Skip to content

MicAff is a genomic data analysis tool. Application made with Shiny. It is used to analyze the data from the microarray experiment. Running on a local server, it allows you to load CEL data, their initial processing and further analysis.

License

Notifications You must be signed in to change notification settings

KamilSuchanek95/micaff

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

41 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

Narzędzie do analizy danych genomicznych - MicAff.

Aplikacja stworzona przy pomocy Shiny-R. Służy do przykładowej analizy danych, pochodzących z eksperymentu mikromacierzowego.

Narzędzie umożliwia:

  • Odczytanie plików .CEL
  • Przetwarzanie wstępne (podsumowanie sond i normalizację)
  • Kontrolę jakości
  • Wizualizację danych
  • Obliczenie statystyk z ewentualną korektą wartości p
  • Typowanie istotnych genów zgodnie z zadanymi kryteriami
  • Przedstawienie ewentualnych wzorców
  • Pobranie danych po normalizacji oraz wykonanych statystyk

Przykładowy przebieg pracy aplikacji:

youtube.com

example

About

MicAff is a genomic data analysis tool. Application made with Shiny. It is used to analyze the data from the microarray experiment. Running on a local server, it allows you to load CEL data, their initial processing and further analysis.

Topics

Resources

License

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published