سامانه جستجوی بانک ژنی دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز
 | |
|---|---|
| محتوا | |
| توضیح | مرورگر اینترنتی بانک ژنی، دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز |
| تماس | |
| مرکز پژوهش | دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز |
| آزمایشگاه | مرکز علوم سلولی-مولکولی و مهندسی، دانشکدهٔ مهندسی بَـسکین |
| استناد ابتدایی | لی و همکاران. (2020)[۱] |
| دسترسی | |
| وبگاه | genome |
سامانه جستجوی بانک ژنی دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز (انگلیسی: UCSC Genome Browser) یک مرورگر اینترنتی بَرخط و قابل بارگیری برای بانک ژنی انسان (ژنوم) است که توسط دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز (UCSC) میزبانی می‌شود.[۲][۳][۴] این وبگاه برهم‌کنشی، اجازه دسترسی به توالی‌های ژنی مربوط به گونه‌های مختلفی از مهره‌داران، بی مهرگان و مدل‌اُرگانیسم‌ها را فراهم می‌آورد و گزارمان مرتبط به آنان را هم ارائه می‌نماید.
این سامانه در سال ۲۰۰۰ میلادی توسط دانشجویی به نام جیم کنت (استاد کنونی علوم کامپیوتر در دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز) پایه‌گذاری و راه‌اندازی شد و بودجه آن توسط مؤسسه پزشکی هاورد هیوز و مؤسسه ملی تحقیقات ژنوم انسان (زیر مجموعه‌ای از مؤسسه ملی سلامت) تأمین می‌شود.
ژنوم
[ویرایش]
از زمان راه‌اندازی تا کنون، این سامانه، توالی‌های ژنی تمامی مهره‌داران و برخی از بی‌مهرگان را (۴۶ گونه تا کنون) با جزئیات کافی ارائه می‌کند.[۵] جانورانی که ژنوم آنها به‌طور کامل در این سامانه ارائه می‌شود عبارتند از:
جستارهای وابسته
[ویرایش]منابع
[ویرایش]- ↑ Lee, CM; Barber, GP; Casper, J; Clawson, H; Diekhans, M; Gonzalez, JN; Hinrichs, A; Lee, BT; Nassar, LR; Powell, CC; Raney, BJ; Rosenbloom, KR; Schmelter, D; Speir, ML; Zweig, AS; Haussler, D; Haeussler, M; Kuhn, RM; Kent, WJ (8 January 2020). "UCSC Genome Browser enters 20th year". Nucleic Acids Research. 48 (D1): D756–D761. doi:10.1093/nar/gkz1012. PMC 7145642. PMID 31691824.
- ↑ Fujita PA, Rhead B, Zweig AS, Hinrichs AS, Karolchik D, Cline MS, Goldman M, Barber GP, Clawson H, Coelho A, Diekhans M, Dreszer TR, Giardine BM, Harte RA, Hillman-Jackson J, Hsu F, Kirkup V, Kuhn RM, Learned K, Li CH, Meyer LR, Pohl A, Raney BJ, Rosenbloom KR, Smith KE, Haussler D, Kent WJ (Jan 2011). "The UCSC Genome Browser database: update 2011". Nucleic Acids Res. 39 (Database issue): D876-82. doi:10.1093/nar/gkq963. PMC 3242726. PMID 20959295.
- ↑ Kent WJ, Sugnet CW, Furey TS, Roskin KM, Pringle TH, Zahler AM, Haussler D (June 2002). "The human genome browser at UCSC". Genome Res. 12 (6): 996–1006. doi:10.1101/gr.229102. PMC 186604. PMID 12045153.
- ↑ Kuhn, R. M.; Karolchik, D.; Zweig, A. S.; Wang, T.; Smith, K. E.; Rosenbloom, K. R.; Rhead, B.; Raney, B. J.; Pohl, A.; Pheasant, M.; Meyer, L. (2009-01-01). "The UCSC Genome Browser Database: update 2009". Nucleic Acids Research (به انگلیسی). 37 (Database): D755–D761. doi:10.1093/nar/gkn875. ISSN 0305-1048. PMC 2686463. PMID 18996895.
- ↑ "High-coverage" here means 6x coverage, or six times more total sequence than the size of the genome.
- مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «UCSC Genome Browser». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۱ نوامبر ۲۰۲۰.