Die Fortuna liga 2019/20 war die 27. Spielzeit der höchsten slowakischen Spielklasse im Fußball der Männer. Die Saison begann am 20. Juli 2019 und endete am 11. Juli 2020.[1]
In der ersten Saisonrunde spielten die 12 Vereine um die Platzierungen, deren Ergebnis in der zweiten Saisonhälfte die Grundlage für eine Verteilung der Mannschaften auf zwei Gruppen zu je sechs Teams darstellte. Die sechs bestplatzierten Vereine erreichten die Meisterschaftsrunde, die Teams auf den Plätzen sieben bis zwölf spielten gegen den Abstieg. In den einzelnen Gruppen wurde die jeweils erreichte Punktzahl aus den 22 Spielen der Vorrunde übertragen. Wegen der COVID-19-Pandemie wurde entschieden, dass nur die Hinspiele der zweiten Runde ausgetragen werden und dass kein Verein direkt absteigt, wobei das letzte Team in der Relegation spielen soll.