Разработать эндпоинт api/reference

[const8ine]

Разработать новый GET эндпоинт, отдающий данные о ссылках на литературу для каждого эксперимента каждого гена.

Формат ответа:

"items": [
  {
    "id": 1,
    "publication": "10.1210/en.2003-0374",
    "type": "doi",
    "gene": "GHR",
    "section": {
      "type": "study", 
      "position": "ageRelatedChangesOfGene"
    }
  },
  {
    "id": 2,
    "publication": "10.1210/en.2003-0374",
    "type": "pmid",
    "gene": "GHR",
    "section": {
      "type": "commentEvolution", 
      "position": "in text"
    }
  }
]

Для того, чтобы отдать данные в этом эндпоинте, нужно собрать следующие данные, относящиеся к гену в таблице gene:

все исследования из связанных таблиц

commentEvolution или commentEvolutionEN

commentCause или commentCauseEN

uniprot_summary или uniprot_summary_en (мы потом поправим эту разницу в нейминге, и то что где-то снейк кейс, где-то кэмел кейс)

в зависимости от языка

Пояснения к структуре ответа:

• id — внутренний id в БД

• publication — это строка с идентификатором статьи из полей pmid или reference. Если заполнено и то и другое, будет два объекта с одним и тем же геном, но разными публикациями

• type — собственно doi или pmid соответственно тому откуда взята строка

• gene — symbol гена

• section — хранит объект, в котором поле type хранит название поля, в котором у одного гена в эндпоинте api/gene/*ген* можно найти ссылку на эту публикацию. Поле position: если type "study", то в position будет указана строка с названием поля с экспериментом. Если у type другое значение, то в position будет строка “in text“.

Подробнее про section

Поле	Значения
type	'researches' | 'commentEvolution' | 'proteinDescriptionUniProt' | 'commentCause'
position	'increaseLifespan' | 'ageRelatedChangesOfGene' | 'interventionToGeneImprovesVitalProcesses' |  'proteinRegulatesOtherGenes' | 'geneAssociatedWithProgeriaSyndromes' | 'geneAssociatedWithLongevityEffects' | 'additionalEvidences' | 'in text'