JP2018520152A - 免疫原性プレプロカルシトニンペプチド - Google Patents
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Abstract
Description
− プロテアソームと呼ばれる多酵素複合体による抗原の細胞質ゾルでの分解、
− この分解の結果生じるペプチドの、TAP輸送体による小胞体(ER;endoplasmic reticulum)内への移動、
− これらペプチドとMHC分子との結合による、安定したペプチド/MHC複合体の形成と、その細胞表面への搬出。
− 以下ではppCT1−15とも呼称されるMGFQKFSPFLALSIL(配列番号1);
− 以下ではppCT71−85とも呼称されるEREGSSLDSPRSKRC(配列番号2);
− 以下ではppCT86−100とも呼称されるGNLSTCMLGTYTQDF(配列番号3);
− 以下ではppCT9−17とも呼称されるFLALSILVL(配列番号4);
− 以下ではppCT16−25とも呼称されるVLLQAGSLHA(配列番号5);
− 以下ではppCT50−59とも呼称されるLLAALVQDYV(配列番号6);
− 以下ではppCT91−100とも呼称されるCMLGTYTQDF(配列番号7);
− 以下ではppCT45−60とも呼称されるEARLLLAALVQDYVQ(配列番号8);
− 以下ではppCT1−10とも呼称されるMGFQKFSPFL(配列番号9);
− 以下ではppCT3−12とも呼称されるFQKFPFLAL(配列番号10);
− 以下ではppCT5−14とも呼称されるKFSPFLALSI(配列番号11);
− 以下ではppCT6−15とも呼称されるFSPFLALSIL(配列番号12);
− 以下ではppCT87−96とも呼称されるNLSTCMLGTY(配列番号13);
− 以下ではppCT88−97とも呼称されるLSTCMLGTYT(配列番号14);
− 以下ではppCT96−105とも呼称されるYTQDFNKFHT(配列番号15);
− 以下ではppCT41−50とも呼称されるTLSEDEARLL(配列番号16);
− 以下ではppCT53−62とも呼称されるALVQDYVQMK(配列番号17);および
− 以下ではppCT58−66とも呼称されるYVQMKASEL(配列番号18)。
− 配列番号1、2、3、5および6の配列の組み合わせ;
− 配列番号1、3、4、5および6の配列の組み合わせ;
− 配列番号1、2、5および6の配列の組み合わせ;
− 配列番号1、3、5および6の配列の組み合わせ;
− 配列番号3、4、5および6の配列の組み合わせ
が含まれ、これらの組み合わせは、前述の配列および上記のような少なくとも一つの免疫チェックポイント阻害剤、特に抗PD−1モノクローナル抗体、好ましくは抗hPD−1抗体、ならびに/または配列番号19、20および/もしくは21の配列のうちの一つを含む。
ペプチド
以下のペプチドを選択した:
ppCT9−17 FLALSILVL(配列番号4);
ppCT16−25 VLLQAGSLHA(配列番号5);
ppCT50−59 LLAALVQDYV(配列番号6);
ppCT91−100 CMLGTYTQDF(配列番号7)。
Ficollにより11人の肺非小細胞癌(NSCLC)患者の末梢血単核細胞(PBMC;peripheral blood mononuclear cells)を末梢血から分離した。ペプチドごとに、20μMのペプチドによりPBMCを二回(D0およびD7)刺激した。PBMCを96ウェルプレートで2週間、2,000万細胞/プレートの割合で、完全培地(RPMI1640、10%SAB、1%ピルビン酸ナトリウム、0.1%ペニシリン/ストレプトアビジン)でIL−2(20IU/ml)+IL−4(10ng/ml)+IL−7(10ng/ml)の存在下で培養した。
15日後に、PBMCを、100μg/mlのブレフェルジンAの存在下で、第一刺激ステップの間に使用したペプチド2.5μMで再び刺激し、37℃、5%CO2で6時間インキュベートした。その後、細胞を抗CD8−APC抗体で20分間インキュベートし、その後PBS中で洗浄し、PBS−ホルムアルデヒド2%で固定し、BSA/サポニンにより透過処理する。その後、細胞を抗IFN−γ−PE抗体でインキュベートする。フローサイトメトリにより分析を行う。マン−ホイットニー検定を用いて統計研究を行い、統計的に有意な増加を示す(*p<0.05;**p<0.01;***p<0.005)。
結果を図2に示す。
ペプチド
以下のペプチドを選択した:
ppCT1−15:MGFQKFSPFLALSIL(配列番号1);
ppCT71−85:EREGSSLDSPRSKRC(配列番号2);
ppCT86−100:GNLSTCMLGTYTQDF(配列番号3);
ppCT9−17 FLALSILVL(配列番号4);
ppCT16−25 VLLQAGSLHA(配列番号5);
ppCT50−59 LLAALVQDYV(配列番号6);
ppCT91−100 CMLGTYTQDF(配列番号7)。
Ficollにより3人の肺非小細胞癌患者の末梢血単核細胞(PBMC)を末梢血から分離し、その後、図3に記載の各ペプチド20μMで、または等モル濃度の20μMの各ペプチドで、二回(D0およびD7)刺激した。PBMCを96ウェルプレートで2週間、2,000万細胞/プレートの割合で、完全培地(RPMI1640、10%SAB、1%ピルビン酸ナトリウム、0.1%ペニシリン/ストレプトアビジン)でIL−2(20IU/ml)+IL−4(10ng/ml)+IL−7(10ng/ml)の存在下で培養する。
15日後にPBMCを回収し、ELISPOTプレートで100,000細胞/ウェルの割合で、2.5μMの各ペプチドまたは刺激のために使用した2.5μMの各ペプチドの等モルの組み合わせを含む培地の存在下でインキュベートする。プレートを、37℃および5%CO2で15〜18時間インキュベートする。製造業者の指示(Gen−Probe Diaclone)にしたがってIFNγスポットを明らかにする。C.T.L Immunospotシステム(Cellular Technology Ltd)を使用して、IFNγ分泌細胞により形成されるスポットを計数および分析する。マン−ホイットニー検定を用いて統計研究を行い、統計的に有意な増加を示す(*p<0.05;**p<0.01;***p<0.005)。
結果は図4に示される。
ペプチド
以下のペプチドを選択した:
ppCT1−15:MGFQKFSPFLALSIL(配列番号1);
ppCT71−85:EREGSSLDSPRSKRC(配列番号2);
ppCT86−100:GNLSTCMLGTYTQDF(配列番号3);
ppCT9−17 FLALSILVL(配列番号4);
ppCT16−25 VLLQAGSLHA(配列番号5);
ppCT50−59 LLAALVQDYV(配列番号6);
ppCT91−100 CMLGTYTQDF(配列番号7)。
抗原ppCTを発現する(甲状腺髄様腫瘍からの)ヒトTT腫瘍細胞株および(患者HeuのNSCLC腫瘍から分離された)IGR−Heu腫瘍細胞株を標的細胞として使用する。(慢性骨髄性白血病の患者からの)K562細胞株を陰性対照として使用する。(患者HeuのBリンパ球からの)Heu−EBV株を溶解の特異性を決定するために使用する。51Crで標識後、Heu−EBV細胞を、(図4に記載される)20μMの各ペプチドを含む等モル混合物でインキュベートする。
HLA−A2分子のトランスジェニックマウスに、100μMの各ペプチドの等モル混合物を含む100μlのペプチドの組み合わせとアジュバント(25μgのPoly(I:C))とを用いて、側腹部皮下に4回(D0、D7、D14およびD21)免疫化を行った(図4)。最初の注射の28日後に、マウスを屠殺して脾細胞を回収し、完全培地(RPMI1640、10%FBS、1%ピルビン酸ナトリウム、0.1%ペニシリン/ストレプトアビジン)でIL−2(20IU/ml)の存在下で一晩培養した。
翌日、10μg/mlのブレフェルジンAの存在下で、単独または組み合わせでの2.5μMの各ペプチドで脾細胞を刺激し、37℃、5%CO2で6時間インキュベートした。その後、細胞を抗CD8−PE抗体で20分間インキュベートし、その後PBS中で洗浄し、PBS−ホルムアルデヒド2%で固定し、BSA/サポニンで透過処理する。その後、細胞を抗IFNγ−APC抗体でインキュベートする。フローサイトメトリにより分析を行う。
ペプチドの組み合わせC1〜C6によるマウスの免疫化後に分離された脾細胞のフローサイトメトリ分析は、IFNγを発現するCD8 Tリンパ球の割合の増加を示す(図5A)。この増加は使用される組み合わせに依存し、3〜13倍(C1で4.8倍、C2で3倍、C3で3.4倍、C4で5.5倍、C5で4.3倍およびC6で13.6倍)の変化を含む。これらの結果は、異なるペプチドの組み合わせによるトランスジェニックマウスの免疫化が、CD8 Tリンパ球の誘導を通じて免疫応答の進行を可能にすることを示す。
ペプチド
以下のペプチドを選択した:
ppCT1−15:MGFQKFSPFLALSIL(配列番号1);
ppCT86−100:GNLSTCMLGTYTQDF(配列番号3);
ppCT9−17 FLALSILVL(配列番号4);
ppCT16−25 VLLQAGSLHA(配列番号5);
ppCT50−59 LLAALVQDYV(配列番号6)。
分子HLA−A2(株D122)のトランスジェニックマウス株LL2(ルイス肺癌種)に、GFPを発現しヒト抗原ppCTをコードするレンチウイルスに感染させた。その後、106個の細胞をマウスの側腹部の皮下に注入した。
HLA−A2分子のトランスジェニックマウスに、100μMの各ペプチドの等モル混合物を含む100μlのペプチドの組み合わせC6とアジュバント(25μgのPoly(I:C))とを用いて、側腹部皮下に4回(D0、D4、D7およびD14)ワクチン接種を行った。
腫瘍細胞の移植後、マウスの体重を毎日モニタリングし、腫瘍を7日目から開始して2〜3日毎に測定した。サイズを次の方法でmm3で計算する:長さ×幅×深さ。統計的に有意な腫瘍成長差をt検定により計算し示す(*p<0.05)。
ppCTを発現する腫瘍を有するHLA−A2分子のトランスジェニックマウスモデルにおいて、組み合わせC6によるワクチン接種は、ワクチン接種していないマウスと比較して有意な腫瘍成長の減少を誘導する。実際、21日の終わりには、ワクチン接種した三匹中一匹のマウスが190mm3のサイズの腫瘍を有し、三匹の対照マウスは350mm3の平均サイズの腫瘍ができていた(図6)。
マウス、ヒト腫瘍移植およびヒトPBMCの移入。
生後3〜4週のNOD−scid Il2rγnullマウス(NSG;Jackson Laboratory)に、Tリンパ球による腫瘍の浸潤および標的細胞と相互作用する能力を最適化するために炎症性細胞遊走因子CCL5(RANTES)および接着分子ICAM−1で予めトランスフェクションし、ヌードマウス(Franciszkiewicz et al.,Cancer Res.2009,69,6249−6255)に維持したヒト腫瘍細胞株IGR−Heuの移植により生成されたヒト腫瘍Heu−nIRを皮下移植した。それから10日後に腫瘍が触知可能となったときに、抗原ペプチドppCTに対するCD8 T細胞の応答を誘導する能力をin vitroで予め試験した健常同種異系ヒトドナーからの2.107個の末梢血単核細胞(PBMC)をマウスの尾に静脈内注入した。その後、T細胞の生存を促進するために組換えIL−15(3μg/マウス/日)を腹腔内投与した。
使用したペプチドは、
− HLA−A拘束性エピトープを含むペプチドppCT9−17、ppCT16−25およびppCT50−59と長鎖ペプチドppCT1−15およびppCT86−100とからなる組み合わせC6、ならびに
− 組み合わせC6のペプチドを同様に含み、HLA−B7拘束性の三つのペプチド:ppCT7−15(配列番号19)、ppCT46−54(配列番号20)およびppCT79−88(配列番号21)を含む、組み合わせC6a
である。
Heu−nIR腫瘍移植およびPBMCの養子移入を受けたNSGマウスに、PBMCの移入から一日後に、各ペプチドの等モル混合物とアジュバント(25μgのポリ(I:C))とを含む100μlのペプチドの組み合わせC6またはC6aを用いて、一週間間隔で2回ワクチン接種した。組み合わせ療法のために、ワクチン接種したマウスを、PBMCの移入の二日後から二日毎に、抗hPD−1抗体(220mg/注入)または同じアイソタイプの対照抗体(220mgの非関連hIgG4)で静脈内処置した。
ワクチン接種したマウスおよびワクチン接種していないマウスの血漿中ヒトIFN−γ濃度を、市販のELISAキット(Human IFN−γ ELISA Set;BD OptEIA(商標),BD Biosciences)を使用して、製造業者の推奨にしたがって測定した。すべてのサンプルをデュプリケートで測定した。
使用した抗体は、ヒトモノクローナル抗体抗CD45、CD3、CD8、CD4、CD44、PD−1、パーフォリン、グランザイムBおよびIFN−γ、ならびにアイソタイプのマウスおよびウサギ対照(Miltenyi)ならびにヒトモノクローナル抗体抗CD69、CD62L、CD49a、CD45ROおよびCCR7(Invitrogen)である。ヒトモノクローナル抗体抗PD−1および同じいずれかのタイプの非関連対照抗体でブロッキング実験を行った。これらの表現型分析は、BD(商標)LSR IIフローサイトメータを用いて、直接免疫蛍光法によって行った。FlowJo(登録商標)ソフトウェアを使用してデータを分析した。
Prism6.0ソフトウェア(GraphPad software)を使用して統計分析を行った。異なる群からの結果を、独立サンプルのt検定を用いて比較する。両側試験でP<0.05の値が統計的に有意であると考えられる。
プレプロカルシトニンの抗原ペプチドに基づくペプチドワクチンの抗腫瘍効果を、ヒト化マウスモデルNOD−scid Il2rγnull(NSG)で評価した。活性Tリンパ球の枯渇を逆転させ、癌に対するワクチンの有益な治療効果を有利に強化するために、この能動免疫療法戦略を臨床的に使用される抗PD1モノクローナル抗体と組み合わせた。NSGマウスに、Heu−nIR腫瘍を移植後、健常HLA−A2+ドナーからのPBMCの養子移入を行い、それから組み合わせC6またはC6aに基づくワクチンを単独で、またはPD−1免疫チェックポイント阻害剤と組み合わせて用いて免疫化した。
Claims (17)
- 配列番号1〜18の配列より選択される少なくとも二つのペプチド配列を含む組成物であって、前記配列の各々は、8〜15個のアミノ酸のペプチドの形態で存在するか、またはマルチエピトープキメラポリペプチドに含まれることを特徴とする、組成物。
- 8〜15個のアミノ酸のペプチドの混合物を含むことを特徴とする、請求項1に記載の組成物。
- 配列番号1〜18の配列より選択される少なくとも二つの配列を含むキメラポリペプチドを含む、請求項1または2に記載の組成物であって、前記配列は、隣接するか、1〜5個のアミノ酸からなる連結要素により連結されるか、またはプレプロカルシトニン以外のタンパク質のエピトープを含む配列によって隔てられることを特徴とする、請求項1または2に記載の組成物。
- 配列番号1〜7の配列より選択される少なくとも二つのペプチド配列を含むことを特徴とする、請求項1〜3のいずれか一項に記載の組成物。
- 配列番号1〜7の配列より選択される少なくとも三つのペプチド配列を含むことを特徴とする、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
- 配列番号4および5、ならびに配列番号6の配列より選択される少なくとも一つの配列を含むことを特徴とする、請求項1〜5のいずれか一項に記載の組成物。
- 配列番号1、2、3、5および6の配列の組み合わせ、配列番号1、3、4、5および6の配列の組み合わせ、配列番号1、2、5および6の配列の組み合わせ、配列番号1、3、5および6の配列の組み合わせ、ならびに配列番号3、4、5および6の配列の組み合わせより選択されるペプチド配列の組み合わせを含むことを特徴とする、請求項1〜6のいずれか一項に記載の組成物。
- 配列番号1〜18の配列より選択される8〜15個のアミノ酸の少なくとも二つのペプチドをコードするか、または請求項3に記載のキメラポリペプチドをコードする少なくとも一つの核酸分子を含む、組成物。
- 前記ポリペプチド配列をロードした抗原提示細胞を含む、請求項1〜7のいずれか一項に記載の組成物。
- 少なくとも一つの免疫チェックポイント阻害剤をさらに含む、請求項1〜9のいずれか一項に記載の組成物。
- 配列番号19、20および/または21のペプチド配列のうちの少なくとも一つをさらに含む、請求項1〜10のいずれか一項に記載の組成物。
- 薬物として使用するための、請求項1〜11のいずれか一項に記載の組成物。
- 抗腫瘍免疫療法における使用のための、請求項1〜11のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記組成物は、カルシトニンを発現する腫瘍、またはカルシトニン、プレカルシトニンもしくはプレプロ−α−CGRPの高い血清中濃度を伴う病変の免疫療法を対象とすることを特徴とする、請求項13と同じ使用のための、請求項13に記載の組成物。
- 前記組成物は、甲状腺髄様癌腫または肺癌腫の免疫療法を対象とすることを特徴とする、請求項13または14と同じ使用のための、請求項13に記載の組成物。
- 前記組成物は、TAPペプチド輸送体を発現しない細胞を有する腫瘍の免疫療法を対象とすることを特徴とする、請求項13〜15のいずれか一項と同じ使用のための、請求項13に記載の組成物。
- 前記組成物は、HLA−A*0201患者の治療を対象とすることを特徴とする、請求項12〜16のいずれか一項と同じ使用のための、請求項12に記載の組成物。
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