JP2021016371A - Car−t細胞の製造方法、核酸導入キャリア及びキット - Google Patents
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Abstract
Description
実施形態の核酸導入キャリアは、詳しくは後述するが、CAR−T細胞の製造のために用いられ、細胞に接触させることによりCAR遺伝子を細胞に導入することが可能である。核酸導入キャリアの一例について図1を参照して説明する。
実施形態の脂質粒子1は、複数の脂質分子1aが非共有結合で配列してできた脂質膜からなる、略球状の中空体である。そして、その中心の内腔1bに第1核酸2及び第2核酸3が内包されている。脂質粒子1は、脂質単分子膜であってもよいし、脂質二重膜であってもよい。また、脂質粒子1は、一層の膜からなっていてもよいし、多重層の膜からなっていてもよい。
1,2−ジオレオイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン(DOPE)、
1,2−ステアロイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン(DSPE)、
1,2−ジパルミトイル−sn−グリセロ−3−ホスファチジルコリン(DPPC)、
1−パルミトイル−2−オレオイル−sn−グリセロ−3−ホスファチジルコリン(POPC)、
1,2−ジ−O−オクタデシル−3−トリメチルアンモニウムプロパン(DOTMA)、
1,2−ジオレオイル−3−ジメチルアンモニウムプロパン(DODAP)、
1,2−ジミリストイル−3−ジメチルアンモニウムプロパン(14:0 DAP)、
1,2−ジパルミトイル−3−ジメチルアンモニウムプロパン(16:0 DAP)、
1,2−ジステアロイル−3−ジメチルアンモニウムプロパン(18:0 DAP)、
N−(4−カルボキシベンジル)−N,N−ジメチル−2,3−ビス(オレオイロキシ)プロパン(DOBAQ)、
1,2−ジオレオイル−3−トリメチルアンモニウムプロパン(DOTAP)、
1,2−ジオレオイル−sn−グリセロ−3−ホスホクロリン(DOPC)、
1,2−ジリノレオイル−sn−グリセロ−3−ホスホクロリン(DLPC)、
1,2−ジオレオイル−sn−グリセロ−3−ホスホ−L−セリン(DOPS)、又は
コレステロール、
或いはこれらの何れかの組み合わせ等を用いることが好ましい。特にDOTAPは、カチオン性脂質であり、その含有量によって脂質粒子1の酸解離定数を調節することができるため好ましい。上記ベース脂質は、細胞膜と融合しやすく、特に、ジアシルホスファチジルコリン、及びジアシルホスファチジルエタノールアミンを用いる場合、脂質粒子1の構造や粒子径の制御が容易であり、且つ細胞膜と融合しやすいため好ましい。脂質に含まれるアシル基の炭化水素鎖の長さはC10〜C20であることが好ましい。この炭化水素鎖は飽和炭化水素基であっても、不飽和炭化水素基であってもよい。
(式中、
Qは、3級窒素を2つ以上含み、酸素を含まない含窒素脂肪族基であり、
Rは、それぞれ独立に、C12〜C24の脂肪族基であり、
少なくとも一つのRは、その主鎖中又は側鎖中に、−C(=O)−O−、−O−C(=O)−、−O−C(=O)−O−、−S−C(=O)−、−C(=O)−S−、−C(=O)−NH−、及び−NHC(=O)−からなる群から選択される連結基LRを含む)。
(式中、
Pは、1つ以上のエーテル結合を主鎖に含むアルキレンオキシであり、
Xは、それぞれ独立に、三級アミン構造を含む2価連結基であり、
Wは、それぞれ独立に、C1〜C6アルキレンであり、
Yは、それぞれ独立に、単結合、エーテル結合、カルボン酸エステル結合、チオカルボン酸エステル結合、チオエステル結合、アミド結合、カルバメート結合及び尿素結合からなる群から選ばれる2価連結基であり、
W’は、それぞれ独立に、単結合又はC1〜C6アルキレンであり、
Zは、それぞれ独立に、脂溶性ビタミン残基、ステロール残基、又はC12〜C22脂肪族炭化水素基である)。
第1核酸2及び第2核酸3は、例えば、一本鎖又は二本鎖の環状、直鎖又は分岐鎖核酸である。第1核酸2及び第2核酸3は、例えば、DNA、RNA、PNA又はこれらの誘導体の何れかである。誘導体とは、DNA、RNA又はPNAにヌクレオチドアナログを挿入したもの、或いはDNA、RNA又はPNAの何れかの末端を標識又は官能基で修飾したもの等である。第1核酸2及び第2核酸3は、例えば、互いに異なる種類の核酸であってもよい。例えば、第1核酸2及び第2核酸3のどちらか一方がDNAで他方がRNAであってもよい。
細胞外ドメインは、上記したとおりT細胞の外側に配置され、標的と特異的に結合するドメインである。例えば細胞外ドメインは、抗標的モノクローナル抗体の抗原結合性断片、例えば、scFv断片を含む。モノクローナル抗体として、例えば、齧歯類(マウス、ラット、ウサギ等)の抗体、ヒト抗体或いはヒト化抗体等を用いることができる。scFv断片は、免疫グロブリンの軽鎖可変領域(VL)と重鎖可変領域(VH)とがリンカーを介して連結された構造体である。リンカーとして、例えば直鎖状にアミノ酸が連結したペプチドからなるペプチドリンカーを用いることができる。ペプチドリンカーは、例えば、グリシンとセリンとから構成されるリンカー(例えば、GGSリンカー又はGSリンカー)である。例えば、アミノ酸残基数が5〜25個のリンカーを用いることができる。
膜貫通ドメインは、細胞外ドメインと細胞内シグナルドメインとの間に設けられ、T細胞の細胞膜に配置されるドメインである。膜貫通ドメインとして、CD28、CD3ε、CD8α、CD3、CD4又は4−1BB等を用いることができる。或いは人工的に構築したポリペプチドからなる膜貫通ドメインを用いることも可能である。
細胞内シグナルドメインは、上記したとおりT細胞の内側に配置され、細胞外ドメインが標的の抗原と結合した際、T細胞の活性化に必要なシグナルを伝達するドメインである。細胞内シグナルドメインは、例えば、TCR複合体を介したシグナルを伝達するためのドメイン(第1ドメイン)と、共刺激シグナルを伝達するためのドメイン(第2ドメイン)とを含む。第1ドメインとして、CD3ζ又はFcεRIγ等を用いることができる。好ましくは、CD3ζが用いられる。また、第2ドメインとして、例えば、CD28、4−1BB(CD137)、CD2、CD4、CD5、CD134、OX−40又はICOS等の共刺激分子の細胞内ドメインを用いることができる。好ましくは、CD28又は4−1BBが用いられる。第1ドメイン及び第2ドメインはそれぞれ、上記列挙した要素のうち1つを含んでもよいし、同一又は異種の複数の上記要素をタンデム状に連結した構成としてもよい。
CARは、その他の要素を含んでもよい。その他の要素として、例えば、CARの分泌を促すリーダー配列(シグナルペプチド)、例えば、GM−CSFレセプターのリーダー配列等を用いることができる。また、細胞外ドメインと膜貫通ドメインとの間にスペーサードメインを配置してもよい。スペーサードメインは、CARと標的との結合を促進させ得る。スペーサードメインとして、例えば、ヒトIgG(例えばヒトIgG1、ヒトIgG4)のFc断片を用いることがきる。或いは、CD28の細胞外ドメインの一部やCD8αの細胞外ドメインの一部等をスペーサードメインとして用いることもできる。尚、膜貫通ドメインと細胞内シグナルドメインの間にもスペーサードメインを設けることもできる。
核酸凝縮ペプチド5は、より多くの核酸をより小さく凝縮し、脂質粒子1内に多くの核酸を効率よく内包するためのペプチドである。このようなペプチドとして、例えば、カチオン性のペプチドを用いることが好ましい。カチオン性のペプチドは、例えば、アニオン性の核酸の螺旋形状の隙間に入り込んで隙間を縮めることにより核酸を凝縮することができる。
RQRQRYYRQRQRGGRRRRRR (配列番号3)
RQRQRGGRRRRRR (配列番号4)。
RRRRRRYYRQRQRGGRRRRRR (配列番号5)。
GNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGY
(M9)(配列番号6)
以下に、実施形態の核酸導入キャリアを用いるCAR−T細胞の製造方法について説明する。実施形態のCAR−T細胞の製造方法は、図5に示す次の工程を含む。T細胞を含む細胞集団を、T細胞を活性化する抗体で刺激する刺激工程(S1)、刺激工程の後、細胞集団に実施形態の核酸導入キャリアを接触させる遺伝子導入工程(S2)、及び遺伝子導入工程の後、細胞集団を培養する培養工程(S3)。
実施形態のキットは、CAR−T細胞の製造方法に用いられるキットであって、実施形態の核酸導入キャリアと核酸導入キャリアの保管安定性を向上させる物質とを含む。
以下に、実施形態の方法で脂質粒子及びCAR−T細胞を作製し、使用した例について説明する。しかしながら、本発明の実施の形態は下記例に限定されるものではない。
・DNA内包キャリアの調製
DNAとして、サイトメガロウイルスプロモーターの下流にNanoLuc遺伝子を連結したプラスミドDNAを使用した。このDNAを含むDNA溶液にカチオン性ペプチドを加え、DNA−ペプチド凝縮体を形成した。次いで、それをエタノール溶解脂質溶液((6)FFT10(前記式(1−01)の脂質化合物)/DOTAP/DOPE/コレステロール/PEG−DMG=37/10.5/5.75/60/4mol)に添加し、更に10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加した後、遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮して、DNA内包キャリアを得た。当該核酸導入キャリアのDNA内包量は、Quant−iT(登録商標)PicoGreendsDNAAssayKit(サーモフィッシャー・サイエンティフィック製)で測定し、DNAが十分な量で内包されていることを確認した。
RNAとして、レポーター遺伝子である緑色蛍光蛋白質(GFP)のメッセンジャーRNA(mRNA、オズバイオサイエンス製)を使用した。このmRNAを含むRNA溶液を、エタノール溶解脂質溶液((6)FFT10/DOTAP/DOPE/コレステロール/PEG−DMG=37/10.5/5.25/60/4mol)に加え、ピペッティングで懸濁した後、10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加し、この溶液を遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮してRNA内包キャリアを得た。当該核酸導入キャリアのRNA内包量は、QuantiFluor(登録商標)RNASystem(プロメガ製)で測定し、mRNAが十分な量で内包されていることを確認した。
ヒト末梢血単核細胞(PBMC)をTexMACS培地(ミルテニーバイオテク製)で培養し、遠心で細胞を回収した後、3.3×106細胞/mLとなるように新鮮なTexMACSに細胞を懸濁して、4ウェル培養ディッシュ(Matsunami)に、1.0×106細胞/ウェルとなるように、細胞懸濁液を300μL加えた。
その後、DNA内包キャリア及びRNA内包キャリアをDNA及びRNAが2.4μg/ウェルずつ、計4.8μg/ウェルとなるように上記ウェルに添加して、37℃、5%CO2雰囲気で培養した。
比較対象として、リポフェクタミン3000試薬(インビトロジェン製)を用いて、上記プラスミドDNA及びmRNAをPBMCに導入した。導入は、当該試薬に添付されたマニュアルに従って行った。プラスミドDNAは、2.4μg/ウェルとなるようにPBMCに添加し、37℃、5%CO2雰囲気で培養した。
DNA内包キャリア又はリポフェクタミン3000を用いたプラスミドDNAの添加の48時間後、各培養プレートをインキュベータから取り出し、発光顕微鏡システム(オリンパス製)で、NanoLucの発光細胞の写真を撮影した。NanoLucの発光強度は、画像処理ソフト(ImageJ)を用いて、発光細胞の写真から求めた。
次に、RNA内包キャリア又はリポフェクタミン3000を用いたmRNAの添加の24時間後、各培養プレートをインキュベータから取り出し、遠心で細胞を回収した後、リン酸緩衝液PBSで1回洗浄後、PBSに再懸濁し、蛍光活性化セルソーター(FACS;FACSVerse(登録商標)、BDバイオサイエンス製)により、GFPの緑色蛍光を検出した。
図7に、NanoLuc発光強度の測定結果を示す。DNA内包キャリアを用いて導入した場合(核酸導入キャリア(+)、リポフェクタミン3000(−))では、リポフェクタミン3000によって導入した場合(核酸導入キャリア(−)、リポフェクタミン3000(+))の約3.5倍もの発光強度が得られた。この結果から、DNA内包キャリアを用いてDNAを導入した細胞では、DNAがよく導入され、且つNanoLuc遺伝子がよく発現していることが明らかである。このことは、DNAを脂質粒子に内包して導入する方法は、リポフェクタミンとDNAとの複合体を用いる方法よりもDNA導入効率及び遺伝子発現効率が高いことを示している。
・DNA内包キャリアの調製
DNAとして、サイトメガロウイルスプロモーターの下流にNanoLuc遺伝子を連結したプラスミドDNAを使用した。このDNAを含むDNA溶液にカチオン性ペプチドを加え、DNA−ペプチド凝縮体を形成した。次いで、それを3種のエタノール溶解脂質溶液((1)FFT10/DOTAP/コレステロール/PEG−DMG=74/21/60/4mol、(2)FFT10/SST04(前記式(2−01)の脂質化合物)/DOTAP/コレステロール/PEG−DMG=37/7.5/21/60/4mol、(3)DOTAP/コレステロール/PEG−DMG=21/30/2mol)にそれぞれ添加し、更に10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加した後、遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮して、DNA内包キャリアを得た。当該核酸導入キャリアのDNA内包量は、Quant−iT(登録商標)PicoGreendsDNAAssayKit(サーモフィッシャー・サイエンティフィック製)で測定し、DNAが十分な量で内包れていることを確認した。
ヒト末梢血単核細胞(PBMC)をTexMACS培地(ミルテニーバイオテク製)で培養し、遠心で細胞を回収した後、2.0×106細胞/mLとなるように新鮮なTexMACSに細胞を懸濁した。96ウェル培養プレートに、4.0×106細胞/ウェルとなるように、細胞懸濁液を200μL加えた。
その後、DNA内包キャリアをDNAが0.5μg/ウェルとなるように上記ウェルに添加して、37℃、5%CO2雰囲気で培養した。
DNA内包キャリアと混合したプラスミドDNAの添加の48時間後、培養プレートをインキュベータから取り出し、Nano−GloLuciferaseAssaySystem(プロメガ製)で、NanoLucの発光強度をルミノメーター(Infinite(登録商標)F200PRO、テカン製)で測定した。測定は、キット及び装置に添付のマニュアルに従って行った。
NanoLuc発光強度の測定結果を図9に示し、DNA内包量の結果を図10に示す。生分解性脂質を含む脂質粒子(1)を用いた場合では、生分解性脂質を含まない脂質粒子(3)を用いた場合と比較して、約157倍の発光強度が得られ、また5倍以上のDNA内包量が得られた。生分解性脂質を含む脂質粒子(2)を用いた場合では、脂質粒子(3)を用いた場合と比較して、約36倍の発光強度が得られ、約2倍のDNA内包量が得られた。この結果から、生分解性脂質を含む脂質粒子を用いると、核酸の内包量が向上し、且つ遺伝子の発現量が大きく向上することが明らかとなった。このことは、生分解性脂質を含む脂質粒子を用いると核酸の導入効率が非常に高くなることを示す。
・DNA内包キャリアの調製
DNAとして、サイトメガロウイルスプロモーターの下流にNanoLuc遺伝子を連結したプラスミドDNAを使用した。このDNAを含むDNA溶液にカチオン性ペプチドを加え、DNA−ペプチド凝縮体を形成した。次いで、それを表4に示す10種のエタノール溶解脂質溶液にそれぞれ添加し、更に10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加した後、遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮して、DNA内包キャリアを得た。
ヒト末梢血単核細胞(PBMC)をTexMACS培地(ミルテニーバイオテク製)で培養し、遠心で細胞を回収した後、2.0×106細胞/mLとなるように新鮮なTexMACSに細胞を懸濁した。96ウェル培養プレートに、4.0×106細胞/ウェルとなるように、細胞懸濁液を200μL加えた。
その後、DNA内包キャリアをDNAが0.5μg/ウェルとなるように上記ウェルに添加して、37℃、5%CO2雰囲気で培養した。
ゼータサイザーナノの自動滴定装置(マルバーン社製)によって、核酸導入キャリアの酸解離定数pKa(ゼータ電位が0になるpH)を測定した。pHは塩酸と水酸化Naを用いて調整した。
DNA内包キャリアと混合したプラスミドDNAの添加の48時間後、培養プレートをインキュベータから取り出し、Nano−GloLuciferaseAssaySystem(プロメガ製)で、NanoLucの発光強度をルミノメーター(Infinite(登録商標)F200PRO、テカン製)で測定した。測定は、キット及び装置に添付のマニュアルに従って行った。
・DNA内包キャリアの調製
DNAとして、サイトメガロウイルスプロモーターの下流にNanoLuc遺伝子を連結したプラスミドDNA、及びサイトメガロウイルスプロモーターの下流にGFP遺伝子を連結したプラスミドDNA使用した。これらのDNAを含むDNA溶液にカチオン性ペプチドを加え、DNA−ペプチド凝縮体を形成した。次いで、それをエタノール溶解脂質溶液((6)FFT10/DOTAP/DOPE/コレステロール/PEG−DMG=37/10.5/5.25/60/4mol)に添加し、更に10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加した後、遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮して、NanoLuc−DNA内包キャリア及びGFP−DNA内包キャリアを得た。当該核酸導入キャリアのDNA内包量は、Quant−iT(登録商標)PicoGreendsDNAAssayKit(サーモフィッシャー・サイエンティフィック製)で測定し、DNAが十分な量で内包れていることを確認した。
メッセンジャーRNA(mRNA)として、レポーター遺伝子である緑色蛍光蛋白質(GFP)のmRNA(オズバイオサイエンス製)を使用した。このmRNAを含むRNA溶液を、エタノール溶解脂質溶液((6)FFT10/DOTAP/DOPE/コレステロール/PEG−DMG=37/10.5/5.25/60/4mol)に加え、ピペッティングで懸濁した後、10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加し、この溶液を遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮してGFP−RNA内包キャリアを得た。当該核酸導入キャリアのRNA内包量は、QuantiFluor(登録商標)RNASystem(プロメガ製)で測定し、mRNAが十分な量で内包されていることを確認した。
ヒト末梢血単核細胞(PBMC)をTexMACS培地(ミルテニーバイオテク製)で培養し、遠心で細胞を回収した後、3.3×106細胞/mLとなるように新鮮なTexMACSに細胞を懸濁して、4ウェル培養ディッシュ(Matsunami)に、1.0×106細胞/ウェルとなるように、細胞懸濁液を300μL加えた。
その後、NanoLuc−DNA内包キャリアとGFP−DNA内包キャリアとをDNAが、2.4μgと2.4μgずつの合計4.8μg/ウェルとなるように上記の同じウェルに添加した(DNA×DNA共導入)。また、NanoLuc−DNA内包キャリアとGFP−RNA内包キャリアとをDNAとRNAとが、2.4μgと2.4μgずつの合計4.8μg/ウェルとなるように上記の同じウェルに添加した(DNA×RNA共導入)。細胞は、脂質粒子を添加後、37℃、5%CO2雰囲気で培養した。
核酸導入キャリア添加の24時間後、培養プレートをインキュベータから取り出し、NanoLucの発光強度とGFPの蛍光強度とを、例1に記載した発光顕微鏡システムと蛍光活性化セルソーターとでそれぞれ測定した。
図12に、NanoLuc発光強度の測定結果を、図13にGFP蛍光強度の測定結果を示す。GFP遺伝子をRNA形態で共導入した場合(DNA×RNA共導入)、同遺伝子をDNAの形態で共導入した場合(DNA×RNA共導入)の約3倍のNanoLucの発光強度が得られた。また、GFP蛍光強度に関しても、DNA×RNA共導入の場合は、DNA×DNA共導入の場合の2倍以上の強度が得られた。この結果から、両方の遺伝子をDNAの形態で共導入するよりも、異なる2種の核酸(DNA及びRNA)の形態で共導入した方が、DNA及びRNAの発現量が高いことが明らかになった。
・CAR−DNA内包キャリアの調製
DNAとして、PiggyBac認識配列(5’ITR及び3’ITR)の間にサイトメガロウイルスプロモーターとCAR遺伝子を連結したCAR遺伝子発現カセットを組込んだプラスミドDNAを使用した。CAR−DNAを含むDNA溶液をエタノール溶解脂質溶液((14)FFT10/DOTAP/コレステロール/PEG−DMG=37/21/30/2mol)に加え、ピペッティングで懸濁した後、10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加し、この溶液を遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮してCAR−DNA内包キャリアを得た。
PiggyBac mRNAは、T7プロモーターにPiggyBac遺伝子を連結したインビトロ転写用プラスミドDNAから、市販のインビトロ転写RNA合成キット(CUGA7invitrotranscriptionkit、ニッポンジーン製)によりRNAを合成した。市販のキットで当該RNAの5’末端にCap構造を付加し、3’末端にポリA構造を付加し、PiggyBacmRNAを得た。mRNAの合成は、キット添付のマニュアルに従った。PiggyBacmRNAを含むRNA溶液をエタノール溶解脂質溶液((15)FFT10/DOPE/コレステロール/PEG−DMG=37/21/30/2mol)に加え、ピペッティングで懸濁した後、10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加し、この溶液を遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮してPiggyBac−RNA内包キャリアを得た。
比較対象として、CAR−DNA、及びサイトメガロウイルスプロモーターとPiggyBac遺伝子を連結したプラスミドDNAの混合溶液をエタノール溶解脂質溶液((14)FFT10/DOTAP/コレステロール/PEG−DMG=37/21/30/2mol)に添加し、更に10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加した後、遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮して、CAR−DNA/PiggyBac−DNA内包キャリアを得た。
凍結した市販のヒト末梢血単核細胞(PBMC、Lonza)を37℃の恒温槽で融解した後、遠心で細胞を回収した。細胞を2種類のサイトカイン(10ng/mLのIL−7、5ng/mLのIL−15(ミルテニー))を含むTexMACSに懸濁した後、6cm培養ディッシュに播種して、37℃、5%CO2雰囲気のインキュベータ内で培養した。1晩培養した後、インキュベータから培養ディッシュを取り出して、遠心で細胞を回収し、TexMACS(10ng/mLのIL−7、5ng/mLのIL−15を含む)に懸濁した後、CD3抗体(ミルテニー)及びCD28抗体(ミルテニー)でコーティングした48ウェル培養プレートで、37℃、5%CO2雰囲気で一晩培養した。
核酸導入キャリア添加から7日後、培養プレートをインキュベータから取り出し、遠心で細胞を回収し、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)に懸濁した後、抗ヒトIGG抗体(Fluorescein (FITC) F(ab')2 Fragment Goat Anti-Human IgG (H+L)、Jackson ImmunoResearch)及びCD3抗体(V450 マウス抗ヒトCD3、クローンUCHT1、BDバイオサイエンス製)を加えて細胞と反応させた。反応が終了した後、遠心で細胞を回収してウシ血清アルブミンを1%含むPBSで洗浄した後、1%BSAを含むPBSに再懸濁してFACSの測定試料とした。FACSでは、抗IGG抗体結合細胞(CAR発現細胞)及び抗CD3抗体結合細胞(Tリンパ球細胞)を、APCフィルターセット及びV450フィルターセットでそれぞれ検出した。
結果を図14に示す。図14の(a)、(b)は、CAR−DNA内包キャリア及びPiggyBac−RNA内包キャリアを導入した結果を示す。図14の(c)、(d)は、CAR−DNA/PiggyBac−DNA内包キャリアを導入した結果を示す。
・CAR−DNA内包キャリアの調製
DNAとして、サイトメガロウイルスプロモーターの下流にCAR遺伝子(CD19.CAR遺伝子)を連結したプラスミドDNAを使用した。このDNAを含むDNA溶液にカチオン性ペプチドを加え、DNA−ペプチド凝縮体を形成した。次いで、それをエタノール溶解脂質溶液((16):FFT10/DOTAP/DOPE/コレステロール/PEG−DMG=37/5.25/10.5/60/4mol、(17):FFT20(前記式(1−02)の脂質化合物)/DOTAP/DOPE/コレステロール/PEG−DMG=37/10.5/5.25/60/4mol)に添加し、更に10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加した後、遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮して、DNA内包キャリアを得た。
メッセンジャーRNA(mRNA)として、PiggyBac遺伝子のmRNAを使用した。このmRNAを含むRNA溶液を、2種のエタノール溶解脂質溶液((16):FFT10/DOTAP/DOPE/コレステロール/PEG−DMG=37/5.25/10.5/60/4mol、(17):FFT20/DOTAP/DOPE/コレステロール/PEG−DMG=37/10.5/5.25/60/4mol)に加え、ピペッティングで懸濁した後、10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加し、この溶液を遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮してRNA内包キャリアを得た。
ヒト末梢血単核細胞(PBMC)をTexMACS培地(ミルテニーバイオテク製)で培養し、遠心で細胞を回収した後、2.0×106細胞/mLとなるように新鮮なTexMACSに細胞を懸濁した。48ウェル培養プレートに、1.0×106細胞/ウェルとなるように、細胞懸濁液を500μL加えた。
その後、DNA及びRNAが、それぞれ4.0μgずつの合計8.0μg/ウェルとなるように上記ウェルにDNA内包キャリアとRNA内包キャリアとを添加して、37℃、5%CO2雰囲気で培養した。
核酸導入キャリア添加から7日後及び14日後、各培養プレートをインキュベータから取り出し、遠心で細胞を回収し、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)に懸濁した後、抗ヒトIGG抗体(Fluorescein (FITC) F(ab')2 Fragment Goat Anti-Human IgG (H+L)、Jackson ImmunoResearch)及びCD3抗体(V450 マウス抗ヒトCD3、クローンUCHT1、BDバイオサイエンス製)を加えて細胞と反応させた。反応が終了した後、遠心で細胞を回収してPBSで洗浄し、PBSに再懸濁してFACSの測定試料とした。FACSでは、抗IGG抗体結合細胞(CAR発現細胞)及び抗CD3抗体結合細胞(Tリンパ球細胞)を、APCフィルターセット及びV450フィルターセットでそれぞれ検出した。
測定結果を図15及び図16に示す。図15は、(16)の脂質組成の脂質粒子を添加したPBMCの培養7日後及び14日後のCD3発現(CD3陽性)、及びCAR発現(IGG陽性)をそれぞれ縦軸と横軸にとったドットプロットを示す。図16は、(17)の脂質組成の核酸導入キャリアを用いた場合の培養7日後及び14日後のドットプロットを示す。
・CAR−DNA内包キャリアの調製
DNAとして、サイトメガロウイルスプロモーターの下流にCAR遺伝子(CD19.CAR遺伝子)を連結したプラスミドDNAを使用した。このDNAを含むDNA溶液にカチオン性ペプチドを加え、DNA−ペプチド凝縮体を形成した。次いで、それをエタノール溶解脂質溶液((14)FFT10/DOTAP/コレステロール/PEG−DMG=37/21/30/2mol)に添加し、更に10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加した後、遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮して、DNA内包キャリアを得た。
メッセンジャーRNA(mRNA)として、PiggyBac遺伝子のmRNAを使用した。このmRNAを含むRNA溶液を、エタノール溶解脂質溶液((15)FFT10/DOPE/コレステロール/PEG−DMG=37/21/30/2mol)に加え、ピペッティングで懸濁した後、10mMのHEPES(pH7.3)を静かに添加し、この溶液を遠心式限外ろ過で洗浄及び濃縮してRNA内包キャリアを得た。
ヒト末梢血単核細胞(PBMC)をTexMACS培地(ミルテニーバイオテク製)で培養し、遠心で細胞を回収した後、2.0×106細胞/mLとなるように新鮮なTexMACSに細胞を懸濁した。48ウェル培養プレートに、1.0×106細胞/ウェルとなるように、細胞懸濁液を500μL加えた。
その後、DNA及びRNAが4.0μgずつの合計8.0μg/ウェルとなるように上記ウェルにDNA内包キャリアとRNA内包キャリアとを添加して、37℃、5%CO2雰囲気で培養した。
脂質粒子添加から14日後、培養プレートをインキュベータから取り出し、遠心で細胞を回収し、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)に懸濁した後、抗ヒトIGG抗体(Fluorescein (FITC) AffiniPure F(ab')2 Fragment Goat Anti-Human IgG (H+L), Jackson ImmunoResearch inc)及び抗CD3抗体(CD3-APC human monoclonal, Miltenyi Biotec)を加えて細胞と反応させた。反応が終了した後、遠心で細胞を回収してPBSで洗浄した後、PBSに再懸濁してFACSの測定試料とした。FACSでは、抗IGG抗体結合細胞(CAR発現細胞)及び抗CD3抗体結合細胞(Tリンパ球細胞)を、FITCフィルターセット及びAPCフィルターセットでそれぞれ検出した。
CAR発現量の結果を図17に示す。この結果から、UR画分にCD3陽性(Tリンパ球細胞)かつIGG陽性の細胞(CAR発現細胞)、すなわちCAR−T細胞が22.9%含まれることが明らかとなった。
ターゲット細胞として、CD19陽性腫瘍細胞株であるSU/SR細胞を使用した。エフェクター細胞として、14日間培養したCAR−T細胞(CD19.CAR−T cell)、及びコントロールとして脂質粒子未添加T細胞を使用した。
結果を図18に示す。SUSR細胞のみの場合(a)、99.7%の割合で抗CD19抗体結合細胞(SUSR細胞)が検出されたが、CAR−T細胞と共培養した場合(c)では、抗CD19抗体結合細胞(SUSR細胞)は、1.44%のみであった。このことは、CAR−T細胞の存在により、SUSR細胞の生存率が98.5%も低下したことを示している。したがって、実施形態に従うCAR−T細胞は、優れた抗腫瘍活性を有することが明らかとなった。
1b…内腔
1c…第1の脂質粒子
1d…第2の脂質粒子
2…第1核酸
2a…CAR遺伝子配列
2b…第1のトランスポゼース認識配列
2c…第2のトランスポゼース認識配列
3…第2核酸
3a…トランスポゼース遺伝子配列
5…核酸凝縮ペプチド
10…核酸導入キャリア
20…核酸導入キャリア
21…核酸導入キャリア
22…第1のサブ核酸導入キャリア
23…第2のサブ核酸導入キャリア
25…細胞集団
26…抗体
Claims (28)
- キメラ抗原受容体(CAR)を発現する遺伝子改変T細胞(CAR−T細胞)を製造する方法であって、
T細胞を含む細胞集団を、前記T細胞を活性化する抗体で刺激する刺激工程、
前記刺激工程の後、前記細胞集団に、脂質粒子と、前記脂質粒子に内包された、CAR遺伝子を含む第1核酸及びトランスポゼース遺伝子を含む第2核酸とを含む核酸導入キャリアを接触させる遺伝子導入工程、及び
前記遺伝子導入工程の後、前記細胞集団を培養する培養工程
を含む、製造方法。 - 前記脂質粒子は、第1の脂質化合物、及び/又は第2の脂質化合物を更に含み、
前記第1の脂質化合物は、式Q−CHR2
(式中、
Qは、3級窒素を2つ以上含み、酸素を含まない含窒素脂肪族基であり、
Rは、それぞれ独立に、C12〜C24の脂肪族基であり、
少なくとも一つのRは、その主鎖中または側鎖中に、−C(=O)−O−、−O−C(=O)−、−O−C(=O)−O−、−S−C(=O)−、−C(=O)−S−、−C(=O)−NH−、および−NHC(=O)−からなる群から選択される連結基LRを含む)
で表され、
前記第2の脂質化合物は、式P−[X−W−Y−W’−Z]2
(式中、
Pは、1つ以上のエーテル結合を主鎖に含むアルキレンオキシであり、
Xは、それぞれ独立に、三級アミン構造を含む2価連結基であり、
Wは、それぞれ独立に、C1〜C6アルキレンであり、
Yは、それぞれ独立に、単結合、エーテル結合、カルボン酸エステル結合、チオカルボン酸エステル結合、チオエステル結合、アミド結合、カルバメート結合及び尿素結合からなる群から選ばれる2価連結基であり、
W’は、それぞれ独立に、単結合またはC1〜C6アルキレンであり、
Zは、それぞれ独立に、脂溶性ビタミン残基、ステロール残基、またはC12〜C22脂肪族炭化水素基である)
で表される、
請求項1に記載の方法。 - 前記脂質粒子は、前記核酸導入キャリアの表面電荷を調整する脂質と、前記核酸導入キャリア同士の凝集を抑制する脂質との少なくとも1つを更に含む、請求項1又は2に記載の方法。
- 前記脂質粒子の酸解離定数が6.5〜8.0である、請求項1〜3の何れか1項に記載の方法。
- 前記脂質粒子は中空体であり、その内腔に前記第1核酸及び前記第2核酸が内包されている、請求項1〜4の何れか1項に記載の方法。
- 前記第1核酸及び前記第2核酸は、DNA、RNA、PNA又はこれらの何れかの誘導体である、請求項1〜5の何れか1項に記載の方法。
- 前記第1核酸及び前記第2核酸は、一本鎖又は二本鎖の、環状、直鎖又は分岐鎖核酸である、請求項1〜6の何れか1項に記載の方法。
- 前記第1核酸及び前記第2核酸は、互いに異なる種類の核酸である、請求項1〜7の何れか1項に記載の方法。
- 前記第1核酸及び前記第2核酸は、一緒に前記脂質粒子に内包されているか、或いは、別々の前記脂質粒子に内包されている、請求項1〜8の何れか1項に記載の方法。
- 前記トランスポゼースは、PiggyBacである、請求項1〜9の何れか1項に記載の方法。
- 前記核酸導入キャリアは、前記第1核酸が第1の脂質粒子に内包されている第1のサブ核酸導入キャリアと、前記第2核酸が第2の脂質粒子に内包されている第2のサブ核酸導入キャリアとを含み、
前記第1の脂質粒子と、前記第2の脂質粒子とが、互いに同じ又は異なる組成を有する、請求項1〜10の何れか1項に記載の方法。 - 前記遺伝子導入工程において、前記第1のサブ核酸導入キャリアと、前記第2のサブ核酸導入キャリアとを同時に接触させる、請求項11に記載の方法。
- 前記遺伝子導入工程において、前記第2のサブ核酸導入キャリアを前記第1のサブ核酸導入キャリアよりも先に接触させる、請求項11に記載の方法。
- 前記刺激工程における前記抗体が、抗CD3抗体、抗CD28抗体の少なくともどちらか1つを含む、請求項1〜13の何れか1項に記載の方法。
- 脂質粒子と、前記脂質粒子に内包されたCAR遺伝子を含む第1核酸及び/又はトランスポゼース遺伝子を含む第2核酸とを含む核酸導入キャリア。
- 前記脂質粒子は、第1の脂質化合物、及び/又は第2の脂質化合物を更に含み、
前記第1の脂質化合物は、式Q−CHR2
(式中、
Qは、3級窒素を2つ以上含み、酸素を含まない含窒素脂肪族基であり、
Rは、それぞれ独立に、C12〜C24の脂肪族基であり、
少なくとも一つのRは、その主鎖中または側鎖中に、−C(=O)−O−、−O−C(=O)−、−O−C(=O)−O−、−S−C(=O)−、−C(=O)−S−、−C(=O)−NH−、および−NHC(=O)−からなる群から選択される連結基LRを含む)
で表され、
前記第2の脂質化合物は、式P−[X−W−Y−W’−Z]2
(式中、
Pは、1つ以上のエーテル結合を主鎖に含むアルキレンオキシであり、
Xは、それぞれ独立に、三級アミン構造を含む2価連結基であり、
Wは、それぞれ独立に、C1〜C6アルキレンであり、
Yは、それぞれ独立に、単結合、エーテル結合、カルボン酸エステル結合、チオカルボン酸エステル結合、チオエステル結合、アミド結合、カルバメート結合及び尿素結合からなる群から選ばれる2価連結基であり、
W’は、それぞれ独立に、単結合またはC1〜C6アルキレンであり、
Zは、それぞれ独立に、脂溶性ビタミン残基、ステロール残基、またはC12〜C22脂肪族炭化水素基である)
で表される、
請求項15に記載の核酸導入キャリア。 - 前記脂質粒子は、前記核酸導入キャリアの酸解離定数を調整する脂質と、前記核酸導入キャリア同士の凝集を抑制する脂質との少なくとも1つを更に含む、請求項15又は16に記載の核酸導入キャリア。
- 前記脂質粒子の酸解離定数が6.5〜8.0である、請求項15〜17の何れか1項に記載の核酸導入キャリア。
- 前記脂質粒子は中空体であり、その内腔に前記第1核酸及び/又は前記第2核酸が内包されている、請求項15〜18の何れか1項に記載の核酸導入キャリア。
- 前記第1核酸及び前記第2核酸は、DNA、RNA、PNA又はこれらの何れかの誘導体である、請求項15〜19の何れか1項に記載の核酸導入キャリア。
- 前記第1核酸及び前記第2核酸は、一本鎖又は二本鎖の、環状、直鎖又は分岐鎖核酸である、請求項15〜20の何れか1項に記載の核酸導入キャリア。
- 前記第1核酸及び前記第2核酸は、互いに異なる種類の核酸である、請求項15〜21の何れか1項に記載の核酸導入キャリア。
- 前記核酸導入キャリアが前記第1核酸及び前記第2核酸の両方を含む場合、
前記第1核酸及び前記第2核酸は、一緒に前記脂質粒子に内包されているか、或いは、別々の前記脂質粒子に内包されている、請求項15〜22の何れか1項に記載の核酸導入キャリア。 - 前記トランスポゼースは、PiggyBacである、請求項15〜23の何れか1項に記載の核酸導入キャリア。
- 前記核酸導入キャリアは、前記第1核酸が第1の脂質粒子に内包されている第1のサブ核酸導入キャリアと、前記第2核酸が第2の脂質粒子に内包されている第2のサブ核酸導入キャリアとを含み、
前記第1の脂質粒子と、前記第2の脂質粒子とが、互いに同じ又は異なる組成を有する、請求項15〜24の何れか1項に記載の核酸導入キャリア。 - 脂質粒子と、前記脂質粒子に内包されている、CAR遺伝子を含む第1核酸及び/又はトランスポゼース遺伝子を含む第2核酸とを備える核酸導入キャリア、及び
前記核酸導入キャリアの保管安定性を向上させる物質
を少なくとも含む、CAR−T細胞を製造するためのキット。 - 前記核酸導入キャリアが、固相に直接又は間接的に付着又は固定されている、請求項26に記載のキット。
- 前記固相が、金属、樹脂、ゲル又は繊維を材料とする容器、プレート又はシートである、請求項27に記載のキット。
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