-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 4
/
input.bed
389 lines (389 loc) · 10.1 KB
/
input.bed
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
1 155213825 155227534 GBAP1
1 155234452 155244627 GBA
X 101396350 101410572 GLA
1 100872372 100895179 EXTL2
1 1020120 1056118 AGRN
1 109687814 109709039 GSTM1
1 11026523 11047239 MASP2
1 113073198 113132260 LRIG2
1 115641970 115698224 VANGL1
1 11845709 11848345 NPPA
1 119911553 120100779 NOTCH2
1 148808181 149048286 PDE4DIP
1 149782671 149792518 FCGR1A
1 152302165 152325239 FLG
1 152613811 152614098 LCE3B
1 154983338 154993111 FLAD1
1 155185824 155192916 MUC1
1 155277463 155289848 HCN3
1 161541759 161550737 FCGR3A
1 161663147 161678654 FCGR2B
1 167430640 167518610 CD247
1 17308195 17364004 PADI4
1 186296279 186314567 PRG4
1 196774813 196795407 CFHR3
1 196819757 196832189 CFHR1
1 198638457 198757476 PTPRC
1 204190341 204196491 KISS1
1 205913048 205943460 SLC26A9
1 206203345 206464443 SRGAP2
1 207321532 207386804 CD55
1 207496147 207641765 CR1
1 225401502 225428925 LBR
1 23801885 23838620 HMGCL
1 23870515 23913362 CNR2
1 25362249 25430192 RHCE
1 26787054 26800659 PIGV
1 6185020 6209389 RPL22
1 6424776 6461367 ESPN
1 65419 71585 OR4F5
1 99850361 99924023 AGL
2 10042849 10054836 KLF11
2 106391290 106468413 RGPD3
2 130521197 130528604 CFC1B
2 130592165 130599575 CFC1
2 1374066 1543711 TPO
2 1631887 1744852 PXDN
2 201182898 201229406 CASP10
2 233059967 233207903 INPP5D
2 237485428 237555322 MLPH
2 238848032 238910534 TWIST2
2 241188509 241225377 ANO7
2 241734602 241768816 D2HGDH
2 43831942 43882988 ABCG8
2 70087477 70089203 PCBP1
2 74461057 74465410 MOGS
2 88691673 88750929 RPIA
2 88857161 88857683 IGKC
2 88947301 88947957 IGKV1-5
2 950849 1367613 SNTG2
3 128619969 128681075 RPN1
3 133400056 133475222 BFSP2
3 136250340 136337896 PCCB
3 16586792 16670306 DAZL
3 184135038 184146127 EIF2B5
3 186717348 186744410 KNG1
3 195746765 195811973 MUC4
3 196319342 196338503 TM4SF19
3 196763 409417 CHL1
3 45823316 45916042 LZTFL1
3 49359145 49412998 RHOA
3 49887002 49903873 MST1R
3 50299890 50312381 HYAL1
4 1009936 1026898 FGFRL1
4 1056250 1113564 RNF212
4 1347208 1395989 UVSSA
4 143870864 143905563 GYPE
4 143996104 144019380 GYPB
4 144109303 144140751 GYPA
4 185500660 185535507 PDLIM3
4 186587794 186726722 FAT1
4 190084412 190085686 DUX4L1
4 190173774 190185942 DUX4
4 337814 384868 ZNF141
4 3463306 3501473 DOK7
4 3503612 3532446 LRPAP1
4 625584 670782 PDE6B
4 68537184 68568527 UGT2B17
4 69280475 69295050 UGT2B28
4 69588417 69653249 UGT2A1
4 69589309 69639642 UGT2A2
4 73431138 73456174 AFP
4 849276 932373 GAK
4 87608529 87616873 DSPP
4 8846076 8871839 HMX1
4 98871684 98930637 EIF4E
5 1225381 1246189 SLC6A18
5 1253147 1295068 TERT
5 134601149 134649271 SAR1B
5 137867858 137887851 MYOT
5 1392794 1445440 SLC6A3
5 140855883 141012347 PCDHA10
5 171387116 171411137 NPM1
5 180601506 180649624 FLT4
5 218241 257082 SDHA
5 69415065 69444330 MARVELD2
5 69492292 69558104 OCLN
5 70049638 70078522 SMN2
5 70925030 70953942 SMN1
5 70968166 71025339 NAIP
5 95461755 95554977 TTC37
5 97091867 97142753 LIX1
6 107867756 107958208 SEC63
6 149749443 149811420 PCMT1
6 160121815 160158718 SLC22A1
6 160531482 160664275 LPA
6 168441151 168673445 SMOC2
6 169215780 169254044 THBS2
6 29395631 29398008 OR12D2
6 31269491 31357188 HLA-B
6 31546870 31558829 NFKBIL1
6 31588895 31593006 NCR3
6 32578769 32589848 HLA-DRB1
6 32659467 32668383 HLA-DQB1
6 33299694 33314387 TAPBP
6 33318558 33323016 DAXX
6 35797206 35845397 LHFPL5
6 73593379 73653992 SLC17A5
7 100733595 100797797 ZAN
7 100949534 100968347 MUC3A
7 107923799 108003187 LAMB1
7 130486171 130506465 MEST
7 130731235 130734176 KLF14
7 140719327 140924928 BRAF
7 142391891 142392412 TRBV9
7 142760398 142774564 PRSS2
7 152134922 152436005 KMT2C
7 153887097 154894285 DPP6
7 157539056 158587823 PTPRN2
7 192571 260772 FAM20C
7 30424527 30478784 NOD1
7 44796680 44824564 PPIA
7 50304068 50405101 IKZF1
7 5274369 5306870 SLC29A4
7 56011051 56051604 PSPH
7 57119614 57139864 ZNF479
7 5970925 6009106 PMS2
7 65960684 65982215 GUSB
7 74289407 74405935 CLIP2
7 74650231 74760692 GTF2I
7 74773962 74789376 NCF1
7 74796144 74851551 GTF2IRD2
7 75156639 75172044 NCF1C
8 143213218 143217170 GPIHBP1
8 143419182 143430732 MAFA
8 143574785 143578649 NAPRT
8 1823926 1958641 ARHGEF10
8 42271302 42332653 IKBKB
8 737596 1708474 DLGAP2
8 81656914 81686331 IMPA1
8 94127162 94217303 CDH17
9 110668779 110806558 MUSK
9 128340527 128361470 SLC27A4
9 128702503 128720916 PKN3
9 133061978 133071863 CEL
9 133250401 133276024 ABO
9 133532164 133575519 ADAMTSL2
9 135693407 135704498 SOHLH1
9 136428619 136439845 INPP5E
9 137086985 137109183 MAN1B1
9 137139154 137168756 GRIN1
9 137447570 137459334 NSMF
9 137618992 137870016 EHMT1
9 2717510 2730037 KCNV2
9 34638133 34651035 GALT
9 69035563 69100178 FXN
9 69121264 69274615 TJP2
9 87914493 87923505 SPATA31C1
10 101354033 101557321 BTRC
10 133362485 133373354 ECHS1
10 133420666 133424572 SPRN
10 14897359 14954432 DCLRE1C
10 17809348 17911164 MRC1
10 26697701 26746798 PDSS1
10 274190 689668 DIP2C
10 79703227 79714681 NUTM2B
10 87357668 87370695 NUTM2D
10 87659613 87747705 PAPSS2
10 87863625 87971930 PTEN
10 88761406 88778242 LIPN
11 1223066 1262172 MUC5B
11 1919703 1938706 TNNT3
11 1995176 2001470 H19
11 215030 236931 SIRT3
11 319676 327537 IFITM3
11 46380756 46383837 MDK
11 47354860 47378547 SPI1
11 4954772 4955713 OR51A2
11 5248269 5249857 HBG1
11 62615296 62622154 B3GAT3
11 637269 640706 DRD4
11 64305497 64316743 ESRRA
11 644233 706715 DEAF1
11 64590641 64602353 SLC22A12
11 69048932 69136316 TPCN2
11 69809968 69819416 FGF3
11 70467856 71252577 SHANK2
12 11061365 11062294 TAS2R46
12 11091287 11092313 TAS2R45
12 120978543 121002512 HNF1A
12 121429096 121581023 KDM2B
12 121839527 121863596 HPD
12 132196372 132329589 GALNT9
12 132618776 132622388 P2RX2
12 132710819 132722734 PGAM5
12 132768914 132829078 GOLGA3
12 50112082 50120457 COX14
12 56712427 56731628 NACA
12 63558913 63668939 DPY19L2
12 6786858 6820799 CD4
12 7080214 7092540 C1R
12 7188685 7218574 PEX5
12 7649400 7665908 APOBEC1
12 7689784 7695775 GDF3
12 80402178 80680273 PTPRQ
13 113105788 113120685 F7
13 113158648 113172386 PROZ
13 113667219 113737736 GRK1
14 105140982 105168824 JAG2
14 105639559 105644790 IGHG2
14 105703995 105708665 IGHA1
14 105736343 105743071 IGHG1
14 105851705 105856218 IGHM
14 106235064 106235594 IGHV3-21
14 92116122 92121917 NDUFB1
15 20657638 20688408 NBEAP1
15 24985100 24985166 SNORD64
15 41387353 41402519 NDUFAF1
15 43533462 43590253 PPIP5K1
15 50424380 50514421 USP8
15 82536750 82540459 RPS17
15 82836946 82986153 HOMER2
16 1078781 1080142 SSTR5
16 1351931 1364113 GNPTG
16 1363205 1414751 UNKL
16 1444934 1475084 CLCN7
16 14672548 14694308 PLA2G10
16 153892 166764 HBM
16 18804860 18926408 SMG1
16 2088708 2135898 PKD1
16 24845841 24911628 SLC5A11
16 2537979 2603188 PDPK1
16 28605196 28623625 SULT1A1
16 287440 352723 AXIN1
16 28846600 28874212 SH2B1
16 30748293 30761176 PHKG2
16 31090842 31095980 VKORC1
16 46689643 46698394 ORC6
16 67430652 67437553 HSD11B2
16 70802084 71230722 HYDIN
16 77007 85851 MPG
16 81081945 81096395 GCSH
16 853634 981318 LMF1
16 8537605 8590193 TMEM114
16 88382959 88440757 ZNF469
16 89171748 89195492 CDH15
16 89267630 89490561 ANKRD11
16 89644435 89657721 CHMP1A
16 89912119 89920977 MC1R
17 1003518 1229738 ABR
17 1742836 1755268 SERPINF2
17 17977409 18039209 ATPAF2
17 21284672 21315232 MAP2K3
17 21692523 21704612 KCNJ18
17 2303383 2325260 SRR
17 28506243 28538896 FOXN1
17 31937007 32001038 SUZ12
17 36194869 36196758 CCL3L1
17 3672199 3696240 P2RX5
17 41040541 41041450 KRTAP1-1
17 44070735 44076344 G6PC3
17 46029916 46225389 KANSL1
17 48611377 48615292 HOXB8
17 48958554 48968596 GIP
17 4932277 4935023 GP1BA
17 4948092 4957131 ENO3
17 508668 721717 VPS53
17 64477785 64497054 POLG2
17 78110458 78132407 TMC6
17 78991716 79009867 CANT1
17 80260866 80398786 RNF213
17 8095900 8119047 ALOXE3
17 8120592 8124106 HES7
17 81528396 81537130 FSCN2
17 81804132 81814008 GCGR
18 46917492 47102243 KATNAL2
18 657653 673578 TYMS
18 74597870 75065671 ZNF407
18 77249848 77277900 GALR1
18 79679803 79754510 CTDP1
19 10350529 10380572 TYK2
19 1177558 1228431 STK11
19 13104902 13117567 TRMT1
19 15640897 15662825 CYP4F3
19 15673018 15697174 CYP4F12
19 1609290 1652615 TCF3
19 16479061 16496167 CALR3
19 17075781 17214537 MYO9B
19 17816512 17821574 INSL3
19 18531751 18544077 FKBP8
19 2427638 2456959 LMNB2
19 34359480 34402413 GPI
19 35648323 35658782 COX6B1
19 3585478 3593541 GIPC3
19 3594507 3606875 TBXA2R
19 39243553 39245129 IFNL3
19 40890826 40912357 CYP2G1P
19 4153631 4173054 CREB3L3
19 43506719 43527230 ETHE1
19 44914247 44919349 APOC1
19 44942237 44945496 APOC4
19 44946035 44949565 APOC2
19 45178784 45216933 BLOC1S3
19 45769709 45782552 DMPK
19 48748011 48755390 FUT1
19 48954815 48961798 BAX
19 49157741 49211836 TRPM4
19 49859882 49878351 PNKP
19 49969673 49975814 SIGLEC16
19 50906352 50910738 KLK4
19 51345169 51366388 ETFB
19 53793741 53824394 NLRP12
19 53879190 53907652 PRKCG
19 54107013 54115675 TFPT
19 54173412 54189882 MBOAT7
19 54738513 54753052 KIR2DL3
19 54769793 54784322 KIR2DL1
19 54816468 54830778 KIR3DL1
19 54923509 54966312 NLRP7
19 54953130 55001142 NLRP2
19 55013705 55038264 GP6
19 55132698 55149206 TNNT1
19 55151767 55157773 TNNI3
19 55540656 55545543 SBK3
19 571277 583493 BSG
19 57487711 57496097 ZNF419
19 5842888 5851474 FUT3
19 58479512 58512413 SLC27A5
19 589881 617159 HCN2
19 5993164 6199572 RFX2
19 6677704 6730562 C3
19 7112255 7294414 INSR
19 7636881 7647873 STXBP2
19 8302127 8308358 CD320
19 851014 856247 ELANE
19 8580240 8610735 ADAMTS10
19 859664 863641 CFD
19 8848844 8981342 MUC16
19 917287 921005 KISS1R
20 34194569 34269344 ASIP
20 45207033 45209768 SEMG1
20 45898621 45912155 PLTP
20 63343223 63378401 CHRNA4
20 63488014 63499185 EEF1A2
20 63528001 63537376 PTK6
20 64080082 64100643 OPRL1
20 64102394 64242253 MYT1
21 34446688 34512210 KCNE1
21 36135079 36146562 CBR3
21 42879644 42913304 NDUFV3
21 43053191 43076943 CBS
21 43092956 43107587 U2AF1
21 43169008 43172805 CRYAA
21 44012309 44106552 TRAPPC10
21 44246339 44262216 DNMT3L
21 45405165 45513720 COL18A1
21 45981769 46005050 COL6A1
21 46098112 46132848 COL6A2
21 46136262 46155579 FTCD
22 18906028 18914238 DGCR6
22 18912777 18936553 PRODH
22 24011192 24178628 CABIN1
22 39097224 39104067 APOBEC3H
22 42085526 42090884 NDUFA6
22 42617840 42649392 CYB5R3
22 42692121 42721298 A4GALT
22 43039516 43089419 TTLL1
22 50059391 50085426 MLC1
22 50217689 50245023 TUBGCP6
22 50674415 50733298 SHANK3