Workshop CDSB 2023: Creando paquetes de R/Bioconductor para análisis transcriptómicos de célula única.
Bienvenidos al Workshop Creando paquetes de R/Bioconductor para análisis transcriptómicos de célula única!
Estamos encantadxs de anunciar que la CDSB, junto con la Red Mexicana de Bioinformática (RMB) y el Nodo Nacional de Bioinformática en la UNAM (NNB-CCG), está organizando el taller Creando paquetes de R/Bioconductor para análisis transcriptómicos de célula única como parte del Encuentro Nacional de Bioinformática México 2023.
Todas las sesiones serán teóricas y prácticas. Nos enfocaremos en dos temas principales:
- Flujo de análisis de datos transcriptómicos de célula única
- Creación de paquetes de R/Bioconductor
- Dra. Joselyn Cristina Chávez Fuentes
- Dra. Laura Gómez Romero
- Dra. Yalbi Balderas Martínez
- Dra. Evelia Lorena Coss Navarrete
- M.C. José Antonio Ovando Ricárdez
- M.C. Erick Cuevas Fernández
- Dra. Alejandra Medina Rivera
- Dra. Mirna Vázquez Rosas Landa
- Andrés Arredondo Cruz
- Dr. Leonardo Collado-Torres
- Dra. Evelia Lorena Coss Navarrete
- Andrés Arredondo Cruz
- M.C. Diego Ramírez
- M.C. Luis Alberto Meza
Consulta el calendario de este curso en: https://bit.ly/calendarcdsb2023
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Día 1: Flujo de análisis de datos transcriptómicos de célula única Parte I
- Presentación de la CDSB.
- Estructura e importe de datos.
- Control de calidad.
- Normalización.
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Día 2: Flujo de análisis de datos transcriptómicos de célula única Parte II
- Selección de genes altamente variables.
- Reducción de dimensiones.
- Clustering.
- Genes marcadores.
- Anotación de tipos celulares.
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Día 3: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte I
- Nuevas funcionalidades de RStudio, Quarto.
- Control de versiones con GitHub y RStudio.
- Solución de problemas con las versiones de paquetes de Rstudio.
- Infraestructura de un paquete de R/Bioconductor.
- Plática: Convirtiendo tu flujo de análisis en un paquete de R/Bioconductor.
- Documentación de funciones.
- Sesión social: Conociendo a la comunidad.
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Día 4: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte II
- Diseño de pruebas.
- Creación de viñetas.
- Compilación e instalación de paquetes.
- Proyectos colaborativos Parte I.
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Día 5: Proyectos colaborativos
- Proyectos colaborativos Parte II.
- Presentación de proyectos.
- Clausura.
Agradecemos el apoyo de: