JP2021130681A - 改善された免疫グロブリン可変ドメイン - Google Patents

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Abstract

【課題】改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメインを提供する。【解決手段】VHドメインであって、(i)112位におけるアミノ酸残基は、リシン(K)もしくはグルタミン(Q)の一方であり、及び/又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、トレオニン(T)であり、及び/又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくはVであり、ここで、前記VHドメインは、C末端伸長(X)n[同伸長中、nは、1〜10であり、各Xはアミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択される]を含有する、VHドメイン。【選択図】なし

Description

本発明は、改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメインに関する。
本発明は、特に、露出したC末端領域又は端部(本明細書に更に記載された通り、国際公開公報第12/175741号も参照のこと)のいずれかを有するか、又は、露出したC末端領域又は端部(再度、本明細書に更に記載された通り)を有する用途に使用される(又は、同用途に使用されることが意図される)改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメインに言及する。前者の一部の好ましく、非限定的な例は、免疫グロブリンシングル可変ドメイン(本明細書において、「ISV」又は「ISVD」とも呼ばれる)、例えば、ナノボディ(VHH、ヒト化VHH、及びラクダ化VH、例えば、ラクダ化ヒトVHを含む)、VHドメインであるか、又は、VHドメインから得られる(シングルドメイン)抗体、ならびに、VHドメインであるか、又は、VHドメインから得られるdAbである。後者の一部の好ましく、非限定的な例は、一本鎖FV(ScFv)又はディアボディに使用される(又は、これらに使用されることが意図される)VHドメインである。
また、本発明は、(1つ以上の)本明細書で記載された本発明の改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメインを含むか、又は、本質的にこれらからなる、タンパク質、ポリペプチド、及び他の構築物、分子、又は化学成分;本発明の改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメインを発現/生成するための方法、及び/又は、それを含むタンパク質、ポリペプチド、及び他の構築物、分子、又は化学成分を発現/生成するための方法;本発明の改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメインを含む組成物及び製品(例えば、医薬組成物及び製品)、及び/又は、それを含むタンパク質、ポリペプチド、及び他の構築物、分子、又は化学成分;本発明の改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメインをコードし、及び/又は、それを含むタンパク質もしくはポリペプチドをコードするヌクレオチド配列及び核酸;ならびに、本発明の改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメインならびにそれを含むタンパク質、ポリペプチド、及び他の構築物、分子、又は化学成分の使用(及び特に、治療的、予防的、及び診断的使用)に関する。
本発明の更なる態様、実施態様、利点、用途、及び使用は、本明細書における更なる説明から明らかとなるであろう。
本願において、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン中のアミノ酸残基/位置は、Kabatに従ったナンバリングで示されるであろう。便宜上、図1に、本明細書において具体的に言及されるであろうアミノ酸位置の一部と、幾つかの代替的なナンバリングシステム(例えば、Aho及びIMGT。注記:本説明及び特許請求の範囲については、Kabatナンバリングが決定的であり、他のナンバリングシステムは、参考のためのみに提供される)に従ったそのナンバリングとを列記する表を提供する。
また、本発明において、免疫グロブリン可変ドメインは、定常ドメイン(例えば、C1ドメイン)に会合又は連結していない場合、「露出したC末端又は領域」を有すると言える。本明細書で引用された関連する従来技術が参照される。
特に、国際公開公報第12/175741号に記載されているように、C末端領域(この用語も、本明細書においても使用される通り)は、ISV上の仮想のエピトープの一部であり、また、他の残基の中でも、14位におけるアミノ酸残基(及びアミノ酸配列における同残基の次/同残基近くのアミノ酸残基、例えば、11、13、及び15位)も含み、83位におけるアミノ酸残基(及びアミノ酸配列における同残基の次/同残基近くのアミノ酸残基、例えば、82、82a、82b、及び84位)、及び/又は、108位におけるアミノ酸残基(及びアミノ酸配列における同残基の次/同残基近くのアミノ酸残基、例えば、107位)も含む場合がある。国際公開公報第12/175741号におけるのと同様に、推定のエピトープは、本明細書においても、まとめて「C末端領域」と呼ばれる。このC末端領域は、C末端配列VTVSS(すなわち、109、110、111、112、及び113位のそれぞれ)と、14位におけるアミノ酸残基とを少なくとも含み、83及び108位におけるアミノ酸残基も含む場合があり、13、15、82b、83、84、及び107位におけるアミノ酸残基も含む可能性があることが理解される。
(ISVDと同様に、定常ドメインと会合していない免疫グロブリン可変ドメインを含有する構築物である)一本鎖Fv又はScFv中の調査の結果として、免疫グロブリン可変ドメインのC末端は、従来の全長抗体では、可変ドメインと定常ドメインとの間の界面に埋もれているが、可変ドメインが定常ドメインと会合していない場合には、溶媒に露出する疎水性パッチを含有することが、当技術分野において記載されている(例えば、Nieba et al., Protein Engineering, 10, 435-444 (1997)及びHarmsen et al., Molecular Immunology (2000), 579-590を参照のこと)。
また、タンパク質の構造内に通常は埋もれているエピトープ(「ネオ−エピトープ」又は「潜在性エピトープ」とも呼ばれる)は、それらが溶媒露出になると、例えば、関与するタンパク質の分解、ミスフォールディング、又は凝集により、免疫システムをトリガーする場合があることが周知である。例えば、生体分子の埋もれた疎水性部分(いわゆる、「hyppos」)の場合には、これらは、hypposが溶媒露出になると、生来の免疫応答をもたらす一般的な傷害関連分子パターンの一部を形成することが示唆されている(例えば、Seong and Matzinger, Nature Reviews 2004, 469を参照のこと)。免疫応答をトリガーする元は埋もれていた疎水性パッチの種々の例が、当技術分野において記載されている(例えば、David et al., JBC, 2001, 6370-6377;Matsuura et al., International Immunology, 2000, 1183-1192;Rasheed et al., Life Sciences 79 (2000), 2320-2328を参照のこと)。より一般的には、疎水性アミノ酸は、B細胞エピトープの一部である傾向があることも、当技術分野において公知である(例えば、国際公開公報第11/07586号、10頁;及びKolaskar, FEBS 276, 172-174 (1990)を参照のこと)。同様に、(Nieba et al.及びHarmsen et al.、上記に記載された)重鎖可変ドメインのC末端における疎水性パッチは、(出現し及び/又は予め存在する)抗−薬剤抗体を生じ、及び/又は、同抗体と相互作用することができるB細胞エピトープを形成する場合があることが記載されている(国際公開公報第11/07586号)。この理由のために、疎水性を低下させ、及び/又は、B細胞エピトープを除去するために、可変ドメインのC末端の一部を形成するアミノ酸残基の一部を変異させることが提唱されている。例えば、Nieba et al.には、VH領域の11、14、41、84、87、及び/又は89位(Kabatに従ったナンバリング)を変異させることが提唱されている。一方、国際公開公報第11/07586号には、VLドメインの99、101、及び/もしくは148位(AHoナンバリング)、又は、VHドメインの12、97、98、103、及び/もしくは144位(再度、AHoナンバリング−これらの位置は、Kabatに従った11、83、84、85、89、及び103位に対応する)を変異させることが提唱されている。同様に、Harmsen et al.には、C1ドメインが存在しないのを補償する、12及び101位(IMGTナンバリング、これらは、Kabatに従った11及び89位である)を変異させることが提唱されている。また、同著者は、これらの位置における置換に適した候補であるアミノ酸を含有する、VHHの特定のサブファミリー(「VHH4」と呼ばれる)も特定している。
また、ヒトの対象から得られた生体サンプルは、免疫グロブリン可変ドメインの露出したC末端領域又は端部(例えば、ScFv又はディアボディ中のISVD又はVHもしくはVLドメインのC末端領域又は端部)に結合可能な(既存の)タンパク質又は因子を含有している場合があることも、当技術分野において記載されている(例えば、国際公開公報第12/175741号及び次の段落で引用した参考文献を参照のこと)。
例えば、国際公開公報第2013/024059号には、「一部の健康でナイーブなヒト対象からの血清には、VHドメイン抗体及びVHH分子の両方に結合することができる既存の抗VH自己抗体と、VL分子に結合することができる抗VL(例えば、Vカッパ(VK))自己抗体が存在する」こと、及び、「VH dAbに結合する既存のADAが、IgGフラグメントに結合するが、インタクトなIgG上にin situで見出された同じ配列には結合しない抗ヒンジ抗体に類似する」ことが記載されている。
Holland et al., J. Clin. Immunol. 2013, 33(7):1192-203には、正常で健康なヒトの約半分の血液に、完全にヒトVドメイン抗体のフレームワーク配列に結合することができる、変動するレベルでの新たな分類の抗IgG自己抗体(Holland et al.において、「HAVH自己抗体」とも呼ばれる)が含まれることが記載されている。さらに、Holland et al.には、これらの自己抗体は、主にIgGアイソタイプのものであり、V配列に比較的高い親和性(約10−10M)を表わすと考えられこと、及び、遊離したC末端は、これらのHAVH自己抗体のVドメインへの結合に重要であると考えらえることが言及されている。
また、バイオ治療分子に対する既存のバイオ治療反応性抗体及びそのレギュラトリーな影響に関する問題は、Xue et al., AAPS J. 2013; 15(3):852-5において、全体的に議論されている。
また、前述の従来技術では、このような既存の抗体/因子の可変ドメインへの結合を妨げる又は低下させるために、免疫グロブリン可変ドメインの配列を改変することができる方法に焦点が当てられてきた。この観点において、国際公開公報第2011/07586号には、可変ドメインのアミノ酸配列中において、このドメインの幾つかの特定の位置(この位置は、表面露出している)に、1つ以上の変異を生じさせることが示唆されている。国際公開公報第12/175741号には、このような既存の抗体/因子の結合を、少しのアミノ酸残基(及び、最少で1つのアラニン残基)をVHドメインのC末端に付加することにより、及び/又は、1つ以上の特定の置換もしくは欠失を可変ドメインのC末端領域内に生じさせることにより低下させることができることが記載されている。このことは、国際公開公報第12/175741号において、C末端アミノ酸配列VTVSSと14位におけるアミノ酸残基とを少なくとも含み(これらの位置については、国際公開公報第12/175741号には、アラニン残基の存在が、「ヒト」アミノ酸残基であるプロリンの存在と比較して、既存の抗体の低下した結合を提供することが教示されている)、108及び83位のアミノ酸残基ならびに前記位置近くのアミノ酸残基も含む可能性があることが記載されている(国際公開公報第2013/024059号は、国際公開公報第12/175741号と同じ教示を本質的に提供する)。
例えば、国際公開公報第12/175741号の出願までに、出願人/譲受人主導で行われた調査において、1つのアラニン残基を露出したVHドメインのC末端領域又は端部に付加することにより、ほとんどのヒト対象から得られたサンプルに存在する既存の抗体/因子の結合(本質的に全ての結合)が通常妨げられ/除去されるであろうことが見出された(例えば、国際公開公報第12/175741号の第62頁20〜25行目、及び、第57頁30行目〜第58頁3行目を参照のこと)。これらの知見は、国際公開公報第12/175741号のC末端アラニン置換を他のナノボディに適用した、国際公開公報第12/175741号の出願後の出願人/譲受人により得られた更なる結果により確認されている(データを示さず)。
また、出願人/譲受人による国際公開公報第12/175741号及び同第12/175400号において、国際公開公報第12/175741号に記載されたC末端伸長が、血清アルブミン結合ナノボディを確認するのに適用されている(例えば、国際公開公報第12/175741号:配列番号:37、51〜53、及び55〜64、ならびに、配列番号:41、43、及び44に示された構築物、ならびに、国際公開公報第12/175400号:配列番号:6〜11を参照のこと)。
また、国際公開公報第12/175741号の図9には、以下の実験部において参照配列として使用される、2つのアルブミン結合配列も記載されいてる。これらは、国際公開公報第12/175741号の図9からの配列番号:37(本明細書において、「参照B」とも呼ばれ、その配列は、本明細書では、配列番号:45として提供される)及び国際公開公報第12/175741号の図9からの「付加されたC末端アミノ酸残基を含まない配列番号:37」(本明細書において、「参照A」とも呼ばれ、その配列は、配列番号:44に提供される)である。参照A及び参照Bは両方とも、国際公開公報第06/122787号における配列番号:62として提供される(及び本明細書では、「Alb−11」とも呼ばれる)、ヒト化抗アルブミンナノボディ「Alb−8」の配列から得られる。一方、Alb−11の配列と比較して、参照Aは、N末端Hisタグを含み、参照Bは、N末端Hisタグ及びC末端アラニン残基を含む。参照A、参照B、及びAlb−8/Alb−11は全て、配列番号:41〜43それぞれに提供されるCDRを含有する。
C末端伸長及び/又はC末端領域における変異を有するナノボディ及び他の免疫グロブリンシングル可変ドメインの他の例は、例えば、下記の従来技術に見出すことができる。国際公開公報第06/129843号(例えば、配列番号:4、6、8、及び10を参照のこと);同第03/035695号(例えば、第61〜64頁に列記された配列の一部を参照のこと);Vu et al., Molecular Immunology, 1121-1131, 1997(例えば、図2に列記された配列の一部を参照のこと);国際公開公報第11/003622号(例えば、配列番号:10〜27として提供された配列を参照のこと);同第09/058383号(例えば、第51頁で言及されたTAR2h−10−27の配列を参照のこと);同第10/042815号(例えば、配列番号:15、17、27、及び30の配列を参照のこと);及び同第04/044204号(例えば、配列番号:31、35、37、47、及び49の配列を参照のこと)。
また、本明細書で引用された参考文献の一部は、例えば、113位におけるセリンが別のアミノ酸により置換されているため、及び/又は、113位におけるセリンが欠失されており、かつ、C末端アミノ酸が付加されている(実際には、C末端アミノ酸配列に関する最終結果は同じであろう)ために、ISVDの最後のC末端アミノ酸がセリン(S)以外のアミノ酸であるISVD配列の例も提供する。
また、本明細書で引用された参考文献の一部は、112位がセリン以外のアミノ酸である、ナノボディ及び他の免疫グロブリンシングル可変ドメインの例も提供する。例えば、国際公開公報第12/175741号には、112位がグリシン(G)であるナノボディが記載されている。Vu at al.(上記)には、112位がアラニン(A)又はイソロイシン(I)であるナノボディが記載されている。国際公開公報第13/024059号には、S112A置換が例示されている。以下で引用された国際公開公報第08/020079号には、S112F置換が例示されており、また、同文献中で記載されたナノボディが、ナノボディのアミノ酸配列のカルボキシ末端に付加された限られた数のアミノ酸残基を含有することができることも全体的に記載されている。
本発明までに行われた調査において、C末端伸長(単純に、1つのC末端アラニン残基であることができる。再度、国際公開公報第12/175741号、実施例3を参照のこと)をナノボディのC末端領域又は端部に付加することにより、ヒトの対象/患者のほとんどのサンプル中における既存の抗体/因子の結合が本質的に妨げられ/除去されることが確立された後、ヒト対象(健康なボランティア及び/又は疾患もしくは障害を患う対象)から得られたサンプルが、C末端伸長が存在する場合であっても、ナノボディ(又は他のVHドメイン)の露出したC末端領域に結合することができる(他の)既存の抗体又は因子を含有する可能性があるかどうかが調査された。そうすることで、本発明者らは、C末端伸長したVHドメインに結合するこのような既存の抗体を、健康なボランティアの血液もしくは血清中において、又は、数多くの種類の疾患の内の1つ(一部の炎症性疾患又は自己免疫障害−データを示さず)を患うヒト患者から得られた血液もしくは血清中において、基本的に見出すことができなかったが、特定の重篤な(自己)免疫障害(例えば、全身性エリテマトーデス、本明細書において、「SLE」とも略される)を患う特定(全員ではない)ヒト対象から得られた一部の血液又は血清サンプルは、前記ナノボディがC末端伸長を含む場合であっても、ナノボディに結合することができる、一部の既存の抗体/因子を含有すると考えられる。
このため、一般的には、本発明の目的は、露出したC末端領域又は端部を有する場合、既存の抗体又は因子、例えば、ヒト対象から得られた血液又は血清サンプル中に見出されるものにより結合される傾向がほとんどない、改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメイン(及び特に、改善された重鎖ISVD、及びとりわけ、改善されたナノボディ)を提供することである。
特に、本発明の目的は、露出したC末端領域又は端部を有する場合、前記ドメインがC末端伸長(例えば、国際公開公報第12/175741号、同第13/024059号、及び本明細書で引用された更なる従来技術に記載)を含む場合でも、重鎖可変ドメインの露出したC末端領域又は端部にも結合することができる、既存の抗体又は因子(再度、例えば、ヒト対象から得られた血液又は血清サンプル中に見出されるもの)により結合される傾向がほとんどない、改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメインを提供することである。
本明細書で言及されたように、C末端伸長を有する重鎖可変ドメインに結合することができるこのような既存の抗体が、本発明者らにより、免疫系に重篤な影響を及ぼし/同免疫系を活性化する特定の(自己)免疫疾患又は障害(例えば、SLE)を患うヒト対象から得られた血液又は血清試料に存在することが見出されている。
このため、とりわけ、本発明の目的は、露出したC末端領域又は端部を有する場合、既存の抗体又は因子、例えば、免疫系に重篤な影響を及ぼし/同免疫系を活性化する特定の(自己)免疫疾患又は障害(例えば、SLE)を患うヒト対象から得られた血液又は血清サンプル中に見出されるものにより結合される傾向がほとんどない、改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメイン(及び特に、改善された重鎖ISVD、及びとりわけ、改善されたナノボディ)を提供することである。
さらにとりわけ、本発明の目的は、露出したC末端領域又は端部を有する場合、特定の(自己)免疫疾患又は障害を患うヒト対象から得られた血液又は血清サンプル中に見出され、VHドメインがC末端伸長を含む場合でも、VHドメインの露出したC末端領域又は端部にも結合することができる既存の抗体又は因子により結合される傾向がほとんどない、改善された重鎖免疫グロブリン可変ドメイン(及び特に、改善された重鎖ISVD、及びとりわけ、改善されたナノボディ)を提供することである。
現在、既存の抗体/因子の露出したC末端領域を有する重鎖可変ドメインへの結合を、112位(Kabatナンバリング)におけるセリンのリシン(K)又はグルタミン(Q)のいずれかへの変異により、(更に)低下させることができることが見出されてきた。特に、このようなS112K又はS112Q変異により、C末端伸長を含む(が、S112K又はS112Q変異を含まない)重鎖可変ドメインに結合することができる既存の抗体/因子、例えば、重篤な自己免疫障害、例えば、SLEを患うヒト対象の血液又は血清中に見出された既存の抗体/因子の結合が、(更に)低下し、又は、同結合が本質的に妨げられ/除去されることが見出された。
本明細書で開示された特定の変異(及び特に、V89Lとの組み合わせにおける、及び場合により、更にT110Kとの組み合わせにおける下記変異L11V)を導入することは、本明細書で一般的に及び具体的に開示された免疫グロブリンシングル可変ドメイン、例えば、ISVDの溶解性を改善することができ、又は、同溶解性の(更なる)改善に寄与することができる(データを示さず)。
このため、第1の態様では、本発明は、112位(Kabatナンバリング)におけるアミノ酸残基は、リシン(K)残基又はグルタミン(Q)残基のいずれかである、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)に関する。このような免疫グロブリン重鎖可変ドメインは、本明細書において、「本発明のVHドメイン」とも呼ばれる。本発明のVHドメインが、免疫グロブリンシングル可変ドメインである(同様に、好ましい)場合、免疫グロブリンシングル可変ドメインは、本明細書において、「本発明のISVDドメイン」とも呼ばれるであろう。同様に、本発明のVHドメインが、ナノボディである(同様に、更により好ましい)場合、ナノボディは、本明細書において、「本発明のナノボディ」とも呼ばれるであろう。
一般的には、本発明のVHドメインは、露出したC末端又は領域のいずれかを有し、及び/又は、露出したC末端又は領域を有するタンパク質、ポリペプチド、化合物、成分、又は構築物中に存在し、及び/又は、露出したC末端又を有する使用(例えば、C末端又は領域を形成するのを意図したタンパク質、ポリペプチド、化合物、成分、又は構築物における使用)を意図されている。
本発明の一態様では、本発明のVHドメインは、VLドメインとの相互作用無しに、機能的な抗原結合部位を形成することができる重鎖可変ドメインを意味する、(重鎖)免疫グロブリンシングル可変ドメインである。例えば、本発明のVHドメインは、ナノボディ(VHH、ヒト化VHH、及び/又はラクダ化VH、例えば、ラクダ化ヒトVHを含む)、VHドメインであるか、もしくは、VHドメインから得られる(シングル)ドメイン抗体、又は、VHドメインであるか、もしくは、VHドメインから得られるdAbであることができる。本発明のVHドメインは、好ましくは、ナノボディ(例えば、VHHドメイン、ヒト化VHHドメイン、又はラクダ化VHドメイン、例えば、ラクダ化ヒトVHドメイン)である。
本発明の別の態様によれば、本発明のVHドメインは、それが存在するタンパク質、ポリペプチド、タンパク質、又は構築物において、抗原結合部位を形成するために、VLドメインとの相互作用を必要とし、露出したC末端又は領域を有するもしくは形成する重鎖可変ドメインであることができる。例えば、本発明のこの態様のVHドメインは、ScFv及び/もしくはディアボディに存在し、ならびに/又は、ScFv及び/もしくはディアボディに使用されるVHドメインであることができる。
本発明のより具体的な態様によれば、本発明のVHドメインは、VTVKS(配列番号:1)もしくはVTVQS(配列番号:2)であるC末端配列(Kabatに従った109〜113位)、又は、配列VTVKS及び/もしくはVTVQSのいずれかと1つのアミノ酸差(すなわち、109、110、111、又は113位の内の1つ)を有し、それでも112位においてリシン(K)もしくはグルタミン(G)のいずれかを有する配列を有する。
また、本明細書で更に記載されたように、本発明の特に好ましい一態様では、本発明のVHドメインは、C末端伸長(例えば、国際公開公報第12/175741号及び/又は同第13/024059号に記載された通り)、特に、本明細書で更に定義されたC末端伸長も、そのC末端(すなわち、VTVKS−、VTVQS−、又は類似するモチーフの端部においてセリン残基に連結されている)に含有する。ただし、本明細書でも更に記載されたように、VTVKS−、VTVQS−、又は類似するモチーフは、VHドメインのC末端を形成する(ただし、これは、通常ほとんど好ましくないであろう)こと、又は、本発明のVHドメインは、そのC末端において(場合により、適切なリンカーを介して)、別のアミノ酸配列、部分、ドメイン、もしくは結合ユニットに連結されることも可能である。例えば、本発明のVHドメインがISVDである場合、VHドメインは、そのC末端において、別のISVDに、場合により、リンカーを介して連結することができる(及び、例えば、前記他のISVDも、本発明のVHドメインであることができる)。
全体として、一般的に免疫グロブリン可変ドメインについて周知であるように、本発明のVHドメインは、4つのフレームワーク領域(FW1、FW2、FW3、及びFW4)と、3つのCDR(CDR1、CDR2、及びCDR3)とを含むであろう。一般的には、免疫グロブリン可変ドメインについてと同様に、CDRの配列は、本発明のVHドメインが生じ、及び/又は、結合することが意図される、抗原/ターゲットにより決まるであろう。フレームワーク領域は、一般的には、VHドメインの任意の適切なフレームワーク領域であることができる(それでも、112位及び/又は89位は、本明細書で更に記載された通りであろう)。本発明のVHドメインがISVDである場合、VHドメインは、ISVDに適したフレームワーク配列を有するであろう(場合により、1つ以上のCDRとの会合において)。例えば、本発明のVHドメインがナノボディである場合、フレームワーク領域は、一般的には、適切な数のVHHホールマーク残基を含有するであろう(これについては、例えば、国際公開公報第08/020079号及び本明細書で引用された出願人/譲受人の一部の他の特許出願が参照される)。
このため、例えば、本発明のVHドメインがナノボディである場合、前記本発明のナノボディは、VHH/ナノボディに特徴的な1つ以上の「ホールマーク残基」(例えば、11、37、44、45、47、83、84、103、104、及び/又は108位、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−3及びA−5〜A−8を参照のこと);VHH/ナノボディに存在することができる1つ以上の他のアミノ酸残基(例えば、それ自体がVHH及びナノボディについて公知である1つ以上のヒト化置換、例えば、国際公開公報第08/020079号における教示が参照され、再度、先に言及された表A−3及びA−5〜A−8を参照のこと)、ならびに/又は、VHH/ナノボディについて1つ以上の他の適切なアミノ酸残基もしくは置換;又は、このようなアミノ酸残基/置換の任意の適切な組み合わせを含有することができる。
112位がK又はQである(すなわち、C末端伸長の有無に関わらず)本発明のナノボディは、好ましくは、L(VHH中に最も頻繁に生じるアミノ酸残基)、E、K、M、S、V、W、又はYから選択され、より好ましくは、L、E、K、V、又はYから選択され、及び更により好ましくは、L、K、又はV(Vが最も好ましい)から選択される、11位におけるアミノ酸を含有する。例えば、限定されず、VHHに最も頻繁に生じるロイシン残基と比較して、本発明のナノボディは、L11K又はL11V変異を含有することができるが、これに限定されない。また、本発明のナノボディは、例えば、Q108L変異(VHH/ナノボディについて周知のヒト化置換)を含有することができるが、これに限定されない。存在することができる他のアミノ酸残基(再度、限定されず、例えば、ヒトVH又はVHH中のこの位置における天然の他のアミノ酸残基も、これらの位置に存在することができる)は、例えば、14位におけるアラニン(A)(天然のVHH中のこの位置において非常に頻繁に生じるアミノ酸残基である)、14位におけるプロリン(ヒトVHドメイン中のこの位置において最も一般的なアミノ酸である)、及び、Harmsen et al.により示唆された変異(特に、Harmsen et al.において、VHH4−クラスVHH、例えば、V89M又はV89Tに基づいて示唆されているもの)、ならびに/又は、Niebaにおいて示唆された位置における(他の)変異(例えば、11、87、及び/又は89位の内の1つ以上において、Nieba、第437頁、右側欄)の内の1つ以上である。別の適切な変異は、例えば、T110K又はT110Qである。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができ(又は、これらから選択することができ)(これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり)、及びとりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)また、42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、及び特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
本発明のより具体的な態様によれば、(本明細書で更に記載された)本発明のVHドメインは、下記のいずれかであるフレームワーク4(FW4配列)を有する。
a)以下の表1で言及された配列番号:3〜20のFW4配列の内の1つ
Figure 2021130681

又は、
b)配列番号:3〜20のFW4配列の内の少なくとも1つに対して、3つ未満、好ましくは2つ未満のアミノ酸差を有する配列。ここで、(i)Kabatナンバリングの112位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、K又はQのいずれかであり、ここで、(ii)Kabatナンバリングの103位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、W又はRであり、(iii)Kabatナンバリングの104位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Gであり、(iv)Kabatナンバリングの106位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Gであり、(v)Kabatナンバリングの107位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Tであり、(vi)Kabatナンバリングの108位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Q又はLであり(及び、ヒト化ナノボディでは、好ましくは、Lであり)、(vii)Kabatナンバリングの109位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Vであり、(viii)Kabatナンバリングの110位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Tであり(又は、代替的に、KもしくはQであることができ)、(ix)Kabatナンバリングの111位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Vである。以下の表2に、このようなFW4配列の(Kabatに従ってナンバリングされた)種々の位置に存在することができるアミノ酸残基の一部の非限定的な例を提供する。
Figure 2021130681
好ましくは、本発明のVHドメインは、下記のいずれかであるフレームワーク4(FW4配列)を有する。
a)WGQGTQVTVKS(配列番号:3)又はWGQGTQVTVQS(配列番号:12)
又は、
b)配列番号:3及び/又は配列番号:12に対して、3つ未満、好ましくは2つ未満のアミノ酸差(例えば、1つのみのアミノ酸差)を有する配列。ここで、(i)Kabatナンバリングの112位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、K又はQのいずれかであり、ここで、(ii)Kabatナンバリングの103位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、W又はRであり、(iii)Kabatナンバリングの104位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Gであり、(iv)Kabatナンバリングの106位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Gであり、(v)Kabatナンバリングの107位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Tであり、(vi)Kabatナンバリングの108位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Q又はLであり(及び、ヒト化ナノボディでは、好ましくは、Lであり)、(vii)Kabatナンバリングの109位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Vであり、(viii)Kabatナンバリングの110位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Tであり(又は、代替的に、KもしくはQであることができ)、(ix)Kabatナンバリングの111位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、好ましくは、Vである。再度、表2に、このようなFW4配列の(Kabatに従ってナンバリングされた)種々の位置に存在することができるアミノ酸残基の一部の非限定的な例を提供する。
本明細書で更に記載されたように、本発明の好ましい態様によれは、上記されたFW4配列を含む本発明のVHドメインは、好ましくは、(本明細書で更に記載された)C末端伸長も含有する。ただし、本明細書でも更に記載されたように、FW4配列が、VHドメインのC末端を形成する可能性もあり(ただし、これは、通常ほとんど好ましくないであろう)、又は、本発明のVHドメインは、そのC末端において(場合により、適切なリンカーを介して)、別のアミノ酸配列、部分、ドメイン、又は結合ユニットに連結する可能性もある。例えば、本発明のVHドメインがISVDである場合、VHドメインは、そのC末端において、別のISVDに、場合により、リンカーを介して連結することができる(及び、例えば、前記他のISVDも、本発明のVHドメインであることができる)。
本明細書で示されたように、本発明の好ましく、非限定的な態様によれば、本発明のVHドメインは、C末端伸長、例えば、国際公開公報第12/175741号及び/又は同第13/024059号に記載され、及び特に、国際公開公報第12/175741号に記載されたC末端伸長を含有する。
このため、この態様によれば、本発明のVHドメインは、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)であって、(i)112位(Kabatナンバリング)におけるアミノ酸残基は、セリン残基ではなく、好ましくは、リシン(K)残基又はグルタミン(Q)残基のいずれかであり、(ii)そのC末端(すなわち、Kabatナンバリングに従った113位であるか、又は、同113位に対応する位置において、アミノ酸残基に連結した)において、それぞれ独立して、適切なアミノ酸残基から選択され、好ましくはそれぞれ独立して、天然アミノ酸から選択され、より好ましくはそれぞれ独立して、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から選択される、1〜5個(例えば、1、2、3、4、又は5個、及び好ましくは、1、2、又は3個、及び最も好ましくは、1又は2個のみ、例えば、1個のみ)のアミノ酸残基を含む、更なるアミノ酸配列(すなわち、「C末端伸長」)に連結している(ただし、国際公開公報第12/175741号に表されたデータからわかるように、他のアミノ酸残基、例えば、セリン、プロリン、スレオニン、及び/又はリシンも、C末端伸張の一部として使用することができる)。
特に、本発明のこの態様によれば、本発明のVHドメインは、好ましくは、VTVKS(X)(配列番号:21)又はVTVQS(X)(配列番号:22)である(又は、VTVKSモチーフ又はVTVQSモチーフの位置において、配列VTVKS及び/又はVTVQSのいずれかに対して1つのアミノ酸差有し、さらに、112位において、リシン(K)又はグルタミン(Q)のいずれかを有する)C末端配列を有する。ここで、(i)VTVKSもしくはVTVQSモチーフ(又は、VTVKSもしくはVTVQS様モチーフ)のアミノ酸残基は、Kabatナンバリングに従って、VHドメインの109〜113位に対応し、(ii)nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、(iii)各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される。
とりわけ、本発明のこの態様によれば、本発明のVHドメインは、そのFW4配列として、配列番号:3〜20のFW4配列(又は、配列番号:3〜20のFW4配列の内の少なくとも1つに対して、3つ未満、好ましくは2つ未満のアミノ酸差を有するアミノ配列、ここで、Kabatナンバリングの112位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、K又はQのいずれかである)の内の1つを有することができる。ここで、前記FW4配列は、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]に連結している。
したがって、本発明のこの態様では、本発明のVHドメインは、そのC末端において、下記のいずれかを有することができる。
a)表3中の配列番号:23〜40として提供されるアミノ酸配列の内の1つ
Figure 2021130681

[ここで、(i)配列番号:23〜40中の(X)C末端伸長に先立つFW4配列のアミノ酸残基は、VHドメインにおけるFW4のアミノ酸位置(すなわち、Kabatナンバリングに従った103〜113位)に対応し、(ii)nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、(iii)各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]
又は、
b)配列番号:23〜40のアミノ酸配列の内の少なくとも1つに対して、3つ未満、好ましくは2つ未満のアミノ酸差を有するアミノ酸配列[ここで、前記アミノ酸差は、VHドメインにおけるFW4のアミノ酸位置に対応する位置、すなわち、Kabatナンバリングに従った103〜113位においてであり、ただし、C末端伸長(X)中の任意のアミノ酸差は無視される)。ここで、(i)Kabatナンバリングの112位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり、(ii)nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、(iii)各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される。再度、先の文章で言及された特徴(i)〜(iii)に対して更に、このようなアミノ酸配列において、(iv)Kabatナンバリングの103位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、W又はRであり、(v)Kabatナンバリングの104位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Gであり、(vi)Kabatナンバリングの106位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Gであり、(vii)Kabatナンバリングの107位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Tであり、(viii)Kabatナンバリングの108位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Q又はLであり(及び、ヒト化ナノボディでは、好ましくは、Lであり)、(ix)Kabatナンバリングの109位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Vであり、(x)Kabatナンバリングの110位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Tであり(又は、代替的に、KもしくはQであることができ)、(xi)Kabatナンバリングの111位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Vである。再度、表2に、各位置に存在することができる、潜在的なアミノ酸残基について、参照がなされる。
好ましくは、本発明のこの態様によれば、本発明のVHドメインは、そのC末端において、下記のいずれかを有する。
a)WGQGTQVTVKS(X)(配列番号:23)又はWGQGTQVTVQS(X)(配列番号:32)[同配列中、(ii)nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、(iii)各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]であるアミノ酸配列
又は
b)WGQGTQVTVKS(X)(配列番号:23)又はWGQGTQVTVQS(X)(配列番号:32)のアミノ酸配列の内の少なくとも1つに対して、3つ未満、好ましくは2つ未満のアミノ酸差を有するアミノ酸配列(ここで、前記アミノ酸差は、VHドメインにおけるFW4のアミノ酸位置に対応する位置、すなわち、Kabatナンバリングに従った103〜113位においてであり、ただし、C末端伸長(X)中の任意のアミノ酸差は無視される)。ここで、(i)Kabatナンバリングの112位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり、(ii)nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、(iii)各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される。再度、このようなアミノ酸配列に対して、先の段落で記載された特徴(vi)〜(xi)も、好ましくは適用する。
また、本明細書で言及されたように、本発明のVHドメインは、それ自体が、VHドメイン、及び特に、ISVD(及びとりわけ、ナノボディ)について当技術分野において公知である他のアミノ酸残基又は置換を、関連する位置に含有することができる。一部の非限定的な例は、本明細書で言及された通りであり、例えば、VHH/ナノボディに特徴的な1つ以上の「ホールマーク残基」(例えば、11位におけるロイシン(L)を含む)、VHHに自然に生じる他のアミノ酸残基(例えば、14位におけるアラニン(A))、それ自体がVHH/ナノボディについて公知であるヒト化置換(例えば、Q108L及びA14P)、Harmsenに示唆された1つ以上の変異(例えば、V89M又はV89T)、及び/又は、Niebaに示唆された位置(例えば、11、87、又は89)、又は、それらの任意の適切な組み合わせ、及び/又は、例えば、T110K、T110Q、もしくはV89L変異を含む。
本発明のVHドメインがC末端伸長(X)を含有する場合、このような伸張の一部の好ましく、非限定的な例によれば、X及びnは、下記の通りであることができる。
(a)n=1及びX=Ala;
(b)n=2及び各X=Ala;
(c)n=3及び各X=Ala;
(d)n=2及び少なくとも一方のX=Ala(ここで、残りのアミノ酸残基Xは、任意の天然のアミノ酸から独立して選択されるが、好ましくは、Val、Leu、及び/又はIleから独立して選択される);
(e)n=3及び少なくとも1つのX=Ala(ここで、残りのアミノ酸残基Xは、任意の天然のアミノ酸から独立して選択されるが、好ましくは、Val、Leu、及び/又はIleから独立して選択される);
(f)n=3及び少なくとも2つのX=Ala(ここで、残りのアミノ酸残基Xは、任意の天然のアミノ酸から独立して選択されるが、好ましくは、Val、Leu、及び/又はIleから独立して選択される);
(g)n=1及びX=Gly;
(h)n=2及び各X=Gly;
(i)n=3及び各X=Gly;
(j)n=2及び少なくとも一方のX=Gly(ここで、残りのアミノ酸残基Xは、任意の天然のアミノ酸から独立して選択されるが、好ましくは、Val、Leu、及び/又はIleから独立して選択される);
(k)n=3及び少なくとも1つのX=Gly(ここで、残りのアミノ酸残基Xは、任意の天然のアミノ酸から独立して選択されるが、好ましくは、Val、Leu、及び/又はIleから独立して選択される);
(l)n=3及び少なくとも2つのX=Gly(ここで、残りのアミノ酸残基Xは、任意の天然のアミノ酸から独立して選択されるが、好ましくは、Val、Leu、及び/又はIleから独立して選択される);
(m)n=2及び各X=Ala又はGly;
(n)n=3及び各X=Ala又はGly;
(o)n=3及び少なくとも1つのX=Ala又はGly(ここで、残りのアミノ酸残基Xは、任意の天然のアミノ酸から独立して選択されるが、好ましくは、Val、Leu、及び/又はIleから独立して選択される);又は、
(p)n=3及び少なくとも2つのX=Ala又はGly(ここで、残りのアミノ酸残基Xは、任意の天然のアミノ酸から独立して選択されるが、好ましくは、Val、Leu、及び/又はIleから独立して選択される)。
ここで、態様(a)、(b)、(c)、(g)、(h)、(i)、(m)、及び(n)が特に好ましく、n=1又は2である態様が好ましく、n=1である態様が特に好ましい。
また、好ましくは、本発明のVHドメインに存在する任意のC末端伸張は、(遊離した)システイン残基を含有しないこと(前記システイン残基が更なる官能化、例えば、ペグ化に使用される又は同官能化を意図されない限り)も留意されたい。
また、国際公開公報第12/175741号に基づいて使用されるC末端伸張(これは、本発明のVHドメインに使用される好ましいC末端伸張でもある)について、国際公開公報第12/175741号の第35〜41頁に示された選択は、本発明のVHドメインに使用される好ましいC末端伸張にも適用する。また、国際公開公報第12/175741号に基づくこれらの選択は、参照により本明細書に含まれる。
好ましくは、本発明のVHドメインがC末端伸長(X)を含有する場合、n=1、2、又は3であり、各Xは、Ala又はGlyのいずれかである。より好ましくは、各Xは、Alaであり、n=1又は2であり、好ましくは、1である。
本発明のVHドメインがC末端伸長を含有する場合、本発明のVHドメインは、それが存在するタンパク質、ポリペプチド、化合物、構築物、又は他の化学成分のC末端に、通常存在する(多くの場合、同C末端を形成する)であろう。再度、このようなタンパク質、ポリペプチド、化合物、構築物、又は他の化学成分は、1つ以上の他の本発明のVHドメイン(すなわち、C末端においてではない)を含有することができる。このような場合において、前記他の本発明のVHドメインは、112位にリシン(K)又はグルタミン(Q)を含有する(及び、本明細書で更に記載された通り)であろうが、C末端伸張を含有しないであろう(その代わりに、そのC末端において、タンパク質、ポリペプチド、化合物、構築物、又は他の化学成分に存在する1つ以上の他のアミノ酸配列、部分、結合ドメイン、又は結合ユニット、例えば、C末端に存在するC末端伸張を有する本発明のVHドメインに(場合により、1つ以上の適切なリンカーを介して)連結することができる)。
本発明のVHドメイン(ならびに、本明細書で更に記載されたのと同じものを含むタンパク質、ポリペプチド、化合物、構築物、及び他の化学成分)が、医薬用途(例えば、それを必要とするヒト対象における疾患及び障害の予防、治療、及び/又は診断)に使用するのに特に有用である(及び、同使用が意図される)場合、本発明のVHドメインは、好ましくは、ヒトVHドメインのフレームワーク領域に対して、そのフレームワーク領域における高い度合いの配列相同性を有する。特に、本発明のVHドメインは、好ましくは、少なくとも1つのヒト生殖系配列(例えば、DP−47、DP−51、又はDP−29)に対して、少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、例えば、90%以上の、全体的な度合いの配列同一性を有する(本明細書で更に記載された通りに決定、フレームワーク領域のみを考慮し、CDRを考慮せず、112位における置換及び存在する場合、任意のC末端伸張も考慮しない)。とりわけ、本発明のVHドメインは、好ましくは、少なくとも1つの下記ヒト生殖系配列:DP−47、DP−51、及び/又はDP−29に対して、少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、例えば、90%以上の、全体的な度合いの配列同一性を有する(本明細書で更に記載された通りに決定、フレームワーク領域のみを考慮し、CDRを考慮せず、112位における置換及び存在する場合、任意のC末端伸張も考慮しない)。
本明細書で更に記載されたように、本発明の一態様によれば、本発明のVHドメインは、それが存在するタンパク質、ポリペプチド、タンパク質、又は構築物において、抗原結合部位を形成するために、VLドメインと相互作用/会合する(又は、相互作用/会合することが意図される)、重鎖可変ドメインであることができる。ここで、少なくともVHドメインは、露出したC末端又は領域を有する。例えば、本発明のこの態様におけるVHドメインは、ScFv及び/又はディアボディに存在し、及び/又は、これらに使用されるVHドメインであることができる。この場合、本発明のVHドメインは、抗原結合部位を形成するために、VLドメインと会合するであろう。
ただし、本発明の好ましい態様によれば、本発明のVHドメインは、VLドメインとの相互作用無しに、機能的な抗原結合部位を形成することができる重鎖可変ドメインを意味する、(重鎖)免疫グロブリンシングル可変ドメイン又は「ISVD」である。例えば、本発明のVHドメインは、ナノボディ(VHH、ヒト化VHH、及び/又はラクダ化VH、例えば、ラクダ化ヒトVHを含む)、VHドメインであるか、もしくは、VHドメインから得られる(シングルドメイン)抗体、又は、VHドメインであるか、もしくは、VHドメインから得られるdAbであることができる。本発明のVHドメインは、好ましくは、ナノボディ(及びより好ましくは、VHHドメイン、ヒト化VHHドメイン、又はラクダ化VHドメイン、例えば、ラクダ化ヒトVHドメイン)である。
本明細書において、
「ナノボディ」という用語は、一般的には、国際公開公報第08/020079号又は同第09/138519号に定義された通りであり、このため、具体的な態様では、一般的には、VHH、ヒト化VHH、もしくはラクダ化VH(例えば、ラクダ化ヒトVHドメイン)又は、一般的には、配列最適化VHH(例えば、化学的安定性及び/又は可溶性の最適化、公知のヒトフレームワーク領域との最大オーバーラップ、ならびに最大発現等)を意味する。ナノボディ(Nanobody)又はナノボディ(Nanobodies)という用語は、Ablynx N. V.の登録商標であるため、ナノボディ(Nanobody)(登録商標)又はナノボディ(Nanobodies)(登録商標)とも呼ぶことができることが留意される。
その最も広い意味において、本明細書で使用する時、「ISVD」(又は、「ISV」)という用語は、「ISVD系生物学的製剤」も含み、ISVDがナノボディである場合、「ナノボディ系生物学的製剤」も含む。「ISVD系生物学的製剤」は、本明細書において、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)のISVDを含むか、又は、本質的に同ISVDからなる、タンパク質、ポリペプチド、又は他の生物学的薬剤と定義される。同様に、「ナノボディ系生物学的製剤」は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)のナノボディを含むか、又は、本質的に同ナノボディからなる、タンパク質、ポリペプチド、又は他の生物学的薬剤と定義される。「ISVD」という用語についてと同様に、「ISVD系生物学的製剤」という用語が使用される場合、このようなISVD系生物学的製剤は、好ましくは、ナノボディ系生物学的製剤であることを理解されたい。本発明の文脈内において、「ISVD系生物学的製剤」及び「ナノボディ系生物学的製剤」は両方とも、例えば、一価、二価(又は多価)、二重特異性(又は多重特異性)、及び二重抗原結合性(又は多重抗原結合性)のISVD構築物又はナノボディ構築物それぞれであることができる。また、任意のISVD系又はナノボディ系生物学的製剤は、例えば、1つ以上(例えば、1、2、又は3つ)のISVD又はナノボディに加えて、場合により更に、1つ以上(例えば、1つ又は2つ)の他の更なる治療部分及び/又は1つ以上(例えば、1つ又は2つ)の、ISVD系又はナノボディ系生物学的製剤の薬理学的又は薬力学的特性(例えば、半減期)に影響を及ぼす他の部分を含む。このような更なる治療的又は他の部分の適切な例は、当業者に明らかであろうし、例えば、一般的には、任意の治療活性タンパク質、ポリペプチド、又は他の結合ドメインもしくは結合ユニット、及び、例えば、改変、例えば、国際公開公報第09/138159号の第149〜152頁に記載されたものを含むことができる。ISVD系生物学的製剤又はナノボディ系生物学的製剤は、好ましくは、治療剤であるか、又は、治療剤(予防及び診断を含む)としての使用が意図されており、この目的のために、好ましくは、治療関連ターゲット(例えば、RANK−L、vWF、IgE、RSV、CXCR−4、IL−23、又は他のインターロイキン等)に対する少なくとも1つのISVDを含有する。このようなISVD系生物学的製剤又はナノボディ系生物学的製剤の一部の具体的で、非限定的な例については、実施例8〜18が参照され、また例えば、Ablynx N.V.による種々の出願(例えば、限定されず、国際公開公報第2004/062551号、同第2006/122825号、同第2008/020079号、及び同第2009/068627号等)及び、例えば(及び、限定されず)、国際公開公報第06/038027号、同第06/059108号、同第07/063308号、同第07/063311号、同第07/066016号、及び同第07/085814号等の出願も参照される。また、本明細書で更に記載されたように、本明細書で記載されたISVD又はナノボディは、(ヒト)血清タンパク質、例えば、(ヒト)血清アルブミンに対することができる。また、このようなISVD又はナノボディは、特に、治療部分及び化合物の半減期における、及び/又は、同半減期を伸ばすための(例えば、本明細書で記載されたISV系生物学的製剤における、及び/又は、同ISV系生物学的製剤のための)、治療的使用を見出すことができる。例えば、国際公開公報第2004/041865号、同第2006/122787号、及び同第2012/175400号が参照される。これらの国際公開公報には、一般的に、半減期を伸ばすための、血清アルブミン結合ナノボディの使用が記載されている。また、本明細書において、特に断りない限り、本明細書で言及された全ての用語は、国際公開公報第09/138519号(又は、同第09/138519号で引用された従来技術)又は国際公開公報第08/020079号(又は、同第08/020079号で引用された従来技術)に提供された意味を有する。また、方法又は技術が、本明細書に具体的に記載されていない場合には、国際公開公報第09/138519号(又は、同第09/138519号で引用された従来技術)又は国際公開公報第08/020079号(又は、同第08/020079号で引用された従来技術)に記載された通りに行うことができる。
また、本明細書又は特許請求の範囲で使用する時、下記用語:「アゴニスト」、「アンタゴニスト」、「逆アゴニスト」、「非極性、無電荷アミノ酸残基」、「極性の無電荷アミノ酸残基」、「極性の電荷アミノ酸残基」、「配列同一性」、「正確に同じ」、及び「アミノ酸差」(2つのアミノ酸配列の配列比較に言及する場合)、「本質的に単離された(形態)(において)」、「ドメイン」、「結合ドメイン」、「抗原決定基」、「エピトープ」、「に対して」、(抗原)「に対する」、「特異性」、及び「半減期」は、国際公開公報第09/138519号の第62〜75頁に提供されたのと同じ意味を有し、及び/又は、その適用可能性は、同頁に記載された方法において決定することができる。加えて、「モデュレーションすること」及び「モデュレーションするために」、「相互作用部位」、「に特異的な」、「クロスブロック」、「クロスブロックした」、及び「クロスブロッキング」、ならびに「本質的にpHとは独立して」という用語は、出願人の国際公開公報第10/130832号における第74〜79頁に定義された通りである(及び/又は、同頁に記載された通りに決定することができる)。また、本発明の構築物、化合物、タンパク質、又はポリペプチドに言及する場合、「一価」、「二価」(又は「多価」)、「二重特異性」(又は「多重特異性」)、及び「二重抗原結合性」(又は「多重抗原結合性」)等の用語は、国際公開公報第09/138519号、同第10/130832号、又は同第08/020079号に提供された意味を有することができる。
本明細書で言及されたISVD、ナノボディ、ISVD系生物学的製剤、ナノボディ系生物学的製剤、又は任意の他のアミノ酸配列、化合物、もしくはポリペプチドに関して、本明細書で使用する時、「半減期」という用語は、一般的には、国際公開公報第08/020079号の第57頁における段落o)に記載された通りに、及び、本明細書言及された通りに定義することができ、例えば、配列もしくは化合物の分解及び/又は該配列もしくは化合物の本来のメカニズムによるクリアランスもしくはゼクエストレーションにより、アミノ酸配列、化合物、又はポリペプチドの血清濃度が、in vivoにおいて50%に減少するのに掛かる時間を意味する。本発明のアミノ酸配列、化合物、又はポリペプチドのin vivo半減期は、それ自体公知の任意の方法において、例えば、薬物動態分析により決定することができる。適切な技術は、当業者に明らかであろうし、例えば、一般的には、国際公開公報第08/020079号の第57頁における段落o)に記載された通りであることができる。また、国際公開公報第08/020079号の第57頁における段落o)で言及されたように、半減期は、t1/2−アルファ、t1/2−ベータ、及び曲線下面積(AUC)等のパラメータを使用して表現することができる。この観点において、本明細書で使用する時、「半減期」という用語は、特に、t1/2−ベータ又は終末半減期を意味する(ここで、t1/2−アルファ及び/もしくはAUC又は両方は考慮されなくてもよい)。例えば、以下の実験部及び、標準的な参考書、例えば、Kenneth, A et al: Chemical Stability of Pharmaceuticals: A Handbook for Pharmacists及びPeters et al, Pharmacokinete analysis: A Practical Approach (1996)が参照される。また、「Pharmacokinetics」, M Gibaldi & D Perron, published by Marcel Dekker, 2nd Rev. edition (1982)も参照される。同様に、「半減期を伸ばす」又は「延長した半減期」という用語も、国際公開公報第08/020079号の第57頁における段落o)に定義された通りであり、特に、t1/2−アルファ及び/もしくはAUC又は両方の伸びに関わらず、t1/2−ベータの伸びを意味する。
用語が、本明細書で具体的に定義されていない場合には、当量者に明らかであろう、当技術分野におけるその通常の意味を有する。例えば、標準的な参考書、例えば、Sambrook et al, 「Molecular Cloning: A Laboratory Manual」 (2nd.Ed.), Vols. 1-3, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989);F. Ausubel et al, eds., 「Current protocols in molecular biology」, Green Publishing and Wiley Interscience, New York (1987);Lewin, 「Genes II」, John Wiley & Sons, New York, N.Y., (1985);Old et al., 「Principles of Gene Manipulation: An Introduction to Genetic Engineering」, 2nd edition, University of California Press, Berkeley, CA (1981);Roitt et al., 「Immunology」 (6th. Ed.), Mosby/Elsevier, Edinburgh (2001);Roitt et al., Roitt’s Essential Immunology, 10th Ed. Blackwell Publishing, UK (2001);及びJaneway et al., 「Immunobiology」 (6th Ed.), Garland Science Publishing/Churchill Livingstone, New York (2005)、ならびに、本明細書で引用された一般的な背景技術が参照される。
また、本明細書で既に示されているように、ナノボディのアミノ酸残基は、Kabat et al(「Sequence of proteins of immunological interest」, US Public Health Services, NIH Bethesda, MD, Publication No. 91)により提供された、VHドメインについての一般的なナンバリングに従ってナンバリングされる。同様に、Riechmann and Muyldermans, J. Immunol. Methods 2000 Jun 23; 240 (1-2): 185-195の文献において、ラクダ科からのVHHに適用され、本明細書で言及される。このナンバリングによれば、ナノボディのFR1は、1〜30位におけるアミノ酸残基を含む。ナノボディのCDR1は、31〜35位におけるアミノ酸残基を含む。ナノボディのFR2は、36〜49位におけるアミノ酸残基を含む。ナノボディのCDR2は、50〜65位におけるアミノ酸残基を含む。ナノボディのFR3は、66〜94位におけるアミノ酸残基を含む。ナノボディのCDR3は、95〜102位におけるアミノ酸残基を含む。そして、ナノボディのFR4は、103〜113位におけるアミノ酸残基を含む。[この観点において、VHドメイン及びVHHドメインについて当技術分野において周知であるように、各CDRにおけるアミノ酸残基の総数は変動する場合があり、Kabatナンバリングにより示されたアミノ酸残基の総数に対応しない場合がある(すなわち、Kabatナンバリングに従った1つ以上の位置が、実際の配列に占有されない場合があり、又は、実際の配列が、Kabatナンバリングにより認められた数より多くのアミノ酸残基を含有する場合がある)ことに留意されたい。このことは、一般的には、Kabatに従ったナンバリングは、この実際の配列中のアミノ酸残基の実際のナンバリングに対応してもよいし、又は、同ナンバリングに対応しなくてもよいことを意味する。ただし、一般的には、Kabatのナンバリングに従って、CDR中のアミノ酸残基数に関係なく、Kabatナンバリングに従った1位は、FR1の開始及びその逆に対応し、Kabatナンバリングに従った36位は、FR2の開始及びその逆に対応し、Kabatナンバリングに従った66位は、FR3の開始及びその逆に対応し、Kabatナンバリングに従った103位は、FR4の開始又はその逆に対応する]。
また、VHドメインのアミノ酸残基をナンバリングするための代替的な方法を、ラクダ科からのVHHドメイン及びナノボディに類似する方法において適用することもでき、Chothia et al.(Nature 342, 877-883 (1989))に記載された方法、いわゆる、「AbM定義」及びいわゆる、「接触定義」である。ただし、本説明、態様、及び図面において、Riechmann及びMuyldermansによりVHHに適用されるのと同様に、特に断りない限り、Kabatに従ったナンバリングに従うであろう。
また、図面、任意の配列表、及び実験部/実施例は、本発明を更に例示するためにのみ提供され、本発明及び/又は添付の特許請求の範囲における範囲を、特に断りない限り、何らか限定すると理解され、又は、解釈されるべきでないと留意されたい。
本発明のVHドメインは、本明細書で記載された任意の薬学的及び/又は治療的関連ターゲットを含む、任意の適切又は所望の抗原又はターゲットに対することができる。
本発明の具体的な態様によれば、本発明のVHドメインは、血清タンパク質、及び特に、ヒト血清タンパク質に対する。好ましい態様によれば、本発明のVHドメインが血清タンパク質に対する場合、本発明のVHドメインは、血清アルブミン、及び特に、ヒト血清アルブミンに対する。またこのため、本発明は、血清タンパク質、特にヒト血清タンパク質に特異的に結合することができ、及び好ましくは、血清アルブミン、及びより好ましくは、ヒト血清アルブミンに特異的に結合することができる本発明のVHドメイン(本明細書で定義された通り、本発明のVHドメインについて定義された選択を含む)に関する。再度、このようなVHドメインは、好ましくは、(本発明で記載された)ISVD、及びより好ましくは、ナノボディである。
例えば、血清アルブミンに対する本発明のVHドメインは、国際公開公報第2004/041865号、及び特に、同第2006/122787号及び同第2012/175400号(全て出願人/譲受人の出願)に記載された(ヒト)血清アルブミンに対するナノボディの内の1つであることができ、ここで、112位におけるアミノ酸は、K又はQのいずれかで置換されており、同VHドメインは、場合により、本明細書で記載されたC末端伸長を備えている(及び、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、89T、V89T、89L、V89L、108L、Q108L、110Q、T110Q、110K、及び/又はT110Kを適切に含有することもでき、ただし通常は、112位がK又はQである場合、110位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tである)。さらに、本発明は、他の血清アルブミン結合重鎖ISVD、例えば、国際公開公報第03/035694号、同第04/003019号、同第05/118642号、同第06/059106号、同第08/096158号、同第09/121804号、同第10/108937号、又は米国特許出願公開公報第2013/0129727号に記載されたものに、すなわち、本明細書で記載された置換(すなわち、S112K、S112Q、及び/又はV89Tの内の少なくとも1つ、ならびに場合により、本明細書で記載された1つ以上の他のアミノ酸残基/置換、例えば、L11V)を適切に導入すること、及び場合により(及び通常好ましくは、本明細書で概説されたように)(本明細書で更に記載された)C末端伸長を付加することにより、適用することもできると想定される。
本発明のこのような血清アルブミン結合ナノボディにおける一部の好ましく、非限定的な例は、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:52のアミノ酸配列のヒト化変異体(国際公開公報第2006/122787号において「Alb−1」と呼ばれる)(同変異体中、112位におけるアミノ酸は、K又はQのいずれかで置換されている(及び、同変異体は、場合により、本明細書で記載されたC末端伸長を備えている))、例えば、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:57〜64に提供されたAlb−1のヒト化変異体(各場合において、S112K又はS112Q置換を有し、場合により、C末端伸長を有する)、又は、国際公開公報第2012/175400号の配列番号:3〜11に提供されたAlb−1のヒト化変異体(再度、各場合において、S112K又はS112Q置換を有する)である。同変異体の内、配列番号:3、4、及び5は、場合により、C末端伸長を含有することができ、配列番号:6〜11は、C末端伸長を予め含有している(及び再度、このような変異体は、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、89T、V89T、89L、V89L、108L、Q108L、110Q、T110Q、110K、及び/又はT110Kを含有することができ、ただし通常は、112位がK又はQである場合、110位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tである)。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
このため、更なる態様では、本発明は、血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、
−CDR1は、アミノ酸配列SFGMS(配列番号:41)であり;
−CDR2は、アミノ酸配列SISGSGSDTLYADSVKG(配列番号:42)であり;
−CDR3は、アミノ酸配列GGSLSR(配列番号:43)であり;
−112位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり、
場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、89T、V89T、89L、V89L、108L、Q108L、110Q、T110Q、110K、及び/又はT110Kを含有することができ、ただし通常は、112位がK又はQである場合、110位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tである)。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
特定の態様では、本発明は、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:52のヒト化変異体である血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、
−CDR1は、アミノ酸配列SFGMS(配列番号:41)であり;
−CDR2は、アミノ酸配列SISGSGSDTLYADSVKG(配列番号:42)であり;
−CDR3は、アミノ酸配列GGSLSR(配列番号:43)であり;
−112位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり、
場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、89T、V89T、89L、V89L、108L、Q108L、110Q、T110Q、110K、及び/又はT110Kを含有することができ、ただし通常は、112位がK又はQである場合、110位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tである)。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
特定の態様では、本発明は、Alb−1(国際公開公報第2006/122787号の配列番号:52)、Alb−8(本明細書における配列番号:46)、及び/又はAlb−23(本明細書における配列番号:61)の内の少なくとも1つ(フレームワーク配列及びCDRの両方を考慮するが、任意のC末端伸長は考慮しない)に対して、少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する、血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、112位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり、場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、89T、V89T、89L、V89L、108L、Q108L、110Q、T110Q、110K、及び/又はT110Kを含有することができ、ただし通常は、112位がK又はQである場合、110位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tである)。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
本発明のこのようなナノボディは、再度好ましくは、Alb−1(ただし、S112K又はS112Q置換を有する)のヒト化変異体であり、より好ましくは、少なくとも1つ、特に任意の2つ、及びとりわけ、配列番号:41〜43のそれぞれで提供されたCDR1、CDR2、及び/又はCDR3の3つ全てを有する。
具体的な一態様によれば、本発明の任意の血清アルブミン結合ナノボディは、Alb−23の特徴を有するアミノ酸残基、及び、国際公開公報第12/175400号に記載されたその変異体(すなわち、44及び45位におけるアミノ酸モチーフGP、74〜76位におけるアミノ酸モチーフSKN、ならびに好ましくは、16位におけるG、また及び場合により、83位におけるR)も有することができる。
ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例は、表4及び実施例20に提供される。
Figure 2021130681

Figure 2021130681

Figure 2021130681

Figure 2021130681
別の態様では、本発明は、VHドメイン、及び特に、ISVD、及びとりわけ、ナノボディに関し、同VHドメインは、下記を有する。
a)下記FW4配列の内の1つであるFW4配列
Figure 2021130681
ここで、(i)配列番号:23〜40中の(X)C末端伸長に先立つFW4配列のアミノ酸残基は、VHドメインにおけるFW4のアミノ酸位置(すなわち、Kabatナンバリングに従った103〜113位)に対応し、(ii)nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、(iii)各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択され、又は、
c)配列番号:99〜106のアミノ酸配列の内の少なくとも1つに対して、3つ未満、好ましくは2つ未満のアミノ酸差を有するアミノ酸配列(ここで、前記アミノ酸差は、VHドメインにおけるFW4のアミノ酸位置に対応する位置、すなわち、Kabatナンバリングに従った103〜113位においてであり、ただし、C末端伸長(X)中の任意のアミノ酸差は無視される)。ここで、(i)Kabatナンバリングの112位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、K又はQのいずれかである場合、前記アミノ酸差は、112以外のアミノ酸位置においてであり、VHドメインの89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、V、T、又はLから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、(i)、Kabatナンバリングの110位に対応する位置におけるアミノ酸残基が、K又はQのいずれかである場合、前記アミノ酸差は、110以外のアミノ酸位置においてであり、VHドメインの89位は、Lであり、(iii)nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、(iv)各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される。再度、先の文章で言及された特徴(i)〜(iv)に対して更に、このようなアミノ酸配列において、(v)Kabatナンバリングの103位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Sであり、(vi)Kabatナンバリングの104位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Sであり、(vii)Kabatナンバリングの106位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Gであり、(viii)Kabatナンバリングの107位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Tであり、(ix)Kabatナンバリングの108位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Q又はLであり(及び、ヒト化ナノボディでは、好ましくは、Lであり)、(x)Kabatナンバリングの109位に対応する位置におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Vである。再度、表2に、各位置に存在することができる、潜在的なアミノ酸残基について、参照される。
再度、本発明のこのようなVHドメインにおいて、(a)11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つ(及びより好ましくは、V)であり、14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、A又はPの一方であり、41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、A又はPの一方である。また、本発明のこのようなVHドメインは、好ましくは、ISVDであり、より好ましくは、ナノボディであり、再度、ヒト血清アルブミンに対することができる(この場合、本発明のこのようなVHドメインは、好ましくは、配列番号:41、42、及び43それぞれに対応する、CDR1、CDR2、CDR3それぞれを有する)。また、前記VHドメインがヒト血清アルブミンに対するISVD又はナノボディである場合、前記VHドメインは、更に、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディについて本明細書に記載された通りであることができる。
血清アルブミンに対する本発明のVHドメイン(及び特に、本発明の血清アルブミン結合ISVD)は、下記の参考文献に開示された血清アルブミン結合ナノボディの使用について、国際公開公報第2004/041865号、同第2006/122787号、及び/又は同第2012/175400号に本質的に記載された方法において(すなわち、血清アルブミン結合ISVDを、タンパク質、ポリペプチド、化合物、又は他の成分に、場合により、適切なリンカーを介して、適切に連結させることにより、例えば、国際公開公報第2012/175400号の第12及び13頁には、適切な融合タンパク質を構築することができる方法の一部の例が提供されている)、治療活性化合物、(ポリ)ペプチド、タンパク質、結合ドメイン、結合ユニット、又は他の治療活性成分もしくは部分の半減期を伸ばすのに使用することができる。
別の態様では、本発明は、89位(Kabatナンバリング)におけるアミノ酸残基がスレオニン(T)であり、112位におけるアミノ酸残基がセリン(S)、リシン(K)残基、又はグルタミン(Q)残基のいずれかである、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)に関する。また、89位にTを有するこのような免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)は、その最も広い意味において本明細書で使用する時、「本発明のVHドメイン」という用語に含まれ、更に、112位にK又はQを含む本発明のVHドメインについて、本明細書で記載された通りであることができる。したがって、このような免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)は、本明細書で更に記載されたC末端伸長(このようなC末端伸長について示された選択を含む)を有することができ、本明細書で更に記載されたISVD、及び特に、ナノボディであることができる。
再度、本発明のこのようなVHドメインが、露出したC末端領域を有する(例えば、本発明のVHドメインは、それが存在するタンパク質、ポリペプチド、又は他の構築物のC末端を形成するためである)場合、本発明のVHドメインは、好ましくは、C末端伸長を含有する(以下の表Cに示されたデータが参照される)。
また、89位がTである(すなわち、C末端伸長の有無に関わらず)本発明のナノボディは、好ましくは、L(VHH中で最も頻繁に生じるアミノ酸残基)、E、K、M、S、V、W、又はYから選択され、より好ましくは、L、E、K、V、又はYから選択され、及び更により好ましくは、L、K、又はV(Vが最も好ましい)から選択される、11位におけるアミノ酸を含有する。例えば、本発明のナノボディは、L11KもしくはL11V置換、及び、例えば、P14AもしくはA14P置換、Q108L置換、ならびに/又はT110K、T110Q、S112K、及び/もしくはS112Q置換を含有することができる(ただし通常は、89位がTである場合、110及び/又は112位における1つ又は2つの更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tであり、112位は、好ましくは、Sである)。
特に、この特定の態様における本発明の免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)は、89位(Kabat)にTと、VTVSS(配列番号:77)、VTVSS(X)n(配列番号:78)、VTVKS(配列番号:1)、VTVKS(X)n(配列番号:21)、VTVQS(配列番号:2)、VTVQS(X)n(配列番号:22)、VKVSS(配列番号:95)、VKVSS(X)n(配列番号:97)、VQVSS(配列番号:96)、VQVSS(X)n(配列番号:98)、VZVZS(配列番号:107(同配列中、各アミノ酸残基Zは、独立して、K又はQである)、又はVZVZSX(n)(配列番号:108、同配列中、各アミノ酸残基Zは、独立して、K又はQである)の内の1つ(及び特に、VTVKS(配列番号:1)、VTVQS(配列番号:2)、VTVSS(配列番号:77)、VTVKS(X)(配列番号:21)、VTVQS(X)(配列番号:22)、又はVTVSS(X)(配列番号:78)の内の1つ、及びとりわけ、VTVSS(配列番号:77)又はVTVSS(X)n(配列番号:78)のいずれか)であるC末端とを有する。ここで、n及びXは、112位がQ又はKである本発明のVHドメインについて本明細書で更に記載された通りである(及びここで、任意のC末端伸長は、好ましくは、112位がQ又はKである本発明VHドメインについて本明細書で更に記載された通りである)。また、112位がQ又はKである本発明VHドメインについての場合と同様に、89位にTを有するこのようなVHドメインがナノボディである場合、11位は、好ましくは、ロイシン(L)であり、14位は、特に、アラニン(A)又はプロリン(P)であることができ、108位は、特に、Q又はLであることができる(及び、ヒト化ナノボディでは、好ましくは、Lである)。89位にTを有するこのようなナノボディは、1つ以上のナノボディホールマーク残基を含有することができ、及び/又は、適切にヒト化されていることができる。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
89位にTを有する本発明のこのようなVHドメインは、再度、本明細書で更に記載された血清アルブミンナノボディであることもできる。例えば、このような血清アルブミン結合ナノボディは、配列番号:46〜75の配列の内の1つ(ただし、89位にTを有する)、又は、Alb−1(国際公開公報第2006/122787号の配列番号:52)、Alb−8(本明細書における配列番号:46)、及び/又はAlb−23(本明細書における配列番号:61)の内の少なくとも1つ(フレームワーク配列及びCDRの両方を考慮するが、任意のC末端伸長は考慮しない)に対して、少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する、89位にTを有する別の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。89位にTを有するこのようなナノボディの一部の他の例は、配列番号:78〜91に提供される(これらは、89位にT及び112位にSを有するAlb−1/Alb−8又はAlb−23の更なる変異体である)。
より一般的には、本発明におけるこの態様の血清アルブミンに対するVHドメインは、国際公開公報第2004/041865号、及び特に、同第2006/122787号及び同第2012/175400号(全て出願人/譲受人の出願)に記載された(ヒト)血清アルブミンに対するナノボディの内の1つであることができ、ここで、89位におけるアミノ酸は、スレオニン(T)であり、ここで、場合により、本明細書で記載されたC末端伸長を備えている(及び、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、Q108L、110K、T110K、110Q、T110Q、S112K、及び/又はS112Qを適切に含有することもでき、ただし通常は、89位にTが存在する場合、110及び/又は112位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tであり、112位は、好ましくは、Sである)。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。またさらに、本発明は、他の血清アルブミン結合重鎖ISVD、例えば、国際公開公報第03/035694号、同第04/003019号、同第05/118642号、同第06/059106号、同第08/096158号、同第09/121804号、同第10/108937号、又は米国特許出願公開公報第2013/0129727号に記載されたものに、すなわち、89位にスレオニン(T)、及び場合により、本明細書で記載された1つ以上の他のアミノ酸残基/置換を適切に導入すること、ならびに場合により(及び通常、本明細書で概説されたように好ましくは)(本明細書で更に記載された)C末端伸長を付加することにより、適用することもできると想定される。
本発明のこのような血清アルブミン結合ナノボディにおける一部の好ましく、非限定的な例は、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:52のアミノ酸配列のヒト化変異体(国際公開公報第2006/122787号において「Alb−1」と呼ばれる)(同変異体中、89位のアミノ酸は、Tである(及び、同変異体は、場合により、本明細書で記載されたC末端伸長を備えている))、例えば、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:57〜64に提供されたAlb−1のヒト化変異体(各場合において、V89T置換を有し、場合により、C末端伸長を有する)、又は、国際公開公報第2012/175400号の配列番号:3〜11に提供されたAlb−1のヒト化変異体(再度、各場合において、V89T置換を有する)である。同変異体の内、配列番号:3、4、及び5は、場合により、C末端伸長を含有することができ、配列番号:6〜11は、C末端伸長を予め含有している(及び再度、このような変異体は、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、Q108L、110K、T110K、110Q、T110Q、112Q、112K、S112Q、及び/又はS112Kを含有することができ、ただし通常は、89位がTである場合、110及び/又は112位における1つ又は2つの更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tであり、112位は、好ましくは、Sである)。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
このため、更なる態様では、本発明は、血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、
−CDR1は、アミノ酸配列SFGMS(配列番号:41)であり;
−CDR2は、アミノ酸配列SISGSGSDTLYADSVKG(配列番号:42)であり;
−CDR3は、アミノ酸配列GGSLSR(配列番号:43)であり;
−89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、
場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、Q108L、110K、T110K、110Q、T110Q、112Q、112K、S112Q、及び/又はS112Kを含有することができ、ただし通常は、89位がTである場合、110及び/又は112位における1つ又は2つの更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tであり、112位は、好ましくは、Sである)。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
特定の態様では、本発明は、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:52のヒト化変異体である、血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、
−CDR1は、アミノ酸配列SFGMS(配列番号:41)であり;
−CDR2は、アミノ酸配列SISGSGSDTLYADSVKG(配列番号:42)であり;
−CDR3は、アミノ酸配列GGSLSR(配列番号:43)であり;
−89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、
場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、Q108L、110K、T110K、110Q、T110Q、112Q、112K、S112Q、及び/又はS112Kを含有することができ、ただし通常は、89位がTである場合、110及び/又は112位における1つ又は2つの更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tであり、112位は、好ましくは、Sである)。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
特定の態様では、本発明は、Alb−1(国際公開公報第2006/122787号の配列番号:52)、Alb−8(本明細書における配列番号:46)、及び/又はAlb−23(本明細書における配列番号:61)の内の少なくとも1つ(フレームワーク配列及びCDRの両方を考慮するが、任意のC末端伸長は考慮しない)に対して、少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する、血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、Q108L、110K、T110K、110Q、T110Q、112Q、112K、S112Q、及び/又はS112Kを含有することができ、ただし通常は、89位がTである場合、110及び/又は112位における1つ又は2つの更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、110位は、好ましくは、Tであり、112位は、好ましくは、Sである)。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
具体的な一態様によれば、89位にTを有する本発明の任意の血清アルブミン結合ナノボディは、国際公開公報第12/175400号に記載されたAlb−23、及び、その変異体の特徴を有するアミノ酸残基(すなわち、44及び45位におけるアミノ酸モチーフGP、74〜76位におけるアミノ酸モチーフSKN、ならびに好ましくは、16位におけるG、また及び場合により、83位におけるR)も有することができる。
112位にQ又はKを含有する本発明のVHドメインについてと同様に、89位にTを含有する(場合により、112位におけるQもしくはK、及び/又は、C末端伸長を伴う)本発明のVHドメインは、既存の抗体による、及び特に、C末端伸長の存在下においてVHドメイン及びナノボディに結合可能な(例えば、SLE患者から得られたサンプル中に見出された)このような既存の抗体による低下した結合を示す。
更に別の態様では、本発明は、89位(Kabatナンバリング)におけるアミノ酸残基がロイシン(L)であり、110位におけるアミノ酸残基がリシン(K)残基又はグルタミン(Q)残基のいずれかである、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)に関する。また、89位にL及び110位にK又はQを有するこのような免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)は、その最も広い意味において本明細書で使用する時、「本発明のVHドメイン」という用語に含まれ、更に、本発明の他のVHドメイン(すなわち、112位にKもしくはQを含むもの、又は、89位にTを含むもの)について、本明細書で記載された通りであることができる。したがって、このような免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)は、本明細書で更に記載されたC末端伸長(このようなC末端伸長について示された選択を含む)を有することができ、本明細書で更に記載されたISVD、及び特に、ナノボディであることができる。
再度、本発明のこのようなVHドメインが、露出したC末端領域を有する(例えば、本発明のVHドメインは、それが存在するタンパク質、ポリペプチド、又は他の構築物のC末端を形成するためである)場合、本発明のVHドメインは、好ましくは、C末端伸長を含有する(以下の表Cに示されたデータが参照される)。
また、89位がLであり、110位がK又はQである(すなわち、C末端伸長の有無に関わらず)本発明のナノボディは、好ましくは、L(VHH中で最も頻繁に生じるアミノ酸残基)、E、K、M、S、V、W、又はYから選択され、より好ましくは、L、E、K、V、又はYから選択され、及び更により好ましくは、L、K、又はV(Vが最も好ましい)から選択される、11位におけるアミノ酸を含有する。例えば、本発明のナノボディは、L11KもしくはL11V置換、及び、例えば、P14AもしくはA14P置換、及び/又は、Q108L置換を含有することができる(また、本発明のナノボディは、S112K及び/又はS112Q置換を適切に含有することもできる。ただし通常は、89位がLであり、110位がK又はQである場合、112位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、112位は、好ましくは、Sである)。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
また、一態様では、89がLであり、110がK又はQである、本発明のこのようなVHドメインにおいて、112位におけるアミノ酸残基は、セリン(S)である。とりわけ、このようなVHドメインのC末端は、VKVSS(配列番号:95)、VQVSS(配列番号:96)、VKVSS(X)(配列番号:97)、又はVQVSS(X)(配列番号:98)の内の1つであることができる(及び好ましくは、これらの内の1つである)。ここで、n及びXは、112位がQ又はKである、本発明VHドメインについて本明細書で更に記載された通りである(及びここで、任意のC末端伸長は、好ましくは、112位がQ又はKである、本発明のVHドメインについて本明細書で更に記載された通りである)。また、112位がQもしくはKであり、又は、89位がTである本発明のVHドメインについての場合と同様に、89位にL及び110位にK又はQを有するこのようなVHドメインがナノボディである場合、11位は、好ましくは、ロイシン(L)であり、14位は、特に、アラニン(A)又はプロリン(P)であることができ、108位は、特に、Q又はLであることができる(及び、ヒト化ナノボディでは、好ましくは、Lである)。89位にL及び110位にK又はQを有するこのようなナノボディは、1つ以上のナノボディホールマーク残基を含有することができ、及び/又は、適切にヒト化されていることができる。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
また再度、89位にL及び110位にK又はQを有する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された血清アルブミンナノボディであることもできる。例えば、このような血清アルブミン結合ナノボディは、配列番号:46〜75の配列の内の1つ(ただし、89位にL及び110位にK又はQを有する)、又は、Alb−1(国際公開公報第2006/122787号の配列番号:52)、Alb−8(本明細書における配列番号:46)、及び/又はAlb−23(本明細書における配列番号:61)の内の少なくとも1つ(フレームワーク配列及びCDRの両方を考慮するが、任意のC末端伸長は考慮しない)に対して、少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する、89位にL及び110位にK又はQを有する別の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
より一般的には、本発明におけるこの態様の血清アルブミンに対するVHドメインは、国際公開公報第2004/041865号、及び特に、同第2006/122787号及び同第2012/175400号(全て出願人/譲受人の出願)に記載された(ヒト)血清アルブミンに対するナノボディの内の1つであることができ、ここで、89位におけるアミノ酸は、ロイシン(L)であり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQであり、ここで、場合により、本明細書で記載されたC末端伸長を備えている(及び、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、及び/又はQ108L、ならびにS112K又はS112Qを含有することもでき、ただし通常は、89位がLであり、110位がK又はQである場合、112位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、112位は、好ましくは、Sである)。またさらに、本発明は、他の血清アルブミン結合重鎖ISVD、例えば、国際公開公報第03/035694号、同第04/003019号、同第05/118642号、同第06/059106号、同第08/096158号、同第09/121804号、同第10/108937号、又は米国特許出願公開公報第2013/0129727号に記載されたものに、すなわち、89位にロイシン(L)及び110位にK又はQのいずれか、ならびに場合により、本明細書で記載された1つ以上の他のアミノ酸残基/置換)を適切に導入すること、及び場合により(及び通常、好ましくは、本明細書で概説されたように)(本明細書で更に記載された)C末端伸長を付加することにより、適用することもできると想定される。血清アルブミンに対するこれらのVHドメインにおいて、112位におけるアミノ酸は、好ましくは、Sである。前記VHドメインは、好ましくは、配列番号:95〜98の内の1つであるC末端を有する。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
本発明のこのような血清アルブミン結合ナノボディにおける一部の好ましく、非限定的な例は、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:52のアミノ酸配列のヒト化変異体(国際公開公報第2006/122787号において「Alb−1」と呼ばれる)(同変異体中、89位におけるアミノ酸は、Lであり、110位におけるアミノ酸は、K又はQである(及び、同変異体は、場合により、本明細書で記載されたC末端伸長を備えている))、例えば、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:57〜64に提供されたAlb−1のヒト化変異体(各場合において、V89L置換及びT110Q又はT110K置換を有し、場合により、C末端伸長を有する)、又は、国際公開公報第2012/175400号の配列番号:3〜11に提供されたAlb−1のヒト化変異体(再度、各場合において、V89L置換及びT110Q又はT110K置換を有する)である。同変異体の内、配列番号:3、4、及び5は、場合により、C末端伸長を含有することができ、配列番号:6〜11は、C末端伸長を予め含有している(及び再度、このような変異体は、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、及び/又はQ108L、ならびにS112K又はS112Qを含有することもでき、ただし通常は、89位がLであり、110位がK又はQである場合、112位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、112位は、好ましくは、Sである)。血清アルブミンに対するこれらのVHドメインにおいて、112位におけるアミノ酸は、好ましくは、Sである。前記VHドメインは、好ましくは、配列番号:95〜98の内の1つであるC末端を有する。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
このため、更なる態様では、本発明は、血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、
−CDR1は、アミノ酸配列SFGMS(配列番号:41)であり;
−CDR2は、アミノ酸配列SISGSGSDTLYADSVKG(配列番号:42)であり;
−CDR3は、アミノ酸配列GGSLSR(配列番号:43)であり;
−89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、
−110位におけるアミノ酸残基は、K又はQであり、
場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、及び/又はQ108L;ならびにS112K又はS112Qを含有することができ、ただし通常は、89位がLであり、110位がK又はQである場合、112位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、112位は、好ましくは、Sである)。血清アルブミンに対するこれらのVHドメインにおいて、112位におけるアミノ酸は、好ましくは、Sであり、前記VHドメインは、好ましくは、配列番号:95〜98の内の1つであるC末端を有する。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
特定の態様では、本発明は、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:52のヒト化変異体である血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、
−CDR1は、アミノ酸配列SFGMS(配列番号:41)であり;
−CDR2は、アミノ酸配列SISGSGSDTLYADSVKG(配列番号:42)であり;
−CDR3は、アミノ酸配列GGSLSR(配列番号:43)であり;
−89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、
−110位におけるアミノ酸残基は、K又はQであり、
場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、及び/又はQ108L;ならびにS112K又はS112Qを含有することができ、ただし通常は、89位がLであり、110位がK又はQである場合、112位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、112位は、好ましくは、Sである)。血清アルブミンに対するこれらのVHドメインにおいて、112位におけるアミノ酸は、好ましくは、Sであり、前記VHドメインは、好ましくは、配列番号:95〜98の内の1つであるC末端を有する。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
特定の態様では、本発明は、Alb−1(国際公開公報第2006/122787号の配列番号:52)、Alb−8(本明細書における配列番号:46)、及び/又はAlb−23(本明細書における配列番号:61)の内の少なくとも1つ(フレームワーク配列及びCDRの両方を考慮するが、任意のC末端伸長は考慮しない)に対して、少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する、血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQであり、場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、及び/又はQ108L;ならびにS112K又はS112Qを含有することができ、ただし通常は、89位がLであり、110位がK又はQである場合、112位における更なる置換の存在は、多くの場合、必ずしも必要ではないであろう。その場合には、112位は、好ましくは、Sである)。再度、本発明のこのようなナノボディは、好ましくは、Alb−1のヒト化変異体(ただし、V89L及びT110K又はT110Q置換を有する)であり、より好ましくは、少なくとも1つ、特に任意の2つ、およびとりわけ、3つ全ての、配列番号:41〜43のそれぞれで提供されたCDR1、CDR2、及び/又はCDR3を有する。血清アルブミンに対するこれらのVHドメインにおいて、112位におけるアミノ酸は、好ましくは、Sであり、前記VHドメインは、好ましくは、配列番号:95〜98の内の1つであるC末端を有する。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
具体的な一態様によれば、89位にL及び110位にK又はQを有する本発明の任意のこのような血清アルブミン結合ナノボディは、国際公開公報第12/175400号に記載されたAlb−23の特徴を有するアミノ酸残基及びその変異体(すなわち、44及び45位におけるアミノ酸モチーフGP、74〜76位におけるアミノ酸モチーフSKN、ならびに好ましくは、16位におけるG、また及び場合により、83位におけるR)も有することができる。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
112位にQ又はKを含有するか、又は、89位にTを有する本発明のVHドメインについてと同様に、89位にL及び110位にK又はQを含有する本発明のVHドメインは、既存の抗体による、及び特に、C末端伸長の存在下においてVHドメイン及びナノボディに結合可能な(例えば、SLE患者から得られたサンプル中に見出された)このような既存の抗体による低下した結合を示す。
89位にL及び110位にK(及び加えて、11位にV)を有する本発明のVHドメインの一部の非限定的な例は、配列番号:123〜136として、図2に提供されている。これらは、ヒト血清アルブミンに結合するVHドメインであり、本発明の好ましい血清アルブミン結合VHドメインについて本明細書で示したCDRを有する。
更に別の態様では、本発明は、89位(Kabatナンバリング)におけるアミノ酸残基がロイシン(L)であり、11位におけるアミノ酸残基がバリン(V)である、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)に関する。また、89位にL及び11位にVを有するこのような免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)は、その最も広い意味において本明細書で使用する時、「本発明のVHドメイン」という用語に含まれ、更に、本明細書で記載された本発明の他のVHドメイン(すなわち、112位にKもしくはQを含むもの、89位にTを含むもの、又は、89位にL及び110位にKもしくはQを含むもの)について、本明細書で記載された通りであることができる。本態様のVHドメインについてのそれにも関わらず、89位におけるアミノ酸残基は、Lであろうし、11位におけるアミノ酸残基は、Vであろうし、110及び112位におけるアミノ酸残基はそれぞれ、これらの位置に適した任意のアミノ酸残基であることができる。したがって、このような免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VHドメイン)は、本明細書で更に記載されたC末端伸長(このようなC末端伸長について示された選択を含む)を有することができ、本明細書で更に記載されたISVD、及び特に、ナノボディであることができる。
再度、本発明のこのようなVHドメインが、露出したC末端領域を有する(例えば、本発明のVHドメインは、それが存在するタンパク質、ポリペプチド、又は他の構築物のC末端を形成するためである)場合、本発明のVHドメインは、好ましくは、C末端伸長を含有する(以下の表Cに示されたデータが参照される)。
また、89位がLであり、11位がVである(すなわち、C末端伸長の有無に関わらず)本発明のナノボディは、(i)好ましくは、T、I、A、K、又はQから選択される(及び好ましくは、T、K、又はQから選択される、及び特に、Tであることができる)110位におけるアミノ酸を含有し、(ii)好ましくは、S、F、K、又はQから選択される(及びより好ましくは、S、K、又はQから選択される、及び特に、Sであることができる)112位におけるアミノ酸を含有し、ならびに(iii)例えば、P14AもしくはA14P置換、及び/又は、Q108L置換も含有することもできる。具体的な一実施態様によれば、本発明のこの態様におけるVHドメインにおいて、110位におけるアミノ酸残基は、Tであり、112位におけるアミノ酸残基は、Sであり、より好ましくは、C末端は、VTVSS(配列番号:77)又はVTVSS(X)n(配列番号:78)のいずれかである。ここで、X及びnは、本発明の他のVHドメインのC末端伸張について本明細書で定義された通りである。また、本発明のこの態様におけるVHドメインにおいて、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
このため、例えば、89がLであり、11がVである、本発明のこのようなVHドメインにおいて、このようなVHドメインのC末端は、VTVSS(配列番号:77)、VTVSS(X)n(配列番号:78)、VTVKS(配列番号:1)、VTVKS(X)n(配列番号:21)、VTVQS(配列番号:2)、VTVQS(X)n(配列番号:22)、VKVSS(配列番号:95)、VKVSS(X)n(配列番号:97)、VQVSS(配列番号:96)、VQVSS(X)n(配列番号:98)、VZVZS(配列番号:107、同配列中、各アミノ酸残基Zは、独立して、K又はQである)、又はVZVZSX(n)(配列番号:108、同配列中、各アミノ酸残基Zは、独立して、K又はQである)の内の1つであることができる(及び好ましくは、これらの内の1つであり)(及び特に、VTVSS、VKVSS(配列番号:95)、VQVSS(配列番号:96)、VKVSS(X)(配列番号:97)、又はVQVSS(X)(配列番号:98)の内の1つであり、及びとりわけ、VTVSS(配列番号:77)又はVTVSS(X)n(配列番号:78)のいずれかであることができる)。ここで、n及びXは、112位がQ又はKである、本発明のVHドメインについて本明細書で更に記載された通りであり(及びここで、任意のC末端伸長は、好ましくは、112位がQ又はKである、本発明VHドメインについて本明細書で更に記載された通りである)。また、112位がQ又はKであるか、又は、89位がLである本発明VHドメインについての場合と同様に、89位にL及び11位にVを有するこのようなVHドメインがナノボディである場合、14位は、特に、アラニン(A)又はプロリン(P)であることができ、108位は、Q又はLであることができる(及び、ヒト化ナノボディでは、好ましくは、Lである)。89位にL及び11位にVを有するこのようなナノボディは、1つ以上のナノボディホールマーク残基を含有することができ、及び/又は、適切にヒト化されていることができる。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
89位にL及び11位にVを有する本発明のこのようなVHドメインは、再度、本明細書で更に記載された血清アルブミンナノボディであることもできる。例えば、このような血清アルブミン結合ナノボディは、配列番号:46〜75の配列の内の1つ(ただし、89位にL及び11位にVを有する)、又は、Alb−1(国際公開公報第2006/122787号の配列番号:52)、Alb−8(本明細書における配列番号:46)、及び/又はAlb−23(本明細書における配列番号:61)の内の少なくとも1つ(フレームワーク配列及びCDRの両方を考慮するが、任意のC末端伸長は考慮しない)に対して、少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する、89位にL及び11位にVを有する別の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
より一般的には、本発明におけるこの態様の血清アルブミンに対するVHドメインは、国際公開公報第2004/041865号、及び特に、同第2006/122787号及び同第2012/175400号(全て出願人/譲受人の出願)に記載された(ヒト)血清アルブミンに対するナノボディの内の1つであることができ、ここで、89位におけるアミノ酸は、ロイシン(L)であり、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、場合により、本明細書で記載されたC末端伸長を備えている(及び、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、14A、P14A、14P、A14P、108L、Q108L、V110K、V110Q、S112K、及び/又はS112Qを適切に含有することもできる)。またさらに、本発明は、他の血清アルブミン結合重鎖ISVD、例えば、国際公開公報第03/035694号、同第04/003019号、同第05/118642号、同第06/059106号、同第08/096158号、同第09/121804号、同第10/108937号、又は米国特許出願公開公報第2013/0129727号に記載されたものに、すなわち、89位にロイシン(L)及び11位にバリン、ならびに場合により、本明細書で記載された1つ以上の他のアミノ酸残基/置換を適切に導入すること、及び場合により(及び通常、好ましくは、本明細書で概説されたように)(本明細書で更に記載された)C末端伸長を付加することにより、適用することもできると想定される。血清アルブミンに対するこれらのVHドメインにおいて、112位におけるアミノ酸は、好ましくは、Sである。前記VHドメインは、好ましくは、配列番号:95〜98の内の1つであるC末端を有する。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
本発明のこのような血清アルブミン結合ナノボディにおける一部の好ましく、非限定的な例は、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:52のアミノ酸配列のヒト化変異体(国際公開公報第2006/122787号において「Alb−1」と呼ばれる)(同変異体中、89位におけるアミノ酸は、Lであり、11位におけるアミノ酸は、Vである(及び、同変異体は、場合により、本明細書で記載されたC末端伸長を備えている))、例えば、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:57〜64に提供されたAlb−1のヒト化変異体(各場合において、V89L置換及びL11V置換を有し、場合により、C末端伸長を有する)、又は、国際公開公報第2012/175400号の配列番号:3〜11に提供されたAlb−1のヒト化変異体(再度、各場合において、V89L置換及びL11Vを有する)である。同変異体の内、配列番号:3、4、及び5は、場合により、C末端伸長を含有することができ、配列番号:6〜11は、C末端伸長を予め含有している(及び再度、このような変異体は、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、14A、P14A、14P、A14P、108L、Q108L、T110K、T110Q、S112K、及び/又はS112Qを適切に含有することもできる)。89位にL及び11位にVを有する血清アルブミンに対するこれらのVHドメインにおいて、110位におけるアミノ酸は、好ましくは、Tであり、112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Sである。前記VHドメインは、好ましくは、配列番号:95〜98の内の1つであるC末端を有する。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
このため、更なる態様では、本発明は、血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、
−CDR1は、アミノ酸配列SFGMS(配列番号:41)であり;
−CDR2は、アミノ酸配列SISGSGSDTLYADSVKG(配列番号:42)であり;
−CDR3は、アミノ酸配列GGSLSR(配列番号:43)であり;
−89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、
−11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、
ここで、好ましくは、
−110位におけるアミノ酸残基は、K、Q、又はTの内の1つ、及びより好ましくは、Tであり、
−112位におけるアミノ酸残基は、K、Q、又はSの内の1つ、及びより好ましくは、Sであり、
場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、14A、P14A、14P、A14P、108L、Q108Lを適切に含有することができる)。再度、89位にL及び11位にVを有する血清アルブミンに対するこれらのVHドメインにおいて、110位におけるアミノ酸は、好ましくは、Tであり、112位におけるアミノ酸は、好ましくは、Sであり、前記VHドメインは、好ましくは、配列番号:95〜98の内の1つであるC末端を有する。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
特定の態様では、本発明は、国際公開公報第2006/122787号における配列番号:52のヒト化変異体である血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、
−CDR1は、アミノ酸配列SFGMS(配列番号:41)であり;
−CDR2は、アミノ酸配列SISGSGSDTLYADSVKG(配列番号:42)であり;
−CDR3は、アミノ酸配列GGSLSR(配列番号:43)であり;
−89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、
−11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、
及び好ましくは、
−110位におけるアミノ酸残基は、K、Q、又はTの内の1つ、及びより好ましくは、Tであり、
−112位におけるアミノ酸残基は、K、Q、又はSの内の1つ、及びより好ましくは、Sであり、
場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、11L、L11V、L11K、14A、P14A、14P、A14P、108L、及び/又はQ108Lを含有することができる)。89位にL及び11位にVを有する血清アルブミンに対するこれらのVHドメインにおいて、110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Tであり、112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、Sであり、前記VHドメインは、好ましくは、配列番号:95〜98の内の1つであるC末端を有する。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
特定の態様では、本発明は、Alb−1(国際公開公報第2006/122787号の配列番号:52)、Alb−8(本明細書における配列番号:46)、及び/又はAlb−23(本明細書における配列番号:61)の内の少なくとも1つ(フレームワーク配列及びCDRの両方を考慮するが、任意のC末端伸長は考慮しない)に対して、少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する、血清アルブミン(及び特に、ヒト血清アルブミン)に結合する(及び特に、特異的に結合する)ことができる、(本明細書で定義された)本発明のナノボディに関し、ここで、89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、場合により、そのC末端において、C末端伸張(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有し(再度、このようなC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りであり、また再度、このようなナノボディは、例えば、本明細書で言及された1つ以上の他の特定のアミノ酸残基/置換、例えば、14A、P14A、14P、A14P、108L、Q108L、T110K、T110Q、S112K、及び/又はS112Qを適切に含有することができる)。再度、本発明のこのようなナノボディは、好ましくは、Alb−1のヒト化変異体(ただし、V89L及びL11V置換を有する)であり、より好ましくは、少なくとも1つ、特に任意の2つ、およびとりわけ、3つ全ての、配列番号:41〜43のそれぞれで提供されたCDR1、CDR2、及び/又はCDR3を有する。血清アルブミンに対するこれらのVHドメインにおいて、112位におけるアミノ酸は、好ましくは、Sであり、前記VHドメインは、好ましくは、配列番号:95〜98の内の1つであるC末端を有する。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
具体的な一態様によれば、89位にL及び11位にVを有する本発明の任意のこのような血清アルブミン結合ナノボディは、国際公開公報第12/175400号に記載されたAlb−23の特徴を有するアミノ酸残基及びその変異体(すなわち、44及び45位におけるアミノ酸モチーフGP、74〜76位におけるアミノ酸モチーフSKN、ならびに好ましくは、16位におけるG、また及び場合により、83位におけるR)も有することができる。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
112位にQ又はKを含有するか、又は、89位にTを有する本発明のVHドメインについてと同様に、89位にL及び11位にVを含有する本発明のVHドメインは、既存の抗体による、及び特に、C末端伸長の存在下においてVHドメイン及びナノボディに結合可能な(例えば、SLE患者から得られたサンプル中に見出された)このような既存の抗体による低下した結合を示す。89位がLであり、11位がVである本発明のVHドメインについて留意する1つの更なる事項は、これらの置換は、ヒトVHドメインにおいて、いくらかの頻度で生じることが公知であることである(11位については、国際公開公報第08/020079号の表A−5、及び、89位については、国際公開公報第08/020079号の表A−7を参照のこと)。
11位にV及び89位にTを有する本発明のVHドメインの一部の非限定的な例は、配列番号:109〜136として、図2に提供されている。これらのVHドメインの内、配列番号:123〜136として提供された配列は、L11V及びV89L変異に加えて、T110K変異も含有する。これらは、ヒト血清アルブミンに結合するVHドメインであり、本発明の好ましい血清アルブミン結合VHドメインについて本明細書で示されたCDRを有する。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、前記VHドメインは、場合により、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。好ましくは、この段落のVHドメインにおいて、110位におけるアミノ酸残基は、Tであり、112位におけるアミノ酸残基は、Sである。再度、本発明の他のVHドメインについてと同様に、このようなVHドメインは、任意の適切なターゲット(及び特に、治療関連ターゲット)に対することができる。具体的な一態様によれば、このようなVHドメインは、血清アルブミンに対する。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び/又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、及び/又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vであり、
ここで、前記VHドメインは、場合により、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。本発明の別の態様は、この段落で記載された、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり(及びここで、14、41、89、108、及び112位におけるアミノ酸残基は、上記ビュレットで列記された通りであることができ、42及び87位におけるアミノ酸残基は、例えば、この段落で記載された通りであることができ、このVHドメインは、場合により、この段落で記載されたC末端伸長(X)を含有することができる)。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、89位におけるアミノは、T、V、又はLの内の1つであり(及び好ましくは、Vであり)、110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Tであり)、及び/又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Sであり)、110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Tであり)、及び/又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Sであり)、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vであり、
ここで、前記VHドメインは、場合により、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。本発明の別の態様は、この段落で記載された、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり(及びここで、14、41、89、108、及び112位におけるアミノ酸残基は、上記ビュレットで列記された通りであることができ、42及び87位におけるアミノ酸残基は、例えば、この段落で記載された通りであることができ、このVHドメインは、場合により、この段落で記載されたC末端伸長(X)を含有することができる)。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vであり、
ここで、前記VHドメインは、場合により、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。本発明の別の態様は、この段落で記載された、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり(及びここで、14、41、89、108、及び112位におけるアミノ酸残基は、上記ビュレットで列記された通りであることができ、42及び87位におけるアミノ酸残基は、例えば、この段落で記載された通りであることができ、このVHドメインは、場合により、この段落で記載されたC末端伸長(X)を含有することができる)。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、89位におけるアミノは、T、V、又はLの内の1つであり(及び好ましくは、Vであり)、110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Tであり)、又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Sであり)、110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Tであり)、又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Sであり)、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vであり、
ここで、前記VHドメインは、場合により、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。本発明の別の態様は、この段落で記載された、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり(及びここで、14、41、89、108、及び112位におけるアミノ酸残基は、上記ビュレットで列記された通りであることができ、42及び87位におけるアミノ酸残基は、例えば、この段落で記載された通りであることができ、このVHドメインは、場合により、この段落で記載されたC末端伸長(X)を含有することができる)。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、89位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、Tであり、又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、112位におけるアミノ酸残基は、Sであり、110位におけるアミノ酸残基は、Tであり、又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、112位におけるアミノ酸残基は、Sであり(及び好ましくは、Sであり)、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vであり、
ここで、前記VHドメインは、場合により、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。本発明の別の態様は、この段落で記載された、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり(及びここで、14、41、89、108、及び112位におけるアミノ酸残基は、上記ビュレットで列記された通りであることができ、42及び87位におけるアミノ酸残基は、例えば、この段落で記載された通りであることができ、このVHドメインは、場合により、この段落で記載されたC末端伸長(X)を含有することができる)。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び/又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、及び/又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vであり、
ここで、前記VHドメインは、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。本発明の別の態様は、この段落で記載された、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり(及びここで、14、41、89、108、及び112位におけるアミノ酸残基は、上記ビュレットで列記された通りであることができ、42及び87位におけるアミノ酸残基は、例えば、この段落で記載された通りであることができ、このVHドメインは、場合により、この段落で記載されたC末端伸長(X)を含有することができる)。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、89位におけるアミノは、T、V、又はLの内の1つであり(及び好ましくは、Vであり)、110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Tであり)、及び/又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Sであり)、110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Tであり)、及び/又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Sであり)、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vであり、
ここで、前記VHドメインは、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される)を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。本発明の別の態様は、この段落で記載された、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり(及びここで、14、41、89、108、及び112位におけるアミノ酸残基は、上記ビュレットで列記された通りであることができ、42及び87位におけるアミノ酸残基は、例えば、この段落で記載された通りであることができ、このVHドメインは、場合により、この段落で記載されたC末端伸長(X)を含有することができる)。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vであり、
ここで、前記VHドメインは、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。本発明の別の態様は、この段落で記載された、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり(及びここで、14、41、89、108、及び112位におけるアミノ酸残基は、上記ビュレットで列記された通りであることができ、42及び87位におけるアミノ酸残基は、例えば、この段落で記載された通りであることができ、このVHドメインは、場合により、この段落で記載されたC末端伸長(X)を含有することができる)。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、
下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、89位におけるアミノは、T、V、又はLの内の1つであり(及び好ましくは、Vであり)、110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Tであり)、又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Sであり)、110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Tであり)、又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり(及び好ましくは、Sであり)、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vであり、
ここで、前記VHドメインは、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。本発明の別の態様は、この段落で記載された、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり(及びここで、14、41、89、108、及び112位におけるアミノ酸残基は、上記ビュレットで列記された通りであることができ、42及び87位におけるアミノ酸残基は、例えば、この段落で記載された通りであることができ、このVHドメインは、場合により、この段落で記載されたC末端伸長(X)を含有することができる)。
更なる態様では、本発明は、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、89位におけるアミノは、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、Tであり、又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、112位におけるアミノ酸残基は、Sであり、110位におけるアミノ酸残基は、Tであり、又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、112位におけるアミノ酸残基は、Sであり(及び好ましくは、Sであり)、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vであり、
ここで、前記VHドメインは、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する(このC末端伸長は、好ましくは、本明細書で更に記載された通りである)。また、(i)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(ii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。本発明の別の態様は、この段落で記載された、VHドメイン(及び特に、ISVDであるVHドメイン、及びとりわけ、ナノボディであるVHドメイン)に関し、ここで、11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQのいずれかであり(及びここで、14、41、89、108、及び112位におけるアミノ酸残基は、上記ビュレットで列記された通りであることができ、42及び87位におけるアミノ酸残基は、例えば、この段落で記載された通りであることができ、このVHドメインは、場合により、この段落で記載されたC末端伸長(X)を含有することができる)。
再度、本明細書で定義された本発明のVHドメインにおいて、本明細書で明確に定義されていない位置におけるアミノ酸残基は、VHドメイン、及び特に、ISVD、及びとりわけ、ナノボディ(ヒト化VHHドメインを含む)についてこのような位置に適した任意のアミノ酸残基であることができる。再度、本明細書で引用された従来技術、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−3及びA−5〜A−8等が参照される。好ましくは、各場合において、11位におけるアミノ酸残基は、L又はVであり、及びより好ましくは、Vである。また、(i)41位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、41位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、アラニン(A)、又はロイシン(L)であることができる(又は、これらから選択することができる)。これらのアミノ酸残基は、ヒト又はラマのいずれかにおけるこの位置に最も頻繁に生じるアミノ酸残基の一部であり、とりわけ、プロリン(P)又はアラニン(A)のいずれかであることができる。及び/又は、(ii)42位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−6で言及された、42位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、グリシン(G)又はグルタミン酸(E)であることができる(又は、これらから選択することができる)。及び/又は、(iii)87位は、例えば、国際公開公報第08/020079号の表A−7で言及された、87位についてのアミノ酸残基(すなわち、ヒトVH3残基及び/又はラクダ化VHH残基)の内の1つであることができ、特に、スレオニン(T)又はアラニン(A)であることができる(又は、これらから選択することができる)。
また、本発明の前記VHドメインは、任意の適切なターゲット、及び特に、治療ターゲットに対することができる。一態様において、本発明の前記VHドメインは、ヒト血清タンパク質、例えば、ヒト血清アルブミンに対する。
また、本発明は、少なくとも1つの本発明のVHドメインを含む、タンパク質、ポリペプチド、構築物、化合物、又は他の化学成分(本明細書において、まとめて、「本発明の化合物」とも呼ばれる)に関する。
本明細書で更に記載されたように、具体的な一態様によれば、本発明の化合物において、本発明のVHドメインは、本発明の化合物のC末端に存在する/同C末端を形成する。このような場合には、本発明の化合物のC末端を形成する/同C末端に存在する本発明のVHドメインは、好ましくは、本明細書で記載されたC末端伸長を有する。
また、本明細書で更に記載されたように、本発明の化合物は、1つ以上の本発明のVHドメインが1つ以上のVLドメインと会合して、1つ以上の機能的な抗原結合部位を形成している、ScFv、ディアボディ、又は他のタンパク質、ポリペプチド、もしくは構築物であることができる。
ただし、本発明の好ましい態様によれば、本発明のVHドメインは、ISVDであり、本発明の化合物は、少なくとも1つの本発明のISVDと、場合により、1つ以上の更なるアミノ酸配列、部分、結合ドメイン、又は結合ユニット(場合により、1つ以上のリンカーを介して、互いに適切に連結)とを含むか、又は、本質的にこれらからなる、タンパク質、ポリペプチド、構築物、化合物、又は他の化学成分である。特に、本発明のこのような化合物は、1つ以上のISVDを含み、又は、本質的にこれらからなることができ、ISVDの内の少なくとも1つは、本発明のISVDである。本発明のこのような化合物は、特に、本発明のISVDを、そのC末端に有することができる。またこの場合には、本発明のISVDは、好ましくは、本明細書で記載されたC末端伸長を有する。また、本発明のこのような化合物が、2つ以上のISVDを含有する場合、存在する2つ以上又は本質的に全てのISVDは、本発明のISVDであることができる(すなわち、それぞれが、下記アミノ酸残基/置換:112K、112Q、S112K、S112Q、89T、及び/もしくはV89T、又は、V89LとT110KもしくはT110Qとの組み合わせ、ならびに場合により、本発明のISVDについて本明細書で言及された1つ以上の更なる置換、例えば、L11Vの内の少なくとも1つを有する)。また、本発明のこのような化合物において、本発明のISVDは、好ましくは、本発明のナノボディであり、本発明の化合物に存在する全て又は本質的に全てのISVDは、ナノボディ(及び特に、本発明のナノボディ、すなわち、それぞれが、下記アミノ酸残基/置換:112K、112Q、S112K、S112Q、89T、及び/もしくはV89T、又は、V89LとT110KもしくはT110Qとの組み合わせ、ならびに場合により、本発明のナノボディについて本明細書で言及された1つ以上の更なる置換、例えば、L11Vの内の少なくとも1つを有する)であることができる(好ましくは、同ナノボディである)。本発明のこのような化合物の例は、本明細書の更なる開示に基づいて、当業者に明らかであろう。
1つ以上のISVD(少なくとも1つの本発明のISVDを含む)を含むタンパク質、ポリペプチド、構築物、化合物、又は他の化学成分の一部の非限定的な例は、直接又は1つ以上の適切なリンカーを介して連結した2つ以上のISVDを含有する、多価、多重特異性(例えば、二重特異性)、又は多重抗原結合性(例えば、二重抗原結合性)の構築物である。再度、ISVDは、好ましくは、ナノボディである。このような構築物及びこのような構築物を(特にナノボディに基づいて)調製することができる方法における一般的な教示の一部の非限定的な例については、例えば、Conrath et al., JBC 276, 10(9), 7346 (2001)及びMuyldermansによるレビュー文献であるReviews in Mol. Biotechnol., 74: 27 (2001)が参照される。
例えば、2つ以上のISVD(少なくとも1つのISVDが本発明のISVDである)を含有する本発明のこのような化合物は、二価、三価、四価、もしくは五価の構築物であることができ、及び/又は、単特異性、二重特異性、三重特異性の構築物であることができ、及び/又は、二重抗原結合性もしくは三重抗原結合性の構築物であることができる。再度、本明細書で引用されたISVD系及びナノボディ系生物学的製剤における従来技術が参照される。また、本発明のこのような化合物は、官能化により、及び/又は、構築物の半減期を伸ばす部分、もしくは結合ユニットを構築物に含ませることにより、延長した半減期を備えることができる。このような官能化、部分、又は結合ユニットの例は、当業者に明らかであろうし、例えば、本明細書に記載された通りであることができ、例えば、ペグ化、血清アルブミンへの融合、又は、血清タンパク質、例えば、血清アルブミンに結合することができるペプチドもしくは結合ユニットへの融合を含むことができる。このような血清アルブミン結合ペプチド又は結合ドメインは、(血清アルブミン結合ペプチド又は結合ドメインを含まない同じ構築物と比較して)構築物の半減期を伸ばすことができる、任意の適切な血清アルブミン結合ペプチド又は結合ドメインであることができ、特に、出願人による国際公開公報第2008/068280号(及び特に、両方とも出願人による国際公開公報第2009/127691号及び非公表の米国仮出願第61/301,819号)に記載された血清アルブミン結合ペプチド、又は、血清アルブミン結合ISV(例えば、血清アルブミン結合ナノボディ、例えば、Alb−8もしくはヒト化バージョンのAkb−1、例えば、Alb−8、これについては、例えば、国際公開公報第06/122787号が参照される)、又は、(ヒト)血清タンパク質、例えば、(本明細書で更に記載された)(ヒト)血清アルブミンに対する本発明のISVDであることができる。一般的には、延長した半減期を有する本発明の任意の化合物は、好ましくは、ヒト対象中において、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日の(本明細書で定義された)半減期を有するであろう。
本発明の化合物が、(ヒト)血清タンパク質に対する、及び特に、(ヒト)血清アルブミンに対する、少なくとも1つ(及び好ましくは、1つ)の本発明のISVD(及び特に、本発明のナノボディ)を含む場合、本発明の化合物は、通常、1つ以上の治療活性アミノ酸配列、部分、結合ドメイン、又は結合ユニット(すなわち、治療関連ターゲット、経路、又はメカニズムに対する)を、更に含有するであろうし、本発明のISVDは、それら(及び化合物全体)の半減期を伸ばすのに機能するであろう。再度、前記1つ以上の更なる治療活性部分は、好ましくは、ISVD(及びより好ましくは、ナノボディ)であり、本発明のISVD(及びより好ましくは、本発明のナノボディ)であることもできる。本発明のこのような化合物中において、ヒト血清アルブミンに対する本発明のISVDは、再度、本化合物のC末端に存在する/同C末端を形成することができ、その場合、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができる(及び好ましくは、同C末端伸長を含む)。本発明の化合物が、(ヒト)血清アルブミンに対する本発明のISVDを含有する場合、前記本発明の化合物は、好ましくは、それが投与され/投与されているヒト対象中において、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日の(本明細書で定義された)半減期を有する。この目的で使用することができる、ヒト血清アルブミンに対する本発明のISVDの一部の非限定的な例は、本明細書で更に記載された通りである。
一態様において、前記本発明の化合物に存在するISVD又はナノボディは全て、本発明のISVDである(本明細書で定義された本発明のVHドメインの特徴を有するアミノ酸残基/置換、すなわち、110Kもしくは110Qとの組み合わせにおける、少なくとも112KもしくはQ、又は、少なくとも89Tもしくは少なくとも89Lを有することを意味する)。本発明の化合物中におけるISVDが全て、本発明のISVDである場合、本発明のISVDは、同じ置換(例えば、全てS112K又はS112Q置換を有する)又は異なる置換(例えば、1つが、S112K又はS112Q置換を有することができ、他のものが、T110K又はT110Qとの組み合わせにおけるV89L変異を有することができる)を有することができる。また通常、本発明の化合物のC末端におけるISVDのみが、C末端伸長を有するであろう(他のものはおそらく、本化合物に存在する別のISVDに対して、そのC末端において連結しているであろう)。
このため、更なる態様では、本発明は、(本明細書で更に記載された)本発明のISVDを含むか、又は、本質的に同ISVDからなる、タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に関する。
さらに、本発明は、少なくとも1つの本発明のISVDと、少なくとも1つの他の治療部分又は成分とを(互いに直接又は適切なリンカーを介して連結)含む、タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に関する。
さらに、本発明は、(ヒト)血清タンパク質に対する(及び好ましくは、ヒト血清アルブミンに対する)少なくとも1つの本発明のISVDと、少なくとも1つの他の治療部分又は成分とを(互いに直接又は適切なリンカーを介して連結)含む、タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に関する。
さらに、本発明は、少なくとも2つ(例えば、2つ、3つ、又は4つ)の免疫グロブリンシングル可変ドメイン(互いに直接又は適切なリンカーを介して連結)を含む、タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に関する。免疫グロブリンシングル可変ドメインの少なくとも1つは、本発明のISVDである。この態様において、(i)存在するISVDは、適切に、同じか又は異なることができ、それらが異なる場合、それらは、同じターゲット(例えば、それらは、異なる配列を有することができ、及び/又は、同じターゲット上の異なるエピトープに対することができる)、又は、2つ以上の異なるターゲット(すなわち、得られたタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子が、二重又は多重特異性構築物であるように)に対することができる。及び/又は、(ii)タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子のC末端に存在するISVDは、本発明のISVDであってもよいし、又は、同ISVDでなくてもよい(ただし、好ましくは、同ISVDである)。及び/又は、(iii)本発明のISVDがタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子のC末端に存在する場合、本発明のISVDは、好ましくは、本明細書で記載されたC末端伸長を有する。及び/又は、(iv)タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に存在する本質的に全てのISVDは、本発明のISVDであることができる。また、ISVDが、異なるターゲットに対する場合(その内の少なくとも1つが、治療ターゲットである場合)、更なる一態様によれば、存在するISVDの少なくとも1つが、(ヒト)血清タンパク質、例えば、ヒト血清アルブミンに対することができる(このISVDは、本発明のISVDであってもよいし、又は、同ISVDでなくてもよく、このISVDが本発明のISVDである場合、本明細書で更に記載されたヒト血清アルブミンに対するナノボディが好ましい)。
さらに、本発明は、2つの免疫グロブリンシングル可変ドメイン(互いに直接又は適切なリンカーを介して連結)を含むか、又は、本質的にこれらからなる、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に関する。
さらに、本発明は、3つの免疫グロブリンシングル可変ドメイン(互いに直接又は適切なリンカーを介して連結)を含むか、又は、本質的にこれらからなる、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に関する。
さらに、本発明は、4つの免疫グロブリンシングル可変ドメイン(互いに直接又は適切なリンカーを介して連結)を含むか、又は、本質的にこれらからなる、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に関する。
さらに、本発明は、延長した半減期を前記タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に付与する、少なくとも1つの部分、結合ドメイン、又は結合ユニットを更に含む、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に関する(すなわち、前記部分、結合ドメイン、又は結合ユニットを含まない、対応するタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子と比較)。より具体的な態様によれば、延長した半減期を前記タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に付与する、前記少なくとも1つの部分、結合ドメイン、又は結合ユニットは、免疫グロブリンシングル可変ドメイン、とりわけ、血清タンパク質(例えば、血清アルブミン)に対する、特に、ヒト血清タンパク質(例えば、ヒト血清アルブミン)に対する、免疫グロブリンシングル可変ドメインであり、本明細書で記載されたように、特に、本発明のISVDであることができる。前記血清タンパク質に対するISVDは、タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子のN末端に、C末端に、又は、(タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子が3つ以上のISVDを含む場合)分子の中央に存在することができる。
さらに、本発明は、以下のいずれかを含むか、又は、本質的に以下のいずれかからなる、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に関する。
−2つの免疫グロブリンシングル可変ドメイン(互いに直接又は適切なリンカーを介して連結)、すなわち、延長した半減期を付与する(前記)一方の免疫グロブリンシングル可変ドメイン(例えば、ナノボディ)と、特に治療ターゲットに対することができる他方の免疫グロブリンシングル可変ドメイン(例えば、ナノボディ);
−3つの免疫グロブリンシングル可変ドメイン(互いに直接又は適切なリンカーを介して連結)、すなわち、延長した半減期を付与する(前記)1つの免疫グロブリンシングル可変ドメイン(例えば、ナノボディ)と、特に治療ターゲットに対することができる他の2つの免疫グロブリンシングル可変ドメイン(例えば、2つの他のナノボディ)(ここで、前記他の2つの免疫グロブリンシングル可変ドメインは、同じターゲットに対し、2つの異なるターゲットに対し、又は同じターゲット上の2つの異なるエピトープに対することができる);又は
−4つの免疫グロブリンシングル可変ドメイン(互いに直接又は適切なリンカーを介して連結)、すなわち、延長した半減期を付与する(前記)1つの免疫グロブリンシングル可変ドメイン(例えば、ナノボディ)と、特に治療ターゲットに対することができる他の2つの免疫グロブリンシングル可変ドメイン(例えば、2つの他のナノボディ)(ここで、前記他の3つの免疫グロブリンシングル可変ドメインは、同じターゲットに対し、2つもしくは3つの異なるターゲットに対し、及び/又は、同じターゲット上の2つもしくは3つの異なるエピトープに対することができる)
再度、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子において、(i)存在するISVDは、適切に、同じか、又は、異なることができ、ISVDが異なる場合、ISVDは、同じターゲットに対し(例えば、ISVDが異なる配列であることができ、及び/又は、同じターゲット上の異なるエピトープに対することができる)、又は、2つ以上の異なるターゲットに対する(すなわち、得られたタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子は、二重又は多重特異性構築物であるように)ことができる。及び/又は、(ii)タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子のC末端に存在するISVDは、本発明のISVDでもよく、又は、同ISVDでなくてもよい(ただし、好ましくは、本発明のISVDである)。及び/又は、(iii)本発明のISVDがタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子のC末端に存在する場合、本発明のISVDは、好ましくは、本明細書で記載されたC末端伸張を有する。及び/又は、(iv)タンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子に存在する本質的に全てのISVDは、本発明のISVDであることができる。
さらに、本発明は、(本明細書で更に記載された)本発明のVHドメイン及び本発明の化合物を発現/生成/製造するための方法に関する。例えば、本発明のVHドメインは、適切なホスト生物中において、本発明のVHドメインをコードする核酸を適切に発現させることにより発現/生成することができる。例えば、国際公開公報第08/020079号(及び、本明細書で引用された出願人/譲受人の幾つかの他の特許出願)が参照される。同文献には、一般的に、ナノボディを発現/生成するのに適した方法及び技術が記載されている。また、この方法は、本発明のナノボディを発現/生成するのにも適切に使用することができる。また、ナノボディ以外の本発明のVHドメインを発現させるための方法は、本開示及び本明細書で引用された従来技術に基づいて、当業者に明らかであろう。本発明の化合物を、1つ以上の本発明のVHドメインを、本発明の最終化合物に存在させるべき1つ以上の更なるアミノ酸残基(及び/又は、他の基もしくは部分)に、場合により、1つ以上のリンカー又はスペーサを介して、(通常、共有結合を介して)適切に連結させることにより、適切に製造/生成することができる。あるいは、本発明の化合物がタンパク質又はポリペプチドである場合、本発明の化合物を、適切なホスト生物中において、本発明の化合物をコードする核酸を適切に発現させることにより、製造/生成することができる。例えば、再度、国際公開公報第08/020079号及び、本明細書で引用された出願人/譲受人の幾つかの他の特許出願に記載された一般的な方法が参照される。
また、本発明は、本発明のVHドメイン又は本発明の化合物をコードするヌクレオチド配列及び/又は核酸に関する。このような核酸は、DNA又はRNAであることができ、及び好ましくは、DNAであり、プラスミド又はベクターの形態であることができる。例えば、再度、国際公開公報第08/020079号及び、本明細書で引用された出願人/譲受人の幾つかの他の特許出願が参照される。
また、本発明は、少なくとも1つの本発明のVHドメイン、本発明の化合物、又は、それらのいずれかをコードする核酸を含む組成物に関する。
さらに、本発明は、ISV(及び好ましくは、治療用ISV)又は、少なくとも1つのISV(及び好ましくは、少なくとも1つの治療用ISV)を含むタンパク質もしくはポリペプチド[ここで、前記ISV、タンパク質、又はポリペプチドは、本明細書で更に記載された通りである(すなわち、1つ以上の本明細書で記載された態様、及び特に、先の頁に記載された1つ以上の態様のISV、タンパク質、又はポリペプチド、及びとりわけ、本明細書で記載された1つ以上の態様によるC末端/配列を有するISV、タンパク質、又はポリペプチド)]と、少なくとも1つの適切な(すなわち、医薬用途に適切な)担体、希釈剤、又は賦形剤と、場合により、1つ以上の更なる活性物質とを含む医薬組成物に関する。このような組成物、担体、希釈剤、又は賦形剤は、例えば、ナノボディ又は、少なくとも1つのナノボディを含むタンパク質もしくはポリペプチドを含む医薬組成物について、国際公開公報第08/020079号に記載された通りである(本発明により既に言及された通り、また、ISVは、好ましくは、ナノボディでもある)。
さらに、本発明は、ヒトにおける疾患の治療(例えば、このような治療を必要とする患者)に使用するための、ISV又は、少なくとも1つのISVを含むタンパク質もしくはポリペプチドであって、前記ISV、タンパク質、又はポリペプチドが、本明細書で更に記載された通りである(すなわち、本明細書で記載された1つ以上の態様、及び特に、先の頁に記載された1つ以上の態様のISV、タンパク質、又はポリペプチド、及びとりわけ、本明細書で記載された1つ以上の態様によるC末端/配列を有するISV、タンパク質、又はポリペプチド)、ISV又は、少なくとも1つのISVを含むタンパク質もしくはポリペプチドに関する。
さらに、本発明は、医薬組成物の製造における、ISV又は、少なくとも1つのISVを含むタンパク質もしくはポリペプチドの使用であって、前記ISV、タンパク質、又はポリペプチドが、本明細書で更に記載された通りである(すなわち、本明細書で記載された1つ以上の態様、及び特に、先の頁に記載された1つ以上の態様のISV、タンパク質、又はポリペプチド、及びとりわけ、本明細書で記載された1つ以上の態様によるC末端/配列を有するISV、タンパク質、又はポリペプチド)使用に関する。
さらに、本発明は、ヒト対象(例えば、以下の処置を必要とする患者)に、ISV又は、少なくとも1つのISVを含むタンパク質もしくはポリペプチドを投与することを含む処置方法であって、前記ISV、タンパク質、又はポリペプチドが、本明細書で更に記載された通りである(すなわち、本明細書で記載された1つ以上の態様、及び特に、先の頁に記載された1つ以上の態様のISV、タンパク質、又はポリペプチド、及びとりわけ、本明細書で記載された1つ以上の態様によるC末端/配列を有するISV、タンパク質、又はポリペプチド)方法、又は、少なくとも1つのこのようなISV、タンパク質、もしくはポリペプチドを含む(上記された)医薬組成物に関する。
上記に関して、本明細書で記載されたISV、タンパク質、又はポリペプチドの治療的使用が、本発明の非常に重要な態様であることが明らかであろう。したがって、治療的使用(又は、このような治療的使用のための、このようなISV、タンパク質、及びポリペプチドの臨床開発)は、前記ISV、タンパク質、又はポリペプチドが免疫原性である(すなわち、ヒト対象に投与された際に、ADAを生じる可能性がある)かを判定するADAアッセイ法の使用を含むことができる。この観点において、可能性のある免疫原性についての懸念は、治療剤が長期間(数週間、数か月、又は数年の間)使用される、及び/又は、少なくとも3日、例えば、少なくとも1週間、及び最長10日以上のヒト対象における半減期(好ましくは、t1/2ベータとして表現)を有するかのいずれかである場合、特に取り組まれなければならないであろうことも明らかであろう。
このため、具体的な一態様によれば、本発明は、ヒトにおける慢性疾患の処置に意図された、本明細書で記載された本発明のISV、タンパク質、ポリペプチド、化合物、又は分子(又は、それらを含む医薬組成物)に関する。及び/又は、本明細書で記載されたこのようなISV、タンパク質、ポリペプチドは、少なくとも1週間の期間、好ましくは少なくとも2週間、例えば、少なくとも1か月間(すなわち、治療活性用量で)投与された対象の循環中に(すなわち、薬理活性レベルで)存在することが意図される。及び/又は、本明細書で記載されたこのようなISV、タンパク質、ポリペプチドは、これらが、少なくとも3日、例えば、少なくとも1週間、及び最大10日以上のヒト対象における半減期(好ましくは、t1/2ベータとして表現)を有するようにである。及び/又は、本明細書で記載されたこのようなISV、タンパク質、ポリペプチド、又は医薬組成物は、少なくとも3日、例えば、少なくとも1週間、例えば、少なくとも2週間もしくは少なくとも1か月、又はそれより長く(すなわち、少なくとも3ヶ月、少なくとも6か月、又は少なくとも1年)の期間にわたって投与され、又は、更に慢性的に投与される2回以上の投与として、ヒトに投与されるのが意図される。
また、本明細書の開示に基づいて当業者に明らかであろうように、本明細書で記載されたVHドメインに対する改善及び得られた改善VHドメインは、−本発明によれば−SLE患者から得られたサンプル中に見出された種類の既存の抗体、すなわち、本明細書で記載されたC末端伸長の存在下においてもVHドメインのC末端領域に結合することができる既存の抗体が全血/血清に含まれる(又は、同抗体が含まれると疑われる)ヒト対象(及び特に、患者)への投与が意図されるタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子における特定の使用を見出すであろう。特に、本明細書で記載されたVHドメインに対する改善及び得られた改善VHドメインは、このような患者における疾患又は障害を治療又は予防するのが意図されるタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは分子における特定の使用を見出すであろう。これは、任意の疾患又は障害であることができるが、特に、このような既存の抗体の存在もしくは発生をもたらす、及び/又は、同存在もしくは発生に関連する疾患又は障害(一例は、SLEであるが、他の重篤な(自己)免疫障害も、このような既存の抗体をもたらすおそれがあると予想される。既存の抗体は、関連する患者集団から得られたサンプルを、このような既存の抗体の存在について、以下の実験部においてSLE患者からのサンプルに行われた試験に本質的に類似する方法において試験することにより、容易に確認することができる)であることができる。
このため、具体的な一態様によれば、本発明は、VHドメインの露出したC末端領域に、前記VHドメインが本明細書で記載されたC末端伸長を含有する場合(又は、VHドメインのC末端が別のタンパク質又はポリペプチド、例えば、別のISVに、場合により、適切なリンカーを介して連結されている場合)でも、結合することができる既存の抗体が血液に含まれるヒト対象への投与が意図される、本明細書で記載された本発明のISV、タンパク質、ポリペプチド、化合物、又は分子(又は、これらを含む医薬組成物)に関する。
特に、本発明は、VHドメインの露出したC末端領域に、前記VHドメインが本明細書で記載されたC末端伸長を含有する場合(又は、VHドメインのC末端が別のタンパク質又はポリペプチド、例えば、別のISVに、場合により、適切なリンカーを介して連結されている場合)でも、結合することができる既存の抗体が血液に含まれるヒト対象における疾患又は障害の処置に使用するための、本明細書で記載された本発明のISV、タンパク質、ポリペプチド、化合物、又は分子(又は、これらを含む医薬組成物)に関する。前記疾患又は障害は、任意の疾患又は障害であることができるが、特に、このような患者の血中におけるこのような既存の抗体の存在により、引き起こされ、もたらされ、又は他の方法で関連付けられる疾患又は障害、例えば、SLE又は別の(重篤な)自己免疫疾患であることができる。
このため、より具体的な態様によれば、本発明は、ヒト対象/患者における疾患又は障害の処置に使用するためのものであり、ここで、前記疾患又は障害が、VHドメインの露出したC末端領域に、前記VHドメインが本明細書で記載されたC末端伸長を含有する場合(又は、VHドメインのC末端が別のタンパク質又はポリペプチド、例えば、別のISVに、場合により、適切なリンカーを介して連結されている場合)でも、結合することができる、前記ヒト対象/患者の血中における既存の抗体の存在により、引き起こされ、もたらされ、又は他の方法で関連付けられる疾患又は障害である、本明細書で記載された本発明のISV、タンパク質、ポリペプチド、化合物、又は分子(又は、これらを含む医薬組成物)に関する。例えば、本明細書で記載された本発明のこのようなISV、タンパク質、ポリペプチド、化合物、又は分子(又は、これらを含む医薬組成物)は、ヒト対象/患者におけるSLE又は別の(重篤な)自己免疫疾患の処置に使用するためのものである。
当業者に明らかであろうように、タンパク質、ポリペプチド、化合物、又は分子がこのような疾患又は障害の予防又は治療に意図されている場合、これらは、関連する疾患又は障害に対する(例えば、適切な疾患又は障害に治療的に関連するターゲット又は経路に対する)治療活性剤である、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、3つ、又は4つ)のドメイン、結合ユニット、又は部分もしくは成分を含有するであろう。再度、このような結合ドメイン又は結合ユニットは、例えば、(他の)ISVDであることができ、一態様によれば、特に、本発明のVHドメイン又はISVDであることができる。このようなタンパク質、ポリペプチド、化合物、又は分子の別の一般的な例は、前記1つ以上の治療ドメイン、結合ユニット、又は部分もしくは成分がISVDでないが(ただし、例えば、別のスキャフォールドから得られた)、タンパク質、ポリペプチド、化合物、又は分子の半減期を伸ばすために、本発明のVHドメインを含有するタンパク質、ポリペプチド、化合物、又は分子(例えば、本明細書で記載された血清アルブミンバインダー)である。
更なる態様では、(本明細書で記載された)本発明のVHドメイン、ISVD、又は化合物は、イオンチャネルKv1.3に対する。このようなVHドメイン、ISVD、又は化合物の一部の好ましく、非限定的な例は、実施例7に提供される。前記実施例に記載されたKv1.3に対するVHドメイン(及び、それを含む本発明の化合物)及び前記実施例で記載されたKv1.3に対する本発明の特定の化合物は、本発明の更なる態様を構成する。
例えば、限定されず、Kv1.3に対する本発明の化合物は、Kv1.3に対する本発明のシングルVHドメイン−及び好ましくは、ナノボディ−を含むか、もしくは、本質的にこれからなることができ、又は、少なくとも2つ(例えば、2つもしくは3つ)のKv1.3に対する本発明のVHドメイン−及び好ましくは、ナノボディ−を含むか、もしくは、本質的にこれからなることができる。このようなポリペプチドが2つ以上のKv1.3に対する本発明のVHドメインを含有する場合、これらのVHドメインは、同じか、又は、異なることができる。それらが異なる場合、それらは、Kv1.3上の同じエピトープもしくはKv1.3上のサブユニットに対して、又は、異なるエピトープもしくはサブユニットに対することができる。
再度、本発明の化合物について本明細書で一般的に記載されたように、このような化合物は、1つ以上のリンカーを適切に含有することができ、C末端伸長(すなわち、本明細書で記載された通り)を含有することができ、また、1つ以上の更なる結合ユニット又は結合ドメイン(又は、他のアミノ酸配列もしくは部分)、例えば、Kv1.3以外のターゲットに対する更なるISVDを含有することもできる。例えば、限定されず、本発明の化合物は、延長した半減期を提供する結合ドメイン又は結合ユニット、例えば、血清タンパク質、例えば、ヒト血清アルブミンに対するISVD(例えば、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディ)を(も)含有することができる。
更なる態様では、本発明は、本明細書で記載された(すなわち、本明細書で記載されたアミノ酸残基/変異/置換を含有する)免疫グロブリン可変ドメイン配列の(合成)ライブラリに関する。このようなライブラリは、通常、(本質的に)全て同じフレームワーク配列(本明細書で示されたアミノ酸残基/変異を含有する前記フレームワーク配列)と、種々のCDR(ライブラリ中の各配列が、ライブラリ中の他の配列と比較して、そのCDRの少なくとも1つにおいて、少なくとも「1つのアミノ酸差」を有することを意味する)とを伴って、通常、少なくとも100種類の配列、例えば、少なくとも1000種類の配列、特に、10種類を超える配列、とりわけ、10種類を超える配列、例えば、10〜1010種類以上の配列を含有するであろう(その広い意味において、配列間に少なくとも1つのアミノ酸差を有することを意味する)。
免疫グロブリンシングル可変ドメイン配列(例えば、ヒトVH配列又はラクダ誘導体化VHH配列に基づく)の合成ライブラリ及びそれらを生成/構築する方法(所定のスキャフォールドに基づき、及び/又は、フレームワーク領域中に1つ以上の特定のアミノ酸残基/変異を含有するライブラリを含む)は、当技術分野において周知である。例えば、Tanha et al., J. Biol. Chem., Vol. 276, pp. 24774-24780, 2001;Bond et al., J. Mol. Biol. (2003) 332, 643-655;Mandrup et al., PLOS One, October 2013, Volume 8, Issue 10, e76834;Goldman et al., Anal. Chem., 2006, 78, 8245-8255;Hussak et al., Protein Engineering, Design & Selection vol. 25 no. 6 pp. 313-318, 2012;及び、Chen et al., Methods Mol. Biol., 2009, 525, 81が参照される。これらに文献に記載された技術(及びそれ自体公知の類似する技術)を、本発明の免疫グロブリンシングル可変ドメインライブラリを生成するのに、適切に使用又は適合させることができる。
このようなライブラリに存在するISVDは、任意の適切なソースからの任意の適切なCDR、例えば、「ナイーブな」哺乳類からの免疫レパートリー(例えば、ラクダ種又はヒト配列類)から開始して得られた/生成されたCDR、抗原により適切に免疫化されている動物(例えば、ラクダ種)からの免疫レパートリーから開始して得られた/生成されたCDR、完全に合成CDRレパートリー、又は、突然変異誘発(例えば、ランダム突然変異誘発又は部位特異的突然変異誘発)等の技術により得られたレパートリーを適切に含有することができる。また、このようなライブラリは、例えば、それ自体公知の親和性成熟法の過程で生成されてくるライブラリであることもできる。
このようなライブラリ中に存在するISVDのフレームワーク領域は、例えば、VH配列(例えば、ヒトVH配列)から開始して、又は、ナノボディ配列(例えば、VHH配列又はヒト化VH配列)から開始して得られるスキャフォールドに基づく、任意の適切な開始配列/スキャフォールドから、適切に得ることができる。また、ライブラリは、2種類以上のソースから得られ、又は、2種類以上のスキャフォールドに基づくISVDを含有することも可能である(例えば、ライブラリは、異なるソースから得られ、又は、異なるスキャフォールドに基づく2つ以上のライブラリを組み合わせることにより得られるためである)。
また、ライブラリ(中に存在するISVD)は、タンパク質の形態、又は、関連するISVDをコードするDNAもしくはRNAの形態にあることができる。例えば、ライブラリは、スクリーニング及び/又は選択技術に適した発現ライブラリの形態にあることができ、この目的で、例えば、適切なディスプレイ技術、例えば、ファージディスプレイライブラリ、酵母ディスプレイライブラリ、又はリボソームディスプレイライブラリを使用してディスプレイすることができる形態にあることができる。
このため、また一般的には、本発明は、(本明細書で更に記載された)本発明のVHドメインを含有する(本明細書で記載された)ライブラリに関する。好ましくは、このようなライブラリの特定の態様によれば、存在するVHドメインは、全て同じ(又は本質的に同じ)フレームワーク配列を有するが、異なるCDR配列(再度、言及されたように、これは、ライブラリ中の個々のVHドメインがそれぞれ、ライブラリ中の他のVHドメインと比較して、少なくとも1つのCDR中に少なくとも1つのアミノ酸差を有することを意味する)を有する。
一態様において、本発明のライブラリは、本発明のISVDのライブラリ(本明細書で更に記載された通り、前記ISVDをコードするのに適した核酸のライブラリを含む)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
ここで、下記のいずれかであり、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び/又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、及び/又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくは、Vである。また場合により、このようなライブラリに存在するISVDは、(本発明のVHドメインについて本明細書で更に記載された)C末端伸長を含有することができ、及び/又は、適切なタグ(例えば、ヒスチジンタグ)を適切に含有することができる。
別の態様では、本発明のこのようなライブラリは、本発明のISVDのライブラリ(本明細書で更に記載された通り、前記ISVDをコードするのに適した核酸のライブラリを含む)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つである。
また場合により、このようなライブラリに存在するISVDは、(本発明のVHドメインについて本明細書で更に記載された)C末端伸長を含有することができ、及び/又は、適切なタグ(例えば、ヒスチジンタグ)を適切に含有することができる。
本発明のライブラリは、それ自体公知で、任意の適切な/意図した目的に使用することができる。例えば、本発明のライブラリは、例えば、スクリーニング及び/又は選択の目的(又は、スクリーニング及び/又は選択プロセスの一部)に使用することができ、親和性成熟の目的又は改善されたVHドメインの生成を意図した他のプロセスに/これらの一部として、例えば、アラニンスキャニングに使用することができる。実際には、通常、ライブラリのサイズ、設計、及び他の特徴は、当業者の範囲であるであろう、その意図した使用に適合されるであろう。
ここから、本発明は、下記の非限定的な好ましい、態様、実施例、及び図面により更に説明されるであろう。ここで、
図1は、本明細書で具体的に言及されるであろうアミノ酸位置の一部及び幾つかの代替的なナンバリングシステム(例えば、Aho及びIMGT)に従ったそのナンバリングを列記した表である。 図2は、本明細書で言及された配列を列記する。 図3は、96個の血清サンプルを、S112K変異を有する代表的なナノボディ(参照A+S112K+C末端アラニン、図3中に(2)として示す)との結合について、S112K変異を有さない参照ナノボディ(参照A、配列番号:44、図3中に(1)として示す)と比較して試験した、 図4は、129個の血清サンプルを、V89T変異を有する代表的なナノボディ(参照A+L11V+V89T+C末端アラニン、図4中に(2)として示す)との結合について、V89T変異を有さない参照ナノボディ(参照A、配列番号:44、図4中に(1)として示す)と比較して試験した場合の、実施例4で得られたデータ点を示すプロットである。 図5は、100個の血清サンプルを、V89L、T110K、及び/又はT110Q変異を有する代表的なナノボディ(参照A+L11V+V89L+C末端Ala、図5中に(2)として示す;参照A+L11V+V89L+T110K+C末端Ala、図5中に(3)として示す;参照A+L11V+V89L+T110Q+C末端Ala、図5中に(4)として示す;及び、参照A+L11V+T87A+V89L+C末端Ala、図5中に(5)として示す)との結合について、これらの変異をいずれも有さない参照ナノボディ(参照A、配列番号:44、図5中に(1)として示す)と比較して試験した場合の、実施例5で得られたデータ点を示すプロットである。 図6は、健康なボランティアから得られた98個の血清サンプルを、代表的な三価のナノボディ構築物との結合について試験した場合の、実施例6で得られたデータ点を示すプロットである。各ドットは、98個の血清サンプルの内の1つに対して、示された構築物を試験することにより収集されたデータ点を表わす。凡例:(1)=参照X(ナノボディA−35GS−ナノボディA−35GS−ナノボディB);(2)=参照X+C末端Ala;(3)=参照X+L11V+V89L+C末端Ala;(4)=参照X+L11V+T87A+V89L+C末端Ala;(5)=参照X+L11V+V89L+T110K+C末端Ala;(6)=参照X+L11V+V89L+T110Q+C末端Ala。 図7は、健康なボランティアから得られた30個の血清サンプル(高力価の既存の抗体又は、C末端アラニン伸長が存在する場合でも高度の結合を有する既存の抗体の存在について選択したサンプル)を、代表的な三価のナノボディ構築物との結合について試験した場合の、実施例6で得られたデータ点を示すプロットである。各ドットは、30個の血清サンプルの内の1つに対して、示された構築物を試験することにより収集されたデータ点を表わす。凡例:(1)=参照X+C末端Ala;(2)=参照X+L11V+V89L+C末端Ala;(3)=参照X+L11V+T87A+V89L+C末端Ala;(4)=参照X+L11V+V89L+T110K+C末端Ala。 図8は、健康なボランティアから得られた98個の血清サンプルを、代表的な二価のナノボディ構築物との結合について試験した場合の、実施例6で得られたデータ点を示すプロットである。各ドットは、30個の血清サンプルの内の1つに対して、示された構築物を試験することにより収集されたデータ点を表わす。凡例:(1)=参照Y(ナノボディA−35GS−ナノボディB);(2)=参照Y+C末端Ala;(3)=参照Y+L11V+V89L+C末端Ala;(4)=参照Y+L11V+T87A+V89L+C末端Ala;(5)=参照Y+L11V+V89L+T110K+C末端Ala;(6)=参照Y+L11V+V89L+T110Q+C末端Ala。 図9A及び9Bは、イオンチャネルKv1.3に対する、本発明の一価のナノボディ(図9A)、及び、本発明の三価の二重特異性半減期延長化合物(図9B)の好ましく、非限定的な例を示す。図9Cは、Kv1.3に対するISVDについての一部の好ましいCDR(Kabat及びAbmそれぞれに従った分類)を列記する。 図9A及び9Bは、イオンチャネルKv1.3に対する、本発明の一価のナノボディ(図9A)、及び、本発明の三価の二重特異性半減期延長化合物(図9B)の好ましく、非限定的な例を示す。図9Cは、Kv1.3に対するISVDについての一部の好ましいCDR(Kabat及びAbmそれぞれに従った分類)を列記する。 図9A及び9Bは、イオンチャネルKv1.3に対する、本発明の一価のナノボディ(図9A)、及び、本発明の三価の二重特異性半減期延長化合物(図9B)の好ましく、非限定的な例を示す。図9Cは、Kv1.3に対するISVDについての一部の好ましいCDR(Kabat及びAbmそれぞれに従った分類)を列記する。 図10は、糖尿病を患うヒト対象から得られた47個の血清サンプルを、Kv1.3に対する本発明の代表的な三価の二重特異性半減期延長化合物との結合について試験した場合の、実施例7で得られたデータ点を示すプロットである。各ドットは、47個の血清サンプルの内の1つに対して、示された構築物を試験することにより収集されたデータ点を表わす。配列番号は、図9で列記された関連する配列を意味する。 図11は、健康なボランティアから得られた90個の血清サンプルを、Kv1.3に対する本発明の代表的な三価の二重特異性半減期延長化合物との結合について試験した場合の、実施例7で得られたデータ点を示すプロットである。各ドットは、47個の血清サンプルの内の1つに対して、示された構築物を試験することにより収集されたデータ点を表わす。配列番号は、図9で列記された関連する配列を意味する。 図12A及び12Bは、示された参照配列に基づく、IL−23に対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例8も参照のこと。 図12A及び12Bは、示された参照配列に基づく、IL−23に対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例8も参照のこと。 図13は、示された参照配列に基づく、OX40−Lに対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例9も参照のこと。 図14は、示された参照配列に基づく、IgEに対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例10も参照のこと。 図15A及び15Bは、示された参照配列に基づく、CXCR−4に対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例11も参照のこと。 図15A及び15Bは、示された参照配列に基づく、CXCR−4に対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例11も参照のこと。 図16A及び16Bは、示された参照配列に基づく、HER−3に対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例12も参照のこと。 図16A及び16Bは、示された参照配列に基づく、HER−3に対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例12も参照のこと。 図17A及び17Bは、示された参照配列に基づく、TNFに対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例13及び14も参照のこと。 図17A及び17Bは、示された参照配列に基づく、TNFに対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例13及び14も参照のこと。 図18A及び18Bは、示された参照配列に基づく、c−Metに対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例15も参照のこと。 図18A及び18Bは、示された参照配列に基づく、c−Metに対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例15も参照のこと。 図19は、示された参照配列に基づく、RANK−Lに対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例16も参照のこと。 図20A〜20Cは、示された参照配列に基づく、CXCR−7に対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例17も参照のこと。 図20A〜20Cは、示された参照配列に基づく、CXCR−7に対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例17も参照のこと。 図20A〜20Cは、示された参照配列に基づく、CXCR−7に対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例17も参照のこと。 図21A及び21Bは、示された参照配列に基づく、A−ベータに対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例18も参照のこと。 図21A及び21Bは、示された参照配列に基づく、A−ベータに対する本発明のナノボディの一部の好ましく、非限定的な例のCDR及びアミノ配列を列記する。実施例18も参照のこと。 図22は、IL−23に対する本発明の化合物の一部の好ましく、非限定的な例のアミノ酸配列を提供する。 図23は、OX40−Lに対する本発明の化合物の一部の好ましく、非限定的な例のアミノ酸配列を提供する。 図24は、IgEに対する本発明の化合物の一部の好ましく、非限定的な例のアミノ酸配列を提供する。 図25は、CXCR−4に対する本発明の化合物の一部の好ましく、非限定的な例のアミノ酸配列を提供する。 図26は、HER−3に対する本発明の化合物の一部の好ましく、非限定的な例のアミノ酸配列を提供する。 図27は、TNFに対する本発明の化合物の一部の好ましく、非限定的な例のアミノ酸配列を提供する。 図28A及び28Bは、c−Metに対する本発明の化合物の一部の好ましく、非限定的な例のアミノ酸配列を提供する。 図28A及び28Bは、c−Metに対する本発明の化合物の一部の好ましく、非限定的な例のアミノ酸配列を提供する。 図29は、RANK−Lに対する本発明の化合物の一部の好ましく、非限定的な例のアミノ酸配列を提供する。 図30は、A−ベータに対する本発明の化合物の一部の好ましく、非限定的な例のアミノ酸配列を提供する。 図31Aは、健康なボランティアから得られた92個の血清サンプルを、A−ベータに対する本発明の代表的な三価の二重特異性半減期延長化合物との結合について試験した場合の、実施例19で得られたデータ点を示すプロットである。各ドットは、92個の血清サンプルの内の1つに対して、示された構築物を試験することにより収集されたデータ点を表わす。参照番号は、表CC−1で列記された通りである。同様に、図31Bは、健康なボランティアから得られた92個の血清サンプルを、図31Aで試験された構築物に存在する(一価の)C末端ナノボディとの結合について試験した場合の、実施例19で得られたデータ点を示すプロットである。各ドットは、92個の血清サンプルの内の1つに対して、示された構築物を試験することにより収集されたデータ点を表わす。参照番号は、表CC−2で列記された通りである。 図31Aは、健康なボランティアから得られた92個の血清サンプルを、A−ベータに対する本発明の代表的な三価の二重特異性半減期延長化合物との結合について試験した場合の、実施例19で得られたデータ点を示すプロットである。各ドットは、92個の血清サンプルの内の1つに対して、示された構築物を試験することにより収集されたデータ点を表わす。参照番号は、表CC−1で列記された通りである。同様に、図31Bは、健康なボランティアから得られた92個の血清サンプルを、図31Aで試験された構築物に存在する(一価の)C末端ナノボディとの結合について試験した場合の、実施例19で得られたデータ点を示すプロットである。各ドットは、92個の血清サンプルの内の1つに対して、示された構築物を試験することにより収集されたデータ点を表わす。参照番号は、表CC−2で列記された通りである。
実験部
以下の実験部で使用したヒトサンプルを、商業的供給元又はヒトボランティアのいずれかから取得し(全ての必要とされる同意及び承認を得た後)、適用される法律及び規則の要件(医療秘匿及び患者プライバシーに関するものを含むが、これらに限定されない)に従って使用した。
以下の実施例において、使用したサンプル(すなわち、健康なボランティア、関節リウマチ(RA)患者、及びSLE患者からのサンプル)中に存在する既存の抗体の試験したナノボディに対する結合を、ProteOnを使用して下記のように決定した。ヒト血清アルブミン(HSA)に捕捉されたナノボディへの既存の抗体の結合を、ProteOn XPR36(Bio-Rad Laboratories, Inc.)を使用して評価した。PBS/Tween(リン酸緩衝生理食塩水、pH7.4、0.005% Tween20)を、ランニングバッファーとして使用した。実験を、25℃で行った。ProteOn GLCセンサチップのリガンドレーンを、EDC/NHS(流速30μL/分)で活性化した。HSAを、ProteOnアセタートバッファー pH4.5(流速100μL/分)中において、10μg/mLで注入して、固定化レベルを約3200RUにした。固定化後、表面を、エタノールアミンHCl(流速30μL/分)で不活性化した。ナノボディを、HSA表面上に、45μL/分で2分間注入して、ナノボディ捕捉レベルを約200RUにした。既存の抗体を含有するサンプルを、14,000rpmで2分間遠心分離した。上清を、PBS−Tween20(0.005%)中において、1:10希釈し、その後、45μL/分で2分間注入し、その後の400秒解離工程を続けた。各サイクル後(すなわち、新たなナノボディの捕捉及び血液サンプル注入工程前)に、HSA表面を、45μL/分でのHCl(100mM)の2分間の注入により再生した。センサグラム処理及びデータ分析を、ProteOn Manager 3.1.0(Bio-Rad Laboratories, Inc.)で行った。既存の抗体の結合を示すセンサグラムを、1)ナノボディ−HSA解離及び2)参照リガンドレーンに対する非特異的結合を差し引くことによる二重参照後に得た。既存の抗体の結合レベルを、125秒(会合終了後5秒)で報告点を設定することにより決定した。既存の抗体結合における%低下を、参照ナノボディの125秒での結合レベルに対して算出した。
実施例1:S112K変異により既存の抗体の結合が阻害される
ヒトサンプル中の既存の抗体のナノボディへの結合における、112位における置換の影響を決定し、国際公開公報第12/175741号に記載されたC末端アラニン伸長の影響と比較した。
2つの参照化合物(C末端アラニン伸長を有さない参照A及びC末端アラニン伸長を有する参照B)及び112位に種々の変異を有するこれらの参照化合物の変異体を、6名の異なるRA患者から得られた血清及び異なる健康なヒト対象から得られた8つの血清に対して試験した。サンプル中の既存の抗体の試験したナノボディへの結合を、ProteOnにおいて、上記概説した全体的なプロトコールに従って測定した。結果を、以下の表Aに示す。
分かるように、試験した112位における変異の内、S112K変異により、(C末端アラニン伸長がS112K変異体に存在しなかった場合でも)C末端アラニン伸長の低下に匹敵する、試験した血清中に存在した既存の抗体による結合の低下が提供された。同様の結果を、3つのヒト血漿サンプルについて得た(データを示さず)。
Figure 2021130681
実施例2:ヒトSLEサンプル中に存在する既存の抗体の結合における、S112K変異の影響
実施例1で使用したのと同じナノボディ変異体を、全身性エリテマトーデス(SLE)について陽性であることが確認された患者から得られた7つの血清サンプルからの既存の抗体による結合について試験した。比較のために、2名の健康なヒトボランティアからの血漿サンプルを含めた。
サンプル中の既存の抗体の試験したナノボディへの結合を、ProteOnにおいて、上記概説した全体的なプロトコールに従って測定した。結果を、以下の表Bに示す。
参照A及び参照B、ならびに本発明のナノボディについての結合データの比較から分かるように、一部のSLE患者から得られたサンプルは、C末端アラニン残基が存在してもナノボディに結合することができる特定の既存の抗体を含有すると考えられる(C末端アラニン残基は、健康なボランティアからの血漿サンプル中に存在した既存の抗体の全ての結合を本質的に(部分的に又は本質的に完全に)妨げる/除去する)。
SLEサンプルからのこれらの既存の抗体の結合を、11及び112位における変異(及び、112位の場合には、特に、S112K)により、大きく低下させることができたことが更に分かる。
Figure 2021130681
実施例3:ヒトSLEサンプル中に存在する既存の抗体の結合における、組み合わせたフレームワーク変異及びC末端伸長の影響
(特定のフレームワーク変異を有し、C末端アラニン伸長を有する又は有さない)4種類のナノボディを、全身性エリテマトーデス(SLE)について陽性であることが確認された患者から得られた5つの血清サンプルからの既存の抗体の結合について試験した。比較のために、健康なヒトボランティアからの1つの血漿サンプルを含めた。
サンプル中の既存の抗体の試験したナノボディへの結合を、ProteOnにおいて、上記概説した全体的なプロトコールに従って測定した。結果を、以下の表C及びDに示す。
参照A及び参照Bについての結合データの比較から分かるように、SLE患者から得られたサンプルは、C末端アラニン残基が存在してもナノボディに結合することができる特定の既存の抗体を含有すると考えられる(C末端アラニン残基は、健康なボランティアからの血漿サンプル中に存在した既存の抗体の全ての結合を本質的に妨げる/除去する)。
SLEサンプルからのこれらの既存の抗体の結合を、11及び112位における変異(及び、112位の場合には、特に、S112K)により、大きく低下させることができたことが更に分かる。
実施例4:SLE患者からのサンプル中の既存の抗体の結合における、V89T変異の影響
本明細書で記載されたように、特定のSLE患者から得られたサンプルは、C末端伸長が存在する場合でも、VHドメインの露出したC末端に結合することができる既存の抗体/因子を含有すると考えられる。V89T変異が、C末端伸長の存在の有無に関わらず、このような結合を低下させ、又は、妨げ/除去することができるかを調査した。結果を、以下の表C及びEにも示す。
分かるように、V89T変異により、S112K変異と同程度に、SLE患者から得られたサンプル中に存在する既存の抗体の結合を本質的に妨げ/除去することができた。ただし、V89T変異を有し、C末端伸長を有さないナノボディと、S112K変異を有し、C末端伸長を有さない類似するナノボディとについての表C及びEに提供されたデータの比較から分かるように、C末端伸長を有さないナノボディ中の112位に変異を有することは、健康なボランティアからのサンプル中の既存の抗体の結合を、V89T変異より大きい程度に全体的に低下させる(すなわち、それぞれ100%、85%、及び64% S112Kナノボディ vs 9%、11%、及び16% V89Tナノボディ)。この理由で、112位における変異の使用(及び特に、S112K又はS112K)が、89位における変異(例えば、V89T)の使用を上回って、多くの場合好ましいであろう。
しかしながら、表C及びEにおけるデータからも分かるように、C末端アラニンをV89Tナノ抗体に付加することにより、健康なボランティアから得られたサンプル中の既存の抗体の結合を完全に妨げ/除去し、この理由で、V89Tナノボディ又はVHドメインが、それが存在するであろうタンパク質又はポリペプチド中に露出したC末端領域を有するか、又は、同領域を有することが意図される場合(例えば、V89Tナノボディ又はVHドメインが、同タンパク質又はポリペプチドのC末端を形成する場合)、本明細書で記載されたV89T変異とC末端伸長との組み合わせが、(すなわち、C末端伸長を有さないV89Tの使用を上回って)通常好ましいであろう。
Figure 2021130681
Figure 2021130681
Figure 2021130681
上記表からの結果/知見が広く適用できることを確認するために、S112K及び/又はV89T変異を有する代表的なナノボディを、96個(S112K)及び129個(V89T)のヒト血清サンプルの試験パネルに対して試験した。結合を、ProteOnにおいて、上記設定されたプロトコールを使用して決定した。
結果を、図3及び表F(S112K変異を有する代表的なナノボディ)と、図4及び表G(V89T変異を有する代表的なナノボディ)にまとめる。
図3において、S112K変異を有するナノボディ(参照A+S112K+C末端アラニン−上記表Cを参照のこと)を、参照ナノボディ(参照A;配列番号:44)と比較した。S112K変異を有するナノボディ及び参照Aを両方とも、それぞれの血清サンプルに対して試験した。125秒での結合レベル(RU)を決定した。ついで、データを、図3にプロットした。ここで、各点は、参照A(図3において(1)と示す)又はS112K変異(図3において(2)と示す)のいずれかについて、1つのサンプルにおいて測定された結合を表わす。破線は、測定結合レベル20RUを示す。
また、同じデータを、表F中に数値で表わす。表Fは、(参照A及びS112K変異それぞれについて)20RU超、20RU未満(すなわち、0〜20RU)、及び10RU未満の125秒での結合レベルを提供する試験したサンプルの総数に言及している。
参照Aについては、図3にプロットされ、表Fに示されたデータから分かるように、試験した96個のサンプルの内の半分超から、20RUを超える結合レベルが提供された(一部の場合では、150〜200RUの高さ)。このことは、サンプル中に存在する既存の抗体が、参照Aに結合したことを示している。比較により、S112K変異については、サンプルから、20RUを超える結合レベルが提供されなかった(及びほとんどが、10RU未満)。このことは、S112K変異は、試験した全96個のサンプル中の既存の抗体の結合を本質的に妨げ/除去することができたことを示している。
129個の血清サンプルに対して試験したV89T変異を有する代表的なナノボディ(参照A+L11V+V89T+C末端アラニン、上記表Eを参照のこと)について、類似するプロット及び類似するデータを、図4及び表Gそれぞれに示し、再度、参照A(図4において(1)で示す、V89T変異を、図4において(2)で示す)と比較した。再度、図4中のプロット及び表G中のデータから、わずかな例外を伴って(すなわち、試験したサンプルの内の10%未満、例えば、それらはそれぞれ、約100RU以下の125秒後の絶対結合値を提供した)、V89T変異は、試験した129個のサンプルのほとんどにおいて、既存の抗体の結合を低下させ/妨げることができたことがわかる。一方、V89T変異を有さない参照は、試験したサンプルのほとんどにおける既存の抗体に結合した。
Figure 2021130681
Figure 2021130681
実施例5:SLE患者からのサンプル中の既存の抗体の結合における、T110K又はT110Qと組み合わせたV89L変異の影響
本明細書で記載されたように、特定のSLE患者から得られたサンプルは、C末端伸長が存在する場合でも、VHドメインの露出したC末端に結合することができる既存の抗体/因子を含有すると考えられる。V89L及び/又はT110QもしくはT110K変異(又は、それらの組み合わせ)が、C末端伸長の存在の有無に関わらず、このような結合を低下させ、又は、妨げ/除去することができるかを調査した。結果を、以下の表H及びIにも示す。これらの表は、2つの別々の実験からのデータを表わす(上記表Dにも、V89L変異と組み合わせた本発明のS112Q変異についてのデータを示す)。また、表Iで使用されたナノボディを、図5及び表Jに示されたデータを生成するのにも使用した。
Figure 2021130681
Figure 2021130681
上記表からの結果/知見が広く適用できることを確認するために、再度、V89L、T110K、及び/又はT110Q変異を有する代表的なナノボディを、99個のヒト血清サンプルのパネルに対して試験した。再度、結合データを取得し、図3及び4ならびに表F及びGに示された結果及びデータについて、実施例4で示したのと同様にプロットした。
試験したナノボディを、図5で使用されたナンバリングに対応するナンバー:(1)参照A、(2)参照A+L11V+V89L+C末端Ala、(3)参照A+L11V+V89L+T110K+C末端Ala、(4)参照A+L11V+V89L+T110Q+C末端Ala、(5)参照A+L11V+T87A+V89L+C末端Alaとした。結果を、図5及び表Iに示す。
分かるように、再度、試験した変異を導入することにより、既存の抗体が試験したナノボディに結合することができたサンプル数が大きく減少した。図5におけるナノボディ(2)(参照A+L11V+V89L+C末端Ala)については、一部のサンプルは、20RUを超える(が、100RU未満の)レベルで125秒後の既存の抗体の結合を示したことも分かった。ただし、V89L変異をT110K変異(ナノボディ(3))又はT100Q変異(ナノボディ(4))と組み合わせた場合には、99個の試験した全てのサンプルは、20RU未満(及び実際には、10RU未満、表Jを参照のこと)の結合レベルを本質的に示した。
Figure 2021130681
実施例6:既存の抗体の結合についての多価構築物の試験
多価構築物を、下記ナノボディに基づいて調製する。
ナノボディA(治療ターゲットに対する):
Figure 2021130681

ナノボディB(血清アルブミンに対する):
Figure 2021130681

ナノボディC(治療ターゲットに対する):
Figure 2021130681
調製した構築物を、以下の表Kに列記する(各場合において、関連するナノボディ中に(存在する場合)導入された置換を、丸かっこ間に記載した。「HIS6」は、6つのヒスチジン残基のN末端his−タグを意味する。「−Ala」は、1つのアラニン残基のC末端伸長を意味する。
Figure 2021130681

Figure 2021130681

Figure 2021130681
代表的な多価構築物を、SLEを患う患者及び健康なボランティアから得られた血液又は血清サンプル中に存在する既存の抗体による結合について試験した。両方とも、本質的に上記されたProteOnを使用して決定した。
試験した代表的な構築物を、表L(三価構築物)及びM(二価構築物)に列記した。結果を、図6〜8及び表N〜Qに示す。試験した三価構築物を、参照構築物であるナノボディA−35GS−ナノボディA−35GS−ナノボディB(「参照X」)から得た。二価構築物を、参照構築物であるナノボディA−35GS−ナノボディB(「参照Y」)から得た。全ての構築物(参照構築物を除く)は、C末端アラニン残基ならびに「ナノボディA」及び「ナノボディB」構築ブロックのそれぞれに示された変異を有し、示した。
Figure 2021130681
Figure 2021130681
Figure 2021130681
Figure 2021130681
Figure 2021130681
また、3つの代表的な三価構築物を、SLE患者から得られた血清サンプルに対しても試験した。結果を、表Qに示す。
Figure 2021130681
実施例7:イオンチャネルKv1.3に対するナノボディ及びナノボディ構築物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、イオンチャネルKv1.3に対することができる。
同時係属中の米国仮出願第62/014,023号(発明の名称:「Kv1.3結合免疫グロブリン」;譲受人:Ablynx N.V.;出願日:2014年6月18日)及びその後に出願された同じ発明の名称の米国仮出願(出願日:2015年3月16日;譲受人:Ablynx N.V.)には、カリウム選択的電位作動型イオンチャネルKv1.3に対する免疫グロブリンシングル可変ドメイン(及び特に、ナノボディ)ならびに少なくとも1つのKv1.3に対するこのようなナノボディを含むタンパク質、ポリペプチド、及び他のナノボディ系構築物が、特に記載されている。
また、(場合により、本明細書及び/又は国際公開公報第12/175741号で記載されたC末端伸長と適切に組み合わせられた)本願で記載された変異は、これらの2つの米国仮出願に記載されたKv1.3に対するナノボディ、タンパク質、ポリペプチド、及び他のナノボディ系構築物に、適切に適用することができる。
このため、一態様において、本発明は、Kv1.3に対し、本発明のISVDについて本明細書で更に記載された(すなわち、本明細書で記載されたアミノ酸残基/変異を含む)VHドメインに関する。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたKv1.3に対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれにも具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、Kv1.3に対するVHドメインに関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、Kv1.3に対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
この実施例において言及されたKv1.3に対するVHドメインは、特に、米国仮出願第62/014,023号の第5〜10頁に記載されたCDR(このようなCDRの任意の好ましい態様/実施態様を含む)又は上記で参照された他の米国仮出願に記載されたその配列最適化バージョンを有することができる。
特に、この実施例において言及されたKv1.3に対するVHドメインは、特に、米国仮出願第62/014,023号の第9及び10頁に跨るリスト中に好ましい態様として列記されたCDR1、CDR2、及びCDR3の組み合わせの内の1つから選択される、CDR1、CDR2、及びCDR3の組み合わせを有することができる。
本発明の一部の好ましく、非限定的な態様では、
−本発明のVHドメイン中において、(i)CDR1(Kabatによる)は、配列番号:166の配列又は、配列番号:166の配列と1つもしくは2つのアミノ酸差を有するアミノ酸配列であり、(ii)CDR2(Kabatによる)は、配列番号:167の配列又は、配列番号:167の配列と1つもしくは2つのアミノ酸差を有するアミノ酸配列であり、そして(iii)CDR3(Kabatによる)は、配列番号:168の配列又は、配列番号:168の配列と1つもしくは2つのアミノ酸差を有するアミノ酸配列であり;及び更により好ましくは、(i)CDR1(Kabatによる)は、配列番号:166の配列であり、(ii)CDR2(Kabatによる)は、配列番号:167の配列であり、そして(iii)CDR3(Kabatによる)は、配列番号:168の配列であり、及び/又は、
−本発明のVHドメイン中において、(i)CDR1(Abmによる)は、配列番号:169の配列又は、配列番号:169の配列と1つもしくは2つのアミノ酸差を有するアミノ酸配列であり、(ii)CDR2(Abmによる)は、配列番号:170の配列又は、配列番号:170の配列と1つもしくは2つのアミノ酸差を有するアミノ酸配列であり、そして(iii)CDR3(Abmによる)は、配列番号:171の配列又は、配列番号:171の配列と1つもしくは2つのアミノ酸差を有するアミノ酸配列であり;及び更により好ましくは、(i)CDR1(Abmによる)は、配列番号:169の配列であり、(ii)CDR2(Abmによる)は、配列番号:170の配列であり、そして(iii)CDR3(Abmによる)は、配列番号:178の配列である。
さらに、Kv1.3に対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、Kv1.3に対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることもできる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
例えば、限定されず、Kv1.3に対する本発明のVHドメインは、米国仮出願第62/014,023号の表A−1に列記された配列(米国仮出願第62/014,023号中の配列番号:1〜123)の内の1つ、又は、米国仮出願、発明の名称「Kv1.3結合免疫グロブリン」(譲受人:Ablynx N.V.;出願日:2015年3月16日)の表A−1に列記された配列(前記米国仮出願中の配列番号:1〜123、495、498〜513、又は523〜540、及び特に、配列番号:495の配列)の内の1つであることができ、適切に、本発明のISVDについて本明細書で記載された変異/特定のアミノ酸残基を有し、及び場合により、適切に、C末端伸長を有する。
具体的な一態様では、Kv1.3に対する本発明のナノボディは、配列番号:137のナノボディの変異体(配列番号:137に対して少なくとも90%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
Kv1.3に対する本発明のナノボディ及びそれを含む本発明の化合物の一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、図9A(一価ナノボディ:配列番号:138〜155)及び図9B(三価の二重特異性半減期延長構築物:配列番号:156〜164)に列記する。配列番号:138〜155の抗Kv1.3ナノボディから選択される、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の抗Kv1.3ナノボディを含むか、又は、本質的に同ナノボディからなる本発明の化合物は、本発明の更なる態様を構成する。また、配列番号:156〜164の化合物はそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。具体的な一態様では、このような化合物は、Kv1.3に対する本発明の2つのこのようなナノボディと、1つのヒト血清アルブミンに対するナノボディ(好ましくは、本発明のナノボディでもある)とを含有する。また再度、このような構築物は、適切なリンカー及びC末端伸長も含有することができる。
配列番号:138〜155の一価の抗Kv1.3ナノボディを、本発明のL11V及びV89L変異を配列番号:137(参照)の開始配列に導入することにより生成した。加えて、種々の組み合わせのヒト化(又は他の配列最適化)変異を導入した(例えば、E1D、A14P、G19R、M53AもしくはM53QもしくはM53Y、T62S、A74S、K83R、S94G、及び/又はT97E)。配列番号:138〜155の配列のそれぞれに導入した具体的な変異を、図9Aに提供する。
また、図9Aからの一価の抗Kv1.3ナノボディの一部を、2つのKv1.3に対する本発明のナノボディと、1つのヒト血清アルブミンに対する本発明の半減期延長ナノボディ(配列番号:109、図9Bにおいて、「ALB−82」とも呼ばれる)とを含む三価の二重特異性構築物としてもフォーマットした。35GSリンカーを使用した。全ての構築物は、C末端伸長(1つのC末端アラニン残基)を有する。得られた構築物の配列を、配列番号:156〜164に提供する。これらの内、3つの構築物(配列番号:156、157、及び160)を、47名の糖尿病を患うヒト対象及び90名の健康なヒト対象から得られたサンプル中の既存の抗体による結合について、本明細書で記載された全体的なプロトコールを使用して試験した。これらの2つのセットからのサンプルによる既存の抗体による結合を、配列番号:165の参照構築物と比較した。同構築物は、再度、C末端アラニン伸長と組み合わせた、配列番号:137の参照抗Kv1.3構築ブロック及び血清アルブミンバインダーAlb−8(配列番号:46)に基づく対応する三価の二重特異性構築物である。結果を、図10(47名の糖尿病を患う患者からのサンプル)及び図11(90名の健康なボランティアからのサンプル)に示す。各場合において、本発明のL11V及びV89L変異を有する構築物は、参照構築物と比較して、既存の抗体による低下した結合を示した。
実施例8:IL−23に対するVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、IL−23に対することができる。
IL−23に対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがIL−23に特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、IL−23に対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、IL−23に対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたIL−23に対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれにも具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、IL−23に対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、IL−23に対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、IL−23に対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、IL−23に対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることもできる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、IL−23に対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:173の配列又は、配列番号:173の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:173の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:174の配列又は、配列番号:174の配列と1つもしくは2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:174の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:175の配列又は、配列番号:175の配列と1つもしくは2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:175の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のIL−23に対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:173であり、(ii)CDR2は、配列番号:174であり、(iii)CDR3は、配列番号:175である。
具体的な一態様では、IL−23に対する本発明のナノボディは、配列番号:172のナノボディの変異体(配列番号:172に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
別の好ましい態様では、IL−23に対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:191の配列又は、配列番号:191の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:191の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:192の配列又は、配列番号:192の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:192の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:193の配列又は、配列番号:193の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:193の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のIL−23に対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:191であり、(ii)CDR2は、配列番号:192であり、(iii)CDR3は、配列番号:193である。
具体的な一態様では、IL−23に対する本発明のナノボディは、配列番号:172のナノボディの変異体(配列番号:190に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。再度、このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
IL−23に対する本発明のこのようなナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:176〜189として図12Aに、配列番号:194〜207として図12Bにそれぞれ列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:176〜189及び/又は194〜207の本発明のナノボディを含む、IL−23に対する本発明の化合物に関する。再度、IL−23に対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表Rが参照される。
例えば、国際公開公報第2009/068627号、同第2010/142534号、及び同第2011/135026号に記載されたように、特に好ましい一分類のIL−23に対するナノボディ系化合物は、二重抗原結合性化合物である。このため、本発明の一態様では、IL−23に対する本発明の化合物は、配列番号:172の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例8で記載された)配列番号:172から得られた本発明のISVのいずれかと、配列番号:190の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例8で記載された)配列番号:190から得られた本発明のISVのいずれかをと含む二重抗原結合性構築物である。ただし、少なくとも一方(及び好ましくは、両方)のこれらのISVが、本発明のISVであるという条件である。また、このような二重抗原結合性構築物は、(すなわち、血清アルブミン結合ISVにより)半減期を伸ばすこともできる。このような二重抗原結合性構築物の一部の具体的な例は、配列番号:514〜549に提供される。
IL−23に対する本発明の化合物の一部の具体的に好ましい例を、配列番号:514〜549として図22に提供し、これらの化合物はそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。このため、別の態様では、本発明は、IL−23に対し、配列番号:514〜549からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドに関する。より一般的には、IL−23に対する本発明の化合物は、国際公開公報第2009/068627号、同第2010/142534号、及び同第2011/135026号に記載された通りであることができ、本発明のISVを含む。また、本発明の化合物は、国際公開公報第2009/068627号、同第2010/142534号、及び同第2011/135026号に記載された目的に使用することもできる。
Figure 2021130681

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実施例9:OX40−Lに対するVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、OX40−Lに対することができる。
OX40−Lに対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがOX40−Lに特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、OX40−Lに対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、OX40−Lに対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたOX40−Lに対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれに具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、OX40−Lに対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、OX40−Lに対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、OX40−Lに対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、OX40−Lに対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、OX40−Lに対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:209の配列又は、配列番号:209の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:209の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:210の配列又は、配列番号:210の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:210の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:211の配列又は、配列番号:211の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:211の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のOX40−Lに対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:209であり、(ii)CDR2は、配列番号:210であり、(iii)CDR3は、配列番号:211である。
具体的な一態様では、OX40−Lに対する本発明のナノボディは、配列番号:208のナノボディの変異体(配列番号:208に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
OX40−Lに対する本発明のナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:212〜225として図13に列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:212〜225の本発明のナノボディを含む、OX40−Lに対する本発明の化合物に関する。再度、OX40−Lに対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表Sが参照される。
OX40−Lに対する本発明の化合物の一部の具体的に好ましい例を、配列番号:550〜585として図23に提供する。これらの化合物はそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。このため、別の態様では、本発明は、OX40−Lに対し、配列番号:550〜585からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドに関する。より一般的には、OX40−Lに対する本発明の化合物は、国際公開公報第2011/073180号に記載された通りであることができ、本発明のISVを含む。また、本発明の化合物は、国際公開公報第2011/073180号に記載された目的に使用することもできる。
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実施例10:IgEに対するVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、IgEに対することができる。
IgEに対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがIgEに特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、IgEに対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、IgEに対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたIgEに対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれに具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、IgEに対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、IgEに対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、IgEに対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、IgEに対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、IgEに対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:227の配列又は、配列番号:227の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:227の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:228の配列又は、配列番号:228の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:228の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:229の配列又は、配列番号:229の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:229の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のIgEに対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:227であり、(ii)CDR2は、配列番号:228であり、(iii)CDR3は、配列番号:229である。
具体的な一態様では、IgEに対する本発明のナノボディは、配列番号:226のナノボディの変異体(配列番号:226に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
IgEに対する本発明のナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:230〜243として図14に列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:230〜243の本発明のナノボディを含む、IgEに対する本発明の化合物に関する。再度、IgEに対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表Tが参照される。
IgEに対する本発明の化合物の一部の具体的に好ましい例を、配列番号:586〜594として図24に提供する。これらの化合物はそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。このため、別の態様では、本発明は、IgEに対し、配列番号:586〜594からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドに関する。
より一般的には、IgEに対する本発明の化合物は、国際公開公報第2012/175740号及び同第2012/175400号の関連部分に記載された通りであることができ、本発明のISVを含む。また、本発明の化合物は、国際公開公報第2012/175740号に記載された目的に使用することもできる。
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実施例11:CXCR−4に対するVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、CXCR−4に対することができる。
CXCR−4に対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがCXCR−4に特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、CXCR−4に対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、CXCR−4に対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたCXCR−4に対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれに具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、CXCR−4に対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、CXCR−4に対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、CXCR−4に対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、CXCR−4に対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、CXCR−4に対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:245の配列又は、配列番号:245の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:245の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:246の配列又は、配列番号:246の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:246の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:247の配列又は、配列番号:247の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:247の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のCXCR−4に対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:245であり、(ii)CDR2は、配列番号:246であり、(iii)CDR3は、配列番号:247である。
具体的な一態様では、CXCR−4に対する本発明のナノボディは、配列番号:244のナノボディの変異体(配列番号:244に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
別の好ましい態様では、CXCR−4に対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:263の配列又は、配列番号:263の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:263の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:264の配列又は、配列番号:264の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:264の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:265の配列又は、配列番号:265の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:265の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のCXCR−4に対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:263であり、(ii)CDR2は、配列番号:264であり、(iii)CDR3は、配列番号:265である。
具体的な一態様では、IL−23に対する本発明のナノボディは、配列番号:262のナノボディの変異体(配列番号:262に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。再度、このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
CXCR−4に対する本発明のナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:248〜261として図15A及び配列番号:266〜279として図15Bにそれぞれ列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:248〜261及び/又は266〜279の本発明のナノボディを含む、CXCR−4に対する本発明の化合物に関する。再度、CXCR−4に対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表Uが参照される。
例えば、国際公開公報第2009/138519号、同第2011/042398号、及び同第2011/161266号に記載されたように、特に好ましい一分類のCXCR−4に対するナノボディ系化合物は、二重抗原結合性化合物である。このため、本発明の一態様では、CXCR−4に対する本発明の化合物は、配列番号:244の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例11で記載された)配列番号:244から得られた本発明のISVのいずれかと、配列番号:262の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例11で記載された)配列番号:262から得られた本発明のISVのいずれかとを含む二重抗原結合性構築物である。ただし、少なくとも一方(及び好ましくは、両方)のこれらのISVが、本発明のISVであるという条件である。また、このような二重抗原結合性構築物は、(すなわち、血清アルブミン結合ISVにより)半減期を伸ばすこともできる。このような二重抗原結合性構築物の一部の具体的な例は、配列番号:595〜603に提供される。
CXCR−4に対する本発明の化合物の一部の具体的に好ましい例を、配列番号:595〜603として図25に提供し、これらの化合物はそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。このため、別の態様では、本発明は、CXCR−4に対し、配列番号:595〜603からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドに関する。より一般的には、CXCR−4に対する本発明の化合物は、国際公開公報第2009/138519号、同第2011/042398号、及び同第2011/161266号、同第2011/144749号に記載された通りであることができ、本発明のISVを含む。また、本発明の化合物は、国際公開公報第2009/138519号、同第2011/042398号、及び同第2011/161266号に記載された目的に使用することもできる。
Figure 2021130681

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実施例12:HER−3に対するVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、HER−3に対することができる。
HER−3に対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがHER−3に特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、HER−3に対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、HER−3に対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたHER−3に対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれに具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、HER−3に対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、HER−3に対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、HER−3に対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、HER−3に対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、HER−3に対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:281の配列又は、配列番号:281の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:281の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:282の配列又は、配列番号:282の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:282の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:283の配列又は、配列番号:283の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:283の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のHER−3に対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:281であり、(ii)CDR2は、配列番号:282であり、(iii)CDR3は、配列番号:283である。
具体的な一態様では、HER−3に対する本発明のナノボディは、配列番号:280のナノボディの変異体(配列番号:280に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
別の好ましい態様では、HER−3に対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:299の配列又は、配列番号:299の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:299の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:300の配列又は、配列番号:300の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:300の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:301の配列又は、配列番号:301の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:301の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のHER−3に対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:299であり、(ii)CDR2は、配列番号:300であり、(iii)CDR3は、配列番号:301である。
具体的な一態様では、HER−3に対する本発明のナノボディは、配列番号:298のナノボディの変異体(配列番号:298に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。再度、このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
HER−3に対する本発明のナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:284〜297として図16A及び配列番号:302〜315として図16Bにそれぞれ列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:284〜297及び/又は302〜315の本発明のナノボディを含む、HER−3に対する本発明の化合物に関する。再度、HER−3に対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表Vが参照される。
例えば、国際公開公報第2011/144749号に記載されたように、特に好ましい一分類のHER−3に対するナノボディ系化合物は、二重抗原結合性化合物である。このため、本発明の一態様では、HER−3に対する本発明の化合物は、配列番号:280の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例12で記載された)配列番号:280から得られた本発明のISVのいずれかと、配列番号:298の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例12で記載された)配列番号:298から得られた本発明のISVのいずれかとを含む二重抗原結合性構築物である。ただし、少なくとも一方(及び好ましくは、両方)のこれらのISVが、本発明のISVであるという条件である。また、このような二重抗原結合性構築物は、(すなわち、血清アルブミン結合ISVにより)半減期を伸ばすこともできる。このような二重抗原結合性構築物の一部の具体的な例は、配列番号:604〜639に提供される。
HER−3に対する本発明の化合物の一部の具体的に好ましい例を、配列番号:604〜639として図26に提供し、これらの化合物はそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。このため、別の態様では、本発明は、HER−3に対し、配列番号:604〜639からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドに関する。より一般的には、HER−3に対する本発明の化合物は、国際公開公報第2011/144749号に記載された通りであることができ、本発明のISVを含む。また、本発明の化合物は、国際公開公報第2011/144749号に記載された目的に使用することもできる。
Figure 2021130681

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実施例13:TNFに対するVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、TNFに対することができる。
TNFに対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがTNFに特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、TNFに対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、TNFに対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたTNFに対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれに具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、TNFに対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、TNFに対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、TNFに対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、TNFに対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、TNFに対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:317の配列又は、配列番号:317の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:317の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:318の配列又は、配列番号:318の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:318の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:319の配列又は、配列番号:319の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:319の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のTNFに対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:317であり、(ii)CDR2は、配列番号:318であり、(iii)CDR3は、配列番号:319である。
具体的な一態様では、TNFに対する本発明のナノボディは、配列番号:316のナノボディの変異体(配列番号:316に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
ここで、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
TNFに対する本発明のナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:320〜333として図17Aに列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:320〜333の本発明のナノボディを含む、TNFに対する本発明の化合物に関する。再度、TNFに対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表Wが参照される。一般的には、TNFが多価ターゲットであるため、2つ又は3つの抗TNF ISV(及び、適切な長さのリンカー、国際公開公報第06/122786号を参照のこと)を含む本発明の化合物が好ましい。
TNFに対する本発明の化合物の一部の具体的に好ましい例を、配列番号:640〜675として図27に提供し、これらの化合物はそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。このため、別の態様では、本発明は、TNFに対し、配列番号:640〜675からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドに関する。より一般的には、TNFに対する本発明の化合物は、国際公開公報第2006/122786号に記載された通りであることができ、本発明のISVを含む。また、本発明の化合物は、国際公開公報第2006/122786号に記載された目的に使用することもできる。
Figure 2021130681

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実施例14:TNFに対する更なるVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、TNFに対することができる。
TNFに対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがTNFに特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、TNFに対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、TNFに対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたTNFに対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれに具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、TNFに対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、TNFに対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、TNFに対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、TNFに対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、TNFに対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:335の配列又は、配列番号:335の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:335の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:336の配列又は、配列番号:336の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:336の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:337の配列又は、配列番号:337の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:337の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のTNFに対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:335であり、(ii)CDR2は、配列番号:336であり、(iii)CDR3は、配列番号:337である。
具体的な一態様では、TNFに対する本発明のナノボディは、配列番号:334のナノボディの変異体(配列番号:334に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
TNFに対する本発明のナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:338〜351として図17Bに列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:338〜351の本発明のナノボディを含む、TNFに対する本発明の化合物に関する。再度、TNFに対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表Xが参照される。一般的には、TNFが多価ターゲットであるため、2つ又は3つの抗TNF ISVを含む本発明の化合物が好ましい。
Figure 2021130681

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実施例15:c−Metに対するVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、c−Metに対することができる。
c−Metに対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがc−Metに特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、c−Metに対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、c−Metに対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたc−Metに対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれに具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、c−Metに対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、c−Metに対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、c−Metに対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、c−Metに対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、c−Metに対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:353の配列又は、配列番号:353の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:353の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:354の配列又は、配列番号:354の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:354の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:355の配列又は、配列番号:355の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:355の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のc−Metに対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:353であり、(ii)CDR2は、配列番号:354であり、(iii)CDR3は、配列番号:355である。
具体的な一態様では、c−Metに対する本発明のナノボディは、配列番号:352のナノボディの変異体(配列番号:352に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、
ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
別の好ましい態様では、c−Metに対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:371の配列又は、配列番号:371の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:371の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:372の配列又は、配列番号:372の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:372の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:373の配列又は、配列番号:373の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:373の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のc−Metに対する本発明のこのようなVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:371であり、(ii)CDR2は、配列番号:372であり、(iii)CDR3は、配列番号:373である。
具体的な一態様では、c−Metに対する本発明のナノボディは、配列番号:370のナノボディの変異体(配列番号:370に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
c−Metに対する本発明のナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:356〜369として図18A及び配列番号:374〜387として図18Bにそれぞれ列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:356〜369及び/又は374〜387の本発明のナノボディを含む、c−Metに対する本発明の化合物に関する。再度、c−Metに対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表Yが参照される。
例えば、国際公開公報第2013/045707号に記載されたように、特に好ましい一分類のc−Metに対するナノボディ系化合物は、二重抗原結合性化合物である。このため、本発明の一態様では、c−Metに対する本発明の化合物は、配列番号:352の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例15で記載された)配列番号:352から得られた本発明のISVのいずれかと、配列番号:370の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例15で記載された)配列番号:370から得られた本発明のISVのいずれかをと含む二重抗原結合性構築物である。ただし、少なくとも一方(及び好ましくは、両方)のこれらのISVが、本発明のISVであるという条件である。また、このような二重抗原結合性構築物は、(すなわち、血清アルブミン結合ISVにより)半減期を伸ばすこともできる。このような二重抗原結合性構築物の一部の具体的な例は、配列番号:676〜693に提供される。また、c−Metに対する二重抗原結合性構築物は、VEGF又はEGFRに対するISVを含むこともできる。再度、国際公開公報第2014/341309号が参照される。
c−Metに対する本発明の化合物の一部の具体的に好ましい例を、配列番号:676〜694として図28A及び28Bに提供し、これらの化合物はそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。このため、別の態様では、本発明は、c−Metに対し、配列番号:676〜694からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドに関する。より一般的には、c−Metに対する本発明の化合物は、国際公開公報第2013/045707号に記載された通りであることができ、本発明のISVを含む。また、本発明の化合物は、国際公開公報第2013/045707号に記載された目的に使用することもできる。
Figure 2021130681

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実施例16:RANK−Lに対するVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、RANK−Lに対することができる。
RANK−Lに対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがRANK−Lに特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、RANK−Lに対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、RANK−Lに対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたRANK−Lに対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれに具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、RANK−Lに対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、RANK−Lに対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、RANK−Lに対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、RANK−Lに対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであり、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通りであることができ、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、RANK−Lに対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:389の配列又は、配列番号:389の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:389の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:390の配列又は、配列番号:390の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:390の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:391の配列又は、配列番号:391の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:391の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のRANK−Lに対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:389であり、(ii)CDR2は、配列番号:390であり、(iii)CDR3は、配列番号:391である。
具体的な一態様では、RANK−Lに対する本発明のナノボディは、配列番号:388のナノボディの変異体(配列番号:388に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
RANK−Lに対する本発明のナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:392〜405として図19に列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:392〜405の本発明のナノボディを含む、RANK−Lに対する本発明の化合物に関する。再度、RANK−Lに対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表Zが参照される。
RANK−Lに対する本発明の化合物の一部の具体的に好ましい例を、配列番号:694〜729として図29に提供し、これらの化合物はそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。このため、別の態様では、本発明は、RANK−Lに対し、配列番号:694〜729からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドに関する。
より一般的には、RANK−Lに対する本発明の化合物は、国際公開公報第2008/142164号に記載された通りであることができ、本発明のISVを含む。また、本発明の化合物は、国際公開公報第2008/142164号に記載された目的に使用することもできる。
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実施例17:CXCR−7に対するVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、CXCR−7に対することができる。
CXCR−7に対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがCXCR−7に特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、CXCR−7に対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、CXCR−7に対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたCXCR−7に対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれに具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、CXCR−7に対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、CXCR−7に対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、CXCR−7に対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、CXCR−7に対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであり、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、CXCR−7に対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:407の配列又は、配列番号:407の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:407の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:408の配列又は、配列番号:408の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:408の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:409の配列又は、配列番号:409の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:409の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のCXCR−7に対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:407であり、(ii)CDR2は、配列番号:408であり、(iii)CDR3は、配列番号:409である。
具体的な一態様では、CXCR−7に対する本発明のナノボディは、配列番号:406のナノボディの変異体(配列番号:406に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
ここで、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
別の好ましい態様では、CXCR−7に対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:425の配列又は、配列番号:425の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:425の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:426の配列又は、配列番号:426の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:426の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:427の配列又は、配列番号:427の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:427の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のCXCR−7に対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:425であり、(ii)CDR2は、配列番号:426であり、(iii)CDR3は、配列番号:427である。
具体的な一態様では、CXCR−7に対する本発明のナノボディは、配列番号:424のナノボディの変異体(配列番号:424に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。再度、このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
CXCR−7に対する本発明のナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:410〜423として図20A及び配列番号:428〜441として図20Bに列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:410〜423及び/又は428〜441の本発明のナノボディを含む、CXCR−7に対する本発明の化合物に関する。再度、CXCR−7に対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表AAが参照される。
例えば、国際公開公報第2012/130874号に記載されたように、特に好ましい一分類のCXCR−7に対するナノボディ系化合物は、二重抗原結合性化合物である。このため、本発明の一態様では、CXCR−7に対する本発明の化合物は、配列番号:406の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例17で記載された)配列番号:406から得られた本発明のISVのいずれかと、配列番号:424の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例17で記載された)配列番号:424から得られた本発明のISVのいずれかとを含む二重抗原結合性構築物である。ただし、少なくとも一方(及び好ましくは、両方)のこれらのISVが、本発明のISVであるという条件である。また、このような二重抗原結合性構築物は、(すなわち、血清アルブミン結合ISVにより)半減期を伸ばすこともできる。
より一般的には、CXCR−7に対する本発明の化合物は、国際公開公報第2012/130874号に記載された通りであり、本発明のISVを含む。また、本発明の化合物は、国際公開公報第2012/130874号に記載された目的に使用することもできる。
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実施例18:A−ベータに対するVHドメイン(及び特に、ナノボディ)及びそれを含む本発明の化合物
具体的な一態様では、本発明のVHドメイン(及び特に、本発明のISVD、及びとりわけ、本発明のナノボディ)及び本発明の化合物は、A−ベータに対することができる。
A−ベータに対する本発明のこのようなVHドメインは、(i)本明細書で記載された本発明のアミノ酸残基/変異を適切に含む適切なフレームワーク配列、及び、(ii)本発明のVHドメインがA−ベータに特異的に結合するのを可能にするCDR配列を、概ね含むであろう。また加えて、A−ベータに対する本発明のこのようなVHドメインは、特に、前記VHドメインが一価であるか、又は、前記VHドメインが(再度、本明細書で更に記載されたように)存在する本発明の化合物のC末端を形成する場合、本明細書で記載されたC末端伸長を適切に有することもできる。さらに、A−ベータに対する本発明のこのようなVHドメインは、本明細書で更に記載された通りであることができ、特に、ISVDであることができる。
再度、本明細書で記載された本発明の他の態様及び実施態様についてと同様に、具体的なISVD(例えば、この実施例で記載されたA−ベータに対するISVD)又はそれを含む化合物が、「本発明の」又は「本明細書で更に記載された」と言われる場合、本発明のISVD又は化合物について本明細書で全体的に記載された好ましい態様/実施態様及び選択も、他の方法で明確に示さない限り、又は、他の方法で必要とされる具体的な技術的文脈が無い限り、前記具体的なISVD又は化合物それぞれに具体的に適用する。
このため、特定の態様では、本発明は、A−ベータに対するVHドメイン(及び特に、ISVD)に関し、ここで、(i)112位が、KもしくはQであり、又は、(ii)110位が、KもしくはQであり、11位が、Vであり、又は、(iii)89位が、Tであり、又は、(iv)89位が、Lであり、110位が、KもしくはQであり、又は、(v)11位が、Vであり、89位が、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。特に、A−ベータに対するこのようなVHドメインにおいて、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。
さらに、A−ベータに対する本発明のVHドメインは、本明細書で記載された通りであることができ、再度特に、A−ベータに対するISVD(及びとりわけ、ナノボディ)、又は、少なくとも1つのこのようなISVDを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物であることができる。また、このようなタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、例えば、延長した半減期を有することができ(すなわち、本明細書で記載された通り、例えば、少なくとも1日、好ましくは少なくとも3日、より好ましくは少なくとも7日、例えば、少なくとも10日のヒト対象における半減期−t1/2ベータとして表現−)、及びこの目的で、例えば、血清アルブミン結合ナノボディを含むことができる。また、同ナノボディは、(再度、本明細書で記載された)本発明の血清アルブミン結合ナノボディであることができる。
また、このようなISVDは、特に、前記ISVDが(再度、本明細書で更に記載された)それを含むタンパク質、ポリペプチド、又は他の化合物もしくは構築物のC末端を形成する場合、(本明細書及び国際公開公報第12/175741号で更に記載された)C末端伸長を適切に有することができる。
好ましい一態様では、A−ベータに対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:461の配列又は、配列番号:461の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:461の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:462の配列又は、配列番号:462の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:462の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:463の配列又は、配列番号:463の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:463の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のA−ベータに対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:461であり、(ii)CDR2は、配列番号:462であり、(iii)CDR3は、配列番号:463である。
具体的な一態様では、A−ベータに対する本発明のナノボディは、配列番号:460のナノボディの変異体(配列番号:460に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
別の好ましい態様では、A−ベータに対する本発明のVHドメインは、(i)配列番号:479の配列又は、配列番号:479の配列と1つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:479の配列が好ましい)であるCDR1配列、(ii)配列番号:480の配列又は、配列番号:480の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:480の配列が好ましい)であるCDR2配列、及び、(iii)配列番号:481の配列又は、配列番号:481の配列と1つ又は2つのアミノ酸差のみを有するアミノ酸配列(配列番号:481の配列が好ましい)であるCDR3配列を含む。
より好ましくは、この態様のA−ベータに対する本発明のVHドメインにおいて、(i)CDR1は、配列番号:479であり、(ii)CDR2は、配列番号:480であり、(iii)CDR3は、配列番号:481である。
具体的な一態様では、A−ベータに対する本発明のナノボディは、配列番号:478のナノボディの変異体(配列番号:478に対して、少なくとも90%の配列同一性、例えば、少なくとも95%の配列同一性を有する)であり、ここで、
−11位におけるアミノ酸残基は、好ましくは、L、V、又はKから選択され(及び最も好ましくは、Vであり)、及び、
−14位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−41位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、A又はPから選択され、及び、
−89位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、V、又はLから選択され、及び、
−108位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、Q又はLから選択され、及び、
−110位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、T、K、又はQから選択され、及び、
−112位におけるアミノ酸残基は、好ましくは適切に、S、K、又はQから選択され、
このため、下記のいずれか、(i)112位は、KもしくはQであり、又は、(ii)110位は、KもしくはQであり、11位は、Vであり、又は、(iii)89位は、Tであり、又は、(iv)89位は、Lであり、110位は、KもしくはQであり、又は、(v)11位は、Vであり、89位は、Lであり、又は、(i)〜(v)の任意の適切な組み合わせである。再度、このようなISVのCDRは、好ましくは、先の2つの段落で定義された通りである。
A−ベータに対する本発明のナノボディの一部の具体的に好ましく、非限定的な例を、配列番号:464〜477として図21A及び配列番号:482〜495として図21Bに列記する。これらのナノボディはそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。
また、本発明は、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の配列番号:464〜477及び/又は482〜495の本発明のナノボディを含む、A−ベータに対する本発明の化合物に関する。再度、A−ベータに対する本発明のこのような化合物は、本明細書で更に記載された通りであることができ、このため、例えば、適切なリンカーを含むことができ、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができ、半減期を伸ばすことができる(例えば、本発明の化合物が、ヒト血清アルブミンに対するナノボディ、例えば(好ましくは)、ヒト血清アルブミンに対する本発明のナノボディを含むため)。以下の表BBが参照される。
例えば、国際公開公報第2006/040153号、及び特に、欧州特許第2542579号に記載されたように、特に好ましい一分類のA−ベータに対するナノボディ系化合物は、二重抗原結合性化合物である。このため、本発明の一態様では、A−ベータに対する本発明の化合物は、配列番号:460の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例17で記載された)配列番号:460から得られた本発明のISVのいずれかと、配列番号:478の1つのISV又は(好ましくは)(この実施例17で記載された)配列番号:478から得られた本発明のISVのいずれかとを含む。ただし、少なくとも一方(及び好ましくは、両方)のこれらのISVが、本発明のISVであるという条件である。また、このような二重抗原結合性構築物は、(すなわち、血清アルブミン結合ISVにより)半減期を伸ばすこともできる。このような二重抗原結合性構築物の一部の具体的な例は、配列番号:730〜766に提供される。
A−ベータに対する本発明の化合物の一部の具体的に好ましい例を、配列番号:730〜766として図30に提供し、これらの化合物はそれぞれ、本発明の更なる態様を構成する。このため、別の態様では、本発明は、A−ベータに対し、配列番号:730〜766からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドに関する。より一般的には、A−ベータに対する本発明の化合物は、国際公開公報第2006/040153号に記載された通りであることができ、及び特に、欧州特許第2542579号に記載された通りであることができ、本発明のISVを含む。また、本発明の化合物は、国際公開公報第2006/040153号、及び特に、欧州特許第2542579号に記載された目的に使用することもできる。
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実施例19:既存の抗体による結合についての抗A−ベータ構築物の試験
3つの半減期延長抗A−ベータ構築物(一般式[A−ベータ−1]−9GS−ALB8−9GS−[A−ベータ−2]−A)を試験し、既存の抗体による結合について、本明細書で記載された全体的なプロトコールを使用して比較した。本発明の2つの構築物は、3つ全ての構築ブロック中(すなわち、2つの抗A−ベータナノボディ中及び血清アルブミン結合ナノボディ中)に本発明の示された変異を有した。参照構築物(配列番号:766)は、いずれの構築ブロック中にも、本発明の変異を有さなかった。試験した全ての構築物は、C末端アラニンを有する。結果を、表CC−1及び図31Aに提供する。
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また、該構築物のC末端に存在する抗A−ベータナノボディを、(C末端アラニンを有する)一価の構築物として別々に試験した。結果を、表CC−2及び図31Bに提供する。
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実施例20:本発明の血清アルブミンバインダーの概観
以下の表DD及びEEは、Alb−8(表DD)及びAlb−23(表EE)それぞれに基づく、本発明の血清アルブミン結合ナノボディの一部の好ましく、非限定的な例を提供する。
言及されたように、また、本発明は、以下の表DD又はEEに列記された血清アルブミン結合ナノボディの内の1つを含む、ポリペプチド、タンパク質、化合物、又は構築物(及び特に、本発明の化合物)に関する。このようなポリペプチド、タンパク質、化合物、又は構築物(及び特に、本発明の化合物)は、少なくとも1つの治療ターゲットに対する、少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、又は3つ)の結合ドメイン又は結合ユニット(例えば、ISVD、及び特に、本発明のISV)を更に含むことができる。再度、このようなポリペプチド、タンパク質、化合物、又は構築物は、適切に、治療ターゲットに対して、単特異性、二重特異性、又は三重特異性であることができ、二価、三価、四価、又はより高い価であることができる。また通常、このようなポリペプチド、タンパク質、化合物、又は構築物は、適切なリンカーを含有するであろうし、本明細書で記載されたC末端伸長を含むことができる。
特に、このようなポリペプチド、タンパク質、化合物、又は構築物は、(本明細書で記載された)本発明の化合物であることができ、及び/又は、本発明の化合物(本発明についての好ましい実施態様を含む。このため、ISVD、及び特に、ナノボディを含む化合物が特に好ましい)について、本明細書で更に記載された通りであることができる。したがって、表DD又はEEに列記された血清アルブミン結合ナノボディの内の1つを含む本発明の化合物は、本発明の更なる態様を構成する。
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Claims (72)

  1. VHドメインであって、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び/又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、及び/又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくはVであり、ここで、前記VHドメインは、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する、
    VHドメイン。
  2. 免疫グロブリンシングル可変ドメインである、請求項1記載のVHドメイン。
  3. ナノボディである、請求項2記載のVHドメイン。
  4. 112位におけるアミノ酸残基は、K又はQの一方である、VHドメイン。
  5. C末端伸長(X)[同伸長中、nが、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xが、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する、請求項4記載のVHドメイン。
  6. 免疫グロブリンシングル可変ドメインである、請求項4又は5記載のVHドメイン。
  7. ナノボディである、請求項6記載のVHドメイン。
  8. VHドメインであって、89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、ここで、前記VHドメインは、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する、
    VHドメイン。
  9. 免疫グロブリンシングル可変ドメインである、請求項8記載のVHドメイン。
  10. ナノボディである、請求項9記載のVHドメイン。
  11. 89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQの一方である、VHドメイン。
  12. 前記VHドメインが、C末端伸長(X)[同伸長中、nが、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xが、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する、請求項11記載のVHドメイン。
  13. 免疫グロブリンシングル可変ドメインである、請求項11又は12記載のVHドメイン。
  14. ナノボディである、請求項13記載のVHドメイン。
  15. 11位におけるアミノ酸残基は、Vであり、110位におけるアミノ酸残基は、K又はQの一方である、VHドメイン。
  16. 前記VHドメインが、C末端伸長(X)[同伸長中、nが、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xが、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する、請求項15記載のVHドメイン。
  17. 免疫グロブリンシングル可変ドメインである、請求項15又は16記載のVHドメイン。
  18. ナノボディである、請求項17記載のVHドメイン。
  19. 89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、11位におけるアミノ酸残基は、Vである、VHドメイン。
  20. 前記VHドメインが、C末端伸長(X)[同伸長中、nが、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xが、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する、請求項19記載のVHドメイン。
  21. 免疫グロブリンシングル可変ドメインである、請求項19又は20記載のVHドメイン。
  22. ナノボディである、請求項21記載のVHドメイン。
  23. VHドメインであって、
    11位におけるアミノ酸残基は、L、V、又はKの内の1つであり、及び
    14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び
    41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び
    89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び
    108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び
    110位におけるアミノ酸残基は、T、K、又はQの内の1つであり、及び
    112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
    ここで、(i)112位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び/又は、(ii)89位におけるアミノ酸残基は、Tであり、及び/又は、(iii)89位におけるアミノ酸残基は、Lであり、110位におけるアミノ酸残基は、KもしくはQの一方であり、及び、(iv)(i)〜(iii)の各場合において、11位におけるアミノ酸は、好ましくはVであり、
    ここで、前記VHドメインは、場合により、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する、
    VHドメイン。
  24. 免疫グロブリンシングル可変ドメインである、請求項23記載のVHドメイン。
  25. ナノボディである、請求項23又は24記載のVHドメイン。
  26. 112位におけるアミノ酸残基が、K又はQの一方である、請求項23〜25のいずれか一項記載のVHドメイン。
  27. 89位におけるアミノ酸残基が、Tである、請求項23〜25のいずれか一項記載のVHドメイン。
  28. 89位におけるアミノ酸残基が、Lであり、110位におけるアミノ酸残基が、K又はQの一方である、請求項23〜25のいずれか一項記載のVHドメイン。
  29. 89位におけるアミノ酸残基が、Lであり、11位におけるアミノ酸残基が、Vである、請求項23〜25のいずれか一項記載のVHドメイン。
  30. 前記VHドメインが、C末端伸長(X)[同伸長中、nが、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xが、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する、請求項23〜29のいずれか一項記載のVHドメイン。
  31. VHドメインであって、
    11位におけるアミノ酸残基は、Lであり、及び
    14位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び
    41位におけるアミノ酸残基は、A又はPの一方であり、及び
    89位におけるアミノ酸残基は、T、V、又はLの内の1つであり、及び
    108位におけるアミノ酸残基は、Q又はLの一方であり、及び
    110位におけるアミノ酸残基は、K又はQの一方であり、及び
    112位におけるアミノ酸残基は、S、K、又はQの内の1つであり、
    ここで、前記VHドメインは、場合により、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する、
    VHドメイン。
  32. 免疫グロブリンシングル可変ドメインである、請求項31記載のVHドメイン。
  33. ナノボディである、請求項31又は32記載のVHドメイン。
  34. 前記VHドメインが、C末端伸長(X)[同伸長中、nは、1〜10、好ましくは、1〜5、例えば、1、2、3、4、又は5(及び好ましくは、1又は2、例えば、1)であり、各Xは、(好ましくは、天然の)アミノ酸残基であり、アラニン(A)、グリシン(G)、バリン(V)、ロイシン(L)、又はイソロイシン(I)から独立して選択され、好ましくは、これらからなる群より独立して選択される]を含有する、請求項30〜32のいずれか一項記載のVHドメイン。
  35. ヒト血清アルブミンに特異的に結合することができる、請求項1〜34のいずれか一項記載のVHドメイン。
  36. 免疫グロブリンシングル可変ドメインである、請求項35記載のVHドメイン。
  37. ナノボディである、請求項36記載のVHドメイン。
  38. 請求項1〜7のいずれか一項記載のVHドメインのライブラリ。
  39. 請求項1〜7のいずれか一項記載のVHドメインをコードする核酸残基のライブラリ。
  40. 発現ライブラリである、請求項39記載のライブラリ。
  41. 合成ライブラリである、請求項38〜40のいずれか一項記載のライブラリ。
  42. 少なくとも100種類の配列、例えば、少なくとも1000種類の配列、特に、10種類を超える配列、とりわけ、10種類を超える配列、例えば、10〜1010種類以上の配列を含有する、請求項38〜41のいずれか一項記載のライブラリ。
  43. 請求項8〜10のいずれか一項記載のVHドメインのライブラリ。
  44. 請求項8〜10のいずれか一項記載のVHドメインをコードする核酸残基のライブラリ。
  45. 発現ライブラリである、請求項44記載のライブラリ。
  46. 合成ライブラリである、請求項43〜45のいずれか一項記載のライブラリ。
  47. 少なくとも100種類の配列、例えば、少なくとも1000種類の配列、特に、10種類を超える配列、とりわけ、10種類を超える配列、例えば、10〜1010種類以上の配列を含有する、請求項43〜46のいずれか一項記載のライブラリ。
  48. 請求項11〜14のいずれか一項記載のVHドメインのライブラリ。
  49. 請求項11〜14のいずれか一項記載のVHドメインをコードする核酸残基のライブラリ。
  50. 発現ライブラリである、請求項48記載のライブラリ。
  51. 合成ライブラリである、請求項48〜50のいずれか一項記載のライブラリ。
  52. 少なくとも100種類の配列、例えば、少なくとも1000種類の配列、特に、10種類を超える配列、とりわけ、10種類を超える配列、例えば、10〜1010種類以上の配列を含有する、請求項48〜51のいずれか一項記載のライブラリ。
  53. 請求項15〜18のいずれか一項記載のVHドメインのライブラリ。
  54. 請求項15〜18のいずれか一項記載のVHドメインをコードする核酸残基のライブラリ。
  55. 発現ライブラリである、請求項54記載のライブラリ。
  56. 合成ライブラリである、請求項53〜55のいずれか一項記載のライブラリ。
  57. 少なくとも100種類の配列、例えば、少なくとも1000種類の配列、特に、10種類を超える配列、とりわけ、10種類を超える配列、例えば、10〜1010種類以上の配列を含有する、請求項53〜56のいずれか一項記載のライブラリ。
  58. 請求項19〜22のいずれか一項記載のVHドメインのライブラリ。
  59. 請求項19〜22のいずれか一項記載のVHドメインをコードする核酸残基のライブラリ。
  60. 発現ライブラリである、請求項59記載のライブラリ。
  61. 合成ライブラリである、請求項58〜60のいずれか一項記載のライブラリ。
  62. 少なくとも100種類の配列、例えば、少なくとも1000種類の配列、特に、10種類を超える配列、とりわけ、10種類を超える配列、例えば、10〜1010種類以上の配列を含有する、請求項58〜61のいずれか一項記載のライブラリ。
  63. 請求項23〜30のいずれか一項記載のVHドメインのライブラリ。
  64. 請求項23〜30のいずれか一項記載のVHドメインをコードする核酸残基のライブラリ。
  65. 発現ライブラリである、請求項64記載のライブラリ。
  66. 合成ライブラリである、請求項63〜65のいずれか一項記載のライブラリ。
  67. 少なくとも100種類の配列、例えば、少なくとも1000種類の配列、特に、10種類を超える配列、とりわけ、10種類を超える配列、例えば、10〜1010種類以上の配列を含有する、請求項63〜66のいずれか一項記載のライブラリ。
  68. 請求項31〜37のいずれか一項記載のVHドメインのライブラリ。
  69. 請求項31〜37のいずれか一項記載のVHドメインをコードする核酸残基のライブラリ。
  70. 発現ライブラリである、請求項69記載のライブラリ。
  71. 合成ライブラリである、請求項68〜70のいずれか一項記載のライブラリ。
  72. 少なくとも100種類の配列、例えば、少なくとも1000種類の配列、特に、10種類を超える配列、とりわけ、10種類を超える配列、例えば、10〜1010種類以上の配列を含有する、請求項68〜71のいずれか一項記載のライブラリ。
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