JP2002281975A - Gene belonging to soy nitrate transporter 1 gene family - Google Patents
Gene belonging to soy nitrate transporter 1 gene familyInfo
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Abstract
Description
【0001】[0001]
【発明の属する技術分野】本発明は、大豆の遺伝子であ
って、窒素源への暴露によって誘導されるナイトレート
トランスポーター1遺伝子に属する遺伝子および遺伝子
断片に係わるものである。TECHNICAL FIELD The present invention relates to a soybean gene and a gene and gene fragment belonging to the nitrate transporter 1 gene induced by exposure to a nitrogen source.
【0002】[0002]
【従来の技術】植物には、窒素源への暴露によって誘導
される、ナイトレート(NO3 -)の取り込みに関与する
輸送体ナイトレートトランスポーター1(Nitrate Tran
sporter 1)とナイトレートトランスポーター2(Nitra
te Transporter 2)の2つのファミリーの存在が知られ
ている(以下、それぞれNRT1、NRT2と略記す
る)。シロイヌナズナやトマトなどの植物では、両ファ
ミリーのcDNAが、既にクローニングされている。し
かし大豆では、NRT2のcDNAが、クローニングさ
れているに過ぎない。2. Description of the Related Art Plants include a transporter, nitrate transporter 1, which is involved in the uptake of nitrate (NO 3 − ) induced by exposure to a nitrogen source.
sporter 1) and nitrate transporter 2 (Nitra
te Transporter 2) is known to exist (hereinafter abbreviated as NRT1 and NRT2, respectively). In plants such as Arabidopsis thaliana and tomato, cDNAs of both families have already been cloned. However, in soybean, the NRT2 cDNA has only been cloned.
【0003】[0003]
【発明が解決しようとする課題】本発明は、NRT1フ
ァミリーに属する、大豆の新規な遺伝子および遺伝子断
片を提供することが目的である。An object of the present invention is to provide novel soybean genes and gene fragments belonging to the NRT1 family.
【0004】[0004]
【課題を解決するための手段】上記課題を解決するた
め、本発明者らは鋭意研究を重ね、大豆のcDNAクロ
ーニングと遺伝子発現解析の結果、NRT1ファミリー
に属する大豆の新規な遺伝子および遺伝子断片を単離
し、ヌクレオチド配列を同定するに至った。Means for Solving the Problems In order to solve the above problems, the present inventors have conducted intensive studies, and as a result of soybean cDNA cloning and gene expression analysis, a novel soybean gene and gene fragment belonging to the NRT1 family have been identified. Isolation led to the identification of the nucleotide sequence.
【0005】窒素源は、多くの高等植物にとって必須の
栄養素であり、ナイトレート(NO 3 -)は、それらの内
でもメインの窒素源である。ナイトレートの同化は、根
の細胞において、土壌中からナイトレートを取り込むこ
とにより開始される。それに引き続いて、細胞中でナイ
トライト(NO2 -)を経由してアンモニウム(NH4 +)
へと還元される。根の表皮細胞および皮質細胞の原形質
膜を横断しての取り込みは、電気化学的なナイトレート
の勾配に対するエレクトロジェニック プロトン−ナイ
トレート(2H+/NO3 -)シンポートによって行われ
る。[0005] Nitrogen sources are essential for many higher plants.
Nutrients, nitrate (NO Three -) Of them
But it is the main nitrogen source. Night rate assimilation is the root
Of nitrate from soil
Is started by Following that,
Tolite (NOTwo -) Via ammonium (NHFour +)
Is reduced to Protoplasm of root epidermal and cortical cells
Transmembrane uptake is electrochemical nitrate
Proton-Ni
Treat (2H+/ NOThree -) Done by symport
You.
【0006】ナイトレートトランスポーター(NRT)
をコードする遺伝子の同定は、ナイトレート同化作用を
欠失している突然変異体に関する研究から始まった。そ
のような真核生物の突然変異体のほとんどはナイトレー
トの還元能が障害されていたが、残りの突然変異体はナ
イトレート取り込み能に欠陥を有していた。このナイト
レート取り込み能に欠陥を有する突然変異体のキャラク
タリゼーション、単離およびホモロジー解析の結果、真
核生物における2種類の遺伝子ファミリーの存在が明ら
かにされた(Crawford et al.,Trends Plant Sci. 199
8; 3:389-395)。これら2つの遺伝子ファミリーは、そ
れぞれNRT1、NRT2と命名されたが、ファミリー
間のヌクレオチド配列の類似性はないという、大きな特
徴を有していた。NRT1とNRT2の2つのファミリ
ーは高等植物間で保存されているが、NRT2ファミリ
ーは菌類や藻類でも保存されている。[0006] Night rate transporter (NRT)
The identification of the gene that encodes began with studies on mutants lacking nitrate assimilation. Most of such eukaryotic mutants had impaired ability to reduce nitrate, while the remaining mutants were defective in their ability to incorporate nitrate. Characterization, isolation and homology analysis of these mutants defective in nitrate incorporation revealed the existence of two gene families in eukaryotes (Crawford et al., Trends Plant Sci. 199
8; 3: 389-395). These two gene families were named NRT1 and NRT2, respectively, but had a significant feature that there was no nucleotide sequence similarity between the families. The NRT1 and NRT2 families are conserved among higher plants, while the NRT2 family is also conserved in fungi and algae.
【0007】Glycine max(大豆)において
は、高親和性のナイトレートトランスポーターのcDN
Aがクローニングされ、NRT2ファミリーに属する遺
伝子としてGmNRT2と命名されており、また、大豆
の根におけるGmNRT2の発現が、供給される窒素源
の種類によって異なるレギュレーションを受けること、
GmNRT2遺伝子の発現増加に伴って、根における正
味のナイトレート取り込み量が増加することが報告され
ている(Amarasinghe et al., Planta 1998; 206: 44-5
2)。しかしながら、大豆のNRT1ファミリーのナイ
トレートトランスポーター遺伝子のクローニングに関し
ては、未だ報告はない。そこで本発明者らは、大豆のc
DNAクローニングと遺伝子発現解析の結果、NRT1
ファミリーに属する大豆の新規な遺伝子および遺伝子断
片を単離し、ヌクレオチド配列を同定するに至った。[0007] In Glycine max (soy), the high affinity nitrate transporter cDN
A has been cloned and named GmNRT2 as a gene belonging to the NRT2 family, and the expression of GmNRT2 in soybean roots is subject to different regulation depending on the type of nitrogen source supplied;
It has been reported that net nitrate uptake in roots increases with increased expression of the GmNRT2 gene (Amarasinghe et al., Planta 1998; 206: 44-5).
2). However, there is no report on cloning of the nitrate transporter gene of the soybean NRT1 family. Therefore, the present inventors have developed soybean c.
As a result of DNA cloning and gene expression analysis, NRT1
Novel soybean genes and gene fragments belonging to the family have been isolated and their nucleotide sequences identified.
【0008】[0008]
【発明の実施の形態】発明の実施の形態を、実施例にも
とづき図面を参照して説明する。DETAILED DESCRIPTION OF THE PREFERRED EMBODIMENTS Embodiments of the present invention will be described based on examples with reference to the drawings.
【0009】本発明の新規な遺伝子および遺伝子断片の
cDNAクローニングは、市販の大豆cDNAライブラ
リー用いて行った。また、DNA操作法は、定法に従っ
た(Sambrook et al., Molecular Cloning: a Laborato
ry Manual, 2nd edn.,1989)。得られたcDNAクロ
ーンは、ヌクレオチド配列分析を行って遺伝子配列を明
らかにした後、既知の遺伝子配列とのホモロジー解析に
かけた。その結果、アミノ酸配列レベルでの比較におい
て、NRT2ファミリーに属する遺伝子とのホモロジー
はなく、NRT1ファミリーに属する遺伝子とのホモロ
ジーは高いことから、大豆のNRT1ファミリーに属す
る遺伝子であることを確認できた。また、既知の遺伝子
とのハイドロパシー解析の結果からも、ナイトレートト
ランスポーター遺伝子であることが推定できた。The cDNA cloning of the novel gene and gene fragment of the present invention was performed using a commercially available soybean cDNA library. The DNA manipulation method was in accordance with a conventional method (Sambrook et al., Molecular Cloning: a Laborato
ry Manual, 2 nd edn., 1989). The obtained cDNA clone was subjected to nucleotide sequence analysis to clarify the gene sequence, and then subjected to homology analysis with a known gene sequence. As a result, in comparison at the amino acid sequence level, there was no homology with the gene belonging to the NRT2 family, and the homology with the gene belonging to the NRT1 family was high. Therefore, it was confirmed that the gene belongs to the soybean NRT1 family. In addition, from the results of hydropathy analysis with known genes, it could be estimated that the gene was a nitrate transporter gene.
【0010】既知のナイトレートトランスポーター遺伝
子では、窒素源の種類によって、あるいは窒素源に対す
る暴露時間の違いによって、複雑な遺伝子発現パターン
を示すことが知られている。本発明の新規NRT1遺伝
子の場合も、複雑な遺伝子発現パターンを示すという点
では同様であった。[0010] It is known that known nitrate transporter genes exhibit a complex gene expression pattern depending on the type of nitrogen source or the difference in exposure time to the nitrogen source. The case of the novel NRT1 gene of the present invention was similar in that it showed a complicated gene expression pattern.
【0011】本発明のNRT1遺伝子が、既知のNRT
1遺伝子と異なる点は、発現している組織の違いにあ
る。既知のNRT1遺伝子、例えばシロイヌナズナ(Ar
abidopsis thaliana)、アブラナ(Brassica napus)、
トマト(Lycopersicon esculentum)の場合は、窒素源
によって遺伝子発現が誘導されるのは、主として根に限
定されている。本発明の大豆のNRT1遺伝子では、窒
素源による誘導条件によっては、根と葉の両方または葉
のみでの発現が確認できた点で、既知のNRT1遺伝子
とは明らかに異なっており、新規なNRT1遺伝子であ
ると言える。[0011] The NRT1 gene of the present invention is a known NRT1 gene.
The difference from one gene lies in the difference in the tissues that express it. Known NRT1 genes, such as Arabidopsis (Ar
abidopsis thaliana), rape (Brassica napus),
In the case of tomato (Lycopersicon esculentum), induction of gene expression by a nitrogen source is mainly limited to the root. The NRT1 gene of the soybean of the present invention is clearly different from the known NRT1 gene in that expression was confirmed in both roots and leaves, or only leaves, depending on the conditions of induction by the nitrogen source. It can be said that it is a gene.
【0012】本発明の新規な遺伝子は、遺伝子組換えに
よる植物の品種改良に利用することが可能である。例え
ば、少量の窒素肥料で、あるいは窒素分の少ないやせた
土壌で生育可能な新規組換え植物創製への利用が考えら
れる。窒素肥料が、合成肥料として大量に使用されるよ
うになってから、食料増産には大きく貢献してきたが、
一方では、窒素肥料に由来する硝酸塩が農地からしみ出
て、湖沼や湾を富栄養化させていることによる環境汚
染、農地に残留している窒素化合物による土壌の酸性化
などのマイナス面も、近年は目立っている。少量の窒素
肥料で生育可能な遺伝子組換え植物は、このような害を
低減させるために役立つ。The novel gene of the present invention can be used for plant breeding by genetic recombination. For example, it can be used for the creation of a new recombinant plant that can grow with a small amount of nitrogen fertilizer or on a soil with low nitrogen content. Nitrogen fertilizers have been used in large quantities as synthetic fertilizers, and have greatly contributed to increasing food production.
On the other hand, nitrate derived from nitrogen fertilizer exudes from farmland, causing environmental pollution due to eutrophication of lakes and bays, and acidification of soil by nitrogen compounds remaining in farmland, It has been noticeable in recent years. Genetically modified plants that can grow with small amounts of nitrogen fertilizers can help reduce such harm.
【0013】本発明の大豆NRT1遺伝子を、植物品種
改良のための遺伝子操作に用いる場合は、植物の組織内
に、遺伝子を導入する必要がある。遺伝子導入には、エ
レクトロポレーション法、ポリエチレングリコール法、
マイクロインジェクション法、マイクロプロジェクタイ
ル法などのベクターを用いない既知の方法が利用でき
る。また、ベクターを用いる形質転換法でも良い。When the soybean NRT1 gene of the present invention is used for genetic engineering for improving plant varieties, it is necessary to introduce the gene into plant tissues. For gene transfer, electroporation, polyethylene glycol,
Known methods that do not use a vector, such as a microinjection method and a microprojectile method, can be used. Alternatively, a transformation method using a vector may be used.
【0014】また、本発明の大豆NRT1遺伝子断片
は、完全長のcDNAクローンを得るためのプローブと
して利用することができる。The soybean NRT1 gene fragment of the present invention can be used as a probe for obtaining a full-length cDNA clone.
【0015】[0015]
【実施例】以下に、本発明の具体的な実施態様を実施例
として示すが、本発明はこれらの実施例のみに限定され
るものではない。EXAMPLES Specific embodiments of the present invention will be shown below as examples, but the present invention is not limited to only these examples.
【0016】[0016]
【実施例1】大豆のcDNAライブラリーは、ストラタ
ジーン(Stratagene)社製を用いた。12日目の大豆
(Glycine max cv. Williams 83)の、上胚軸(epicoty
l)由来のmRNAを用いて作製されたcDNAライブ
ラリーである。Example 1 As a soybean cDNA library, Stratagene was used. Epicoty of soybean (Glycine max cv. Williams 83) on day 12
l) A cDNA library prepared using the mRNA derived from it.
【0017】宿主菌は、大腸菌XL1−Blueを用い
た。PCR(Polymerase Chain Reaction)用として、
2つのプライマーAAT−NおよびAAT−C(表1)
を用いた時に、GmNRT1−1cDNAは増幅され、
大豆のcDNAライブラリーからクローニングできた。As a host bacterium, Escherichia coli XL1-Blue was used. For PCR (Polymerase Chain Reaction)
Two primers AAT-N and AAT-C (Table 1)
When GmNRT1-1 cDNA is amplified,
It was cloned from a soybean cDNA library.
【0018】完全長のcDNAをクローニングするため
のPCRは、大豆cDNAライブラリー0.1μgをテ
ンプレートとし、2.5ユニットのTaq DNAポリメ
レ−ス、100pmolのプライマーを用いた。GmN
RT1−1cDNAの5’−領域は、プライマー5’V
ECと3’VECのセット(表1)を用い、3’−領域
はプライマー5’SBON1と3’SBON1のセット
(表1)を用いて、それぞれのcDNAを増幅させた。
プライマー5’SBON1と3’SBON1の5’端に
は、それぞれ制限酵素BamHIおよびHindIIIの
切断部位を有している。増幅されたPCRフラグメント
を、制限酵素BamHIまたはHindIIIで切断後、
ベクターpUC118のマルティプルクローニングサイ
トに挿入した。次に、それぞれのPCRフラグメント
を、HindIII切断部位を有するオーバーラッピング
領域で再結合させた後、pBluescriptベクタ
ーのBamHI−HindIII切断部位に挿入した。最
終的な組換え体は、ヌクレオチド配列分析により確認し
た。PCR for cloning full-length cDNA was performed using 0.1 μg of a soybean cDNA library as a template, 2.5 units of Taq DNA polymerase, and 100 pmol of primers. GmN
The 5'-region of the RT1-1 cDNA is labeled with the primer 5'V
Each cDNA was amplified using a set of EC and 3 ′ VEC (Table 1) and a primer of 5 ′ SBON1 and 3 ′ SBON1 (Table 1) for the 3′-region.
The 5′-ends of the primers 5′SBON1 and 3′SBON1 have cleavage sites for restriction enzymes BamHI and HindIII, respectively. After cutting the amplified PCR fragment with restriction enzymes BamHI or HindIII,
It was inserted into the multiple cloning site of the vector pUC118. Next, each PCR fragment was recombined with an overlapping region having a HindIII cleavage site, and then inserted into the BamHI-HindIII cleavage site of the pBluescript vector. The final recombinant was confirmed by nucleotide sequence analysis.
【0019】[0019]
【表1】 [Table 1]
【0020】GmNRT1−1と相同性を有するcDN
Aを探索するため、前述の大豆cDNAライブラリーの
約1×105ファージクローンをスクリーニングした。
スクリーニング用のプローブは、GmNRT1−1cD
NAの816番目から1,267番目のヌクレオチドに
相当する452bpのDNA断片を用い、ECLキット
(Amersham-Pharmacia Biotech 製)で検出した。その
結果、GmNRT1−1およびGmNRT1−2の2つ
の完全長cDNAを検出できた。それぞれのcDNA塩
基配列を、配列表の配列番号1および配列番号2に示し
た。CDN having homology to GmNRT1-1
In order to search for A, about 1 × 10 5 phage clones of the aforementioned soybean cDNA library were screened.
The screening probe was GmNRT1-1cD.
Using a 452 bp DNA fragment corresponding to nucleotides 816 to 1,267 of NA, detection was carried out using an ECL kit (Amersham-Pharmacia Biotech). As a result, two full-length cDNAs of GmNRT1-1 and GmNRT1-2 could be detected. The respective cDNA base sequences are shown in SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2 in the sequence listing.
【0021】GmNRT1−1cDNAは、オープンリ
ーディングフレーム(ORF)の上流の同じフレーム内
に、ストップコドンがヌクレオチド17−19番目のサ
イトに存在して、そのフレーム内に最初のメチオニン残
基(Met)が存在することを示しており、また3’端
の非翻訳領域(3'-UTR)にポリ(A)テイルが存在する
ことから、完全長のcDNAであることが示された。
1,794bpから成るORFには、597アミノ酸の
ペプチドがコードされており、その分子量は65,82
0Daと計算された。GmNRT1-1 cDNA has a stop codon at the 17th-19th nucleotide site in the same frame upstream of the open reading frame (ORF), and the first methionine residue (Met) in that frame. The presence of a poly (A) tail in the untranslated region (3′-UTR) at the 3 ′ end indicated that the cDNA was a full-length cDNA.
The ORF consisting of 1,794 bp encodes a peptide of 597 amino acids and has a molecular weight of 65,82.
ODa was calculated.
【0022】GmNRT1−2cDNAも、オープンリ
ーディングフレーム(ORF)の上流の同じフレーム内
の、開始コドンから105ヌクレオチド上流のサイトに
ストップコドンが存在しており、そのフレーム内に最初
のメチオニン残基(Met)が存在することを示してお
り、また3’端の非翻訳領域(3'-UTR)にポリ(A)テ
イルが存在することから、完全長のcDNAであること
が示された。1,818bpから成るORFには、60
5アミノ酸のペプチドがコードされており、その分子量
は66,720Daと計算された。GmNRT1-2 cDNA also has a stop codon at a site 105 nucleotides upstream from the start codon in the same frame upstream of the open reading frame (ORF), and the first methionine residue (Met ), And the presence of a poly (A) tail in the untranslated region (3′-UTR) at the 3 ′ end, indicated that the cDNA was a full-length cDNA. An ORF consisting of 1,818 bp contains 60
A peptide of 5 amino acids was encoded and its molecular weight was calculated to be 66,720 Da.
【0023】[0023]
【実施例2】大豆のNRT1ファミリーに属する遺伝子
が、GmNRT1−1やGmNRT1−2以外にも存在
するのではないかと考え、さらなるcDNAクローニン
グを試みた。実験方法は、実施例1と実質的に同等であ
る。その結果、新たに3種類のcDNAを検出できた。Example 2 It was considered that a gene belonging to the soybean NRT1 family may exist in addition to GmNRT1-1 and GmNRT1-2, and further cDNA cloning was attempted. The experimental method is substantially the same as in Example 1. As a result, three new types of cDNAs could be detected.
【0024】完全長のGmNRT1−3(配列表の配列
番号3)は、RACE(Rapid Amplification of cDNA
Ends)法により得られたものであり、SMART RA
CEcDNA Amplification kit
(Clontech製)およびプライマー 5'-TTGGATTC
ACAACGTTGGACACGG-3' を用いて行った。オープンリー
ディングフレーム(ORF)の上流の同じフレーム内
に、ストップコドンがヌクレオチド138−140番目
のサイトに存在して、そのクローン内に最初のメチオニ
ン残基(Met)が存在することを示しており、また
3’端の非翻訳領域(3'-UTR)にポリ(A)テイルが存
在することから、GmNRT1−1およびGmNRT1
−2と同じく、完全長のcDNAであることが確認でき
た。1,728bpから成るORFには、575アミノ
酸のペプチドがコードされており、その分子量は64,
120Daと計算された。The full-length GmNRT1-3 (SEQ ID NO: 3 in the sequence listing) was prepared by RACE (Rapid Amplification of cDNA).
Ends) method, and the SMART RA
CEcDNA Amplification kit
(Clontech) and primer 5'-TTGGATTC
This was performed using ACAACGTTGGACACGG-3 '. In the same frame upstream of the open reading frame (ORF), a stop codon is present at nucleotides 138-140, indicating that the first methionine residue (Met) is present in the clone; Further, since the poly (A) tail exists in the untranslated region (3′-UTR) at the 3 ′ end, GmNRT1-1 and GmNRT1
As in -2, it was confirmed that the cDNA was full-length. The ORF consisting of 1,728 bp encodes a peptide of 575 amino acids and has a molecular weight of 64,
It was calculated to be 120 Da.
【0025】一方、GmNRT1−4(配列表の配列番
号4)とGmNRT1−5(配列表の配列番号5)は完
全長のcDNAではなく、遺伝子断片であった。GmN
RT1−4は、5’端の非翻訳領域(5'-UTR)、3’端
の非翻訳領域(3'-UTR)およびポリ(A)テイルを欠失
していた。GmNRT1−5は、5’端の非翻訳領域
(5'-UTR)を欠失していたが、3’端の非翻訳領域(3'
-UTR)とポリ(A)テイルは有していた。コーディング
領域に関しては、GmNRT1−4はN末端側の約30
0アミノ酸とC末端側の約50アミノ酸を欠失してい
た。また、GmNRT1−5のコーディング領域は、N
末端側の約20アミノ酸が欠失していた。On the other hand, GmNRT1-4 (SEQ ID NO: 4 in the sequence listing) and GmNRT1-5 (SEQ ID NO: 5 in the sequence listing) were not full-length cDNAs, but gene fragments. GmN
RT1-4 lacked the 5 'untranslated region (5'-UTR), the 3' untranslated region (3'-UTR) and the poly (A) tail. GmNRT1-5 lacks the 5′-end untranslated region (5′-UTR), but the 3′-end untranslated region (3′-UTR).
-UTR) and poly (A) tail. For the coding region, GmNRT1-4 is approximately 30 N-terminal.
0 amino acids and about 50 amino acids on the C-terminal side were deleted. The coding region of GmNRT1-5 is N
About 20 terminal amino acids were deleted.
【0026】[0026]
【実施例3】得られた新規なcDNA、GmNRT1−
1〜GmNRT1−5が、NRT1遺伝子ファミリーに
属することを証明するため、既に知られている他の植物
のNRT1タンパク質とのホモロジー解析を行った。G
mNRT1−2の配列を基準として、それぞれのコーデ
ィング領域のアミノ酸配列を対象に、ソフトウエアBL
ASTを用いて解析した(図1)。ホモロジーは、シロ
イヌナズナ(Arabidopsis thaliana)との比較ではAtNR
T1とは31%、AtNRT3 とは31%であり(図1)、ま
たトマト(Lycopersicon esculentum)の場合はLeNRT1-
1とは31%、LeNRT1-2とは32%であり(表2)、い
ずれも高い相同性を示した。また、大豆のNRT1ファ
ミリー間のホモロジーは、97〜29%という高い値で
あった(表2)。Example 3 The obtained novel cDNA, GmNRT1-
In order to prove that 1 to GmNRT1-5 belong to the NRT1 gene family, homology analysis with NRT1 proteins of other known plants was performed. G
Based on the sequence of mNRT1-2, the software BL
Analysis was performed using AST (FIG. 1). Homology is AtNR compared to Arabidopsis thaliana
T1 is 31% and AtNRT3 is 31% (Fig. 1). In the case of tomato (Lycopersicon esculentum), LeNRT1-
1 was 31% and LeNRT1-2 was 32% (Table 2), all showing high homology. The homology between the soybean NRT1 families was as high as 97 to 29% (Table 2).
【0027】[0027]
【表2】 [Table 2]
【0028】また、ハイドロパシー解析の結果、シロイ
ヌナズナのNRT1ファミリーに属するAtNRT1タンパク
質と同様に、12個の膜貫通セグメントを有するととも
に、中央部に疎水性が低い領域が存在するという2つの
特徴を有していた。ハイドロパシー解析の結果の一例
を、図2に示してある。As a result of the hydropathy analysis, similar to the AtNRT1 protein belonging to the NRT1 family of Arabidopsis thaliana, it has two characteristics that it has 12 transmembrane segments and a low hydrophobic region in the center. Was. FIG. 2 shows an example of the result of the hydropathy analysis.
【0029】一方、同じくGmNRT1−2を基準とし
た、大豆および他の植物のNRT2ファミリーとのホモ
ロジーは4〜3%と低く(表2)、実質的にはホモロジ
ーがないと言える。従って、NRT1ファミリーとNR
T2ファミリーとのアミノ酸配列には、明らかな違いが
存在することを証明できた。On the other hand, the homology with the NRT2 family of soybeans and other plants based on GmNRT1-2 is as low as 4 to 3% (Table 2), and it can be said that there is substantially no homology. Therefore, the NRT1 family and NR
It was proved that there was a clear difference in the amino acid sequence from the T2 family.
【0030】以上の結果を総合すると、アミノ酸配列レ
ベルでの比較により、本発明の新規遺伝子および遺伝子
断片は、大豆のNRT1ファミリーに属することが示さ
れた。When the above results are combined, the comparison at the amino acid sequence level shows that the novel gene and gene fragment of the present invention belong to the soybean NRT1 family.
【0031】[0031]
【実施例4】本発明の大豆NRT1ファミリーに属する
遺伝子の発現パターンを確認するため、以下の試験を行
った。Example 4 In order to confirm the expression pattern of a gene belonging to the soybean NRT1 family of the present invention, the following test was conducted.
【0032】フォトチャンバー内において、大豆(Glyc
ine max cv. Williams)を22℃、16時間/8時間の
明暗サイクル条件下に栽培した。窒素源によるNRT1
遺伝子のインダクションの結果は、RT−PCR(Reve
rse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction)によ
り確認した。In a photo chamber, soybeans (Glyc
ine max cv. Williams) was grown under a light / dark cycle condition of 22 ° C. and 16 hours / 8 hours. NRT1 with nitrogen source
The result of the gene induction was determined by RT-PCR (Reve
rse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction).
【0033】窒素源に対する短時間暴露の場合は、大豆
の種子は、滅菌した湿潤バーミキュライト(vermiculit
e)のトレイ中で発芽させた。6日後の実生を、栄養液
を含んだ水栽培用ポットに移し、3〜6時間処理した。
実質的に窒素源を含まない栄養液は、2mM CaSO
4,1mM MgSO4,0.94mM CaCl2,
0.5mM K2SO4,0.16mM K2HPO4,
0.082mM KH2PO4,0.024mM Fe−
EDTA,1.08mM MES バッファー,0.8
mM KOH,5μM H3BO3,2μM MnS
O4,0.8μM ZnSO4,0.033μM CoC
l,0.65nM (NH4)6MO7O24 の組成であ
る。窒素源補充栄養液には、10mM KNO3 また
は 10mMNH4Clまたは10mM KNO3 と
10mM NH4Clの両方を、実質的に窒素源を含ま
ない栄養液に添加した。培養液のpHは、6.0に調整
した。For short-term exposure to a nitrogen source, the soybean seeds are sterilized wet vermiculite.
Germinated in the tray of e). The seedlings after 6 days were transferred to a hydroponics pot containing a nutrient solution and treated for 3 to 6 hours.
A nutrient solution substantially free of nitrogen source is 2 mM CaSO
4 , 1 mM MgSO 4 , 0.94 mM CaCl 2 ,
0.5mM K 2 SO 4, 0.16mM K 2 HPO 4,
0.082mM KH 2 PO 4, 0.024mM Fe-
EDTA, 1.08 mM MES buffer, 0.8
mM KOH, 5 μM H 3 BO 3 , 2 μM MnS
O 4 , 0.8 μM ZnSO 4 , 0.033 μM CoC
1, 0.65 nM (NH 4 ) 6 MO 7 O 24 . The nutrient solution supplemented with nitrogen contains 10 mM KNO 3 or 10 mM NH 4 Cl or 10 mM KNO 3 .
Both 10 mM NH 4 Cl were added to the nutrient solution substantially free of the nitrogen source. The pH of the culture was adjusted to 6.0.
【0034】窒素源に対する長期間暴露の場合は、大豆
の種子を滅菌した湿潤バーミキュライト(vermiculit
e)のトレイ中で発芽させ、3種類の栄養液の1種類を
添加した後、7〜14日間成長させた。ナイトレートお
よびアンモニウム(NH4 +)補充液の組成は、25mM
NH4NO3,2mM CaCl2,3mM KCl,
1.6mM MgCl2,0.375mM MgSO4,
0.375mM NaH2PO4,0.05mM Fe−
EDTA,0.01mM ホウ酸,0.045mM M
nSO4,0.7μM ZnSO4,0.2μM CuS
O4,0.2μMKIである。アンモニウム補充液の組
成は、NH4NO3の代わりに、25mMコハク酸アンモ
ニウムを含有している他には、ナイトレートおよびアン
モニウム補充液と同じである。培養液のpHは、6.0
に調整した。For prolonged exposure to a nitrogen source, soybean seeds are sterilized by wet vermiculit
The seeds were germinated in the tray of e) and, after adding one of the three nutrient solutions, they were grown for 7-14 days. The composition of nitrate and ammonium (NH 4 + ) replenisher is 25 mM
NH 4 NO 3 , 2 mM CaCl 2 , 3 mM KCl,
1.6 mM MgCl 2 , 0.375 mM MgSO 4 ,
0.375mM NaH 2 PO 4, 0.05mM Fe-
EDTA, 0.01 mM boric acid, 0.045 mM M
nSO 4 , 0.7 μM ZnSO 4 , 0.2 μM CuS
O 4 , 0.2 μM KI. The composition of the ammonium replenisher is the same as the nitrate and ammonium replenisher, except that it contains 25 mM ammonium succinate instead of NH 4 NO 3 . The pH of the culture was 6.0
Was adjusted.
【0035】RT−PCRは、宝酒造のmRNA Se
lective RT−PCRキットを用いた。トータ
ルRNAは、TRIzol(GIBCO BRL製)を
用いて単離した。窒素源への短時間暴露の場合は、トー
タルRNAを大豆の根から単離した。また、窒素源への
長期間暴露の場合は、大豆の根と葉からトータルRNA
を単離した。RT-PCR was performed using Takara Shuzo's mRNA Se.
The active RT-PCR kit was used. Total RNA was isolated using TRIzol (manufactured by GIBCO BRL). For brief exposure to a nitrogen source, total RNA was isolated from soybean roots. In the case of long-term exposure to nitrogen sources, total RNA from soybean roots and leaves
Was isolated.
【0036】GmNRT1−1およびGmNRT1−2
の両方の発現を解析するためには、5’SBON1と
3’SBON1のプライマーセット(表1)を用いた。
逆転写反応は、0.1μgのトータルRNAと3’SB
ON1プライマーを用いて、50℃、15分間行った。
続くPCR反応は、5’SBON1と3’SBON1の
プライマーセットを用いて、25〜40サイクルの反応
を行った(後述の図3および4には、25、30、3
5、40の各サイクルのサンプルでの結果を示してあ
り、RT−PCR産物の経時変化を見ることができ
る)。1サイクル毎の反応は、85℃、1分間の熱変性
(denature)、45℃、1分間のアニ−リング(aneali
ng)、72℃、1分間の伸長(extension)反応を行っ
た。反応生成物を1.5%アガロースゲル電気泳動によ
り分離し、エチジウム ブロマイドで染色した。ゲル上
のバンドの濃度は、デンシトメーター(Bio-Rad製 Mole
cular Imager)で定量した。GmNRT1-1 and GmNRT1-2
To analyze the expression of both, a primer set of 5 ′ SBON1 and 3 ′ SBON1 (Table 1) was used.
The reverse transcription reaction was performed using 0.1 μg of total RNA and 3′SB
The test was performed at 50 ° C. for 15 minutes using the ON1 primer.
In the subsequent PCR reaction, 25 to 40 cycles of the reaction were performed using a primer set of 5′SBON1 and 3′SBON1 (FIGS. 3 and 4 described below show 25, 30, 3
The results are shown for samples from each cycle of 5, 40, and the time course of the RT-PCR product can be seen). Reactions per cycle were performed at 85 ° C. for 1 minute heat denaturation, 45 ° C. for 1 minute annealing.
ng) at 72 ° C. for 1 minute. Reaction products were separated by 1.5% agarose gel electrophoresis and stained with ethidium bromide. The concentration of the band on the gel was determined using a densitometer (Bio-Rad Mole
Quantification using a cular imager).
【0037】GmNRT1−1とGmNRT1−2の発
現を区別するためには、5’Ndifと3’Ndif
(表1)という別のプライマーセットを用いた。これら
はそれぞれ、GmNRT1−2のヌクレオチド配列の1
27〜143番目と313〜329番目に対応してい
る。この反応の生成物は、12%ポリアクリルアミドゲ
ル電気泳動により分離した。In order to distinguish the expression of GmNRT1-1 and GmNRT1-2, 5′Ndif and 3′Ndif
Another primer set (Table 1) was used. These are each one of the nucleotide sequences of GmNRT1-2.
27th to 143rd and 313th to 329th. The products of this reaction were separated by 12% polyacrylamide gel electrophoresis.
【0038】RT−PCRの生成物が、GmNRT1−
1とGmNRT1−2のどちらに由来するかを決定する
ためには、同じトータルRNA、同じプライマーセット
5’Ndifと3’Ndifを用いて、同じ宝酒造製の
RNA PCRキット(AMV)によるRT−PCRを
行った。この反応の生成物は、T−ベクター(Promega
製)にクローニングした後、ヌクレオチド配列分析を行
った。The product of RT-PCR is GmNRT1-
1 and GmNRT1-2, the same total RNA and the same primer set 5′Ndif and 3′Ndif were used to determine the RT-PCR using the same Takara Shuzo RNA PCR kit (AMV). Was done. The product of this reaction is a T-vector (Promega
), And nucleotide sequence analysis was performed.
【0039】GmNRT2の転写物を検出する場合に
は、RT−PCR用のプライマーセットとして、5’−
GNTと3’−GNT(表1)を用いた。mRNA S
elective RT−PCRキットを用いた本発明
の実験条件下においては、逆転写酵素を除いた条件下で
は、いかなるバンドも検出されなかった。従って、本実
施例において増幅されたバンドは、RNA由来であるこ
とが示された。図3に結果を示したが、目的のバンドの
位置は、楔形の矢印マークで示してある。When a transcript of GmNRT2 is to be detected, 5'-
GNT and 3'-GNT (Table 1) were used. mRNA S
Under the experimental conditions of the present invention using the selective RT-PCR kit, no band was detected under the conditions excluding reverse transcriptase. Therefore, it was shown that the band amplified in this example was derived from RNA. FIG. 3 shows the results. The position of the target band is indicated by a wedge-shaped arrow mark.
【0040】窒素源に短時間(3時間)暴露した場合
は、GmNRT1−1および/またはGmNRT1−2
の増幅バンドが検出されたのは、窒素源なし(Nitrogen
-free)、ナイトレート存在下での成長(Nitrate)、ナ
イトレートとアンモニウム共存下での成長(Nitrate/Am
monium)の3つのケースであり、アンモニウム存在下で
成長させた場合(Ammonium)には、増幅バンドは検出さ
れなかった(図3 A))。増幅バンドの相対的な強度
は、ナイトレート存在下、窒素源なし、ナイトレートと
アンモニウム共存下の順に大きかった。When exposed to a nitrogen source for a short time (3 hours), GmNRT1-1 and / or GmNRT1-2
No amplified band was detected without a nitrogen source (Nitrogen
-free), growth in the presence of nitrate (Nitrate), growth in the presence of nitrate and ammonium (Nitrate / Am
monium), and when grown in the presence of ammonium (Ammonium), no amplified band was detected (FIG. 3A). The relative intensity of the amplified band was higher in the presence of nitrate, no nitrogen source, and coexistence of nitrate and ammonium.
【0041】コントロールとして、NRT2ファミリー
のGmNRT2の発現を、同じトータルRNAを用いて
調べてみた。その結果、GmNRT2の増幅バンドは、
ナイトレート存在下で最も高く、窒素源なしの条件下が
次に高かったが、アンモニウム存在下では増幅バンドは
検出されなかった(図3 B))。このGmNRT2の
結果は、文献値と一致していた(Amarasinghe et al.,
Planta 1998; 206: 44-52)。窒素源に長時間(6時
間)暴露した時のトータルRNAを用いた場合は、Gm
NRT1−1および/またはGmNRT1−2およびG
mNRT2に対して、ほとんど同様の結果が得られた。As a control, the expression of GmNRT2 of the NRT2 family was examined using the same total RNA. As a result, the amplified band of GmNRT2 is
The highest in the presence of nitrate and the next highest in the absence of a nitrogen source, but no amplified band was detected in the presence of ammonium (FIG. 3B)). The GmNRT2 results were in agreement with the literature values (Amarasinghe et al.,
Planta 1998; 206: 44-52). When using total RNA after long-term (6 hours) exposure to a nitrogen source, Gm
NRT1-1 and / or GmNRT1-2 and G
Almost the same results were obtained for mNRT2.
【0042】GmNRT1−1とGmNRT1−2の発
現を区別するために、プライマーセット5’Ndifと
3’Ndif(表1)を用いてRT−PCRを行った。
この場合には、GmNRT1−1からは179bpのバ
ンドが、GmNRT1−2からは203bpのバンドが
検出される。ナイトレート存在下で成長させた根からの
トータルRNAでは、プライマー セット5’Ndif
と3’Ndifを用いたRT−PCRにより、203b
pのバンドだけが検出された(図3 C))。さらに、
ヌクレオチド配列分析により、確かにGmNRT1−2
の転写物であることを確認できた。従って、ナイトレー
ト存在下で成長させた大豆の根では、GmNRT1−2
だけが発現されていることが判明した。同様にして、窒
素源なしとナイトレートとアンモニウム共存下のケース
も、GmNRT1−2の増幅バンドだけが観察された。In order to distinguish the expression of GmNRT1-1 and GmNRT1-2, RT-PCR was performed using the primer sets 5′Ndif and 3′Ndif (Table 1).
In this case, a 179 bp band is detected from GmNRT1-1, and a 203 bp band is detected from GmNRT1-2. For total RNA from roots grown in the presence of nitrate, primer set 5'Ndif
RT-PCR using 3'Ndif and
Only the p band was detected (FIG. 3C). further,
Nucleotide sequence analysis confirms that GmNRT1-2
Was confirmed as a transcript. Therefore, in soybean roots grown in the presence of nitrate, GmNRT1-2
Was found to have been expressed. Similarly, in the case without a nitrogen source and in the presence of nitrate and ammonium, only the amplified band of GmNRT1-2 was observed.
【0043】窒素源への14日間の長期間暴露において
は、アンモニウム存在下で成長させた根だけに、GmN
RT1−2のバンドだけが観察され、ヌクレオチド配列
分析からもGmNRT1−2由来であることが確認でき
たが、ナイトレートとアンモニウム共存下では、バンド
は観察されなかった(図3 D)のレーン1および
2)。一方、葉からは、GmNRT1−1とGmNRT
1−2の2つのバンドが観察され、ヌクレオチド配列分
析からも確認できた(図3 D)のレーン4および
5)。以上の結果から、GmNRT1−1とGmNRT
1−2は、組織における発現パターンが異なっており、
GmNRT1−1は葉で発現されており、GmNRT1
−2は根と葉の両方で発現されていることが明らかにな
った。For 14 days of prolonged exposure to a nitrogen source, only roots grown in the presence of ammonium contained GmN
Only the RT1-2 band was observed, and nucleotide sequence analysis confirmed that it was derived from GmNRT1-2, but no band was observed in the presence of nitrate and ammonium (FIG. 3D), lane 1 And 2). On the other hand, GmNRT1-1 and GmNRT
Two bands of 1-2 were observed and confirmed by nucleotide sequence analysis (FIG. 3D), lanes 4 and 5). From the above results, GmNRT1-1 and GmNRT
1-2 have different expression patterns in tissues,
GmNRT1-1 is expressed in leaves and GmNRT1
-2 was found to be expressed in both roots and leaves.
【0044】図3のE)のデータは、試験に用いたトー
タルRNAの品質チェックと、結果の定量性の保証を目
的として行ったものであるが、rRNA(ribosomal RN
A)の28Sおよび18Sバンドの状態を指標として判
定した結果、問題はないことが示された。The data shown in FIG. 3E was used to check the quality of the total RNA used in the test and to assure the quantitativeness of the results.
As a result of determination using the states of the 28S and 18S bands in A) as an index, it was shown that there was no problem.
【0045】[0045]
【実施例5】GmNRT1−3およびGmNRT1−4
についても、遺伝子の発現パターンを確認するための試
験を行った。特にことわらない限り、試験条件は実施例
4と同等である。Example 5 GmNRT1-3 and GmNRT1-4
Was also tested for confirming the gene expression pattern. Unless otherwise stated, the test conditions are the same as in Example 4.
【0046】3時間処理後の根から得られたトータルR
NAの場合は、すべての条件において、GmNRT1−
3の増幅バンドが検出された(図4 A))。この結果
は、GmNRT1−3遺伝子は、構成的(constitutiv
e)に発現されていることを示している。GmNRT2
に関しては、実施例4と一致した結果が得られた(図4
B)および図3 B))。また、6時間処理後の根から
得られたトータルRNAの場合も、GmNRT1−3と
GmNRT2のどちらについても、ほぼ同等の結果が得
られた。図4のC)のデータは、試験に用いたトータル
RNAの品質チェックと、結果の定量性の保証を目的と
して行ったものであるが、rRNAの28Sおよび18
Sバンドの状態を指標として判定した結果、問題はない
ことが示された。Total R obtained from root after 3 hours treatment
In the case of NA, GmNRT1-
Three amplified bands were detected (FIG. 4A)). This result indicates that the GmNRT1-3 gene is constitutive
e). GmNRT2
As for the result, a result consistent with Example 4 was obtained (FIG. 4).
B) and FIG. 3 B)). In addition, in the case of total RNA obtained from the root after the treatment for 6 hours, almost the same results were obtained for both GmNRT1-3 and GmNRT2. The data shown in FIG. 4C) was performed for the purpose of checking the quality of the total RNA used in the test and ensuring the quantification of the results.
As a result of determining using the state of the S band as an index, it was shown that there was no problem.
【0047】窒素源への長期間暴露の場合は、アンモニ
ウム存在下およびナイトレートとアンモニウム共存下の
2つの条件下で行った。トータルRNAは、大豆の根か
らは5、7、11、14日目に調製し、葉からは11、
14日目に調製した後に、RT−PCRにかけた。プラ
イマーセットとしては、GmNRT1−3用には5’S
BON2と3’SBON2(表1)を、GmNRT1−
4用には5’SBON3と3’SBON3(表1)を用
いた。In the case of long-term exposure to a nitrogen source, the exposure was carried out under two conditions: in the presence of ammonium and in the presence of nitrate and ammonium. Total RNA was prepared on days 5, 7, 11, and 14 from soybean roots, and 11 and 11 from leaves.
After preparation on day 14, they were subjected to RT-PCR. As a primer set, 5'S for GmNRT1-3
BON2 and 3'SBON2 (Table 1) were converted to GmNRT1-
For 4, 5′SBON3 and 3′SBON3 (Table 1) were used.
【0048】根においては、GmNRT1−3の増幅バ
ンドが、すべてのサンプルで同等に検出された(図5の
A))。この結果からも、GmNRT1−3遺伝子は構
成的に発現されていることが示された。GmNRT1−
2のバンドは、アンモニウム存在下に成長させた大豆の
すべての試料において観察されたが、ナイトレートとア
ンモニウム共存下の場合は、バンドは観察されなかった
(図5のB))。バンドの強度は成長と共に徐々に増加
しており、明らかにバンドの強度の増加は、根の成長と
対応していることが示された。In the roots, amplified bands of GmNRT1-3 were equally detected in all samples (FIG. 5A). This result also indicated that the GmNRT1-3 gene was constitutively expressed. GmNRT1-
The band No. 2 was observed in all the soybean samples grown in the presence of ammonium, but no band was observed in the presence of nitrate and ammonium (FIG. 5B). Band intensity gradually increased with growth, clearly indicating that the increase in band intensity was associated with root growth.
【0049】GmNRT1−4の発現は弱く、アンモニ
ウム存在下の5日目と7日目の試料だけに観察された
(図5のC))。従って、この結果は、アンモニウム存
在下に成長させた大豆では、GmNRT1−4遺伝子は
成長の初期段階で発現しており、GmNRT1−2遺伝
子の発現は、根の成長と共に増加して行くことが示され
た。GmNRT1−5の増幅バンドは、すべての試験サ
ンプルにおいて観察できなかった。恐らく、今回の試験
条件下では、発現が低すぎるものと考えられる。GmN
RT2のバンドは、アンモニウム存在下の7日目と11
日目の試料で見られたが、ナイトレートとアンモニウム
共存下では11日目の試料だけに、非常に弱いバンドが
観察された(図5のD))。図5のE)のデータは、試
験に用いたトータルRNAの品質チェックと、結果の定
量性の保証を目的として行ったものであるが、rRNA
の28Sおよび18Sバンドの状態を指標として判定し
た結果、問題はないことが示された。The expression of GmNRT1-4 was weak and was observed only in the samples on the 5th and 7th days in the presence of ammonium (FIG. 5C). Therefore, this result indicates that in soybean grown in the presence of ammonium, the GmNRT1-4 gene is expressed at an early stage of growth, and the expression of the GmNRT1-2 gene increases with root growth. Was done. No amplified band of GmNRT1-5 could be observed in all test samples. Probably, expression is too low under the current test conditions. GmN
The RT2 band was detected on days 7 and 11 in the presence of ammonium.
As seen in the day sample, a very weak band was observed only in the sample on day 11 in the presence of nitrate and ammonium (FIG. 5D). The data in FIG. 5E) was used to check the quality of the total RNA used in the test and to assure the quantitativeness of the results.
As a result, it was shown that there was no problem.
【0050】葉では、GmNRT1−3遺伝子の増幅バ
ンドが、アンモニウム存在下およびナイトレートとアン
モニウム共存下の両方の試料において同様に検出され、
11日目と14日目の試料のバンド強度は、ほとんど同
等であった(図6のA))。しかしながら、GmNRT
1−1および/またはGmNRT1−2のバンドもまた
両方の条件下で検出され、14日目のバンドの強度は1
1日目の試料よりもずっと強かった(図6のB))。図
6のC)のデータは、試験に用いたトータルRNAの品
質チェックと、結果の定量性の保証を目的として行った
ものであるが、rRNAの28Sおよび18Sバンドの
状態を指標として判定した結果、問題はないことが示さ
れた。In leaves, amplified bands of the GmNRT1-3 gene were similarly detected in samples both in the presence of ammonium and in the presence of nitrate and ammonium,
The band intensities of the samples on the 11th and 14th days were almost the same (A in FIG. 6). However, GmNRT
A band of 1-1 and / or GmNRT1-2 was also detected under both conditions, and the intensity of the band at day 14 was 1
It was much stronger than the day 1 sample (FIG. 6B)). The data shown in FIG. 6C) was performed for the purpose of checking the quality of the total RNA used in the test and assuring the quantitativeness of the results. , Showed no problem.
【0051】[0051]
【発明の効果】本発明は、大豆のcDNAクローニング
と遺伝子発現解析の結果、NRT1ファミリーに属する
大豆の新規な遺伝子および遺伝子断片を単離し、ヌクレ
オチド配列を同定するに至った。既知のNRT1ファミ
リー遺伝子との比較、特に発現組織の違いなどから、本
発明の遺伝子および遺伝子断片は、確かに新規な遺伝子
であることを同定できた。According to the present invention, as a result of soybean cDNA cloning and gene expression analysis, novel genes and gene fragments of soybeans belonging to the NRT1 family have been isolated and their nucleotide sequences have been identified. From the comparison with the known NRT1 family genes, particularly the difference in expression tissues, etc., the genes and gene fragments of the present invention could certainly be identified as novel genes.
【0052】[0052]
【表3】 [Table 3]
【0053】[0053]
【表4】 [Table 4]
【0054】[0054]
【表5】 [Table 5]
【0055】[0055]
【表6】 [Table 6]
【0056】[0056]
【表7】 [Table 7]
【図1】大豆のGmNRT1−1およびGmNRT1−
2と、シロイヌナズナ(Arabidopsis)、アブラナ(Bras
sica)、トマト(Lycopersicon) のNRT1ファミリーと
のアミノ酸配列の比較である。GmNRT1−1と一致
しているアミノ酸は点(.)で示し、対応するアミノ酸
が存在しない部分は−マークで示し、すべてで保存され
ているアミノ酸は*マークで示している。FIG. 1. Soybean GmNRT1-1 and GmNRT1-
2 and Arabidopsis, Brassica
sica) and the tomato (Lycopersicon) NRT1 family. Amino acids corresponding to GmNRT1-1 are indicated by dots (.), Portions where no corresponding amino acid is present are indicated by-marks, and amino acids conserved in all are indicated by * marks.
【図2】タンパク質のハイドロパシープロットを示して
ある。A)は大豆のGmNRT1−2、B)はシロイヌ
ナズナのNRT1のハイドロパシープロットである。図
の上方に示したバー(−)は、12個の膜貫通領域を示
している。FIG. 2 shows a hydropathy plot of the protein. A) is a hydropathy plot of soybean GmNRT1-2, and B) is an Arabidopsis thaliana NRT1. The bar (-) shown at the top of the figure indicates 12 transmembrane regions.
【図3】GmNRT1および/またはGmNRT1−2
とGmNRT2との発現解析結果を示す電気泳動写真で
ある。主要なバンドの位置を、楔形の矢印で示してあ
る。FIG. 3. GmNRT1 and / or GmNRT1-2
9 is an electrophoretic photograph showing the results of expression analysis of GmNRT2 and GmNRT2. The location of the main band is indicated by a wedge-shaped arrow.
【図4】窒素源への短時間(3時間)暴露条件下での、
大豆の根におけるGmNRT1−3とGmNRT2との
発現の比較である。A)はGmNRT1−3、B)はG
mNRT2の結果であり、目的のバンドの位置を、楔形
の矢印で示してある。FIG. 4. Under short-term (3 hours) exposure to a nitrogen source,
It is a comparison of the expression of GmNRT1-3 and GmNRT2 in soybean roots. A) is GmNRT1-3, B) is G
This is the result of mNRT2, and the position of the target band is indicated by a wedge-shaped arrow.
【図5】窒素源への長期間暴露条件下での、大豆の根に
おける発現の比較である。A)はGmNRT1−3、
B)はGmNRT1−2、C)はGmNRT1−4、
D)はGmNRT2の結果である。それぞれ、窒素源へ
の暴露期間が、5日目、7日目、11日目および14日
目の結果を示してある。目的のバンドの位置を、楔形の
矢印で示してある。また、バンドが薄くて確認し難い部
分があるため、図5のA)〜D)のデータでは、楔形の
矢印がある場合はバンドの存在を示しており、楔形の矢
印がない場合はバンドが存在しないことを示している。FIG. 5 is a comparison of expression in soybean roots under conditions of long-term exposure to a nitrogen source. A) GmNRT1-3,
B) is GmNRT1-2, C) is GmNRT1-4,
D) is the result of GmNRT2. The duration of exposure to the nitrogen source is shown on days 5, 7, 11, and 14 respectively. The position of the band of interest is indicated by a wedge-shaped arrow. In addition, since there is a part where the band is thin and difficult to confirm, in the data of FIGS. 5A to 5D, the presence of the band is indicated when there is a wedge-shaped arrow. Indicates that it does not exist.
【図6】窒素源への長期間暴露条件下での、大豆の葉に
おける発現の比較である。A)はGmNRT1−3、
B)はGmNRT1−1および/またはGmNRT1−
2の結果である。それぞれ、窒素源への暴露期間が11
日目および14日目の結果であり、目的のバンドの位置
を楔形の矢印で示してある。FIG. 6 is a comparison of expression in soybean leaves under conditions of long-term exposure to a nitrogen source. A) GmNRT1-3,
B) is GmNRT1-1 and / or GmNRT1-
2 is the result. Each exposure period was 11
Results from days 14 and 14, with the position of the band of interest indicated by a wedge-shaped arrow.
Claims (3)
によって誘導されるナイトレートトランスポーター1遺
伝子ファミリーに属する遺伝子。1. A soybean gene belonging to the nitrate transporter 1 gene family induced by exposure to a nitrogen source.
1、配列番号2、配列番号3のいずれかで示される請求
項1に記載の大豆の遺伝子。2. The soybean gene according to claim 1, wherein the nucleotide sequence is represented by any one of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, and SEQ ID NO: 3 in the sequence listing.
または配列番号5で示される請求項1に記載の大豆の遺
伝子断片。3. The nucleotide sequence is SEQ ID NO: 4 in the sequence listing.
Alternatively, the soybean gene fragment according to claim 1 represented by SEQ ID NO: 5.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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