTAAATAAAATGAAAGAGAAACTTGAAAAGGAGACTACTGAGCATAAGCAAGTCAAGCAGCAGGTGGCGGACCTCACAGCACAGCTCCATGAGCTCAGCAGGAGGGCCGTCTGTGCTTCAATCCCAGGTGGACCCTCGCCTGGAGCACCAGGAGGGCCCTTTCCTTCCTCTGTGCCTGGATCTCTCCTTCCTCCCCCACCACCCCCACCTCTACCAGGTGGGATGCTTCCCCCTCCACCGCCTCCCCTCCCTCCAGGTGGCCCTCCTCCTCCCCCAGGGCCTCCTCCCTTAGGGGCAATCATGCCACCTCCTGGTGCTCCAATGGGCCTAGCACTGAAGAAGAAAAGCATTCCTCAGCCCACAAATGCCCTGAAATCCTTCAACTGGTCTAAACTGCCCGAGAACAAACTGGAAGGAACAGTATGGACCGAAATTGATGATACAAAAGTCTTCAAAATTCTAGATCTTGAAGACCTGGAAAGAACCTTCTCTGCCTATCAAAGACAGCAGAAAGAAGCAGATGCCATTGATGACACTCTGAGTTCCAAACTTAAAGTTAAAGAGCTTTCGGTGATTGATGGTCGGAGAGCTCAGAATTGCAACATCCTTCTATCGAGGTTGAAATTATCCAATGACGAAATCAAACGGGCAATTCTAACAATGGACGAACAGGAAGATCTGCCCAAGGACATGTTGGAACAGCTCTTGAAATTTGTTCCTGAAAAAAGTGACATTGACCTATTGGAGGAACATAAACACGAACTGGATCGGATGGCCAAGGCTGATAGGTTCCTTTTTGAGATGAGCCGAATTAATCACTATCAGCAAAGGTTGCAATCGCTGTACTTCAAAAAGAAGTTTGCAGAGCGTGTGGCAGAAGTGAAACCTAAAGTGGAAGCAATTCGTTCTGGCTCAGAAGAGGTGTTTAGGAGTGGTGCCCTCAAGCAGTTGCTGGAGGTGGTTTTGGCATTTGGAAATTATATGAATAAAGGTCAAAGAGGGAATGCATATGGATTCAAGATATCTAGCCTAAACAAAATTGCTGACACAAAATCCAGCATCGACAAAAACATTACCCTTTTGCACTATCTCATCACTATTGTGGAAAATAAGTACCCCAGTGTTCTCAATCTAAATGAAGAATTGCGAGATATTCCTCAAGCTGCGAAAGTAAACATGACTGAGCTGGACAAAGAAATAAGTACCTTGAGAAGTGGCTTGAAAGCAGTAGAGACAGAGCTGGAATATCAGAAGTCTCAGCCCCCACAGCCCGGAGATAAGTTTGTGTCTGTTGTCAGCCAGTTCATCACAGTAGCCAGCTTCAGCTTCTCTGATGTTGAAGACCTTCTAGCAGAAGCTAAAGACCTGTTTACTAAAGCAGTGAAGCACTTTGGGGAAGAGGCTGGCAAAATACAACCAGATGAGTTCTTTGGCATTTTTGATCAATTTCTTCAAGCTGTGTCAGAAGCCAAACAAGAAAACGAAAATATGAGAAAGAAAAAGGAGGAAGAAGAACGTCGAGCTCGCATGGAAGCTCAGCTCAAAGAACAACGTGAAAGGGAACGTAAAATGAGAAAAGCTAAAGAGAATAGTGAAGAAAGCGGAGAGTTTGATGACCTTGTTTCAGCTTTACGCTCAGGAGAAGTGTTTGACAAAGACCTTTCTAAATTGAAACGGAATCGCAAACGTATTACCAACCAGATGACTGACAGCAGCAGAGAGAGACCAATCACAAAACTTAATTTCTAATTTTCCATGAATACTTTTTTTTAGAAAGCTCATTAGCAGCCCTCTAAAGTGACTAGAACGTTTCATTACACTGCCTTGCAATCCAAACAGTGGCAATTTTTTCCTTCATCTGTGAGTGAATGTGTGAACGTGTGTATGTAAATGTATGTGTGTATATATTAAAAAATGTATATAGATGTCTGAGTGTTGTCTGGAGACCTATACGTATGGTTAAAAAGATTTATGTTAATGTATGTGCTCCAAAACCTTTCGTGTATGCATTCACATTGAGTGTGGCTCATTTTCTTTCCCCGAACGCCATGACTGTTCAGAAGCACAATACTATCTCCTGAAAGAGATAAGAGACATTCCCTAGATTCAAAGGCAAAACAGAAGAAACAAACAAACAAACAAAAAAAGCTTGCAAAATATTTTATGGTTTCCAAGCTTGATATCCTTTAAAATTATTTTCATTGATGGAACTGGAGTTGTTGGAAAAACATAGATTTAAAATGATTTTTGATAGCTGACATTGTGATGTTGATGTATCACATCAGTAATAGGACCAGCTTTGAATTTCTGACATTGGTGTGGGGATACAGTCTGTAAATGTTTATTGAGAACATCTTGCACACAATTTGAATTATGTAGAATGTCAATCAAGTTTTTGTATATTTAAAAGTTGGACATCAATTTTTTCCCCTGATTTCATCAAGTTATCTCTGCCAAGTGCTCTTGATAATTTCTTCAGATTTTTGGAAAAAAACACTATATAAATGCAATCCATGCTTTTTTTAAAGAACAACATTGCCAGAGTATGCTTGTTCTAACAATATAGATATATAAACCTTAAAAATAATAAAATATCTCACCCAAGACTTAAAGGAAGAATTCTCTGAAGGGATAAAGATTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAATGGGGTGCCTTTTTGTTATAGTTTCTATTTTCTGTTTTGTAGGACAAGCTGCATTTTCTGTAAATATAGGTCTGGACTAAAGGATACATAAAGAATGCACAAAATGTCAACATCAGCAGAGATGCCCAGATCTATTTATCTCTAAGTATATTTGAAGTGATTGCTGTTTATATGTTGTCATTTTAAAATTGTGTGTCAGTAAAGCTACCTGTAAAATTTCAGTCCAAAAAAATAAAGCTCTCAGGGAGACATGAATAAAATCAATGAACATTAGAAAATAAAATATAGATGCTTACCATTAACCTACCAACTCTTAATATCCTTAAATTATGTGATATATAAAGAGGACTGTTACTTTTTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTTTGCTTTATTTATTTGTAGTTGGGGGCTAACGTTTTCTCTTTTCTTTCTATTGATCCTGTTGTGGTTGGGTTTCCTGTGGAGAGAGTAGTTTGTCCTGTTGCACTAGAACATTATTTACTCACTAAATTGAGTTTTTCAGTCAATTAACAAATATTTATTAAGTTCCTACTATGTACCAGGCATAGTAGGGCTACAATGGTAAGCAAGACAGAGTCCCTGCCCCCAAAGAGCTTATATTCTAATGGGGATATTAAGGGATGAATAGAATACCAATGTGTGCACTGTACAGGAATCATACTATTTAAAAATAATTTGTATAAACTATAATGCTTAGCACAGATGGCGAGTTATCTGTGCTATGTGAAAGCTGTGAAATAGTGCTCTAAGAGTTGTCAAGAGCTGTGGTTTTACATCTTTTCCTCATTGCAAATTTAGTGACTTTCTACACACTATATGGAAATAAATGACTAGCAAATAAAACAGTCATAAATACAAAGCAGAGGTTGCACTCCCCCAATCCCGAGTTAACCCAGGTCTGCAATAACACCATGTTAAAGGTGCAGATAGAGACTTGGCTCAAAAAGGCTTGGAGATGAGGAAGATTGGAATATAATGATGGTTTTGTCTGTTCCTTAACTAAAGTGCCTCTATGTATATTCTTTTCTATTTGTAGCAGGATAAATTTGGTCTGGCTCAGTTTTGGAACTGTATTTTGAAAATGGCTTTGTCTTACAGTTTAAGGAATAGACAGGTGGAGGGAAAGTCACATAAAGGAGCAAGTTTGTGTAGCTGTCCCTCTTGCCCCTTTTAATCATCCTCCTTTGATATGGCCATCCTGGTGGGCCTCCTTTGCCATTTCCATTTTTGGTTTCTTTCCCTGAAAACTGTGTGCAGGTAATTCCATGTGCCATTGTTGAAAAGAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACCTACTTTTTAGATTGGTGCTGGTGTAAGTAGCCACTTTTCTCTCTTGGGTGTGTATTTTAAACTTTTTTTGTTTTTTTAAATTAATGCCAAAAAGAAAATGCATAATTTGTAAACTTAATTATATGTCTTATATCTTATTAGCTTAGTAGTTGGAACCACTTAGTCTTTAGGTGCAAGACTGTTGTTAGATAGTACTGAGAAAAAAAAAGTATGTGTTATGAGACTGTACATGTTTTTTTAAAAATAGCAATATGCAATAAAGAGATGAATTCATTGGGTGTA
SEQ ID NO:632 DAAM1之全蛋白質序列
MAPRKRGGRGISFIFCCFRNNDHPEITYRLRNDSNFALQTMEPALPMPPVEELDVMFSELVDELDLTDKHREAMFALPAEKKWQIYCSKKKDQEENKGATSWPEFYIDQLNSMAARKSLLALEKEEEEERSKTIESLKTALRTKPMRFVTRFIDLDGLSCILNFLKTMDYETSESRIHTSLIGCIKALMNNSQGRAHVLAHSESINVIAQSLSTENIKTKVAVLEILGAVCLVPGGHKKVLQAMLHYQKYASERTRFQTLINDLDKSTGRYRDEVSLKTAIMSFINAVLSQGAGVESLDFRLHLRYEFLMLGIQPVIDKLREHENSTLDRHLDFFEMLRNEDELEFAKRFELVHIDTKSATQMFELTRKRLTHSEAYPHFMSILHHCLQMPYKRSGNTVQYWLLLDRIIQQIVIQNDKGQDPDSTPLENFNIKNVVRMLVNENEVKQWKEQAEKMRKEHNELQQKLEKKERECDAKTQEKEEMMQTLNKMKEKLEKETTEHKQVKQQVADLTAQLHELSRRAVCASIPGGPSPGAPGGPFPSSVPGSLLPPPPPPPLPGGMLPPPPPPLPPGGPPPPPGPPPLGAIMPPPGAPMGLALKKKSIPQPTNALKSFNWSKLPENKLEGTVWTEIDDTKVFKILDLEDLERTFSAYQRQQKEADAIDDTLSSKLKVKELSVIDGRRAQNCNILLSRLKLSNDEIKRAILTMDEQEDLPKDMLEQLLKFVPEKSDIDLLEEHKHELDRMAKADRFLFEMSRINHYQQRLQSLYFKKKFAERVAEVKPKVEAIRSGSEEVFRSGALKQLLEVVLAFGNYMNKGQRGNAYGFKISSLNKIADTKSSIDKNITLLHYLITIVENKYPSVLNLNEELRDIPQAAKVNMTELDKEISTLRSGLKAVETELEYQKSQPPQPGDKFVSVVSQFITVASFSFSDVEDLLAEAKDLFTKAVKHFGEEAGKIQPDEFFGIFDQFLQAVSEAKQENENMRKKKEEEERRARMEAQLKEQRERERKMRKAKENSEESGEFDDLVSALRSGEVFDKDLSKLKRNRKRITNQMTDSSRERPITKLNF
ASPH 序列資訊SEQ ID NO:633 來自ASPH-NRG1融合物5’處之ASPH外顯子22的序列
AAGGTCTCTTCCTGCCTGAGGATGAAAACCTGAGGGAAAAAGGGGACTGGAGCCAGTTCACGCTGTGGCAGCAAG
SEQ ID NO:634 ASPH-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA
SEQ ID NO:635 ASPH-NRG1多核苷酸序列
AAGGTCTCTTCCTGCCTGAGGATGAAAACCTGAGGGAAAAAGGGGACTGGAGCCAGTTCACGCTGTGGCAGCAAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA
SEQ ID NO:636 ASPH-NRG1多肽序列
GLFLPEDENLREKGDWSQFTLWQQALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCE
SEQ ID NO:637 ASPH之外顯子1
AGTCTCAAGCTCTGGTAGGCAAGTGCATGCAGTGTGCCTAAAACCTGCCAGCAGTACTTTTGAGTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTACTTTAGCATTTATTATTCATGGATTGAAGAAATCAAAATGGCTGAAGATAAAG
SEQ ID NO:638 ASPH之外顯子2
AGACAAAGCATGGAGGACACAAGAATGGGAGGAAAGGCGGACTCTCAGGAACTTCATTCTTCACGTGGTTTATGGTGATTGCATTGCTGGGCGTCTGGACATCTGTAGCTGTCGTTTGGTTTGATCTTGTTGACTATGAGGAAGTTCTAG
SEQ ID NO:639 ASPH之外顯子3
GAAAACTAGGAATCTATGATGCTGATGGTGATGGAGATTTTGATGTGGATGATGCCAAAGTTTTATTAG
SEQ ID NO:640 ASPH之外顯子4
GACTTAAAGAGAGATCTACTTCAGAGCCAGCAGTCCCGCCAGAAGAGGCTGAGCCACACACTGAGCCCGAGGAGCAGGTTCCTGTGGAGGCAG
SEQ ID NO:641 ASPH之外顯子5
AACCCCAGAATATCGAAGATGAAGCAAAAGAACAAATTCAGTCCCTTCTCCATGAAATGGTACACGCAGAACATG
SEQ ID NO:642 ASPH之外顯子6
TTGAGGGAGAAGACTTGCAACAAGAAGATGGACCCACAGGAGAACCACAACAAGAGGATGATGAGTTTCTTATGGCGACTGATGTAGATGATAGATTTGAGACCCTGGAACCTGAAGTATCTCATGAAG
SEQ ID NO:643 ASPH之外顯子7
AAACCGAGCATAGTTACCACGTGGAAGAGACAG
SEQ ID NO:644 ASPH之外顯子8
TTTCACAAGACTGTAATCAGGATATGGAAGAGATGATGTCTGAGCAGGAAAATCCAG
SEQ ID NO:645 ASPH之外顯子9
ATTCCAGTGAACCAGTAGTAGAAGATGAAAGATTGCACCATGATACAG
SEQ ID NO:646 ASPH之外顯子10
ATGATGTAACATACCAAGTCTATGAGGAACAAG
SEQ ID NO:647 ASPH之外顯子11
CAGTATATGAACCTCTAGAAAATGAAGGGATAGAAATCACAG
SEQ ID NO:648 ASPH之外顯子12
AAGTAACTGCTCCCCCTGAGGATAATCCTGTAGAAGATTCACAGGTAATTGTAGAAG
SEQ ID NO:649 ASPH之外顯子13
AAGTAAGCATTTTTCCTGTGGAAGAACAGCAGGAAGTACCACCAG
SEQ ID NO:650 ASPH之外顯子14
AAACAAATAGAAAAACAGATGATCCAGAACAAAAAGCAAAAG
SEQ ID NO:651 ASPH之外顯子15
TTAAGAAAAAGAAGCCTAAACTTTTAAATAAATTTGATAAGACTATTAAAGCTGAACTTGATGCTGCAGAAAAACTCCGTAAAAGG
SEQ ID NO:652 ASPH之外顯子16
GGAAAAATTGAGGAAGCAGTGAATGCATTTAAAGAACTAGTACGCAAATACCCTCAGAGTCCACGAGCAAGATATGGGAAGGCGCAG
SEQ ID NO:653 ASPH之外顯子17
TGTGAGGATGATTTGGCTGAGAAGAGGAGAAGTAATGAGGTGCTACGTGGAGCCATCGAGACCTACCAAGAGGTGGCCAGCCTACCTGATGTCCCTGCAGACCTGCTGAAGCTGAGTTTGAAGCGTCGCTCAGACAGGCAACAATTTCTAG
SEQ ID NO:654 ASPH之外顯子18
GTCATATGAGAGGTTCCCTGCTTACCCTGCAGAGATTAGTTCAACTATTTCCCAATGATACTTCCTTAAAAAATGACCTTGGCGTGGGATACCTCTTGATAGGAGATAATGACAATGCAAAGAAAGTTTATGAAGAG
SEQ ID NO:655 ASPH之外顯子19
GTGCTGAGTGTGACACCTAATGATGGCTTTGCTAAAGTCCATTATGGCTTCATCCTGAAGGCACAGAACAAAATTGCTGAGAGCATCCCATATTTAAAG
SEQ ID NO:656 ASPH之外顯子20
GAAGGAATAGAATCCGGAGATCCTGGCACTGATGATGGGAGATTTTATTTCCACCTGGGGGATGCCATGCAGAGGGTTGGGAACAAAGAG
SEQ ID NO:657 ASPH之外顯子21
GCATATAAGTGGTATGAGCTTGGGCACAAGAGAGGACACTTTGCATCTGTCTGGCAACGCTCACTCTACAATGTGAATGGACTGAAAGCACAGCCTTGGTGGACCCCAAAAGAAACGGGCTACACAGAGTTAGTAAAG
SEQ ID NO:658 ASPH之外顯子22
TCTTTAGAAAGAAACTGGAAGTTAATCCGAGATGAAGGCCTTGCAGTGATGGATAAAGCCAAAGGTCTCTTCCTGCCTGAGGATGAAAACCTGAGGGAAAAAGGGGACTGGAGCCAGTTCACGCTGTGGCAGCAAG
SEQ ID NO:659 ASPH之外顯子23
GAAGAAGAAATGAAAATGCCTGCAAAGGAGCTCCTAAAACCTGTACCTTACTAGAAAAGTTCCCCGAGACAACAGGATGCAGAAGAGGACAG
SEQ ID NO:660 ASPH之外顯子24
ATCAAATATTCCATCATGCACCCCGGGACTCACGTGTGGCCGCACACAGGGCCCACAAACTGCAGGCTCCGAATGCACCTGGGCTTGGTGATTCCCAAGGAAGGCTGCAAGATTCGATGTGCCAACGAGACCAA
SEQ ID NO:661 ASPH之外顯子25
GACCTGGGAGGAAGGCAAGGTGCTCATCTTTGATGACTCCTTTGAGCACGAGGTATGGCAGGATGCCTCATCTTTCCGGCTGATATTCATCGTGGATGTGTGGCATCCGGAACTGACACCACAGCAGAGACGCAGCCTTCCAGCAATTTAGCATGAATTCATGCAAGCTTGGGAAACTCTGGAGAGAGGCTGCCTTTCTGGTTCCATCTCCTTGGGTGTGAGGATAGAATTTCGAACACCAAGAGTCAATTCCCTTGACTTGCAGCCCGAGTAATTCAAAGCCTCCTCCTAGGGTCAGAAGACACTAAAGGGAATATTTGCCTCGCTGCAATTCATTTAGGAAACACCCTGCTGTGTGTCATCTCATGACAGCACTGGTCTTCTGCCAGTATTTAAGGTGAACATTTGATAGCTTCTACCTTACCAGCCAAAGATATTTTTTCCACATAGAATAGGTCTAATTCAATGTATAATGAGAACATATGTAGAAACTGTGAATGGATTGCTTTAGTTTGTAATTTTTCTATGCAGTTATATTTTTCTAGTGTAGCTAGACTATTTTGTCATCATGTACCACTACATTTTTGTTTATTTTAATGACAAGCTGTATAAATGCTTTACTTCTAGCTATTTAATGGTAGCATTACTGGGGAACTCAGACTTCCCTCTTTTAATTCTTCTTAGTAAAAGATACTCATGAAAAAAGCAGTTTTATTTTCCTAACAAAAAAGAAAGAGCTCATTATGTCAGTGTCTATGAACTGTACCCATCCCAACTCTCAAATCGTTTGGTTTTTTTTATCTTGATTGAGATCCTCTTCTCACTATGCTAGTGGTGGAGATATTGACAAAATCCTATTTCTTTCAAAGAGGAACTTTTCACACCGAAAAAAGAGCATGGAATTATTTTATATTGTTATAAAAATCCCAGATGCAAATTTTTTTAATGCCAATTATTAGAGCTTCTGGGGAAAAAGTATAGTTCACGGAAATAAAACTATGTTCTTTCAGGGTTGGGTGGATAGGTGGCTGCTAGGGTGTCTGGCTCCTGGCGGCTTTGCCATCCATGAGGCAAGGGCTGGGAACACAGTGTCTTTGCCTATGGTAGATCCATGTGAATGTCAGGAAGCCAGCTCTTCAGTCTTGGAGATGATTTCTGCTACAATTCTGTAGAAAGATTAAGGATGGCAGAGTAAAAGGTTACCAAGAATGCCAGGATGTTTTTCTTGGGCGTAGGAGGTCCAGATTACTTTCCTTTTTGATGAAAGAGTTTGGAAGACTGTCCCATCTCTCTGGCTTGAGAAATCTCTGCCATTTTAAACATCACTGTGAAATAGCAATTATTATCATCTGTATTTAGTTTTAACATTACCCACAACATAGAAATAATAGGTAAAAATCGTCTTGCCTACTCATTCCAAAGATGATCAAGTCATTAATCTAGCAAAGTATTCATGTATCAGATTTTGTATATTTTGAATCAAAGCTAACTAGGAATGTTAGATATAAGAATGTAATGATATTCATGCACTGAATTCTAAGCCAATATGAACAAAAATGCTGCATGAATGGCACATATAGGTCACCAAAGTTCATTCACAGGTAGAAAAAACTTGTGCTTTCTTTTCCATCTAAAAACAAAAGGAGACTTTCTTTATCTCATTTAAAGAACAGCTCTTTGAAATTGAAATTGACCCTTTTTGCTTGACCTTAAGGAGATTAGCTTCCAGTAGATGAGTTTGCAAAATACTTTTCCTGTTCTTTTGTTTTGCTGGTATTGAAAACATCCCACTAAATCAGATGAAGAGGCATGGGAGGAAAAATATCCAAATTAATTACTAAAATCGAGAAGAGAAGGCAAACTCTTGAAAAGTAAAAAGGTGTTTGTGACCTTCAGTATTTATTGAACAGAGGAAATAACTGACAAGGGCAATACAATTCAATGTTCATGTAGTAACATTCATGTCACTTGTTGAATTTGGTTCTCATATGTATATTGCATACACATAAATTCAAACTATAAGTCGTCATTTTTGAGCCATCATCTTACATTCATGTAATGAAATTATGGAAGAGAGTAAAAACTAGCTCTTAACTTAGTAAATATAATATGGTATTTAAAATCAGGTCACTACAGTAAGGTTCTAAGTATTGCCAATTGAAAAGCTAGAAATGGTATTACTGTTGCAAAGTGTTGTCAATAATTGACTCCAATAGCATTGTAAATACTTGTATCCCACAACTATTTTAAACCCAAGCAATAAAATGGATTTTCTAATTCACTTCAATTCTTTATTTCTCTTACCTATCTATGTCTTGGTACATAAGAAAAGTGTTTCCATCACTGCATTGGTAGAATTATTTCAGTGTTATTATTTTTGTGATTTCGTATGTCTACACAAAAATGAATTAGTTTAATTTATATTGTGATACAGTTGTTTGAGAAATATTTTTAATTCTGTTTCAACTTTATTTCTCCAAGTGTATAATATAAAAATTACTTCTGTTATTGTTCTCTACCAATAGGGGAAAAAATTAAAACATTAGATCCATTGAGAAAGAGATGATGTAATAAATAATTAAGATTAGTAATAATATTATCAGGGGTGATTATGACCAGTTGAATAATCTCTTTCCCTTGAATTATTTAGCTAACAAATTAACTCTCCCAAATATTTAAAATAATGTAAAATCATATTTTACTGCCCATTATTAACTAAAATATTTTTGTTTGACTTTGAGCACCAACTGGTAATACTAATAAATACCCATGTCATGCAGATGGCTGGGCGAATAAGAGATGTCTAAAAATATGCACTGGTCTTGGAAAACATGGCACAAGTAAGGATATCATATATGATGTCTGTTTATTTTATGTCTGATTTCTTTTGAATGAGTAGTTGGGGACTCCATTTCTAAGGAGACTAGGTAAATAAAATGACCTTTGACATTTCA
SEQ ID NO:662 ASPH之全mRNA多核苷酸序列
AGTCTCAAGCTCTGGTAGGCAAGTGCATGCAGTGTGCCTAAAACCTGCCAGCAGTACTTTTGAGTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTACTTTAGCATTTATTATTCATGGATTGAAGAAATCAAAATGGCTGAAGATAAAGAGACAAAGCATGGAGGACACAAGAATGGGAGGAAAGGCGGACTCTCAGGAACTTCATTCTTCACGTGGTTTATGGTGATTGCATTGCTGGGCGTCTGGACATCTGTAGCTGTCGTTTGGTTTGATCTTGTTGACTATGAGGAAGTTCTAGGAAAACTAGGAATCTATGATGCTGATGGTGATGGAGATTTTGATGTGGATGATGCCAAAGTTTTATTAGGACTTAAAGAGAGATCTACTTCAGAGCCAGCAGTCCCGCCAGAAGAGGCTGAGCCACACACTGAGCCCGAGGAGCAGGTTCCTGTGGAGGCAGAACCCCAGAATATCGAAGATGAAGCAAAAGAACAAATTCAGTCCCTTCTCCATGAAATGGTACACGCAGAACATGTTGAGGGAGAAGACTTGCAACAAGAAGATGGACCCACAGGAGAACCACAACAAGAGGATGATGAGTTTCTTATGGCGACTGATGTAGATGATAGATTTGAGACCCTGGAACCTGAAGTATCTCATGAAGAAACCGAGCATAGTTACCACGTGGAAGAGACAGTTTCACAAGACTGTAATCAGGATATGGAAGAGATGATGTCTGAGCAGGAAAATCCAGATTCCAGTGAACCAGTAGTAGAAGATGAAAGATTGCACCATGATACAGATGATGTAACATACCAAGTCTATGAGGAACAAGCAGTATATGAACCTCTAGAAAATGAAGGGATAGAAATCACAGAAGTAACTGCTCCCCCTGAGGATAATCCTGTAGAAGATTCACAGGTAATTGTAGAAGAAGTAAGCATTTTTCCTGTGGAAGAACAGCAGGAAGTACCACCAGAAACAAATAGAAAAACAGATGATCCAGAACAAAAAGCAAAAGTTAAGAAAAAGAAGCCTAAACTTTTAAATAAATTTGATAAGACTATTAAAGCTGAACTTGATGCTGCAGAAAAACTCCGTAAAAGGGGAAAAATTGAGGAAGCAGTGAATGCATTTAAAGAACTAGTACGCAAATACCCTCAGAGTCCACGAGCAAGATATGGGAAGGCGCAGTGTGAGGATGATTTGGCTGAGAAGAGGAGAAGTAATGAGGTGCTACGTGGAGCCATCGAGACCTACCAAGAGGTGGCCAGCCTACCTGATGTCCCTGCAGACCTGCTGAAGCTGAGTTTGAAGCGTCGCTCAGACAGGCAACAATTTCTAGGTCATATGAGAGGTTCCCTGCTTACCCTGCAGAGATTAGTTCAACTATTTCCCAATGATACTTCCTTAAAAAATGACCTTGGCGTGGGATACCTCTTGATAGGAGATAATGACAATGCAAAGAAAGTTTATGAAGAGGTGCTGAGTGTGACACCTAATGATGGCTTTGCTAAAGTCCATTATGGCTTCATCCTGAAGGCACAGAACAAAATTGCTGAGAGCATCCCATATTTAAAGGAAGGAATAGAATCCGGAGATCCTGGCACTGATGATGGGAGATTTTATTTCCACCTGGGGGATGCCATGCAGAGGGTTGGGAACAAAGAGGCATATAAGTGGTATGAGCTTGGGCACAAGAGAGGACACTTTGCATCTGTCTGGCAACGCTCACTCTACAATGTGAATGGACTGAAAGCACAGCCTTGGTGGACCCCAAAAGAAACGGGCTACACAGAGTTAGTAAAGTCTTTAGAAAGAAACTGGAAGTTAATCCGAGATGAAGGCCTTGCAGTGATGGATAAAGCCAAAGGTCTCTTCCTGCCTGAGGATGAAAACCTGAGGGAAAAAGGGGACTGGAGCCAGTTCACGCTGTGGCAGCAAGGAAGAAGAAATGAAAATGCCTGCAAAGGAGCTCCTAAAACCTGTACCTTACTAGAAAAGTTCCCCGAGACAACAGGATGCAGAAGAGGACAGATCAAATATTCCATCATGCACCCCGGGACTCACGTGTGGCCGCACACAGGGCCCACAAACTGCAGGCTCCGAATGCACCTGGGCTTGGTGATTCCCAAGGAAGGCTGCAAGATTCGATGTGCCAACGAGACCAAGACCTGGGAGGAAGGCAAGGTGCTCATCTTTGATGACTCCTTTGAGCACGAGGTATGGCAGGATGCCTCATCTTTCCGGCTGATATTCATCGTGGATGTGTGGCATCCGGAACTGACACCACAGCAGAGACGCAGCCTTCCAGCAATTTAGCATGAATTCATGCAAGCTTGGGAAACTCTGGAGAGAGGCTGCCTTTCTGGTTCCATCTCCTTGGGTGTGAGGATAGAATTTCGAACACCAAGAGTCAATTCCCTTGACTTGCAGCCCGAGTAATTCAAAGCCTCCTCCTAGGGTCAGAAGACACTAAAGGGAATATTTGCCTCGCTGCAATTCATTTAGGAAACACCCTGCTGTGTGTCATCTCATGACAGCACTGGTCTTCTGCCAGTATTTAAGGTGAACATTTGATAGCTTCTACCTTACCAGCCAAAGATATTTTTTCCACATAGAATAGGTCTAATTCAATGTATAATGAGAACATATGTAGAAACTGTGAATGGATTGCTTTAGTTTGTAATTTTTCTATGCAGTTATATTTTTCTAGTGTAGCTAGACTATTTTGTCATCATGTACCACTACATTTTTGTTTATTTTAATGACAAGCTGTATAAATGCTTTACTTCTAGCTATTTAATGGTAGCATTACTGGGGAACTCAGACTTCCCTCTTTTAATTCTTCTTAGTAAAAGATACTCATGAAAAAAGCAGTTTTATTTTCCTAACAAAAAAGAAAGAGCTCATTATGTCAGTGTCTATGAACTGTACCCATCCCAACTCTCAAATCGTTTGGTTTTTTTTATCTTGATTGAGATCCTCTTCTCACTATGCTAGTGGTGGAGATATTGACAAAATCCTATTTCTTTCAAAGAGGAACTTTTCACACCGAAAAAAGAGCATGGAATTATTTTATATTGTTATAAAAATCCCAGATGCAAATTTTTTTAATGCCAATTATTAGAGCTTCTGGGGAAAAAGTATAGTTCACGGAAATAAAACTATGTTCTTTCAGGGTTGGGTGGATAGGTGGCTGCTAGGGTGTCTGGCTCCTGGCGGCTTTGCCATCCATGAGGCAAGGGCTGGGAACACAGTGTCTTTGCCTATGGTAGATCCATGTGAATGTCAGGAAGCCAGCTCTTCAGTCTTGGAGATGATTTCTGCTACAATTCTGTAGAAAGATTAAGGATGGCAGAGTAAAAGGTTACCAAGAATGCCAGGATGTTTTTCTTGGGCGTAGGAGGTCCAGATTACTTTCCTTTTTGATGAAAGAGTTTGGAAGACTGTCCCATCTCTCTGGCTTGAGAAATCTCTGCCATTTTAAACATCACTGTGAAATAGCAATTATTATCATCTGTATTTAGTTTTAACATTACCCACAACATAGAAATAATAGGTAAAAATCGTCTTGCCTACTCATTCCAAAGATGATCAAGTCATTAATCTAGCAAAGTATTCATGTATCAGATTTTGTATATTTTGAATCAAAGCTAACTAGGAATGTTAGATATAAGAATGTAATGATATTCATGCACTGAATTCTAAGCCAATATGAACAAAAATGCTGCATGAATGGCACATATAGGTCACCAAAGTTCATTCACAGGTAGAAAAAACTTGTGCTTTCTTTTCCATCTAAAAACAAAAGGAGACTTTCTTTATCTCATTTAAAGAACAGCTCTTTGAAATTGAAATTGACCCTTTTTGCTTGACCTTAAGGAGATTAGCTTCCAGTAGATGAGTTTGCAAAATACTTTTCCTGTTCTTTTGTTTTGCTGGTATTGAAAACATCCCACTAAATCAGATGAAGAGGCATGGGAGGAAAAATATCCAAATTAATTACTAAAATCGAGAAGAGAAGGCAAACTCTTGAAAAGTAAAAAGGTGTTTGTGACCTTCAGTATTTATTGAACAGAGGAAATAACTGACAAGGGCAATACAATTCAATGTTCATGTAGTAACATTCATGTCACTTGTTGAATTTGGTTCTCATATGTATATTGCATACACATAAATTCAAACTATAAGTCGTCATTTTTGAGCCATCATCTTACATTCATGTAATGAAATTATGGAAGAGAGTAAAAACTAGCTCTTAACTTAGTAAATATAATATGGTATTTAAAATCAGGTCACTACAGTAAGGTTCTAAGTATTGCCAATTGAAAAGCTAGAAATGGTATTACTGTTGCAAAGTGTTGTCAATAATTGACTCCAATAGCATTGTAAATACTTGTATCCCACAACTATTTTAAACCCAAGCAATAAAATGGATTTTCTAATTCACTTCAATTCTTTATTTCTCTTACCTATCTATGTCTTGGTACATAAGAAAAGTGTTTCCATCACTGCATTGGTAGAATTATTTCAGTGTTATTATTTTTGTGATTTCGTATGTCTACACAAAAATGAATTAGTTTAATTTATATTGTGATACAGTTGTTTGAGAAATATTTTTAATTCTGTTTCAACTTTATTTCTCCAAGTGTATAATATAAAAATTACTTCTGTTATTGTTCTCTACCAATAGGGGAAAAAATTAAAACATTAGATCCATTGAGAAAGAGATGATGTAATAAATAATTAAGATTAGTAATAATATTATCAGGGGTGATTATGACCAGTTGAATAATCTCTTTCCCTTGAATTATTTAGCTAACAAATTAACTCTCCCAAATATTTAAAATAATGTAAAATCATATTTTACTGCCCATTATTAACTAAAATATTTTTGTTTGACTTTGAGCACCAACTGGTAATACTAATAAATACCCATGTCATGCAGATGGCTGGGCGAATAAGAGATGTCTAAAAATATGCACTGGTCTTGGAAAACATGGCACAAGTAAGGATATCATATATGATGTCTGTTTATTTTATGTCTGATTTCTTTTGAATGAGTAGTTGGGGACTCCATTTCTAAGGAGACTAGGTAAATAAAATGACCTTTGACATTTCA
SEQ ID NO:663 ASPH之外顯子1的轉譯多肽序列
MAEDK
SEQ ID NO:664 ASPH之外顯子2的轉譯多肽序列
TKHGGHKNGRKGGLSGTSFFTWFMVIALLGVWTSVAVVWFDLVDYEEVL
SEQ ID NO:665 ASPH之外顯子3的轉譯多肽序列
KLGIYDADGDGDFDVDDAKVLL
SEQ ID NO:666 ASPH之外顯子4的轉譯多肽序列
LKERSTSEPAVPPEEAEPHTEPEEQVPVEA
SEQ ID NO:667 ASPH之外顯子5的轉譯多肽序列
PQNIEDEAKEQIQSLLHEMVHAEH
SEQ ID NO:668 ASPH之外顯子6的轉譯多肽序列
EGEDLQQEDGPTGEPQQEDDEFLMATDVDDRFETLEPEVSHE
SEQ ID NO:669 ASPH之外顯子7的轉譯多肽序列
TEHSYHVEET
SEQ ID NO:670 ASPH之外顯子8的轉譯多肽序列
SQDCNQDMEEMMSEQENP
SEQ ID NO:671 ASPH之外顯子9的轉譯多肽序列
SSEPVVEDERLHHDT
SEQ ID NO:672 ASPH之外顯子10的轉譯多肽序列
DVTYQVYEEQ
SEQ ID NO:673 ASPH之外顯子11的轉譯多肽序列
VYEPLENEGIEIT
SEQ ID NO:674 ASPH之外顯子12的轉譯多肽序列
VTAPPEDNPVEDSQVIVE
SEQ ID NO:675 ASPH之外顯子13的轉譯多肽序列
VSIFPVEEQQEVPP
SEQ ID NO:676 ASPH之外顯子14的轉譯多肽序列
TNRKTDDPEQKAK
SEQ ID NO:677 ASPH之外顯子15的轉譯多肽序列
KKKKPKLLNKFDKTIKAELDAAEKLRKR
SEQ ID NO:678 ASPH之外顯子16的轉譯多肽序列
GKIEEAVNAFKELVRKYPQSPRARYGKAQ
SEQ ID NO:679 ASPH之外顯子17的轉譯多肽序列
CEDDLAEKRRSNEVLRGAIETYQEVASLPDVPADLLKLSLKRRSDRQQFL
SEQ ID NO:680 ASPH之外顯子18的轉譯多肽序列
HMRGSLLTLQRLVQLFPNDTSLKNDLGVGYLLIGDNDNAKKVYEE
SEQ ID NO:681 ASPH之外顯子19的轉譯多肽序列
VLSVTPNDGFAKVHYGFILKAQNKIAESIPYLK
SEQ ID NO:682 ASPH之外顯子20的轉譯多肽序列
EGIESGDPGTDDGRFYFHLGDAMQRVGNKE
SEQ ID NO:683 ASPH之外顯子21的轉譯多肽序列
AYKWYELGHKRGHFASVWQRSLYNVNGLKAQPWWTPKETGYTELVK
SEQ ID NO:684 ASPH之外顯子22的轉譯多肽序列
SLERNWKLIRDEGLAVMDKAKGLFLPEDENLREKGDWSQFTLWQQ
SEQ ID NO:685 ASPH之外顯子23的轉譯多肽序列
RRNENACKGAPKTCTLLEKFPETTGCRRGQ
SEQ ID NO:686 ASPH之外顯子24的轉譯多肽序列
IKYSIMHPGTHVWPHTGPTNCRLRMHLGLVIPKEGCKIRCANET
SEQ ID NO:687 ASPH之外顯子25的轉譯多肽序列
TWEEGKVLIFDDSFEHEVWQDASSFRLIFIVDVWHPELTPQQRRSLPAI
SEQ ID NO:688 ASPH之全蛋白質序列
MAEDKETKHGGHKNGRKGGLSGTSFFTWFMVIALLGVWTSVAVVWFDLVDYEEVLGKLGIYDADGDGDFDVDDAKVLLGLKERSTSEPAVPPEEAEPHTEPEEQVPVEAEPQNIEDEAKEQIQSLLHEMVHAEHVEGEDLQQEDGPTGEPQQEDDEFLMATDVDDRFETLEPEVSHEETEHSYHVEETVSQDCNQDMEEMMSEQENPDSSEPVVEDERLHHDTDDVTYQVYEEQAVYEPLENEGIEITEVTAPPEDNPVEDSQVIVEEVSIFPVEEQQEVPPETNRKTDDPEQKAKVKKKKPKLLNKFDKTIKAELDAAEKLRKRGKIEEAVNAFKELVRKYPQSPRARYGKAQCEDDLAEKRRSNEVLRGAIETYQEVASLPDVPADLLKLSLKRRSDRQQFLGHMRGSLLTLQRLVQLFPNDTSLKNDLGVGYLLIGDNDNAKKVYEEVLSVTPNDGFAKVHYGFILKAQNKIAESIPYLKEGIESGDPGTDDGRFYFHLGDAMQRVGNKEAYKWYELGHKRGHFASVWQRSLYNVNGLKAQPWWTPKETGYTELVKSLERNWKLIRDEGLAVMDKAKGLFLPEDENLREKGDWSQFTLWQQGRRNENACKGAPKTCTLLEKFPETTGCRRGQIKYSIMHPGTHVWPHTGPTNCRLRMHLGLVIPKEGCKIRCANETKTWEEGKVLIFDDSFEHEVWQDASSFRLIFIVDVWHPELTPQQRRSLPAI
SEQ ID NO:689 ASPH之全部外顯子1-22按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:690 ASPH之全部外顯子1-22按順序排列的轉譯多肽序列
NOTCH2 序列資訊SEQ ID NO:691 來自NOTCH2-NRG1融合物5’處之NOTCH2外顯子6的序列
CCTCCTGTACTCCAGGCTCCACCTGCATCGACCGTGTGGCCTCCTTCTCTTGCATGTGCCCAGAGGGGAAGGCAG
SEQ ID NO:692 NOTCH2-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG
SEQ ID NO:693 Notch2-NRG1多核苷酸序列
CCTCCTGTACTCCAGGCTCCACCTGCATCGACCGTGTGGCCTCCTTCTCTTGCATGTGCCCAGAGGGGAAGGCAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG
SEQ ID NO:694 Notch2-NRG1多肽序列
SCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAATSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVN
SEQ ID NO:695 NOTCH2之外顯子1
AGGCTGCTTCGTTGCACACCCGAGAAAGTTTCAGCCAAACTTCGGGCGGCGGCTGAGGCGGCGGCCGAGGAGCGGCGGACTCGGGGCGCGGGGAGTCGAGGCATTTGCGCCTGGGCTTCGGAGCGTAGCGCCAGGGCCTGAGCCTTTGAAGCAGGAGGAGGGGAGGAGAGAGTGGGGCTCCTCTATCGGGACCCCCTCCCCATGTGGATCTGCCCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGCGACCGAGAAGATGCCCGCCCTGCGCCCCGCTCTGCTGTGGGCGCTGCTGGCGCTCTGGCTGTGCTGCGCGGCCCCCGCGCATG
SEQ ID NO:696 NOTCH2之外顯子2
CATTGCAGTGTCGAGATGGCTATGAACCCTGTGTAAATGAAGGAATGTGTGTTACCTACCACAATGGCACAGGATACTGCAA
SEQ ID NO:697 NOTCH2之外顯子3
ATGTCCAGAAGGCTTCTTGGGGGAATATTGTCAACATCGAGACCCCTGTGAGAAGAACCGCTGCCAGAATGGTGGGACTTGTGTGGCCCAGGCCATGCTGGGGAAAGCCACGTGCCGATGTGCCTCAGGGTTTACAGGAGAGGACTGCCAGTACTCAACATCTCATCCATGCTTTGTGTCTCGACCCTGCCTGAATGGCGGCACATGCCATATGCTCAGCCGGGATACCTATGAGTGCACCTGTCAAGTCGGGTTTACAG
SEQ ID NO:698 NOTCH2之外顯子4
GTAAGGAGTGCCAATGGACGGATGCCTGCCTGTCTCATCCCTGTGCAAATGGAAGTACCTGTACCACTGTGGCCAACCAGTTCTCCTGCAAATGCCTCACAGGCTTCACAGGGCAGAAATGTGAGACTGATGTCAATGAGTGTGACATTCCAGGACACTGCCAGCATGGTGGCACCTGCCTCAACCTGCCTGGTTCCTACCAGTGCCAGTGCCCTCAGGGCTTCACAGGCCAGTACTGTGACAGCCTGTATGTGCCCTGTGCACCCTCACCTTGTGTCAATGGAGGCACCTGTCGGCAGACTGGTGACTTCACTTTTGAGTGCAACTGCCTTCCAG
SEQ ID NO:699 NOTCH2之外顯子5
GTTTTGAAGGGAGCACCTGTGAGAGGAATATTGATGACTGCCCTAACCACAGGTGTCAGAATGGAGGGGTTTGTGTGGATGGGGTCAACACTTACAACTGCCGCTGTCCCCCACAATGGACAG
SEQ ID NO:700 NOTCH2之外顯子6
GACAGTTCTGCACAGAGGATGTGGATGAATGCCTGCTGCAGCCCAATGCCTGTCAAAATGGGGGCACCTGTGCCAACCGCAATGGAGGCTATGGCTGTGTATGTGTCAACGGCTGGAGTGGAGATGACTGCAGTGAGAACATTGATGATTGTGCCTTCGCCTCCTGTACTCCAGGCTCCACCTGCATCGACCGTGTGGCCTCCTTCTCTTGCATGTGCCCAGAGGGGAAGGCAG
SEQ ID NO:701 NOTCH2之外顯子7
GTCTCCTGTGTCATCTGGATGATGCATGCATCAGCAATCCTTGCCACAAGGGGGCACTGTGTGACACCAACCCCCTAAATGGGCAATATATTTGCACCTGCCCACAAGGCTACAAAGGGGCTGACTGCACAGAAGATGTGGATGAATGTGCCATGG
SEQ ID NO:702 NOTCH2之外顯子8-34
CCAATAGCAATCCTTGTGAGCATGCAGGAAAATGTGTGAACACGGATGGCGCCTTCCACTGTGAGTGTCTGAAGGGTTATGCAGGACCTCGTTGTGAGATGGACATCAATGAGTGCCATTCAGACCCCTGCCAGAATGATGCTACCTGTCTGGATAAGATTGGAGGCTTCACATGTCTGTGCATGCCAGGTTTCAAAGGTGTGCATTGTGAATTAGAAATAAATGAATGTCAGAGCAACCCTTGTGTGAACAATGGGCAGTGTGTGGATAAAGTCAATCGTTTCCAGTGCCTGTGTCCTCCTGGTTTCACTGGGCCAGTTTGCCAGATTGATATTGATGACTGTTCCAGTACTCCGTGTCTGAATGGGGCAAAGTGTATCGATCACCCGAATGGCTATGAATGCCAGTGTGCCACAGGTTTCACTGGTGTGTTGTGTGAGGAGAACATTGACAACTGTGACCCCGATCCTTGCCACCATGGTCAGTGTCAGGATGGTATTGATTCCTACACCTGCATCTGCAATCCCGGGTACATGGGCGCCATCTGCAGTGACCAGATTGATGAATGTTACAGCAGCCCTTGCCTGAACGATGGTCGCTGCATTGACCTGGTCAATGGCTACCAGTGCAACTGCCAGCCAGGCACGTCAGGGGTTAATTGTGAAATTAATTTTGATGACTGTGCAAGTAACCCTTGTATCCATGGAATCTGTATGGATGGCATTAATCGCTACAGTTGTGTCTGCTCACCAGGATTCACAGGGCAGAGATGTAACATTGACATTGATGAGTGTGCCTCCAATCCCTGTCGCAAGGGTGCAACATGTATCAACGGTGTGAATGGTTTCCGCTGTATATGCCCCGAGGGACCCCATCACCCCAGCTGCTACTCACAGGTGAACGAATGCCTGAGCAATCCCTGCATCCATGGAAACTGTACTGGAGGTCTCAGTGGATATAAGTGTCTCTGTGATGCAGGCTGGGTTGGCATCAACTGTGAAGTGGACAAAAATGAATGCCTTTCGAATCCATGCCAGAATGGAGGAACTTGTGACAATCTGGTGAATGGATACAGGTGTACTTGCAAGAAGGGCTTTAAAGGCTATAACTGCCAGGTGAATATTGATGAATGTGCCTCAAATCCATGCCTGAACCAAGGAACCTGCTTTGATGACATAAGTGGCTACACTTGCCACTGTGTGCTGCCATACACAGGCAAGAATTGTCAGACAGTATTGGCTCCCTGTTCCCCAAACCCTTGTGAGAATGCTGCTGTTTGCAAAGAGTCACCAAATTTTGAGAGTTATACTTGCTTGTGTGCTCCTGGCTGGCAAGGTCAGCGGTGTACCATTGACATTGACGAGTGTATCTCCAAGCCCTGCATGAACCATGGTCTCTGCCATAACACCCAGGGCAGCTACATGTGTGAATGTCCACCAGGCTTCAGTGGTATGGACTGTGAGGAGGACATTGATGACTGCCTTGCCAATCCTTGCCAGAATGGAGGTTCCTGTATGGATGGAGTGAATACTTTCTCCTGCCTCTGCCTTCCGGGTTTCACTGGGGATAAGTGCCAGACAGACATGAATGAGTGTCTGAGTGAACCCTGTAAGAATGGAGGGACCTGCTCTGACTACGTCAACAGTTACACTTGCAAGTGCCAGGCAGGATTTGATGGAGTCCATTGTGAGAACAACATCAATGAGTGCACTGAGAGCTCCTGTTTCAATGGTGGCACATGTGTTGATGGGATTAACTCCTTCTCTTGCTTGTGCCCTGTGGGTTTCACTGGATCCTTCTGCCTCCATGAGATCAATGAATGCAGCTCTCATCCATGCCTGAATGAGGGAACGTGTGTTGATGGCCTGGGTACCTACCGCTGCAGCTGCCCCCTGGGCTACACTGGGAAAAACTGTCAGACCCTGGTGAATCTCTGCAGTCGGTCTCCATGTAAAAACAAAGGTACTTGCGTTCAGAAAAAAGCAGAGTCCCAGTGCCTATGTCCATCTGGATGGGCTGGTGCCTATTGTGACGTGCCCAATGTCTCTTGTGACATAGCAGCCTCCAGGAGAGGTGTGCTTGTTGAACACTTGTGCCAGCACTCAGGTGTCTGCATCAATGCTGGCAACACGCATTACTGTCAGTGCCCCCTGGGCTATACTGGGAGCTACTGTGAGGAGCAACTCGATGAGTGTGCGTCCAACCCCTGCCAGCACGGGGCAACATGCAGTGACTTCATTGGTGGATACAGATGCGAGTGTGTCCCAGGCTATCAGGGTGTCAACTGTGAGTATGAAGTGGATGAGTGCCAGAATCAGCCCTGCCAGAATGGAGGCACCTGTATTGACCTTGTGAACCATTTCAAGTGCTCTTGCCCACCAGGCACTCGGGGCCTACTCTGTGAAGAGAACATTGATGACTGTGCCCGGGGTCCCCATTGCCTTAATGGTGGTCAGTGCATGGATAGGATTGGAGGCTACAGTTGTCGCTGCTTGCCTGGCTTTGCTGGGGAGCGTTGTGAGGGAGACATCAACGAGTGCCTCTCCAACCCCTGCAGCTCTGAGGGCAGCCTGGACTGTATACAGCTCACCAATGACTACCTGTGTGTTTGCCGTAGTGCCTTTACTGGCCGGCACTGTGAAACCTTCGTCGATGTGTGTCCCCAGATGCCCTGCCTGAATGGAGGGACTTGTGCTGTGGCCAGTAACATGCCTGATGGTTTCATTTGCCGTTGTCCCCCGGGATTTTCCGGGGCAAGGTGCCAGAGCAGCTGTGGACAAGTGAAATGTAGGAAGGGGGAGCAGTGTGTGCACACCGCCTCTGGACCCCGCTGCTTCTGCCCCAGTCCCCGGGACTGCGAGTCAGGCTGTGCCAGTAGCCCCTGCCAGCACGGGGGCAGCTGCCACCCTCAGCGCCAGCCTCCTTATTACTCCTGCCAGTGTGCCCCACCATTCTCGGGTAGCCGCTGTGAACTCTACACGGCACCCCCCAGCACCCCTCCTGCCACCTGTCTGAGCCAGTATTGTGCCGACAAAGCTCGGGATGGCGTCTGTGATGAGGCCTGCAACAGCCATGCCTGCCAGTGGGATGGGGGTGACTGTTCTCTCACCATGGAGAACCCCTGGGCCAACTGCTCCTCCCCACTTCCCTGCTGGGATTATATCAACAACCAGTGTGATGAGCTGTGCAACACGGTCGAGTGCCTGTTTGACAACTTTGAATGCCAGGGGAACAGCAAGACATGCAAGTATGACAAATACTGTGCAGACCACTTCAAAGACAACCACTGTGACCAGGGGTGCAACAGTGAGGAGTGTGGTTGGGATGGGCTGGACTGTGCTGCTGACCAACCTGAGAACCTGGCAGAAGGTACCCTGGTTATTGTGGTATTGATGCCACCTGAACAACTGCTCCAGGATGCTCGCAGCTTCTTGCGGGCACTGGGTACCCTGCTCCACACCAACCTGCGCATTAAGCGGGACTCCCAGGGGGAACTCATGGTGTACCCCTATTATGGTGAGAAGTCAGCTGCTATGAAGAAACAGAGGATGACACGCAGATCCCTTCCTGGTGAACAAGAACAGGAGGTGGCTGGCTCTAAAGTCTTTCTGGAAATTGACAACCGCCAGTGTGTTCAAGACTCAGACCACTGCTTCAAGAACACGGATGCAGCAGCAGCTCTCCTGGCCTCTCACGCCATACAGGGGACCCTGTCATACCCTCTTGTGTCTGTCGTCAGTGAATCCCTGACTCCAGAACGCACTCAGCTCCTCTATCTCCTTGCTGTTGCTGTTGTCATCATTCTGTTTATTATTCTGCTGGGGGTAATCATGGCAAAACGAAAGCGTAAGCATGGCTCTCTCTGGCTGCCTGAAGGTTTCACTCTTCGCCGAGATGCAAGCAATCACAAGCGTCGTGAGCCAGTGGGACAGGATGCTGTGGGGCTGAAAAATCTCTCAGTGCAAGTCTCAGAAGCTAACCTAATTGGTACTGGAACAAGTGAACACTGGGTCGATGATGAAGGGCCCCAGCCAAAGAAAGTAAAGGCTGAAGATGAGGCCTTACTCTCAGAAGAAGATGACCCCATTGATCGACGGCCATGGACACAGCAGCACCTTGAAGCTGCAGACATCCGTAGGACACCATCGCTGGCTCTCACCCCTCCTCAGGCAGAGCAGGAGGTGGATGTGTTAGATGTGAATGTCCGTGGCCCAGATGGCTGCACCCCATTGATGTTGGCTTCTCTCCGAGGAGGCAGCTCAGATTTGAGTGATGAAGATGAAGATGCAGAGGACTCTTCTGCTAACATCATCACAGACTTGGTCTACCAGGGTGCCAGCCTCCAGGCCCAGACAGACCGGACTGGTGAGATGGCCCTGCACCTTGCAGCCCGCTACTCACGGGCTGATGCTGCCAAGCGTCTCCTGGATGCAGGTGCAGATGCCAATGCCCAGGACAACATGGGCCGCTGTCCACTCCATGCTGCAGTGGCAGCTGATGCCCAAGGTGTCTTCCAGATTCTGATTCGCAACCGAGTAACTGATCTAGATGCCAGGATGAATGATGGTACTACACCCCTGATCCTGGCTGCCCGCCTGGCTGTGGAGGGAATGGTGGCAGAACTGATCAACTGCCAAGCGGATGTGAATGCAGTGGATGACCATGGAAAATCTGCTCTTCACTGGGCAGCTGCTGTCAATAATGTGGAGGCAACTCTTTTGTTGTTGAAAAATGGGGCCAACCGAGACATGCAGGACAACAAGGAAGAGACACCTCTGTTTCTTGCTGCCCGGGAGGGGAGCTATGAAGCAGCCAAGATCCTGTTAGACCATTTTGCCAATCGAGACATCACAGACCATATGGATCGTCTTCCCCGGGATGTGGCTCGGGATCGCATGCACCATGACATTGTGCGCCTTCTGGATGAATACAATGTGACCCCAAGCCCTCCAGGCACCGTGTTGACTTCTGCTCTCTCACCTGTCATCTGTGGGCCCAAC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SEQ ID NO:703 NOTCH2之全mRNA多核苷酸序列
AGGCTGCTTCGTTGCACACCCGAGAAAGTTTCAGCCAAACTTCGGGCGGCGGCTGAGGCGGCGGCCGAGGAGCGGCGGACTCGGGGCGCGGGGAGTCGAGGCATTTGCGCCTGGGCTTCGGAGCGTAGCGCCAGGGCCTGAGCCTTTGAAGCAGGAGGAGGGGAGGAGAGAGTGGGGCTCCTCTATCGGGACCCCCTCCCCATGTGGATCTGCCCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGCGACCGAGAAGATGCCCGCCCTGCGCCCCGCTCTGCTGTGGGCGCTGCTGGCGCTCTGGCTGTGCTGCGCGGCCCCCGCGCATGCATTGCAGTGTCGAGATGGCTATGAACCCTGTGTAAATGAAGGAATGTGTGTTACCTACCACAATGGCACAGGATACTGCAAATGTCCAGAAGGCTTCTTGGGGGAATATTGTCAACATCGAGACCCCTGTGAGAAGAACCGCTGCCAGAATGGTGGGACTTGTGTGGCCCAGGCCATGCTGGGGAAAGCCACGTGCCGATGTGCCTCAGGGTTTACAGGAGAGGACTGCCAGTACTCAACATCTCATCCATGCTTTGTGTCTCGACCCTGCCTGAATGGCGGCACATGCCATATGCTCAGCCGGGATACCTATGAGTGCACCTGTCAAGTCGGGTTTACAGGTAAGGAGTGCCAATGGACGGATGCCTGCCTGTCTCATCCCTGTGCAAATGGAAGTACCTGTACCACTGTGGCCAACCAGTTCTCCTGCAAATGCCTCACAGGCTTCACAGGGCAGAAATGTGAGACTGATGTCAATGAGTGTGACATTCCAGGACACTGCCAGCATGGTGGCACCTGCCTCAACCTGCCTGGTTCCTACCAGTGCCAGTGCCCTCAGGGCTTCACAGGCCAGTACTGTGACAGCCTGTATGTGCCCTGTGCACCCTCACCTTGTGTCAATGGAGGCACCTGTCGGCAGACTGGTGACTTCACTTTTGAGTGCAACTGCCTTCCAGGTTTTGAAGGGAGCACCTGTGAGAGGAATATTGATGACTGCCCTAACCACAGGTGTCAGAATGGAGGGGTTTGTGTGGATGGGGTCAACACTTACAACTGCCGCTGTCCCCCACAATGGACAGGACAGTTCTGCACAGAGGATGTGGATGAATGCCTGCTGCAGCCCAATGCCTGTCAAAATGGGGGCACCTGTGCCAACCGCAATGGAGGCTATGGCTGTGTATGTGTCAACGGCTGGAGTGGAGATGACTGCAGTGAGAACATTGATGATTGTGCCTTCGCCTCCTGTACTCCAGGCTCCACCTGCATCGACCGTGTGGCCTCCTTCTCTTGCATGTGCCCAGAGGGGAAGGCAGGTCTCCTGTGTCATCTGGATGATGCATGCATCAGCAATCCTTGCCACAAGGGGGCACTGTGTGACACCAACCCCCTAAATGGGCAATATATTTGCACCTGCCCACAAGGCTACAAAGGGGCTGACTGCACAGAAGATGTGGATGAATGTGCCATGGCCAATAGCAATCCTTGTGAGCATGCAGGAAAATGTGTGAACACGGATGGCGCCTTCCACTGTGAGTGTCTGAAGGGTTATGCAGGACCTCGTTGTGAGATGGACATCAATGAGTGCCATTCAGACCCCTGCCAGAATGATGCTACCTGTCTGGATAAGATTGGAGGCTTCACATGTCTGTGCATGCCAGGTTTCAAAGGTGTGCATTGTGAATTAGAAATAAATGAATGTCAGAGCAACCCTTGTGTGAACAATGGGCAGTGTGTGGATAAAGTCAATCGTTTCCAGTGCCTGTGTCCTCCTGGTTTCACTGGGCCAGTTTGCCAGATTGATATTGATGACTGTTCCAGTACTCCGTGTCTGAATGGGGCAAAGTGTATCGATCACCCGAATGGCTATGAATGCCAGTGTGCCACAGGTTTCACTGGTGTGTTGTGTGAGGAGAACATTGACAACTGTGACCCCGATCCTTGCCACCATGGTCAGTGTCAGGATGGTATTGATTCCTACACCTGCATCTGCAATCCCGGGTACATGGGCGCCATCTGCAGTGACCAGATTGATGAATGTTACAGCAGCCCTTGCCTGAACGATGGTCGCTGCATTGACCTGGTCAATGGCTACCAGTGCAACTGCCAGCCAGGCACGTCAGGGGTTAATTGTGAAATTAATTTTGATGACTGTGCAAGTAACCCTTGTATCCATGGAATCTGTATGGATGGCATTAATCGCTACAGTTGTGTCTGCTCACCAGGATTCACAGGGCAGAGATGTAACATTGACATTGATGAGTGTGCCTCCAATCCCTGTCGCAAGGGTGCAACATGTATCAACGGTGTGAATGGTTTCCGCTGTATATGCCCCGAGGGACCCCATCACCCCAGCTGCTACTCACAGGTGAACGAATGCCTGAGCAATCCCTGCATCCATGGAAACTGTACTGGAGGTCTCAGTGGATATAAGTGTCTCTGTGATGCAGGCTGGGTTGGCATCAACTGTGAAGTGGACAAAAATGAATGCCTTTCGAATCCATGCCAGAATGGAGGAACTTGTGACAATCTGGTGAATGGATACAGGTGTACTTGCAAGAAGGGCTTTAAAGGCTATAACTGCCAGGTGAATATTGATGAATGTGCCTCAAATCCATGCCTGAACCAAGGAACCTGCTTTGATGACATAAGTGGCTACACTTGCCACTGTGTGCTGCCATACACAGGCAAGAATTGTCAGACAGTATTGGCTCCCTGTTCCCCAAACCCTTGTGAGAATGCTGCTGTTTGCAAAGAGTCACCAAATTTTGAGAGTTATACTTGCTTGTGTGCTCCTGGCTGGCAAGGTCAGCGGTGTACCATTGACATTGACGAGTGTATCTCCAAGCCCTGCATGAACCATGGTCTCTGCCATAACACCCAGGGCAGCTACATGTGTGAATGTCCACCAGGCTTCAGTGGTATGGACTGTGAGGAGGACATTGATGACTGCCTTGCCAATCCTTGCCAGAATGGAGGTTCCTGTATGGATGGAGTGAATACTTTCTCCTGCCTCTGCCTTCCGGGTTTCACTGGGGATAAGTGCCAGACAGACATGAATGAGTGTCTGAGTGAACCCTGTAAGAATGGAGGGACCTGCTCTGACTACGTCAACAGTTACACTTGCAAGTGCCAGGCAGGATTTGATGGAGTCCATTGTGAGAACAACATCAATGAGTGCACTGAGAGCTCCTGTTTCAATGGTGGCACATGTGTTGATGGGATTAACTCCTTCTCTTGCTTGTGCCCTGTGGGTTTCACTGGATCCTTCTGCCTCCATGAGATCAATGAATGCAGCTCTCATCCATGCCTGAATGAGGGAACGTGTGTTGATGGCCTGGGTACCTACCGCTGCAGCTGCCCCCTGGGCTACACTGGGAAAAACTGTCAGACCCTGGTGAATCTCTGCAGTCGGTCTCCATGTAAAAACAAAGGTACTTGCGTTCAGAAAAAAGCAGAGTCCCAGTGCCTATGTCCATCTGGATGGGCTGGTGCCTATTGTGACGTGCCCAATGTCTCTTGTGACATAGCAGCCTCCAGGAGAGGTGTGCTTGTTGAACACTTGTGCCAGCACTCAGGTGTCTGCATCAATGCTGGCAACACGCATTACTGTCAGTGCCCCCTGGGCTATACTGGGAGCTACTGTGAGGAGCAACTCGATGAGTGTGCGTCCAACCCCTGCCAGCACGGGGCAACATGCAGTGACTTCATTGGTGGATACAGATGCGAGTGTGTCCCAGGCTATCAGGGTGTCAACTGTGAGTATGAAGTGGATGAGTGCCAGAATCAGCCCTGCCAGAATGGAGGCACCTGTATTGACCTTGTGAACCATTTCAAGTGCTCTTGCCCACCAGGCACTCGGGGCCTACTCTGTGAAGAGAACATTGATGACTGTGCCCGGGGTCCCCATTGCCTTAATGGTGGTCAGTGCATGGATAGGATTGGAGGCTACAGTTGTCGCTGCTTGCCTGGCTTTGCTGGGGAGCGTTGTGAGGGAGACATCAACGAGTGCCTCTCCAACCCCTGCAGCTCTGAGGGCAGCCTGGACTGTATACAGCTCACCAATGACTACCTGTGTGTTTGCCGTAGTGCCTTTACTGGCCGGCACTGTGAAACCTTCGTCGATGTGTGTCCCCAGATGCCCTGCCTGAATGGAGGGACTTGTGCTGTGGCCAGTAACATGCCTGATGGTTTCATTTGCCGTTGTCCCCCGGGATTTTCCGGGGCAAGGTGCCAGAGCAGCTGTGGACAAGTGAAATGTAGGAAGGGGGAGCAGTGTGTGCACACCGCCTCTGGACCCCGCTGCTTCTGCCCCAGTCCCCGGGACTGCGAGTCAGGCTGTGCCAGTAGCCCCTGCCAGCACGGGGGCAGCTGCCACCCTCAGCGCCAGCCTCCTTATTACTCCTGCCAGTGTGCCCCACCATTCTCGGGTAGCCGCTGTGAACTCTACACGGCACCCCCCAGCACCCCTCCTGCCACCTGTCTGAGCCAGTATTGTGCCGACAAAGCTCGGGATGGCGTCTGTGATGAGGCCTGCAACAGCCATGCCTGCCAGTGGGATGGGGGTGACTGTTCTCTCACCATGGAGAACCCCTGGGCCAACTGCTCCTCCCCACTTCCCTGCTGGGATTATATCAACAACCAGTGTGATGAGCTGTGCAACACGGTCGAGTGCCTGTTTGACAACTTTGAATGCCAGGGGAACAGCAAGACATGCAAGTATGACAAATACTGTGCAGACCACTTCAAAGACAACCACTGTGACCAGGGGTGCAACAGTGAGGAGTGTGGTTGGGATGGGCTGGACTGTGCTGCTGACCAACCTGAGAACCTGGCAGAAGGTACCCTGGTTATTGTGGTATTGATGCCACCTGAACAACTGCTCCAGGATGCTCGCAGCTTCTTGCGGGCACTGGGTACCCTGCTCCACACCAACCTGCGCATTAAGCGGGACTCCCAGGGGGAACTCATGGTGTACCCCTATTATGGTGAGAAGTCAGCTGCTATGAAGAAACAGAGGATGACACGCAGATCCCTTCCTGGTGAACAAGAACAGGAGGTGGCTGGCTCTAAAGTCTTTCTGGAAATTGACAACCGCCAGTGTGTTCAAGACTCAGACCACTGCTTCAAGAACACGGATGCAGCAGCAGCTCTCCTGGCCTCTCACGCCATACAGGGGACCCTGTCATACCCTCTTGTGTCTGTCGTCAGTGAATCCCTGACTCCAGAACGCACTCAGCTCCTCTATCTCCTTGCTGTTGCTGTTGTCATCATTCTGTTTATTATTCTGCTGGGGGTAATCATGGCAAAACGAAAGCGTAAGCATGGCTCTCTCTGGCTGCCTGAAGGTTTCACTCTTCGCCGAGATGCAAGCAATCACAAGCGTCGTGAGCCAGTGGGACAGGATGCTGTGGGGCTGAAAAATCTCTCAGTGCAAGTCTCAGAAGCTAACCTAATTGGTACTGGAACAAGTGAACACTGGGTCGATGATGAAGGGCCCCAGCCAAAGAAAGTAAAGGCTGAAGATGAGGCCTTACTCTCAGAAGAAGATGACCCCATTGATCGACGGCCATGGACACAGCAGCACCTTGAAGCTGCAGACATCCGTAGGACACCATCGCTGGCTCTCACCCCTCCTCAGGCAGAGCAGGAGGTGGATGTGTTAGATGTGAATGTCCGTGGCCCAGATGGCTGCACCCCATTGATGTTGGCTTCTCTCCGAGGAGGCAGCTCAGATTTGAGTGATGAAGATGAAGATGCAGAGGACTCTTCTGCTAACATCATCACAGACTTGGTCTACCAGGGTGCCAGCCTCCAGGCCCAGACAGACCGGACTGGTGAGATGGCCCTGCACCTTGCAGCCCGCTACTCACGGGCTGATGCTGCCAAGCGTCTCCTGGATGCAGGTGCAGATGCCAATGCCCAGGACAACATGGGCCGCTGTCCACTCCATGCTGCAGTGGCAGCTGATGCCCAAGGTGTCTTCCAGATTCTGATTCGCAACCGAGTAACTGATCTAGATGCCAGGATGAATGATGGTACTACACCCCTGATCCTGGCTGCCCGCCTGGCTGTGGAGGGAATGGTGGCAGAACTGATCAACTGCCAAGCGGATGTGAATGCAGTGGATGACCATGGAAAATCTGCTCTTCACTGGGCAGCTGCTGTCAATAATGTGGAGGCAACTCTTTTGTTGTTGAAAAATGGGGCCAACCGAGACATGCAGGACAACAAGGAAGAGACACCTCTGTTTCTTGCTGCCCGGGAGGGGAGCTATGAAGCAGCCAAGATCCTGTTAGACCATTTTGCCAATCGAGACATCACAGACCATATGGATCGTCTTCCCCGGGATGTGGCTCGGGATCGCATGCACCATGACATTGTGCGCCTTCTGGATGAATACAATGTGACCCCAAGCCCTCCAGGCACCGTGTTGACTTCTGCTCTCTCACCTGTCATCTGTGGGCCCAACAGATCTTTCCTCAGCCTGAAGCACACCCCAATGGGCAAGAAGTCTAGACGGCCCAGTGCCAAGAGTACCATGCCTACTAGCCTCCCTAACCTTGCCAAGGAGGCAAAGGATGCCAAGGGTAGTAGGAGGAAGAAGTCTCTGAGTGAGAAGGTCCAACTGTCTGAGAGTTCAGTAACTTTATCCCCTGTTGATTCCCTAGAATCTCCTCACACGTATGTTTCCGACACCACATCCTCTCCAATGATTACATCCCCTGGGATCTTACAGGCCTCACCCAACCCTATGTTGGCCACTGCCGCCCCTCCTGCCCCAGTCCATGCCCAGCATGCACTATCTTTTTCTAACCTTCATGAAATGCAGCCTTTGGCACATGGGGCCAGCACTGTGCTTCCCTCAGTGAGCCAGTTGCTATCCCACCACCACATTGTGTCTCCAGGCAGTGGCAGTGCTGGAAGCTTGAGTAGGCTCCATCCAGTCCCAGTCCCAGCAGATTGGATGAACCGCATGGAGGTGAATGAGACCCAGTACAATGAGATGTTTGGTATGGTCCTGGCTCCAGCTGAGGGCACCCATCCTGGCATAGCTCCCCAGAGCAGGCCACCTGAAGGGAAGCACATAACCACCCCTCGGGAGCCCTTGCCCCCCATTGTGACTTTCCAGCTCATCCCTAAAGGCAGTATTGCCCAACCAGCGGGGGCTCCCCAGCCTCAGTCCACCTGCCCTCCAGCTGTTGCGGGCCCCCTGCCCACCATGTACCAGATTCCAGAAATGGCCCGTTTGCCCAGTGTGGCTTTCCCCACTGCCATGATGCCCCAGCAGGACGGGCAGGTAGCTCAGACCATTCTCCCAGCCTATCATCCTTTCCCAGCCTCTGTGGGCAAGTACCCCACACCCCCTTCACAGCACAGTTATGCTTCCTCAAATGCTGCTGAGCGAACACCCAGTCACAGTGGTCACCTCCAGGGTGAGCATCCCTACCTGACACCATCCCCAGAGTCTCCTGACCAGTGGTCAAGTTCATCACCCCACTCTGCTTCTGACTGGTCAGATGTGACCACCAGCCCTACCCCTGGGGGTGCTGGAGGAGGTCAGCGGGGACCTGGGACACACATGTCTGAGCCACCACACAACAACATGCAGGTTTATGCGTGAGAGAGTCCACCTCCAGTGTAGAGACATAACTGACTTTTGTAAATGCTGCTGAGGAACAAATGAAGGTCATCCGGGAGAGAAATGAAGAAATCTCTGGAGCCAGCTTCTAGAGGTAGGAAAGAGAAGATGTTCTTATTCAGATAATGCAAGAGAAGCAATTCGTCAGTTTCACTGGGTATCTGCAAGGCTTATTGATTATTCTAATCTAATAAGACAAGTTTGTGGAAATGCAAGATGAATACAAGCCTTGGGTCCATGTTTACTCTCTTCTATTTGGAGAATAAGATGGATGCTTATTGAAGCCCAGACATTCTTGCAGCTTGGACTGCATTTTAAGCCCTGCAGGCTTCTGCCATATCCATGAGAAGATTCTACACTAGCGTCCTGTTGGGAATTATGCCCTGGAATTCTGCCTGAATTGACCTACGCATCTCCTCCTCCTTGGACATTCTTTTGTCTTCATTTGGTGCTTTTGGTTTTGCACCTCTCCGTGATTGTAGCCCTACCAGCATGTTATAGGGCAAGACCTTTGTGCTTTTGATCATTCTGGCCCATGAAAGCAACTTTGGTCTCCTTTCCCCTCCTGTCTTCCCGGTATCCCTTGGAGTCTCACAAGGTTTACTTTGGTATGGTTCTCAGCACAAACCTTTCAAGTATGTTGTTTCTTTGGAAAATGGACATACTGTATTGTGTTCTCCTGCATATATCATTCCTGGAGAGAGAAGGGGAGAAGAATACTTTTCTTCAACAAATTTTGGGGGCAGGAGATCCCTTCAAGAGGCTGCACCTTAATTTTTCTTGTCTGTGTGCAGGTCTTCATATAAACTTTACCAGGAAGAAGGGTGTGAGTTTGTTGTTTTTCTGTGTATGGGCCTGGTCAGTGTAAAGTTTTATCCTTGATAGTCTAGTTACTATGACCCTCCCCACTTTTTTAAAACCAGAAAAAGGTTTGGAATGTTGGAATGACCAAGAGACAAGTTAACTCGTGCAAGAGCCAGTTACCCACCCACAGGTCCCCCTACTTCCTGCCAAGCATTCCATTGACTGCCTGTATGGAACACATTTGTCCCAGATCTGAGCATTCTAGGCCTGTTTCACTCACTCACCCAGCATATGAAACTAGTCTTAACTGTTGAGCCTTTCCTTTCATATCCACAGAAGACACTGTCTCAAATGTTGTACCCTTGCCATTTAGGACTGAACTTTCCTTAGCCCAAGGGACCCAGTGACAGTTGTCTTCCGTTTGTCAGATGATCAGTCTCTACTGATTATCTTGCTGCTTAAAGGCCTGCTCACCAATCTTTCTTTCACACCGTGTGGTCCGTGTTACTGGTATACCCAGTATGTTCTCACTGAAGACATGGACTTTATATGTTCAAGTGCAGGAATTGGAAAGTTGGACTTGTTTTCTATGATCCAAAACAGCCCTATAAGAAGGTTGGAAAAGGAGGAACTATATAGCAGCCTTTGCTATTTTCTGCTACCATTTCTTTTCCTCTGAAGCGGCCATGACATTCCCTTTGGCAACTAACGTAGAAACTCAACAGAACATTTTCCTTTCCTAGAGTCACCTTTTAGATGATAATGGACAACTATAGACTTGCTCATTGTTCAGACTGATTGCCCCTCACCTGAATCCACTCTCTGTATTCATGCTCTTGGCAATTTCTTTGACTTTCTTTTAAGGGCAGAAGCATTTTAGTTAATTGTAGATAAAGAATAGTTTTCTTCCTCTTCTCCTTGGGCCAGTTAATAATTGGTCCATGGCTACACTGCAACTTCCGTCCAGTGCTGTGATGCCCATGACACCTGCAAAATAAGTTCTGCCTGGGCATTTTGTAGATATTAACAGGTGAATTCCCGACTCTTTTGGTTTGAATGACAGTTCTCATTCCTTCTATGGCTGCAAGTATGCATCAGTGCTTCCCACTTACCTGATTTGTCTGTCGGTGGCCCCATATGGAAACCCTGCGTGTCTGTTGGCATAATAGTTTACAAATGGTTTTTTCAGTCCTATCCAAATTTATTGAACCAACAAAAATAATTACTTCTGCCCTGAGATAAGCAGATTAAGTTTGTTCATTCTCTGCTTTATTCTCTCCATGTGGCAACATTCTGTCAGCCTCTTTCATAGTGTGCAAACATTTTATCATTCTAAATGGTGACTCTCTGCCCTTGGACCCATTTATTATTCACAGATGGGGAGAACCTATCTGCATGGACCTCTGTGGACCACAGCGTACCTGCCCCTTTCTGCCCTCCTGCTCCAGCCCCACTTCTGAAAGTATCAGCTACTGATCCAGCCACTGGATATTTTATATCCTCCCTTTTCCTTAAGCACAATGTCAGACCAAATTGCTTGTTTCTTTTTCTTGGACTACTTTAATTTGGATCCTTTGGGTTTGGAGAAAGGGAATGTGAAAGCTGTCATTACAGACAACAGGTTTCAGTGATGAGGAGGACAACACTGCCTTTCAAACTTTTTACTGATCTCTTAGATTTTAAGAACTCTTGAATTGTGTGGTATCTAATAAAAGGGAAGGTAAGATGGATAATCACTTTCTCATTTGGGTTCTGAATTGGAGACTCAGTTTTTATGAGACACATCTTTTATGCCATGTATAGATCCTCCCCTGCTATTTTTGGTTTATTTTTATTGTTATAAATGCTTTCTTTCTTTGACTCCTCTTCTGCCTGCCTTTGGGGATAGGTTTTTTTGTTTGTTTATTTGCTTCCTCTGTTTTGTTTTAAGCATCATTTTCTTATGTGAGGTGGGGAAGGGAAAGGTATGAGGGAAAGAGAGTCTGAGAATTAAAATATTTTAGTATAAGCAATTGGCTGTGATGCTCAAATCCATTGCATCCTCTTATTGAATTTGCCAATTTGTAATTTTTGCATAATAAAGAACCAAAGGTGTAATGTTTTGTTGAGAGGTGGTTTAGGGATTTTGGCCCTAACCAATACATTGAATGTATGATGACTATTTGGGAGGACACATTTATGTACCCAGAGGCCCCCACTAATAAGTGGTACTATGGTTACTTCCTTGTGTACATTTCTCTTAAAAGTGATATTATATCTGTTTGTATGAGAAACCCAGTAACCAATAAAATGACCGCATATTCCTGACTAAACGTAGTAAGGAAAATGCACACTTTGTTTTTACTTTTCCGTTTCATTCTAAAGGTAGTTAAGATGAAATTTATATGAAAGCATTTTTATCACAAAATAAAAAAGGTTTGCCAAGCTCAGTGGTGTTGTATTTTTTATTTTCCAATACTGCATCCATGGCCTGGCAGTGTTACCTCATGATGTCATAATTTGCTGAGAGAGCAAATTTTCTTTTCTTTCTGAATCCCACAAAGCCTAGCACCAAACTTCTTTTTTTCTTCCTTTAATTAGATCATAAATAAATGATCCTGGGGAAAAAGCATCTGTCAAATAGGAAACATCACAAAACTGAGCACTCTTCTGTGCACTAGCCATAGCTGGTGACAAACAGATGGTTGCTCAGGGACAAGGTGCCTTCCAATGGAAATGCGAAGTAGTTGCTATAGCAAGAATTGGGAACTGGGATATAAGTCATAATATTAATTATGCTGTTATGTAAATGATTGGTTTGTAACATTCCTTAAGTGAAATTTGTGTAGAACTTAATATACAGGATTATAAAATAATATTTTGTGTATAAATTTGTTATAAGTTCACATTCATACATTTATTTATAAAGTCAGTGAGATATTTGAACATGAA
SEQ ID NO:704 NOTCH2之外顯子1的轉譯多肽序列
MPALRPALLWALLALWLCCAAPAH
SEQ ID NO:705 NOTCH2之外顯子2的轉譯多肽序列
LQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYC
SEQ ID NO:706 NOTCH2之外顯子3的轉譯多肽序列
CPEGFLGEYCQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECTCQVGFT
SEQ ID NO:707 NOTCH2之外顯子4的轉譯多肽序列
KECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLP
SEQ ID NO:708 NOTCH2之外顯子5的轉譯多肽序列
FEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWT
SEQ ID NO:709 NOTCH2之外顯子6的轉譯多肽序列
QFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKA
SEQ ID NO:710 NOTCH2之外顯子7的轉譯多肽序列
LLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAM
SEQ ID NO:711 NOTCH2之外顯子8-34的轉譯多肽序列
NSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCFDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSPRDCESGCASSPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQEQEVAGSKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLTPERTQLLYLLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDAVGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHLEAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFLSLKHTPMGKKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQPLAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQYNEMFGMVLAPAEGTHPGIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPLPTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMSEPPHNNMQVYA
SEQ ID NO:712 NOTCH2之全蛋白質序列
MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCFDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSPRDCESGCASSPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQEQEVAGSKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLTPERTQLLYLLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDAVGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHLEAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFLSLKHTPMGKKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQPLAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQYNEMFGMVLAPAEGTHPGIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPLPTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMSEPPHNNMQVYA
SEQ ID NO:713 NOTCH2之全部外顯子1-6按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:714 NOTCH2之全部外顯子1-6按順序排列的轉譯多肽序列
CD74 序列資訊SEQ ID NO:715 來自CD74-NRG1融合物5’處之CD74外顯子2的序列
AGGGCCGGCTGGACAAACTGACAGTCACCTCCCAGAACCTGCAGCTGGAGAACCTGCGCATGAAGCTTCCCAAGC
SEQ ID NO:716 CD74-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA
SEQ ID NO:717 CD74-NRG1多核苷酸序列
AGGGCCGGCTGGACAAACTGACAGTCACCTCCCAGAACCTGCAGCTGGAGAACCTGCGCATGAAGCTTCCCAAGCCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA
SEQ ID NO:718 CD74-NRG1多肽序列
GRLDKLTVTSQNLQLENLRMKLPKPLPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCE
SEQ ID NO:719 CD74之外顯子1
ATCCTGCCCCGCAAAAGGCAGCTTCACCAAAGTGGGGTATTTCCAGCCTTTGTAGCTTTCACTTCCACATCTACCAAGTGGGCGGAGTGGCCTTCTGTGGACGAATCAGATTCCTCTCCAGCACCGACTTTAAGAGGCGAGCCGGGGGGTCAGGGTCCCAGATGCACAGGAGGAGAAGCAGGAGCTGTCGGGAAGATCAGAAGCCAGTCATGGATGACCAGCGCGACCTTATCTCCAACAATGAGCAACTGCCCATGCTGGGCCGGCGCCCTGGGGCCCCGGAGAG
SEQ ID NO:720 CD74之外顯子2
CAAGTGCAGCCGCGGAGCCCTGTACACAGGCTTTTCCATCCTGGTGACTCTGCTCCTCGCTGGCCAGGCCACCACCGCCTACTTCCTGTACCAGCAGCAGGGCCGGCTGGACAAACTGACAGTCACCTCCCAGAACCTGCAGCTGGAGAACCTGCGCATGAAGCTTCCCAAGC
SEQ ID NO:721 CD74之外顯子3
CTCCCAAGCCTGTGAGCAAGATGCGCATGGCCACCCCGCTGCTGATGCAGGCGCTGCCCATGGGAGCCCTGCCCCAGGGG
SEQ ID NO:722 CD74之外顯子4
CCCATGCAGAATGCCACCAAGTATGGCAACATGACAGAGGACCATGTGATGCACCTGCTCCAG
SEQ ID NO:723 CD74之外顯子5
AATGCTGACCCCCTGAAGGTGTACCCGCCACTGAAGGGGAGCTTCCCGGAGAACCTGAGACACCTTAAGAACACCATGGAGACCATAGACTGGAAG
SEQ ID NO:724 CD74之外顯子6
GTCTTTGAGAGCTGGATGCACCATTGGCTCCTGTTTGAAATGAGCAGGCACTCCTTGGAGCAAAAGCCCACTGACGCTCCACCGAAAG
SEQ ID NO:725 CD74之外顯子7
TACTGACCAAGTGCCAGGAAGAGGTCAGCCACATCCCTGCTGTCCACCCGGGTTCATTCAGGCCCAAGTGCGACGAGAACGGCAACTATCTGCCACTCCAGTGCTATGGGAGCATCGGCTACTGCTGGTGTGTCTTCCCCAACGGCACGGAGGTCCCCAACACCAGAAGCCGCGGGCACCATAACTGCAGTG
SEQ ID NO:726 CD74之外顯子8
AGTCACTGGAACTGGAGGACCCGTCTTCTGGGCTGGGTGTGACCAAGCAGGATCTGGGCCCAG
SEQ ID NO:727 CD74之外顯子9
TCCCCATGTGAGAGCAGCAGAGGCGGTCTTCAACATCCTGCCAGCCCCACACAGCTACAGCTTTCTTGCTCCCTTCAGCCCCCAGCCCCTCCCCCATCTCCCACCCTGTACCTCATCCCATGAGACCCTGGTGCCTGGCTCTTTCGTCACCCTTGGACAAGACAAACCAAGTCGGAACAGCAGATAACAATGCAGCAAGGCCCTGCTGCCCAATCTCCATCTGTCAACAGGGGCGTGAGGTCCCAGGAAGTGGCCAAAAGCTAGACAGATCCCCGTTCCTGACATCACAGCAGCCTCCAACACAAGGCTCCAAGACCTAGGCTCATGGACGAGATGGGAAGGCACAGGGAGAAGGGATAACCCTACACCCAGACCCCAGGCTGGACATGCTGACTGTCCTCTCCCCTCCAGCCTTTGGCCTTGGCTTTTCTAGCCTATTTACCTGCAGGCTGAGCCACTCTCTTCCCTTTCCCCAGCATCACTCCCCAAGGAAGAGCCAATGTTTTCCACCCATAATCCTTTCTGCCGACCCCTAGTTCCCTCTGCTCAGCCAAGCTTGTTATCAGCTTTCAGGGCCATGGTTCACATTAGAATAAAAGGTAGTAATTAGAA
SEQ ID NO:728 CD74之全mRNA多核苷酸序列
ATCCTGCCCCGCAAAAGGCAGCTTCACCAAAGTGGGGTATTTCCAGCCTTTGTAGCTTTCACTTCCACATCTACCAAGTGGGCGGAGTGGCCTTCTGTGGACGAATCAGATTCCTCTCCAGCACCGACTTTAAGAGGCGAGCCGGGGGGTCAGGGTCCCAGATGCACAGGAGGAGAAGCAGGAGCTGTCGGGAAGATCAGAAGCCAGTCATGGATGACCAGCGCGACCTTATCTCCAACAATGAGCAACTGCCCATGCTGGGCCGGCGCCCTGGGGCCCCGGAGAGCAAGTGCAGCCGCGGAGCCCTGTACACAGGCTTTTCCATCCTGGTGACTCTGCTCCTCGCTGGCCAGGCCACCACCGCCTACTTCCTGTACCAGCAGCAGGGCCGGCTGGACAAACTGACAGTCACCTCCCAGAACCTGCAGCTGGAGAACCTGCGCATGAAGCTTCCCAAGCCTCCCAAGCCTGTGAGCAAGATGCGCATGGCCACCCCGCTGCTGATGCAGGCGCTGCCCATGGGAGCCCTGCCCCAGGGGCCCATGCAGAATGCCACCAAGTATGGCAACATGACAGAGGACCATGTGATGCACCTGCTCCAGAATGCTGACCCCCTGAAGGTGTACCCGCCACTGAAGGGGAGCTTCCCGGAGAACCTGAGACACCTTAAGAACACCATGGAGACCATAGACTGGAAGGTCTTTGAGAGCTGGATGCACCATTGGCTCCTGTTTGAAATGAGCAGGCACTCCTTGGAGCAAAAGCCCACTGACGCTCCACCGAAAGTACTGACCAAGTGCCAGGAAGAGGTCAGCCACATCCCTGCTGTCCACCCGGGTTCATTCAGGCCCAAGTGCGACGAGAACGGCAACTATCTGCCACTCCAGTGCTATGGGAGCATCGGCTACTGCTGGTGTGTCTTCCCCAACGGCACGGAGGTCCCCAACACCAGAAGCCGCGGGCACCATAACTGCAGTGAGTCACTGGAACTGGAGGACCCGTCTTCTGGGCTGGGTGTGACCAAGCAGGATCTGGGCCCAGTCCCCATGTGAGAGCAGCAGAGGCGGTCTTCAACATCCTGCCAGCCCCACACAGCTACAGCTTTCTTGCTCCCTTCAGCCCCCAGCCCCTCCCCCATCTCCCACCCTGTACCTCATCCCATGAGACCCTGGTGCCTGGCTCTTTCGTCACCCTTGGACAAGACAAACCAAGTCGGAACAGCAGATAACAATGCAGCAAGGCCCTGCTGCCCAATCTCCATCTGTCAACAGGGGCGTGAGGTCCCAGGAAGTGGCCAAAAGCTAGACAGATCCCCGTTCCTGACATCACAGCAGCCTCCAACACAAGGCTCCAAGACCTAGGCTCATGGACGAGATGGGAAGGCACAGGGAGAAGGGATAACCCTACACCCAGACCCCAGGCTGGACATGCTGACTGTCCTCTCCCCTCCAGCCTTTGGCCTTGGCTTTTCTAGCCTATTTACCTGCAGGCTGAGCCACTCTCTTCCCTTTCCCCAGCATCACTCCCCAAGGAAGAGCCAATGTTTTCCACCCATAATCCTTTCTGCCGACCCCTAGTTCCCTCTGCTCAGCCAAGCTTGTTATCAGCTTTCAGGGCCATGGTTCACATTAGAATAAAAGGTAGTAATTAGAA
SEQ ID NO:729 CD74之外顯子1的轉譯多肽序列
MHRRRSRSCREDQKPVMDDQRDLISNNEQLPMLGRRPGAPE
SEQ ID NO:730 CD74之外顯子2的轉譯多肽序列
KCSRGALYTGFSILVTLLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTVTSQNLQLENLRMKLPK
SEQ ID NO:731 CD74之外顯子3的轉譯多肽序列
PKPVSKMRMATPLLMQALPMGALPQG
SEQ ID NO:732 CD74之外顯子4的轉譯多肽序列
PMQNATKYGNMTEDHVMHLLQ
SEQ ID NO:733 CD74之外顯子5的轉譯多肽序列
NADPLKVYPPLKGSFPENLRHLKNTMETIDWK
SEQ ID NO:734 CD74之外顯子6的轉譯多肽序列
VFESWMHHWLLFEMSRHSLEQKPTDAPPK
SEQ ID NO:735 CD74之外顯子7的轉譯多肽序列
LTKCQEEVSHIPAVHPGSFRPKCDENGNYLPLQCYGSIGYCWCVFPNGTEVPNTRSRGHHNCS
SEQ ID NO:736 CD74之外顯子8的轉譯多肽序列
SLELEDPSSGLGVTKQDLGP
SEQ ID NO:737 CD74之外顯子9的轉譯多肽序列
PM
SEQ ID NO:738 CD74之全蛋白質序列
MHRRRSRSCREDQKPVMDDQRDLISNNEQLPMLGRRPGAPESKCSRGALYTGFSILVTLLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTVTSQNLQLENLRMKLPKPPKPVSKMRMATPLLMQALPMGALPQGPMQNATKYGNMTEDHVMHLLQNADPLKVYPPLKGSFPENLRHLKNTMETIDWKVFESWMHHWLLFEMSRHSLEQKPTDAPPKVLTKCQEEVSHIPAVHPGSFRPKCDENGNYLPLQCYGSIGYCWCVFPNGTEVPNTRSRGHHNCSESLELEDPSSGLGVTKQDLGPVPM
SEQ ID NO:739 CD74之全部外顯子1-2按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:740 CD74之全部外顯子1-2按順序排列的轉譯多肽序列
SDC4 序列資訊SEQ ID NO:741 來自SDC4-NRG1融合物5’處之SDC4外顯子2的序列
TACCAGACGATGAGGATGTAGTGGGGCCCGGGCAGGAATCTGATGACTTTGAGCTGTCTGGCTCTGGAGATCTGG
SEQ ID NO:742 SDC4-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA
SEQ ID NO:743 SDC4-NRG1多核苷酸序列
TACCAGACGATGAGGATGTAGTGGGGCCCGGGCAGGAATCTGATGACTTTGAGCTGTCTGGCTCTGGAGATCTGGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA
SEQ ID NO:744 SDC4-NRG1多肽序列
PDDEDVVGPGQESDDFELSGSGDLALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCE
SEQ ID NO:745 SDC4之外顯子1
ACTCGCCGCAGCCTGCGCGCCTTCTCCAGTCCGCGGTGCCATGGCCCCCGCCCGTCTGTTCGCGCTGCTGCTGTTCTTCGTAGGCGGAGTCGCCGAGTCG
SEQ ID NO:746 SDC4之外顯子2
ATCCGAGAGACTGAGGTCATCGACCCCCAGGACCTCCTAGAAGGCCGATACTTCTCCGGAGCCCTACCAGACGATGAGGATGTAGTGGGGCCCGGGCAGGAATCTGATGACTTTGAGCTGTCTGGCTCTGGAGATCTGG
SEQ ID NO:747 SDC4之外顯子3
ATGACTTGGAAGACTCCATGATCGGCCCTGAAGTTGTCCATCCCTTG
SEQ ID NO:748 SDC4之外顯子4
GTGCCTCTAGATAACCATATCCCTGAGAGGGCAGGGTCTGGGAGCCAAGTCCCCACCGAACCCAAGAAACTAGAGGAGAATGAGGTTATCCCCAAGAGAATCTCACCCGTTGAAGAGAGTGAGGATGTGTCCAACAAGGTGTCAATGTCCAGCACTGTGCAGGGCAGCAACATCTTTGAGAGAACGGAGGTCCTGGCAG
SEQ ID NO:749 SDC4之外顯子5
CTCTGATTGTGGGTGGCATCGTGGGCATCCTCTTTGCCGTCTTCCTGATCCTACTGCTCATGTACCGTATGAAGAAGAAGGATGAAGGCAGCTATGACCTGGGCAAGAAACCCATCTACAAGAAAGCCCCCACCAATGAGTTCTACGCGTGAAGCTTGCTTGTGGGCACTGGCTTGGACTTTAGCGGGGAGGGAAGCCAGGGGATTTTGAAGGGTGGACATTAGGGTAGGGTGAGGTCAACCTAATACTGACTTGTCAGTATCTCCAGCTCTGATTACCTTTGAAGTGTTCAGAAGAGACATTGTCTTCTACTGTTCTGCCAGGTTCTTCTTGAGCTTTGGGCCTCAGTTGCCCTGGCAGAAAAATGGATTCAACTTGGCCTTTCTGAAGGCAAGACTGGGATTGGATCACTTCTTAAACTTCCAGTTAAGAATCTAGGTCCGCCCTCAAGCCCATACTGACCATGCCTCATCCAGAGCTCCTCTGAAGCCAGGGGGCTAACGGATGTTGTGTGGAGTCCTGGCTGGAGGTCCTCCCCCAGTGGCCTTCCTCCCTTCCTTTCACAGCCGGTCTCTCTGCCAGGAAATGGGGGAAGGAACTAGAACCACCTGCACCTTGAGATGTTTCTGTAAATGGGTACTTGTGATCACACTACGGGAATCTCTGTGGTATATACCTGGGGCCATTCTAGGCTCTTTCAAGTGACTTTTGGAAATCAACCTTTTTTATTTGGGGGGGAGGATGGGGAAAAGAGCTGAGAGTTTATGCTGAAATGGATTTATAGAATATTTGTAAATCTATTTTTAGTGTTTGTTCGTTTTTTTAACTGTTCATTCCTTTGTGCAGAGTGTATATCTCTGCCTGGGCAAGAGTGTGGAGGTGCCGAGGTGTCTTCATTCTCTCGCACATTTCCACAGCACCTGCTAAGTTTGTATTTAATGGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTGTTTCTTGAAAATGAGAGAAGAGCCGGAGAGATGATTTTTATTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTATTTATAGCTTTAGATAGGGCCTCCCTTCCCCTCTTCTTTCTTTGTTCTCTTTCATTAAACCCCTTCCCCAGTTTTTTTTTTATACTTTAAACCCCGCTCCTCATGGCCTTGGCCCTTTCTGAAGCTGCTTCCTCTTATAAAATAGCTTTTGCCGAAACATAGTTTTTTTTTAGCAGATCCCAAAATATAATGAAGGGGATGGTGGGATATTTGTGTCTGTGTTCTTATAATATATTATTATTCTTCCTTGGTTCTAGAAAAATAGATAAATATATTTTTTTCAGGAAATAGTGTGGTGTTTCCAGTTTGATGTTGCTGGGTGGTTGAGTGAGTGAATTTTCATGTGGCTGGGTGGGTTTTTGCCTTTTTCTCTTGCCCTGTTCCTGGTGCCTTCTGATGGGGCTGGAATAGTTGAGGTGGATGGTTCTACCCTTTCTGCCTTCTGTTTGGGACCCAGCTGGTGTTCTTTGGTTTGCTTTCTTCAGGCTCTAGGGCTGTGCTATCCAATACAGTAACCACATGCGGCTGTTTAAAGTTAAGCCAATTAAAATCACATAAGATTAAAAATTCCTTCCTCAGTTGCACTAACCACGTTTCTAGAGGCGTCACTGTATGTAGTTCATGGCTACTGTACTGACAGCGAGAGCATGTCCATCTGTTGGACAGCACTATTCTAGAGAACTAAACTGGCTTAACGAGTCACAGCCTCAGCTGTGCTGGGACGACCCTTGTCTCCCTGGGTAGGGGGGGGGGAATGGGGGAGGGCTGATGAGGCCCCAGCTGGGGCCTGTTGTCTGGGACCCTCCCTCTCCTGAGAGGGGAGGCCTGGTGGCTTAGCCTGGGCAGGTCGTGTCTCCTCCTGACCCCAGTGGCTGCGGTGAGGGGAACCACCCTCCCTTGCTGCACCAGTGGCCATTAGCTCCCGTCACCACTGCAACCCAGGGTCCCAGCTGGCTGGGTCCTCTTCTGCCCCCAGTGCCCTTCCCCTTGGGCTGTGTTGGAGTGAGCACCTCCTCTGTAGGCACCTCTCACACTGTTGTCTGTTACTGATTTTTTTTGATAAAAAGATAATAAAACCTGGTACTTTCTAAA
SEQ ID NO:750 SDC4之全mRNA多核苷酸序列
ACTCGCCGCAGCCTGCGCGCCTTCTCCAGTCCGCGGTGCCATGGCCCCCGCCCGTCTGTTCGCGCTGCTGCTGTTCTTCGTAGGCGGAGTCGCCGAGTCGATCCGAGAGACTGAGGTCATCGACCCCCAGGACCTCCTAGAAGGCCGATACTTCTCCGGAGCCCTACCAGACGATGAGGATGTAGTGGGGCCCGGGCAGGAATCTGATGACTTTGAGCTGTCTGGCTCTGGAGATCTGGATGACTTGGAAGACTCCATGATCGGCCCTGAAGTTGTCCATCCCTTGGTGCCTCTAGATAACCATATCCCTGAGAGGGCAGGGTCTGGGAGCCAAGTCCCCACCGAACCCAAGAAACTAGAGGAGAATGAGGTTATCCCCAAGAGAATCTCACCCGTTGAAGAGAGTGAGGATGTGTCCAACAAGGTGTCAATGTCCAGCACTGTGCAGGGCAGCAACATCTTTGAGAGAACGGAGGTCCTGGCAGCTCTGATTGTGGGTGGCATCGTGGGCATCCTCTTTGCCGTCTTCCTGATCCTACTGCTCATGTACCGTATGAAGAAGAAGGATGAAGGCAGCTATGACCTGGGCAAGAAACCCATCTACAAGAAAGCCCCCACCAATGAGTTCTACGCGTGAAGCTTGCTTGTGGGCACTGGCTTGGACTTTAGCGGGGAGGGAAGCCAGGGGATTTTGAAGGGTGGACATTAGGGTAGGGTGAGGTCAACCTAATACTGACTTGTCAGTATCTCCAGCTCTGATTACCTTTGAAGTGTTCAGAAGAGACATTGTCTTCTACTGTTCTGCCAGGTTCTTCTTGAGCTTTGGGCCTCAGTTGCCCTGGCAGAAAAATGGATTCAACTTGGCCTTTCTGAAGGCAAGACTGGGATTGGATCACTTCTTAAACTTCCAGTTAAGAATCTAGGTCCGCCCTCAAGCCCATACTGACCATGCCTCATCCAGAGCTCCTCTGAAGCCAGGGGGCTAACGGATGTTGTGTGGAGTCCTGGCTGGAGGTCCTCCCCCAGTGGCCTTCCTCCCTTCCTTTCACAGCCGGTCTCTCTGCCAGGAAATGGGGGAAGGAACTAGAACCACCTGCACCTTGAGATGTTTCTGTAAATGGGTACTTGTGATCACACTACGGGAATCTCTGTGGTATATACCTGGGGCCATTCTAGGCTCTTTCAAGTGACTTTTGGAAATCAACCTTTTTTATTTGGGGGGGAGGATGGGGAAAAGAGCTGAGAGTTTATGCTGAAATGGATTTATAGAATATTTGTAAATCTATTTTTAGTGTTTGTTCGTTTTTTTAACTGTTCATTCCTTTGTGCAGAGTGTATATCTCTGCCTGGGCAAGAGTGTGGAGGTGCCGAGGTGTCTTCATTCTCTCGCACATTTCCACAGCACCTGCTAAGTTTGTATTTAATGGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTGTTTCTTGAAAATGAGAGAAGAGCCGGAGAGATGATTTTTATTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTATTTATAGCTTTAGATAGGGCCTCCCTTCCCCTCTTCTTTCTTTGTTCTCTTTCATTAAACCCCTTCCCCAGTTTTTTTTTTATACTTTAAACCCCGCTCCTCATGGCCTTGGCCCTTTCTGAAGCTGCTTCCTCTTATAAAATAGCTTTTGCCGAAACATAGTTTTTTTTTAGCAGATCCCAAAATATAATGAAGGGGATGGTGGGATATTTGTGTCTGTGTTCTTATAATATATTATTATTCTTCCTTGGTTCTAGAAAAATAGATAAATATATTTTTTTCAGGAAATAGTGTGGTGTTTCCAGTTTGATGTTGCTGGGTGGTTGAGTGAGTGAATTTTCATGTGGCTGGGTGGGTTTTTGCCTTTTTCTCTTGCCCTGTTCCTGGTGCCTTCTGATGGGGCTGGAATAGTTGAGGTGGATGGTTCTACCCTTTCTGCCTTCTGTTTGGGACCCAGCTGGTGTTCTTTGGTTTGCTTTCTTCAGGCTCTAGGGCTGTGCTATCCAATACAGTAACCACATGCGGCTGTTTAAAGTTAAGCCAATTAAAATCACATAAGATTAAAAATTCCTTCCTCAGTTGCACTAACCACGTTTCTAGAGGCGTCACTGTATGTAGTTCATGGCTACTGTACTGACAGCGAGAGCATGTCCATCTGTTGGACAGCACTATTCTAGAGAACTAAACTGGCTTAACGAGTCACAGCCTCAGCTGTGCTGGGACGACCCTTGTCTCCCTGGGTAGGGGGGGGGGAATGGGGGAGGGCTGATGAGGCCCCAGCTGGGGCCTGTTGTCTGGGACCCTCCCTCTCCTGAGAGGGGAGGCCTGGTGGCTTAGCCTGGGCAGGTCGTGTCTCCTCCTGACCCCAGTGGCTGCGGTGAGGGGAACCACCCTCCCTTGCTGCACCAGTGGCCATTAGCTCCCGTCACCACTGCAACCCAGGGTCCCAGCTGGCTGGGTCCTCTTCTGCCCCCAGTGCCCTTCCCCTTGGGCTGTGTTGGAGTGAGCACCTCCTCTGTAGGCACCTCTCACACTGTTGTCTGTTACTGATTTTTTTTGATAAAAAGATAATAAAACCTGGTACTTTCTAAA
SEQ ID NO:751 SDC4之外顯子1的轉譯多肽序列
MAPARLFALLLFFVGGVAES
SEQ ID NO:752 SDC4之外顯子2的轉譯多肽序列
IRETEVIDPQDLLEGRYFSGALPDDEDVVGPGQESDDFELSGSGDL
SEQ ID NO:753 SDC4之外顯子3的轉譯多肽序列
DLEDSMIGPEVVHPL
SEQ ID NO:754 SDC4之外顯子4的轉譯多肽序列
VPLDNHIPERAGSGSQVPTEPKKLEENEVIPKRISPVEESEDVSNKVSMSSTVQGSNIFERTEVLA
SEQ ID NO:755 SDC4之外顯子5的轉譯多肽序列
LIVGGIVGILFAVFLILLLMYRMKKKDEGSYDLGKKPIYKKAPTNEFYA
SEQ ID NO:756 SDC4之全蛋白質序列
MAPARLFALLLFFVGGVAESIRETEVIDPQDLLEGRYFSGALPDDEDVVGPGQESDDFELSGSGDLDDLEDSMIGPEVVHPLVPLDNHIPERAGSGSQVPTEPKKLEENEVIPKRISPVEESEDVSNKVSMSSTVQGSNIFERTEVLAALIVGGIVGILFAVFLILLLMYRMKKKDEGSYDLGKKPIYKKAPTNEFYA
SEQ ID NO:757 SDC4之全部外顯子1-2按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:758 SDC4之全部外顯子1-2按順序排列的轉譯多肽序列
CD44 (2) 序列資訊SEQ ID NO:759 來自CD44-NRG1融合物5’處之CD44外顯子5的序列
TTTCTACTGTACACCCCATCCCAGACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTACCA
SEQ ID NO:760 CD44-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG
SEQ ID NO:761 CD44-NRG1多核苷酸序列
TTTCTACTGTACACCCCATCCCAGACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTACCACTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG
SEQ ID NO:762 CD44-NRG1多肽序列
STVHPIPDEDSPWITDSTDRIPATTTSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVN
SLC4A4 序列資訊SEQ ID NO:763 來自SLC4A4-NRG1融合物5’處之SLC4A4外顯子14的序列
ACTACCCCATCAACTCCAACTTCAAAGTGGGCTACAACACTCTCTTTTCCTGTACCTGTGTGCCACCTGACCCAG
SEQ ID NO:764 SLC4A4-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG
SEQ ID NO:765 SCL4A4-NRG1多核苷酸序列
ACTACCCCATCAACTCCAACTTCAAAGTGGGCTACAACACTCTCTTTTCCTGTACCTGTGTGCCACCTGACCCAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG
SEQ ID NO:766 SCL4A4-NRG1多肽序列
YPINSNFKVGYNTLFSCTCVPPDPATSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVN
SEQ ID NO:767 SLC4A4之外顯子1
GGCGGCGCGCCGGGCAGCGCTTCGGTGGCGGCGGCGGCCGCGGTGGCAGCGAAGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGTGGCAGTGGCCGCTGCAGCCCCACACTCCGCCGCCAAACTGGAGGAGCGACGGAAGCCAGACCCCAGGAG
SEQ ID NO:768 SLC4A4之外顯子2
GATGGAGGATGAAGCTGTCCTGGACAGAGGGGCTTCCTTCCTCAAGCATGTGTGTGATGAAGAAGAAGTAGAAG
SEQ ID NO:769 SLC4A4之外顯子3
GCCACCATACCATTTACATCGGAGTCCATGTGCCGAAGAGTTACAGGAGAAGGAGACGTCACAAGAGAAAGACAGGGCACAAAGAAAAGAAGGAAAAGGAGAGAATCTCTGAGAACTACTCTGACAAATCAGATATTGAAAATGCTGATGAATCCAGCAGCAGCATCCTAAAACCTCTCA
SEQ ID NO:770 SLC4A4之外顯子4
TCTCTCCTGCTGCAGAACGCATCCGATTCATCTTGGGAGAGGAGGATGACAGCCCAGCTCCCCCTCAGCTCTTCACGGAACTGGATGAGCTGCTGGCCGTGGATGGGCAGGAGATGGAGTGGAAGGAAACAGCCAG
SEQ ID NO:771 SLC4A4之外顯子5
GTGGATCAAGTTTGAAGAAAAAGTGGAACAGGGTGGGGAAAGATGGAGCAAGCCCCATGTGGCCACATTGTCCCTTCATAGTTTATTTGAGCTGAGGACATGTATGGAGAAAGGATCCATCATGCTTGATCGGGAGGCTTCTTCTCTCCCACAGTTGGTGG
SEQ ID NO:772 SLC4A4之外顯子6
AGATGATTGTTGACCATCAGATTGAGACAGGCCTATTGAAACCTGAACTTAAGGATAAGGTGACCTATACTTTGCTCCGGAAGCACCGGCATCAAACCAAGAAATCCAACCTTCGGTCCCTGGCTGACATTGGGAAGACAGTCTCCAGTGCAAGTAGGATGTTTACCAACCCTGATAATG
SEQ ID NO:773 SLC4A4之外顯子7
GTAGCCCAGCCATGACCCATAGGAATCTGACTTCCTCCAGTCTGAATGACATTTCTGATAAACCGGAGAAGGACCAG
SEQ ID NO:774 SLC4A4之外顯子8
CTGAAGAATAAGTTCATGAAAAAATTGCCACGTGATGCAGAAGCTTCCAACGTGCTTGTTGGGGAGGTTGACTTTTTGGATACTCCTTTCATTGCCTTTGTTAGGCTACAGCAGGCTGTCATGCTGGGTGCCCTGACTGAAGTTCCTGTGCCCACAAG
SEQ ID NO:775 SLC4A4之外顯子9
GTTCTTGTTCATTCTCTTAGGTCCTAAGGGGAAAGCCAAGTCCTACCACGAGATTGGCAGAGCCATTGCCACCCTGATGTCTGATGAG
SEQ ID NO:776 SLC4A4之外顯子10
GTGTTCCATGACATTGCTTATAAAGCAAAAGACAGGCACGACCTGATTGCTGGTATTGATGAGTTCCTAGATGAAGTCATCGTCCTTCCACCTGGGGAATGGGATCCAGCAATTAGGATAGAGCCTCCTAAGAGTCTTCCATCCTCTGACAAAAG
SEQ ID NO:777 SLC4A4之外顯子11
AAAGAATATGTACTCAGGTGGAGAGAATGTTCAGATGAATGGGGATACGCCCCATGATGGAGGTCACGGAGGAGGAGGACATGGGGATTGTGAAGAATTGCAGCGAACTGGACG
SEQ ID NO:778 SLC4A4之外顯子12
GTTCTGTGGTGGACTAATTAAAGACATAAAGAGGAAAGCGCCATTTTTTGCCAGTGATTTTTATGATGCTTTAAATATTCAAGCTCTTTCGGCAATTCTCTTCATTTATCTGGCAACTGTAACTAATGCTATCACTTTTGGAGGACTGCTTGGGGATGCCACTGACAACATGCAG
SEQ ID NO:779 SLC4A4之外顯子13
GGCGTGTTGGAGAGTTTCCTGGGCACTGCTGTCTCTGGAGCCATCTTTTGCCTTTTTGCTGGTCAACCACTCACTATTCTGAGCAGCACCGGACCTGTCCTAGTTTTTGAGAGGCTTCTATTTAATTTCAGCAA
SEQ ID NO:780 SLC4A4之外顯子14
GGACAATAATTTTGACTATTTGGAGTTTCGCCTTTGGATTGGCCTGTGGTCCGCCTTCCTATGTCTCATTTTGGTAGCCACTGATGCCAGCTTCTTGGTTCAATACTTCACACGTTTCACGGAGGAGGGCTTTTCCTCTCTGATTAGCTTCATCTTTATCTATGATGCTTTCAAGAAGATGATCAAGCTTGCAGATTACTACCCCATCAACTCCAACTTCAAAGTGGGCTACAACACTCTCTTTTCCTGTACCTGTGTGCCACCTGACCCAG
SEQ ID NO:781 SLC4A4之外顯子15
CTAATATCTCAATATCTAATGACACCACACTGGCCCCAGAGTATTTGCCAACTATGTCTTCTACTGACATG
SEQ ID NO:782 SLC4A4之外顯子16
TACCATAATACTACCTTTGACTGGGCATTTTTGTCGAAGAAGGAGTGTTCAAAATACGGAGGAAACCTCGTCGGGAACAACTGTAATTTTGTTCCTGATATCACACTCATGTCTTTTATCCTCTTCTTGGGAACCTACACCTCTTCCATGGCTCTGAAAAAATTCAAAACTAGTCCTTATTTTCCAACCACA
SEQ ID NO:783 SLC4A4之外顯子17
GCAAGAAAACTGATCAGTGATTTTGCCATTATCTTGTCCATTCTCATCTTTTGTGTAATAGATGCCCTAGTAGGCGTGGACACCCCAAAACTAATTGTGCCAAGTGAGTTCAAG
SEQ ID NO:784 SLC4A4之外顯子18
CCAACAAGTCCAAACCGAGGTTGGTTCGTTCCACCGTTTGGAGAAAACCCCTGGTGGGTGTGCCTTGCTGCTGCTATCCCGGCTTTGTTGGTCACTATACTGATTTTCATGGACCAACAAATTACAGCTGTGATTGTAAACAGGAAAGAACATAAACTCAAG
SEQ ID NO:785 SLC4A4之外顯子19
AAAGGAGCAGGGTATCACTTGGATCTCTTTTGGGTGGCCATCCTCATGGTTATATGCTCCCTCATGGCTCTTCCGTGGTATGTAGCTGCTACGGTCATCTCCATTGCTCACATCGACAGTTTGAAGATGGAGACAGAGACTTCTGCACCTGGAGAACAACCAAAGTTTCTAGGAGTGAG
SEQ ID NO:786 SLC4A4之外顯子20
GGAACAAAGAGTCACTGGAACCCTTGTGTTTATTCTGACTGGTCTGTCAGTCTTTATGGCTCCCATCTTGAAG
SEQ ID NO:787 SLC4A4之外顯子21
GTTTATACCCATGCCTGTACTCTATGGTGTGTTCCTGTATATGGGAGTAGCATCCCTTAATGGTGTGCAG
SEQ ID NO:788 SLC4A4之外顯子22
TTCATGGATCGTCTGAAGCTGCTTCTGATGCCTCTGAAGCATCAGCCTGACTTCATCTACCTGCGTCATGTTCCTCTGCGCAGAGTCCACCTGTTCACTTTCCTGCAGGTGTTGTGTCTGGCCCTGCTTTGGATCCTCAAGTCAACGGTGGCTGCTATCATTTTTCCAGTAATG
SEQ ID NO:789 SLC4A4之外顯子23
ATCTTGGCACTTGTAGCTGTCAGAAAAGGCATGGACTACCTCTTCTCCCAGCACGACCTCAGCTTCCTGGATGATGTCATTCCAGAAAAGGACAAGAAAAAGAAGGAGGATGAGAAGAAAAAGAAAAAGAAGAAGGGAAGTCTGGACAGTGACAATGATGAT
SEQ ID NO:790 SLC4A4之外顯子24
TCTGACTGCCCATACTCAGAAAAAGTTCCAAGTATTAAAATTCCAATGGACATCATGGAACAGCAACCTTTCCTAAGCGATAGCAAACCTTCTGACA
SEQ ID NO:791 SLC4A4之外顯子25
GAGAAAGATCACCAACATTCCTTGAACGCCACACATCATGCTGATAAAATTCCTTTCCTTCAGTCACTCGGTATGCCAAG
SEQ ID NO:792 SLC4A4之外顯子26
TCCTCCTAGAACTCCAGTAAAAGTTGTGCCTCAAATTAGAATAGAACTTGAACCTGAAGACAATGATTATTTCTGGAGGAGCAAGGGAACAGAAACTACATTGTAACCTGTTTGTCTTTCTTAAAACTGACATTTGTTGTTAATGTCATTTGTTTTTGTTTGGCTGTTTGTTTATTTTTTAACTTTTATTTCGTCTCAGTTTTTGGTCACAGGCCAAATAATACAGCGCTCTCTCTGCTTCTCTCTTGCATAGACACAATCAAGACAATAGTGCACCGTTCCTTAAAAACAGCATCTGAGGAATCCCCCTTTTGTTCTTAAACTTTCAGATGTGTCCTTTGATAACCAAATTCTGTCACTCAAGACACAGACACGCACAGACCCTGTCCTTTGCCTCTATTAAGCAGAGGATGGAAGTATTAAGGATTTTGTAACACCTTTTATGAAAATGTTGAAGGAACTTAAAACTTTAGCTTTGGAGCTGTGCTTACTGGCTTGTCTTTGTCTGGTAGAACAAACCTTGACCTCCAGACAGAGTCCCTTCTCACTTATAGAGCTCTCCAGGACTGGAAAAAGTGCTGCTATTTTAACTTGCTCTTGCTTGTAAATCCTAATCTTAGAGTTATCAAAAGAAGAAAAAACTGAAGGTACTTTACTCCCTATAGAGAAACCATTGCCATCATTGTAGCAAGTGCTGGAATGTCCCTTTTTTCCTATGCAACTTTTTTTAACCCTTTAATGAACTTATCTGTTGAGTACATTGAAGAATATTTTTCTTCCTAGATTTTGTTGTTTAAATTATGGGGCCTAACCTGCCACTTATTTTTTGTCAATTTTTAAAACTTTTTTTTAATTACTGTAAAGAAAATGAATTTTTTCCTGCAGCAGGAAACATAGTTTTGAGTAGTTCTACCTCTTATTTGTAGCTGCCAGGCTTTCTGTAAAAATTGTATTGTATATAATGTGATTTTTACACATACATACACACACAAATACACAATCTCTAGGGTAAGCCAGAAGGCAAGATCAGATTAAAAACACCATGTTTCTAAGCATCCATTTTTCCCTTTCTTTAAAAGAAACTTAACTGTTCTATGAAGGAGATTGAGGGAGAAGAGACAAACTCCTATGTCATGAGAATAACCGATGTTCTGATAATAGTAGCATCTAGGTACAGATGCTGGTTGTATTACCACGTCAATGTCCTATGCAGTATTGTTAGACATTTTCTCATTTTGAAATATTTGTGTGTTTGTGTATGTGCTCTGTGCCATGGCTGGTGTATATATGTGCAATGTTAGAAGGCAAAAGAGTGATGGTAGGCAGAGGGCAAAGTCATTGAATCTCTTATGCCAGTTTTCATAAAACCCAAACCACATATGAAAAAATCCATTAAGGGTCCAAGAAGTCTGTCCATATGAAAATGAGGGTAAATATAGTTTATTTCCCAGGTATCAGTCATTATAATTGATATAATAGCTCTAACATGCAATATAAAATTCATAGGAGTATTAATAGCCCATTTACACATCTATAAAATGTAATGGGATTGCAGAGCTGCAGAGTACAGTGTAACAGTACTCTCATGCAATTTTTTTCAGGATGCAAAGGCAATTATTCTTTGTAAGCGGGACATTTAGAATATATTTGTGTACATATTATATGTATGTATATTTCAAAGTACCACACTGAAAATTAGACATTTATTAACCAAATTTAACGTGGTATTTAAAGGTAATATTTTTAATATGATACATTACATATTGTGAATGTATACTAAAAAAACATTTTAAATGTTAAAATTATAATTTCAGATTCATATAACCACAACTGTGATATATCCTAACTATAACCAGTTGTTGAGGGGTATACTAGAAGCAGAATGAAACCACATTTTTTGGTTTGATAATATGCACTTATTGACTCCCACTCATTGTTATGTTAATTAAGTTATTATTCTGTCTCCTTGTAATTTTGATTACAAAAATTTTATTATCCTGAGTTAGCTGTTACTTTTACAGTACCTGATACTCCTAAAACTTTTAACTTATACAAATTAGTCAATAATGACCCCAATTTTTTCATTAAAATAATAGTGGTGAATTATATGTTATTGTGTTAAAACCTCACTTGCCAAATTCTGGCTTCACATTTGTATTTAGGGCTATCCTTAAAATGATGAGTCTATATTATCTAGCTTTCTATTACCCTAATATAAACTGGTATAAGAAGACTTTCCTTTTTTCTTTATGCATGGAAGCATCAATAAATTGTTTAAAAACCATGTATAGTAAATTCAGCTTAACCCGTGATCTTCTTAAGTTAAAGGTACTTTTGTTTTATAAAAGCTCTAGATAAAACTTTCTTTTCTGATCATGAATCAAGTATCTGTGGTTTCATGCCCCTCTCTATACCTTTCAAAGAACTCCTGAAGCAACTTAACTCATCATTTCAGCCTCTGAGTAGAGGTAAAACCTATGTGTACTTCTGTTTATGATCCATATTGATATTTATGACATGAACACAGAATAGTACCTTACATTTGCTAAACAGACAGTTAATATCAAATCCTTTCAATATTCTGGGAACCCAGGGAAGTTTTTAAAAATGTCATTACTTTCAAAGGAACAGAAGTAGTTAACCAAACTAACAAGCAAAACCTGAGGTTTACCTAGTGACACCAAATTATCGGTATTTTAACTGAATTTACCCATTGACTAAGAATGAACCAGATTTGGTGGTGGTTTTGTTTCTATGCAAACTGGACACAAATTACAACAGTAAATTTTTTTATAAGTGCTTCTCCCTTCTCCATGATGTGACTTCCGGAGATAAAGGATTCAAAAGATAAAGACAAAGTACGCTCAGAGTTGTTAACCAGAAAGTCCTGGCTGTGGTTGCAGAAACACTGTTGGAAGAAAAGAGATGACTAAGTCAAGTGTCTGCCTTATCAAAAGAGCAAAAATGCCTCTGGTTTTGTGTTTGGGAGAAAAGTATCTTGGACGCACTGTTTTCCTTGATAAAAGTCATCTTCTCTACTGTGTGAAATGAATACTTGGAATTCTAATTGTTTTGTGTGCCAGGGGCAGTAATGTCCCTGCCTCTTCTCCCAATCAAGGTTGAGGAGTGGGGCTGGGGAGAGGACTTAACTGACTTAAGAAGTAGGAAAACAAAAACCTCTCTCCTCAGCCTTCCACCTCCAAGAGAGGAGGAAAAACAGTTGTCTGCTGTCTGTAATTCAGTTTGCGTGTATTTTATGCTCATGCACCAACCCATACAGAGTAAATCTTTTATCAACTGTATACTGGTGTTTAATAGAGAATGATTGTCTTCCGAGTTTTTTGGTTCCTTTTTTAACTGTGTTAAAGTACTTGAAATGTATTGACTGCTGACTATATTTTAAAAACAAAATGAAATAATTTGAGTTGTATTACAGAGGTTGACATTGTTCAGGGATGGGACAAAGCCTTCTTCAATCCTTTTCATACTACTTAATGATTTTGGTGCAGGAACCTGAGATTTTCTGATTTATATTTCATGATATTTCACATTTGCTCTTCACAGCATGAGCATGAAGCCCAGTGGCACCAAATGGCTGGGTACAATCAAGTGATATTTTGTAGCACCTCACTATCTGAAAGGCCATGAGTTTTCAGATGATTTCATTGAGCTTCATTGCAGCCTGAAATTTTAAAAAAGTTGTGTAATACGCCAACCAGTCAAGTTGTGTTTTGGCCAGAGATTTAGATATGTCCAATTTCCTGGCTCATTTCATTGTGCTCTATGGGTACGTATAAAAAGCAAGAATTCTGTTTCCTAGGCAAACATTGCAACTCAGGGCTAAAGTCATCCAGTGAAACTTTTAGAGCCAGAAGTAACTTTGTCCCAGTCCTACAATGTGAAAAGAGTGAATAGTTGCCTCTTTTTAGCCATTTTCATGGCTGGTACATATTCGTACGCATTACTTTTCAGAATCAATACGCACTTTCAGATATTCTTATTTTTATTCTCTTAAGTCTTTATTAACTTTGGAGAGAGAAATGATGCATCTTTTTATTTTAAATGAAGTAGATCAACATGGTGGAACAAAATGATAAAGAACAGAAAACATTTCAATATATTACTAATAACTTTTTCCAATATAAATCCTAAAATTCCTATAACATAGTATTTTACAGTTTTATGAAGCTTTCTATTGTGACTTTTATGGAATTAAGAGATGAAGAAGATGAGATATTTTAGCATTTATATTTTTCAAAATTATATGTATACTTAAAAATAAAGTAACTTTATGCA
SEQ ID NO:793 SLC4A4之全mRNA多核苷酸序列
GGCGGCGCGCCGGGCAGCGCTTCGGTGGCGGCGGCGGCCGCGGTGGCAGCGAAGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGTGGCAGTGGCCGCTGCAGCCCCACACTCCGCCGCCAAACTGGAGGAGCGACGGAAGCCAGACCCCAGGAGGATGGAGGATGAAGCTGTCCTGGACAGAGGGGCTTCCTTCCTCAAGCATGTGTGTGATGAAGAAGAAGTAGAAGGCCACCATACCATTTACATCGGAGTCCATGTGCCGAAGAGTTACAGGAGAAGGAGACGTCACAAGAGAAAGACAGGGCACAAAGAAAAGAAGGAAAAGGAGAGAATCTCTGAGAACTACTCTGACAAATCAGATATTGAAAATGCTGATGAATCCAGCAGCAGCATCCTAAAACCTCTCATCTCTCCTGCTGCAGAACGCATCCGATTCATCTTGGGAGAGGAGGATGACAGCCCAGCTCCCCCTCAGCTCTTCACGGAACTGGATGAGCTGCTGGCCGTGGATGGGCAGGAGATGGAGTGGAAGGAAACAGCCAGGTGGATCAAGTTTGAAGAAAAAGTGGAACAGGGTGGGGAAAGATGGAGCAAGCCCCATGTGGCCACATTGTCCCTTCATAGTTTATTTGAGCTGAGGACATGTATGGAGAAAGGATCCATCATGCTTGATCGGGAGGCTTCTTCTCTCCCACAGTTGGTGGAGATGATTGTTGACCATCAGATTGAGACAGGCCTATTGAAACCTGAACTTAAGGATAAGGTGACCTATACTTTGCTCCGGAAGCACCGGCATCAAACCAAGAAATCCAACCTTCGGTCCCTGGCTGACATTGGGAAGACAGTCTCCAGTGCAAGTAGGATGTTTACCAACCCTGATAATGGTAGCCCAGCCATGACCCATAGGAATCTGACTTCCTCCAGTCTGAATGACATTTCTGATAAACCGGAGAAGGACCAGCTGAAGAATAAGTTCATGAAAAAATTGCCACGTGATGCAGAAGCTTCCAACGTGCTTGTTGGGGAGGTTGACTTTTTGGATACTCCTTTCATTGCCTTTGTTAGGCTACAGCAGGCTGTCATGCTGGGTGCCCTGACTGAAGTTCCTGTGCCCACAAGGTTCTTGTTCATTCTCTTAGGTCCTAAGGGGAAAGCCAAGTCCTACCACGAGATTGGCAGAGCCATTGCCACCCTGATGTCTGATGAGGTGTTCCATGACATTGCTTATAAAGCAAAAGACAGGCACGACCTGATTGCTGGTATTGATGAGTTCCTAGATGAAGTCATCGTCCTTCCACCTGGGGAATGGGATCCAGCAATTAGGATAGAGCCTCCTAAGAGTCTTCCATCCTCTGACAAAAGAAAGAATATGTACTCAGGTGGAGAGAATGTTCAGATGAATGGGGATACGCCCCATGATGGAGGTCACGGAGGAGGAGGACATGGGGATTGTGAAGAATTGCAGCGAACTGGACGGTTCTGTGGTGGACTAATTAAAGACATAAAGAGGAAAGCGCCATTTTTTGCCAGTGATTTTTATGATGCTTTAAATATTCAAGCTCTTTCGGCAATTCTCTTCATTTATCTGGCAACTGTAACTAATGCTATCACTTTTGGAGGACTGCTTGGGGATGCCACTGACAACATGCAGGGCGTGTTGGAGAGTTTCCTGGGCACTGCTGTCTCTGGAGCCATCTTTTGCCTTTTTGCTGGTCAACCACTCACTATTCTGAGCAGCACCGGACCTGTCCTAGTTTTTGAGAGGCTTCTATTTAATTTCAGCAAGGACAATAATTTTGACTATTTGGAGTTTCGCCTTTGGATTGGCCTGTGGTCCGCCTTCCTATGTCTCATTTTGGTAGCCACTGATGCCAGCTTCTTGGTTCAATACTTCACACGTTTCACGGAGGAGGGCTTTTCCTCTCTGATTAGCTTCATCTTTATCTATGATGCTTTCAAGAAGATGATCAAGCTTGCAGATTACTACCCCATCAACTCCAACTTCAAAGTGGGCTACAACACTCTCTTTTCCTGTACCTGTGTGCCACCTGACCCAGCTAATATCTCAATATCTAATGACACCACACTGGCCCCAGAGTATTTGCCAACTATGTCTTCTACTGACATGTACCATAATACTACCTTTGACTGGGCATTTTTGTCGAAGAAGGAGTGTTCAAAATACGGAGGAAACCTCGTCGGGAACAACTGTAATTTTGTTCCTGATATCACACTCATGTCTTTTATCCTCTTCTTGGGAACCTACACCTCTTCCATGGCTCTGAAAAAATTCAAAACTAGTCCTTATTTTCCAACCACAGCAAGAAAACTGATCAGTGATTTTGCCATTATCTTGTCCATTCTCATCTTTTGTGTAATAGATGCCCTAGTAGGCGTGGACACCCCAAAACTAATTGTGCCAAGTGAGTTCAAGCCAACAAGTCCAAACCGAGGTTGGTTCGTTCCACCGTTTGGAGAAAACCCCTGGTGGGTGTGCCTTGCTGCTGCTATCCCGGCTTTGTTGGTCACTATACTGATTTTCATGGACCAACAAATTACAGCTGTGATTGTAAACAGGAAAGAACATAAACTCAAGAAAGGAGCAGGGTATCACTTGGATCTCTTTTGGGTGGCCATCCTCATGGTTATATGCTCCCTCATGGCTCTTCCGTGGTATGTAGCTGCTACGGTCATCTCCATTGCTCACATCGACAGTTTGAAGATGGAGACAGAGACTTCTGCACCTGGAGAACAACCAAAGTTTCTAGGAGTGAGGGAACAAAGAGTCACTGGAACCCTTGTGTTTATTCTGACTGGTCTGTCAGTCTTTATGGCTCCCATCTTGAAGTTTATACCCATGCCTGTACTCTATGGTGTGTTCCTGTATATGGGAGTAGCATCCCTTAATGGTGTGCAGTTCATGGATCGTCTGAAGCTGCTTCTGATGCCTCTGAAGCATCAGCCTGACTTCATCTACCTGCGTCATGTTCCTCTGCGCAGAGTCCACCTGTTCACTTTCCTGCAGGTGTTGTGTCTGGCCCTGCTTTGGATCCTCAAGTCAACGGTGGCTGCTATCATTTTTCCAGTAATGATCTTGGCACTTGTAGCTGTCAGAAAAGGCATGGACTACCTCTTCTCCCAGCACGACCTCAGCTTCCTGGATGATGTCATTCCAGAAAAGGACAAGAAAAAGAAGGAGGATGAGAAGAAAAAGAAAAAGAAGAAGGGAAGTCTGGACAGTGACAATGATGATTCTGACTGCCCATACTCAGAAAAAGTTCCAAGTATTAAAATTCCAATGGACATCATGGAACAGCAACCTTTCCTAAGCGATAGCAAACCTTCTGACAGAGAAAGATCACCAACATTCCTTGAACGCCACACATCATGCTGATAAAATTCCTTTCCTTCAGTCACTCGGTATGCCAAGTCCTCCTAGAACTCCAGTAAAAGTTGTGCCTCAAATTAGAATAGAACTTGAACCTGAAGACAATGATTATTTCTGGAGGAGCAAGGGAACAGAAACTACATTGTAACCTGTTTGTCTTTCTTAAAACTGACATTTGTTGTTAATGTCATTTGTTTTTGTTTGGCTGTTTGTTTATTTTTTAACTTTTATTTCGTCTCAGTTTTTGGTCACAGGCCAAATAATACAGCGCTCTCTCTGCTTCTCTCTTGCATAGACACAATCAAGACAATAGTGCACCGTTCCTTAAAAACAGCATCTGAGGAATCCCCCTTTTGTTCTTAAACTTTCAGATGTGTCCTTTGATAACCAAATTCTGTCACTCAAGACACAGACACGCACAGACCCTGTCCTTTGCCTCTATTAAGCAGAGGATGGAAGTATTAAGGATTTTGTAACACCTTTTATGAAAATGTTGAAGGAACTTAAAACTTTAGCTTTGGAGCTGTGCTTACTGGCTTGTCTTTGTCTGGTAGAACAAACCTTGACCTCCAGACAGAGTCCCTTCTCACTTATAGAGCTCTCCAGGACTGGAAAAAGTGCTGCTATTTTAACTTGCTCTTGCTTGTAAATCCTAATCTTAGAGTTATCAAAAGAAGAAAAAACTGAAGGTACTTTACTCCCTATAGAGAAACCATTGCCATCATTGTAGCAAGTGCTGGAATGTCCCTTTTTTCCTATGCAACTTTTTTTAACCCTTTAATGAACTTATCTGTTGAGTACATTGAAGAATATTTTTCTTCCTAGATTTTGTTGTTTAAATTATGGGGCCTAACCTGCCACTTATTTTTTGTCAATTTTTAAAACTTTTTTTTAATTACTGTAAAGAAAATGAATTTTTTCCTGCAGCAGGAAACATAGTTTTGAGTAGTTCTACCTCTTATTTGTAGCTGCCAGGCTTTCTGTAAAAATTGTATTGTATATAATGTGATTTTTACACATACATACACACACAAATACACAATCTCTAGGGTAAGCCAGAAGGCAAGATCAGATTAAAAACACCATGTTTCTAAGCATCCATTTTTCCCTTTCTTTAAAAGAAACTTAACTGTTCTATGAAGGAGATTGAGGGAGAAGAGACAAACTCCTATGTCATGAGAATAACCGATGTTCTGATAATAGTAGCATCTAGGTACAGATGCTGGTTGTATTACCACGTCAATGTCCTATGCAGTATTGTTAGACATTTTCTCATTTTGAAATATTTGTGTGTTTGTGTATGTGCTCTGTGCCATGGCTGGTGTATATATGTGCAATGTTAGAAGGCAAAAGAGTGATGGTAGGCAGAGGGCAAAGTCATTGAATCTCTTATGCCAGTTTTCATAAAACCCAAACCACATATGAAAAAATCCATTAAGGGTCCAAGAAGTCTGTCCATATGAAAATGAGGGTAAATATAGTTTATTTCCCAGGTATCAGTCATTATAATTGATATAATAGCTCTAACATGCAATATAAAATTCATAGGAGTATTAATAGCCCATTTACACATCTATAAAATGTAATGGGATTGCAGAGCTGCAGAGTACAGTGTAACAGTACTCTCATGCAATTTTTTTCAGGATGCAAAGGCAATTATTCTTTGTAAGCGGGACATTTAGAATATATTTGTGTACATATTATATGTATGTATATTTCAAAGTACCACACTGAAAATTAGACATTTATTAACCAAATTTAACGTGGTATTTAAAGGTAATATTTTTAATATGATACATTACATATTGTGAATGTATACTAAAAAAACATTTTAAATGTTAAAATTATAATTTCAGATTCATATAACCACAACTGTGATATATCCTAACTATAACCAGTTGTTGAGGGGTATACTAGAAGCAGAATGAAACCACATTTTTTGGTTTGATAATATGCACTTATTGACTCCCACTCATTGTTATGTTAATTAAGTTATTATTCTGTCTCCTTGTAATTTTGATTACAAAAATTTTATTATCCTGAGTTAGCTGTTACTTTTACAGTACCTGATACTCCTAAAACTTTTAACTTATACAAATTAGTCAATAATGACCCCAATTTTTTCATTAAAATAATAGTGGTGAATTATATGTTATTGTGTTAAAACCTCACTTGCCAAATTCTGGCTTCACATTTGTATTTAGGGCTATCCTTAAAATGATGAGTCTATATTATCTAGCTTTCTATTACCCTAATATAAACTGGTATAAGAAGACTTTCCTTTTTTCTTTATGCATGGAAGCATCAATAAATTGTTTAAAAACCATGTATAGTAAATTCAGCTTAACCCGTGATCTTCTTAAGTTAAAGGTACTTTTGTTTTATAAAAGCTCTAGATAAAACTTTCTTTTCTGATCATGAATCAAGTATCTGTGGTTTCATGCCCCTCTCTATACCTTTCAAAGAACTCCTGAAGCAACTTAACTCATCATTTCAGCCTCTGAGTAGAGGTAAAACCTATGTGTACTTCTGTTTATGATCCATATTGATATTTATGACATGAACACAGAATAGTACCTTACATTTGCTAAACAGACAGTTAATATCAAATCCTTTCAATATTCTGGGAACCCAGGGAAGTTTTTAAAAATGTCATTACTTTCAAAGGAACAGAAGTAGTTAACCAAACTAACAAGCAAAACCTGAGGTTTACCTAGTGACACCAAATTATCGGTATTTTAACTGAATTTACCCATTGACTAAGAATGAACCAGATTTGGTGGTGGTTTTGTTTCTATGCAAACTGGACACAAATTACAACAGTAAATTTTTTTATAAGTGCTTCTCCCTTCTCCATGATGTGACTTCCGGAGATAAAGGATTCAAAAGATAAAGACAAAGTACGCTCAGAGTTGTTAACCAGAAAGTCCTGGCTGTGGTTGCAGAAACACTGTTGGAAGAAAAGAGATGACTAAGTCAAGTGTCTGCCTTATCAAAAGAGCAAAAATGCCTCTGGTTTTGTGTTTGGGAGAAAAGTATCTTGGACGCACTGTTTTCCTTGATAAAAGTCATCTTCTCTACTGTGTGAAATGAATACTTGGAATTCTAATTGTTTTGTGTGCCAGGGGCAGTAATGTCCCTGCCTCTTCTCCCAATCAAGGTTGAGGAGTGGGGCTGGGGAGAGGACTTAACTGACTTAAGAAGTAGGAAAACAAAAACCTCTCTCCTCAGCCTTCCACCTCCAAGAGAGGAGGAAAAACAGTTGTCTGCTGTCTGTAATTCAGTTTGCGTGTATTTTATGCTCATGCACCAACCCATACAGAGTAAATCTTTTATCAACTGTATACTGGTGTTTAATAGAGAATGATTGTCTTCCGAGTTTTTTGGTTCCTTTTTTAACTGTGTTAAAGTACTTGAAATGTATTGACTGCTGACTATATTTTAAAAACAAAATGAAATAATTTGAGTTGTATTACAGAGGTTGACATTGTTCAGGGATGGGACAAAGCCTTCTTCAATCCTTTTCATACTACTTAATGATTTTGGTGCAGGAACCTGAGATTTTCTGATTTATATTTCATGATATTTCACATTTGCTCTTCACAGCATGAGCATGAAGCCCAGTGGCACCAAATGGCTGGGTACAATCAAGTGATATTTTGTAGCACCTCACTATCTGAAAGGCCATGAGTTTTCAGATGATTTCATTGAGCTTCATTGCAGCCTGAAATTTTAAAAAAGTTGTGTAATACGCCAACCAGTCAAGTTGTGTTTTGGCCAGAGATTTAGATATGTCCAATTTCCTGGCTCATTTCATTGTGCTCTATGGGTACGTATAAAAAGCAAGAATTCTGTTTCCTAGGCAAACATTGCAACTCAGGGCTAAAGTCATCCAGTGAAACTTTTAGAGCCAGAAGTAACTTTGTCCCAGTCCTACAATGTGAAAAGAGTGAATAGTTGCCTCTTTTTAGCCATTTTCATGGCTGGTACATATTCGTACGCATTACTTTTCAGAATCAATACGCACTTTCAGATATTCTTATTTTTATTCTCTTAAGTCTTTATTAACTTTGGAGAGAGAAATGATGCATCTTTTTATTTTAAATGAAGTAGATCAACATGGTGGAACAAAATGATAAAGAACAGAAAACATTTCAATATATTACTAATAACTTTTTCCAATATAAATCCTAAAATTCCTATAACATAGTATTTTACAGTTTTATGAAGCTTTCTATTGTGACTTTTATGGAATTAAGAGATGAAGAAGATGAGATATTTTAGCATTTATATTTTTCAAAATTATATGTATACTTAAAAATAAAGTAACTTTATGCA
SEQ ID NO:794 SLC4A4之外顯子2的轉譯多肽序列
MEDEAVLDRGASFLKHVCDEEEVE
SEQ ID NO:795 SLC4A4之外顯子3的轉譯多肽序列
HHTIYIGVHVPKSYRRRRRHKRKTGHKEKKEKERISENYSDKSDIENADESSSSILKPL
SEQ ID NO:796 SLC4A4之外顯子4的轉譯多肽序列
SPAAERIRFILGEEDDSPAPPQLFTELDELLAVDGQEMEWKETA
SEQ ID NO:797 SLC4A4之外顯子5的轉譯多肽序列
WIKFEEKVEQGGERWSKPHVATLSLHSLFELRTCMEKGSIMLDREASSLPQLV
SEQ ID NO:798 SLC4A4之外顯子6的轉譯多肽序列
MIVDHQIETGLLKPELKDKVTYTLLRKHRHQTKKSNLRSLADIGKTVSSASRMFTNPDN
SEQ ID NO:799 SLC4A4之外顯子7的轉譯多肽序列
SPAMTHRNLTSSSLNDISDKPEKDQ
SEQ ID NO:800 SLC4A4之外顯子8的轉譯多肽序列
LKNKFMKKLPRDAEASNVLVGEVDFLDTPFIAFVRLQQAVMLGALTEVPVPT
SEQ ID NO:801 SLC4A4之外顯子9的轉譯多肽序列
FLFILLGPKGKAKSYHEIGRAIATLMSDE
SEQ ID NO:802 SLC4A4之外顯子10的轉譯多肽序列
VFHDIAYKAKDRHDLIAGIDEFLDEVIVLPPGEWDPAIRIEPPKSLPSSDK
SEQ ID NO:803 SLC4A4之外顯子11的轉譯多肽序列
KNMYSGGENVQMNGDTPHDGGHGGGGHGDCEELQRTG
SEQ ID NO:804 SLC4A4之外顯子12的轉譯多肽序列
FCGGLIKDIKRKAPFFASDFYDALNIQALSAILFIYLATVTNAITFGGLLGDATDNMQ
SEQ ID NO:805 SLC4A4之外顯子13的轉譯多肽序列
GVLESFLGTAVSGAIFCLFAGQPLTILSSTGPVLVFERLLFNFS
SEQ ID NO:806 SLC4A4之外顯子14的轉譯多肽序列
DNNFDYLEFRLWIGLWSAFLCLILVATDASFLVQYFTRFTEEGFSSLISFIFIYDAFKKMIKLADYYPINSNFKVGYNTLFSCTCVPPDP
SEQ ID NO:807 SLC4A4之外顯子15的轉譯多肽序列
NISISNDTTLAPEYLPTMSSTDM
SEQ ID NO:808 SLC4A4之外顯子16的轉譯多肽序列
YHNTTFDWAFLSKKECSKYGGNLVGNNCNFVPDITLMSFILFLGTYTSSMALKKFKTSPYFPTT
SEQ ID NO:809 SLC4A4之外顯子17的轉譯多肽序列
ARKLISDFAIILSILIFCVIDALVGVDTPKLIVPSEFK
SEQ ID NO:810 SLC4A4之外顯子18的轉譯多肽序列
PTSPNRGWFVPPFGENPWWVCLAAAIPALLVTILIFMDQQITAVIVNRKEHKLK
SEQ ID NO:811 SLC4A4之外顯子19的轉譯多肽序列
KGAGYHLDLFWVAILMVICSLMALPWYVAATVISIAHIDSLKMETETSAPGEQPKFLGV
SEQ ID NO:812 SLC4A4之外顯子20的轉譯多肽序列
EQRVTGTLVFILTGLSVFMAPILK
SEQ ID NO:813 SLC4A4之外顯子21的轉譯多肽序列
FIPMPVLYGVFLYMGVASLNGVQ
SEQ ID NO:814 SLC4A4之外顯子22的轉譯多肽序列
FMDRLKLLLMPLKHQPDFIYLRHVPLRRVHLFTFLQVLCLALLWILKSTVAAIIFPVM
SEQ ID NO:815 SLC4A4之外顯子23的轉譯多肽序列
ILALVAVRKGMDYLFSQHDLSFLDDVIPEKDKKKKEDEKKKKKKKGSLDSDNDD
SEQ ID NO:816 SLC4A4之外顯子24的轉譯多肽序列
SDCPYSEKVPSIKIPMDIMEQQPFLSDSKPSD
SEQ ID NO:817 SLC4A4之外顯子25的轉譯多肽序列
ERSPTFLERHTSC
SEQ ID NO:819 SLC4A4之全蛋白質序列
MEDEAVLDRGASFLKHVCDEEEVEGHHTIYIGVHVPKSYRRRRRHKRKTGHKEKKEKERISENYSDKSDIENADESSSSILKPLISPAAERIRFILGEEDDSPAPPQLFTELDELLAVDGQEMEWKETARWIKFEEKVEQGGERWSKPHVATLSLHSLFELRTCMEKGSIMLDREASSLPQLVEMIVDHQIETGLLKPELKDKVTYTLLRKHRHQTKKSNLRSLADIGKTVSSASRMFTNPDNGSPAMTHRNLTSSSLNDISDKPEKDQLKNKFMKKLPRDAEASNVLVGEVDFLDTPFIAFVRLQQAVMLGALTEVPVPTRFLFILLGPKGKAKSYHEIGRAIATLMSDEVFHDIAYKAKDRHDLIAGIDEFLDEVIVLPPGEWDPAIRIEPPKSLPSSDKRKNMYSGGENVQMNGDTPHDGGHGGGGHGDCEELQRTGRFCGGLIKDIKRKAPFFASDFYDALNIQALSAILFIYLATVTNAITFGGLLGDATDNMQGVLESFLGTAVSGAIFCLFAGQPLTILSSTGPVLVFERLLFNFSKDNNFDYLEFRLWIGLWSAFLCLILVATDASFLVQYFTRFTEEGFSSLISFIFIYDAFKKMIKLADYYPINSNFKVGYNTLFSCTCVPPDPANISISNDTTLAPEYLPTMSSTDMYHNTTFDWAFLSKKECSKYGGNLVGNNCNFVPDITLMSFILFLGTYTSSMALKKFKTSPYFPTTARKLISDFAIILSILIFCVIDALVGVDTPKLIVPSEFKPTSPNRGWFVPPFGENPWWVCLAAAIPALLVTILIFMDQQITAVIVNRKEHKLKKGAGYHLDLFWVAILMVICSLMALPWYVAATVISIAHIDSLKMETETSAPGEQPKFLGVREQRVTGTLVFILTGLSVFMAPILKFIPMPVLYGVFLYMGVASLNGVQFMDRLKLLLMPLKHQPDFIYLRHVPLRRVHLFTFLQVLCLALLWILKSTVAAIIFPVMILALVAVRKGMDYLFSQHDLSFLDDVIPEKDKKKKEDEKKKKKKKGSLDSDNDDSDCPYSEKVPSIKIPMDIMEQQPFLSDSKPSDRERSPTFLERHTSC
SEQ ID NO:820 SLC4A4之全部外顯子1-14按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:821 SLC4A4之全部外顯子1-14按順序排列的轉譯多肽序列
SDC4 (2) 序列資訊SEQ ID NO:822 來自SDC4-NRG1融合物5’處之SDC4外顯子4的序列
ATGTGTCCAACAAGGTGTCAATGTCCAGCACTGTGCAGGGCAGCAACATCTTTGAGAGAACGGAGGTCCTGGCAG
SEQ ID NO:823 SDC4-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA
SEQ ID NO:824 SDC4-NRG1多核苷酸序列
ATGTGTCCAACAAGGTGTCAATGTCCAGCACTGTGCAGGGCAGCAACATCTTTGAGAGAACGGAGGTCCTGGCAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA
SEQ ID NO:825 SDC4-NRG1多肽序列
VSNKVSMSSTVQGSNIFERTEVLAALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCE
SEQ ID NO:940 SDC4之全部外顯子1-4按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:941 SDC4之全部外顯子1-4按順序排列的轉譯多肽序列
ZFAT 序列資訊SEQ ID NO:826 來自ZFAT-NRG1融合物5’處之ZFAT外顯子12的序列
ACAGGAAGCACCCTAATGAGGAGTATGCCAACGTGGGCACCGGGGAGCTGGCAGCGGAGGTGCTCATCCAGCAAG
SEQ ID NO:827 ZFAT-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子6序列
CTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG
SEQ ID NO:828 ZFAT-NRG1多核苷酸序列
ACAGGAAGCACCCTAATGAGGAGTATGCCAACGTGGGCACCGGGGAGCTGGCAGCGGAGGTGCTCATCCAGCAAGCTACATCTACATCCACCACTGGGACAAGCCATCTTGTAAAATGTGCGGAGAAGGAGAAAACTTTCTGTGTGAATG
SEQ ID NO:829 ZFAT-NRG1多肽序列
RKHPNEEYANVGTGELAAEVLIQQATSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVN
SEQ ID NO:830 ZFAT之外顯子1
ATCCGCCATGTTGGATGCCGCAGATTCGCCATAACCTCGCCGGCTCTTTTCTTAAAAAAATAAAAATAAAAAGCGAAGCGTCAGCAGGGCGCCCCGCCCCCTCGGTCGGCACGGGAGGGGGCCCGGAAGAGCCCGAGGCTTTTTTTTCCTCCGCGGTGGGGCGTTGCCATGGAGACGCGGGCGGCAG
SEQ ID NO:831 ZFAT之外顯子2
AAAACACGGCCATCTTTATGTGTAAATGTTGTAACCTCTTCTCACCAAATCAGTCGGAACTCCTCTCCCACGTTTCAGAGAAGCACATGGAAGAAGGGGTTAATGTTGATGAGATTATTATTCCCCTTAGGCCTCTGAGTACACCTGAACCCCCCAACTCAAGCAAAACCGGAGATG
SEQ ID NO:832 ZFAT之外顯子3
AGTTTTTGGTCATGAAGAGGAAGAGAGGCAGGCCTAAGGGGTCCACGAAGAAGTCCAGCACAGAAGAGGAGCTGGCAGAAAACATCGTGAGTCCGACTGAGGACAGCCCGCTGGCTCCGGAGGAAGGGAACAGCCTGCCTCCAAGCAGCTTGGAGTGTAGCAAGTGCTGTCGGAAGTTCTCCAACACGCGCCAGCTGCGGAAGCACATCTGCATTATCGTGCTGAATTTGGGTGAGGAGGAAGGAGAAGCAG
SEQ ID NO:833 ZFAT之外顯子4
GTAACGAGTCTGACCTTGAACTAGAAAAGAAGTGTAAGGAAGATGATCGGGAAAAAGCCTCGAAAAGACCACGGTCACAGAAAACAGAGAAAGTCCAGAAGATCTCAGGAAAGGAGGCCAGACAGCTTTCTGGGGCGAAGAAACCCATCATAAGTGTGGTTTTAACTGCACACGAAGCAATTCCAG
SEQ ID NO:834 ZFAT之外顯子5
GTGCTACCAAGATTGTGCCAGTGGAGGCTGGGCCCCCTGAAACAGGAGCTACAAATTCTGAGACCACTTCAGCAGACCTGGTGCCTCGGAGAGGCTACCAGGAATACGCCATTCAGCAGACACCTTATGAGCAACCAATGAAGTCAAGCAG
SEQ ID NO:835 ZFAT之外顯子6
GCTAGGTCCCACTCAGCTCAAAATCTTCACTTGTGAATACTGCAACAAGGTCTTCAAGTTCAAGCACTCGCTGCAGGCCCACCTGAGGATCCACACCAATGAAAAGCCATACAAGTGCCCCCAGTGCAGCTATGCCAGTGCCATCAAGGCCAACCTCAATGTGCACCTGCGCAAGCACACTGGAGAGAAGTTCGCCTGCGACTATTGCTCGTTCACCTGCCTGAGCAAGGGCCACCTCAAGGTGCACATCGAGCGAGTGCACAAGAAGATCAAGCAGCACTGCCGCTTCTGCAAGAAGAAGTACTCTGACGTCAAGAACCTCATCAAGCACATCCGAGACGCGCATGACCCACAGGACAAGAAGGTCAAAGAGGCCTTGGACGAGCTCTGCCTGATGACGAGGGAGGGCAAGCGGCAGCTGCTCTATGACTGCCACATCTGTGAGCGCAAGTTCAAGAACGAGCTGGACCGTGACCGCCATATGCTGGTCCACGGAGACAAGTGGCCTTTTGCCTGTGAGCTCTGTGGCCATGGGGCCACCAAGTACCAGGCGCTGGAACTGCATGTCAGGAAGCACCCCTTCGTGTACGTCTGTGCCGTCTGCCGCAAGAAGTTCGTCAGCTCCATCAGGCTGCGCACCCACATCAAAGAGGTGCACGGGGCTGCCCAGGAGGCCTTGGTCTTCACCAGTTCCATCAACCAGAGCTTCTGCCTCCTGGAACCTGGTGGGGACATCCAGCAAGAAGCTCTGGGGGACCAGCTACAGCTGGTGGAAGAGGAGTTTGCCCTCCAGGGCGTGAATGCACTCAAGGAAGAGGCCTGTCCTGGGGACACTCAGCTGGAGGAGGGCCGGAAGGAGCCGGAGGCCCCTGGGGAAATGCCTGCCCCAGCTGTGCACCTGGCCTCCCCGCAGGCCGAAAGCACAGCCCTGCCACCCTGTGAGCTGGAAACCACCGTGGTCTCCTCCTCAGACCTGCATTCTCAAGAGGTGGTTTCAGATGATTTTTTGTTGAAAAATGATACCTCCTCCGCAGAGGCTCATGCTGCTCCTGAGAAGCCCCCAGACATGCAGCACAGAAGCTCAGTCCAGACGCAAGGTGAAGTGATCACACTACTGCTGTCCAAGGCCCAGAGTGCTGGGTCAGATCAGGAAAGCCATGGCGCCCAGAGCCCCCTAGGGGAAGGGCAGAACATGGCTGTGCTTTCAGCTGGTGACCCAGATCCCAGCAGGTGTCTCAGGTCAAACCCAGCTGAGGCCTCAGACCTCCTCCCTCCAGTAGCTGGTGGTGGGGACACCATCACACATCAGCCTGACTCTTGCAAAGCTGCCCCTGAGCACCGGTCAGGCATCACCGCTTTCATGAAGGTCCTGAACAGTTTACAGAAGAAGCAAATGAACACCAGCTTGTGTGAGCGGATCCGGAAGGTTTATGGAGACCTGGAGTGTGAATACTGTG
SEQ ID NO:836 ZFAT之外顯子7
GCAAACTTTTTTGGTACCAAGTGCATTTTGATATGCATGTCCGCACCCACACCCGGGAACATCTGTATTATTGCTCTCAGTGTCATTATTCTTCCATCACCAAAAACTGCCTTAAACGCCACGTAATTCAGAAACACAGTAACATCTTGCTGAAGTGTCCCACCGATGGCTGTGACTACTCAACTCCAGATAAATATAAGCTACAGGCACATCTTAAAGTTCACACAGCACTG
SEQ ID NO:837 ZFAT之外顯子8
GACAAAAGGAGTTATTCTTGTCCTGTTTGTGAAAAGTCTTTTTCAGAGGATCGATTGATAAAGTCACATATCAAGACCAACCATCCTG
SEQ ID NO:838 ZFAT之外顯子9
AGGTCTCCATGAGCACCATTTCTGAGGTTCTCGGGAGGAGGGTTCAGCTGAAAGGGCTAATTGGAAAGAGAGCCATGAAATGCCCATATTGTGACTTTTATTTCATGAAGAATGGCTCAGACCTTCAGCGTCATATTTGGGCTCATGAAG
SEQ ID NO:839 ZFAT之外顯子10
GTGTGAAGCCCTTCAAGTGTTCTTTGTGTGAGTATGCAACTCGTAGCAAGAGTAACCTCAAGGCTCATATGAATCGTCACAGCACTGAGAAAACCCACCTATGTGACATGTGTGGCAAGAAATTCAAATCAAAAGGGACACTGAAAAGTCACAAACTCCTTCACACTGCAGATG
SEQ ID NO:840 ZFAT之外顯子11
GGAAGCAGTTTAAGTGCACGGTGTGTGACTACACAGCGGCCCAGAAGCCACAGCTGCTGCGGCACATGGAACAGCATGTCTCCTTCAAG
SEQ ID NO:841 ZFAT之外顯子12
CCTTTCCGCTGTGCCCATTGCCATTACTCCTGCAACATATCTGGCTCTCTGAAGCGGCACTACAACAGGAAGCACCCTAATGAGGAGTATGCCAACGTGGGCACCGGGGAGCTGGCAGCGGAGGTGCTCATCCAGCAAG
SEQ ID NO:842 ZFAT之外顯子13
GTGGTTTGAAGTGTCCTGTTTGCAGCTTTGTATATGGCACCAAATGGGAGTTCAATAGGCACTTGAAGAACAAACATGGCTTGAAGGTGGTGGAAATTGATGGAGACCCCAAGTGGGAG
SEQ ID NO:843 ZFAT之外顯子14
ACAGCAACAGAAGCTCCTGAGGAGCCCTCCACCCAGTATCTCCACATCACAGAGGCCGAAGAAGACGTTCAAGGGACACAGGCAGCGGTGGCCGCGCTCCAGGACCTGAGATACACCTCTGAGAGTG
SEQ ID NO:844 ZFAT之外顯子15
GCGACCGACTGGACCCCACGGCCGTGAACATCCTGCAGCAGATCATTGAGCTGGGCGCCGAGACCCATGACGCCACTGCCCTTGCCTCGGTGGTTGCCATGGCACCAGGGACGGTGACTGTGGTTAAGCAG
SEQ ID NO:845 ZFAT之外顯子16
GTCACCGAGGAGGAGCCCAGCTCCAACCACACGGTCATGATCCAGGAGACGGTCCAGCAAGCGTCCGTGGAGCTTGCCGAGCAGCACCACCTGGTGGTGTCCTCCGACGACGTGGAGGGCATTGAGACGGTGACTGTCTACACGCAGGGCGGGGAGGCCTCGGAGTTCATCGTCTACGTGCAGGAGGCCATGCAGCCTGTGGAGGAGCAGGCTGTGGAGCAGCCGGCCCAGGAACTCTAGAGGACATGTGGCATCGGATGGCCACAGGGCGGGGCTGCCAGGCTCTGCAGGCACCCAGGGTGGGGAGGCCACCCTTCCTGCCCTACCCGCAGAATGGTGCTCTCCTTTGCCCTCCCTGCCCAGCAGCCTGATAGGACTCTCCTAGTCCAACTTGGGGTGGGCAAGGCAGTCAGCATCACCAGCAATACCACAGGACCCTCACCCCAGCATAGACACACACCCCCTGACCCTTACCATCTGCTTCCTGAAAGACTTCAGTGTCAGCTCCCCTACACACACCCCACACCTTCACCCCTTGCTTCAAGATTCAAACAGAGACTCCCAGTCCCCCTCAGCATCTTCCCTGAATCACAGCCCCAGCTCCTTGACCCCCATCTAGGTGCCAAATGTTCATCTGCAACCGCTATGCAGTCTGGTGAGAGGGAGACAGCCATCACATAGAAAGTGACCGTACGGGTTTTTAATCACTGCTGGGTGGGGTGGGGGTAGGGGGATTGTCCTGGCTTTGTCGACAAAGTCCCACTTCCCCGAGTATTAAGGGCCCTTGGTATCAAGTGAGGTAAATTCACCCATCACAGGGTCTCGCCCTACCATCCTGGAATTATTTCACTTTTAAGATAAATGCACTATTTCACTGTTCGCCTCCCATTCTAAGGAGGTGAGGTGGTTGGAATAAAAACAGTTCCTGTCTGAA
SEQ ID NO:846 ZFAT之全mRNA多核苷酸序列
ATCCGCCATGTTGGATGCCGCAGATTCGCCATAACCTCGCCGGCTCTTTTCTTAAAAAAATAAAAATAAAAAGCGAAGCGTCAGCAGGGCGCCCCGCCCCCTCGGTCGGCACGGGAGGGGGCCCGGAAGAGCCCGAGGCTTTTTTTTCCTCCGCGGTGGGGCGTTGCCATGGAGACGCGGGCGGCAGAAAACACGGCCATCTTTATGTGTAAATGTTGTAACCTCTTCTCACCAAATCAGTCGGAACTCCTCTCCCACGTTTCAGAGAAGCACATGGAAGAAGGGGTTAATGTTGATGAGATTATTATTCCCCTTAGGCCTCTGAGTACACCTGAACCCCCCAACTCAAGCAAAACCGGAGATGAGTTTTTGGTCATGAAGAGGAAGAGAGGCAGGCCTAAGGGGTCCACGAAGAAGTCCAGCACAGAAGAGGAGCTGGCAGAAAACATCGTGAGTCCGACTGAGGACAGCCCGCTGGCTCCGGAGGAAGGGAACAGCCTGCCTCCAAGCAGCTTGGAGTGTAGCAAGTGCTGTCGGAAGTTCTCCAACACGCGCCAGCTGCGGAAGCACATCTGCATTATCGTGCTGAATTTGGGTGAGGAGGAAGGAGAAGCAGGTAACGAGTCTGACCTTGAACTAGAAAAGAAGTGTAAGGAAGATGATCGGGAAAAAGCCTCGAAAAGACCACGGTCACAGAAAACAGAGAAAGTCCAGAAGATCTCAGGAAAGGAGGCCAGACAGCTTTCTGGGGCGAAGAAACCCATCATAAGTGTGGTTTTAACTGCACACGAAGCAATTCCAGGTGCTACCAAGATTGTGCCAGTGGAGGCTGGGCCCCCTGAAACAGGAGCTACAAATTCTGAGACCACTTCAGCAGACCTGGTGCCTCGGAGAGGCTACCAGGAATACGCCATTCAGCAGACACCTTATGAGCAACCAATGAAGTCAAGCAGGCTAGGTCCCACTCAGCTCAAAATCTTCACTTGTGAATACTGCAACAAGGTCTTCAAGTTCAAGCACTCGCTGCAGGCCCACCTGAGGATCCACACCAATGAAAAGCCATACAAGTGCCCCCAGTGCAGCTATGCCAGTGCCATCAAGGCCAACCTCAATGTGCACCTGCGCAAGCACACTGGAGAGAAGTTCGCCTGCGACTATTGCTCGTTCACCTGCCTGAGCAAGGGCCACCTCAAGGTGCACATCGAGCGAGTGCACAAGAAGATCAAGCAGCACTGCCGCTTCTGCAAGAAGAAGTACTCTGACGTCAAGAACCTCATCAAGCACATCCGAGACGCGCATGACCCACAGGACAAGAAGGTCAAAGAGGCCTTGGACGAGCTCTGCCTGATGACGAGGGAGGGCAAGCGGCAGCTGCTCTATGACTGCCACATCTGTGAGCGCAAGTTCAAGAACGAGCTGGACCGTGACCGCCATATGCTGGTCCACGGAGACAAGTGGCCTTTTGCCTGTGAGCTCTGTGGCCATGGGGCCACCAAGTACCAGGCGCTGGAACTGCATGTCAGGAAGCACCCCTTCGTGTACGTCTGTGCCGTCTGCCGCAAGAAGTTCGTCAGCTCCATCAGGCTGCGCACCCACATCAAAGAGGTGCACGGGGCTGCCCAGGAGGCCTTGGTCTTCACCAGTTCCATCAACCAGAGCTTCTGCCTCCTGGAACCTGGTGGGGACATCCAGCAAGAAGCTCTGGGGGACCAGCTACAGCTGGTGGAAGAGGAGTTTGCCCTCCAGGGCGTGAATGCACTCAAGGAAGAGGCCTGTCCTGGGGACACTCAGCTGGAGGAGGGCCGGAAGGAGCCGGAGGCCCCTGGGGAAATGCCTGCCCCAGCTGTGCACCTGGCCTCCCCGCAGGCCGAAAGCACAGCCCTGCCACCCTGTGAGCTGGAAACCACCGTGGTCTCCTCCTCAGACCTGCATTCTCAAGAGGTGGTTTCAGATGATTTTTTGTTGAAAAATGATACCTCCTCCGCAGAGGCTCATGCTGCTCCTGAGAAGCCCCCAGACATGCAGCACAGAAGCTCAGTCCAGACGCAAGGTGAAGTGATCACACTACTGCTGTCCAAGGCCCAGAGTGCTGGGTCAGATCAGGAAAGCCATGGCGCCCAGAGCCCCCTAGGGGAAGGGCAGAACATGGCTGTGCTTTCAGCTGGTGACCCAGATCCCAGCAGGTGTCTCAGGTCAAACCCAGCTGAGGCCTCAGACCTCCTCCCTCCAGTAGCTGGTGGTGGGGACACCATCACACATCAGCCTGACTCTTGCAAAGCTGCCCCTGAGCACCGGTCAGGCATCACCGCTTTCATGAAGGTCCTGAACAGTTTACAGAAGAAGCAAATGAACACCAGCTTGTGTGAGCGGATCCGGAAGGTTTATGGAGACCTGGAGTGTGAATACTGTGGCAAACTTTTTTGGTACCAAGTGCATTTTGATATGCATGTCCGCACCCACACCCGGGAACATCTGTATTATTGCTCTCAGTGTCATTATTCTTCCATCACCAAAAACTGCCTTAAACGCCACGTAATTCAGAAACACAGTAACATCTTGCTGAAGTGTCCCACCGATGGCTGTGACTACTCAACTCCAGATAAATATAAGCTACAGGCACATCTTAAAGTTCACACAGCACTGGACAAAAGGAGTTATTCTTGTCCTGTTTGTGAAAAGTCTTTTTCAGAGGATCGATTGATAAAGTCACATATCAAGACCAACCATCCTGAGGTCTCCATGAGCACCATTTCTGAGGTTCTCGGGAGGAGGGTTCAGCTGAAAGGGCTAATTGGAAAGAGAGCCATGAAATGCCCATATTGTGACTTTTATTTCATGAAGAATGGCTCAGACCTTCAGCGTCATATTTGGGCTCATGAAGGTGTGAAGCCCTTCAAGTGTTCTTTGTGTGAGTATGCAACTCGTAGCAAGAGTAACCTCAAGGCTCATATGAATCGTCACAGCACTGAGAAAACCCACCTATGTGACATGTGTGGCAAGAAATTCAAATCAAAAGGGACACTGAAAAGTCACAAACTCCTTCACACTGCAGATGGGAAGCAGTTTAAGTGCACGGTGTGTGACTACACAGCGGCCCAGAAGCCACAGCTGCTGCGGCACATGGAACAGCATGTCTCCTTCAAGCCTTTCCGCTGTGCCCATTGCCATTACTCCTGCAACATATCTGGCTCTCTGAAGCGGCACTACAACAGGAAGCACCCTAATGAGGAGTATGCCAACGTGGGCACCGGGGAGCTGGCAGCGGAGGTGCTCATCCAGCAAGGTGGTTTGAAGTGTCCTGTTTGCAGCTTTGTATATGGCACCAAATGGGAGTTCAATAGGCACTTGAAGAACAAACATGGCTTGAAGGTGGTGGAAATTGATGGAGACCCCAAGTGGGAGACAGCAACAGAAGCTCCTGAGGAGCCCTCCACCCAGTATCTCCACATCACAGAGGCCGAAGAAGACGTTCAAGGGACACAGGCAGCGGTGGCCGCGCTCCAGGACCTGAGATACACCTCTGAGAGTGGCGACCGACTGGACCCCACGGCCGTGAACATCCTGCAGCAGATCATTGAGCTGGGCGCCGAGACCCATGACGCCACTGCCCTTGCCTCGGTGGTTGCCATGGCACCAGGGACGGTGACTGTGGTTAAGCAGGTCACCGAGGAGGAGCCCAGCTCCAACCACACGGTCATGATCCAGGAGACGGTCCAGCAAGCGTCCGTGGAGCTTGCCGAGCAGCACCACCTGGTGGTGTCCTCCGACGACGTGGAGGGCATTGAGACGGTGACTGTCTACACGCAGGGCGGGGAGGCCTCGGAGTTCATCGTCTACGTGCAGGAGGCCATGCAGCCTGTGGAGGAGCAGGCTGTGGAGCAGCCGGCCCAGGAACTCTAGAGGACATGTGGCATCGGATGGCCACAGGGCGGGGCTGCCAGGCTCTGCAGGCACCCAGGGTGGGGAGGCCACCCTTCCTGCCCTACCCGCAGAATGGTGCTCTCCTTTGCCCTCCCTGCCCAGCAGCCTGATAGGACTCTCCTAGTCCAACTTGGGGTGGGCAAGGCAGTCAGCATCACCAGCAATACCACAGGACCCTCACCCCAGCATAGACACACACCCCCTGACCCTTACCATCTGCTTCCTGAAAGACTTCAGTGTCAGCTCCCCTACACACACCCCACACCTTCACCCCTTGCTTCAAGATTCAAACAGAGACTCCCAGTCCCCCTCAGCATCTTCCCTGAATCACAGCCCCAGCTCCTTGACCCCCATCTAGGTGCCAAATGTTCATCTGCAACCGCTATGCAGTCTGGTGAGAGGGAGACAGCCATCACATAGAAAGTGACCGTACGGGTTTTTAATCACTGCTGGGTGGGGTGGGGGTAGGGGGATTGTCCTGGCTTTGTCGACAAAGTCCCACTTCCCCGAGTATTAAGGGCCCTTGGTATCAAGTGAGGTAAATTCACCCATCACAGGGTCTCGCCCTACCATCCTGGAATTATTTCACTTTTAAGATAAATGCACTATTTCACTGTTCGCCTCCCATTCTAAGGAGGTGAGGTGGTTGGAATAAAAACAGTTCCTGTCTGAA
SEQ ID NO:847 ZFAT之外顯子1的轉譯多肽序列
METRA
SEQ ID NO:848 ZFAT之外顯子2的轉譯多肽序列
NTAIFMCKCCNLFSPNQSELLSHVSEKHMEEGVNVDEIIIPLRPLSTPEPPNSSKTGD
SEQ ID NO:849 ZFAT之外顯子3的轉譯多肽序列
FLVMKRKRGRPKGSTKKSSTEEELAENIVSPTEDSPLAPEEGNSLPPSSLECSKCCRKFSNTRQLRKHICIIVLNLGEEEGEA
SEQ ID NO:850 ZFAT之外顯子4的轉譯多肽序列
NESDLELEKKCKEDDREKASKRPRSQKTEKVQKISGKEARQLSGAKKPIISVVLTAHEAIP
SEQ ID NO:851 ZFAT之外顯子5的轉譯多肽序列
ATKIVPVEAGPPETGATNSETTSADLVPRRGYQEYAIQQTPYEQPMKSS
SEQ ID NO:852 ZFAT之外顯子6的轉譯多肽序列
LGPTQLKIFTCEYCNKVFKFKHSLQAHLRIHTNEKPYKCPQCSYASAIKANLNVHLRKHTGEKFACDYCSFTCLSKGHLKVHIERVHKKIKQHCRFCKKKYSDVKNLIKHIRDAHDPQDKKVKEALDELCLMTREGKRQLLYDCHICERKFKNELDRDRHMLVHGDKWPFACELCGHGATKYQALELHVRKHPFVYVCAVCRKKFVSSIRLRTHIKEVHGAAQEALVFTSSINQSFCLLEPGGDIQQEALGDQLQLVEEEFALQGVNALKEEACPGDTQLEEGRKEPEAPGEMPAPAVHLASPQAESTALPPCELETTVVSSSDLHSQEVVSDDFLLKNDTSSAEAHAAPEKPPDMQHRSSVQTQGEVITLLLSKAQSAGSDQESHGAQSPLGEGQNMAVLSAGDPDPSRCLRSNPAEASDLLPPVAGGGDTITHQPDSCKAAPEHRSGITAFMKVLNSLQKKQMNTSLCERIRKVYGDLECEYC
SEQ ID NO:853 ZFAT之外顯子7的轉譯多肽序列
KLFWYQVHFDMHVRTHTREHLYYCSQCHYSSITKNCLKRHVIQKHSNILLKCPTDGCDYSTPDKYKLQAHLKVHTAL
SEQ ID NO:854 ZFAT之外顯子8的轉譯多肽序列
DKRSYSCPVCEKSFSEDRLIKSHIKTNHP
SEQ ID NO:855 ZFAT之外顯子9的轉譯多肽序列
VSMSTISEVLGRRVQLKGLIGKRAMKCPYCDFYFMKNGSDLQRHIWAHE
SEQ ID NO:856 ZFAT之外顯子10的轉譯多肽序列
VKPFKCSLCEYATRSKSNLKAHMNRHSTEKTHLCDMCGKKFKSKGTLKSHKLLHTAD
SEQ ID NO:857 ZFAT之外顯子11的轉譯多肽序列
KQFKCTVCDYTAAQKPQLLRHMEQHVSFK
SEQ ID NO:858 ZFAT之外顯子12的轉譯多肽序列
PFRCAHCHYSCNISGSLKRHYNRKHPNEEYANVGTGELAAEVLIQQ
SEQ ID NO:859 ZFAT之外顯子13的轉譯多肽序列
GLKCPVCSFVYGTKWEFNRHLKNKHGLKVVEIDGDPKWE
SEQ ID NO:860 ZFAT之外顯子14的轉譯多肽序列
TATEAPEEPSTQYLHITEAEEDVQGTQAAVAALQDLRYTSES
SEQ ID NO:861 ZFAT之外顯子15的轉譯多肽序列
DRLDPTAVNILQQIIELGAETHDATALASVVAMAPGTVTVVKQ
SEQ ID NO:862 ZFAT之外顯子16的轉譯多肽序列
VTEEEPSSNHTVMIQETVQQASVELAEQHHLVVSSDDVEGIETVTVYTQGGEASEFIVYVQEAMQPVEEQAVEQPAQEL
SEQ ID NO:863 ZFAT之全蛋白質序列
METRAAENTAIFMCKCCNLFSPNQSELLSHVSEKHMEEGVNVDEIIIPLRPLSTPEPPNSSKTGDEFLVMKRKRGRPKGSTKKSSTEEELAENIVSPTEDSPLAPEEGNSLPPSSLECSKCCRKFSNTRQLRKHICIIVLNLGEEEGEAGNESDLELEKKCKEDDREKASKRPRSQKTEKVQKISGKEARQLSGAKKPIISVVLTAHEAIPGATKIVPVEAGPPETGATNSETTSADLVPRRGYQEYAIQQTPYEQPMKSSRLGPTQLKIFTCEYCNKVFKFKHSLQAHLRIHTNEKPYKCPQCSYASAIKANLNVHLRKHTGEKFACDYCSFTCLSKGHLKVHIERVHKKIKQHCRFCKKKYSDVKNLIKHIRDAHDPQDKKVKEALDELCLMTREGKRQLLYDCHICERKFKNELDRDRHMLVHGDKWPFACELCGHGATKYQALELHVRKHPFVYVCAVCRKKFVSSIRLRTHIKEVHGAAQEALVFTSSINQSFCLLEPGGDIQQEALGDQLQLVEEEFALQGVNALKEEACPGDTQLEEGRKEPEAPGEMPAPAVHLASPQAESTALPPCELETTVVSSSDLHSQEVVSDDFLLKNDTSSAEAHAAPEKPPDMQHRSSVQTQGEVITLLLSKAQSAGSDQESHGAQSPLGEGQNMAVLSAGDPDPSRCLRSNPAEASDLLPPVAGGGDTITHQPDSCKAAPEHRSGITAFMKVLNSLQKKQMNTSLCERIRKVYGDLECEYCGKLFWYQVHFDMHVRTHTREHLYYCSQCHYSSITKNCLKRHVIQKHSNILLKCPTDGCDYSTPDKYKLQAHLKVHTALDKRSYSCPVCEKSFSEDRLIKSHIKTNHPEVSMSTISEVLGRRVQLKGLIGKRAMKCPYCDFYFMKNGSDLQRHIWAHEGVKPFKCSLCEYATRSKSNLKAHMNRHSTEKTHLCDMCGKKFKSKGTLKSHKLLHTADGKQFKCTVCDYTAAQKPQLLRHMEQHVSFKPFRCAHCHYSCNISGSLKRHYNRKHPNEEYANVGTGELAAEVLIQQGGLKCPVCSFVYGTKWEFNRHLKNKHGLKVVEIDGDPKWETATEAPEEPSTQYLHITEAEEDVQGTQAAVAALQDLRYTSESGDRLDPTAVNILQQIIELGAETHDATALASVVAMAPGTVTVVKQVTEEEPSSNHTVMIQETVQQASVELAEQHHLVVSSDDVEGIETVTVYTQGGEASEFIVYVQEAMQPVEEQAVEQPAQEL
SEQ ID NO:864 ZFAT之全部外顯子1-12按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:865 ZFAT之全部外顯子1-12按順序排列的轉譯多肽序列
DSCAML1 序列資訊SEQ ID NO:866 來自DSCAML1-NRG1融合物5’處之DSCAML1外顯子3的序列
GCCTCATCCCCTCTTCAGTGCAGGAATATGTTAGCGTTGTATCTTGGGAGAAAGACACAGTCTCCATCATCCCAG
SEQ ID NO:867 DSCAML1-NRG1融合物3’處之NRG1外顯子2序列
CCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA
SEQ ID NO:868 DSCAML1-NRG1多核苷酸序列
GCCTCATCCCCTCTTCAGTGCAGGAATATGTTAGCGTTGTATCTTGGGAGAAAGACACAGTCTCCATCATCCCAGCCTTGCCTCCCCGATTGAAAGAGATGAAAAGCCAGGAATCGGCTGCAGGTTCCAAACTAGTCCTTCGGTGTGAAA
SEQ ID NO:869 DSCAML1-NRG1多肽序列
LIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPALPPRLKEMKSQESAAGSKLVLRCE
SEQ ID NO:870 DSCAML1之外顯子1
AGCCGAGCGCTGGGCTGAGGAGCAGAGAGAGCGGGGCGCCGAGTGCGGGCGGCTGGGAGCGCGCTGAGCGGGGGAGAGGCGCTGCCGCACGGCCGGCCACAGGACCACCTCCCCGGAGAATAGGGCCTCTTTATGGCATGTGGCTGGTAACTTTCCTCCTGCTCCTGGACTCTTTACACAAAG
SEQ ID NO:871 DSCAML1之外顯子2
CCCGCCCTGAAGATGTTGGCACCAGCCTCTACTTTGTAAATGACTCCTTGCAGCAGGTGACCTTTTCCAGCTCCGTGGGGGTGGTGGTGCCCTGCCCGGCCGCGGGCTCCCCCAGCGCGGCCCTTCGATGGTACCTGGCCACAGGGGACGACATCTACGACGTGCCGCACATCCGGCACGTCCACGCCAACGGGACGCTGCAGCTCTACCCCTTCTCCCCCTCCGCCTTCAATAGCTTTATCCACGACAATGACTACTTCTGCACCGCGGAGAACGCTGCCGGCAAGATCCGGAGCCCCAACATCCGCGTCAAAGCAG
SEQ ID NO:872 DSCAML1之外顯子3
TTTTCAGGGAACCCTACACCGTCCGGGTGGAGGATCAAAGGTCAATGCGTGGCAACGTGGCCGTCTTCAAGTGCCTCATCCCCTCTTCAGTGCAGGAATATGTTAGCGTTGTATCTTGGGAGAAAGACACAGTCTCCATCATCCCAG
SEQ ID NO:873 DSCAML1之外顯子4
AACACAGGTTTTTTATTACCTACCACGGCGGGCTGTACATCTCTGACGTACAGAAGGAGGACGCCCTCTCCACCTATCGCTGCATCACCAAGCACAAGTATAGCGGGGAGACCCGGCAGAGCAATGGGGCACGCCTCTCTGTGACAG
SEQ ID NO:874 DSCAML1之外顯子5
ACCCTGCTGAGTCGATCCCCACCATCCTGGATGGCTTCCACTCCCAGGAAGTGTGGGCCGGCCACACCGTGGAGCTGCCCTGCACCGCCTCGGGCTACCCTATCCCCGCCATCCGCTGGCTCAAGGATGGCCGGCCCCTCCCGGCTGACAGCCGCTGGACCAAGCGCATCACAGGGCTGACCATCAGCGACTTGCGGACCGAGGACAGCGGCACCTACATTTGTGAGGTCACCAACACCTTCGGTTCGGCAGAGGCCACAGGCATCCTCATGGTCATTG
SEQ ID NO:875 DSCAML1之外顯子6
ATCCCCTTCATGTGACCCTGACACCAAAGAAGCTGAAGACCGGCATTGGCAGCACGGTCATCCTCTCCTGTGCCCTGACGGGCTCCCCAGAGTTCACCATCCGCTGGTATCGCAACACGGAGCTGGTGCTGCCTGACGAGGCCATCTCCATCCGCGGGCTCAGCAACGAGACGCTGCTCATCACCTCGGCCCAGAAGAGCCATTCCGGGGCCTACCAGTGCTTCGCTACCCGCAAGGCCCAGACCGCCCAGGACTTTGCCATCATTGCACTTGAGG
SEQ ID NO:876 DSCAML1之外顯子7
ATGGCACGCCCCGCATCGTCTCGTCCTTCAGCGAGAAGGTGGTCAACCCCGGGGAGCAGTTCTCACTGATGTGTGCGGCCAAGGGCGCCCCGCCCCCCACGGTCACCTGGGCCCTCGACGATGAGCCCATCGTGCGGGATGGCAGCCACCGCACCAACCAGTACACCATGTCGGACGGCACCACCATCAGCCACATGAACGTCACAGGCCCCCAGATCCGCGACGGGGGCGTGTACCGGTGCACAGCGCGGAACTTGGTGGGCAGTGCTGAATATCAGGCGCGAATAAACGTAAGAG
SEQ ID NO:877 DSCAML1之外顯子8
GCCCACCCAGCATCCGGGCTATGCGGAACATCACAGCAGTCGCCGGGCGGGACACCCTTATCAACTGCAGGGTCATCGGCTATCCCTACTACTCCATCAAGTGGTACAAGGATGCCCTGCTGCTGCCAGACAACCACCGCCAGGTGGTGTTTGAGAATGGGACCCTCAAGCTGACTGACGTGCAGAAGGGCATGGATGAGGGGGAGTACCTGTGCAGTGTCCTCATCCAGCCCCAGCTCTCCATCAGCCAGAGCGTTCACGTAGCCGTCAAAG
SEQ ID NO:878 DSCAML1之外顯子9
TGCCCCCTCTGATCCAGCCCTTCGAATTCCCACCCGCCTCCATCGGCCAGCTGCTCTACATTCCCTGTGTGGTGTCCTCGGGGGACATGCCCATCCGTATCACCTGGAGGAAGGACGGACAGGTGATCATCTCAGGCTCGGGCGTGACCATCGAGAGCAAGGAATTCATGAGCTCCCTGCAGATCTCTAGCGTCTCCCTCAAGCACAACGGCAACTATACATGCATCGCCAGCAACGCAGCCGCCACCGTGAGCCGGGAGCGCCAGCTCATCGTGCGTG
SEQ ID NO:879 DSCAML1之外顯子10
TGCCCCCTCGATTTGTGGTGCAACCCAACAACCAGGATGGCATCTACGGCAAAGCTGGTGTGCTCAACTGCTCGGTGGACGGCTACCCCCCACCCAAGGTCATGTGGAAGCATGCCAAGG
SEQ ID NO:880 DSCAML1之外顯子11
GGAGCGGGAACCCCCAGCAGTACCACCCTGTGCCCCTCACTGGCCGCATCCAGATCCTGCCCAACAGCTCGCTGCTGATCCGCCACGTCCTAGAAGAGGACATCGGCTACTACCTCTGCCAGGCCAGCAACGGCGTAGGCACCGACATCAGCAAGTCCATGTTCCTCACAGTCAAGA
SEQ ID NO:881 DSCAML1之外顯子12
TCCCGGCCATGATCACTTCCCACCCCAACACCACCATCGCCATCAAGGGCCATGCGAAGGAGCTAAACTGCACGGCACGGGGTGAGCGGCCCATCATCATCCGCTGGGAGAAGGGGGACACAGTCATCGACCCTGACCGCGTCATGCGGTATGCCATCGCCACCAAGGACAACGGCGACGAGGTCGTCTCCACACTGAAG
SEQ ID NO:882 DSCAML1之外顯子13
CTCAAGCCCGCTGACCGTGGGGACTCTGTGTTCTTCAGCTGCCATGCCATCAACTCGTATGGGGAGGACCGGGGCTTGATCCAACTCACTGTGCAAG
SEQ ID NO:883 DSCAML1之外顯子14
AGCCCCCCGACCCCCCAGAGCTGGAGATCCGGGAGGTGAAGGCCCGGAGCATGAACCTGCGCTGGACCCAGCGATTCGACGGGAACAGCATCATCACGGGCTTCGACATTGAATACAAGAACAAATCAG
SEQ ID NO:884 DSCAML1之外顯子15
ATTCCTGGGACTTCAAGCAGTCCACACGCAACATCTCCCCCACCATCAACCAGGCCAACATTGTGGACTTGCACCCGGCATCTGTGTACAGCATCCGCATGTACTCTTTCAACAAGATTGGCCGCAGTGAACCAAGCAAGGAGCTCACCATCAGCACTGAGGAGGCCG
SEQ ID NO:885 DSCAML1之外顯子16
CTCCCGATGGGCCCCCCATGGATGTTACCTTGCAGCCAGTGACCTCACAGAGCATCCAGGTGACCTGGAAG
SEQ ID NO:886 DSCAML1之外顯子17
GCACCCAAGAAGGAGCTGCAGAACGGTGTCATCCGGGGCTACCAGATTGGCTACAGAGAGAACAGCCCCGGCAGCAACGGGCAGTACAGCATCGTGGAGATGAAGGCCACGGGGGACAGCGAGGTCTACACCCTGGACAACCTCAAGAAGTTCGCCCAGTATGGGGTGGTGGTCCAAGCCTTCAATCGGGCTGGCACGGGGCCCTCTTCCAGCGAGATCAATGCCACCACTCTGGAGGATG
SEQ ID NO:887 DSCAML1之外顯子18
TGCCCAGCCAGCCCCCTGAGAACGTCCGGGCCCTGTCCATCACTTCTGACGTGGCCGTCATCTCCTGGTCAGAGCCCCCGCGCAGCACCCTCAATGGCGTCCTCAAAGGCTATCGGGTCATCTTCTGGTCCCTCTATGTTGATGGGG
SEQ ID NO:888 DSCAML1之外顯子19
AGTGGGGCGAGATGCAGAACATCACCACCACGCGGGAGCGGGTGGAGCTGCGGGGCATGGAGAAGTTCACCAACTACAGCGTCCAGGTGCTGGCCTACACCCAGGCTGGGGACGGCGTACGCAGCAGTGTGCTCTACATCCAGACCAAGGAGGACG
SEQ ID NO:889 DSCAML1之外顯子20
TTCCAGGTCCCCCTGCTGGCATCAAAGCTGTCCCTTCATCAGCTAGCAGTGTGGTTGTGTCTTGGCTCCCCCCTACCAAGCCCAACGGGGTGATCCGCAAGTACACCATCTTCTGTTCCAGCCCCGGGTCTGGCCAGCCG
SEQ ID NO:890 DSCAML1之外顯子21
GCTCCCAGCGAGTACGAGACGAGTCCAGAGCAGCTCTTCTACCGGATCGCCCACCTAAACCGCGGTCAGCAGTATCTGCTGTGGGTGGCCGCCGTCACCTCTGCCGGCCGGGGCAACAGCAGCGAGAAGGTGACCATCGAGCCTGCTGGCAAGG
SEQ ID NO:891 DSCAML1之外顯子22
CCCCAGCAAAGATCATCTCCTTTGGGGGCACCGTGACAACACCTTGGATGAAAGATGTTCGGCTGCCTTGCAATTCAGTGGGAGATCCAGCCCCTGCTGTGAAGTGGACCAAGGACAG
SEQ ID NO:892 DSCAML1之外顯子23
TGAAGACTCGGCCATTCCAGTGTCCATGGATGGGCACCGGCTCATCCACACCAATGGCACACTGCTGCTGCGTGCAGTGAAGGCTGAGGACTCTGGCTACTACACGTGCACGGCCACCAACACTGGTGGCTTTGACACCATCATCGTCAACCTTCTGGTGCAAG
SEQ ID NO:893 DSCAML1之外顯子24
TTCCCCCGGACCAGCCCCGCCTCACTGTCTCCAAAACCTCAGCTTCGTCCATCACCCTGACCTGGATTCCAGGTGACAATGGGGGCAGCTCCATCCGAG
SEQ ID NO:894 DSCAML1之外顯子25
GCTTCGTGCTACAGTACTCGGTGGACAACAGCGAGGAGTGGAAGGATGTGTTCATCAGCTCCAGCGAGCGCTCCTTCAAGCTGGACAGCCTCAAGTGTGGCACGTGGTACAAGGTGAAGCTGGCAGCCAAGAACAGCGTGGGCTCTGGGCGCATCAGCGAGATCATCGAGGCCAAGACCCACGGGCGGG
SEQ ID NO:895 DSCAML1之外顯子26
AGCCCTCCTTCAGCAAAGACCAACACCTCTTCACCCACATCAACTCCACGCATGCTCGGCTTAACCTGCAGGGCTGGAACAATGGGGGCTGCCCTATCACAGCCATCGTTCTGGAGTACCGGCCCAAGGGGACCTGGGCCTGGCAGGGCCTCCGGGCCAACAGCTCCGGGGAGGTGTTTCTGACGGAACTGCGAGAGGCCACGTGGTACGAGCTGCGCATGAGGGCTTGCAACAGTGCGGGCTGCGGCAATGAAACAGCCCAGTTCGCCACCCTGGACTACGATGGCA
SEQ ID NO:896 DSCAML1之外顯子27
GCACCATTCCACCCATCAAGTCTGCTCAAGGTGAAGGGGATGATGTGAAGAAGCTGTTCACCATCGGCTGCCCTGTCATCCTGGCCACACTGGGGGTGGCACTGCTCTTCATCGTACGCAAGAAGAGGAAGGAGAAACGGCTGAAGCGACTCCGAG
SEQ ID NO:897 DSCAML1之外顯子28
ATGCAAAGAGTTTGGCAGAAATGTTGATAAG
SEQ ID NO:898 DSCAML1之外顯子29
CAAGAACAATAGAAGCTTTGACACCCCTGTGAAAGGGCCACCCCAGGGCCCACGGCTACACATTGACATCCCCAGGGTCCAGCTGCTCATCGAGGACAAAGAAGGCATCAAGCAACTGG
SEQ ID NO:899 DSCAML1之外顯子30
GAGATGACAAGGCCACCATCCCTGTGACAGATGCTGAGTTCAGCCAAGCTGTCAACCCACAGAGCTTCTGTACTGGCGTCTCCTTGCACCACCCAACCCTCATCCAGAGCACAGGACCCCTCATCGACATGTCTGACATCCGGCCAGGAACCA
SEQ ID NO:900 DSCAML1之外顯子31
ATCCAGTGTCCAGGAAGAATGTGAAGTCAGCCCACAGCACCCGGAACCGGTACTCAAGCCAGTGGACCCTGACCAAGTGCCAGGCCTCCACACCTGCCCGCACCCTCACCTCCGACTGGCGCACCGTGGGCTCCCAGCATGGTGTCACGGTCACTGAGAGTGACAGCTACAGTGCCAGCCTGTCCCAGGACACAG
SEQ ID NO:901 DSCAML1之外顯子32
ACAAAGGAAGGAACAGCATGGTGTCCACTGAGAGTGCCTCTTCCACCTACGAGGAGCTGGCCCGGGCCTATGAGCATGCCAAGCTGGAGGAGCAGCTGCAGCACGCCAAGTTTGAGATCACCGAGTGCTTCATCTCTGACAGTTCCTCTGACCAGATGACCACAGGCACCAACGAGAACGCCGACAGCATGACATCCATGAGCACACCCTCAGAGCCTGGCATCTGCCGCTTTACCGCCTCACCACCCAAGCCCCAGGATGCGGACCGGGGCAAAAACGTGGCTGTGCCCATCCCTCACCGGGCCAACAAGA
SEQ ID NO:902 DSCAML1之外顯子33
GTGACTACTGCAACCTGCCCCTGTATGCCAAGTCAGAGGCCTTCTTTCGAAAGGCAGATGGACGTGAGCCCTGCCCCGTGGTCCCACCCCGTGAGGCCTCCATCCGGAACCTGGCTCGAACCTACCACACCCAGGCTCGCCACCTGACCCTGGACCCTGCCAGCAAGTCCTTGGGCCTTCCCCACCCAGGGGCCCCCGCTGCCGCCTCCACAGCCACCTTACCTCAGAGGACTCTGGCCATGCCAGCCCCCCCAGCCGGCACAGCCCCCCCAGCCCCCGGCCCCACCCCTGCTGAGCCACCCACCGCCCCCAGCGCTGCCCCTCCGGCCCCCAGCACCGAGCCTCCACGAGCCGGGGGCCCACACACCAAAATGGGGGGCTCCAGGGACTCGCTTCTCGAGATGAGCACATCGGGGGTAGGGAGGTCTCAGAAGCAGGGGGCCGGGGCCTACTCCAAATCCTACACCCTGGTGTAGGGCCCGCAGGAAGAGCAGCCACGCCTGGACCGCGCCGCGCCGCAGCCCCACACGCCAGCTCGGCTGTTTTTCTGCATTATTTATATTCAACTGACAGACAAAAACCAACCAACGACAAAACAAAAACCCCCAATCATGAACGCCTGTACATAGAACTCTTTTGTACAAATGAAACTATTTTCTTCTTCTCCATGAAGCCAGGGCACAAAGAATTTGACAGTACAAGTCAAATCCCCCACCCCACAAAATATGTGTGGAGATATATATACATATATAGACAGACAGGAACGCGTCCACGAGCTATATATCTATATATTTCTCTCACCCTATTTTGAGACAGAGGCACAAAGACTCAGCAATTTTTTTCCCTCCTCCTCACCTTCCCCCCAGTCTAGGTGGTTTTGACAAAGACCAAAATCCCAACTCAGAGACACTGCATGCGATTTTACTGTTCCAAGAAAACCAGGAGTTGCTTCAATTTGCAGATGCTTATGTGTTAATACCTTTTTCTATGAAAAAAGACCCAGCGCCGTGTGCAATAAAGGTTATGTTTCTA
SEQ ID NO:903 DSCAML1之全mRNA多核苷酸序列
AGCCGAGCGCTGGGCTGAGGAGCAGAGAGAGCGGGGCGCCGAGTGCGGGCGGCTGGGAGCGCGCTGAGCGGGGGAGAGGCGCTGCCGCACGGCCGGCCACAGGACCACCTCCCCGGAGAATAGGGCCTCTTTATGGCATGTGGCTGGTAACTTTCCTCCTGCTCCTGGACTCTTTACACAAAGCCCGCCCTGAAGATGTTGGCACCAGCCTCTACTTTGTAAATGACTCCTTGCAGCAGGTGACCTTTTCCAGCTCCGTGGGGGTGGTGGTGCCCTGCCCGGCCGCGGGCTCCCCCAGCGCGGCCCTTCGATGGTACCTGGCCACAGGGGACGACATCTACGACGTGCCGCACATCCGGCACGTCCACGCCAACGGGACGCTGCAGCTCTACCCCTTCTCCCCCTCCGCCTTCAATAGCTTTATCCACGACAATGACTACTTCTGCACCGCGGAGAACGCTGCCGGCAAGATCCGGAGCCCCAACATCCGCGTCAAAGCAGTTTTCAGGGAACCCTACACCGTCCGGGTGGAGGATCAAAGGTCAATGCGTGGCAACGTGGCCGTCTTCAAGTGCCTCATCCCCTCTTCAGTGCAGGAATATGTTAGCGTTGTATCTTGGGAGAAAGACACAGTCTCCATCATCCCAGAACACAGGTTTTTTATTACCTACCACGGCGGGCTGTACATCTCTGACGTACAGAAGGAGGACGCCCTCTCCACCTATCGCTGCATCACCAAGCACAAGTATAGCGGGGAGACCCGGCAGAGCAATGGGGCACGCCTCTCTGTGACAGACCCTGCTGAGTCGATCCCCACCATCCTGGATGGCTTCCACTCCCAGGAAGTGTGGGCCGGCCACACCGTGGAGCTGCCCTGCACCGCCTCGGGCTACCCTATCCCCGCCATCCGCTGGCTCAAGGATGGCCGGCCCCTCCCGGCTGACAGCCGCTGGACCAAGCGCATCACAGGGCTGACCATCAGCGACTTGCGGACCGAGGACAGCGGCACCTACATTTGTGAGGTCACCAACACCTTCGGTTCGGCAGAGGCCACAGGCATCCTCATGGTCATTGATCCCCTTCATGTGACCCTGACACCAAAGAAGCTGAAGACCGGCATTGGCAGCACGGTCATCCTCTCCTGTGCCCTGACGGGCTCCCCAGAGTTCACCATCCGCTGGTATCGCAACACGGAGCTGGTGCTGCCTGACGAGGCCATCTCCATCCGCGGGCTCAGCAACGAGACGCTGCTCATCACCTCGGCCCAGAAGAGCCATTCCGGGGCCTACCAGTGCTTCGCTACCCGCAAGGCCCAGACCGCCCAGGACTTTGCCATCATTGCACTTGAGGATGGCACGCCCCGCATCGTCTCGTCCTTCAGCGAGAAGGTGGTCAACCCCGGGGAGCAGTTCTCACTGATGTGTGCGGCCAAGGGCGCCCCGCCCCCCACGGTCACCTGGGCCCTCGACGATGAGCCCATCGTGCGGGATGGCAGCCACCGCACCAACCAGTACACCATGTCGGACGGCACCACCATCAGCCACATGAACGTCACAGGCCCCCAGATCCGCGACGGGGGCGTGTACCGGTGCACAGCGCGGAACTTGGTGGGCAGTGCTGAATATCAGGCGCGAATAAACGTAAGAGGCCCACCCAGCATCCGGGCTATGCGGAACATCACAGCAGTCGCCGGGCGGGACACCCTTATCAACTGCAGGGTCATCGGCTATCCCTACTACTCCATCAAGTGGTACAAGGATGCCCTGCTGCTGCCAGACAACCACCGCCAGGTGGTGTTTGAGAATGGGACCCTCAAGCTGACTGACGTGCAGAAGGGCATGGATGAGGGGGAGTACCTGTGCAGTGTCCTCATCCAGCCCCAGCTCTCCATCAGCCAGAGCGTTCACGTAGCCGTCAAAGTGCCCCCTCTGATCCAGCCCTTCGAATTCCCACCCGCCTCCATCGGCCAGCTGCTCTACATTCCCTGTGTGGTGTCCTCGGGGGACATGCCCATCCGTATCACCTGGAGGAAGGACGGACAGGTGATCATCTCAGGCTCGGGCGTGACCATCGAGAGCAAGGAATTCATGAGCTCCCTGCAGATCTCTAGCGTCTCCCTCAAGCACAACGGCAACTATACATGCATCGCCAGCAACGCAGCCGCCACCGTGAGCCGGGAGCGCCAGCTCATCGTGCGTGTGCCCCCTCGATTTGTGGTGCAACCCAACAACCAGGATGGCATCTACGGCAAAGCTGGTGTGCTCAACTGCTCGGTGGACGGCTACCCCCCACCCAAGGTCATGTGGAAGCATGCCAAGGGGAGCGGGAACCCCCAGCAGTACCACCCTGTGCCCCTCACTGGCCGCATCCAGATCCTGCCCAACAGCTCGCTGCTGATCCGCCACGTCCTAGAAGAGGACATCGGCTACTACCTCTGCCAGGCCAGCAACGGCGTAGGCACCGACATCAGCAAGTCCATGTTCCTCACAGTCAAGATCCCGGCCATGATCACTTCCCACCCCAACACCACCATCGCCATCAAGGGCCATGCGAAGGAGCTAAACTGCACGGCACGGGGTGAGCGGCCCATCATCATCCGCTGGGAGAAGGGGGACACAGTCATCGACCCTGACCGCGTCATGCGGTATGCCATCGCCACCAAGGACAACGGCGACGAGGTCGTCTCCACACTGAAGCTCAAGCCCGCTGACCGTGGGGACTCTGTGTTCTTCAGCTGCCATGCCATCAACTCGTATGGGGAGGACCGGGGCTTGATCCAACTCACTGTGCAAGAGCCCCCCGACCCCCCAGAGCTGGAGATCCGGGAGGTGAAGGCCCGGAGCATGAACCTGCGCTGGACCCAGCGATTCGACGGGAACAGCATCATCACGGGCTTCGACATTGAATACAAGAACAAATCAGATTCCTGGGACTTCAAGCAGTCCACACGCAACATCTCCCCCACCATCAACCAGGCCAACATTGTGGACTTGCACCCGGCATCTGTGTACAGCATCCGCATGTACTCTTTCAACAAGATTGGCCGCAGTGAACCAAGCAAGGAGCTCACCATCAGCACTGAGGAGGCCGCTCCCGATGGGCCCCCCATGGATGTTACCTTGCAGCCAGTGACCTCACAGAGCATCCAGGTGACCTGGAAGGCACCCAAGAAGGAGCTGCAGAACGGTGTCATCCGGGGCTACCAGATTGGCTACAGAGAGAACAGCCCCGGCAGCAACGGGCAGTACAGCATCGTGGAGATGAAGGCCACGGGGGACAGCGAGGTCTACACCCTGGACAACCTCAAGAAGTTCGCCCAGTATGGGGTGGTGGTCCAAGCCTTCAATCGGGCTGGCACGGGGCCCTCTTCCAGCGAGATCAATGCCACCACTCTGGAGGATGTGCCCAGCCAGCCCCCTGAGAACGTCCGGGCCCTGTCCATCACTTCTGACGTGGCCGTCATCTCCTGGTCAGAGCCCCCGCGCAGCACCCTCAATGGCGTCCTCAAAGGCTATCGGGTCATCTTCTGGTCCCTCTATGTTGATGGGGAGTGGGGCGAGATGCAGAACATCACCACCACGCGGGAGCGGGTGGAGCTGCGGGGCATGGAGAAGTTCACCAACTACAGCGTCCAGGTGCTGGCCTACACCCAGGCTGGGGACGGCGTACGCAGCAGTGTGCTCTACATCCAGACCAAGGAGGACGTTCCAGGTCCCCCTGCTGGCATCAAAGCTGTCCCTTCATCAGCTAGCAGTGTGGTTGTGTCTTGGCTCCCCCCTACCAAGCCCAACGGGGTGATCCGCAAGTACACCATCTTCTGTTCCAGCCCCGGGTCTGGCCAGCCGGCTCCCAGCGAGTACGAGACGAGTCCAGAGCAGCTCTTCTACCGGATCGCCCACCTAAACCGCGGTCAGCAGTATCTGCTGTGGGTGGCCGCCGTCACCTCTGCCGGCCGGGGCAACAGCAGCGAGAAGGTGACCATCGAGCCTGCTGGCAAGGCCCCAGCAAAGATCATCTCCTTTGGGGGCACCGTGACAACACCTTGGATGAAAGATGTTCGGCTGCCTTGCAATTCAGTGGGAGATCCAGCCCCTGCTGTGAAGTGGACCAAGGACAGTGAAGACTCGGCCATTCCAGTGTCCATGGATGGGCACCGGCTCATCCACACCAATGGCACACTGCTGCTGCGTGCAGTGAAGGCTGAGGACTCTGGCTACTACACGTGCACGGCCACCAACACTGGTGGCTTTGACACCATCATCGTCAACCTTCTGGTGCAAGTTCCCCCGGACCAGCCCCGCCTCACTGTCTCCAAAACCTCAGCTTCGTCCATCACCCTGACCTGGATTCCAGGTGACAATGGGGGCAGCTCCATCCGAGGCTTCGTGCTACAGTACTCGGTGGACAACAGCGAGGAGTGGAAGGATGTGTTCATCAGCTCCAGCGAGCGCTCCTTCAAGCTGGACAGCCTCAAGTGTGGCACGTGGTACAAGGTGAAGCTGGCAGCCAAGAACAGCGTGGGCTCTGGGCGCATCAGCGAGATCATCGAGGCCAAGACCCACGGGCGGGAGCCCTCCTTCAGCAAAGACCAACACCTCTTCACCCACATCAACTCCACGCATGCTCGGCTTAACCTGCAGGGCTGGAACAATGGGGGCTGCCCTATCACAGCCATCGTTCTGGAGTACCGGCCCAAGGGGACCTGGGCCTGGCAGGGCCTCCGGGCCAACAGCTCCGGGGAGGTGTTTCTGACGGAACTGCGAGAGGCCACGTGGTACGAGCTGCGCATGAGGGCTTGCAACAGTGCGGGCTGCGGCAATGAAACAGCCCAGTTCGCCACCCTGGACTACGATGGCAGCACCATTCCACCCATCAAGTCTGCTCAAGGTGAAGGGGATGATGTGAAGAAGCTGTTCACCATCGGCTGCCCTGTCATCCTGGCCACACTGGGGGTGGCACTGCTCTTCATCGTACGCAAGAAGAGGAAGGAGAAACGGCTGAAGCGACTCCGAGATGCAAAGAGTTTGGCAGAAATGTTGATAAGCAAGAACAATAGAAGCTTTGACACCCCTGTGAAAGGGCCACCCCAGGGCCCACGGCTACACATTGACATCCCCAGGGTCCAGCTGCTCATCGAGGACAAAGAAGGCATCAAGCAACTGGGAGATGACAAGGCCACCATCCCTGTGACAGATGCTGAGTTCAGCCAAGCTGTCAACCCACAGAGCTTCTGTACTGGCGTCTCCTTGCACCACCCAACCCTCATCCAGAGCACAGGACCCCTCATCGACATGTCTGACATCCGGCCAGGAACCAATCCAGTGTCCAGGAAGAATGTGAAGTCAGCCCACAGCACCCGGAACCGGTACTCAAGCCAGTGGACCCTGACCAAGTGCCAGGCCTCCACACCTGCCCGCACCCTCACCTCCGACTGGCGCACCGTGGGCTCCCAGCATGGTGTCACGGTCACTGAGAGTGACAGCTACAGTGCCAGCCTGTCCCAGGACACAGACAAAGGAAGGAACAGCATGGTGTCCACTGAGAGTGCCTCTTCCACCTACGAGGAGCTGGCCCGGGCCTATGAGCATGCCAAGCTGGAGGAGCAGCTGCAGCACGCCAAGTTTGAGATCACCGAGTGCTTCATCTCTGACAGTTCCTCTGACCAGATGACCACAGGCACCAACGAGAACGCCGACAGCATGACATCCATGAGCACACCCTCAGAGCCTGGCATCTGCCGCTTTACCGCCTCACCACCCAAGCCCCAGGATGCGGACCGGGGCAAAAACGTGGCTGTGCCCATCCCTCACCGGGCCAACAAGAGTGACTACTGCAACCTGCCCCTGTATGCCAAGTCAGAGGCCTTCTTTCGAAAGGCAGATGGACGTGAGCCCTGCCCCGTGGTCCCACCCCGTGAGGCCTCCATCCGGAACCTGGCTCGAACCTACCACACCCAGGCTCGCCACCTGACCCTGGACCCTGCCAGCAAGTCCTTGGGCCTTCCCCACCCAGGGGCCCCCGCTGCCGCCTCCACAGCCACCTTACCTCAGAGGACTCTGGCCATGCCAGCCCCCCCAGCCGGCACAGCCCCCCCAGCCCCCGGCCCCACCCCTGCTGAGCCACCCACCGCCCCCAGCGCTGCCCCTCCGGCCCCCAGCACCGAGCCTCCACGAGCCGGGGGCCCACACACCAAAATGGGGGGCTCCAGGGACTCGCTTCTCGAGATGAGCACATCGGGGGTAGGGAGGTCTCAGAAGCAGGGGGCCGGGGCCTACTCCAAATCCTACACCCTGGTGTAGGGCCCGCAGGAAGAGCAGCCACGCCTGGACCGCGCCGCGCCGCAGCCCCACACGCCAGCTCGGCTGTTTTTCTGCATTATTTATATTCAACTGACAGACAAAAACCAACCAACGACAAAACAAAAACCCCCAATCATGAACGCCTGTACATAGAACTCTTTTGTACAAATGAAACTATTTTCTTCTTCTCCATGAAGCCAGGGCACAAAGAATTTGACAGTACAAGTCAAATCCCCCACCCCACAAAATATGTGTGGAGATATATATACATATATAGACAGACAGGAACGCGTCCACGAGCTATATATCTATATATTTCTCTCACCCTATTTTGAGACAGAGGCACAAAGACTCAGCAATTTTTTTCCCTCCTCCTCACCTTCCCCCCAGTCTAGGTGGTTTTGACAAAGACCAAAATCCCAACTCAGAGACACTGCATGCGATTTTACTGTTCCAAGAAAACCAGGAGTTGCTTCAATTTGCAGATGCTTATGTGTTAATACCTTTTTCTATGAAAAAAGACCCAGCGCCGTGTGCAATAAAGGTTATGTTTCTA
SEQ ID NO:904 DSCAML1之外顯子1的轉譯多肽序列
MWLVTFLLLLDSLHK
SEQ ID NO:905 DSCAML1之外顯子2的轉譯多肽序列
RPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKA
SEQ ID NO:906 DSCAML1之外顯子3的轉譯多肽序列
FREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIP
SEQ ID NO:907 DSCAML1之外顯子4的轉譯多肽序列
HRFFITYHGGLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVT
SEQ ID NO:908 DSCAML1之外顯子5的轉譯多肽序列
PAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVI
SEQ ID NO:909 DSCAML1之外顯子6的轉譯多肽序列
PLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALE
SEQ ID NO:910 DSCAML1之外顯子7的轉譯多肽序列
GTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVR
SEQ ID NO:911 DSCAML1之外顯子8的轉譯多肽序列
PPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVK
SEQ ID NO:912 DSCAML1之外顯子9的轉譯多肽序列
PPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVR
SEQ ID NO:913 DSCAML1之外顯子10的轉譯多肽序列
PPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAK
SEQ ID NO:914 DSCAML1之外顯子11的轉譯多肽序列
SGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVK
SEQ ID NO:915 DSCAML1之外顯子12的轉譯多肽序列
PAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLK
SEQ ID NO:916 DSCAML1之外顯子13的轉譯多肽序列
LKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQ
SEQ ID NO:917 DSCAML1之外顯子14的轉譯多肽序列
PPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKS
SEQ ID NO:918 DSCAML1之外顯子15的轉譯多肽序列
SWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEA
SEQ ID NO:919 DSCAML1之外顯子16的轉譯多肽序列
PDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWK
SEQ ID NO:920 DSCAML1之外顯子17的轉譯多肽序列
APKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLED
SEQ ID NO:921 DSCAML1之外顯子18的轉譯多肽序列
PSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDG
SEQ ID NO:922 DSCAML1之外顯子19的轉譯多肽序列
WGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKED
SEQ ID NO:923 DSCAML1之外顯子20的轉譯多肽序列
PGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQP
SEQ ID NO:924 DSCAML1之外顯子21的轉譯多肽序列
APSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGK
SEQ ID NO:925 DSCAML1之外顯子22的轉譯多肽序列
PAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKD
SEQ ID NO:926 DSCAML1之外顯子23的轉譯多肽序列
EDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQ
SEQ ID NO:927 DSCAML1之外顯子24的轉譯多肽序列
PPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIR
SEQ ID NO:928 DSCAML1之外顯子25的轉譯多肽序列
FVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGR
SEQ ID NO:929 DSCAML1之外顯子26的轉譯多肽序列
PSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDG
SEQ ID NO:930 DSCAML1之外顯子27的轉譯多肽序列
TIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLR
SEQ ID NO:931 DSCAML1之外顯子28的轉譯多肽序列
AKSLAEMLI
SEQ ID NO:932 DSCAML1之外顯子29的轉譯多肽序列
KNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQL
SEQ ID NO:933 DSCAML1之外顯子30的轉譯多肽序列
DDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGT
SEQ ID NO:934 DSCAML1之外顯子31的轉譯多肽序列
PVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQDT
SEQ ID NO:935 DSCAML1之外顯子32的轉譯多肽序列
KGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANK
SEQ ID NO:936 DSCAML1之外顯子33的轉譯多肽序列
DYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
SEQ ID NO:937 DSCAML1之全蛋白質序列
MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHGGLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
SEQ ID NO:938 DSCAML1之全部外顯子1-3按順序排列的多核苷酸序列
SEQ ID NO:939 DSCAML1之全部外顯子1-3按順序排列的轉譯多肽序列
<![CDATA[<110> 荷蘭商美勒斯公司 (MERUS N.V.)]]> <![CDATA[<120> 新NRG1融合物、融合接合處及檢測彼等之方法]]> <![CDATA[<140> TW 111120470]]> <![CDATA[<141> 2022-06-01]]> <![CDATA[<150> NL 2028384]]> <![CDATA[<151> 2021-06-03]]> <![CDATA[<150> NL 2030006]]> <![CDATA[<151> 2021-12-03]]> <![CDATA[<160> 942 ]]> <![CDATA[<170> PatentIn version 3.5]]> <![CDATA[<210> 1]]> <![CDATA[<211> 43]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 1]]> caggtcctga gcctcgagcc gcagcacgag ctcaaattcc gag 43 <![CDATA[<210> 2]]> <![CDATA[<211> 51]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 2]]> ccttgcctcc ccgattgaaa gagatgaaaa gccaggaatc ggctgcaggt t 51 <![CDATA[<210> 3]]> <![CDATA[<211> 94]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 3]]> caggtcctga gcctcgagcc gcagcacgag ctcaaattcc gagccttgcc tccccgattg 60 aaagagatga aaagccagga atcggctgca ggtt 94 <![CDATA[<210> 4]]> <![CDATA[<211> 31]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 4]]> Gln Val Leu Ser Leu Glu Pro Gln His Glu Leu 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aaaataccaa gtgttctttt agagggaagg aaaaagtaca cacactctcc 12480 tctcacaatg atatatttta tacattcatt tgttatttgt ttcatgcttt atgattccag 12540 atggaaaggt aatttcagtg acttttcaag tttaaattcc attataggta aatgataagt 12600 tatgatgcaa ataaaatcta taagatcccc agggcaaata aaaatcaaaa catgaagtag 12660 aagatgtggc cgtgaggtag tttatgtaac aaattcaaag tgaaaatcat gtttactttt 12720 acttatactt atttgataaa aatatttttg aaacgatagt acttatttta ttatttgata 12780 tttcagttcc tattcaattg tggcagattt tctctgtttc acattttaga ttggcgttgg 12840 taatagaaat gtcagaatgt tcaaattggc cttcacgttg tcggagtgaa cacattgaca 12900 cctagcttta agactgattt atctgttggt gtactgaagg tttccatgta ggacttcaaa 12960 tgtggaaaag gaaaagcagt caggaaaatg gggcattctt tggagagtca cgcgttttga 13020 ttcggacatt tccgtagagc tcggctccca gtgttgtgtt cctcggtcga aagggtctct 13080 gctgtttggg gactcactgg cctctcctag ggactccttt gtcttgtgaa ccccacgctg 13140 ttggattctg tatcattatg ctgaattctc tgcacagttt tccctggcca acctgcccac 13200 atccttggag atttgctttg ccagtgggaa tccttacatt gctgtttcac agtagacggg 13260 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Val Thr Pro Glu Tyr Cys Ser Gly Asn 1 5 10 15 Met Gly Leu Leu Gln Gln Leu Glu Ala Asp Ile 20 25 <![CDATA[<210> 582]]> <![CDATA[<211> 35]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 58]]>2 Ile Thr Leu Ile Ala Val Asp Glu Ala His Cys Ile Ser Glu Trp Gly 1 5 10 15 His Asp Phe Arg Asp Ser Phe Arg Lys Leu Gly Ser Leu Lys Thr Ala 20 25 30 Leu Pro Met 35 <![CDATA[<210> 583]]> <![CDATA[<211> 61]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 583]]> Val Pro Ile Val Ala Leu Thr Ala Thr Ala Ser Ser Ser Ile Arg Glu 1 5 10 15 Asp Ile Val Arg Cys Leu Asn Leu Arg Asn Pro Gln Ile Thr Cys Thr 20 25 30 Gly Phe Asp Arg Pro Asn Leu Tyr Leu Glu Val Arg Arg Lys Thr Gly 35 40 45 Asn Ile Leu Gln Asp Leu Gln Pro Phe Leu Val Lys Thr 50 55 60 <![CDATA[<210> 584]]> <![CDATA[<211> 58]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 584]]> Ser His Trp Glu Phe Glu Gly Pro Thr Ile Ile Tyr Cys Pro Ser Arg 1 5 10 15 Lys Met Thr Gln Gln Val Thr Gly Glu Leu Arg Lys Leu Asn Leu Ser 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人類]]> <![CDATA[<400> 595]]> Pro Thr Thr Val Glu Asn Val Lys Arg Ile Asp Gly Val Ser Glu Gly 1 5 10 15 Lys Ala Ala Met Leu Ala Pro Leu Leu Glu Val Ile Lys His Phe Cys 20 25 30 Gln Thr Asn Ser Val Gln 35 <![CDATA[<210> 596]]> <![CDATA[<211> 44]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 596]]> Thr Asp Leu Phe Ser Ser Thr Lys Pro Gln Glu Glu Gln Lys Thr Ser 1 5 10 15 Leu Val Ala Lys Asn Lys Ile Cys Thr Leu Ser Gln Ser Met Ala Ile 20 25 30 Thr Tyr Ser Leu Phe Gln Glu Lys Lys Met Pro Leu 35 40 <![CDATA[<210> 597]]> <![CDATA[<211> 54]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 597]]> Lys Ser Ile Ala Glu Ser Arg Ile Leu Pro Leu Met Thr Ile Gly Met 1 5 10 15 His Leu Ser Gln Ala Val Lys Ala Gly Cys Pro Leu Asp Leu Glu Arg 20 25 30 Ala Gly Leu Thr Pro Glu Val Gln Lys Ile Ile Ala Asp Val Ile Arg 35 40 45 Asn Pro Pro Val Asn Ser 50 <![CDATA[<210> 598]]> <![CDATA[<211> 69]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 598]]> Met Ser Lys Ile Ser Leu 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Ser Asp Gly Asp Val Val Gly 65 70 75 80 Phe Asp Met Glu Trp Pro Pro Leu Tyr Asn Arg Gly Lys Leu Gly Lys 85 90 95 Val Ala Leu Ile Gln Leu Cys Val Ser Glu Ser Lys Cys Tyr Leu Phe 100 105 110 His Val Ser Ser Met Ser Val Phe Pro Gln Gly Leu Lys Met Leu Leu 115 120 125 Glu Asn Lys Ala Val Lys Lys Ala Gly Val Gly Ile Glu Gly Asp Gln 130 135 140 Trp Lys Leu Leu Arg Asp Phe Asp Ile Lys Leu Lys Asn Phe Val Glu 145 150 155 160 Leu Thr Asp Val Ala Asn Lys Lys Leu Lys Cys Thr Glu Thr Trp Ser 165 170 175 Leu Asn Ser Leu Val Lys His Leu Leu Gly Lys Gln Leu Leu Lys Asp 180 185 190 Lys Ser Ile Arg Cys Ser Asn Trp Ser Lys Phe Pro Leu Thr Glu Asp 195 200 205 Gln Lys Leu Tyr Ala Ala Thr Asp Ala Tyr Ala Gly Phe Ile Ile Tyr 210 215 220 Arg Asn Leu Glu Ile Leu Asp Asp Thr Val Gln Arg Phe Ala Ile Asn 225 230 235 240 Lys Glu Glu Glu Ile Leu Leu Ser Asp Met Asn Lys Gln Leu Thr Ser 245 250 255 Ile Ser Glu Glu Val Met Asp Leu Ala Lys His Leu Pro His Ala Phe 260 265 270 Ser Lys Leu Glu Asn Pro Arg Arg Val Ser Ile Leu Leu Lys Asp Ile 275 280 285 Ser Glu Asn Leu Tyr Ser Leu Arg Arg Met Ile Ile Gly Ser Thr Asn 290 295 300 Ile Glu Thr Glu Leu Arg Pro Ser Asn Asn Leu Asn Leu Leu Ser Phe 305 310 315 320 Glu Asp Ser Thr Thr Gly Gly Val Gln Gln Lys Gln Ile Arg Glu His 325 330 335 Glu Val Leu Ile His Val Glu Asp Glu Thr Trp Asp Pro Thr Leu Asp 340 345 350 His Leu Ala Lys His Asp Gly Glu Asp Val Leu Gly Asn Lys Val Glu 355 360 365 Arg Lys Glu Asp Gly Phe Glu Asp Gly Val Glu Asp Asn Lys Leu Lys 370 375 380 Glu Asn Met Glu Arg Ala Cys Leu Met Ser Leu Asp Ile Thr Glu His 385 390 395 400 Glu Leu Gln Ile Leu Glu Gln Gln Ser Gln Glu Glu Tyr Leu Ser Asp 405 410 415 Ile Ala Tyr Lys Ser Thr Glu His Leu Ser Pro Asn Asp Asn Glu Asn 420 425 430 Asp Thr Ser Tyr Val Ile Glu Ser Asp Glu Asp Leu Glu Met Glu Met 435 440 445 Leu Lys His Leu Ser Pro Asn Asp Asn Glu Asn Asp Thr Ser Tyr Val 450 455 460 Ile Glu Ser Asp Glu Asp Leu Glu Met Glu Met Leu Lys Ser Leu Glu 465 470 475 480 Asn Leu Asn Ser Gly Thr Val Glu Pro Thr His Ser Lys Cys Leu Lys 485 490 495 Met Glu Arg Asn Leu Gly Leu Pro Thr Lys Glu Glu Glu Glu Asp Asp 500 505 510 Glu Asn Glu Ala Asn Glu Gly Glu Glu Asp Asp Asp Lys Asp Phe Leu 515 520 525 Trp Pro Ala Pro Asn Glu Glu Gln Val Thr Cys Leu Lys Met Tyr Phe 530 535 540 Gly His Ser Ser Phe Lys Pro Val Gln Trp Lys Val Ile His Ser Val 545 550 555 560 Leu Glu Glu Arg Arg Asp Asn Val Ala Val Met Ala Thr Gly Tyr Gly 565 570 575 Lys Ser Leu Cys Phe Gln Tyr Pro Pro Val Tyr Val Gly Lys Ile Gly 580 585 590 Leu Val Ile Ser Pro Leu Ile Ser Leu Met Glu Asp Gln Val Leu Gln 595 600 605 Leu Lys Met Ser Asn Ile Pro Ala Cys Phe Leu Gly Ser Ala Gln Ser 610 615 620 Glu Asn Val Leu Thr Asp Ile Lys Leu Gly Lys Tyr Arg Ile Val Tyr 625 630 635 640 Val Thr Pro Glu Tyr Cys Ser Gly Asn Met Gly Leu Leu Gln Gln Leu 645 650 655 Glu Ala Asp Ile Gly Ile Thr Leu Ile Ala Val Asp Glu Ala His Cys 660 665 670 Ile Ser Glu Trp Gly His Asp Phe Arg Asp Ser Phe Arg Lys Leu Gly 675 680 685 Ser Leu Lys Thr Ala Leu Pro Met Val Pro Ile Val Ala Leu Thr Ala 690 695 700 Thr Ala Ser Ser Ser Ile Arg Glu Asp Ile Val Arg Cys Leu Asn Leu 705 710 715 720 Arg Asn Pro Gln Ile Thr Cys Thr Gly Phe Asp Arg Pro Asn Leu Tyr 725 730 735 Leu Glu Val Arg Arg Lys Thr Gly Asn Ile Leu Gln Asp Leu Gln Pro 740 745 750 Phe Leu Val Lys Thr Ser Ser His Trp Glu Phe Glu Gly Pro Thr Ile 755 760 765 Ile Tyr Cys Pro Ser Arg Lys Met Thr Gln Gln Val Thr Gly Glu Leu 770 775 780 Arg Lys Leu Asn Leu Ser Cys Gly Thr Tyr His Ala Gly Met Ser Phe 785 790 795 800 Ser Thr Arg Lys Asp Ile His His Arg Phe Val Arg Asp Glu Ile Gln 805 810 815 Cys Val Ile Ala Thr Ile Ala Phe Gly Met Gly Ile Asn Lys Ala Asp 820 825 830 Ile Arg Gln Val Ile His Tyr Gly Ala Pro Lys Asp Met Glu Ser Tyr 835 840 845 Tyr Gln Glu Ile Gly Arg Ala Gly Arg Asp Gly Leu Gln Ser Ser Cys 850 855 860 His Val Leu Trp Ala Pro Ala Asp Ile Asn Leu Asn Arg His Leu Leu 865 870 875 880 Thr Glu Ile Arg Asn Glu Lys Phe Arg Leu Tyr Lys Leu Lys Met Met 885 890 895 Ala Lys Met Glu Lys Tyr Leu His Ser Ser Arg Cys Arg Arg Gln Ile 900 905 910 Ile Leu Ser His Phe Glu Asp Lys Gln Val Gln Lys Ala Ser Leu Gly 915 920 925 Ile Met Gly Thr Glu Lys Cys Cys Asp Asn Cys Arg Ser Arg Leu Asp 930 935 940 His Cys Tyr Ser Met Asp Asp Ser Glu Asp Thr Ser Trp Asp Phe Gly 945 950 955 960 Pro Gln Ala Phe Lys Leu Leu Ser Ala Val Asp Ile Leu Gly Glu Lys 965 970 975 Phe Gly Ile Gly Leu Pro Ile Leu Phe Leu Arg Gly Ser Asn Ser Gln 980 985 990 Arg Leu Ala Asp Gln Tyr Arg Arg His Ser Leu Phe Gly Thr Gly Lys 995 1000 1005 Asp Gln Thr Glu Ser Trp Trp Lys Ala Phe Ser Arg Gln Leu Ile 1010 1015 1020 Thr Glu Gly Phe Leu Val Glu Val Ser Arg Tyr Asn Lys Phe Met 1025 1030 1035 Lys Ile Cys Ala Leu Thr Lys Lys Gly Arg Asn Trp Leu His Lys 1040 1045 1050 Ala Asn Thr Glu Ser Gln Ser Leu Ile Leu Gln Ala Asn Glu Glu 1055 1060 1065 Leu Cys Pro Lys Lys Leu Leu Leu Pro Ser Ser Lys Thr Val Ser 1070 1075 1080 Ser Gly Thr Lys Glu His Cys Tyr Asn Gln Val Pro Val Glu Leu 1085 1090 1095 Ser Thr Glu Lys Lys Ser Asn Leu Glu Lys Leu Tyr Ser Tyr Lys 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Glu Val Gln Lys Ile Ile Ala Asp Val Ile Arg Asn Pro 1310 1315 1320 Pro Val Asn Ser Asp Met Ser Lys Ile Ser Leu Ile Arg Met Leu 1325 1330 1335 Val Pro Glu Asn Ile Asp Thr Tyr Leu Ile His Met Ala Ile Glu 1340 1345 1350 Ile Leu Lys His Gly Pro Asp Ser Gly Leu Gln Pro Ser Cys Asp 1355 1360 1365 Val Asn Lys Arg Arg Cys Phe Pro Gly Ser Glu Glu Ile Cys Ser 1370 1375 1380 Ser Ser Lys Arg Ser Lys Glu Glu Val Gly Ile Asn Thr Glu Thr 1385 1390 1395 Ser Ser Ala Glu Arg Lys Arg Arg Leu Pro Val Trp Phe Ala Lys 1400 1405 1410 Gly Ser Asp Thr Ser Lys Lys Leu Met Asp Lys Thr Lys Arg Gly 1415 1420 1425 Gly Leu Phe Ser 1430 <![CDATA[<210> 601]]> <![CDATA[<211> 4222]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 601]]> gtgtactgtg tgcgccgggg aggcgccggc ttgtactcgg cagcgcggga ataaagtttg 60 ctgatttggt gtctagcctg gatgcctggg ttgcaggccc tgcttgtggt ggcgctccac 120 agtcatccgg ctgaagaaga cctgttggac tggatcttct cgggttttct ttcagatatt 180 gttttgtatt tacccatgaa gacattgttt tttggactct gcaaatagga catttcaaag 240 atgagtgaaa aaaaattgga aacaactgca cagcagcgga aatgtcctga atggatgaat 300 gtgcagaata aaagatgtgc tgtagaagaa agaaaggcat gtgttcggaa gagtgttttt 360 gaagatgacc tccccttctt agaattcact ggatccattg tgtatagtta cgatgctagt 420 gattgctctt tcctgtcaga agatattagc atgagtctat cagatgggga tgtggtggga 480 tttgacatgg agtggccacc attatacaat agagggaaac ttggcaaagt tgcactaatt 540 cagttgtgtg tttctgagag caaatgttac ttgttccacg tttcttccat gtcagttttt 600 ccccagggat taaaaatgtt gcttgaaaat aaagcagtta aaaaggcagg tgtaggaatt 660 gaaggagatc agtggaaact tctacgtgac tttgatatca aattgaagaa ttttgtggag 720 ttgacagatg ttgccaataa aaagctgaaa tgcacagaga cctggagcct taacagtctg 780 gttaaacacc tcttaggtaa acagctcctg aaagacaagt ctatccgctg tagcaattgg 840 agtaaatttc ctctcactga ggaccagaaa ctgtatgcag ccactgatgc ttatgctggt 900 tttattattt accgaaattt agagattttg gatgatactg tgcaaaggtt tgctataaat 960 aaagaggaag aaatcctact tagcgacatg aacaaacagt tgacttcaat ctctgaggaa 1020 gtgatggatc tggctaagca tcttcctcat gctttcagta aattggaaaa cccacggagg 1080 gtttctatct tactaaagga tatttcagaa aatctatatt cactgaggag gatgataatt 1140 gggtctacta acattgagac tgaactgagg cccagcaata atttaaactt attatccttt 1200 gaagattcaa ctactggggg agtacaacag aaacaaatta gagaacatga agttttaatt 1260 cacgttgaag atgaaacatg ggacccaaca cttgatcatt tagctaaaca tgatggagaa 1320 gatgtacttg gaaataaagt ggaacgaaaa gaagatggat ttgaagatgg agtagaagac 1380 aacaaattga aagagaatat ggaaagagct tgtttgatgt cgttagatat tacagaacat 1440 gaactccaaa ttttggaaca gcagtctcag gaagaatatc ttagtgatat tgcttataaa 1500 tctactgagc atttatctcc caatgataat gaaaacgata cgtcctatgt aattgagagt 1560 gatgaagatt tagaaatgga gatgcttaag catttatctc ccaatgataa tgaaaacgat 1620 acgtcctatg taattgagag tgatgaagat ttagaaatgg agatgcttaa gtctttagaa 1680 aacctcaata gtggcacggt agaaccaact cattctaaat gcttaaaaat ggaaagaaat 1740 ctgggtcttc ctactaaaga agaagaagaa gatgatgaaa atgaagctaa tgaaggggaa 1800 gaagatgatg ataaggactt tttgtggcca gcacccaatg aagagcaagt tacttgcctc 1860 aagatgtact ttggccattc cagttttaaa ccagttcagt ggaaagtgat tcattcagta 1920 ttagaagaaa 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250 255 Ile Arg Trp Leu Lys Asp Gly Arg Pro Leu Pro Ala Asp Ser Arg Trp 260 265 270 Thr Lys Arg Ile Thr Gly Leu Thr Ile Ser Asp Leu Arg Thr Glu Asp 275 280 285 Ser Gly Thr Tyr Ile Cys Glu Val Thr Asn Thr Phe Gly Ser Ala Glu 290 295 300 Ala Thr Gly Ile Leu Met Val Ile Asp Pro Leu His Val Thr Leu Thr 305 310 315 320 Pro Lys Lys Leu Lys Thr Gly Ile Gly Ser Thr Val Ile Leu Ser Cys 325 330 335 Ala Leu Thr Gly Ser Pro Glu Phe Thr Ile Arg Trp Tyr Arg Asn Thr 340 345 350 Glu Leu Val Leu Pro Asp Glu Ala Ile Ser Ile Arg Gly Leu Ser Asn 355 360 365 Glu Thr Leu Leu Ile Thr Ser Ala Gln Lys Ser His Ser Gly Ala Tyr 370 375 380 Gln Cys Phe Ala Thr Arg Lys Ala Gln Thr Ala Gln Asp Phe Ala Ile 385 390 395 400 Ile Ala Leu Glu Asp Gly Thr Pro Arg Ile Val Ser Ser Phe Ser Glu 405 410 415 Lys Val Val Asn Pro Gly Glu Gln Phe Ser Leu Met Cys Ala Ala Lys 420 425 430 Gly Ala Pro Pro Pro Thr Val Thr Trp Ala Leu Asp Asp Glu Pro Ile 435 440 445 Val Arg Asp Gly Ser His Arg Thr Asn Gln Tyr Thr Met Ser Asp Gly 450 455 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670 Asn Ala Ala Ala Thr Val Ser Arg Glu Arg Gln Leu Ile Val Arg Val 675 680 685 Pro Pro Arg Phe Val Val Gln Pro Asn Asn Gln Asp Gly Ile Tyr Gly 690 695 700 Lys Ala Gly Val Leu Asn Cys Ser Val Asp Gly Tyr Pro Pro Pro Lys 705 710 715 720 Val Met Trp Lys His Ala Lys Gly Ser Gly Asn Pro Gln Gln Tyr His 725 730 735 Pro Val Pro Leu Thr Gly Arg Ile Gln Ile Leu Pro Asn Ser Ser Leu 740 745 750 Leu Ile Arg His Val Leu Glu Glu Asp Ile Gly Tyr Tyr Leu Cys Gln 755 760 765 Ala Ser Asn Gly Val Gly Thr Asp Ile Ser Lys Ser Met Phe Leu Thr 770 775 780 Val Lys Ile Pro Ala Met Ile Thr Ser His Pro Asn Thr Thr Ile Ala 785 790 795 800 Ile Lys Gly His Ala Lys Glu Leu Asn Cys Thr Ala Arg Gly Glu Arg 805 810 815 Pro Ile Ile Ile Arg Trp Glu Lys Gly Asp Thr Val Ile Asp Pro Asp 820 825 830 Arg Val Met Arg Tyr Ala Ile Ala Thr Lys Asp Asn Gly Asp Glu Val 835 840 845 Val Ser Thr Leu Lys Leu Lys Pro Ala Asp Arg Gly Asp Ser Val Phe 850 855 860 Phe Ser Cys His Ala Ile Asn Ser Tyr Gly Glu Asp Arg Gly Leu Ile 865 870 875 880 Gln Leu Thr Val Gln Glu Pro Pro Asp Pro Pro Glu Leu Glu Ile Arg 885 890 895 Glu Val Lys Ala Arg Ser Met Asn Leu Arg Trp Thr Gln Arg Phe Asp 900 905 910 Gly Asn Ser Ile Ile Thr Gly Phe Asp Ile Glu Tyr Lys Asn Lys Ser 915 920 925 Asp Ser Trp Asp Phe Lys Gln Ser Thr Arg Asn Ile Ser Pro Thr Ile 930 935 940 Asn Gln Ala Asn Ile Val Asp Leu His Pro Ala Ser Val Tyr Ser Ile 945 950 955 960 Arg Met Tyr Ser Phe Asn Lys Ile Gly Arg Ser Glu Pro Ser Lys Glu 965 970 975 Leu Thr Ile Ser Thr Glu Glu Ala Ala Pro Asp Gly Pro Pro Met Asp 980 985 990 Val Thr Leu Gln Pro Val Thr Ser Gln Ser Ile Gln Val Thr Trp Lys 995 1000 1005 Ala Pro Lys Lys Glu Leu Gln Asn Gly Val Ile Arg Gly Tyr Gln 1010 1015 1020 Ile Gly Tyr Arg Glu Asn Ser Pro Gly Ser Asn Gly Gln Tyr Ser 1025 1030 1035 Ile Val Glu Met Lys Ala Thr Gly Asp Ser Glu Val Tyr Thr Leu 1040 1045 1050 Asp Asn Leu Lys Lys Phe Ala Gln Tyr Gly Val Val Val Gln Ala 1055 1060 1065 Phe Asn Arg Ala Gly Thr Gly Pro Ser Ser Ser Glu Ile Asn Ala 1070 1075 1080 Thr Thr Leu Glu Asp Val Pro Ser Gln Pro Pro Glu Asn Val Arg 1085 1090 1095 Ala Leu Ser Ile Thr Ser Asp Val Ala Val Ile Ser Trp Ser Glu 1100 1105 1110 Pro Pro Arg Ser Thr Leu Asn Gly Val Leu Lys Gly Tyr Arg Val 1115 1120 1125 Ile Phe Trp Ser Leu Tyr Val Asp Gly Glu Trp Gly Glu Met Gln 1130 1135 1140 Asn Ile Thr Thr Thr Arg Glu Arg Val Glu Leu Arg Gly Met Glu 1145 1150 1155 Lys Phe Thr Asn Tyr Ser Val Gln Val Leu Ala Tyr Thr Gln Ala 1160 1165 1170 Gly Asp Gly Val Arg Ser Ser Val Leu Tyr Ile Gln Thr Lys Glu 1175 1180 1185 Asp Val Pro Gly Pro Pro Ala Gly Ile Lys Ala Val Pro Ser Ser 1190 1195 1200 Ala Ser Ser Val Val Val Ser Trp Leu Pro Pro Thr Lys Pro Asn 1205 1210 1215 Gly Val Ile Arg Lys Tyr Thr Ile Phe Cys Ser Ser Pro Gly Ser 1220 1225 1230 Gly Gln Pro Ala Pro Ser Glu Tyr Glu Thr Ser Pro Glu Gln Leu 1235 1240 1245 Phe Tyr Arg Ile Ala His Leu Asn Arg Gly Gln Gln Tyr Leu Leu 1250 1255 1260 Trp Val Ala Ala Val Thr Ser Ala Gly Arg Gly Asn Ser Ser Glu 1265 1270 1275 Lys Val Thr Ile Glu Pro Ala Gly Lys Ala Pro Ala Lys Ile Ile 1280 1285 1290 Ser Phe Gly Gly Thr Val Thr Thr Pro Trp Met Lys Asp Val Arg 1295 1300 1305 Leu Pro Cys Asn Ser Val Gly Asp Pro Ala Pro Ala Val Lys Trp 1310 1315 1320 Thr Lys Asp Ser Glu Asp Ser Ala Ile Pro Val Ser Met Asp Gly 1325 1330 1335 His Arg Leu Ile His Thr Asn Gly Thr Leu Leu Leu Arg Ala Val 1340 1345 1350 Lys Ala Glu Asp Ser Gly Tyr Tyr Thr Cys Thr Ala Thr Asn Thr 1355 1360 1365 Gly Gly Phe Asp Thr Ile Ile Val Asn Leu Leu Val Gln Val Pro 1370 1375 1380 Pro Asp Gln Pro Arg Leu Thr Val Ser Lys Thr Ser Ala Ser Ser 1385 1390 1395 Ile Thr Leu Thr Trp Ile Pro Gly Asp Asn Gly Gly Ser Ser Ile 1400 1405 1410 Arg Gly Phe Val Leu Gln Tyr Ser Val Asp Asn Ser Glu Glu Trp 1415 1420 1425 Lys Asp Val Phe Ile Ser Ser Ser Glu Arg Ser Phe Lys Leu Asp 1430 1435 1440 Ser Leu Lys Cys Gly Thr Trp Tyr Lys Val Lys Leu Ala Ala Lys 1445 1450 1455 Asn Ser Val Gly Ser Gly Arg Ile Ser Glu Ile Ile Glu Ala Lys 1460 1465 1470 Thr His Gly Arg Glu Pro Ser Phe Ser Lys Asp Gln His Leu Phe 1475 1480 1485 Thr His Ile Asn Ser Thr His Ala Arg Leu Asn Leu Gln Gly Trp 1490 1495 1500 Asn Asn Gly Gly Cys Pro Ile Thr Ala Ile Val Leu Glu Tyr Arg 1505 1510 1515 Pro Lys Gly Thr Trp Ala Trp Gln Gly Leu Arg Ala Asn Ser Ser 1520 1525 1530 Gly Glu Val Phe Leu Thr Glu Leu Arg Glu Ala Thr Trp Tyr Glu 1535 1540 1545 Leu Arg Met Arg Ala Cys Asn Ser Ala Gly Cys Gly Asn Glu Thr 1550 1555 1560 Ala Gln Phe Ala Thr Leu Asp Tyr Asp Gly Ser Thr Ile Pro Pro 1565 1570 1575 Ile Lys Ser Ala Gln Gly Glu Gly Asp Asp Val Lys Lys Leu Phe 1580 1585 1590 Thr Ile Gly Cys Pro Val Ile Leu Ala Thr Leu Gly Val Ala Leu 1595 1600 1605 Leu Phe Ile Val Arg Lys Lys Arg Lys Glu Lys Arg Leu Lys Arg 1610 1615 1620 Leu Arg Asp Ala Lys Ser Leu Ala Glu Met Leu Ile Ser Lys Asn 1625 1630 1635 Asn Arg Ser Phe Asp Thr Pro Val Lys Gly Pro Pro Gln Gly Pro 1640 1645 1650 Arg Leu His Ile Asp Ile Pro Arg Val Gln Leu Leu Ile Glu Asp 1655 1660 1665 Lys Glu Gly Ile Lys Gln Leu Gly Asp Asp Lys Ala Thr Ile Pro 1670 1675 1680 Val Thr Asp Ala Glu Phe Ser Gln Ala Val Asn Pro Gln Ser Phe 1685 1690 1695 Cys Thr Gly Val Ser Leu His His Pro Thr Leu Ile Gln Ser Thr 1700 1705 1710 Gly Pro Leu Ile Asp Met Ser Asp Ile Arg Pro Gly Thr Asn Pro 1715 1720 1725 Val Ser Arg Lys Asn Val Lys Ser Ala His Ser Thr Arg Asn Arg 1730 1735 1740 Tyr Ser Ser Gln Trp Thr Leu Thr Lys Cys Gln Ala Ser Thr Pro 1745 1750 1755 Ala Arg Thr Leu Thr Ser Asp Trp Arg Thr Val Gly Ser Gln His 1760 1765 1770 Gly Val Thr Val Thr Glu Ser Asp Ser Tyr Ser Ala Ser Leu Ser 1775 1780 1785 Gln Asp Thr Asp Lys Gly Arg Asn Ser Met Val Ser Thr Glu Ser 1790 1795 1800 Ala Ser Ser Thr Tyr Glu Glu Leu Ala Arg Ala Tyr Glu His Ala 1805 1810 1815 Lys Leu Glu Glu Gln Leu Gln His Ala Lys Phe Glu Ile Thr Glu 1820 1825 1830 Cys Phe Ile Ser Asp Ser Ser Ser Asp Gln Met Thr Thr Gly Thr 1835 1840 1845 Asn Glu Asn Ala Asp Ser Met Thr Ser Met Ser Thr Pro Ser Glu 1850 1855 1860 Pro Gly Ile Cys Arg Phe Thr Ala Ser Pro Pro Lys Pro Gln Asp 1865 1870 1875 Ala Asp Arg Gly Lys Asn Val Ala Val Pro Ile Pro His Arg Ala 1880 1885 1890 Asn Lys Ser Asp Tyr Cys Asn Leu Pro Leu Tyr Ala Lys Ser Glu 1895 1900 1905 Ala Phe Phe Arg Lys Ala Asp Gly Arg Glu Pro Cys Pro Val Val 1910 1915 1920 Pro Pro Arg Glu Ala Ser Ile Arg Asn Leu Ala Arg Thr Tyr His 1925 1930 1935 Thr Gln Ala Arg His Leu Thr Leu Asp Pro Ala Ser Lys Ser Leu 1940 1945 1950 Gly Leu Pro His Pro Gly Ala Pro Ala Ala Ala Ser Thr Ala Thr 1955 1960 1965 Leu Pro Gln Arg Thr Leu Ala Met Pro Ala Pro Pro Ala Gly Thr 1970 1975 1980 Ala Pro Pro Ala Pro Gly Pro Thr Pro Ala Glu Pro Pro Thr Ala 1985 1990 1995 Pro Ser Ala Ala Pro Pro Ala Pro Ser Thr Glu Pro Pro Arg Ala 2000 2005 2010 Gly Gly Pro His Thr Lys Met Gly Gly Ser Arg Asp Ser Leu Leu 2015 2020 2025 Glu Met Ser Thr Ser Gly Val Gly Arg Ser Gln Lys Gln Gly Ala 2030 2035 2040 Gly Ala Tyr Ser Lys Ser Tyr Thr Leu Val 2045 2050 <![CDATA[<210> 938]]> <![CDATA[<211> 648]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 938]]> agccgagcgc tgggctgagg agcagagaga gcggggcgcc gagtgcgggc ggctgggagc 60 gcgctgagcg ggggagaggc gctgccgcac ggccggccac aggaccacct ccccggagaa 120 tagggcctct ttatggcatg tggctggtaa ctttcctcct gctcctggac tctttacaca 180 aagcccgccc tgaagatgtt ggcaccagcc tctactttgt aaatgactcc ttgcagcagg 240 tgaccttttc cagctccgtg ggggtggtgg tgccctgccc ggccgcgggc tcccccagcg 300 cggcccttcg atggtacctg gccacagggg acgacatcta cgacgtgccg cacatccggc 360 acgtccacgc caacgggacg ctgcagctct accccttctc cccctccgcc ttcaatagct 420 ttatccacga caatgactac ttctgcaccg cggagaacgc tgccggcaag atccggagcc 480 ccaacatccg cgtcaaagca gttttcaggg aaccctacac cgtccgggtg gaggatcaaa 540 ggtcaatgcg tggcaacgtg gccgtcttca agtgcctcat cccctcttca gtgcaggaat 600 atgttagcgt tgtatcttgg gagaaagaca cagtctccat catcccag 648 <![CDATA[<210> 939]]> <![CDATA[<211> 170]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 939]]> Met Trp Leu Val Thr Phe Leu Leu Leu Leu Asp Ser Leu His Lys Ala 1 5 10 15 Arg Pro Glu Asp Val Gly Thr Ser Leu Tyr Phe Val Asn Asp Ser Leu 20 25 30 Gln Gln Val Thr Phe Ser Ser Ser Val Gly Val Val Val Pro Cys Pro 35 40 45 Ala Ala Gly Ser Pro Ser Ala Ala Leu Arg Trp Tyr Leu Ala Thr Gly 50 55 60 Asp Asp Ile Tyr Asp Val Pro His Ile Arg His Val His Ala Asn Gly 65 70 75 80 Thr Leu Gln Leu Tyr Pro Phe Ser Pro Ser Ala Phe Asn Ser Phe Ile 85 90 95 His Asp Asn Asp Tyr Phe Cys Thr Ala Glu Asn Ala Ala Gly Lys Ile 100 105 110 Arg Ser Pro Asn Ile Arg Val Lys Ala Val Phe Arg Glu Pro Tyr Thr 115 120 125 Val Arg Val Glu Asp Gln Arg Ser Met Arg Gly Asn Val Ala Val Phe 130 135 140 Lys Cys Leu Ile Pro Ser Ser Val Gln Glu Tyr Val Ser Val Val Ser 145 150 155 160 Trp Glu Lys Asp Thr Val Ser Ile Ile Pro 165 170 <![CDATA[<210> 940]]> <![CDATA[<211> 485]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 940]]> actcgccgca gcctgcgcgc cttctccagt ccgcggtgcc atggcccccg cccgtctgtt 60 cgcgctgctg ctgttcttcg taggcggagt cgccgagtcg atccgagaga ctgaggtcat 120 cgacccccag gacctcctag aaggccgata cttctccgga gccctaccag acgatgagga 180 tgtagtgggg cccgggcagg aatctgatga ctttgagctg tctggctctg gagatctgga 240 tgacttggaa gactccatga tcggccctga agttgtccat cccttggtgc ctctagataa 300 ccatatccct gagagggcag ggtctgggag ccaagtcccc accgaaccca agaaactaga 360 ggagaatgag gttatcccca agagaatctc acccgttgaa gagagtgagg atgtgtccaa 420 caaggtgtca atgtccagca ctgtgcaggg cagcaacatc tttgagagaa cggaggtcct 480 ggcag 485 <![CDATA[<210> 941]]> <![CDATA[<211> 148]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人類]]> <![CDATA[<400> 941]]> Met Ala Pro Ala Arg Leu Phe Ala Leu Leu Leu Phe Phe Val Gly Gly 1 5 10 15 Val Ala Glu Ser Ile Arg Glu Thr Glu Val Ile Asp Pro Gln Asp Leu 20 25 30 Leu Glu Gly Arg Tyr Phe Ser Gly Ala Leu Pro Asp Asp Glu Asp Val 35 40 45 Val Gly Pro Gly Gln Glu Ser Asp Asp Phe Glu Leu Ser Gly Ser Gly 50 55 60 Asp Leu Asp Asp Leu Glu Asp Ser Met Ile Gly Pro Glu Val Val His 65 70 75 80 Pro Leu Val Pro Leu Asp Asn His Ile Pro Glu Arg Ala Gly Ser Gly 85 90 95 Ser Gln Val Pro Thr Glu Pro Lys Lys Leu Glu Glu Asn Glu Val Ile 100 105 110 Pro Lys Arg Ile Ser Pro Val Glu Glu Ser Glu Asp Val Ser Asn Lys 115 120 125 Val Ser Met Ser Ser Thr Val Gln Gly Ser Asn Ile Phe Glu Arg Thr 130 135 140 Glu Val Leu Ala 145 <![CDATA[<210> 942]]> <![CDATA[<211> 33]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> T7啟動子]]> <![CDATA[<400> 942]]> cagagatgca taatacgact cactataggg aga 33
(無)
Claims (61)
- 一種多核苷酸,包含: - 一PVALB核酸序列或該PVALB序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合,或 - 一ASPH核酸序列或該ASPH序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合,或 - 一DAAM1核酸序列或該DAAM1序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合,或 - 一ZFAT核酸序列或該ZFAT序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合,或 - 一DACAML1核酸序列或該DSCAML1序列的對偶基因變異體,其係與一NRG1核酸序列或該NRG1序列的對偶基因變異體融合。
- 如請求項1之多核苷酸,其中 - 該PVALB核酸序列包含SEQ ID NO: 439-444中之任一者或由其組成,或包含SEQ ID NO: 439-444中之任一者之對偶基因變異體或由其組成,且該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或由其組成; - 該DAAM1核酸序列包含SEQ ID NO: 606-631中之任一者或由其組成,或包含SEQ ID NO: 606-631中之任一者之對偶基因變異體或由其組成,且該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或由其組成; - 該ZFAT核酸序列包含SEQ ID NO: 830-846中之任一者或由其組成,或包含SEQ ID NO: 830-846中之任一者之對偶基因變異體或由其組成,且該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或由其組成;或 - 該DSCAML1核酸序列包含SEQ ID NO: 870-903中之任一者或由其組成,或包含SEQ ID NO: 870-903中之任一者之對偶基因變異體或由其組成,且該NRG1核酸序列包含SEQ ID NO: 125-138中之任一者或由其組成。
- 如請求項1或2之多核苷酸,其中該PVALB、DAAM1、ZFAT或DSCAML1核酸序列(或其對偶基因變異體)係位於NRG1核酸序列(或其對偶基因變異體)的5’端。
- 如請求項1至3中任一項之多核苷酸,其中 - 該PVALB核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 439-444中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性; - 該DAAM1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 606-631中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性; - 該ZFAT核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 830-846中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;或 - 該DSCAML1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 870-903中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性;且該NRG1核酸序列之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125-138中之任一者有至少85%的一致性,較佳地至少90%的一致性,更佳地至少95%的序列一致性。
- 如請求項1至4中任一項之多核苷酸,其中 - 該PVALB核酸與該NRG1核酸之融合物包含來自SEQ ID NO: 437的2至約40個連續核酸,較佳地包括位置102及103處的核酸; - 該DAAM1核酸與該NRG1核酸之融合物包含來自SEQ ID NO: 605的2至約40個連續核酸,較佳地包括位置75及76處的核酸; - 該ZFAT核酸與該NRG1核酸之融合物包含來自SEQ ID NO: 828的2至約40個連續核酸,較佳地包括位置75及76處的核酸;或 - 該DSCAML1核酸與該NRG1核酸之融合物包含來自SEQ ID NO: 868的2至約40個連續核酸,較佳地包括位置75及76處的核酸。
- 如請求項1至5中任一項之多核苷酸,其中該編碼NRG1蛋白序列(或其對偶基因變異體)之核酸係包含或編碼NRG1之EGF樣結構域,較佳為如SEQ ID NO: 163之EGF樣結構域。
- 一種多核苷酸,包含: - VAPB之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分,其與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分融合; - CADM1之外顯子7或外顯子7之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - CD44之外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分; - SLC3A2之轉錄本6之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體的一部分; - VTCN1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分; - CDH1之外顯子11或外顯子11之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分; - CXADR之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分; - GTF2E2之外顯子2或外顯子1之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分; - CSMD1之外顯子23或外顯子23之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - PTN之外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分; - ST14之外顯子11或外顯子11之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - THBS1之外顯子9或外顯子9之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - AGRN之外顯子12或外顯子12之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - PVALB之外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - SLC3A2之轉錄本3之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - APP之外顯子14或外顯子14之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; -WRN之外顯子33或外顯子33之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - DAAM1之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體的一部分; - ASPH之外顯子22或外顯子22之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分; - NOTCH2之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - CD74之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分; - SDC4之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分; - CD44之外顯子5或外顯子5之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - SLC4A4之外顯子14或外顯子14之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分; - SDC4之外顯子4或外顯子4之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分; - ZFAT之外顯子12或外顯子12之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體的一部分;或 - DSCAML1之外顯子3或外顯子3之對偶基因變異體的一部分,與NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體的一部分。
- 如請求項7之多核苷酸,其中VAPB之外顯子1為SEQ ID NO: 17之外顯子;CADM1之外顯子7為SEQ ID NO: 39之外顯子;CD44之外顯子5為SEQ ID NO: 65之外顯子;SLC3A2之外顯子1為SEQ ID NO: 103之外顯子;VTCN1之外顯子2為SEQ ID NO: 169之外顯子;CDH1之外顯子11為SEQ ID NO: 198之外顯子;CXADR之外顯子1為SEQ ID NO: 219之外顯子;GTF2E2之外顯子2為SEQ ID NO: 236之外顯子;CSMD1之外顯子23為SEQ ID NO: 279之外顯子;PTN之外顯子4為SEQ ID NO: 318之外顯子;ST14之外顯子11為SEQ ID NO: 342之外顯子;THBS1之外顯子9為SEQ ID NO: 386之外顯子;AGRN之外顯子12為SEQ ID NO: 416之外顯子;PVALB之外顯子4為SEQ ID NO: 442之外顯子;SLC3A2之外顯子2為SEQ ID NO: 457之外顯子;APP之外顯子14為SEQ ID NO: 501之外顯子;WRN之外顯子33為SEQ ID NO: 562之外顯子;DAAM1之外顯子1為SEQ ID NO: 606之外顯子;ASPH之外顯子22為SEQ ID NO: 658之外顯子;NOTCH2之外顯子6為SEQ ID NO: 700之外顯子;CD74之外顯子2為SEQ ID NO: 720之外顯子;SDC4之外顯子2為SEQ ID NO: 746之外顯子;CD44之外顯子5為SEQ ID NO: 65之外顯子;SLC4A4之外顯子14為SEQ ID NO: 780之外顯子;SDC4之外顯子4為SEQ ID NO: 748之外顯子;ZFAT之外顯子12為SEQ ID NO: 841之外顯子;DSCAML1之外顯子3為SEQ ID NO: 872之外顯子,且NRG1之外顯子1、2、5及6分別為SEQ ID NO: 125、126、129及130之外顯子。
- 如請求項7或8中任一項之多核苷酸,其中: - 該VAPB之外顯子1或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該CADM1之外顯子7或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該CD44之外顯子5或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該SLC3A2之外顯子1或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子5或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該VTCN1之外顯子2或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該CDH1之外顯子11或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該CXADR之外顯子1或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該GTF2E2之外顯子2或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該CSMD1之外顯子23或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該PTN之外顯子4或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該ST14之外顯子11或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該THBS1之外顯子9或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該AGRN之外顯子12或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該PVALB之外顯子4或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端; - 該SCL3A2之外顯子2或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或其對偶基因變異體部分的5’端; -該APP之外顯子14或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端; - 該WRN之外顯子33或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端; - 該DAAM1之外顯子1或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子1或外顯子1之對偶基因變異體部分的5’端; - 該ASPH之外顯子22或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體部分的5’端; - 該NOTCH2之外顯子6或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端; - 該CD74之外顯子2或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體部分的5’端; - 該SDC4之外顯子2或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體部分的5’端; - 該CD44之外顯子5或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端; - 該SLC4A4之外顯子14或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端; - 該SDC4之外顯子4或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體部分的5’端; - 該ZFAT之外顯子12或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子6或外顯子6之對偶基因變異體部分的5’端;及 - 該DSCAML1之外顯子3或其對偶基因變異體部分係位於該NRG1之外顯子2或外顯子2之對偶基因變異體部分的5’端。
- 如請求項7至9中任一項之多核苷酸,其中: - 該VAPB之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 17有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - CADM1該之外顯子7之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 39有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該CD44之外顯子5之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 65有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該SLC3A2之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 103有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - VTCN1該之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 169有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該CDH1之外顯子11之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 198有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該NRG1之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 126有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該NRG1之外顯子5之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 129有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該NRG1之外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 130有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該CXADR之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 219有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該GTF2E2之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 236有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該CSMD1之外顯子23之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 279有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該PTN之外顯子4之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 318有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該ST14之外顯子11之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 342有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該THBS1之外顯子9之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 386有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該AGRN之外顯子12之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 416有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該PVALB之外顯子4之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 442有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該SCL3A2之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 457有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該APP之外顯子14之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 501有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該WRN之外顯子33之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 562有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該DAAM1之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 606有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該NRG1之外顯子1之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 125有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該ASPH之外顯子22之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 658有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該NOTCH2之外顯子6之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 700有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該CD74之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 720有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該SDC4之外顯子2之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 746有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該CD44之外顯子5之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 65有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該SLC4A4之外顯子14之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 780有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該SDC4之外顯子4之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 748有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性; - 該ZFAT之外顯子12之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 841有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性;及 - 該DSCAML1之外顯子3之對偶基因變異體與SEQ ID NO: 872有至少85%的一致性,較佳地有至少90%、92%、94%、96%或甚至98%的一致性。
- 如請求項7至10中任一項之多核苷酸,其中: - 該VAPB與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 3的2至約40個連續核酸,包括位置43及44處的核酸; - 該CADM1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 7的2至約40個連續核酸,包括位置53及54處的核酸; - 該CD44與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 11的2至約40個連續核酸,包括位置52及53處的核酸; - 該SLC3A2與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 15的2至約40個連續核酸,包括位置53及54處的核酸; - 該VTCN1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 166的2至約40個連續核酸,包括位置65及66處的核酸; - 該CDH1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 186的2至約40個連續核酸,包括位置119及120處的核酸; - 該CXADR與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 217的2至約40個連續核酸,包括位置43及44處的核酸; - 該GTF2E2與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 233的2至約40個連續核酸,包括位置141及142處的核酸; - 該CSMD1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 255的2至約40個連續核酸,包括位置88及89處的核酸; - 該PTN與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 313的2至約40個連續核酸,包括位置102及103處的核酸; - 該ST14與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 330的2至約40個連續核酸,包括位置95及96處的核酸; - 該THBS1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 376的2至約40個連續核酸,包括位置56及57處的核酸; - 該AGRN與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 403的2至約40個連續核酸,包括位置106及107處的核酸; - 該PVALB與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 437的2至約40個連續核酸,包括位置102及103處的核酸; - 該SLC3A2與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 454的2至約40個連續核酸,包括位置93及94處的核酸; - 該APP與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 486的2至約40個連續核酸,包括位置54及55處的核酸; - 該WRN與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 528的2至約40個連續核酸,包括位置96及97處的核酸; - 該DAAM1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 605的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸; - 該ASPH與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 635的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸; - 該NOTCH2與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 693的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸; - 該CD74與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 717的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸; - 該SDC4與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 743的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸; - 該CD44與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 761的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸; - 該SLC4A4與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 765的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸; - 該SDC4與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 824的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸; - 該ZFAT與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 828的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸;以及 - 該DSCAML1與NRG1之融合物包含來自SEQ ID NO: 868的2至約40個連續核酸,包括位置75及76處的核酸。
- 如請求項7至11中任一項之多核苷酸,其中: - 該VAPB與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 3或其對偶基因變異體; - 該CAD1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 7或其對偶基因變異體; - 該CD44與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 11或其對偶基因變異體; - 該SLC3A2與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 15或其對偶基因變異體; - 該VTCN1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 166或其對偶基因變異體; - 該CDH1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 186或其對偶基因變異體; - 該CXADR與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 217或其對偶基因變異體; - 該GTF2E2與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 233或其對偶基因變異體; - 該CSMD1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 255或其對偶基因變異體; - 該PTN與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 313或其對偶基因變異體; - 該ST14與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 330或其對偶基因變異體; - 該THBS1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 376或其對偶基因變異體; - 該AGRN與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 403或其對偶基因變異體; - 該PVALB與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 437或其對偶基因變異體; - 該SLC3A2與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 454或其對偶基因變異體; - 該APP與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 486或其對偶基因變異體; - 該WRN與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 528或其對偶基因變異體; - 該DAAM1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 605或其對偶基因變異體; - 該ASPH與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 635或其對偶基因變異體; - 該NOTCH2與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 693或其對偶基因變異體; - 該CD74與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 717或其對偶基因變異體; - 該SDC4與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 743或其對偶基因變異體; - 該CD44與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 761或其對偶基因變異體; - 該SLC4A4與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 765或其對偶基因變異體; - 該SDC4與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 824或其對偶基因變異體; - 該ZFAT與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 828或其對偶基因變異體;及 - 該DSCAML1與NRG1之融合物包含SEQ ID NO: 868或其對偶基因變異體。
- 如請求項7至12中任一項之多核苷酸,其中: - 該VAPB之外顯子1部分為或包含SEQ ID NO: 1或SEQ ID NO: 1之對偶基因變異體; - 該CADM1之外顯子7部分為或包含SEQ ID NO: 5或SEQ ID NO: 5之對偶基因變異體; - 該CD44之外顯子5部分為或包含SEQ ID NO: 9或SEQ ID NO: 9之對偶基因變異體; - 該SLC3A2之外顯子1部分為或包含SEQ ID NO: 13或SEQ ID NO: 13之對偶基因變異體; - 該VTCN1之外顯子2部分為或包含SEQ ID NO: 164或SEQ ID NO: 164之對偶基因變異體; - 該CDH1之外顯子11部分為或包含SEQ ID NO: 184或SEQ ID NO: 184之對偶基因變異體; - 該CXADR之外顯子1部分為或包含SEQ ID NO: 215或SEQ ID NO: 215之對偶基因變異體; - 該GTF2E2之外顯子2部分為或包含SEQ ID NO: 231或SEQ ID NO: 231之對偶基因變異體; - 該CSMD1之外顯子23部分為或包含SEQ ID NO: 253或SEQ ID NO: 253之對偶基因變異體; - 該PTN之外顯子4部分為或包含SEQ ID NO: 311或SEQ ID NO: 311之對偶基因變異體; - 該ST14之外顯子11部分為或包含SEQ ID NO: 328或SEQ ID NO: 328之對偶基因變異體; - 該THBS1之外顯子9部分為或包含SEQ ID NO: 374或SEQ ID NO: 374之對偶基因變異體; - 該AGRN之外顯子12部分為或包含SEQ ID NO: 401或SEQ ID NO: 401之對偶基因變異體; - 該PVALB之外顯子4部分為或包含SEQ ID NO: 435或SEQ ID NO: 435之對偶基因變異體; - 該SLC3A2之外顯子 2部分為或包含SEQ ID NO: 452或SEQ ID NO: 452之對偶基因變異體; - 該NRG1之外顯子2部分為或包含SEQ ID NO: 165或SEQ ID NO: 165之對偶基因變異體; - 該NRG1之外顯子5部分為或包含SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 14之對偶基因變異體; - 該NRG1之外顯子6部分為或包含SEQ ID NO: 6或其對偶基因變異體; - 該APP之外顯子14部分為或包含SEQ ID NO: 484或其對偶基因變異體; - 該WRN之外顯子33部分為或包含SEQ ID NO: 526或其對偶基因變異體; - 該DAAM1之外顯子1部分為或包含SEQ ID NO: 603或其對偶基因變異體; - 該ASPH之外顯子22部分為或包含SEQ ID NO: 633或其對偶基因變異體; - 該NOTCH2之外顯子6部分為或包含SEQ ID NO: 691或其對偶基因變異體; - 該CD74之外顯子2部分為或包含SEQ ID NO: 715或其對偶基因變異體; - 該SDC4之外顯子2部分為或包含SEQ ID NO: 741或其對偶基因變異體; - 該CD44之外顯子5部分為或包含SEQ ID NO: 759或其對偶基因變異體; - 該SLC4A4之外顯子14部分為或包含SEQ ID NO: 763或其對偶基因變異體; - 該SDC4之外顯子4部分為或包含SEQ ID NO: 822或其對偶基因變異體; - 該ZFAT之外顯子12部分為或包含SEQ ID NO: 826或其對偶基因變異體; - 該DSCAML1之外顯子3部分為或包含SEQ ID NO: 866或其對偶基因變異體;及 - 該NRG1之外顯子1部分為或包含SEQ ID NO: 604或其對偶基因變異體。
- 如請求項7至12中任一項之多核苷酸,其中: - VAPB與NRG1之融合包含一個在VAPB之外顯子1與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 3的VAPB位置43之核酸與NRG1位置44之核酸之間的接合處; - CADM1與NRG1之融合包含一個在CADM1之外顯子7與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 7的CADM1位置53之核酸與NRG1位置54之核酸之間的接合處; - CD44與NRG1之融合包含一個在CD44之外顯子5與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 11的CD44位置52之核酸與NRG1位置53之核酸之間的接合處; - SLC3A2與NRG1之融合包含一個在SLC3A2之外顯子1與NRG1之外顯子5之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 15的SLC3A2位置53之核酸與NRG1位置54之核酸之間的接合處; - VTCN1與NRG1之融合包含一個在VTCN1之外顯子2與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 166的VTCN1位置65之核酸與NRG1位置66之核酸之間的接合處; - CDH1與NRG1之融合包含一個在CDH1之外顯子11與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 186的CDH1位置119之核酸與NRG1位置120之核酸之間的接合處; - CXADR與NRG1之融合包含一個在CXADR之外顯子1與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 217的CXADR位置43之核酸與NRG1位置44之核酸之間的接合處; - GTF2E2與NRG1之融合包含一個在GTF2E2之外顯子2與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 233的GTF2E2位置141之核酸與NRG1位置142之核酸之間的接合處; - CSMD1與NRG1之融合包含一個在CSMD1之外顯子23與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 255的CSMD1位置88之核酸與NRG1位置89之核酸之間的接合處; - PTN與NRG1之融合包含一個在PTN之外顯子4與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 313的PTN位置102之核酸與NRG1位置103之核酸之間的接合處; - ST14與NRG1之融合包含一個在ST14之外顯子11與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 330的ST14位置95之核酸與NRG1位置96之核酸之間的接合處; - THBS1與NRG1之融合包含一個在THBS1之外顯子9與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 376的THBS1位置56之核酸與NRG1位置57之核酸之間的接合處; - AGRN與NRG1之融合包含一個在AGRN之外顯子12與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 403的AGRN位置106之核酸與NRG1位置107之核酸之間的接合處; - PVALB與NRG1之融合包含一個在PVALB之外顯子4與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 437的PVALB位置102之核酸與NRG1位置103之核酸之間的接合處; - SLC3A2與NRG1之融合包含一個在SLC3A2之外顯子2與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 454的SLC3A2位置93之核酸與NRG1位置94之核酸之間的接合處; - APP與NRG1之融合包含一個在APP之外顯子14與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 486的APP位置54之核酸與NRG1位置55之核酸之間的接合處; - WRN與NRG1之融合包含一個在WRN之外顯子33與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 528的WRN位置96之核酸與NRG1位置97之核酸之間的接合處; - DAAM1與NRG1之融合包含一個在DAAM1之外顯子1與NRG1之外顯子1之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 605的DAAM1位置之核酸75與NRG1位置之核酸76之間的接合處; - ASPH與NRG1之融合包含一個在ASPH之外顯子22與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 635的ASPH位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處; - NOTCH2與NRG1之融合包含一個在NOTCH2之外顯子6與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 693的NOTCH2位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處; - CD74與NRG1之融合包含一個在CD74之外顯子2與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 717的CD74位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處; - SDC4與NRG1之融合包含一個在SDC4之外顯子2與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 743的SDC4位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處; - CD44與NRG1之融合包含一個在CD44之外顯子5與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 761的VAPB位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處; - SLC4A4與NRG1之融合包含一個在SLC4A4之外顯子14與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 765的SLC4A4位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處; - SDC4與NRG1之融合包含一個在SDC4之外顯子4與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 824的SDC4位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處; - ZFAT與NRG1之融合包含一個在ZFAT之外顯子12與NRG1之外顯子6之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 828的ZFAT位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處;及 - DSCAML1與NRG1之融合包含一個在DSCAML1之外顯子3與NRG1之外顯子2之間的融合接合處,較佳為SEQ ID NO: 868的DSCAML1位置75之核酸與NRG1位置76之核酸之間的接合處。
- 如前述請求項中任一項之多核苷酸,其中該多核苷酸係經分離的或純化的。
- 如前述請求項中任一項之多核苷酸,其中該等融合中之任一者為符合讀框的融合。
- 如前述請求項中任一項之多核苷酸,其中該多核苷酸為哺乳動物多核苷酸,較佳為人類多核苷酸。
- 一種由前述請求項中任一項之多核苷酸所編碼的多肽融合物。
- 一種包含有如請求項1至17中任一項之多核苷酸的載體。
- 一種包含有如請求項1至17中任一項之多核苷酸或如請求項19之載體的重組宿主細胞。
- 一種製造如請求項18之多肽融合物的方法,包含將如請求項20之宿主細胞維持在適合該宿主細胞所包含之多核苷酸表現的條件下,藉以表現該多核苷酸且產生一多肽融合物,隨後分離或純化該多肽融合物。
- 一種製造重組宿主細胞的方法,包含將如請求項19之載體導入一宿主細胞內。
- 一種檢測測定法,其包含用於檢測如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物的存在之核酸探針、引子或引子對。
- 一種用於檢測如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物的核酸探針、引子或引子對。
- 如請求項24之核酸探針、引子或引子對,其長度為10至40個核苷酸。
- 如請求項24或25之核酸探針、引子或引子對,其中所檢測到的融合物包含: - VAPB與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 3或由其組成,且較佳地包括位置43或44的核酸; - CADM1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 7或由其組成,且較佳地包括位置53或54的核酸; - CD44與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 11或由其組成,且較佳地包括位置52或53的核酸; - SLC3A2與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 15或由其組成,且較佳地包括位置53或54的核酸; - VTCN1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 166或由其組成,且較佳地包括位置65或66的核酸; - CDH1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 186或由其組成,且較佳地包括位置119或120的核酸; - CXADR與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 217或由其組成,且較佳地包括位置43或44的核酸; - GTF2E2與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 233或由其組成,且較佳地包括位置141或142的核酸; - CSMD1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 255或由其組成,且較佳地包括位置88或89的核酸; - PTN與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 313或由其組成,且較佳地包括位置102或103的核酸; - ST14與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 330或由其組成,且較佳地包括位置95或96的核酸; - THBS1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 376或由其組成,且較佳地包括位置56或57的核酸; - AGRN與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 403或由其組成,且較佳地包括位置106或107的核酸; - PVALB與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 437或由其組成,且較佳地包括位置102或103的核酸; - SLC3A2與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 454或由其組成,且較佳地包括位置93或94的核酸; - APP與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 486或由其組成,且較佳地包括位置54或55的核酸; - WRN與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 528或由其組成,且較佳地包括位置96或97的核酸; - DAAM1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 605或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸; - ASPH與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 635或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸; - NOTCH2與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 693或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸; - CD74與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 717或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸; - SDC4與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 743或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸; - CD44與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 761或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸; - SLC4A4與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 765或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸; - SDC4與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 824或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸; - ZFAT與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 828或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸;以及 – DSCAML1與NRG1的融合物,包含有SEQ ID NO: 868或由其組成,且較佳地包括位置75或76的核酸。
- 如請求項24至26中任一項之核酸探針、引子或引子對,其中: - 用以檢測VAPB與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由VAPB之外顯子1所組成之序列或位於外顯子1的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CADM1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CADM1之外顯子7所組成之序列或位於外顯子7的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CD44 與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CD44 之外顯子5所組成之序列或位於外顯子5的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測SLC3A2之轉錄本6與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SLC3A2之外顯子1所組成之序列或位於外顯子1的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子5所組成之序列或位於外顯子5的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測VTCN1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由VTCN1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CDH1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CDH1之外顯子11所組成之序列或位於外顯子11的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CXADR與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CXADR之外顯子1所組成之序列或位於外顯子1的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測GTF2E2與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由GTF2E2之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CSMD1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CSMD1之外顯子23所組成之序列或位於外顯子23的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測PTN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由PTN之外顯子4所組成之序列或位於外顯子4的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測ST14與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由ST14之外顯子11所組成之序列或位於外顯子11的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測THBS1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由THBS1之外顯子9所組成之序列或位於外顯子9的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測AGRN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由AGRN之外顯子12所組成之序列或位於外顯子12的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測PVALB與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由PVALB之外顯子4所組成之序列或位於外顯子4的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測SLC3A2之轉錄本3與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SLC3A2之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測APP與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由APP之外顯子14所組成之序列或位於外顯子14的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測WRN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由WRN之外顯子33所組成之序列或位於外顯子33的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測DAAM1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由DAAM1之外顯子1所組成之序列或位於外顯子1的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子1所組成之序列或位於外顯子1的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測ASPH與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由ASPH之外顯子22所組成之序列或位於外顯子22的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測NOTCH2與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由NOTCH2之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CD74與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CD74之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測SDC4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SDC4之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CD44與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由CD44之外顯子5所組成之序列或位於外顯子5的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測SLC4A4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SLC4A4之外顯子14所組成之序列或位於外顯子14的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測SDC4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SDC4之外顯子4所組成之序列或位於外顯子4的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測ZFAT與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由ZFAT之外顯子12所組成之序列或位於外顯子12的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子6所組成之序列或位於外顯子6的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;或 - 用以檢測DSCAML1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由DSCAML1之外顯子3所組成之序列或位於外顯子3的5’處之序列雜交,及/或特異性地與一由NRG1之外顯子2所組成之序列或位於外顯子2的3’處之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性。
- 如請求項28之核酸探針、引子或引子對,其中: - 來自VAPB之外顯子1包含SEQ ID NO: 17或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自CADM1之外顯子7包含SEQ ID NO: 39或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自CD44之外顯子5包含SEQ ID NO: 65或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自SLC3A2之外顯子1包含SEQ ID NO: 103或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自VTCN1之外顯子2包含SEQ ID NO: 169或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自CDH1之外顯子11包含SEQ ID NO: 198或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自CXADR之外顯子1包含SEQ ID NO: 219或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自GTF2E2之外顯子2包含SEQ ID NO: 236或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自CSMD1之外顯子23包含SEQ ID NO: 279或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自PTN之外顯子4包含SEQ ID NO: 318或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自ST14之外顯子11包含SEQ ID NO: 342或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自THBS1之外顯子9包含SEQ ID NO: 386或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自AGRN之外顯子12包含SEQ ID NO: 416或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自PVALB之外顯子4包含SEQ ID NO: 442或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自SLC3A2之外顯子2包含SEQ ID NO: 457或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自APP之外顯子14包含SEQ ID NO: 501或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自WRN之外顯子33包含SEQ ID NO: 562或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自DAAM1之外顯子1包含SEQ ID NO: 606或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自ASPH之外顯子22包含SEQ ID NO: 658或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自NOTCH2之外顯子6包含SEQ ID NO: 700或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自CD74之外顯子2包含SEQ ID NO: 720或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自SDC4之外顯子2包含SEQ ID NO: 746或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自CD44之外顯子5包含SEQ ID NO: 65或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自SLC4A4之外顯子14包含SEQ ID NO: 780或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自SDC4之外顯子4包含SEQ ID NO: 748或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自ZFAT之外顯子12包含SEQ ID NO: 841或其對偶基因變異體,或是由其組成; - 來自DSCAML1之外顯子3包含SEQ ID NO: 872或其對偶基因變異體,或是由其組成;以及 - 來自NRG1之外顯子1、2、5及6分別包含SEQ ID NO: 125、126、129及130或其對偶基因變異體,或是由其組成。
- 如請求項27之核酸探針、引子或引子對,其中: - 用以檢測VAPB與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 17所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CADM1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 57所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CD44與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 99所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測SLC3A2 與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 103所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 157所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測VTCN1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 181所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CDH1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 213所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CXADR與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 219所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測GTF2E2與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 252所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CSMD1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 309所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測PTN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 326所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測ST14與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 372所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測THBS1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 399所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測AGRN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 433所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測PVALB與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 450所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測SLC3A2 與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 482所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測APP與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 524所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測WRN與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 601所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測DAAM1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 606所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 138所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測ASPH與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 689所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測NOTCH2與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 713所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CD74與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 739所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測SDC4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 757所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測CD44與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 99所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測SLC4A4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 820所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測SDC4與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 940所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性; - 用以檢測ZFAT與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 864所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 155所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性;及 - 用以檢測DSCAML1與NRG1之融合的探針、引子或引子對係特異性地與一由SEQ ID NO: 938所組成之序列雜交或其對偶基因變異體雜交,及/或特異性地與一由SEQ ID NO: 153所組成之序列雜交,或是與該等序列有95%或更高的互補序列一致性。
- 一種供使用於原位雜交測定法以檢測如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物的第一核酸探針及第二核酸探針, - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 3之位置43之核酸5’處的VAPB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 3之位置44之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 7之位置53之核酸5’處的CADM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 7之位置54之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 11之位置52之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 11之位置53之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 15之位置53之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 15之位置54之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 166之位置65之核酸5’處的VTCN1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 166之位置66之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 186之位置119之核酸5’處的CDH1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 186之位置120之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 217之位置43之核酸5’處的CXADR序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 217之位置44之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 233之位置141之核酸5’處的GTF2E2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 233之位置142之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 255之位置88之核酸5’處的CSMD1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 255之位置89之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 313之位置102之核酸5’處的PTN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 313之位置103之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 330之位置95之核酸5’處的ST14序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 330之位置96之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 376之位置56之核酸5’處的THBS1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 376之位置57之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 403之位置106之核酸5’處的AGRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 403之位置107之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 437之位置102之核酸5’處的PVALB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 437之位置103之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 454之位置93之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 454之位置94之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 486之位置54之核酸5’處的APP序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 486之位置55之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 528之位置96之核酸5’處的WRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 528之位置97之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 605之位置75之核酸5’處的DAAM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 605之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 635之位置75之核酸5’處的ASPH序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 635之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 693之位置75之核酸5’處的NOTCH2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 693之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 717之位置75之核酸5’處的CD74序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 717之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 743之位置75之核酸5’處的SDC4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 743之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 761之位置75之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 761之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 765之位置75之核酸5’處的SLC4A4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 765之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 824之位置75之核酸5’處的SDC4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 824之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交; - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 828之位置75之核酸5’處的ZFAT序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 828之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交;或 - 其中該第一探針特異性地與位於SEQ ID NO: 868之位置75之核酸5’處的DSCAML1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 868之位置76之核酸3’處的NRG1序列雜交。
- 一種用於檢測如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物所編碼的多肽之第一抗體或第一與第二抗體對組。
- 一種包含有用於檢測如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物所編碼之多肽的存在之第一抗體或第一與第二抗體組的檢測測定法,其中該第一抗體或第一與第二抗體組較佳為如請求項31之第一抗體或第一與第二抗體組。
- 如請求項31之第一抗體或第一與第二抗體組,或如請求項32之檢測測定法,其中該第一抗體係結合選自VAPB-NRG1、CADM1-NRG1、CD44-NRG1、SLC3A2-NRG1、VTCN1-NRG1、CDH1-NRG1、CXADR-NRG1、GTF2E2-NRG1、CSMD1-NRG1、PTN-NRG1、ST14-NRG1、THBS1-NRG1、AGRN-NRG1、PVALB-NRG1、APP-NRG1、WRN-NRG1、ASPH-NRG1、NOTCH2-NRG1、CD74-NRG1、SDC4-NRG1、SLC4A4-NRG1、ZFAT-NRG1或DSCAML1-NRG1之多肽融合物,而該第一與第二抗體組係分別結合VAPB與NRG1或CADM1與NRG1、或CD44與NRG1、SLC3A2與NRG1、VTCN1與NRG1、CDH1與NRG1、CXADR與NRG1、GTF2E2與NRG1、CSMD1與NRG1、PTN與NRG1、ST14與NRG1、THBS1與NRG1、AGRN與NRG1、PVALB與NRG1、APP與NRG1、WRN與NRG1、ASPH與NRG1、NOTCH2與NRG1、CD74與NRG1、SDC4與NRG1、SLC4A4與NRG1、ZFAT與NRG1、或DSCAML1與NRG1。
- 一種於樣本中鑑定如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
- 一種於樣本中檢測如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽是否存在的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
- 一種確定來自個體之異常細胞是否包含如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自該個體之異常細胞之多核苷酸或多肽內容物是否於樣本中存在該融合物。
- 一種鑑定一個體帶有如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物、或由其所編碼之多肽的方法,所述方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
- 如請求項34至37中任一項之方法,其中該檢驗包含利用諸如請求項24至29中任一項之核酸探針、引子或引子對之結合劑特異性地結合該多核苷酸或由其所編碼之多肽以檢測該融合物,或利用結合一包含有該多核苷酸融合物之多核苷酸的結合劑以檢測該融合物。
- 如請求項34至37中任一項之方法,其中該檢驗包含擴增或檢測一用於區別該多核苷酸融合物或由其所編碼之多肽是否存在的序列。
- 如請求項34至39中任一項之方法,其中該多核苷酸融合物係獲自一會表現包含有NRG1之EGF樣結構域之多核苷酸融合物的異常細胞。
- 如請求項34至40中任一項之方法,其中該方法包含從一個體獲得樣本之步驟,隨後為從該樣本中分離該多核苷酸或由其所編碼之多肽的步驟。
- 如請求項34至41中任一項之方法,其中該方法包含從該樣本純化或分離該多核苷酸的步驟。
- 如請求項34至42中任一項之方法,其中該結合劑係為或包含引子、引子對、探針或抗體。
- 如請求項34至43中任一項之方法,其中該檢驗為一種體外方法,較佳為一種活體外方法。
- 如請求項34至44中任一項之方法,其中該結合劑包含一可檢測標籤物或與其相關聯。
- 如請求項34至45中任一項之方法,其中該樣本為液態檢體樣本或固態樣本,諸如經福馬林固定之石蠟包埋組織(FFPE)樣本。
- 如請求項34至46中任一項之方法,其中該樣本包含血液、血清、血漿、胸水、尿液、精液、羊水或腹水。
- 如請求項34至47中任一項之方法,其中該樣本包含變異細胞,諸如腫瘤細胞或癌細胞,或其多核苷酸或多肽內容物。
- 一種治療患有包含了多核苷酸融合物及/或表現了由其所編碼之融合多肽之ErbB-2及/或ErbB-3陽性癌症或腫瘤之個體的方法,所述方法包含向該個體投與有效量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,其中該融合物為如請求項1至17中任一項之融合物。
- 一種抑制患有包含了多核苷酸融合物及/或表現了由其所編碼之融合多肽之ErbB-2及ErbB-3陽性癌症或腫瘤之個體病程的方法,所述方法包含向該個體投與有效量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,其中所述融合物為如請求項1至17中任一項之融合物。
- 一種供使用於患有包含了多核苷酸融合物及/或表現了由其所編碼之融合多肽之ErbB-2及ErbB-3陽性癌症或腫瘤之個體的治療中的ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,所述治療包含向該個體投與有效量之ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑,其中所述融合物為如請求項1至17中任一項之融合物。
- 一種診斷個體是否有包含如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物或由其所編碼之多肽的異常細胞之方法,該方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在該融合物。
- 如請求項52之方法,其中該檢驗包含利用諸如請求項24至29中任一項之核酸探針、引子或引子對之結合劑特異性地結合該多核苷酸或由其所編碼之多肽以檢測該融合物,或利用結合一包含有該多核苷酸融合物之多核苷酸的結合劑以檢測該融合物。
- 一種評估個體是否罹患癌症或腫瘤或是易於罹患癌症或腫瘤的方法,該方法包含檢驗獲自一個體之樣本以檢測該樣本中是否存在如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物或由其所編碼之多肽,且藉由鑑定所述多核苷酸或多肽融合物是否存在來評估所述個體罹患所述癌症或腫瘤或是易於罹患所述癌症或腫瘤。
- 如請求項49至51中任一項之方法或用途,其中該ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑係選自由以下所組成之群組:包含一結合ErbB-2之胞外部分的第一抗原結合位點及一結合ErbB-3之胞外部分的第二抗原結合位點之多特異性抗體、ErbB-2之酪胺酸激酶抑制劑、包含有一結合ErbB-2之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、包含有一結合ErbB-3之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、或其任何組合。
- 如請求項49至51、或55中任一項之方法或用途,其中該ErbB-2及/或ErbB-3標靶劑為澤妥珠單抗(zenocutuzumab)。
- 如請求項35至56中任一項之方法或用途,其中該異常細胞、癌細胞、腫瘤細胞或樣本係包含如請求項1至17之多核苷酸融合物或由其編碼之多肽,且其中該細胞或樣本所包含之多核苷酸融合物進一步包含符合讀框的融合一編碼NRG1之EGF樣結構域的編碼序列。
- 如請求項35至57中任一項之方法或用途,其中該異常細胞係來自癌症,尤其所述癌症為腺癌,更尤其是黏液腺癌、胰臟癌,更尤其是胰臟腺癌,更尤其是胰臟導管腺癌、腎細胞癌、肉瘤、膀胱癌、大腸癌、直腸癌、大腸直腸癌、膽囊癌、頭頸癌、前列腺癌、子宮癌、乳癌、卵巢癌、肝癌、子宮內膜癌、肺癌,較佳為非小細胞肺癌,較佳地、更佳地為浸潤性黏液腺癌、或是原發性癌或轉移性癌。
- 一種包含如請求項1至17中任一項之多核苷酸融合物及/或表現由其所編碼之多肽融合物的活體內動物模型,其中由該動物模型所組成之多核苷酸融合物或多肽融合物較佳地係由存在於該動物模型中之移植異常細胞所組成,或是由該動物模型的基因體所組成。
- 一種以Erb2及/或Erb3標靶劑治療如請求項59之活體內動物模型的方法,該標靶劑係選自由以下所組成之群組:包含一結合ErbB-2之胞外部分的第一抗原結合位點及一結合ErbB-3之胞外部分的第二抗原結合位點之多特異性抗體、ErbB-2之酪胺酸激酶抑制劑、包含有一結合ErbB-2之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、包含有一結合ErbB-3之胞外部分的抗原結合位點之單特異性雙價抗體、或其任何組合,所述方法包含向該動物投與所述Erb2及/或Erb3標靶劑。
- 一種供使用於原位雜交測定法以檢測VAPB、CADM1、CD44、SLC3A2、VTCN1、CDH1、CXADR、GTF2E2、CSMD1、PTN、ST14、THBS1、AGRN、PVALB、APP、WRN、DAAM1、ASPH、NOTCH2、CD74、SDC4、SLC4A4、ZFAT或DSCAML1之基因重排的第一核酸探針及第二核酸探針,其中: - 用於檢測VAPB之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 1之位置43之核酸5’處的VAPB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 1之位置43之核酸3’處的VAPB序列雜交; - 用於檢測CADM1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 5之位置53之核酸5’處的CADM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 5之位置53之核酸3’處的CADM1序列雜交; - 用於檢測CD44之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 9之位置52之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 9之位置52之核酸3’處的CD44序列雜交; - 用於檢測SLC3A2之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 13之位置53之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 13之位置53之核酸3’處的SLC3A2序列雜交; - 用於檢測VTCN1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 164之位置65之核酸5’處的VTCN1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 164之位置65之核酸3’處的VTCN1序列雜交; - 用於檢測CDH1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 184之位置119之核酸5’處的CDH1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 184之位置119之核酸3’處的CDH1序列雜交; - 用於檢測CXADR之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 215之位置43之核酸5’處的CXADR序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 215之位置43之核酸3’處的CXADR序列雜交; - 用於檢測GTF2E2之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 231之位置141之核酸5’處的GTF2E2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 231之位置141之核酸3’處的GTF2E2序列雜交; - 用於檢測CSMD1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 253之位置88之核酸5’處的CSMD1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 253之位置88之核酸3’處的CSMD1序列雜交; - 用於檢測PTN之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 311之位置102之核酸5’處的PTN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 311之位置102之核酸3’處的PTN序列雜交; - 用於檢測ST14之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 328之位置95之核酸5’處的ST14序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 328之位置95之核酸3’處的ST14序列雜交; - 用於檢測AGRN之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 401之位置106之核酸5’處的AGRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 401之位置106之核酸3’處的AGRN序列雜交; - 用於檢測THBS1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 374之位置56之核酸5’處的THBS1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 374之位置56之核酸3’處的THBS1序列雜交; - 用於檢測PVALB之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 435之位置102之核酸5’處的PVALB序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 435之位置102之核酸3’處的PVALB序列雜交; - 用於檢測SLC3A2之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 452之位置93之核酸5’處的SLC3A2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 452之位置93之核酸3’處的SLC3A2序列雜交; - 用於檢測APP之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 484之位置54之核酸5’處的APP序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 484之位置54之核酸3’處的APP序列雜交; - 用於檢測WRN之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 526之位置96之核酸5’處的WRN序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 526之位置96之核酸3’處的WRN序列雜交; - 用於檢測DAAM1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 603之位置75之核酸5’處的DAAM1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 603之位置75之核酸3’處的DAAM1序列雜交; - 用於檢測ASPH之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 633之位置75之核酸5’處的ASPH序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 633之位置75之核酸3’處的ASPH序列雜交; - 用於檢測NOTCH2之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 691之位置75之核酸5’處的NOTCH2序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 691之位置75之核酸3’處的NOTCH2序列雜交; - 用於檢測CD74之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 715之位置75之核酸5’處的CD74序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 715之位置75之核酸3’處的CD74序列雜交; - 用於檢測SDC4之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 741之位置75之核酸5’處的SDC4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 741之位置75之核酸3’處的SDC4序列雜交; - 用於檢測CD44之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 759之位置75之核酸5’處的CD44序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 759之位置75之核酸3’處的CD44序列雜交; - 用於檢測SLC4A4之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 763之位置75之核酸5’處的SLC4A4序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 763之位置75之核酸3’處的SLC4A4序列雜交; - 用於檢測SDC4 之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 822之位置75之核酸5’處的SDC4 序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 822之位置75之核酸3’處的SDC4 序列雜交; - 用於檢測ZFAT之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 826之位置75之核酸5’處的ZFAT序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 826之位置75之核酸3’處的ZFAT序列雜交;或 - 用於檢測DSCAML1之基因重排的第一探針特異性地與SEQ ID NO: 866之位置75之核酸5’處的DSCAML1序列雜交,且該第二探針特異性地與位於SEQ ID NO: 866之位置75之核酸3’處的DSCAML1序列雜交。
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