JP2021525534A - Muc16特異的キメラ抗原受容体およびそれらの使用 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、ASCIIフォーマットにおいて、電子的に提出され、参照によりその全体において本明細書に組み込まれる配列表を含有する。2019年5月23日に作成された前記ASCIIコピーは、50471_715_601_SL.txtと名付けられ、331,880バイトのサイズである。
本明細書で言及される、全ての刊行物、特許、および特許出願は、各個別の刊行物、特許、または特許出願が、参照により具体的かつ個別に組み込まれることが指し示された場合と同じ程度に、参照により本明細書に組み込まれる。
本開示の特徴は、特に、付属の特許請求の範囲において明示されている。本開示の特徴および利点についてのよりよい理解は、本開示の原理が用いられる、例示的な実施形態を明示する、以下の詳細な記載および付属の図面を参照することにより得られるであろう。
以下の記載および例は、本発明の実施形態について、詳細に例示する。本発明は、本明細書で記載される特定の実施形態に限定されず、そのようなものとして、変動しうることを理解されたい。当業者は、本発明には、多数の変動および改変がなされ、これらは、その範囲内に包含されることを認識するであろう。
CA−125(がん抗原125、腫瘍抗原125、または炭水化物抗原125)またはムチン16としてもまた公知の、MUC16は、糖タンパク質のムチンファミリーのメンバーである。MUC16は、いくつかの異なるメカニズムによって、腫瘍形成および腫瘍増殖の進行に役割を果たすことが示されている。MUC16に対する抗体ベースの手法は、非常にわずかにしか成功していない。したがって、他の処置戦略が必要である。
本明細書で記載される実施形態では、CARは、標的認識のための細胞外抗体由来一本鎖可変ドメイン(scFv)を含んでもよく、scFvは、膜貫通ドメインおよび/または、例えば、T細胞活性化のためのCD3ζを含む細胞内シグナル伝達ドメインに可撓性リンカーによって連結されうる。通常、T細胞がin vivoで活性化されるとき、それらは一次抗原誘導TCRシグナル伝達を、サイトカイン(すなわち、IL−2およびIL−21)の産生を誘導し、次いでオートクライン/パラクライン様式でシグナル伝達ループへとフィードバックするCD28からの二次共刺激シグナル伝達と共に受け取る。このようにして、CARは、シグナル伝達ドメイン、例えば、CD28細胞質シグナル伝達ドメイン、または4−1BBシグナル伝達ドメインなどの他の共刺激分子シグナル伝達ドメインを含みうる。キメラCD28共刺激は、抗アポトーシス分子の上方制御およびIL−2の産生、ならびに、末梢血単核細胞(PBMC)由来のT細胞の拡大増殖によってT細胞の存続を改善する。
複数の実施形態では、本明細書で記載されるCARは、そうでなければ、抗原結合性部分と称する、標的特異的結合エレメントを含む。複数の実施形態では、細胞上の抗原に特異的に結合する、所望の抗原結合性部分を操作することにより、目的の抗原をターゲティングするように、本明細書で記載されるCARを操作する。
複数の実施形態では、本発明のMUC16 CARは、抗原結合性部分と、T細胞膜との間の分離をもたらすストークドメインを含む。複数の実施形態では、ストークドメインは、最適なエフェクター−標的膜間距離を確立する。複数の実施形態では、ストークドメインは、その標的に到達するように抗原結合性ドメインに可撓性をもたらす。一実施形態では、ストークドメインは、CD8アルファヒンジドメインである。
他の実施形態では、CARの細胞外ドメインと、膜貫通ドメインとの間に、スペーサーが組み込まれる。本明細書で記載されるように、スペーサーは、図3で描示されるストーク領域およびストーク伸長領域を含みうる。一実施形態では、スペーサーは、単一のストーク領域を含みうる。別の実施形態では、スペーサーは、ストーク領域(「s」として示される)および本明細書では「s−n’」として示されるストーク伸長領域を含みうる。例えば、スペーサーは、1つのストーク領域、および、nが0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20であってよい、s’−nを含みうる。さらなる実施形態では、ストーク領域を、リンカーを介して、ストーク伸長領域s’−nへと連結することができる。本明細書で記載されるリンカーは、例えば、GSGリンカー(配列番号85)、SGSGリンカー(配列番号86)、(G4S)3リンカー(配列番号83)、(G4S)4リンカー(配列番号200)、および/またはホイットローリンカーを含みうる。
複数の実施形態では、CARは、CARストークドメインの細胞外ドメインに融合される膜貫通ドメインを含む。一実施形態では、CARのドメインの1つと天然では会合する膜貫通ドメインが使用される。複数の実施形態では、膜貫通ドメインは、膜を貫通する疎水性アルファヘリックスである。
本明細書で記載されるCARの細胞内シグナル伝達ドメインとしてまた公知の細胞質ドメインは、CARを入れた免疫細胞の正常エフェクター機能のうちの少なくとも1つの活性化の一因となる。「エフェクター機能」という用語は、細胞の特化機能を指す。T細胞のエフェクター機能は、例えば、細胞溶解活性の場合もあり、サイトカインの分泌を含むヘルパー活性の場合もある。したがって、「細胞内シグナル伝達ドメイン」という用語は、エフェクター機能シグナルを伝達し、特化機能を実施するように、細胞を方向付ける、タンパク質の部分を指す。通常、細胞内シグナル伝達ドメインの全体が用いられうるが、多くの場合、鎖全体を使用することは必要ではない。細胞内シグナル伝達ドメインの、トランケートされた部分を使用し、エフェクター機能シグナルを伝達する限りにおいて、このようなトランケートされた部分を、無傷鎖の代わりに使用することができる。したがって、細胞内シグナル伝達ドメインという用語とは、エフェクター機能シグナルを伝達するのに十分な、細胞内シグナル伝達ドメインの、任意のトランケートされた部分を含むことが意図される。
ランダムな順序または特定の順序で互いに連結されうる。任意選択で、2〜10アミノ酸の間の長さである、短いオリゴリンカーまたはポリペプチドリンカーは、連結を形成しうる。グリシン−セリン対は、特定の適切なリンカーをもたらす。
細胞療法は、ヒト疾患の処置のために、極めて有望であるが、細胞自体またはそれらのトランス遺伝子産物に由来する著明な毒性は、臨床的探索を妨げている。本明細書で記載される、複数の実施形態では、哺乳動物対象、例えば、ヒトへと輸注された、本明細書で記載されるCARを含む免疫エフェクター細胞は、それらの使用から、毒性が生じる場合は、このような免疫エフェクター細胞の効果を調節するために、枯渇させることができる。したがって、ある特定の実施形態では、本明細書で記載される、MUC16特異的キメラ抗原受容体に加えて、第2の遺伝子もまた、本明細書で記載される、操作免疫エフェクター細胞へと導入される。第2の遺伝子は、効果的に、MUC16 CARまたはMUC16 CAR/mbIL−15を含有する細胞の枯渇を可能とする、「キルスイッチ」である。ある特定の実施形態では、「キルスイッチ」とは、HER1またはCD20の、少なくとも1つの抗体結合性エピトープまたはその機能的断片と、任意選択で、シグナルポリペプチド配列またはその断片とを含むHER1ポリペプチドまたはCD20ポリペプチドを含むHER1タグまたはCD20タグである。
本明細書で記載される方法および組成物によって包含される例示的なCARおよびヒトMUC16受容体のオープンリーディングフレームは、表1に列挙する:
一部の実施形態では、本明細書で記載されるCARは、サイトカインを含むが、限定されない、1または複数のさらなる治療剤と共に対象に投与される。場合によって、サイトカインは、少なくとも1つのケモカイン、インターフェロン、インターロイキン、リンホカイン、腫瘍壊死因子、またはこれらの変異体もしくは組合せを含む。場合によって、サイトカインは、インターロイキンである。場合によって、インターロイキンは、IL−1、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−9、IL−10、IL−11、IL−12、IL−13、IL−14、IL−15、IL−16、IL−17、IL−18、IL−19、IL−20、IL−21、IL−22、IL−23、IL−24、IL−25、IL−26、IL−27、IL−28、IL−29、IL−30、IL−31、IL−32、IL−33、ならびにこれらの機能的な変異体および断片のうちの少なくとも1つである。一部の実施形態では、サイトカインは、膜結合型の場合もあり、分泌型の場合もある。複数の実施形態では、サイトカインは、可溶性IL−15、可溶性IL−15/可溶性IL−15Rα複合体(例えば、ALT−803)である。ある特定の場合では、インターロイキンは、膜結合型IL−15(mbIL−15)またはIL−15とIL−15Rαの融合体を含みうる。一部の実施形態では、mbIL−15は、本明細書で記載される改変免疫エフェクター細胞を用いて共発現させうる、膜結合型キメラIL−15である。一部の実施形態では、mbIL−15は、全長IL−15Rα、またはこれらの機能的な断片もしくは変異体とインフレームで融合させた、全長IL−15(例えば、天然IL−15ポリペプチド)、またはこれらの断片もしくは変異体を含む。場合によって、IL−15を、IL−15Rαへと、リンカーを介して、間接的に連結する。場合によって、mbIL−15は、Hurton et al., “Tethered IL-15 augments antitumor activity and promotes a stem-cell memory subset in tumor-specific T cells,” PNAS 2016において記載されている通りである。場合によって、サイトカインは、CARと同じ免疫エフェクター細胞で発現させる。
本明細書では、遺伝子スイッチポリペプチド、リガンド誘導性遺伝子スイッチポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリペプチドおよび/またはポリヌクレオチドを組み込む方法および系が提示される。「遺伝子スイッチ」という用語は、プロモーターと関連する応答エレメントの組合せを指し、例えば、1または複数のリガンドの存在下で、応答エレメントおよびプロモーターを組み込んだ遺伝子の発現をモジュレートする、エクジソン受容体(EcR)ベースの系を指す。緊密に調節された誘導性遺伝子発現系または遺伝子スイッチは、遺伝子治療、細胞内の、大スケールのタンパク質の作製、細胞ベースのハイスループットのスクリーニングアッセイ、機能的なゲノミクス、ならびにトランスジェニック植物およびトランスジェニック動物における形質の調節など、多様な適用に有用である。このような誘導性遺伝子発現系は、リガンド誘導性異種遺伝子発現系を含みうる。
一部の実施形態では、誘導性遺伝子スイッチの調節のために使用されるリガンドは、以下:N−[(1R)−1−(1,1−ジメチルエチル)ブチル]−N’−(2−エチル−3−メトキシベンゾイル)−3,5−ジメチルベンゾヒドラジド(ベレジメクスともまた称する)、(2S,3R,5R,9R,10R,13R,14S,17R)−17−[(2S,3R)−3,6−ジヒドロキシ−6−メチルヘプタン−2−イル]−2,3,14−トリヒドロキシ−10,13−ジメチル−2,3,4,5,9,11,12,15,16,17−デカヒドロ−1H−シクロペンタ[a]フェナントレン−6−オン;N’−(3,5−ジメチルベンゾイル)−N’−[(3R)−2,2−ジメチル−3−ヘキサニル]−2−エチル−3−メトキシベンゾヒドラジド;5−メチル−2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸N’−(3,5−ジメチル−ベンゾイル)−N’−(1−エチル−2,2−ジメチル−プロピル)−ヒドラジド;5−メチル−2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸N’−(3,5−ジメトキシ−4−メチル−ベンゾイル)−N’−(1−エチル−2,2−ジメチル−プロピル)−ヒドラジド;5−メチル−2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸N’−(1−tert−ブチル−ブチル)−N’−(3,5−ジメチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;5−メチル−2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸N’−(1−tert−ブチル−ブチル)−N’−(3,5−ジメトキシ−4−メチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;5−エチル−2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸N’−(3,5−ジメチル−ベンゾイル)−N’−(1−エチル−2,2−ジメチル−プロピル)−ヒドラジド;5−エチル−2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸N’−(3,5−ジメトキシ−4−メチル−ベンゾイル)−N’−(1−エチル−2,2−ジメチル−プロピル)−ヒドラジド;5−エチル−2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸N’−(1−tert−ブチル−ブチル)−N’−(3,5−ジメチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;5−エチル−2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸N’−(1−tert−ブチル−ブチル)−N’−(3,5−ジメトキシ−4−メチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;3,5−ジメチル−安息香酸N−(1−エチル−2,2−ジメチル−プロピル)−N’−(3−メトキシ−2−メチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;3,5−ジメトキシ−4−メチル−安息香酸N−(1−エチル−2,2−ジメチル−プロピル)−N’−(3−メトキシ−2−メチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;3,5−ジメチル−安息香酸N−(1−tert−ブチル−ブチル)−N’−(3−メトキシ−2−メチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;3,5−ジメトキシ−4−メチル−安息香酸N−(1−tert−ブチル−ブチル)−N’−(3−メトキシ−2−メチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;3,5−ジメチル−安息香酸N−(1−エチル−2,2−ジメチル−プロピル)−N’−(2−エチル−3−メトキシ−ベンゾイル)−ヒドラジド;3,5−ジメトキシ−4−メチル−安息香酸N−(1−エチル−2,2−ジメチル−プロピル)−N’−(2−エチル−3−メトキシ−ベンゾイル)−ヒドラジド;3,5−ジメチル−安息香酸N−(1−tert−ブチル−ブチル)−N’−(2−エチル−3−メトキシ−ベンゾイル)−ヒドラジド;3,5−ジメトキシ−4−メチル−安息香酸N−(1−tert−ブチル−ブチル)−N’−(2−エチル−3−メトキシ−ベンゾイル)−ヒドラジド;2−メトキシ−ニコチン酸N−(1−tert−ブチル−ペンチル)−N’−(4−エチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;3,5−ジメチル−安息香酸N−(2,2−ジメチル−1−フェニル−プロピル)−N’−(4−エチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;3,5−ジメチル−安息香酸N−(1−tert−ブチル−ペンチル)−N’−(3−メトキシ−2−メチル−ベンゾイル)−ヒドラジド;および3,5−ジメトキシ−4−メチル−安息香酸N−(1−tert−ブチル−ペンチル)−N’−(3−メトキシ−2−メチル−ベンゾイル)−ヒドラジドのうちのいずれかから選択しうるがこれらに限定されない。
本発明で記載されるCARをコードする核酸はまた、DNA配列を、脊椎動物の染色体へと導入するための、合成DNAトランスポゾン系を指す、「Sleeping Beauty(SB)トランスポゾン系」など、非ウイルスベースの送達系を使用して、免疫エフェクター細胞へと導入することもできる。例示的なSBトランスポゾン系は、例えば、米国特許第6,489,458号明細書および同第8,227,432号明細書において記載され、図3に描示されている。Sleeping Beautyトランスポゾン系は、Sleeping Beauty(SB)トランスポザーゼおよびSBトランスポゾンを含む。本明細書で使用する、Sleeping Beautyトランスポゾン系は、Sleeping Beautyトランスポザーゼポリペプチドならびに活性を保持する誘導体、変異体および/または断片、およびSleeping Beautyトランスポゾンポリヌクレオチド、活性を保持する誘導体、変異体および/または断片を含みうる。ある特定の実施形態では、Sleeping Beautyトランスポザーゼは、mRNAとして提供される。一部の態様では、mRNAは、SB10、SB11、SB110x、またはSB110トランスポザーゼをコードする。一部の態様では、mRNAは、キャップおよびポリAテールを含む。
本明細書ではまた、本発明の核酸を挿入したウイルスのベースの送達系も提供する。代表的なウイルス発現ベクターは、アデノウイルスベースのベクター(例えば、Crucell,Inc.(Leiden、Netherlands)から市販されている、アデノウイルスベースのPer.C6系)、レンチウイルスベースのベクター(例えば、Life Technologies(Carlsbad、Calif.)製の、レンチウイルスベースのpLPI)、およびレトロウイルスベクター(例えば、pCFB−EGSHを付加したpFB−ERV)、ヘルペスウイルスを含むがこれらに限定されない。ある実施形態では、ウイルスベクターはレンチウイルスベクターである。レンチウイルスなどのレトロウイルスに由来するベクターは、トランス遺伝子の、娘細胞における、長期にわたる、安定的な組込みおよびその繁殖を可能とするので、長期にわたる遺伝子導入を達成するのに適するツールである。レンチウイルスベクターは、肝細胞などの非増殖性細胞に形質導入しうるという点で、マウス白血病ウイルスなど、がんレトロウイルスに由来するベクターに優る追加の利点を有する。レンチウイルスベクターはまた、低免疫原性という追加の利点も有する。一般に、かつ、複数の実施形態では、適切なベクターは、少なくとも1つの生物において機能的な複製起点、プロモーター配列、好都合な制限エンドヌクレアーゼ部位、および1または複数の選択用マーカー(例えば、国際公開第01/96584号パンフレット、国際公開第01/29058号パンフレット、および米国特許第6,326,193号明細書)を含有する。
本明細書では、本明細書で記載されるCARを発現する操作細胞が提示される。ある特定の実施形態では、本明細書で記載される操作細胞は、免疫エフェクター細胞である。複数の実施形態では、本明細書では、骨格ならびに(1)トランケート型表皮増殖因子受容体(HER1tまたはHER1t1)および(2)キメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸配列を含むベクターを含む免疫エフェクター細胞であって、CARが(a)MUC16抗原結合性ドメイン;(b)ストークドメイン;(c)膜貫通ドメイン;(d)4−1BBもしくはCD28、または両方を含む共刺激シグナル伝達ドメイン;および(e)CD3ゼータシグナル伝達ドメインを含む、免疫エフェクター細胞が提示される。
本明細書で記載される、1または複数の異種遺伝子またはポリペプチドを発現するように改変された免疫エフェクター細胞が提示される。本明細書で記載されるMUC16 CARおよびHER1t、HER1t1、CD20、およびCD20t−1タグのうちの少なくとも1つを発現するように改変された免疫エフェクター細胞が提示される。場合によってMUC16 CAR、mbIL−15mおよび本明細書で開示されるHER1t、HER1t1、CD20、およびCD20t−1タグのうちの少なくとも1つを発現するように改変された免疫エフェクター細胞が提示される。
一部の実施形態では、ある量の改変免疫エフェクター細胞を、それを必要とする対象へと投与するが、量は、サイトカインと関連する傷害作用を誘導する有効性および潜在的可能性に基づき決定する。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約102〜約109個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約103〜約109個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約104〜約109個を含む。場合によって、場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約105〜約109個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約105〜約108個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約105〜約107個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約106〜約109個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約106〜約108個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約107〜約109個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約105〜約106個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約106〜約107個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約107〜約108個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約108〜約109個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約109個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約108個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約107個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約106個を含む。場合によって、改変免疫エフェクター細胞の量は、1kg当たりの改変免疫エフェクター細胞約105個を含む。
ある特定の態様では、本明細書で記載される実施形態は、リダイレクトされた、抗原特異的免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞、Treg細胞、NK細胞、またはNK T細胞)を作り出し、かつ/またはこれを拡大増殖させる方法であって、細胞に、CARをコードするDNA(またはRNA)構築物を含有する発現ベクターによりトランスフェクトし、次いで、任意選択で、細胞を、フィーダー細胞、組換え抗原、または受容体に対する抗体で刺激して、細胞を増殖させるステップを含む方法を含む。ある特定の態様では、CARを発現するように操作された細胞(または細胞集団)は、肝細胞、iPS細胞、iPS細胞から分化したT細胞、免疫エフェクター細胞、またはこれらの細胞の前駆細胞である。
本明細書に記載されるCARを発現するようにT細胞を操作する前であれ後であれ、T細胞は、一般に、例えば、米国特許第6,352,694号明細書;同第6,534,055号明細書;同第6,905,680号明細書;同第6,692,964号明細書;同第5,858,358号明細書;同第6,887,466号明細書;同第6,905,681号明細書;同第7,144,575号明細書;同第7,067,318号明細書;同第7,172,869号明細書;同第7,232,566号明細書;同第7,175,843号明細書;同第5,883,223号明細書;同第6,905,874号明細書;同第6,797,514号明細書;同第6,867,041号明細書;および米国特許出願公開第20060121005号明細書において記載されている方法を使用して活性化させ、拡大増殖させることができる。
本開示の一実施形態では、本明細書で記載される免疫エフェクター細胞を、POC(point−of−care)施設で改変する。場合によって、改変免疫エフェクター細胞はまた、操作T細胞とも呼ばれる。場合によって、POC(point−of−care)施設は、処置を必要とする対象の近隣の病院または機関(例えば、医療機関)にある。対象は、アファレーシスを受け、末梢血単核細胞(PBMC)またはPBMCのサブ集団は、例えば、湿式分級またはFicoll分離により濃縮することができる。濃縮されたPBMCまたはPBMCのサブ集団は、さらなるプロセシングの前に任意の適切な凍結保存用溶液中で凍結保存することができる。1つの場合には、ヒト血清アルブミンを含有する緩衝液を使用して、湿式分級工程を実施する。T細胞などの免疫エフェクター細胞は、本明細書で記載される選択法により単離することができる。1つの場合には、T細胞についての選択法は、T細胞上のCD3に特異的なビーズまたはCD4およびCD8に特異的なビーズを含む。1つの場合には、ビーズは、常磁性ビーズでありうる。採取された免疫エフェクター細胞は、改変の前に、任意の適切な凍結保存用溶液中で凍結保存することができる。免疫エフェクター細胞は、輸注に先立ち、最大で24時間、36時間、48時間、72時間、または96時間にわたり融解させることができる。融解させた細胞は、改変の前に、細胞培養緩衝液、例えば、ウシ胎仔血清(FBS)もしくはヒト血清ABを補充した細胞培養緩衝液(例えば、RPMI)、またはIL−2およびIL−21などのサイトカインを含む緩衝液に入れることができる。別の態様では、採取された免疫エフェクター細胞は、凍結保存を必要とせずに、速やかに改変することができる。
本明細書で記載される複数の実施形態では、Sleeping BeautyトランスポゾンおよびSleeping Beautyトランスポザーゼにより形質導入された、免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞)が提示される。例えば、Sleeping Beautyトランスポゾンまたはトランスポゾンは、本明細書で記載されるように、MUC16の抗原認識ドメインをCD8アルファヒンジおよびこれらの変異体のストークドメイン、CD3ゼータ、CD28、4−1BBの細胞内ドメイン、またはこれらの任意の組合せ、およびCD3ゼータ細胞内ドメイン、1または複数の細胞タグ、1または複数のサイトカイン、ならびに任意選択で、遺伝子スイッチ系の構成要素と組み合わせる、CARを含みうる。したがって、一部の場合には、形質導入したT細胞は、CAR媒介性T細胞応答を誘発しうる。
本開示の一態様は、本発明のMUC16特異的CARおよび任意選択で、安全性のため、例えばHER1tもしくはHER1t−1およびこれらの機能的変異体、またはCD20もしくはCD20t−1、およびこれらの機能的変異体を含む遺伝子をコードするコード領域を含む、第1のベクターを含む、キットおよび組成物に関する。キットおよび組成物は、サイトカインをさらに含みうる。別の態様では、キットおよび組成物は、RHEOSWITCH(登録商標)遺伝子スイッチ構成要素を含みうる。これらのキットおよび組成物は、それぞれ異なるタンパク質またはタンパク質のサブセットをコードする、複数のベクターを含みうる。これらのベクターは、ウイルス、非ウイルス、エピソーム、または組込みでありうる。一部の実施形態では、ベクターは、トランスポゾン、例えばSleeping Beautyトランスポゾンである。
T細胞への、Sleeping Beauty系のヌクレオフェクション
遺伝子改変T細胞を作るため、凍結保存された汎T細胞を融解させ、洗浄し、あらかじめ温めた、FBSおよびGlutamaxを補充したフェノールレッドフリーRPMI 1640培地(R20培地)で再懸濁し、37℃で5%CO2の加湿したインキュベーター内に置いた。細胞をカウントし、遠心分離し、ヌクレオフェクション緩衝液中に再懸濁した。CAR−T細胞を作るため、特定の数のT細胞(典型的には、キュベット当たり5〜40×106個の範囲)反応を含有する各ヌクレオフェクションキュベット用に、CAR構築物を含む合計で15μgのトランスポゾンプラスミドを、SBトランスポザーゼをコードする5μgのプラスミドと組み合わせた。T細胞の電気穿孔法は、Amexa 2bヌクレオフェクション装置または4Dヌクレオフェクター(Lonza,Walkersville,MD)を使用して達せられた。電気穿孔法後、各キュベットからの内容物は、あらかじめ温めたR20培地に移し、37℃のインキュベーター内に置いた。各T細胞培養の試料は、フローサイトメトリー解析のために採取し、特定の時点で適用可能なCAR、HER1t、およびmbIL−15の発現を特徴づけた。ある特定の実験のため、CAR+T細胞は、さらに特徴づけるために、ex vivoにおいて、数的に拡大増殖させた。作出されたCAR+T細胞の、ex vivoにおける、数的な拡大のため、T細胞を、さらに、AaPC(activating and propagating cell)と共に共培養させた。略述すると、トランケート型MUC16(MUC16t)抗原と一緒にCD86、41BBL、mbIL15を発現するように操作されたK562細胞系由来の照射されたAaPCを、続く毎週のAaPC添加のため、IL−21およびIL−2を伴う完全培地中でCAR+T細胞と共に共培養させた。
MUC16 CAR−T細胞の作出
MUC16−2 CARを発現するCAR−T細胞は、実施例1に記載されるSB系プラスミドの電気穿孔法により作出した。MUC16−2 CAR−HER1t1 T細胞は、MUC16−2 CARおよびHER1t1をコードするSBトランスポゾンプラスミド、ならびにSB11トランスポザーゼプラスミドの、ヒトT細胞への電気穿孔法により作出した。MUC16−2 CAR−mbIL15−HER1t1 T細胞は、(1)MUC16−2 CAR、mbIL15、およびHER1t1をコードするSBトランスポゾンプラスミド、ならびに(2)SB11トランスポザーゼプラスミドの、ヒトT細胞への電気穿孔法により作出した。CAR、mbIL15、およびHER1t1の発現は、ヌクレオフェクション後1日目において、マルチパラメーターのフローサイトメトリーを使用して定量した。
異なるスペーサー長を有するMUC16 CAR
CD8アルファヒンジ領域由来の異なるスペーサー長のMUC16 CARを発現するCAR−T細胞は、実施例1に記載されるように、健常なドナーのT細胞(ドナー番号D133098)において、SB系プラスミドの電気穿孔法により作出した。CAR−T細胞は、実施例1に記載されるように、週に1回の刺激により、MUC16tを発現するAaPCと共培養することにより、ex vivoにおいて、数的に拡大増殖させた。CARの発現は、ヌクレオフェクション後1日目および8日目において、マルチパラメーターのフローサイトメトリーにより測定した。評価したCAR−T試験物を表6に列挙する。図5は、異なるMUC16 CAR−T細胞のMUC16 CAR発現のフローサイトメトリーデータを示す。細胞は、CD3+生細胞についてゲートをかけられた。図5に示すように、遺伝子導入後1日目におけるMUC16 CAR発現の程度の変動は、CAR分子の構築のために利用されるMUC16scFvおよびスペーサーに依存して、観察された。CAR+T細胞の濃縮は、in vitroにおけるCAR+T細胞のMUC16t+AaPC株との共培養時に観察された。ドナー番号D133098由来のMUC16 CAR−T細胞については、MUC16−2 CARのCD8a(3×)スペーサーを使用する、およびMUC16−7 CARのCD8a(2×)スペーサーを使用する、電気穿孔法後1日目〜8日目に、CAR+T細胞のより強い濃縮が観察された。
ウェスタンブロット
プロテアーゼ阻害剤を含有する放射性免疫沈降アッセイにおいて細胞ペレットを再懸濁することにより、T細胞溶解物を作出した。精製した溶解物を、細胞抽出物から分離し、凍結保存した。総タンパク質濃度を決定するため、また試料間のノーマライゼーションのために、ビシンコニン酸(BCA)アッセイを実施した。10μgのタンパク質試料の全てを、還元状態下での電気穿孔法によって解析した。ゲルからのタンパク質材料を、フッ化ポリビニリデン(PVDF)膜へと転写した。タンパク質が転写された膜は、ブロッキングされ、次いでロッカープレート上で、一次抗体、マウス抗ヒトCD3ζ、または抗IL−15抗体と、インキュベートされた。膜は、適切な西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)標識二次抗体の添加の前に洗浄した。ブロットは、化学発光(ECL)検出を使用して調製した。ウェスタンブロットの画像を、FluorChem(商標)E Imagerシステム上で捕捉した。
MUC16−3 CAR−T細胞の細胞傷害性
T細胞の細胞傷害活性は、発光細胞生存率アッセイを使用して決定した。MUC16−3 CAR−mbIL15−HER1t1細胞の特異的細胞傷害性は、上記に記載されたように作出されたCAR+T細胞を使用して評価した。MUC16−3 CAR−mbIL15−HER1t1、対照MUC16−3 CAR−HER1t1 T細胞、および非MUC16対照CAR−mbIL15−HER1t1 T細胞は、MUC16 CAR、HER1t1、およびmbIL−15の発現を評価した。エフェクターCAR−T細胞は、HER1t1の発現によって同定された。異なるエフェクター:標的(E:T)比は、卵巣細胞株、MUC16tを異所発現するSKVO3(SKVO3−MUC16t)、MUC16を発現しないSKVO3親株、MUC16を自然発現するOVCAR3、およびMUC16陰性細胞株であるA549で評価した。細胞培養からの上澄みは、サイトカイン解析まで−80℃で保存した。細胞傷害性のパーセントは、以下の式を使用して決定した:
MUC16−3 CAR−T細胞によるサイトカイン産生
実施例5の細胞傷害性アッセイからの培養上清は、IFNγおよびGranzymeBを含む、サイトカイン産生のため、慣例のマルチ分析キットを使用して、スクリーニングした。
MUC16 CAR−T細胞の特異性
T細胞の細胞傷害活性は、ルシフェラーゼアッセイを使用して決定した。対照CAR−T細胞と共に、MUC16 CAR−T細胞(表8)は、実施例1に記載されるように、2人の健常なドナーのT細胞(D326782およびD132552)への、SB系プラスミドの電気穿孔法によって作出し、ex vivoにおいて、AaPCとの共培養により数的に拡大増殖させた。細胞傷害性は、3連のウェルで、標的細胞として、SKOV3−MUC16t、OVCAR3、およびMUC16negA549細胞株を使用して、異なるE:T比で評価した。細胞傷害性のパーセントは、上記に記載した式を使用して決定した。
mbIL15を発現するMUC16 CAR−T細胞の自己増殖の存続および欠如
CAR−T細胞の存続へのmbIL15の影響を評価するため、MUC16−3 CAR−HER1t1 T細胞およびMUC16−3 CAR−mbIL15−HER1t1 T細胞をCellTrace(商標)Violetで標識し、自己PBMCと共に共培養した。共培養は、14日間維持した。細胞培養中、細胞試料は、生存率を測定するために評価し、CAR T細胞およびメモリー表現型のアセスメントのためのフローサイトメトリーのために染色した。増殖は、色素の希釈によって決定した。
ADCCアッセイ
自己ナチュラルキラー(NK)細胞を、ADCCアッセイのエフェクター細胞として使用した。ex vivoにおいて拡大増殖させたMUC16−2 CAR−mbIL15−HER1t1細胞を、このアッセイの標的細胞として使用した。エフェクター細胞と標的細胞の共培養は、10μg/mLのセツキシマブもしくはリツキシマブの存在下または抗体無しで、10:1のE:T比に設定した。生存率は、共培養後に、フローサイトメトリーを使用して評価した。CAR+T細胞の、ADCC%を決定するため、標識したCD3+細胞の画分の欠如を、最初のCAR+T細胞集団との比較により決定した。
卵巣がんのin vivoモデルにおけるMUC16−2 CAR−T細胞の機能的評価
SKOV3−fLUC−MUC16を、NSGマウスへとIP投与した(0日目)。6日目に、IVISイメージングにより確認した定着腫瘍量を有するマウスをランダム化し(群当たりn=5〜7匹のマウス)、生理食塩水(HBSS)、MUC16−2 CAR−HER1t1 T細胞(マウス当たり2×106個の細胞)、MUC16−2 CAR−mbIL15−HER1t1 T細胞(マウス当たり2×106個の細胞)のいずれかを単回IP注射、またはMUC16−2 CAR−mbIL15−HER1t1 T細胞(マウス当たり2×106個の細胞)を単回IV注射した。腫瘍増殖に対する有効性は、腫瘍量を評価するため、CAR−T細胞投与後、3〜4日ごとに実施したin vivo生物発光(IVIS)イメージングにより評価した。一般的安全性は、CAR T細胞投与後、1週間当たり最少2〜3回で、研究を通して実施された、体重および臨床観察のアセスメントにより評価した。
卵巣がんのin vivoモデルにおけるMUC16−3 CAR−T細胞の機能的評価
SKOV3−fLUC−MUC16t腫瘍細胞を、0日目にNSGマウスへとIP投与した。5日目に、定着腫瘍量を有するマウス(IVISイメージングにより確認した)をランダム化し(群当たりn=5〜7匹のマウス)、生理食塩水(HBSS)、MUC16−3 CAR−HER1t1 T細胞(マウス当たり2×106個の細胞)、またはMUC16−3 CAR−mbIL15−HER1t1 T細胞(マウス当たり2×106個の細胞)のいずれかを単回IP注射した。腫瘍増殖に対する有効性は、腫瘍量を評価するため、CAR−T細胞投与後、3〜4日ごとに実施したin vivo生物発光(IVIS)イメージングにより評価した。EDTA中の全血試料を1週間当たり1回採血し、異なるT細胞サブセットのMUC16 CAR T細胞存続、拡大増殖、および定量の評価のため、マルチパラメーターのフローサイトメトリーにかけた。血漿試料を、T細胞活性の指標として、ヒトサイトカインを解析した。一般的安全性は、CAR T細胞投与後、1週間当たり最少2〜3回で、研究を通して実施された、体重および臨床観察のアセスメントにより評価した。
卵巣がんのin vivoモデルにおけるMUC16 CAR−T細胞の用量応答
SKOV3−fLUC−MUC16を、0日目に、NSGマウスへとIP投与した。6日目に、定着腫瘍量を有するマウス(IVISイメージングにより確認した)をランダム化し(群当たりn=5匹のマウス)、生理食塩水(HBSS)、3つの異なる用量のMUC16−2 CAR−mbIL15−HER1t1 T細胞(マウス当たり1×105、5×105、または1×106個の細胞)、およびMUC16−3 CAR−mbIL15−HER1t1 T細胞(マウス当たり1×105、5×105、または1×106個の細胞)または単一の用量のMUC16−3 CAR−HER1t1 T細胞(マウス当たり1×106個の細胞)のいずれかを単回IP注射した。MUC16−2 CAR−mbIL15−HER1t1 T細胞、MUC16−3 CAR−HER1t1 T細胞、およびMUC16−3 CAR−mbIL15−HER1t1 T細胞は全て、1人のドナー由来であり、2日以内に製造された。腫瘍増殖に対する有効性は、腫瘍量を評価するため、CAR−T細胞投与後、3〜4日ごとに実施したin vivo生物発光(IVIS)イメージングにより評価した。
抗MUC16モノクローナル抗体の結合親和性
様々な抗MUC16モノクローナル抗体(mAb)の結合親和性を、Biacore3000を使用する表面プラズモン共鳴(SPR)アッセイにより評価した。抗MUC16mAbは、それぞれの軽鎖および重鎖プラスミドのHEK293細胞への一過性トランスフェクションを介して作出した。抗−MUC16 mAbの可変領域を、マウス定常鎖領域へと融合させ、キメラマウスIgG1 mAbを作出した。ヒトFc領域へと融合させたトランケート型MUC16を、センサーチップCM5上に固定した。異なる濃度のmAbを溶液相で注射し、データをBIA評価を使用して解析し、mAbのKDを算出した。
表11では、本明細書で提供される実施形態に含まれる特定の配列の代表的なリストを提示する。
Claims (83)
- キメラ抗原受容体(CAR)をコードする単離核酸であって、前記CARが、
(a)MUC16抗原結合性ドメイン;
(b)ストークドメイン;
(c)膜貫通ドメイン;
(d)4−1BBもしくはCD28、または両方を含む共刺激シグナル伝達ドメイン;および、
(e)CD3ゼータシグナル伝達ドメイン
を含む、単離核酸。 - 前記MUC16抗原結合性ドメインが、
(a)配列番号1、3、5、7、9、12、および14に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチド;
(b)配列番号2、4、6、8、10、11、13、および15に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチド;および
(c)配列番号27〜57に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチド
のうちの少なくとも1つを含む、請求項1に記載の単離核酸。 - 前記MUC16抗原結合性ドメインが、配列番号27〜57に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドである、請求項1または2に記載の単離核酸。
- 前記ストークドメインが、配列番号16のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドである、請求項1または2に記載の単離核酸。
- 前記共刺激シグナル伝達ドメインが4−1BBを含む、請求項1から4のいずれか一項に記載の単離核酸。
- 前記4−1BBの共刺激シグナル伝達ドメインが、配列番号22のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドを含む、請求項5に記載の単離核酸。
- 前記共刺激シグナル伝達ドメインがCD28を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の単離核酸。
- 前記CD28の共刺激シグナル伝達ドメインが、配列番号23のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドを含む、請求項7に記載の単離核酸。
- 前記CD3ゼータシグナル伝達ドメインが、配列番号26のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドを含む、請求項1から8のいずれか一項に記載の単離核酸。
- トランケート型表皮増殖因子受容体をさらに含む、請求項1から9のいずれか一項に記載の単離核酸。
- 前記トランケート型表皮増殖因子受容体が、HER1tであり、配列番号65のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドを含む、請求項10に記載の単離核酸。
- 前記トランケート型表皮増殖因子受容体が、HER1t−1であり、配列番号66のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドを含む、請求項10に記載の単離核酸。
- 前記CARが、配列番号27〜57に示されるアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドを含む、請求項1に記載の単離核酸。
- 骨格ならびに
(1)HER1t、HER1t−1、またはこれらの機能的な変異体のうちの少なくとも1つを含むトランケート型表皮増殖因子受容体;
(2)サイトカイン;および
(3)キメラ抗原受容体(CAR)
をコードする核酸配列を含むベクターであって、前記CARが、
(a)MUC16抗原結合性ドメイン;
(b)ストークドメイン;
(c)膜貫通ドメイン;
(d)4−1BBもしくはCD28、または両方を含む共刺激シグナル伝達ドメイン;および
(e)CD3ゼータシグナル伝達ドメイン
を含む、ベクター。 - 前記サイトカインが、IL−15またはIL−12である、請求項14に記載のベクター。
- レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、または非ウイルスベクターである、請求項14または15に記載のベクター。
- 前記トランケート型表皮増殖因子受容体が、配列番号65または配列番号66のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドを含む、請求項14に記載のベクター。
- 前記IL−15が、膜結合IL−15である、請求項15に記載のベクター。
- 膜結合IL−15が、配列番号161をコードするヌクレオチド配列を含む、請求項18に記載のベクター。
- 自己切断型トセア・アシグナ(Thosea asigna)ウイルス(T2A)ペプチドをコードするヌクレオチド配列をさらに含む、請求項14から19のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記骨格が、Sleeping BeautyトランスポゾンDNAプラスミドまたはpFUGWである、請求項14から20のいずれか一項に記載のベクター。
- プロモーターをさらに含む、請求項14から21のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記プロモーターが、hEF1a1である、請求項22に記載のベクター。
- 前記MUC16抗原結合性ドメインが、
(a)配列番号1、3、5、7、9、12、および14に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチド;
(b)配列番号2、4、6、8、10、11、13、および15に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチド;および
(c)配列番号27〜57に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチド
のうちの少なくとも1つを含む、請求項14から23のいずれか一項に記載のベクター。 - 前記MUC16抗原結合性ドメインが、配列番号27〜57に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドである、請求項14から24のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記ストークドメインが、配列番号16のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有するポリペプチドを含む、請求項14から25のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記共刺激シグナル伝達ドメインが、4−1BBを含む、請求項14から26のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記4−1BBの共刺激シグナル伝達ドメインが、配列番号22のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有する核酸配列を含む、請求項27に記載のベクター。
- 前記共刺激シグナル伝達ドメインが、CD28を含む、請求項14から26のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記CD28の共刺激シグナル伝達ドメインが、配列番号23のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有する核酸配列を含む、請求項29に記載のベクター。
- 前記CD3ゼータシグナル伝達ドメインが、配列番号26のアミノ酸配列との、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有する核酸配列を含む、請求項14から30のいずれか一項に記載のベクター。
- プラスミドを含む、請求項14から31のいずれか一項に記載のベクター。
- 各前記ベクターが発現プラスミドを含む、請求項14から31に記載のベクター。
- 前記非ウイルスベクターが、Sleeping Beautyトランスポゾンである、請求項16に記載のベクター。
- 請求項1から13のいずれか一項に記載のヌクレオチドを含む、免疫エフェクター細胞。
- (1)細胞タグ(2)IL−15および(3)キメラ抗原受容体(CAR)を含む免疫エフェクター細胞であって、前記CARが、(a)MUC16抗原結合性ドメイン;(b)ストークドメイン;(c)膜貫通ドメイン;(d)4−1BBもしくはCD28、または両方を含む共刺激シグナル伝達ドメイン;および(e)CD3ゼータシグナル伝達ドメインを含む、免疫エフェクター細胞。
- 前記IL−15が、膜結合IL−15である、請求項36に記載の免疫エフェクター細胞。
- 前記膜結合IL−15が、配列番号161のポリペプチド配列を含む、請求項36に記載の免疫エフェクター細胞。
- 前記細胞タグが、HER1tを含み、前記HER1tが、配列番号65のポリペプチド配列を含む、請求項36に記載の免疫エフェクター細胞。
- 前記細胞タグが、HER1t−1を含み、前記HER1t−1が、配列番号66のポリペプチド配列を含む、請求項36に記載の免疫エフェクター細胞。
- 請求項14から34のいずれか一項に記載のベクターを含む免疫エフェクター細胞。
- T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、または調節性T細胞である、請求項35から41のいずれか一項に記載の免疫エフェクター細胞。
- 前記CARが、配列番号27〜57のアミノ酸配列のうちの少なくとも1つを含む、請求項36に記載の免疫エフェクター細胞。
- それを必要とするヒト対象において標的細胞集団または組織に対するT細胞媒介性免疫応答を刺激するための方法であって、CARを発現するように遺伝子改変された有効量の細胞をヒト対象に投与するステップを含み、前記CARが、
(a)MUC16抗原結合性ドメイン;
(b)ストークドメイン;
(c)膜貫通ドメイン;
(d)4−1BBもしくはCD28、または両方を含む共刺激シグナル伝達ドメイン;
(e)CD3ゼータシグナル伝達ドメイン;および
(f)トランケート型表皮増殖因子受容体(HER1t)
を含む、方法。 - 前記ヒトが、卵巣がんおよび乳がんのうちの少なくとも1つを伴うと診断されている、請求項44に記載の方法。
- 前記卵巣がんまたは乳がんが、再発性または不応性の卵巣がんまたは乳がんである、請求項45に記載の方法。
- キメラ抗原受容体(CAR)をコードする単離核酸であって、前記CARが、
(a)配列番号1〜15または27〜57に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも1つを伴うMUC16抗原結合性ドメイン;
(b)配列番号16のアミノ酸配列を伴うストークドメイン;
(c)配列番号23のアミノ酸配列を伴うCD28を含む共刺激シグナル伝達ドメイン;
(d)配列番号65のアミノ酸配列を伴うHER1tおよび配列番号66のアミノ酸配列を伴うHER1t−1のうちの少なくとも1つを含むHER1タグ;および
(e)配列番号26のアミノ酸配列を伴うCD3ゼータシグナル伝達ドメイン
を含む、単離核酸。 - キメラ抗原受容体(CAR)をコードする単離核酸であって、前記CARが、
(a)配列番号1〜15または27〜57に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも1つを伴うMUC16抗原結合性ドメイン;
(b)配列番号16のアミノ酸配列を伴うストークドメイン;
(c)配列番号23のアミノ酸配列を伴う4−1BBを含む共刺激シグナル伝達ドメイン;
(d)配列番号65のアミノ酸配列を伴うHER1tおよび配列番号66のアミノ酸配列を伴うHER1t−1のうちの少なくとも1つを含むHER1タグ;および
(e)配列番号26のアミノ酸配列を伴うCD3ゼータシグナル伝達ドメイン
を含む、単離核酸。 - 請求項47または48に記載の1または複数のポリヌクレオチドのいずれかを含む、ベクター。
- レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、または非ウイルスベクターである、請求項49に記載のベクター。
- 前記非ウイルスベクターが、Sleeping Beautyトランスポゾンである、請求項50に記載のベクター。
- 複数のベクターである、請求項51に記載のベクター。
- 免疫エフェクター細胞においてCARを発現するための系であって、請求項1から13および47から48のいずれか一項で提示される単離核酸をコードする1または複数のベクターを含む系。
- 前記免疫エフェクター細胞が、T細胞またはNK細胞である、請求項53に記載の系。
- 少なくとも1つのさらなる遺伝子をコードする核酸をさらに含む、請求項53または54に記載の系。
- 前記さらなる遺伝子が、サイトカインを含む、請求項55に記載の系。
- 前記サイトカインが、IL−2、IL−15、IL−12、IL−21、ならびにIL−15およびIL−15Rαの融合体のうちの少なくとも1つを含む、請求項56に記載の系。
- 前記サイトカインが、分泌形態にある、請求項56に記載の系。
- 前記サイトカインが、膜結合形態にある、請求項56に記載の系。
- 1つのベクターを含む、請求項53から59のいずれか一項に記載の系。
- 前記1または複数のベクターが、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、または非ウイルスベクターである、請求項53から60のいずれか一項に記載の系。
- 前記非ウイルスベクターが、Sleeping Beautyトランスポゾンである、請求項61に記載の系。
- Sleeping Beautyトランスポザーゼをさらに含む、請求項62に記載の系。
- 前記Sleeping Beautyトランスポザーゼが、SB11、SB100X、またはSB110である、請求項63に記載の系。
- 前記免疫エフェクター細胞が、哺乳動物細胞である、請求項53から64のいずれか一項に記載の系。
- 免疫エフェクター細胞においてCARを発現する方法であって、前記免疫エフェクター細胞を請求項53から65のいずれか一項に記載の系と接触させるステップを含む方法。
- 操作T細胞の増殖および/または生存を刺激する方法であって、
(a)細胞の試料を、対象から得るステップであって、前記試料がT細胞またはT細胞前駆細胞を含む、ステップ;
(b)細胞に、請求項1から13および44から45のいずれか一項で提示される単離核酸をコードする1または複数のベクター、ならびにトランスポザーゼをコードするベクターをトランスフェクトし、操作MUC16 CAR発現T細胞の集団をもたらすステップ;
(c)および、任意選択で、MUC16 CAR T細胞の集団を2日間またはそれ以下の間、ex vivoにおいて培養するステップ
を含む方法。 - 細胞に、サイトカインをコードするベクターをトランスフェクトするステップをさらに含む、請求項67に記載の方法。
- 前記サイトカインが、IL−15およびIL−15Rαを含む融合タンパク質である、請求項68に記載の方法。
- 前記1または複数のベクターが、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、または非ウイルスベクターである、請求項67から69のいずれか一項に記載の方法。
- 前記非ウイルスベクターが、Sleeping Beautyトランスポゾンである、請求項70に記載の方法。
- Sleeping Beautyトランスポザーゼをさらに含む、請求項71に記載の方法。
- 前記Sleeping Beautyトランスポザーゼが、SB11、SB100XまたはSB110である、請求項72に記載の方法。
- それを必要とする対象においてがんを処置する方法であって、有効量の操作T細胞の1または複数の用量を前記対象に投与するステップを含み、前記操作T細胞がMUC16 CARおよび膜結合IL−15を含む、方法。
- 有効量の操作T細胞の第1の用量が、腹腔内に投与される、請求項74に記載の方法。
- 有効量の操作T細胞の第2の用量が、静脈内に投与される、請求項75に記載の方法。
- 前記がんが、卵巣がんである、請求項74に記載の方法。
- 前記がんが、乳がんである、請求項74に記載の方法。
- 前記MUC16 CARが、配列番号95〜107、119〜149、または194〜195に示される配列のうちのいずれか1つによってコードされる、請求項74に記載の方法。
- 前記膜結合IL−15が、配列番号161によってコードされる、請求項74に記載の方法。
- 操作T細胞の有効量が、少なくとも102個の細胞/kgである、請求項74に記載の方法。
- 操作T細胞の有効量が、少なくとも104個の細胞/kgである、請求項74に記載の方法。
- 操作T細胞の有効量が、少なくとも105個の細胞/kgである、請求項74に記載の方法。
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