O projeto Vis_Zoo propõe visualizações de bases de dados de coleções de biodiversidade, originalmente desenhadas para bases do PPGZoo-Museu Nacional-UFRJ. Neste repositório encontram-se os códigos referentes às versões atualizadas das visualizações propostas inicialmente na Fase 1 do projeto e incorporadas em um aplicativo web. As tecnologias utilizadas para o desenvolvimento são, principalmente: Altair, Pandas, Python e Streamlit.

• Coordenação:

  • Asla Medeiros e Sá, FGV EMAp;

• Desenvolvimento:

  • 2023: Este repositório: Atualizações das visualizações desenvolvidas como trabalho de Iniciação Científica da FGV EMAp por Carlos Cesar O. Fonseca;
  • 2022: Aplicativo web desenvolvido por Pierre Haslee, por ocasião de visita de pesquisa à Universidade de Brighton, UK;
  • 2021: VisZoo - Fase 1: trabalho de Mestrado da FGV EMAp do aluno Franklin Alves de Oliveira, documentado na dissertação Visualização de coleções científicas digitais de biodiversidade: um framework em Altair, Python, defendida em março de 2021, orientado por Asla Medeiros e Sá. Um exemplo de gráfico proposto pode ser acessado aqui.

• Colaboradores:

  • Karina Rodriguez Echavarria, University of Brighton, UK;
  • Bruno Schneider.

• Curadores e técnicos de coleções zoológicas do PPGZoo - Museu Nacional - UFRJ.

  • Cristiana Silveira Serejo - Carcinologia;
  • Paulo Passos, Manoela Woitovicz Cardoso e Pedro Pinna - Herpetologia;
  • Joana Zanol e Camila Messias - Polychaeta.

• 2022 - Camila Simões M. A. Messias, Franklin Alves de Oliveira, Monique Cristina dos Santos, Asla Medeiros e Sá and Joana Zanol - New perspectives of Polychaeta collection database from National Museum/UFRJ using information visualization techniques to analyze and manage biological collection presented in SILPOLY 2022, Puerto Varas, Chile, on 22-25 November 2022.

• 2022 - Asla Medeiros e Sá, Franklin Alves de Oliveira and Bruno Schneider, Karina Rodriguez Echavarria, Cristiana Silveira Serejo: Visually Overviewing Biodiversity Open Data Digital Collections, ODAK 2022: Symposium on Open Data and Knowledge for a Post-Pandemic Era, Brighton, UK.

• 2021 - Asla Medeiros e Sá, Franklin Alves de Oliveira e Cristiana Silveira Serejo: Visualização de Informação como Ferramenta de Apoio à Curadoria de Dados em Coleções Biológicas, Revista Museologia & Interdiciplinariedade, v10, n. especial 2021.

Neste Repositório se encontra o código com o Server "VizZoo"

Para criar um ambiente que suporte o server:

• Ter instalado python na máquina
• Instalar as bibliotecas necessárias (a lista delas se encontra em requeriments.txt)

Para a execução:

• Abra o prompt do ambiente python que já suporta o server
• Caminhe até o a pasta com o arquivo
• Execute streamlit run streamlit_app.py