CN101553569A - 含j-结构域蛋白质赋予的非生物应激耐受 - Google Patents
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Abstract
公开了增强编码包含至少DnaJ-型J-结构域的蛋白质的核苷酸序列表达的方法和构建物,以提供对非生物应激,特别是脱水和盐度应激有耐受性的植物或植物细胞。
Description
技术领域
本发明涉及植物遗传工程领域。更具体说,本发明涉及通过增强含J-结构域的蛋白质,特别是DnaJ-型蛋白质的表达而赋予对非生物应激条件(abioticstress condition),例如盐度、渗透性和脱水应激耐受性的方法。
背景技术
种子成熟蛋白,或晚期胚胎发生丰富(late embryogenesis abundant)(LEA)蛋白在种子发育的晚期干燥阶段大量产生。大多数LEA蛋白累积在接触外源性脱落酸或经历盐度或脱水所致的非生物应激的种子或植物性组织中。一些LEA蛋白可能通过使大分子水合、螯合离子并使去折叠蛋白质复性而赋予转基因植物对盐和脱水的耐受性。
采用抑制消减技术(suppression subtractive technique),发现9种基因在非生物应激条件下的表达高于正常条件。它们中的一种(GmDNJ1)与作为DnaJ同源物并由GenBank保藏为AF 169022的栽培大豆(Glycine max)种子成熟蛋白PM37(GmPM37)有99%核苷酸序列同源性。如图11a所示,其含有DnaJ的特征性组分,包括保守性N-末端J-结构域,富甘氨酸/苯丙氨酸结构域,包含(CXXCXGXG)4锌指型基序的结构域和非特征性的C-末端结构域(Cyr,D.M.等,J.Biol.Chem.(1994)269:9798-9804,Hennessy,F.等,Cell Stress & Chaperones(2000)4:347-358)。GmDNJ1与任何LEA蛋白不相似。
据信,DnaJ-样蛋白主要通过辅助Hsp70s的陪伴分子功能来用作陪伴分子或辅助陪伴分子蛋白。Hsp70是最初在果蝇幼虫上发现的对温度升高起反应的许多热激蛋白之一。虽然热激蛋白可以组成型产生或在应激条件下产生,但据信它们主要起陪伴分子的作用。
DnaJ-样蛋白定义为约73个氨基酸的保守性“J”区域(依据原始公开的大肠杆菌蛋白,通常对着蛋白质的N-末端产生(Hennessy,F.等,同上)。在真核生物蛋白中该结构域略短。如Hennessy等所述,DnaJ-样蛋白可分为:在包括J-结构域、富甘氨酸-苯丙氨酸结构域和(CXXCXGXG)4基序在内的所有结构域上与DnaJ相似的I型;含J-结构域和富甘氨酸-苯丙氨酸区域的II型;和只含J-结构域的III型。这些组别重新命名为A、B和C。
J-结构域需要包含三联组氨酸-脯氨酸-天冬氨酸(HPD)并且还含有许多其它高度保守的区域。Hennessy等,(同上)详细比较了许多DnaJ-样蛋白的J-结构域,表明I型和II型蛋白中这些区域的相同性高于III型。
Miernyk,J.A.,Cell Stress & Chaperones(2001)6:209-218分析了拟南芥(Arabidopsis thaliana)的基因组和EST分布,显示该基因组编码89种含J-结构域的蛋白质,它们对应于不同的EST水平。这些蛋白中只有一种高度表达;即III型DnaJ-样蛋白。未分析实际蛋白质水平。
现已有报道说DnaJ表达与植物耐受盐和脱水有关。Zhu等,Cell(1993)5:341-349显示盐度应激下植物细胞培养物中诱导高等植物钱币状滨藜(Atriplex nummularia)的DnaJ同系物(ANJ1)表达。最近,Nguyuen等,Mol.Gen.Genomics(2004)272:35-46开发了用于绘制水稻中耐受脱水的数量性状基因座(QTL)区域的标记物,其显示与玉蜀黍(Zea mays)DnaJ-相关蛋白(ZMDJ1)相似并由热应激诱导(Baszczynski等,Maydica(1997)42:189-201)。虽然这些研究报道了在盐和脱水应激下对DnaJ同系物的诱导,但未表征ANJ1和ZMDJ1对盐或脱水耐受性的作用。
一组种子成熟蛋白包括小热激蛋白(sHsps),但不包括DnaJ或Hsp40(Wise,BMC Bioinformatics(2003)29:52-70)。只有GmPM37(GmDNJ1)报道是DnaJ-样种子成熟蛋白。推测的蛋白质序列显示GmDNJ1含有DnaJ的保守基序,预计的分子量类似于普通DnaJ蛋白(Hdj1:38kDa;Ydj1:45kDa;Hsp40:41kDa)。
迄今为止,没有记载DnaJ蛋白在植物中赋予非生物应激(除热激外)耐受性的功能作用的任何报道。
发明概述
本发明提供通过利用蛋白质的表达系统赋予高等植物非生物应激,例如盐度、渗透性和脱水应激耐受性的方法,所述蛋白质含有J-结构域共有序列,优选还含有DnaJ蛋白的特征性甘氨酸/苯丙氨酸结构域和(CXXCXGXG)4序列。
因此,在一方面,本发明涉及通过修饰植物或植物细胞以产生含有保守性J-结构域的异源蛋白而保护植物或植物细胞免遭非生物应激,例如盐度、渗透性和脱水应激的方法,其中该方法包括用编码该蛋白质的核苷酸序列或与其基本上相同的核苷酸序列,或下述本发明重组核酸构建物转化植物或植物细胞。
在另一方面,本发明提供保护植物或植物细胞免遭非生物应激,例如盐度、渗透性和脱水应激的方法,该方法通过修饰植物或植物细胞使之包含含有编码蛋白质的内源性核苷酸序列的表达系统或构建物,所述蛋白质包含DnaJ-型J-结构域,而所述核苷酸序列连接于就该序列而言异源的并可在所述植物中操作的启动子。
在还有另一方面,本发明涉及实施上述方法的核酸构建物。这些构建物可包含含有核苷酸序列的核酸转化载体,所述核苷酸序列编码包含DnaJ-型J-结构域的蛋白质并操作性连接于可在植物细胞中操作的启动子。这种构建物还包含含有用于以同源重组或其它方式将高度表达水平启动子插入植物或植物细胞基因组的序列的转化载体。
在还有另一方面,本发明涉及编码含有DnaJ-型J-结构域的蛋白质的核苷酸序列或含有所述序列作为可选择标记物的构建物的应用。
在还有另一方面,本发明涉及通过增强作为选择标记的含DnaJ-型J-结构域的蛋白质表达来鉴定成功转化体的方法。
在还有另一方面,本发明涉及转基因植物和植物细胞,其包含本发明的含DnaJ-型J-结构域的核苷酸序列或构建物。
在还有另一方面,本发明涉及制备或产生耐受非生物应激的植物或植物细胞的方法,包括修饰植物或植物细胞以产生含有DnaJ-型J结构域的蛋白质。因此,按照本发明方法可获得耐受非生物应激的植物或植物细胞。
当本发明方法与节水技术联用来培养经修饰具有耐受力的植物时,其赋予盐度、渗透性和脱水应激耐受性的能力特别有帮助。因此,可能联用本发明方法与减少灌溉或其它方法来降低作物培养中的用水量。
在还有另一方面,本发明涉及编码含DnaJ-型J-结构域的蛋白质的核酸序列或该蛋白在制备含有该蛋白的构建物或者植物或植物细胞中的应用。
在还有另一方面,本发明涉及编码含DnaJ-型J-结构域的蛋白质的核酸序列或该蛋白在制备试剂或试剂盒中的应用,所述试剂或试剂盒可用于制备含有该蛋白的构建物或者植物或植物细胞。
附图简述
图1a-1d显示Northern印迹分析,该分析设计用于检测盐度应激下在盐耐受(Wenfeng7)和盐敏感(Union)大豆栽培品种中编码GmDNJ1的mRNA,其中图1a显示Union叶片的Northern印迹;图1b显示Wenfeng7叶片的Northern印迹;图1c显示Union根的Northern印迹;图1d显示Wenfeng7根的Northern印迹。
图2a显示开花后不同时间点的GmDNJ1表达水平的Northern印迹分析;图2b显示在这些时间点豆荚的外观。
图3显示与对照相比4种拟南芥转基因品系中GmDNJ1表达的Northern印迹。
图4a和4b显示脱水应激(图4a)和盐度应激(图4b)对野生型和转基因拟南芥品系的作用。图4a和4b显示渗透应激(图4a)和盐度应激(图4b)对表达拟南芥ASN1cDNA(作为阴性转基因对照)或GmDNJ1的野生型和转基因拟南芥品系的表型的作用。
图5显示盐度和渗透应激对表达拟南芥ASN1cDNA(作为阴性转基因对照)或GmDNJ1的野生型和转基因拟南芥品系的鲜重(fresh weight)的作用。
图6显示水稻转基因品系中GmDNJ1的Northern印迹。
图7a和7b是比较GmDNJ1转基因品系(分离群体)和野生型水稻对盐度应激的反应的照片。
图8a和8b显示脱水应激(图8a)和盐度应激(图8b)对表达栽培大豆(G.max)AS2cDNA(作为阴性转基因对照)或GmDNJ1的未转化野生型和转基因水稻品系的表型的作用。
图9a和9b显示脱水应激和盐度应激对表达栽培大豆AS2cDNA(作为阴性转基因对照)或GmDNJ1的野生型和转基因水稻品系的存活率的作用。
图10a和10b显示脱水应激和盐度应激对表达栽培大豆AS2cDNA(作为阴性转基因对照)或GmDNJ1的野生型和转基因水稻品系的鲜重的作用。
图11a和11b比较了GmDNJ1蛋白与已知的DnaJ蛋白的氨基酸序列(图11a),和大肠杆菌(E.coli)细胞中产生的GST-GmDNJ1融合蛋白形式的纯化GmDNJ1的辅助陪伴分子活性(图11b)。
发明详述
定义
举出以下定义是为了有助于解释本发明。
术语“高等植物”指具有维管系统的植物,即维管植物。具体地说,高等植物包括蕨类植物、裸子植物和被子植物。
本文所用的术语“非生物应激”指对植物或植物细胞施加不利影响的无生命环境因素。在大多数情形中,依据与总体生长相关的植物存活、作物产量、生长(生物量累积)或基础同化过程(CO2和矿物质摄取)检测应激。非生物应激的例子包括但不限于:盐度、脱水、氧化应激和极端冷或热。盐度应激表示生长基质(包括但不限于土壤和水耕系统)含有盐(包括但不限于NaCl、NaHCO3、Na2CO3、Na2SO4)的水平限制目标植物生长。渗透应激表示生长基质含有能降低生长基质中水势的物质(包括但不限于盐)。脱水应激表示生长基质含有的水低于目标植物最佳生长所需。
术语“异源蛋白质”指具有不同来源,例如不同物种、不同组织或不同基因的那些蛋白质。例如,认为拟南芥的DnaJ蛋白对于大豆是异源的。“异源核酸序列”指天然彼此不操作性相连或毗连的那些序列。例如,当启动子和其操作性相连的编码序列衍生自不同物种或基因时,二者是异源的。
本文所用的术语“内源性”表示在获得其的生物中使用的蛋白质和核酸序列。
本文所用的术语“偶联”表示所涉及的诸部分,例如启动子和编码序列操作性相连。
本文所用的术语“启动子”和“控制序列”指离基因的5’端不远的调控区,其用作RNA聚合酶的结合位点。这种序列具有指导或调节紧邻其下游的核酸序列转录的功能。启动子的类型各种各样,包括组成型启动子、组织特异性启动子、诱导型启动子和特定生理条件,例如脱水触发的那些启动子。本发明可用的启动子的例子包括但不限于:CaMV35S、Ubi、SAG12启动子等。更合适的启动子见PlantProm数据库(Shahmuradov等,Nucleic Acids Research,2003,第31卷,第1号114-117)。
本文所用的术语“操作性连接于”指启动子相对于编码多肽的多核苷酸的定位方式使得该多核苷酸在调节核酸的控制下转录并任选翻译成多肽。
本文所用的短语“在植物细胞中可操作”表示启动子或控制序列在植物细胞中能行使其正常功能和/或调节紧邻其下游的编码序列表达,其中所述植物细胞可以是活的植物或细胞培养物的一部分。
可互换的术语“可选择标记”和“选择标记”指某种基因,其赋予表达该标记基因的细胞独特的表型,因此可区分这种转化细胞与不具有该标记的细胞。可选择标记基因赋予可根据对选择因子(例如,除草剂、抗生素、射线、热、或破坏未转化细胞的其它处理,包括非生物应激)的耐受性而“选出”的性状。可筛选标记基因(或报道基因)赋予可通过观察或测试,即通过“筛选”(例如,β-葡糖醛酸糖苷酶、萤光素酶或未转化细胞中不存在的其它酶活性)鉴定的性状或表型。
本文所用的术语“构建物”是描述可通过重组DNA技术修饰的核酸序列。构建物可以是依据插入其中的元件而用于转化或表达的载体。例如,具有T-DNA边界的构建物可以是用于转化植物的二元载体。构建物还可以是下述表达系统。
本文所用的术语“转化载体”指可将待转化的核酸序列插入或克隆入其中的核酸分子,优选衍生自,例如质粒、噬菌体或植物病毒的DNA分子。载体优选含有一个或多个独特的限制性位点,在特定的宿主细胞,包括靶细胞或组织或祖细胞或其组织中能自主复制,或者可与特定宿主的基因组整合,从而可复制克隆的序列。因此,载体可以是自主复制载体,即作为染色体外实体存在的载体,其复制不依赖于染色体复制,例如线形或封闭的环状质粒、染色体外元件、微型染色体或人工染色体。载体可含有确保自身复制的任何元件。或者,载体可以在引入细胞时整合入接受细胞的基因组并与其所整合入的染色体一起复制。载体系统可包含一种载体或质粒、两种或更多种载体或质粒,它们一起含有待引入宿主细胞基因组或转座子的总DNA。载体的选择通常取决于载体与载体所引入的细胞的相容性。载体还可包括选择标记,例如可用于选择合适转化体的抗生素抗性基因。本领域技术人员熟知这种抗性基因的例子。在本发明中,术语“构建物”和“载体”可互换使用。
本文所用的术语“表达系统”指核酸序列,特别是含有基因和与所述基因操作性相连的控制序列的DNA序列。利用各种控制序列可调节基因的表达模式和水平。可将一种或多种表达系统插入本发明构建物或转化载体,再引入所需宿主,从而在其中表达基因。
本发明的实施方式
在本发明中,发现包含DnaJ保守性J-结构域基序的蛋白质能成功地赋予植物细胞和植物对盐度、低渗透势和脱水等应激因素的耐受性。植物和植物细胞借助转基因修饰以包含产生这种蛋白质的表达系统从而显示这种耐受性。下文以水稻和拟南芥植物为例作了说明,但绝非限制于这些实例。任何高等植物或高等植物的细胞均是本发明方法和材料的合适对象。
本发明的方法适用于任何植物,优选属于被子植物和裸子植物纲的高等植物。双子叶植物亚纲和单子叶植物亚纲的植物特别合适。双予叶植物包括以下目:木兰目(Magnoliales)、八角目(Illiciales)、樟目(Laurales)、胡椒目(Piperales)、马兜铃目(Aristochiales)、睡莲目(Nymphaeales)、毛茛目(Ranunculales)、罂粟目(Papeverales)、瓶子草科(Sarraceniaceae)、昆蓝树目(Trochodendrales)、金缕梅目(Hamamelidales)、杜仲目(Eucomiales)、塞子木目(Leitneriales)、杨梅目(Myricales)、山毛榉目(Fagales)、木麻黄目(Casuarinales)、石竹目(Caryophyllales)、肉穗果目(Batales)、蓼目(Polygonales)、蓝雪目(Plumbaginales)、五桠果目(Dilleniales)、山茶目(Theales)、锦葵目(Malvales)、荨麻目(Urticales)、玉蕊目(Lecythidales)、紫堇目(Violales)、杨柳目(Salicales)、白花菜目(Capparales)、杜鹃花目(Ericales)、岩梅目(Diapensales)、柿树目(Ebenales)、报春花目(Primulales)、蔷薇目(Rosales)、豆目(Fabales)、川草目(Podostemales)、小二仙草目(Haloragales)、桃金娘目(Myrtales)、山茱萸目(Cornales)、山龙眼目(Proteales)、檀香目(Santales)、大花草目(Rafflesiales)、卫矛目(Celastrales)、大戟目(Euphorbiales)、鼠李目(Rhamnales)、无患子目(Sapindales)、胡桃目(Juglandales)、牻牛儿苗目(Geraniales)、远志目(Polygalales)、伞形目(Umbellales)、龙胆目(Gentianales)、花葱目(Polemoniales)、唇形目(Lamiales)、车前草目(Plantaginales)、玄参目(Scrophulariales)、桔梗目(Campanulales)、茜草目(Rubiales)、川绿断目(Dipsacales)和菊目(Asterales)。单子叶植物包括以下目:泽泻目(Alismatales)、天南星目(Arales)、棕榈目(Arecales)、凤梨目(Bromeliales)、鸭跖草目(Commelinales)、巴拿马草目(Cyclanthales)、莎草目(Cyperales)、谷精草目(Eriocaulales)、水鳖目(Hydrocharitales)、灯芯草目(Juncales)、茨藻目(Najadales)、帚灯草目(Restionales)、禾本目(Poales)、霉草目(Triuridales)、香蒲目(Typhales)、姜目(Zingiberales)、露兜树目(Pandanales)、百合目(Lilliales)和蓝目(Orchidales)。属于裸子植物纲的植物是苏铁目(Cycadales)、松目(Pinales)、银杏目(Ginkgoales)和买麻藤目(Gnetales)。
本发明方法优选用于对于农业、园艺、能源工业、用于生物转化的生物质和/或林业重要或感兴趣的植物。例子是烟草、油料种子、油菜、甜菜、土豆、西红柿、黄瓜、胡椒、豆类、豌豆、柑橘水果、鳄梨、桃、苹果、梨、浆果、李子(plumbs)、瓜、茄子、棉花、大豆、葵花籽、玫瑰、猩猩木(poinsettia)、牵牛花、银胶菊、甘蓝、菠菜、苜蓿、洋蓟、玉米、小麦、水稻、黑麦、大麦、禾本植物,例如柳枝稷(switch grass)或草坪草(turf grass)、小米、大麻、香蕉、白杨、桉树和针叶树。
为提供必需的蛋白质,修饰植物细胞以含有编码相关蛋白质的核苷酸序列,其任选操作性连接于可在植物中操作的控制序列,或整合入基因组,从而能在内源性控制序列的控制下表达。
在本发明的一个实施方式中,用本发明的核酸构建物或载体感染或转化植物细胞或植物。核酸构建物优选含有可在植物中操作的控制序列,其操作性连接于J-结构域蛋白质编码序列,可选择控制序列以实现组成型、组织特异性或非组织特异性或诱导性表达。本领域有各种这样的控制序列可用,遗传修饰的合适载体也是熟知的并且实际上可商品化购得。
在本发明的一个实施方式中,衍生自土壤杆菌(Agrobacteria)的Ti质粒的二元系统特别适合于本发明。二元系统通常包含大小不同的两种载体。较大的载体是辅助载体,其含有将较小载体所携带的T-DNA整合入植物细胞基因组的必需基因。较小的载体通常称为二元载体,其携带要插入或克隆的基因。辅助载体通常预先转化合适的土壤杆菌菌株。本领域熟知许多这种土壤杆菌菌株,例如LBA4404、GV3101、EHA101、EHA105、ABI等(Plant MolecularBiology Manual(植物分子生物学手册),S.B.Gelvin和R.A.Schilperoort编,第2版,斯普林格公司(Springer),1994)。类似地,可用许多二元载体实施本发明,例如pBR322、pUC系列、pBI系列、pMON系列、pCambia系列、pGreen系列,等等。二元载体的选择可取决于待转化的植物物种。例如,LBA4404适合于转化双子叶植物,而EHA105可选用于单子叶植物。本领域普通技术人员具有选择合适载体的知识,这些知识可参见,例如植物分子生物学手册,S.B.Gelvin和R.A.Schilperoort编,第2版,斯普林格公司,1994。
类似地,如今本领域熟知实施植物细胞的遗传修饰和重建完整植物的技术。该方面现有技术状态的总结,包括能构成本发明对象的植物和植物细胞类型的相当广泛的清单可见2004年1月14日公布的美国专利公布2004/0009476,该份文献关于植物的遗传操作的合适技术与可施加这些技术的植物和植物细胞范围的内容通过引用纳入本文。
此外,因为本发明的修饰细胞和植物耐受脱水所致应激和/或高盐度应激,所以包含编码含J-结构域蛋白质的核苷酸序列的表达系统可用作成功转化细胞的可选择标记,该序列操作性连接于在植物中可操作的控制序列。成功转化体耐受性更高,可经历施加的应激(标记赋予耐受性)而存活。因此,可借助转化体经历这种应激条件而存活的能力鉴定成功的转化体。
从以上背景章节的讨论中可知,其表达能实现对非生物应激,例如盐度、渗透性和脱水应激的耐受性的蛋白质必须至少含有DnaJ-型J-结构域。该结构域约60个氨基酸,其与I(或A)型DnaJ-样蛋白的保守性J-结构域同源。为明确起见,如图11a所示,所需的同源性(相同性)程度是与大豆GmDNJ1的13-77位氨基酸序列有至少80%、85%、90%或95%相同性,且必须含有序列组氨酸-脯氨酸-天冬氨酸(HPD)。(从图11a可以知道,如果GmDNJ1独立编号,该区域是12-77位)。
在一个实施方式中,除DnaJ-型J-保守性结构域外,该蛋白还含有类似于DnaJ-I(A)型蛋白的特征性序列的富甘氨酸/苯丙氨酸序列和/或也是I(A)型DnaJ蛋白特征性的(CXXCXGXG)4结构域。
为在植物或植物细胞中产生所需的DnaJ-样蛋白,可利用含有编码DnaJ-样蛋白的异源核酸序列的重组表达载体修饰这些细胞或植物,或者可通过增强含DnaJ-型J-结构域蛋白质的内源性编码基因的表达来修饰这些细胞或植物。可通过将代表DnaJ-型J-结构域的内源性编码序列的核苷酸序列置于编码序列操作性连接于控制序列的载体上以实现这种增强,所述控制序列是所述编码序列的异源序列,所述编码序列能在它们的控制下在植物或植物细胞中实现高水平表达。或者,可修饰植物或植物细胞使之含有转化载体,所述转化载体包含这种强效控制序列以及实现控制序列与植物中所含的所需DnaJ样蛋白的内源性编码序列操作性连接的额外核苷酸序列。这些序列包括,例如与编码序列附近的内源性DNA同源(基本上相同)的序列。还可利用Cre-lox系统。普通技术人员知道可利用各种方法获得至少包含DnaJ-型J-结构域的所需蛋白质的表达水平。
编码序列可包括,例如与其同源(基本上相同的)的序列。本文用于描述两条核苷酸序列之间相似性程度的术语“基本上相同”指两条或更多条序列比较和比对最大一致性时,有至少约60%、优选至少约70%、更优选至少约80%、更优选约90%-约99%、还要更优选约95%-约99%,最优选约99%核苷酸相同性。本发明的核苷酸序列优选包含与编码大豆GmDNJ1的序列基本上相同的核苷酸序列或序列。
两条核苷酸序列基本相同的另一指标是这两个分子在严格条件下彼此特异性或实质性地杂交。
就核酸杂交实验,例如Sourthern和Northern印迹分析而言,“严格杂交条件”和“严格杂交洗涤条件”同时依赖于序列和环境。较长的序列在较高温度发生特异性杂交。核酸杂交的广泛指南见Tijssen(1993)LaboratoryTechniques in Biochemistry and Molecular Biology-Hybridization withNucleic Acid Probes(生物化学和分子生物学的实验室技术-用核酸探针杂交),第I部分第2章,埃尔西维公司(Elsevier),纽约,纽约州。通常选择的高度严格的杂交和洗涤条件比特定序列在指定离子强度和pH时的热解链温度(Tm)低约5℃。
当本发明方法与节水技术联用来培养经修饰具有耐受力的植物时,其赋予盐度、渗透性和脱水应激耐受性的能力特别有帮助。因此,可能联用本发明方法与减少灌溉或其它方法来降低作物培养中的用水量。
以下实施例和结果证实并说明了本发明方法和构建物是成功的。在以下实施例中,利用SPSS(12.0版)统计学软件包分析数据。标出了显示显著差异(p<0.01或p<0.05)的样品。
实施例1
对盐度和脱水应激起反应而表达GmDNJ1
在本实施例中,研究了对盐度应激起反应的两种大豆栽培品种叶片和根中GmDNJ1的表达。用改进的Hoagland溶液(4.5mM KNO3,3.6mM Ca(NO3)2,1.2mM NH4NO3,3.0mM MgSO4,1.2mM(NH4)2SO4,0.25mM KH2PO4,4.5μMMnSO4,4.5μM ZnSO4,1.5μM CuSO4,0.4μM(NH4)6Mo7O24,0.09mM Fe-EDTA和1.5μM H3BO3)灌溉两种大豆种质,Wenfeng7(盐耐受性)和Union(盐敏感性),用125mM NaCl处理。处理后0-144小时收集叶片和根样品。
如前所述(Sambrook,J.等,Molecular Cloning:A Laboratory Manuals(分子克隆:实验室手册),第3版,冷泉港实验室出版社,纽约,纽约州,(2001))对根和叶片的提取物进行Northern印迹分析。用德国曼海姆罗氏公司的洋地黄毒苷(DIG)(Roche,Mannheim,Germany)标记反义单链DNA探针(Finckh,,U.等,Biotechniques(1991)10:35-38)。
结果见图1a-1d。在图1中,CK所标注的泳道代表未处理的对照,T0.3代表0.3%NaCl,T0.6代表用0.6%NaCl处理,T0.9代表用0.9%NaCl处理,T1.2代表用1.2%NaCl处理。盐度应激导致两种栽培品种的叶片中GmDNJ1的稳态mRNA水平升高,在Union中显示更显著,从而证实盐度应激诱导GmDNJ1基因表达。对于Wenfeng7,叶片中也诱导了GmDNJ1表达,但程度较低。非应激条件下,Wenfeng7叶片中的GmDNJ1表达通常高于Union中。根的结果见图1c和1d,与叶片的结果类似。
还利用提取物并通过Northern印迹分析再次研究了种子成熟和吸涨的相关性。就种子成熟而言,在环境受控温室中,用补加了改进的Hoagland溶液的土壤培养1,300个Union个体。在开花后的第一天用不同颜色的丝线给约1,500朵花作标记。开花后第17、22、27、32、37、42、47和52天收集大豆豆荚。
结果示于图2。Northern印迹分析显示开花后17-37天诱导GmDNJ1表达,然后略微降低,如图2a所示。图2b显示开花后豆荚的典型外观。
实施例2
转基因拟南芥
采用真空渗入方案(Bechtold,N.等,Arabidopsis Protocols(拟南芥方案),休玛娜出版公司(Humana Press Inc.),托托瓦(Totowa),新泽西州,(1993)259-266),将含有组成型花椰菜花叶病毒35S启动子控制下的GmDNJ1的重组核酸克隆入二元载体(Brears,T.等,Plant Physiol.(1993)103:1285-1290)中,引入土壤杆菌并转化入拟南芥。用含抗生素的培养基选择转化体后,利用基因特异性引物通过PCR验证转基因成功整合入基因组的个体;进行Northern印迹分析以证实转基因植物品系中的转基因表达。获得了含单插入体的T3纯合品系种子,将其用于后续生理研究。构建了4种拟南芥的GmDNJ1纯合转基因品系。选择GmDNJ1表达水平较高的A-3-4和M-3-1用于功能分析。图3显示了4种转化体与表达水平均检测不到的未转化对照(Co1-0)和含空载体(V7)的转化体相比的相对表达水平。
实施例3
转基因拟南芥的应激耐受
本实施例研究了渗透性和盐度应激对拟南芥的植物性生长的影响。
将野生型Co1-0、一种ASN1转基因品系(利用与GmDNJ1构建物相同的载体表达ASN1克隆的转基因拟南芥(Lam等,Plant Physiol(2003)132:926-935))和两种GmDNJ1转基因品系(A-3-4和M-3-1)在MS琼脂平板上培养14天,然后转移至砂基培养。在维持于约22℃的生长室中,以16小时白天(强度约130μE)-8小时黑夜为周期,将植物砂基培养12天并用1/8MS培养基灌溉,然后加入15%PEG或500mM NaCl(1/8MS培养基配制)培养6天。
用15%PEG(渗透应激)处理显著减缓了Co1-0和ASN1转基因品系生长,而GmDNJ1转基因品系生长得更好(图4a和5)。
在与上述相同的实验中,用15%PEG(渗透应激)处理显著降低了Co1-0和ASN1转基因品系的鲜重,而GmDNJ1转基因品系生长得更好(图4b和5)。
实施例4
转基因稻(Oryza sativa)
将GmDNJ1克隆到双T-DNA质粒pSB130(从香港中文大学的QiaoquanLiu博士和Samuel Sun教授处获得)中。该质粒具有两个T-DNA,一个含有潮霉素抗性基因(可选择标记),另一个具有用于靶基因克隆的多克隆位点。通过土壤杆菌介导的转化方法将该构建物引入亲代水稻品系日本裸稻(Nipponbare)中。构建了水稻的GmDNJ1纯合转基因品系。图6显示了5种独立的转基因水稻品系中GmDNJ1的表达水平,而在亲代日本裸稻中,检测不到表达。
实施例5
转基因稻的应激耐受
本实施例研究了渗透和盐度应激对水稻(稻)的植物性生长的影响。
避光萌发10天后,在维持于约28℃的生长室中,以16小时白天(强度约120μE)-8小时黑夜为周期,将各含野生型亲代、AS2转基因品系(利用与GmDNJ1构建物相同的载体表达AS2克隆的转基因稻)和5种独立GmDNJ1转基因水稻品系的一式三份的小组在1/2MS液体培养基中再培养9天。用补加了200mMNaCl的1/2MS液体培养基处理第一组2天,然后用1/2MS液体培养基灌溉2天。通过除去液体生长培养基,维持16小时将脱水应激引入另一组,然后补充1/2MS液体培养基,维持3天。在整个测试期间用1/2MS液体培养基灌溉对照组。
除去液体生长培养基(脱水应激)首先导致野生型和转基因水稻的叶片均卷起。补充1/2MS液体培养基可拯救GmDNJ1转基因品系,但无法拯救未转化的亲代和AS2转基因品系(图8a)。在这种处理下GmDNJ1转基因品系的恢复率明显高于未转化的亲代和AS2转基因品系(图9a)。在这种处理下,GmDNJ1转基因品系的所得鲜重也明显高于未转化的亲代和AS2转基因品系(图10a)。
200mM NaCl处理(盐度应激)导致野生型和转基因水稻的叶片均下垂并出现盐害症状。用1/2MS液体培养基恢复可拯救GmDNJ1转基因品系,但不能拯救未转化的亲代和AS2转基因品系(图8b)。在这种处理下GmDNJ1转基因品系的恢复率明显高于未转化的亲代和AS2转基因品系(图9b)。在这种处理下,GmDNJ1转基因品系的所得鲜重也明显高于未转化的亲代和AS2转基因品系(图10b)。
还在高盐含量的试验田中培养GmDNJ1转基因品系和未转化的植物。转基因品系中的一些个别植物(分离群体)存活,而未转化的植物均枯萎和死亡(图7)。
实施例6
GmDNJ1蛋白的辅助陪伴分子活性
通过监测热变性萤光素酶的活性进行辅助陪伴分子活性试验(Zmijewski等,J.Mol.Biol.(2004)336:539-549)。
将GmDNJ1 cDNA序列克隆入表达载体pGEX-4T-1(GE保健公司(GEHealthcare))以形成嵌合构建物,从而在大肠杆菌细胞(所用的细菌菌株:BL23(DE3))中产生谷胱甘肽S-转移酶(GST)-GmDNJ1融合蛋白。
25℃,在有DnaK、DnaJ、GrpE、GST-GmDNJ1融合蛋白、GST和牛血清白蛋白(BSA)的不同组合存在下,温育萤火虫萤光素酶(普洛麦格公司(Promega))10分钟。42℃使萤光素酶变性10分钟,通过加入5mM ATP再于25℃温育30分钟使之复性。利用普洛麦格公司的萤光素酶测定系统检测萤光素酶活性。将DnaK、DnaJ和GrpE(大肠杆菌同源性陪伴分子系统)存在下的萤光素酶活性设定为100%用于参比。
GST-GmDNJ1融合蛋白具有类似大肠杆菌DnaJ蛋白活性的明显辅助陪伴分子活性。另一方面,GST或BSA未显示相同类型的活性(图11b)。
序列表
<110>林汉明(LAM,Hon-Ming)
辛世文(SUN,Samuel Sai Ming)
邵桂花(SHAO,Gui Hua)
<120>含J-结构域蛋白质赋予的非生物应激耐受
<130>07C50755
<150>US 60/843,943
<151>2006-09-11
<160>2
<170>PatentIn Version 4.0
<210>1
<211>1254
<212>DNA
<213>大豆(Glycine max)
<220>
<223>GmDNJ1
<400>1
atgtttggga gggcaccgaa gaagagcgat aatacgaggt actacgaaat cctcggcgtc 60
tccaagaacg cttcgcagga tgatctgaag aaggcttaca agaaagccgc cattaagaat 120
caccccgaca agggcggtga tcccgagaag tttaaagagc tggcgcaagc ttatgaggtt 180
ctgagtgacc ctgagaagcg tgagatatat gatcagtatg gtgaagatgc gcttaaggaa 240
ggaatgggtg gtggcggtgg ccatgatcca tttgatatct tttcatcttt ctttggcggt 300
gggagtccct ttggatcagg tggaagtagt cgaggtagga ggcagaggcg cggagaagac 360
gtggttcacc ctctcaaggt ctctttggag gacctttatc ttggaacttc caagaagctc 420
tccctctcca gaaatgttat atgctccaag tgcagtggca agggttctaa gtctggtgct 480
tcgatgaagt gtgctggttg tcaaggaact ggtatgaagg tttctataag acatcttggc 540
ccatccatga ttcagcaaat gcagcatgcc tgcaatgaat gtaagggtac tggagaaact 600
atcaatgaca gagatcgctg cccacagtgc aagggagaga aggttgtgca ggagaagaaa 660
gtccttgaag ttattgtaga aaaggggatg cagaatgggc agaagataac attccctggc 720
gaagctgatg aagcgccgga cacaattact ggggatatcg tctttgtcct tcagcagaag 780
gaacatccca aattcaaaag aaaggctgaa gatctttttg tagagcacac tttgtccctt 840
accgaggcct tgtgtggctt ccaatttgtg ctgactcact tggatagccg tcagcttctt 900
attaaatcaa atcccgggga agttgtgaag cctgattcat acaaggctat aaatgatgag 960
ggaatgccca tgtatcagag gccatttatg aaggggaaac tttacattca cttcactgtg 1020
gagtttccag attctctaaa ccctgatcaa gttaaggcct tggaggctgt tctgccacca 1080
aagccttctt cacaattgac agacatggag ctggatgaat gtgaggaaac tacactccat 1140
gatgtcaaca tggaggagga gactaggagg aagcagcaac aagctcagga ggcatatgat 1200
gaggatgatg acatgcctgg tggtgcacag agggtacagt gcgcccagca gtaa 1254
<210>2
<211>417
<212>PRT
<213>大豆(Glycine max)
<220>
<223>GmDNJ1
<400>2
Met Phe Gly Arg Ala Pro Lys Lys Ser Asp Asn Thr Arg Tyr Tyr Glu
1 5 10 15
Ile Leu Gly Val Ser Lys Asn Ala Ser Gln Asp Asp Leu Lys Lys Ala
20 25 30
Tyr Lys Lys Ala Ala Ile Lys Asn His Pro Asp Lys Gly Gly Asp Pro
35 40 45
Glu Lys Phe Lys Glu Leu Ala Gln Ala Tyr Glu Val Leu Ser Asp Pro
50 55 60
Glu Lys Arg Glu Ile Tyr Asp Gln Tyr Gly Glu Asp Ala Leu Lys Glu
65 70 75 80
Gly Met Gly Gly Gly Gly Gly His Asp Pro Phe Asp Ile Phe Ser Ser
85 90 95
Phe Phe Gly Gly Gly Ser Pro Phe Gly Ser Gly Gly Ser Ser Arg Gly
100 105 110
Arg Arg Gln Arg Arg Gly Glu Asp Val Val His Pro Leu Lys Val Ser
115 120 125
Leu Glu Asp Leu Tyr Leu Gly Thr Ser Lys Lys Leu Ser Leu Ser Arg
130 135 140
Asn Val Ile Cys Ser Lys Cys Ser Gly Lys Gly Ser Lys Ser Gly Ala
145 150 155 160
Ser Met Lys Cys Ala Gly Cys Gln Gly Thr Gly Met Lys Val Ser Ile
165 170 175
Arg His Leu Gly Pro Ser Met Ile Gln Gln Met Gln His Ala Cys Asn
180 185 190
Glu Cys Lys Gly Thr Gly Glu Thr Ile Asn Asp Arg Asp Arg Cys Pro
195 200 205
Gln Cys Lys Gly Glu Lys Val Val Gln Glu Lys Lys Val Leu Glu Val
210 215 220
Ile Val Glu Lys Gly Met Gln Asn Gly Gln Lys Ile Thr Phe Pro Gly
225 230 235 240
Glu Ala Asp Glu Ala Pro Asp Thr Ile Thr Gly Asp Ile Val Phe Val
245 250 255
Leu Gln Gln Lys Glu His Pro Lys Phe Lys Arg Lys Ala Glu Asp Leu
260 265 270
Phe Val Glu His Thr Leu Ser Leu Thr Glu Ala Leu Cys Gly Phe Gln
275 280 285
Phe Val Leu Thr His Leu Asp Ser Arg Gln Leu Leu Ile Lys Ser Asn
290 295 300
Pro Gly Glu Val Val Lys Pro Asp Ser Tyr Lys Ala Ile Asn Asp Glu
305 310 315 320
Gly Met Pro Met Tyr Gln Arg Pro Phe Met Lys Gly Lys Leu Tyr Ile
325 330 335
His Phe Thr Val Glu Phe Pro Asp Ser Leu Asn Pro Asp Gln Val Lys
340 345 350
Ala Leu Glu Ala Val Leu Pro Pro Lys Pro Ser Ser Gln Leu Thr Asp
355 360 365
Met Glu Leu Asp Glu Cys Glu Glu Thr Thr Leu His Asp Val Asn Met
370 375 380
Glu Glu Glu Thr Arg Arg Lys Gln Gln Gln Ala Gln Glu Ala Tyr Asp
385 390 395 400
Glu Asp Asp Asp Met Pro Gly Gly Ala Gln Arg Val Gln Cys Ala Gln
405 410 415
Gln
Claims (24)
1.一种重组核酸构建物,其包含编码含有DnaJ-型J-结构域的蛋白质的核苷酸序列或与其基本相同的核苷酸序列。
2.如权利要求1所述的重组核酸构建物,其特征在于,所述蛋白质还包含DnaJ-型富甘氨酸/苯丙氨酸结构域。
3.如权利要求2所述的重组核酸构建物,其特征在于,所述蛋白质还包含(CXXCXGXG)4DnaJ-型J-结构域。
4.如权利要求3所述的重组核酸构建物,其特征在于,所述蛋白质是GmDNJ1。
5.如权利要求1-4中任一项所述的重组核酸构建物,其特征在于,所述编码核苷酸序列操作性连接于在植物或植物细胞中可操作的控制序列,所述控制序列是所述编码核苷酸序列的异源序列。
6.如权利要求5所述的重组核酸构建物,其特征在于,所述控制序列在所述植物或植物细胞中实现编码核苷酸序列的高水平表达。
7.如权利要求5或6所述的重组核酸构建物,其特征在于,所述控制序列连接于将所述控制序列插入所述植物或植物细胞的序列。
8.一种保护植物或植物细胞免遭非生物应激的方法,该方法通过修饰所述植物或植物细胞以产生含DnaJ-型J-结构域的异源蛋白,其中该方法包括用编码所述蛋白质的核苷酸序列或与其基本相同的核苷酸序列或权利要求1-7中任一项所述的重组核酸构建物转化所述植物或植物细胞。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述异源蛋白还包含DnaJ-型富甘氨酸/苯丙氨酸结构域。
10.如权利要求9所述的方法,其特征在于,所述异源蛋白还包含(CXXCXGXG)4DnaJ-型J-结构域。
11.如权利要求10所述的方法,其特征在于,所述异源蛋白是GmDNJ1。
12.如权利要求8-11中任一项所述的方法,其特征在于,所述核苷酸序列操作性连接于在所述植物或植物细胞中实现所述编码核苷酸序列高水平表达的控制序列,其中所述编码核苷酸序列是所述控制序列的异源序列。
13.如权利要求8-12中任一项所述的方法,其特征在于,所述非生物应激是选自盐度或脱水增加的一种或多种情形。
14.一种转基因植物或植物细胞,其含有权利要求1-7中任一项所述的重组核酸构建物。
15.一种选择成功转化的植物细胞或植物的方法,包括将非生物应激施加于用重组载体转化的植物细胞或植物,所述重组载体包含编码含DnaJ-型J-结构域的蛋白作为可选择标记的核苷酸序列,从而选择耐受所述非生物应激的细胞或植物。
16.如权利要求15所述的方法,其特征在于,所述含DnaJ-型J-结构域的蛋白还包含DnaJ-型富甘氨酸/苯丙氨酸结构域。
17.如权利要求16所述的方法,其特征在于,所述含DnaJ-型J-结构域的蛋白还包含(CXXCXGXG)4DnaJ-型J-结构域。
18.如权利要求15所述的方法,其特征在于,所述含DnaJ-型J-结构域的蛋白是GmDNJ1。
19.如权利要求15-18中任一项所述的方法,其特征在于,所述非生物应激选自盐度或脱水增加。
20.一种产生耐受非生物应激的植物或植物细胞的方法,该方法通过修饰植物或植物细胞以表达含DnaJ-型J-结构域的蛋白,其中该方法包括用编码所述蛋白质的核苷酸序列或与其基本相同的核苷酸序列或权利要求1-7中任一项所述的重组核苷酸构建物转化所述植物或植物细胞。
21.如权利要求20所述的方法,其特征在于,所述蛋白质还包含DnaJ-型富甘氨酸/苯丙氨酸结构域。
22.如权利要求21所述的方法,其特征在于,所述蛋白质还包含(CXXCXGXG)4DnaJ-型J-结构域。
23.如权利要求20所述的方法,其特征在于,所述蛋白质是GmDNJ1。
24.如权利要求19-23中任一项所述的方法,其特征在于,所述非生物应激选自盐度和脱水增加。
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