CPSF4

CPSF4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D9N, 2RHK
Ідентифікатори
Символи	CPSF4, CPSF30, NAR, NEB1, NEB-1, cleavage and polyadenylation specific factor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603052 MGI: 1861602 HomoloGene: 38216 GeneCards: CPSF4
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • endoribonuclease activity • RNA binding Клітинна компонента • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • mRNA processing • modification by virus of host mRNA processing • GO:0022415 viral process • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA polyadenylation • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10898	54188
Ensembl	ENSG00000160917	ENSMUSG00000029625
UniProt	O95639	Q8BQZ5
RefSeq (мРНК)	NM_001081559 NM_006693 NM_001318160 NM_001318161 NM_001318162	NM_001291248 NM_001291249 NM_178576 NM_001374716
RefSeq (білок)	NP_001075028 NP_001305089 NP_001305090 NP_001305091 NP_006684	NP_001278177 NP_001278178 NP_848671 NP_001361645
Локус (UCSC)	Хр. 7: 99.44 – 99.46 Mb	Хр. 5: 145.1 – 145.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CPSF4 (англ. Cleavage and polyadenylation specific factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 269 амінокислот, а молекулярна маса — 30 255.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQEIIASVDH		IKFDLEIAVE		QQLGAQPLPF		PGMDKSGAAV		CEFFLKAACG
KGGMCPFRHI		SGEKTVVCKH		WLRGLCKKGD		QCEFLHEYDM		TKMPECYFYS
KFGECSNKEC		PFLHIDPESK		IKDCPWYDRG		FCKHGPLCRH		RHTRRVICVN
YLVGFCPEGP		SCKFMHPRFE		LPMGTTEQPP		LPQQTQPPAK		QSNNPPLQRS
SSLIQLTSQN		SSPNQQRTPQ		VIGVMQSQNS		SAGNRGPRPL		EQVTCYKCGE
KGHYANRCTK		GHLAFLSGQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Barabino S.M.L., Huebner W., Jenny A., Minvielle-Sebastia L., Keller W. (1997). The 30-kD subunit of mammalian cleavage and polyadenylation specificity factor and its yeast homolog are RNA-binding zinc finger proteins. Genes Dev. 11: 1703—1716. PMID 9224719 DOI:10.1101/gad.11.13.1703
• Nemeroff M.E., Barabino S.M.L., Li Y., Keller W., Krug R.M. (1998). Influenza virus NS1 protein interacts with the cellular 30 kDa subunit of CPSF and inhibits 3'end formation of cellular pre-mRNAs. Mol. Cell. 1: 991—1000. PMID 9651582 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80099-4
• Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
• Laishram R.S., Anderson R.A. (2010). The poly A polymerase Star-PAP controls 3'-end cleavage by promoting CPSF interaction and specificity toward the pre-mRNA. EMBO J. 29: 4132—4145. PMID 21102410 DOI:10.1038/emboj.2010.287

Див. також

• Хромосома 7