Lista de links de repositórios distribuídos ao longo do git do ACMElab e tutoriais para ajudar a entender os principais programas.
#1 BaseSpace CLI Tutorial
#2 CustomNextcladeLite tutorial
#3 Heatmap tutorial
#4 Entrando no cluster Carlos Chagas
#5 Opentrons passo a passo
#6 Automação RVOP/RPIP/VSP
#7 Automação relatório CovidSeq
#8 Executar Viralflow 1.0.0 Cluster Carlos Chagas
#10 Tipos de Arquivo da Bioinformática
#11 Tutorial de depósito no GISAID
#12 Links de definição de novas variantes pelo PANGO
Desenho de primers e sondas para HPV usando múltiplos programas #HPVPrimersSondas. [@allyssonallan]
Dummy dataset para a análise simplificada pelo software Nextclade #nextclade_customization. [@pdrmglc]
Produção de códigos do Redcap para planilha excel #VigSind Code XLSX. [@allyssonallan][@AlysonS4ntos]
Heatmap para visualizar mutações para diferentes linhagens de SARS-CoV-2 #heatmap. [@cleberaksenen]
Testes do viral-flow para artigos #Viral-flow testes. [@cleberaksenen][@pdrmglc]
Scripts do opentrons #Scripts do robô. [@cleberaksenen][@suzana-porto]
Futuro programa com banco de dados para produzir códigos para pacientes e amostras automaticamente a partir de dados do Redcap #Produção de códigos para planilha. [@AlysonS4ntos]
IC da Débora 🤓 #IC da Débora. [@DeboraLab]
Mestrado Cleber 🥸 #Mestrado do Cleber.[@cleberaksenen]
ACME site #ACME site. [@cleberaksenen][@AlysonS4ntos]
Analises com python e R #PyRAnalytics. [@cleberaksenen]
Central de acesso e automação de protocolos de sequenciamento (RPIP e RVOP) #SeqHub. [@cleberaksenen][@pdrmglc]
Manipulador e transformador de sequências FASTA de maneira hábil e automática #FASTACraft. [@cleberaksenen]
Scripts genéricos #Scripts genericos. [@marconso]
Dashboard de vigilância e geração de relatórios #Dashboards vigilância. [@marconso]
Filogenias: checa sinapomorfias e constroi clados #Filogenias. [@pdrmglc]
Rosalind bionformatics training #Rosalind scripts. [@clebersaksenen]
Automatização para raspagem de dados do GAL #GAL scrapper. [@cleberaksenen][@suzana-porto]
App para organizar os dados do laboratório #ACME app. [@suzana-porto][@marconso]
Script para automatizar o envio de sequencias pro GISAID #GISAID. [@cleberaksenen]
Raspador de PDF #PDFscrapper. [@suzana-porto]
Raspador do Vacine já #Vacine scrapper. [@suzana-porto][@cleberaksenen]
Painel Acme: utilitários para o ACME lab #PainelAcme. [suzana-porto]
Algoritmos de análise de dados e construção de gráficos no R [#R] (https://github.com/ACMElab-Fioce/Rscripts.git). [@cleberaksenen]
Tipos de Arquivos na Bioinformática [#BionfoFiles] (#10). [@rayratargdy]