FR2621324A1 - NUCLEOTIDE SEQUENCE ENCODING B2 TRANSFORMER GROWTH FACTOR PRECURSOR, B2 TRANSFORMANT GROWTH FACTOR PRECURSOR, AND B2 TRANSFORMANT GROWTH FACTOR - Google Patents
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Abstract
La présente invention concerne essentiellement une séquence nucléotidique codant pour le précurseur du facteur de croissance transformant beta2. Selon l'invention, cette séquence nucléotidique comprend la séquence codante de nucléotides sensiblement telle que représentée à la figure 1a depuis environ le résidu de nucléotide numéro 1 jusqu'à environ le résidu de nucléotide numéro 1326. L'invention trouve application notamment dans la production en grande quantité du facteur de croissance transformant beta2.The present invention essentially relates to a nucleotide sequence encoding the precursor of the transforming growth factor beta2. According to the invention, this nucleotide sequence comprises the coding sequence of nucleotides substantially as represented in FIG. 1a from approximately the residue of nucleotide number 1 to approximately the residue of nucleotide number 1326. The invention finds application in particular in the production in large amounts of transforming growth factor beta2.
Description
La présente invention concerne généralement le clonage et l'expression duThe present invention generally relates to cloning and expression of
facteur de croissancegrowth factor
transformant humain beta2.human transforming beta2.
Dans ce domaine technique, on sait que le facteur de croissance transformant beta (TGF-R) est un membre d'une famille décrite récemment de polypeptides qui règlent la différenciation et la prolifération cellulaires. D'autres membres de cette famille comprennent la substance inhibitrice de Muller (Cate et al, 1986, Cell 45:685-698), les inhibines (Mason et al, 1985, Nature 318:659-663) et une protéine prédite à In this technical field, transforming growth factor beta (TGF-R) is known to be a member of a recently described family of polypeptides that regulate cell differentiation and proliferation. Other members of this family include the Muller inhibitory substance (Cate et al., 1986, Cell 45: 685-698), inhibins (Mason et al., 1985, Nature 318: 659-663) and a predicted protein
partir d'un transcrit du complexe de gène décapentaplé- from a transcript of the decapentaploid gene complex
gique de la drosophile (Padgett et al, 1987, Nature of Drosophila (Padgett et al, 1987, Nature
325:81-84)325: 81-84)
Le facteur de croissance transformant Beta (TGF-B) consiste en deux sousunités identiques liées par ponts disulfures ayant des poids moléculaires de 13 000 (Assoian et al., 1983, J. Biol. Chem. 258:7155-7160; Frolik et al, 1983, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80:3676-3680; Frolik et al. 1984, J. Biol. Chem. 260:10995-11000). Il a été purifié à partir de plusieurs sources de tissu y compris le placenta (Frolik et al., 1983, Nature 325:81-84), les plaquettes sanguines (Childs et al.,1982, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79:5312-5316; Assoian et al., 1983; J. Biol. Chem. 258: 7155- 7160), le rein (Roberts et al., 1983, Biochemistry 22:5692-5698), et d'os déminéralisés (Seyedin et al., 1985, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:119-123). En présence de sérum à 10% et de facteur de croissance épidermique, TGF-B favorise la croissance indépendante de l'ancrage de fibroblastes de reins de rats normaux (Roberts et al., 1981, Proc Natl. Acad. Sci. USA 78:5339-5343; Roberts et al., 1982, Nature 295:417-419; Twardzik et al., 1985, J. Cell. Biochem. 28:289-297); en présence de sérum à 10% seul, il est capable d'induire la formation de colonies de fibroblastes AKR-2B (Tucker et al. 1983, Cancer Res. 43:1518- 1586). TGFB s'est aussi révélé causer la différenciation de cellules de mésenchyme de muscles de Transforming Growth Factor Beta (TGF-B) consists of two identical disulfide bonded subunits with molecular weights of 13,000 (Assoian et al., 1983, J. Biol Chem 258: 7155-7160, Frolik et al. 1983, Proc Natl Acad Sci USA 80: 3676-3680, Frolik et al 1984, J. Biol Chem 260: 10995-11000). It has been purified from several tissue sources including placenta (Frolik et al., 1983, Nature 325: 81-84), platelets (Childs et al., 1982, Proc Natl Acad Sci. USA 79: 5312-5316, Assoian et al., 1983, J. Biol Chem 258: 7155-7160), the kidney (Roberts et al., 1983, Biochemistry 22: 5692-5698), and demineralized bones. (Seyedin et al., 1985, Proc Natl Acad Sci USA 82: 119-123). In the presence of 10% serum and epidermal growth factor, TGF-B promotes growth independent of fibroblast anchorage of normal rat kidneys (Roberts et al., 1981, Proc Natl Acad Sci USA 78: 5339-5343, Roberts et al., 1982, Nature 295: 417-419, Twardzik et al., 1985, J. Cell Biochem 28: 289-297); in the presence of 10% serum alone, it is capable of inducing the formation of AKR-2B fibroblast colonies (Tucker et al 1983, Cancer Res 43: 1518-1586). TGFB has also been shown to cause differentiation of muscle mesenchyme cells
foetus de rat pour produire des macromolécules spéci- rat fetus to produce specific macromolecules
fiques du cartilage (Seyedin et al., 1986, J. Biol. Chem. cartilage (Seyedin et al., 1986, J. Biol Chem.
261:5693-5695).261: 5693-5695).
En contraste avec son effet sur la prolifé- In contrast to its effect on the proliferation
ration cellulaire, TGF-3 purifié à partir de plaquettes humaines de même qu'une protéine apparentée du point de vue fonctionnel isolée à partir de cellules de callitriche africain (BSC-1) s'est révélé inhiber la croissance de certaines cellules en culture (Tucker et al., 1984, Science 226:705-707). TGF-B s'est aussi révélé inhiber la croissance de plusieurs lignées cellulaires cancéreuses humaines (Roberts et al., 1985, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:119-123). Cet effet inhibant/stimulant de TGF-B peut dépendre de plusieurs facteurs y compris le type cellulaire et l'état physiologique des cellules (pour un compte rendu voir Sporn et al., 1986, Science cell ration, TGF-3 purified from human platelets as well as a functionally related protein isolated from African Callikric Cells (BSC-1) was found to inhibit the growth of certain cells in culture ( Tucker et al., 1984, Science 226: 705-707). TGF-B has also been shown to inhibit the growth of several human cancer cell lines (Roberts et al., 1985, Proc Natl Acad Sci USA 82: 119-123). This inhibitory / stimulating effect of TGF-B may depend on several factors including cell type and physiological state of cells (for review see Sporn et al., 1986, Science).
233:532-534).233: 532-534).
Des clones d'ADNc codant pour TGF-B humain (Derynck et al., 1985, Nature 316:701-705), murin (Derinck et al., 1986, J.Biol. Chem. 261:4377-4379) et simien (Sharples et al., 1987, DNA 6:239-244) ont été isolés. L'analyse des séquences d'ADN de ces clones indique que TGF-B est synthétisé sous forme d'un polypeptide précurseur de grande taille, dont l'extrémité carboxy est clivée pour former le monomère mature de TGF-B. Une forte homologie de séquences a été trouvée dans toute la protéine précurseur de TGF-B provenant de CDNA clones encoding human TGF-B (Derynck et al., 1985, Nature 316: 701-705), murine (Derinck et al., 1986, J. Biol Chem 261: 4377-4379) and simian (Sharples et al., 1987, DNA 6: 239-244) were isolated. Analysis of the DNA sequences of these clones indicates that TGF-B is synthesized as a large precursor polypeptide, the carboxy terminus of which is cleaved to form the mature TGF-B monomer. Strong sequence homology was found in all TGF-B precursor protein from
toutes les sources ci-dessus.all sources above.
Très récemment, une protéine isolée à partir d'os bovins déminéralisés a été identifiée comme étant apparentée à TGF-B (Seyedin et al., 1987, J. Biol. Chem. 262:1946-1949). La protéine a également été isolée à partir de plaquettes de porc (Cheifetz et ai., 1987, Cell 48:409-415), d'une lignée cellulaire d'adénocarcinome de Very recently, protein isolated from demineralized bovine bone has been identified as being related to TGF-B (Seyedin et al., 1987, J. Biol Chem 262: 1946-1949). The protein was also isolated from pork platelets (Cheifetz et al., 1987, Cell 48: 409-415), from a cell adenocarcinoma cell line.
la prostate humain, PC-3 (Ikeda et al., 1987, Biochemis- the human prostate, PC-3 (Ikeda et al., 1987, Biochemis-
try 26:2406- 2410), et d'une lignée cellulaire de glio- try 26: 2406-2410), and a glio cell line.
blastome humain (Wrann et al., 1987, EMBO 6:1633-1636). Une séquence partielle d'acides aminés de cette protéine indiquait qu'elle était homologue de TGF-B et a été dénommée TGF-B2. Le TGF-B humain (Derynck et al., 1985, Nature 316:701-705), murin (Derynck et al., 1986, J. Biol. Chem. 261:4377-4379) et simien (Sharpies et al., 1987, DNA 6:239-244) décrit précédemment a été dénommé human blastoma (Wrann et al., 1987, EMBO 6: 1633-1636). A partial amino acid sequence of this protein indicated that it was homologous to TGF-B and was referred to as TGF-B2. Human TGF-B (Derynck et al., 1985, Nature 316: 701-705), murine (Derynck et al., 1986, J. Biol Chem 261: 4377-4379) and simian (Sharpies et al. 1987, DNA 6: 239-244) previously described has been referred to
TGF-B1.TGF-B1.
La présente invention a pour objet la production de grandes quantités de TGF-B2 par des cellules h8tes eucaryotes transfectées par des vecteurs d'ADN recombinant contenant une séquence codant pour TGF-B2 contr8lée par des éléments régulateurs d'expression. Dans un mode de réalisation spécifique, des clones d'ADNc codant pour le précurseur de TGF-B2 humain ont été obtenus à partir d'une bibliothèque d'ADNc constituée à partir d'une lignée cellulaire d'adénocarcinome de la prostate humain traitée au tamoxifen, PC-3. La séquence d'ADNc d'un tel clone prédit que TGF-B2 est synthétisé sous forme d'un précurseur de polypeptide de 442 acides aminés duquel est dérivée la sous-unité mature de TGF-B2 de 112 acides aminés par un clivage protéolytique. Ce précurseur de TGF-B2, dénommé TGF-B2-442, partage une homologie de 41% avec le précurseur de TGF-B1. Dans un autre mode de réalisation, des clones d'ADNc codant pour le précurseur de TGFB2 simien ont été obtenus à partir d'une bibliothèque d'ADNc constituée à partir d'une lignée cellulaire de rein de callitriche africain, BCS-40. La séquence d'ADNc d'un tel clone prédit que TGF-B2 est également synthétisé sous forme d'un précurseur de polypeptide de 414 acides aminés duquel est dérivée la sous-unité mature de TGF-B2 de 112 acides aminés par clivage protéolytique. Ce précurseur dé TGF-B2, dénommé TGF-B2-414, a une séquence d'acides aminés de 414 résidus d'acides aminés et est identique à la séquence d'acides aminés de TGF-B2-442, excepté qu'il contient un seul résidu d'asparagine au lieu de la séquence de 29 acides aminés des résidus No. 116 à 135 de The present invention relates to the production of large amounts of TGF-B2 by eukaryotic host cells transfected with recombinant DNA vectors containing a sequence encoding TGF-B2 controlled by expression regulatory elements. In a specific embodiment, cDNA clones encoding the human TGF-B2 precursor were obtained from a cDNA library made from a human prostate adenocarcinoma cell line treated with tamoxifen, PC-3. The cDNA sequence of such a clone predicts that TGF-B2 is synthesized as a 442 amino acid polypeptide precursor which is derived from the mature 112-amino acid TGF-B2 subunit by proteolytic cleavage. This TGF-B2 precursor, called TGF-B2-442, shares a 41% homology with the TGF-B1 precursor. In another embodiment, cDNA clones encoding the simian TGFB2 precursor were obtained from a cDNA library made from an African callikric kidney cell line, BCS-40. The cDNA sequence of such a clone predicts that TGF-B2 is also synthesized as a 414 amino acid polypeptide precursor which is derived from the mature 112-amino acid TGF-B2 subunit by proteolytic cleavage. This TGF-B2 precursor, designated TGF-B2-414, has an amino acid sequence of 414 amino acid residues and is identical to the amino acid sequence of TGF-B2-442 except that it contains a single residue of asparagine instead of the 29 amino acid sequence of residues No. 116 to 135 of
la séquence de TGF-B2-442 humain.the human TGF-B2-442 sequence.
Des clones provenant de la bibliothèque d'ADNc de BSC-40 qui codent pour un précurseur de TGF-B2-442 simien de même que des clones provenant de la bibliothèque d'ADNc de PC-3 humain qui codent pour un précurseur de TGFB2-414 humain ont également été identifiés. Les précurseurs de TGF-B2-442 humain et simien paraissent être parfaitement homologues au niveau des acides aminés, comme le sont les précurseurs de Clones from the BSC-40 cDNA library that encode a simian TGF-B2-442 precursor as well as clones from the human PC-3 cDNA library that encode a TGFB2-precursor. 414 human have also been identified. The human and simian TGF-B2-442 precursors appear to be perfectly homologous at the amino acid level, as are the precursors of
TGF-B2-414 humain et simien.TGF-B2-414 human and simian.
Les monomères matures de 112 acides aminés de The mature monomers of 112 amino acids of
TGF-B1 et TGF-B2 montrent 71 % d'homologie. TGF-B1 and TGF-B2 show 71% homology.
Des vecteurs d'expression contenant la séquence mature codant pour TGF-B2 jointe en phase aux séquences de signal et précurseur de TGF-B1 (demande de brevet US en instance et en co-propriété No. 189 984) ont été construits et utilisés pour transfecter des cellules ovariennes de hamster chinois (cellules CH0). Les transfectants de CHO résultants produisent et secrètent Expression vectors containing the TGF-B2 encoding mature sequence joined in phase with the TGF-B1 signal and precursor sequences (US Patent Application Pending and Co-owned No. 189,984) were constructed and used to transfect Chinese hamster ovary cells (CH0 cells). The resulting CHO transfectants produce and secrete
un TGF-B2 mature, biologiquement actif. mature, biologically active TGF-B2.
Les termes suivants tels qu'utilisés ici au The following terms as used here at
singulier ou au pluriel ont les significations indiquées. singular or plural have the meanings indicated.
TGF-B2: un facteur de croissance transformant B2 d'origine humaine ou simienne comprenant la séquence d'acides aminés sensiblement telle que représentée à la figure la depuis environ le reste d'acide aminé No. 331 jusqu'à environ le TGF-B2: a transforming growth factor B2 of human or simian origin comprising the amino acid sequence substantially as shown in Figure la from about amino acid residue No. 331 to about
reste d'acide aminé 442.amino acid residue 442.
Précurseur de TGF-B2: Une famille de molécules de facteur de croissance transformant B2 d'origine humaine ou simienne comprenant une séquence d'acides aminés sensiblement telle que représentée à la figure la depuis environ le résidu d'acide aminé No. 1 jusqu'à environ le résidu d'acide aminé No.442 dans laquelle la séquence d'acides aminés depuis le résidu d'acide aminé No. 116 jusqu'au résidu d'acide aminé No. 144 est supprimée et remplacée TGF-B2 Precursor: A family of transformant growth factor molecules B2 of human or simian origin comprising an amino acid sequence substantially as shown in Figure la from about amino acid residue No. 1 to to about amino acid residue No.442 in which the amino acid sequence from amino acid residue No. 116 to amino acid residue No. 144 is deleted and replaced
par un seul résidu d'asparagine.by a single residue of asparagine.
Le terme signifie un précurseur de TGF-B2 désigné TGF-B2-442 ou TGF-B2414 d'origine humaine ou simienne. Précurseur de TGF-B1/ The term means a TGF-B2 precursor designated TGF-B2-442 or TGF-B2414 of human or simian origin. Precursor of TGF-B1 /
TGF-B2TGF-B2
hybride: Nouvelle molécule de précurseur hybrid: New precursor molecule
de facteur de croissance transfor-transformed growth factor
mant B comprenant la séquence d'acides aminés sensiblement telle que représentée à la figure lb depuis environ le résidu d'acide aminé No. 1 jusqu'à environ le mantle B comprising the amino acid sequence substantially as shown in FIG. 1b from about amino acid residue No. 1 to about
résidu d'acide aminé No. 390.amino acid residue No. 390.
Précurseur de TGF-B1: Séquences de précurseur et de signal du facteur de croissance Precursor of TGF-B1: Growth Factor Precursor and Signal Sequences
transformant B1 simien sensible-transforming B1 simian sensitive-
ment telle que représentée à la figure lb depuis environ le résidu d'acide aminé No.1 jusqu'à environ as shown in FIG. 1b from about amino acid residue No.1 to about
le résidu d'acide aminé No. 278.amino acid residue No. 278.
Les caractéristiques et avantages de l'inven- The characteristics and advantages of the invention
tion appara!tront mieux dans la description détaillée qui will appear better in the detailed description
va suivre et qui se réfère aux figures annexées données à titre d'exemple, dans lesquelles: - la figure la représente la séquence nucléotidique d'ADNc de TGF-B2-442 humain et la séquence d'acides aminés déduite; la séquence d'insersion bp 2597 de PC-21 a été sous-clonée dans pEMBL (Dante et al., 1983, Nucleic Acids Res. 11:1645-1654) et séquencée sur les deux brins à l'aide de la réaction de terminaison au didésoxy nucléotide (Sanger et al., 1977, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74:5463-5467); la séquence codante est montrée et la séquence d'acides aminés déduite est présentée directement au-dessus; la séquence de TGF-B2 mature est encadrée e.t le peptide signal est surmonté d'un trait; les sites de glycosylation potentielle sont indiqués par des astérisques; la flèche indique le site présumé de clivage de la séquence signal; la séquence nucléotidique de l'ADNc de TGF-B2-414 simien est identique à la séquence d'ADNc de TGF-B2-442 humain excepté que les nucléotides 346 à 432 (entre crochets) sont supprimés et remplacés par la séquence AAT, et excepté que plusieurs changements silencieux de nucléotides ont lieu ailleurs dans la structure (ceci est indiqué par deslettres isolées directement au-dessous du nucléotide modifié); la séquence d'acides aminés déduite pour le précurseur de TGF-B2-414 simien est identique à la séquence d'acides aminés de précurseur de TGF-B2-442 humain sauf que l'asparagine remplace les restes d'acides aminés 116 à 144 dans la structure de TGF-B2-442 humain; la séquence nueléotidique d'un ADNc de TGF-B2-414 humain a été séquencée dans la région soulignée en traits interrompus et s'est révélée parfaitement homologue de la séquence d'ADNc de TGF-B2-442 humain mis à part que les nucléotides 346 à 432 sont supprimés et remplacés par la séquence AAT; will follow and which refers to the accompanying figures given by way of example, in which: - Figure la represents the nucleotide sequence of human TGF-B2-442 cDNA and the deduced amino acid sequence; the PC-21 bp 2597 insertional sequence was subcloned into pEMBL (Dante et al., 1983, Nucleic Acids Res., 11: 1645-1654) and sequenced on both strands using the dideoxy nucleotide termination (Sanger et al., 1977, Proc Natl Acad Sci USA 74: 5463-5467); the coding sequence is shown and the deduced amino acid sequence is presented directly above; the mature TGF-B2 sequence is flanked and the signal peptide is surmounted by a line; potential glycosylation sites are indicated by asterisks; the arrow indicates the presumed site of cleavage of the signal sequence; the nucleotide sequence of the simian TGF-B2-414 cDNA is identical to the human TGF-B2-442 cDNA sequence except that nucleotides 346 to 432 (in square brackets) are deleted and replaced by the AAT sequence, and except that several silent changes of nucleotides occur elsewhere in the structure (this is indicated by isolated letters directly beneath the modified nucleotide); the deduced amino acid sequence for the simian TGF-B2-414 precursor is identical to the human TGF-B2-442 precursor amino acid sequence except that asparagine replaces the amino acid residues 116 to 144 in the structure of human TGF-B2-442; the nucleotide sequence of a human TGF-B2-414 cDNA was sequenced in the dashed underlined region and was found to be fully homologous to the human TGF-B2-442 cDNA sequence except for the nucleotides 346 to 432 are deleted and replaced by the AAT sequence;
- la figure lb représente la séquence nucléo- FIG. 1b represents the nucleotide sequence
tidique d'ADN précurseur de TGF-B1/TGF-B2 hybride et la séquence d'acides aminés déduite; la séquence codante est montrée et la séquence d'acides aminés déduite est présentée directement au-dessus; la séquence de TGF-B2 mature est encadrée et le peptide signal précurseur est surmonté d'un trait. Les sites de glycosylation sont indiqués par des astérisques; la flèche indique le site présumé de clivage de la séquence signal. La séquence de codage mature de TGF-B2 décrite est d'origine humaine. La séquence de codage mature de TGF-B2 simien est à peu près identique à la séquence humaine: seuls trois changements silencieux de bases ont lieu et sont indiqués par des lettres isolées directement au-dessous du nucléotide modifié; les détails du clonage par ADNc de TGF-B2 et la construction du gène TGF-B1/TGF-B2 hybride sont donnés dans le texte; - la figure lc représente un diagramme schématique du gène précurseur de TGF-B1/TGF-B2 hybride; - la figure ld représente les sites de l'endonucléase de restriction de pPC-14 (2,2 kb) et pPC-21 (2,3 kb);les régions encadrées indiquent les séquences de codage pour le monomère de TGF-B2; ATG représente le codon de méthionine d'initiation; la TGF-B1 / TGF-B2 precursor DNA precursor DNA hybrid and deduced amino acid sequence; the coding sequence is shown and the deduced amino acid sequence is presented directly above; the mature TGF-B2 sequence is flanked and the precursor signal peptide is surmounted by a line. The glycosylation sites are indicated by asterisks; the arrow indicates the presumed site of cleavage of the signal sequence. The mature TGF-B2 coding sequence described is of human origin. The simian TGF-B2 mature coding sequence is approximately identical to the human sequence: only three base silencing changes take place and are indicated by single letters directly beneath the modified nucleotide; the details of the cDNA cloning of TGF-B2 and the construction of the TGF-B1 / TGF-B2 hybrid gene are given in the text; FIG. 1c is a schematic diagram of the hybrid TGF-B1 / TGF-B2 precursor gene; Figure 1d shows the sites of the restriction endonuclease of pPC-14 (2.2 kb) and pPC-21 (2.3 kb), the boxed regions indicate the coding sequences for the TGF-B2 monomer; ATG represents the initiation methionine codon; the
262 1 324262 1,324
distance entre ATG et le site KpnI dans pPC-21 (2,34 kb) est d'approximativement 420 bp; la zone noircie indique la position de l'insertion de 84 bp dans pPC-21 (2,3 kb); - la figure le représente une analyse partielle de séquences d'ADN de pPC-14 (2,2 kb); un oligonucléotide synthétique 5'-AGGAGCGACGAAGAGTACTA-3' qui s'hybridait approximativement 140 bp en amont du site KpnI à l'intérieur de la séquence d'insertion dans pPC-21 (2,3 kb) a été utilisé pour amorcer les réactions de séquençage d'ADN; dans cette région, la séquence de pPC-14 (2,2 kb) (ligne supérieure) est identique à pPC-21 (2,3 kb) jusqu'aux nucléotides codant pour Asn-116; l'insertion de 84 bp à l'intérieur du codon Asn-116 de pPC-14 (2,2 kb) qui a été trouvée dans pPC-21 (2,3 kb) est montrée; le site KpnI à l'intérieur de la séquence d' -sertion est représenté; - la figure 2 représente des homologies de séquences de précurseurs de TGF-B1 et TGF-B2-442 humain; distance between ATG and the KpnI site in pPC-21 (2.34 kb) is approximately 420 bp; the blackened area indicates the position of the 84 bp insertion in pPC-21 (2.3 kb); FIG. 1a shows a partial analysis of DNA sequences of pPC-14 (2.2 kb); a synthetic oligonucleotide 5'-AGGAGCGACGAAGAGTACTA-3 'which hybridized approximately 140 bp upstream of the KpnI site within the insertion sequence in pPC-21 (2.3 kb) was used to prime the DNA sequencing; in this region, the pPC-14 (2.2 kb) sequence (upper line) is identical to pPC-21 (2.3 kb) to the nucleotides encoding Asn-116; the insertion of 84 bp within the Asn-116 codon of pPC-14 (2.2 kb) that was found in pPC-21 (2.3 kb) is shown; the KpnI site within the -sertion sequence is shown; FIG. 2 represents homologies of TGF-B1 and human TGF-B2-442 precursor sequences;
a) homologie primaire de séquences: les résidus identi- a) primary homology of sequences: the residues identified
ques sont encadrés; les astérisques désignent les sites potentiels de glycosylation dans TGF-B2; le site potentiel de clivage de la séquence signal et le site de are framed; asterisks refer to potential glycosylation sites in TGF-B2; the potential cleavage site of the signal sequence and the site of
clivage du polypeptide mature sont indiqués; b) comr=- cleavage of the mature polypeptide are indicated; b) comr = -
raison de matrices de points à l'aide du logitiel GO.e Pro; chaque point localise un point o 5 acides aminés sont identiques parmi 10 acides aminés; les lignes en diagonale indiquent les régions d'homologie; - la figure 3 représente une analyse au Northern blot de l'ARN polyadénylé de BSC-40 et de PC-3; l'ARN polyadénylé a été isolé à partir de cellules de because of dot matrices using the GO.e Pro software; each point locates a point where 5 amino acids are identical among 10 amino acids; the diagonal lines indicate the regions of homology; FIG. 3 represents a Northern blot analysis of the polyadenylated RNA of BSC-40 and PC-3; polyadenylated RNA was isolated from
BSC-40 et de PC-3, fractionné sur un gel agarose- BSC-40 and PC-3, fractionated on an agarose gel-
formaldéhyde, transféré sur des filtres Hybond-N et hybridé avec une sonde spécifique de TGF-B2 marquée au [32p], avec pPC-21 (partie A) ou un mélange de sondes spécifiques de TGF-B1 et TGF-B2 marquées au [32P] (partie B) (Sharples et al., 1987) comme décrit dans la partie des matériaux et méthodes; bande 1, ARN polyadénylé de BSC-40 (5 microgrammes) ; bande 2, ARN polyadénylé de PC-3 (5 microgrammes); - la figure 4 représente une analyse au Northern blot d'ARN polyadénylé provenant de différentes sources; l'ARN polyadénylé a été isolé à partir de cellules de MCF-7 (carcinome mammaire humain), de SK-MEL 28 (mélanome humain), de KB (carcinome nasopharyngien) et de HBL-100 (épithélium mammaire humain) et analysé par hybridation au Northern blot avec une sonde spécifique de TGF-B2 (pPC-21) comme décrit dans la partie matériaux et méthodes; chaque bande contient 5 microgrammes d'ARN polyadênylé provenant de cellules de SK-MEL 28 (bande 1), de MCF-7 (bande 2), de HBL-100 (bande 3) ou de KB (bande 4); - la figure 5 correspond à un test de bioactivité de TGF-B2 recombinant; des cellules ovariennes de hamster chinois de clone 36 de 1B9 portant pSV/beta 1 - beta 2/dhfr dont la lignée cellulaire a été déposée à l'ATCC (American Type Culture Collection) sous le numéro d'accès CRL 9800, ont été cultivées jusqu'à la confluence dans des bacs de culture de tissus de 100 mm; les cellules ont été lavées trois fois avec un milieu dépourvu de sérum et ont été mises à incuber pendant 24 heures dans 5 ml de milieu dépourvu de sérum; le milieu a été recueilli, dialysé contre de l'acide acétique 0,2M, et testé concernant l'inhibition de la synthèse d'ADN dans les cellules de CCL64 comme décrit (Gentry et al., 1987, Mol. Cell. Biol. 7:3418). Dans ce test, 3,3 pg de TGF-B1 purifié naturel standard ont donné 50 % d'inhibition; l'activité spécifique du TGF-B2 purifié naturel a été calculée: elle était environ la moitié de celle de TGF-B1; et - la figure 6 représente une analyse au Western blot de protéines recombinantes secrétées par des 1 cellules ovariennes de hamster chinois de clone 36 de 1B9 portant pSV/beta 1 -beta 2/dhfr dont la lignée cellulaire a été déposée à l'ATCC (American Type Culture Collection) sous le numéro d'accès CRL 9800; un milieu conditionné dépourvu de sérum dialysé à l'acide provenant de cellules du clone 36 de lB9, a été fractionné par électrophorèse sur gel de SDS- polyacrylamide et analysé par Western blot avec un anti-sérum préparé contre le peptide synthétique NH2-YNTINPEASASPC-COOH comme décrit (Gentry et al., 1987, formaldehyde, transferred to Hybond-N filters, and hybridized with a [32p] -labeled TGF-B2 specific probe, with pPC-21 (Part A) or a mixture of [TG] -labeled TGF-B1 and TGF-B2 specific probes [ 32P] (Part B) (Sharples et al., 1987) as described in the Materials and Methods section; lane 1, polyadenylated BSC-40 RNA (5 micrograms); band 2, polyadenylated PC-3 RNA (5 micrograms); FIG. 4 represents a Northern blot analysis of polyadenylated RNA from different sources; polyadenylated RNA was isolated from MCF-7 cells (human breast carcinoma), SK-MEL 28 (human melanoma), KB (nasopharyngeal carcinoma) and HBL-100 (human mammary epithelium) and analyzed by Northern blot hybridization with a TGF-B2 specific probe (pPC-21) as described in the materials and methods part; each band contains 5 micrograms of polyadenylated RNA from cells of SK-MEL 28 (lane 1), MCF-7 (lane 2), HBL-100 (lane 3) or KB (lane 4); FIG. 5 corresponds to a recombinant TGF-B2 bioactivity test; 1B9 clone 36 Chinese hamster ovary cells bearing pSV / beta 1-beta 2 / dhfr whose cell line was deposited with the ATCC (American Type Culture Collection) under access number CRL 9800, were cultured to confluence in 100 mm tissue culture trays; the cells were washed three times with serum-free medium and incubated for 24 hours in 5 ml of serum-free medium; the medium was collected, dialyzed against 0.2M acetic acid, and tested for inhibition of DNA synthesis in CCL64 cells as described (Gentry et al., 1987, Mol Cell Biol. 7: 3418). In this test, 3.3 μg of standard natural purified TGF-B1 gave 50% inhibition; the specific activity of natural purified TGF-B2 was calculated: it was about half that of TGF-B1; and FIG. 6 represents a Western blot analysis of recombinant proteins secreted by 1B9 clone 36 Chinese hamster ovary cells bearing pSV / beta 1 -beta 2 / dhfr whose cell line has been deposited with ATCC (FIG. American Type Culture Collection) under accession number CRL 9800; acid-dialysed serum-free conditioned medium from clone 36 cells of IB9 was fractionated by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis and analyzed by Western blot with antiserum prepared against synthetic peptide NH2-YNTINPEASASPC- COOH as described (Gentry et al., 1987,
Mol. Cell. Biol. 7:3418).Mol. Cell. Biol. 7: 3418).
La présente invention concerne la production d'une forme mature biologiquement active de TGF-B32 à partir d'une séquence codante du gène précurseur de TGF-B et son produit. Le TGF-B2 mature biologiquement actif peut être produit par le clonage et l'expression de toute la longueur de la séquence de codage du nucléotide du précurseur de TGF-B2 ou de son équivalent fonctionnel dans une cellule h8te qui transforme correctement le précurseur de sorte qu'est produit un TGF-B32 mature ayant une activité biologique qui virtuellement ne peut pas The present invention relates to the production of a biologically active mature form of TGF-B32 from a coding sequence of the TGF-B precursor gene and its product. The mature biologically active TGF-B2 can be produced by cloning and expressing the entire length of the TGF-B2 precursor nucleotide encoding sequence or its functional equivalent in a host cell which correctly transforms the precursor so that mature TGF-B32 is produced with biological activity that virtually can not
être distinguée de celle du TGF-B2 naturel authentique. to be distinguished from that of genuine natural TGF-B2.
Les équivalents fonctionnels de la longueur totale de la séquence de codage du nucléotide du précurseur de TGF-B2 comprennent toute séquence d'ADN qui, lorsqu'elle est exprimée à l'intérieur d'une cellule h8te appropriée, est capable de diriger la synthèse, la transformation et l'export de TGF-B2 mature. A cet égard, des séquences de codage de précurseur hybride incluant par exemple la séquence de précurseur de TGFB1 dans le cadre de lecture de la séquence mature de TGF-B2, peuvent être construites et utilisées pour produire un TGF-B2 biologiquement actif. Le procédé selon l'invention peut être divisé en Functional equivalents of the total length of the TGF-B2 precursor nucleotide coding sequence include any DNA sequence which, when expressed within a suitable host cell, is capable of directing synthesis. , transformation and export of mature TGF-B2. In this regard, hybrid precursor coding sequences including, for example, the TGFB1 precursor sequence in reading frame of the mature TGF-B2 sequence, can be constructed and used to produce a biologically active TGF-B2. The process according to the invention can be divided into
les étapes suivantes dans un but de description the following steps for the purpose of description
uniquement: (a) isolement ou production de la séquence de codage pour une forme de précurseur de TGF-1z2; (b) construction d'un vecteur d'expression qui va diriger l'expression d'une séquence de codage de TGF- B2; (c) transfection de cellules h8tes appropriées qui sont capables de répliquer et d'exprimer le gène et de transformer le produit du gène pour produire la forme mature biologiquement active de TGF-B2; (d) identification et purification du TGF-B2 mature biologiquement actif. Le transfectant qui exprime des niveaux élevés de TGF-B2 mature bicactif étant identifié, la pratique de l'invention inclue l'expansion de ce clone only: (a) isolation or production of the coding sequence for a precursor form of TGF-1z2; (b) constructing an expression vector that will direct the expression of a TGF-B2 coding sequence; (c) transfection of appropriate host cells that are capable of replicating and expressing the gene and transforming the gene product to produce the biologically active mature form of TGF-B2; (d) identification and purification of mature biologically active TGF-B2. Since the transfectant which expresses high levels of mature bicactive TGF-B2 is identified, the practice of the invention includes the expansion of this clone.
et l'isolement du produit de gène exprimé. and isolating the expressed gene product.
Le procédé de l'invention est démontré ici au moyen d'exemples dans lesquels des ADNc de la région de codage du précurseur de TGF-B2 ont été préparés, clones, séquences et utilisés pour construire des vecteurs d'expression qui dirigent l'expression à niveau élevé de TGF-B2 dans des cellules de CHO. Dans un mode de réalisation spécifique, la séquence d'acides aminés complète de la forme mature du TGF-B2 humain a été déterminée et présente une homologie globale de 71 % avec TGF-B1. A l'aide de sondes d'oligonucléotides synthétiques nous avons identifié les clones provenant The method of the invention is demonstrated herein by means of examples in which cDNAs of the TGF-B2 precursor coding region have been prepared, cloned, sequenced and used to construct expression vectors that direct expression. high level of TGF-B2 in CHO cells. In a specific embodiment, the complete amino acid sequence of the mature form of human TGF-B2 has been determined and has an overall homology of 71% with TGF-B1. Using synthetic oligonucleotide probes we identified clones from
d'une bibliothèque d'ADNc de PC 3 codant pour TGF-B2. a PC 3 cDNA library encoding TGF-B2.
L'analyse de séquences d'ADN de l'un de ces clones a révélé que le TGF-B2, de même que le TGF-B1, est synthétisé sous forme d'une protéine de précurseur de plus grande taille, dont l'extrémité carboxy est clivée pour produire le monomère de TGF-B2 mature. Tandis qu'il y a une homologie de 71 % entre TGF-B1 et TGF-B2 d'un bout à l'autre des portions matures de ces molécules, il existe seulement un maximum de 31 % d'homologie dans le reste du précurseur, ce qui suggère que les régions d'extrémité amine de TGF-B1 et TGF-B2 peuvent être DNA sequence analysis of one of these clones revealed that TGF-B2, like TGF-B1, is synthesized as a larger precursor protein, the carboxy is cleaved to produce the mature TGF-B2 monomer. While there is 71% homology between TGF-B1 and TGF-B2 across mature portions of these molecules, there is only a maximum of 31% homology in the rest of the precursor , suggesting that the amine end regions of TGF-B1 and TGF-B2 may be
distinctes du point de vue fonctionnel. distinct from the functional point of view.
Dans un mode de réalisation spécifique de l'invention, l'expression d'un nouveau gène hybride de TGF-B1/TGF-B2 dans des cellules de CHO est utilisée pour produire de grandes quantités de TGF-B2 biologiquement actif. Les différents aspects du procédé de l'invention sont décrits plus en détails dans les sous-sections In a specific embodiment of the invention, expression of a novel TGF-B1 / TGF-B2 hybrid gene in CHO cells is used to produce large amounts of biologically active TGF-B2. The different aspects of the process of the invention are described in more detail in the subsections
suivantes et dans les exemples qui suivent. following examples and in the following examples.
La séquence de codage du nucléotide pour TGF-B2 est représentée à la figure la. Dans la pratique du procédé de l'invention, la séquence du nucléotide représentée ici, ou des fragments ou des équivalents fonctionnels de celle-ci, peut être utilisée pour produire les molécules recombinantes qui vont diriger l'expression du produit de TGF-B2 dans des cellules h8tes appropriées. Dans un mode de réalisation spécifique, un gène hybride de TGF-B1/TGF-B2 (figure lb) a été construit et utilisé pour transfecter des cellules de CHO. Des transfectants produisant une quantité aussi importante que 500 jg de TGF-B2 mature biologiquement actif par ml The nucleotide coding sequence for TGF-B2 is shown in Figure la. In the practice of the method of the invention, the nucleotide sequence shown herein, or fragments or functional equivalents thereof, can be used to produce the recombinant molecules that will direct the expression of TGF-B2 product in appropriate host cells. In a specific embodiment, a TGF-B1 / TGF-B2 hybrid gene (Figure 1b) was constructed and used to transfect CHO cells. Transfectants producing as much as 500 μg of biologically active mature TGF-B2 per ml
de milieu de culture ont été isolés. of culture medium have been isolated.
Du fait de la dégénérescence des séquences de codage de nucléotide, d'autres séquences d'ADN qui codent sensiblement pour les mêmes séquences d'acides aminés que celles représentées à.la figure la et la figure lb peuvent être utilisées dans la pratique de la présente invention pour le clonage et l'expression de TGF-B2. De telles modifications comprennent les délétions, les additions ou les substitutions de différents résidus de nucléotides ayant pour résultat une séquence qui code pour le même produit de gène ou pour un produit de gène équivalent du point de vue fonctionnel. Le produit de gène peut contenir des délétions, des additions ou des substitutions de restes d'acides aminés dans la séquence, ce qui a pour résultat une modification silencieuse produisant ainsi un produit bio-actif. De telles substitutions d'acides aminés peuvent être réalisées sur la base de similarité de polarité, de charge, de solubilité, d'hydrophobicité, hydrophilicité et/ou de nature amphipathique des résidus impliqués. Par exemple, les acides aminés chargés négativement comprennent l'acide aspartique et l'acide glutamique; les acides aminés chargés positivement comprennent la lysine et l'arginine; les acides aminés comportant des groupes de Due to the degeneracy of the nucleotide coding sequences, other DNA sequences that substantially encode the same amino acid sequences as those shown in Figure 1a and Figure 1b can be used in the practice of present invention for the cloning and expression of TGF-B2. Such modifications include deletions, additions, or substitutions of different nucleotide residues resulting in a sequence that encodes the same gene product or a functionally equivalent gene product. The gene product may contain deletions, additions, or substitutions of amino acid residues in the sequence, resulting in a silent change thereby producing a bioactive product. Such amino acid substitutions may be made on the basis of similarity of polarity, charge, solubility, hydrophobicity, hydrophilicity and / or amphipathic nature of the residues involved. For example, negatively charged amino acids include aspartic acid and glutamic acid; positively charged amino acids include lysine and arginine; amino acids with groups of
tête polaires non chargés ou des groupes de tête non- unloaded polar heads or non-head groups
polaires ayant des valeurs semblables d'hydrophilicité comprennent les suivants: leucine, isoleucine, valine; glycine, alanine; asparagine, glutamine; sérine, Polar compounds with similar hydrophilicity values include: leucine, isoleucine, valine; glycine, alanine; asparagine, glutamine; serine,
thréonine; phénylalanine, tyrosine. threonine; phenylalanine, tyrosine.
la séquence de codage de nucléotide pour TGF-B2 peut être obtenue à partir de sources cellulaires qui produisent une activité semblable à TGF- B2. La séquence de codage peut être obtenue par clonage par ADNc d'ARN isolé et purifié à partir de telles sources cellulaires ou par clonage génomique. L'ADNc ou les bibliothèques génomiques de clones peuvent être préparés à partir des fragments d'ADN produits à l'aide de procédés bien connus dans la technique comprenant sans être limités à celle-ci l'utilisation d'enzymes de restriction. Les fragments qui codent pour TGF- B2 peuvent être identifiés par criblage de telles bibliothèques avec une sonde de nucléotide qui est sensiblement complémentaire de toute portion de la séquence représentée à la figure la. Des clones de longueur totale, c'est-à-dire ceux contenant la région de codage totale pour le précurseur de TGF-B2 peuvent être the nucleotide coding sequence for TGF-B2 can be obtained from cell sources that produce TGF-B2-like activity. The coding sequence can be obtained by cloning cDNA of RNA isolated and purified from such cell sources or by genomic cloning. The cDNA or genomic libraries of clones can be prepared from DNA fragments produced using methods well known in the art including but not limited to the use of restriction enzymes. Fragments that encode TGF-B2 can be identified by screening such libraries with a nucleotide probe that is substantially complementary to any portion of the sequence shown in Figure la. Total length clones, i.e. those containing the total coding region for the TGF-B2 precursor, may be
choisis en vue de l'expression.chosen for the purpose of expression.
Dans un autre mode de réalisation de l'invention, la séquence de codage de la figure la peut être synthétisée en entier ou en partie, à l'aide de procédés chimiques bien connus dans la technique. Voir par exemple, Caruthers et al., 1980, Nuc. Acids Res. In another embodiment of the invention, the coding sequence of Figure la may be synthesized in whole or in part, using chemical methods well known in the art. See, for example, Caruthers et al., 1980, Nuc. Acids Res.
Symp. Ser. 7:215-223; Crea et Horn, 1980, Nuc Acids. Symp. Ser. 7: 215-223; Crea and Horn, 1980, Nuc Acids.
Res. 9(10):2331; Matteucci et Carruthers, 1980, Res. 9 (10): 2331; Matteucci and Carruthers, 1980,
Tetrahedron Letters 21:719 et Chow et Kempe, 1981, Nuc. Tetrahedron Letters 21: 719 and Chow and Kempe, 1981, Nuc.
Acids. Res. 9(12):2807-2917. Ou bien encore, la protéine pourrait être produite à l'aide de procédés chimiques pour synthétiser la séquence d'acides aminés représentée à la figure la en entier ou en partie. Par exemple, des peptides peuvent être synthétisés par des procédés en phase solide sur un instrument Beckman 990, et clivés à partir de la résine comme décrit précédemment (Gentry, L.E., et al, 1983, J. Biol. Chem. 258:11219-11228; Acids. Res. 9 (12): 2807-2917. Alternatively, the protein could be produced using chemical methods to synthesize the amino acid sequence shown in Figure la in whole or in part. For example, peptides can be synthesized by solid phase methods on a Beckman 990 instrument, and cleaved from the resin as previously described (Gentry, LE, et al, 1983, J. Biol Chem 258: 11219- 11228;
Gentry, L.E. et Lawton, A., 1986, Virology 152:421-431). Gentry, L.E. and Lawton, A., 1986, Virology 152: 421-431).
La purification peut être réalisée par chromatographie liquide préparative à haute performance. La composition des peptides a été confirmée par analyse des acides aminés. Dans un mode de réalisation spécifique, décrit dans les exemples ci-inclus, la séquence de codage de TGF-M2 a été obtenue par clonage par ADNc de séquences de codage de précurseur de TGF-B2 humain dérivées d'ARN polyadénylé isolé à partir d'une lignée cellulaire d'adénocarcinome de la prostate humain traitée par tamoxifen, PC3, dont il a été montré précédemment qu'elle produit TGF- B2. La région de codage entière d'un clone d'ADNc a été séquencée et comparée à la séquence publiée The purification can be carried out by high performance preparative liquid chromatography. Peptide composition was confirmed by amino acid analysis. In a specific embodiment, described in the examples herein, the TGF-M2 coding sequence was obtained by cDNA cloning of human TGF-B2 precursor coding sequences derived from polyadenylated RNA isolated from a human prostate adenocarcinoma cell line treated with tamoxifen, PC3, which has previously been shown to produce TGF-B2. The entire coding region of a cDNA clone was sequenced and compared to the published sequence
de TGF-B1 humain (voir figure 2).human TGF-B1 (see Figure 2).
L'analyse de séquences d'ADN des clones d'ADNc de TGF-B2 indiquent que TGF-B2 de même que TGF-B1 est synthétisé sous forme d'une protéine précurseur de grande taille, dont l'extrémité carboxy est clivée pour produire le monomère mature de TGF-B2 de 112 acides aminés. Il a été montré que TGF-B2 a un poids moléculaire de 24 000 composé de deux sousunités de 13 000 daltons liés par ponts disulfure (Ikeda et al., 1987, Biochemistry DNA sequence analysis of TGF-B2 cDNA clones indicates that TGF-B2 as well as TGF-B1 is synthesized as a large precursor protein, the carboxy terminus of which is cleaved to produce the TGF-B2 mature monomer of 112 amino acids. TGF-B2 has been shown to have a molecular weight of 24,000 composed of two disulfide bonded 13,000 dalton subunits (Ikeda et al., 1987, Biochemistry).
26:2406-2410; Cheifetz et al., 1987, Cell 48:409-415). 26: 2406-2410; Cheifetz et al., 1987, Cell 48: 409-415).
Ainsi, la production de TGF-32 nécessite un clivage protéolytique approprié de même que la formation de ponts disulfure intra- et intermoléculaires. Une séquence leader hydrophobe à l'extrémité amine (résidu 3-19) est présente dans le précurseur et peut être responsable du fait de diriger la protéine hors de la cellule. Le TGF-B2 mature peut encore être associé à la partie restante du Thus, the production of TGF-32 requires appropriate proteolytic cleavage as well as the formation of intra- and intermolecular disulfide bridges. A hydrophobic leader sequence at the amine end (residue 3-19) is present in the precursor and may be responsible for directing the protein out of the cell. The mature TGF-B2 can still be associated with the remaining part of the
précurseur au cours de ce processus. precursor during this process.
TGF-B2 présente 71 % d'homologie avec TGF-B1 dans toute la partie mature du précurseur, ce qui implique une similarité fonctionnelle qui est soutenue par les preuves expérimentales (Seyedin et al., 1987, J. Biol. Chem. 262:1946-1949; Cheifetz et al., 1987, Cell 48:409-415). La partie amine de la région précurseur de TGF-B1 provenant de sources humaines, de rongeurs ou de sources simiennes (Derynck et al., 1985, Nature 316:701705; Derynck et al., 1986, J. Biol. Chem. 261:4377-4379; Sharples et al., 1987, DNA 6:239-244) est hautement conservée et suggère que cette partie de la TGF-B2 exhibits 71% homology with TGF-B1 throughout the mature portion of the precursor, implying a functional similarity that is supported by experimental evidence (Seyedin et al., 1987, J. Biol Chem 262: 1946-1949, Cheifetz et al., 1987, Cell 48: 409-415). The amine portion of the TGF-B1 precursor region from human sources, rodents, or simian sources (Derynck et al., 1985, Nature 316: 701705, Derynck et al., 1986, J. Biol Chem 261: 4377-4379, Sharples et al., 1987, DNA 6: 239-244) is highly conserved and suggests that this part of the
molécule peut avoir une fonction biologique importante. molecule can have an important biological function.
Par contraste, il n'y a pas plus de 31 % d'homologie entre les régions précurseur N-terminales de TGF-B1 et TGF-B2. Après clivage du peptide signal supposé, le précurseur de TGF-B2 contiendrait également davantage d'acides aminés que le précurseur de TGF-B1. Les différences structurales primaires à l'intérieur de la région de l'extrémité amine des protéines précurseur de TGF-B1/TGF-B2 peuvent refléter des différences fonctionnelles. Cependant, des régions homologues de façon significative à l'intérieur des précurseurs sont trouvées dans des blocs isolés suggérant la conservation de domaines fonctionnels importants même à l'intérieur de In contrast, there is no more than 31% homology between the N-terminal precursor regions of TGF-B1 and TGF-B2. After cleavage of the supposed signal peptide, the TGF-B2 precursor would also contain more amino acids than the TGF-B1 precursor. Primary structural differences within the amine end region of TGF-B1 / TGF-B2 precursor proteins may reflect functional differences. However, significantly homologous regions within the precursors are found in isolated blocks suggesting the retention of important functional domains even within
la région précurseur N-terminales. the N-terminal precursor region.
L'analyse par Northern blot a révélé deux classes de dimensions importantes de l'ARNm spécifique de TGF-B2 de 4,1 et 6,5 kb dans les cellules.de BSC-40. Les cellules de PC-3 traitées au tamoxifen contiennent trois séquences transcrites de TGF-B2 de 4,1 kb, 5,1 kb et 6, 5 kb. Ces messages de dimensions différentes pourraient être le résultat d'épissage d'ARN différentiel, de la polyadénylation, ou des deux comme cela a été décrit pour Northern blot analysis revealed two large size classes of 4.1 and 6.5 kb TGF-B2 specific mRNA in BSC-40 cells. Tamoxifen-treated PC-3 cells contain three 4.1 kb, 5.1 kb and 6.5 kb TGF-B2 transcribed sequences. These messages of different sizes could be the result of differential RNA splicing, polyadenylation, or both as has been described for
d'autres gènes (Helfman et al., 1986, Mol Cell. Biol. other genes (Helfman et al., 1986, Mol Cell Biol.
6:3582-3595; Sayre et al., 1987, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84:2941-2945). Une analyse préliminaire d'un autre clone d'ADNc de TGF-B2 montre qu'il contient une région non traduite en 3' plus grande d'environ 1 kb que celle de pPC-21 et de pPC-14 et qu'il contient un site de polyadénylation différent suggérant qu'une autre polyadénylation est un facteur responsable de la production d'ARNm de TGF-B2 multiples observés sur des 6: 3582-3595; Sayre et al., 1987, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84: 2941-2945). Preliminary analysis of another TGF-B2 cDNA clone shows that it contains a 3 'untranslated region about 1 kb larger than pPC-21 and pPC-14 and contains a different polyadenylation site suggesting that another polyadenylation is a factor responsible for the production of multiple TGF-B2 mRNA observed on
Northern blots.Northern blots.
Les cellules de BSC-40 contiennent des niveaux comparables de séquencestranscrites spécifiques de TGF-B1 et TGF-B2: les cellules de PC-3 traitées au tamoxifen contiennent davantage d'ARNm de TGF-B1 que TGF-B2 (figure 3B). Ce dernier résultat est inattendu puisque ces cellules produisent davantage de protéine de TGF-B2 que TGF-B1 (Ikeda et al, 1987, Biochemistry 26: 2406- 2410) et suggère un niveau de post-transcription de régulation concernant la synthèse de ce modulateur de croissance. Les expériences destinées à comprendre les mécanismes de commande de transcription et de traduction qui conduisent à la production de TGF-B1 et de TGF-B2 sont en cours. La production de quantités adéquates de TGF- B2 par des techniques d'ADN recombinant, comme cela a été fait pour TGF- B1, devrait encore aider à concevoir des expériences pour explorer les différents effets de BSC-40 cells contain comparable levels of transcribed sequences specific for TGF-B1 and TGF-B2: Tamoxifen-treated PC-3 cells contain more TGF-B1 mRNA than TGF-B2 (Figure 3B). This latter result is unexpected since these cells produce more TGF-B2 protein than TGF-B1 (Ikeda et al., 1987, Biochemistry 26: 2406-2410) and suggest a level of regulatory post-transcription concerning the synthesis of this modulator. growth. Experiments to understand transcription and translation control mechanisms leading to the production of TGF-B1 and TGF-B2 are underway. The production of adequate amounts of TGF-B2 by recombinant DNA techniques, as has been done for TGF-B1, should further assist in designing experiments to explore the different effects of
cette protéine.this protein.
Dans un autre mode de réalisation, la séquence de codage de TGF-B2 a été obtenue par clonage par ADNc de séquences de codage de précurseur de TGFB2 simien dérivées d'ARN polyadénylé isolé à partir d'une lignée cellulaire de callitriche africain, BSC-40. La région codante totale d'un clone d'ADNc a été séquencée. Les précurseurs de TGF-B2 humain et simien semblent avoir des séquences d'acides aminés identiques, et leurs séquences In another embodiment, the TGF-B2 coding sequence was obtained by cDNA cloning of simian TGFB2 precursor coding sequences derived from polyadenylated RNA isolated from an African callikric cell line, BSC- 40. The total coding region of a cDNA clone was sequenced. Human and simian TGF-B2 precursors appear to have identical amino acid sequences, and their sequences
de nucléotides sont à peu près identiques. nucleotides are about the same.
Afin d'exprimer une forme mature biologiquement active de TGF-B2 on devrait choisir un système vecteur d'expression/h8te pourvoyant non seulement à des niveaux élevés de transcription et de traduction mais aussi à l'élaboration correcte du gène produit. Ceci est particulièrement important lorsqu'on utilise la séquence codante entière d'un précurseur de TGF-B2 dans les vecteurs d'expression car la forme mature de TGF-B2 semble être dérivée du produit de précurseur par l'intermédiaire de phénomènes de transformation cellulaire. En outre, un système expression/cellule h8te In order to express a biologically active mature form of TGF-B2 an expression / hte vector system should be chosen which provides not only for high levels of transcription and translation but also for the correct elaboration of the produced gene. This is particularly important when using the entire coding sequence of a TGF-B2 precursor in the expression vectors because the mature form of TGF-B2 appears to be derived from the precursor product via cellular transformation phenomena. . In addition, a system expression / cell h8te
qui pourvoit à la sécrétion du produit peut être choisi. which provides for the secretion of the product may be chosen.
En particulier, il apparait que le TGF-B2 mature, un homodimère lié par pont disulfure de 112 acides aminés par sous-unité peut être formé par transformation cellulaire mettant en jeu un clivage protéolytique entre les acides aminés Arg-Ala du In particular, it appears that the mature TGF-B2, a disulfide bonded homodimer of 112 amino acids per subunit can be formed by cell transformation involving proteolytic cleavage between the amino acids Arg-Ala of the
précurseur (résidus numéros 330 et 331 à la figure la). precursor (residues numbers 330 and 331 in Figure la).
En outre, le précurseur de TGF-B2 contient trois sites potentiels de Nglycosylation non trouvés dans la forme mature. La glycosylation appropriée du précurseur peut être importante pour la synthèse cellulaire et la libération ou la sécrétion de la molécule mature. En outre, la forme mature de TGF-B2 comprend un dimère à liaisons disulfure mettant en jeu 9 résidus de cystéine par sous-unité. Certains de ceux-ci sont impliqués dans \ les ponts disulfure intercaténaires et d'autres dans les ponts disulfure intracaténaires qui modifient la structure et la configuration tertiaires de la molécule mature et donc son activité biologique. Ainsi, la capacité d'une cellule h8te utilisée dans le système d'expression d'exprimer et de transformer correctement le produit du gène de TGF-B32 est importante pour la In addition, the TGF-B2 precursor contains three potential sites of Nglycosylation not found in the mature form. Proper glycosylation of the precursor may be important for cell synthesis and release or secretion of the mature molecule. In addition, the mature form of TGF-B2 comprises a disulfide-linked dimer involving 9 residues of cysteine per subunit. Some of these are involved in interchain disulfide bridges and others in intracellular disulfide bridges that modify the tertiary structure and configuration of the mature molecule and thus its biological activity. Thus, the ability of a host cell used in the expression system to express and correctly transform the TGF-B32 gene product is important for the
production d'un TGF-B2 mature biologiquement actif. production of mature biologically active TGF-B2.
Une variété de systèmes hôte animal/vecteurs d'expression (c'est-à-dire des vecteurs qui contiennent les éléments nécessaires pour diriger la réplication, la transcription et la traduction de la séquence de codage de TGF-B2 dans une cellule h8te appropriée) peuvent être utilisés aussi bien par l'homme du métier. Ils comprennent mais sans être limités à ceux- ci, les systèmes vecteurs d'expression de virus/cellules h8tes de mammifères (par exemple, cytomégalovirus, virus de vaccine, adénovirus, et analogues); les systèmes vecteurs d'expression de virus d'insectes/cellules d'insectes (par exemple, baculovirus); ou des systèmes d'expression de promoteurs non viraux dérivés des génomes de cellules de mammifères (par exemple le promoteur de la A variety of animal host systems / expression vectors (i.e. vectors that contain the elements necessary to direct the replication, transcription and translation of the TGF-B2 coding sequence into a suitable host cell ) can be used both by the skilled person. These include, but are not limited to, mammalian virus / host cell expression vector systems (e.g., cytomegalovirus, vaccinia virus, adenovirus, and the like); insect virus / insect cell expression vector systems (e.g., baculovirus); or non-viral promoter expression systems derived from mammalian cell genomes (e.g.
métallothionine de souris).mouse metallothionine).
Les éléments d'expression de ces vecteurs varient en ce qui concerne leur force et leurs spécificités. Selon le système h8te/vecteur utilisé, l'un quelconque parmi un certain nombre d'éléments de transcription et de traduction appropriés peut être utilisé. Par exemple, lors du clonage dans des systèmes cellulaires de mammifères, des promoteurs isolés à partir du génome de cellules de mammifères, (par exemple le promoteur de métallothionine de souris) ou à partir de virus qui se développent dans ces cellules, (par exemple le promoteur 7,5K du virus de la vaccine) peuvent être utilisés. Des promoteurs produits par des techniques d'ADN récombinant ou par des techniques synthétiques peuvent également être utilisés pour pourvoir à la The expression elements of these vectors vary in strength and specificity. Depending on the host / vector system used, any of a number of suitable transcription and translation elements may be used. For example, when cloning into mammalian cell systems, promoters isolated from the mammalian cell genome, (for example the mouse metallothionin promoter) or from viruses that grow in these cells, (e.g. the 7.5K promoter of vaccinia virus) can be used. Promoters produced by recombinant DNA techniques or by synthetic techniques can also be used to provide the
transcription des séquences insérées. transcription of inserted sequences.
Des signaux d'initiation spécifiques sont également nécessaires pour une traduction suffisante des séquences insérées de codage des protéines. Ces signaux comprennent le codon ATG d'initiation et les séquences adjacentes. Dans les cas o le gène de TGF-B2 entier y compris son propre codon d'initiation et les séquences adjacentes est inséré dans les vecteurs d'expression appropriés, des signaux de commande de traduction Specific initiation signals are also needed for sufficient translation of the inserted protein coding sequences. These signals include the initiation ATG codon and the adjacent sequences. In cases where the entire TGF-B2 gene including its own initiation codon and the adjacent sequences is inserted into the appropriate expression vectors, translation control signals
supplémentaires peuvent ne pas être nécessaires. additional information may not be necessary.
Cependant, dans les cas o seule une partie de la séquence codante est insérée, des signaux de commande de traduction exogènes, comprenant le codon d'initiation ATG doivent être fournis. En outre, le codon d'initiation doit être en phase avec le cadre de lecture des séquences de codage de TGF-B2 pour assurer la traduction de la séquence d'insertion entière. Ces signaux de commande de traductions exogènes et les codons d'initiation peuvent However, in cases where only a portion of the coding sequence is inserted, exogenous translation control signals, including the ATG initiation codon, must be provided. In addition, the initiation codon must be in phase with the reading frame of the TGF-B2 coding sequences to ensure translation of the entire insertion sequence. These exogenous translation control signals and initiation codons can
être d'origine variée, naturelle ou synthétique. be of varied, natural or synthetic origin.
L'efficacité de l'expression peut être améliorée par inclusion de séquences d'atténuation de transcription, d'éléments d'amélioration, etc. L'un quelconque des procédés décrits précédemment pour l'insertion de fragments d'ADN dans un vecteur peut être utilisé pour construire des vecteurs d'expression contenant le gène de TGF-B et les signaux de commande de transcription/traduction appropriés. Ces procédés peuvent comprendre des techniques d'ADN recombinant in vitro, des techniques synthétiques et des The efficiency of the expression can be improved by inclusion of transcriptional attenuation sequences, enhancement elements, etc. Any of the methods previously described for insertion of DNA fragments into a vector can be used to construct expression vectors containing the TGF-B gene and appropriate transcription / translation control signals. These methods may include recombinant DNA techniques in vitro, synthetic techniques and
recombinaisons in vivo (recombinaison génétique). in vivo recombination (genetic recombination).
Dans les cas o un adénovirus est utilisé comme vecteur d'expression, la séquence de codage de TGF-B2 peut être liée à un complexe de commande de transcription/traduction d'adénovirus, par exemple le dernier promoteur et la séquence leader tripartite. Ce gène chimérique peut ensuite être inséré dans le génome In cases where an adenovirus is used as an expression vector, the TGF-B2 coding sequence may be linked to an adenovirus transcription / translation control complex, for example the last promoter and the tripartite leader sequence. This chimeric gene can then be inserted into the genome
de l'adénovirus par recombinaison in vitro ou in vivo. adenovirus by recombination in vitro or in vivo.
L'insertion dans une région non essentielle du génome viral (par exemple, la région El ou E3) va entraîner la formation d'un virus recombinant qui est viable et capable d'exprimer TGF-B2 dans des hôtes affectés. De façon similaire, le promoteur 7,5K de la vaccine peut Insertion into a non-essential region of the viral genome (e.g., E1 or E3 region) will result in the formation of a recombinant virus that is viable and capable of expressing TGF-B2 in affected hosts. Similarly, the vaccinia 7.5K promoter can
être utilisé.to be used.
Un autre système d'expression qui pourrait être Another expression system that could be
utilisé pour exprimer TGF-B2 est un système d'insecte. used to express TGF-B2 is an insect system.
Dans un tel système, le virus de la polyhedrose nucléaire de Autographa californica (AcNPV) est utilisé en tant que vecteur pour exprimer des gènes étrangers. Le vire développe dans les cellules de Spodoptera frugiperda. La séquence de codage de TGF-B2 peut être clonée dans des régions non essentielles (par exemple le gène de polyhedrine) du virus et placée sous le contrôle d'un promoteur de AcNPV (par exemple le promoteur de polyhedrine). L'insertion réussie de la séquence de codage de TGF-B2 va entraîner l'inactivation du gène de polyhedrine et la production de virus recombinant r occlus (c'est-à-dire un virus dépourvu du revêtement protéique pour lequel code le gène de polyhedrine). Ces virus recombinants sont ensuite utilisés pour infecter des cellules de Spodoptera frugiperda dans lesquelles le In such a system, the Autographa californica nuclear polyhedrosis virus (AcNPV) is used as a vector to express foreign genes. The vire develops in the cells of Spodoptera frugiperda. The TGF-B2 coding sequence may be cloned into non-essential regions (e.g., the polyhedrin gene) of the virus and placed under the control of an AcNPV promoter (e.g. polyhedrin promoter). Successful insertion of the TGF-B2 coding sequence will result in inactivation of the polyhedrin gene and production of recombinant viruses r occluded (i.e., virus lacking the protein coating for which the gene of polyhedrin). These recombinant viruses are then used to infect Spodoptera frugiperda cells in which the
gène inséré est exprimé.inserted gene is expressed.
En outre, on peut choisir une souche de cellules hôtes qui module l'expression des séquences insérées, ou qui modifie et transforme le produit de gène c; la façon spécifique souhaitée. L'expression de certains promoteurs peut être augmentée en présence de certains inducteurs, (par exemple les ions zinc et cadmium pour les promoteurs de métallothionine). Ainsi, l'expression du TG--B2 obtenu par génie génétique peut être contrôlée. Ceci est important si le produit de protéine du gène étranger cloné est léthal vis-à-vis des cellules h8tes. En outre, les modifications (par exemple glycosylation) et les transformations (par exemple clivage) de produits de protéines sont importantes pour la fonction de la protéine. Différentes cellules h8tes ont des mécanismes caractéristiques et spécifiques pour la transformation et la modification post-traduction des protéines. Des lignées cellulaires ou des systèmes h8tes appropriés peuvent être choisis pour assurer la modification et la transformation correctes de la In addition, one may select a host cell strain that modulates the expression of the inserted sequences, or that modifies and transforms the gene product c; the specific way desired. The expression of certain promoters can be increased in the presence of certain inducers, (for example zinc and cadmium ions for metallothionine promoters). Thus, the expression of TG - B2 obtained by genetic engineering can be controlled. This is important if the cloned foreign gene protein product is lethal to host cells. In addition, modifications (e.g., glycosylation) and transformations (e.g., cleavage) of protein products are important for the function of the protein. Different host cells have characteristic and specific mechanisms for protein transformation and post-translational modification. Suitable cell lines or host systems can be chosen to ensure correct modification and transformation of the
protéine étrangère exprimée.foreign protein expressed.
Les cellules h8tes qui contiennent la séquence de codage de TGF-B2 recombinant et qui expriment le produit mature biologiquement actif peuvent être identifiées par au moins quatre approches générales: (a) Host cells that contain the recombinant TGF-B2 coding sequence and express the biologically active mature product can be identified by at least four general approaches: (a)
hybridation ADN-ADN; (b) présence ou absence de - DNA-DNA hybridization; (b) presence or absence of -
fonctions de gène "marqueur"; (c) estimation du niveau de transcription tel que mesuré par l'expression des séquences de transcription d'ARNm de TGF-B2 dans la cellule h8te et (d) détection du produit de gène mature tel que mesuré par immunoessai et, finalement, par son "marker" gene functions; (c) estimating the level of transcription as measured by the expression of TGF-B2 mRNA transcription sequences in the hte cell and (d) detecting the mature gene product as measured by immunoassay and ultimately by his
activité biologique.biological activity.
Dans la première approche, la présence de la séquence de codage de TGF-B2 insérée dans le vecteur d'expression peut être détectée par hybridation ADN-ADN à l'aide de sondes comprenant les séquences nucléotidiques qui sont homologues de la séquence de codage de TGF-B2 sensiblement comme montré à la figure la, ou de parties In the first approach, the presence of the TGF-B2 coding sequence inserted into the expression vector can be detected by DNA-DNA hybridization using probes comprising the nucleotide sequences that are homologous to the coding sequence of TGF-B2 substantially as shown in Figure la, or parts thereof
ou de dérivés de celle-ci.or derivatives thereof.
Dans la seconde approche, le système vecteur d'expression recombinant/h8te peut être identifié et choisi sur la base de la présence ou de l'absence de certaines fonctions de gène "marqueur" (par exemple, activité de thymidine kinase, résistance aux antibiotiques, résistance au méthotrexate, phénotype del transformation, formation d'un corps d'occlusion dans le baculovirus, etc.). Par exemple, si la séquence de codage de TGF-B2 est insérée dans une séquence de gène marqueur du vecteur, les recombinants contenant la séquence de codage de TGF-B2 peuvent être identifiés par l'absence de la fonction de gène marqueur. Ou bien encore, un gène marqueur peut être placé en tandem avec la séquence de TGF-B2 sous le contr8le du même promoteur ou d'un promoteur différent utilisé pour commander l'expression de la séquence de codage de TGF-B2. L'expression du marqueur en réponse à l'induction ou à la sélection In the second approach, the recombinant expression vector system / hte can be identified and selected on the basis of the presence or absence of certain "marker" gene functions (e.g., thymidine kinase activity, antibiotic resistance , resistance to methotrexate, phenotype of transformation, formation of an occlusion body in baculovirus, etc.). For example, if the TGF-B2 coding sequence is inserted into a vector marker gene sequence, the recombinants containing the TGF-B2 coding sequence can be identified by the absence of the marker gene function. Alternatively, a marker gene may be placed in tandem with the TGF-B2 sequence under the control of the same or a different promoter used to control expression of the TGF-B2 coding sequence. Marker expression in response to induction or selection
indique l'expression de la séquence de codage de TGF-B2. indicates the expression of the TGF-B2 coding sequence.
Dans la troisième approche, l'activité de transcription pour la région de codage de TGF-B2 peut être évaluée par des essais d'hybridation. Par exemple, l'ARN polyadénylé peut être isolé et analysé par Northern blot à l'aide d'une sonde homologue de la séquence de In the third approach, transcriptional activity for the TGF-B2 coding region can be assayed by hybridization assays. For example, the polyadenylated RNA can be isolated and analyzed by Northern blot using a probe homologous to the sequence of
codage de TGF-B2 ou de parties particulières de celle-ci. encoding of TGF-B2 or particular parts thereof.
Ou bien encore, les acides nucléiques totaux de la cellule h8te peuvent être extraits et testés en ce qui Alternatively, the total nucleic acids of the host cell can be extracted and tested for
concerne l'hybridation avec de telles sondes. relates to hybridization with such probes.
Dans la quatrième approche, l'expression de la protéine mature produite peut être estimée de façon immunologique, par exemple par des Western blots, des immunoessais tels que la radioimmunoprécipitation, des immunoessais liés à des enzymes et analogues. Cependant, le test ultime quant au succès du système d'expression inclue la détection du produit de gène de TGF-B2 biologiquement actif. Lorque la cellule h8te secrète le produit de gène, le milieu dépourvu de cellules obtenu à partir de la cellule h8te transfectante cultivée peut être testé pour l'activité de TGF-B2. Lorsque le produit de gène n'est pas secrété, des lysats cellulaires peuvent être testés pour une telle activité. Dans chacun des cas, les essais biologiques tels que l'essai d'inhibition de croissance décrit ici ou la stimulation de la croissance indépendante de l'ancrage dans des cellules cibles (Twardzik et Sherwin, 1985, J. Cell. Biochem. 28:289-297; Delarco et Todaro, 1978, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. In the fourth approach, expression of the mature protein produced can be immunologically assessed, for example by Western blots, immunoassays such as radioimmunoprecipitation, enzyme-linked immunoassays and the like. However, the ultimate test for the success of the expression system includes the detection of the biologically active TGF-B2 gene product. When the cell secretes the gene product, the cell-free medium obtained from the cultured transfectant host cell can be tested for TGF-B2 activity. When the gene product is not secreted, cell lysates can be tested for such activity. In each case, bioassays such as the growth inhibition assay described herein or stimulation of growth independent of anchoring in target cells (Twardzik and Sherwin, 1985, J. Cell Biochem 28: 289-297, Delarco and Todaro, 1978, Proc Natl Acad Sci USA
:4001-4005) ou analogues peuvent être utilisées. 4001-4005) or the like may be used.
Un clone produisant des niveaux élevés de TGF-B2 mature biologiquement actif étant identifié, le clone peut 8tre étendu et le TGF-B2 peut être purifié à l'aide de procédés bien connus dans la technique. De tels procédés comprennent la purification par immunoaffinité, les procédés chromatographiques comprenant la chromatographie liquide à haute performance, et Since a clone producing high levels of mature biologically active TGF-B2 is identified, the clone can be expanded and TGF-B2 can be purified using methods well known in the art. Such methods include immunoaffinity purification, chromatographic methods including high performance liquid chromatography, and
analogues.like.
Les exemples suivants décrivent le clonage par ADNc de séquences de codage de précurseur de TGF-B2 provenant de la lignée cellulaire de l'adénocarcinome de la prostate humain, PC-3, de laquelle le TGF-B2 a été The following examples describe cDNA cloning of TGF-B2 precursor coding sequences from the human prostate adenocarcinoma cell line, PC-3, from which TGF-B2 has been
isolé précédemment.isolated previously.
Les modes opératoires suivants, illustrant les matériaux et méthodes, ont été utilisés pour cloner des The following procedures, illustrating the materials and methods, were used to clone
ADNc codants pour le précurseur de TGF-B2 humain. CDNAs encoding the human TGF-B2 precursor.
La lignée cellulaire de l'adénocarcinome de prostate humain, PC-3, a été cultivée dans un milieu complété au tamoxifen comme décrit (Ikeda et al., 1987, Biochemistry 26:2406-2410). Des cellules de MCF-7 ont été cultivées dans un milieu de Eagle modifié par Dulbecco contenant 10 % de sérum de foetus de veau et 6 unités/ml d'insuline. Toutes les autres lignées cellulaires ont été cultivées dans le même milieu sans insuline. L'ARN polyadénylé a été isolé par chromatographie sur oligo[dT]-cellulose comme décrit (Purchio et Fareed, The human prostate adenocarcinoma cell line, PC-3, was cultured in tamoxifen supplemented medium as described (Ikeda et al., 1987, Biochemistry 26: 2406-2410). MCF-7 cells were cultured in Dulbecco's modified Eagle's medium containing 10% fetal calf serum and 6 units / ml insulin. All other cell lines were grown in the same medium without insulin. The polyadenylated RNA was isolated by oligo [dT] -cellulose chromatography as described (Purchio and Fareed,
1979, J. Virol. 29:763-769).1979, J. Virol. 29: 763-769).
Un ADNc double brin a été synthétisé à partir d'ARN polyadénylé isolé à partir de cellules de PC-3 traitées par le tamoxifen pendant 24 heures comme décrit (Maniatis et al., 1982, dans Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York). Des fractions d'ADNc supérieures à 1000 paires de bases ont été clonées dans lambda gtlO comme décrit (Webb et al., 1987, DNA 6:71-79). La bibliothèque a été tout d'abord criblée en double avec une sonde 24 fois dégénérée marquée au 132P] complémentaire d'acides aminés WKWIHEP codant pour l'ADN (sonde 1) qui sont conservés entre TGF-B1 et TGF-B2: [5'GGTTCGTGTATCCATTTCCA-3'i Double-stranded cDNA was synthesized from polyadenylated RNA isolated from tamoxifen-treated PC-3 cells for 24 hours as described (Maniatis et al., 1982, in Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York). Fractions of cDNA greater than 1000 base pairs were cloned into lambda gt10 as described (Webb et al., 1987, DNA 6: 71-79). The library was first screened in duplicate with a 132-P-labeled degenerate 24-fold probe complementary to amino acids WKWIHEP encoding DNA (probe 1) that are conserved between TGF-B1 and TGF-B2: [5] 'GGTTCGTGTATCCATTTCCA-3'i
C A G CC A G C
AAT
Les clones positifs ont ensuite été criblés avec une seconde sonde dégénérée 128 fois complémentaire d'acides aminés CFRNVQD codant pour 1'ADN (sonde 2); cinq de ces sept acides aminés sont spécifiques de TGFB2: Positive clones were then screened with a second 128-fold degenerate probe complementary to CFRNVQD amino acids encoding DNA (probe 2); five of these seven amino acids are specific for TGFB2:
[5'TCTTGAACGTTTCTGAAGCA-3'][5'TCTTGAACGTTTCTGAAGCA-3 ']
C C A C A AC C A C A A
G T L'hybridation a été réalisée à 42 C dans 6X de SSC, dans 5X de solution de Denhart, dans le pyrophosphate 0,15 mM, dans 100 microgrammes/ml d'ADN de thymus de veau dénaturé, dans 100 microgrammes/ml d'ARNt de levure et lmM d'EDTA (Maniatis et al., 1982, dans Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York). Les filtres ont été lavés à 42 C dans 2XSSC, NaDodS04 à 0,1 %, quatre fois pendant minutes. On a isolé plusieurs clones d'ADNc qui s'hybridaient aux deux sondes et qui ont été sous-clonés dans pEMBL (Dante et al., 1983, Nucleic Acids Res. 11:1645- 1654). Un clone (pPC-21) contenant une séquence d'insertion de 2,6kb a été séquencé sur les deux brins par la réaction de terminaison au didésoxy nucléotide (Sanger et al., 1977, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74:5463-5467) à l'aide de différents fragments de restriction et de délétion d'exonucléase III combinés à un amorçage d'oligonucléotide spécifique (Henikoff, 1984, Gene 28:351-359). Un autre clone (pPC-14) contenant une séquence d'insertion de 2,2kb a été partiellement séquencé. L'analyse par matrice de points a été réalisée sur un PCAT IBM à l'aide du logiciel Gene Pro de GT Hybridization was performed at 42C in 6X SSC, 5X Denhart's solution, 0.15mM pyrophosphate, in 100 micrograms / ml denatured calf thymus DNA, in 100 micrograms / ml d Yeast tRNA and EDTA lmM (Maniatis et al., 1982, in Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York). The filters were washed at 42 ° C in 2XSSC, 0.1% NaDodSO4, four times for minutes. Several cDNA clones that hybridized to both probes and were subcloned into pEMBL were isolated (Dante et al., 1983, Nucleic Acids Res., 11: 1645-1654). A clone (pPC-21) containing a 2.6 kb insertion sequence was sequenced on both strands by the dideoxy nucleotide termination reaction (Sanger et al., 1977, Proc Natl Acad Sci USA 74 5463-5467) using different restriction and deletion fragments of exonuclease III combined with specific oligonucleotide priming (Henikoff, 1984, Gene 28: 351-359). Another clone (pPC-14) containing a 2.2kb insertion sequence was partially sequenced. Dot matrix analysis was performed on an IBM PCAT using the Gene Pro software from
Riverside Scientific Enterprises (Seattle, WA). Riverside Scientific Enterprises (Seattle, WA).
L'ARN polyadénylé a été fractionné sur un gel agaroseformaldéhyde à 1 % (Lehrach et al., 1977, Biochemistry 16:4743-4751), transféré sur une membrane de nylon (Hybond, Amrersham), et hybridé avec une sonde marquée au [32P]. L'hybridation a été réalisée à 42 C dans du formamide à 50 % contenant 0,9 M de NaCL, 50 mM de phosphate de sodium (pH 7), 5mM d'EDTA, 0,1% de NaDodS04, 4X de solution de Denhardt, 0,4 mg/ml d'ARNt de The polyadenylated RNA was fractionated on a 1% agaroseformaldehyde gel (Lehrach et al., 1977, Biochemistry 16: 4743-4751), transferred to a nylon membrane (Hybond, Amrersham), and hybridized with a [2H-labeled probe]. 32P]. Hybridization was carried out at 42 ° C in 50% formamide containing 0.9 M NaCl, 50 mM sodium phosphate (pH 7), 5 mM EDTA, 0.1% NaDodSO4, 4X bromine solution. Denhardt, 0.4 mg / ml tRNA from
levure, et 0,25mg/ml d'ADN de thymus de veau dénaturé. yeast, and 0.25 mg / ml of denatured calf thymus DNA.
Les filtres ont été lavés à 65 C dans 0,25X de SSC, 0,1 % de NaDodSO4, séchés et exposés à un film de rayons X Cronex-4 (DuPont) à l'aide d'écrans d'intensification The filters were washed at 65 ° C in 0.25X SSC, 0.1% NaDodSO4, dried and exposed to Cronex-4 X-ray film (DuPont) using intensifying screens.
Lightening Plus (DuPont).Lightening Plus (DuPont).
Une bibliothèque d'ADNc a été construite à l'aide d'ARN polyadénylé isolé à partir de cellules de PC-3 traitées au tamoxifen. Des observations précédentes indiquaient que le traitement au tamoxifen provoquait un accroissement de deux à cinq fois la sécrétion de TGF-B2 (Ikeda et al., 1987, Biochemistry 26-2406-2410). La bibliothèque a été criblée avec les sondes 1 et 2 comme décrit ci-dessus. On a obtenu cinq clones qui se sont hybridés aux deux sondes. Un clone, pPC-21, contenant une séquence d'insertion de 2,6kb, a été choisi pour le séquençage. Un autre clone, pPC-14 contenant une séquence d'insertion de 2,2kb, a été partiellement séquencé. L'ADN et les séquences d'acides aminés déduites sont montrés à A cDNA library was constructed using polyadenylated RNA isolated from tamoxifen-treated PC-3 cells. Previous observations indicated that tamoxifen treatment increased the secretion of TGF-B2 by two to five times (Ikeda et al., 1987, Biochemistry 26-2406-2410). The library was screened with probes 1 and 2 as described above. Five clones hybridized to both probes were obtained. A clone, pPC-21, containing a 2.6kb insertion sequence, was chosen for sequencing. Another clone, pPC-14 containing a 2.2kb insertion sequence, was partially sequenced. The DNA and deduced amino acid sequences are shown in
la figure 1.Figure 1.
pPC-21 contient un seul cadre de lecture ouvert codant pour un polypeptide déduit de 442 acides aminés; les 112 acides aminés de l'extrémité carboxy comprennent le monomère de TGF-B2 mature (encadré à la figure la). La première méthionine codée par le cadre de lecture ouvert est immédiatement suivie par une étendue d'acides aminés hydrophobes et non chargés (surmontée d'un trait à la figure la) caractéristique d'un peptide signal. Ni la séquence nucléotidique codant pour cette méthionine ni celles codant pour les deux méthionines suivantes présentes dans le cadre de lecture ouvert ne sont homologues de la séquence de consensus pour la séquence de méthionine d'initiation (kozak, 1986, Cell 44:283-292). Du fait que la traduction débute habituellement avec la première méthionine dans un cadre de lecture ouvert et du fait que des régions homologues de TGF-B1, comme discuté ci- dessous, surviennent en amont de la seconde méthionine, on a tenté d'attribuer à la première méthionine le site du début de la traduction. Il apparait alors que TGF-B2, de même que TGF-B1, est exprimé en tant que partie d'un précurseur sécrété de bien plus grande taille. Le clone de pPC-21 contient 467 bp en amont de la méthionine supposée d'amorçage et une région non traduite en 3' d'approximativement 800 bp incluant une terminaison poly [A], quinze bases en amont de laquelle est située une séquence signal de polyadénylation (Proudfoot et Brownlee, 1976, Nature pPC-21 contains a single open reading frame encoding a polypeptide derived from 442 amino acids; the 112 amino acids of the carboxy terminus comprise the mature TGF-B2 monomer (box in Figure la). The first methionine encoded by the open reading frame is immediately followed by an expanse of hydrophobic and uncharged amino acids (surmounted by a line in Figure la) characteristic of a signal peptide. Neither the nucleotide sequence encoding this methionine nor those encoding the following two methionines present in the open reading frame are homologous to the consensus sequence for the initiating methionine sequence (kozak, 1986, Cell 44: 283-292 ). Since translation usually begins with the first methionine in an open reading frame and because homologous regions of TGF-B1, as discussed below, occur upstream of the second methionine, attempts have been made to attribute the first methionine the site of the beginning of the translation. It appears then that TGF-B2, as well as TGF-B1, is expressed as part of a secreted precursor of much larger size. The clone of pPC-21 contains 467 bp upstream of the supposed priming methionine and a 3 'untranslated region of approximately 800 bp including a poly [A] terminus, fifteen bases upstream of which is located a signal sequence of polyadenylation (Proudfoot and Brownlee, 1976, Nature
263:211-214).263: 211-214).
L'homologie de séquences de nucléotides à l'intérieur des régions codantes du clone d'ADNc pPC-21 The homology of nucleotide sequences within the coding regions of the pPC-21 cDNA clone
de TGF-ElB1 et TGF-B2 a été déterminée comme étant de 53 %. TGF-ElB1 and TGF-B2 were determined to be 53%.
Les régions codant pour les protéines matures ont 57 % d'homologie tandis que les régions précurseurs en amont ont 48 % d'homologie. Après alignement optimal des deux séquences, plusieurs insertions de nucléotides ont été notées dans la région précurseur de TGF-B2, l'une d'elles s'étendant sur 75 nucléotides. On ignore si ces insertions sont dues à la présence d'exons supplémentaires dans TGF-B2. Aucune homologie significative n'a été détectée entre les séquences d'ADN dans les régions non cpdantes des deux clones. En fait, tandis que TGF-BEI comportait des régions étendues non codantes riches en G-C, TGF-B2 comportait des régions extensives non codantes riches en A-T. Les deux clones d'ADNc contiennent des motifs structuraux répétitifs dans la région non codante en 3', les motifs répétitifs dans TGF-B1 consistant en CCCC (purine) (Sharples et al., 1987, DNA 6:239-244) et dans TGF-B2 en ATG ou The mature protein coding regions have 57% homology while the upstream precursor regions have 48% homology. After optimal alignment of the two sequences, several nucleotide insertions were noted in the TGF-B2 precursor region, one of them extending over 75 nucleotides. It is not known if these insertions are due to the presence of additional exons in TGF-B2. No significant homology was detected between the DNA sequences in the non-cpdant regions of the two clones. In fact, while TGF-BEI had extensive non-coding regions rich in G-C, TGF-B2 had extensive non-coding regions rich in AT. Both cDNA clones contain repetitive structural units in the 3 'noncoding region, repeating units in TGF-B1 consisting of CCCC (purine) (Sharples et al., 1987, DNA 6: 239-244) and in TGF-B2 in ATG or
A(pyrimidine) (purine).A (pyrimidine) (purine).
La localisation des sites de restriction de nombreux clones a révélé qu'un clone, pPC-14, manquait d'un site de restriction KpnI situé dans la partie amine de la séquence de codage de TGF-22. Les sites de restriction de pPC-14 et de pPC-21 sont montrés à la figure ld. pPC-14 a été séquencé sur une étendue d'environ 100 nucléotides correspondant à cette région de la molécule par amorçage spécifique avec un oligonucléotide de 20-mer complémentaire des nucléotides 277 à 296 dans la figure la. Les résultats montrent que le clone pPC-14 contient une délétion de 87 nucléotides (positions de nucléotides 346 à 432 dans la figure la; voir aussi figure le) qui explique le site KpnI manquant et qui est remplacé par la séquence AAT, le codon pour l'asparagine. Les résultats suggèrent que le clone pPC-14 code pour un précurseur de TGF-B2 plus court de 414 1 acides aminés différent de la séquence pour laquelle code pPC-21 seulement en ce que les résidus d'acides aminés 116 à 144 sont supprimés et remplacés par un seul résidu d'asparagine. Bien que la région codante entière de pPC-14 n'ait pas été déterminée, elle est probablement en accord parfait avec la séquence de codage de pPC-21 puisque, à l'exception du site KpnI, les sites de restriction des deux clones se recouvrent parfaitement (figure ld). En outre, un clone simien codant pour un précurseur de TGF-B à 414 acides aminés contenant la même délétion de 29 acides aminés et le même remplacement a été identifié comme décrit dans la section 7 en exemple cidessous. Ce clone simien a une séquence codante qui est à peu près identique à celle du clone pPC-21 humain dans les régions ' et 3' par rapport à la délétion. La figure 2A montre la séquence protéique déduite de TGF-B1 humain (Derynck et al., 1985, Nature 316:701-705) comparée à celle de TGF-B2-442 humain. On a déterminé que TGF-B2 est homologue à 71 % de TGF-Bl humain dans toute la partie mature de la molécule comme The location of the restriction sites of many clones revealed that a clone, pPC-14, lacked a KpnI restriction site located in the amine portion of the TGF-22 coding sequence. The restriction sites of pPC-14 and pPC-21 are shown in Figure 1d. pPC-14 was sequenced over an extent of about 100 nucleotides corresponding to this region of the molecule by specific priming with a 20-mer oligonucleotide complementary to nucleotides 277-296 in Figure la. The results show that the clone pPC-14 contains a deletion of 87 nucleotides (nucleotide positions 346 to 432 in Figure la, see also Figure 1a) which explains the missing KpnI site and which is replaced by the AAT sequence, the codon for asparagine. The results suggest that clone pPC-14 encodes a shorter TGF-B2 precursor of 414 amino acids different from the sequence for which pPC-21 code only in that amino acid residues 116 to 144 are deleted and replaced by a single residue of asparagine. Although the entire coding region of pPC-14 has not been determined, it is probably in perfect agreement with the coding sequence of pPC-21 since, with the exception of the KpnI site, the restriction sites of both clones cover perfectly (Figure ld). In addition, a simian clone encoding a 414 amino acid TGF-B precursor containing the same 29 amino acid deletion and replacement was identified as described in Example Section 7 below. This simian clone has a coding sequence which is approximately identical to that of the human pPC-21 clone in the 'and 3' regions relative to the deletion. Figure 2A shows the deduced protein sequence of human TGF-B1 (Derynck et al., 1985, Nature 316: 701-705) compared to that of human TGF-B2-442. TGF-B2 was determined to be 71% homologous to human TGF-β1 throughout the mature portion of the molecule as
décrit précédemment (Marquardt et al. 1987, J. Biol. previously described (Marquardt et al., 1987, J. Biol.
Chem., sous presse). La partie amine du précurseur en amont de la molécule mature montre une homologie de 31 % entre TGF-B1 et TGF-B2-442. La comparaison d'homologie par matrice de points montrée à la figure 2B révèle qu'une homologie significative existe dans plusieurs zones spécifiques des protéines. La comparaison des séquences d'acides aminés Nterminales dans la région supposée de peptide signal ne révèle pas d'homologie significative. Chem., In press). The amine portion of the precursor upstream of the mature molecule shows a 31% homology between TGF-B1 and TGF-B2-442. The dot matrix homology comparison shown in Figure 2B reveals that significant homology exists in several specific areas of the proteins. Comparison of the N-terminal amino acid sequences in the supposed signal peptide region does not reveal significant homology.
262 1 324262 1,324
Dans TGF-B2, le site de clivage de séquence signal est prédit comme étant situé après l'acide aminé (sérine) et après l'acide aminé 29 (glycine) dans TGF-B1 (Von Heijne, 1983, Eur. J Biochem. 133:17-21). Ce site de clivage précède directement le premier bloc d'homologie entre TGF-B1 et TGF-B2 qui s'étend sur 34 acides aminés en aval. Après élimination des séquences de signal, les précurseurs de TGF-B1 et TGF-B2 partageraient des terminaisons N identiques sur les quatre premiers In TGF-B2, the signal sequence cleavage site is predicted to be located after the amino acid (serine) and after amino acid 29 (glycine) in TGF-B1 (Von Heijne, 1983, Eur J Biochem. 133: 17-21). This cleavage site directly precedes the first block of homology between TGF-B1 and TGF-B2 which extends over 34 amino acids downstream. After elimination of the signal sequences, TGF-B1 and TGF-B2 precursors would share identical N terminations on the first four
acides aminés, y compris la cystéine en position 4. amino acids, including cysteine at position 4.
Quatorze acides aminés en aval de cette extrémité N supposée, 19 acides aminés parmi les 21 acides aminés suivants sont conservés entre TGF-B1 et TGF-B2, un bloc d'homologie plus important que tous ceux déjà vus même dans la région C-terminale contenant la protéine de TGF-B mature. Plusieurs autres blocs de forte homologie existent à l'intérieur de la région en amont de la Fourteen amino acids downstream of this supposed N-terminus, 19 amino acids out of the following 21 amino acids are conserved between TGF-B1 and TGF-B2, a block of greater homology than all those already seen even in the C-terminal region containing the mature TGF-B protein. Several other blocks of strong homology exist within the region upstream of the
protéine mature comme représenté aux figures 2A et 2B. mature protein as shown in Figures 2A and 2B.
Ces domaines sont séparés par de longues étendues These areas are separated by long stretches
d'acides aminés non homologues.non-homologous amino acids.
Le précurseur de TGF-B2 comporte trois sites potentiels de Nglycosylation (situés au niveau des résidus 72, 168 et 269 à la figure la) . Seul le premier site est conservé dans TGF-B1, et est situé à l'intérieur d'un bloc plus important de résidus conservés, suggérant que ce site potentiel de glycosylation a des caractéristiques structurales et/ou fonctionnelles importantes. Après élimination de la séquence signal, le précurseur de TGF-B2 contiendrait 31 ou 59 acides aminés de plus que sa contrepartie de TGF-B1. Un résidu de cystéine supplémentaire dans TGF- B2 est situé juste en amont d'une région de grande taille d'acides aminés non homologues qui précède la séquence mature. Comme avec TGF-B1, le site de clivage de la protéine de TGF-B2 mature se situe juste après une région de 4-5 acides aminés basiques comme montré à la figure 2A. La région mature contient neuf cystéines. La conservation de 7 des 9 cystéines est caractéristique des différents membres de la famille de TGF- B. Les analyses d'hydropathie de TGF-B1 et de TGF-B2 révèlent des motifs semblables dans le précurseur et dans les régions matures, les deux protéines étant généralement de nature hydrophile The precursor of TGF-B2 has three potential sites of Nglycosylation (located at residues 72, 168 and 269 in Figure la). Only the first site is conserved in TGF-B1, and is located within a larger block of conserved residues, suggesting that this potential glycosylation site has important structural and / or functional characteristics. After removal of the signal sequence, the TGF-B2 precursor would contain 31 or 59 amino acids more than its TGF-B1 counterpart. An additional cysteine residue in TGF-B2 is located just upstream of a large non-homologous amino acid region that precedes the mature sequence. As with TGF-B1, the mature TGF-B2 protein cleavage site is just after a region of 4-5 basic amino acids as shown in Figure 2A. The mature region contains nine cysteines. Preservation of 7 of the 9 cysteines is characteristic of the different members of the TGF-B family. Hydropathy analyzes of TGF-B1 and TGF-B2 reveal similar patterns in the precursor and in the mature regions, the two proteins being generally hydrophilic in nature
(données non représentées).(data not shown).
La figure 3A montre une analyse par Northern blot à l'aide de pPC-21 pour tester l'ARN polyadénylé provenant de BSC-40 (une lignée cellulaire du rein du callitriche africain) et de cellules de pPC-3 traitées au tamoxifen. Les cellules de PC-3 contiennent trois espèces majeures d'ARNm spécifiques de TGF-B2 ayant une taille de 4,1, 5,1 et 6,5 kb (figure 3A, bande 2); les cellules de BSC-40 contiennent de façon prédominante les séquences de transcription de 4,1 et 6,5 kb et des quantités moindres de l'ARN de 5,1 kb (figure 3A, bande 1). Il est à noter que la sonde de pPC21 ne détecte pas l'espèce d'ARNm spécifique de TGF-B1 de 2,5 kb présente dans cette lignée cellulaire dans les conditions d'hybridation utilisées ici. Ces résultats et des observations antérieures (Sharples et al., 1987, DNA 6:239-244) suggèrent que les cellules de BSC-40 contiennent les ARNm spécifiques de TGF-B1 et de TGF-B2. Afin de démontrer ceci plus clairement, des Northern blots ont été hybridés à un mélange contenant des quantités égales de sondes de TGF-B1 et de TGF-B2 radio-marquées à la même activité spécifique. La bande 1 de la figure 3B montre que les cellules de BSC-40 contiennent l'ARNm spécifique de TGF-B1 de 2,5 kb de même que les espèces d'ARNm de TGF-B2 de 4,1 et 6,5 kb: la bande 2 de la figure 3B montre que les cellules de PC-3 traitées au tamoxifen contiennent aussi l'ARNm spécifique de TGF-B1 de 2,5 kb. La figure 3B démontre aussi que les cellules de PC-3 traitées au tamoxifen contiennent davantage de message spécifique de TGF-B1 que de message Figure 3A shows Northern blot analysis using pPC-21 to test for polyadenylated RNA from BSC-40 (an African callikric kidney cell line) and tamoxifen-treated pPC-3 cells. PC-3 cells contain three major species of TGF-B2-specific mRNA with a size of 4.1, 5.1 and 6.5 kb (Fig. 3A, lane 2); BSC-40 cells predominantly contain 4.1 and 6.5 kb transcription sequences and smaller amounts of 5.1 kb RNA (Figure 3A, lane 1). It should be noted that the pPC21 probe does not detect the 2.5 kb TGF-B1 specific mRNA species present in this cell line under the hybridization conditions used herein. These results and previous observations (Sharples et al., 1987, DNA 6: 239-244) suggest that BSC-40 cells contain TGF-B1 and TGF-B2 specific mRNAs. In order to demonstrate this more clearly, Northern blots were hybridized to a mixture containing equal amounts of radio-labeled TGF-B1 and TGF-B2 probes with the same specific activity. Band 1 of Figure 3B shows that the BSC-40 cells contain the 2.5 kb TGF-B1 specific mRNA as well as the 4.1 and 6.5 kb TGF-B2 mRNA species. Band 2 of Figure 3B shows that tamoxifen-treated PC-3 cells also contain the 2.5 kb TGF-B1 specific mRNA. Figure 3B also demonstrates that tamoxifen-treated PC-3 cells contain more specific TGF-B1 message than message
spécifique de TGF-B2.specific to TGF-B2.
L'identification des clones d'ADNc spécifiques de TGF-B2 nous a permis de cribler pour l'ARNm de TGF-B2 dans différentes lignées cellulaires. Le Northern blot montré à la figure 4, montre que des séquences de transcription spécifiques de TGF-B2 pourraient être détectées dans HBL100 (une lignée cellulaire épithéliale normale dérivée du lait humain, obtenue du Dr. Greg Schultz), MCF-7 (une lignée cellulaire de carcinome mammaire humain), SK-MEL 28 (une lignée cellulaire de mélanome) et de cellules de KB (une lignée cellulaire de carcinome nasopharyngien) contenant de très faibles Identification of TGF-B2 specific cDNA clones enabled us to screen for TGF-B2 mRNA in different cell lines. The Northern blot shown in Figure 4 shows that TGF-B2 specific transcription sequences could be detected in HBL100 (a normal human milk-derived epithelial cell line obtained from Dr. Greg Schultz), MCF-7 (a line human breast carcinoma cell), SK-MEL 28 (a melanoma cell line) and KB cells (a nasopharyngeal carcinoma cell line) containing very low
niveaux d'ARNm de TGF-B2.TGF-B2 mRNA levels.
Les exemples suivants décrivent le clonage par ADNc de séquences de codage de TGF-B2 provenant de la lignée cellulaire du rein du callitriche africain, BSC-40, qui s'est révélée contenir des ARNm spécifiques The following examples describe cDNA cloning of TGF-B2 coding sequences from the African callikric kidney cell line, BSC-40, which has been found to contain specific mRNAs.
de TGF-B2 (description ci-dessus). Les résultats TGF-B2 (description above). The results
indiquent que le TGF-B2 simien, de même que le TGF-B2 humain, est synthétisé comme l'un d'au moins deux précurseurs plus longs desquels est dérivée la molécule indicate that simian TGF-B2, as well as human TGF-B2, is synthesized as one of at least two longer precursors from which the molecule is derived
de TGF-B2 mature par clivage protéolytique. mature TGF-B2 by proteolytic cleavage.
Les modes opératoires suivants ont été utilisés pour cloner les ADNccodant pour le précurseur de TGF-B2 simien. Des cellules de BSC-40 ont été cultivées dans un milieu de Eagle modifié par Dulbecco contenant 10 % de sérum de foetus de veau. L'ARN polyadénylé a été isolé par chromatographie sur oligo[dT]-cellulose comme décrit The following procedures were used to clone the cDNAs for the simian TGF-B2 precursor. BSC-40 cells were cultured in Dulbecco's modified Eagle's medium containing 10% fetal calf serum. Polyadenylated RNA was isolated by oligo [dT] -cellulose chromatography as described.
(Purchio et Fareed, 1979, J Virol. 29:763-769). (Purchio and Fareed, 1979, J Virol 29: 763-769).
Un ADNc double brin a été synthétisé à partir d'ARN polyadénylé de BSC-40 comme décrit (Maniatis et al., 1982, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, 371-372) et, après traitement avec EcoRI méthylase, a été lié à des liants d'oligonucléotide contenant un site de reconnaissance d'enzyme de restriction de EcoRI (liants de EcoRI). L'ADNc a été soumis a une digestion avec EcoRI et a été fractionné par chromatographie sur Sephacryl S-1000. Les fractions d'ADNc supérieures à 750 paires de bases ont été rassemblées et liées dans lambda gtlO qui avait été coupé avec EcoRI (Davis et al., 1980, A Manual for Genetic Engineering: Advanced Bacterial Genetics; Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Sring Harbor, NY), emballées (Grosveld et al., 1981, Gene 13:227-237) et plaquées sur E. coli C600 rK mK+hfl. La bibliothèque a été criblée par hybridation sur plaque (Bentonet et al., 1977, Science 196:180-182) à des sondes de pPC- 21 et de pPC-14 marquées au [32p]. Le clone pBSC-40-16, qui a hybridé la sonde pPC-21, et le clone pBSC-40-1, qui a hybridé la sonde pPC-14, ont été isolés et sous-clonés dans pEMBL. La séquence de codage de TGF-B2 de pBSC-40-1 a été déterminée par séquengage des deux brins à l'aide de la réaction de terminaison au didésoxy nucléotide (Sanger et al., 1977, Proc. Natl. Acad. Sci. USA Double-stranded cDNA was synthesized from polyadenylated BSC-40 RNA as described (Maniatis et al., 1982, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, 371-372). after treatment with EcoRI methylase, was ligated to oligonucleotide linkers containing an EcoRI restriction enzyme recognition site (EcoRI binders). The cDNA was digested with EcoRI and fractionated by Sephacryl S-1000 chromatography. The cDNA fractions greater than 750 base pairs were pooled and bound in lambda gt10 which had been cut with EcoRI (Davis et al., 1980, A Manual for Genetic Engineering: Advanced Bacterial Genetics, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Sring Harbor, NY), packaged (Grosveld et al., 1981, Gene 13: 227-237) and plated on E. coli C600 rK mK + hfl. The library was screened by plaque hybridization (Bentonet et al., 1977, Science 196: 180-182) for [32p] labeled pPC-21 and pPC-14 probes. Clone pBSC-40-16, which hybridized the pPC-21 probe, and clone pBSC-40-1, which hybridized the pPC-14 probe, were isolated and subcloned into pEMBL. The TGF-B2 coding sequence of pBSC-40-1 was determined by sequencing both strands using the dideoxy nucleotide termination reaction (Sanger et al., 1977, Proc Natl Acad Sci. USA
74:5463-5467). pBSC-40-16 a été partiellement séquencé. 74: 5463-5467). pBSC-40-16 was partially sequenced.
Deux clones ont été obtenus à partir d'une bibliothèque d'ADNc de BSC-40 qui se sont hybridés tour à tour avec des sondes construites à partir des séquences de codage de précurseur de TGF-B2-442 et de TGF-B2-414 humain. Le clone pBSC-40-16 qui s'est hybridé à la sonde de TGF-B2-442, a été séquencé sur une étendue de nucléotides (nucléotides 300 à 450 à la figure la) supposée contenir la séquence codante pour le segment de 29 acides aminés depuis la position 346 jusqu'à la position 432 à la figure la. Les résultats montrent que, dans cette région, pBSC-40-16 code pour une séquence d'acides aminés qui est identique à la séquence correspondante du clone d'ADNc de TGF-B2-442 humain, pPC-21, et suggèrent que pBSC-40-16 code pour un Two clones were obtained from a BSC-40 cDNA library which hybridized in turn with probes constructed from TGF-B2-442 and TGF-B2-414 precursor coding sequences. human. Clone pBSC-40-16, which hybridized to the TGF-B2-442 probe, was sequenced over a range of nucleotides (nucleotides 300 to 450 in Figure 1a) assumed to contain the coding sequence for the 29 amino acids from position 346 to position 432 in Figure la. The results show that, in this region, pBSC-40-16 encodes an amino acid sequence that is identical to the corresponding sequence of the human TGF-B2-442 cDNA clone, pPC-21, and suggests that pBSC -40-16 code for a
précurseur de TGF-B2 de 442 acides aminés. TGF-B2 precursor of 442 amino acids.
Le clone pBSC-40-1, qui s'est hybridé à la sonde de TGF-B2-414, a été séquencé sur toute la région codante. Les résultats montrent que ce clone code pour un précurseur de TGF-B2 de 414 acides aminés qui est identique au précurseur de TGF-B2-442 humain sauf que les résidus d'acides aminés 116 à 144 de TGF-B2-442 humain Clone pBSC-40-1, which hybridized to the TGF-B2-414 probe, was sequenced over the entire coding region. The results show that this clone encodes a 414 amino acid TGF-B2 precursor which is identical to the human TGF-B2-442 precursor except that human TGF-B2-442 amino acid residues 116 to 144
sont supprimés et remplacés par un seul résidu d'aspa- deleted and replaced by a single residue of asphal-
ragine. Au niveau du nucléotide, pBSC-40-1 diffère de TGF-B2-442 humain dans la région de délétion: les nucléotides 346 à 432 à la figure la sont supprimés et remplacés par le codon pour l'asparagine, AAT. A l'exception de 13 changements silencieux de bases, les deux structures sont autrement parfaitement homologues ragine. At the nucleotide level, pBSC-40-1 differs from human TGF-B2-442 in the deletion region: nucleotides 346 to 432 in Figure la are deleted and replaced by the codon for asparagine, AAT. With the exception of 13 silent base changes, the two structures are otherwise perfectly homologous
sur le reste de la séquence codante. on the rest of the coding sequence.
Les exemples suivants, décrivent l'expression de TGF-B2 mature biologiquement actif dans les cellules ovariennes de Hamster chinois (cellules de CH0) transfectées avec un plasmide recombinant contenant la séquence codant pour le TGF-B2 humain mature lié en aval et par encadrement avec la séquence codant pour le précurseur de TGF-B1 simien, sous le contrôle régulateur des séquences de promoteur de SV40. La séquence de construction a dirigé la synthèse et la sécrétion de TGF-B2 mature biolcgiquement actif à un niveau d'environ The following examples describe the expression of mature biologically active TGF-B2 in Chinese hamster ovary cells (CHO cells) transfected with a recombinant plasmid containing the downstream-bound mature human TGF-B2 coding sequence and by frame with the coding sequence for the simian TGF-B1 precursor, under the regulatory control of the SV40 promoter sequences. The construction sequence directed the synthesis and secretion of mature biologically active TGF-B2 to a level of about
0,5 mg/L.0.5 mg / L.
Des cellules ovariennes de Hamster chinois (CH0) déficientes en dihydrofolate réductase (dhfr) (Urlaub et Chasin, 1980, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 77:4216) ont été propagées dans un milieu F-12 de Ham (Gibco Laboratories, NY) complété par 10 % de sérum bovinI foetal (FBS) et 150 pg/ml de L-proline. De la pénicilline et de la streptomycine ont été incorporées à raison de 100 U/ml et 100j.g/ml, respectivement. Les transfectants de CHO ont été cultivés dans un milieu de Eagle modifié par Dulbecco contenant les mêmes compléments que ceux énumérés ci-dessus. Les cellules de CHO et leurs dérivés ont été séparés de leurs supports par trypsination de Chinese hamster ovary cells (CH0) deficient in dihydrofolate reductase (dhfr) (Urlaub and Chasin, 1980, Proc Natl Acad Sci USA 77: 4216) were propagated in Ham's F-12 medium (Gibco Laboratories). , NY) supplemented with 10% fetal bovine serum (FBS) and 150 μg / ml L-proline. Penicillin and streptomycin were included at 100 U / ml and 100 μg / ml, respectively. CHO transfectants were cultured in Dulbecco's modified Eagle's medium containing the same supplements as those listed above. CHO cells and their derivatives were separated from their supports by trypsinization of
faqon routinière à un rapport de séparation de 1:5. routinely at a separation ratio of 1: 5.
Le Méthotrexate (Sigma, MO) a été préparé à une concentration de réserve de 10 mg/ml dans l'eau. NaOH dilué (0,2 M) a été ajouté afin de solubiliser le médicament (pH final de 6). La réserve a été stérilisée par filtration et stockée à - 20 C. Des solutions mères de méthotrexate dans un milieu (100lM) ont été Methotrexate (Sigma, MO) was prepared at a stock concentration of 10 mg / ml in water. Dilute NaOH (0.2 M) was added to solubilize the drug (final pH of 6). The stock was sterilized by filtration and stored at -20 ° C. Stock solutions of methotrexate in medium (100 μM) were
maintenues à 4 C pendant pas plus d'un mois. kept at 4 C for no more than one month.
Des enzymes de restrictions, l'ADN ligase T4, la phosphatase intestinale de veau, le fragment de Klenow de l'ADN polyméràse I et d'autres réactifs d'ADN ont été achetés auprès de Bethesda Research Laboratories, MD. Des manipulations standards d'ADN ont été réalisées comme décrit dans Maniatis, T., et al., 1982, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Restriction enzymes, T4 DNA ligase, calf intestinal phosphatase, Klenow fragment of DNA polymerase I and other DNA reagents were purchased from Bethesda Research Laboratories, MD. Standard DNA manipulations were performed as described in Maniatis, T., et al., 1982, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor
Laboratory, New York.Laboratory, New York.
Le plasmide pSV2 (Bl-TGF-dhfr) qui contient l'ADNc de TGF-B1 et le gène dhfr de souris en tandem de même que des séquences intervenantes de SV40, a été The plasmid pSV2 (B1-TGF-dhfr) which contains the TGF-B1 cDNA and the tandem mouse dhfr gene as well as intervening sequences of SV40, was
construit comme décrit (Gentry et al., 1987, Mol. Cell. constructed as described (Gentry et al., 1987, Mol Cell.
Biol. 7:3418).Biol. 7: 3418).
Le plasmide pSV2/B1-B2/dhfr a été construit comme décrit plus loin aux pages 37, 38 et 39 premier paragraphe. Environ 24 heures après l'ensemencement de 106 cellules de CHO déficientes en dhfr dans des bacs de Omm, les cultures ont été transfectées avec 20 "g de plasmide pSV2-(BlTGF-dhfr) linéarisé par NdeI sous forme d'un précipité de phosphate de calcium (Wigler, M., et Plasmid pSV2 / B1-B2 / dhfr was constructed as described further on pages 37, 38 and 39 first paragraph. Approximately 24 hours after seeding of 106 dhfr-deficient CHO cells into Omm trays, the cultures were transfected with 20 μg of plasmid pSV2- (BlTGF-dhfr) linearized with NdeI as a phosphate precipitate. of calcium (Wigler, M., and
al., 1979, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 76:1373-1376). al., 1979, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 76: 1373-1376).
Brièvement, 20 ug d'ADN linéarisé ont été ajoutés à 1 ml de CaC!2 stérile 250 mM. Une portion de 1 ml de solution 2X HEPES (280 mM de NaCl, 50 mM de HEPES, 1,4 mM de phosphate de sodium, pH 7,1) a ensuite été ajoutée goutte à goutte, et on a laissé reposer le mélange sur la glace pendant 30 minutes. Puis le précipité a été dispersé goutte à goutte sur les cellules contenant 10 ml du milieu F12. Après incubation à 37 C pendant 4 heures, le milieu a été éliminé et remplacé par 10 ml de milieu F12 contenant 25 % de glycérol pendant 90 secondes à la température ambiante. Les cellules ont été rincées une fois avec 20 ml de milieu F12 et ont été mises à incuber dans le milieu F12 non sélectif (20 ml) pendant encore 48 heures. La sélection des transfectants exprimant dhfr a été accomplie en remplaçant le milieu par DMEM complété par 10 % de FBS dialysé (Gibco, N. Y.) et 150,ug/ml de L-proline. Des colonies ont été observées après culture des cellules pendant 10-14 jours dans le milieu de sélection. Dix colonies ont été aspirées au moyen d'une Briefly, 20 μg of linearized DNA was added to 1 ml of 250 mM sterile CaCl 2. A 1 ml portion of 2X HEPES solution (280 mM NaCl, 50 mM HEPES, 1.4 mM sodium phosphate, pH 7.1) was then added dropwise, and the mixture was allowed to stand. ice for 30 minutes. Then the precipitate was dispersed dropwise on cells containing 10 ml of F12 medium. After incubation at 37 ° C. for 4 hours, the medium was removed and replaced with 10 ml of F12 medium containing 25% glycerol for 90 seconds at room temperature. The cells were rinsed once with 20 ml of F12 medium and incubated in non-selective F12 medium (20 ml) for another 48 hours. Selection of dhfr-expressing transfectants was accomplished by replacing the medium with DMEM supplemented with 10% dialysed FBS (Gibco, N.Y.) and 150, ug / ml L-proline. Colonies were observed after culturing the cells for 10-14 days in the selection medium. Ten colonies were aspirated by means of a
pipette pasteur et étalées.Pasteur pipette and spread.
Des cellules amplifiées à la dihydrofolate réductase (dhfr) ont été dérivées des transfectants primaires essentiellement comme décrit (Gasser, C.S. et Schimke, R.T., 1986, J. Biol. Chem. 261:6938-6946). Apres étalement, 105 cellules ont été ensemencées dans des bacs de 100 mm et adaptées à des concentrations croissantes de méthotrexate. La plaque contenant des colonies visibles à la concentration la plus élevée en méthotrexate a été trypsinée et adaptée à cette concentration de méthotrexate pendant au moins deux autres séparations 1:5 de cellules. Des cellules (105) ont alors été ensemensées dans des bacs de 100 mm à 5 fois la concentration de méthotrexate. Le bac contenant des colonies visibles a de nouveau été trypsiné et adapté au milieu contenant le méthotrexate. Les cellules ont été figées de nouveau à différents stades d'amplification dans des milieux contenant 40 % de FBS, 10 % de diméthyl sulfoxyde et 50 % de DMEM. Le méthotrexate n'a pas été ajouté au milieu de Dihydrofolate reductase (dhfr) amplified cells were derived from primary transfectants essentially as described (Gasser, C.S. and Schimke, R.T., 1986, J. Biol Chem 261: 6938-6946). After plating, 105 cells were seeded in 100 mm tubs and adapted to increasing concentrations of methotrexate. The plate containing visible colonies at the highest concentration of methotrexate was trypsinized and adapted to this concentration of methotrexate for at least two further 1: 5 cell separations. Cells (105) were then sequenced in 100 mm dishes at 5 times the concentration of methotrexate. The tray containing visible colonies was again trypsinized and adapted to the medium containing methotrexate. The cells were fixed again at different amplification stages in media containing 40% FBS, 10% dimethyl sulfoxide and 50% DMEM. Methotrexate was not added to
figeage.freezing.
Des cellules épithéliales de poumons de visons, Mv 1 Lu (numéro matricule CCL-64, American Type Culture Collection), qui sont extrêmement sensibles à TGF-Bl, ont Mink lung lung epithelial cells, Mv 1 Lu (CCL-64 serial number, American Type Culture Collection), which are extremely sensitive to TGF-B1,
été utilisées pour l'essai d'inhibition de croissance. were used for the growth inhibition test.
L'essai a été réalisé à l'aide de l'analogue de thymidine '-[1253I]-iodo2' desoxyuridine (125IdU) pour estimer la synthèse d'ADN. Une unité d'activité a été définie comme étant la quantité nécessaire pour inhiber 50 % d'incorporation de 125IdU comparée à des cellules de The assay was performed using the thymidine analog - 1253I! Iodo-2 desoxyuridine (125IdU) to estimate DNA synthesis. One unit of activity was defined as the amount required to inhibit 50% 125IdU incorporation compared to
*CCL-64 non traitées.* CCL-64 untreated.
Pour tester les cellules transfectées en ce qui concerne la sécrétion de TGF-B2 actif, les surnageants dépourvus de sérum ont été recueillis à partir d'une récolte de 24 heures sur les cultures confluentes de cellules et dyalisés largement contre de l'acide acétique 0,2 M. L'acide acétique a été éliminé par lyophilisation et l'échantillon a été redissous dans le milieu de To test transfected cells for active TGF-B2 secretion, serum-free supernatants were collected from a 24-hour harvest on confluent cell cultures and extensively plated against acetic acid. , 2 M. The acetic acid was removed by lyophilization and the sample was redissolved in the medium of
culture complet stérile pour les essais. complete sterile culture for testing.
Un gène précurseur de TGF-B hybride consistant en codage de précurseur de TGF-B1 simien et en séquences non traduites en 5' jointes par encadrement avec le codage mature de TGF-B2 humain et avec des séquences non traduites en 3' a été construit comme illustré à la A hybrid TGF-B precursor gene consisting of simian TGF-B1 precursor coding and 5 'flanked untranslated sequences with mature human TGF-B2 coding and with 3' untranslated sequences was constructed. as shown in the
figure lc.Figure lc.
pPC-21 a d'abord subi une digestion avec EcoRI, rempli avec l'enzyme de Klenow, le fragment 2,3 kb lié à pEMBL ayant subi une digestion avec HincII, et utilisé pour transformer E. coli. Deux clones, pPC-21/HincII+ et pPC-21/HincII-, ayant des séquences d'insersion dans des orientations opposées, ont été utilisés pour produire des fragments de digestion de ExoIII se recouvrant par digestion avec SstI et BamHI puis par digestion par ExoIII, réparation de Klenow, reliaison de l'ADN, et transformation de E. coli. Deux clones, Exo 5,9 et Exo c se sont révélés contenir différentes longueurs des pPC-21 was first digested with EcoRI, filled with the Klenow enzyme, the 2.3 kb fragment bound to pEMBL digested with HincII, and used to transform E. coli. Two clones, pPC-21 / HincII + and pPC-21 / HincII-, having opposite orientation insertional sequences, were used to produce overlapping ExoIII digests by digestion with SstI and BamHI followed by digestion with ExoIII, Klenow repair, DNA binding, and E. coli transformation. Two clones, Exo 5.9 and Exo c were found to contain different lengths of
séquences 5' et 3' respectivement, et ont été sous- sequences 5 'and 3' respectively, and were sub-
clonés dans pEMBL pour produire pEMBL 5,9 et pEMBL 25C. cloned into pEMBL to produce pEMBL 5.9 and pEMBL 25C.
pEMBL 5,9 a été mis à digérer avec HindIII, coupé avec des bords francs par l'enzyme de Klenow, mis à digérer avec KpnI, et le fragment 0,6 kb (fragment 1) a été isolé. Exo 25C a été mis à digérer avec EcoRI et KpnI et le fragment 1,1 kb (fragment 2) a été isolé. pGS62 a été mis à digérer avec BamHI, rempli avec l'enzyme de Klenow, mis à digérer avec EcoRI et lié aux fragments 1 et 2 (pGS62 a été dérivé de pGS20 (Mackett et al, 1984, J. Virol. 49:857) par délétion d'un seul site EcoRI). Le mélange a été utilisé pour transformer E. coli et pEMBL 5.9 was digested with HindIII, cleaved with Klenow enzyme digests with KpnI, and the 0.6 kb fragment (fragment 1) was isolated. Exo 25C was digested with EcoRI and KpnI and the 1.1 kb fragment (fragment 2) was isolated. pGS62 was digested with BamHI, filled with Klenow enzyme, digested with EcoRI and ligated to fragments 1 and 2 (pGS62 was derived from pGS20 (Mackett et al, 1984, J. Virol 49: 857). ) by deletion of a single EcoRI site). The mixture was used to transform E. coli and
pGS62/CIFB a été isolé.pGS62 / CIFB has been isolated.
pGS62/CIFB a été mis à digérer avec PstI et EcoRI et le fragment de 1600 bp a été isolé et encore mis à digérer avec XhoII. Le fragment XhoIIEcoRI de 400 bp a été isolé (fragment 3). pSV2-beta-TGF (Gentry et al., 1987, Mol. Cell. Biol. 7:3418) a été mis à digérer avec ApaI et EcoRI et le grand fragment de 3000 bp a été isolé pGS62 / CIFB was digested with PstI and EcoRI and the 1600 bp fragment was isolated and further digested with XhoII. The XhoIIEcoRI fragment of 400 bp was isolated (fragment 3). pSV2-beta-TGF (Gentry et al., 1987, Mol Cell Biol 7: 3418) was digested with ApaI and EcoRI and the large 3000 bp fragment isolated.
(fragment 4).(fragment 4).
Deux brins complémentaires d'ADN avec les séquences montrées ci-dessous ont été synthétisés, phosphorylés, fusionnés et liés aux fragments "3" et "4" Two complementary strands of DNA with the sequences shown below were synthesized, phosphorylated, fused and linked to fragments "3" and "4"
décrits ci-dessus.described above.
CAA CAT CTG CAA AGC TCC CGG CAC CGC CGA GCT TTG CAA CAT CTG CAA AGC TCC CGG CAC CGC CGA GCT TTG
GAT GCG GCC TAT TGC TTT AGA AAT GTG CAG GAT AAT GAT GCG GCC TAT TGC TT AGA AAT GTG CAG GAT AAT
TGC TGC CTA CGT CCA CTT TAC ATT GAT TTC AAG AGG 3' TGC TGC CTA CGT CCA TTC TAC ATT GAT TTC AGG 3 '
' GATC CCT CTT GAA ATC AAT GTA AAG TGG ACG TAG GCA 'GATC CCT CTT GAA ATC AAT GTA AAG TGG ACG TAG GCA
GCA ATT ATC CTG CAC ATT TCT AAA GCA ATA GGC CGC GCA ATC ATT CTG CAC AT ATT AAA GCA ATA GGC CGC
ATC CAA AGC TCG GCG GTG CCG GGA GCT TTG CAG ATG ATC CAA AGC TCG GCG GTG CGC GGA GCT TTG CAG ATG
TTG GGCC 3'TTG GGCC 3 '
Le mélange de liaison a été utilisé pour transformer E. The binding mixture was used to transform E.
coli et pBl/B2 a été isolé.coli and pB1 / B2 was isolated.
Le plasmide pBl/B2 a été mis à digérer avec EcoRI, rempli avec le fragment de Klenow de l'ADN polymérase I, coupé avec HindIII et le fragment de 1600bp a été isolé: pSV2,B1/B2 a été construit en insérant ce fragment dans pSV2, neo qui avait été préalablement mis à Plasmid pB1 / B2 was digested with EcoRI, filled in with the Klenow fragment of DNA polymerase I, cut with HindIII and the 1600bp fragment isolated: pSV2, B1 / B2 was constructed by inserting this fragment in pSV2, neo which had been previously put in
digérer avec HindIII et HpaI pour éliminer le neo gène. digest with HindIII and HpaI to remove the neo gene.
pSV2,B1/B2 a été mis à digérer avec PvuI et EcoRI, rempli avec l'enzyme de Klenow, mis à digérer avec NdeI et le fragment NdeI-EcoRI de 2,6 kb (approximativement) a été isolé et lié à pSV2, dhfr qui avait été mis à digérer avec NdeI et PvuII. Le mélange de liaison a été utilisé pour transformer E. coli et pSV2, B1 / B2 was digested with PvuI and EcoRI, filled with Klenow enzyme, digested with NdeI and the 2.6 kb NdeI-EcoRI fragment (approximately) isolated and bound to pSV2, dhfr that had been digested with NdeI and PvuII. The binding mixture was used to transform E. coli and
pSV2/B1/B2/dhfr a été isolé.pSV2 / B1 / B2 / dhfr has been isolated.
PSV/B1-B2/dhfr a été utilisé pour transfecter des cellules de CHO déficientes en dhfr et des cellules amplifiées en dhfr ont été dérivées des transfectants PSV / B1-B2 / dhfr was used to transfect CHO cells deficient in dhfr and dhfr-amplified cells were derived from transfectants
primaires décrits dans matériaux et méthodes ci-dessus. described in materials and methods above.
Les clones positifs ont été identifiés par bioessai (inhibition des cellules épithéliales de poumons de visons (CCL-64) comme décrit (Gentry et al. 1987, Mol. Cell, Biol. 7:3418). Des protéines recombinantes ont également été détectées en pratiquant un Western blot à l'aide d'antisérums anti-peptides préparés contre la séquence NH2-YNTINPEASASPC-COOH (Gentry et al., 1987, Mol. Cell, Biol. 7:3418) qui est présente dans le TGF-B2 mature. Une bande, lB9, 12,5, s'est révélée secréter 240 ng/ml de TGF-B2 (figure 5). Cette bande a ensuite été Positive clones were identified by bioassay (inhibition of mink lung epithelial cells (CCL-64) as described (Gentry et al., 1987, Mol Cell, Biol 7: 3418).) Recombinant proteins were also detected performing a Western blot using anti-peptide antisera prepared against the NH2-YNTINPEASASPC-COOH sequence (Gentry et al., 1987, Mol Cell, Biol 7: 3418) which is present in mature TGF-B2 One band, IB9, 12.5, was found to secrete 240 ng / ml of TGF-B2 (Figure 5).
clonée en limitant la dilution dans 96 plaques à cuves. cloned by limiting the dilution in 96 cell plates.
Un clone, 1B9, 12,5, cl 36, a produit approximativement A clone, 1B9, 12.5, cl 36, produced approximately
500 ng/ml (figure 5).500 ng / ml (Figure 5).
L'analyse de la protéine secrétée par ce clone à l'aide d'un Western blot en utilisant un anti-sérum anti-peptide est présentée à la figure 6, montrant la présence du dimère de TGF-B2 mature de 24 kd de même que la forme précurseur de plus grande taille The analysis of the protein secreted by this clone using a Western blot using anti-peptide anti-serum is presented in FIG. 6, showing the presence of the mature 24 kd TGF-B2 dimer of the same that the precursor form of larger size
(approximativement 96 kd).(approximately 96 kd).
Les micro-organismes suivants ont été déposés auprès de la collection de culture de recherche en agriculture (Agricultural Research Culture Collection), Northern Regional Research Center (NRRL) et les numéros The following microorganisms were deposited with the Agricultural Research Culture Collection, the Northern Regional Research Center (NRRL) and
de dép8t suivants leurs ont été attribués. The following depots have been awarded to them.
Microorganisme Plasmide NO de dépôt Escherichia coli HB101 pPC-21 B-18256 Escherichia coli HB101 pPC-14 B-18333 Escherichia coli HB101 pBSC-40-1 B18335 Escherichia coli HB101 pBSC-40-16 B-18334 Ovaire d'hamster chinois pSV/B1-B2/dhfr Microorganism Plasmid Deposit NO Escherichia coli HB101 pPC-21 B-18256 Escherichia coli HB101 pPC-14 B-18333 Escherichia coli HB101 pBSC-40-1 B18335 Escherichia coli HB101 pBSC-40-16 B-18334 Chinese hamster ovary pSV / B1-B2 / dhfr
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