WO2017039001A1 - γ-グルタミルバリルグリシンの製造法 - Google Patents

γ-グルタミルバリルグリシンの製造法 Download PDF

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WO2017039001A1
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synthase
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glu
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綾子 笹原
崇敬 伊藤
博之 野崎
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味の素株式会社
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P21/00Preparation of peptides or proteins
    • C12P21/02Preparation of peptides or proteins having a known sequence of two or more amino acids, e.g. glutathione
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K5/00Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K5/04Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing only normal peptide links
    • C07K5/08Tripeptides
    • C07K5/0802Tripeptides with the first amino acid being neutral
    • C07K5/0804Tripeptides with the first amino acid being neutral and aliphatic
    • C07K5/0806Tripeptides with the first amino acid being neutral and aliphatic the side chain containing 0 or 1 carbon atoms, i.e. Gly, Ala
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
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    • C12R2001/01Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
    • C12R2001/185Escherichia
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    • C12YENZYMES
    • C12Y603/00Ligases forming carbon-nitrogen bonds (6.3)
    • C12Y603/02Acid—amino-acid ligases (peptide synthases)(6.3.2)
    • C12Y603/02002Glutamate-cysteine ligase (6.3.2.2)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y603/00Ligases forming carbon-nitrogen bonds (6.3)
    • C12Y603/02Acid—amino-acid ligases (peptide synthases)(6.3.2)
    • C12Y603/02003Glutathione synthase (6.3.2.3)

Definitions

  • the present invention relates to a microorganism useful as an expression host for ⁇ -glutamylvaline synthase ( ⁇ -Glu-Val synthase), and production of ⁇ -glutamylvalylglycine using ⁇ -glutamylvaline synthase expressed in the same microorganism Regarding the law.
  • ⁇ -Glutamylvalylglycine is useful in fields such as foods and pharmaceuticals.
  • Certain peptides such as ⁇ -glutamyl-L-valyl-glycine (hereinafter also referred to as “ ⁇ -Glu-Val-Gly”), have a calcium receptor activating effect.
  • Patent Document 1 a peptide having a calcium receptor activating effect can impart a rich taste to foods and drinks (Patent Document 2), and can improve the taste of low-fat foods, particularly fat-like richness and smoothness (Patent Document) 3) and it is known that the body feeling of sweet substances can be improved and the bitterness peculiar to sweet substances can be improved (Patent Document 4).
  • the peptide as described above has a preventive or therapeutic effect for diarrhea (Patent Document 5), diabetes (Patent Document 6), and a gastrointestinal bicarbonate secretion promoting effect (Patent Document 7). Yes.
  • chemical synthesis and enzymatic methods are known as methods for producing ⁇ -glutamyl tripeptide.
  • a chemical synthesis method a method of selectively obtaining ⁇ -glutamyl tripeptide from a dipeptide using N-protected glutamic anhydride is known (Patent Document 8).
  • a method using glutamic acid-cysteine ligase (GSHA) and glutathione synthetase (GSHB) is known (Patent Documents 9 and 10).
  • GSHA glutamic acid-cysteine ligase
  • GSHB glutathione synthetase
  • a method is also known in which Val-Gly is converted to ⁇ -glutamyl using ⁇ -glutamyltransferase to produce ⁇ -Glu-Val-Gly (Patent Document 11).
  • Glutamate-cysteine ligase is known as an enzyme (EC 6.3.2.2) that has the activity of catalyzing the reaction to produce ⁇ -Glu-Cys, ADP, and phosphate using Glu, Cys, and ATP as substrates. .
  • GSHA usually requires divalent metal ions such as Mg 2+ and Mn 2+ for enzymatic reactions.
  • Vmax / Km the ratio of ⁇ -Glu-Val production activity to ⁇ -Glu-Gly production activity when Mg 2+ is used as a cofactor can be calculated as 0.15.
  • Mn 2+ is used as a cofactor
  • Km 1.7 mM
  • Non-patent Document 2 when Glu, various amino acids, and ATP are used as a substrate in the presence of Mg 2+ and ⁇ -Glu-Gly production activity is 100%, ⁇ -Glu-Val production activity is 52 It is reported to be about%.
  • the ratio of the ⁇ -Glu-Val production activity to the ⁇ -Glu-Gly production activity can be calculated as 0.52.
  • the ratio of the ⁇ -Glu-Val production activity to the ⁇ -Glu-Gly production activity of GSHA in Escherichia coli is about 0.15 to 0.5.
  • mutant GSHA having a high ratio of ⁇ -Glu-Val production activity to ⁇ -Glu-Gly production activity was obtained by introducing various mutations into GSHA of Escherichia coli (patent document) 12).
  • GSHA derived from Proteus mirabilis a gram-negative bacterium, produces ⁇ -glutamyldipeptide using Mg 2+ or Mn 2+ as cofactors, Glu, various amino acids, and ATP as substrates. It is known to do (Non-patent Document 3).
  • ⁇ -Glu-Gly production activity is reported to be 14.5% and ⁇ -Glu-Val production activity is 7.2% when ⁇ -Glu-Cys production activity is taken as 100%. ing. That is, if a comparison is made based on these relative activities, the ratio of the ⁇ -Glu-Val production activity to the ⁇ -Glu-Gly production activity can be calculated as 0.50.
  • ⁇ -glutamylcysteine synthetase-glutatione synthetase derived from Streptococcus agalactiae produces ⁇ -glutamyldipeptide using Glu, various amino acids and ATP as a substrate in the presence of Mg 2+ It is known to do.
  • ⁇ -GCS-GS derived from Streptococcus agalactia
  • the ⁇ -Glu-Val production activity is about 21% when the ⁇ -Glu-Gly production activity is 100% (Non-patent Document 2). That is, if a comparison is made based on these relative activities, the ratio of ⁇ -Glu-Val production activity to ⁇ -Glu-Gly production activity can be calculated as 0.21.
  • Non-patent document 4 it is reported that ⁇ -Glu-Glu, ⁇ -Glu-Val, and ⁇ -Glu-Leu were isolated by applying a culture solution of Micrococcus glutamicus to various columns and separating peptides and the like. However, the biosynthetic pathway of these ⁇ -glutamyl dipeptides has not been reported.
  • Non-patent Document 5 ⁇ -glutamyl dipeptide producing activity other than ⁇ -Glu-Cys of Escherichia coli YBDK has not been reported.
  • the present invention relates to a microorganism useful as an expression host for ⁇ -glutamyl valine synthase ( ⁇ -Glu-Val synthase), and ⁇ -Glu-Val-Gly using ⁇ -glutamyl valine synthase expressed in the same microorganism. It is an object of the present invention to provide a manufacturing method for the above.
  • the present invention can be exemplified as follows.
  • a bacterium having a gene that is modified so that the activity of the protein encoded by the ybdK gene is reduced as compared to that of an unmodified strain and that encodes ⁇ -glutamylvaline synthase Bacteria wherein a ratio of ⁇ -glutamyl valine synthase activity to ⁇ -glutamyl glycine synthase activity in the ⁇ -glutamyl valine synthase is 3.0 or more.
  • the bacterium, wherein the activity of the protein is decreased by decreasing the expression of the ybdK gene or by destroying the ybdK gene.
  • the bacterium, wherein the ⁇ -glutamylvaline synthase is the protein described in the following (a), (b), or (c): (A) a protein comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18, 20, or 22; (B) the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18, 20, or 22, comprising an amino acid sequence comprising substitution, deletion, insertion or addition of 1 to 10 amino acid residues, and ⁇ -glutamyl valine synthase An active protein; (C) a protein comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18, 20, or 22 and having ⁇ -glutamylvaline synthase activity.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase has a mutation in an amino acid residue corresponding to one or more amino acid residues selected from the following in wild-type glutamate-cysteine ligase, and has ⁇ -glutamyl valine synthase activity.
  • the bacterium comprising a mutation corresponding to one or more mutations selected from the following: L135 (I, F, M, V, G, A, W, K, H, R, C, N, S, T), Q144 (F, A, N, S, D, T, R, H, G, K, Y, W, C, M, P, V, L, I), Y241 (A), N243 (I, W, K, R, H), Y300 (A, H, R, K).
  • the bacterium comprising a mutation corresponding to any of the following mutations: L135I / Q144R, L135I / Q144D, L135I / Q144A, L135I / Q144L, L135I / N243W, L135I / N243F, L135F / Q144A, L135F / N243W, L135M / Q144R, L135M / Q144A, L135M / Q144L, L135M / N243W, L135M / N243W N243F, L135M / Q144H, L135M / Q144N, L135M / N243Y, L135M / N243R, L135M / N243C, L135V / Q144R, L135V / Q144D, L135V / Q144A, L135V / Q144L, L135V / Q144V, L1
  • the bacterium comprising a mutation corresponding to any of the following mutations: L135 (I, M, V, G, A, K, H, C, N, S, T), Q144 (F, A, S, D, T, R, H, K, Y, W, C, M, P, V, L, I), N243 (R, H), Y300 (R, K), L135I / Q144R, L135I / Q144D, L135I / Q144A, L135I / Q144L, L135I / N243W, L135I / N243F, L135F / Q144A, L135M / Q144R, L135M / Q144A, L135M / Q144L, L135M / N243W, L135M / Q144H, L135M / Q144H Q144N, L135M / N243C, L135V / Q144R, L135
  • the bacterium wherein the wild-type glutamate-cysteine ligase is the protein described in the following (a), (b), or (c): (A) a protein comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24; (B) a protein comprising an amino acid sequence comprising a substitution, deletion, insertion, or addition of 1 to 10 amino acid residues in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24; (C) a protein comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24; [10] Further, the bacterium as described above, wherein the bacterium has been modified so that the activity of the protein encoded by the gshA gene is reduced as compared with the unmodified strain.
  • the bacterium as described above wherein the bacterium has been modified so that the activity of ⁇ -glutamyltransferase is reduced as compared with the unmodified strain.
  • the bacterium as described above which is a bacterium belonging to the genus Escherichia.
  • a method for producing ⁇ -Glu-Val-Gly and / or a salt thereof including the step of producing ⁇ -Glu-Val-Gly by allowing ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase to act on Glu, Val, and Gly, A method wherein the ⁇ -glutamyl valine synthase is obtained using the bacterium as an expression host. [16] The method as described above, wherein the glutathione synthetase is obtained using the bacterium as an expression host. [17] The method described above, wherein the ⁇ -glutamyl valine synthase is a purified enzyme.
  • amino acids are L-forms unless otherwise specified.
  • microorganism of the present invention is a bacterium modified so that the activity of the protein encoded by the ybdK gene (also referred to as “YBDK”) is reduced.
  • the microorganism of the present invention is a bacterium that has been modified so that the activity of YBDK is reduced as compared to an unmodified strain.
  • the microorganism of the present invention can be obtained, for example, by modifying the following bacteria so that the activity of YBDK decreases.
  • bacteria examples include bacteria belonging to the family Enterobacteriaceae, coryneform bacteria, and Bacillus bacteria.
  • NCBI National Center for Biotechnology Information
  • the Escherichia bacterium is not particularly limited, but includes bacteria classified into the genus Escherichia by classification known to microbiologists.
  • Escherichia bacteria include, for example, Neidhardt et al. (Backmann, B. J. 1996. Derivations and Genotypes of some mutant derivatives of Escherichia coli K-12, p. 2460-2488. Table 1.
  • Neidhardt et al. Backmann, B. J. 1996. Derivations and Genotypes of some mutant derivatives of Escherichia coli K-12, p. 2460-2488. Table 1.
  • F. D. Nehard ed.
  • Salmonella Cellular, and Molecular, Biology / Second Edition
  • Escherichia coli examples include, for example, Escherichia coli K-12 strain such as W3110 strain (ATCC 32525) and MG1655 strain (ATCC 47076); Escherichia coli K5 strain (ATCC 23506); And the derivatives thereof (for example, the JM109 strain derived from the K-12 strain).
  • Escherichia coli K-12 strain such as W3110 strain (ATCC 32525) and MG1655 strain (ATCC 47076); Escherichia coli K5 strain (ATCC 23506); And the derivatives thereof (for example, the JM109 strain derived from the K-12 strain).
  • the bacteria belonging to the genus Enterobacter are not particularly limited, but include bacteria classified into the genus Enterobacter by classification known to microbiologists.
  • Enterobacter bacteria include Enterobacter agglomerans and Enterobacter aerogenes.
  • Specific examples of Enterobacter agglomerans include the Enterobacter agglomerans ATCC12287 strain.
  • Specific examples of Enterobacter aerogenes include Enterobacter aerogenes ATCC13048, NBRC12010 (BiotechonolonBioeng.eng2007 Mar 27; 98 (2) 340-348), AJ110637 (FERM BP-10955) .
  • Enterobacter bacteria include those described in European Patent Application Publication No. EP0952221. Some Enterobacter agglomerans are classified as Pantoea agglomerans.
  • Pantoea bacterium is not particularly limited, and examples include bacteria classified into the Pantoea genus by classification known to microbiologists.
  • Examples of the genus Pantoea include Pantoea ⁇ ananatis, Pantoea stewartii, Pantoea agglomerans, and Pantoea citrea.
  • Pantoea Ananatis LMG20103 strain AJ13355 strain (FERM ⁇ BP-6614), AJ13356 strain (FERM BP-6615), AJ13601 strain (FERM BP-7207), SC17 strain (FERM BP) -11091), SC17 (0) strain (VKPM B-9246), and SC17sucA strain (FERM BP-8646).
  • Pantoea bacterium also includes a bacterium reclassified as Pantoea in this way.
  • Examples of the genus Erwinia include Erwinia amylovora and Erwinia carotovora.
  • Examples of Klebsiella bacteria include Klebsiella planticola.
  • coryneform bacteria examples include bacteria belonging to genera such as Corynebacterium genus, Brevibacterium genus, and Microbacterium genus.
  • coryneform bacteria include the following species. Corynebacterium acetoacidophilum Corynebacterium acetoglutamicum Corynebacterium alkanolyticum Corynebacterium callunae Corynebacterium crenatum Corynebacterium glutamicum Corynebacterium lilium Corynebacterium melassecola Corynebacterium thermoaminogenes (Corynebacterium efficiens) Corynebacterium herculis Brevibacterium divaricatum (Corynebacterium glutamicum) Brevibacterium flavum (Corynebacterium glutamicum) Brevibacterium immariophilum Brevibacterium lactofermentum (Corynebacterium glutamicum) Brevibacterium roseum Brevibacterium saccharolyticum Brevibacterium thiogenitalis Corynebacterium ammoniagenes (Corynebacterium stationis) Brevibacterium album Brevibacterium cerinum
  • coryneform bacteria include the following strains. Corynebacterium acetoacidophilum ATCC 13870 Corynebacterium acetoglutamicum ATCC 15806 Corynebacterium alkanolyticum ATCC 21511 Corynebacterium crenatum AS1.542 Corynebacterium callunae ATCC 15991 Corynebacterium glutamicum ATCC 13020, ATCC 13032, ATCC 13060, ATCC 13869, FERM BP-734 Corynebacterium lilium ATCC 15990 Corynebacterium melassecola ATCC 17965 Corynebacterium efficiens (Corynebacterium thermoaminogenes) AJ12340 (FERM BP-1539) Corynebacterium herculis ATCC 13868 Brevibacterium divaricatum (Corynebacterium glutamicum) ATCC 14020 Brevibacterium flavum (Corynebacterium glutamicum) ATCC
  • corynebacteria belonging to the genus Brevibacterium has been classified as a genus of corynebacteria, but bacteria integrated into the genus corynebacteria (Int. J. Syst. Bacteriol., 41, 255 (1991)) are also available. included.
  • Corynebacterium stationis which was previously classified as Corynebacterium ammoniagenes, includes bacteria that have been reclassified as Corynebacterium stationis by 16S rRNA sequencing (Int. J Syst. Evol. Microbiol., 60, 874-879 (2010)).
  • Bacteria belonging to the genus Bacillus are not particularly limited, but include bacteria classified as belonging to the genus Bacillus by classification known to microbiologists.
  • bacteria belonging to the genus Bacillus include Bacillus ⁇ ⁇ subtilis, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus umipumilus, Bacillus licheniformis, and Bacillus megaterium. Bacillus brevis, Bacillus polymixa, and Bacillus stearothermophilus.
  • Specific examples of Bacillus subtilis include Bacillus subtilis 168 Marburg strain (ATCC 6051) and Bacillus subtilis PY79 strain (Plasmid, 1984, 12, 1-9).
  • Bacillus amyloliquefaciens include Bacillus amyloliquefaciens T strain (ATCC 842 23842) and Bacillus amyloliquefaciens N strain (ATCC 23845).
  • strains can be sold, for example, from the American Type Culture Collection (address 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852 P.O. Box 1549, Manassas, VA 20108, United States States of America). That is, a registration number corresponding to each strain is given, and it is possible to receive a sale using this registration number (see https://www.atcc.org/). The registration number corresponding to each strain is described in the catalog of American Type Culture Collection. Moreover, these strains can be obtained from, for example, a depository institution where each strain is deposited.
  • the BL21 (DE3) strain is available, for example, from Life Technologies (product number C6000-03).
  • the BLR (DE3) strain is available, for example, from Merck Millipore (product number 69053).
  • the JM109 strain is available from, for example, Takara Bio Inc. (Product No. 9052).
  • YBDK is a protein having an activity of catalyzing the reaction of generating ⁇ -Glu-Gly, ADP and phosphoric acid using Glu, Gly and ATP as substrates. This activity is also referred to as “ ⁇ -glutamylglycine synthase activity”, “ ⁇ -Glu-Gly production activity”, or “ ⁇ -Glu-Gly synthesis activity”.
  • ⁇ -glutamylvaline synthase activity activity of catalyzing the reaction of producing ⁇ -Glu-Val, ADP and phosphate using Glu, Val and ATP as substrates is referred to as “ ⁇ -glutamylvaline synthase activity”, “ ⁇ - Also referred to as “Glu-Val production activity” or “ ⁇ -Glu-Val synthesis activity”.
  • the activity of catalyzing the reaction of producing ⁇ -Glu-Cys, ADP and phosphate using Glu, Cys and ATP as substrates is also referred to as “ ⁇ -glutamylcysteine synthetase activity”.
  • These enzyme activities can be measured, for example, based on the production of ⁇ -glutamyl dipeptide when the enzyme is allowed to act on a substrate under appropriate conditions. These enzyme activities can be measured, for example, in the presence of a divalent metal ion. Examples of the divalent metal ion include Mg 2+ and Mn 2+ .
  • Conditions for measuring ⁇ -glutamylvaline synthase activity and ⁇ -glutamylglycine synthase activity in the presence of Mn 2+ include the conditions described in Example 3. That is, specific activity measurement conditions are as follows. ⁇ -glutamyl valine synthase activity was determined by adding an appropriate amount of enzyme to the reaction solution (10 mM glutamic acid, 10 mM valine, 10 mM ATP, 10 mM MnS0 4 , 100 mM Tris-HCl (pH 7.0 to 9.0)) at 30 ° C. The reaction can be performed for 30 minutes, and measurement can be performed based on the amount of ⁇ -Glu-Val produced.
  • the enzyme activity that produces 1 ⁇ mol of ⁇ -Glu-Val per minute under these conditions is defined as 1 U of ⁇ -glutamylvaline synthase activity (in the presence of Mn 2+ ).
  • the reaction solution (10 mM glutamate, 10 mM glycine, 10mM ATP, 10mM MnS0 4, 100mM Tris-HCl (pH7.0 ⁇ 9.0)) was added an appropriate amount of enzyme, The reaction can be performed at 30 ° C. for 30 minutes, and the measurement can be made based on the amount of ⁇ -Glu-Gly produced.
  • the enzyme activity that produces 1 ⁇ mol of ⁇ -Glu-Gly per minute under these conditions is defined as 1 U of ⁇ -glutamylglycine synthase activity (in the presence of Mn 2+ ).
  • 1 U of ⁇ -glutamylglycine synthase activity (in the presence of Mg 2+ ) is defined as the enzyme activity that produces 1 ⁇ mol of ⁇ -Glu-Gly per minute under the same conditions as described above using the same reaction solution.
  • Val selectivity The ratio of ⁇ -glutamyl valine synthase activity (specific activity) to ⁇ -glutamyl glycine synthase activity (specific activity) (ie, the ratio of specific activity of ⁇ -glutamyl valine synthase activity / ⁇ -glutamyl glycine synthase activity) Activity) is also referred to as “Val selectivity”. Val selectivity can be calculated by measuring ⁇ -glutamylvaline synthase activity and ⁇ -glutamylglycine synthase activity.
  • YBDK may or may not have an activity to produce ⁇ -glutamylglycine other than ⁇ -glutamylglycine as long as it has ⁇ -glutamylglycine synthase activity. That is, for example, YBDK may or may not have ⁇ -glutamylvaline synthethase activity. For example, YBDK may or may not have ⁇ -glutamylcysteine synthetase activity. YBDK only needs to have ⁇ -glutamylglycine synthase activity under appropriate conditions.
  • YBDK may have, for example, ⁇ -glutamylglycine synthase activity in the presence of Mg 2+ or Mn 2+ , particularly in the presence of Mn 2+ .
  • YBDK may have ⁇ -glutamylglycine synthase activity at, for example, at least one of pH 7.0 to 9.0, particularly pH 7.0.
  • Val selectivity in YBDK is not particularly limited. YBDK may exhibit lower Val selectivity than ⁇ -glutamylvaline synthase described later. In YBDK, Val selectivity may be, for example, less than 3.0. YBDK may exhibit the Val selectivity exemplified above in the presence of Mg 2+ or Mn 2+ , particularly in the presence of Mn 2+ . In addition, YBDK may exhibit Val selectivity exemplified above, for example, at least at pH 7.0 to 9.0, particularly at pH 7.0.
  • YBDK may be a protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16, for example.
  • YBDK may be a protein encoded by a gene having the base sequence shown in SEQ ID NO: 15, for example.
  • the expression “having an (amino acid or base) sequence” includes the case of “including the (amino acid or base) sequence” and the case of “consisting of the (amino acid or base) sequence”.
  • YBDK may be a variant of the YBDK exemplified above (for example, a protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16) as long as the original function is maintained.
  • the ybdK gene may be a variant of the ybdK gene exemplified above (for example, the gene having the base sequence shown in SEQ ID NO: 15) as long as the original function is maintained.
  • Such a variant in which the original function is maintained may be referred to as a “conservative variant”. That is, the term “ybdK gene” includes conservative variants in addition to the ybdK gene exemplified above.
  • YBDK is intended to encompass conservative variants thereof in addition to the YBDK exemplified above.
  • conservative variants include the ybdK gene and YBDK homologs and artificially modified forms exemplified above.
  • the original function is maintained means that the variant of the gene or protein has a function (activity or property) corresponding to the function (activity or property) of the original gene or protein. That is, “the original function is maintained” means that in YBDK, a variant of a protein has ⁇ -glutamylglycine synthase activity. As long as the variant has ⁇ -glutamylglycine synthase activity, the enzymatic properties of the variant, such as substrate specificity, requirement for divalent metal ions, pH dependence, etc. May or may not be identical to the scientific properties. For example, the variant may or may not have an activity to produce ⁇ -glutamyldipeptide other than ⁇ -glutamylglycine.
  • the variant may exhibit the Val selectivity exemplified above.
  • “The original function is maintained” means that in the ybdK gene, the variant of the gene encodes a protein in which the original function is maintained (that is, a protein having ⁇ -glutamylglycine synthase activity). To do.
  • Examples of the ybdK gene or YBDK homolog include genes or proteins obtained from public databases by BLAST search or FASTA search using the above base sequence or amino acid sequence as a query sequence.
  • the homologue of the ybdK gene can be obtained, for example, by PCR using chromosomes of various microorganisms as templates and oligonucleotides prepared based on these known gene sequences as primers.
  • YBDK is a substitution, deletion, or insertion of one or several amino acids at one or several positions in the above amino acid sequence (for example, the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16).
  • it may be a protein having an added amino acid sequence.
  • the above “one or several” varies depending on the position and type of the amino acid residue in the three-dimensional structure of the protein, but specifically, for example, 1 to 50, 1 to 40, 1 to 30, Preferably, it means 1-20, more preferably 1-10, even more preferably 1-5, particularly preferably 1-3.
  • substitution, deletion, insertion, or addition of one or several amino acids described above is a conservative mutation that maintains the protein function normally.
  • a typical conservative mutation is a conservative substitution.
  • Conservative substitution is a polar amino acid between Phe, Trp, and Tyr when the substitution site is an aromatic amino acid, and between Leu, Ile, and Val when the substitution site is a hydrophobic amino acid. In this case, between Gln and Asn, when it is a basic amino acid, between Lys, Arg, and His, when it is an acidic amino acid, between Asp and Glu, when it is an amino acid having a hydroxyl group Is a mutation that substitutes between Ser and Thr.
  • substitutions considered as conservative substitutions include substitution from Ala to Ser or Thr, substitution from Arg to Gln, His or Lys, substitution from Asn to Glu, Gln, Lys, His or Asp, Asp to Asn, Glu or Gln, Cys to Ser or Ala, Gln to Asn, Glu, Lys, His, Asp or Arg, Glu to Gly, Asn, Gln, Lys or Asp Substitution, Gly to Pro substitution, His to Asn, Lys, Gln, Arg or Tyr substitution, Ile to Leu, Met, Val or Phe substitution, Leu to Ile, Met, Val or Phe substitution, Substitution from Lys to Asn, Glu, Gln, His or Arg, substitution from Met to Ile, Leu, Val or Phe, substitution from Phe to Trp, Tyr, Met, Ile or Leu, Ser to Thr or Ala Substitution, substitution from Trp to Phe or Tyr, substitution
  • YBDK is 80% or more, preferably 90% or more, more preferably 95% or more, still more preferably 97% or more, particularly preferably as long as the original function is maintained. It may be a protein having an amino acid sequence having 99% or more homology. In the present specification, “homology” means “identity”.
  • YBDK is a probe that can be prepared from the above base sequence (for example, the base sequence shown in SEQ ID NO: 15), such as a complementary sequence to the whole or a part of the base sequence, and a string. It may be a protein encoded by DNA that hybridizes under a gentle condition. Such a probe can be prepared, for example, by PCR using an oligonucleotide prepared based on the base sequence as a primer and a DNA fragment containing the base sequence as a template. “Stringent conditions” refers to conditions under which so-called specific hybrids are formed and non-specific hybrids are not formed.
  • highly homologous DNAs for example, 80% or more, preferably 90% or more, more preferably 95% or more, further preferably 97% or more, particularly preferably 99% or more.
  • are hybridized and DNAs with lower homology do not hybridize with each other, or normal Southern hybridization washing conditions of 60 ° C., 1 ⁇ SSC, 0.1% SDS, preferably 60 ° C., 0.1 ⁇ SSC And 0.1% SDS, more preferably 68 ° C., 0.1 ⁇ SSC, at a salt concentration and temperature corresponding to 0.1% SDS, conditions of washing once, preferably 2 to 3 times.
  • hybridization washing conditions include 50 ° C., 2 ⁇ SSC, 0.1% SDS.
  • the percentage sequence identity between two sequences can be determined using, for example, a mathematical algorithm.
  • a mathematical algorithm include Myers and Miller (1988) CABIOS 4: 11 17 algorithm, Smith et aldv (1981) Adv. Appl. Math. 2: 482 local homology algorithm, Needleman and Wunsch (1970) J. Mol. Biol. 48: 443 453 homology alignment algorithm, Pearson and Lipman (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. 85: 2444 2448 similarity search method, Karlin and Altschul ⁇ (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 5873 5877, an improved algorithm of Karlin and Altschul (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 872264.
  • sequence comparison for determining sequence identity can be performed.
  • the program can be appropriately executed by a computer.
  • Such programs include, but are not limited to, PC / Gene program CLUSTAL (available from Intelligents, Mountain View, Calif.), ALIGN program (Version 2.0), and Wisconsin Genetics Software Package, Version 8 (Genetics Computer Group (GCG), 575 Science Drive, available from Madison, Wis., USA) GAP, BESTFIT, BLAST, FASTA, and TFASTA. Alignment using these programs can be performed using initial parameters, for example.
  • CLUSTAL program HigGlns et al. (1988) Gene 73: 237 244 (1988), HigGlns et al.
  • Gapped BLAST (BLAST 2.0) can be used to obtain an alignment with a gap added for comparison purposes.
  • PSI-BLAST BLAST 2.0
  • BLAST 2.0 can be used to perform an iterated search that detects distant relationships between sequences.
  • Gapped BLAST and PSI-BLAST see Altschul et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25: 3389.
  • the initial parameters of each program eg, BLASTN for nucleotide sequences, BLASTX for amino acid sequences
  • the alignment may be performed manually.
  • sequence identity between two sequences is calculated as the ratio of residues that match between the two sequences when the two sequences are aligned for maximum matching.
  • microorganism of the present invention may be further modified so that the activity of ⁇ -glutamylcysteine synthetase is reduced.
  • ⁇ -glutamylcysteine synthetase refers to a protein having ⁇ -glutamylcysteine synthetase activity.
  • ⁇ -glutamylcysteine synthetase is also referred to as “glutamic acid-cysteine ligase” or “GSHA”.
  • the ⁇ -glutamylcysteine synthetase may further have an activity to produce ⁇ -glutamyldipeptides other than ⁇ -glutamylcysteine, such as ⁇ -glutamylvaline synthase activity and ⁇ -glutamylglycine synthase activity.
  • the ⁇ -glutamylcysteine synthetase may exhibit a lower Val selectivity than the ⁇ -glutamylvaline synthase described below. In ⁇ -glutamylcysteine synthase, the Val selectivity may be, for example, less than 3.0.
  • Examples of ⁇ -glutamylcysteine synthetase include GshA protein encoded by gshA gene.
  • GshA protein encoded by gshA gene As an example, the base sequence of the gshA gene of Escherichia coli and the amino acid sequence of the protein encoded by the same gene are shown in SEQ ID NOs: 23 and 24, respectively.
  • the ⁇ -glutamylcysteine synthetase may be a variant of the above ⁇ -glutamylcysteine synthetase as long as it has ⁇ -glutamylcysteine synthetase activity.
  • gshA gene and “GshA protein” include conservative variants thereof in addition to the gshA gene and GshA protein exemplified above, respectively.
  • the microorganism of the present invention may be further modified so that the activity of the protein involved in the degradation of ⁇ -glutamyl peptide is reduced.
  • An example of a protein involved in the degradation of ⁇ -glutamyl peptide is ⁇ -glutamyltransferase (GGT).
  • GGT includes Ggt protein encoded by ggt gene.
  • the base sequence of the ggt gene of Escherichia coli and the amino acid sequence of the protein encoded by the same gene are shown in SEQ ID NOs: 25 and 26, respectively.
  • GGT may be a variant of the above GGT as long as it has GGT activity.
  • the above-mentioned descriptions concerning the conservative variants of YBDK and ybdK genes can be applied mutatis mutandis.
  • the terms “ggt gene” and “Ggt protein” include conservative variants in addition to the ggt gene and Ggt protein exemplified above, respectively.
  • the order of modification for constructing the microorganism of the present invention is not particularly limited.
  • the protein activity decreases means that the activity of the protein decreases as compared to the unmodified strain. Specifically, “the protein activity decreases” may mean that the activity per cell of the protein is decreased as compared to the unmodified strain.
  • unmodified strain refers to a control strain that has not been modified so that the activity of the target protein is reduced.
  • Non-modified strains include wild strains and parent strains. Specific examples of the non-modified strain include a reference strain (type strain) of each bacterial species. Specific examples of non-modified strains include strains exemplified in the description of bacteria.
  • the activity of the protein may be reduced compared to a reference strain (ie, a reference strain of a species to which the microorganism of the present invention belongs).
  • the activity of the protein may be reduced as compared to Escherichia coli K-12 MG1655 strain.
  • the activity of the protein may be reduced as compared to Escherichia coli JM109 strain.
  • “the activity of the protein is reduced” includes the case where the activity of the protein is completely lost. More specifically, “reduced protein activity” means that the number of molecules per cell of the protein is decreased and / or per molecule of the protein compared to the unmodified strain. It may mean that the function is degraded.
  • “activity” in the case of “decrease in protein activity” means not only the catalytic activity of the protein but also the transcription amount (mRNA amount) or translation amount (protein amount) of the gene encoding the protein. May be.
  • “the number of molecules per cell of the protein is reduced” includes the case where the protein is not present at all.
  • “the function per molecule of the protein is reduced” includes the case where the function per molecule of the protein is completely lost.
  • the degree of the decrease in protein activity is not particularly limited as long as the activity of the protein is decreased as compared with the unmodified strain.
  • the activity of the protein may be reduced to, for example, 50% or less, 20% or less, 10% or less, 5% or less, or 0% of an unmodified strain.
  • Modification that decreases the activity of the protein can be achieved, for example, by decreasing the expression of the gene encoding the protein.
  • the expression of a gene is reduced means that the expression of the gene is reduced as compared with an unmodified strain. Specifically, “the expression of a gene is decreased” may mean that the expression level of the gene per cell is decreased as compared to a non-modified strain such as a wild strain or a parent strain. More specifically, “the gene expression decreases” means that the gene transcription amount (mRNA amount) decreases and / or the gene translation amount (protein amount) decreases. It's okay. “Gene expression decreases” includes the case where the gene is not expressed at all.
  • the expression of the gene is reduced is also referred to as “the expression of the gene is weakened”. Gene expression may be reduced to, for example, 50% or less, 20% or less, 10% or less, 5% or less, or 0% of an unmodified strain.
  • the decrease in gene expression may be due to, for example, a decrease in transcription efficiency, a decrease in translation efficiency, or a combination thereof.
  • gene expression can be reduced by altering expression regulatory sequences such as the promoter of the gene, Shine-Dalgarno (SD) sequence (also called ribosome binding site (RBS)), spacer region between RBS and start codon. Can be achieved.
  • SD Shine-Dalgarno
  • RBS ribosome binding site
  • the expression control sequence is preferably modified by 1 base or more, more preferably 2 bases or more, particularly preferably 3 bases or more. Further, part or all of the expression regulatory sequence may be deleted.
  • reduction of gene expression can be achieved, for example, by manipulating factors involved in expression control.
  • Factors involved in expression control include small molecules (such as inducers and inhibitors) involved in transcription and translation control, proteins (such as transcription factors), nucleic acids (such as siRNA), and the like.
  • reduction of gene expression can be achieved, for example, by introducing a mutation that reduces gene expression into the coding region of the gene.
  • gene expression can be reduced by replacing codons in the coding region of the gene with synonymous codons that are used less frequently in the host.
  • gene expression itself may be reduced by gene disruption as described below.
  • the modification that decreases the activity of the protein can be achieved, for example, by destroying a gene encoding the protein. “Gene is disrupted” means that the gene is modified so that it does not produce a normally functioning protein. “Does not produce a protein that functions normally” includes the case where no protein is produced from the same gene, or the case where a protein whose function (activity or property) per molecule is reduced or lost is produced from the same gene. It is.
  • Gene disruption can be achieved, for example, by deleting part or all of the coding region of the gene on the chromosome. Furthermore, the entire gene including the sequences before and after the gene on the chromosome may be deleted.
  • the region to be deleted may be any region such as an N-terminal region, an internal region, or a C-terminal region as long as a decrease in protein activity can be achieved. Usually, the longer region to be deleted can surely inactivate the gene. Moreover, it is preferable that the reading frames of the sequences before and after the region to be deleted do not match.
  • gene disruption is, for example, introducing an amino acid substitution (missense mutation) into a coding region of a gene on a chromosome, introducing a stop codon (nonsense mutation), or adding or deleting 1 to 2 bases. It can also be achieved by introducing a frameshift mutation (Journal of Biological Chemistry 272: 8611-8617 (1997), Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 95 5511-5515 (1998), Journal of Biological Chemistry 26 116, 20833-20839 (1991)).
  • gene disruption can be achieved, for example, by inserting another sequence into the coding region of the gene on the chromosome.
  • the insertion site may be any region of the gene, but the longer the inserted sequence, the more reliably the gene can be inactivated.
  • the other sequence is not particularly limited as long as it reduces or eliminates the activity of the encoded protein, and examples thereof include marker genes such as antibiotic resistance genes and genes useful for the production of target substances.
  • a deletion type gene modified so as not to produce a normally functioning protein is prepared, and a host is transformed with a recombinant DNA containing the deletion type gene.
  • This can be accomplished by replacing the wild-type gene on the chromosome with the deletion-type gene by converting and causing homologous recombination between the deletion-type gene and the wild-type gene on the chromosome.
  • the recombinant DNA can be easily manipulated by including a marker gene in accordance with a trait such as auxotrophy of the host.
  • Deletion-type genes include genes that have lost all or part of the gene, genes that have been introduced with gene nonsense mutations that have introduced missense mutations, genes that have introduced frameshift mutations, insertions of transposon, marker genes, etc.
  • a gene into which a sequence has been introduced may be mentioned. Even if the protein encoded by the deletion-type gene is produced, it has a three-dimensional structure different from that of the wild-type protein, and its function is reduced or lost. Gene disruption by gene replacement using such homologous recombination has already been established, and a method called “Red-driven integration” (Datsenko, K. A, and Wanner, B. L. Proc .Natl. Acad. Sci. U S A.
  • the modification that reduces the activity of the protein may be performed by, for example, a mutation treatment.
  • Mutation treatments include X-ray irradiation, UV irradiation, and N-methyl-N′-nitro-N-nitrosoguanidine (MNNG), ethylmethanesulfonate (EMS), and methylmethanesulfonate (MMS). ) And the like.
  • all of the plurality of subunits may be modified or only a part may be modified as long as the activity of the protein decreases as a result. . That is, for example, all of a plurality of genes encoding these subunits may be destroyed, or only a part of them may be destroyed.
  • all the activities of the plurality of isozymes may be reduced, or only a part of the activities may be reduced. That is, for example, all of a plurality of genes encoding these isozymes may be destroyed, or only a part of them may be destroyed.
  • the decrease in the activity of the protein can be confirmed by measuring the activity of the protein.
  • the decrease in protein activity can also be confirmed by confirming that the expression of the gene encoding the protein has decreased.
  • the decrease in gene expression can be confirmed by confirming that the transcription amount of the gene has decreased, or confirming that the amount of protein expressed from the gene has decreased.
  • the amount of transcription of the gene has been reduced by comparing the amount of mRNA transcribed from the same gene with that of the unmodified strain.
  • methods for evaluating the amount of mRNA include Northern hybridization, RT-PCR, and the like (Molecular cloning (Cold spring spring Laboratory Laboratory, Cold spring Harbor (USA), 2001)).
  • the amount of mRNA may be reduced to, for example, 50% or less, 20% or less, 10% or less, 5% or less, or 0% compared to the unmodified strain.
  • the amount of protein may be reduced to, for example, 50% or less, 20% or less, 10% or less, 5% or less, or 0% compared to the unmodified strain.
  • the gene has been destroyed by determining part or all of the nucleotide sequence, restriction enzyme map, full length, etc. of the gene according to the means used for the destruction.
  • the microorganism of the present invention can be used as an expression host for ⁇ -glutamylvaline synthase. That is, the microorganism of the present invention may have a gene encoding ⁇ -glutamyl valine synthase (also referred to as “ ⁇ -glutamyl valine synthase gene”).
  • the “host having the ⁇ -glutamyl valine synthase gene” refers to the microorganism of the present invention having the ⁇ -glutamyl valine synthase gene.
  • Having ⁇ -glutamyl valine synthase gene is also referred to as “having ⁇ -glutamyl valine synthase”. That is, for example, a host having a ⁇ -glutamyl valine synthase gene is also referred to as a “host having ⁇ -glutamyl valine synthase”.
  • a host having a ⁇ -glutamyl valine synthase gene may originally have a ⁇ -glutamyl valine synthase gene or may be modified to have a ⁇ -glutamyl valine synthase gene. Good.
  • Examples of the host modified so as to have the ⁇ -glutamyl valine synthase gene include a host into which the ⁇ -glutamyl valine synthase gene has been introduced. That is, the microorganism of the present invention may have, for example, a ⁇ -glutamyl valine synthase gene introduced therein.
  • the order of modification for constructing the microorganism of the present invention is not particularly limited.
  • a bacterium originally having a ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be modified so that the activity of YBDK decreases.
  • a ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be introduced into a bacterium modified so that the activity of YBDK decreases, or the activity of YBDK decreases after the ⁇ -glutamyl valine synthase gene is introduced into the bacterium. You may modify it.
  • ⁇ -glutamylvaline synthase refers to a protein having ⁇ -glutamylvaline synthase activity.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase may or may not have an activity to produce ⁇ -glutamyl dipeptide other than ⁇ -glutamyl valine as long as it has ⁇ -glutamyl valine synthase activity. Also good. That is, for example, ⁇ -glutamylvaline synthase may or may not have ⁇ -glutamylcysteine synthetase activity.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase may or may not have ⁇ -glutamylglycine synthase activity.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase preferably has no ⁇ -glutamylglycine synthase activity.
  • the methods for measuring ⁇ -glutamylvaline synthase activity and ⁇ -glutamylglycine synthase activity are as described above.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase only needs to have ⁇ -glutamyl valine synthase activity under appropriate conditions.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase may have ⁇ -glutamyl valine synthase activity, for example, in the presence of Mg 2+ or Mn 2+ , particularly in the presence of Mg 2+ .
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase may have ⁇ -glutamyl valine synthase activity at, for example, at least one of pH 7.0 to 9.0, particularly pH 9.0.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase preferably exhibits higher Val selectivity than YBDK.
  • the Val selectivity may be, for example, 3.0 or more, 5.0 or more, 10 or more, 15 or more, or 20 or more.
  • the Val selectivity may be, for example, 10 million or less, 1 million or less, 100,000 or less, 10,000 or less, 1000 or less, 100 or less, or 50 or less.
  • the Val selectivity may be, for example, in the range of a combination thereof.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase may exhibit Val selectivity as exemplified above under appropriate conditions.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase may exhibit Val selectivity as exemplified above in the presence of Mg 2+ or Mn 2+ , particularly in the presence of Mg 2+ .
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase may exhibit Val selectivity exemplified above at least at any pH of pH 7.0 to 9.0, particularly pH 9.0.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase with high Val selectivity in combination with glutathione synthase, ⁇ -glutamyl glycine is reduced using Glu, Val, and Gly as raw materials while reducing by-product of ⁇ -glutamylglycine. It is expected that glycine can be produced efficiently. In particular, it is expected that ⁇ -glutamyl valine can be efficiently produced from Glu and Val as raw materials by using ⁇ -glutamyl valine synthase having high ⁇ -glutamyl valine synthase activity (specific activity).
  • Examples of ⁇ -glutamyl valine synthase include ⁇ -glutamyl valine synthase of bacteria belonging to the genus Kocuria and Micrococcus.
  • Examples of the bacterium belonging to the genus Cochria include Kocuria rosea and Kocuria rhizophila.
  • Examples of the genus Micrococcus include Micrococcus luteus. That is, ⁇ -glutamyl valine synthase may be, for example, a protein derived from such a bacterium.
  • the amino acid sequence of ⁇ -glutamylvaline synthase of Cochlear Rosea (AJ3132) and the base sequence of the gene encoding it are shown in SEQ ID NOs: 18 and 17, respectively.
  • the amino acid sequence of the ⁇ -glutamylvaline synthase of Koclear lysophylla DC2201 strain (ATCC 9341) and the base sequence of the gene encoding it are shown in SEQ ID NOs: 20 and 19, respectively.
  • the amino acid sequence of ⁇ -glutamylvaline synthase of Micrococcus luteus NCTC2665 strain (ATCC-15307) and the base sequence of the gene encoding it are shown in SEQ ID NOs: 22 and 21, respectively.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase may be a protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18, 20, or 22, for example.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase may be a protein encoded by a gene having the base sequence shown in SEQ ID NO: 17, 19, or 21, for example.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase is a variant of the above-exemplified ⁇ -glutamyl valine synthase (for example, a protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18, 20, or 22) as long as it has ⁇ -glutamyl valine synthase activity. There may be.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene encodes a protein having ⁇ -glutamyl valine synthase activity
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene exemplified above for example, shown in SEQ ID NO: 17, 19, or 21
  • It may be a variant of a gene having a base sequence.
  • the above description concerning the ybdK gene and the conservative variant of YBDK can be applied mutatis mutandis.
  • “The original function is maintained” means that, in the case of ⁇ -glutamyl valine synthase, the variant of the protein has ⁇ -glutamyl valine synthase activity.
  • the variant has ⁇ -glutamylvaline synthase activity, the enzymatic properties of the variant, such as substrate specificity, requirement for divalent metal ions, pH dependence, etc. May or may not be identical to the scientific properties.
  • the variant may or may not have an activity to produce ⁇ -glutamyldipeptide other than ⁇ -glutamylvaline.
  • the variant may exhibit the Val selectivity exemplified above.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase examples include mutant glutamate-cysteine ligase (mutant GSHA) described in WO2015 / 115612.
  • mutant glutamate-cysteine ligase refers to GSHA having “specific mutation”.
  • the gene encoding mutant GSHA is also referred to as “mutant glutamate-cysteine ligase gene (mutant gshA gene)”. The “specific mutation” will be described later.
  • glutamate-cysteine ligase having no “specific mutation” is also referred to as “wild-type glutamate-cysteine ligase (wild-type GSHA)”.
  • wild-type GSHA the gene encoding wild-type GSHA is also referred to as “wild-type glutamate-cysteine ligase gene (wild-type gshA gene)”.
  • wild type used here is a description for the sake of distinction from the “mutant type”, and is not limited to those obtained naturally unless it has a “specific mutation”.
  • Examples of the wild-type GSHA include the GSHA exemplified above, such as Escherichia coli GshA protein.
  • Wild-type GSHA may usually be a protein having ⁇ -glutamylcysteine synthetase activity.
  • wild-type GSHA is ⁇ -glutamylcysteine synthetase activity, ⁇ -glutamylvaline synthase activity, ⁇ -glutamylglycine synthesis as long as the corresponding mutant GSHA has ⁇ -glutamylvaline synthase activity. It may have enzymatic activity, or any combination thereof, and none of them.
  • Mutant GSHA has “specific mutation” in the amino acid sequence of wild-type GSHA. That is, for example, the mutant GSHA may be a protein having a “specific mutation” in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24. In addition, for example, the mutant GSHA has a “specific mutation” in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24, and further substitution or deletion of one or several amino acids other than the “specific mutation”, It may be a protein having an amino acid sequence including insertion or addition and having ⁇ -glutamyl valine synthase activity. In other words, the mutant GSHA may be a protein having the same amino acid sequence as the wild-type GSHA except that it has a “specific mutation”.
  • the mutant GSHA may be a protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24 except that it has a “specific mutation”. Further, for example, the mutant GSHA has an amino acid sequence including substitution, deletion, insertion, or addition of one or several amino acids in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24, except that it has a “specific mutation”. And a protein having ⁇ -glutamyl valine synthase activity. Further, for example, the mutant GSHA has 80% or more, preferably 90% or more, more preferably 95% or more, more preferably, relative to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24, except that it has a “specific mutation”. It may be a protein having an amino acid sequence having homology of 97% or more, particularly preferably 99% or more, and having ⁇ -glutamylvaline synthase activity.
  • Specific mutation refers to a mutation that, when introduced into wild-type GSHA, imparts properties suitable for the production of ⁇ -glutamylvaline to wild-type GSHA. That is, the mutant GSHA has a “specific mutation” and thus has a property suitable for the production of ⁇ -glutamylvaline compared to the wild-type GSHA.
  • Properties suitable for the production of ⁇ -glutamyl valine include, for example, increased ⁇ -glutamyl valine synthase activity (specific activity), decreased ⁇ -glutamyl glycine synthase activity (specific activity), increased Val selectivity, and A combination of them is mentioned.
  • ⁇ -glutamylvaline synthase activity is 1.1 times or more, 1.5 times or more, 2 times or more, 5 times or more, 10 times or more of wild type GSHA, Or it may rise 20 times or more.
  • Examples of the “specific mutation” include a mutation corresponding to a mutation in one or more amino acid residues selected from the following. L135, Q144, Y241, N243, Y300.
  • the number indicates the position in the amino acid sequence of wild-type GSHA shown in SEQ ID NO: 24, and the letter on the left side of the number indicates the amino acid residue at that position in the amino acid sequence of wild-type GSHA shown in SEQ ID NO: 24 (that is, before mutation).
  • Amino acid residues; one letter code indicates the Leu residue at position 135 in the amino acid sequence of wild-type GSHA shown in SEQ ID NO: 24.
  • the amino acid residue after substitution may be any amino acid residue other than the original amino acid residue, as long as the mutant GSHA has ⁇ -glutamyl valine synthase activity.
  • the amino acid residues after substitution are K (Lys), R (Arg), H (His), A (Ala), V (Val), L (Leu), I (Ile), G ( Gly), S (Ser), T (Thr), P (Pro), F (Phe), W (Trp), Y (Tyr), C (Cys), M (Met), D (Asp), E ( Glu), N (Asn), and Q (Gln) include those other than the original amino acid residue.
  • the “specific mutation” include a mutation corresponding to one or more mutations selected from the following. That is, the “specific mutation” may include a mutation corresponding to one or more mutations selected from the following.
  • the “specific mutation” may be, for example, a mutation corresponding to any mutation selected from the following, or may be a mutation corresponding to a combination of two or more mutations selected from the following.
  • the “specific mutation” is, for example, one or more mutations selected from the following and a mutation in one or more amino acid residues selected from other L135, Q144, Y241, N243, and Y300. It may be a mutation corresponding to a combination.
  • L135 (I, F, M, V, G, A, W, K, H, R, C, N, S, T), Q144 (F, A, N, S, D, T, R, H, G, K, Y, W, C, M, P, V, L, I), Y241 (A), N243 (I, W, K, R, H), Y300 (A, H, R, K).
  • the numbers and the meanings of the characters on the left side are the same as described above.
  • the letter in parentheses on the right side of the number indicates the amino acid residue after mutation (indicated by one letter).
  • L135 (I, F, M, V, G, A, W, K, H, R, C, N, S, T)” in the amino acid sequence of the wild type GSHA shown in SEQ ID NO: 24
  • a mutation in which the Leu residue at position 135 is substituted with any one of the amino acid residues Ile, Phe, Met, Val, Gly, Ala, Trp, Lys, His, Arg, Cys, Asn, Ser, and Thr is shown.
  • the amino acid after each mutation may be expressed without parentheses. That is, for example, “L135I” indicates a mutation in which the Leu residue at position 135 in the amino acid sequence of wild-type GSHA shown in SEQ ID NO: 24 is replaced with an Ile residue.
  • the combination of mutations is not particularly limited. Specific examples of combinations of mutations include the following combinations. L135I / Q144R, L135I / Q144D, L135I / Q144A, L135I / Q144L, L135I / N243W, L135I / N243F, L135F / Q144A, L135F / N243W, L135M / Q144R, L135M / Q144A, L135M / Q144L, L135M / N243W, L135M / N243W N243F, L135M / Q144H, L135M / Q144N, L135M / N243Y, L135M / N243R, L135M / N243C, L135V / Q144R, L135V / Q144D, L135V / Q144A, L135V / Q144L, L135V / Q144V
  • L135 (I, M, V, G, A, K, H, C, N, S, T), Q144 (F, A, S, D, T, R, H, K, Y, W, C, M, P, V, L, I), N243 (R, H), Y300 (R, K), L135I / Q144R, L135I / Q144D, L135I / Q144A, L135I / Q144L, L135I / N243W, L135I / N243F, L135F / Q144A, L135M / Q144R, L135M / Q144A, L135M / Q144L, L135M / N243W, L135M / Q144H, L135M / Q144H, L135M / Q144H, L135M / Q144H, L135M / Q144H, L135M / Q144H, L135M / Q
  • “mutation corresponding to the mutation of the amino acid residue at position n in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24” refers to the amino acid residue at position n in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24 It means a mutation at the corresponding amino acid residue. That is, for example, “mutation corresponding to L135I” is a mutation in which the amino acid residue corresponding to the Leu residue at position 135 (L135) in the amino acid sequence of wild-type GSHA shown in SEQ ID NO: 24 is replaced with an Ile residue. Indicates.
  • the “amino acid residue corresponding to L135” herein may be a Leu residue, but may not be a Leu residue.
  • a mutation corresponding to L135I is not limited to a mutation in which the Leu residue is replaced with an Ile residue when the “amino acid residue corresponding to L135” is a Leu residue, If the ⁇ corresponding amino acid residue '' is a Lys, Arg, His, Ala, Val, Gly, Ser, Thr, Pro, Phe, Trp, Tyr, Cys, Met, Asp, Glu, Asn, or Gln residue Also included are mutations in which an amino acid residue is replaced with an Ile residue. The same applies to other mutations.
  • the amino acid residue corresponding to the amino acid residue at position n in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24 refers to the amino acid sequence of the target wild-type GSHA and the amino acid sequence of SEQ ID NO: 24 Means the amino acid residue corresponding to the amino acid residue at position n in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24. That is, in the mutation described above, the position of the amino acid residue does not necessarily indicate an absolute position in the amino acid sequence of wild-type GSHA, but indicates a relative position based on the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 24. .
  • the original n-position amino acid residue is counted from the N-terminal.
  • the n-1st amino acid residue it is regarded as “the amino acid residue corresponding to the n-th amino acid residue in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24”.
  • amino acid residue in the GSHA homolog is “Amino acid residue corresponding to the amino acid residue at position 101 in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 24”.
  • Alignment can be performed using, for example, known gene analysis software.
  • Specific gene analysis software includes DNA Solutions from Hitachi Solutions, GENETYX from GENETICS, and ClustalW published by DDBJ (Elizabeth C. Tyler et al., Computers and Biomedical Research, 24 (1), 72-96, 1991; Barton GJ et al., Journal of molecular biology, 198 (2), 327-37. 1987; Thompson JD et al., Nucleic acid Reseach, 22 (22), 4673-80. 1994).
  • ⁇ -glutamyl valine synthase may be a fusion protein with another peptide.
  • the “other peptide” is not particularly limited as long as ⁇ -glutamyl valine synthase has ⁇ -glutamyl valine synthase activity.
  • “Other peptides” can be appropriately selected depending on various conditions such as the purpose of use. Examples of “other peptides” include peptide tags, signal peptides, and protease recognition sequences. “Other peptides” may be linked to, for example, the N-terminus or C-terminus of ⁇ -glutamylvaline synthase, or both. As the “other peptide”, one type of peptide may be used, or two or more types of peptides may be used in combination.
  • Specific peptide tags include His tags, FLAG tags, GST tags, Myc tags, MBP (maltose binding protein), CBP (cellulose binding protein), TRX (Thioredoxin), GFP (green fluorescent protein), HRP (horseradish) peroxidase), ALP (Alkaline Phosphatase), and antibody Fc region.
  • His tag is a 6xHis tag.
  • the peptide tag can be used, for example, for detection and purification of the expressed ⁇ -glutamyl valine synthase.
  • the signal peptide is not particularly limited as long as it functions in a host that expresses ⁇ -glutamylvaline synthase.
  • Examples of the signal peptide include a signal peptide recognized by the Sec-type secretory pathway and a signal peptide recognized by the Tat-type secretory pathway.
  • Specific examples of signal peptides recognized by the Tat secretion pathway include the TorA signal sequence of E. coli, the SufI signal sequence of E. coli, the PhoD signal sequence of Bacillus subtilis, the LipA signal sequence of Bacillus subtilis, and Arthrobacter globiformis.
  • An IMD signal sequence is mentioned (WO2013 / 118544).
  • the signal peptide can be used, for example, for secretory production of ⁇ -glutamylvaline synthase.
  • secretory production of ⁇ -glutamyl valine synthase is performed using a signal peptide, the signal peptide is cleaved during secretion, and ⁇ -glutamyl valine synthase without the signal peptide can be secreted outside the cell.
  • protease recognition sequence examples include Factor Xa protease recognition sequence and proTEV protease recognition sequence.
  • the protease recognition sequence can be used, for example, to cleave the expressed ⁇ -glutamyl valine synthase.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase when ⁇ -glutamyl valine synthase is expressed as a fusion protein with a peptide tag, the ⁇ -glutamyl valine synthase is expressed by introducing a protease recognition sequence into the junction between the ⁇ -glutamyl valine synthase and the peptide tag.
  • a protease recognition sequence By cleaving the peptide tag from ⁇ -glutamyl valine synthase using a protease, ⁇ -glutamyl valine synthase without the peptide tag can be obtained.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be one obtained by substituting an arbitrary codon with an equivalent codon in the base sequence of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene exemplified above or a conservative variant thereof.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be modified to have an optimal codon depending on the codon usage frequency of the host to be used. Specifically, for example, when the start codon is other than ATG, the start codon can be changed to ATG.
  • the base sequence of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene of cochlear rosea (AJ3132) optimized for expression in Escherichia coli is shown in SEQ ID NO: 29.
  • the term “gene” is not limited to DNA as long as it encodes a target protein, and may include any polynucleotide. That is, “ ⁇ -glutamyl valine synthase gene” may mean any polynucleotide encoding ⁇ -glutamyl valine synthase.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be DNA, RNA, or a combination thereof.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be single-stranded or double-stranded.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be single-stranded DNA or single-stranded RNA.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be double-stranded DNA, double-stranded RNA, or a hybrid strand composed of a DNA strand and an RNA strand.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene may contain both DNA and RNA residues in a single polynucleotide chain.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene contains RNA, the above description of DNA such as the base sequence may be read as appropriate according to the RNA.
  • the mode of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be appropriately selected according to various conditions such as the mode of use.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be obtained by cloning from an organism having the ⁇ -glutamyl valine synthase gene. For cloning, nucleic acids such as genomic DNA and cDNA containing the same gene can be used. The ⁇ -glutamyl valine synthase gene can also be obtained by chemical synthesis (Gene, 60 (1), 115-127 (1987)).
  • the obtained ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be appropriately modified to obtain a variant thereof.
  • the gene can be modified by a known method.
  • a target mutation can be introduced into a target site of DNA by site-specific mutagenesis. That is, for example, the coding region of a gene can be modified by site-directed mutagenesis so that an amino acid residue at a specific site of the encoded protein includes substitution, deletion, insertion or addition.
  • site-directed mutagenesis a method using PCR (Higuchi, R., 61, in PCR technology, rlErlich, H. A. Eds., Stockton press (1989); Carter, P., ethMeth.
  • the mutant gshA gene can be obtained, for example, by modifying the wild-type gshA gene so that the encoded GSHA has the above-mentioned “specific mutation”.
  • the wild-type gshA gene to be modified can be obtained, for example, by cloning from an organism having the wild-type gshA gene or by chemical synthesis.
  • a mutant gshA gene can also be obtained without using a wild-type gshA gene.
  • the mutant gshA gene may be obtained directly by chemical synthesis or another mutant gshA gene may be obtained by further modifying the mutant gshA gene.
  • the method for introducing the ⁇ -glutamyl valine synthase gene into the host is not particularly limited.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be retained so that it can be expressed under the control of a promoter that functions in the host.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be present on a vector autonomously replicating outside the chromosome, such as a plasmid, or may be introduced on the chromosome.
  • the host may have only one copy of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene, or may have two or more copies.
  • the host may have only one type of ⁇ -glutamyl valine synthase gene or may have two or more types of ⁇ -glutamyl valine synthase genes. “Introducing a mutant gshA gene into a host” includes modifying the gshA gene on the host chromosome so as to have a “specific mutation”.
  • the promoter for expressing the ⁇ -glutamyl valine synthase gene is not particularly limited as long as it functions in the host.
  • the “promoter that functions in the host” refers to a promoter having promoter activity in the host.
  • the promoter may be a host-derived promoter or a heterologous promoter.
  • the promoter may be a native promoter of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene or a promoter of another gene.
  • the promoter may be a stronger promoter than the intrinsic promoter of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene.
  • strong promoters that function in Enterobacteriaceae bacteria such as Escherichia coli include, for example, T7 promoter, trp promoter, trc promoter, lac promoter, tac promoter, tet promoter, araBAD promoter, rpoH promoter, PR promoter, and PL promoter is mentioned.
  • a strong promoter that functions in coryneform bacteria artificially redesigned P54-6 promoter (Appl. Microbiol.
  • the activity of the promoter can be increased by bringing the ⁇ 35 and ⁇ 10 regions in the promoter region closer to the consensus sequence (WO 00/18935).
  • the highly active promoter include various tac-like promoters (Katashkina JI et al. Russian Patent application 2006134574) and pnlp8 promoter (WO2010 / 027045). Methods for evaluating promoter strength and examples of strong promoters are described in Goldstein et al. (Prokaryotickpromoters in biotechnology. Biotechnol. Annu. Rev.,. 1, 105-128 (1995)).
  • a terminator for termination of transcription can be arranged downstream of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene.
  • the terminator is not particularly limited as long as it functions in the host.
  • the terminator may be a host-derived terminator or a heterologous terminator.
  • the terminator may be a specific terminator of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene, or may be a terminator of another gene. Specific examples of the terminator include T7 terminator, T4 terminator, fd phage terminator, tet terminator, and trpA terminator.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be introduced into a host using a vector containing the gene, for example.
  • a vector containing a ⁇ -glutamyl valine synthase gene is also referred to as an expression vector or a recombinant vector of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene.
  • An expression vector for the ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be constructed by, for example, ligating a DNA fragment containing the ⁇ -glutamyl valine synthase gene with a vector that functions in the host.
  • a transformant introduced with the vector By transforming the host with an expression vector of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene, a transformant introduced with the vector can be obtained, that is, the gene can be introduced into the host.
  • a vector capable of autonomous replication in a host cell can be used.
  • the vector is preferably a multicopy vector.
  • the vector preferably has a marker such as an antibiotic resistance gene in order to select a transformant.
  • the vector may be equipped with a promoter or terminator for expressing the inserted gene.
  • the vector may be, for example, a vector derived from a bacterial plasmid, a vector derived from a yeast plasmid, a vector derived from a bacteriophage, a cosmid, or a phagemid.
  • vectors capable of autonomous replication in bacteria of the Enterobacteriaceae family such as Escherichia coli, specifically, for example, pUC19, pUC18, pHSG299, pHSG399, pHSG398, pBR322, pSTV29 (all available from Takara Bio Inc.), pACYC184, pMW219 (Nippon Gene), pTrc99A (Pharmacia), pPROK vector (Clontech), pKK233-2 (Clontech), pET vector (Novagen), pQE vector (Qiagen), pACYC, Hiroshi
  • the host range vector RSF1010 can be mentioned.
  • vectors that can autonomously replicate in coryneform bacteria include, for example, pHM1519 (Agric, Biol. Chem., 48, 2901-2903 (1984)); pAM330 (Agric. Biol. Chem., 48, 2901-2903 (1984)); plasmids having improved drug resistance genes; plasmid pCRY30 described in JP-A-3-210184; described in JP-A-2-72876 and US Pat. No.
  • a ⁇ -glutamyl valine synthase gene containing a unique promoter region may be directly incorporated into the vector, and the coding region of ⁇ -glutamyl valine synthase is placed downstream of the above promoter. They may be combined and then incorporated into the vector, or the coding region of ⁇ -glutamyl valine synthase may be incorporated downstream of the promoter inherent on the vector.
  • the vectors, promoters, and terminators that can be used in various microorganisms are described in detail in, for example, “Basic Course of Microbiology 8, Genetic Engineering, Kyoritsu Shuppan, 1987”, and these can be used.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be introduced into the host chromosome, for example.
  • Introduction of a gene into a chromosome can be performed, for example, using homologous recombination (Miller I, J. H. Experiments in Molecular Genetics, 1972, Cold Spring Harbor Laboratory).
  • homologous recombination Examples of gene introduction methods using homologous recombination include the Red-driven integration method (Datsenko, K. A, and Wanner, B. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 97).
  • a transduction method using a phage Only one copy of the gene may be introduced, or two copies or more may be introduced.
  • multiple copies of a gene can be introduced into a chromosome by performing homologous recombination with a sequence having multiple copies on the chromosome as a target. Examples of sequences having many copies on a chromosome include repetitive DNA sequences (inverted DNA) and inverted repeats present at both ends of a transposon.
  • homologous recombination may be performed by targeting an appropriate sequence on a chromosome such as a gene unnecessary for carrying out the present invention.
  • genes unnecessary for the practice of the present invention include the ybdK gene, the gshA gene, and the ggt gene.
  • the gene can also be randomly introduced onto the chromosome using transposon or Mini-Mu (Japanese Patent Laid-Open No. 2-109985, US Pat. No. 5,882,888, EP805867B1).
  • a ⁇ -glutamyl valine synthase gene containing a unique promoter region may be directly incorporated into the chromosome, and the coding region of ⁇ -glutamyl valine synthase may be incorporated into the promoter as described above. After binding downstream, it may be incorporated into the chromosome, or the coding region of ⁇ -glutamylvaline synthase may be incorporated downstream of the promoter originally present on the chromosome.
  • the introduction of a gene onto a chromosome can be attributed to, for example, Southern hybridization using a probe having a base sequence complementary to all or part of the gene, or a primer prepared based on the base sequence of the gene. Can be confirmed by PCR.
  • the transformation method is not particularly limited, and a conventionally known method can be used.
  • a transformation method for example, a method in which a recipient cell is treated with calcium chloride to increase DNA permeability as reported for Escherichia coli K-12 (Mandel, M. and Higa, A., J. Mol. Biol. 1970, 53, 159-162), as described for Bacillus subtilis, a method of preparing competent cells from cells at the growth stage and introducing DNA (Duncan, C. H. , Wilson, G. A. and Young, F. E .., 1997. Gene 1: 153-167).
  • recombinant DNA is prepared by transforming DNA-receptive cells, such as those known for Bacillus subtilis, actinomycetes, and yeast, into a protoplast or spheroplast state that easily incorporates recombinant DNA.
  • DNA-receptive cells such as those known for Bacillus subtilis, actinomycetes, and yeast
  • recombinant DNA is prepared by transforming DNA-receptive cells, such as those known for Bacillus subtilis, actinomycetes, and yeast, into a protoplast or spheroplast state that easily incorporates recombinant DNA.
  • an electric pulse method Japanese Patent Laid-Open No. 2-207791
  • a host that originally has a ⁇ -glutamyl valine synthase gene may be modified so that the expression of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene is increased.
  • Gene expression is increased means that the expression of the gene is increased compared to an unmodified strain.
  • the expression of the gene is increased specifically may mean that the expression level of the gene per cell is increased as compared with the unmodified strain.
  • unmodified strain means a control strain that has not been modified to increase expression of a target gene.
  • Non-modified strains include wild strains and parent strains.
  • Methods for increasing the expression of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene include increasing the copy number of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene and improving the transcription efficiency and translation efficiency of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene. It is done.
  • An increase in the copy number of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be achieved by introducing the ⁇ -glutamyl valine synthase gene into the host. The introduction of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be performed as described above.
  • the introduced ⁇ -glutamylvaline synthase gene may be derived from the same species or from a different species.
  • Improvement of transcription efficiency and translation efficiency of ⁇ -glutamyl valine synthase gene includes promoter, Shine-Dalgarno (SD) sequence (also called ribosome binding site (RBS)), spacer region between RBS and start codon, etc. This can be achieved by modifying the gene expression regulatory sequence.
  • SD Shine-Dalgarno
  • RBS ribosome binding site
  • the transcription efficiency of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be improved by replacing the promoter of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene with a stronger promoter. Examples of stronger promoters include those described above.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase can be produced by expressing a ⁇ -glutamyl valine synthase gene in a host having the ⁇ -glutamyl valine synthase gene.
  • the expression of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene is also referred to as “expression of ⁇ -glutamyl valine synthase”.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase By culturing a host having a ⁇ -glutamyl valine synthase gene, ⁇ -glutamyl valine synthase can be expressed. At that time, gene expression is induced as necessary.
  • Host culture conditions and gene expression induction conditions may be appropriately selected according to various conditions such as marker type, promoter type, and host type.
  • the medium used for the culture is not particularly limited as long as the host can proliferate and can express ⁇ -glutamyl valine synthase.
  • a normal medium containing a carbon source, a nitrogen source, a sulfur source, inorganic ions, and other organic components as required can be used.
  • Examples of the carbon source include sugars such as glucose, fructose, sucrose, molasses and starch hydrolysates, alcohols such as glycerol and ethanol, and organic acids such as fumaric acid, citric acid and succinic acid.
  • sugars such as glucose, fructose, sucrose, molasses and starch hydrolysates
  • alcohols such as glycerol and ethanol
  • organic acids such as fumaric acid, citric acid and succinic acid.
  • Nitrogen sources include inorganic ammonium salts such as ammonium sulfate, ammonium chloride, and ammonium phosphate, organic nitrogen such as soybean hydrolysate, ammonia gas, and aqueous ammonia.
  • inorganic ammonium salts such as ammonium sulfate, ammonium chloride, and ammonium phosphate
  • organic nitrogen such as soybean hydrolysate, ammonia gas, and aqueous ammonia.
  • sulfur sources include inorganic sulfur compounds such as sulfates, sulfites, sulfides, hyposulfites, and thiosulfates.
  • Inorganic ions include calcium ions, magnesium ions, manganese ions, potassium ions, iron ions, and phosphate ions.
  • organic components include organic trace nutrient sources.
  • organic micronutrients include required substances such as vitamin B1, yeast extract containing them, and the like.
  • the culture temperature may be, for example, 20 ° C to 45 ° C, preferably 24 ° C to 45 ° C, more preferably 30 ° C to 37 ° C.
  • the culture is preferably aeration culture.
  • the oxygen concentration at that time may be adjusted to, for example, 5 to 50%, preferably about 10% of the saturated concentration.
  • the pH during the culture is preferably 5-9.
  • inorganic or organic acidic or alkaline substances such as calcium carbonate, ammonia gas, aqueous ammonia, etc. can be used for pH adjustment.
  • a culture containing ⁇ -glutamyl valine synthase can be obtained by culturing preferably for about 10 to 120 hours under the above conditions.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase can accumulate, for example, in the host cell.
  • the ⁇ -glutamyl valine synthase may be used as it is contained in the microbial cells or the like, and may be appropriately separated and purified from the microbial cells and used as a crude enzyme fraction or a purified enzyme.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase may be used in a free state, or may be used in a state of an immobilized enzyme fixed on a solid phase such as a resin.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase when ⁇ -glutamyl valine synthase accumulates in the host cell body, ⁇ -glutamyl valine synthase can be recovered by crushing, dissolving or extracting the cell body as appropriate.
  • the cells can be recovered from the culture by centrifugation or the like.
  • Cell disruption, lysis, extraction or the like can be performed by a known method. Examples of such a method include ultrasonic crushing method, dynomill method, bead crushing, French press crushing, and lysozyme treatment. One of these methods may be used alone, or two or more thereof may be used in appropriate combination.
  • the culture supernatant can be obtained by centrifugation or the like, and ⁇ -glutamyl valine synthase can be recovered from the culture supernatant.
  • Purification of ⁇ -glutamylvaline synthase can be performed by a known method used for enzyme purification. Examples of such methods include ammonium sulfate fractionation, ion exchange chromatography, hydrophobic chromatography, affinity chromatography, gel filtration chromatography, and isoelectric point precipitation. One of these methods may be used alone, or two or more thereof may be used in appropriate combination. Purification of ⁇ -glutamyl valine synthase can be performed to a desired degree. For example, when a component involved in the degradation of ⁇ -glutamyl peptide such as GGT coexists with ⁇ -glutamylvaline synthase, it is preferable to remove such component.
  • a component involved in the degradation of ⁇ -glutamyl peptide such as GGT coexists with ⁇ -glutamylvaline synthase, it is preferable to remove such component.
  • the purified ⁇ -glutamyl valine synthase can be used as “ ⁇ -glutamyl valine synthase” in the method of the present invention.
  • any fraction containing ⁇ -glutamyl valine synthase may be used as “ ⁇ -glutamyl valine synthase” in the method of the present invention. That is, the “ ⁇ -glutamyl valine synthase” in the method of the present invention may be contained in such a fraction.
  • the fraction containing ⁇ -glutamyl valine synthase is not particularly limited as long as it is contained so that ⁇ -glutamyl valine synthase can act on Glu and Val.
  • fractions include a culture of a host having a ⁇ -glutamyl valine synthase gene (host having ⁇ -glutamyl valine synthase), a cell recovered from the culture (cultured cell), Disrupted microbial cells, lysates of the microbial cells, extracts of the microbial cells (cell-free extract), and processed microbial cells such as immobilized cells obtained by immobilizing the microbial cells with a carrier such as acrylamide or carrageenan And culture supernatants recovered from the same culture, partially purified products (crude products), and combinations thereof. Any of these fractions may be used alone or together with purified ⁇ -glutamyl valine synthase.
  • Glutathione synthase is usually composed of ⁇ -Glu-Cys, Gly and ATP as substrates, glutathione ( ⁇ -Glu-Cys-Gly), ADP and phosphate. It is known as an enzyme (EC 6.3.2.3) that has the activity of catalyzing the reaction that produces the. This activity is also referred to as “glutathione synthase activity”.
  • ⁇ -Glu-Val, Gly, and ATP are used as substrates, and the activity of catalyzing the reaction to produce ⁇ -Glu-Val-Gly, ADP, and phosphate is expressed as “ ⁇ -Glutamylvalylglycine synthethase”. ) Activity "or” ⁇ -Glu-Val-Gly production (synthesis) activity ".
  • glutathione synthetase having ⁇ -glutamylvalylglycine synthase activity refers to a protein having ⁇ -glutamylvalylglycine synthase activity.
  • glutathione synthetase may or may not have an activity to produce ⁇ -glutamyltripeptide other than ⁇ -glutamylvalylglycine as long as it has ⁇ -glutamylvalylglycine synthase activity. Also good. That is, for example, glutathione synthetase may or may not have glutathione synthetase activity.
  • Glutathione synthetase ⁇ - Guru Tamil valyl glycine synthetase activity for example, the reaction solution 12.5 mM ⁇ -Glu-Val composition, 12.5 mM Gly, 12.5 mM ATP , 12.5 mM MgS0 4, 2 mM dithiothreitol, 100 mM Tris- An HCl buffer (pH 8.0), a reaction temperature of 37 ° C., and a reaction time of 1 minute to 50 hours can be measured using an appropriate amount of glutathione synthetase.
  • the enzyme activity that produces 1 ⁇ mol of ⁇ -Glu-Val-Gly in 1 minute under these conditions is defined as 1 U of ⁇ -glutamylvalylglycine synthase activity.
  • Glutathione synthase includes GshB protein encoded by gshB gene and Gsh2 protein encoded by GSH2 gene.
  • Examples of the gshB gene include gshB genes of Escherichia bacteria such as Escherichia coli.
  • Examples of the GSH2 gene include GSH2 gene of Saccharomyces cerevisiae and other Saccharomyces yeasts.
  • Examples of glutathione synthetase include mutant glutathione synthetase described in WO2013 / 054447.
  • the base sequence of the gshB gene of Escherichia coli K-12 MG1655 strain corresponds to the sequence at positions 3,089,900 to 3,090,850 in the genome sequence registered in the NCBI database as GenBank accession NC_000913.3.
  • the nucleotide sequence of the gshB gene of MG1655 strain (same for Escherichia coli K-12 W3110 strain) is shown in SEQ ID NO: 27.
  • the amino acid sequence of the protein encoded by the same gene is shown in SEQ ID NO: 28. That is, glutathione synthetase may be a protein encoded by a gene having the base sequence shown in SEQ ID NO: 27, for example.
  • the glutathione synthetase may be a protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 28, for example.
  • the glutathione synthetase may be a variant of the above glutathione synthetase as long as it has ⁇ -glutamylvalylglycine synthetase activity.
  • the above-mentioned descriptions concerning the conservative variants of the YBDK and ybdK genes can be applied mutatis mutandis.
  • gshB gene and GshB protein include conservative variants thereof in addition to the gshB gene and GshB protein exemplified above, respectively.
  • Gsh2 gene and Gsh2 protein are intended to include conservative variants thereof in addition to the GSH2 gene and Gsh2 protein exemplified above, respectively.
  • the glutathione synthetase may be a fusion protein with another peptide.
  • the description regarding the fusion protein in the above-mentioned ⁇ -glutamyl valine synthase can be applied mutatis mutandis.
  • Glutathione synthase can be produced by expressing a glutathione synthase gene in a host having a gene encoding glutathione synthase (also referred to as “glutathione synthase gene”). “Having a glutathione synthase gene” is also referred to as “having a glutathione synthase”. That is, for example, a host having a glutathione synthetase gene is also referred to as a “host having a glutathione synthetase”. The expression of glutathione synthetase gene is also referred to as “expression of glutathione synthetase”.
  • a host having a glutathione synthetase gene may be one that inherently has a glutathione synthetase gene or may be modified to have a glutathione synthetase gene.
  • Examples of the host having the glutathione synthase gene inherently include microorganisms such as Escherichia coli having the gshB gene and Saccharomyces cerevisiae having the GSH2 gene.
  • Examples of the host modified to have the glutathione synthetase gene include a host into which the glutathione synthetase gene has been introduced.
  • the host into which the glutathione synthetase gene is introduced is not particularly limited as long as it can express a functional glutathione synthetase.
  • the host include bacteria, actinomycetes, yeast, fungi, plant cells, insect cells, and animal cells.
  • Preferred hosts include microorganisms such as bacteria and yeast.
  • bacteria include Escherichia bacteria, Enterobacter bacteria, Pantoea bacteria such as Enterobacteriaceae bacteria, Corynebacterium bacteria, etc.
  • Examples include coryneform bacteria and bacteria belonging to the genus Bacillus. Among them, Escherichia coli can be preferably used as the host.
  • modification of the host such as introduction of the glutathione synthetase gene
  • the above description regarding the modification of the host such as introduction of the ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be applied mutatis mutandis.
  • Materials used for host modification such as vectors and promoters can be appropriately selected depending on the type of host.
  • the host for expressing the glutathione synthetase gene may be modified so that the activity of YBDK decreases.
  • the host for expressing the glutathione synthetase gene may be modified so that the activity of ⁇ -glutamylcysteine synthetase is reduced.
  • the host for expressing the glutathione synthetase gene may be modified so that the activity of the protein involved in the degradation of ⁇ -glutamyl peptide such as ⁇ -glutamyltransferase (GGT) is reduced.
  • GTT ⁇ -glutamyltransferase
  • the microorganism of the present invention can also be used as an expression host for glutathione synthetase. That is, the microorganism of the present invention may have a glutathione synthetase gene. The microorganism of the present invention may have both a glutathione synthase gene and a ⁇ -glutamyl valine synthase gene.
  • Glutathione synthase can also be produced by expressing a glutathione synthase gene in a cell-free protein synthesis system.
  • the above description regarding the production of ⁇ -glutamyl valine synthase using a host having a ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be applied mutatis mutandis.
  • Cells may be appropriately read as “cells” depending on the type of host.
  • the produced glutathione synthetase (a purified glutathione synthetase or a fraction containing glutathione synthetase) can be used as the “glutathione synthase” in the method of the present invention.
  • Glutathione synthase may be produced alone or together with ⁇ -glutamylvaline synthase. That is, when the microorganism of the present invention has both a glutathione synthetase gene and a ⁇ -glutamyl valine synthase gene, the microorganism of the present invention expresses these genes, thereby allowing glutathione synthetase and ⁇ -glutamyl valine synthase to be expressed. Can be manufactured together.
  • ⁇ 4> Method for Producing ⁇ -Glutamylvalylglycine ( ⁇ -Glu-Val-Gly)
  • the present invention utilizes a method for producing ⁇ -Glu-Val using ⁇ -glutamylvaline synthase and ⁇ -glutamylvaline synthase
  • a method for producing ⁇ -Glu-Val-Gly (CAS 38837-70-6, also called Gluvalicine) is provided. These methods are collectively referred to as “the method of the present invention”.
  • the structural formula of ⁇ -Glu-Val-Gly is shown in the following formula (I).
  • the present invention provides a method for enzymatically producing ⁇ -Glu-Val-Gly using ⁇ -glutamyl valine synthase. This method is also referred to as “a method for producing ⁇ -Glu-Val-Gly of the present invention (enzyme method)”.
  • ⁇ -Glu-Val can be produced by reacting Glu and Val by using ⁇ -glutamylvaline synthase. That is, the present invention provides a method for producing ⁇ -Glu-Val comprising (A) a step of producing ⁇ -Glu-Val by allowing ⁇ -glutamylvaline synthase to act on Glu and Val. This method is also referred to as “a method for producing ⁇ -Glu-Val of the present invention (enzyme method)”. The produced ⁇ -Glu-Val can be appropriately recovered from the reaction solution.
  • ⁇ -Glu-Val-Gly can be produced using the generated ⁇ -Glu-Val as a raw material.
  • a method for producing ⁇ -Glu-Val-Gly using ⁇ -Glu-Val as a raw material a method using glutathione synthetase is known (Japanese Patent Laid-Open No. 2012-85637). Specifically, by using glutathione synthetase, ⁇ -Glu-Val and Gly can be reacted to generate ⁇ -Glu-Val-Gly.
  • one embodiment (also referred to as “first embodiment”) of the production method (enzyme method) of ⁇ -Glu-Val-Gly according to the present invention is to allow (A) ⁇ -glutamylvaline synthase to act on Glu and Val.
  • the step (A) and the step (B) may be performed separately, or may be performed simultaneously in part or all of the periods. That is, for example, the step (A) and the step (B) may be started at the same time, or the step (B) may be started during or after the completion of the step (A).
  • step (A) and step (B) can be started simultaneously.
  • step (A) is started under conditions where glutathione synthase and / or Gly are not present in the reaction system, and glutathione synthase and / or Gly is present in the reaction system during or after the completion of the step (A).
  • a process (B) can be started.
  • ⁇ -Glu-Val generated in step (A) may be recovered, and step (B) may be performed using the recovered ⁇ -Glu-Val.
  • ⁇ -Glu-Val may be used in step (B) after being appropriately subjected to treatments such as purification, dilution, concentration, drying and dissolution.
  • process (A) of the manufacturing method (enzyme method) of (gamma) -Glu-Val of this invention can be implemented by the aspect similar to implementing the process (A) of a 1st aspect independently, for example.
  • ⁇ -Glu-Val-Gly can be produced by reacting Glu, Val and Gly by using ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase. That is, another embodiment (also referred to as “second embodiment”) of the production method (enzyme method) of ⁇ -Glu-Val-Gly of the present invention comprises (C) ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase. A process for producing ⁇ -Glu-Val-Gly by acting on Glu, Val, and Gly.
  • ⁇ -glutamylvaline synthase, glutathione synthase, Glu, Val, and Gly are allowed to coexist in the reaction system, so that ⁇ -Glu-Val-Gly can be produced by collectively acting on Gly.
  • ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase are also collectively referred to as “enzyme”.
  • Glu, Val, and Gly are also collectively referred to as “amino acids”.
  • ⁇ -Glu-Val and ⁇ -Glu-Val-Gly are also collectively referred to as “peptides”.
  • Glu, Val, Gly, and ⁇ -Glu-Val are also collectively referred to as “substrate”.
  • the “substrate” may further include ATP unless otherwise specified.
  • the reaction between an enzyme and the corresponding substrate is also called an “enzymatic reaction”.
  • “ ⁇ -glutamyl valine synthase” refers to those obtained using the microorganism of the present invention as an expression host.
  • each enzyme used in the method of the present invention is as described above. That is, as each enzyme, for example, a purified enzyme, an arbitrary fraction containing the enzyme, or a combination thereof can be used. As each enzyme, one type of enzyme may be used, or two or more types of enzymes may be used in combination.
  • amino acid a commercially available product may be used, and an amino acid produced and obtained as appropriate may be used.
  • the production method of the amino acid is not particularly limited, and for example, a known method can be used.
  • Amino acids can be produced, for example, by chemical synthesis, enzymatic reaction, or a combination thereof.
  • An amino acid can be produced, for example, by culturing a microorganism capable of producing the amino acid and recovering the amino acid from the culture.
  • a microorganism having an amino acid-producing ability for example, an amino acid-producing bacterium as described later can be used.
  • an amino acid can be manufactured by collect
  • amino acid a purified product purified to a desired level may be used, or a material containing the amino acid may be used.
  • the material containing an amino acid is not particularly limited as long as it contains the amino acid in such a manner that the enzyme can act on the amino acid.
  • Specific examples of the amino acid-containing material include, for example, a culture obtained by culturing a microorganism having the ability to produce the amino acid, a culture supernatant separated from the culture, and a cell isolated from the culture And processed products such as concentrates (concentrated liquids) and concentrated dry products.
  • the amino acid and the peptide may be a free form, a salt thereof, or a mixture thereof. That is, the term “amino acid” may mean a free amino acid, a salt thereof, or a mixture thereof, unless otherwise specified.
  • the term “peptide” may mean a free peptide, a salt thereof, or a mixture thereof, unless otherwise specified.
  • the salt is not particularly limited as long as it is chemically acceptable.
  • the salt of ⁇ -Glu-Val-Gly is a chemically acceptable edible salt. If there is no particular limitation.
  • “chemically acceptable edible salt” specifically, for acidic groups such as carboxyl groups, ammonium salts, salts with alkali metals such as sodium and potassium, calcium and magnesium, etc. Salts with alkaline earth metals, aluminum salts, zinc salts, salts with organic amines such as triethylamine, ethanolamine, morpholine, pyrrolidine, piperidine, piperazine, dicyclohexylamine, salts with basic amine acids such as arginine and lysine Can be mentioned.
  • acidic groups such as carboxyl groups, ammonium salts, salts with alkali metals such as sodium and potassium, calcium and magnesium, etc. Salts with alkaline earth metals, aluminum salts, zinc salts, salts with organic amines such as triethylamine, ethanolamine, morpholine, pyrrolidine, piperidine, piperazine, dicyclohexylamine, salts with basic amine acids such as arginine and lysine
  • a “chemically acceptable edible salt” specifically, for a basic group, for example, with an inorganic acid such as hydrochloric acid, sulfuric acid, phosphoric acid, nitric acid, hydrobromic acid, etc. Salt, acetic acid, citric acid, benzoic acid, maleic acid, fumaric acid, tartaric acid, succinic acid, tannic acid, butyric acid, hibenzic acid, pamoic acid, enanthic acid, decanoic acid, teocric acid, salicylic acid, lactic acid, oxalic acid, mandelic acid And salts with organic carboxylic acids such as malic acid and salts with organic sulfonic acids such as methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid and p-toluenesulfonic acid.
  • an inorganic acid such as hydrochloric acid, sulfuric acid, phosphoric acid, nitric acid, hydrobromic acid, etc. Salt, ace
  • Enzymatic reaction can be achieved by allowing the enzyme and the substrate to coexist in the reaction solution. That is, the enzyme reaction can be carried out in a suitable reaction solution.
  • the enzyme reaction may be performed in a batch system or a column system. In the case of the batch type, the enzyme reaction can be carried out by mixing the enzyme and the substrate in the reaction solution in the reaction vessel. The enzyme reaction may be performed by standing or may be performed with stirring or shaking.
  • the enzyme reaction can be carried out by passing a reaction solution containing a substrate through a column filled with immobilized cells or immobilized enzyme.
  • the reaction solution water, a buffer solution or the like containing necessary components can be used.
  • the reaction solution may contain, for example, an enzyme, a substrate, ATP, and a divalent metal ion.
  • the combination of components used for the enzyme reaction can be appropriately selected according to the type of process to be performed and the embodiment thereof (whether a plurality of processes are performed simultaneously).
  • Both ⁇ -glutamyl valine synthase and glutathione synthase utilize ATP for the enzymatic reaction. Therefore, ATP is appropriately supplied to the reaction system. That is, the reaction system (reaction solution) may contain ATP. Any of the steps (A) to (C) can be carried out in the presence of ATP.
  • the method for supplying ATP is not particularly limited as long as ATP can be used for the enzymatic reaction.
  • ATP can be added to the reaction solution in any form such as powder or aqueous solution. ATP may be supplied to the reaction system by, for example, a method for generating or regenerating ATP.
  • a method of generating or regenerating ATP As a method of generating or regenerating ATP, a method of supplying ATP from a carbon source using Corynebacterium bacteria (Hori, H et al., Appl.lMicrobiol. Biotechnol. 48 (6): 693-698 ( 1997)), ATP regeneration using yeast cells and glucose (Yamamoto, S et al., Biosci. Biotechnol. Biochem. 69 (4): 784-789 (2005)), phosphoenolpyruvate and Regenerating ATP using pyruvate kinase (C. (Aug'e and Ch. Gautheron, Tetrahedron Lett.
  • the reaction system may contain a divalent metal ion.
  • Any of the steps (A) to (C) can be carried out in the presence of a divalent metal ion.
  • the divalent metal ion is not particularly limited as long as ⁇ -glutamyl valine synthase activity can be obtained.
  • Examples of the divalent metal ion include Mg 2+ and Mn 2+ , and a preferable divalent metal ion includes Mg 2+ .
  • the concentration of the divalent metal ion may be, for example, 1 to 200 mM.
  • Reaction conditions are not particularly limited as long as ⁇ -Glu-Val-Gly is produced.
  • the pH of the reaction solution may be, for example, usually 6.0 to 10.0, preferably 6.5 to 9.0.
  • the reaction temperature may be, for example, usually 15 to 50 ° C., preferably 15 to 45 ° C., more preferably 20 to 40 ° C.
  • the reaction time may be, for example, 5 minutes to 200 hours for each of the step (A) and the step (B) of the first aspect.
  • the reaction time may be, for example, 5 minutes to 200 hours for the step (C) of the second embodiment.
  • the flow rate of the reaction solution may be a rate such that the reaction time is within the range of the reaction time exemplified above.
  • the concentration of each substrate in the reaction solution may be, for example, usually 0.1 to 2000 mM, preferably 1 to 2000 mM, more preferably 10 to 1000 mM.
  • the molar ratio of each substrate in the first aspect is appropriately referred to the molar ratio of each substrate in the second aspect. May be.
  • the amount of enzyme used can be set based on the enzyme activity, for example.
  • the amount of ⁇ -glutamylvaline synthase used is usually 0.01 to 1000 U, preferably 0.1 to 500 U, for example, in terms of ⁇ -Glu-Val production activity, with respect to the total amount of 1 mmol of Glu and Val. More preferably, it may be 0.1 to 100 U.
  • “ ⁇ -Glu-Val production activity” is measured under appropriate conditions, for example, in the presence of Mg 2+ or Mn 2+ , particularly in the presence of Mg 2+ , pH 7.0 to 9.0, especially pH 9.0. ⁇ -Glu-Val production activity.
  • the amount of glutathione synthase used is, for example, converted to ⁇ -Glu-Val-Gly production activity with respect to 1 mmol of the total amount of ⁇ -Glu-Val and Gly. In general, it may be 0.01 to 1000 U, preferably 0.1 to 500 U, more preferably 0.1 to 100 U.
  • the amount of glutathione synthetase used in the step (C) of the second embodiment is, for example, ⁇ -Glu-Val-Gly with respect to the total amount of 1 mmol of Glu half amount, Val half amount, and Gly total amount. In terms of the production activity, it may be generally 0.01 to 1000 U, preferably 0.1 to 500 U, more preferably 0.1 to 100 U.
  • the usage-amount of the glutathione synthetase in a 1st aspect is suitably used. It may be helpful.
  • reaction conditions may be uniform from the start to the end of the enzyme reaction, or may change during the enzyme reaction. “The reaction conditions change in the course of the enzymatic reaction” includes not only that the reaction conditions change temporally but also that the reaction conditions change spatially. “Reaction conditions vary spatially” means that, for example, when a column-type enzyme reaction is performed, reaction conditions such as reaction temperature and enzyme concentration differ depending on the position on the flow path.
  • a reaction solution containing ⁇ -Glu-Val-Gly can be obtained.
  • the formation of ⁇ -Glu-Val-Gly can be confirmed by a known method used for detection or identification of a compound. Examples of such a method include HPLC, LC / MS, GC / MS, and NMR. One of these methods may be used alone, or two or more thereof may be used in appropriate combination.
  • ⁇ -Glu-Val-Gly can be appropriately recovered from the reaction solution. The recovery of ⁇ -Glu-Val-Gly can be performed by a known method used for separation and purification of compounds.
  • ⁇ -Glu-Val-Gly may contain components other than ⁇ -Glu-Val-Gly, such as components and moisture used for the production of ⁇ -Glu-Val-Gly.
  • ⁇ -Glu-Val-Gly may be purified to a desired degree.
  • ⁇ -Glu-Val-Gly is, for example, 30% (w / w) or more, 50% (w / w) or more, 70% (w / w) or more, 80% (w / w) or more, 90% ( It may be purified to a purity of w / w) or higher, or 95% (w / w) or higher. Further, ⁇ -Glu-Val can be recovered in the same manner as ⁇ -Glu-Val-Gly.
  • the present invention provides a method for producing ⁇ -Glu-Val-Gly by fermentation using ⁇ -glutamylvaline synthase. Specifically, the present invention provides a method for producing ⁇ -Glu-Val-Gly by fermentation using a microorganism having ⁇ -glutamyl valine synthase. This method is also referred to as “a method for producing ⁇ -Glu-Val-Gly of the present invention (fermentation method)”.
  • ⁇ -Glu-Val can be produced by fermentation from Glu and Val. That is, the present invention relates to a method for producing ⁇ -Glu-Val comprising (A) a step of producing ⁇ -Glu-Val from Glu and Val by culturing a microorganism having ⁇ -glutamylvaline synthase in a medium. provide. This method is also referred to as “a method for producing ⁇ -Glu-Val of the present invention (fermentation method)”. The produced ⁇ -Glu-Val can be appropriately recovered from the culture.
  • ⁇ -Glu-Val-Gly can be produced by fermentation from ⁇ -Glu-Val and Gly. That is, one embodiment (also referred to as “third embodiment”) of the production method (fermentation method) of ⁇ -Glu-Val-Gly of the present invention is (A) culturing a microorganism having ⁇ -glutamylvaline synthase in a medium.
  • step (B) culturing a microorganism having glutathione synthase in a medium to produce ⁇ from ⁇ -Glu-Val and Gly produced in step (A)
  • a method for producing ⁇ -Glu-Val-Gly which comprises a step of producing -Glu-Val-Gly.
  • the step (A) and the step (B) may be performed separately, or may be performed simultaneously during a part or all of the periods. That is, for example, the step (A) and the step (B) may be started at the same time, or the step (B) may be started during or after the completion of the step (A).
  • the step (A) and the step (B) may be carried out using a microorganism having ⁇ -glutamylvaline synthase and a microorganism having a glutathione synthetase which is separate from the microorganism. A single microorganism having both ⁇ -glutamyl valine synthase and glutathione synthase may be used.
  • step (A) and step (B) are simultaneously performed.
  • the ⁇ -Glu-Val produced in the step (A) may be recovered, and the recovered ⁇ -Glu-Val may be added to the medium to perform the step (B).
  • ⁇ -Glu-Val may be used in step (B) after being appropriately subjected to treatments such as purification, dilution, concentration, drying and dissolution.
  • process (A) of the manufacturing method (fermentation method) of (gamma) -Glu-Val of this invention can be implemented by the aspect similar to implementing the process (A) of a 3rd aspect independently, for example.
  • ⁇ -Glu-Val-Gly can be fermented from Glu, Val, and Gly by using a microorganism having both ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase. That is, another embodiment (also referred to as “fourth embodiment”) of the production method (fermentation method) of ⁇ -Glu-Val-Gly of the present invention has (C) ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase.
  • a method for producing ⁇ -Glu-Val-Gly comprising a step of producing ⁇ -Glu-Val-Gly from Glu, Val, and Gly by culturing a microorganism in a medium.
  • microorganisms having ⁇ -glutamylvaline synthase In the fermentation method, terms such as enzyme, amino acid, peptide, substrate and enzyme reaction are used in the same meaning as in the enzyme method.
  • microorganisms having ⁇ -glutamylvaline synthase, microorganisms having glutathione synthase, and microorganisms having ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase are also collectively referred to as “microorganisms”.
  • microorganism having ⁇ -glutamyl valine synthase refers to the microorganism of the present invention having ⁇ -glutamyl valine synthase.
  • the “microorganism having both ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase” refers to the microorganism of the present invention having both ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase. Point to.
  • each amino acid serving as a substrate is not particularly limited as long as the amino acid can be used in an enzyme reaction.
  • each amino acid may be biosynthesized by a microorganism used in each step, added to a medium, or a combination thereof. That is, for example, all of Glu, Val, and Gly may be biosynthesized by microorganisms, and all of Glu, Val, and Gly may be added to the medium. Further, for example, one or two amino acids of Glu, Val, and Gly may be biosynthesized by a microorganism, and other amino acids may be added to the medium. Any of Glu, Val, and Gly may be biosynthesized by a microorganism and added to the medium.
  • one embodiment of the production method (fermentation method) of ⁇ -Glu-Val of the present invention is, for example, (A1) by culturing a microorganism having ⁇ -glutamylvaline synthase in a medium containing Glu and Val.
  • a method for producing ⁇ -Glu-Val comprising a step of producing -Glu-Val, wherein (A2) a microorganism having ⁇ -glutamylvaline synthase and having the ability to produce Glu and Val It may be a method for producing ⁇ -Glu-Val comprising a step of producing ⁇ -Glu-Val by culturing in a medium.
  • one aspect of the third aspect is, for example, a method for producing ⁇ -Glu-Val-Gly including any one of (A1) and (A2) and (B1) and (B2). May be: (A1) A step of producing ⁇ -Glu-Val by culturing a microorganism having ⁇ -glutamylvaline synthase in a medium containing Glu and Val; (A2) producing ⁇ -Glu-Val by culturing a microorganism having ⁇ -glutamylvaline synthase and having the ability to produce Glu and Val in a medium; (B1) A step of producing ⁇ -Glu-Val-Gly by culturing a microorganism having glutathione synthase in a medium containing ⁇ -Glu-Val and Gly produced in step (A1) or (A2); (B2) ⁇ -Glu-Val by culturing a microorganism having glutathione synthase and having the ability to produce Gly in a medium containing ⁇
  • one aspect of the fourth aspect is, for example, by culturing a microorganism having (C1) ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase in a medium containing Glu, Val, and Gly.
  • a step of producing ⁇ -Gly-Gly-Vly-Gly, comprising (C2) ⁇ -glutamylvaline synthase and glutathione synthase, and Glu, Val, and Gly A method of producing ⁇ -Glu-Val-Gly, which comprises culturing a microorganism having the production ability of ⁇ -Glu-Val-Gly in a medium.
  • the microorganism having ⁇ -glutamyl valine synthase As the microorganism having ⁇ -glutamyl valine synthase, the microorganism of the present invention as described above and having the ⁇ -glutamyl valine synthase gene can be used as it is or after being appropriately modified.
  • the microorganism having glutathione synthetase As the microorganism having glutathione synthetase, the microorganism having the glutathione synthetase gene as described above can be used as it is or after being appropriately modified.
  • the microorganism having ⁇ -glutamyl valine synthase and glutathione synthase As the microorganism having ⁇ -glutamyl valine synthase and glutathione synthase, the microorganism of the present invention as described above, which has both ⁇ -glutamyl valine synthase gene and glutathione synthase gene, is used as it is or It can be used with appropriate modifications.
  • the microorganism having an amino acid-producing ability may be one that originally has an amino acid-producing ability, or one that has been modified to have an amino acid-producing ability.
  • a microorganism having an amino acid-producing ability can be obtained by imparting an amino acid-producing ability to a microorganism, or by enhancing the amino acid-producing ability of a microorganism. Either the provision or enhancement of enzyme production ability such as introduction of ⁇ -glutamyl valine synthase gene and / or glutathione synthetase gene and the provision or enhancement of amino acid production ability may be performed first.
  • a microorganism having ⁇ -glutamyl valine synthase and / or glutathione synthase and capable of producing an amino acid is a microorganism having ⁇ -glutamyl valine synthase and / or glutathione synthase. It may be obtained by modifying so as to have it, or it may be obtained by modifying a microorganism having amino acid-producing ability so as to have ⁇ -glutamylvaline synthase and / or glutathione synthase.
  • L-amino acid-producing ability can be imparted or enhanced by a method conventionally used for breeding amino acid-producing bacteria such as coryneform bacteria or Escherichia bacteria (Amino Acid Fermentation, Academic Publishing Center, Inc., 1986). (May 30, 1st edition issued, see pages 77-100). Examples of such methods include acquisition of auxotrophic mutants, acquisition of L-amino acid analog-resistant strains, acquisition of metabolic control mutants, and recombination with enhanced activity of L-amino acid biosynthetic enzymes. The creation of stocks.
  • the L-amino acid-producing ability can be imparted or enhanced by reducing the activity of an enzyme that catalyzes a reaction that branches from the biosynthetic pathway of the target L-amino acid to produce a compound other than the target L-amino acid. It can be carried out.
  • an odhA-deficient strain obtained from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium lactofermentum) ATCC 13869 was introduced into a recombinant strain in which the mviN gene having a V197M mutation was introduced (JP 2010- 161970), Pantoea agglomerans strain AJ13355 (patent No.
  • gltA citrate synthase
  • Brevibacterium lactofermentum a gltA gene derived from Brevibacterium lactofermentum
  • tyrosine residue at position 397 of glutamine synthetase is replaced with other amino acid residues
  • Examples include bacteria belonging to the genus Escherichia having a substituted glutamine synthetase (US Patent Application Publication No. 2003-0148474).
  • L-valine-producing bacteria include Escherichia coli VL1970 strain (US Pat. No. 5,658,766), a genus belonging to the genus Escherichia, and a mutation that requires lipoic acid for growth and / or a mutation that lacks H + -ATPase.
  • Escherichia in which a DNA fragment containing the ilvGMEDA operon that expresses at least each gene of ilvG, ilvM, ilvE, and ilvD and does not express threonine deaminase activity has been introduced into the cell.
  • Examples include genus bacteria (WO96 / 06926). That is, for example, amino acid-producing ability can be imparted or enhanced by introducing these modifications into a microorganism.
  • the microorganism may be modified so that the ability to take in the amino acid added to the medium is improved.
  • the microorganism may be modified so as to improve the ability to discharge the produced ⁇ -Glu-Val out of the microbial cell according to the utilization mode, and the ⁇ -Glu-Val added to the medium may be changed. It may be modified to improve the ability to capture.
  • the microorganism may be modified so that the ability to discharge the produced ⁇ -Glu-Val-Gly out of the cell body is improved.
  • Culture conditions are not particularly limited as long as microorganisms can grow and ⁇ -Glu-Val-Gly is produced.
  • the description of the culture conditions in the above-described method for producing ⁇ -glutamylvaline synthase can be referred to.
  • Both ⁇ -glutamyl valine synthase and glutathione synthase utilize ATP for the enzymatic reaction. Therefore, ATP is appropriately supplied to the reaction system. That is, the reaction system may contain ATP. Any of the steps (A) to (C) can be carried out in the presence of ATP.
  • the method for supplying ATP is not particularly limited as long as ATP can be used for the enzymatic reaction. ATP may be produced, for example, by a microorganism used in each step, or may be supplied to the reaction system by a method for producing or regenerating ATP as described above.
  • a co-culture system such as a method in which a microorganism having an enhanced ATP regeneration system by normal energy metabolism or a microorganism having the ability to regenerate ATP by the action of polyphosphate kinase coexists in a culture solution ( JP-B-7-16431 and JP-B-6-69386) can be preferably used.
  • ⁇ -glutamyl valine synthase usually requires a divalent metal ion for the enzyme reaction. Therefore, the reaction system may contain a divalent metal ion. Any of the steps (A) to (C) can be carried out in the presence of a divalent metal ion.
  • the amino acid When using a medium containing an amino acid, the amino acid may be contained in the medium from the beginning of the culture or may be added to the medium at any time during the culture.
  • the timing of addition can be appropriately changed according to various conditions such as the culture time. As an example, it is preferably 0 to 50 hours before the end of the culture, more preferably 0.1 to 24 hours, and particularly preferably 0. .5-6 hours ago.
  • the amino acid may be added once or multiple times, or may be added continuously.
  • the concentration of each amino acid in the medium may be, for example, usually 0.1 to 2000 mM, preferably 1 to 2000 mM, more preferably 10 to 1000 mM.
  • the description regarding the molar ratio of each substrate in the reaction liquid in an enzyme method may apply mutatis mutandis.
  • ⁇ -Glu-Val-Gly By culturing in this way, a culture containing ⁇ -Glu-Val-Gly can be obtained. Generation of ⁇ -Glu-Val-Gly can be confirmed by a known technique used for detection or identification of a compound as described above. ⁇ -Glu-Val-Gly can be appropriately recovered from the culture. As described above, ⁇ -Glu-Val-Gly can be recovered by a known method used for separation and purification of compounds. In the case where L-amino acid accumulates in the microbial cells, for example, the microbial cells are crushed with ultrasonic waves, and the microbial cells are removed from the supernatant obtained by centrifugation to obtain ⁇ - Glu-Val-Gly can be recovered.
  • the yeast when the microorganism having glutathione synthetase is yeast and ⁇ -Glu-Val-Gly accumulates in the microbial cells, the yeast can be used, for example, for the production of a yeast extract containing ⁇ -Glu-Val-Gly. it can. That is, the present invention provides a method for producing a yeast extract containing ⁇ -Glu-Val-Gly, which comprises preparing a yeast extract using the yeast as a raw material. Preparation of yeast extract from yeast may be carried out in the same manner as normal yeast extract preparation.
  • the yeast extract may be one obtained by treating a yeast cell extracted with hot water, or one obtained by digesting a yeast cell.
  • the obtained yeast extract may be concentrated as needed, and may be dried and made into a powder form.
  • Example 1 Construction of ybdK gene expression plasmid
  • the expression plasmid pSF12-EcybdK of Escherichia coli MG1655 (ATCC 47076) was constructed by the following procedure.
  • the nucleotide sequence of the ybdK gene and the YBDK amino acid sequence encoded thereby are shown in SEQ ID NO: 15 and SEQ ID NO: 16, respectively.
  • YBDK is expressed in a form in which a His tag is added to the C-terminus.
  • the pUC18-derived plasmid pSF12_ggt (WO2013 / 051685A1) containing the ggt gene encoding the ⁇ -glutamyl transpeptidase derived from Escherichia coli W3110 (ATCC 27325) and the rpoH promoter was digested with NdeI / PstI, and QIAquick Gel Extraction Kit ( Qiagen) to obtain a fragment of about 3.0 kb.
  • PCR was performed according to the manufacturer's protocol using PrimeSTAR Max polymerase (manufactured by Takara Bio Inc.) using the genomic DNA of Escherichia coli MG1655 as a template to obtain a fragment of about 1.2 kb containing the ybdK gene.
  • PrimeSTAR Max polymerase manufactured by Takara Bio Inc.
  • sequence number 1 and sequence number 2 Table 1
  • plasmid was extracted from the grown colonies of the transformant according to a known method, the nucleotide sequence was confirmed using 3130 Genetic Analyzer (manufactured by Life Technologies), and the plasmid having the desired structure was named pSF12-EcybdK .
  • Example 2 Purification of YBDK derived from Escherichia coli MG1655 strain with a His tag added to the C terminus Inoculate 3 mL of LB medium containing 100 ⁇ g / mL Amp with the JM109 strain having the pSF12-EcybdK plasmid obtained in Example 1 The preculture solution was obtained by shaking culture at 30 ° C. and 120 reciprocations / min for 20 hours.
  • the cells are collected by centrifugation (4 ° C, 12,000 ⁇ g, 5 minutes), and the resulting cells are added to 0.2 mL of buffer solution (20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 300 mM NaCl, 10 mM imidazole, 15% The cells were suspended in glycerol and subjected to ultrasonic disruption while cooling to disrupt the cells. The obtained cell disruption solution was centrifuged (4 ° C., 29,100 ⁇ g, 10 minutes), and the resulting supernatant was used as a cell-free extract.
  • buffer solution (20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 300 mM NaCl, 10 mM imidazole, 15%
  • the cells were suspended in glycerol and subjected to ultrasonic disruption while cooling to disrupt the cells.
  • the obtained cell disruption solution was centrifuged (4 ° C., 29,100 ⁇ g, 10 minutes), and the resulting supernatant was used as a cell-free extract.
  • the resulting cell-free extract was equilibrated with a buffer solution (20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 300 mM NaCl, 10 mM mM imidazole, 15%% glycerol) in advance.
  • the enzyme was eluted with elution buffer (20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 300 mM NaCl, 250 mM mM imidazole, 15% glycerol) to obtain an active fraction. This active fraction was used as purified YBDK in subsequent experiments.
  • Example 3 Production of ⁇ -glutamyl dipeptide by purified YBDK The purified YBDK obtained in Example 2 was measured for ⁇ -Glu-Val synthetic activity and ⁇ -Glu-Gly synthetic activity.
  • the measurement conditions for ⁇ -Glu-Val synthetic activity are as follows.
  • the reaction solution composition is 10 mM glutamic acid, 10 mM valine, was 10 mM ATP, 10 mM MnS0 4 , 100 mM Tris-HCl (pH7.0).
  • the reaction volume was 0.2 mL, and the enzyme reaction was started by adding purified enzyme. At this time, purified YBDK was added to the reaction solution so as to be 0.1 g / L.
  • the reaction temperature was 30 ° C., and the reaction time was 30 minutes. When stopping the reaction, 0.2 mL of 200 mM sulfuric acid was added to 0.2 mL of the reaction solution.
  • ⁇ -Glu-Val produced by HPLC was quantified.
  • the enzyme activity that produces 1 ⁇ mol of ⁇ -Glu-Val per minute under these conditions was defined as 1 U ⁇ -Glu-Val synthesis activity.
  • Quantitative conditions for ⁇ -Glu-Val are as follows. As the column, Phenomenex Synergi 4 ⁇ Hydro-RP-80A (particle size 4 ⁇ m, inner diameter 4.6 mm, length 250 mm) was used. Eluent A (50 mM sodium dihydrogen phosphate (pH 2.5, pH adjusted with phosphoric acid)) and eluent B (eluent A and acetonitrile 1: 1 (v / v)) A mixed solution in which the mixed solution was mixed at a ratio of 93: 7 (v / v) was used. The flow rate was 1.0 mL / min, the column temperature was 40 ° C, and the UV detection wavelength was 210 nm.
  • valine in the reaction solution was replaced with glycine, and purified YBDK was added to the reaction solution so as to be 0.025 ⁇ g / L, and an enzyme reaction was performed. After stopping the reaction by the above procedure, the produced ⁇ -Glu-Gly was quantified.
  • the enzyme activity that produces 1 ⁇ mol of ⁇ -Glu-Gly per minute under these conditions was defined as 1 ⁇ U ⁇ -Glu-Gly synthetic activity.
  • Quantitative conditions for ⁇ -Glu-Gly are as follows.
  • Inertsil-ODS-3 particle size: 5 ⁇ m, inner diameter: 4.6 mm, length: 250 mm
  • the eluent C 100 mM potassium dihydrogen phosphate, 5 mM sodium octanesulfonate (pH 2.2, pH adjusted with phosphoric acid)
  • the flow rate was 1.5 mL / min
  • the column temperature was 40 ° C
  • the UV detection wavelength was 210 nm.
  • the specific activity was calculated by quantifying the amount of ⁇ -Glu-Val and ⁇ -Glu-Gly produced by the above method.
  • the results are shown in Table 2.
  • ⁇ Reaction (A) '' is the specific activity of ⁇ -Glu-Gly synthetic activity
  • ⁇ Reaction (B) '' is the specific activity of ⁇ -Glu-Val synthetic activity
  • ⁇ (B) / (A) '' The ratio of specific activity of ⁇ -Glu-Val synthetic activity to specific activity of ⁇ -Glu-Gly synthetic activity is shown respectively.
  • Example 4 Production of triple disruption strains of Escherichia coli JM109 strain-derived ggt gene, gshA gene, and ybdK gene (1) Preparation of Escherichia coli JM109 strain-derived ggt gene disruption strain Escherichia coli JM109 strain as a parent strain A non-GGT producing strain was constructed. The nucleotide sequence of the ggt gene and the amino acid sequence of GGT encoded thereby are shown in SEQ ID NO: 25 and SEQ ID NO: 26, respectively.
  • the “Red-driven integration” method using a PCR product containing an antibiotic resistance gene obtained by PCR using a synthetic oligonucleotide designed as a primer corresponding to a part of the target gene on the 5 ′ side.
  • a gene-disrupted strain can be constructed.
  • the excision system derived from ⁇ phage the antibiotic resistance gene incorporated into the gene-disrupted strain can be removed.
  • PMW118-attL-Cm-attR (WO2006 / 078039) was used as a PCR template for the “Red-driven integration” method.
  • pMW118-attL-Cm-attR (WO2006 / 078039) is a plasmid in which pMW118 (manufactured by Nippon Gene) is inserted with the attL and attR genes which are attachment sites of ⁇ phage and the cat gene which is an antibiotic resistance gene. Inserted in the order cat-attR.
  • PCR is performed using a synthetic oligonucleotide having a sequence corresponding to both ends of attL and attR at the 3 'end of the primer and a sequence corresponding to a part of the target gene at the 5' end of the primer as a primer.
  • a fragment was obtained.
  • a gene disruption strain was constructed using the obtained gene disruption fragment. The procedure is shown below.
  • the fragment for ggt gene disruption was obtained as follows. That is, PCR is performed according to the manufacturer's protocol with KOD-plus-Ver.2 (manufactured by Toyobo Co., Ltd.) using the genomic DNA of Escherichia coli JM109 strain as a template and the primers of SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4. Then, 0.3 kb upstream of the ggt gene was amplified to obtain DNA fragment A. Similarly, PCR was carried out using the genomic DNA of Escherichia coli JM109 strain as a template and the primers of SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6, thereby amplifying the 0.3 kb downstream region of the ggt gene to obtain DNA fragment C.
  • 1.6 kb DNA fragment B was obtained by performing PCR using pMW118-attL-Cm-attR as a template and primers of SEQ ID NO: 7 and SEQ ID NO: 8. Ten cycles of PCR reaction were performed with 50 ⁇ L of the PCR reaction solution at 50/10/50 ng of fragment A / B / C. Using this reaction solution (1 ⁇ L) as a template, a 2 kb DNA fragment was amplified using the primers of SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 6, purified with QIAquick Gel Extraction Kit (Qiagen), and fragment for ggt gene disruption Got. The primers used are shown in Table 3.
  • Plasmid pKD46 is a gene encoding Red recombinase of ⁇ Red homologous recombination system which is controlled by an arabinose-inducible P araB promoter (gamma, beta, exo genes) DNA fragment (GenBank / EMBL Accession of 2,154 bases of ⁇ phage containing the JO2459, positions 31088 to 33241), and a temperature-sensitive plasmid having replication ability. Plasmid pKD46 is necessary for integrating the DNA fragment for gene disruption into the chromosome of JM109 strain.
  • a competent cell for electroporation was prepared as follows. That is, Escherichia coli JM109 strain containing plasmid pKD46 cultured in LB medium containing 100 mg / L Amp at 30 ° C. for 20 hours, 2 mL SOB medium containing Amp (100 mg / L) (molecular cloning: experiment Laboratory Manual Second Edition, Sambrrok, J. et al., Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)). The obtained dilution was grown at 30 ° C. until OD610 reached about 0.3, 70 ⁇ L of 10% (v / v) L-arabinose was added, and the mixture was cultured at 37 ° C. for 1 hour. The obtained culture solution was concentrated 65 times and washed with 10% (v / v) glycerol three times to obtain a competent cell for electroporation.
  • pMW-intxis-ts (WO2007 / 037460) was used as a helper plasmid.
  • pMW-intxis-ts is a temperature-sensitive replication plasmid carrying a gene encoding ⁇ phage integrase (Int) and a gene encoding excisionase (Xis).
  • Int ⁇ phage integrase
  • Xis excisionase
  • the JM109 ⁇ ggt: att-cat strain obtained above was transformed with pMW-intxis-ts, cultured at 30 ° C on LB-agar medium containing 100 mg / L Amp, and an Amp resistant strain was selected. did.
  • the DNA fragment for gshA gene disruption was obtained using KMW-plus-Ver.2 (manufactured by Toyobo Co., Ltd.) using pMW118-attL-Cm-attR as a template and primers of SEQ ID NO: 9 and SEQ ID NO: 10 (Table 4). Obtained by performing PCR according to the manufacturer's protocol.
  • the gshA gene disruption DNA fragment was introduced into the JM109 ⁇ ggt strain containing pKD46 by electroporation.
  • a competent cell for electroporation of the JM109 ⁇ ggt strain containing pKD46 was obtained by the same method as that described in Example 4 (1).
  • the JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA: att-cat strain obtained above was transformed with pMW-intxis-ts, and 100 mg at 30 ° C. Cultured on LB-agar medium containing / L Amp, Amp-resistant strains were selected.
  • the ybdK gene disruption DNA fragment was prepared by using the manufacturer's protocol with PrimeSTAR Max polymerase (manufactured by Takara Bio Inc.) using pMW118-attL-Cm-attR as a template and primers of SEQ ID NO: 11 and SEQ ID NO: 12 (Table 5). Obtained by performing PCR according to The ybdK gene disruption DNA fragment was introduced into the JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA strain containing pKD46 by electroporation. A competent cell for electroporation of the JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA strain containing pKD46 was obtained by the same method as that described in Example 4 (1).
  • the JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA ⁇ ybdK: att-cat strain obtained above was transformed with pMW-intxis-ts, and 100 mg at 30 ° C. Cultured on LB-agar medium containing / L Amp, Amp-resistant strains were selected.
  • Example 5 Construction of a ⁇ -Glu-Val synthase expression strain derived from Cochlear rosea A double disruption strain (JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA) of the Escherichia coli JM109 strain and the gshA gene, ggt gene, gshA gene, and ybdK gene Using a triple disruption strain (JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA ⁇ ybdK) as an expression host, a co-clear rosea-derived ⁇ -Glu-Val synthase expression strain was constructed.
  • SEQ ID NO: 17 shows the nucleotide sequence of the KrgshA gene encoding ⁇ -Glu-Val synthase derived from the Cochlear rosea (AJ3132) strain.
  • the amino acid sequence of ⁇ -Glu-Val synthase encoded by the same gene is shown in SEQ ID NO: 18.
  • SEQ ID NO: 17 shows the base sequence in which codons were optimized for expression of Escherichia coli.
  • SEQ ID NO: 29 shows the base sequence of the KrgshA gene with codon optimized for expression of Escherichia coli.
  • the pUC18-derived plasmid pSF12_ggt (WO2013 / 051685A1) containing the ggt gene encoding the ⁇ -glutamyl transpeptidase derived from Escherichia coli W3110 (ATCC 27325) and the rpoH promoter was digested with NdeI / PstI, and QIAquick Gel Extraction Kit ( Qiagen) to obtain a fragment of about 3.0 kb.
  • a plasmid was extracted from the grown colonies of the transformant according to a known method, the base sequence was confirmed using 3130 Genetic Analyzer (manufactured by Life Technologies), and the plasmid having the target structure was named pSF12-KrGshA .
  • the JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA strain and JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA ⁇ ybdK strain obtained in Example 4 were transformed with pSF12-KrgshA, respectively, to obtain transformants having pSF12KrgshA.
  • the transformants were designated as JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA / pSF12-KrgshA strain and JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA ⁇ ybdK / pSF12-KrgshA strain, respectively.
  • Example 6 Production of ⁇ -glutamyldipeptide using a cell-free extract of a ⁇ -Glu-Val synthase-expressing strain derived from Cochlear rosea A double disruption strain (JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA) of the ggt gene and gshA gene derived from Escherichia coli JM109 strain ) And a gamma-glutamyl dipeptide using a cell-free extract of a ⁇ -Glu-Val synthase expression strain derived from Cochlear rosea constructed with a triple disruption strain (JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA ⁇ ybdK) of the ggt gene, gshA gene, and ybdK gene The generation of was examined.
  • JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA ⁇ ybdK triple disruption strain
  • JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA / pSF12-KrgshA strain and JM109 ⁇ ggt ⁇ gshA ⁇ ybdK / pSF12-KrgshA strain obtained in Example 5 are inoculated into 3 mL of LB medium containing 100 ⁇ g / mL Amp, respectively, and cultured with shaking at 30 ° C. and 120 reciprocations / min for 20 hours. A preculture was obtained. 150 ⁇ L of the obtained preculture solution was inoculated into a 70 mL test tube ( ⁇ 25 mm) in which 15 mL of TB medium containing 100 ⁇ g / mL Amp was put, and cultured with shaking at 30 ° C.
  • Bacteria are collected by centrifugation (4 °C, 12,000 ⁇ g, 5 minutes), and the resulting cells are mixed with 0.2 mL buffer solution (20 Mm Tris-HCl (pH 8.0), 300 mM NaCl, 10 mM imidazole, 15% The cells were suspended in glycerol and subjected to ultrasonic disruption while cooling to disrupt the cells. The obtained cell disruption solution was centrifuged (4 ° C., 29,100 ⁇ g, 10 minutes), and the resulting supernatant was used as a cell-free extract.
  • ⁇ -Glu-Val synthesis activity was measured using the cell-free extract.
  • the reaction solution composition is 100 mM glutamate, was 100 mM valine, 40 mM ATP, 20 mM MgS0 4, 100 mM Tris-HCl (pH 7.0).
  • the reaction volume was 0.5 mL.
  • the enzymatic reaction was started by adding a cell-free extract containing 0.25 mg protein.
  • the reaction temperature was 30 ° C., and the reaction time was 30 minutes.
  • 0.5 mL of 200 mM sulfuric acid was added to 0.5 mL of the reaction solution.
  • ⁇ -Glu-Val was quantified by the method shown in Example 3, and ⁇ -Glu-Val synthesis activity per cell-free extract was calculated. The results are shown in Table 7.
  • ⁇ -Glu-Val synthesis amount and ⁇ -Glu-Gly synthesis amount in the presence of Glu, Val, and Gly were measured using the obtained cell-free extract.
  • the reaction solution composition is 100 mM glutamate, 50 mM valine was a 50 mM glycine, 40 mM ATP, 20 mM MgS0 4, 100 mM Tris-HCl (pH 7.0).
  • the enzyme reaction was started by adding cell-free extract. When the reaction was stopped, 200 mM sulfuric acid in an amount equal to the amount of the reaction solution was added. After completion of the reaction, ⁇ -Glu-Val and ⁇ -Glu-Gly were quantified by the method shown in Example 3. The results are shown in Tables 8 and 9.
  • Table 8 shows the results when the cell-free extract was added to the reaction solution so that the ⁇ -Glu-Val synthase activity was 0.004 U.
  • the reaction liquid volume at that time was 0.2 mL, the reaction temperature was 30 ° C., and the reaction time was 16 hours.
  • Table 9 shows the results when a cell-free extract containing 2.5 mg of protein was added to the reaction solution. The amount of the reaction solution at that time was 0.5 mL, the reaction temperature was 30 ° C., and the reaction time was 2.5 hours.
  • a microorganism useful as an expression host for ⁇ -Glu-Val synthase can be provided.
  • ⁇ -Glu-Val and ⁇ -Glu-Val-Gly can be efficiently produced using ⁇ -Glu-Val synthase expressed in the same microorganism.
  • ⁇ -Glu-Val synthase expressed in the same microorganism in combination with glutathione synthase ⁇ -Glu-Gly by-product can be reduced while using Glu, Val, and Gly as raw materials.
  • -Expected to be able to produce Glu-Val-Gly can be provided.

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Abstract

γ-Glu-Val合成酵素の発現宿主として有用な微生物、及び同微生物で発現させたγ-Glu-Val合成酵素を用いたγ-Glu-Val-Glyの製造法を提供する。ybdK遺伝子にコードされるタンパク質(YBDK)の活性が低下するように改変されたエシェリヒア(Escherichia)属細菌等の細菌を発現宿主として発現させたγ-Glu-Val合成酵素を利用して、Glu、Val、及びGlyを原料としてγ-Glu-Val-Glyを製造する。

Description

γ-グルタミルバリルグリシンの製造法
 本発明は、γ-グルタミルバリン合成酵素(γ-Glu-Val合成酵素)の発現宿主として有用な微生物、及び同微生物で発現させたγ-グルタミルバリン合成酵素を用いたγ-グルタミルバリルグリシンの製造法に関する。γ-グルタミルバリルグリシンは、食品及び医薬品等の分野で有用である。
 γ-グルタミルバリルグリシン(L-γ-glutamyl-L-valyl-glycine;以下、「γ-Glu-Val-Gly」ともいう。)のようなある種のペプチドは、カルシウム受容体活性化作用を有している(特許文献1)。このようなカルシウム受容体活性化作用を有するペプチドは、飲食品にコク味を付与できること(特許文献2)、低脂肪食品の呈味、特に脂肪様濃厚感及び滑らかさ、を改善できること(特許文献3)、及び、甘味物質のボディー感を改善し、甘味物質特有の苦味を改善できること(特許文献4)が知られている。
 また、前記のようなペプチドは、下痢(特許文献5)、糖尿病(特許文献6)の予防又は治療効果、及び、消化管の重炭酸分泌促進効果(特許文献7)を有することが知られている。
 一般に、γ-グルタミルトリペプチドの製造法としては、化学合成法および酵素法が知られている。化学合成法としては、N-保護グルタミン酸無水物を利用して、ジペプチドから選択的にγ-グルタミルトリペプチドを得る方法が知られている(特許文献8)。酵素法としては、グルタミン酸-システインリガーゼ(GSHA)およびグルタチオン合成酵素(GSHB)を利用する方法が知られている(特許文献9、10)。また、酵素法としては、γ-グルタミルトランスフェラーゼを利用し、Val-Glyをγ-グルタミル化してγ-Glu-Val-Glyを生成する方法も知られている(特許文献11)。
 グルタミン酸-システインリガーゼ(GSHA)は、GluとCysとATPを基質として、γ-Glu-CysとADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を有する酵素(EC 6.3.2.2)として知られている。GSHAは、通常、酵素反応にMg2+やMn2+等の2価の金属イオンを要求する。
 エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)のGSHAは、Mg2+またはMn2+の存在下でGluと各種のアミノ酸およびATPを基質としてγ-グルタミルジペプチドを生成するが、補因子となる金属イオンの種類が基質特異性に影響することが知られている(非特許文献1)。具体的には、Mg2+を補因子とした場合には、γ-Glu-Gly生成活性は、Vmax = 251 mol/mg/hr, Km = 17.6 mMであるのに対して、γ-Glu-Val生成活性は、Vmax = 59 mol/mg/hr, Km = 27.1 mMであると報告されている。すなわち、Vmax/Kmを活性の指標として比較すれば、Mg2+を補因子とした場合のγ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.15と算出できる。一方、Mn2+を補因子とした場合には、γ-Glu-Gly生成活性は、Vmax = 39 mol/mg/hr, Km = 1.7 mMであるのに対して、γ-Glu-Val生成活性は、Vmax = 95 mol/mg/hr, Km = 21 mMであると示されている。すなわち、Vmax/Kmを活性の指標として比較すれば、Mn2+を補因子とした場合のγ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.20と算出できる。また、エシェリヒア・コリ由来GSHAの基質特異性に関しては、他の活性測定例も挙げることができる(非特許文献2)。同文献では、Mg2+の存在下でGluと各種のアミノ酸およびATPを基質として反応を行い、γ-Glu-Gly生成活性を100%とした場合には、γ-Glu-Val生成活性は52%程度であると報告されている。すなわち、これら相対活性に基づいて比較をすれば、γ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.52と算出できる。このように、エシェリヒア・コリのGSHAのγ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.15~0.5程度であると言える。また、エシェリヒア・コリのGSHAに各種変異を導入することにより、γ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率が高い変異型GSHAを取得したことが報告されている(特許文献12)。
 また、グラム陰性細菌の1種であるプロテウス・ミラビリス(Proteus mirabilis)由来のGSHAは、Mg2+またはMn2+を補因子とし、Gluと各種のアミノ酸およびATPを基質としてγ-グルタミルジペプチドを生成することが知られている(非特許文献3)。プロテウス・ミラビリス由来のGSHAについて、γ-Glu-Cys生成活性を100%とした場合には、γ-Glu-Gly生成活性は14.5%、γ-Glu-Val生成活性は7.2%であると報告されている。すなわち、これら相対活性に基づいて比較をすれば、γ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.50と算出できる。
 また、ストレプトコッカス・アガラクチア(Streptococcus agalactiae)由来のγ-glutamylcysteine synthetase-glutatione synthetase(γ-GCS-GS)は、Mg2+の存在下でGluと各種のアミノ酸およびATPを基質としてγ-グルタミルジペプチドを生成することが知られている。ストレプトコッカス・アガラクチア由来のγ-GCS-GSについて、γ-Glu-Gly生成活性を100%とした場合に、γ-Glu-Val生成活性は21%程度であると報告されている(非特許文献2)。すなわち、これら相対活性に基づいて比較をすれば、γ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.21と算出できる。
 また、ミクロコッカス・グルタミカス(Micrococcus glutamicus)の培養液を各種カラムにかけペプチド等を分離し、γ-Glu-Glu、γ-Glu-Val、γ-Glu-Leuを単離したと報告されている(非特許文献4)。しかしながら、これらγ-グルタミルジペプチドの生合成経路については報告されていない。
 エシェリヒア・コリのybdK遺伝子にコードされるタンパク質(YBDK)は、γ-Glu-Cys生成活性を有することが報告されている(非特許文献5)。しかしながら、エシェリヒア・コリのYBDKのγ-Glu-Cys以外のγ-グルタミルジペプチド生成活性については報告されていない。
WO2007/055388 WO2007/055393 WO2008/139945 WO2008/139946 WO2008/139947 WO2009/107660 WO2009/119554 特開平08-119916 WO2013/054447 特開2012-85637 WO2013/051685 WO2015/115612
Brenda S. Kelly et al., J. Biol. Chem., 277, 50-58, 2002 Kino, K. et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 352, 351-359, 2007 Kumagai, H. et al., Agric. Biol. Chem., 46, 1301-1309, 1982 Ronald A. Vitali et al., J. Biol. Chem., 240, 2508‐2511, 1965 Lehmann C. et al., Proteins. 2004 Aug 1;56(2):376-83.
 本発明は、γ-グルタミルバリン合成酵素(γ-Glu-Val合成酵素)の発現宿主として有用な微生物、及び同微生物で発現させたγ-グルタミルバリン合成酵素を用いたγ-Glu-Val-Glyの製造法を提供することを課題とする。
 本発明者は、上記課題を解決するために鋭意検討を行った結果、エシェリヒア・コリのYBDKがγ-Glu-Gly生成活性を有すること、およびYBDKを欠損させたエシェリヒア・コリがγ-Glu-Val合成酵素の発現宿主として有用であることを見出し、本発明を完成させた。
 すなわち本発明は、以下のとおり例示できる。
[1]
 ybdK遺伝子にコードされるタンパク質の活性が非改変株と比較して低下するように改変され、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素をコードする遺伝子を有する細菌であって、
 前記γ-グルタミルバリン合成酵素におけるγ-グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ-グルタミルバリン合成酵素活性の比率が3.0以上である、細菌。
[2]
 前記タンパク質が、下記(a)、(b)、または(c)に記載のタンパク質である、前記細菌:
(a)配列番号16に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
(b)配列番号16に示すアミノ酸配列において、1~10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有するタンパク質;
(c)配列番号16に示すアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有するタンパク質。
[3]
 前記タンパク質の活性が、ybdK遺伝子の発現を低下させることにより、またはybdK遺伝子を破壊することにより、低下した、前記細菌。
[4]
 前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、下記(a)、(b)、または(c)に記載のタンパク質である、前記細菌:
(a)配列番号18、20、または22に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
(b)配列番号18、20、または22に示すアミノ酸配列において、1~10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質;
(c)配列番号18、20、または22に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
[5]
 前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、野生型グルタミン酸-システインリガーゼにおいて下記より選ばれる1またはそれ以上のアミノ酸残基に相当するアミノ酸残基に変異を有し、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有する変異型グルタミン酸-システインリガーゼである、前記細菌:
L135、Q144、Y241、N243、Y300。
[6]
 前記変異が、下記より選ばれる1またはそれ以上の変異に相当する変異を含む、前記細菌:
L135(I, F, M, V, G, A, W, K, H, R, C, N, S, T)、
Q144(F, A, N, S, D, T, R, H, G, K, Y, W, C, M, P, V, L, I)、
Y241(A)、
N243(I, W, K, R, H)、
Y300(A, H, R, K)。
[7]
 前記変異が、下記のいずれかの変異に相当する変異を含む、前記細菌:
L135I/Q144R、L135I/Q144D、L135I/Q144A、L135I/Q144L、L135I/N243W、L135I/N243F、L135F/Q144A、L135F/N243W、L135M/Q144R、L135M/Q144A、L135M/Q144L、L135M/N243W、L135M/N243F、L135M/Q144H、L135M/Q144N、L135M/N243Y、L135M/N243R、L135M/N243C、L135V/Q144R、L135V/Q144D、L135V/Q144A、L135V/Q144L、L135V/Q144V、L135V/Q144K、L135V/Q144C、L135V/Q144T、L135H/Q144R、L135G/Q144L、L135A/Q144L、L135V/N243W、L135V/N243F、L135V/N243P、Q144R/N243W、Q144R/N243F、Q144D/N243W、Q144D/N243F、Q144A/N243W、Q144A/N243F、Q144L/N243W、Q144L/N243F、L135M/Q144F、L135M/N243A、L135V/N243G、L135V/N243A、L135V/N243L、L135V/N243Y、L135V/N243K、L135V/N243R、L135V/N243H、L135V/N243D、L135V/N243E、L135V/N243C、L135V/N243Q、L135V/N243S、L135V/N243T、L135V/Q144I、L135V/Q144P、L135V/Q144W、L135V/Q144H、L135V/Q144E、L135V/Q144N、L135V/Q144S、L135K/Q144L、L135H/Q144L、L135D/Q144L、L135C/Q144L、L135Q/Q144L、L135N/Q144L、L135S/Q144L、L135T/Q144L。
[8]
 前記変異が、下記のいずれかの変異に相当する変異を含む、前記細菌:
L135(I, M, V, G, A, K, H, C, N, S, T)、
Q144(F, A, S, D, T, R, H, K, Y, W, C, M, P, V, L, I)、
N243(R, H)、
Y300(R, K)、
L135I/Q144R、L135I/Q144D、L135I/Q144A、L135I/Q144L、L135I/N243W、L135I/N243F、L135F/Q144A、L135M/Q144R、L135M/Q144A、L135M/Q144L、L135M/N243W、L135M/Q144H、L135M/Q144N、L135M/N243C、L135V/Q144R、L135V/Q144D、L135V/Q144A、L135V/Q144L、L135V/Q144V、L135V/Q144K、L135V/Q144C、L135V/Q144T、L135H/Q144R、L135G/Q144L、L135A/Q144L、L135V/N243W、L135V/N243F、L135V/N243P、Q144R/N243W、Q144D/N243W、Q144A/N243W、Q144A/N243F、Q144L/N243W、Q144L/N243F、L135M/Q144F、L135M/N243A、L135V/N243G、L135V/N243A、L135V/N243L、L135V/N243Y、L135V/N243K、L135V/N243R、L135V/N243H、L135V/N243D、L135V/N243E、L135V/N243C、L135V/N243Q、L135V/N243S、L135V/N243T、L135V/Q144P、L135V/Q144W、L135V/Q144H、L135V/Q144E、L135V/Q144N、L135V/Q144S、L135D/Q144L、L135C/Q144L、L135N/Q144L、L135S/Q144L、L135T/Q144L。
[9]
 前記野生型グルタミン酸-システインリガーゼが、下記(a)、(b)、又は(c)に記載のタンパク質である、前記細菌:
(a)配列番号24に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
(b)配列番号24に示すアミノ酸配列において、1~10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含むタンパク質;
(c)配列番号24に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むタンパク質。
[10]
 さらに、gshA遺伝子にコードされるタンパク質の活性が非改変株と比較して低下するように改変されている、前記細菌。
[11]
 さらに、γ-グルタミルトランスフェラーゼの活性が非改変株と比較して低下するように改変されている、前記細菌。
[12]
 グルタチオン合成酵素をコードする遺伝子を有する、前記細菌。
[13]
 エシェリヒア(Escherichia)属細菌である、前記細菌。
[14]
 エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)である、前記細菌。
[15]
 γ-Glu-Val-Glyおよび/またはその塩の製造方法であって、
 γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を、Glu、Val、およびGlyに作用させることにより、γ-Glu-Val-Glyを生成する工程を含み、
 前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、前記細菌を発現宿主として得られたものである、方法。
[16]
 前記グルタチオン合成酵素が前記細菌を発現宿主として得られたものである、前記方法。
[17]
 前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、精製酵素である、前記方法。
[18]
 前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、固定化酵素である、前記方法。
[19]
 前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、前記細菌の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、前記方法。
[20]
 前記グルタチオン合成酵素が、該酵素を有する微生物の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、前記方法。
[21]
 前記γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素が、前記細菌の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、前記方法。
[22]
 前記工程がATPの存在下で実施される、前記方法。
[23]
 前記工程が2価の金属イオンの存在下で実施される、前記方法。
 以下、本発明を詳細に説明する。尚、本明細書において、アミノ酸は特記しない限りL-体である。
<1>本発明の微生物
 本発明の微生物は、ybdK遺伝子にコードされるタンパク質(「YBDK」ともいう)の活性が低下するように改変された細菌である。本発明の微生物は、具体的には、YBDKの活性が非改変株と比較して低下するように改変された細菌である。本発明の微生物は、例えば、下記のような細菌をYBDKの活性が低下するように改変することにより取得することができる。
 細菌としては、例えば、腸内細菌科(Enterobacteriaceae)に属する細菌、コリネ型細菌、バチルス(Bacillus)属細菌が挙げられる。
 腸内細菌科に属する細菌としては、エシェリヒア(Escherichia)属、エンテロバクター(Enterobacter)属、パントエア(Pantoea)属、クレブシエラ(Klebsiella)属、セラチア(Serratia)属、エルビニア(Erwinia)属、フォトラブダス(Photorhabdus)属、プロビデンシア(Providencia)属、サルモネラ(Salmonella)属、モルガネラ(Morganella)等の属に属する細菌が挙げられる。具体的には、NCBI(National Center for Biotechnology Information)のデータベース(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=91347)で用いられている分類法により腸内細菌科に分類されている細菌を用いることができる。
 エシェリヒア属細菌としては、特に制限されないが、微生物学の専門家に知られている分類によりエシェリヒア属に分類されている細菌が挙げられる。エシェリヒア属細菌としては、例えば、Neidhardtらの著書(Backmann, B. J. 1996. Derivations and Genotypes of some mutant derivatives of Escherichia coli K-12, p. 2460-2488. Table 1. In F. D. Neidhardt (ed.), Escherichia coli and Salmonella Cellular and Molecular Biology/Second Edition, American Society for Microbiology Press, Washington, D.C.)に記載されたものが挙げられる。エシェリヒア属細菌としては、例えば、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)が挙げられる。エシェリヒア・コリとしては、例えば、W3110株(ATCC 27325)やMG1655株(ATCC 47076)等のエシェリヒア・コリK-12株;エシェリヒア・コリK5株(ATCC 23506);BL21(DE3)株等のエシェリヒア・コリB株;およびそれらの派生株(例えば、K-12株由来のJM109株)が挙げられる。
 エンテロバクター属細菌としては、特に制限されないが、微生物学の専門家に知られている分類によりエンテロバクター属に分類されている細菌が挙げられる。エンテロバクター属細菌としては、例えば、エンテロバクター・アグロメランス(Enterobacter agglomerans)やエンテロバクター・アエロゲネス(Enterobacter aerogenes)が挙げられる。エンテロバクター・アグロメランスとして、具体的には、例えば、エンテロバクター・アグロメランスATCC12287株が挙げられる。エンテロバクター・アエロゲネスとして、具体的には、例えば、エンテロバクター・アエロゲネスATCC13048株、NBRC12010株(Biotechonol Bioeng. 2007 Mar 27; 98(2) 340-348)、AJ110637株(FERM BP-10955)が挙げられる。また、エンテロバクター属細菌としては、例えば、欧州特許出願公開EP0952221号明細書に記載されたものが挙げられる。なお、Enterobacter agglomeransには、Pantoea agglomeransと分類されているものも存在する。
 パントエア属細菌としては、特に制限されないが、微生物学の専門家に知られている分類によりパントエア属に分類されている細菌が挙げられる。パントエア属細菌としては、例えば、パントエア・アナナティス(Pantoea ananatis)、パントエア・スチューアルティ(Pantoea stewartii)、パントエア・アグロメランス(Pantoea agglomerans)、パントエア・シトレア(Pantoea citrea)が挙げられる。パントエア・アナナティスとして、具体的には、例えば、パントエア・アナナティスLMG20103株、AJ13355株(FERM BP-6614)、AJ13356株(FERM BP-6615)、AJ13601株(FERM BP-7207)、SC17株(FERM BP-11091)、SC17(0)株(VKPM B-9246)、及びSC17sucA株(FERM BP-8646)が挙げられる。なお、エンテロバクター・アグロメランスのある種のものは、最近、16S rRNAの塩基配列分析等に基づき、パントエア・アグロメランス、パントエア・アナナティス、パントエア・ステワルティイ等に再分類された(Int. J. Syst. Bacteriol., 43, 162-173 (1993))。本発明において、パントエア属細菌には、このようにパントエア属に再分類された細菌も含まれる。
 エルビニア属細菌としては、エルビニア・アミロボーラ(Erwinia amylovora)、エルビニア・カロトボーラ(Erwinia carotovora)が挙げられる。クレブシエラ属細菌としては、クレブシエラ・プランティコーラ(Klebsiella planticola)が挙げられる。
 コリネ型細菌としては、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属、ブレビバクテリウム(Brevibacterium)属、およびミクロバクテリウム(Microbacterium)属等の属に属する細菌が挙げられる。
 コリネ型細菌としては、具体的には、下記のような種が挙げられる。
コリネバクテリウム・アセトアシドフィラム(Corynebacterium acetoacidophilum)
コリネバクテリウム・アセトグルタミカム(Corynebacterium acetoglutamicum)
コリネバクテリウム・アルカノリティカム(Corynebacterium alkanolyticum)
コリネバクテリウム・カルナエ(Corynebacterium callunae)
コリネバクテリウム・クレナタム(Corynebacterium crenatum)
コリネバクテリウム・グルタミカム(Corynebacterium glutamicum)
コリネバクテリウム・リリウム(Corynebacterium lilium)
コリネバクテリウム・メラセコーラ(Corynebacterium melassecola)
コリネバクテリウム・サーモアミノゲネス(コリネバクテリウム・エフィシエンス)(Corynebacterium thermoaminogenes (Corynebacterium efficiens))
コリネバクテリウム・ハーキュリス(Corynebacterium herculis)
ブレビバクテリウム・ディバリカタム(コリネバクテリウム・グルタミカム)(Brevibacterium divaricatum (Corynebacterium glutamicum))
ブレビバクテリウム・フラバム(コリネバクテリウム・グルタミカム)(Brevibacterium flavum (Corynebacterium glutamicum))
ブレビバクテリウム・イマリオフィラム(Brevibacterium immariophilum)
ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム(コリネバクテリウム・グルタミカム)(Brevibacterium lactofermentum (Corynebacterium glutamicum))
ブレビバクテリウム・ロゼウム(Brevibacterium roseum)
ブレビバクテリウム・サッカロリティカム(Brevibacterium saccharolyticum)
ブレビバクテリウム・チオゲニタリス(Brevibacterium thiogenitalis)
コリネバクテリウム・アンモニアゲネス(コリネバクテリウム・スタティオニス)(Corynebacterium ammoniagenes (Corynebacterium stationis))
ブレビバクテリウム・アルバム(Brevibacterium album)
ブレビバクテリウム・セリナム(Brevibacterium cerinum)
ミクロバクテリウム・アンモニアフィラム(Microbacterium ammoniaphilum)
 コリネ型細菌としては、具体的には、下記のような菌株が挙げられる。
Corynebacterium acetoacidophilum ATCC 13870
Corynebacterium acetoglutamicum ATCC 15806
Corynebacterium alkanolyticum ATCC 21511
Corynebacterium crenatum AS1.542
Corynebacterium callunae ATCC 15991
Corynebacterium glutamicum ATCC 13020, ATCC 13032, ATCC 13060, ATCC 13869, FERM BP-734
Corynebacterium lilium ATCC 15990
Corynebacterium melassecola ATCC 17965
Corynebacterium efficiens (Corynebacterium thermoaminogenes) AJ12340 (FERM BP-1539)
Corynebacterium herculis ATCC 13868
Brevibacterium divaricatum (Corynebacterium glutamicum) ATCC 14020
Brevibacterium flavum (Corynebacterium glutamicum) ATCC 13826, ATCC 14067, AJ12418 (FERM BP-2205)
Brevibacterium immariophilum ATCC 14068
Brevibacterium lactofermentum (Corynebacterium glutamicum) ATCC 13869
Brevibacterium roseum ATCC 13825
Brevibacterium saccharolyticum ATCC 14066
Brevibacterium thiogenitalis ATCC 19240
Corynebacterium ammoniagenes (Corynebacterium stationis) ATCC 6871, ATCC 6872
Brevibacterium album ATCC 15111
Brevibacterium cerinum ATCC 15112
Microbacterium ammoniaphilum ATCC 15354
 なお、コリネバクテリウム属細菌には、従来ブレビバクテリウム属に分類されていたが、現在コリネバクテリウム属に統合された細菌(Int. J. Syst. Bacteriol., 41, 255(1991))も含まれる。また、コリネバクテリウム・スタティオニスには、従来コリネバクテリウム・アンモニアゲネスに分類されていたが、16S rRNAの塩基配列解析等によりコリネバクテリウム・スタティオニスに再分類された細菌も含まれる(Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 60, 874-879(2010))。
 バチルス属細菌としては、特に制限されないが、微生物学の専門家に知られている分類によりバチルス属に分類される細菌が挙げられる。バチルス属細菌としては、例えば、バチルス・サブチリス(Bacillus subtilis)、バチルス・アミロリケファシエンス(Bacillus amyloliquefaciens)、バチルス・プミルス(Bacillus pumilus)、バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)、バチルス・メガテリウム(Bacillus megaterium)、バチルス・ブレビス(Bacillus brevis)、バチルス・ポリミキサ(Bacillus polymixa)、バチルス・ステアロサーモフィラス(Bacillus stearothermophilus)が挙げられる。バチルス・サブチリスとして、具体的には、例えば、バチルス・サブチリス168 Marburg株(ATCC 6051)やバチルス・サブチリスPY79株(Plasmid, 1984, 12, 1-9)が挙げられる。バチルス・アミロリケファシエンスとして、具体的には、例えば、バチルス・アミロリケファシエンスT株(ATCC 23842)やバチルス・アミロリケファシエンスN株(ATCC 23845)が挙げられる。
 これらの菌株は、例えば、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(住所12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852 P.O. Box 1549, Manassas, VA 20108, United States of America)より分譲を受けることが出来る。すなわち各菌株に対応する登録番号が付与されており、この登録番号を利用して分譲を受けることが出来る(https://www.atcc.org/参照)。各菌株に対応する登録番号は、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクションのカタログに記載されている。また、これらの菌株は、例えば、各菌株が寄託された寄託機関から入手することができる。また、BL21(DE3)株は、例えば、ライフテクノロジーズ社より入手可能である(製品番号C6000-03)。また、BLR(DE3)株は、例えば、メルクミリポア社より入手可能である(製品番号 69053)。また、JM109株は、例えば、タカラバイオ社より入手可能である(製品番号 9052)。
 YBDKは、GluとGlyとATPを基質として、γ-Glu-GlyとADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を有するタンパク質である。同活性を、「γ-グルタミルグリシン合成酵素(γ-glutamylglycine synthethase)活性」、「γ-Glu-Gly生成活性」、または「γ-Glu-Gly合成活性」ともいう。
 また、GluとValとATPを基質として、γ-Glu-ValとADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を、「γ-グルタミルバリン合成酵素(γ-glutamylvaline synthethase)活性」、「γ-Glu-Val生成活性」、または「γ-Glu-Val合成活性」ともいう。
 また、GluとCysとATPを基質として、γ-Glu-CysとADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を、「γ-グルタミルシステイン合成酵素(γ-glutamylcysteine synthetase)活性」ともいう。
 これらの酵素活性は、例えば、適切な条件で酵素を基質に作用させた際のγ-グルタミルジペプチドの生成に基づいて測定することができる。これらの酵素活性は、例えば、2価の金属イオンの存在下で測定することができる。2価の金属イオンとしては、Mg2+やMn2+が挙げられる。
 Mn2+存在下でのγ-グルタミルバリン合成酵素活性およびγ-グルタミルグリシン合成酵素活性の測定条件としては、実施例3に記載の条件が挙げられる。すなわち、具体的な活性測定条件は以下の通りである。γ-グルタミルバリン合成酵素活性は、反応液(10mM グルタミン酸、10mM バリン、10mM ATP、10mM MnS04、100mM Tris-HCl (pH7.0~9.0))に適切な量の酵素を添加し、30℃で30分間反応を行い、生成したγ-Glu-Val量に基づいて測定することができる。本発明においては、本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Valを生成する酵素活性を1 Uのγ-グルタミルバリン合成酵素活性(Mn2+存在下)とする。同様に、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性は、反応液(10mM グルタミン酸、10mM グリシン、10mM ATP、10mM MnS04、100mM Tris-HCl (pH7.0~9.0))に適切な量の酵素を添加し、30℃で30分間反応を行い、生成したγ-Glu-Gly量に基づいて測定することができる。本発明においては、本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Glyを生成する酵素活性を1 Uのγ-グルタミルグリシン合成酵素活性(Mn2+存在下)とする。
 また、10mM MnS04に代えて10mM MgS04を含有する反応液を用いることで、Mg2+存在下でのγ-グルタミルバリン合成酵素活性およびγ-グルタミルグリシン合成酵素活性を測定することができる。すなわち、同反応液を用いて上記と同様の条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Valを生成する酵素活性を1 Uのγ-グルタミルバリン合成酵素活性(Mg2+存在下)とする。同様に、同反応液を用いて上記と同様の条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Glyを生成する酵素活性を1 Uのγ-グルタミルグリシン合成酵素活性(Mg2+存在下)とする。
 また、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性(比活性)に対するγ-グルタミルバリン合成酵素活性(比活性)の比率(すなわち、γ-グルタミルバリン合成酵素活性の比活性/γ-グルタミルグリシン合成酵素活性の比活性)を「Val選択性」ともいう。Val選択性は、γ-グルタミルバリン合成酵素活性およびγ-グルタミルグリシン合成酵素活性を測定し、算出できる。
 YBDKは、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有する限り、γ-グルタミルグリシン以外のγ-グルタミルジペプチドを生成する活性を有していてもよく、有していなくてもよい。すなわち、例えば、YBDKは、γ-グルタミルバリン合成酵素(γ-glutamylvaline synthethase)活性を有していてもよく、有していなくてもよい。また、例えば、YBDKは、γ-グルタミルシステイン合成酵素(γ-glutamylcysteine synthetase)活性を有していてもよく、有していなくてもよい。YBDKは、適切な条件でγ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有していればよい。YBDKは、例えば、Mg2+またはMn2+の存在下、特にMn2+の存在下、でγ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有していてよい。また、YBDKは、例えば、pH7.0~9.0の少なくともいずれかのpH、特にpH7.0、でγ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有していてよい。
 YBDKがγ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有する限り、YBDKにおけるVal選択性は特に制限されない。YBDKは、後述するγ-グルタミルバリン合成酵素よりも低いVal選択性を示すものであってよい。YBDKにおいて、Val選択性は、例えば、3.0未満であってよい。YBDKは、Mg2+またはMn2+の存在下、特にMn2+の存在下、で上記例示したVal選択性を示すものであってよい。また、YBDKは、例えば、pH7.0~9.0の少なくともいずれかのpH、特にpH7.0、で上記例示したVal選択性を示すものであってよい。
 E. coli K-12 MG1655のybdK遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるYBDKのアミノ酸配列を、それぞれ、配列番号15および16に示す。すなわち、YBDKは、例えば、配列番号16に示すアミノ酸配列を有するタンパク質であってよい。また、YBDKは、例えば、配列番号15に示す塩基配列を有する遺伝子にコードされるタンパク質であってよい。なお、「(アミノ酸または塩基)配列を有する」という表現は、当該「(アミノ酸または塩基)配列を含む」場合および当該「(アミノ酸または塩基)配列からなる」場合を包含する。
 YBDKは、元の機能が維持されている限り、上記例示したYBDK(例えば、配列番号16に示すアミノ酸配列を有するタンパク質)のバリアントであってもよい。同様に、ybdK遺伝子は、元の機能が維持されている限り、上記例示したybdK遺伝子(例えば、配列番号15に示す塩基配列を有する遺伝子)のバリアントであってもよい。なお、このような元の機能が維持されたバリアントを「保存的バリアント」という場合がある。すなわち、「ybdK遺伝子」という用語は、上記例示したybdK遺伝子に加えて、その保存的バリアントを包含するものとする。同様に、「YBDK」という用語は、上記例示したYBDKに加えて、その保存的バリアントを包含するものとする。保存的バリアントとしては、例えば、上記例示したybdK遺伝子やYBDKのホモログや人為的な改変体が挙げられる。
 「元の機能が維持されている」とは、遺伝子やタンパク質のバリアントが、元の遺伝子やタンパク質の機能(活性や性質)に対応する機能(活性や性質)を有することをいう。すなわち、「元の機能が維持されている」とは、YBDKにあっては、タンパク質のバリアントが、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有することをいう。同バリアントがγ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有する限り、基質特異性、2価の金属イオンの要求性、pH依存性等の、同バリアントの酵素学的性質は、いずれも、元のタンパク質の酵素学的性質と同一であってもよく、同一でなくてもよい。例えば、同バリアントは、γ-グルタミルグリシン以外のγ-グルタミルジペプチドを生成する活性を有していてもよく、有していなくてもよい。また、例えば、同バリアントは、上記例示したVal選択性を示してもよい。また、「元の機能が維持されている」とは、ybdK遺伝子にあっては、遺伝子のバリアントが、元の機能が維持されたタンパク質(すなわちγ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有するタンパク質)をコードすることをいう。
 以下、保存的バリアントについて例示する。
 上記ybdK遺伝子またはYBDKのホモログとしては、例えば、上記塩基配列またはアミノ酸配列を問い合わせ配列として用いたBLAST検索やFASTA検索によって公開データベースから取得される遺伝子またはタンパク質が挙げられる。また、上記ybdK遺伝子のホモログは、例えば、各種微生物の染色体を鋳型にして、これら公知の遺伝子配列に基づいて作製したオリゴヌクレオチドをプライマーとして用いたPCRにより取得することができる。
 YBDKは、元の機能が維持されている限り、上記アミノ酸配列(例えば、配列番号16に示すアミノ酸配列)において、1若しくは数個の位置での1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、挿入または付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質であってもよい。なお上記「1若しくは数個」とは、アミノ酸残基のタンパク質の立体構造における位置や種類によっても異なるが、具体的には、例えば、1~50個、1~40個、1~30個、好ましくは1~20個、より好ましくは1~10個、さらに好ましくは1~5個、特に好ましくは1~3個を意味する。
 上記の1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、または付加は、タンパク質の機能が正常に維持される保存的変異である。保存的変異の代表的なものは、保存的置換である。保存的置換とは、置換部位が芳香族アミノ酸である場合には、Phe、Trp、Tyr間で、置換部位が疎水性アミノ酸である場合には、Leu、Ile、Val間で、極性アミノ酸である場合には、Gln、Asn間で、塩基性アミノ酸である場合には、Lys、Arg、His間で、酸性アミノ酸である場合には、Asp、Glu間で、ヒドロキシル基を持つアミノ酸である場合には、Ser、Thr間でお互いに置換する変異である。保存的置換とみなされる置換としては、具体的には、AlaからSer又はThrへの置換、ArgからGln、His又はLysへの置換、AsnからGlu、Gln、Lys、His又はAspへの置換、AspからAsn、Glu又はGlnへの置換、CysからSer又はAlaへの置換、GlnからAsn、Glu、Lys、His、Asp又はArgへの置換、GluからGly、Asn、Gln、Lys又はAspへの置換、GlyからProへの置換、HisからAsn、Lys、Gln、Arg又はTyrへの置換、IleからLeu、Met、Val又はPheへの置換、LeuからIle、Met、Val又はPheへの置換、LysからAsn、Glu、Gln、His又はArgへの置換、MetからIle、Leu、Val又はPheへの置換、PheからTrp、Tyr、Met、Ile又はLeuへの置換、SerからThr又はAlaへの置換、ThrからSer又はAlaへの置換、TrpからPhe又はTyrへの置換、TyrからHis、Phe又はTrpへの置換、及び、ValからMet、Ile又はLeuへの置換が挙げられる。また、上記のようなアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、または逆位等には、タンパク質が由来する生物の個体差、種の違いに基づく場合などの天然に生じる変異(mutant又はvariant)によって生じるものも含まれる。
 また、YBDKは、元の機能が維持されている限り、上記アミノ酸配列全体に対して、80%以上、好ましくは90%以上、より好ましくは95%以上、さらに好ましくは97%以上、特に好ましくは99%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有するタンパク質であってもよい。尚、本明細書において、「相同性」(homology)は、「同一性」(identity)を意味する。
 また、YBDKは、元の機能が維持されている限り、上記塩基配列(例えば、配列番号15に示す塩基配列)から調製され得るプローブ、例えば上記塩基配列の全体または一部に対する相補配列、とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAにコードされるタンパク質であってもよい。そのようなプローブは、例えば、上記塩基配列に基づいて作製したオリゴヌクレオチドをプライマーとし、上記塩基配列を含むDNA断片を鋳型とするPCRによって作製することができる。「ストリンジェントな条件」とは、いわゆる特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいう。一例を示せば、相同性が高いDNA同士、例えば80%以上、好ましくは90%以上、より好ましくは95%以上、さらに好ましくは97%以上、特に好ましくは99%以上の相同性を有するDNA同士がハイブリダイズし、それより相同性が低いDNA同士がハイブリダイズしない条件、あるいは通常のサザンハイブリダイゼーションの洗いの条件である60℃、1×SSC、0.1% SDS、好ましくは60℃、0.1×SSC、0.1% SDS、より好ましくは68℃、0.1×SSC、0.1% SDSに相当する塩濃度および温度で、1回、好ましくは2~3回洗浄する条件を挙げることができる。また、例えば、プローブとして、300 bp程度の長さのDNA断片を用いる場合には、ハイブリダイゼーションの洗いの条件としては、50℃、2×SSC、0.1% SDSが挙げられる。
 2つの配列間の配列同一性のパーセンテージは、例えば、数学的アルゴリズムを用いて決定できる。このような数学的アルゴリズムの限定されない例としては、Myers 及び Miller (1988) CABIOS 4:11 17のアルゴリズム、Smith et al (1981) Adv. Appl. Math. 2:482の局所ホモロジーアルゴリズム、Needleman及びWunsch (1970) J. Mol. Biol. 48:443 453のホモロジーアライメントアルゴリズム、Pearson及びLipman (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. 85:2444 2448の類似性を検索する方法、Karlin 及びAltschul (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873 5877に記載されているような、改良された、Karlin及びAltschul (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 872264のアルゴリズムが挙げられる。
 これらの数学的アルゴリズムに基づくプログラムを利用して、配列同一性を決定するための配列比較(アラインメント)を行うことができる。プログラムは、適宜、コンピュータにより実行することができる。このようなプログラムとしては、特に限定されないが、PC/GeneプログラムのCLUSTAL(Intelligenetics, Mountain View, Calif.から入手可能)、ALIGNプログラム(Version 2.0)、並びにWisconsin Genetics Software Package, Version 8(Genetics Computer Group (GCG), 575 Science Drive, Madison, Wis., USAから入手可能)のGAP、BESTFIT、BLAST、FASTA、及びTFASTAが挙げられる。これらのプログラムを用いたアライメントは、例えば、初期パラメーターを用いて行うことができる。CLUSTALプログラムについては、HigGlns et al. (1988) Gene 73:237 244 (1988)、HigGlns et al. (1989) CABIOS 5:151 153、Corpet et al. (1988) Nucleic Acids Res. 16:10881 90、Huang et al. (1992) CABIOS 8:155 65、及びPearson et al. (1994) Meth. Mol. Biol. 24:307 331によく記載されている。
 対象のタンパク質をコードするヌクレオチド配列と相同性があるヌクレオチド配列を得るために、具体的には、例えば、BLASTヌクレオチド検索を、BLASTNプログラム、スコア=100、ワード長=12にて行うことができる。対象のタンパク質と相同性があるアミノ酸配列を得るために、具体的には、例えば、BLASTタンパク質検索を、BLASTXプログラム、スコア=50、ワード長=3にて行うことができる。BLASTヌクレオチド検索やBLASTタンパク質検索については、https://www.ncbi.nlm.nih.govを参照されたい。また、比較を目的としてギャップを加えたアライメントを得るために、Gapped BLAST(BLAST 2.0)を利用できる。また、PSI-BLAST (BLAST 2.0)を、配列間の離間した関係を検出する反復検索を行うのに利用できる。Gapped BLASTおよびPSI-BLASTについては、Altschul et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389を参照されたい。BLAST、Gapped BLAST、またはPSI-BLASTを利用する場合、例えば、各プログラム(例えば、ヌクレオチド配列に対してBLASTN、アミノ酸配列に対してBLASTX)の初期パラメーターが用いられ得る。アライメントは、手動にて行われてもよい。
 2つの配列間の配列同一性は、2つの配列を最大一致となるように整列したときに2つの配列間で一致する残基の比率として算出される。
 本発明の微生物は、さらに、γ-グルタミルシステイン合成酵素の活性が低下するように改変されていてもよい。「γ-グルタミルシステイン合成酵素」とは、γ-グルタミルシステイン合成酵素活性を有するタンパク質をいう。γ-グルタミルシステイン合成酵素を、「グルタミン酸-システインリガーゼ」または「GSHA」ともいう。γ-グルタミルシステイン合成酵素は、さらに、γ-グルタミルバリン合成酵素活性やγ-グルタミルグリシン合成酵素活性等の、γ-グルタミルシステイン以外のγ-グルタミルジペプチドを生成する活性を有し得る。γ-グルタミルシステイン合成酵素は、後述するγ-グルタミルバリン合成酵素よりも低いVal選択性を示すものであってよい。γ-グルタミルシステイン合成酵素において、Val選択性は、例えば、3.0未満であってよい。γ-グルタミルシステイン合成酵素としては、gshA遺伝子にコードされるGshAタンパク質が挙げられる。一例として、エシェリヒア・コリのgshA遺伝子の塩基配列及び同遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列を、それぞれ、配列番号23及び24に示す。γ-グルタミルシステイン合成酵素は、γ-グルタミルシステイン合成酵素活性を有する限り、上記γ-グルタミルシステイン合成酵素のバリアントであってもよい。γ-グルタミルシステイン合成酵素やそれをコードする遺伝子のバリアントについては、上述したYBDKやybdK遺伝子の保存的バリアントに関する記載を準用できる。なお、「gshA遺伝子」および「GshAタンパク質」という用語は、それぞれ、上記例示したgshA遺伝子およびGshAタンパク質に加えて、それらの保存的バリアントを包含するものとする。
 本発明の微生物は、さらに、γ-グルタミルペプチドの分解に関与するタンパク質の活性が低下するように改変されていてもよい。γ-グルタミルペプチドの分解に関与するタンパク質としては、γ-グルタミルトランスフェラーゼ(GGT)が挙げられる。GGTの活性が低下することにより、γ-Glu-Valおよびγ-Glu-Val-Glyの分解を抑制することが出来る。GGTとしては、ggt遺伝子にコードされるGgtタンパク質が挙げられる。一例として、エシェリヒア・コリのggt遺伝子の塩基配列及び同遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列を、それぞれ、配列番号25及び26に示す。GGTは、GGT活性を有する限り、上記GGTのバリアントであってもよい。GGTやそれをコードする遺伝子のバリアントについては、上述したYBDKやybdK遺伝子の保存的バリアントに関する記載を準用できる。なお、「ggt遺伝子」および「Ggtタンパク質」という用語は、それぞれ、上記例示したggt遺伝子およびGgtタンパク質に加えて、それらの保存的バリアントを包含するものとする。
 本発明の微生物を構築するための改変の順序は特に制限されない。
 以下、YBDK、GSHA、GGT等のタンパク質の活性を低下させる手法について説明する。
 「タンパク質の活性が低下する」とは、同タンパク質の活性が非改変株と比較して低下することを意味する。「タンパク質の活性が低下する」とは、具体的には、同タンパク質の細胞当たりの活性が非改変株と比較して減少していることを意味してよい。ここでいう「非改変株」とは、標的のタンパク質の活性が低下するように改変されていない対照株を意味する。非改変株としては、野生株や親株が挙げられる。非改変株として、具体的には、各細菌種の基準株(type strain)が挙げられる。また、非改変株として、具体的には、細菌の説明において例示した菌株も挙げられる。すなわち、一態様において、タンパク質の活性は、基準株(すなわち本発明の微生物が属する種の基準株)と比較して低下してよい。また、別の態様において、タンパク質の活性は、エシェリヒア・コリK-12 MG1655株と比較して低下してもよい。また、別の態様において、タンパク質の活性は、エシェリヒア・コリJM109株と比較して低下してもよい。なお、「タンパク質の活性が低下する」ことには、同タンパク質の活性が完全に消失している場合も含まれる。「タンパク質の活性が低下する」とは、より具体的には、非改変株と比較して、同タンパク質の細胞当たりの分子数が低下していること、および/または、同タンパク質の分子当たりの機能が低下していることを意味してよい。すなわち、「タンパク質の活性が低下する」という場合の「活性」とは、タンパク質の触媒活性に限られず、タンパク質をコードする遺伝子の転写量(mRNA量)または翻訳量(タンパク質の量)を意味してもよい。なお、「タンパク質の細胞当たりの分子数が低下している」ことには、同タンパク質が全く存在していない場合も含まれる。また、「タンパク質の分子当たりの機能が低下している」ことには、同タンパク質の分子当たりの機能が完全に消失している場合も含まれる。タンパク質の活性の低下の程度は、タンパク質の活性が非改変株と比較して低下していれば特に制限されない。タンパク質の活性は、例えば、非改変株の、50%以下、20%以下、10%以下、5%以下、または0%に低下してよい。
 タンパク質の活性が低下するような改変は、例えば、同タンパク質をコードする遺伝子の発現を低下させることにより達成できる。「遺伝子の発現が低下する」とは、同遺伝子の発現が非改変株と比較して低下することを意味する。「遺伝子の発現が低下する」とは、具体的には、同遺伝子の細胞当たりの発現量が野生株や親株等の非改変株と比較して減少することを意味してよい。「遺伝子の発現が低下する」とは、より具体的には、遺伝子の転写量(mRNA量)が低下すること、および/または、遺伝子の翻訳量(タンパク質の量)が低下することを意味してよい。「遺伝子の発現が低下する」ことには、同遺伝子が全く発現していない場合も含まれる。なお、「遺伝子の発現が低下する」ことを、「遺伝子の発現が弱化される」ともいう。遺伝子の発現は、例えば、非改変株の、50%以下、20%以下、10%以下、5%以下、または0%に低下してよい。
 遺伝子の発現の低下は、例えば、転写効率の低下によるものであってもよく、翻訳効率の低下によるものであってもよく、それらの組み合わせによるものであってもよい。遺伝子の発現の低下は、例えば、遺伝子のプロモーター、シャインダルガノ(SD)配列(リボソーム結合部位(RBS)ともいう)、RBSと開始コドンとの間のスペーサー領域等の発現調節配列を改変することにより達成できる。発現調節配列を改変する場合には、発現調節配列は、好ましくは1塩基以上、より好ましくは2塩基以上、特に好ましくは3塩基以上が改変される。また、発現調節配列の一部または全部を欠失させてもよい。また、遺伝子の発現の低下は、例えば、発現制御に関わる因子を操作することによっても達成できる。発現制御に関わる因子としては、転写や翻訳制御に関わる低分子(誘導物質、阻害物質など)、タンパク質(転写因子など)、核酸(siRNAなど)等が挙げられる。また、遺伝子の発現の低下は、例えば、遺伝子のコード領域に遺伝子の発現が低下するような変異を導入することによっても達成できる。例えば、遺伝子のコード領域のコドンを、宿主においてより低頻度で利用される同義コドンに置き換えることによって、遺伝子の発現を低下させることができる。また、例えば、後述するような遺伝子の破壊により、遺伝子の発現自体が低下し得る。
 また、タンパク質の活性が低下するような改変は、例えば、同タンパク質をコードする遺伝子を破壊することにより達成できる。「遺伝子が破壊される」とは、正常に機能するタンパク質を産生しないように同遺伝子が改変されることを意味する。「正常に機能するタンパク質を産生しない」ことには、同遺伝子からタンパク質が全く産生されない場合や、同遺伝子から分子当たりの機能(活性や性質)が低下又は消失したタンパク質が産生される場合が含まれる。
 遺伝子の破壊は、例えば、染色体上の遺伝子のコード領域の一部又は全部を欠損させることにより達成できる。さらには、染色体上の遺伝子の前後の配列を含めて、遺伝子全体を欠失させてもよい。タンパク質の活性の低下が達成できる限り、欠失させる領域は、N末端領域、内部領域、C末端領域等のいずれの領域であってもよい。通常、欠失させる領域は長い方が確実に遺伝子を不活化することができる。また、欠失させる領域の前後の配列は、リーディングフレームが一致しないことが好ましい。
 また、遺伝子の破壊は、例えば、染色体上の遺伝子のコード領域にアミノ酸置換(ミスセンス変異)を導入すること、終止コドンを導入すること(ナンセンス変異)、あるいは1~2塩基を付加または欠失するフレームシフト変異を導入すること等によっても達成できる(Journal of Biological Chemistry 272: 8611-8617 (1997), Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 95 5511-5515 (1998), Journal of Biological Chemistry 26 116, 20833-20839 (1991))。
 また、遺伝子の破壊は、例えば、染色体上の遺伝子のコード領域に他の配列を挿入することによっても達成できる。挿入部位は遺伝子のいずれの領域であってもよいが、挿入する配列は長い方が確実に遺伝子を不活化することができる。また、挿入部位の前後の配列は、リーディングフレームが一致しないことが好ましい。他の配列としては、コードされるタンパク質の活性を低下又は消失させるものであれば特に制限されないが、例えば、抗生物質耐性遺伝子等のマーカー遺伝子や目的物質の生産に有用な遺伝子が挙げられる。
 染色体上の遺伝子を上記のように改変することは、例えば、正常に機能するタンパク質を産生しないように改変した欠失型遺伝子を作製し、該欠失型遺伝子を含む組換えDNAで宿主を形質転換して、欠失型遺伝子と染色体上の野生型遺伝子とで相同組換えを起こさせることにより、染色体上の野生型遺伝子を欠失型遺伝子に置換することによって達成できる。その際、組換えDNAには、宿主の栄養要求性等の形質にしたがって、マーカー遺伝子を含ませておくと操作がしやすい。欠失型遺伝子としては、遺伝子の全領域あるいは一部の領域を欠失した遺伝子、ミスセンス変異を導入した遺伝子ナンセンス変異を導入した遺伝子、フレームシフト変異を導入した遺伝子、トランスポゾンやマーカー遺伝子等の挿入配列を導入した遺伝子が挙げられる。欠失型遺伝子によってコードされるタンパク質は、生成したとしても、野生型タンパク質とは異なる立体構造を有し、機能が低下又は消失する。このような相同組換えを利用した遺伝子置換による遺伝子破壊は既に確立しており、「Redドリブンインテグレーション(Red-driven integration)」と呼ばれる方法(Datsenko, K. A, and Wanner, B. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 97: 6640-6645 (2000))、Redドリブンインテグレーション法とλファージ由来の切り出しシステム(Cho, E. H., Gumport, R. I., Gardner, J. F. J. Bacteriol. 184: 5200-5203 (2002))とを組み合わせた方法(WO2005/010175号参照)等の直鎖状DNAを用いる方法や、温度感受性複製起点を含むプラスミドを用いる方法、接合伝達可能なプラスミドを用いる方法、宿主内で機能する複製起点を持たないスイサイドベクターを用いる方法などがある(米国特許第6303383号、特開平05-007491号)。
 また、タンパク質の活性が低下するような改変は、例えば、突然変異処理により行ってもよい。突然変異処理としては、X線の照射、紫外線の照射、ならびにN-メチル-N'-ニトロ-N-ニトロソグアニジン(MNNG)、エチルメタンスルフォネート(EMS)、およびメチルメタンスルフォネート(MMS)等の変異剤による処理が挙げられる。
 なお、タンパク質が複数のサブユニットからなる複合体として機能する場合、結果としてタンパク質の活性が低下する限り、それら複数のサブユニットの全てを改変してもよく、一部のみを改変してもよい。すなわち、例えば、それらのサブユニットをコードする複数の遺伝子の全てを破壊等してもよく、一部のみを破壊等してもよい。また、タンパク質に複数のアイソザイムが存在する場合、結果としてタンパク質の活性が低下する限り、複数のアイソザイムの全ての活性を低下させてもよく、一部のみの活性を低下させてもよい。すなわち、例えば、それらのアイソザイムをコードする複数の遺伝子の全てを破壊等してもよく、一部のみを破壊等してもよい。
 タンパク質の活性が低下したことは、同タンパク質の活性を測定することで確認できる。
 タンパク質の活性が低下したことは、同タンパク質をコードする遺伝子の発現が低下したことを確認することによっても、確認できる。遺伝子の発現が低下したことは、同遺伝子の転写量が低下したことを確認することや、同遺伝子から発現するタンパク質の量が低下したことを確認することにより確認できる。
 遺伝子の転写量が低下したことの確認は、同遺伝子から転写されるmRNAの量を非改変株と比較することによって行うことが出来る。mRNAの量を評価する方法としては、ノーザンハイブリダイゼーション、RT-PCR等が挙げられる(Molecular cloning(Cold spring Harbor Laboratory Press, Cold spring Harbor (USA), 2001))。mRNAの量は、非改変株と比較して、例えば、50%以下、20%以下、10%以下、5%以下、または0%に低下してよい。
 タンパク質の量が低下したことの確認は、抗体を用いてウェスタンブロットによって行うことが出来る(Molecular cloning(Cold spring Harbor Laboratory Press, Cold spring Harbor (USA), 2001))。タンパク質の量は、非改変株と比較して、例えば、50%以下、20%以下、10%以下、5%以下、または0%に低下してよい。
 遺伝子が破壊されたことは、破壊に用いた手段に応じて、同遺伝子の一部または全部の塩基配列、制限酵素地図、または全長等を決定することで確認できる。
<2>γ-グルタミルバリン合成酵素(γ-Glu-Val合成酵素)の製造
 本発明の微生物は、γ-グルタミルバリン合成酵素の発現宿主として利用することができる。すなわち、本発明の微生物は、γ-グルタミルバリン合成酵素をコードする遺伝子(「γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子」ともいう)を有していてよい。以下、「γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主」とは、本発明の微生物であって、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有するものを指す。なお、「γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する」ことを、「γ-グルタミルバリン合成酵素を有する」ともいう。すなわち、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主を、「γ-グルタミルバリン合成酵素を有する宿主」ともいう。
 γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主は、本来的にγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有するものであってもよく、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有するように改変されたものであってもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有するように改変された宿主としては、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子が導入された宿主が挙げられる。すなわち、本発明の微生物は、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子が導入されていてよい。本発明の微生物を構築するための改変の順序は特に制限されない。すなわち、例えば、本来的にγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する細菌をYBDKの活性が低下するよう改変してもよい。また、例えば、YBDKの活性が低下するよう改変された細菌にγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を導入してもよいし、細菌にγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を導入してからYBDKの活性が低下するよう改変してもよい。
 本発明において、「γ-グルタミルバリン合成酵素(γ-glutamylvaline synthethase)(γ-Glu-Val合成酵素(γ-Glu-Val synthethase))」とは、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質をいう。本発明において、γ-グルタミルバリン合成酵素は、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有する限り、γ-グルタミルバリン以外のγ-グルタミルジペプチドを生成する活性を有していてもよく、有していなくてもよい。すなわち、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素は、γ-グルタミルシステイン合成酵素活性を有していてもよく、有していなくてもよい。また、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素は、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有していてもよく、有していなくてもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素は、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有さないのが好ましい。γ-グルタミルバリン合成酵素活性およびγ-グルタミルグリシン合成酵素活性の測定方法は上述したとおりである。γ-グルタミルバリン合成酵素は、適当な条件でγ-グルタミルバリン合成酵素活性を有していればよい。γ-グルタミルバリン合成酵素は、例えば、Mg2+またはMn2+の存在下、特にMg2+の存在下、でγ-グルタミルバリン合成酵素活性を有していてよい。また、γ-グルタミルバリン合成酵素は、例えば、pH7.0~9.0の少なくともいずれかのpH、特にpH9.0、でγ-グルタミルバリン合成酵素活性を有していてよい。
 γ-グルタミルバリン合成酵素は、YBDKよりも高いVal選択性を示すのが好ましい。γ-グルタミルバリン合成酵素において、Val選択性は、例えば、3.0以上、5.0以上、10以上、15以上、または20以上であってよい。また、γ-グルタミルバリン合成酵素において、Val選択性は、例えば、1000万以下、100万以下、10万以下、1万以下、1000以下、100以下、または50以下であってよい。また、γ-グルタミルバリン合成酵素において、Val選択性は、例えば、それらの組み合わせの範囲であってもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素は、適切な条件で上記例示したVal選択性を示すものであってよい。γ-グルタミルバリン合成酵素は、例えば、Mg2+またはMn2+の存在下、特にMg2+の存在下、で上記例示したVal選択性を示すものであってよい。また、γ-グルタミルバリン合成酵素は、例えば、pH7.0~9.0の少なくともいずれかのpH、特にpH9.0、で上記例示したVal選択性を示すものであってよい。
 特に、Val選択性が高いγ-グルタミルバリン合成酵素をグルタチオン合成酵素と組み合わせて利用することにより、Glu、Val、およびGlyを原料として、γ-グルタミルグリシンの副生を低減しつつγ-グルタミルバリルグリシンを効率的に生産できると期待される。また、特に、γ-グルタミルバリン合成酵素活性(比活性)が高いγ-グルタミルバリン合成酵素を利用することにより、GluおよびValを原料としてγ-グルタミルバリンを効率的に生産できると期待される。
 γ-グルタミルバリン合成酵素としては、例えば、コクリア(Kocuria)属細菌やミクロコッカス(Micrococcus)属細菌のγ-グルタミルバリン合成酵素が挙げられる。コクリア属細菌としては、コクリア・ロゼア(Kocuria rosea)やコクリア・リゾフィラ(Kocuria rhizophila)が挙げられる。ミクロコッカス属細菌としては、ミクロコッカス・ルテウス(Micrococcus luteus)が挙げられる。すなわち、γ-グルタミルバリン合成酵素は、例えば、このような細菌に由来するタンパク質であってよい。
 コクリア・ロゼア(AJ3132)のγ-グルタミルバリン合成酵素のアミノ酸配列、およびそれをコードする遺伝子の塩基配列を、それぞれ、配列番号18および17に示す。コクリア・リゾフィラDC2201株(ATCC 9341)のγ-グルタミルバリン合成酵素のアミノ酸配列、およびそれをコードする遺伝子の塩基配列を、それぞれ、配列番号20および19に示す。ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株(ATCC 15307)のγ-グルタミルバリン合成酵素のアミノ酸配列、およびそれをコードする遺伝子の塩基配列を、それぞれ、配列番号22および21に示す。すなわち、γ-グルタミルバリン合成酵素は、例えば、配列番号18、20、または22に示すアミノ酸配列を有するタンパク質であってよい。また、γ-グルタミルバリン合成酵素は、例えば、配列番号17、19、または21に示す塩基配列を有する遺伝子にコードされるタンパク質であってよい。
 γ-グルタミルバリン合成酵素は、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有する限り、上記例示したγ-グルタミルバリン合成酵素(例えば、配列番号18、20、または22に示すアミノ酸配列を有するタンパク質)のバリアントであってもよい。同様に、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質をコードする限り、上記例示したγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子(例えば、配列番号17、19、または21に示す塩基配列を有する遺伝子)のバリアントであってもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子およびγ-グルタミルバリン合成酵素のバリアントについては、上述したybdK遺伝子およびYBDKの保存的バリアントに関する記載を準用できる。「元の機能が維持されている」とは、γ-グルタミルバリン合成酵素にあっては、タンパク質のバリアントが、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有することをいう。同バリアントがγ-グルタミルバリン合成酵素活性を有する限り、基質特異性、2価の金属イオンの要求性、pH依存性等の、同バリアントの酵素学的性質は、いずれも、元のタンパク質の酵素学的性質と同一であってもよく、同一でなくてもよい。例えば、同バリアントは、γ-グルタミルバリン以外のγ-グルタミルジペプチドを生成する活性を有していてもよく、有していなくてもよい。また、例えば、同バリアントは、上記例示したVal選択性を示してもよい。
 また、γ-グルタミルバリン合成酵素としては、例えば、WO2015/115612に記載の変異型グルタミン酸-システインリガーゼ(変異型GSHA)が挙げられる。
 本発明において、「変異型グルタミン酸-システインリガーゼ(変異型GSHA)」とは、「特定の変異」を有するGSHAをいう。また、本発明において、変異型GSHAをコードする遺伝子を、「変異型グルタミン酸-システインリガーゼ遺伝子(変異型gshA遺伝子)」ともいう。「特定の変異」については後述する。
 本発明において、「特定の変異」を有しないグルタミン酸-システインリガーゼを「野生型グルタミン酸-システインリガーゼ(野生型GSHA)」ともいう。また、本発明において、野生型GSHAをコードする遺伝子を、「野生型グルタミン酸-システインリガーゼ遺伝子(野生型gshA遺伝子)」ともいう。なお、ここでいう「野生型」とは、「変異型」と区別するための便宜上の記載であり、「特定の変異」を有しない限り、天然に得られるものには限定されない。野生型GSHAとしては、例えば、エシェリヒア・コリのGshAタンパク質等の、上記例示したGSHAが挙げられる。また、上記例示したGSHAの保存的バリアントは、「特定の変異」を有しない限り、いずれも野生型GSHAである。野生型GSHAは、通常、γ-グルタミルシステイン合成酵素活性を有するタンパク質であってよい。ただし、本発明において、野生型GSHAは、それに対応する変異型GSHAがγ-グルタミルバリン合成酵素活性を有する限り、γ-グルタミルシステイン合成酵素活性、γ-グルタミルバリン合成酵素活性、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性、またはそれらの任意の組み合わせを有していてもよく、それらのいずれも有していなくてもよい。
 変異型GSHAは、野生型GSHAのアミノ酸配列において、「特定の変異」を有する。すなわち、例えば、変異型GSHAは、配列番号24に示すアミノ酸配列において、「特定の変異」を有するタンパク質であってよい。また、例えば、変異型GSHAは、配列番号24に示すアミノ酸配列において、「特定の変異」を有し、当該「特定の変異」以外の箇所にさらに1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、又は付加を含むアミノ酸配列を有し、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質であってよい。また、言い換えると、変異型GSHAは、「特定の変異」を有する以外は、野生型GSHAと同一のアミノ酸配列を有するタンパク質であってよい。例えば、変異型GSHAは、「特定の変異」を有する以外は、配列番号24に示すアミノ酸配列を有するタンパク質であってよい。また、例えば、変異型GSHAは、「特定の変異」を有する以外は、配列番号24に示すアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、又は付加を含むアミノ酸配列を有し、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質であってよい。また、例えば、変異型GSHAは、「特定の変異」を有する以外は、配列番号24に示すアミノ酸配列に対して、80%以上、好ましくは90%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、特に好ましくは99%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有し、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質であってよい。
 「特定の変異」とは、野生型GSHAに導入した際に、γ-グルタミルバリンの生成に適した性質を野生型GSHAに付与する変異をいう。すなわち、変異型GSHAは、「特定の変異」を有することにより、野生型GSHAと比較して、γ-グルタミルバリンの生成に適した性質を有する。γ-グルタミルバリンの生成に適した性質としては、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素活性(比活性)の上昇、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性(比活性)の低下、Val選択性の上昇、およびそれらの組み合わせが挙げられる。例えば、変異型GSHAにおいては、γ-グルタミルバリン合成酵素活性(比活性)が、野生型GSHAの、1.1倍以上、1.5倍以上、2倍以上、5倍以上、10倍以上、または20倍以上に上昇していてよい。
 「特定の変異」としては、下記より選ばれる1又はそれ以上のアミノ酸残基における変異に相当する変異が挙げられる。
 L135、Q144、Y241、N243、Y300。
 上記表記において、数字は配列番号24に示す野生型GSHAのアミノ酸配列における位置を、数字の左側の文字は配列番号24に示す野生型GSHAのアミノ酸配列における当該位置のアミノ酸残基(すなわち、変異前のアミノ酸残基;一文字表記)を、各々示す。すなわち、例えば、「L135」は、配列番号24に示す野生型GSHAのアミノ酸配列における135位のLeu残基を示す。
 上記変異において、置換後のアミノ酸残基は、変異型GSHAがγ-グルタミルバリン合成酵素活性を有する限り、元のアミノ酸残基以外のいずれのアミノ酸残基であってもよい。置換後のアミノ酸残基として、具体的には、K(Lys)、R(Arg)、H(His)、A(Ala)、V(Val)、L(Leu)、I(Ile)、G(Gly)、S(Ser)、T(Thr)、P(Pro)、F(Phe)、W(Trp)、Y(Tyr)、C(Cys)、M(Met)、D(Asp)、E(Glu)、N(Asn)、Q(Gln)の内、元のアミノ酸残基以外のものが挙げられる。
 「特定の変異」として、具体的には、下記より選ばれる1又はそれ以上の変異に相当する変異が挙げられる。すなわち、「特定の変異」は、下記より選ばれる1又はそれ以上の変異に相当する変異を含んでいてよい。「特定の変異」は、例えば、下記より選ばれるいずれかの変異に相当する変異であってもよく、下記より選ばれる2又はそれ以上の変異の組み合わせに相当する変異であってもよい。また、「特定の変異」は、例えば、下記より選ばれる1又はそれ以上の変異と、それ以外のL135、Q144、Y241、N243、Y300より選ばれる1又はそれ以上のアミノ酸残基における変異との組み合わせに相当する変異であってもよい。
L135(I, F, M, V, G, A, W, K, H, R, C, N, S, T)、
Q144(F, A, N, S, D, T, R, H, G, K, Y, W, C, M, P, V, L, I)、
Y241(A)、
N243(I, W, K, R, H)、
Y300(A, H, R, K)。
 上記表記において、数字およびその左側の文字の意味は前記と同様である。数字の右側のカッコ内の文字は、変異後のアミノ酸残基(一文字表記)を示す。すなわち、例えば、「L135(I, F, M, V, G, A, W, K, H, R, C, N, S, T)」は、配列番号24に示す野生型GSHAのアミノ酸配列における135位のLeu残基がIle、Phe、Met、Val、Gly、Ala、Trp、Lys、His、Arg、Cys、Asn、Ser、およびThrのいずれかのアミノ酸残基に置換される変異を示す。なお、各変異後のアミノ酸をカッコなしで表記してもよい。すなわち、例えば、「L135I」は、配列番号24に示す野生型GSHAのアミノ酸配列における135位のLeu残基がIle残基に置換される変異を示す。
 変異の組み合わせは特に制限されない。変異の組み合わせとして、具体的には、下記の組み合わせが挙げられる。
L135I/Q144R、L135I/Q144D、L135I/Q144A、L135I/Q144L、L135I/N243W、L135I/N243F、L135F/Q144A、L135F/N243W、L135M/Q144R、L135M/Q144A、L135M/Q144L、L135M/N243W、L135M/N243F、L135M/Q144H、L135M/Q144N、L135M/N243Y、L135M/N243R、L135M/N243C、L135V/Q144R、L135V/Q144D、L135V/Q144A、L135V/Q144L、L135V/Q144V、L135V/Q144K、L135V/Q144C、L135V/Q144T、L135H/Q144R、L135G/Q144L、L135A/Q144L、L135V/N243W、L135V/N243F、L135V/N243P、Q144R/N243W、Q144R/N243F、Q144D/N243W、Q144D/N243F、Q144A/N243W、Q144A/N243F、Q144L/N243W、Q144L/N243F、L135M/Q144F、L135M/N243A、L135V/N243G、L135V/N243A、L135V/N243L、L135V/N243Y、L135V/N243K、L135V/N243R、L135V/N243H、L135V/N243D、L135V/N243E、L135V/N243C、L135V/N243Q、L135V/N243S、L135V/N243T、L135V/Q144I、L135V/Q144P、L135V/Q144W、L135V/Q144H、L135V/Q144E、L135V/Q144N、L135V/Q144S、L135K/Q144L、L135H/Q144L、L135D/Q144L、L135C/Q144L、L135Q/Q144L、L135N/Q144L、L135S/Q144L、L135T/Q144L。
 上記表記において、数字、数字の左側の文字、および数字の右側の文字の意味は前記と同様である。また、上記表記において、「/」で区切られた2又はそれ以上の変異の併記は、二重変異又はそれ以上の多重変異を示す。すなわち、例えば、「L135I/Q144R」は、L135IとQ144Rの二重変異を示す。
 また、WO2015/115612の実施例においてγ-グルタミルバリン合成酵素活性(比活性)の顕著な上昇が認められた変異として、下記の変異が挙げられる。
L135(I, M, V, G, A, K, H, C, N, S, T)、
Q144(F, A, S, D, T, R, H, K, Y, W, C, M, P, V, L, I)、
N243(R, H)、
Y300(R, K)、
L135I/Q144R、L135I/Q144D、L135I/Q144A、L135I/Q144L、L135I/N243W、L135I/N243F、L135F/Q144A、L135M/Q144R、L135M/Q144A、L135M/Q144L、L135M/N243W、L135M/Q144H、L135M/Q144N、L135M/N243C、L135V/Q144R、L135V/Q144D、L135V/Q144A、L135V/Q144L、L135V/Q144V、L135V/Q144K、L135V/Q144C、L135V/Q144T、L135H/Q144R、L135G/Q144L、L135A/Q144L、L135V/N243W、L135V/N243F、L135V/N243P、Q144R/N243W、Q144D/N243W、Q144A/N243W、Q144A/N243F、Q144L/N243W、Q144L/N243F、L135M/Q144F、L135M/N243A、L135V/N243G、L135V/N243A、L135V/N243L、L135V/N243Y、L135V/N243K、L135V/N243R、L135V/N243H、L135V/N243D、L135V/N243E、L135V/N243C、L135V/N243Q、L135V/N243S、L135V/N243T、L135V/Q144P、L135V/Q144W、L135V/Q144H、L135V/Q144E、L135V/Q144N、L135V/Q144S、L135D/Q144L、L135C/Q144L、L135N/Q144L、L135S/Q144L、L135T/Q144L。
 任意の野生型GSHAのアミノ酸配列において、「配列番号24に示すアミノ酸配列におけるn位のアミノ酸残基の変異に相当する変異」とは、配列番号24に示すアミノ酸配列におけるn位のアミノ酸残基に相当するアミノ酸残基における変異を意味する。すなわち、例えば、「L135Iに相当する変異」とは、配列番号24に示す野生型GSHAのアミノ酸配列における135位のLeu残基(L135)に相当するアミノ酸残基がIle残基に置換される変異を示す。なお、ここでいう「L135に相当するアミノ酸残基」は、通常Leu残基であってよいが、Leu残基でなくてもよい。すなわち、例えば、「L135Iに相当する変異」は、「L135に相当するアミノ酸残基」がLeu残基である場合に当該Leu残基がIle残基に置換される変異に限られず、「L135に相当するアミノ酸残基」がLys、Arg、His、Ala、Val、Gly、Ser、Thr、Pro、Phe、Trp、Tyr、Cys、Met、Asp、Glu、Asn、またはGln残基である場合に当該アミノ酸残基がIle残基に置換される変異も包含する。他の変異についても同様である。
 任意の野生型GSHAのアミノ酸配列において、「配列番号24に示すアミノ酸配列におけるn位のアミノ酸残基に相当するアミノ酸残基」とは、対象の野生型GSHAのアミノ酸配列と配列番号24のアミノ酸配列とのアラインメントにおいて配列番号24に示すアミノ酸配列におけるn位のアミノ酸残基に相当するアミノ酸残基を意味する。すなわち、上記変異において、アミノ酸残基の位置は、必ずしも野生型GSHAのアミノ酸配列における絶対的な位置を示すものではなく、配列番号24に記載のアミノ酸配列に基づく相対的な位置を示すものである。例えば、配列番号24に示すアミノ酸配列からなる野生型GSHAにおいて、n位よりもN末端側の位置で1アミノ酸残基が欠失した場合、元のn位のアミノ酸残基はN末端から数えてn-1番目のアミノ酸残基となるが、「配列番号24に示すアミノ酸配列におけるn位のアミノ酸残基に相当するアミノ酸残基」とみなされる。同様に、例えば、ある微生物のGSHAホモログのアミノ酸配列中の100位のアミノ酸残基が、配列番号24に示すアミノ酸配列中の101位に相当するときは、当該アミノ酸残基は、当該GSHAホモログにおける「配列番号24に示すアミノ酸配列における101位のアミノ酸残基に相当するアミノ酸残基」である。
 アラインメントは、例えば、公知の遺伝子解析ソフトウェアを利用して実施できる。具体的な遺伝子解析ソフトウェアとしては、日立ソリューションズ製のDNASIS、ゼネティックス製のGENETYX、DDBJが公開しているClustalWなどが挙げられる(Elizabeth C. Tyler et al., Computers and Biomedical Research, 24(1), 72-96, 1991;Barton GJ et al., Journal of molecular biology, 198(2), 327-37. 1987;Thompson JD et al., Nucleic acid Reseach, 22(22), 4673-80. 1994)。
 γ-グルタミルバリン合成酵素は、他のペプチドとの融合タンパク質であってもよい。「他のペプチド」は、γ-グルタミルバリン合成酵素がγ-グルタミルバリン合成酵素活性を有する限り、特に制限されない。「他のペプチド」は、その利用目的等の諸条件に応じて適宜選択できる。「他のペプチド」としては、ペプチドタグ、シグナルペプチド、プロテアーゼの認識配列が挙げられる。「他のペプチド」は、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素のN末端、若しくはC末端、またはその両方に連結されてよい。「他のペプチド」としては、1種のペプチドを用いてもよく、2種またはそれ以上のペプチドを組み合わせて用いてもよい。
 ペプチドタグとして、具体的には、Hisタグ、FLAGタグ、GSTタグ、Mycタグ、MBP(maltose binding protein)、CBP(cellulose binding protein)、TRX(Thioredoxin)、GFP(green fluorescent protein)、HRP(horseradish peroxidase)、ALP(Alkaline Phosphatase)、抗体のFc領域が挙げられる。Hisタグとしては、6xHisタグが挙げられる。ペプチドタグは、例えば、発現したγ-グルタミルバリン合成酵素の検出や精製に利用できる。
 シグナルペプチドは、γ-グルタミルバリン合成酵素を発現させる宿主で機能するものであれば、特に制限されない。シグナルペプチドとしては、Sec系分泌経路で認識されるシグナルペプチドやTat系分泌経路で認識されるシグナルペプチドが挙げられる。Tat系分泌経路で認識されるシグナルペプチドとして、具体的には、E. coliのTorAシグナル配列、E. coliのSufIシグナル配列、Bacillus subtilisのPhoDシグナル配列、Bacillus subtilisのLipAシグナル配列、Arthrobacter globiformisのIMDシグナル配列が挙げられる(WO2013/118544)。シグナルペプチドは、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素の分泌生産に利用できる。シグナルペプチドを利用してγ-グルタミルバリン合成酵素を分泌生産する場合、分泌時にシグナルペプチドが切断され、シグナルペプチドを有さないγ-グルタミルバリン合成酵素が菌体外に分泌され得る。
 プロテアーゼの認識配列として、具体的には、Factor Xaプロテアーゼの認識配列やproTEVプロテアーゼの認識配列が挙げられる。プロテアーゼの認識配列は、例えば、発現したγ-グルタミルバリン合成酵素の切断に利用できる。具体的には、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素をペプチドタグとの融合タンパク質として発現させる場合、γ-グルタミルバリン合成酵素とペプチドタグの連結部にプロテアーゼの認識配列を導入することにより、発現したγ-グルタミルバリン合成酵素からプロテアーゼを利用してペプチドタグを切断し、ペプチドタグを有さないγ-グルタミルバリン合成酵素を得ることができる。
 γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、上記例示したγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子またはその保存的バリアントの塩基配列において、任意のコドンをそれと等価のコドンに置換したものであってもよい。例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、使用する宿主のコドン使用頻度に応じて最適なコドンを有するように改変されてよい。具体的には、例えば、開始コドンがATG以外である場合に、開始コドンをATGに改変することができる。また、エシェリヒア・コリでの発現に最適化したコクリア・ロゼア(AJ3132)のγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の塩基配列を配列番号29に示す。
 なお、本発明において、「遺伝子」という用語は、目的のタンパク質をコードする限り、DNAに限られず、任意のポリヌクレオチドを包含してよい。すなわち、「γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子」とは、γ-グルタミルバリン合成酵素をコードする任意のポリヌクレオチドを意味してよい。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、DNAであってもよく、RNAであってもよく、その組み合わせであってもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、一本鎖であってもよく、二本鎖であってもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、一本鎖DNAであってもよく、一本鎖RNAであってもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、二本鎖DNAであってもよく、二本鎖RNAであってもよく、DNA鎖とRNA鎖からなるハイブリッド鎖であってもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、単一のポリヌクレオチド鎖中に、DNA残基とRNA残基の両方を含んでいてもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子がRNAを含む場合、上記例示した塩基配列等のDNAに関する記載は、RNAに合わせて適宜読み替えてよい。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の態様は、その利用態様等の諸条件に応じて適宜選択できる。
 γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する生物からのクローニングにより取得できる。クローニングには、同遺伝子を含むゲノムDNAやcDNA等の核酸を利用できる。また、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、化学合成によっても取得できる(Gene, 60(1), 115-127 (1987))。
 また、取得したγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を適宜改変してそのバリアントを取得することもできる。遺伝子の改変は公知の手法により行うことができる。例えば、部位特異的変異法により、DNAの目的部位に目的の変異を導入することができる。すなわち、例えば、部位特異的変異法により、コードされるタンパク質の特定の部位のアミノ酸残基が置換、欠失、挿入または付加を含むように、遺伝子のコード領域を改変することができる。部位特異的変異法としては、PCRを用いる方法(Higuchi, R., 61, in PCR technology, Erlich, H. A. Eds., Stockton press (1989);Carter, P., Meth. in Enzymol., 154, 382 (1987))や、ファージを用いる方法(Kramer,W. and Frits, H. J., Meth. in Enzymol., 154, 350 (1987);Kunkel, T. A. et al., Meth. in Enzymol., 154, 367 (1987))が挙げられる。
 また、変異型gshA遺伝子は、例えば、野生型gshA遺伝子を、コードされるGSHAが上記「特定の変異」を有するよう改変することにより取得できる。改変のもとになる野生型gshA遺伝子は、例えば、野生型gshA遺伝子を有する生物からのクローニングにより、または、化学合成により、取得できる。また、変異型gshA遺伝子は、野生型gshA遺伝子を介さずに取得することもできる。例えば、化学合成等により変異型gshA遺伝子を直接取得してもよく、変異型gshA遺伝子をさらに改変することにより別の変異型gshA遺伝子を取得してもよい。
 γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を宿主に導入する手法は特に制限されない。宿主において、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、当該宿主で機能するプロモーターの制御下で発現可能に保持されていればよい。宿主において、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、プラスミドのように染色体外で自律複製するベクター上に存在していてもよく、染色体上に導入されていてもよい。宿主は、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を1コピーのみ有していてもよく、2またはそれ以上のコピーで有していてもよい。宿主は、1種類のγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子のみを有していてもよく、2またはそれ以上の種類のγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有していてもよい。なお、「変異型gshA遺伝子を宿主に導入する」ことには、宿主の染色体上のgshA遺伝子を「特定の変異」を有するように改変することも含まれる。
 γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を発現させるためのプロモーターは、宿主において機能するものであれば特に制限されない。「宿主において機能するプロモーター」とは、宿主においてプロモーター活性を有するプロモーターをいう。プロモーターは、宿主由来のプロモーターであってもよく、異種由来のプロモーターであってもよい。プロモーターは、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の固有のプロモーターであってもよく、他の遺伝子のプロモーターであってもよい。プロモーターは、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の固有のプロモーターよりも強力なプロモーターであってもよい。エシェリヒア・コリ等の腸内細菌科の細菌において機能する強力なプロモーターとしては、例えば、T7プロモーター、trpプロモーター、trcプロモーター、lacプロモーター、tacプロモーター、tetプロモーター、araBADプロモーター、rpoHプロモーター、PRプロモーター、およびPLプロモーターが挙げられる。また、コリネ型細菌において機能する強力なプロモーターとしては、人為的に設計変更されたP54-6プロモーター(Appl.Microbiol.Biotechnol., 53, 674-679(2000))、コリネ型細菌内で酢酸、エタノール、ピルビン酸等で誘導できるpta、aceA、aceB、adh、amyEプロモーター、コリネ型細菌内で発現量が多い強力なプロモーターであるcspB、SOD、tuf(EF-Tu)プロモーター(Journal of Biotechnology 104 (2003) 311-323, Appl Environ Microbiol. 2005 Dec;71(12):8587-96.)、lacプロモーター、tacプロモーター、trcプロモーターが挙げられる。また、プロモーターとしては、各種レポーター遺伝子を用いることにより、在来のプロモーターの高活性型のものを取得し利用してもよい。例えば、プロモーター領域内の-35、-10領域をコンセンサス配列に近づけることにより、プロモーターの活性を高めることができる(国際公開第00/18935号)。高活性型プロモーターとしては、各種tac様プロモーター(Katashkina JI et al. Russian Federation Patent application 2006134574)やpnlp8プロモーター(WO2010/027045)が挙げられる。プロモーターの強度の評価法および強力なプロモーターの例は、Goldsteinらの論文(Prokaryotic promoters in biotechnology. Biotechnol. Annu. Rev., 1, 105-128 (1995))等に記載されている。
 また、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の下流には、転写終結用のターミネーターを配置することができる。ターミネーターは、宿主において機能するものであれば特に制限されない。ターミネーターは、宿主由来のターミネーターであってもよく、異種由来のターミネーターであってもよい。ターミネーターは、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の固有のターミネーターであってもよく、他の遺伝子のターミネーターであってもよい。ターミネーターとして、具体的には、例えば、T7ターミネーター、T4ターミネーター、fdファージターミネーター、tetターミネーター、およびtrpAターミネーターが挙げられる。
 γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、例えば、同遺伝子を含むベクターを用いて宿主に導入することができる。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を含むベクターを、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現ベクターまたは組み換えベクターともいう。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現ベクターは、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を含むDNA断片を宿主で機能するベクターと連結することにより、構築することができる。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現ベクターで宿主を形質転換することにより、同ベクターが導入された形質転換体が得られる、すなわち、同遺伝子を宿主に導入することができる。ベクターとしては、宿主の細胞内において自律複製可能なベクターを用いることができる。ベクターは、マルチコピーベクターであるのが好ましい。また、ベクターは、形質転換体を選択するために、抗生物質耐性遺伝子などのマーカーを有することが好ましい。また、ベクターは、挿入された遺伝子を発現するためのプロモーターやターミネーターを備えていてもよい。ベクターは、例えば、細菌プラスミド由来のベクター、酵母プラスミド由来のベクター、バクテリオファージ由来のベクター、コスミド、またはファージミド等であってよい。エシェリヒア・コリ等の腸内細菌科の細菌において自律複製可能なベクターとして、具体的には、例えば、pUC19、pUC18、pHSG299、pHSG399、pHSG398、pBR322、pSTV29(いずれもタカラバイオ社より入手可)、pACYC184、pMW219(ニッポンジーン社)、pTrc99A(ファルマシア社)、pPROK系ベクター(クロンテック社)、pKK233‐2(クロンテック社製)、pET系ベクター(ノバジェン社)、pQE系ベクター(キアゲン社)、pACYC、広宿主域ベクターRSF1010が挙げられる。また、コリネ型細菌で自律複製可能なベクターとして、具体的には、例えば、pHM1519(Agric, Biol. Chem., 48, 2901-2903(1984));pAM330(Agric. Biol. Chem., 48, 2901-2903(1984));これらを改良した薬剤耐性遺伝子を有するプラスミド;特開平3-210184号公報に記載のプラスミドpCRY30;特開平2-72876号公報及び米国特許5,185,262号明細書公報に記載のプラスミドpCRY21、pCRY2KE、pCRY2KX、pCRY31、pCRY3KE及びpCRY3KX;特開平1-191686号公報に記載のプラスミドpCRY2およびpCRY3;特開昭58-192900号公報に記載のpAJ655、pAJ611及びpAJ1844;特開昭57-134500号公報に記載のpCG1;特開昭58-35197号公報に記載のpCG2;特開昭57-183799号公報に記載のpCG4およびpCG11が挙げられる。発現ベクターの構築の際には、例えば、固有のプロモーター領域を含むγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子をそのままベクターに組み込んでもよく、γ-グルタミルバリン合成酵素のコード領域を上記のようなプロモーターの下流に結合してからベクターに組み込んでもよく、ベクター上にもともと備わっているプロモーターの下流にγ-グルタミルバリン合成酵素のコード領域を組み込んでもよい。
 各種微生物において利用可能なベクター、プロモーター、ターミネーターに関しては、例えば「微生物学基礎講座8 遺伝子工学、共立出版、1987年」に詳細に記載されており、それらを利用することが可能である。
 また、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、例えば、宿主の染色体上へ導入することができる。染色体への遺伝子の導入は、例えば、相同組み換えを利用して行うことができる(MillerI, J. H. Experiments in Molecular Genetics, 1972, Cold Spring Harbor Laboratory)。相同組み換えを利用する遺伝子導入法としては、例えば、Redドリブンインテグレーション(Red-driven integration)法(Datsenko, K. A, and Wanner, B. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 97:6640-6645 (2000))等の直鎖状DNAを用いる方法、温度感受性複製起点を含むプラスミドを用いる方法、接合伝達可能なプラスミドを用いる方法、宿主内で機能する複製起点を持たないスイサイドベクターを用いる方法、ファージを用いたtransduction法が挙げられる。遺伝子は、1コピーのみ導入されてもよく、2コピーまたはそれ以上導入されてもよい。例えば、染色体上に多数のコピーが存在する配列を標的として相同組み換えを行うことで、染色体へ遺伝子の多数のコピーを導入することができる。染色体上に多数のコピーが存在する配列としては、反復DNA配列(repetitive DNA)、トランスポゾンの両端に存在するインバーテッド・リピートが挙げられる。また、本発明の実施に不要な遺伝子等の染色体上の適当な配列を標的として相同組み換えを行ってもよい。本発明の実施に不要な遺伝子としては、例えば、ybdK遺伝子、gshA遺伝子、ggt遺伝子が挙げられる。また、遺伝子は、トランスポゾンやMini-Muを用いて染色体上にランダムに導入することもできる(特開平2-109985号公報、US5,882,888、EP805867B1)。染色体への遺伝子の導入の際には、例えば、固有のプロモーター領域を含むγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子をそのまま染色体に組み込んでもよく、γ-グルタミルバリン合成酵素のコード領域を上記のようなプロモーターの下流に結合してから染色体に組み込んでもよく、染色体上にもともと存在するプロモーターの下流にγ-グルタミルバリン合成酵素のコード領域を組み込んでもよい。
 染色体上に遺伝子が導入されたことは、例えば、同遺伝子の全部又は一部と相補的な塩基配列を有するプローブを用いたサザンハイブリダイゼーション、または同遺伝子の塩基配列に基づいて作成したプライマーを用いたPCRによって確認できる。
 形質転換法は特に限定されず、従来知られた方法を用いることができる。形質転換法としては、例えば、エシェリヒア・コリ K-12について報告されているような、受容菌細胞を塩化カルシウムで処理してDNAの透過性を増す方法(Mandel, M. and Higa, A.,J. Mol. Biol. 1970, 53, 159-162)、バチルス・ズブチリスについて報告されているような、増殖段階の細胞からコンピテントセルを調製してDNAを導入する方法(Duncan, C. H., Wilson, G. A. and Young, F. E.., 1997. Gene 1: 153-167)などが挙げられる。また、形質転換法としては、バチルス・ズブチリス、放線菌類及び酵母について知られているような、DNA受容菌の細胞を、組換えDNAを容易に取り込むプロトプラストまたはスフェロプラストの状態にして組換えDNAをDNA受容菌に導入する方法(Chang, S.and Choen, S.N., 1979. Mol. Gen. Genet. 168: 111-115; Bibb, M. J., Ward, J. M. and Hopwood, O. A. 1978. Nature 274: 398-400; Hinnen, A., Hicks, J. B. and Fink, G. R. 1978. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75: 1929-1933)も応用できる。また、形質転換法としては、コリネ型細菌について報告されているような、電気パルス法(特開平2-207791号公報)を利用することもできる。
 また、本来的にγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主を、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現が増大するよう改変してもよい。「遺伝子の発現が増大する」とは、同遺伝子の発現が非改変株と比較して増大することを意味する。「遺伝子の発現が増大する」とは、具体的には、同遺伝子の細胞当たりの発現量が非改変株と比較して増大することを意味してよい。ここでいう「非改変株」とは、標的の遺伝子の発現が増大するように改変されていない対照株を意味する。非改変株としては、野生株や親株が挙げられる。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現を増大させる手法としては、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子のコピー数を増加させることやγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の転写効率や翻訳効率を向上させることが挙げられる。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子のコピー数の増加は、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を宿主に導入することにより達成できる。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の導入は、上述したように実施できる。なお、導入されるγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、同種由来であってもよく、異種由来であってもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の転写効率や翻訳効率の向上は、プロモーター、シャインダルガノ(SD)配列(リボソーム結合部位(RBS)ともいう)、およびRBSと開始コドンとの間のスペーサー領域等の、遺伝子の発現調節配列の改変により達成できる。例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の転写効率の向上は、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子のプロモーターをより強力なプロモーターに置換することにより達成できる。より強力なプロモーターとしては、上述したような強力なプロモーターが挙げられる。
 γ-グルタミルバリン合成酵素は、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主にγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を発現させることにより製造できる。なお、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現を、「γ-グルタミルバリン合成酵素の発現」ともいう。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主を培養することにより、γ-グルタミルバリン合成酵素を発現させることができる。その際、必要に応じて、遺伝子の発現誘導を行う。宿主の培養条件や遺伝子の発現誘導の条件は、マーカーの種類、プロモーターの種類、および宿主の種類等の諸条件に応じて適宜選択すればよい。培養に用いる培地は、宿主が増殖でき、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素を発現できるものであれば特に制限されない。培地としては、例えば、炭素源、窒素源、イオウ源、無機イオン、及び必要に応じその他の有機成分を含有する通常の培地を用いることができる。
 炭素源としては、グルコース、フラクトース、シュクロース、糖蜜、でんぷんの加水分解物等の糖類、グリセロール、エタノール等のアルコール類、フマル酸、クエン酸、コハク酸等の有機酸類が挙げられる。
 窒素源としては、硫酸アンモニウム、塩化アンモニウム、リン酸アンモニウム等の無機アンモニウム塩、大豆加水分解物などの有機窒素、アンモニアガス、アンモニア水が挙げられる。
 イオウ源としては、硫酸塩、亜硫酸塩、硫化物、次亜硫酸塩、チオ硫酸塩等の無機硫黄化合物が挙げられる。
 無機イオンとしては、カルシウムイオン、マグネシウムイオン、マンガンイオン、カリウムイオン、鉄イオン、リン酸イオンが挙げられる。
 その他の有機成分としては、有機微量栄養源が挙げられる。有機微量栄養源としては、ビタミンB1などの要求物質や、それらを含む酵母エキス等が挙げられる。
 培養温度は、例えば、20℃~45℃、好ましくは24℃~45℃、より好ましくは30℃~37℃であってよい。培養は、通気培養が好ましい。その際の酸素濃度は、例えば、飽和濃度に対して5~50%に、好ましくは10%程度に調節してよい。培養中のpHは、5~9が好ましい。尚、pH調整には無機あるいは有機の酸性あるいはアルカリ性物質、例えば炭酸カルシウム、アンモニアガス、アンモニア水等、を使用することができる。
 上記のような条件下で、好ましくは10時間~120時間程度培養することにより、γ-グルタミルバリン合成酵素を含む培養物が得られる。γ-グルタミルバリン合成酵素は、例えば、宿主の菌体内に蓄積し得る。尚、使用する宿主及びγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の設計によっては、ペリプラズムにγ-グルタミルバリン合成酵素を蓄積させることや、菌体外にγ-グルタミルバリン合成酵素を分泌生産させることも可能である。
 γ-グルタミルバリン合成酵素は、菌体等に含まれたまま使用してもよく、適宜、菌体等から分離精製し粗酵素画分又は精製酵素として使用してもよい。また、γ-グルタミルバリン合成酵素は、遊離の状態で利用されてもよいし、樹脂等の固相に固定化された固定化酵素の状態で利用されてもよい。
 例えば、宿主の菌体内にγ-グルタミルバリン合成酵素が蓄積する場合、適宜、菌体を破砕、溶解、または抽出等し、γ-グルタミルバリン合成酵素を回収することができる。菌体は、遠心分離等により培養物から回収することができる。細胞の破砕、溶解、または抽出等は、公知の方法により行うことができる。そのような方法としては、例えば、例えば、超音波破砕法、ダイノミル法、ビーズ破砕、フレンチプレス破砕、リゾチーム処理が挙げられる。これらの方法は、1種を単独で用いてもよく、2種またはそれ以上を適宜組み合わせて用いてもよい。また、例えば、培地にγ-グルタミルバリン合成酵素が蓄積する場合、遠心分離等により培養上清を取得し、培養上清からγ-グルタミルバリン合成酵素を回収することができる。
 γ-グルタミルバリン合成酵素の精製は、酵素の精製に用いられる公知の方法により行うことができる。そのような方法としては、例えば、硫安分画、イオン交換クロマトグラフィー、疎水クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー、等電点沈殿が挙げられる。これらの方法は、1種を単独で用いてもよく、2種またはそれ以上を適宜組み合わせて用いてもよい。γ-グルタミルバリン合成酵素の精製は、所望の程度に行うことができる。例えば、GGT等のγ-グルタミルペプチドの分解に関与する成分がγ-グルタミルバリン合成酵素と共存している場合には、そのような成分を除去するのが好ましい。
 精製されたγ-グルタミルバリン合成酵素は、本発明の方法における「γ-グルタミルバリン合成酵素」として利用できる。
 また、精製されたγ-グルタミルバリン合成酵素に限られず、γ-グルタミルバリン合成酵素を含有する任意の画分を本発明の方法における「γ-グルタミルバリン合成酵素」として利用してもよい。すなわち、本発明の方法における「γ-グルタミルバリン合成酵素」とは、そのような画分に含有されるものであってよい。γ-グルタミルバリン合成酵素を含有する画分は、γ-グルタミルバリン合成酵素がGluおよびValに作用できるように含有される限り特に制限されない。そのような画分としては、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主(γ-グルタミルバリン合成酵素を有する宿主)の培養物、同培養物から回収した菌体(培養菌体)、同菌体の破砕物、同菌体の溶解物、同菌体の抽出物(無細胞抽出液)、同菌体をアクリルアミドやカラギーナン等の担体で固定化した固定化菌体等の菌体処理物、同培養物から回収した培養上清、それらの部分精製物(粗精製物)、それらの組み合わせが挙げられる。これらの画分は、いずれも、単独で利用されてもよいし、精製されたγ-グルタミルバリン合成酵素と共に利用されてもよい。
<3>グルタチオン合成酵素およびその製造
 「グルタチオン合成酵素(glutathione synthase)」は、通常、γ-Glu-CysとGlyとATPを基質として、グルタチオン(γ-Glu-Cys-Gly)とADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を有する酵素(EC 6.3.2.3)として知られている。同活性を、「グルタチオン合成酵素活性」ともいう。
 また、γ-Glu-ValとGlyとATPを基質として、γ-Glu-Val-GlyとADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を、「γ-グルタミルバリルグリシン合成酵素(gamma-Glutamylvalylglycine synthethase)活性」または「γ-Glu-Val-Gly生成(合成)活性」ともいう。
 本発明において、グルタチオン合成酵素としては、γ-グルタミルバリルグリシン合成酵素活性を有するものを用いる。すなわち、本発明において、「グルタチオン合成酵素」とは、γ-グルタミルバリルグリシン合成酵素活性を有するタンパク質をいう。
 本発明において、グルタチオン合成酵素は、γ-グルタミルバリルグリシン合成酵素活性を有する限り、γ-グルタミルバリルグリシン以外のγ-グルタミルトリペプチドを生成する活性を有していてもよく、有していなくてもよい。すなわち、例えば、グルタチオン合成酵素は、グルタチオン合成酵素活性を有していてもよく、有していなくてもよい。
 グルタチオン合成酵素のγ-グルタミルバリルグリシン合成酵素活性は、例えば、反応液組成を12.5 mMγ-Glu-Val、12.5 mM Gly、12.5 mM ATP、12.5 mM MgS04、2 mMジチオスレイトール、100 mM Tris-HCl緩衝液(pH8.0)、反応温度37℃、反応時間1分~50時間として、適切な量のグルタチオン合成酵素を用いて測定することができる。本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Val-Glyを生成する酵素活性を1 Uのγ-グルタミルバリルグリシン合成酵素活性とする。
 グルタチオン合成酵素としては、gshB遺伝子によりコードされるGshBタンパク質やGSH2遺伝子によりコードされるGsh2タンパク質が挙げられる。gshB遺伝子としては、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)等のエシェリヒア属細菌のgshB遺伝子が挙げられる。GSH2遺伝子としては、サッカロマイセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)等のサッカロマイセス属酵母のGSH2遺伝子が挙げられる。また、グルタチオン合成酵素としては、WO2013/054447に記載の変異型グルタチオン合成酵素も挙げられる。エシェリヒア・コリK-12 MG1655株のgshB遺伝子の塩基配列は、GenBank accession NC_000913.3としてNCBIデータベースに登録されているゲノム配列中の3,089,900~3,090,850位の配列に相当する。MG1655株(エシェリヒア・コリK-12 W3110株においても同一)のgshB遺伝子の塩基配列を配列番号27に示す。また、同遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列を配列番号28に示す。すなわち、グルタチオン合成酵素は、例えば、配列番号27に示す塩基配列を有する遺伝子にコードされるタンパク質であってよい。また、グルタチオン合成酵素は、例えば、配列番号28に示すアミノ酸配列を有するタンパク質であってよい。グルタチオン合成酵素は、γ-グルタミルバリルグリシン合成酵素活性を有する限り、上記グルタチオン合成酵素のバリアントであってもよい。グルタチオン合成酵素やそれをコードする遺伝子のバリアントについては、上述したYBDKやybdK遺伝子の保存的バリアントに関する記載を準用できる。なお、「gshB遺伝子」および「GshBタンパク質」という用語は、それぞれ、上記例示したgshB遺伝子およびGshBタンパク質に加えて、それらの保存的バリアントを包含するものとする。また、「GSH2遺伝子」および「Gsh2タンパク質」という用語は、それぞれ、上記例示したGSH2遺伝子およびGsh2タンパク質に加えて、それらの保存的バリアントを包含するものとする。グルタチオン合成酵素は、他のペプチドとの融合タンパク質であってもよい。融合タンパク質については、上述したγ-グルタミルバリン合成酵素における融合タンパク質に関する記載を準用できる。
 グルタチオン合成酵素は、グルタチオン合成酵素をコードする遺伝子(「グルタチオン合成酵素遺伝子」ともいう)を有する宿主にグルタチオン合成酵素遺伝子を発現させることにより製造できる。なお、「グルタチオン合成酵素遺伝子を有する」ことを、「グルタチオン合成酵素を有する」ともいう。すなわち、例えば、グルタチオン合成酵素遺伝子を有する宿主を、「グルタチオン合成酵素を有する宿主」ともいう。また、グルタチオン合成酵素遺伝子の発現を、「グルタチオン合成酵素の発現」ともいう。グルタチオン合成酵素遺伝子を有する宿主は、本来的にグルタチオン合成酵素遺伝子を有するものであってもよく、グルタチオン合成酵素遺伝子を有するように改変されたものであってもよい。本来的にグルタチオン合成酵素遺伝子を有する宿主としては、上記gshB遺伝子を有するエシェリヒア・コリや上記GSH2遺伝子を有するサッカロマイセス・セレビシエ等の微生物が挙げられる。グルタチオン合成酵素遺伝子を有するように改変された宿主としては、グルタチオン合成酵素遺伝子が導入された宿主が挙げられる。グルタチオン合成酵素遺伝子を導入する宿主は、機能するグルタチオン合成酵素を発現できるものであれば特に制限されない。宿主としては、例えば、細菌、放線菌、酵母、真菌、植物細胞、昆虫細胞、および動物細胞が挙げられる。好ましい宿主としては、細菌や酵母等の微生物が挙げられる。細菌としては、例えば、エシェリヒア(Escherichia)属細菌、エンテロバクター(Enterobacter)属細菌、パントエア(Pantoea)属細菌等の腸内細菌科(Enterobacteriaceae)に属する細菌、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属細菌等のコリネ型細菌、バチルス(Bacillus)属細菌が挙げられる。宿主としては、中でも、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)を好適に用いることができる。また、本来的にグルタチオン合成酵素遺伝子を有する宿主を、グルタチオン合成酵素遺伝子の発現が増大するよう改変してもよい。グルタチオン合成酵素遺伝子の導入等の宿主の改変については、上述したγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の導入等の宿主の改変に関する記載を準用できる。ベクターやプロモーター等の宿主の改変に利用する材料は宿主の種類に応じて適宜選択できる。グルタチオン合成酵素遺伝子を発現するための宿主は、YBDKの活性が低下するように改変されていてもよい。また、グルタチオン合成酵素遺伝子を発現するための宿主は、γ-グルタミルシステイン合成酵素の活性が低下するように改変されていてもよい。また、グルタチオン合成酵素遺伝子を発現するための宿主は、γ-グルタミルトランスフェラーゼ(GGT)等のγ-グルタミルペプチドの分解に関与するタンパク質の活性が低下するように改変されていてもよい。
 本発明の微生物を、グルタチオン合成酵素の発現宿主として利用することもできる。すなわち、本発明の微生物は、グルタチオン合成酵素遺伝子を有していてもよい。また、本発明の微生物は、グルタチオン合成酵素遺伝子とγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の両方を有していてもよい。
 また、グルタチオン合成酵素は、グルタチオン合成酵素遺伝子を無細胞タンパク質合成系で発現させることによっても製造できる。
 グルタチオン合成酵素遺伝子を有する宿主を利用したグルタチオン合成酵素の製造については、上述したγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主を利用したγ-グルタミルバリン合成酵素の製造に関する記載を準用できる。「菌体」は、宿主の種類に応じて、適宜「細胞」と読み替えてよい。製造されたグルタチオン合成酵素(精製されたグルタチオン合成酵素やグルタチオン合成酵素を含有する画分)は、本発明の方法における「グルタチオン合成酵素」として利用できる。なお、グルタチオン合成酵素は、単独で製造してもよく、γ-グルタミルバリン合成酵素とまとめて製造してもよい。すなわち、本発明の微生物がグルタチオン合成酵素遺伝子とγ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子の両方を有する場合、本発明の微生物にそれらの遺伝子を発現させることにより、グルタチオン合成酵素とγ-グルタミルバリン合成酵素をまとめて製造することができる。
<4>γ-グルタミルバリルグリシン(γ-Glu-Val-Gly)の製造法
 本発明は、γ-グルタミルバリン合成酵素を利用したγ-Glu-Valの製造法やγ-グルタミルバリン合成酵素を利用したγ-Glu-Val-Gly(CAS 38837-70-6、Gluvalicineとも呼ぶ)の製造法を提供する。これらの方法を総称して、「本発明の方法」ともいう。γ-Glu-Val-Glyの構造式を下記式(I)に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000001
<4-1>酵素法
 本発明は、γ-グルタミルバリン合成酵素を利用してγ-Glu-Val-Glyを酵素的に製造する方法を提供する。同方法を、「本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(酵素法)」ともいう。
 本発明においては、γ-グルタミルバリン合成酵素を利用することにより、GluとValとを反応させ、γ-Glu-Valを生成することができる。すなわち、本発明は、(A)γ-グルタミルバリン合成酵素をGluおよびValに作用させることによりγ-Glu-Valを生成する工程、を含むγ-Glu-Valの製造法を提供する。同方法を、「本発明のγ-Glu-Valの製造法(酵素法)」ともいう。生成したγ-Glu-Valは、適宜、反応液から回収することができる。
 さらに、生成したγ-Glu-Valを原料としてγ-Glu-Val-Glyを製造することができる。γ-Glu-Valを原料としてγ-Glu-Val-Glyを製造する方法としては、グルタチオン合成酵素を利用する方法が知られている(特開2012-85637)。具体的には、グルタチオン合成酵素を利用することにより、γ-Glu-ValとGlyとを反応させ、γ-Glu-Val-Glyを生成することができる。すなわち、本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(酵素法)の一態様(「第1の態様」ともいう)は、(A)γ-グルタミルバリン合成酵素をGluおよびValに作用させることによりγ-Glu-Valを生成する工程、および(B)グルタチオン合成酵素を工程(A)で生成したγ-Glu-ValおよびGlyに作用させることによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法である。
 第1の態様において、工程(A)と工程(B)は、それぞれ別個に実施してもよく、一部または全部の期間において同時に実施してもよい。すなわち、例えば、工程(A)と工程(B)を同時に開始してもよく、工程(A)の進行中または完了後に工程(B)を開始してもよい。反応開始時にγ-グルタミルバリン合成酵素、グルタチオン合成酵素、Glu、Val、およびGlyを反応系に共存させることで、工程(A)と工程(B)を同時に開始することができる。また、グルタチオン合成酵素および/またはGlyが反応系に共存していない条件下で工程(A)を開始し、工程(A)の進行中または完了後にグルタチオン合成酵素および/またはGlyを反応系に共存させることで、工程(B)を開始することができる。また、工程(A)で生成したγ-Glu-Valを回収し、回収したγ-Glu-Valを用いて工程(B)を実施してもよい。γ-Glu-Valは、適宜、精製、希釈、濃縮、乾燥、溶解等の処理に供してから、工程(B)に用いてもよい。
 なお、本発明のγ-Glu-Valの製造法(酵素法)の工程(A)は、例えば、第1の態様の工程(A)を単独で実施するのと同様の態様で実施できる。
 また、本発明においては、γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を利用することにより、GluとValとGlyとを反応させ、γ-Glu-Val-Glyを生成することができる。すなわち、本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(酵素法)の別の態様(「第2の態様」ともいう)は、(C)γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を、Glu、Val、およびGlyに作用させることにより、γ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法である。第2の態様においては、γ-グルタミルバリン合成酵素、グルタチオン合成酵素、Glu、Val、およびGlyを反応系に共存させることにより、γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を、Glu、Val、およびGlyにまとめて作用させ、γ-Glu-Val-Glyを製造することができる。
 本発明の方法において、γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を総称して「酵素」ともいう。Glu、Val、およびGlyを総称して「アミノ酸」ともいう。γ-Glu-Valおよびγ-Glu-Val-Glyを総称して「ペプチド」ともいう。Glu、Val、Gly、およびγ-Glu-Valを総称して「基質」ともいう。「基質」には、特記しない限り、さらにATPを含めてよい。酵素とそれに対応する基質との反応を「酵素反応」ともいう。なお、酵素法において、「γ-グルタミルバリン合成酵素」とは、本発明の微生物を発現宿主として得られたものを指す。
 本発明の方法に用いられる各酵素の態様は上述した通りである。すなわち、各酵素としては、例えば、精製された酵素、酵素を含有する任意の画分、またはそれらの組み合わせを用いることができる。各酵素としては、1種の酵素を用いてもよく、2種またはそれ以上の酵素を組み合わせて用いてもよい。
 アミノ酸としては、市販品を用いてもよく、適宜製造して取得したものを用いてもよい。アミノ酸の製造方法は特に制限されず、例えば、公知の方法を利用できる。アミノ酸は、例えば、化学合成、酵素反応、またはその組み合わせにより製造することができる。また、アミノ酸は、例えば、当該アミノ酸の生産能を有する微生物を培養し、培養物から当該アミノ酸を回収することにより、製造することができる。アミノ酸の生産能を有する微生物としては、例えば、後述するようなアミノ酸生産菌を利用できる。また、アミノ酸は、例えば、当該アミノ酸を含有する農水畜産物から回収することにより、製造することができる。アミノ酸としては、所望の程度に精製された精製品を用いてもよく、当該アミノ酸を含有する素材を用いてもよい。アミノ酸を含有する素材は、酵素が当該アミノ酸に作用できる態様で当該アミノ酸を含有する限り特に制限されない。アミノ酸を含有する素材として、具体的には、例えば、当該アミノ酸の生産能を有する微生物を培養して得られた培養物、該培養物から分離した培養上清、該培養物から分離した菌体、それらの濃縮物(濃縮液)や濃縮乾燥物等の処理物が挙げられる。
 本発明の方法において、アミノ酸およびペプチドは、いずれも、特記しない限り、フリー体、もしくはその塩、またはそれらの混合物であってよい。すなわち、「アミノ酸」という用語は、特記しない限り、フリー体のアミノ酸、もしくはその塩、またはそれらの混合物を意味してよい。また、「ペプチド」という用語は、特記しない限り、フリー体のペプチド、もしくはその塩、またはそれらの混合物を意味してよい。塩は、化学的に許容されるものであれば特に制限されない。また、製造されるγ-Glu-Val-Glyを経口用途(例えば飲食品への添加用途)に用いる場合、γ-Glu-Val-Glyの塩は、化学的に許容される可食性のものであれば特に制限されない。「化学的に許容される可食性の塩」として、具体的には、例えば、カルボキシル基等の酸性基に対しては、アンモニウム塩、ナトリウム、カリウム等のアルカリ金属との塩、カルシウム、マグネシウム等のアルカリ土類金属との塩、アルミニウム塩、亜鉛塩、トリエチルアミン、エタノールアミン、モルホリン、ピロリジン、ピペリジン、ピペラジン、ジシクロヘキシルアミン等の有機アミンとの塩、アルギニン、リジン等の塩基性アミン酸との塩を挙げることができる。また、「化学的に許容される可食性の塩」として、具体的には、例えば、塩基性基に対しては、塩酸、硫酸、リン酸、硝酸、臭化水素酸等の無機酸との塩、酢酸、クエン酸、安息香酸、マレイン酸、フマル酸、酒石酸、コハク酸、タンニン酸、酪酸、ヒベンズ酸、パモ酸、エナント酸、デカン酸、テオクル酸、サリチル酸、乳酸、シュウ酸、マンデル酸、リンゴ酸等の有機カルボン酸との塩、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸、p-トルエンスルホン酸等の有機スルホン酸との塩を挙げることができる。塩としては、1種の塩を用いてもよく、2種またはそれ以上の塩を組み合わせて用いてもよい。
 酵素反応は、酵素と基質を反応液中に共存させることにより達成できる。すなわち、酵素反応は、適当な反応液中で実施できる。酵素反応は、バッチ式で実施してもよく、カラム式で実施してもよい。バッチ式の場合は、反応容器内の反応液中で、酵素と基質を混合することにより、酵素反応を実施できる。酵素反応は、静置で実施してもよく、撹拌や振盪下で実施してもよい。カラム式の場合は、固定化菌体又は固定化酵素を充填したカラムに基質を含有する反応液を通液することにより、酵素反応を実施できる。反応液としては、必要な成分を含有する、水や緩衝液等を用いることができる。反応液は、例えば、酵素、基質、ATP、2価の金属イオンを含有していてよい。酵素反応に用いられる成分の組み合わせは、実施する工程の種類およびその実施態様(複数の工程を同時に実施するか等)に応じて適宜選択することができる。
 γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素は、いずれも、酵素反応にATPを利用する。よって、反応系には、ATPを適宜供給する。すなわち、反応系(反応液)は、ATPを含有していてよい。前記工程(A)~(C)は、いずれも、ATPの存在下で実施することができる。ATPの供給方法は、酵素反応にATPを利用できる限り特に制限されない。ATPは、例えば、粉末あるいは水溶液等の任意の形態で、反応液に添加することができる。また、ATPは、例えば、ATPを生成または再生する方法により反応系に供給されてもよい。ATPを生成または再生する方法としては、コリネバクテリウム属細菌を利用して炭素源からATPを供給させる方法(Hori, H et al., Appl. Microbiol. Biotechnol. 48(6): 693-698 (1997))、酵母菌体とグルコースを利用してATPを再生する方法(Yamamoto, S et al., Biosci. Biotechnol. Biochem. 69(4): 784-789 (2005))、ホスホエノールピルビン酸とピルビン酸キナーゼを利用してATPを再生する方法(C. Aug’e and Ch. Gautheron, Tetrahedron Lett. 29:789-790 (1988))、ポリリン酸とポリリン酸キナーゼを利用してATPを再生する方法(Murata, K et al., Agric. Biol. Chem. 52(6): 1471-1477 (1988))等が知られている。
 また、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素は、通常、酵素反応に2価の金属イオンを要求する。よって、反応系(反応液)は、2価の金属イオンを含有していてよい。前記工程(A)~(C)は、いずれも、2価の金属イオンの存在下で実施することができる。2価の金属イオンは、γ-グルタミルバリン合成酵素活性が得られるものであれば特に制限されない。2価の金属イオンとしては、Mg2+やMn2+が挙げられ、好ましい2価の金属イオンとしては、Mg2+が挙げられる。2価の金属イオンの濃度は、例えば、1~200mMであってよい。
 反応条件(反応液のpH、反応温度、反応時間、基質や酵素等の各種成分の濃度等)は、γ-Glu-Val-Glyが生成する限り特に制限されない。
 反応液のpHは、例えば、通常6.0~10.0、好ましくは6.5~9.0であってよい。
 反応温度は、例えば、通常15~50℃、好ましくは15~45℃、より好ましくは20~40℃であってよい。
 反応時間は、第1の態様の工程(A)および工程(B)のそれぞれについて、例えば、5分~200時間であってよい。反応時間は、第2の態様の工程(C)について、例えば、5分~200時間であってよい。反応液の通液速度は、例えば、反応時間が上記例示した反応時間の範囲となるような速度であってよい。
 反応液中の各基質の濃度は、例えば、通常0.1~2000mM、好ましくは1~2000mM、より好ましくは10~1000mMであってよい。
 反応液中の各基質のモル比は、第1の態様の工程(A)については、例えば、通常、Glu:Val:ATP=1:1:1であってよく、任意の基質の比率を0.1~10に変化させてもよい。すなわち、例えば、Glu:Val:ATP=0.1~10:0.1~10:0.1~10であってよい。反応液中の各基質のモル比は、第1の態様の工程(B)については、例えば、通常、γ-Glu-Val:Gly:ATP=1:1:1であってよく、任意の基質の比率を0.1~10に変化させてもよい。すなわち、例えば、γ-Glu-Val:Gly:ATP=0.1~10:0.1~10:0.1~10であってよい。反応液中の各基質のモル比は、第2の態様の工程(C)については、例えば、通常、Glu:Val:Gly:ATP=1:1:1:2であってよく、任意の基質の比率を0.1~10に変化させてもよく、ATPの比率を0.2~20に変化させてもよい。すなわち、例えば、Glu:Val:Gly:ATP=0.1~10:0.1~10:0.1~10:0.2~20であってよい。なお、第1の態様において工程(A)と工程(B)を同時に実施する場合、第1の態様における各基質のモル比については、適宜、第2の態様における各基質のモル比を参考にしてもよい。
 酵素の使用量は、例えば、酵素活性に基づいて設定することができる。γ-グルタミルバリン合成酵素の使用量は、GluおよびValの合計量1 mmolに対して、例えば、γ-Glu-Val生成活性に換算して、通常0.01~1000 U、好ましくは0.1~500 U、より好ましくは0.1~100 Uであってよい。ここでいう「γ-Glu-Val生成活性」とは、適切な条件、例えば、Mg2+またはMn2+の存在下、特にMg2+の存在下、pH7.0~9.0、特にpH9.0、で測定されたγ-Glu-Val生成活性であってよい。グルタチオン合成酵素の使用量は、第1の態様の工程(B)については、γ-Glu-ValおよびGlyの合計量1 mmolに対して、例えば、γ-Glu-Val-Gly生成活性に換算して、通常0.01~1000 U、好ましくは0.1~500 U、より好ましくは0.1~100 Uであってよい。グルタチオン合成酵素の使用量は、第2の態様の工程(C)については、Gluの半量、Valの半量、およびGlyの全量の合計量1 mmolに対して、例えば、γ-Glu-Val-Gly生成活性に換算して、通常0.01~1000 U、好ましくは0.1~500 U、より好ましくは0.1~100 Uであってよい。なお、第1の態様において工程(A)と工程(B)を同時に実施する場合、第1の態様におけるグルタチオン合成酵素の使用量については、適宜、第2の態様におけるグルタチオン合成酵素の使用量を参考にしてもよい。
 いずれの態様においても、酵素反応の過程において、基質、酵素、および/またはその他の成分を単独で、あるいは任意の組み合わせで、追加的に反応系に添加してもよい。これらの成分は、1回または複数回添加されてもよく、連続的に添加されてもよい。また、反応条件は、酵素反応の開始から終了まで均一であってもよく、酵素反応の過程において変化してもよい。「反応条件が酵素反応の過程において変化する」とは、反応条件が時間的に変化することに限られず、反応条件が空間的に変化することを含む。「反応条件が空間的に変化する」とは、例えば、カラム式で酵素反応を実施する場合に、反応温度や酵素濃度等の反応条件が流路上の位置に応じて異なっていることをいう。
 このようにして酵素反応を実施することにより、γ-Glu-Val-Glyを含有する反応液が得られる。γ-Glu-Val-Glyが生成したことは、化合物の検出または同定に用いられる公知の手法により確認することができる。そのような手法としては、例えば、HPLC、LC/MS、GC/MS、NMRが挙げられる。これらの手法は、1種を単独で用いてもよく、2種またはそれ以上を適宜組み合わせて用いてもよい。γ-Glu-Val-Glyは、適宜、反応液から回収することができる。γ-Glu-Val-Glyの回収は、化合物の分離精製に用いられる公知の手法により行うことができる。そのような手法としては、例えば、イオン交換クロマトグラフィー、逆相高速液体クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー等の各種クロマトグラフィー、溶液からの結晶化、再結晶が挙げられる。これらの手法は、1種を単独で用いてもよく、2種またはそれ以上を適宜組み合わせて用いてもよい。回収されるγ-Glu-Val-Glyは、γ-Glu-Val-Gly以外の成分、例えばγ-Glu-Val-Glyの製造に用いられた成分や水分等、を含んでいてもよい。γ-Glu-Val-Glyは、所望の程度に精製されていてよい。γ-Glu-Val-Glyは、例えば、30%(w/w)以上、50%(w/w)以上、70%(w/w)以上、80%(w/w)以上、90%(w/w)以上、または95%(w/w)以上の純度に精製されてよい。また、γ-Glu-Valの回収も、γ-Glu-Val-Glyの回収と同様に行うことができる。
<4-2>発酵法
 本発明は、γ-グルタミルバリン合成酵素を利用してγ-Glu-Val-Glyを発酵により製造する方法を提供する。具体的には、本発明は、γ-グルタミルバリン合成酵素を有する微生物を利用してγ-Glu-Val-Glyを発酵により製造する方法を提供する。同方法を、「本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(発酵法)」ともいう。
 本発明においては、γ-グルタミルバリン合成酵素を有する微生物を利用することにより、GluとValからγ-Glu-Valを発酵生産することができる。すなわち、本発明は、(A)γ-グルタミルバリン合成酵素を有する微生物を培地で培養することによりGluおよびValからγ-Glu-Valを生成する工程、を含むγ-Glu-Valの製造法を提供する。同方法を、「本発明のγ-Glu-Valの製造法(発酵法)」ともいう。生成したγ-Glu-Valは、適宜、培養物から回収することができる。
 さらに、グルタチオン合成酵素を有する微生物を利用することにより、γ-Glu-ValとGlyからγ-Glu-Val-Glyを発酵生産することができる。すなわち、本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(発酵法)の一態様(「第3の態様」ともいう)は、(A)γ-グルタミルバリン合成酵素を有する微生物を培地で培養することによりGluおよびValからγ-Glu-Valを生成する工程、および(B)グルタチオン合成酵素を有する微生物を培地で培養することにより工程(A)で生成したγ-Glu-ValおよびGlyからγ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法である。
 第3の態様において、工程(A)と工程(B)は、それぞれ別個に実施してもよく、一部または全部の期間において同時に実施してもよい。すなわち、例えば、工程(A)と工程(B)を同時に開始してもよく、工程(A)の進行中または完了後に工程(B)を開始してもよい。また、第3の態様において、工程(A)と工程(B)は、γ-グルタミルバリン合成酵素を有する微生物と、それとは別個の、グルタチオン合成酵素を有する微生物を用いて実施してもよく、γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素の両方を有する単一の微生物を用いて実施してもよい。例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素の両方を有する微生物を利用し、Glu、Val、およびGlyが利用可能な状態で培養を実施すれば、工程(A)と工程(B)を同時に実施することができる。また、工程(A)で生成したγ-Glu-Valを回収し、回収したγ-Glu-Valを培地に添加して工程(B)を実施してもよい。γ-Glu-Valは、適宜、精製、希釈、濃縮、乾燥、溶解等の処理に供してから、工程(B)に用いてもよい。
 なお、本発明のγ-Glu-Valの製造法(発酵法)の工程(A)は、例えば、第3の態様の工程(A)を単独で実施するのと同様の態様で実施できる。
 また、本発明においては、γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素の両方を有する微生物を利用することにより、GluとValとGlyとからγ-Glu-Val-Glyを発酵生産することができる。すなわち、本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(発酵法)の別の態様(「第4の態様」ともいう)は、(C)γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を有する微生物を培地で培養することによりGlu、Val、およびGlyからγ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法である。
 発酵法において、酵素、アミノ酸、ペプチド、基質、酵素反応等の用語は、酵素法と同様の意味で使用する。また、γ-グルタミルバリン合成酵素を有する微生物、グルタチオン合成酵素を有する微生物、およびγ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を有する微生物を総称して「微生物」ともいう。なお、発酵法において、「γ-グルタミルバリン合成酵素を有する微生物」とは、本発明の微生物であって、γ-グルタミルバリン合成酵素を有するものを指す。また、発酵法において、「γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素の両方を有する微生物」とは、本発明の微生物であって、γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素の両方を有するものを指す。
 基質となる各アミノ酸の供給方法は、酵素反応に当該アミノ酸を利用できる限り特に制限されない。各アミノ酸は、例えば、各工程で用いられる微生物により生合成されてもよく、培地に添加されてもよく、その組み合わせであってもよい。すなわち、例えば、Glu、Val、およびGlyの全てが微生物により生合成されてもよく、Glu、Val、およびGlyの全てが培地に添加されてもよい。また、例えば、Glu、Val、およびGlyの内、1種または2種のアミノ酸が微生物により生合成され、他のアミノ酸が培地に添加されてもよい。Glu、Val、およびGlyのいずれも、微生物により生合成され、且つ、培地に添加されてもよい。
 すなわち、本発明のγ-Glu-Valの製造法(発酵法)の一態様は、例えば、(A1)γ-グルタミルバリン合成酵素を有する微生物をGluおよびValを含有する培地で培養することによりγ-Glu-Valを生成する工程、を含むγ-Glu-Valの製造法であってもよく、(A2)γ-グルタミルバリン合成酵素を有し、且つ、GluおよびValの生産能を有する微生物を培地で培養することによりγ-Glu-Valを生成する工程、を含むγ-Glu-Valの製造法であってもよい。
 また、第3の態様の一態様は、例えば、(A1)と(A2)のいずれか、および、(B1)と(B2)のいずれかを含むγ-Glu-Val-Glyの製造法であってもよい:
(A1)γ-グルタミルバリン合成酵素を有する微生物をGluおよびValを含有する培地で培養することによりγ-Glu-Valを生成する工程;
(A2)γ-グルタミルバリン合成酵素を有し、且つ、GluおよびValの生産能を有する微生物を培地で培養することによりγ-Glu-Valを生成する工程;
(B1)グルタチオン合成酵素を有する微生物を工程(A1)または(A2)で生成したγ-Glu-ValおよびGlyを含有する培地で培養することによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程;
(B2)グルタチオン合成酵素を有し、且つ、Glyの生産能を有する微生物を工程(A1)または(A2)で生成したγ-Glu-Valを含有する培地で培養することによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程。
 また、第4の態様の一態様は、例えば、(C1)γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を有する微生物をGlu、Val、およびGlyを含有する培地で培養することによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法であってもよく、(C2)γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を有し、且つ、Glu、Val、およびGlyの生産能を有する微生物を培地で培養することによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法であってもよい。
 γ-グルタミルバリン合成酵素を有する微生物としては、上述したような本発明の微生物であって、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有するものを、そのまま、あるいは適宜改変して用いることができる。グルタチオン合成酵素を有する微生物としては、上述したようなグルタチオン合成酵素遺伝子を有する微生物を、そのまま、あるいは適宜改変して用いることができる。γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を有する微生物としては、上述したような本発明の微生物であって、γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子とグルタチオン合成酵素遺伝子の両方を有するものを、そのまま、あるいは適宜改変して用いることができる。
 アミノ酸の生産能を有する微生物は、本来的にアミノ酸の生産能を有するものであってもよく、アミノ酸の生産能を有するように改変されたものであってもよい。アミノ酸の生産能を有する微生物は、微生物にアミノ酸生産能を付与することにより、または、微生物のアミノ酸生産能を増強することにより、取得できる。γ-グルタミルバリン合成酵素遺伝子および/またはグルタチオン合成酵素遺伝子の導入等の酵素生産能の付与または増強と、アミノ酸生産能の付与または増強とは、いずれを先に実施してもよい。すなわち、γ-グルタミルバリン合成酵素および/またはグルタチオン合成酵素を有し、且つ、アミノ酸の生産能を有する微生物は、γ-グルタミルバリン合成酵素および/またはグルタチオン合成酵素を有する微生物を、アミノ酸生産能を有するように改変することにより取得してもよく、アミノ酸生産能を有する微生物を、γ-グルタミルバリン合成酵素および/またはグルタチオン合成酵素を有するように改変することにより取得してもよい。L-アミノ酸生産能の付与または増強は、従来、コリネ型細菌又はエシェリヒア属細菌等のアミノ酸生産菌の育種に採用されてきた方法により行うことができる(アミノ酸発酵、(株)学会出版センター、1986年5月30日初版発行、第77~100頁参照)。そのような方法としては、例えば、栄養要求性変異株の取得、L-アミノ酸のアナログ耐性株の取得、代謝制御変異株の取得、L-アミノ酸の生合成系酵素の活性が増強された組換え株の創製が挙げられる。また、L-アミノ酸生産能の付与又は増強は、目的のL-アミノ酸の生合成経路から分岐して目的のL-アミノ酸以外の化合物を生成する反応を触媒する酵素の活性を低下させることによっても行うことができる。
 L-グルタミン酸生産菌としては、コリネバクテリウム・グルタミカム(ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム)ATCC13869株より取得されたodhA欠損株に、V197M変異を有するmviN遺伝子を導入した組換え株(特開2010-161970)、ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム由来gltA(クエン酸シンターゼ)遺伝子を導入したパントエア・アグロメランスAJ13355株(特許第4285582号)、グルタミンシンセターゼの397位のチロシン残基が他のアミノ酸残基に置換されたグルタミンシンセターゼを有するエシェリヒア属細菌(米国特許出願公開第2003-0148474号明細書)などが例示できる。L-バリン生産菌としては、エシェリヒア・コリVL1970株(米国特許第5658766号)、エシェリヒア属に属し、生育のためにリポ酸を要求する変異および/またはH+-ATPaseを欠損する変異を有するエシェリヒア属細菌、および、これらの性質に加えて、少なくともilvG、ilvM、ilvE、およびilvDの各遺伝子を発現し、且つ、スレオニンデアミナーゼ活性を発現しないilvGMEDAオペロンを含むDNA断片が細胞内に導入されたエシェリヒア属細菌(WO96/06926)などが例示できる。すなわち、例えば、これらの改変を微生物に導入することにより、アミノ酸生産能を付与または増強できる。
 また、微生物は、培地中に添加されたアミノ酸を取り込む能力が向上するよう改変されていてもよい。また、微生物は、その利用態様に応じて、生成したγ-Glu-Valを菌体外に排出する能力が向上するよう改変されていてもよく、培地中に添加されたγ-Glu-Valを取り込む能力が向上するよう改変されていてもよい。また、微生物は、生成したγ-Glu-Val-Glyを菌体外に排出する能力が向上するよう改変されていてもよい。
 培養条件は、微生物が増殖でき、γ-Glu-Val-Glyが生成する限り、特に制限されない。培養条件については、上述したγ-グルタミルバリン合成酵素の製造法における培養条件の記載を参照できる。
 γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素は、いずれも、酵素反応にATPを利用する。よって、反応系には、ATPを適宜供給する。すなわち、反応系は、ATPを含有していてよい。前記工程(A)~(C)は、いずれも、ATPの存在下で実施することができる。ATPの供給方法は、酵素反応にATPを利用できる限り特に制限されない。ATPは、例えば、各工程で用いられる微生物により生成されてもよく、上述したようなATPを生成または再生する方法により反応系に供給されてもよい。ATPの供給には、例えば、通常のエネルギー代謝によるATP再生系が強化された微生物やポリリン酸キナーゼの作用でATPを再生する能力を有する微生物を培養液中に共存させる方法等の共培養系(特公平7-16431、特公平6-69386)が好適に利用できる。
 また、例えば、γ-グルタミルバリン合成酵素は、通常、酵素反応に2価の金属イオンを要求する。よって、反応系は、2価の金属イオンを含有していてよい。前記工程(A)~(C)は、いずれも、2価の金属イオンの存在下で実施することができる。
 アミノ酸を含有する培地を用いる場合、アミノ酸は、培養開始時から培地に含まれていてもよく、培養途中の任意の時点で培地に添加されてもよい。添加のタイミングは、培養時間等の諸条件に応じて適宜変更できるが、一例としては、培養終了時の好ましくは0~50時間前、より好ましくは0.1~24時間前、特に好ましくは0.5~6時間前であってよい。アミノ酸は、1回または複数回添加されてもよく、連続的に添加されてもよい。培地中の各アミノ酸の濃度は、例えば、通常0.1~2000mM、好ましくは1~2000mM、より好ましくは10~1000mMであってよい。また、培地中の各基質のモル比については、酵素法における反応液中の各基質のモル比に関する記載を準用してもよい。
 このようにして培養を行うことにより、γ-Glu-Val-Glyを含む培養物が得られる。γ-Glu-Val-Glyが生成したことは、上述したように、化合物の検出または同定に用いられる公知の手法により確認することができる。γ-Glu-Val-Glyは、適宜、培養物から回収することができる。γ-Glu-Val-Glyの回収は、上述したように、化合物の分離精製に用いられる公知の手法により行うことができる。なお、菌体内にL-アミノ酸が蓄積する場合には、例えば、菌体を超音波などにより破砕し、遠心分離によって菌体を除去して得られる上清から、イオン交換樹脂法などによってγ-Glu-Val-Glyを回収することができる。
 また、グルタチオン合成酵素を有する微生物が酵母であり、γ-Glu-Val-Glyが菌体内に蓄積する場合、同酵母は、例えば、γ-Glu-Val-Glyを含有する酵母エキスの製造に利用できる。すなわち、本発明は、同酵母を原料として用いて酵母エキスを調製することを含む、γ-Glu-Val-Glyを含有する酵母エキスの製造法を提供する。酵母からの酵母エキスの調製は、通常の酵母エキスの調製と同様にして行えばよい。酵母エキスは、酵母菌体を熱水抽出したものを処理したものでもよいし、酵母菌体を消化したものを処理したものでもよい。また、必要に応じて、得られた酵母エキスを濃縮してもよいし、乾燥し粉末の形態にしてもよい。
 以下、本発明を実施例に基づいて更に具体的に説明する。
〔実施例1〕ybdK遺伝子発現プラスミドの構築
 エシェリヒア・コリMG1655(ATCC 47076)のybdK遺伝子の発現プラスミドpSF12-EcybdKを以下の手順で構築した。ybdK遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるYBDKアミノ酸配列を、それぞれ配列番号15および配列番号16に示す。なお、pSF12-EcybdKによれば、YBDKはC末端にHisタグが付加された形態で発現する。
 初めに、エシェリヒア・コリW3110株(ATCC 27325)由来のγ-グルタミルトランスペプチダーゼをコードするggt遺伝子とrpoHプロモーターを含むpUC18由来プラスミドpSF12_ggt(WO2013/051685A1)をNdeI/PstI消化し、QIAquick Gel Extraction Kit(Qiagen社製)にて精製し、約3.0kbの断片を得た。
 次に、エシェリヒア・コリMG1655株のゲノムDNAを鋳型として、PrimeSTAR Maxポリメラーゼ(タカラバイオ社製)を使用して、製造元のプロトコールに従ってPCRを行い、ybdK遺伝子を含む約1.2kbの断片を得た。プライマーとしては、配列番号1および配列番号2のプライマーの組み合わせ(表1)を使用した。
 次に、pSF12_ggtをNdeI/PstI消化して得られた約3.0kbの断片とPCRで得られたybdK遺伝子を含む約1.2kbの断片を、In-Fusion HD Cloning Kit(Clontech社製)を用いて、製造元のプロトコールに従って融合させた。該反応液でエシェリヒア・コリJM109株を形質転換し、100μg/mLのアンピシリンナトリウム(Amp)を含むLB寒天培地(1.0%(w/v)ペプトン、0.5%(w/v)酵母エキス、1.0%(w/v)NaCl、1.5%(w/v)寒天)に塗布後、30℃で20時間培養した。生育してきた形質転換体のコロニーから公知の方法に従ってプラスミドを抽出し、3130ジェネティックアナライザー(Life Technologies社製)を用いて塩基配列の確認を行い、目的の構造を持つプラスミドをpSF12-EcybdKと命名した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
〔実施例2〕C末端にHisタグ付加されたエシェリヒア・コリMG1655株由来YBDKの精製
 実施例1で取得したpSF12-EcybdKプラスミドを有するJM109株を100μg/mLのAmpを含むLB培地3 mLに接種し、30℃、120往復/分で20時間振とう培養することで前培養液を得た。得られた前培養液150μLを、100μg/mLのAmpを含むTB培地(1.2%(w/v)トリプトン、2.4%(w/v)酵母エキス、0.4%(w/v)グリセロール、0.23%(w/v)KH2PO4、1.25%(w/v)K2HPO4)15 mLを張り込んだ70 mL容の試験管(φ25mm)に接種し、30℃、120往復/分で20時間振とう培養した。遠心分離(4℃、12,000×g、5分)によって集菌し、得られた菌体を0.2 mLの緩衝液(20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 300 mM NaCl, 10 mM イミダゾール, 15 % グリセロール)に懸濁し、冷却しながら超音波破砕処理に供して菌体を破砕した。得られた菌体破砕液を遠心分離(4℃、29,100×g、10分)し、得られた上清を無細胞抽出液とした。
 得られた無細胞抽出液を、予め緩衝液(20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 300 mM NaCl, 10 mM イミダゾール, 15 % グリセロール)で平衡化したNi Sepharose 6 Fast Flowビーズ(GEヘルスケア社製)にアプライし、溶離緩衝液(20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 300 mM NaCl, 250 mM イミダゾール, 15 % グリセロール)により酵素を溶出し、活性画分を得た。この活性画分を精製YBDKとして、以降の実験に用いた。
〔実施例3〕精製YBDKによるγ-グルタミルジペプチドの生成
 実施例2で取得した精製YBDKについて、γ-Glu-Val合成活性およびγ-Glu-Gly合成活性を測定した。
 γ-Glu-Val合成活性の測定条件は以下の通りである。反応液組成は10 mM グルタミン酸、10 mM バリン、10 mM ATP、10 mM MnS04、100 mM Tris-HCl (pH7.0)とした。反応液量は0.2 mLとし、精製酵素を添加することによって酵素反応を開始した。この時、精製YBDKは0.1 g/Lとなるように反応液に添加した。反応温度は30℃とし、反応時間は30分間とした。反応を停止する際には、反応液0.2 mLに対して、0.2 mLの200 mM 硫酸を添加した。反応終了後に、HPLCにて生成したγ-Glu-Valを定量した。本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Valを生成する酵素活性を1 Uのγ-Glu-Val合成活性とした。
 γ-Glu-Valの定量条件は以下の通りである。カラムには、Phenomenex社製Synergi 4μ Hydro-RP 80A(粒子径4μm、内径4.6 mm、長さ250 mm)を用いた。溶離液には、溶離液A(50 mMリン酸二水素ナトリウム(pH2.5、リン酸によってpH調整))、及び、溶離液B(溶離液Aとアセトニトリルの1:1(v/v)の混合液)を93:7(v/v)の比率で混合した混合液を用いた。流速は1.0 mL/min、カラム温度は40℃、UV検出波長は210 nmとした。
 γ-Glu-Gly合成活性を測定する場合には、上記反応液中のバリンをグリシンに置き換え、精製YBDKを0.025 g/Lとなるように反応液に添加し、酵素反応を実施した。上記の手順で反応を停止した後、生成したγ-Glu-Glyを定量した。本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Glyを生成する酵素活性を1 Uのγ-Glu-Gly合成活性とした。
 γ-Glu-Glyの定量条件は以下の通りである。カラムには、ジーエルサイエンス社製Inertsil ODS-3(粒子径5μm、内径4.6 mm、長さ250 mm)を用いた。溶離液には、溶離液C(100 mMリン酸二水素カリウム、5 mMオクタンスルホン酸ナトリウム(pH2.2、リン酸によってpH調整))を用いた。流速は1.5 mL/min、カラム温度は40℃、UV検出波長は210 nmとした。
 以上の方法により、γ-Glu-Val生成量及びγ-Glu-Gly生成量を定量し、比活性を算出した。結果を表2に示す。表中、「反応(A)」はγ-Glu-Gly合成活性の比活性、「反応(B)」はγ-Glu-Val合成活性の比活性、「(B)/(A)」は、γ-Glu-Gly合成活性の比活性に対するγ-Glu-Val合成活性の比活性の比率をそれぞれ示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
〔実施例4〕エシェリヒア・コリJM109株由来ggt遺伝子、gshA遺伝子、及びybdK遺伝子の三重破壊株の作製
(1)エシェリヒア・コリJM109株由来ggt遺伝子破壊株の作製
 エシェリヒア・コリJM109株を親株として、GGT非産生株の構築を行った。ggt遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるGGTのアミノ酸配列を、それぞれ配列番号25および配列番号26に示す。
 遺伝子の破壊は、DatsenkoとWannerによって最初に開発された「Red-driven integration」と呼ばれる方法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, vol.97, No.12, p6640-6645)とλファージ由来の切り出しシステム(J. Bacteriol. 2002 Sep; 184(18): 5200-3. Interactions between integrase and excisionase in the phage lambda excisive nucleoprotein complex. Cho EH, Gumport RI, Gardner JF.)を組み合わせた方法(WO2005/010175号参照)によって行った。「Red-driven integration」法によれば、標的遺伝子の一部に対応する配列を5'側にデザインした合成オリゴヌクレオチドをプライマーとするPCRにより得られた抗生物質耐性遺伝子を含むPCR産物を用いて、染色体上の標的遺伝子を抗生物質耐性遺伝子に置換し、遺伝子破壊株を構築することができる。さらにλファージ由来の切り出しシステムを組み合わせることにより、遺伝子破壊株に組み込んだ抗生物質耐性遺伝子を除去することが出来る。
 「Red-driven integration」法のPCRの鋳型としては、pMW118-attL-Cm-attR(WO2006/078039)を使用した。pMW118-attL-Cm-attR(WO2006/078039)は、pMW118(ニッポンジーン社製)にλファージのアタッチメントサイトであるattL及びattR遺伝子と抗生物質耐性遺伝子であるcat遺伝子を挿入したプラスミドであり、attL-cat-attRの順で挿入されている。このattLとattRの両端に対応する配列をプライマーの3'末端に、標的遺伝子の一部に対応する配列をプライマーの5'末端に有する合成オリゴヌクレオチドをプライマーに用いてPCRを行い、遺伝子破壊用断片を得た。得られた遺伝子破壊用断片を用いて遺伝子破壊株を構築した。手順を以下に示す。
 ggt遺伝子破壊用断片は次のようにして取得した。すなわち、エシェリヒア・コリJM109株のゲノムDNAを鋳型とし、配列番号3および配列番号4のプライマーを用いて、KOD-plus-Ver.2(東洋紡社製)にて製造元のプロトコールに従ってPCRを行うことで、ggt遺伝子上流0.3kbを増幅し、DNAフラグメントAを得た。同様に、エシェリヒア・コリJM109株のゲノムDNAを鋳型に、配列番号5および配列番号6のプライマーを用いてPCRを行うことで、ggt遺伝子下流領域0.3kbを増幅し、DNAフラグメントCを得た。同様に、pMW118-attL-Cm-attRを鋳型として、配列番号7および配列番号8のプライマーを用いてPCRを行うことで、1.6kbのDNAフラグメントBを得た。50μLのPCR反応液に対してフラグメントA/B/Cを50/10/50ngとして、10サイクルのPCR反応を行った。この反応液(1μL)を鋳型として、配列番号3および配列番号6のプライマーを用いて、2kbのDNA断片を増幅し、QIAquick Gel Extraction Kit(Qiagen社製)にて精製し、ggt遺伝子破壊用断片を得た。用いたプライマーを表3に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000004
 得られたggt遺伝子破壊用DNA断片を、プラスミドpKD46(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, vol. 97, No. 12, p6640-6645)を含むエシェリヒア・コリJM109株にエレクトロポレーションにより導入した。プラスミドpKD46は、アラビノース誘導性ParaBプロモーターに制御されるλRed相同組換えシステムのRedレコンビナーゼをコードする遺伝子(γ、β、exo遺伝子)を含むλファージの合計2154塩基のDNAフラグメント(GenBank/EMBL Accession;JO2459、第31088~33241位)を含む、温度感受性の複製能を有するプラスミドである。プラスミドpKD46は遺伝子破壊用DNA断片をJM109株の染色体に組み込むために必要である。
 エレクトロポレーション用のコンピテントセルは次のようにして調製した。すなわち、100mg/LのAmpを含んだLB培地中で30℃、20時間培養したプラスミドpKD46を含むエシェリヒア・コリJM109株を、Amp(100mg/L)を含んだ2mLのSOB培地(モレキュラークローニング:実験室マニュアル第2版、Sambrrok, J.ら,Cold SpringHarbor Laboratory Press(1989年))で50倍希釈した。得られた希釈物を30℃でOD610が約0.3になるまで生育させた後、10%(v/v)のL-アラビノースを70μL添加し、37℃で1時間培養した。得られた培養液を65倍に濃縮し、10%(v/v)グリセロールで3回洗浄することによってエレクトロポレーション用のコンピテントセルを得た。
 エレクトロポレーション後、細胞懸濁液に、0.3mLのSOC培地を加えて37℃で3時間培養した後、37℃でクロラムフェニコール(Cm)(50mg/L)を含むLB-寒天培地上で培養し、Cm耐性組換え体を選択した。
 次に、pKD46プラスミドを除去するために、Cm(50mg/L)を含むLB-寒天培地上で42℃にて培養し、得られたコロニーのAmp耐性を試験し、pKD46が脱落しているAmp感受性株を取得した。Cm耐性遺伝子によって識別できた変異体のggt遺伝子の破壊を、PCRによって確認した。得られたggt遺伝子破壊株をJM109Δggt:att-cat株と命名した。
 次に、ggt遺伝子内に導入されたatt-cat遺伝子の除去を行うために、ヘルパープラスミドとしてpMW-intxis-ts(WO2007/037460)を使用した。pMW-intxis-tsは、λファージのインテグラーゼ(Int)をコードする遺伝子、及び、エクシジョナーゼ(Xis)をコードする遺伝子を搭載する、温度感受性の複製能を有するプラスミドである。pMW-intxis-ts導入により、染色体上のattLあるいはattRを認識して組換えを起こし、attLとattRの間の遺伝子を切り出し、染色体上にはattLあるいはattR配列のみ残る。上記で得られたJM109Δggt:att-cat株を、pMW-intxis-tsにて形質転換し、30℃で100 mg/LのAmpを含むLB-寒天培地上にて培養し、Amp耐性株を選択した。
 次に、pMW-intxis-tsプラスミドを除去するために、LB寒天培地にて42℃で培養し、得られたコロニーのAmp耐性及びCm耐性を試験して、att-cat及びpMW-intxis-tsが脱落し、かつ、ggt遺伝子が破壊された株である、Cm及びAmp感受性株を取得した。この株をJM109Δggt株と命名した。
(2)エシェリヒア・コリJM109株由来ggt遺伝子及びgshA遺伝子の2重破壊株の作製
 エシェリヒア・コリJM109Δggt株を親株として、GGT及びGSHA非産生株の構築を行った。gshA遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるGSHAのアミノ酸配列を、それぞれ配列番号23および配列番号24に示す。
 gshA遺伝子破壊用DNA断片は、pMW118-attL-Cm-attRを鋳型とし、配列番号9および配列番号10のプライマー(表4)を用いて、KOD-plus-Ver.2(東洋紡社製)にて製造元のプロトコールに従ってPCRを行うことで得た。そのgshA遺伝子破壊用DNA断片を、pKD46を含むJM109Δggt株にエレクトロポレーションにより導入した。pKD46を含むJM109Δggt株のエレクトロポレーション用のコンピテントセルは、実施例4(1)に記載の方法と同様の手法で取得した。エレクトロポレーション後、細胞懸濁液に、0.3mLのSOC培地を加えて37℃で3時間培養した後、37℃でCm(50mg/L)を含むLB-寒天培地上で培養し、Cm耐性組換え体を選択した。次に、pKD46プラスミドを除去するために、Cm(50mg/L)を含むLB-寒天培地上で42℃にて培養し、得られたコロニーのAmp耐性を試験し、pKD46が脱落しているAmp感受性株を取得した。Cm耐性遺伝子によって識別できた変異体のgshA遺伝子の破壊を、PCRによって確認した。得られたgshA遺伝子破壊株をJM109ΔggtΔgshA:att-cat株と命名した。
 次に、gshA遺伝子内に導入されたatt-cat遺伝子の除去を行うために、上記で得られたJM109ΔggtΔgshA:att-cat株を、pMW-intxis-tsにて形質転換し、30℃で100 mg/LのAmpを含むLB-寒天培地上にて培養し、Amp耐性株を選択した。
 次に、pMW-intxis-tsプラスミドを除去するために、LB寒天培地にて42℃で培養し、得られたコロニーのAmp耐性及びCm耐性を試験して、att-cat及びpMW-intxis-tsが脱落し、かつ、gshA遺伝子が破壊された株である、Cm及びAmp感受性株を取得した。この株をJM109ΔggtΔgshA株と命名した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000005
(3)エシェリヒア・コリJM109株由来ggt遺伝子、gshA遺伝子、及びybdK遺伝子の3重破壊株の作製
 エシェリヒア・コリJM109ΔggtΔgshA株を親株として、GGT、GSHA、及びYBDK非産生株の構築を行った。ybdK遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるYBDKのアミノ酸配列を、それぞれ配列番号15および配列番号16に示す。
 ybdK遺伝子破壊用DNA断片は、pMW118-attL-Cm-attRを鋳型とし、配列番号11および配列番号12のプライマー(表5)を用いて、PrimeSTAR Maxポリメラーゼ(タカラバイオ社製)にて製造元のプロトコールに従ってPCRを行うことで得た。そのybdK遺伝子破壊用DNA断片を、pKD46を含むJM109ΔggtΔgshA株にエレクトロポレーションにより導入した。pKD46を含むJM109ΔggtΔgshA株のエレクトロポレーション用のコンピテントセルは、実施例4(1)に記載の方法と同様の手法で取得した。エレクトロポレーション後、細胞懸濁液に、0.3mLのSOC培地を加えて37℃で3時間培養した後、37℃でCm(50mg/L)を含むLB-寒天培地上で培養し、Cm耐性組換え体を選択した。
 次に、pKD46プラスミドを除去するために、Cm(50mg/L)を含むLB-寒天培地上で42℃にて培養し、得られたコロニーのAmp耐性を試験し、pKD46が脱落しているAmp感受性株を取得した。Cm耐性遺伝子によって識別できた変異体のybdK遺伝子の破壊を、PCRによって確認した。得られたybdK遺伝子破壊株をJM109ΔggtΔgshAΔybdK:att-cat株と命名した。
 次に、ybdK遺伝子内に導入されたatt-cat遺伝子の除去を行うために、上記で得られたJM109ΔggtΔgshAΔybdK:att-cat株を、pMW-intxis-tsにて形質転換し、30℃で100 mg/LのAmpを含むLB-寒天培地上にて培養し、Amp耐性株を選択した。
 次に、pMW-intxis-tsプラスミドを除去するために、LB寒天培地にて42℃で培養し、得られたコロニーのAmp耐性及びCm耐性を試験して、att-cat及びpMW-intxis-tsが脱落し、かつ、ybdK遺伝子が破壊された株である、Cm及びAmp感受性株を取得した。この株をJM109ΔggtΔgshAΔybdK株と命名した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
〔実施例5〕コクリア・ロゼア由来γ-Glu-Val合成酵素発現株の構築
 エシェリヒア・コリJM109株由来ggt遺伝子及びgshA遺伝子の2重破壊株(JM109ΔggtΔgshA)およびggt遺伝子、gshA遺伝子、及びybdK遺伝子の3重破壊株(JM109ΔggtΔgshAΔybdK)を発現宿主として、コクリア・ロゼア由来γ-Glu-Val合成酵素発現株を構築した。コクリア・ロゼア(AJ3132)株由来のγ-Glu-Val合成酵素をコードするKrgshA遺伝子の塩基配列を配列番号17に示す。同遺伝子にコードされるγ-Glu-Val合成酵素のアミノ酸配列を配列番号18に示す。なお、KrgshA遺伝子の発現プラスミドpSF-KrgshAの構築に際し、KrgshA遺伝子の塩基配列(配列番号17)を基に、エシェリヒア・コリ発現用にコドンを最適化した塩基配列をデザインした。エシェリヒア・コリ発現用にコドンを最適化したKrgshA遺伝子の塩基配列を配列番号29に示す。
 初めに、エシェリヒア・コリW3110株(ATCC 27325)由来のγ-グルタミルトランスペプチダーゼをコードするggt遺伝子とrpoHプロモーターを含むpUC18由来プラスミドpSF12_ggt(WO2013/051685A1)をNdeI/PstI消化し、QIAquick Gel Extraction Kit(Qiagen社製)にて精製し、約3.0kbの断片を得た。
 次に、コクリア・ロゼア(AJ3132)由来のKrgshA遺伝子の塩基配列(配列番号17)を基に、エシェリヒア・コリ発現用にコドンを最適化したcDNA(配列番号29)をユーロフィンジェノミクス株式会社に発注した。納品されたプラスミドを鋳型にPhusion High-Fidelity DNA Polymerase(FINNZYMES社製)を使用して、製造元のプロトコールに従ってPCRを行い、KrgshA遺伝子を含む約1.2kbの断片を得た。プライマーとしては、配列番号13および配列番号14の組合せ(表6)を使用した。
 次に、PCRで得られたKrgshA遺伝子を含む約1.2kbのPCR断片とpSF12_ggtをNdeI/PstI消化して得られた約3.0kbの断片を、In-fusion HD Cloning Kit(Clonech社製)を用いて、製造元のプロトコールに従って融合させた。該反応液でエシェリヒア・コリJM109株を形質転換し、100μg/mLのアンピシリンナトリウム(Amp)を含むLB寒天培地に塗布後、30℃で20時間培養した。生育してきた形質転換体のコロニーから公知の方法に従ってプラスミドを抽出し、3130ジェネティックアナライザー(Life Technologies社製)を用いて塩基配列の確認を行い、目的の構造を持つプラスミドをpSF12-KrGshAと命名した。
 実施例4にて取得したJM109ΔggtΔgshA株とJM109ΔggtΔgshAΔybdK株をpSF12-KrgshAにてそれぞれ形質転換し、pSF12KrgshAを有する形質転換体を得た。この形質転換体を、それぞれJM109ΔggtΔgshA/pSF12-KrgshA株およびJM109ΔggtΔgshAΔybdK/pSF12-KrgshA株と命名した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000007
〔実施例6〕コクリア・ロゼア由来γ-Glu-Val合成酵素発現株の無細胞抽出液を用いたγ-グルタミルジペプチドの生成
 エシェリヒア・コリJM109株由来ggt遺伝子及びgshA遺伝子の2重破壊株(JM109ΔggtΔgshA)およびggt遺伝子、gshA遺伝子、及びybdK遺伝子の3重破壊株(JM109ΔggtΔgshAΔybdK)を発現宿主として構築したコクリア・ロゼア由来γ-Glu-Val合成酵素発現株の無細胞抽出液を用いたγ-グルタミルジペプチドの生成を検討した。
 実施例5で取得したJM109ΔggtΔgshA/pSF12-KrgshA株とJM109ΔggtΔgshAΔybdK/pSF12-KrgshA株をそれぞれ100μg/mLのAmpを含むLB培地3mLに接種し、30℃、120往復/分で20時間振とう培養することで前培養液を得た。得られた前培養液150μLを、100μg/mLのAmpを含むTB培地15mLを張り込んだ70mL容の試験管(φ25mm)に接種し、30℃、120往復/分で20時間振とう培養した。遠心分離(4℃、12,000×g、5分)によって集菌し、得られた菌体を0.2 mLの緩衝液(20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 300 mM NaCl, 10 mM イミダゾール, 15 % グリセロール)に懸濁し、冷却しながら超音波破砕処理に供して菌体を破砕した。得られた菌体破砕液を遠心分離(4℃、29,100×g、10分)し、得られた上清を無細胞抽出液とした。
 まず、該無細胞抽出液を用いてγ-Glu-Val合成活性を測定した。反応液組成は100 mM グルタミン酸、100 mM バリン、40 mM ATP、20 mM MgS04、100 mM Tris-HCl (pH 7.0)とした。反応液量は0.5 mLとした。0.25 mgのタンパク質を含む無細胞抽出液を添加することによって酵素反応を開始した。反応温度は30℃とし、反応時間は30分間とした。反応を停止する際には、反応液0.5 mLに対して、0.5 mLの200 mM硫酸を添加した。反応終了後に、実施例3に示した方法でγ-Glu-Valを定量し、無細胞抽出液当たりのγ-Glu-Val合成活性を算出した。その結果を表7に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000008
 続いて、得られた無細胞抽出液を用いて、Glu、Val、及びGly存在下でのγ-Glu-Val合成量及びγ-Glu-Gly合成量を測定した。反応液組成は100 mM グルタミン酸、50 mM バリン、50 mM グリシン、40 mM ATP、20 mM MgS04、100 mM Tris-HCl (pH 7.0)とした。無細胞抽出液を添加することによって酵素反応を開始した。反応を停止する際には、反応液量と等量の200mM 硫酸を添加した。反応終了後に、実施例3に示した方法でγ-Glu-Val及びγ-Glu-Glyを定量した。その結果を表8と表9に示す。なお、表8は、γ-Glu-Val合成酵素活性が0.004 Uとなるように無細胞抽出液を反応液に添加した場合の結果を示す。その際の反応液量は0.2 mLとし、反応温度は30℃、反応時間は16時間とした。また、表9は、2.5 mgのタンパク質を含む無細胞抽出液を反応液に添加した場合の結果を示す。その際の反応液量は0.5 mLとし、反応温度は30℃、反応時間は2.5時間とした。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000009
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000010
 本発明によれば、γ-Glu-Val合成酵素の発現宿主として有用な微生物を提供できる。同微生物で発現させたγ-Glu-Val合成酵素を利用して、γ-Glu-Valやγ-Glu-Val-Glyを効率よく製造することができる。例えば、同微生物で発現させたγ-Glu-Val合成酵素をグルタチオン合成酵素と組み合わせて利用することにより、Glu、Val、及びGlyを原料として、γ-Glu-Glyの副生を低減しつつγ-Glu-Val-Glyを製造することができると期待される。
<配列表の説明>
配列番号1~14:プライマー
配列番号15:エシェリヒア・コリK-12 W3110株のybdK遺伝子の塩基配列
配列番号16:エシェリヒア・コリK-12 W3110株のYBDKのアミノ酸配列
配列番号17:コクリア・ロゼア(AJ3132)のγ-Glu-Val合成酵素遺伝子の塩基配列
配列番号18:コクリア・ロゼア(AJ3132)のγ-Glu-Val合成酵素のアミノ酸配列
配列番号19:コクリア・リゾフィラDC2201株のγ-Glu-Val合成酵素遺伝子の塩基配列
配列番号20:コクリア・リゾフィラDC2201株のγ-Glu-Val合成酵素のアミノ酸配列
配列番号21:ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株のγ-Glu-Val合成酵素遺伝子の塩基配列
配列番号22:ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株のγ-Glu-Val合成酵素のアミノ酸配列
配列番号23:エシェリヒア・コリK-12 W3110株のgshA遺伝子の塩基配列
配列番号24:エシェリヒア・コリK-12 W3110株のGSHAのアミノ酸配列
配列番号25:エシェリヒア・コリK-12 MG1655株のggt遺伝子の塩基配列
配列番号26:エシェリヒア・コリK-12 MG1655株のGGTのアミノ酸配列
配列番号27:エシェリヒア・コリK-12 W3110株のgshB遺伝子の塩基配列
配列番号28:エシェリヒア・コリK-12 W3110株のGSHBのアミノ酸配列
配列番号29:エシェリヒア・コリでの発現に最適化したコクリア・ロゼア(AJ3132)のγ-Glu-Val合成酵素遺伝子の塩基配列

Claims (23)

  1.  ybdK遺伝子にコードされるタンパク質の活性が非改変株と比較して低下するように改変され、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素をコードする遺伝子を有する細菌であって、
     前記γ-グルタミルバリン合成酵素におけるγ-グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ-グルタミルバリン合成酵素活性の比率が3.0以上である、細菌。
  2.  前記タンパク質が、下記(a)、(b)、または(c)に記載のタンパク質である、請求項1に記載の細菌:
    (a)配列番号16に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
    (b)配列番号16に示すアミノ酸配列において、1~10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有するタンパク質;
    (c)配列番号16に示すアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ-グルタミルグリシン合成酵素活性を有するタンパク質。
  3.  前記タンパク質の活性が、ybdK遺伝子の発現を低下させることにより、またはybdK遺伝子を破壊することにより、低下した、請求項1または2に記載の細菌。
  4.  前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、下記(a)、(b)、または(c)に記載のタンパク質である、請求項1~3のいずれか1項に記載の細菌:
    (a)配列番号18、20、または22に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
    (b)配列番号18、20、または22に示すアミノ酸配列において、1~10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質;
    (c)配列番号18、20、または22に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
  5.  前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、野生型グルタミン酸-システインリガーゼにおいて下記より選ばれる1またはそれ以上のアミノ酸残基に相当するアミノ酸残基に変異を有し、且つ、γ-グルタミルバリン合成酵素活性を有する変異型グルタミン酸-システインリガーゼである、請求項1~3のいずれか1項に記載の細菌:
    L135、Q144、Y241、N243、Y300。
  6.  前記変異が、下記より選ばれる1またはそれ以上の変異に相当する変異を含む、請求項5に記載の細菌:
    L135(I, F, M, V, G, A, W, K, H, R, C, N, S, T)、
    Q144(F, A, N, S, D, T, R, H, G, K, Y, W, C, M, P, V, L, I)、
    Y241(A)、
    N243(I, W, K, R, H)、
    Y300(A, H, R, K)。
  7.  前記変異が、下記のいずれかの変異に相当する変異を含む、請求項5または6に記載の細菌:
    L135I/Q144R、L135I/Q144D、L135I/Q144A、L135I/Q144L、L135I/N243W、L135I/N243F、L135F/Q144A、L135F/N243W、L135M/Q144R、L135M/Q144A、L135M/Q144L、L135M/N243W、L135M/N243F、L135M/Q144H、L135M/Q144N、L135M/N243Y、L135M/N243R、L135M/N243C、L135V/Q144R、L135V/Q144D、L135V/Q144A、L135V/Q144L、L135V/Q144V、L135V/Q144K、L135V/Q144C、L135V/Q144T、L135H/Q144R、L135G/Q144L、L135A/Q144L、L135V/N243W、L135V/N243F、L135V/N243P、Q144R/N243W、Q144R/N243F、Q144D/N243W、Q144D/N243F、Q144A/N243W、Q144A/N243F、Q144L/N243W、Q144L/N243F、L135M/Q144F、L135M/N243A、L135V/N243G、L135V/N243A、L135V/N243L、L135V/N243Y、L135V/N243K、L135V/N243R、L135V/N243H、L135V/N243D、L135V/N243E、L135V/N243C、L135V/N243Q、L135V/N243S、L135V/N243T、L135V/Q144I、L135V/Q144P、L135V/Q144W、L135V/Q144H、L135V/Q144E、L135V/Q144N、L135V/Q144S、L135K/Q144L、L135H/Q144L、L135D/Q144L、L135C/Q144L、L135Q/Q144L、L135N/Q144L、L135S/Q144L、L135T/Q144L。
  8.  前記変異が、下記のいずれかの変異に相当する変異を含む、請求項5または6に記載の細菌:
    L135(I, M, V, G, A, K, H, C, N, S, T)、
    Q144(F, A, S, D, T, R, H, K, Y, W, C, M, P, V, L, I)、
    N243(R, H)、
    Y300(R, K)、
    L135I/Q144R、L135I/Q144D、L135I/Q144A、L135I/Q144L、L135I/N243W、L135I/N243F、L135F/Q144A、L135M/Q144R、L135M/Q144A、L135M/Q144L、L135M/N243W、L135M/Q144H、L135M/Q144N、L135M/N243C、L135V/Q144R、L135V/Q144D、L135V/Q144A、L135V/Q144L、L135V/Q144V、L135V/Q144K、L135V/Q144C、L135V/Q144T、L135H/Q144R、L135G/Q144L、L135A/Q144L、L135V/N243W、L135V/N243F、L135V/N243P、Q144R/N243W、Q144D/N243W、Q144A/N243W、Q144A/N243F、Q144L/N243W、Q144L/N243F、L135M/Q144F、L135M/N243A、L135V/N243G、L135V/N243A、L135V/N243L、L135V/N243Y、L135V/N243K、L135V/N243R、L135V/N243H、L135V/N243D、L135V/N243E、L135V/N243C、L135V/N243Q、L135V/N243S、L135V/N243T、L135V/Q144P、L135V/Q144W、L135V/Q144H、L135V/Q144E、L135V/Q144N、L135V/Q144S、L135D/Q144L、L135C/Q144L、L135N/Q144L、L135S/Q144L、L135T/Q144L。
  9.  前記野生型グルタミン酸-システインリガーゼが、下記(a)、(b)、又は(c)に記載のタンパク質である、請求項5~8のいずれか1項に記載の細菌:
    (a)配列番号24に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
    (b)配列番号24に示すアミノ酸配列において、1~10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含むタンパク質;
    (c)配列番号24に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むタンパク質。
  10.  さらに、gshA遺伝子にコードされるタンパク質の活性が非改変株と比較して低下するように改変されている、請求項1~9のいずれか1項に記載の細菌。
  11.  さらに、γ-グルタミルトランスフェラーゼの活性が非改変株と比較して低下するように改変されている、請求項1~10のいずれか1項に記載の細菌。
  12.  グルタチオン合成酵素をコードする遺伝子を有する、請求項1~11のいずれか1項に記載の細菌。
  13.  エシェリヒア(Escherichia)属細菌である、請求項1~12のいずれか1項に記載の細菌。
  14.  エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)である、請求項1~13のいずれか1項に記載の細菌。
  15.  γ-Glu-Val-Glyおよび/またはその塩の製造方法であって、
     γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を、Glu、Val、およびGlyに作用させることにより、γ-Glu-Val-Glyを生成する工程を含み、
     前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、請求項1~14のいずれか1項に記載の細菌を発現宿主として得られたものである、方法。
  16.  前記グルタチオン合成酵素が前記細菌を発現宿主として得られたものである、請求項15に記載の方法。
  17.  前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、精製酵素である、請求項15または16に記載の方法。
  18.  前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、固定化酵素である、請求項15~17のいずれか1項に記載の方法。
  19.  前記γ-グルタミルバリン合成酵素が、請求項1~14のいずれか1項に記載の細菌の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、請求項15または16に記載の方法。
  20.  前記グルタチオン合成酵素が、該酵素を有する微生物の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、請求項15~19のいずれか1項に記載の方法。
  21.  前記γ-グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素が、請求項1~14のいずれか1項に記載の細菌の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、請求項15または16に記載の方法。
  22.  前記工程がATPの存在下で実施される、請求項15~21のいずれか1項に記載の方法。
  23.  前記工程が2価の金属イオンの存在下で実施される、請求項15~22のいずれか1項に記載の方法。
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