KR102335916B1 - Human leukocyte antigen A02:01 allele specific binding peptides and uses thereof - Google Patents

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Abstract

암 세포의 인간 백혈구 항원 (human leucocyte antigen : HLA) A02:01 대립유전자에 특이적으로 결합하는 펩타이드, 상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 백신 조성물, 암의 예방 또는 치료제, 및 암의 진단용 조성물에 관한 것이다. 일 양상에 따른 암 세포의 인간 백혈구 항원 (human leucocyte antigen : HLA) A02:01 대립유전자에 특이적으로 결합하는 펩타이드는 면역원성이 높으므로 이를 활용하면 상기 A02:01 대립유전자 HLA를 발현하는 암 조직에 대한 세포성 면역반응을 유도할 수 있어 암 치료용 백신으로 활용할 수 있다. 따라서, 일 양상에 따른 펩타이드는 궁극적으로는 암을 예방 또는 치료할 수 있는 치료제로 활용될 수 있다. 또한, 일 양상에 따른 펩타이드는 암세포에 특이적으로 결합이 가능하여, 암의 진단이 가능하다. A peptide that specifically binds to the human leucocyte antigen (HLA) A02:01 allele of cancer cells, a vaccine composition comprising the peptide as an active ingredient, a preventive or therapeutic agent for cancer, and a composition for diagnosis of cancer will be. Since the peptide specifically binding to the human leucocyte antigen (HLA) A02:01 allele of cancer cells according to an aspect has high immunogenicity, if it is utilized, cancer tissue expressing the A02:01 allele HLA It can induce a cellular immune response against Therefore, the peptide according to one aspect may ultimately be utilized as a therapeutic agent capable of preventing or treating cancer. In addition, the peptide according to an aspect is capable of specifically binding to cancer cells, thereby enabling diagnosis of cancer.

Description

인간 백혈구 항원 A02:01 대립유전자에 특이적으로 결합하는 펩타이드 및 이의 용도{Human leukocyte antigen A02:01 allele specific binding peptides and uses thereof} Human leukocyte antigen A02:01 allele specific binding peptides and uses thereof

암 세포의 인간 백혈구 항원 (human leucocyte antigen : HLA) A02:01 대립유전자에 특이적으로 결합하는 펩타이드, 상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 백신 조성물, 암의 예방 또는 치료제, 및 암의 진단용 조성물에 관한 것이다.A peptide that specifically binds to the human leucocyte antigen (HLA) A02:01 allele of cancer cells, a vaccine composition comprising the peptide as an active ingredient, a preventive or therapeutic agent for cancer, and a composition for diagnosis of cancer will be.

암은 정상 세포에 비하여 세포 성장이 조절되지 않고, 근접한 조직으로 침입이 가능하며, 때로는 전이가 되는 특성을 가지고 있다. 암은 기본적으로 조직의 성장 조절에 관련되어 있는 질병으로, 정상 세포가 암 세포로 형질전환이 되면 세포 성장과 분열을 조절하는 유전자의 발현이 변화한다 (Croce., The New England Journal of Medicine, 358(5): 502-511, 2008).Compared to normal cells, cancer is characterized by uncontrolled cell growth, ability to invade adjacent tissues, and sometimes metastasis. Cancer is basically a disease related to tissue growth regulation. When normal cells are transformed into cancer cells, the expression of genes that control cell growth and division is changed (Croce., The New England Journal of Medicine, 358). (5): 502-511, 2008).

항암 치료는 물리적으로 암 조직을 제거하거나, 또는 방사선 조사나 항암제 투여를 통해 암 유전자 (oncogene)를 비롯하여 항-세포 사멸 분자 (anti-apoptotic molecule), 텔로머라제 (telomerase), 성장인자 수용체 유전자 (growth factor receptor gene), 신호전달 분자 (signaling molecule) 등과 같이 암 세포의 생존에 필요한 유전자의 발현을 저해시키거나 세포 사멸을 유도하는 방식으로 수행된다 (Knudson AG, Nature reviews. Cancer 1(2): 157-162, 2001). 그러나 이와 같은 치료 과정에서 암 세포뿐만 아니라 정상 세포도 영향을 받을 수 있어 부작용이 나타나는 문제점이 있다.Anticancer treatment includes oncogenes, anti-apoptotic molecules, telomerase, growth factor receptor genes ( It is performed by inhibiting the expression of genes necessary for the survival of cancer cells, such as growth factor receptor gene) and signaling molecules, or inducing apoptosis (Knudson AG, Nature reviews. Cancer 1(2): 157-162, 2001). However, there is a problem that not only cancer cells but also normal cells may be affected in such a treatment process, resulting in side effects.

이에, 대안적으로 암을 치료하는 방법으로 암 치료 백신에 대한 필요성이 대두되고 있다. 암 치료 백신접종은 감염원을 예방하는 전통적인 예방접종과는 방법이 다르며, 특히 암 백신은 비자기-항원보다는 자기-항원에 대하여 면역반응을 유도하여야 한다. 또한, 상기 백신은 암이 형성된 후 투여하였을 때 작용하여야 하고 면역억제 효과를 발휘하여야 하며, 환자 사이의 이종 암 항원 발현에 대하여 감수성이 없어야 한다. Accordingly, there is a need for a cancer treatment vaccine as an alternative method for treating cancer. Cancer treatment vaccination is different from traditional vaccination to prevent infectious agents. In particular, cancer vaccines must induce an immune response against self-antigens rather than non-self-antigens. In addition, the vaccine should act when administered after cancer has formed, exhibit an immunosuppressive effect, and should not be sensitive to heterologous cancer antigen expression between patients.

많은 암 항원은 자기항원으로서 면역 허용원이므로, 특정한 면역 반응을 유도하는 것은 어려우며 특히 많은 암에서 공통적으로 작용할 수 있는 항원을 찾아내는 것은 용이하지 않다. 다만, 암 세포에 대해 특이적인 면역 반응을 유발하는 항원 펩타이드를 이용하면 상기 항원을 발현하는 암세포를 특이적으로 제거하는 면역치료에 유용하게 사용될 수 있을 것이나, 현재까지 이에 대해 전혀 알려진바 없다.Since many cancer antigens are autoantigens and immune tolerants, it is difficult to induce a specific immune response, and in particular, it is not easy to find antigens that can act in common in many cancers. However, if an antigenic peptide that induces a specific immune response to cancer cells is used, it may be usefully used for immunotherapy to specifically remove cancer cells expressing the antigen, but nothing has been known about this until now.

일 양상은 암 세포의 인간 백혈구 항원 (human leucocyte antigen : HLA) A02:01 대립유전자(allele)에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 제공한다.One aspect provides a peptide that specifically binds to the human leucocyte antigen (HLA) A02:01 allele of cancer cells.

일 양상은 상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 백신 조성물을 제공한다.One aspect provides a vaccine composition comprising the peptide as an active ingredient.

또 다른 양상은 상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 암의 예방 또는 치료제를 제공한다. Another aspect provides a preventive or therapeutic agent for cancer comprising the peptide as an active ingredient.

또 다른 양상은 상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 암의 진단용 조성물을 제공한다.Another aspect provides a composition for diagnosis of cancer comprising the peptide as an active ingredient.

상기 목적을 달성하기 위하여, 암 세포의 인간 백혈구 항원 (human leucocyte antigen : HLA) A02:01 대립유전자(allele)에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 제공한다.In order to achieve the above object, there is provided a peptide that specifically binds to the human leucocyte antigen (HLA) A02:01 allele of cancer cells.

상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 백신 조성물을 제공한다.It provides a vaccine composition comprising the peptide as an active ingredient.

상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 암의 예방 또는 치료제를 제공한다. It provides a preventive or therapeutic agent for cancer comprising the peptide as an active ingredient.

상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 암의 진단용 조성물을 제공한다.It provides a composition for diagnosis of cancer comprising the peptide as an active ingredient.

일 양상에 따른 암 세포의 인간 백혈구 항원 (human leucocyte antigen : HLA) A02:01 대립유전자에 특이적으로 결합하는 펩타이드는 면역원성이 높으므로 이를 활용하면 상기 HLA-A02:01 대립유전자를 발현하는 암 조직에 대한 세포성 면역반응을 유도할 수 있어 암 치료용 백신으로 활용할 수 있다. 따라서, 일 양상에 따른 펩타이드는 궁극적으로는 암을 예방 또는 치료할 수 있는 치료제로 활용될 수 있다. 또한, 일 양상에 따른 펩타이드는 암세포에 특이적으로 결합이 가능하여, 암의 진단이 가능하다. A peptide that specifically binds to the human leucocyte antigen (HLA) A02:01 allele of cancer cells according to an aspect has high immunogenicity, so if it is utilized, cancer expressing the HLA-A02:01 allele It can induce a cellular immune response to tissues, so it can be used as a vaccine for cancer treatment. Therefore, the peptide according to one aspect may ultimately be utilized as a therapeutic agent capable of preventing or treating cancer. In addition, the peptide according to an aspect is capable of specifically binding to cancer cells, thereby enabling diagnosis of cancer.

도 1은 암환자의 암 조직으로부터 보편적으로 발현하는 인간 백혈구 항원(HLA)에 높은 친화도를 갖는 펩타이드를 수득하는 방법을 간단하게 모식화한 도이다.1 is a diagram schematically schematically illustrating a method for obtaining a peptide having a high affinity for a human leukocyte antigen (HLA) commonly expressed from cancer tissues of a cancer patient.

일 양상은 암 세포의 인간 백혈구 항원 (human leucocyte antigen : HLA) A02:01 대립유전자(allele)에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 제공한다.One aspect provides a peptide that specifically binds to the human leucocyte antigen (HLA) A02:01 allele of cancer cells.

용어 “인간 백혈구 항원(HLA)은 인간의 주요 조직 적합성 복합체 (Major Histocompatibility Complex: MHC) 단백질을 코딩하는 유전자 복합체로, 조직적합성 항원을 지배하는 유전자를 함유한 염색체부위를 의미한다. 인간 백혈구 항원(HLA)이라고 하며 MHC 복합체라고 약기한다. 본 명세서 내에서 사용하는 용어 HLA는 주요 조직 적합성 복합체와 동일한 의미로 기재하고 있으며, MHC와 HLA는 본 명세서 내에서 혼용하여 사용이 가능하다. The term “human leukocyte antigen (HLA) is a gene complex encoding a human major histocompatibility complex (MHC) protein, and refers to a chromosomal region containing a gene that controls histocompatibility antigen. It is called human leukocyte antigen (HLA) and is abbreviated as the MHC complex. The term HLA used in the present specification has the same meaning as the major histocompatibility complex, and MHC and HLA may be used interchangeably in the present specification.

명세서에서 사용된 용어 "암" 은 포유동물에서 조절되지 않는 세포 성장을 전형적인 특징으로 하는 생리적 상태를 의미하거나 그러한 생리적 상태를 설명하는 것으로 주위 조직에 침윤하면서 빠르게 성장하고 신체 각 부위에 확산되거나 전이되어 생명을 위협하는 악성 종양을 제한 없이 포함할 수 있다. 암의 예로는 암종, 림프종, 모세포종, 육종 및 백혈병 또는 림프성 악성 종양 등이 있으나 이것으로 제한되지 않는다. 이러한 암의 보다 특별한 예로는 폐암, 후두암, 위암, 대장/직장암, 간암, 담낭암, 췌장암, 유방암, 난소암, 자궁암, 자궁경부암, 전립선암, 신장암, 피부암 등의 상피세포 등에서 유래하는 암종(carcinoma), 골암, 근육암, 지방암, 섬유세포암 등의 결합조직세포에서 유래하는 육종(sarcoma), 백혈병, 림프종, 다발성골수종 등의 조혈세포에서 유래하는 혈액암, 신경조직에 발생하는 종양, 및 삼중음성유방암(Triple negative breast cancer) 뿐만이 아니라 두경부암 등이 있다.As used herein, the term "cancer" refers to or describes a physiological condition characterized by uncontrolled cell growth in mammals, which rapidly grows while infiltrating surrounding tissues and spreads or metastasizes to various parts of the body. It may include, without limitation, life-threatening malignancies. Examples of cancer include, but are not limited to, carcinoma, lymphoma, blastoma, sarcoma and leukemia or lymphoid malignancy. More specific examples of these cancers include carcinomas derived from epithelial cells such as lung cancer, laryngeal cancer, stomach cancer, colorectal/rectal cancer, liver cancer, gallbladder cancer, pancreatic cancer, breast cancer, ovarian cancer, uterine cancer, cervical cancer, prostate cancer, kidney cancer, skin cancer, etc. ), bone cancer, muscle cancer, fat cancer, sarcoma derived from connective tissue cells such as fibroblast cancer, hematopoietic cancer derived from hematopoietic cells such as leukemia, lymphoma, multiple myeloma, tumors occurring in nerve tissue, and There are triple negative breast cancer as well as head and neck cancer.

일 양상에 따른 펩타이드는 암 관련 항원(Tumor-Associated antigen: TAA) 또는 암 특이 항원(Tumor specific antigen: TSA) 및 신생항원(Neoantigen)으로 이루어진 군으로부터 선택된 1종 이상일 수 있다. 암 세포의 성장은 비자기(non-self)로 식별하여 이를 제거하는 면역체계에 결함이 있을 때 발생하는 것으로 알려져 있는데, 상기 TAA는 일부 정상세포 혹은 암세포에서 주로 발견되는 항원이고 TSA는 암세포에서 발견되는 항원으로 정상세포에서는 발견되지 않는 것으로 알려져 있다. 신생항원은 발암물질에 의한 DNA 돌연변이의 결과로 나타나거나 발암성 DNA 바이러스 혹은 RNA 바이러스에 의한 유전물질의 발현 결과로 나타나는 것으로 알려져 있다. 일 양상에 따른 펩타이드는 암세포의 표면에 존재하면서 면역세포가 암세포를 제거할 수 있도록 돕는 HLA와 결합하여 암 세포에 대한 면역계의 반응, 즉 면역학적 감시(immunologic surveillance)를 유도하여 암 세포를 제거할 수 있다.The peptide according to an aspect may be one or more selected from the group consisting of a tumor-associated antigen (TAA) or a tumor specific antigen (TSA) and a neoantigen. The growth of cancer cells is known to occur when there is a defect in the immune system that identifies and removes them as non-self. The TAA is an antigen mainly found in some normal cells or cancer cells, and TSA is found in cancer cells. It is known that the antigen is not found in normal cells. Neoantigens are known to appear as a result of DNA mutation by carcinogens or as a result of expression of genetic material by oncogenic DNA viruses or RNA viruses. The peptide according to one aspect is present on the surface of cancer cells and binds to HLA, which helps immune cells to remove cancer cells, thereby inducing the immune system response to cancer cells, that is, immunologic surveillance to eliminate cancer cells. can

일 양상의 구체예에서는 삼중 음성 유방암 환자에서 가장 보편적으로 발현하는 HLA 클래스 1 중 A02:01 대립유전자(allele)에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 확인하였다.In one aspect, a peptide that specifically binds to the A02:01 allele among HLA class 1 most commonly expressed in triple-negative breast cancer patients was identified.

일 양상에 따른 펩타이드는 5 내지 50개의 아미노산으로 이루어질 수 있으며, 예를 들어 8 내지 15개의 아미노산을 포함할 수 있다. The peptide according to one aspect may consist of 5 to 50 amino acids, for example, may include 8 to 15 amino acids.

일 양상에 따른 펩타이드는 서열번호 1 내지 20으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어질 수 있으나, 암 세포의 A02:01에 특이적으로 결합하면서 T세포의 면역원성을 높일 수 있는 펩타이드라면 제한 없이 포함 가능하다. The peptide according to an aspect may consist of the amino acid sequence shown in SEQ ID NOs: 1 to 20, but any peptide capable of increasing the immunogenicity of T cells while specifically binding to A02:01 of cancer cells may be included without limitation.

일 양상에 따른 펩타이드는 HLA에 대한 친화도가 500 nM이하일 수 있으며, 또한 상기 펩타이드는 T세포 특이적인 면역원성이 나타나는 것 일 수 있다. The peptide according to an aspect may have an affinity for HLA of 500 nM or less, and the peptide may exhibit T cell-specific immunogenicity.

일 양상의 구체예에서는 HLA 클래스 1 중 A02:01 대립유전자(allele)에 특이적으로 결합하는 20종의 펩타이드를 확인하였으며, 구체적인 20종의 펩타이드는 하기와 같다.In an embodiment of one aspect, 20 types of peptides specifically binding to the A02:01 allele in HLA class 1 were identified, and specific 20 types of peptides are as follows.

서열번호SEQ ID NO: 아미노산 시퀀스amino acid sequence 길이length 유전자gene 단백질protein 친화도(IC50, nM)Affinity (IC50, nM) 면역원성 스코어
Immunogenicity score
정상조직에서 TPM 최대값Maximum TPM in normal tissue
1One KLYDGFQYLKLYDGFQYL 99 PI4KBPI4KB Phosphatidylinositol 4-kinase betaPhosphatidylinositol 4-kinase beta 33 0.064
0.064
98.2798.27
22 KLVELPYTVKLVELPYTV 99 OSGEPOSGEP Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferaseProbable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase 44 0.112
0.112
80.5180.51
33 ALQEKLWNVALQEKLWNV 99 INTS4INTS4 Integrator complex subunit 4Integrator complex subunit 4 55 0.026
0.026
19.5819.58
44 SLLDPVPEVSLLDPVPEV 99 GCN1L1GCN1L1 Translational activator GCN1Translational activator GCN1 55 0.096
0.096
72.5272.52
55 TLADLVHHVTLADLVHHV 99 TRRAPTRRAP Transformation/transcription domain-associated proteinTransformation/transcription domain-associated protein 55 0.109
0.109
27.7727.77
66 FLANIGTSVFLANIGTSV 99 APPL1APPL1 DCC-interacting protein 13-alphaDCC-interacting protein 13-alpha 55 0.104
0.104
40.5440.54
77 NMVDIIHSVNMVDIIHSV 99 PCCBPCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrialPropionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial 55 0.221
0.221
41.9041.90
88 LMVDHVTEVLMVDHVTEV 99 SRA1SRA1 Steroid receptor RNA activator 1Steroid receptor RNA activator 1 55 0.1970.197 69.5669.56 99 NMLPQIFRVNMLPQIFRV 99 C12orf4C12orf4 Protein C12orf4Protein C12orf4 55 0.1270.127 18.8018.80 1010 KLIGQVHEVKLIGQVHEV 99 FRYFRY Protein furry homologProtein furry homolog 55 0.0890.089 46.9746.97 1111 MITDVVPEVMITDVVPEV 99 TOX4TOX4 TOX high mobility group box family member 4TOX high mobility group box family member 4 66 0.1630.163 53.0253.02 1212 ALIEKLVELALIEKLVEL 99 POLA2POLA2 DNA polymerase alpha subunit BDNA polymerase alpha subunit B 66 0.0170.017 33.7933.79 1313 GQIEVVPEVGQIEVVPEV 99 PHF3PHF3 PHD finger protein 3PHD finger protein 3 77 0.2720.272 43.1143.11 1414 SLSAFTPALSLSAFTPAL 99 MCM3APMCM3AP Germinal-center associated nuclear proteinGerminal-center associated nuclear protein 77 0.1500.150 52.2552.25 1515 ILWETVPSMILWETVPSM 99 FNDC3BFNDC3B Fibronectin type III domain-containing protein 3BFibronectin type III domain-containing protein 3B 77 0.1430.143 59.8359.83 1616 YITERIIAVYITERIAV 99 TNS3TNS3 Tensin-3Tensin-3 88 0.4240.424 92.8792.87 1717 ALLGILQHVALLGILQHV 99 NUDCD3NUDCD3 NudC domain-containing protein 3NudC domain-containing protein 3 88 0.0710.071 58.9258.92 1818 ALANGIEEVALANGIEEV 99 APOL3APOL3 Apolipoprotein L3Apolipoprotein L3 88 0.3070.307 67.6967.69 1919 GMAERIPELGMAERIPEL 99 ACSL3ACSL3 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3 99 0.3380.338 55.4055.40 2020 YLNQHIEHVYLNQHIEHV 99 ERCC5ERCC5 DNA repair protein complementing XP-G cellsDNA repair protein complementing XP-G cells 99 0.1420.142 36.6336.63

일 양상의 구체예에서는 암 조직을 파쇄하고, 이를 용해액으로 용해시켜 암 조직에서 발현하는 HLA-항체-레진과 이와 결합하는 펩티돔을 통한 면역 침강반응(Immunoprecipitation) 및 tC18 레진으로 정제하여 질량분석기로 분석하였다. 질량분석 데이터로부터 효소 특이도(enzyme specificity)를 unspecific으로, false discovery rate를 0.01로, 펩타이드 길이를 8~15로, 최대 펩타이드 질량을 1,500로, 최대 전하를 3으로 하여 1차 암 관련 항원 펩타이드를 동정하였다. In an embodiment of one aspect, the cancer tissue is crushed, dissolved with a lysate, and the HLA-antibody-resin expressed in the cancer tissue and the immunoprecipitation reaction (Immunoprecipitation) through the peptidome binding thereto and tC18 resin are purified by mass spectrometry was analyzed with From the mass spectrometry data, the primary cancer-associated antigenic peptide was identified by setting the enzyme specificity to unspecific, the false discovery rate to 0.01, the peptide length to 8 to 15, the maximum peptide mass to 1,500, and the maximum charge to be 3. sympathized.

이후 구체예에서는 NetMHC (https://www.cbs.dtu.dk/services/NetMHC/) 프로그램을 이용하여 각 HLA 대립유전자(allele)에 대한 친화도를 분석하고, IEDB Analysis Resource (https://tools.iedb.org/immunogenicity/) 프로그램으로 수득한 1차 암 관련 항원 펩타이드의 면역원성을 분석하여 최종적으로 HLA-A02:01에 대한 친화도(IC50)가 500 nM 이하인 암 관련 항원으로 총 20종의 펩타이드를 선별하였다.In a later embodiment, the affinity for each HLA allele is analyzed using the NetMHC (https://www.cbs.dtu.dk/services/NetMHC/) program, and the IEDB Analysis Resource (https:// tools.iedb.org/immunogenicity/) program to analyze the immunogenicity of the primary cancer-associated antigen peptide, and finally, a total of 20 cancer-associated antigens with an affinity (IC 50 ) to HLA-A02:01 of 500 nM or less The peptides of the species were selected.

일 양상은 상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 백신 조성물을 제공한다.One aspect provides a vaccine composition comprising the peptide as an active ingredient.

상기 백신 조성물은 부가적으로 완충제, 등장화제, 보존제, 안정화제 및 용해보조제를 포함할 수 있다. 완충제로는 예를 들면 인산염, 초산염, 인산암모늄, 탄산암모늄, 구연산염 등을 사용할 수 있다. 또한 상기 백신 조성물은 아쥬반트(adjuvant) 및 면역활성물질을 추가로 더 포함할 수 있다. The vaccine composition may additionally include a buffering agent, isotonic agent, preservative, stabilizing agent and solubilizing agent. As the buffer, for example, phosphate, acetate, ammonium phosphate, ammonium carbonate, citrate and the like can be used. In addition, the vaccine composition may further include an adjuvant and an immunoactive material.

상기 백신은 항원에 특이적인 체액성 면역반응뿐만 아니라 높은 세포성 면역반응을 유도할 수 있다.The vaccine can induce an antigen-specific humoral immune response as well as a high cellular immune response.

상기 백신은 상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하고 있으므로, 암세포의 표면에 존재하면서 면역세포가 암세포를 제거할 수 있도록 돕는 펩타이드가 HLA와 결합하여 암 세포에 대한 면역계의 반응, 즉 면역학적 감시(immunologic surveillance)를 유도하므로 효율적으로 암을 예방할 수 있는 백신으로 사용될 수 있다. 따라서, 상기 펩타이드는 암세포에 보편적으로 발현되는 HLA-A02:01에 특이적으로 결합하면서 T 세포의 면역원성이 높아 면역세포의 면역반응을 유도할 수 있어, 암이 형성된 후 투여하였을 때 작용하면서, 환자 사이의 이종 암 항원 발현에 대하여 감수성이 없어 암의 예방을 위한 백신으로 효과적으로 활용될 수 있다.Since the vaccine contains the peptide as an active ingredient, a peptide that exists on the surface of cancer cells and helps immune cells to remove cancer cells binds to HLA and the response of the immune system to cancer cells, that is, immunologic surveillance (immunologic surveillance). ), so it can be used as a vaccine that can effectively prevent cancer. Therefore, the peptide specifically binds to HLA-A02:01, which is commonly expressed in cancer cells, and has high immunogenicity of T cells, so it can induce an immune response of immune cells. Since there is no sensitivity to heterologous cancer antigen expression between patients, it can be effectively used as a vaccine for cancer prevention.

또 다른 양상은 상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 암의 예방 또는 치료제를 제공한다. Another aspect provides a preventive or therapeutic agent for cancer comprising the peptide as an active ingredient.

일 양상에 따른 암의 예방 또는 치료제는 상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하고 있으므로, 암세포의 표면에 존재하면서 면역세포가 암세포를 제거할 수 있도록 돕는 펩타이드가 HLA-A02:01와 결합하여 면역세포의 암 세포에 대한 면역계의 반응, 즉 면역학적 감시(immunologic surveillance)를 유도하므로 효율적으로 암 치료에 높은 효과를 기대할 수 있다. Since the preventive or therapeutic agent for cancer according to an aspect contains the peptide as an active ingredient, a peptide that exists on the surface of cancer cells and helps immune cells to remove cancer cells binds to HLA-A02:01 to cause cancer cells in immune cells. Since it induces the immune system response to cells, that is, immunologic surveillance, it can be expected to be effective in cancer treatment efficiently.

상기 펩타이드가 암의 예방 또는 치료제로 포함되어 제조되는 경우, 상기 암의 예방 또는 치료제는 약학적으로 허용되는 담체를 포함할 수 있다. 상기 예방 또는 치료제에 포함되는 약학적으로 허용되는 담체는 제제시에 통상적으로 이용되는 것으로서, 예를 들면 락토오스, 덱스트로오스, 수크로오스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산 칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산 칼슘, 미세결정성 셀룰로오스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로오스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로오스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 상기 암의 예방 또는 치료제는 상기 성분들 이외에 예를 들면 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제, 보존제 등을 추가로 포함할 수 있다.When the peptide is prepared to be included as a preventive or therapeutic agent for cancer, the preventive or therapeutic agent for cancer may include a pharmaceutically acceptable carrier. Pharmaceutically acceptable carriers included in the prophylactic or therapeutic agents are those commonly used in formulation, for example, lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, starch, acacia gum, calcium phosphate, alginate, gelatin. , calcium silicate, microcrystalline cellulose, polyvinylpyrrolidone, cellulose, water, syrup, methyl cellulose, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate and mineral oil, etc. It is not limited. The preventive or therapeutic agent for cancer may further include, for example, a lubricant, a wetting agent, a sweetening agent, a flavoring agent, an emulsifying agent, a suspending agent, a preservative, and the like, in addition to the above components.

상기 암의 예방 또는 치료제는 경구 또는 비경구로 투여할 수 있다. 비경구 투여인 경우에는 예를 들면, 정맥내 주입, 피하 주입, 근육 주입, 복강 주입, 내피 투여, 국소 투여, 비내 투여, 폐내 투여 및 직장내 투여 등으로 투여할 수 있다. 경구 투여시, 단백질 또는 펩타이드는 소화가 되기 때문에 경구용 조성물은 활성 약제를 코팅하거나 위에서의 분해로부터 보호되도록 제형화 되어야 한다. 또한, 상기 조성물은 활성 물질이 표적 세포로 이동할 수 있는 임의의 장치에 의해 투여될 수 있다.The preventive or therapeutic agent for cancer may be administered orally or parenterally. In the case of parenteral administration, for example, intravenous injection, subcutaneous injection, intramuscular injection, intraperitoneal injection, endothelial administration, local administration, intranasal administration, intrapulmonary administration, rectal administration, etc. can be administered. Since the protein or peptide is digested upon oral administration, oral compositions should be formulated to coat the active agent or to protect it from degradation in the stomach. In addition, the composition may be administered by any device capable of transporting the active agent to a target cell.

상기 암의 예방 또는 치료제의 적합한 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하게 처방될 수 있다. 상기 조성물의 바람직한 투여량은 성인 기준으로 예를 들면 0.001-100 ㎎/kg 범위 내일 수 있다. 용어 "약학적 유효량"은 암을 예방 또는 치료하는 데, 또는 암으로 인한 질환의 예방 또는 치료하는 데 충분한 양을 의미한다. A suitable dosage of the cancer prevention or therapeutic agent is variously prescribed depending on factors such as formulation method, administration method, patient's age, weight, sex, pathological condition, food, administration time, administration route, excretion rate, and response sensitivity. can be A preferred dosage of the composition may be in the range of, for example, 0.001-100 mg/kg on an adult basis. The term "pharmaceutically effective amount" means an amount sufficient to prevent or treat cancer, or to prevent or treat a disease caused by cancer.

상기 암의 예방 또는 치료제는 당해 당업자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화함으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기 내에 내입시켜 제조될 수 있다. 이때 제형은 오일 또는 수성 매질중의 용액, 현탁액, 시럽제 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 산제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캅셀제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수 있다. The preventive or therapeutic agent for cancer may be prepared in a unit dosage form by formulating using a pharmaceutically acceptable carrier and/or excipient according to a method readily practiced by a person skilled in the art, or prepared by introducing into a multi-dose container. can In this case, the formulation may be in the form of a solution, suspension, syrup, or emulsion in oil or an aqueous medium, or may be in the form of an extract, powder, powder, granule, tablet or capsule, and may additionally include a dispersant or stabilizer.

또한, 상기 조성물은 개별 치료제로 투여하거나 암을 치료, 예방 또는 처리하는데 통상적으로 사용되어온 치료법과 병용하여 투여될 수 있다. 상기 조성물은 치료법과 병용하여 투여될 수 있고, 종래의 치료법과는 순차적 또는 동시에 투여될 수 있다.In addition, the composition may be administered as an individual therapeutic agent or in combination with a therapy conventionally used to treat, prevent or treat cancer. The composition may be administered in combination with therapy, and may be administered sequentially or simultaneously with conventional therapy.

통상적 치료법의 예는 외과수술, 화학요법, 방사선 요법, 호르몬 요법, 생물학적 요법 및 면역요법을 포함하되 이에 한정되지는 않는다. 또한, 본 발명의 암의 예방 또는 치료제는 암과 관련된 질병이나 장애의 예방 또는 치료하기 위하여 이용될 수 있는데, 그러한 치료, 또는 예방이 필요한 환자에게 치료적으로 또는 예방적으로 효과적인 양의 특정 약물 또는 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염, 용매화물, 수화물, 입체 이성질체, 포접물 또는 이들의 프로드럭을 투여하는 것을 포함한다. 상기 암의 예방 또는 치료제는 은 다른 약물(“차 약물”) 또는 암을 치료, 처리 또는 예방하는 방법과 병용하여 투여된 다. 2차 약물은 그 종류를 제한하지 않으며, 단백질, 항체, 소분자 약물, 리포좀, 나노입자, 줄기세포 등일 수 있다.Examples of conventional therapies include, but are not limited to, surgery, chemotherapy, radiation therapy, hormone therapy, biological therapy, and immunotherapy. In addition, the prophylactic or therapeutic agent for cancer of the present invention can be used to prevent or treat cancer-related diseases or disorders, and a specific drug or a therapeutically or prophylactically effective amount for a patient in need of such treatment or prevention or a pharmaceutically acceptable salt, solvate, hydrate, stereoisomer, clathrate or prodrug thereof. The preventive or therapeutic agent for cancer is administered in combination with another drug (“tea drug”) or a method for treating, treating or preventing cancer. The type of the secondary drug is not limited, and may be a protein, antibody, small molecule drug, liposome, nanoparticles, stem cell, or the like.

또 다른 양상은 상기 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 암의 진단용 조성물을 제공한다.Another aspect provides a composition for diagnosis of cancer comprising the peptide as an active ingredient.

사용된 용어 "진단"은 병태 생리의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미한다. 본 명세서 내에서의 진단은 암의 발병 여부 및 경과를 확인하는 것이다.The term “diagnosing” as used refers to ascertaining the presence or characteristics of pathophysiology. Diagnosis within the present specification is to determine whether or not cancer has developed and progressed.

상기 일 양상의 펩타이드는 영상을 통하여 암을 진단하기 위하여 분자 영상용 형광체와 결합할 수 있다.The peptide of one aspect may bind to a fluorescent substance for molecular imaging in order to diagnose cancer through imaging.

상기 분자 영상용 형광체는 형광을 발생시키는 모든 물질을 말하며, 예를 들면 적색이나 근적외선(near-infrared)의 형광을 발광하는 것일 수 있고, 양자 수득량(quantum yield)이 높은 형광체일 수 있으나, 이에 한정되지 않는다.The fluorescent substance for molecular imaging refers to any material that generates fluorescence, for example, may be one that emits red or near-infrared fluorescence, and may be a fluorescent substance having a high quantum yield, but this not limited

상기 분자 영상용 형광체는 상기 HLA-A02:01에 특이적으로 결합하는 펩타이드와 결합할 수 있는 형광체는 예를 들면, 형광 단백질 또는 기타 영상용 물질일 수 있으나, 이에 한정되지 않는다.The fluorescent substance for molecular imaging may be, for example, a fluorescent protein or other imaging material, but is not limited thereto.

상기 형광체는 예를 들면, 플루오레신(fluorescein), 보디피(BODYPY), 테트라메틸로드아민(Tertramethylrhodamine), 알렉사(Alexa), 시아닌(Cyanine), 알로피코시아닌(allopicocyanine) 또는 이들의 유도체일 수 있으나, 이에 한정되지 않는다.The phosphor may be, for example, fluorescein, BODYPY, tetramethylrhodamine, Alexa, cyanine, allopicocyanine, or a derivative thereof. However, it is not limited thereto.

상기 형광 단백질은 예를 들면, Dronpa 단백질, 녹색 형광 단백질(EGFP), 적색 형광 단백질(red fluorescent protein, DsRFP), 근적외선 형광을 나타내는 시아닌 형광체인 Cy5.5 또는 기타 형광 단백질일 수 있으나, 이에 한정되지 않는다.The fluorescent protein may be, for example, Dronpa protein, green fluorescent protein (EGFP), red fluorescent protein (DsRFP), Cy5.5, which is a cyanine fluorescent protein exhibiting near-infrared fluorescence, or other fluorescent protein, but is not limited thereto. does not

상기 기타 영상용 물질은 예를 들면 산화철, 방사성 동위원소 등일 수 있으나, 이에 한정되지 않으며, MRI, PET과 같은 영상 장비에 응용될 수 있다.The other imaging material may be, for example, iron oxide or a radioactive isotope, but is not limited thereto, and may be applied to imaging equipment such as MRI and PET.

중복되는 내용은 본 명세서의 복잡성을 고려하여 생락하며, 본 명세서에서 달리 정의되지 않은 용어들은 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상적으로 사용되는 의미를 갖는 것이다.Overlapping content is omitted in consideration of the complexity of the present specification, and terms not defined otherwise in the present specification have the meanings commonly used in the art to which the present invention pertains.

이하 본 발명을 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예 기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail through examples. However, these examples are provided and the scope of the present invention is not limited to these examples.

[실시예][Example]

실시예 1. 암세포 발현 HLA- A02:01에 특이적으로 결합하는 펩타이드의 정제 및 분석Example 1. Purification and analysis of peptides that specifically bind to cancer cell expression HLA-A02:01

공통 암 항원을 확인하기 위하여 암 조직에서 발현하는 인간 백혈구 항원(HLA)와 결합하는 펩티돔을 펩티돔-MHC간 면역침강반응 (Immunoprecipitation: IP)을 통하여 수득한 펩타이드를 분석하였다. 동결된 삼중 음성 유방암(Triple negative breast cancer : TNBC) 환자의 조직 180-400 mg을 파쇄기(CP02 cryoPREP Automated Dry Pulverizer)로 파쇄하고 1mL의 융해액(1% 옥틸 글루코시드(octyl glucoside), 0.25% 소듐 디옥시콜레이트(sodium deoxycholate), 1 mM 에틸렌다이아민테트라아세트산(EDTA), 1 mM 페닐메탄슬포릴 플루오리드(PMSF), 0.2 mM 요오드아세트아미드 (iodoacetamide), 프로테아제 인히비터 칵테일(protease inhibitor cocktail) 및 인산완충식염수(PBS))을 넣고 1시간 동안 정치한 후, 17,000 rpm으로 4°C에서 20분간 원심분리를 실시하였다. 이후 상등액을 분리하여 50 μL의 HLA-항체-레진(resin)과 4°C에서 2시간 동안 반응시켰다. 이후, 150 mM의 NaCl 및 20 mM의 Tris-HCl로 이루어진 세척용액 A (pH 8.0), 400 mM의 NaCl 및 20 mM의 Tris-HCl로 이루어진 세척용액 B(pH 8.0), 세척용액 A 및 20 mM Tris-HCl의 세척용액 C (pH 8.0) 순으로 용액을 300 μL씩 3 회 레진에 처리하여 세척하였다. 이후 100 μL의 0.1 M 아세트산(acetic acid) 용액으로 8회 용출시키고, 용출하여 얻은 용액을 tC18 레진을 이용하여 정제하였다. 이후 최종적으로 펩타이드를 30% 아세토나이트릴(acetonitrile) 및 0.1% 트리플루오로아세트산(trifluoroacetic acid, TFA) 용액으로 용출하여 건조한 후, 0.1% 포름산(formic acid) 용액에 녹여 Q Exactive mass spectrometry 질량분석기로 분석하였으며, 수득한 질량분석 데이터를 MaxQuant 프로그램을 이용하여 분석하여 HLA에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 동정하였다. 펩타이드의 분석조건을 효소 특이도(enzyme specificity)를 unspecific으로, false discovery rate를 0.01로, 펩타이드 길이를 8~15로, 최대 펩타이드 질량을 1,500kDa로, 최대 전하를 3으로 하였다.In order to identify a common cancer antigen, a peptide obtained through an immunoprecipitation reaction (Immunoprecipitation: IP) between Peptidom and MHC for peptidom binding to human leukocyte antigen (HLA) expressed in cancer tissues was analyzed. 180-400 mg of frozen triple negative breast cancer (TNBC) patient's tissue is shredded with a crusher (CP02 cryoPREP Automated Dry Pulverizer), and 1 mL of lysed solution (1% octyl glucoside, 0.25% sodium Sodium deoxycholate, 1 mM ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), 1 mM phenylmethanesulforyl fluoride (PMSF), 0.2 mM iodoacetamide, protease inhibitor cocktail and Phosphate-buffered saline (PBS)) was added and allowed to stand for 1 hour, followed by centrifugation at 17,000 rpm at 4 °C for 20 minutes. After that, the supernatant was separated and reacted with 50 μL of HLA-antibody-resin at 4 °C for 2 hours. Then, wash solution A (pH 8.0) consisting of 150 mM NaCl and 20 mM Tris-HCl, wash solution B (pH 8.0) consisting of 400 mM NaCl and 20 mM Tris-HCl, wash solution A and 20 mM Tris-HCl washing solution C (pH 8.0) was washed by treating the resin with 300 μL of the solution 3 times in the order. Then, it was eluted 8 times with 100 μL of 0.1 M acetic acid solution, and the eluted solution was purified using tC18 resin. After that, the peptide was finally eluted with 30% acetonitrile and 0.1% trifluoroacetic acid (TFA) solution, dried, dissolved in 0.1% formic acid solution, and analyzed by Q Exactive mass spectrometry mass spectrometry. The analysis was performed, and the obtained mass spectrometry data was analyzed using the MaxQuant program to identify a peptide that specifically binds to HLA. Peptide analysis conditions were set as unspecific for enzyme specificity, a false discovery rate of 0.01, a peptide length of 8 to 15, a maximum peptide mass of 1,500 kDa, and a maximum charge of 3.

상기 펩티돔-MHC간 면역침강반응이후 수득한 펩티돔 분석을 통하여 총 1000여종의 후보군 펩타이드를 결정하였다. A total of about 1,000 candidate peptides were determined through analysis of the peptidome obtained after the immunoprecipitation reaction between the peptidome and MHC.

실시예 2. HLA-A02:01에 특이적으로 결합하는 펩타이드 암 관련 항원으로 결정Example 2. Determination of a peptide cancer-associated antigen that specifically binds to HLA-A02:01

암을 예방 또는 치료할 수 있는 백신에 활용하기 위한 공통 암 항원을 찾아내기 위하여, TNBC 환자의 조직에서 보편적으로 과발현되는 HLA-A02:01에 특이적으로 결합하는 펩타이드에 대한 면역 원성을 확인하기 위한 실험을 실시하였다. 실시예 1에서 수득한 1000여종의 1차 후보군 펩타이드 중 공통 암 항원 후보 펩타이드를 선별하기 위한 실험을 수행하였다. 동정된 펩타이드는 NetMHC (https://www.cbs.dtu.dk/services/NetMHC/) 프로그램을 이용하여 각 HLA-A02:01 대립유전자(allele)에 대한 친화도를 분석하였다. 또한 각 펩타이드에 대하여 IEDB Analysis Resource (https://tools.iedb.org/immunogenicity/) 프로그램으로 상기 실시예 1에서 수득한 1000여종의 펩타이드의 면역원성을 분석하였다. In order to find a common cancer antigen for use in vaccines that can prevent or treat cancer was carried out. An experiment was performed to select a common cancer antigen candidate peptide from among the 1000 types of primary candidate group peptides obtained in Example 1. The identified peptides were analyzed for affinity for each HLA-A02:01 allele using the NetMHC (https://www.cbs.dtu.dk/services/NetMHC/) program. In addition, for each peptide, the immunogenicity of about 1000 kinds of peptides obtained in Example 1 was analyzed using the IEDB Analysis Resource (https://tools.iedb.org/immunogenicity/) program.

상기 분석된 내용을 후보 펩타이드를 바이오인포매틱스 분석을 기반으로 하여 펩타이드 중 HLA-A02:01에 대한 친화도(IC50)가 500 nM 이하인 암 관련 항원으로 총 20종의 펩타이드를 선별하였다.A total of 20 peptides were selected as cancer-related antigens having an affinity (IC 50 ) of 500 nM or less for HLA-A02:01 among the peptides based on the bioinformatics analysis of the candidate peptides analyzed above.

본 실시예에서 찾아낸 보편적으로 암조직에서 과발현되는 HLA-A02:01에 특이적으로 결합하는 20종의 펩타이드는 암세포의 표면에 존재하면서 특이적으로 HLA-A02:01와 결합하여, 면역세포가 암세포를 제거할 수 있도록 도와 면역세포의 암 세포에 대한 면역계의 반응을 유도하면서 동시에 T세포의 면역원성을 높일 수 있으므로, 효과적으로 암 세포를 제거할 수 있음을 확인할 수 있었다. The 20 types of peptides that specifically bind to HLA-A02:01, which are commonly overexpressed in cancer tissues, found in this Example are present on the surface of cancer cells and specifically bind to HLA-A02:01, so that immune cells become cancer cells. It can be confirmed that it can effectively remove cancer cells because it can help to remove cancer cells and induce the immune system response to cancer cells and at the same time increase the immunogenicity of T cells.

<110> KOREA INSTITUTE OF SCIENCE AND TECHNOLOGY THE ASAN FOUNDATION University of Ulsan Foundation For Industry Cooperation <120> Human leukocyte antigen A02:01 allele specific binding peptides and uses thereof <130> PN126045KR <160> 20 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Phosphatidylinositol 4-kinase beta <400> 1 Lys Leu Tyr Asp Gly Phe Gln Tyr Leu 1 5 <210> 2 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase <400> 2 Lys Leu Val Glu Leu Pro Tyr Thr Val 1 5 <210> 3 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Integrator complex subunit 4 <400> 3 Ala Leu Gln Glu Lys Leu Trp Asn Val 1 5 <210> 4 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Translational activator GCN1 <400> 4 Ser Leu Leu Asp Pro Val Pro Glu Val 1 5 <210> 5 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Transformation/transcription domain-associated protein <400> 5 Thr Leu Ala Asp Leu Val His His Val 1 5 <210> 6 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> DCC-interacting protein 13-alpha <400> 6 Phe Leu Ala Asn Ile Gly Thr Ser Val 1 5 <210> 7 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial <400> 7 Asn Met Val Asp Ile Ile His Ser Val 1 5 <210> 8 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Steroid receptor RNA activator 1 <400> 8 Leu Met Val Asp His Val Thr Glu Val 1 5 <210> 9 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Protein C12orf4 <400> 9 Asn Met Leu Pro Gln Ile Phe Arg Val 1 5 <210> 10 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Protein furry homolog <400> 10 Lys Leu Ile Gly Gln Val His Glu Val 1 5 <210> 11 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> TOX high mobility group box family member 4 <400> 11 Met Ile Thr Asp Val Val Pro Glu Val 1 5 <210> 12 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> DNA polymerase alpha subunit B <400> 12 Ala Leu Ile Glu Lys Leu Val Glu Leu 1 5 <210> 13 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> PHD finger protein 3 <400> 13 Gly Gln Ile Glu Val Val Pro Glu Val 1 5 <210> 14 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Germinal-center associated nuclear protein <400> 14 Ser Leu Ser Ala Phe Thr Pro Ala Leu 1 5 <210> 15 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Fibronectin type III domain-containing protein 3B <400> 15 Ile Leu Trp Glu Thr Val Pro Ser Met 1 5 <210> 16 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Tensin-3 <400> 16 Tyr Ile Thr Glu Arg Ile Ile Ala Val 1 5 <210> 17 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> NudC domain-containing protein 3 <400> 17 Ala Leu Leu Gly Ile Leu Gln His Val 1 5 <210> 18 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Apolipoprotein L3 <400> 18 Ala Leu Ala Asn Gly Ile Glu Glu Val 1 5 <210> 19 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Long chain fatty acid CoA ligase 3 <400> 19 Gly Met Ala Glu Arg Ile Pro Glu Leu 1 5 <210> 20 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> DNA repair protein complementing XP-G cells <400> 20 Tyr Leu Asn Gln His Ile Glu His Val 1 5 <110> KOREA INSTITUTE OF SCIENCE AND TECHNOLOGY THE ASAN FOUNDATION University of Ulsan Foundation For Industry Cooperation <120> Human leukocyte antigen A02:01 allele specific binding peptides and uses it <130> PN126045KR <160> 20 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Phosphatidylinositol 4-kinase beta <400> 1 Lys Leu Tyr Asp Gly Phe Gln Tyr Leu 1 5 <210> 2 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase <400> 2 Lys Leu Val Glu Leu Pro Tyr Thr Val 1 5 <210> 3 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Integrator complex subunit 4 <400> 3 Ala Leu Gln Glu Lys Leu Trp Asn Val 1 5 <210> 4 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Translational activator GCN1 <400> 4 Ser Leu Leu Asp Pro Val Pro Glu Val 1 5 <210> 5 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Transformation/transcription domain-associated protein <400> 5 Thr Leu Ala Asp Leu Val His His Val 1 5 <210> 6 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> DCC-interacting protein 13-alpha <400> 6 Phe Leu Ala Asn Ile Gly Thr Ser Val 1 5 <210> 7 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial <400> 7 Asn Met Val Asp Ile Ile His Ser Val 1 5 <210> 8 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Steroid receptor RNA activator 1 <400> 8 Leu Met Val Asp His Val Thr Glu Val 1 5 <210> 9 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Protein C12orf4 <400> 9 Asn Met Leu Pro Gln Ile Phe Arg Val 1 5 <210> 10 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Protein furry homolog <400> 10 Lys Leu Ile Gly Gln Val His Glu Val 1 5 <210> 11 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> TOX high mobility group box family member 4 <400> 11 Met Ile Thr Asp Val Val Pro Glu Val 1 5 <210> 12 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> DNA polymerase alpha subunit B <400> 12 Ala Leu Ile Glu Lys Leu Val Glu Leu 1 5 <210> 13 <211> 9 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> PHD finger protein 3 <400> 13 Gly Gln Ile Glu Val Val Pro Glu Val 1 5 <210> 14 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Claims (9)

암 세포의 인간 백혈구 항원 (human leucocyte antigen : HLA) A02:01 대립유전자(allele)에 특이적으로 결합하는 펩타이드로서,
상기 펩타이드는 서열번호 2의 아미노산 서열로 이루어진 것이고, 상기 펩타이드는 HLA에 대한 친화도(IC50)가 500 nM 이하인 것인 펩타이드.
A peptide that specifically binds to the human leucocyte antigen (HLA) A02:01 allele of cancer cells,
The peptide is composed of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, and the peptide has an affinity for HLA (IC 50 ) of 500 nM or less.
청구항 1에 있어서, 상기 펩타이드는 암 관련 항원, 암 특이 항원 또는 신생항원인 것인 펩타이드.The peptide of claim 1, wherein the peptide is a cancer-associated antigen, a cancer-specific antigen, or a neoantigen. 삭제delete 삭제delete 청구항 1에 있어서, 상기 펩타이드는 T세포 특이적인 면역원성이 나타나는 것인 펩타이드.The peptide according to claim 1, wherein the peptide exhibits T cell-specific immunogenicity. 청구항 1에 있어서, 상기 암은 폐암, 후두암, 위암, 대장/직장암, 간암, 담낭암, 췌장암, 유방암, 난소암, 자궁암, 자궁경부암, 전립선암, 신장암, 피부암 등의 상피세포 등에서 유래하는 암종(carcinoma), 골암, 근육암, 지방암, 섬유세포암 등의 결합조직세포에서 유래하는 육종(sarcoma), 백혈병, 림프종, 다발성골수종 등의 조혈세포에서 유래하는 혈액암, 신경조직에 발생하는 종양, 및 삼중음성유방암(Triple negative breast cancer) 으로 이루어진 군으로부터 선택된 1종 이상인 것인, 펩타이드.The method according to claim 1, wherein the cancer is lung cancer, laryngeal cancer, stomach cancer, colon/rectal cancer, liver cancer, gallbladder cancer, pancreatic cancer, breast cancer, ovarian cancer, uterine cancer, cervical cancer, prostate cancer, carcinoma derived from epithelial cells, such as kidney cancer, skin cancer ( Carcinoma), bone cancer, muscle cancer, adipose cancer, sarcoma derived from connective tissue cells such as fibroblast cancer, hematopoietic cancer derived from hematopoietic cells such as leukemia, lymphoma, multiple myeloma, tumors occurring in nerve tissue, And triple negative breast cancer (Triple negative breast cancer) will at least one selected from the group consisting of, the peptide. 청구항 1, 2, 5 내지 6 중 어느 한 항의 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 백신 조성물.A vaccine composition comprising the peptide of any one of claims 1, 2, 5 to 6 as an active ingredient. 청구항 1, 2, 5 내지 6 중 어느 한 항의 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 암의 예방 또는 치료제.A preventive or therapeutic agent for cancer comprising the peptide of any one of claims 1, 2, 5 to 6 as an active ingredient. 청구항 1, 2, 5 내지 6 중 어느 한 항의 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 암의 진단용 조성물.A composition for diagnosis of cancer comprising the peptide of any one of claims 1, 2, 5 to 6 as an active ingredient.
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EP3231867B1 (en) * 2014-12-09 2022-09-14 Sapporo Medical University Tumor antigen peptide
KR101970709B1 (en) * 2017-06-13 2019-04-22 가톨릭대학교 산학협력단 Epitopes of PLK1 specific to HLA-A2 subtype inducing antigen-specific T cell immune response against PLK1
JP2020532957A (en) * 2017-08-10 2020-11-19 グッド ティー セルズ、 インコーポレイテッド Method of activating T cells for cancer treatment

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Mol. Cell. Proteomics, Vol. 5, No. 2, pp. 357-365(2006.02.)*

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